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THESE
Présentée à l’UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie)
et soutenue publiquement le 15 novembre 2017
pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire
par
LAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
VETAGRO SUP
CAMPUS VÉTÉRINAIRE DE LYON
Année 2017 - Thèse n°073
THESE
Présentée à l’UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie)
et soutenue publiquement le 15 novembre 2017
pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire
par
LAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
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Remerciements
-5-
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Remerciements
À toute ma famille
Quelles que soient les circonstances, vous avez toujours été présents pour moi,
Que vous trouviez ici l’expression de tout mon amour et de mon profond respect.
À mes parents
À qui je dois tout et bien plus encore,
Sans vous je ne serais pas là où j’en suis aujourd’hui,
Je vous aimerai toujours.
À ma sœur Fiona
Pour m’avoir soutenu et cru en moi toutes ces années et pour m’avoir poussé à me dépasser,
Je suis très fier de la femme que tu es devenue,
Rien ne pourra jamais remplacer notre complicité.
À ma grand-mère Jeanine
À qui je dédie cette thèse,
Tu aurais dû être présente à mes côtés aujourd’hui,
Tu étais et tu resteras à jamais dans mon cœur.
À Sarah
Pour tous les moments qui nous restent à vivre,
Pour être présente à mes côtés et dans mon cœur,
Je t’aime.
À mes amis
À William, Guillaume, Clémentine, Alexis, Chloé, Margot, Florence, Mélanie, Marie-Aude,
Thomas, Hugues et Martin,
Pour votre bonne humeur et tous les merveilleux moments passés en votre compagnie,
On a encore tellement à partager ensemble.
-7-
-8-
Table des matières
Introduction ............................................................................................................................23
I) Bactériologie ........................................................................................................................27
A) Classification des mycobactéries ........................................................................................27
1) La classification selon le pouvoir pathogène ...............................................................27
2) Autres types de classifications ......................................................................................27
B) Caractéristiques bactériologiques des mycobactéries .........................................................29
1) Morphologie .................................................................................................................29
2) Affinité tinctoriale .........................................................................................................30
3) Résistance aux agents physico-chimiques et aux antibiotiques ....................................31
i) Les agents physico-chimiques ................................................................................31
ii) Les antibiotiques antituberculeux .........................................................................31
iii) Le cas particulier du pyrazinamide chez Mycobacterium bovis .........................32
4) Croissance ....................................................................................................................33
5) Propriétés biochimiques des mycobactéries .................................................................35
C) Caractéristiques biologiques des mycobactéries .................................................................35
1) Habitat ..........................................................................................................................35
2) Espèces sensibles aux mycobactéries ...........................................................................36
3) Facteurs influençant le pouvoir pathogène ..................................................................38
-9-
3) Mode de transmission ...................................................................................................43
i) Intraspécifique aux bovins .....................................................................................43
ii) Interspécifique des bovins à l’Homme ..................................................................43
C) Épidémiologie synthétique ..................................................................................................44
1) Modalités de contamination .........................................................................................44
i) Dans l’espèce bovine .............................................................................................44
a) Au sein d’un élevage ........................................................................................44
b) À l’échelle des différents pays .........................................................................45
ii) Dans l’espèce humaine .........................................................................................46
2) Facteurs de risque ........................................................................................................46
i) Dans l’espèce bovine .............................................................................................46
a) À l’échelle de l’individu ...................................................................................46
b) À l’échelle d’un troupeau ................................................................................46
ii) Dans l’espèce humaine .........................................................................................47
- 10 -
D) Réponses immunitaires associées .......................................................................................62
1) La réponse Th2 humorale .............................................................................................62
2) La réaction d’hypersensibilité retardée ........................................................................63
i) Les différents types d’hypersensibilité retardée .....................................................63
ii) Évolution de l’hypersensibilité retardée ...............................................................64
3) Le phénomène d’anergie ...............................................................................................64
E) Le phénomène de latence ....................................................................................................65
II) Les différentes évolutions du complexe primaire et les lésions associées .......................66
A) Les différentes évolutions du complexe primaire et la généralisation ................................66
1) La progression de l’infection ........................................................................................66
2) La tuberculose miliaire .................................................................................................67
3) Les autres formes de généralisation .............................................................................69
B) Tuberculose pulmonaire et tableau clinique général ...........................................................70
1) Le développement d’une tuberculose pulmonaire ........................................................70
2) Tableau clinique ............................................................................................................72
i) Chez les bovins .......................................................................................................72
ii) Chez l’Homme ......................................................................................................72
C) Les différentes localisations possibles de la tuberculose ....................................................73
1) La tuberculose ganglionnaire .......................................................................................73
