Fundamentos Químicos PDF

6/2/2020 Fundamentos Químicos
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CAPÍTULO
norte norte
norte FeII
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norte
F
norte
norte Fe
F
II
PAG
norte
norte norte
F
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norte FeII norte
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2
norte norte norte norte
Químico
norte FeII norte norte FeII norte
norte norte norte norte

norte norte
norte FeII norte
norte norte
Catenane "Estrella de David". Dos anillos triplemente entrelazados compuestos de

Cimientos
El carbono, el hidrógeno y el nitrógeno están unidos entre sí con el hierro puente.
átomos a través de una compleja ruta química sintética para cruzarse entre sí seis
veces y formar un hexagrama (estrella de seis puntas). La estructura química es
indicado a la izquierda, donde los dos anillos independientes son de color azul
y naranja A la derecha está determinada la estructura tridimensional.
por cristalografía de rayos X con los átomos de carbono de un anillo en azul y
el otro gris claro; los hierros son rosados y los nitrógenos morados. En el centro
es un hexafluoruro de fósforo cargado negativamente y no covalentemente
(cian y verde). Ver DA Leigh, RG Pritchard y AJ Stephens, 2014,
Nature Chem. 6 : 978–982.
La vida de una célula depende de miles de interacciones químicas. y prosperar? Uno de los objetivos de la biología celular molecular es
acciones y reacciones exquisitamente coordinadas entre sí responda estas y otras preguntas sobre la estructura y
en tiempo y espacio, influenciado por las instrucciones genéticas de la célula función de las células y organismos en términos de las propiedades de
y su entorno Al comprender estas interacciones y Moléculas e iones individuales.
reacciones a nivel molecular, podemos comenzar a responder diversión Por ejemplo, las propiedades de una de esas moléculas, agua,
preguntas fundamentales sobre la vida celular: ¿Cómo funciona una célula controla la evolución, estructura y función de todas las células. Un
nutrientes del tracto e información de su entorno? Cómo la comprensión de la biología no es posible sin una apreciación
Cómo convierte una célula la energía almacenada en nutrientes en Cómo las propiedades del agua controlan la química de la vida.
trabajo de movimiento o metabolismo? ¿Cómo se transmite una célula? La vida surgió primero en un ambiente acuoso. Constituyendo 70–80
formar nutrientes en los componentes celulares necesarios para su porcentaje de la mayoría de las células en peso, el agua es la más abundante
¿supervivencia? ¿Cómo se une una célula a otras células para formar molécula en sistemas biológicos. Está dentro de este acuoso
¿en cuestión? ¿Cómo se comunican las células entre sí? medio que pequeñas moléculas e iones, que forman alrededor
que se puede desarrollar un organismo complejo y eficientemente funcional 7 por ciento del peso de la materia viva, se combinan en el
CONTORNO
2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 2.3 Reacciones químicas y equilibrio químico
2.2 Bloques de construcción químicos de células 2.4 Energética bioquímica
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(a) Complementariedad molecular (b) Bloques de construcción químicos
Proteína A
CH 3 O
H
C CH 3 Polimerización
No covalente
O norte CH 3
H CH 3 O interacciones
H CH 3
O C
O
CH 3
C
Proteína B
Macromolécula
(c) Equilibrio químico (d) Energía de enlace químico
"Energia alta" γ
fosfoanhídrido
cautiverio
β
kf ADP + P i + Energía
kr α
kf
K eq
kr Adenosina
trifosfato
(ATP)
FIGURA 2 1 Química de la vida: cuatro conceptos clave. (a) Molecular entre los reactivos de partida ( izquierda ) y los productos de las reacciones ( derecha )
la complementariedad se encuentra en el corazón de todas las interacciones biomoleculares (ver depende de las constantes de velocidad de avance ( k f , flecha superior) y retroceso
Sección 2.1), como cuando dos proteínas con formas complementarias y quimicos ( k r , flecha inferior) reacciones. La relación de estos, K eq , proporciona una información
Las propiedades iónicas se unen para formar un complejo estrechamente unido. (b) Pequeño medida de las cantidades relativas de productos y reactivos que serán
Las moléculas sirven como bloques de construcción para estructuras más grandes (ver Sección 2.2). presente en equilibrio (ver Sección 2.3). (d) En muchos casos, la fuente de
Por ejemplo, para generar el ADN de la macromolécula portadora de información, La energía para las reacciones químicas en las células es la hidrólisis de la molécula ATP
cuatro pequeños bloques de construcción de nucleótidos están unidos covalentemente en largas cadenas
(Ver Sección 2.4). Esta energía se libera cuando un fosfato de alta energía
(polímeros), que luego se envuelven entre sí para formar la doble hélice. el enlace hidruro que une los fosfatos de byg en la molécula de ATP (rojo) es
(c) Las reacciones químicas son reversibles y la distribución de los productos químicos. roto por la adición de una molécula de agua, formando ADP y P i .
macromoléculas más grandes y ensambles macromoleculares que la masa de la molécula de ADN en el cromosoma 1 humano es
conforman la maquinaria y la arquitectura de una célula y por lo tanto 8.6 × 10 10 veces la de un protón!). La interacción química
masa restante de organismos. Estas pequeñas moléculas incluyen de todas estas moléculas, grandes y pequeñas, con agua y
aminoácidos (los componentes básicos de las proteínas), nucleótidos el uno con el otro define la naturaleza de la vida.
(los bloques de construcción de ADN y ARN), lípidos (el edificio Afortunadamente, aunque muchos tipos de biomoléculas interactúan y
bloques de biomembranas) y azúcares (los bloques de construcción de reaccionar en numerosas y complejas vías para formar funcional
hidratos de carbono complejos). células y organismos, un número relativamente pequeño de sustancias químicas
Muchas de las biomoléculas de la célula (como los azúcares) fácilmente Los principios son necesarios para comprender los procesos celulares en el momento
disolver en agua; estas moléculas se denominan hidro- nivel lecular (Figura 2-1). En este capítulo, revisamos estas claves
philic ("gusto por el agua"). Otros (como el colesterol) son aceitosos, principios, algunos de los cuales ya conoces bien. Empezamos
sustancias grasas que evitan el agua; se dicen estas moléculas con los enlaces covalentes que conectan átomos en moléculas
ser hidrofóbico ("miedo al agua"). Todavía otras biomoléculas y las interacciones no covalentes que estabilizan grupos de átomos
(como los fosfolípidos) contienen hidrofílicos e hidro- dentro y entre moléculas. Luego consideramos lo básico
regiones fóbicas; se dice que estas moléculas son anfipáticas bloques de construcción químicos de macromoléculas y macromolec-
o anfifílico ("ambos me gusta"). El buen funcionamiento de asambleas ulares. Después de revisar esos aspectos de la química química
células, tejidos y organismos dependen de todas estas moléculas, librio que son más relevantes para los sistemas biológicos, terminamos
desde el más pequeño hasta el más grande. De hecho, la química de la el capítulo con los principios básicos de la energía bioquímica,
El protón simple (H + ) puede ser tan importante para la supervivencia de incluyendo el papel central de ATP (trifosfato de adenosina) en
una célula humana como la de cada molécula de ADN gigantesca (la capturando y transfiriendo energía en el metabolismo celular.
32 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos
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2.1 Bonos covalentes y no covalentes biomoléculas orgánicas, cada carbono generalmente se une a tres
u otros cuatro átomos. [El carbono también puede unirse a otros dos
Interacciones átomos, como en la molécula lineal de dióxido de carbono, CO 2 , que
Las fuerzas atractivas fuertes y débiles entre los átomos son las tiene dos enlaces dobles carbono-oxígeno (O = C = O); sin embargo,
"Pegamento" que mantiene unidas moléculas individuales y per- tales arreglos de enlace de carbono no se encuentran en biologi-
Mits interacciones entre diferentes moléculas. Cuando dos cal bloques de construcción.] Como se ilustra en la Figura 2-3a para la forma-
los átomos comparten un solo par de electrones, el resultado es un covalente aldehído, el carbono puede unirse a tres átomos, todo en común
enlace: un tipo de fuerza fuerte que mantiene unidos a los átomos avión. El átomo de carbono forma dos enlaces simples con dos
moléculas. Compartir múltiples pares de electrones da como resultado átomos y un doble enlace (dos pares de electrones compartidos) con
enlaces covalentes múltiples (por ejemplo, enlaces "dobles" o "triples"). El tercer átomo. En ausencia de otras restricciones, los átomos
Las débiles fuerzas atractivas de las interacciones no covalentes son unidos por un enlace simple generalmente pueden girar libremente alrededor
igualmente importante para determinar las propiedades y funciones el eje de enlace, mientras que los conectados por un doble enlace
iones de biomoléculas como proteínas, ácidos nucleicos, carbohidratos no puedo. La rígida planaridad impuesta por los dobles enlaces tiene
hidratos y lípidos. En esta sección, primero revisamos covalente enorme importancia para las formas y flexibilidad de bio-
bonos y luego discutir los cuatro tipos principales de no covalente moléculas como fosfolípidos, proteínas y ácidos nucleicos.
interacciones: enlaces iónicos, enlaces de hidrógeno, van der Waals El carbono también puede unirse a cuatro en lugar de a tres átomos. Como
interacciones y el efecto hidrofóbico. ilustrado por metano (CH 4 ), cuando el carbono está unido a cuatro
otros átomos, el ángulo entre dos enlaces cualesquiera es 109.5 °, y
Las posiciones de los átomos unidos definen los cuatro puntos de un
La estructura electrónica de un átomo tetraedro (Figura 2-3b). Esta geometría define la estructura
Determina el número y la geometría Tures de muchas biomoléculas. Un átomo de carbono (o cualquier otro)
de los enlaces covalentes que puede hacer unidos a cuatro átomos o grupos diferentes en un plano no plano
Hidrógeno, oxígeno, carbono, nitrógeno, fósforo y sulfuro.

Las pieles son los elementos más abundantes en las moléculas biológicas.
(a) formaldehído
Estos átomos, que rara vez existen como entidades aisladas, fácilmente
forman enlaces covalentes, utilizando electrones en los electrones más externos
orbitales tron que rodean sus núcleos (figura 2-2). Como una regla, H O
cada tipo de átomo forma un número característico de covalente C O

H C ~ 120 °
se une con otros átomos. Estos enlaces tienen un bien definido H
geometría determinada por el tamaño del átomo y tanto por la dis-

H
contribución de electrones alrededor del núcleo y el número
de electrones que puede compartir. En algunos casos, el número de
los enlaces covalentes estables que puede formar un átomo son fijos; carbono, para
(b) metano
ejemplo, siempre forma cuatro enlaces covalentes. En otros casos, H
son posibles diferentes números de enlaces covalentes estables; para H
109,5
Por ejemplo, el azufre puede formar dos, cuatro o seis covalentes estables
H C H C
cautiverio. H H
Todos los componentes biológicos están organizados alrededor H H
El átomo de carbono, que forma cuatro enlaces covalentes. En estos

Químico Bola y palo Relleno de espacio
estructura modelo modelo
Enlace covalente
Electrones FIGURA 2 3 Geometría de enlaces cuando el carbono es covalentemente
H
vinculado a otros tres o cuatro átomos. (a) Un átomo de carbono puede ser
H unido a tres átomos, como en formaldehído (CH 2 O). En este caso, el
los electrones de enlace de carbono participan en dos enlaces simples y uno
H
doble enlace, que todos se encuentran en el mismo plano. A diferencia de los átomos conectados
+ por un enlace simple, que generalmente puede girar libremente alrededor del eje del enlace,
C C H
H
los conectados por un doble enlace no pueden. (b) Cuando un átomo de carbono
H
H forma cuatro enlaces simples, como en el metano (CH 4 ), los átomos unidos (todos
H en este caso) están orientados en el espacio en forma de tetraedro. los
Metano las representaciones de letras a la izquierda indican claramente la composición atómica
H
posición de cada molécula y su patrón de unión. La bola y el palo
Los modelos en el centro ilustran la disposición geométrica de los átomos.
FIGURA 2 2 Los enlaces covalentes se forman al compartir electrones. y enlaces, pero los diámetros de las bolas que representan los átomos y
Enlaces covalentes, las fuerzas fuertes que mantienen unidos a los átomos sus electrones no adherentes son poco realistas en comparación con
moléculas, se forman cuando los átomos comparten electrones desde sus extremos las longitudes de enlace. El tamaño de las nubes de electrones en el espacio
orbitales de electrones. Cada átomo forma un número definido y una geometría de Los modelos de la derecha representan con mayor precisión la estructura en tres
enlaces covalentes dimensiones.
2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 33
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TABLA 2 1 Propiedades de unión de los átomos más

Espejo
Abundante en biomoléculas
COO - COO -
Átomo y Numero usual Típico

Electrones externos de enlaces covalentes Geometría de enlace
H 1 H
H Cα + H Cα +
NH 3 NH 3
O 2 O
S 2, 4 o 6 S
R R
Isómero D Isómero L norte 3o4 norte
PAG 55 PAG
FIGURA 2 4 Estereoisómeros . Muchas moléculas en las células contienen en
al menos un átomo de carbono asimétrico. La orientación tetraédrica de
los enlaces formados por un átomo de carbono asimétrico se pueden organizar en C 44 C
espacio tridimensional de dos formas diferentes, produciendo moléculas
que son imágenes especulares o estereoisómeros entre sí. Aquí se muestra
La estructura común de un aminoácido, con su asimétrica central
carbono y cuatro grupos adjuntos, incluido el grupo R, discutido en interacciones no covalentes El azufre forma dos enlaces covalentes
Sección 2.2. Los aminoácidos pueden existir en dos formas de imagen especular, designadas en sulfuro de hidrógeno (H 2 S), pero puede acomodar seis covalente
NATed L y D . Aunque las propiedades químicas de tales estereoisómeros
enlaces, como en el ácido sulfúrico (H 2 SO 4 ) y sus derivados de sulfato.
son idénticos, sus actividades biológicas son distintas. Solo L aminoácidos
El nitrógeno y el fósforo tienen cinco electrones para compartir.
se encuentran en las proteínas
En el amoníaco (NH 3 ), el átomo de nitrógeno forma tres covalentes.
cautiverio; el par de electrones alrededor del átomo no involucrado en
Se dice que la configuración es asimétrica. El orificio tetraédrico un enlace covalente puede participar en interacciones no covalentes.
En el ion amonio (NH 4 + ), el nitrógeno forma cuatro cova-
vinculación de enlaces formados por un átomo de carbono asimétrico
se puede organizar en un espacio tridimensional en dos diferentes enlaces prestados, que tienen una geometría tetraédrica. Fósforo
formas, produciendo moléculas que son imágenes especulares de cada comúnmente forma cinco enlaces covalentes, como en el ácido fosfórico
otro, una propiedad llamada quiralidad ("entrega", del (H 3 PO 4 ) y sus derivados de fosfato, que forman la parte posterior
Palabra griega cheir , que significa "mano") (Figura 2-4). Tal mol- hueso de ácidos nucleicos. Grupos fosfato unidos covalentemente
los ecules se llaman isómeros ópticos o estereoisómeros . Muchos a las proteínas juegan un papel clave en la regulación de la actividad de muchos
Las moléculas en las células contienen al menos un carbono asimétrico proteínas y la molécula central en la energía celular,
átomo, a menudo llamado átomo de carbono quiral . Los diferentes ste- ATP, contiene tres grupos fosfato (ver Sección 2.4).
Los reformistas de una molécula generalmente tienen diferencias completamente Un resumen de enlaces covalentes comunes y funcionales
actividades biológicas entrantes porque la disposición de los átomos grupos, que confieren propiedades químicas distintivas a la
dentro de sus estructuras y, por lo tanto, su capacidad de interactuar con Las moléculas de las que forman parte se proporcionan en la Tabla 2-2.
otras moléculas, difiere.
Algunas drogas son mezclas de estereoisómeros de pequeños

Los electrones se pueden compartir de manera igual o desigual
moléculas en las que solo un estereoisómero tiene el bio- en enlaces covalentes
Actividad lógica de interés. El uso de un solo estereoiso puro El alcance de la capacidad de un átomo para atraer un electrón se llama
mer del químico en lugar de la mezcla puede resultar en un Su electronegatividad . En un enlace entre átomos con identi-
fármaco más potente con efectos secundarios reducidos. Por ejemplo, uno Cal o electronegatividades similares, los electrones de enlace son
estereoisómero del fármaco antidepresivo citalopram (Celexa) esencialmente compartido por igual entre los dos átomos, como es
Es 170 veces más potente que el otro. Algunos estereoisómeros el caso de la mayoría de los enlaces simples carbono-carbono (CJC) y
tienen actividades muy diferentes Darvon es un analgésico, enlaces simples carbono-hidrógeno (CJH). Tales enlaces se llaman
mientras que su estereoisómero, Novrad ( Darvon deletreó de nuevo- no polar . En muchas moléculas, sin embargo, los átomos unidos
sala), es un supresor de la tos. Un estereoisómero de ketamina tienen diferentes electronegatividades, lo que resulta en un enfoque desigual
es un anestésico, mientras que el otro causa alucinaciones. ■ ing de electrones. Se dice que el vínculo entre ellos es polar .
Un extremo de un enlace polar tiene una carga negativa parcial
Los números típicos de enlaces covalentes formados por otros (δ J ), y el otro extremo tiene una carga positiva parcial (δ + ). En
Los átomos comunes en las biomoléculas se muestran en la Tabla 2-1. un enlace OJH, por ejemplo, la mayor electronegatividad de
Un átomo de hidrógeno forma solo un enlace covalente. Un átomo el átomo de oxígeno en relación con el átomo de hidrógeno da como resultado
de oxígeno generalmente forma solo dos enlaces covalentes pero tiene los electrones pasan más tiempo alrededor del átomo de oxígeno que
dos pares adicionales de electrones que pueden participar en alrededor del hidrógeno. Por lo tanto, el enlace OJH posee un
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TABLA 2 2 Grupos funcionales comunes y enlaces en biomoléculas
Grupos funcionales
O O O
OH
Hidroxilo
C R C CO
Acilo Carbonilo Carboxilo
(alcohol)
(triacilglicerol) (cetona) (ácido carboxílico)
O
O O
O PAG O
SH NH 2 o NH 3 O PAG O PAG
Sulfhidrilo O
Aminado O O
Fosfato
(tiol) Pirofosfato
(aminas)
(fosforilada
(difosfato)
molécula)
Enlaces
O O
C O C
COC CAROLINA DEL NORTE
Éter
Ester Amida
dipolo eléctrico , una carga positiva separada de una igual pero

carga negativa opuesta. La cantidad de δ + carga en el
O -
El átomo de oxígeno de un dipolo O-H es aproximadamente del 25 por ciento δ- δ-
la de un electrón, y hay un equivalente y opuesto
Dipolo
δ + carga en el átomo de H. Una medida cuantitativa común momento
del grado de separación de carga, o fuerza, de un dipolo es δ+
H H
δ+
104.5 ° +
llamado momento dipolar , μ, que para un enlace químico es el
producto de la carga parcial en cada átomo y la distancia
entre los dos átomos Para una molécula con dipolos múltiples, FIGURA 2 5 La naturaleza dipolar de una molécula de agua. El símbolo
δ representa una carga parcial (una carga más débil que la de un
la cantidad de separación de carga para la molécula en su conjunto
depende en parte de los momentos dipolares de todos sus individuos electrón o un protón). Debido a la diferencia en el electronegativi-
Lazos de H y O, cada uno de los enlaces polares de H-O en el agua es un dipolo. los
enlaces químicos y en parte sobre la geometría de la molécula
los tamaños y las direcciones de los dipolos de cada uno de los enlaces determinan la
(las orientaciones relativas de los momentos dipolares individuales).
distancia neta y cantidad de separación de carga, o momento dipolar, de
Considere el ejemplo del agua (H 2 O), que tiene dos
la molécula
Enlaces O-H y, por lo tanto, dos momentos dipolo de enlace individual.
Si el agua fuera una molécula lineal con los dos enlaces exactamente
moléculas de agua y con moléculas de otros tipos. Estas
lados opuestos del átomo de O, los dos dipolos en cada extremo de
las interacciones juegan un papel crítico en casi todos los productos bioquímicos
la molécula sería idéntica en fuerza pero sería ori-
interacción en células y organismos, como veremos en breve.
ented en direcciones opuestas. Los dos momentos dipolares serían
Otro ejemplo importante de polaridad es el O = P
cancelarse entre sí, y el momento dipolar de la molécula como un
doble enlace en H 3 PO 4 . En la estructura de H 3 PO 4 que se muestra en
todo sería cero. Sin embargo, porque el agua tiene forma de V
a la izquierda debajo, las líneas representan enlaces simples y dobles y
molécula, con los dipolos individuales de sus dos enlaces O-H
los electrones no enlazantes se muestran como pares de puntos (cada punto
ambos apuntando hacia el oxígeno, un extremo del molde de agua
representa un electrón):
ecule (el final con el átomo de oxígeno) tiene un negativo parcial
carga y el otro extremo (el que tiene los dos hidrógeno
H H
átomos) tiene una carga positiva parcial. Como consecuencia, el
la molécula en su conjunto es un dipolo con un dipolo bien definido O O
momento (Figura 2-5). Este momento dipolar y el electrónico
H O PAG O H H O PAG O H
Las propiedades de los átomos de oxígeno e hidrógeno permiten que el agua
O O
para formar interacciones electrostáticas no covalentes con otros
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FIGURA 2 6 Energías relativas de covalente Interacciones no covalentes Enlaces covalentes

