Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Tema | Nutrigenética
NTRODUCCIÓN Contenido
Desde hace años es conocida la existencia de una distinta respuesta inter-
Introducción
individual a la misma dieta. Aunque los factores implicados no eran conocidos,
se hipotetizaba una importante modulación genética. Recientemente, los Nutrigenética
nuevos conocimientos derivados de la secuenciación del genoma humano y los
grandes avances en técnicas moleculares de alta resolución han posibilitado su Resumen
entendimiento y el auge de la Nutrición molecular.
Bibliografía
El objetivo de la genómica nutricional es prevenir y/o curar enfermedades a
través de la nutrición personalizada. Este concepto se sustenta en el estudio de la
interacción genes-nutrientes desde dos campos de actuación bien diferenciados.
(Figura 1)
Conceptos clave
Cada célula del cuerpo posee dos copias completas del genoma (una heredada
del padre y otra de la madre), excepto las reproductoras o gametos que portan una
única copia. Cada una de las copias contiene aprox. 3000 millones de nucleótidos
((A, T, C o G), formando parte de una molécula química, el ADN, que se compacta y
reparte en 24 cromosomas diferentes (22 autosomas y 2 sexuales). En total, cada
célula humana diploide contiene 23 pares de cromosomas (22 autosomas y 1 par
sexual), mientras que los gametos contienen 23 cromosomas.
La secuenciación del genoma completo, una determinada posición del genoma. También
aunque es ya una realidad, sigue siendo compleja puede ocurrir que se inserte una secuencia
y cara, por lo que se han desarrollado una batería corta varias veces en la misma posición, en este
de marcadores genéticos asociados a cambios caso se denomina repetición. Estas pueden
genéticos responsables de enfermedades, los cuales ser en Tandem (pocas repeticiones de bloques
permiten identificar la variante genética y rastrear grandes) o microsatélites (muchas repeticiones
la manera en que pasa de una generación a la de bloques pequeños).
siguiente. Estos biomarcadores para que constituyan • Cambios en la secuencia de bases: denominados
una herramienta útil de apoyo al diagnóstico, han de polimorfismos de un solo nucleótido o SNP (Single
cumplir algunos criterios de eficacia y validez: Nucleotide Polymorphism). Suponen el cambio
de un nucleótido por otro diferente (A, T, C o G)
• Localización determinada y precisa en gen en la secuencia del genoma. Son los marcadores
candidato: El gen se describe como candidato más comunes y utilizados, actualmente hay
debido a que se encuentra en una región identificados más de 3 millones, se encuentran
cromosómica específica relacionada con la en frecuencias de más de 1% de la población
enfermedad o a la posibilidad de que el producto general y son los responsables de una gran
proteínico sea la causa de la enfermedad. mayoría de diferencias fenotípicas individuales.
• Coherencia con el problema de salud o proceso Los SNP se numeran para identificarlos mediante
evaluado: Esta asociación se determina en un número de orden antecedido por las letras rs
estudios llamados análisis de genes candidatos, (reference SNP).
que permiten analizar los efectos de las
variantes de un gen candidato en los miembros
de una familia afectada o en casos y controles no
relacionados. El análisis de genes candidatos es Predisposición genética a enfermedad
útil para determinar rápidamente la relación de
La predisposición a enfermedad viene
una variante genética con una enfermedad.
determinada por mutaciones en los genes. Estos
• Presencia fácilmente detectable: Su uso supone
cambios se generan espontáneamente en un
un método práctico y asequible para valorar el
individuo y luego aumentan su frecuencia en la
riesgo genético a muchas enfermedades.
población general al transmitirse a la descendencia.
• Poder diagnóstico: Es necesario considerar si ese
Se distinguen dos patrones de herencia bien
marcador único tiene un poder de diagnóstico
diferenciados:
tan grande como para considerarlo por sí solo o
si hay que considerar otros marcadores, que es • Enfermedades de herencia monogénica:
lo habitual. Una característica importante es que Una única mutación genética es responsable
son polimórficos, lo que significa que pueden directa de la enfermedad al codificar una
presentar diferentes variantes, denominadas proteína anómala incapaz de realizar su función
alelos. En ocasiones, el efecto producido por correctamente. Siguen las leyes mendelianas
estas variantes es aditivo por lo que se ha de según un patrón de herencia dominante,
tener en cuenta si la asociación se detecta en recesivo o ligado al sexo.(Figura 3)
estado homo o heterocigoto. También puede • Enfermedades de herencia multifactorial:
ocurrir que, al considerar varios marcadores, su Causadas por el efecto conjunto de varios
efecto sea contradictorio, por lo que siempre genes (poligénicas) y la influencia de factores
hay que realizar una interpretación holística y ambientales concretos. Los efectos son
personalizada. aditivos (a mayor número de cambios, mayor
• Generar biomarcadores de respuesta: Permiten predisposición a enfermedad). Su estudio es
conocer con antelación a la intervención matemático y complejo.(Figura 4)
dietética, el posible éxito de la misma.
