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Objet et Question posée

Critiquer la Méthodologie
Analyses statistiques
Résultats

Méthodologie de la «Lecture critique


d’articles» 1 scientifiques médicaux
Cours de Méthodes quantitatives de recherche scientifique

Samuel RAPHAEL, MD-Msc1

1 Faculté de Médecine et de Pharmacie


Université d’État d’Haïti

octobre 2015

1. Lire Lecture critique d’articles en place de LCA


Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles
Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie
Identifier l’objet et la question posée
Analyses statistiques
Résultats

Plan de la présentation

1 Objet et Question posée


Identifier l’objet et la question posée
2 Critiquer la Méthodologie
Population
Schéma expérimental
Technique de randomisation
3 Analyses statistiques
Choix d’un test statistique
Risque alpha
4 Résultats
Critiquer la présentation des résultats

Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles


Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie
Identifier l’objet et la question posée
Analyses statistiques
Résultats

1 Objet et Question posée


Identifier l’objet et la question posée

2 Critiquer la Méthodologie
Population
Schéma expérimental
Technique de randomisation

3 Analyses statistiques
Choix d’un test statistique
Risque alpha

4 Résultats
Critiquer la présentation des résultats

Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles


Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie
Identifier l’objet et la question posée
Analyses statistiques
Résultats

Objectifs

1.- Savoir identifier l’objet d’un article médical


Evaluation d’une procédure diagnostique
Evaluation d’un traitement
Evaluation d’une opération de dépistage
Estimation d’un pronostic
Enquête épidémiologique. . .

2.- Savoir identifier la question posée

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Identifier l’objet et la question posée
Analyses statistiques
Résultats

Quel est l’objectif de l’étude ?

Il est fondamental d’identifier rapidement et de bien comprendre


l’objectif de l’étude. Il est généralement situé en fin d’introduc-
tion. Il doit être :
Précis
Unique sinon on définit :
L’objectif principal
Un ou des objectifs(s) secondaire(s)

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Identifier l’objet et la question posée
Analyses statistiques
Résultats

Quel est l’objectif de l’étude (suite)

L’objectif doit être :


- Pécis c’est-à-dire qu’il doit être formulé dans toutes ses com-
posantes :
Facteur ou intervention étudié (médicament, procédure
thérapeutique, test diagnostique, facteur de risque. . . )
La population d’étude
Le schéma de l’étude
Critère de jugement

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Objet et Question posée
Population
Critiquer la Méthodologie
Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Plan de la présentation

1 Objet et Question posée


Identifier l’objet et la question posée
2 Critiquer la Méthodologie
Population
Schéma expérimental
Technique de randomisation
3 Analyses statistiques
Choix d’un test statistique
Risque alpha
4 Résultats
Critiquer la présentation des résultats

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Objet et Question posée
Population
Critiquer la Méthodologie
Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Objectifs de ce chapitre

Population étudiée :
Identifier les caractéristiques de la population étudiée
Analyser les modalités de sélection des sujets, critères
d’inclusion et critères d’exclusion
Analyser la technique de randomisation
Discuter de la comparabilité des groupes soumis à
comparaison
Vérifier le choix des effectifs étudiés. S’assurer que le
choix des effectifs est identifiable dans la totalité de l’article

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Population
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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
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Objectifs de ce chapitre (suite)

Méthode :
S’assurer que la méthode employée est cohérente avec le
projet du travail, que la méthodologie est effectivement
susceptible d’apporter «une» réponse à la question posée
dans l’introduction
Vérifier le respect des règles d’éthique

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Population
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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Population d’étude

Il est important de garder en tête le schema de d’étude et


les définitions détaillées de (population cible / population
source / échantillon)

Le choix de la population source et la méthode de


sélection de l’échantillon sont importants pour :
Interpréter les résultats
Apprécier la validité externe (généralisabilité)

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Population
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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Population étudiée (suite)

Les auteurs doivent préciser (partie méthode) :


Les critères d’éligibilité (critères d’inclusion et de non
inclusion)
Critères liés au sujet : âge, sexe. . .
Critères liés à la maladie : critères diagnostiques,
comorbidités associées. . .
Les critères de non-inclusion ont généralement un objectif
de sécurité (exclusion des plus à risque)