enlaces e interacciones no covalentes. Enlace
las energías se definen como la energía requerida para
romper un tipo particular de vinculación Se muestra aquí van der Hidrógeno
son las energías requeridas para romper una variedad Waals cautiverio
de enlaces, dispuestos en una escala logarítmica. Covalente
Térmico Hidrólisis de ATP
bonos, incluidos simples (C − C) y dobles energía enlace fosfoanhídrido C C
C C
(C = C) enlaces carbono-carbono, son uno o dos
poderes de 10 más fuertes que los no covalentes
comportamiento. Las interacciones no covalentes tienen energías.
algo mayor que la energía térmica de 0.24 2,4 24 240
el ambiente a temperatura ambiente normal kcal / mol
(25 ° C) Muchos procesos biológicos están acoplados
a la energía liberada durante la hidrólisis de un
Incremento de la fuerza de unión
enlace fosfoanhídrido en ATP.
Debido a la polaridad del doble enlace O = P, H 3 PO 4 puede a temperaturas fisiológicas (25–37 ° C), múltiples no
También estar representado por la estructura de la derecha, en la que Las interacciones de valent pueden, como veremos, actuar juntas para promover
uno de los electrones del enlace doble P = O tiene accu- duce asociaciones altamente estables y específicas entre diferentes
mulado alrededor del átomo de O, dándole una carga negativa y partes de una molécula grande o entre diferentes macromol
dejando el átomo P con una carga positiva. Estos cargos son ecules Interacciones proteína-proteína y proteína-ácido nucleico
importante en interacciones no covalentes. Ninguno de estos dos son buenos ejemplos de tales interacciones no covalentes. Abajo,
los modelos describen con precisión el estado electrónico de H 3 PO 4 . los revisamos los cuatro tipos principales de interacciones no covalentes
la estructura real se puede considerar como intermedia, o y luego considerar sus roles en la unión de biomoléculas
híbrido, entre estas dos representaciones, como lo indica el uno al otro y a otras moléculas.
la flecha de doble punta entre ellos. Tal intermedio
Las estructuras se denominan híbridos de resonancia .
Las interacciones iónicas son atracciones entre
Iones con carga opuesta
Los enlaces covalentes son mucho más fuertes y más Las interacciones iónicas resultan de la atracción entre un posi-
Estable que las interacciones no covalentes iones cargados positivamente (un catión) y un ión cargado negativamente
Los enlaces covalentes se consideran fuertes porque el ion: un anión . En cloruro de sodio (NaCl), por ejemplo, el
las energías necesarias para romperlas son mucho mayores que las el electrón de unión aportado por el átomo de sodio es com-
energía térmica disponible a temperatura ambiente (25 ° C) o transferido completamente al átomo de cloro (Figura 2-7a). diferente a
temperatura corporal (37 ° C). Como consecuencia, son stan enlaces covalentes, las interacciones iónicas no tienen fijas o espectrales
ble a estas temperaturas. Por ejemplo, la energía térmica. orientaciones geométricas específicas porque el campo electrostático
disponible a 25 ° C es aproximadamente 0.6 kilocalorías por mol alrededor de un ion, su atracción por una carga opuesta, es uni-
(kcal / mol), mientras que la energía requerida para romper el C - C forma en todas las direcciones. En NaCl sólido, iones con carga opuesta
el enlace en etano es aproximadamente 140 veces más grande (Figura 2-6). Estafa- empacar firmemente en un patrón alterno, formando el
secuencialmente, a temperatura ambiente (25 ° C), menos de 1 en 10 12 matriz cristalina altamente ordenada, o enrejado, que es típico de
las moléculas de etano se dividen en un par de moléculas · CH 3 , cristales de sal (Figura 2-7b). La energía requerida para romper un
cada uno contiene un electrón no emparejado, no enlazante (llamado la interacción iónica depende de la distancia entre los iones
radical). y las propiedades eléctricas del medio ambiente de los iones.
Los enlaces simples covalentes en moléculas biológicas tienen Cuando las sales sólidas se disuelven en agua, los iones se separan de
energías similares a la energía del enlace C - C en etano. uno al otro y se estabilizan por sus interacciones con
Porque se comparten más electrones entre los átomos en doble moléculas de agua. En soluciones acuosas, iones simples de biología
enlaces, requieren más energía para romperse que los enlaces individuales. significancia ical, como Na + , K + , Ca 2+ , Mg 2+ y Cl - , son
Por ejemplo, se necesitan 84 kcal / mol para romper una sola C - O hidratado , rodeado por una capa estable de moléculas de agua
enlace pero 170 kcal / mol para romper un enlace doble C = O. los sostenido en su lugar por interacciones iónicas entre el ion en el centro
los enlaces dobles más comunes en las moléculas biológicas son ter y los extremos con carga opuesta de las moléculas de agua,
C = O, C = N, C = C y P = O. que son dipolos (Figura 2-7c). La mayoría de los compuestos iónicos dis-
En contraste, la energía requerida para romper no covalente resolver fácilmente en agua porque la energía de hidratación:
las interacciones son solo de 1 a 5 kcal / mol, mucho menos que el enlace energía liberada cuando los iones se unen fuertemente a las moléculas de agua y
energías de enlaces covalentes (ver Figura 2-6). De hecho, no extendido en una solución acuosa, es mayor que la red
las interacciones valent son lo suficientemente débiles como para estar constantemente
energía que estabiliza la estructura cristalina. Partes o todas las
siendo formado y roto a temperatura ambiente. A pesar de que la capa de hidratación acuosa debe eliminarse de los iones en solución
Estas interacciones son débiles y tienen una existencia transitoria. ción cuando interactúan directamente con las proteínas. Por ejemplo,
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(un) (si) (C)
H2O
+
- +
- +
+ - +H2O
-
N/A + disolviendo
- Na + Cl - -
Cl +
- + -
- Cl Na + - +
Cl -
N/A + - Cristalizando
- +
- + +
Donacion de electron - +
- +
-
FIGURA 2 7 Interacciones electrostáticas de la carga opuesta contrarrestarse unos a otros. (c) Cuando los cristales se disuelven en agua,
iones de sal (NaCl) en cristales y en solución acuosa. (a) En cristal los iones se separan y sus cargas ya no están equilibradas por lo inmediato
+
sal de mesa lineal, los átomos de sodio son iones cargados positivamente (Na ) debido a Los iones adyacentes de carga opuesta se estabilizan por interacciones.
la pérdida de un electrón cada uno, mientras que los átomos de cloruro son correspondientes con agua polar Las moléculas de agua y los iones se mantienen unidos por
J
ingly negativamente cargado (Cl ) ganando un electrón cada uno. (b) En interacciones electrostáticas entre las cargas en el ion y el par
forma sólida, los compuestos iónicos forman arreglos cuidadosamente ordenados, o cristales, de cargas marciales en los átomos de oxígeno e hidrógeno del agua. En agua acuosa
iones fuertemente empaquetados en los que los iones positivos y negativamente cargados Según las soluciones, todos los iones están rodeados por una capa de hidratación de moléculas de agua.
El agua de hidratación se pierde cuando los iones pasan a través de las proteínas. La longitud del enlace covalente D J H es un poco más larga
poros en la membrana celular durante la conducción nerviosa. de lo que sería si no hubiera enlace de hidrógeno porque
La fuerza relativa de la interacción entre dos. el aceptador "extrae" el hidrógeno del donante.
los iones con carga opuesta, A J y C + , dependen de Una característica importante de todos los enlaces de hidrógeno es direccional.
Centración de otros iones en una solución. Cuanto más alto sea el ity. En los enlaces de hidrógeno más fuertes, el átomo donante, el
concentración de otros iones (p. ej., Na + y Cl J ), cuanto más átomo de hidrógeno, y el átomo aceptor todos se encuentran en una recta
Oportunidades A J y C + tienen que interactuar iónicamente con línea. Los enlaces de hidrógeno no lineales son más débiles que los lineales;
esos otros iones, y por lo tanto, menor es la energía requerida aún así, múltiples enlaces de hidrógeno no lineales ayudan a estabilizar la
para romper la interacción entre A J y C + . Como resultado, estructuras tridimensionales
Los enlaces deson
de hidrógeno muchas proteínas.
más largos y más débiles que
aumentando las concentraciones de sales como NaCl en una solución
La acción de moléculas biológicas puede debilitar e incluso interrumpir enlaces covalentes entre los mismos átomos. En agua, por
interacciones iónicas que mantienen unidas las biomoléculas. Esta ejemplo, la distancia entre los núcleos del hidrógeno
principio puede ser explotado para separar mezclas complejas de y átomos de oxígeno del agua adyacente unida al hidrógeno
moléculas interactivas como las proteínas en su individuo, las moléculas son de aproximadamente 0.27 nm, aproximadamente el doble de la longitud de
componentes puros los enlaces covalentes O J H dentro de una sola molécula de agua
(Figura 2-8a). Un enlace de hidrógeno entre las moléculas de agua.
(aproximadamente 5 kcal / mol) es mucho más débil que un covalente
Los enlaces de hidrógeno no son covalentes O J H enlace (aproximadamente 110 kcal / mol), aunque es más fuerte
Interacciones que determinan el agua que muchos otros enlaces de hidrógeno en moléculas biológicas
Solubilidad de moléculas no cargadas (1–2 kcal / mol). Extenso enlace de hidrógeno intermolecular
entre las moléculas de agua representa muchas de las claves del agua
Un enlace de hidrógeno es la interacción de una parte parcialmente positiva
propiedades, incluida su inusualmente alta fusión y ebullición
átomo de hidrógeno cargado en un dipolo, como el agua, con
puntos y su capacidad para disolver muchas otras moléculas.
electrones no apareados de otro átomo, ya sea en el mismo
La solubilidad de las sustancias no cargadas en una solución acuosa.
o en una molécula diferente. Normalmente, un átomo de hidrógeno
el medio ambiente depende en gran medida de su capacidad para formar
forma un enlace covalente con solo otro átomo. Sin embargo,
enlaces de hidrógeno con agua. Por ejemplo, el hidroxilo
un átomo de hidrógeno unido covalentemente a un electronegativo
grupo ( J OH) en alcoholes ( J CH 2 OH) y el grupo amino
el átomo D del donante puede formar una asociación débil adicional, la
( J NH 2 ) en aminas ( J CH 2 NH 2 ) puede formar varios hidrógeno
enlace de hidrógeno, con un átomo aceptor A, que debe tener
se une con el agua, lo que permite que estas moléculas se disuelvan
Un par de electrones no enlazantes disponibles para la interacción:
resolver en agua a altas concentraciones (Figura 2-8b). En general
re H UN re H UN eral, moléculas con enlaces polares que forman fácilmente hidrógeno
Enlace de hidrógeno se une con agua, así como con moléculas e iones cargados
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O H
(un) (si) (C)
H
H
O
H H H H O H H O
CN
O H O H O H O H H
H H
H
H O O
H H H H O H norte CH 3
H
H O H O O H O CH 3 H CO
Agua agua Alcohol-agua Agua de amina Grupo peptídico – agua Grupo éster – agua
FIGURA 2 8 Enlace de hidrógeno del agua consigo mismo y con de moléculas unidas por hidrógeno. (b) El agua también puede formar hidrógeno
otros compuestos Cada par de electrones externos no unidos en un se une con alcoholes y aminas, lo que explica la alta solubilidad
un átomo de oxígeno o nitrógeno puede aceptar un átomo de hidrógeno en un hidrógeno de estos compuestos. (c) El grupo peptídico y el grupo éster, que
enlace. Los grupos hidroxilo y amino también pueden formar hidrógeno. están presentes en muchas biomoléculas, comúnmente participan en hidrógeno
se une con agua. (a) En agua líquida, cada molécula de agua forma tran- se une con agua o grupos polares en otras moléculas.
Sient enlaces de hidrógeno con varios otros, creando una red dinámica
que interactúan con el dipolo en agua, pueden disolverse fácilmente de las fluctuaciones aleatorias momentáneas en la distribución
en agua; es decir, son hidrofílicos. Muchos mol biológicos ción de los electrones de cualquier átomo, que dan lugar a una transición
los ecules contienen, además de grupos hidroxilo y amino, sient distribución desigual de electrones. Si dos no covalentemente
grupos péptido y éster, que forman enlaces de hidrógeno con los átomos unidos están lo suficientemente cerca, los electrones de un átomo
agua a través de electrones no unidos en su carbonilo perturbar los electrones del otro. Esta perturbación gen-
oxígenos (Figura 2-8c). Cristalografía de rayos X combinada con borra un dipolo transitorio en el segundo átomo, y los dos
El análisis computacional permite una representación precisa de la dipolos se atraen débilmente (Figura 2-10). Del mismo modo, un
distribución de los electrones de átomos no unidos más externos enlace covalente polar en una molécula atrae un opuesto
que puede participar en los enlaces de hidrógeno, así como en la electricidad dipolo orientado en otro.
trons en enlaces covalentes, como se ilustra en la Figura 2-9. Interacciones de Van der Waals, que implican transitorios
o dipolos permanentes, se producen en todo tipo de moléculas, tanto
polar y no polar. En particular, van der Waals interac-
Las interacciones de Van der Waals son débilmente atractivas
son responsables de la cohesión entre los no polares
Interacciones causadas por dipolos transitorios moléculas como el heptano, CH 3 J (CH 2 ) 5 J CH 3 , que no pueden
Cuando dos átomos cualquiera se acercan entre sí, forman enlaces de hidrógeno o interacciones iónicas entre sí.
crear una fuerza atractiva débil e inespecífica llamada van der La fuerza de las interacciones de van der Waals disminuye rápidamente
Interacción de Waals . Estas interacciones inespecíficas resultan con una distancia creciente; así, estas interacciones no covalentes
FIGURA 2 9 Distribución de unión y no unión externa

electrones en el grupo peptídico. Aquí se muestra un enlace de enlace peptídico
dos aminoácidos dentro de una proteína llamada crambina. Ninguna proteína ha sido
H norte estructuralmente caracterizado a mayor resolución que crambin. El negro
Las líneas representan los enlaces covalentes entre los átomos. El rojo (negativo)
y las líneas azules (positivas) representan contornos de carga determinados
utilizando cristalografía de rayos X y métodos computacionales. El mayor
el número de líneas de contorno, mayor es la carga. La alta densidad
de líneas de contorno rojas entre átomos representa los enlaces covalentes
C O (pares de electrones compartidos). Los dos conjuntos de líneas de contorno rojas que emanan
del oxígeno (O) y no caer en un enlace covalente (línea negra)
representan los dos pares de electrones no enlazantes en el oxígeno que
están disponibles para participar en enlaces de hidrógeno. La alta densidad de
Las líneas de contorno azules cerca del hidrógeno (H) unido al nitrógeno (N) representan
No vinculado envía una carga positiva parcial, lo que indica que esta H puede actuar como donante
electrones en enlaces de hidrógeno. [De Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos, 2000, 97 (7): 3171–3176,
Cα Fig. 3A. Cristalografía precisa de proteínas a resolución ultra alta: valencia
distribución de electrones en crambin, por Christian Jelsch et al., Copyright (2000)
Academia Nacional de Ciencias, Estados Unidos.]
Página 9
Las moléculas no polares o las partes no polares de las moléculas tienden

para agregar en el agua debido a un fenómeno llamado
efecto hidrófobo . Porque las moléculas de agua no pueden formarse
δ δ δ δ enlaces de hidrógeno con sustancias no polares, tienden a

forman "jaulas" de pentágonos relativamente rígidos unidos por hidrógeno
y hexágonos alrededor de moléculas no polares (Figura 2-11, izquierda ).
Este estado es energéticamente desfavorable porque disminuye
la entropía, o aleatoriedad, de la población de moldes de agua
ecules (Se discute el papel de la entropía en los sistemas químicos
Covalente Van der Waals en la Sección 2.4.) Si las moléculas no polares en un entorno acuoso
radio radio agregado de ronmento con sus superficies hidrofóbicas enfrentadas
(0.062 nm) (0.14 nm)
entre sí, el área de superficie hidrofóbica neta expuesta a
FIGURA 2 10 Dos moléculas de oxígeno en contacto de van der Waals. se reduce el agua (Figura 2-11, derecha ). Como consecuencia, menos
En este modelo, el rojo indica carga negativa y el azul indica positivo se necesita agua para formar las jaulas que rodean el no
cargar. Los dipolos transitorios en las nubes de electrones de todos los átomos dan lugar a moléculas largas, la entropía aumenta en relación con la no agregada
fuerzas atractivas débiles, llamadas interacciones de van der Waals. Cada tipo de estado, y se alcanza un estado energéticamente más favorable.
el átomo tiene un radio característico de van der Waals en el que van der Waals
En cierto sentido, entonces, el agua exprime las moléculas no polares en
Las interacciones con otros átomos son óptimas. Porque los átomos repelen uno
agregados En lugar de constituir una fuerza atractiva,
otro si están lo suficientemente cerca como para que sus electrones externos
como en los enlaces de hidrógeno, el efecto hidrofóbico resulta de
traslaparse sin ser compartido en un enlace covalente, el van der Waals ra-
evitar un estado inestable, es decir, agua extensa
dius es una medida del tamaño de la nube de electrones que rodea un átomo.
jaulas alrededor de moléculas no polares individuales.
El radio covalente indicado aquí es para el doble enlace de O = O; el
El radio de oxígeno covalente de enlace simple es un poco más largo. Las moléculas no polares también pueden asociarse, aunque débilmente,
a través de las interacciones de van der Waals. El resultado neto de la
efecto hidrofóbico y las interacciones de van der Waals es un muy
poderosa tendencia de las moléculas hidrofóbicas a interactuar con
uno al otro, no con agua. En pocas palabras, como se disuelve como .
puede formarse solo cuando los átomos están bastante cerca uno del otro.
Las moléculas polares se disuelven en disolventes polares como el agua; no-
Sin embargo, si los átomos se acercan demasiado, lo negativo
Las moléculas polares se disuelven en disolventes no polares como el hexano.
Las cargas de sus electrones crean una fuerza repulsiva. Cuando el
La atracción de van der Waals entre dos átomos exactamente
Una molécula hidrófoba bien conocida es el colesterol.
ante la repulsión entre sus dos nubes de electrones, la
(Ver la estructura en la Sección 2.2). Colesterol, triglicón
Se dice que los átomos están en contacto con Van der Waals. La fuerza
erides, y otras moléculas poco solubles en agua se llaman
de la interacción de van der Waals es de aproximadamente 1 kcal / mol, por lo que es
lípidos A diferencia de las moléculas hidrofílicas como la glucosa o
más débil que los enlaces de hidrógeno típicos, y su energía es solo
ligeramente superior a la energía térmica promedio de las moléculas
Aguas liberadas a granel
a 25 ° C. Así, múltiples interacciones de van der Waals, un van der
No polar Altamente ordenado solución
Interacción de Waals junto con otras interacciones no covalentes
sustancia moléculas de agua
o ambas son necesarias para formar van der Waals-mediada
atracciones estables dentro y entre moléculas.
El efecto hidrofóbico causa no polar

Moléculas para adherirse unas a otras Hidrofóbico
agregación
Debido a que las moléculas no polares no contienen grupos cargados,
no posees un momento dipolar, y no te conviertas
hidratados, son insolubles, o casi insolubles, en agua;
es decir, son hidrofóbicos. Los enlaces covalentes entre
dos átomos de carbono y entre átomos de carbono e hidrógeno
son los enlaces no polares más comunes en los sistemas biológicos.
Hidrocarburos: moléculas formadas solo por carbono y
hidrógeno: son prácticamente insolubles en agua. Triacilo grande Baja entropía Mayor entropía
Lycerols (también conocidos como triglicéridos), que forman ani- FIGURA 2-11 Representación esquemática del efecto hidrofóbico.
grasas mal y aceites vegetales, también son esencialmente insolubles en Jaulas de moléculas de agua que se forman alrededor de moléculas no polares en
agua. Como veremos más adelante, la mayor parte de estas moléculas la solución está más ordenada que las moléculas de agua en los alrededores
consiste en largas cadenas de hidrocarburos. Después de ser sacudido en líquidos a granel. La agregación de moléculas no polares reduce el número de
agua, los triacilgliceroles forman una fase separada. Un familiar moléculas de agua involucradas en la formación de jaulas altamente ordenadas, lo que resulta en
ejemplo es la separación del aceite del vino a base de agua un estado de mayor entropía, más energéticamente favorable ( derecha ) en comparación
egar en un aderezo para ensalada de aceite y vinagre. con el estado no agregado ( izquierda ).
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aminoácidos, los lípidos no pueden disolverse fácilmente en la sangre, el

OH O C OH O C
sistema circulatorio acuoso que transporta moléculas y
células en todo el cuerpo. En cambio, los lípidos como el colesterol Enlace iónico
debe empaquetarse en portadores hidrofílicos especiales, llamados
lipoproteínas, que pueden disolverse en la sangre y C O HN Enlace de hidrógeno C O HN
ser transportado por todo el cuerpo. Puede haber cientos

CH 3 H3C
Hidrofóbico
a miles de moléculas de lípidos empaquetados en el centro, o
CH 3 H3C y van der
núcleo, de cada lipoproteína. El núcleo hidrofóbico está sobre Waals
redondeado por moléculas anfipáticas que tienen hidrófila
CH 3 H3C interacciones
partes que interactúan con el agua y partes hidrofóbicas que

interactuar entre sí y con el núcleo. El embalaje de
los lípidos en lipoproteínas (discutidos en el Capítulo 14) permiten C O OH C O H3C
su transporte eficiente en sangre y recuerda a la
contenerización de la carga para un transporte eficiente a larga distancia Proteína A Proteína B Proteína A Proteína C
puerto a través de buques de carga, trenes y camiones. Complejo estable Complejo menos estable
Lipoproteína de alta densidad (HDL) y lipoproteína de baja densidad FIGURA 2.12 La complementariedad molecular permite una proteína estrecha
Las proteínas (LDL) son dos de estos portadores de lipoproteínas que son unión a través de múltiples interacciones no covalentes. El complementario
asociado con enfermedad cardíaca reducida o aumentada, formas, cargas, polaridad e hidrofobicidad de dos superficies proteicas
respectivamente, y por lo tanto a menudo se los denomina "buenos" permitir múltiples interacciones débiles, que en combinación producen un
y colesterol "malo". En realidad, las moléculas de colesterol Fuerte interacción y estrecha unión. Porque las desviaciones de la molécula
y sus derivados que son transportados por HDL y LDL La complementariedad lar debilita sustancialmente la unión, una superficie particular
son esencialmente idénticos y en sí mismos no son "buenos" La región de cualquier biomolécula dada generalmente puede unirse fuertemente a una sola
ni "malo". Sin embargo, HDL y LDL tienen diferentes efectos en o un número muy limitado de otras moléculas. La complementariedad de
las dos moléculas de proteína a la izquierda les permiten unirse mucho más
células, y como consecuencia, LDL contribuye y HDL
fuertemente que las dos proteínas no complementarias a la derecha.
parece proteger contra la obstrucción de las arterias (conocido como
aterosclerosis ) y la consiguiente enfermedad cardíaca y accidente cerebrovascular.
Por lo tanto, el LDL se conoce como colesterol "malo". ■ de grupos de moléculas en conjuntos multimoleculares, o
complejos, que conducen, por ejemplo, a la formación de músculo
fibras, a las asociaciones de tipo pegamento entre las células en tejido sólido
Complementariedad molecular debida
demanda, y a numerosas otras estructuras celulares. El anti
a las interacciones no covalentes conduce a una los cuerpos que ayudan a neutralizar los patógenos (ver Capítulo 23) se unen
Ajuste de cerradura y llave entre biomoléculas a ellos usando principios similares de molecular complementario
Tanto dentro como fuera de las células, iones y moléculas constantemente formas
chocar. Cuanto mayor sea la concentración de cualquiera de los dos tipos de Dependiendo del número y la fuerza del no
moléculas, cuanto más probable es que se encuentren. Valent interacciones entre las dos moléculas y en su
Cuando dos moléculas se encuentran, son más medio ambiente, su unión puede ser apretada o floja y, como
es probable que simplemente reboten porque la intercolación no covalente una consecuencia, ya sea duradera o transitoria. Cuanto mayor sea
las acciones que los unirían son débiles y tienen una afinidad de dos moléculas entre sí, mejor será la molecula
existencia transitoria a temperaturas fisiológicas. Sin embargo, "ajuste" ular entre ellos, las interacciones más no covalentes
moléculas que exhiben complementariedad molecular , un bloqueo pueden formarse, y cuanto más estrechamente se puedan unir. Un
tipo de llave y ajuste entre sus formas, cargas u otros Una medida cuantitativa importante de la afinidad es la distorsión vinculante
propiedades físicas, pueden formar múltiples interacciones no covalentes constante de sociación K d , descrita en la Sección 2.3. Es importante
iones a corta distancia. Cuando dos de estos completan estructuralmente Tenga en cuenta que muchas moléculas biológicas grandes no son
moléculas mentales chocan entre sí, estas múltiples estructuras rígidas y duras, sino que pueden ser algo maleables.
las interacciones hacen que se peguen o se unan. Así, la unión de una molécula a otra tiene el potencial
La Figura 2-12 ilustra cómo múltiples, diferentes débiles inter- para inducir un cambio en la forma de su compañero vinculante. Cuando
las acciones pueden hacer que dos proteínas hipotéticas se unan la complementariedad molecular aumenta después de tal interacción
herméticamente. Numerosos ejemplos de dicha proteína a proteína En este caso, el proceso se llama ajuste inducido .
La complementariedad molecular se puede encontrar a lo largo de este Como discutimos en el Capítulo 3, casi todas las reacciones químicas
libro (ver, por ejemplo, las Figuras 16-8, 16-9 y 16-11). las funciones que ocurren en las células también dependen de las propiedades de unión
Casi cualquier otra disposición de los mismos grupos de mol- Erties de enzimas. Estas proteínas no solo se aceleran, o
los ecules en las dos superficies no permitirían que las moléculas catalizar reacciones, pero hacerlo con un alto grado de especificidad
para atar tan fuerte. Tal complementariedad molecular entre Ficción , que es un reflejo de su capacidad para unirse fuertemente
regiones dentro de una molécula de proteína permiten que se pliegue en un a solo una o unas pocas moléculas relacionadas. La especificidad de
forma tridimensional única (ver Capítulo 3); tambien es interacciones y reacciones intermoleculares, que depende de
lo que mantiene unidas las dos cadenas de ADN en una doble hélice complementariedad molecular, es esencial para muchos procesos
(ver Capítulo 5). Interacciones similares subyacen a la asociación. crítico para la vida.
Página 11
CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 2.1 efecto hidrofóbico, reduciendo así la extensión de su