2) La tuberculose cutanée .................................................................................................75
i) La tuberculose cutanée exogène ............................................................................75
a) Le chancre tuberculeux ....................................................................................75
b) La tuberculose verruqueuse .............................................................................76
ii) La tuberculose cutanée endogène .........................................................................76
a) Le scrofuloderme .............................................................................................76
b) La tuberculose orificielle .................................................................................76
iii) La tuberculose hématogène .................................................................................76
iv) La tuberculose éruptive ........................................................................................76
3) La tuberculose du système nerveux central ..................................................................77
4) La tuberculose ostéo-articulaire ...................................................................................78
5) La tuberculose de l’abdomen ........................................................................................80
i) La tuberculose digestive et viscérale .....................................................................80
ii) La tuberculose urogénitale ...................................................................................81
6) La tuberculose oculaire ................................................................................................82
7) Le cas particulier de la tuberculose de la mamelle ......................................................83
- 11 -
Troisième partie : Les méthodes de diagnostic et de dépistage ..........................................85
- 12 -
2) La mise en évidence de mycobactéries par différentes méthodes ...............................107
i) Les différentes méthodes de coloration ................................................................107
ii) Méthodes de lecture et interprétation des résultats ............................................108
iii) L’immunohistochimie ........................................................................................109
3) Les frottis d’expectorations chez l’Homme ................................................................110
B) Culture et identification de M. bovis .................................................................................111
1) Méthode de culture des mycobactéries .......................................................................111
2) Critères d’identification et expression des résultats ...................................................112
C) Méthodes d’identification par l’utilisation du génie génétique .........................................112
1) Hybridation directe avec une sonde spécifique ..........................................................112
2) L’hybridation inverse sur bandelettes ........................................................................113
3) Le séquençage de l’ADN ............................................................................................114
4) Méthodes basées sur l’utilisation de marqueurs génotypiques ..................................114
Conclusion .............................................................................................................................119
Bibliographie ........................................................................................................................121
Annexes .................................................................................................................................131
- 13 -
- 14 -
Liste des annexes
- 15 -
- 16 -
Liste des figures
- 17 -
Figure 27 : Lésions macroscopiques de tuberculose abdominale ...........................................79
Figure 28 : Lésions macroscopiques de tuberculose uro-génitale ..........................................80
Figure 29 : Tuberculose de la mamelle chez un bovin ............................................................81
Figure 30 : Follicule fibreux calcifié ......................................................................................92
Figure 31 : Exemples d’images pouvant être observées lors de tuberculose pulmonaire ….
chez l’Homme ..........................................................................................................................95
Figure 32 : Localisation de l’injection de tuberculine lors d’une IDS ....................................97
Figure 33 : Différentes étapes de l’IDS ...................................................................................97
Figure 34 : Localisation des injections de tuberculine lors d’une IDC ...................................98
Figure 35 : Représentation graphique des résultats obtenus avec une IDC ............................99
- 18 -
Liste des tableaux
- 19 -
- 20 -
Liste des abréviations
- 21 -
mm : millimètre
MTC : Mycobacterium Tuberculosis Complex ou Complexe Mycobacterium Tuberculosis
µm : micromètre
NALC : N-Acétyl-L-Cystéine
NaOH : Hydroxyde de sodium
NF-κB : Nuclear Factor kappa B
NK : Natural Killer
OIE : Office International des Épizooties (Organisation Mondiale de la Santé Animale)
OMS : Organisation Mondiale de la Santé
ORF : Open Reading Frame ou cadre de lecture ouvert
PAMP : Pathogen Associated Molecular Patterns ou motifs moléculaires associés aux
pathogènes
pb : Paire de Bases
PCR : Polymerase Chain Reaction ou réaction de polymérisation en chaîne
PGE2 : ProstaGlandine E2
pH : Potentiel Hydrogène
POA : Pyrazinoic Acid ou Acide Pyrazinoïque
PPD : Purified Protein Derivative ou dérivé protéique purifié
PRR : Patern Recognition Receptors ou récepteurs de reconnaissance de motifs moléculaires
PZA : Pyrazinamide
RD : Region of Difference ou région de différence
RNS : Reactive Nitrogen Species ou espèces réactives de l’azote
ROS : Reactive Oxygene Species ou espèces réactives de l’oxygène
RX : radiographie
sp. : species ou espèce
subsp. : subspecies ou sous-espèce
TGF : Transforming Growth Factor
Th : Lymphocyte T auxiliaire ou T helper
TLR : Toll Like Receptors ou récepteurs de type Toll
TNF : Tumor Necrosis Factor
UFC : Unités Formant de Colonie
UI : Unités Internationales
US : UltraSonography ou échographie
VIH : Virus de l’Immunodéficience Humaine
WAHIS : World Animal Health Information System
- 22 -
Introduction
La tuberculose bovine à M. bovis est une zoonose pouvant affecter pratiquement tous
les mammifères, et doit être différenciée de la tuberculose humaine à M. tuberculosis. Elle est
inscrite dans la liste des dangers sanitaires de première catégorie définis par l’arrêté du 29
juillet 2013 et fait partie des vices rédhibitoires chez les bovins. Bien que l’infection ait été
contrôlée dans la plupart des pays développés, elle représente un enjeu économique et de
santé publique majeur. En effet, de nombreux cas humains sont recensés par l’Organisation
Mondiale de la Santé (OMS) chaque année dans les pays en voie de développement. Depuis
quelques années, la prévalence de la tuberculose bovine augmente aux États-Unis et dans
certains pays européens comme le Royaume-Uni, entraînant la réapparition de cas humains de
tuberculose à M. bovis. Or, cette maladie peut causer une altération profonde de l’état général
et potentiellement être mortelle. De plus, son impact économique est très important car les
mesures de contrôle impliquent des saisies et des abattages totaux de troupeaux. Elle entre
aussi en compte dans les échanges commerciaux dans le cadre de la sécurité sanitaire et
alimentaire. Malgré les mesures de lutte mises en œuvre, l’éradication de la maladie demeure
difficile à cause de la présence de réservoirs sauvages comme les blaireaux au Royaume-Uni
ou les daims à queue blanche aux États-Unis.