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Analyses statistiques
Technique de randomisation
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Population étudiée (suite)

Les auteurs doivent préciser (partie méthode) :

Le mode de sélection des sujets :


Recrutement aléatoire(randomisation)
Série consécutive de patients c’est-à-dire tous les
nouveaux patients sont soumis aux critères d’éligibilité)
Sujets volontaires (sources de biais de sélection)

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Schéma expérimental
Analyses statistiques
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Population étudiée (suite)

Les auteurs doivent préciser (partie méthode) :

Le lieu de sélection :
Type de structure : hôpital (privé, public, universitaire) ou
ambulatoire
Mono- ou multicentrique (les essais multicentriques offrent
une meilleure puissance)
la période de l’étude
Le calcul du nombre de sujets nécessaire

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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Population étudiée (suite)

Dans la partie résultats, les auteurs doivent :


Décrire le devenir des sujets de l’échantillon : idéalement
représenté par un diagramme de flux
Comparer les groupes (généralement sous forme de
tableau) :
Il est normal de retrouver 2 groupes similaires en tous
points. Pour certains auteurs, il n’est pas utile de réaliser
des tests statistiques de comparaison à cette étape. En
effet, si les groupes sont significativement différents pour
une variable et si la randomisation a été bien faite, cela
peut être simplement dû au hasard.

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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
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Quel schéma d’étude choisir ?

Pour une même question, on pourra envisager plusieurs


schémas expérimentaux

Certains sont meilleurs que d’autres pour répondre au


mieux à l’objectif de l’étude

Voyons le tableau suivant 2 qui présente les différents


plans expérimentaux en fonction de l’objet de l’étude

2. source : ANAES
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Population
Critiquer la Méthodologie
Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
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Tableau résumé

Objet de l’article Type de questions


- Évaluer la validité d’un test diagnostique
par rapport au gold standard
Évaluation d’une
procédure diag- - Comparer plusieurs tests diagnostiques
nostique
- Comparer un test sur plusieurs popula-
tions
Estimation d’un - Évaluer l’évolution (complications, survie
pronostic ou récidive...) d’un groupe de malades

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Critiquer la Méthodologie
Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Tableau résumé

Objet de l’article Type de questions


Évaluation d’une - Évaluer l’efficacité d’un programme de dé-
opération de dé- pistage (sur l’incidence et le taux de morta-
pistage lité d’une maladie)
- Décrire une population (incidence, préva-
lence d’une maladie) : épidémiologie des-
criptive
- Déterminer si un facteur d’exposition (fac-
Enquête épidé-
teur de risque) est responsable d’une ma-
miologique
ladie : épidémiologie analytique

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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
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Technique de randomisation

Les techniques de randomisation doivent être décrites en


détail

Les participants doivent être assignés dans les groupes de


l’essai sur la base d’un processus aléatoire (au hasard)
caractérisé par l’imprévisibilité
Générer la séquence de randomisation soit sur une liste de
nombres générés par ordinateur soit des tables de
nombres aléatoires
Garantir l’imprévisibilité

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Schéma expérimental
Analyses statistiques
Technique de randomisation
Résultats

Technique de randomisation (suite)

Randomisation restreinte
Randomisation par blocs : permet d’équilibrer le nombre
de sujets par groupe
Randomisation stratifiée : permet d’équilibrer les groupes
à comparer au sein de strates

Attention
Il ne faut pas confondre recrutement aléatoire des patients (ti-
rage au sort au sein de la population source), possible pour les
enquêtes épidémiologiques, et l’allocation aléatoire des traite-
ments, possible uniquement pour les études expérimentales !

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Plan de la présentation

1 Objet et Question posée


Identifier l’objet et la question posée
2 Critiquer la Méthodologie
Population
Schéma expérimental
Technique de randomisation
3 Analyses statistiques
Choix d’un test statistique
Risque alpha
4 Résultats
Critiquer la présentation des résultats

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Objectifs de ce chapitre

1 Vérifier si les analyses statistiques sont cohérentes avec le


projet du travail

2 Discuter leur interprétation en fonctions des notions


élémentaires acquises en 1er et en 2ème cycle

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Comment choisir les tests statistiques pour analyser


les données ?
Justification

Le choix d’un test statistique dépend de :