contacto directo con moléculas de agua (ver Figura 2-11).
Bonos Covalentes y No Covalentes r La complementariedad molecular es el ajuste de cerradura y llave entre
Interacciones moléculas cuyas formas, cargas y otras propiedades físicas
los lazos son complementarios. Múltiples interacciones no covalentes
r Los términos hidrofílico, hidrofóbico y anfipático /
anfifílico se refiere a la tendencia de las moléculas a ser agua puede formarse entre moléculas complementarias, causándolas
amoroso, incapaz de interactuar con el agua y tener fea- para unirse firmemente (ver Figura 2-12), pero no entre moléculas
tures o ser tolerantes con ambos, respectivamente. Hidrofílico que no son complementarios
las moléculas típicamente se disuelven fácilmente en agua, mientras que la hidro- r El alto grado de especificidad de unión que resulta de
Las moléculas fóbicas son poco solubles o insolubles en agua. La complementariedad molecular es una de las características que
reside interacciones intermoleculares en biología y, por lo tanto, es esencial
r Los enlaces covalentes consisten en pares de electrones compartidos por dos
átomos Los enlaces covalentes organizan los átomos de una molécula en Prueba de muchos procesos críticos para la vida.
Una geometría específica.
r Muchas moléculas en las células contienen al menos una asimétrica

átomo de carbono, que está unido a cuatro átomos diferentes. Tal
las moléculas pueden existir como estereoisómeros (imágenes especulares), designadas
d y l (ver Figura 2-4), que tienen diferentes características biológicas. 2.2 Bloques de construcción químicos de células
actividades cal. Casi todos los aminoácidos son isómeros l.
Un tema común en biología es la construcción de grandes mac-
r Los electrones se pueden compartir de manera equitativa o desigual en covalentes romolecules y estructuras macromoleculares de pequeños
cautiverio. Los átomos que difieren en electronegatividad forman polar
subunidades moleculares, que pueden considerarse como constructoras
enlaces covalentes, en los cuales los electrones de enlace son distributivos bloques A menudo, estas subunidades son similares o idénticas. los
Uted desigual. Un extremo de un enlace polar tiene una posición parcial.
tres tipos principales de macromoléculas biológicas: proteínas,
tive carga y el otro extremo tiene una carga negativa parcial
ácidos nucleicos y polisacáridos: todos son polímeros compuestos
(Ver Figura 2-5). planteado de múltiples moléculas pequeñas unidas covalentemente, o
r Los enlaces covalentes son estables en los sistemas biológicos porque monómeros (figura 2-13). Las proteínas son polímeros lineales con-
las energías relativamente altas requeridas para romperlos (50–200 que contiene hasta varios miles de aminoácidos unidos por pep-
kcal / mol) son mucho más grandes que la energía cinética térmica enlaces de marea . Los ácidos nucleicos son polímeros lineales que contienen
disponible a temperatura ambiente (25 ° C) o corporal (37 ° C). cientos a millones de nucleótidos unidos por fosfodiéster
bonos . Los polisacáridos son polímeros lineales o ramificados de
r Las interacciones no covalentes entre átomos son considerablemente
monosacáridos (azúcares) como la glucosa unida por gluco-
más débiles que los enlaces covalentes, con energías que van desde
enlaces sidicos .
aproximadamente 1–5 kcal / mol (ver Figura 2-6).
Aunque los mecanismos reales de la formación de enlaces covalentes
r Cuatro tipos principales de interacciones no covalentes ocurren en bio- La relación entre monómeros es compleja, como veremos, la forma-
sistemas lógicos: enlaces iónicos, enlaces de hidrógeno, van der Waals Relación de un enlace covalente entre dos monómeros.
interacciones e interacciones debido al efecto hidrofóbico. implica la pérdida neta de un hidrógeno (H) de un monómero
r Los enlaces iónicos resultan de la atracción electrostática y un hidroxilo (OH) del otro monómero, o la red
entre las cargas positivas y negativas de iones. En acue pérdida de una molécula de agua y, por lo tanto, se puede pensar
En nuestras soluciones, todos los cationes y aniones están rodeados por un como una reacción de deshidratación . El colapso o escisión de un
caparazón de moléculas de agua unidas (ver Figura 2-7c). Creciente enlace covalente en un polímero que libera un sub monómero
la concentración de sal (p. ej., NaCl) de una solución puede debilitarse la unidad implica la reacción inversa, o la adición de agua,
es la fuerza relativa de e incluso romper los enlaces iónicos llamado hidrólisis . Los enlaces covalentes que unen a los monómeros.
entre biomoléculas. juntos son normalmente estables bajo condiciones biológicas normales
diciones (p. ej., 37 ° C, pH neutro), por lo que estos biopolímeros son
r En un enlace de hidrógeno, un átomo de hidrógeno unido covalentemente
estable y puede realizar una amplia variedad de trabajos en celdas, como
a un átomo electronegativo se asocia con un aceptor
almacenar información, catalizar reacciones químicas, servir
átomo cuyos electrones no enlazantes atraen el hidrógeno (ver
como elementos estructurales que definen la forma y el movimiento de la célula,
Figura 2-8).
y muchos otros. Las estructuras macromoleculares también pueden ser
r Interacción débil y relativamente inespecífica de van der Waals ensamblado utilizando interacciones no covalentes. La de dos capas, o
Como resultado de la atracción entre dipolos transitorios "Bicapa", la estructura de las membranas celulares está construida por
asociado con todas las moléculas. Se pueden formar cuando dos ensamblaje no covalente de muchos miles de moléculas pequeñas
los átomos se acercan entre sí de cerca (ver Figura 2-10). llamados fosfolípidos (ver Figura 2-13).
r En un ambiente acuoso, moléculas no polares o no En este capítulo, nos centramos en los componentes químicos.
las partes polares de moléculas más grandes son conducidas juntas por el formando células: aminoácidos, nucleótidos, azúcares y
fosfolípidos La estructura, función y montaje de
2.2 Bloques de construcción químicos de células 41
Pagina 12
Monómeros POLIMEROS
HO H O H H OH H O HHO HHO
H 2 N CC OH H norte C C OH H CN C norte C C norte CC norte CC OH
R R R1 R2 R3 R4
Aminoácidos Enlace peptídico

Polipéptido
Enlace fosfodiéster
si si B1 B2 B3
O O O O O
3 3 3 3 3
HO OP 55 OH HO OP 55 OH OP OP
SALTO O 55 O 55 O 55 OH
O O O O O
Nucleótido Ácido nucleico
Enlace glucosídico
OH OH
44 O OH 44 O HO OH 1
44 O O OH
HO 1 O 44
1 OH HO 1 OH HO OH O
HO OH OH
HO OH
Monosacárido Polisacárido
Grupo polar
Hidrofílico
Fosfato
grupo principal
Glicerol
OCOC
Hidrofóbico
acilo graso
cruz
Bicapa de fosfolípidos
Fosfolípido
FIGURA 2 13 Descripción general del edificio químico principal de la célula polisacáridos de monosacáridos (azúcares). Cada monómero es
bloques ( Arriba ) Los tres tipos principales de macromoléculas biológicas unido covalentemente al polímero por una reacción cuyo resultado neto es la pérdida
cada uno se ensambla mediante la polimerización de múltiples molde una molécula de agua (deshidratación). ( Abajo ) En contraste, fosfolípido
ecules (monómeros) de un tipo particular: proteínas de aminoácidos los monómeros se ensamblan de forma no covalente en una estructura de dos capas, que
(ver Capítulo 3), ácidos nucleicos de nucleótidos (ver Capítulo 5), y forma la base de todas las membranas celulares (ver Capítulo 7).
proteínas, ácidos nucleicos, polisacáridos y biomembranas grupo . Debido a que el carbono α en todos los aminoácidos, excepto el glu-
se discuten en capítulos posteriores. cine es asimétrico, estas moléculas pueden existir en dos espejos
formas de imagen, llamadas por convención d (dextro) y el
l (levo) isómeros (ver Figura 2-4). Los dos isómeros no pueden
Aminoácidos que difieren solo en su lado ser interconvertido (uno hecho idéntico al otro) sin
Las cadenas componen proteínas romper y luego volver a formar un enlace químico en uno de
Los bloques de construcción monoméricos de proteínas son 20 amino ellos. Con raras excepciones, solo las formas l de aminoácidos
ácidos que, cuando se incorporan a una proteína poli se encuentran en las proteínas Sin embargo, los aminoácidos d son prevalentes
mer: a veces se denominan residuos . Todos los aminoácidos tienen en paredes celulares bacterianas y otros productos microbianos.
una estructura característica que consiste en un coche alfa central Comprender las estructuras y funciones tridimensionales.
átomo de bon ( C α ) unido a cuatro grupos químicos diferentes: las proteínas que se analizan en detalle en el Capítulo 3 deben ser
un grupo amino ( J NH 2 ), un carboxilo o ácido carboxílico familiarizado con algunas de las propiedades distintivas de los aminoácidos,
( J COOH) grupo (de ahí el nombre de aminoácido ), un hidrógeno que están determinados en parte por sus cadenas laterales. Necesitas
(H) átomo, y un grupo variable, llamado cadena lateral o R no memorice la estructura detallada de cada tipo de cadena lateral
Página 13
AMINOÁCIDOS HIDROFÓBICOS
ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO
H3NC H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H
CH 3 CH HC CH 3 CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 CH 2
H3C CH 3
CH 2 CH CH 2 C CH
H3C CH 3 NUEVA HAMPSHIRE
CH 3 S
CH 3 OH
Alanina Valina Isoleucina Leucina Metionina Fenilalanina Tirosina Triptófano

(Ala o A) (Val o V) (Ile o I) (Leu o L) (Met o M) (Phe o F) (Tyr o Y) (Trp o W)
AMINOÁCIDOS HIDRÓFILOS
Aminoácidos Acidos Aminoácidos polares con grupos R sin carga
Aminoácidos básicos ARRULLO ARRULLO ARRULLO
H3N C H H3N C H H3N C H

ARRULLO ARRULLO ARRULLO
CH 2 CH 2 HC OH
H3N C H H3N C H H3N C H
ARRULLO OH CH 3
CH 2 CH 2 CH 2
Aspartato Serina Treonina
CH 2 CH 2 C NH (Asp o D) (Ser o S) (Thr o T)
CH
CH 2 CH 2 ARRULLO ARRULLO
ARRULLO
C norte
CH 2 NUEVA HAMPSHIRE S.S H3N C H H3N C H H3N C H
NH 3 C NH 2
CH 2 CH 2 CH 2
NH 2
CH 2 C CH 2
Lisina Arginina Histidina
H2N O
(Lys o K) (Arg o R) (Su o H) ARRULLO C
H2N O
Glutamato Asparagina Glutamina
AMINOÁCIDOS ESPECIALES (Glu o E) (Asn o N) (Gln o Q)
ARRULLO ARRULLO ARRULLO

H FIGURA 2 14 Los 20 aminoácidos comunes utilizados para construir
H3N C H H3N C H C
H2N CH 2 proteínas La cadena lateral (grupo R; rojo) determina la característica
CH 2 H propiedades de cada aminoácido y es la base para agrupar amino
H2C CH 2
ácidos en tres categorías principales: hidrofóbico, hidrofílico y especial.
SH
Cisteína Glicina Prolina Se muestran las formas ionizadas que existen al pH ( ∼ 7) del citosol. En
(Cys o C) (Gly o G) (Pro o P) los paréntesis son las abreviaturas de tres letras y una letra para cada
aminoácidos.
para entender cómo funcionan las proteínas porque los aminoácidos pueden Anillos aromáticos en sus cadenas laterales. En capítulos posteriores, lo haremos
ser clasificado en varias categorías amplias según el tamaño, ver en detalle cómo las cadenas laterales hidrofóbicas bajo la influencia
forma, carga, hidrofobicidad (una medida de solubilidad en agua), A menudo, el efecto hidrofóbico se acumula en el interior de
y reactividad química de sus cadenas laterales (Figura 2-14). proteínas o alinear las superficies de proteínas que están incrustadas
Aminoácidos con cadenas laterales no polares, llamados hidrofo- dentro de regiones hidrofóbicas de biomembranas.
aminoácidos bicos, son poco solubles en agua. Cuanto mayor sea Los aminoácidos con cadenas laterales polares se denominan hidrófilos.
cadena lateral no polar, más hidrofóbico es el aminoácido. aminoácidos; el más hidrofílico de estos aminoácidos es
Las cadenas laterales de alanina , valina , leucina e isoleucina son el subconjunto con cadenas laterales que están cargadas (ionizadas) en el
hidrocarburos lineales o ramificados que no forman un anillo, pH típico de fluidos biológicos (∼7) tanto dentro como fuera
y por lo tanto se llaman aminoácidos alifáticos. Estas la celda (ver Sección 2.3). La arginina y la lisina tienen posi-
todos los aminoácidos son no polares, al igual que la metionina , que es simi- cadenas laterales cargadas positivamente y se denominan aminoácidos básicos;
lar a ellos excepto que contiene un átomo de azufre. Fenilo- el ácido aspártico y el ácido glutámico tienen un lado cargado negativamente
alanina , tirosina y triptófano tienen grandes, hidrofóbicos, cadenas debido a los grupos de ácido carboxílico en sus cadenas laterales
Página 14
(sus formas cargadas se llaman aspartato y glutamato ) y enlaces de hidrógeno. La presencia de prolina en una proteína cre-
Se llaman aminoácidos ácidos. Un quinto aminoácido, histidina , odia un pliegue fijo en la cadena de polímero, lo que limita la forma en que puede
tiene una cadena lateral que contiene un anillo con dos nitrógenos, llamado doblar en la vecindad del residuo de prolina.
imidazol, que puede pasar de estar cargado positivamente a Algunos aminoácidos son más abundantes en proteínas que
sin carga en respuesta a pequeños cambios en la acidez de su otros. La cisteína, el triptófano y la metionina no son
ambiente: aminoácidos comunes: juntos, constituyen aproximadamente
aproximadamente el 5 por ciento de los aminoácidos en una proteína típica. Cuatro
CH 2 CH 2
los aminoácidos (leucina, serina, lisina y ácido glutámico) son
norte
H
norte
H los aminoácidos más abundantes, que constituyen el 32 por ciento de
C C
Todos los residuos en una proteína típica. Sin embargo, el aminoácido
C H C H
C C
Las composiciones de proteínas particulares pueden variar ampliamente de
norte norte
H + H H estos valores
pH 5.8 pH 7.8
Los humanos y otros mamíferos pueden sintetizar 11 de los
Las actividades de muchas proteínas están moduladas por cambios en 20 aminoácidos Los otros nueve se llaman esenciales
acidez ambiental (pH) a través de la protonación o desprotección aminoácidos y deben incluirse en la dieta para permitir
onación de cadenas laterales de histidina. Asparagina y glutamina producción de proteínas mal. Estos aminoácidos esenciales son fe-
no están cargados pero tienen cadenas laterales polares que contienen amida nylalanine, valina, treonina, triptófano, isoleucina,
grupos con amplias capacidades de enlace de hidrógeno. Simi metionina, leucina, lisina e histidina. Provisión adecuada
En general, la serina y la treonina no tienen carga pero tienen polar La sión de estos aminoácidos esenciales en el alimento es clave para la vida.
grupos hidroxilo, que también participan en enlaces de hidrógeno industria de valores. De hecho, una variedad genéticamente modificada de
con otras moléculas polares. el maíz con un alto contenido de lisina ahora se usa como un "
Finalmente, la cisteína, la glicina y la prolina desempeñan papeles especiales. alimentado "para promover el crecimiento de los animales. ■
en proteínas debido a las propiedades únicas de su lado
Aunque las células usan los 20 aminoácidos que se muestran en
cadenas La cadena lateral de cisteína contiene un sulfuro reactivo .
Figura 2-14 en la síntesis inicial de proteínas, análisis de
grupo hidrilo ( - SH ). En la liberación de un protón (H + ), un sulfhy-
Las proteínas celulares revelan que contienen más de 100 diferentes
El grupo Dryl se convierte en un anión tiolato (S - ). Tiolato
aminoácidos. La diferencia se debe a la modificación química.
los aniones pueden desempeñar papeles importantes en la catálisis, especialmente en ciertas
ción de algunos aminoácidos después de que se incorporan a
contienen enzimas que destruyen proteínas (proteasas). En proteínas,
proteínas mediante la adición de una variedad de grupos químicos
cada uno de los dos grupos sulfhidrilo adyacentes puede oxidarse, cada uno
(Figura 2-15). Una modificación importante es la adición de
liberando un protón y un electrón, para formar una disulfura covalente
grupos acetilo (CH 3 CO) a aminoácidos, un proceso conocido como
enlace fide ( - S - S - ):
acetilación Otra es la adición de un fosfato (PO 4 ) a
grupos hidroxilo en residuos de serina, treonina y tirosina,
norte H norte H Un proceso conocido como fosforilación. Nos encontraremos
H C CH 2 SH + HS CH 2 C H Numerosos ejemplos de proteínas cuya actividad está regulada
por fosforilación reversible y desfosforilación. Fos-
C O C O
la fosforilación de nitrógeno en la cadena lateral de histidina está bien
conocido en bacterias, hongos y plantas, pero menos estudiado:
tal vez debido a la relativa inestabilidad de fosforilados
histidina, y aparentemente rara en mamíferos. Metilación de
H norte norte H
las cadenas laterales de arginina y lisina en proteínas llamadas histonas son
H C CH 2 S S CH 2 C H un importante regulador de la expresión génica en eucariotas (ver
Capítulo 9). Como la fosforilación y la desfosforilación,
O C C O
La metilación y la desmetilación controladas son importantes.
procesos ulatorios. Las cadenas laterales de asparagina, serina y
Los enlaces disulfuro sirven para regiones de "enlace cruzado" dentro de un solo treonina son sitios para la glicosilación, la unión de lineal
cadena polipeptídica (reticulación intramolecular) o entre y cadenas de carbohidratos ramificadas. Muchas proteínas secretadas
dos cadenas separadas (entrecruzamiento intermolecular). Disulfuro y las proteínas de membrana contienen residuos glicosilados, y
Los enlaces estabilizan la estructura plegada de algunas proteínas. los la modificación reversible de grupos hidroxilo en específico
el aminoácido más pequeño, la glicina , tiene un solo átomo de hidrógeno como serinas y treoninas por un azúcar llamado N-acetilglucosamina
su grupo R. Su tamaño pequeño le permite caber en espacios reducidos. También regula las actividades proteicas. Otras modificaciones de aminoácidos
A diferencia de los otros aminoácidos comunes, el lado Las funciones encontradas en proteínas seleccionadas incluyen la hidroxilación
cadena de prolina (pronunciado pro-leen) se dobla para de residuos de prolina y lisina en el colágeno (ver Capítulo 19),
formar un anillo uniéndose covalentemente al átomo de nitrógeno en la metilación de residuos de histidina en receptores de membrana,
el grupo amino unido a la C α . Como resultado, la prolina es y la γ-carboxilación de glutamato en factores de coagulación sanguínea
muy rígido, y su grupo amino no está disponible para los típicos tors como la protrombina. Desamidación de asparagina y
Página 15
O Esta modificación puede jugar un papel importante en el control