- 23 -
- 24 -
PREMIÈRE PARTIE :
L’AGENT ÉTIOLOGIQUE
- 25 -
- 26 -
I) Bactériologie
On peut classer les mycobactéries selon d’autres critères que leur pathogénicité
comme par exemple leur vitesse de croissance. Celles à croissance rapide ne sont
généralement pas pathogènes. Parmi les mycobactéries à croissance lente, on retrouve les
bactéries du MTC dont M. bovis. Elles ont besoin de plus de 7 jours pour former des colonies
lorsqu’elles sont repiquées sur un milieu de Löwenstein-Jensen. Ce milieu spécifique contient
du vert de malachite qui inhibe la croissance de nombreux contaminants, favorisant ainsi celle
des mycobactéries. Il contient aussi des éléments nutritifs indispensables à la constitution de
leur paroi particulière. (4)
- 27 -
De nombreuses classifications des mycobactéries basées sur les distances entre
différents gènes existent. Elles permettent un classement des différentes espèces de
mycobactéries en fonction de leur éloignement génétique pour un ensemble de gènes choisis.
La figure 1 donne un exemple d’arbre provenant d’une étude où quatre gènes de l’ARN 16S
(564 paires de bases) ont été séquencés et analysés pour 44 espèces de mycobactéries à
croissance lente. (5)
Comme nous pouvons le remarquer sur cette figure (Fig 1), les espèces de
mycobactéries pathogènes sont également proches d’un point de vue phylogénétique.
- 28 -
B) Caractéristiques bactériologiques des mycobactéries
1) Morphologie
Sur le plan structural, les mycobactéries se caractérisent par une paroi épaisse de sept à
huit nanomètres, riche en lipides (60 % des constituants) et dont la constitution explique, au
moins partiellement, leurs propriétés tinctoriales, leur pathogénicité et leur résistance à divers
antibiotiques. Les mycobactéries sont rattachées aux bactéries à Gram positif, sans en être à
proprement parler. Leur paroi a une structure particulière comprenant trois couches. La plus
interne est formée d'un peptidoglycane à la périphérie duquel est fixé un arabinogalactane
(polymère de molécules d'arabinose et de galactose). L’arabinogalactane s’attache par des
liaisons esters à des acides mycoliques, acides gras à longue chaîne carbonée (60 à 90
carbones), situés dans la couche intermédiaire de la paroi. La partie externe de la paroi est
constituée d'une matrice de phospholipides, de glycolipides (comme le tréhalose dimycolate
notamment), de protéines dont certaines sont sans doute des porines, et de mycosides, ces
derniers formant une pseudo-capsule. La paroi est traversée de part en part par des molécules
de lipoarabinomannane dont la partie lipidique est ancrée dans la membrane cytoplasmique et
dont la partie polysaccharidique gagne la surface de la pseudo-capsule. (7)
- 29 -
2) Affinité tinctoriale
Nous avons pu voir qu’une des particularités des mycobactéries résidait dans la
composition de leur paroi. Sa richesse en lipides et en acides mycoliques lui confère une
grande hydrophobicité et donne ainsi aux mycobactéries une propriété particulière : ce sont
des Bacilles Acido-Alcoolo-Résistants (BAAR). Elles sont de ce fait difficilement colorées
par les colorations classiques de type Gram. En effet, leur paroi hydrophobe empêche le
violet de gentiane d’accéder au cytoplasme. Ensuite, lors du traitement à l’alcool, ce dernier
ne parvient pas dissoudre les lipides pariétaux. Ainsi, lors de la dernière étape de la coloration
de Gram, le second colorant (safranine ou fuchsine) ne parvient pas non plus jusqu’au
cytoplasme. (9) Les mycobactéries n’apparaissent donc pas ou peu colorées.
Une coloration spécifique permet la mise en évidence des bactéries de l’ordre des
Actinomycétales, c’est la coloration de Ziehl-Neelsen (Fig 3). Elle utilise d’abord de la
fuchsine phéniquée de Ziehl à 0,3 % qui colore les mycobactéries en rouge. La fuchsine est
chauffée jusqu’à formation de vapeur afin d’augmenter sa cinétique de pénétration au sein de
la paroi. Il y a alors formation de complexes mycolate-fuschine dans cette dernière. Si les
mycobactéries ont absorbé le colorant, elles le retiennent encore après le traitement intensif à
l’acide sulfurique à 25 % qui survient ensuite. Ce dernier a notamment pour but de décolorer
les bactéries n’étant pas Acido-Alcoolo-Résistantes qui pourraient se trouver sur la lame. Une
contre-coloration au bleu de méthylène à 3 % est alors réalisée pour simplifier la lecture de la
lame, car ce produit ne colore pas les mycobactéries. Elles apparaissent ainsi de couleur rouge
sur fond bleu au microscope optique, tandis que tous les autres micro-organismes non
résistants à l'acide se teintent en fonction de la contre-coloration. (10) (11)
Il faut toutefois garder à l’esprit que toutes les mycobactéries sont colorées de la
même façon par cette méthode. Il faudra donc toujours être prudent dans l’interprétation de
cette coloration car elle n’indique pas si on a affaire à des mycobactéries pathogènes ou non.
Les bacilles apparaissent en rouge vif sur fond bleu et sont colorés de façon homogène.