Los marcadores genéticos más utilizados son Las enfermedades comunes son multifactoriales.
polimorfismos o secuencias de ADN corto. Los Los genes involucrados son pleomórficos, es decir,
polimorfismos son variantes genéticas de un existen varios alelos posibles en el mismo locus (cada
gen (al menos dos) que ocurren con frecuencia individuo tiene sólo dos y la trasmisión sigue patrón de
significativa (al menos en el 1% de la población). herencia monogénica). En este modelo los alelos de
Según el tipo de cambio que producen en la riesgo son menos deterministas, y el hecho de presentar
secuencia de ADN se clasifican en dos grupos: una o dos copias de la variante de riesgo influye en la
predisposición a desarrollar la enfermedad.(Figura 5)
• Inserciones, deleciones y repeticiones: consisten
en la adición o sustracción de nucleótidos en
Nutrigenética 4
Figura 3. Herencia monogénica: la presencia del gen mutado es causa directa de la patología y determina la condición de portado o el
desarrollo de la enfermedad según sea el patrón de herencia, dominante, recesivo o ligado al sexo.
Figura 4. Herencia Poligénica Cuantitativa: una característica está controlada por más de un gen, lo cual origina numerosas combinaciones
que son la causa de que exista una gradación de fenotipos, mostrando un modelo de distribución normal. En este ejemplo, con tres
genes, sería posible encontrar siete grados distintos de afectación.
Nutrigenética 5
Figura 5. Factor de riesgo en enfermedad compleja: existe una variación continúa controlada por el efecto aditivo de varias variantes de
riesgo.
Hay que señalar que los efectos no siempre Detección variante genética (Identificación
son negativos, sino que a veces tienen un efecto genotipo)
protector, ya sea directo, o bajo condiciones
ambientales concretas. Esta circunstancia puede Existen numerosos métodos para detectar la
ser aprovechada para diseñar una estrategia eficaz variación genética. Cada uno tiene sus alcances
que propicie tales condiciones favorables a fin de y limitaciones.(Tabla 1) Tradicionalmente, se ha
modular el riesgo genético. El riesgo a enfermedad venido utilizando la tecnología convencional
se calcula de manera probabilística y refleja la de secuenciación diseñada por Sanger, que
contribución individual de cada una de las variantes proporciona la resolución necesaria para detectar
alélicas identificadas.(Figura 6) variantes genéticas de pequeño tamaño, aunque
tiene la limitación de una velocidad de lectura muy
Las variantes asociadas a cada enfermedad lenta y un coste elevado.
se determinan mediante un estudio de asociación
genética en genes candidatos. Se analizan miles En los últimos años, los avances tecnológicos,
de variantes genéticas para cada enfermedad. En han conducido al desarrollo de la secuenciación
cada experimento hay un grupo control que no de nueva generación o NGS (Next generation
tiene la enfermedad y otro de enfermos. Se acepta sequencing), también conocida como secuenciación
la hipótesis que las variantes responsables de masiva paralela o MPS (massive parallel
enfermedad serán más frecuentes en el grupo de sequencing). Este método de secuenciación de alto
afectos que en el de sanos. Si el estudio se hace a rendimiento, tiene el potencial de detectar todos
nivel de genoma completo se denomina Estudio de los tipos de mutaciones conocidas y la capacidad
Asociación a Genoma Completo o GWAS (Genome- tecnológica de leer un genoma completo en un día
wide Association study). Estos estudios han y a un coste muy asequible. Sin embargo, presenta
permitido identificar nuevos genes hasta ahora una notable limitación: su análisis computacional
desconocidos y que tienen gran interés en Nutrición. produce una cantidad de datos sin precedentes,
Continuamente se publican GWAS que describen tantos que un ordenador común no puede manejar.
nuevas relaciones, incorporando al catálogo de Por lo que la secuenciación de un genoma completo
marcadores nuevas variantes poco frecuentes, que en diagnóstico, sigue sin ser factible y la lectura
ayudan a explicar cada vez mejor la diversidad e interpretación se siguen centrando sólo en
clínica de la enfermedad, por lo que es fundamental determinadas mutaciones o genes conocidos.
mantenerse actualizado si se quiere ser riguroso en
la aplicación de los patrones de respuesta.
Nutrigenética 6
Figura 6. Modelo "Enfermedad común, variante común": el gen confiere un riesgo, pero no es causa directa de la patología. en este
ejemplo, una enfermedad a la cual contribuyen varias variantes genéticas de tres genes diferentes, es padecida por aquellos que reciben
al menos dos variantes de riesgo.
VENTAJAS LIMITACIONES
Resolución necesaria para detectar Velocidad de lectura muy lenta y un
SANGER variantes genéticas de pequeño tamaño. coste elevado.
Tabla 1. Metodología detección variante genética. Ventajas y limitaciones de cada uno de ellos.
Nutrigenética 7
Figura 7. Variabilidad en la distinta respuesta fenotípica a la dieta. Los individuos van a absorber, metabolizar o utilizar los nutrientes de
diferente manera en función de sus diferencias en el genoma. Se clasifican en hipo- normo- o hiper-respondedores según su respuesta a
la dieta sea inferior, superior o la esperada respectivamente.