H
la vida útil de las proteínas dentro de las células porque muchas
Acetil lisina CH 3 C norte CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 CH ARRULLO
Las proteínas tardías se degradan rápidamente.
NH 3
O
Fosfoserina
-O
PAG O CH 2 CH COO Se usan cinco nucleótidos diferentes
construir ácidos nucleicos
O- NH 3
Dos tipos de ácidos nucleicos químicamente similares, el ADN ( desoxi
O ácido ribonucleico ) y ARN ( ácido ribonucleico ), son las células
-O
moléculas principales que transportan información genética. los
Fosfotirosina PAG O CH 2 CH COO
monómeros a partir de los cuales se construyen los polímeros de ADN y ARN,
O- NH 3 llamados nucleótidos , todos tienen una estructura común: un fos-
grupo de fato unido por un enlace fosfoéster a una pentosa
O CH 3 (cinco carbonos) azúcar, que a su vez está vinculada a un nitrógeno
-O
y estructura de anillo que contiene carbono comúnmente referida
Fosfotreonina PAG O CH 2 CH COO
como base (Figura 2-16a). En el ARN, la pentosa es ribosa; en
O- NH 3 ADN, es desoxirribosa, que tiene un protón, en lugar de un
grupo hidroxilo, en la posición 2! (Figura 2-16b). (Describimos
OH las estructuras de azúcares con más detalle a continuación.) Las bases
adenina , guanina y citosina (Figura 2-17) se encuentran en
3-hidroxiprolina H2C CH
tanto ADN como ARN; la timina se encuentra solo en el ADN, y
H2C CH ARRULLO El uracilo se encuentra solo en el ARN.
NH 2 La adenina y la guanina son purinas , que contienen un par
de anillos fusionados; la citosina, la timina y el uracilo son pirimidinas ,
HC C CH 2 CH ARRULLO
que contienen un solo anillo (ver Figura 2-17). Las bases son
3-metilhistidina
H3C norteC norte NH 3 aLas
menudo abreviado A, G, C,también
T y U, respectivamente; estospara
mismos
abreviaturas de una letra se usan comúnmente denotar
H
los nucleótidos completos en polímeros de ácido nucleico. En nucleo
OOC mareas, el 1! átomo de carbono del azúcar (ribosa o desoxirri-
-Carboxiglutamato
CH CH 2 CH ARRULLO bose) está unido al nitrógeno en la posición 9 de una purina
OOC (N 9 ) o en la posición 1 de una pirimidina (N 1 ). El carbonato ácido
NH 3
El comportamiento de los nucleótidos se debe al grupo fosfato, que
O-GlcNAc-treonina OH En condiciones intracelulares normales libera hidrógeno
O
HO CH 3
HO O CH CH COO
NUEVA HAMPSHIRE (un) NH 2 (si)
NH 3 Adenina
CO 5!
C norte HOCH 2 O OH
66
CH 3 norte
1 5C
5 77
8 CH 4! 1!
2 44 99 H H
FIGURA 2-15 Modificaciones comunes de las cadenas laterales de aminoácidos. HC 3 C
norte norte H H
en proteínas Estos residuos modificados y muchos otros se forman. 3! 2!
mediante la adición de varios grupos químicos (rojo) al lado del aminoácido O OH OH

cadenas durante o después de la síntesis de una cadena polipeptídica. 5! Ribosa
O PAG O CH 2 O
4! 1! 5!
O H H O
HOCH 2 OH
Fosfato H H
3! 2! 4! 1!
H H
glutamina para formar los aminoácidos ácidos correspondientes, OH OH H H
3! 2!
aspartato y glutamato, también es una ocurrencia común. Ribosa
Acetilación del grupo amino del residuo N-terminal Adenosina 5 -monofosfato OH H

(AMPERIO) 2'-desoxirribosa
es la forma más común de modificación química de aminoácidos
ción, que afecta aproximadamente al 80 por ciento de todas las proteínas: FIGURA 2.16 Estructura común de nucleótidos. (a) adenosina
5! -Monophosphate (AMP), un nucleótido presente en el ARN. Por convención,
O RO los átomos de carbono del azúcar pentosa en los nucleótidos están numerados
CH 3 C norte C C con primos En nucleótidos naturales, el 1! el carbono está unido por un enlace ß
a la base (en este caso, adenina); tanto la base (azul) como el fos-
H H phate en los 5! El hidroxilo (rojo) se extiende sobre el plano del anillo de azúcar.
N-terminal acetilado (b) Ribosa y desoxirribosa, las pentosas en ARN y ADN, respectivamente.
Página 16
Purines éster: implica la unión covalente de un ácido, como un car-

ácido boxílico o ácido fosfórico, con un alcohol acompañado
NH 2 O
atemorizado por la liberación de un grupo hidroxilo ( - OH) de
C norte C norte el ácido y un H del grupo hidroxilo en el otro
66 66
norte
1 5C
5 77 HN 1 5C
5 77
8 CH 8 CH molécula, que juntas forman una molécula de agua. Aquí un
2 44 99 2 44 99
HC C C C
3
norte
3
norte el ácido fosfórico se esterifica con el grupo hidroxilo 5 'de
norte H2N norte
la ribosa Los monofosfatos de nucleósidos tienen un único esteri-
H H
fosfato fito (ver Figura 2-16a); difosfatos de nucleósidos
Adenina (A) Guanina (G)
contiene un grupo pirofosfato:
PIRIMIDINAS O O
O O NH 2 OP O PAG O
C C C O O
44 44 44
HN 3 5 5CH HN 3 5C
5 CH 3 norte
3 5 CH
5
Pirofosfato
2 66 2 66 2 66
C 1 CH C 1 CH C 1 CH
norte norte norte
O O O y los nucleósidos trifosfatos tienen un tercer fosfato.
H H H La Tabla 2-3 enumera los nombres de los nucleósidos y nucleótidos
Uracilo (U) Timina (T) Citosina (C) en ácidos nucleicos y las diversas formas de nucleósido fos-
FIGURA 2.17 Estructuras químicas de las bases principales en Fatos Los nucleósidos trifosfatos se utilizan en la síntesis.
sis de ácidos nucleicos, que cubrimos en el Capítulo 5. Entre
ácidos nucleicos. En ácidos nucleicos y nucleótidos, nitrógeno 9 de purinas.
y el nitrógeno 1 de pirimidinas (rojo) están unidos al carbono 1 'de
sus otras funciones en la célula, GTP participa en intracel-
ribosa o desoxirribosa. U se encuentra solo en ARN, y T se encuentra solo en señalización lular y actúa como un depósito de energía, particularmente en
ADN Tanto el ARN como el ADN contienen A, G y C. La síntesis de proteínas y ATP, discutida más adelante en este capítulo, es
El portador de energía biológica más utilizado.
iones (H + ), dejando el fosfato cargado negativamente (ver

Figura 2-16a). La mayoría de los ácidos nucleicos en las células están asociados con
Los monosacáridos se ensamblan covalentemente en
proteínas, que forman interacciones iónicas con el negativo Polisacáridos lineales y ramificados
fosfatos cargados. Los bloques de construcción de los polisacáridos son los simples
Las células y los fluidos extracelulares en los organismos contienen pequeños azúcares o monosacáridos . Los monosacáridos son carbohidratos
concentraciones de nucleósidos , combinaciones de una base y Drates , que son combinaciones literalmente unidas covalentemente
un azúcar sin fosfato Los nucleótidos son nucleósidos de carbono y agua en una relación uno a uno (CH 2 O) n , donde n
que tienen uno, dos o tres grupos fosfato esterificados es igual a 3, 4, 5, 6 o 7. Hexosas ( n = 6) y pentosas ( n = 5)
en el 5 'hidroxilo. Esterificación: la formación de un son los monosacáridos más comunes. Todos los monosacáridos
CUADRO 2 3 Terminología de nucleósidos y nucleótidos
Purinas Pirimidinas
Uracilo (U)
Bases Adenina (A) Guanina (G) Citosina (C) Timina (T)
Nucleósidos
{en ARN
en el ADN
Adenosina
Desoxiadenosina
Guanosina
Desoxicoguanosina
Citidina
Desoxicitidina
Uridina
Desoxitimidina
{
en ARN Adenilato Guanilato Citidilato Uridilato
Nucleótidos
en el ADN Desoxiadenilato Desoxiguanilato Desoxicitidilato Desoxitimidilato
Monofosfatos de nucleósidos AMPERIO GMP CMP UMP
Difosfatos de nucleósidos ADP PIB CDP UDP
Trifosfatos de nucleósidos ATP GTP CTP UTP
Desoxinucleósido mono-,
di- y trifosfatos dAMP, etc. dGMP, etc. dCMP, etc. dTMP, etc.
Página 17
contienen grupos hidroxilo ( J OH) y un aldehído o al carbono 1 puntos "hacia abajo" desde el anillo, como se muestra
un grupo ceto: en la figura 2-18a; en el anómero ß, este hidroxilo apunta
"Hacia arriba". En solución acuosa, los anómeros α y ß leen-
O O se interconvierten espontáneamente; en equilibrio hay aproximadamente
C C H C C C un tercio de anómero α y dos tercios de ß, con muy poca cantidad de
forma de cadena abierta. Porque las enzimas pueden distinguir entre
Aldehído Keto los anómeros α y ß de d-glucosa, estas formas tienen distintas
Roles biológicos. Condensación del grupo hidroxilo en car-
Muchos azúcares biológicamente importantes son hexosas, bon 4 de la glucosa lineal con su grupo aldehído da como resultado
incluyendo glucosa, manosa y galactosa (figura 2-18). la formación de d-glucofuranosa, un hemiacetal que contiene
La manosa es idéntica a la glucosa, excepto que la orientación Un anillo de cinco miembros. Aunque las tres formas de d-glucosa
de los grupos unidos al carbono 2 se invierte. Similar, existen en sistemas biológicos, la piranosa (anillo de seis miembros)
galactosa, otra hexosa, difiere de la glucosa solo en el La forma es, con mucho, la más abundante.
orientación de los grupos unidos al carbono 4. Interconver- El anillo de piranosa en la figura 2-18a se representa como plano.
sion de glucosa y manosa o galactosa requiere la ruptura De hecho, debido a la geometría tetraédrica alrededor del carbono
ing y fabricación de enlaces covalentes; tales reacciones son llevadas átomos, la conformación más estable de un anillo de piranosa tiene un
fuera por enzimas llamadas epimerasas . forma no plana, chairlike. En esta conformación, cada enlace
La d-glucosa (C 6 H 12 O 6 ) es la principal fuente externa de de un anillo de carbono a un átomo no anillo (por ejemplo, H u O) es
energía para la mayoría de las células en organismos multicelulares complejos. casi perpendicular al anillo, denominado axial (a), o
Puede existir en tres formas diferentes: una estructura lineal y casi en el plano del anillo, denominado ecuatorial (e):
dos estructuras de anillo hemiacetal diferentes (figura 2-18a).
un H
Si el grupo aldehído en el carbono 1 se combina con el 66
mi O CH 2 OH O
grupo hidroxilo en el carbono 5, el hemiacetal resultante, mi HO 44
un 55 H
d-glucopiranosa, contiene un anillo de seis miembros. En el α un H
2
1
anómero de d-glucopiranosa, el grupo hidroxilo unido mi mi HO H
mi 3 HO
un un H OH
Piranosis - D- Glucopiranosa
(un) Los disacáridos , formados por dos monosacáridos, son

H O 66
66 1
CH 2 OH Los polisacáridos más simples. El disacárido lactosa, compuesto
CH 2 OH C
55 2
55
O Posee galactosa y glucosa, es el principal azúcar en la leche;
HCOH O H H C OH H H el disacárido sacarosa, compuesto de glucosa y fructosa,
H
3 44 1
44
OH H
1
HO CH OH H Es un producto principal de la fotosíntesis de las plantas y es refinado.
H OH HO OH en azúcar de mesa común (Figura 2-19).
44
3 2 3 2
H C OH
Polisacáridos más grandes, que contienen decenas a cientos de
H OH 55 H OH
H C OH las unidades de monosacáridos, pueden funcionar como reservorios de glucosa,
D- glucofuranosa D- glucopiranosa
(raro) 66 (común) como componentes estructurales o como adhesivos que ayudan a mantener las células
CH 2 OH
juntos en tejidos. El carbohidrato de almacenamiento más común.
D- Glucosa
en las células animales es el glucógeno , un muy largo, muy ramificado
(si) H H
polímero de glucosa Tanto como el 10 por ciento del hígado por
1
O 1
O
C C
El peso puede ser glucógeno. El carbohidrato de almacenamiento primario
HO CH2 H C 2OH En las células vegetales, el almidón es también un polímero de glucosa. Ocurre en
una forma no ramificada (amilosa) y una forma ligeramente ramificada
3 3
HO CH HO CH (amilopectina). Tanto el glucógeno como el almidón están compuestos por
44 44 α anómero de glucosa. En contraste, la celulosa , el principal con-
H C OH HO CH
55 55
rigidez de las paredes celulares de las plantas, lo que confiere rigidez a muchos
H C OH H C OH estructuras vegetales (ver Capítulo 19), es un polímero no ramificado
66 66
CH 2 OH CH 2 OH del anómero ß de glucosa. Las enzimas digestivas humanas pueden
D- Manosa D- galactosa
hidrolizar los enlaces glicosídicos α en almidón pero no el ß glu-
enlaces cosídicos en celulosa. Muchas especies de plantas, bacterias,
FIGURA 2 18 Estructuras químicas de hexosas. Todas las hexosas tienen
y los mohos producen enzimas que degradan la celulosa. Vacas y
la misma fórmula química (C 6 H 12 O 6 ) y contiene un aldehído o un ceto
las termitas pueden descomponer la celulosa porque albergan celulitis
grupo. (a) Las formas de anillo de D -glucosa se generan a partir del lineal
Bacterias que se degradan en el intestino. Las paredes celulares bacterianas con-
molécula por reacción del aldehído en el carbono 1 con el hidroxilo
sist de peptidoglicano , una cadena de polisacárido reticulada por
en carbono 5 o carbono 4. Las tres formas son fácilmente interconvertibles,
aunque la forma de piranosa ( derecha ) predomina en los sistemas biológicos.
puentes cruzados de péptidos, que confieren rigidez y forma celular.
(b) En D -mannosa y D -galactosa, la configuración de H (verde) y Las lágrimas humanas y los líquidos gastrointestinales contienen lisozima,
OH (azul) unido a un átomo de carbono difiere del de glucosa. Estas una enzima capaz de hidrolizar peptidoglucano en el bac-
los azúcares, como la glucosa, existen principalmente como piranosas (anillos de seis miembros). pared celular terial.
Página 18
CH 2 OH CH 2 OH CH 2 OH CH 2 OH
O O H2O O O
HO OH H OH HO H OH
H ß H H ß H
1 + 44 1 O 44
OH H OH H OH H OH H
H H HO H H H H
FIGURA 2.19 Formación de H OH H OH H OH H OH

Galactosa Glucosa Lactosa
los disacáridos lactosa y
sacarosa En cualquier enlace glucosídico,
el carbono anomérico de un azúcar CH 2 OH CH 2 OH
molécula (en α o ß CH 2 OH CH 2 OH
O H2O O
conformación) está vinculada a un hy- H H O H H H O H
H α H α
droxil oxígeno en otro azúcar 1 + 2 1 2
OH H H HO OH H H HO
O
molécula. Los enlaces se nombran HO OH HO CH 2 OH HO CH 2 OH
en consecuencia; así lactosa contiene
H OH OH H H OH OH H
un enlace ß (1 → 4) y sacarosa
Glucosa Fructosa Sacarosa
contiene un enlace α (1 → 2).
Las enzimas que forman los enlaces glucosídicos que unen mono- sus orgánulos intracelulares y forman las superficies externas de
los sacáridos en polisacáridos son específicos para el ano α o ß Algunos virus. Las membranas literalmente definen qué es una célula (la
mer de un azúcar y un grupo hidroxilo particular en el otro. membrana externa y el contenido dentro de la membrana) y
En principio, dos moléculas de azúcar se pueden unir en una variedad lo que no es (el espacio extracelular fuera de la membrana).
de maneras porque cada monosacárido tiene múltiples hidroxilos A diferencia de las proteínas, los ácidos nucleicos y los polisacáridos, los miembros
grupos que pueden participar en la formación de glucosídicos las branas se ensamblan por la asociación no covalente de sus
cautiverio. Además, cualquier monosacárido tiene el potencial Bloques de construcción de componentes. Los bloques de construcción primarios de
tial para estar vinculado a más de otros dos monosacáridos, por lo tanto todas las biomembranas son fosfolípidos , cuya propiedad física
generando un punto de ramificación y polímeros no lineales. Glucosídico los lazos son responsables de la formación de la bicapa en forma de lámina
los enlaces generalmente se forman entre el polisacárido en crecimiento estructura de membranas. Además de los fosfolípidos, bio-
cadena y una forma modificada covalentemente de un monosacárido. Las membranas pueden contener una variedad de otras moléculas, incluyendo
Dichas modificaciones incluyen la adición de un fosfato (por ejemplo, ing colesterol, glicolípidos y proteínas. La estructura
glucosa-6-fosfato) o un nucleótido (p. ej., UDP-galactosa): y las funciones de las biomembranas se describirán en detalle
en el Capítulo 7. Aquí nos centraremos en los fosfolípidos en
66 66
CH 2 OPO 3
2
CH 2 OH
biomembranas
O O
Para entender la estructura de una molécula de fosfolípido, nosotros
H H OH H tiene que entender cada uno de sus componentes y cómo es
H H O O
1 1
ensamblado Como veremos en breve, una molécula de fosfolípido
OH H OH H
HO OH H O PAG O PAG O Uridina consiste en dos grupos de ácidos grasos no polares de cadena larga unidos
O O (generalmente por un enlace éster) a grupos pequeños y altamente polares,
H OH H OH
incluyendo una molécula orgánica corta como el glicerol (trihy-
Glucosa-6-fosfato UDP-galactosa
droxy propano), un fosfato, y típicamente, un pequeño orgánico
molécula (Figura 2-20).
Las enzimas epimerasas que interconvierten diferentes monosacos
Los ácidos grasos consisten en una cadena de hidrocarburos unida a
los carburos a menudo lo hacen usando azúcares de nucleótidos en lugar de
un grupo carboxilo ( J COOH). Al igual que la glucosa, los ácidos grasos son
los azúcares no modificados o "libres".
Una fuente de energía importante para muchas células (ver Capítulo 12).
Muchos polisacáridos complejos contienen azúcares modificados.
Difieren en longitud, aunque los ácidos grasos predominantes
que están vinculados covalentemente a varios grupos pequeños, en particular
en las células tienen un número par de átomos de carbono, generalmente 14,
larly grupos amino, sulfato y acetilo. Tales modificaciones
16, 18 o 20. Los principales ácidos grasos en los fosfolípidos son
son abundantes en glicosaminoglicanos , los principales polisacáridos
enumerados en la Tabla 2-4. Los ácidos grasos a menudo son designados por el
componentes de la matriz extracelular que describimos en abreviatura C x : y , donde x es el número de carbonos en
Capítulo 19
la cadena e y es el número de dobles enlaces. Ácidos grasos
que contienen 12 o más átomos de carbono son casi insolubles en
soluciones acuosas debido a su larga hidro- hidrófoba
Los fosfolípidos se asocian de manera no covalente
cadenas de carbono
formar la estructura básica de la bicapa Ácidos grasos en los que todos los enlaces carbono-carbono son
de biomembranas enlaces simples, es decir, los ácidos grasos no tienen carbono-carbono
Las biomembranas son láminas grandes y flexibles con dos capas, o dobles enlaces: se dice que están saturados ; aquellos con al menos
bicapa, estructura. Sirven como los límites de las células y un doble enlace carbono-carbono se llama insaturado .
Página 19
Cadenas de ácidos grasos
O Cabeza hidrofílica
C CH 2 Fosfato
O CH 3
O CH O H2
C
C N+
H2C PAG CH 3
O C
Cola hidrofóbica O O CH 3
O- H2
Glicerol
Colina
FOSFATIDILLCOLINA
FIGURA 2.20 Fosfatidilcolina, un fosfoglicérido típico. de las cadenas laterales de acilo graso en un fosfoglicérido pueden estar saturadas o
Todos los fosfoglicéridos son fosfolípidos anfipáticos, que tienen un insaturado En el ácido fosfatídico (rojo), el fosfolípido más simple, el
cola hidrofóbica (amarillo) y una cabeza hidrofílica (azul) en la que El fosfato no está vinculado a un alcohol.
el glicerol se une mediante un grupo fosfato a un alcohol. Cualquiera o los dos
Ácidos grasos insaturados con más de un carbono-carbono. la colina está unida al fosfato (ver Figura 2-20).
doble enlace se denominan poliinsaturados . Dos "essen- El fosfato cargado negativamente, así como el cargado
ácidos grasos poliinsaturados tial ”, ácido linoleico (C18: 2) y o grupos polares esterificados, pueden interactuar fuertemente con
ácido linolénico (C18: 3), no puede ser sintetizado por mamíferos agua. El fosfato y su grupo esterificado asociado.
y deben ser suministrados en su dieta. Los mamíferos pueden sintetizar constituyen el grupo "cabeza" de un fosfolípido, que es
Otros ácidos grasos comunes. hidrofílica, mientras que las cadenas de acilo graso, las "colas", son
En los fosfolípidos, los ácidos grasos están unidos covalentemente a hidrofóbico. Otros fosfoglicéridos comunes y asociados
otra molécula por esterificación. En la molécula combinada Los grupos de cabezas modificadas se muestran en la Tabla 2-5. Moléculas como
formado por esta reacción, la parte derivada del ácido graso fosfolípidos que tienen hidrofóbicos e hidrofílicos
se llama grupo acilo , o grupo acilo graso . Esta estructura es Las regiones se llaman anfipáticas. En el Capítulo 7, veremos
ilustrado por las formas más comunes de fosfolípidos: fosfatasa cómo las propiedades anfipáticas de los fosfolípidos permiten su
Foglicéridos , que contienen dos grupos acilo unidos a dos ensamblado en bicapas en forma de láminas en las que las colas de acilo graso
de los tres grupos hidroxilo de glicerol (ver Figura 2-20). apunte hacia el centro de la hoja y los grupos de cabeza señalan
En los fosfoglicéridos, un grupo hidroxilo del glicerol hacia afuera hacia el ambiente acuoso (ver Figura 2-13).
está esterificado a fosfato mientras que los otros dos están normalmente Los grupos acilo grasos también pueden estar unidos covalentemente en otros
esterificado a ácidos grasos. El fosfolípido más simple, fosfa- moléculas grasas, incluidos triacilgliceroles o triglicéridos ,
ácido tídico, contiene solo estos componentes. Fosfolípidos que contienen tres grupos acilo esterificados a glicerol:
tales como los ácidos fosfatídicos no son solo membranas
O
ing bloques pero también importantes moléculas de señalización. Liso
ácido fosfatídico, en el que la cadena de acilo en la posición 2 H3C (CH 2 ) n C O CH 2
(unido al grupo hidroxilo en el carbono central de O

se ha eliminado el glicerol), es relativamente soluble en agua
H3C (CH 2 ) n C O CH
y puede ser un potente inductor de la división celular (llamado mito-
O
gen). En la mayoría de los fosfolípidos encontrados en las membranas, el fos-
H3C (CH 2 ) n C O CH 2
el grupo del fato también se esterifica a un grupo hidroxilo en otro
Triacilglicerol
compuesto hidrofílico En fosfatidilcolina, por ejemplo,
CUADRO 2-4 Ácidos grasos que predominan en los fosfolípidos
Nombre común del ácido (forma ionizada entre paréntesis) Abreviatura Fórmula química
Ácidos grasos saturados

Mirista (miristato) C14: 0 CH 3 (CH 2 ) 12 COOH
Palmitico (palmitato) C16: 0 CH 3 (CH 2 ) 14 COOH
Esteárico (estearato) C18: 0 CH 3 (CH 2 ) 16 COOH
Ácidos grasos insaturados

Oleico (oleato) C18: 1 CH 3 (CH 2 ) 7 CH = CH (CH 2 ) 7 COOH
Linoleico (linoleato) C18: 2 CH 3 (CH 2 ) 4 CH = CHCH 2 CH = CH (CH 2 ) 7 COOH
Araquidónico (araquidonato) C20: 4 CH 3 (CH 2 ) 4 (CH = CHCH 2 ) 3 CH = CH (CH 2 ) 3 COOH
Página 20
Los triglicéridos y los ésteres de colesterilo son extremadamente agua-