- 30 -
3) Résistance et sensibilité aux agents physico-chimiques et aux antibiotiques
La structure de la paroi des mycobactéries explique leur résistance aux agents physico-
chimiques. Elles sont en effet résistantes à la dessiccation, aux détergents, aux acides et bases
dilués, au froid (plusieurs années à 4°C) et à la chaleur (20 minutes à 70°C mais elles sont
détruites à 80°C). Les mycobactéries sont sensibles au glutaraldéhyde, aux dérivés
phénoliques (comme le Crézyl par exemple), à l’eau de Javel (hypochlorite de sodium), à
l’éthanol à 70° et à l’acide peracétique. Néanmoins, des temps de contact plus longs qu’avec
les autres bactéries seront nécessaires pour obtenir un effet bactéricide. (13)
Il existe plusieurs antimicrobiens actifs sur les mycobactéries, répartis entre les
antituberculeux dits « essentiels » et ceux de réserve. Les médicaments antituberculeux ont
trois propriétés principales : ils sont bactéricides, stérilisants et capables de prévenir
l’apparition d’une résistance. Les médicaments antituberculeux essentiels possèdent ces trois
caractéristiques à des degrés divers :
La rifampicine inhibe la synthèse de l’acide ribonucléique (ARN) chez un grand
nombre d’agents pathogènes en se liant spécifiquement à leur ARN polymérase. C’est un
bactéricide puissant qui se trouve être le stérilisant le plus efficace dont nous disposons à
l’heure actuelle. Il est en effet capable d’agir sur toutes les populations de bacilles
tuberculeux, qu’ils se trouvent en position extracellulaire ou intracellulaire.
L’isoniazide (hydrazide de l’acide isonicotinique) exerce un effet bactéricide puissant
sur les bacilles tuberculeux en phase de réplication en inhibant la synthèse des acides
mycoliques. C’est une prodrogue qui pour être efficace doit être activée par une catalase
peroxydase bactérienne. Comme la rifampicine, l’isoniazide est actif contre toutes les
populations de bacilles tuberculeux.
La streptomycine est un antimicrobien inhibiteur de la synthèse des protéines. Il agit
en se fixant sur l’ARN ribosomique 16S. Il appartient à la famille des aminosides et possède
une activité bactéricide contre certaines populations bacillaires qui se multiplient rapidement.
Il est historiquement le premier antibiotique ayant eu une action contre M. tuberculosis.
L’éthambutol et la thioacétazone sont utilisés en association avec des médicaments
plus puissants pour éviter l’apparition de bacilles résistants. (14)
Le pyrazinamide sera étudié à part dans la partie I.B.3.iii.
Les antituberculeux de réserve sont utilisés dans certains cas particuliers et leur
utilisation doit être strictement interdite en dehors de quelques services spécialisés. On peut
les utiliser pour les cas de tuberculose chronique où le test de dépistage rapide par lecture
d’un frottis d’expectoration au microscope revient positif à l’issue d’un traitement bien
conduit avec des médicaments antituberculeux essentiels. On les utilise aussi pour les
tuberculoses multirésistantes où les bacilles sont au moins résistants à la rifampicine et à
l’isoniazide.
Le terme « réserve » est utilisé à la place de « deuxième intention » pour se conformer
à la Liste modèle de Médicaments Essentiels (LME) de l’OMS. La LME a été créée en 1977
en vue d’offrir un modèle auquel les gouvernements puissent se référer pour sélectionner les
médicaments et établir des listes nationales. Parmi les antituberculeux de réserve, on trouve la
kanamycine, l’éthionamide, le protionamide, l’amikacine, l’ofloxacine et la ciprofloxacine.
(14)
- 31 -
iii) Le cas particulier du pyrazinamide chez Mycobacterium bovis
A : Entrée par transport actif et passif du PZA dans la bactérie. B : Conversion du PZA en POA par
la protéine PncA. C : En milieu acide, le POA devient actif (POAH sur le schéma). D : Réduction du
potentiel membranaire de la bactérie. E : Inhibition de la FAS entraînant une rupture de la membrane.
F : Acidification du cytoplasme. G : Inhibition de la synthèse des protéines bactériennes.
- 32 -
Chez M. bovis, il existe une mutation caractéristique à point unique en position 169 du
nucléotide du gène pncA codant pour la pyrazinamidase. Une cytosine est remplacée par une
guanine par rapport à la séquence pncA de M. tuberculosis. Cela entraîne une substitution des
acides aminés en position 57 de la séquence PncA, rendant la pyrazinamidase de M. bovis
inactive. Cela confère à M. bovis une résistance naturelle au pyrazinamide car ce dernier n’est
pas converti en POA actif (Inhibition de l’étape B sur la figure 4). Cette caractéristique est
habituellement utilisée pour distinguer M. bovis de M. tuberculosis. Il est aussi intéressant de
noter que la plupart des résistances au pyrazinamide ont pour origine une mutation du gène
pncA. (18)
4) Croissance
M. bovis M. tuberculosis
Température optimale
38,5°C 37,5°C
de croissance
pH Entre 6 et 6,5 unités pH Entre 5,8 et 6,7 unités pH
Délai de culture 1 à 2 mois 2 à 4 semaines
Eugoniques (colonies à
Dysgoniques (colonies restant développement progressif
toujours de petite taille) pouvant atteindre 1 cm de
diamètre)
Aspect des colonies
Arrondies aux bords irréguliers, En forme de « chou-fleur », de
de teinte blanche, à surface teinte crème beige, à surface
brillante et lisse (Smooth) sèche et rugueuse (Rough)
Les colonies de M. bovis sont petites, non pigmentées, lisses et dysgoniques. D’abord
plates, elles deviennent ensuite bombées et brillantes mais ne dépassent pas la taille d’une tête
d’épingle (6) sauf si le milieu de culture est enrichi en pyruvate de sodium (comme le milieu
de Coletsos). Elles n’apparaissent jamais avant un mois à l’isolement mais, après repiquage,
la croissance peut être plus rapide et les colonies peuvent devenir rugueuses, bien développées
et se confondre avec celles de M. tuberculosis.