Figura 8. Cariograma representando los loci que se han asociado con la pérdida de peso corporal en respuesta a una intervención
nutricional. Fuente: Adaptado de «Future Perspectives of Personalized Weight Loss Interventions Based on Nutrigenetic, Epigenetic, and
Metagenomic», Goni L et al. 2016.
Nutrigenética 9
Polimorfismo
Gen Alelo Interacción dietética Respuesta fenotípica
(SNP)
FTO rs1558902 A Alto contenido en proteína Mayor pérdida de peso
Menor reducción de insulina e
FTO rs1558902 A Bajo contenido en grasa
índice HOMA
Menor pérdida de peso y menor
TCF7L2 rs7903146 T Alto contenido en grasa
reducción índice HOMA
Mayor reducción de los niveles
de colesterol total y LDL-
LIPC rs2070895 A Bajo contenido en grasa
colesterol, y menor incremento
de HDL-colesterol
Mayor aumento de HDL-
CEPT rs3764261 C Alto contenido en grasa colesterol y mayor reducción de
los niveles de trigilicéridos
Mayor reducción de los niveles
APOA5 rs964184 G Bajo contenido en grasa de colesterol total y LDL-
colesterol
Mayor disminución de los
Alto contenido en niveles de insulina, índice
IRS1 rs2943641 C
carbohidratos HOMA y mayor reducción del
peso corporal
IL6 rs2069827 C Dieta Mediterránea Menor ganancia de peso
TFAP2B rs987237 G Alto contenido en proteína Mayor recuperación de peso
Tabla 2. Asociación Gen-Dieta-Respuesta: Algunos ejemplos de interacciones SNP-dieta implicados en respuestas fenotípicas diferentes
ante una intervención nutricional. Se han asociado varios SNPs con enfermedades crónico degenerativas comunes a través de la
interacción entre macronutrientes y micronutrientes procedentes de la dieta, o con el consumo de determinadas comidas o patrones
alimentarios.
Ahora bien, fenotipos como la fuerza muscular En este contexto, adquiere una gran importancia
o el peso varían de forma continua en la población. la correcta interpretación de los resultados genéticos.
Esto se debe principalmente a numerosos La información genética no determina la consecución
genes afectan a un mismo fenotipo y a que el inevitable de los rasgos, sino una susceptibilidad
componente genético, como hemos visto antes, relativa respecto al resto de la población (por
no es determinista en el fenotipo observado, sino ejemplo, la probabilidad de lesión). Además, esta
que se ve afectado por el ambiente. Y el ambiente susceptibilidad corresponde a un ambiente concreto
en el ámbito deportivo está constituido, entre (planificación deportiva, alimentación, fatiga…),
otros aspectos, por el entrenamiento propiamente por tanto, conocer las variables relacionadas a
dicho, el descanso y, por supuesto, la alimentación. fenotipos de interés, supone una gran ventaja a
Admitiendo que estos aspectos ya tienen por sí la hora de planificar tanto la alimentación como
mismos un componente genético, el sistema se los entrenamientos y optimizar el rendimiento
hace mucho más complejo al tener en cuenta las deportivo. En la (tabla 3) se indican algunos de los
interacciones entre ellos y el carácter dinámico de fenotipos de interés en el ámbito deportivo, así
estas interacciones. Por ejemplo, la probabilidad de como algunos genes asociados a ellos.
lesión podría aumentar considerablemente en un
atleta ya susceptible genéticamente si además está
deshidratado o fatigado.
Nutrigenética 11
Fenotipo Genes
ADBR FTO PPARG FABP2 TCF7L2 APOA2 LPL
Adiposidad
rs4994 rs9939609 rs1801282 rs1799883 rs7903146 rs5z082 rs328
Metabolismo PPARG TCF7L2 ACE
de la glucosa e
rs1801282 rs7903146 rs4646994
insulina
SOD2 CAT GPX1
Capacidad
antioxidante rs4880 rs1001179 rs1050450
VDR MTHFR
Necesidades
de vitaminas rs731236 rs1801133
Sensibilidad a CYP1A2
cafeína rs76551
Capacidad EPHX1 GSTM1 GSTT1
eliminación
rs1051740 INDEL INDEL
sustancias
nocivas
ACTN3 AGT ACE THRH
Eficiencia
muscular rs1815739 rs699 rs4646994 rs16892496
Capacidad ADBR2 PPARGC1A CRP VEGF
aeróbica y
1042713 8192678 rs1205 rs2010963
VO2max
IL6 IL6R TNF CRP
Inflamación
rs1800795 rs2228145 rs1800629 rs1205
SOD2 ACTN3
Daño muscular
rs4880 rs1815739
Resistencia VEGF COL1A1 GDF5 COL5A1
de tendones y
rs2010963 rs1800012 rs143383 rs12722
ligamentos
ACE AGT CYP1A2
Tensión
arterial rs4646994 rs699 rs76551
Tabla 3. Asociación Gen-Fenotipo: Algunos de los fenotipos de interés en el ámbito deportivo y algunos genes asociados a ellos. Fuente:
Elaboración propia.
Nutrigenética 12