CUADRO 2-5 Fosfoglicéridos comunes moléculas insolubles en las que los ácidos grasos y el colesterol son
y grupos principales ya sea almacenado o transportado. Los triglicéridos son el almacenamiento
forma de ácidos grasos en las células grasas del tejido adiposo y son
Fosfoglicéridos Comunes Grupo principal Los principales componentes de las grasas dietéticas. Ésteres de colesterilo
y los triglicéridos se transportan entre los tejidos a través de
CH 3 el torrente sanguíneo en portadores especializados llamados lipoproteínas
CH 3
(ver Capítulo 14).
N+
Fosfatidilcolina O CH 3
Vimos anteriormente que los ácidos grasos, que son componentes clave
Colina
los componentes de fosfolípidos y triglicéridos pueden
estar saturado o insaturado. Un importante conse-
H
secuencia del doble enlace carbono-carbono (C = C) en un
H ácido graso saturado es que dos configuraciones estereoisoméricas,
N+
Fosfatidiletanolamina O H
cis y trans, son posibles alrededor de cada uno de estos enlaces:
Etanolamina
H2C CH 2 H2C H
C C C C
H H H CH 2
H
H
Cis Trans
N+
O H
Fosfatidilserina Un doble enlace cis introduce un pliegue rígido en el otro
O O- cadena de acilo recta flexible de un ácido graso saturado
(Figura 2-21). En general, los ácidos grasos insaturados en bi-
Serina
Los sistemas ológicos contienen solo dobles enlaces cis. Saturado
los ácidos grasos sin torceduras pueden empaquetarse fuertemente y así
OH OH tienen puntos de fusión más altos que los ácidos grasos insaturados. los
HO 66 44 OH Las principales moléculas grasas en la mantequilla son triglicéridos con satu-
55
O
Fosfatidilinositol 1
2
3
OH cadenas de acilo graso clasificadas, razón por la cual la mantequilla suele ser sólida
a temperatura ambiente. Ácidos grasos insaturados o acilo graso
Inositol
las cadenas con el doble enlace cis no pueden empaquetarse tan de cerca
juntos como cadenas de acilo graso saturado. Así aceites vegetales,
compuesto de triglicéridos con grupos acilo graso insaturado,
Suelen ser líquidos a temperatura ambiente. Vegetales y Simi
los aceites lar pueden estar parcialmente hidrogenados para convertir algunos de
sus cadenas de acilo graso insaturado a acilo graso saturado
También se pueden unir covalentemente a los muy hidrófobos. cadenas Como consecuencia, el aceite vegetal hidrogenado
Molécula de colesterol, un alcohol, para formar ésteres de colesterilo: se puede moldear en barras sólidas de margarina. Un subproducto
de la reacción de hidrogenación es la conversión de algunos de
H3C CH 3
las cadenas de acilo graso en ácidos grasos trans, popularmente llamados
CH 3 "Grasas trans". Estas "grasas trans", que se encuentran en hidrogen parcialmente
CH 3
La margarina y otros productos alimenticios no son naturales.
CH 3 Los ácidos grasos saturados y trans tienen propiedades físicas similares.
corbatas; por ejemplo, tienden a ser sólidos a temperatura ambiente.
Su consumo, en relación con el consumo de insatu-
grasas clasificadas, se asocia con un aumento del colesterol en plasma
HO
Colesterol
niveles y es desalentado por algunos nutricionistas. ■
H3C CH 3
CH 3
CH 3
CH 3
CH 3
O
Éster de colesterilo
Página 21
H3C
H
C
H
H
C H
H
C
H
H
C
H
H C
H
H C
H
H
C
H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H
O H O
C
H3C C C C C C C C C C C C C C CC H C C C C C C C CC
J J
O O
H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H
Palmitato Oleato
(forma ionizada de ácido palmítico) (forma ionizada de ácido oleico)
FIGURA 2-21 El efecto de un doble enlace en la forma de uno insaturado con 18 átomos de C. En ácidos grasos saturados, el
ácidos grasos. Se muestran estructuras químicas de la forma ionizada de la cadena de hidrocarburos es a menudo lineal; el doble enlace cis en oleato crea
ácido palmítico, un ácido graso saturado con 16 átomos de carbono y ácido oleico, un pliegue rígido en la cadena de hidrocarburos.
CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 2.2 azúcar, que conduce a la formación de disacáridos y otros poli-
sacáridos (ver Figura 2-19).
Bloques de construcción químicos de células r Los fosfolípidos son moléculas anfipáticas con un hidro-
Las macromoléculas son polímeros de subunidades monoméricas. cola fóbica (a menudo dos cadenas de acilo graso) conectadas por una pequeña
unidos por enlaces covalentes a través de reacciones de deshidratación. molécula orgánica (a menudo glicerol) a una cabeza hidrofílica (ver
Se encuentran tres tipos principales de macromoléculas en las células: Figura 2-20).
proteínas, compuestas de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos;
r La larga cadena de hidrocarburos de un ácido graso puede estar saturada
ácidos nucleicos, compuestos de nucleótidos unidos por fosfodi uratado (que no contiene dobles enlaces carbono-carbono) o
enlaces éster; y polisacáridos, compuestos de monosaccha- insaturado (que contiene uno o más dobles enlaces). Graso
paseos (azúcares) unidos por enlaces glucosídicos (ver Figura 2-13). sustancias como la mantequilla que tienen principalmente grasas saturadas
Fosfolípidos, el cuarto componente químico principal, las cadenas de acilo tienden a ser sólidas a temperatura ambiente, mientras que
ensamblar de forma no covalente en biomembranas. Las grasas insaturadas con dobles enlaces cis tienen cadenas retorcidas
r Diferencias en el tamaño, forma, carga, hidrofobicidad y que no pueden empaquetarse juntas y tienden a ser líquidos
reactividad de las cadenas laterales de los 20 aminoácidos comunes a temperatura ambiente.
Determinar las propiedades químicas y estructurales de las proteínas.
(Ver Figura 2-14). Las tres categorías generales en las que
las cadenas laterales caen son hidrofóbicas, hidrofílicas (básicas, ácidas,
polar) y especial (ver Figura 2-14). Es útil recordar
¿Qué aminoácidos se incluyen en cada una de estas categorías? 2.3 Reacciones químicas y productos químicos
r Las bases en los nucleótidos que componen el ADN y el ARN Equilibrio
son anillos que contienen carbono y nitrógeno unidos a una pluma
el azúcar Forman dos grupos: las purinas, con dos Ahora cambiamos nuestra discusión a reacciones químicas en las que
anillos (adenina (A) y guanina (G)) y las pirimidinas, enlaces, principalmente enlaces covalentes en químicos reactivos , son
los enlaces rotos y nuevos se forman para generar reacción
con un anillo: citosina (C), timina (T) y uracilo (U) (ver
Figura 2-17). A, G, T y C se encuentran en el ADN, y A, G, productos . En cualquier momento, varios cientos de tipos diferentes
de reacciones químicas se producen simultáneamente en cada
U y C se encuentran en el ARN.
celular, y muchas sustancias químicas pueden, en principio, sufrir múltiples
r La glucosa y otras hexosas pueden existir en tres formas: una reacciones químicas. Tanto la medida en que las reacciones pueden
estructura lineal de cadena abierta, seis miembros (piranosa) proceder y la velocidad a la que tienen lugar determina el
anillo y un anillo de cinco miembros (furanosa) (ver Figura 2-18). Composición química de las células. En esta sección, discutimos el
En sistemas biológicos, la forma de piranosa de d-glucosa conceptos de equilibrio y estado estacionario, así como disociación
predomina.
constantes y pH. Estos conceptos surgirán nuevamente y
r Los enlaces glucosídicos se forman entre el α o el nuevamente a lo largo de este texto, por lo que es importante que usted sea
ß anómero de un azúcar y un grupo hidroxilo en otro familiarizado con ellos. En la Sección 2.4, discutimos cómo la energía
influye en la extensión y velocidad de las reacciones químicas.
2.3 Reacciones químicas y equilibrio químico 51
Página 22
Una reacción química está en equilibrio La constante de equilibrio refleja

Cuando las tasas de avance y retroceso el alcance de una reacción química
Las reacciones son iguales Para cualquier reacción química, K eq depende del químico
Cuando los reactivos se mezclan por primera vez, antes de cualquier producto naturaleza de los reactivos y productos, la temperatura y
se han formado: la velocidad de reacción hacia adelante para formar la presión (particularmente en reacciones que involucran gases). Debajo
los productos están determinados en parte por el contacto inicial de los reactivos. condiciones físicas estándar (25 ° C y 1 atm de presión para
centraciones, que determinan la probabilidad de reactivos sistemas biológicos), K eq es siempre el mismo para una reacción dada
chocando entre sí y reaccionando (Figura 2-22). Como ción, esté o no presente un catalizador.
los productos de reacción se acumulan, la concentración de cada Para la reacción general con tres reactivos y tres
el reactivo disminuye, y también lo hace la velocidad de reacción directa. productos,
Mientras tanto, algunas de las moléculas del producto comienzan a participar
paté en la reacción inversa, que vuelve a formar los reactivos. aA + bB + cC ZZX YZZ zZ + yY + xX (2-1)
La capacidad de una reacción para ir "hacia atrás" se llama micro-
reversibilidad escopica . La reacción inversa es lenta al principio pero donde las letras mayúsculas representan moléculas o átomos particulares
se acelera a medida que aumenta la concentración del producto. Eventu- y letras minúsculas representan el número de cada uno en el
aliado, las tasas de las reacciones directas e inversas se vuelven reacción, la fórmula para la constante de equilibrio viene dada por
igual, de modo que las concentraciones de reactivos y productos [X] x [Y] y [Z] z
deja de cambiar. Luego se dice que el sistema está en química K eq = (2-2)
equilibrio (plural, equilibrios ). [A] a [B] b [C] c
La relación de las concentraciones de los productos a la donde los corchetes denotan las concentraciones de las moléculas.
concentraciones de los reactivos cuando alcanzan el equilibrio En la ecuación 2-2, las concentraciones de reactivos y productos
El rio, llamado constante de equilibrio ( K eq ), es un valor fijo. Los efectos son aquellos presentes en el equilibrio. La tasa de avance
Por lo tanto, K eq proporciona una medida de la medida en que una reacción la reacción (de izquierda a derecha en la ecuación 2-1) es
La acción ocurre cuando alcanza el equilibrio. La tasa de
una reacción química puede ser incrementada por un catalizador , pero un Tasa adelante = k f [A] a [B] b [C] c
el catalizador no cambia la constante de equilibrio (ver sección
sección 2.4). Un catalizador acelera la fabricación y ruptura de donde k f es la constante de velocidad para la reacción directa.
enlaces covalentes pero en sí mismo no se cambia permanentemente durante Del mismo modo, la velocidad de la reacción inversa (de derecha a izquierda en
una reacción. La ecuación 2-1) es
Velocidad inversa = k r [X] x [Y] y [Z] z
donde k r es la constante de velocidad para la reacción inversa. Estas

las ecuaciones de velocidad de reacción se aplican independientemente de si la reacción tiene o no
alcanzado el equilibrio Es importante recordar que el
Velocidad de reacción hacia adelante las tasas de avance y retroceso de una reacción pueden cambiar porque
(disminuye a medida que disminuye la concentración de reactivos)
de cambios en las concentraciones de reactivo o producto, pero a la
Al mismo tiempo, las constantes de velocidad directa e inversa no
cambio; de ahí el nombre de "constante". Tasas y tasas confusas
Equilibrio químico
(las tasas de avance y retroceso son
constantes es un error común. En equilibrio el delantero
igual, sin cambio en la concentración y las tasas inversas son iguales, por lo que la tasa directa / tasa inversa = 1. Por
de reactivos y productos) reorganizando estas ecuaciones, podemos expresar el equilibrio
Velocidad de reacción constante como la razón de las constantes de velocidad:
Velocidad de reacción inversa
(aumenta a medida que aumenta la concentración de productos) kf
K eq = (2-3)
kr
Cuando los reactivos se mezclan por primera vez,
El concepto de K eq es particularmente útil cuando queremos
concentración inicial de productos = 0
pensar en la energía que se libera o se absorbe cuando
Hora Se produce una reacción química. Discutiremos este concepto en
considerable detalle en la Sección 2.4.
FIGURA 2 22 Dependencia temporal de las tasas de un químico
reacción. Las velocidades de avance y retroceso de una reacción dependen en parte de
Las concentraciones iniciales de reactivos y productos. El neto hacia adelante
Las reacciones químicas en las células están en estado estacionario
la velocidad de reacción disminuye a medida que disminuye la concentración de reactivos,
mientras que la velocidad de reacción inversa neta aumenta a medida que la concentración de
En condiciones apropiadas y con el tiempo suficiente, un
aumenta los productos En equilibrio, las tasas de avance y retroceso reacción bioquímica única realizada en un tubo de ensayo incluso
las reacciones son iguales y las concentraciones de reactivos y productos alcanza el equilibrio, en el cual las concentraciones de
permanecer constante. los reactivos y productos no cambian con el tiempo porque el
Página 23
(a) Concentraciones de equilibrio del tubo de ensayo de un ligando (p. ej., la hormona insulina o adrenalina) a su
receptor en la superficie de una célula, que desencadena una intracel-
BBB
AAA BBB vía de señalización lular (ver Capítulo 15). Otro ejemplo
BBB es la unión de una proteína a una secuencia específica de bases en
una molécula de ADN, que frecuentemente causa la expresión
(b) Concentraciones intracelulares de estado estacionario de un gen cercano para aumentar o disminuir (ver Capítulo 9). Si
BBB CC
se conoce la constante de equilibrio para una reacción de unión, la
Automóvil club británico Se puede predecir la estabilidad del complejo resultante.
BBB CC
Ilustrar el enfoque general para determinar el
FIGURA 2.23 Comparación de reacciones en equilibrio y en
concentración de complejos no covalentemente asociados, vamos
estado estable. (a) En el tubo de ensayo, una reacción bioquímica (A → B)
calcular el grado en que una proteína (P) se une al ADN
finalmente alcanza el equilibrio, al cual las tasas de avance y
(D), formando un complejo proteína-ADN (PD):
las reacciones inversas son iguales (como lo indican las flechas de reacción de
misma longitud). (b) En las rutas metabólicas dentro de las células, el producto B es
comúnmente consumido, en este ejemplo, por conversión a C. Una vía
P + D ZZX
PD YZZ
de reacciones vinculadas está en estado estacionario cuando la tasa de formación de la
intermedios (p. ej., B) es igual a su tasa de consumo. Como se indica
Más comúnmente, las reacciones de unión se describen en términos de
por la longitud desigual de las flechas, las reacciones reversibles individuales la constante de disociación ( K d ), que es el recíproco de la
que constituyen una vía metabólica no alcanzan el equilibrio. Además, equilibrio constante. Para esta reacción de unión, la disociación
las concentraciones de los intermedios en estado estacionario pueden diferir de constante constante se calcula a partir de las concentraciones de la
lo que estarían en equilibrio. tres componentes cuando están en equilibrio por
[P] [D]
Kd= (2-4)
[PD]
Las tasas de las reacciones directas e inversas son iguales. Dentro
células, sin embargo, muchas reacciones están vinculadas en vías en Vale la pena señalar que en una reacción tan vinculante, cuando la mitad
que un producto de una reacción no se reconvierte simplemente del ADN está unido a la proteína ([PD] = [D]), el con-
a través de una reacción inversa a los reactivos. Por ejemplo, el centration de P es igual a K d . Cuanto más bajo es el K d , más bajo
El producto de una reacción podría servir como reactivo en otra, la concentración de P necesitaba unirse a la mitad de D. En otro
o podría ser bombeado fuera de la celda. En este más complejo palabras, cuanto más baja es la K d , más estrecha es la unión (mayor
situación, la reacción original nunca puede alcanzar el equilibrio la afinidad) de P por D.
porque algunos de los productos no tienen la posibilidad de ser Típicamente, la unión de una proteína a una secuencia de ADN específica
convertido de nuevo a reactivos. Sin embargo, en tales no exhibe una K d de 10 −10 M, donde M simboliza la molaridad, o
condiciones de equilibrio, la tasa de formación de una sustancia moles por litro (mol / L). Relacionar la magnitud de esta dis-
puede ser igual a la tasa de su consumo, y como consecuencia constante de sociación a la relación intracelular de unido a
Por lo tanto, la concentración de la sustancia permanece constante ADN no unido, consideremos el simple ejemplo de una bacteria
tiempo extraordinario. En tales circunstancias, el sistema de reacción vinculada Célula rial que tiene un volumen de 1.5 × 10 −15 L y que contiene
se dice para producir y consumir esa sustancia 1 molécula de ADN y 10 moléculas de unión al ADN
estar en un estado estable (figura 2-23). Una consecuencia de proteína P. En este caso, dada una K d de 10 −10 M y el total
tales reacciones vinculadas es que evitan la acumulación concentración de P en la célula (∼111 × 10 −10 M, aproximadamente
del exceso de intermedios, protegiendo las células de los nocivos cien veces mayor que la K d ), el 99 por ciento de las veces
efectos de intermedios que son tóxicos a altas concentraciones. esta secuencia de ADN específica tendrá una molécula de proteína
Cuando la concentración de un producto de una reacción continua atado a él y el 1 por ciento de las veces no lo hará, aunque
no cambia con el tiempo, podría ser una consecuencia ¡La célula contiene solo 10 moléculas de la proteína! Claramente
de un estado de equilibrio, o podría ser una consecuencia de un P y D tienen una alta afinidad entre sí y se unen fuertemente,
estado estable. En sistemas biológicos, cuando el metabolito se concentra como lo refleja el bajo valor de la constante de disociación para
Traciones, como los niveles de glucosa en sangre, no están cambiando con Su reacción vinculante. Para proteína-proteína y proteína-ADN
tiempo, una condición llamada homeostasis , es consecuencia de vinculante, se consideran valores de K d de ∼10 −9 M (nanomolar)
un estado estable en lugar de equilibrio. ser apretado, ∼10 −6 M (micromolar) modestamente apretado, y
∼10 −3 M (milimolar) relativamente débil.
Una gran macromolécula biológica, como una proteína, puede
Constantes de disociación de las reacciones de unión tener múltiples superficies de unión para unir varias moléculas
Refleja la afinidad de las moléculas interactuantes simultáneamente (Figura 2-24). En algunos casos, estos se unen
El concepto de equilibrio también se aplica a la unión de Las reacciones son independientes, con su propia K d distinta
una molécula a otra sin cambios covalentes a cualquiera valores que son independientes entre sí. En otros casos,
molécula. Muchos procesos celulares importantes dependen de tales unión de una molécula en un sitio en una lata de macromolécula
"reacciones" vinculantes, que implican la toma y ruptura cambiar la forma tridimensional o conformación de un
ing de varias interacciones no covalentes en lugar de covalentes sitio distante, alterando así las interacciones de unión de ese
bonos, como se discutió anteriormente. Un ejemplo común es el enlace sitio distante con alguna otra molécula. Las modificaciones
Página 24
Macromolécula de unión multiligando (p. Ej., Proteína) La concentración de iones de hidrógeno en una solución es
expresado convencionalmente como su pH , definido como el negativo
Ligando A
registro de la concentración de iones de hidrógeno. El pH del agua pura.
(p. ej., proteína pequeña)
a 25 ° C es 7:
Ligando B 1 1
pH = −log [H + ] = log = log
(por ejemplo, pequeño [H + ] 10 −7 = 7
molécula)
Unión
sitio A ( K dA ) Es importante tener en cuenta que una diferencia de una unidad
en pH representa una diferencia de diez veces en la concentración
de protones. En la escala de pH, 7.0 se considera neutral: pH
Unión
valores inferiores a 7.0 indican soluciones ácidas (mayor [H + ]),
sitio B ( K dB )
y valores superiores a 7.0 indican soluciones básicas o alcalinas
(Figura 2-25). Por(HCl),
ácido clorhídrico ejemplo, jugo
tiene un gástrico, que es rico en 1. Su [H + ] es
pH de aproximadamente
Ligando C
(p. ej., polisacárido) Sitio de unión C ( K dC ) aproximadamente 1 millón de veces mayor que el del citoplasma, que
tiene un pH de aproximadamente 7.2–7.4.
FIGURA 2.24 Las macromoléculas pueden tener distintos sitios de unión para
Aunque el citosol de las células normalmente tiene un pH de aproximadamente
ligandos múltiples Una macromolécula grande (p. Ej., Una proteína, azul) con
7.2, el interior de ciertos orgánulos en las células eucariotas (ver
se muestran tres sitios de unión distintos (A – C); cada uno de los tres enlaces
Capítulo 1) puede tener un pH mucho más bajo. El interno (luminal)
los sitios exhiben complementariedad molecular con tres enlaces diferentes
El líquido en los lisosomas, por ejemplo, tiene un pH de aproximadamente 4.5.
parejas (ligandos A – C) con constantes de disociación distintas ( K dA – C ).
Cada vez más básico

(menor concentración de H + )
de cadenas laterales de aminoácidos, mencionadas anteriormente, a menudo

homenaje a las formas moleculares requeridas para tal unión escala PH
interacciones Estas reacciones de unión covalentes y no covalentes
iones son mecanismos importantes por los cuales una molécula puede
14 Hidróxido de sodio (1 N)
alterar, y así regular, la estructura y la actividad de unión
13
de otro. Examinamos este mecanismo regulador en más
Blanqueador
detalle en el Capítulo 3. 12
Amoniaco (1 N)
11
10
Los fluidos biológicos tienen valores de pH característicos Agua de mar
99
El disolvente dentro de las células y en todos los fluidos extracelulares es el agua.
Una característica importante de cualquier solución acuosa es el 8 Interior de la celda
Neutral Huevo fertilizado
concentración de iones de hidrógeno cargados positivamente (H + ) y -] 77
[H +] = [OH Huevo no fertilizado
iones hidroxilo cargados negativamente (OH - ). Porque estos iones
66 Orina
son los productos de disociación de H 2 O, que son constituyentes
55
de todos los sistemas vivos, y son liberados por muchas reacciones Interior del lisosoma
iones que tienen lugar entre moléculas dentro de las células. Estas 44
Los iones también se pueden transportar dentro o fuera de las células, como cuando 3 Jugo de uva
El jugo gástrico altamente ácido es secretado por las células que recubren las paredes.
2
del estomago
1 Jugo gastrico
Cuando una molécula de agua se disocia, uno de sus H - O polares
Se rompe lazos. El ion de hidrógeno resultante, denominado 00 Ácido clorhídrico (1 N)
protón , tiene una corta vida útil como ion libre y se combina rápidamente
con una molécula de agua para formar un ion hidronio (H 3 O + ). por
conveniencia, nos referimos a la concentración de iones de hidrógeno
en una solución, [H + ], a pesar de que esta cantidad realmente representa
Cada vez más ácido
establece la concentración de iones hidronio, [H 3 O + ]. Disociarse (mayor concentración de H + )
La porción de H 2 O genera un ion OH - junto con cada H + . los
FIGURA 2 25 Algunos valores de pH para soluciones comunes. los
La disociación del agua es una reacción reversible:
El pH de una solución acuosa es el logaritmo negativo del ion hidrógeno.
concentración. Los valores de pH para la mayoría de los intracelulares y extracelulares.
H 2 O ZZX
YZZ H + + OH - los fluidos biológicos están cerca de 7 y están cuidadosamente regulados para permitir
buen funcionamiento de las células, orgánulos y secreciones celulares. los
A 25 ° C, [H + ] [OH - ] = 10 −14 M 2 , de modo que en agua pura, Los valores de pH para soluciones de amoníaco y ácido clorhídrico son para uno
[H + ] = [OH - ] = 10 −7 M. soluciones normales (1 N).
Página 25
Las muchas enzimas degradativas dentro de la función de los lisosomas H 2 CO 3 HCO 3 - + H +

