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 Son enzimas proteolíticas que rompen los enlaces peptídicos de

las proteínas, usando una molécula de agua por lo que se


clasifican como hidrolasas.

 Su acción puede dividirse en dos categorías: proteólisis limitada


y proteólisis ilimitada.

Pueden romper todas las proteínas a menos que sean parte de una
célula viva.
En la primera la proteasa rompe sólo uno o un número limitado de enlaces peptid́ icos necesarios
para el crecimiento y desarrollo de las plantas. Como se encuentran: la maduración de enzimas,
el ensamblaje de proteiń as, la modificación pos-traduccional de proteiń as en sitios especif́ icos y
el control de la actividad de enzimas, proteínas reguladoras y péptidos.

La segunda se caracteriza por la degradación de las proteiń as en sus aminoácidos; estos


usualmente se conjugan con múltiples moléculas del polipéptido ubiquitina. Esta modificación
los identifica para su hidrólisis por el proteosoma en presencia de ATP.

1.1 Clasificación de las enzimas proteolíticas Las proteasas se clasifican según su mecanismo
catalítico en cuatro clases: seriń , cisteiń , aspártico y metalo proteasas. Las primeras tres
clases reciben su nombre de acuerdo con los aminoácidos que hacen parte de la
conformación de su sitio activo y las metalo proteasas requieren iones metálicos para su
actividad (Barrett, 1986).

Serina-Proteasas
• Se caracteriza por tener un residuo serina muy reactivo en su sitio activo.
• Todas ellas son endoproteasas (enzima que corta los enlaces peptídicos internos de
un polipeptido).
También intervienen un residuo histidina y un residuo ácido aspá rtico en el proceso
catalítico, formando la llamada triada catalítica
 su especificidad por el sustrato es muy diferente. La razó n de estas diferencias
tan marcadas en especificidad radica en las diferencias estructurales en las
cavidades donde se aloja el sustrato junto al sitio activo de la enzima.
 Mecanismo de acción:
 El proceso de catálisis inicia cuando la cadena polipeptid ́ ica del sustrato se
une a la enzima especif́ icamente en el sitio donde se encuentra la triada
catalit́ ica. En la primera fase de reacción, la histidina 57 actúa como una
base para retirar un protón de la serina 195, lo cual facilita el ataque
nucleofiĺ ico de la serina 195 sobre el carbono carbonilo del enlace peptid ́ ico a
ser hidrolizado. Esto debe ser una fase concertada ya que la transferencia
del protón previa al ataque de la serina 195 sobre el carbono acilo podria ́
dejar una carga negativa en el oxig ́ eno de serina que seri ́
a relativamente
inestable.
 En la siguiente etapa, la donación de un protón de la histidina 57 al nitrógeno
amida del péptido crea una amina protonada en el intermediario tetraédrico
covalente, facilitando el rompimiento subsecuente del enlace y la disociación
del producto amina. La carga negativa en el oxig ́ eno peptid́ ico es inestable;
el intermediario tetraédrico tiene una vida muy corta y rápidamente se rompe
para expulsar el producto amina. Con el sustrato peptid ́ ico normal, un ataque
nucleofiĺ ico subsecuente sobre el carbono carbonilo, por una molécula de
agua, genera otro intermediario tetraédrico transiente, donde la histidina 57
actúa como base aceptando un protón de la molécula de agua atacante.

́ proteasas
cisteina
• Comparten un mecanismo catalítico común que involucra un tiol de la cisteína
nucleófila en una díada catalítica.
• Se encuentran comúnmente en frutas como la papaya, piña, higos y kiwis.
• Se utilizan como ingrediente en ablandadores de carne.

 Mecanismo de acción
 desprotonación de un tiol en el sitio activo de la enzima por un aminoácido
adyacente con una cadena lateral básica, por lo general un residuo de histidina.
 ataque nucleofílico por el azufre de la cisteína aniónico desprotonado en el sustrato
de carbono de carbonilo. En este paso, un fragmento del sustrato se libera con un
extremo amino, el residuo de histidina en la proteasa se restaura a su forma
desprotonada, y un tioéster intermedio que une el nuevo extremo carboxi-terminal
del sustrato para el tiol de la cisteína se forma. El enlace tioéster luego es
hidrolizado para generar un resto de ácido carboxílico en el fragmento sustrato
restante, mientras que la regeneración de la enzima libre.

Metalo-proteasas.
• Amplias diferencias en secuencias y estructura
• La mayoria contienen Zn en el sitio activo.
• Ej: Termolisina metaloproteasa de la matriz extracelular

 En su funcionamiento es necesaria la presencia de metales como átomos de zinc o


cobalto
 coordinan la proteína con el ion metalo por medio de tres ligandos (aminoácidos ),
la molécula de agua que se utiliza para la proteólisis está unida con el ion metálico
en el centro catalítico de la enzima.
 Se ha encontrado que esta proteína está ligada a la aparición de cáncer.
Mecanismo:
El mecanismo catalítico lleva a la formación de un intermediario tetraédrico no covalente
luego del ataque de la molécula de H2O unidad al Zn sobre el grupo carbonilo del enlace
peptídico.
El intermediario se descompone por la transferencia del protón del acido glutámico al
grupo NH
 Aspártico-proteasas
 Se trata de enzimas bilobuladas donde el sitio activo esta entre dos lóbulos
homólogos. Cada lóbulo contribuye con un aspartato.
 Para la mayoría su pH optimo es acido donde un protón esta compartido por los dos
aspartatos del sitio activo.
 El agua es activada por los aspartatos para realizar el ataque nucleofílico.

 utilizan un residuo de aspartato para la catálisis de los sustratos peptídicos.


 tienen dos aspartatos altamente conservados en el sitio activo
 son óptimamente activa a pH ácido.
 Casi todas son inhibidos por la pepstatina.
Mecanismo de acción
 Los 2 residuos aspartil tienen una gran proximidad geometrica en la molecula
 Un aspartato se ioniza mientras que el segundo no lo esta al rango de pH optimo de
2-3
 La catalisis de las aspartico proteasas no involucra la generacion de un
intermediario tetrahedrico.
 El ataque nucleofilo se consigue por 2 transferencias simultaneas de protones: una
desde H2O2 a la diada de dos carboxilos y ptra desde la diada al oxigeno carbonilo
del sustrato con el consiguiente clivaje CO-NH
 En terminos generales es una catalisis acido-bas

 Son proteínas de bajo peso molecular.


 Divididos en 67 familias según la identidad de las secuencias de
́ ,
aminoácidos o el tipo de proteasa con la cual interactúan: serin
cisteín, aspártico, metalo, glutámico y treonín proteasa.
 Se caracterizan:
En el complejo enzima-inhibidor todas las actividades
enzimáticas hacia todos los sustratos se anulan completamente.
La inhibición es competitiva.
El centro reactivo de un inhibidor particular determina su
especificidad.

Clase de fármacos antirretrovirales que bloquean el proceso por


el cual el virus de la inmunodeficiencia humana se reensambla por
sí mismo en el interior de una célula. Los inhibidores de proteasa
inutilizan la proteasa, una enzima imprescindible para cortar
grandes péptidos del virus en unidades funcionales de menor
tamaño, para crear nuevas partículas virales. El virus resultante es
defectuoso y no infeccioso. Ejemplos de inhibidores de proteasa
son saquinavir, ritonavir e indinavir.

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