- 33 -
Figure 5 : Aspect des colonies de M. bovis, M. tuberculosis et M. avium intracellulare sur
milieu de Löwestein-Jensen
- 34 -
5) Propriétés biochimiques des mycobactéries
Les mycobactéries sont des bacilles aérobies strictes à micro-aérobies, possédant des
propriétés biochimiques variées pouvant permettre de faire la distinction entre elles. M. bovis
et M. tuberculosis possèdent une peroxydase et une catalase thermolabile. Cela diffère des
mycobactéries atypiques qui ont en commun l’absence de peroxydase et la présence d’une
catalase résistante à 75°C pendant 15 minutes. Les mycobactéries atypiques ont aussi la
particularité d’être résistantes au thioacétazone.
M. tuberculosis possède une nicotinamidase qui n’est pas retrouvée chez les autres
mycobactéries telles que M. bovis qui ne peuvent donc pas convertir le nicotinamide en acide
nicotinique (ou niacine). Cela explique pourquoi M. tuberculosis est la seule pouvant donner
un test de Konno (ou niacine-test) positif. Ce test est spécifique de ce dernier bacille et se
réalise sur une culture de 40 jours. (21) De plus, M. bovis est aussi incapable de réduire les
nitrates contrairement à M. tuberculosis qui possède une nitrate réductase.
Il est intéressant de noter que la glycérine présente dans les milieux de culture a
tendance à inhiber la croissance de M. bovis alors que cette dernière est stimulée par le
pyruvate de sodium. Cela explique la croissance plus longue de M. bovis par rapport à M.
tuberculosis sur le milieu de Löwenstein-Jensen contenant de la glycérine. De même, malgré
la présence de glycérine sur le milieu de Coletsos, la croissance de M. bovis y est favorisée car
il contient du pyruvate de sodium. (13)
Tableau II : Principales propriétés distinctives entre M. bovis, M. tuberculosis et les
mycobactéries atypiques (d’après (13) et (21))
- 35 -
Le climat influence la survie de M. bovis dans l’environnement. Une température juste
au-dessus de 0°C et une forte hygrométrie la favorisent tandis qu’un temps chaud et sec la
diminue. Cependant, aucun cas d’infection humaine par M. bovis directement à partir de
l’environnement n’a encore été répertorié. De plus, l’infection de troupeaux par des bacilles
présents dans l’environnement est probablement négligeable car un bovin doit ingérer 10 7
bacilles pour se contaminer alors que quelques bacilles en aérosol suffisent pour infecter un
veau de 4 à 7 mois. (24) Il est donc plutôt bien établi que la niche écologique des bacilles
tuberculeux est restreinte à l’Homme et à quelques animaux. M. bovis est considéré comme
un pathogène intracellulaire dont la voie de contamination la plus courante est la transmission
par contact direct entre les animaux.
M. bovis possède le spectre d’hôte le plus large de tous les bacilles du MTC. Par exemple, en
France, une proportion non négligeable de Cerfs (Cervus elaphus) contaminés par M. bovis
ont été trouvés dans des régions où des cas d’infection de cheptels ont été rapportés. Cela
nous permet de suspecter le rôle de la faune sauvage dans la transmission de la maladie d’où
l’importance de sa détection. (23) Les fèces, l’urine et le pus peuvent se retrouver facilement
sous forme d’aérosols capables de propager l’infection dans les troupeaux par voie aérienne.