óptimamente en un ambiente ácido, mientras que su acción es
inhibido en el entorno de pH casi neutro del cito- H 2 CO 3
-
HCO 3
plasma. Como lo ilustra este ejemplo, el mantenimiento de un
100
El pH lar es esencial para el buen funcionamiento de algunas células
estructuras Por otro lado, cambios dramáticos en el pH celular
puede jugar un papel importante en el control de la actividad celular.
Por ejemplo, el pH del citoplasma de un huevo no fertilizado. 50 p K a = 6.4
del erizo de mar, un animal acuático, es 6.6. Dentro de 1 minuto
de fertilización, sin embargo, el pH se eleva a 7.2; es decir, el [H + ]
disminuye a aproximadamente un cuarto de su valor original, un cambio que
Es necesario para el posterior crecimiento y división del huevo. 00
o moléculas de bicarbonato
Porcentaje0de0 ácido carbónico
2 44 66 7.4 8
pH
Los iones de hidrógeno son liberados por los ácidos FIGURA 2 26 La relación entre pH, p K a y el
y tomado por bases disociación de un ácido. A medida que aumenta el pH de una solución de ácido carbónico
En general, un ácido es cualquier molécula, ión o grupo químico de 0 a 8.5, el porcentaje del compuesto en el no disociado, o
que tiende a liberar un ion de hidrógeno (H + ), como el car- la forma no ionizada (H 2 CO 3 ) disminuye del 100 por ciento y la del
la forma ionizada aumenta de 0 por ciento. Cuando el pH (6.4) es igual a
grupo boxilo ( - COOH), que tiende a disociarse para formar
p del ácido K a , la mitad del ácido carbónico se ha ionizado. Cuando el pH sube
el ion carboxilato cargado negativamente ( - COO - ); o hidro-
a más de 8, prácticamente todo el ácido se ha ionizado a la forma de bicarbonato
-
ácido clorhídrico (HCl). Por el contrario, una base es cualquier molécula, ion, (HCO 3 )
o grupo químico que se combina fácilmente con un H + , como
el ion hidroxilo (OH - ); amoniaco (NH 3 ), que forma un
De esta expresión, comúnmente conocida como la
+ ); o el grupo amino ( - NH 2 ).
ion amonio (NH 4
Ecuación de Henderson-Hasselbalch , se puede ver que la p K a
Cuando se agrega un ácido a una solución acuosa, el [H + ]
de cualquier ácido es igual al pH al cual la mitad de las moléculas
aumenta y el pH baja. Por el contrario, cuando una base
están disociados y la mitad son neutrales (no disociados). Esto es
se agrega a una solución, el [H + ] disminuye y el pH pasa
porque cuando [A - ] = [HA], entonces log ([A - ] / [HA]) = 0, y
arriba. Como [H + ] [OH - ] = 10 −14 M 2 , cualquier aumento en [H + ] es
así p K a = pH. La ecuación de Henderson-Hasselbalch permite
junto con una disminución proporcional en [OH - ], y viceversa
nosotros para calcular el grado de disociación de un ácido, que
viceversa
es decir, la proporción de formas disociadas y no disociadas, si ambas
Muchas moléculas biológicas contienen ácidos y ácidos.
Se conoce el pH de la solución y la p K a del ácido.
grupos Por ejemplo, en soluciones neutras (pH = 7.0), muchos
Experimentalmente, midiendo [A - ] y [HA] como función
los aminoácidos existen predominantemente en la forma doblemente ionizada,
ción del pH de la solución, se puede calcular la p K a de la
en el que el grupo carboxilo ha perdido un protón y el amino
ácido y, por lo tanto, la constante de equilibrio K a para la disociación
el grupo ha aceptado uno:
reacción (figura 2-26). Conociendo la p K a de una molécula
NH 3 no solo proporciona una descripción importante de sus propiedades,
pero también nos permite explotar estas propiedades para manipular
H C ARRULLO
la acidez de una solución acuosa y entender cómo
R los sistemas biológicos controlan esta característica crítica de sus
fluidos acuosos
donde R representa la cadena lateral sin carga. Tal
molécula, que contiene un número igual de positivo y
iones negativos, se llama zwitterion . Zwitteriones, al no tener Tampones Mantener el pH de Intracelular
carga neta, son neutrales. A valores de pH extremos, solo uno de
y fluidos extracelulares
estos dos grupos ionizables de un aminoácido están cargados: el
- NH 2 + a pH bajo y el - COO - a pH alto.
Una célula viva que metaboliza activamente debe mantener una constante
pH en el citoplasma de aproximadamente 7.2–7.4, y debe hacerlo
La reacción de disociación para un ácido (o grupo ácido en un
aun cuando su metabolismo está produciendo muchos ácidos. Las células tienen
molécula más grande) HA puede escribirse como HA ZZX
YZZ H + + A - .
un depósito de bases débiles y ácidos débiles, llamados tampones ,
La constante de equilibrio para esta reacción, denotada K a (la
que aseguran que el pH citoplasmático de la célula permanezca relacionado
el subíndice a significa "ácido"), se define como K a = [H + ] [A - ] / constante constante a pesar de pequeñas fluctuaciones en las cantidades de
[DECIR AH]. Tomando el logaritmo de ambos lados y reorganizando H + u OH - generado por el metabolismo o por la captación
el resultado produce una relación muy útil entre el equilibrio o secreción de moléculas e iones por la célula. Tampones hacer
constante de rio y pH: esto al "absorber" el exceso de H + o OH - cuando estos iones son
[A - ] añadido a la célula o son producidos por el metabolismo. Como lo haremos

pH = p K a + log (2-5) ver abajo, los amortiguadores son más efectivos para prevenir cambios
[DECIR AH]
en pH cuando el pH de la solución es similar al p K a de
donde p K a es igual a −log K a . el búfer
Page 26
8 mezcla de HA y A - que está a un pH cercano al p K a causará

menos de un cambio de pH lo que sería si el HA y A - no eran
presente o si el pH estuviera lejos del valor p K a .
CH 3 COOH CH 3 COO - + H +
Todos los sistemas biológicos contienen uno o más tampones.
66 Los iones fosfato, las formas ionizadas del ácido fosfórico, son
presente en cantidades considerables en las células y son importantes
p K a = 4.75 Tant en mantener, o amortiguar, el pH del citoplasma.
El ácido fosfórico (H 3 PO 4 ) tiene tres protones que son capaces
pH4 4 de disociarse, pero no se disocian simultáneamente.
La pérdida de cada protón puede describirse mediante un discreto examen.
reacción de ciación y p K a , como se muestra en la figura 2-28. Cuando
los iones hidroxilo se agregan a una solución de ácido fosfórico,
2
el cambio de pH es mucho menos pronunciado a valores de pH cercanos a los tres
p K a valores (región sombreada) que cuando el pH de la solución
ción no es similar a ninguna de las p K a s. La curva de titulación para
el ácido fosfórico muestra que la p K a para la disociación de
00 0.2 0.2 0.4 0.4 0.6 0.8 1.0 El segundo protón es 7.2. Por lo tanto, a pH 7.2, alrededor del 50 por ciento
Fracción de disociado CH 3 COOH de fosfato celular es H 2 PO 4 - y alrededor del 50 por ciento es
OH agregado - HPO 4 2− según la ecuación de Henderson-Hasselbalch.

Por esta razón, el fosfato es un excelente tampón a un valor de pH
FIGURA 2-27 La curva de titulación del tampón de ácido acético
ues alrededor de 7.2, el pH aproximado del citoplasma de
(CH 3 COOH). La p K a para la disociación del ácido acético en hidrógeno y
células, y a pH 7,4, el pH de la sangre humana. El amino
iones acetato es 4.75. A este pH, la mitad de las moléculas de ácido se disocian.
Debido a que el pH se mide en una escala logarítmica, la solución cambia
(lisina), guanidinio (arginina) y carboxilato (aspartato,
de 91 por ciento de CH 3 COOH a pH 3.75 a 9 por ciento de CH 3 COOH a pH
glutamato) porciones de cadenas laterales de proteínas de aminoácidos
5.75. El ácido tiene una capacidad de amortiguación máxima en este rango de pH. así como los grupos amino y carboxilato en el N y
Los términos C de las proteínas también pueden unirse y liberar protones.
Por lo tanto, las proteínas que están presentes en altas concentraciones en el interior
de células y en muchos fluidos extracelulares pueden servir ellos mismos
como amortiguadores
Si se agrega ácido (o base) adicional a una solución tamponada
cuyo pH es igual a la p K a del tampón ([HA] = [A - ]),
el pH de la solución cambia, pero cambia menos de lo que
lo haría si el búfer no hubiera estado presente. Esto es porque
14
los protones liberados por el ácido agregado son absorbidos por el ion p K a = 12.7
forma izada del tampón (A - ); asimismo, los iones hidroxilo generan 2− 3− + H+
12 HPO 4 PO 4
Ayudado por la adición de una base son neutralizados por protones
liberado por el buffer no disociado (HA). La capacidad de
un tampón o cualquier otra sustancia para liberar iones de hidrógeno o 10
tomarlos depende en parte de la medida en que
la postura ya ha tomado o liberado protones, que en 8 p K a = 7.2 -
2− + H+
a su vez depende del pH de la solución en relación con el p K a pH H 2 PO 4 HPO 4
de la sustancia. La capacidad de un búfer para minimizar los cambios. 66
en pH, su capacidad de amortiguación depende de la concentración
del búfer y la relación entre su valor p K a y
44
el pH, expresado por Henderson-Hasselbalch
ecuación. p K a = 2.1 -+ H+
2 H 3 PO 4 H 2 PO 4
La curva de titulación para el ácido acético que se muestra en la figura 2-27
ilustra el efecto del pH sobre la fracción de moléculas en el
formas no ionizadas (HA) e ionizadas (A - ). Cuando el pH es 00
igual a la p K a , la mitad del ácido acético se disocia (discontinua OH agregado -
líneas). A una unidad de pH por debajo de la p K a de un ácido, 91 por ciento FIGURA 2.28 La curva de titulación del ácido fosfórico (H 3 PO 4 ), a
de las moléculas están en forma de HA; a una unidad de pH arriba
tampón común en sistemas biológicos. Esta biológicamente ubicua
el p K una , 91 por ciento están en la A - forma. A valores de pH más
la molécula tiene tres átomos de hidrógeno que se disocian a diferentes pH
de una unidad por encima o por debajo de la p K a (regiones sin sombrear en valores; así, el ácido fosfórico tiene tres valores de p K a , como se indica en el
Figura 2-27), la capacidad de amortiguación de ácidos y bases débiles. grafico. Las áreas sombreadas denotan los rangos de pH, dentro de una unidad de pH
disminuye rápidamente. En otras palabras, la adición de la misma de los tres valores de p K a , donde la capacidad de amortiguación del fósforo
cantidad de moles de base, por ejemplo, iones hidroxilo añadidos El ácido es alto. En estas regiones, la adición de un ácido (o base) causará
como hidróxido de sodio (NaOH), a una solución que contiene un Cambios relativamente pequeños en el pH.
Página 27
En esta sección, revisamos cómo la energía influye en la extensión

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 2.3 de reacciones químicas (termodinámica química) y la
tasas de reacciones químicas (cinética química).
Reacciones Químicas y Químicas
Equilibrio
Varias formas de energía son importantes
r Una reacción química está en equilibrio cuando la tasa de
La reacción directa es igual a la velocidad de la reacción inversa, en sistemas biológicos
y por lo tanto no hay cambio neto en la concentración de la Hay dos formas principales de energía: cinética y potencia.
reactivos o productos. tial La energía cinética es la energía del movimiento: el movimiento
de moléculas, por ejemplo. La energía potencial se almacena.
r La constante de equilibrio K eq de una reacción refleja el
relación de productos a reactivos en equilibrio y, por lo tanto, es una energía: la energía almacenada en enlaces covalentes, por ejemplo.
medida de la extensión de la reacción y la relativa estabilidad La energía potencial juega un papel particularmente importante en el
Lazos de los reactivos y productos. economía energética de las células.
La energía térmica , o calor, es una forma de energía cinética: la
r La K eq depende de la temperatura, la presión y la química Energía del movimiento de las moléculas. Para que el calor haga el trabajo,
propiedades cal de los reactivos y productos pero es independiente
debe fluir desde una región de mayor temperatura, donde
mella de la velocidad de reacción y de las concentraciones iniciales de la velocidad promedio del movimiento molecular es mayor a uno
reactivos y productos.
de baja temperatura. Aunque las diferencias de temperatura
r Para cualquier reacción, la constante de equilibrio K eq es igual a puede existir entre los ambientes internos y externos
relación entre la tasa de avance constante y la tasa de retorno inversa de las células, estos gradientes térmicos no suelen servir como
stant ( k f / k r ). Las tasas de conversión de reactivos a productos. fuente de energía para actividades celulares. La energía térmica
y viceversa, dependen de las constantes de velocidad y la concentración en animales de sangre caliente, que han desarrollado un mecanismo
Traciones de los reactivos o productos. para termorregulación, se usa principalmente para mantener constante
temperaturas organismales. Este es un homeostático importante
r Dentro de las células, las reacciones vinculadas en las vías metabólicas
generalmente no están en equilibrio, sino más bien en estado estacionario, en funcionan porque las tasas de muchas actividades celulares son temporales
dependiente de la peratura. Por ejemplo, enfriar células de mamíferos
que la tasa de formación de los intermedios es igual a su
tasa de consumo (ver Figura 2-23) y, por lo tanto, la concentración de su temperatura corporal normal de 37 ° C a 4 ° C puede
virtualmente "congelar" o detener muchos procesos celulares (por ejemplo, intra-
Las tradiciones de los intermedios no están cambiando.
movimientos de la membrana celular).
r La constante de disociación K d para la unión no covalente Energía radiante , la energía cinética de los fotones u ondas de
de dos moléculas es una medida de la estabilidad del complejo ligero, es crítico para la biología. La energía radiante se puede convertir
formado entre las moléculas (p. ej., ligando-receptor o pro- a la energía térmica, por ejemplo, cuando la luz es absorbida por
complejos de ADN-teína). Valores de K d de ∼10 −9 M (nanomolar) moléculas y la energía se convierte en movimiento molecular.
se consideran apretados, ∼10 −6 M (micromolar) modestamente La energía radiante absorbida por las moléculas también puede cambiar el
apretado, y ∼10 −3 M (milimolar) relativamente débil. estructura electrónica de las moléculas moviendo electrones
r El pH es el logaritmo negativo de la concentración de en orbitales de mayor energía, de donde se puede recuperar más tarde
iones de hidrógeno (−log [H + ]). El pH del citoplasma es normal. para realizar trabajo. Por ejemplo, durante la fotosíntesis, la luz
mally alrededor de 7.2–7.4, mientras que el interior de los lisosomas tiene energía absorbida por moléculas de pigmento como la clorofila
un pH de aproximadamente 4.5. posteriormente se convierte en la energía de los enlaces químicos
(ver Capítulo 12).
r Los ácidos liberan protones (H + ) y las bases los unen.
Energía mecánica , una forma importante de energía cinética en
r Los tampones son mezclas de un ácido débil (HA) y su correspondiente biología, generalmente resulta de la conversión de químicos almacenados
forma de base esponjosa (A - ), que minimiza el cambio en el pH energía cal. Por ejemplo, cambios en la longitud del citoesqueleto
de una solución cuando se agrega un ácido o una base. Sistema biológico Los filamentos de tal generan fuerzas que empujan o tiran de las membranas
los equipos usan varios tampones para mantener su pH dentro de
y orgánulos (véanse los capítulos 17 y 18).
rango estrecho. Energía eléctrica: la energía de los electrones en movimiento u otros
partículas cargadas: es otra forma importante de cinética
energía, una con particular importancia para las funciones de membrana
ción, como en las neuronas eléctricamente activas (ver Capítulo 22).
Varias formas de energía potencial son biológicamente significativas.
2.4 Energética bioquímica
importante Central para la biología es la energía potencial química , la
La transformación de la energía, su almacenamiento y su uso son energía almacenada en los enlaces que conectan los átomos en las moléculas.
central para la economía de la célula. La energía puede ser definida De hecho, la mayoría de las reacciones bioquímicas descritas en este
como la capacidad de hacer trabajo, un concepto que es aplicable a libro implica la fabricación o ruptura de al menos una cova-
células en cuanto a motores de automóviles y plantas de energía eléctrica. los prestado enlace químico. En general, la energía debe gastarse en
la energía almacenada dentro de los enlaces químicos se puede aprovechar para hacer enlaces covalentes en biomoléculas típicas y energía
Apoyar el trabajo químico y los movimientos físicos de las células. se libera cuando se rompen esos enlaces. Por ejemplo, el
2.4 Energética bioquímica 57
Página 28
alto potencial de energía en los enlaces covalentes de glucosa puede elevar la temperatura de un gramo de agua en 1 ° C.
ser liberado por combustión enzimática controlada en las células (ver A lo largo de este libro, usamos la kilocaloría para medir
Capítulo 12). Esta energía es aprovechada por la célula para hacer muchas cambios de energía (1 kcal = 1000 cal). Cuando lees o escuchas
tipos de trabajo sobre las "Calorías" en los alimentos (tenga en cuenta la C mayúscula ), la referencia
Una segunda forma biológicamente importante de energía potencial. casi siempre es a kilocalorías como se define aquí.
es la energía en un gradiente de concentración . Cuando la concentración
Tración de una sustancia en un lado de una barrera, como un
membrana, es diferente de la del otro lado, una concentración
El cambio en la energía libre determina si un
El gradiente de tration existe. Todas las células forman gradientes de concentración. Reacción química ocurrirá espontáneamente
entre su interior y los fluidos externos selectivamente Las reacciones químicas se pueden dividir en dos tipos, dependiendo
intercambiando nutrientes, productos de desecho e iones con sus sobre si la energía es absorbida o liberada en el proceso.
alrededores. Además, los fluidos dentro de los orgánulos en En una reacción exergónica ("liberación de energía"), los productos
las células (p. ej., mitocondrias, lisosomas) con frecuencia contienen dif contienen menos energía que los reactivos. Reacciones ejercónicas
concentraciones diferentes de iones y otras moléculas que no sean tener lugar espontáneamente. La energía liberada suele ser
citoplasma; la concentración de protones dentro de un lisosoma, liberado como calor (la energía del movimiento molecular) y gen-
como vimos en la última sección, es aproximadamente 500 veces mayor que Eralmente resulta en un aumento de la temperatura, como en la oxidación
El citoplasma. Gradientes de concentración de protones a través de (quema) de madera. En un endergónico ("absorbente de energía")
las membranas son un importante motor de producción de energía en reacción, los productos contienen más energía que la reacción
mitocondrias tants, y la energía se absorbe durante la reacción. Si hay
Una tercera forma de energía potencial en las células es una eléctrica. ninguna fuente externa de energía para impulsar una reacción endergónica,
potencial: la energía de separación de carga. Por ejemplo, No puede tener lugar. Las reacciones endergónicas son responsables
hay un gradiente de carga eléctrica de aproximadamente 200,000 voltios por la capacidad de las compresas frías instantáneas que a menudo se usan para tratar
por centímetro a través de las membranas plasmáticas de prácticamente Las lesiones se enfrían rápidamente por debajo de la temperatura ambiente. Aplastante
todas las celdas Discutimos cómo gradientes de concentración y elec- el paquete mezcla los reactivos, iniciando la reacción.
gradientes potenciales tric se generan y mantienen en Un concepto fundamentalmente importante en la comprensión.
Capítulo 11 y cómo se convierten en potencia química si una reacción es exergónica o endergónica, y por lo tanto si
energía espacial en el Capítulo 12. ocurre espontáneamente o no, es energía libre ( G ), o Gibbs
energía libre , llamada así por JW Gibbs. Gibbs, quien recibió
Las células pueden transformar un tipo El primer doctorado en ingeniería en América en 1863, mostró
de energía en otro que "todos los sistemas cambian de tal manera que la energía libre [ G ]
se minimiza ". En otras palabras, se produce una reacción química
Según la primera ley de la termodinámica, la energía es nei-
creado o destruido, pero se puede convertir de uno espontáneamente cuando la energía libre de los productos es menor
forma a otro. (En reacciones nucleares, la masa se convierte en que la energía libre de los reactivos. En el caso de una sustancia química
energía, pero esto es irrelevante en los sistemas biológicos.) Energía reacción, reactivos ZZX Productos YZZ, el cambio de energía libre,
Las conversiones son muy importantes en biología. En fotosynthe- Δ G , viene dado por
sis, por ejemplo, la energía radiante de la luz se transforma Δ G = G productos - G reactivos
en la energía potencial química de los enlaces covalentes
entre los átomos en una molécula de sacarosa o almidón. En mus- La relación de Δ G con la dirección de cualquier reacción química.
cles y nervios, energía química potencial almacenada en covalente se puede resumir en tres declaraciones:
los enlaces se transforman, respectivamente, en la energía cinética de
r Si Δ G es negativo, la reacción directa tenderá a ocurrir
contracción muscular y la energía eléctrica de la transmisión neuronal
espontáneamente, y la energía generalmente se liberará a medida que
misión. En todas las células, energía potencial, liberada al romperse
la acción tiene lugar (reacción exergónica) (figura 2-29). Una reac-
ciertos enlaces químicos: se utilizan para generar energía potencial la sección con un Δ G negativo se denomina termodinámicamente
en forma de gradientes de concentración y potencial eléctrico.
favorable.
Del mismo modo, la energía almacenada en gradientes de concentración química
o gradientes de potencial eléctrico se utilizan para sintetizar productos químicos r Si Δ G es positivo, la reacción directa no ocurrirá
enlaces o para transportar moléculas de un lado de un miembro espontáneamente; habrá que añadir energía al sistema en
Brane a otro para generar un gradiente de concentración. los para forzar a los reactivos a convertirse en productos (endergonic
este último proceso ocurre durante el transporte de nutrientes tales reacción).
como glucosa en ciertas células y el transporte de muchos desechos
r Si Δ G es cero, se producirán reacciones directas e inversas
productos fuera de las células.
cur a tasas iguales, y no habrá con- red neta espontánea
Debido a que todas las formas de energía son interconvertibles, pueden
versión de reactivos a productos, o viceversa; el sistema es
expresarse en las mismas unidades de medida. A pesar de que
en equilibrio.
la unidad estándar de energía es el julio, los bioquímicos tienen
Tradicionalmente se utiliza una unidad alternativa, la caloría (1 julio = Por convención, el cambio estándar de energía libre de un
0.239 calorías). Una caloría es la cantidad de energía requerida. reacción (Δ G ° ′) es el valor del cambio en energía libre en
Página 29
(un) (si) si Δ S aumenta lo suficiente para que el término T Δ S pueda superar