(Prenons un exemple : une statine A (hypolipémiant) versus sta-
tine de référence B en prévention secondaire de l’IDM)
La nature de la variable qu’on cherche à expliquer
(outcome ou critère de jugement) :
Qualitative (ex. : récidive d’IDM : oui/non)
Quantitative (ex. : taux de LDL)

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Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Comment choisir les tests statistiques pour analyser


les données ?
Justification

Le choix d’un test statistique dépend de :


La nature des variables explicatives :
Qualitative (ex. : statine A ou B, fumeur : oui/non)
Quantitative (ex. : âge, tension artérielle. . . )
Le type de séries à comparer :
Appariés (ex. : mesure du taux de LDL chez le même
patient avant et après traitement A)
Indépendantes (ex. : comparaison du LDL entre 2 groupes
de patients différents : ceux ayant reçu A et ceux ayant reçu
B)

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Comment choisir les tests statistiques pour analyser


les données ? (suite)
La taille de l’échantillon
La distribution des variables (ex. : la variable LDL
suit-elle une loi normale ?)
Analyse de données de survie :
C’est s’intéresser à la survenue d’un évènement (décès au
cours du temps
Ces analyses prennent en compte 2 paramètres : des
durées de suivi différentes selon les sujets, l’existence de
données censurées
Les données peuvent être censurées : date de survenue de
l’évènement n’est pas connue pour tous les sujets (ex. :
pour les sujets non décédés en fin d’étude, on ne connait
pas leur date de décès)
Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles
Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Comment choisir les tests statistiques pour analyser


les données ? (suite)

Les analyses peuvent être :

Univariées => une seule variable explicative pour la variable


à expliquer (ex. : la fréquence de récidive d’un IDM est-elle
différente suivant que les patients ait reçu la statine A ou B)
Multivariées => prise en compte de plusieurs variables ex-
plicatives (la fréquence de récidive d’un IDM est-elle diffé-
rente suivant que l’on ait reçu A ou B si l’on tient compte de
l’âge, de la TA et des autres facteurs de risque)

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Analyse univariée (séries indépendantes)


Variable à expliquer Variable explicative Test
Qualitative (IDM) Quantitative (Age) Comparaison de moyennes
(Analyse de variance)*
Qualitative (IDM) Qualitative (traitement) Test du Chi2**

Quantitative (LDL) Quantitative (Age) Coeff de corrélation


de Pearson***
Quantitative(LDL) Qualitative (traitement) Comparaison de moyennes
(Analyse de variance)*

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

* Test classique pour comparer 2 moyennes : test de Student


(conditions d’application : distribution normale des variables,
égalité des variances) : Test de Mann Whitney
Pour comparer plus de 2 moyennes : Analyse de variance
(ANOVA)avec les mêmes conditions d’application ; sinon test
de Kruskal Wallis

** Conditions d’application du test : effectifs théoriques >5 ;


sinon test de Fisher

***Conditions d’application du test : distribution normale des


variables ; sinon : coefficient de corrélation de Spearman

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Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Analyse multivariée
(séries indépendantes)
Variable à expliquer Variable explicative Modèle multivarié
Quantitative (LDL) Qualitatives/Quantitatives Régression linéaire
Qualitative (IDM) Quantitatives/Qualitatives Régression logistique

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Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Séries appariées
(données chez un même patient : variable avant et après traitement)
Variable Test
Qualitatives (2 classe) Test de MacNemar (Chi2 apparié)
Quantitative (distribution normale) Test apparié
Quantitative (non normale) Test de Wilcoxon apparié

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Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Analyse de données censurées :


Analyse de survie(ex : risque de survenue d’un IDM
Analyse univariée
(ex : étude du risque de survenue d’IDM) Comparaison des courbes de
en fonction du traitement recu survie par le test du log rank
Analyse Multivariée
(prise en compte d’autres variables : Modèle de survie de Cox
âge, sexe, autres FDR...

Les analyses de survie et les courbes de survie (c’est-à-dire


par exemple la représentation du risque de survenue de l’IDM
en fonction du temps) peuvent être réalisés par la méthode de
Kaplan-Meier ou la méthode actuarielle

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Test unilatéral ou bilatéral ?