Ainsi, la limitation des contacts entre les animaux sauvages potentiellement infectés et les
troupeaux de bovins semble être la base de tout programme de lutte contre la tuberculose
bovine. (24)
Il existe de nombreuses mesures facilitant la détection de la maladie chez les animaux
de la faune sauvage, comme par exemple des guides de reconnaissance des lésions de
tuberculose à l’usage des chasseurs. En Suisse, les chasseurs et organismes de surveillance de
la chasse ont l’obligation de signaler à un vétérinaire officiel toute lésion suspecte. (25) En
France, il existe deux réseaux acteurs de la surveillance de la tuberculose dans la faune
sauvage. Le réseau SAGIR s’occupe de la détection des agents pathogènes zoonotiques ou
partagés par la faune sauvage et les animaux domestiques. Il fait intervenir les Fédérations des
chasseurs et l’Office National de la Chasse et de la faune sauvage. Le réseau Sylvatub quant à
lui a été lancé en 2011 par le Ministère de l’Agriculture pour faire face à la recrudescence de
la tuberculose bovine en élevage. Il s’appuie sur le réseau SAGIR et son principal objectif est
la détection de la présence de tuberculose au sein de la faune sauvage. (26)
- 36 -
Deux catégories d’hôtes sont à distinguer : les espèces réservoir capables d’entretenir
et de propager l’infection et les espèces relais, dites « spill over species », qui ne font que
propager la maladie sans l’entretenir. Chez les espèces réservoir, l’infection peut persister par
transmission horizontale en l’absence de source de M. bovis et peut être transmise à d’autres
hôtes sensibles. Les espèces relais peuvent être infectées par M. bovis mais l’infection
survient de manière sporadique et ne persiste dans leur population qu’en présence d’une
espèce réservoir atteinte dans leur écosystème. Si la source de l’infection est éliminée, la
prévalence de la maladie est réduite et ne peut être maintenue sur le long terme que par
l’apparition d’une nouvelle source ou bien par la présence d’un réservoir. (23)
Tableau III : Liste non exhaustive des espèces sauvages chez lesquelles M. bovis a pu être
isolé, et leur rôle de réservoir ou de relais dans la transmission de la tuberculose bovine à
des troupeaux de bovins domestiques (d’après (23))
Espèces 1 2 Espèces 1 2
Cervidés Ruminants Sauvages
Cerf de Virginie (Odocoileus X X Buffle d'Afrique (Syncerus X
virginianus) caffer)
Cerf élaphe (Cervus elaphus) X X Buffle d’Asie (Bubalus arnee) X
Cerf sika (Cervus nippon) X X Bison (Bison bison) X
Daim (Dama dama) X X Kudu (Tragelaphus imberbis) X
Chevreuil (Capreolus capreolus) X ? Grand Kudu (Tragelaphus X
strepsiceros)
Wapiti (Cervus canadensis) X X Cobe de Lechwe (Kobus leche) X
Suidés Chèvre (Capra hircus) X
Sanglier (Sus scrofa) X Gnou (Connochaetes taurinus) X X
Phacochère (Phacochoerus X X Sassabi (Damaliscus lunatus) X
aethiopicus)
Porc (Sus domesticus) X Petits mammifères
Carnivores Hérisson (Erinaceus europaeus) X
Renard roux (Vulpes vulpes) X Taupe (Talpa europaea) X
Furet (Mustela furo) X ? Rat (Rattus norvegicus) X ?
Hermine (Mustela erminea) X Musaraigne (Sorex araneus) X
Putois (Mustela putorius) X Écureuil (Sciurus carolinensis) X
Vison (Mustela vison) X Campagnol (Clethrionomys X
glareolus)
Lion (Panthera leo) X ? Mulot (Apodemus flavicollis) X
Guépard (Acinonyx jubatus) X Autres
Chat Sauvage (Felis catus) X Blaireau (Meles meles) X
Léopard (Panthera pardus) X Possum (Trichosurus vulpecula) X
Hyène (Crocuta crocuta) X Babouin (Papio cynocephalus) X
Lynx roux (Lynx rufus) X
1 : Relais (« Spill over species »)
Coyote (Canis latrans) X
Ours noir (Ursus americanus) X 2 : Réservoir (« Maintenance species »)
Raton laveur (Procyon lotor) X
- 37 -
La localisation des lésions chez les animaux atteints permet de savoir à quelle
catégorie d’hôtes ils appartiennent. Les lésions majoritairement localisées en région
thoracique suggèrent une infection par voie aérienne, ce qui est couramment observé chez les
espèces réservoir. Les lésions localisées au niveau du tractus digestif évoquent quant à elles
une contamination orale par ingestion de carcasses contaminées. Elles sont plutôt retrouvées
chez les espèces relais. Néanmoins, la limite entre ces deux catégories d’hôtes n’est pas
encore clairement établie. La capacité d’excrétion de M. bovis, l’éthologie (comme par
exemple la vie en groupe ou en solitaire) et l’écologie (alimentation, comportement, la densité
de population et les interactions interspécifiques) sont des facteurs pouvant amener une
espèce à devenir, dans un biotope particulier, un réservoir de la tuberculose bovine. Le tableau
III est une liste non exhaustive décrivant les principales espèces réservoirs et relais pour M.
bovis dans la faune sauvage. (24)
De nombreux facteurs ont une influence sur le pouvoir pathogène de M. bovis. Ils
peuvent être regroupés en deux grandes catégories : les facteurs liés à l’hôte et ceux liés au
bacille lui-même.
Plusieurs paramètres liés à M. bovis sont à prendre en compte dans son pouvoir
pathogène. Tout d’abord, le nombre de lésions induites suite à une contamination par voie
respiratoire est proportionnel à la quantité de mycobactéries inhalée. De même, il existe une
relation inversement exponentielle entre la quantité de bacilles inhalée et le délai avant
l’excrétion des bactéries par l’hôte, qui est en moyenne de 87 jours dans les conditions
naturelles. (28) La taille et la viscosité des particules présentes dans les aérosols vecteurs de
bacilles semblent également être des paramètres importants dans l’installation de l’infection.