el positivo Δ H .
Exergónico Endergonic
Muchas reacciones biológicas conducen a un aumento en el orden
Reactivos y, por lo tanto, una disminución de la entropía (Δ S <0). Un examen obvio
ple es la reacción que une los aminoácidos para formar una proteína. UN
La solución de moléculas de proteínas tiene una entropía más baja que
∆ G <0
sol sol Productos una solución de los mismos aminoácidos sin unir porque
la libre circulación de cualquier aminoácido está más restringida (mayor
Productos orden) cuando está unido en una cadena larga que cuando no lo está.
∆G>0 Por lo tanto, cuando las células sintetizan polímeros como las proteínas de
Energía gratis, Energía gratis,
sus monómeros constituyentes, la reacción de polimerización
Reactivos
ser espontáneo solo si las células pueden transferir energía de manera eficiente
para generar los enlaces que mantienen unidos a los monómeros
y superar la pérdida de entropía que acompaña al polímero
ización A menudo las células logran esta hazaña al "acoplar" tales
reacciones sintéticas reductoras de la entropía con reacción independiente
Progreso de la reacción. Progreso de la reacción.
iones que tienen un Δ G muy altamente negativo , como el hidro-
FIGURA 2.29 Cambios en la energía libre ( Δ G ) de exergónico y Lisis de nucleósidos trifosfatos (ver más abajo). De este modo,
reacciones endergónicas (a) En las reacciones exergónicas, la energía libre de las células pueden convertir fuentes de energía en su entorno en
los productos son menores que los de los reactivos. En consecuencia, estos Las estructuras altamente organizadas y las vías metabólicas que
las reacciones ocurren espontáneamente y se libera energía a medida que las reacciones Son esenciales para la vida.
Continuar. (b) En las reacciones endergónicas, la energía libre de los productos.
El cambio real en la energía libre durante una reacción es
es mayor que la de los reactivos, y estas reacciones no ocurren
influenciado por la temperatura, la presión y la temperatura inicial
espontáneamente. Se debe suministrar una fuente de energía externa si el
centrados de reactivos y productos, por lo que generalmente difiere
Los reactivos deben convertirse en productos.
del cambio estándar de energía libre Δ G ° ′. Más biológico
reacciones, como otras que tienen lugar en soluciones acuosas,
También se ven afectados por el pH de la solución. Podemos estimar
cambios de energía libre para temperaturas y concentración inicial
298 K (25 ° C), presión de 1 atm, pH 7.0 (como en agua pura), iones que difieren de las condiciones estándar mediante el uso de
y concentraciones iniciales de 1 M para todos los reactivos y productos ecuación
uctos excepto protones, que se mantienen a 10−7 M (pH 7.0).
[productos]
La mayoría de las reacciones biológicas difieren de estas condiciones estándar. Δ G = Δ G ° ′ + RT ln Q = Δ G ° ′ + RT ln (2-7)
iones, particularmente en las concentraciones de reactivos, que [reactivos]
son normalmente menos de 1 M.
donde R es la constante de gas de 1.987 cal / (grado · mol), T es
La energía libre de un sistema químico se puede definir como
la temperatura (en grados Kelvin), y Q es la relación inicial
G = H - TS , donde H es la energía de enlace, o entalpía , de
de productos a reactivos. Para una reacción A + B ZZX YZZ C, en
el sistema; T es su temperatura en grados Kelvin (K); y
cuales dos moléculas se combinan para formar una tercera, Q en Equa-
S es la entropía , una medida de su aleatoriedad o desorden
der. De acuerdo con la segunda ley de la termodinámica, el la sección 2-7 es igual a [C] / [A] [B]. En este caso, un aumento en el
La tendencia natural de cualquier sistema aislado es volverse más la concentración inicial de [A] o [B] dará como resultado una mayor
desordenada, es decir, para que aumente la entropía. Una reacción puede valor negativo para Δ G y así conducir la reacción hacia
ocurrir espontáneamente solo si los efectos combinados de los cambios formación espontánea de C.
en entalpía y entropía conducen a un Δ G más bajo . Es decir, si tem- Independientemente del Δ G ° ′ de una reacción bioquímica particular
la temperatura permanece constante, se produce una reacción espontánea ción, procederá espontáneamente dentro de las células solo si Δ G es
solo si el cambio de energía libre, Δ G , en lo siguiente negativo dadas las concentraciones intracelulares de reactivos
la ecuación es negativa: y productos. Por ejemplo, la conversión de gluceraldehído
3-fosfato (G3P) a dihidroxiacetona fosfato (DHAP),
ΔG=ΔH-TΔS (2-6) dos intermedios en la descomposición de la glucosa,
En una reacción química exotérmica ("liberación de calor"), Δ H G3P ZZX

YZZ DHAP
es negativo En una reacción endotérmica ("absorción de calor")
ción, Δ H es positivo. Los efectos combinados de los cambios. tiene un Δ G ° ′ de −1840 cal / mol. Si las concentraciones iniciales
en la entalpía y entropía determinar si el Δ G para una reac- de G3P y DHAP son iguales, entonces Δ G = Δ G ° ′ porque RT
ción es positiva o negativa y, por lo tanto, si se produce la reacción ln = 0; En esta situación, la reacción reversible G3P ZZX YZZ
espontáneamente. Una reacción exotérmica (Δ H <0), en la que DHAP procederá espontáneamente en la dirección de DHAP
la entropía aumenta (Δ S > 0), ocurre espontáneamente (Δ G <0). formación hasta alcanzar el equilibrio. Sin embargo, si la inicial
Una reacción endotérmica (Δ H > 0) ocurrirá espontáneamente [DHAP] es 0.1 M y el [G3P] inicial es 0.001 M, con
Página 30
otras condiciones estándar, entonces Q en la ecuación 2-7 es igual pasa del estado relativamente estable de los reactivos a
0.1 / 0.001 = 100, dando un Δ G de +887 cal / mol. Bajo estas este estado transitorio, intermedio y de mayor energía durante
condiciones, la reacción procederá en la dirección de El curso de la reacción (Figura 2-30). El estado durante
formación de G3P. una reacción química en la cual el sistema está en su punto más alto
El Δ G de una reacción es independiente de la velocidad de reacción. el nivel de energía se llama estado de transición y la colección
De hecho, en condiciones fisiológicas normales, pocos, si los hay, de reactivos en ese estado se llama el estado de transición inter-
de las reacciones bioquímicas necesarias para mantener la vida mediar . La energía necesaria para excitar a los reactivos a esto
ocurrir sin algún mecanismo para aumentar las velocidades de reacción. El estado de energía superior se llama energía de activación de la reacción
Como describimos a continuación y con más detalle en el Capítulo 3, el ción La energía de activación generalmente está representada por Δ G ‡ ,
las tasas de reacciones en los sistemas biológicos son generalmente determinantes que es análogo a la representación del cambio en
minado por la actividad de las enzimas , los catalizadores de proteínas que Energía libre de Gibbs (Δ G ) ya discutida. De la transición
acelerar la formación de productos a partir de reactivos sin estado de la nación, la colección de átomos puede liberar energía
alterar el valor de Δ G . a medida que se forman los productos de reacción o liberan energía a medida que
los átomos van "hacia atrás" y vuelven a formar los reactivos originales.
La velocidad ( V ) a la que se generan los productos a partir de reac-
El Δ G ° ′ de una reacción se puede calcular Tants durante la reacción bajo un conjunto dado de condiciones
(temperatura, presión, concentraciones de reactivo) dependerá
de su K eq
sobre la concentración de material en el estado de transición,
Una mezcla química en equilibrio está en un estado estable de
que a su vez dependerá de la energía de activación y de
Mínima energía libre. Para un sistema en equilibrio (Δ G = 0,
la constante de velocidad característica ( v ) a la cual el material en
Q = K eq ) en condiciones estándar, podemos escribir
El estado de transición se convierte en productos. Cuanto mayor sea
energía de activación, menor es la fracción de reactivos que
Δ G ° ′ = −2.3 RT log K eq = −1362 log K eq (2-8)
alcanzar el estado de transición, y cuanto más lenta sea la tasa general de
la reacción. La relación entre la concentración de
(tenga en cuenta el cambio a la base 10 logaritmos). Por lo tanto, si determinamos
reactivos, v y V es
Las concentraciones de reactivos y productos en equilibrio
(es decir, la K eq ), podemos calcular el valor de Δ G ° ′. Por ejemplo, V = v [reactivos] × 10 - (Δ G ‡ 2.3RT)
la K eq para la interconversión de gliceraldehído 3- fosfato
a fosfato de dihidroxiacetona (G3P ZZX YZZ DHAP) es 22.2 De esta ecuación, podemos ver que disminuyendo la activación
bajo condiciones estándar Sustituyendo este valor en Equa- energía, es decir, disminuir la energía libre de la transición
ción 2-8, podemos calcular fácilmente el Δ G ° ′ para esta reacción como
−1840 cal / mol.
Al reorganizar la ecuación 2-8 y tomar el antiloga- Estado de transición
(sin catalizar)
ritmo, obtenemos
≠
∆ G uncat.
K eq = 10 - (ΔG ° ′ 2.3 RT ) (2-9)
sol
, Estado de transición
De esta expresión, está claro que si Δ G ° ′ es negativo, el (catalizado)
≠
el exponente será positivo y, por lo tanto, K eq será mayor que 1. ∆ G gato.
Por lo tanto, en equilibrio habrá más productos.

energía ree
que los reactivos; en otras palabras, la formación de productos F
de los reactivos es favorecido. Por el contrario, si Δ G ° ′ es positivo, Reactivos
el exponente será negativo y K eq será menor que 1.
La relación entre K eq y Δ G ° ′ enfatiza aún más Productos
dimensiona la influencia de las energías libres relativas de los reactivos
y productos en la medida en que ocurrirá una reacción Progreso de la reacción.
espontáneamente. FIGURA 2 30 Energía de activación de no catalizado y catalizado
reacciones químicas. Esta hipotética vía de reacción (azul) representa
los cambios en la energía libre, G , a medida que avanza una reacción. Una reacción
La velocidad de una reacción depende de la tener lugar espontáneamente si la energía libre ( G ) de los productos es menor
Energía de activación necesaria para energizar que el de los reactivos (Δ G <0). Sin embargo, todas las reacciones químicas.
proceder a través de una (como se muestra aquí) o más transición de alta energía
los reactivos en un estado de transición
estados, y la velocidad de una reacción es inversamente proporcional a la activación
A medida que avanza una reacción química, los reactivos se acercan ción de energía (Δ G ‡ ), que es la diferencia en energía libre entre
otro; algunos lazos comienzan a formarse mientras que otros comienzan a romperse.reactivos y el estado de transición. En una reacción catalizada (rojo), el libre
Una forma de pensar en el estado de las moléculas durante este las energías de los reactivos y productos no cambian, pero las
la transición es que hay tensiones en la configuración electrónica la energía del estado de transición se reduce, aumentando así la velocidad de
relaciones de los átomos y sus enlaces. La colección de átomos la reacción.
60 60 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos
Page 31
estado Δ G ‡: conduce a una aceleración de la reacción general NH 2
tasa de V . Una reducción en Δ G ‡ de 1.36 kcal / mol conduce a un diez- C

norte
aumento de la velocidad de reacción, mientras que un 2.72 kcal / norte C
CH
La reducción de mol aumenta la tasa cien veces. Por lo tanto, rela- Enlaces de fosfoanhidruro
HC C
norte norte
Los cambios relativamente pequeños en Δ G ‡ pueden conducir a grandes cambios en el O O O
velocidad global de la reacción. JO
PAG O correos PAG O CH 2 O
Catalizadores como las enzimas (discutido más adelante en
OJ OJ OJ H H
Capítulo 3) acelerar las velocidades de reacción bajando el relativo
H H
energía del estado de transición y, por lo tanto, la energía de activación Trifosfato de adenosina
requerido para alcanzarlo (ver Figura 2-30). Las energías relativas (ATP) HO OH
de reactivos y productos determinan si una reacción es termo-
dinámicamente favorable (Δ G negativo ), mientras que la activación
la energía determina qué tan rápido se forman los productos, es decir, la
cinética de reacción. Reacciones termodinámicamente favorables. H2O
NH 2
no ocurrirá a tasas apreciables si las energías de activación
C
son demasiado altos norte
norte C
Fosfoanhidruro
CH
enlace
HC C
norte norte
La vida depende del acoplamiento de los desfavorables O O O
JO JO
Reacciones químicas con energía PAG OH + correos PAG O CH 2 O
Favorables OJ OJ OJ H H
H H
Muchos procesos en las células son energéticamente desfavorables
(Δ G > 0) y no procederá espontáneamente. Ejemplos HO OH
incluir la síntesis de ADN a partir de nucleótidos y la trans Fosfato inorgánico Difosfato de adenosina
(P ) (ADP)
puerto de una sustancia a través de la membrana plasmática desde una parte inferior i
a una mayor concentración. Las células pueden llevar a cabo una energía FIGURA 2.31 Hidrólisis del trifosfato de adenosina (ATP).
requiriendo, o endergonic, reacción (Δ G 1 > 0) por acoplamiento Los dos enlaces de fosfoanhidruro (rojo) en ATP ( arriba ), que unen el
a una reacción de liberación de energía o exergónica (Δ G 2 <0) si tres grupos fosfato, cada uno tiene un Δ G ° ′ de aproximadamente -7.3 kcal / mol para
la suma de las dos reacciones tiene una negativa neta global Δ G . hidrólisis. Hidrólisis del enlace de fosfoanhidruro terminal por el
Supongamos, por ejemplo, que la reacción A ZZX YZZ B + X tiene La adición de agua produce la liberación de fosfato y la generación de
ADP. Hidrólisis de los enlaces de fosfoanhidruro de ATP, especialmente el
un Δ G de +5 kcal / mol y que la reacción X ZZX YZZ Y + Z tiene
terminal uno, es la fuente de energía que impulsa muchos que requieren energía
a Δ G de −10 kcal / mol:
reacciones en sistemas biológicos.
(1) A ZZXYZZ B + X Δ G = +5 kcalmol
(2) X ZZXYZZ Y + Z Δ G = −10 kcalmol estaba trabajando con el gran bioquímico Otto Meyerhof en
Suma : un ZZX
YZZ B + Y + Z Δ G ° ′ = −5 kcalmol Alemania y quien publicó primero, y por Cyrus Fiske y
Yellapragada SubbaRow en los Estados Unidos. Contraste muscular
En ausencia de la segunda reacción, habría mucho Se demostró que las tracciones dependían del ATP en la década de 1930. los
más A que B en equilibrio. Sin embargo, porque el propuesta de que ATP es el principal intermediario para la transferencia
La energía de las células se acredita a Fritz Lipmann alrededor
la versión de X a Y + Z es una reacción tan favorable que lo hará
tirar del primer proceso hacia la formación de B y la con- 1941. Se han otorgado muchos premios Nobel por el estudio
de ATP y su papel en el metabolismo de la energía celular, y su
Supresión de A. Reacciones energéticamente desfavorables en las células
a menudo están acoplados a la hidrólisis liberadora de energía del ATP. importancia en la comprensión de la biología molecular celular no puede
ser exagerado
La energía útil en una molécula de ATP está contenida en
La hidrólisis de ATP libera substancialmente libre enlaces de fosfoanhídrido , que son enlaces covalentes formados
Energía y maneja muchos procesos celulares de la condensación de dos moléculas de fosfato por el
En casi todos los organismos, el nucleósido trifosfato ade- pérdida de agua
trifosfato de nosina , o ATP (Figura 2-31), es el más O O
molécula importante para capturar, almacenar transitoriamente y O PAG OH HO PAG O

posteriormente transfiriendo energía para realizar el trabajo (p. ej., bio-
O O
síntesis, movimiento mecánico). Comúnmente conocido como
La "moneda" energética de la célula, el ATP es un tipo de potencial utilizable O O
energía que las células pueden "gastar" para potenciar su actividad
O PAG O PAG O H2O
corbatas. La historia de ATP comienza con su descubrimiento.
O O
en 1929, aparentemente simultáneamente por Kurt Lohmann, quien
Página 32
Como se muestra en la Figura 2-31, una molécula de ATP tiene dos claves en ATP y la formación de un enlace covalente entre el
enlaces de fosfoanhidruro (también llamado fosfodiéster). grupo fosfato liberado y ese reactivo. El fosforory-
Formando estos enlaces (representados aquí por el símbolo ∼) El intermedio tardío generado de esta manera puede reaccionar con
en ATP requiere un aporte de energía. Cuando estos enlaces son reactivo C para formar el producto D + P i en una reacción que tiene un
hidrolizado, o roto por la adición de agua, esa energía negativo general Δ G :
en lanzamiento. Hidrólisis de un enlace fosfoanhídrido en cada
de las siguientes reacciones tiene un Δ G ° ′ altamente negativo de B + Ap∼p∼p → B∼p + Ap∼p
aproximadamente −7.3 kcal / mol:
B∼p + C → D + P i
Ap∼p∼p + H 2 O → Ap∼p + P i + H +
(ATP) (ADP) La reacción general
Ap∼p∼p + H 2 O → Ap + PP i + H + B + C + ATP ZZX YZZ D + ADP + P i

(ATP) (AMPERIO)
es energéticamente favorable (Δ G <0). Del mismo modo, la hidrólisis de
Ap∼p + H 2 O → Ap + P i + H + GTP a GDP puede proporcionar energía para realizar el trabajo, incluyendo
(ADP) (AMPERIO) la síntesis de ATP (ver Capítulo 12), pero con mayor frecuencia GTP
la hidrólisis se usa para controlar los sistemas celulares (p. ej., proteínas
P i significa fosfato inorgánico (PO 4 3− ) y PP i para inor-
síntesis, señalización hormonal) en lugar de como fuente de
pirofosfato ganico, dos grupos fosfato unidos por un energía.
enlace fosfoanhídrido. Como muestran las dos reacciones principales, el Un mecanismo alternativo de acoplamiento de energía es utilizar
La eliminación de un grupo fosfato del ATP deja adenosina la energía liberada por la hidrólisis de ATP para cambiar el con-
difosfato (ADP) y la eliminación de un pirofosfato
formación de una molécula a un estado estresado "rico en energía".
grupo de ATP deja monofosfato de adenosina (AMP). A su vez, la energía almacenada como estrés conformacional puede ser
Un enlace fosfoanhídrido u otro "enlace de alta energía" liberado a medida que la molécula "se relaja" de nuevo en su tensión
(comúnmente denotado por ∼) no es intrínsecamente diferente de conformación. Si este proceso de relajación se puede acoplar a
Otros enlaces covalentes. Los enlaces de alta energía simplemente liberan sub- otra reacción, la energía liberada se puede aprovechar para
cantidades considerables de energía cuando se hidroliza. Por ejemplo, impulsar procesos celulares.
Δ G ° ′ para la hidrólisis de un enlace de fosfoanhídrido en ATP Como con muchas reacciones biosintéticas, el transporte de mol-
(–7.3 kcal / mol) es más de tres veces el Δ G ° ′ para hidro- los ecules dentro o fuera de la célula a menudo tienen un Δ G positivo y por lo tanto
lisis del enlace fosfoéster (rojo) en glicerol 3-fosfato requiere un aporte de energía para proceder. Tal simple trans-
(–2,2 kcal / mol): las reacciones portuarias no implican directamente la fabricación o ruptura
O OH ing de enlaces covalentes; así su Δ G ° ′ es 0. En el caso de un
sustancia que se mueve hacia una celda, la ecuación 2-7 se convierte
HO PAG O CH 2 CH CH 2 OH
O [C en ]
Δ G = RT ln (2-10)
Glicerol 3-fosfato [C fuera ]
Una razón principal de esta diferencia es que ATP y sus donde [C in ] es la concentración inicial de la sustancia
Los productos de hidrólisis, ADP y P i , se cargan a pH neutro. dentro de la célula y [C fuera ] es su concentración fuera de la célula.
Durante la síntesis de ATP, una gran cantidad de energía debe ser Podemos ver en la ecuación 2-10 que Δ G es positivo para trans-
solía forzar las cargas negativas en ADP y P i juntas. puerto de una sustancia en una célula contra su gradiente de concentración
Por el contrario, esta energía se libera cuando el ATP se hidroliza. ent (cuando [C in ]> [C out ]); la energía para conducir tal "cuesta arriba"
a ADP y P i . En comparación, la formación del fosfo- El transporte a menudo es suministrado por la hidrólisis de ATP. Estafa-
enlace éster entre un hidroxilo no cargado en glicerol y a la inversa, cuando una sustancia baja su concentración
P i requiere menos energía, y se libera menos energía cuando esto gradiente ([C out ]> [C in ]), Δ G es negativo. Tal "cuesta abajo"
el enlace se hidroliza. el transporte libera energía que se puede acoplar a una energía
Las células han desarrollado mecanismos mediados por proteínas para requiere reacción, como el movimiento de otro sub-
transfiriendo la energía libre liberada por hidrólisis de fos- postura cuesta arriba a través de una membrana o la síntesis de ATP
los enlaces de foanhidruro a otras moléculas, conduciendo así en sí (véanse los capítulos 11 y 12).
reacciones que de otro modo serían energéticamente desfavorables
poder. Por ejemplo, si el Δ G para la reacción B + C → D
es positivo pero menor que el Δ G para la hidrólisis de ATP, el
El ATP se genera durante la fotosíntesis
la reacción se puede conducir hacia la derecha al acoplarla a y la respiración
Lisis del enlace de fosfoanhidruro terminal en ATP. En uno El ATP se hidroliza continuamente para proporcionar energía
mecanismo común de tal acoplamiento de energía , algunos de los para muchas actividades celulares. Algunas estimaciones sugieren que
la energía almacenada en este enlace de fosfoanhidruro se transfiere los humanos hidrolizan diariamente una masa de ATP igual a su totalidad
a uno de los reactivos (aquí, B) por la ruptura del enlace peso corporal. Claramente, para continuar funcionando, las células deben
Page 33
constantemente reponer su suministro de ATP. Reponer constantemente oxidación , y la ganancia de electrones por un átomo o un mol-
ing ATP requiere que las células obtengan energía de su entorno ecule se llama reducción . Un ejemplo de oxidación es el
ronment. Para casi todas las células, la mejor fuente de energía. eliminación de electrones del grupo sulfhidrilo que contiene
usado para hacer ATP es la luz solar. Algunos organismos pueden usar el sol. cadenas laterales de dos aminoácidos de cisteína para formar un disulfuro
Luz directamente. A través del proceso de fotosíntesis , plantas, enlace, descrito anteriormente en la Sección 2.2. Los electrones no son
algas y ciertas bacterias fotosintéticas atrapan la energía creado ni destruido en una reacción química, por lo que si un átomo
de luz solar y usarlo para sintetizar ATP a partir de ADP y P i . o la molécula se oxida, otra debe reducirse. Para examen-
Gran parte del ATP producido en la fotosíntesis se hidroliza. Por ejemplo, el oxígeno extrae electrones de iones Fe 2+ (ferrosos) para formar
para proporcionar energía para la conversión de dióxido de carbono a Fe 3+ (férrico) iones, una reacción que ocurre como parte del pro-
azúcares de seis carbonos, un proceso llamado fijación de carbono : proceso por el cual los carbohidratos se degradan en las mitocondrias.
Cada átomo de oxígeno recibe dos electrones, uno de cada
6 CO 2 + 6H2O C 6 H 12 O 6 + 6 O 2 + energía dos iones Fe 2+ :
Los azúcares producidos durante la fotosíntesis son una fuente de alimento, 2 Fe 2+ + 1 2 O 2 → 2 Fe 3+ + O 2−

