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Pueden romper todas las proteínas a menos que sean parte de una
célula viva.
En la primera la proteasa rompe sólo uno o un número limitado de enlaces peptid́ icos necesarios
para el crecimiento y desarrollo de las plantas. Como se encuentran: la maduración de enzimas,
el ensamblaje de proteiń as, la modificación pos-traduccional de proteiń as en sitios especif́ icos y
el control de la actividad de enzimas, proteínas reguladoras y péptidos.
1.1 Clasificación de las enzimas proteolíticas Las proteasas se clasifican según su mecanismo
catalítico en cuatro clases: seriń , cisteiń , aspártico y metalo proteasas. Las primeras tres
clases reciben su nombre de acuerdo con los aminoácidos que hacen parte de la
conformación de su sitio activo y las metalo proteasas requieren iones metálicos para su
actividad (Barrett, 1986).
Serina-Proteasas
• Se caracteriza por tener un residuo serina muy reactivo en su sitio activo.
• Todas ellas son endoproteasas (enzima que corta los enlaces peptídicos internos de
un polipeptido).
También intervienen un residuo histidina y un residuo ácido aspá rtico en el proceso
catalítico, formando la llamada triada catalítica
su especificidad por el sustrato es muy diferente. La razó n de estas diferencias
tan marcadas en especificidad radica en las diferencias estructurales en las
cavidades donde se aloja el sustrato junto al sitio activo de la enzima.
Mecanismo de acción:
El proceso de catálisis inicia cuando la cadena polipeptid ́ ica del sustrato se
une a la enzima especif́ icamente en el sitio donde se encuentra la triada
catalit́ ica. En la primera fase de reacción, la histidina 57 actúa como una
base para retirar un protón de la serina 195, lo cual facilita el ataque
nucleofiĺ ico de la serina 195 sobre el carbono carbonilo del enlace peptid ́ ico a
ser hidrolizado. Esto debe ser una fase concertada ya que la transferencia
del protón previa al ataque de la serina 195 sobre el carbono acilo podria ́
dejar una carga negativa en el oxig ́ eno de serina que seri ́
a relativamente
inestable.
En la siguiente etapa, la donación de un protón de la histidina 57 al nitrógeno
amida del péptido crea una amina protonada en el intermediario tetraédrico
covalente, facilitando el rompimiento subsecuente del enlace y la disociación
del producto amina. La carga negativa en el oxig ́ eno peptid́ ico es inestable;
el intermediario tetraédrico tiene una vida muy corta y rápidamente se rompe
para expulsar el producto amina. Con el sustrato peptid ́ ico normal, un ataque
nucleofiĺ ico subsecuente sobre el carbono carbonilo, por una molécula de
agua, genera otro intermediario tetraédrico transiente, donde la histidina 57
actúa como base aceptando un protón de la molécula de agua atacante.
́ proteasas
cisteina
• Comparten un mecanismo catalítico común que involucra un tiol de la cisteína
nucleófila en una díada catalítica.
• Se encuentran comúnmente en frutas como la papaya, piña, higos y kiwis.
• Se utilizan como ingrediente en ablandadores de carne.
Mecanismo de acción
desprotonación de un tiol en el sitio activo de la enzima por un aminoácido
adyacente con una cadena lateral básica, por lo general un residuo de histidina.
ataque nucleofílico por el azufre de la cisteína aniónico desprotonado en el sustrato
de carbono de carbonilo. En este paso, un fragmento del sustrato se libera con un
extremo amino, el residuo de histidina en la proteasa se restaura a su forma
desprotonada, y un tioéster intermedio que une el nuevo extremo carboxi-terminal
del sustrato para el tiol de la cisteína se forma. El enlace tioéster luego es
hidrolizado para generar un resto de ácido carboxílico en el fragmento sustrato
restante, mientras que la regeneración de la enzima libre.
Metalo-proteasas.
• Amplias diferencias en secuencias y estructura
• La mayoria contienen Zn en el sitio activo.
• Ej: Termolisina metaloproteasa de la matriz extracelular