Des gouttes fines de faible viscosité sont ainsi les plus aptes à délivrer les mycobactéries
qu’elles contiennent. (27) Il est aussi intéressant de noter que seules des particules dont le
diamètre est inférieur à cinq microns sont capables d’atteindre les alvéoles pulmonaires. (29)
Les propriétés des mycobactéries liées à leur virulence sont relativement complexes et
concernent leur capacité à infecter, survivre et se répliquer dans les cellules de l’hôte. Elles
sont peu définies pour les bacilles tuberculeux mais plusieurs facteurs de virulence ont été
identifiés. Les mycosides et les lipoarabinomannanes permettent par exemple une persistance
de la bactérie dans les macrophages. (27)
L’objectif de ce travail étant d’étudier la tuberculose à M. bovis chez les bovins et chez
l’Homme, nous ne nous intéresserons plus qu’à cette mycobactérie spécifiquement dans les
parties à venir.
- 38 -
II) Épidémiologie
A) Épidémiologie descriptive
1) Évolution du MTC dans le temps
La tuberculose est une maladie très ancienne car M. prototuberculosis, l’ancêtre qui
serait à l’origine du MTC, serait apparu il y a 40 000 ans. Une étude reposant sur l’utilisation
de marqueurs génétiques hypervariables sur différentes lignées de bactéries appartenant au
MTC tend à prouver que le complexe aurait émergé en Mésopotamie. Il se serait ensuite
répandu avec les migrations humaines en Asie, en Afrique et en Europe il y a 10 000 ans. (30)
La présence de déformations vertébrales sur des momies égyptiennes datant d’environ
5 000 ans ont pu être rattachées à la maladie de Pott, une spondylodiscite due au bacille de la
tuberculose. Grâce aux techniques du génie génétique comme la PCR (Polymerase Chain
Reaction), de l’ADN de M. tuberculosis a pu être amplifié à partir de tissus appartenant à ces
momies. Des manuscrits décrivent la présence de tuberculose en Inde et en Chine il y a
respectivement 3 300 ans et 2.300 ans. Grâce aux mêmes techniques que celles employées
pour les momies égyptiennes, l’étude de momies péruviennes a permis de mettre en évidence
la présence de tuberculose en Amérique bien avant l’arrivée des premiers explorateurs
européens. Il existait au niveau du détroit de Béring un pont terrestre reliant la Sibérie et
l'Alaska il y a plus de 10 000 ans, ce qui aurait permis les migrations humaines ayant emmené
la tuberculose sur le continent américain. (31)
- 39 -
La sédentarisation et la domestication d’animaux dans des milieux de vie différents
ont ensuite permis l’émergence de nouvelles espèces de mycobactéries telles que M. bovis ou
M. caprae, ainsi que le développement de leur capacité à se transmettre à un large spectre
d’hôtes. L’ensemble de ces données explique la vaste répartition de la tuberculose dans le
monde et indiquerait que la transmission de cette maladie s’est faite de l’Homme aux animaux
domestiques à l’origine. (33)
Des programmes d’éradication basés sur la surveillance ainsi que des mesures de
dépistage et d’abattage visant à éliminer les animaux infectés des troupeaux ont pratiquement
éradiqué la tuberculose des élevages de nombreux pays développés. Aujourd’hui, de
nombreux pays en Europe et en Amérique du Nord, ainsi que l’Australie, sont indemnes de
tuberculose bovine ou proches de son éradication complète chez le bétail. Néanmoins, la
présence de réservoirs sauvage de M. bovis ont gravement compromis les programmes
d ‘éradication dans des pays comme l’Irlande, la Nouvelle-Zélande, le Royaume-Uni et
l’Irlande du Nord, ainsi que dans certaines parties des États-Unis d’Amérique. Il a été prouvé
que les animaux sauvages se contaminaient au contact des troupeaux et entretenaient ensuite
la maladie. Des analyses génétiques ont montré que les troupeaux étaient infectés par les
mêmes souches que la faune sauvage qui les entourait, et que le niveau de contamination des
cheptels était directement relié à la prévalence de la maladie dans la faune sauvage. (36)
- 40 -
Figure 8 : Carte de la répartition géographique mondiale de la tuberculose bovine entre
janvier et juin 2016 (d’après (37))
Il est difficile de faire un état des lieux précis de la tuberculose zoonotique à M. bovis.
La majorité des données disponibles ne différencient pas la tuberculose due à M. bovis de
celle liée à M. tuberculosis. L’identification de l’espèce exacte nécessite une culture
bactérienne et l’utilisation de techniques moléculaires qui sont très rarement employées. Le
nombre cas humains de tuberculose à M. bovis peut donc s’avérer fortement sous-évalué. (39)
- 41 -
Tableau IV : Incidence et mortalité de la tuberculose due à M. bovis chez l’homme en
2015 selon les estimations de l’OMS (d’après (38))
Région Incidence Mortalité
Afrique 76 300 (20 300 – 168 000) 10 000 (2 570 – 22 500)
Amérique 804 (218 – 1 770) 46 (12 – 98)
Est de la Méditerranée 7 490 (1 883 – 16 900) 639 (113 – 1 610)
Europe 1 290 (350 – 2 840) 103 (28 – 225)
Asie du Sud-Est 47 400 (11 300 – 109 000) 2 280 (602 – 5 050)
Ouest du Pacifique 15 900 (4 290 – 34 900) 286 (77 – 630)
Global 149 000 (71 600 – 255 000) 13 400 (5 050 – 25 700)
L’intervalle de confiance à 95 % est indiqué entre parenthèses.
Avant la mise en place d’un programme de contrôle de la tuberculose, une proportion
significative des cas humains était due à M. bovis dans la plupart des pays développés. En
France, les mesures obligatoires de pasteurisation du lait et d’abattage systématique des
bovidés contrôlés positifs au test à la tuberculine datent respectivement de 1955 et de 1963.