y así energía, para los organismos fotosintéticos que hacen Por lo tanto, el Fe 2+ se oxida y el O 2 se reduce. Tales reacciones en
ellos y para los organismos no fotosintéticos, como ani- cuál molécula se reduce y otra se oxida son
machos, que consumen las plantas directa o indirectamente por a menudo referido como reacciones redox . El oxígeno es un electrón.
comiendo otros animales que se han comido las plantas. De este modo, aceptor en muchas reacciones redox en células bajo condiciones aeróbicas
la luz solar es la fuente de energía directa o indirecta para la mayoría condiciones
organismos (ver Capítulo 12). Muchas oxidaciones y reducciones biológicamente importantes
En plantas, animales y casi todos los demás organismos, el las reacciones implican la eliminación o adición de hidrógeno
energía libre en azúcares y otras moléculas derivadas de los alimentos
átomos (protones más electrones) en lugar de la transferencia de
se libera en los procesos de glucólisis y respiración celular electrones aislados por su cuenta. La oxidación del succinato.
ración . Durante la respiración celular, moléculas ricas en energía.
Fumar, que ocurre en las mitocondrias, es un ejemplo
en los alimentos (p. ej., glucosa) se oxidan a dióxido de carbono y
(Figura 2-32). Los protones son solubles en soluciones acuosas (como
agua. La oxidación completa de la glucosa, H 3 O + ), pero los electrones no lo son, por lo que deben transferirse
directamente de un átomo o molécula a otra sin un
C 6 H 12 O 6 + 6 O 2 → 6 CO 2 + 6 H 2 O intermedio disuelto en agua. En este tipo de oxidación
reacción, los electrones a menudo se transfieren a pequeños electrones
tiene un Δ G ° ′ de −686 kcal / mol y es el reverso de la foto portando moléculas, a veces denominadas coenzimas . los
Fijación de carbono sintético. Las células emplean un elaborado conjunto de Los más comunes de estos portadores de electrones son NAD + ( nicotina-
reacciones mediadas por proteínas para acoplar la oxidación de 1 mol- amida adenina dinucleótido ), que se reduce a NADH,
ecule de glucosa a la síntesis de hasta 30 moléculas y FAD ( dinucleótido de adenina flavina ), que se reduce
de ATP de 30 moléculas de ADP. Esta dependiente de oxígeno a FADH 2 (Figura 2-33). Las formas reducidas de estos núcleos
La degradación ( aeróbica ) ( catabolismo ) de la glucosa es la principal Los zimas pueden transferir protones y electrones a otras moléculas,
vía para generar ATP en todas las células animales, todas no reduciéndolos así.
células vegetales fotosintéticas y muchas células bacterianas. Catabo- Describir reacciones redox, como la reacción de fer-
La contaminación de los ácidos grasos también puede ser una fuente importante de ATP.
ión rous (Fe 2+ ) y oxígeno (O 2 ), es más fácil dividirlos
Discutimos los mecanismos de fotosíntesis y celular en dos medias reacciones:
respiración en el Capítulo 12.
Aunque la energía de la luz capturada en la fotosíntesis es la Oxidación de Fe 2+ : 2 Fe 2+ → 2 Fe 3+ + 2 e -
fuente primaria de energía química para las células, no es la única
Reducción de O 2 : 2 e - + 1 2 O 2 → O 2−
fuente. Ciertos microorganismos que viven en o alrededor de las profundidades
respiraderos hidrotermales del mar, donde la luz solar adecuada no está disponible
capaz, derivar la energía para convertir ADP y P i en ATP O O
de la oxidación de compuestos inorgánicos reducidos. Estas J J
CO CO
compuestos reducidos se originan en las profundidades de la tierra y son
liberado en los respiraderos. H CH CH
H CH J +
CH
+ J 2e 2H J
NAD y FAD juntan muchos productos biológicos CO CO
Reacciones de oxidación y reducción O O

Sucinar Fumarato
En muchas reacciones químicas, los electrones se transfieren de
un átomo o molécula a otro; esta transferencia puede o puede FIGURA 2.32 Conversión de succinato a fumarato. En esta oxidación
No acompañar la formación de nuevos enlaces químicos o reacción de reacción, que ocurre en las mitocondrias como parte del ácido cítrico
La liberación de energía que se puede acoplar a otras reacciones. ciclo, succinato pierde dos electrones y dos protones. Estos protones
La pérdida de electrones de un átomo o una molécula se llama y los electrones se transfieren a FAD, reduciéndolo a FADH 2 .
34
(un) (si)
Oxidado: FAD Reducido: FADH 2
Oxidado: NAD Reducido: NADH H O H H O
H H H H3C norte H H3C norte H

O O norte norte
+2H
+H +2e
C NH 2 C NH 2
+2e
H3C norte norte O H3C norte norte O
+
norte Nicotinamida norte H Flavina H H
Ribosa Ribosa Ribitol Ribitol
2P 2P 2P 2P
Adenosina Adenosina Adenosina Adenosina
NAD + H + 2 e NADH FAD + 2 H + 2 e FADH 2

+
FIGURA 2.33 Las coenzimas portadoras de electrones NAD y FAD. El protón se libera en solución. (b) FAD (dinucleótido de adenina flavina)
+
(un anuncio (dinucleótido de nicotinamida y adenina) se reduce a NADH por se reduce a FADH 2 mediante la adición de dos electrones y dos protones,
La adición de dos electrones y un protón simultáneamente. En muchos como ocurre cuando el succinato se convierte en fumarato (ver Figura 2-32).
reacciones redox biológicas, un par de átomos de hidrógeno (dos protones En esta reacción de dos pasos, la adición de un electrón junto con uno
y dos electrones) se elimina de una molécula. En algunos casos, uno el protón primero genera un intermedio de semiquinona de corta duración (no
+
de los protones y ambos electrones se transfieren a NAD ; el otro se muestra), que luego acepta un segundo electrón y protón.
En este caso, el oxígeno reducido (O 2− ) reacciona fácilmente con donde n es el número de electrones transferidos. Tenga en cuenta que un
dos protones para formar una molécula de agua (H 2 O). El readi- La reacción redox con un valor Δ E positivo tendrá un valor negativo.
ness con que un átomo o una molécula gana un electrón Δ G y así tenderá a proceder espontáneamente desde la izquierda
es su potencial de reducción ( E ). La tendencia a perder elec- a derecha.
trons, el potencial de oxidación , tiene la misma magnitud que
el potencial de reducción para la reacción inversa, pero tiene el
signo opuesto. CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 2.4
Los potenciales de reducción se miden en voltios (V) desde
un punto cero arbitrario establecido en el potencial de reducción de la Energética bioquímica
siguiente semirreacción en condiciones estándar (25 ° C,
r El cambio en la energía libre, Δ G , es la medida más útil
1 atm y reactivos a 1 M):
para predecir el potencial de reacciones químicas
reducción
ZZX 1 espontáneamente en sistemas biológicos. Reacciones químicas
H++e- YZZ
oxidación 2 H2 tienden a proceder espontáneamente en la dirección para la cual
Δ G es negativo. La magnitud de Δ G es independiente de la
El valor de E para una molécula o un átomo bajo estándar
velocidad de reacción Una reacción con un Δ G negativo se conoce como
condiciones es su potencial de reducción estándar, E ′ 0 . Un mol-
termodinámicamente favorable.
ecule o un ion con un E ' 0 positivo tiene una mayor afinidad por
electrones que el ion H + en condiciones estándar. r El cambio químico de energía libre, Δ G ° ′, es igual a −2.3 RT
Por el contrario, una molécula o ion con un E ' 0 negativo tiene un log K eq . Por lo tanto, el valor de Δ G ° ′ puede calcularse a partir de
menor afinidad por los electrones que el ion H + bajo stan- concentraciones de reactivos determinadas experimentalmente y
Dard condiciones. Como los valores de Δ G ° ′, reducción estándar productos en equilibrio.
los potenciales pueden diferir algo de los encontrados bajo el r La velocidad de una reacción depende de la energía de activación.
condiciones en una célula porque las concentraciones de reactivos necesitaba energizar reactivos a un estado de transición. Catalizadores
en una celda no son 1 M. tales como las enzimas aceleran las reacciones al disminuir la activación
En una reacción redox, los electrones se mueven espontáneamente ción de energía del estado de transición.
hacia átomos o moléculas que tienen una reducción más positiva
potenciales En otras palabras, una molécula que tiene un efecto más negativo. r Una reacción química que tiene un Δ G positivo puede proceder si
se combina con una reacción que tiene un Δ G negativo de mayor
El potencial de reducción puede transferir electrones espontáneamente a,
magnitud.
o reducir, una molécula con un potencial de reducción más positivo
tial En este tipo de reacción, el cambio en el potencial eléctrico r Muchos pro- pios celulares energéticamente desfavorables
Δ E es la suma de los potenciales de reducción y oxidación para los procesos son impulsados por la hidrólisis del fosfanhidruro
Las dos medias reacciones. El Δ E para una reacción redox está relacionado enlaces en ATP (ver Figura 2-31).
al cambio en energía libre Δ G por la siguiente expresión: r Directa o indirectamente, la energía de la luz capturada por fotosin-
tesis en plantas, algas y bacterias fotosintéticas es la
Δ G (calmol) = - n (23,064) Δ E (voltios) (2-11)
Página 35
estado estacionario 53 insaturado 48

última fuente de energía química para casi todas las células en estereoisómero 34 Van der Waals
Tierra. estado de transición 60 interacción 38
r Una reacción de oxidación (pérdida de electrones) siempre está acoplada
con una reacción de reducción (ganancia de electrones).
r La oxidación biológica y las reacciones de reducción son a menudo Repasa los conceptos
acoplado por coenzimas portadoras de electrones como NAD + y
1. El gecko es un reptil con una increíble capacidad de escalar.
FAD (ver Figura 2-33).
superficies lisas, incluido el vidrio. Los gecos parecen pegarse
r Las reacciones de oxidación-reducción con un Δ E positivo tienen un para alisar superficies mediante interacciones de van der Waals entre
Δ G negativo y por lo tanto tienden a proceder espontáneamente. septos en sus pies y la superficie lisa. Cómo es esto
método de adherencia ventajoso sobre interacción covalente
iones? Dado que las fuerzas de van der Waals están entre los débiles
son las interacciones moleculares, ¿cómo pueden pegarse los pies del geco?
¿efectivamente?
2. El canal K + es un ejemplo de una proteína transmembrana.
(una proteína que abarca la bicapa de fosfolípidos del plasma
Visite LaunchPad para acceder a las herramientas de estudio y obtener más información sobre membrana). ¿Qué tipos de aminoácidos se pueden encontrar?
contenido en este capítulo. (a) alineando el canal a través del cual pasa K + , (b) en contacto
t "OBMZ [F UIF% BUB con el núcleo hidrofóbico de la bicapa de fosfolípidos con-
que contienen grupos acilo grasos, (c) en el dominio citosólico de la
t "EEJUJPOBM TUVEZ UPPMT JODMVEJOH WJEFPT BOJNBUJPOT BOE
proteína, y (d) en el dominio extracelular de la proteína?
RVJ [[FT
3. VMYFEN: esta es la abreviatura de aminoácidos de una letra
viación para un péptido. ¿Cuál es la carga neta de este péptido?
a pH 7.0? Una enzima llamada proteína tirosina quinasa puede
une fosfatos a los grupos hidroxilo de tirosina (Y).
Términos clave ¿Cuál es la carga neta del péptido a pH 7.0 después de que tiene
ácido 55 ácidos grasos 48 sido fosforilado por una tirosina quinasa? ¿Cuál es el probable
fuente de fosfato utilizada por la quinasa para esta reacción?
trifosfato de adenosina Δ G (cambio de energía libre) 58
(ATP) 32 4. Los enlaces disulfuro ayudan a estabilizar el tridimensional
enlace de hidrógeno 37
estructura de las proteínas. ¿Qué aminoácidos están involucrados en el
α átomo de carbono (C α ) 42 hidrofílico 32 formación de enlaces disulfuro? ¿La formación de un disul-
aminoácido 42 hidrofóbico 32 el enlace fide aumenta o disminuye la entropía (Δ S )?
anfipático 32 efecto hidrofóbico 39 5. En la década de 1960, se recetó el medicamento talidomida a
base 55 interacciones iónicas 36 mujeres embarazadas para tratar las náuseas matutinas. Sin embargo, eso
tampón 55 molecular La lidomida causó defectos graves en las extremidades en los hijos de algunos
catalizador 52 complementariedad 40 mujeres que tomaron la droga y su uso para las mañanas
potencial químico monómero 41 ness fue descontinuado. Ahora se sabe que la talidomida
energía 57 se administró como una mezcla de dos compuestos estereoisoméricos
monosacárido 46
libras, una de las cuales alivió las náuseas matutinas y la
enlace covalente 33 no covalente otro de los cuales fue responsable de los defectos de nacimiento. Qué
reacción de deshidratación 41 interacciones 33 son estereoisómeros? ¿Por qué podrían dos cosas tan estrechamente relacionadas?
dipolo 35 nucleósido 46 libras tienen efectos fisiológicos tan diferentes?
Constante de disociación nucleótido 45 6. Nombra el compuesto que se muestra a continuación.
( K d ) 53 oxidación 63 O
enlace disulfuro 44 pH 54 C norte

66
endergonic 58 HN 5C
77
fosfoanhídrido 1 5
8 CH
2 44
59 endotérmico enlace 61 C 3 C 99
norte
H2N norte
acoplamiento de energía 62 fosfoglicéridos 49
entalpía ( H ) 59 fosfolípido 48 O O O
entropía ( S ) 59 polar 34 55
O PAG O O PAG O O PAG O CH 2 O
equilibrio constante polímero 41
O O O 44
H H
1
( K eq ) 52 reacción redox 63
H H
exergónico 58 reducción 63 3 2
OH OH
exotérmico 59 48 saturado
Repasa los conceptos sesenta y cinco
Page 36
¿Es este nucleótido un componente de ADN, ARN o ambos? o grasas trans, que aumentan los niveles de colesterol total en el cuerpo,
Nombre otra función de este compuesto. También han sido implicados en enfermedades del corazón. ¿Cómo funciona el cis
7. La base química de la especificidad del grupo sanguíneo reside en estereoisómero difiere de la configuración trans, y qué
los carbohidratos que se muestran en las superficies de la sangre roja efecto tiene la configuración cis en la estructura de la
células. Los carbohidratos tienen el potencial para una gran estructura cadena de ácidos grasos?
diversidad. De hecho, la complejidad estructural del oligo- 14. Las modificaciones químicas de los aminoácidos contribuyen
los sacáridos que se pueden formar a partir de cuatro azúcares es mayor a la diversidad y función de las proteínas. Por ejemplo,
que el de los oligopéptidos que se pueden formar a partir de cuatro Se requiere la γ-carboxilación de aminoácidos específicos para hacer
aminoácidos. ¿Qué propiedades de los carbohidratos hacen que esto Algunas proteínas biológicamente activas. Que amino particular
¿Gran diversidad estructural posible? el ácido sufre esta modificación, y cuál es su biológico
8. Calcule el pH de 1 L de agua pura en equilibrio. ¿Relevancia? Warfarina, un derivado de la cumarina, que es pres-
¿Cómo cambiará el pH después de 0.008 moles de la base fuerte? ent en muchas plantas, inhibe la γ-carboxilación de este amino
¿Se disuelve el hidróxido de sodio (NaOH) en el agua? Ahora, ácido y fue utilizado en el pasado como veneno para ratas. En el presente,
calcular el pH de una solución acuosa 50 mM de los débiles También se utiliza clínicamente en humanos. Qué pacientes podrían ser
ácido 3- ( N -morfolino) propano-1-sulfónico ácido (MOPS) en prescrito warfarina y por qué?
cuál 61 por ciento del soluto está en su forma ácida débil y
El 39 por ciento tiene la forma de la base correspondiente de MOPS (el
p K a para MOPS es 7.20). ¿Cuál es el pH final después de 0.008? Referencias
¿Se agregan moles de NaOH a 1 L de este tampón MOPS?
Alberty, RA y RJ Silbey. 2005. Química Física , 4to.
9. El amoníaco (NH 3 ) es una base débil que bajo condiciones ácidas ed. Wiley
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NH 3 impregna libremente las membranas biológicas, incluidas las
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un pH de aproximadamente 4.5-5.0; El pH del citoplasma es de aproximadamente 7.0.
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¿Cuál es el efecto sobre el pH del contenido de líquido de liso- Eisenberg, D. y D. Crothers. 1979. Química física con
¿Cuándo se exponen las células al amoníaco? Nota: munición Aplicaciones a las ciencias de la vida. Benjamin-Cummings.
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Fisiología , 10ª ed. Saunders
10. Considere la reacción de unión L + R → LR, donde L
Hill, TJ 1977. Transducción de energía libre en biología. Académico
es un ligando y R es su receptor. Cuando 1 × 10 −3 M de L es
Prensa.
añadido a una solución que contiene 5 × 10 −2 M de R, 90 por ciento Klotz, IM 1978. Cambios de energía en reacciones bioquímicas.
de la L se une para formar LR. ¿Cuál es el K eq de esta reacción? Prensa Académica
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que facilita (cataliza) esta reacción de unión? Cuál es el Lange
equilibrio de disociación constante K d ? Nicholls, DG y SJ Ferguson. 1992. Bioenergética 2.
Prensa Académica
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Oxtoby, D., H. Gillis y N. Nachtrieb. 2003. Principios de
¿citoplasma? ¿Por qué el ácido fosfórico es tan fisiológicamente?
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mol. ¿Cuál es el Δ G a 25 ° C (298 ° Kelvin) comenzando con Micelas y membranas biológicas , 2ª ed. Wiley
0.01 M cada uno de X, Y y XY? Sugerir dos formas en que uno podría Tinoco, I., K. Sauer y J. Wang. 2001. Química física
Hacer esta reacción energéticamente favorable. Principios y aplicaciones en ciencias biológicas , 4ª ed. Aprendiz
Salón.
13. Según los expertos en salud, los ácidos grasos saturados, que
Van Holde, K., W. Johnson y P. Ho. 1998. Principios de
provienen de grasas animales, son un factor importante que contribuye a Bioquímica Física. Prentice Hall.
enfermedad coronaria. Lo que distingue a un graso saturado Voet, D. y J. Voet. 2004. Biochemistry , 3d ed. Wiley
ácido de un ácido graso insaturado, y para qué sirve Wood, WB, y col. 1981. Bioquímica: un enfoque de problemas ,
término referido saturado ? Recientemente, los ácidos grasos transinsaturados, 2d ed. Benjamin-Cummings.

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6/2/2020 Fundamentos Químicos

norte FeII norte

norte norte norte norte

norte FeII norte

Catenane "Estrella de David". Dos anillos triplemente entrelazados compuestos de

2.2 Bloques de construcción químicos de células 2.4 Energética bioquímica

(a) Complementariedad molecular (b) Bloques de construcción químicos

(c) Equilibrio químico (d) Energía de enlace químico

32 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

Hidrógeno, oxígeno, carbono, nitrógeno, fósforo y sulfuro.

cada tipo de átomo forma un número característico de covalente C O

geometría determinada por el tamaño del átomo y tanto por la dis-

Todos los componentes biológicos están organizados alrededor H H

El átomo de carbono, que forma cuatro enlaces covalentes. En estos

2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 33

TABLA 2 1 Propiedades de unión de los átomos más

Átomo y Numero usual Típico

Algunas drogas son mezclas de estereoisómeros de pequeños

34 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

TABLA 2 2 Grupos funcionales comunes y enlaces en biomoléculas

dipolo eléctrico , una carga positiva separada de una igual pero

2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 35

FIGURA 2 6 Energías relativas de covalente Interacciones no covalentes Enlaces covalentes

36 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

(un) (si) (C)

2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 37

FIGURA 2 9 Distribución de unión y no unión externa

38 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

Las moléculas no polares o las partes no polares de las moléculas tienden

δ δ δ δ enlaces de hidrógeno con sustancias no polares, tienden a

El efecto hidrofóbico causa no polar

2.1 Bonos covalentes e interacciones no covalentes 39

aminoácidos, los lípidos no pueden disolverse fácilmente en la sangre, el

ser transportado por todo el cuerpo. Puede haber cientos

partes que interactúan con el agua y partes hidrofóbicas que

40 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 2.1 efecto hidrofóbico, reduciendo así la extensión de su

r Muchas moléculas en las células contienen al menos una asimétrica

2.2 Bloques de construcción químicos de células 41

H 2 N CC OH H norte C C OH H CN C norte C C norte CC norte CC OH

Aminoácidos Enlace peptídico

42 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO ARRULLO

H3NC H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H

Alanina Valina Isoleucina Leucina Metionina Fenilalanina Tirosina Triptófano

Aminoácidos básicos ARRULLO ARRULLO ARRULLO

H3N C H H3N C H H3N C H

ARRULLO ARRULLO ARRULLO

2.2 Bloques de construcción químicos de células 43

44 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

O Esta modificación puede jugar un papel importante en el control

mediante la adición de varios grupos químicos (rojo) al lado del aminoácido O OH OH

Acetilación del grupo amino del residuo N-terminal Adenosina 5 -monofosfato OH H

2.2 Bloques de construcción químicos de células 45

Purines éster: implica la unión covalente de un ácido, como un car-

iones (H + ), dejando el fosfato cargado negativamente (ver

CUADRO 2 3 Terminología de nucleósidos y nucleótidos

Monofosfatos de nucleósidos AMPERIO GMP CMP UMP

Difosfatos de nucleósidos ADP PIB CDP UDP

Trifosfatos de nucleósidos ATP GTP CTP UTP

46 CAPÍTULO 2 t Fundamentos químicos

(un) Los disacáridos , formados por dos monosacáridos, son

2.2 Bloques de construcción químicos de células 47