Rappel
test bilatéral
- H0 : A = B
- H1 : A 6= B
test unilatéral
- H1 : A > B (ou H1 : B > A)

Les tests utilisés sont généralement bilatéraux


Utiliser un test unilatéral augmente la puissance de l’étude
et donc diminue le nombre de sujets à inclure
Mais le choix d’un test unilatéral doit être justifié (il faut être
certain que A > B

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Objet et Question posée
Critiquer la Méthodologie Choix d’un test statistique
Analyses statistiques Risque alpha
Résultats

Inflation du risque alpha

Il faut se méfier des analyses trop nombreuses


Multiplier les analyses augmente le risque d’observer
un résultat significatif dû au hasard (= « inflation du
risque de 1ère espèce alpha»
Ce problème peut survenir à plusieurs niveaux : multiplicité
des critères de jugement, analyses en sous-groupe, ana-
lyses intermédiaires
Pour y remédier : Diminuer le seuil de significativité des
tests (ex : choisir un seuil de significativité à 0.01 plutôt
que 0.05)
En pratique, le seuil de significativité est très rarement
abaissé

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Critiquer la Méthodologie
Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Plan de la présentation

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Identifier l’objet et la question posée
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Technique de randomisation
3 Analyses statistiques
Choix d’un test statistique
Risque alpha
4 Résultats
Critiquer la présentation des résultats

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Critiquer la Méthodologie
Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Objectifs

1 Savoir analyser la présentation, la précision et la lisibilité


des tableaux et des figures, leur cohérence avec le texte et
leur utilité

2 Vérifier la présentation des indices de dispersion (valeurs


extrêmes, quantiles, écarts-types) des données numériques,
et celle de l’imprécision des estimations (moyennes, risque,
taux de guérison, rapport de cotes. . . )

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Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Généralités

Les données peuvent être présentées de plusieurs façons

Les tableaux et figures permettent de donner un maximum


d’information sur une forme synthétique et claire

Ils doivent pouvoir se lire isolément :


Un titre informatif
Une légende explicative
Une taille raisonnable
Pas d’abréviations ou sinon elles doivent être expliquées

Leur présentation obéit à des règles standard

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Critiquer la Méthodologie
Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Pour un tableau

Pour les variables :


Les effectifs sont-ils systématiquement présentés ?
La variabilité est-elle systématiquement présentée ?
(écart-type, intervalle de confiance. . . )
Redondance ?

Utilité du tableau ?

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Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Pour une figure

Courbe de survie, histogramme, boxplot, etc. . .


Axes de la figure
Sont-ils légendés
Les échelles et unités sont-elles indiquées ?
S’il y a plusieurs figures, ont-elles la même présentation ?

La variabilité est-elle présentée ? (écart-type, intervalle de


confiance)

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Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Indices de dispersion

Les indices de dispersion permettent de caractériser la


variation des observations autour de la valeur centrale

Il s’agit le plus souvent de l’écart-type et l’intervalle de


confiance

L’écart-type est un indice qui caractérise la dispersion


d’une distibution normale, autour de sa moyenne
La variance est le carré de l’écart-type. C’est la somme
des carrés des écarts à la moyenne

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Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Indices de dispersion (suite)

Intervalle de confiance(IC) :
Pour chaque paramètre estimé (RR, OR), les auteurs doivent
fournir l’IC (généralement à 95% c’est-à-dire au risque α =
95%)

C’est l’intervalle de valeurs qui inclut la vraie valeur du


paramètre avec une probabilité de 0.95

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Présentation des résultats
Analyses statistiques
Résultats

Indices de dispersion (suite)

D’autres indices de dispersion peuvent être utilisés

Valeurs extrêmes (minimum et maximum)

Quantiles Ex. :
les quartiles
les quintiles
les déciles

Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles


Annexe Pour des lectures supplémentaires

Pour des lectures supplémentaires

Anne Jolivet
Santé Publique
Vernazobres-Grego, 2007
G. Bordage
Considerations on Preparing a Paper for Publication,
Teaching and Learning in Medicine.
Ann intern Medicine, 1(1), 47-52, 2000.
Marius Fieschi, Roch Giorgi, Joanny Gouvernet,
Gilles Bouvenot
Introduction à la lecture critique d’articles médicaux et
scientifiques.

Samuel RAPHAEL Lecture critique d’articles