La prévalence de M. bovis à cette époque était de l’ordre de 1,5 % en Europe alors que seuls
quelques cas sporadiques sont observables de nos jours. (40) La situation est différente pour
les pays en voie de développement. Dans la plupart des pays d’Afrique, la tuberculose bovine
est présente et aucune mesure de contrôle de la maladie telle que la pasteurisation du lait ou
l’inspection des carcasses à l’abattoir n’est mise en place. Ce phénomène est aggravé par la
présence de nombreux facteurs de risque tels que la forte prévalence de l’infection par le HIV.
Une étude de juin 2013 rapporte que la tuberculose à M. bovis représente en moyenne 2,8 %
des cas de tuberculose en Afrique, 0,3 % des cas sur l’ensemble du continent américain et
0,4 % des cas en Europe. La consommation de lait cru dans certains pays d’Afrique,
d’Amérique du Sud et d’Asie où la maladie est fortement prévalente chez les bovins permet
d’expliquer la proportion plus élevée de cas de tuberculose humaine imputables à M. bovis.
C’est le cas notamment en Éthiopie, en Tanzanie et au Mexique où la proportion de cas de
tuberculose à M. bovis s’élève respectivement à 17 %, 26,1 % et 7,8 %. (39)
B) Épidémiologie analytique
1) Sources de contamination
L’homme et les animaux infectés peuvent excréter M. bovis par plusieurs voies et
représentent la principale source de contamination pour les individus sains et
l’environnement. L’excrétion est présente pendant toute la durée de l’infection, même si son
intensité est irrégulière. Elle peut se faire par le biais du jetage et des expectorations lors
d’une atteinte des poumons ou des nœuds lymphatiques céphaliques, par les matières fécales
dans le cas d’une localisation digestive ou par l’urine si l’infection est généralisée. Le passage
de bacilles dans les fèces en l’absence de lésions gastro-intestinales est aussi possible, par
déglutition de mucus chargé en bactéries dans le cadre d’une atteinte pulmonaire. (41) Les
tissus et organes infectés constituent aussi une source de contamination. Selon la proximité du
muscle avec les lésions, la viande peut se contaminer et donc devenir impropre à la
consommation. Il est intéressant de noter que le sang n’est que très rarement contaminé par
M. bovis, ce dernier ne s’y trouvant que transitoirement avant d’infiltrer les macrophages.
L’ensemble des éléments environnementaux souillés par M. bovis, tels que l’eau, le sol
ou les mangeoires, peut aussi devenir une source de contamination. (3)
- 42 -
2) Réceptivité
Pratiquement tous les mammifères peuvent être atteints par la tuberculose mais la
sensibilité à l’infection varie selon les individus. Chaque espèce possède une réceptivité
propre à M. bovis. Par exemple, les bovins sont plus fréquemment touchés par ce bacille que
les caprins ou les ovins. Tous les facteurs entraînant une altération de l’état général peuvent
diminuer les défenses de l’hôte et le rendre ainsi plus sensible au bacille tuberculeux. C’est le
cas notamment lors de carences alimentaires, de surmenage physique ou de conditions de vie
en promiscuité dans certains élevages intensifs. La maladie est aussi plus grave et plus
fréquente chez les animaux jeunes ou âgés. La présence de lésions tissulaires locales
préexistantes peut aussi favoriser l’implantation de M. bovis. (3) (13)
3) Mode de transmission
La transmission de M. bovis d’un animal à l’homme peut s’effectuer par voie aérienne
directement à partir des animaux infectés, par contact direct entre des tissus animaux infectés
et la peau humaine lésée ou encore par consommation de lait contaminé non pasteurisé. (43)
Comme chez les bovins, la localisation des lésions de tuberculose est souvent liée à la voie de
pénétration du bacille.
- 43 -
La contamination horizontale directe par inhalation de particules très fines aboutit à
une tuberculose pulmonaire. Il arrive néanmoins que la tuberculose puisse s’étendre à d’autres
organes secondairement à une infection du poumon.
La tuberculose extra-pulmonaire résulte habituellement de l’invasion transitoire du
sang circulant par M. bovis suite à un contact direct ou à l’ingestion de lait contaminé. Le lait
a été historiquement le moyen de dissémination principal du bacille car la mise en place d’une
politique de pasteurisation obligatoire a permis une diminution de la prévalence de la
tuberculose dans les pays développés. Le lait constitue un vecteur idéal pour M. bovis car ce
dernier peut former une émulsion avec les graisses, facilitant ainsi sa migration à travers le
mucus et le tissu lymphoïde de l’intestin. La consommation de viande contaminée est interdite
dans plusieurs pays développés, bien que le danger qu’elle représente soit peu décrit. (35)
C) Épidémiologie synthétique
1) Modalités de contamination
Figure 9 : Modèle explicatif de l’origine d’un foyer de tuberculose dans un élevage bovin
indemne (d’après (44))
- 44 -
Le premier risque correspond à l’introduction d’un animal infecté dans un élevage
indemne, que se soit à des fins de reproduction, de renouvellement de troupeau ou de mise en
pension transitoire. Dans les pays développés, les documents d’exploitation ainsi que les
passeports accompagnant les animaux permettent de limiter ce risque en témoignant du statut
indemne de tuberculose des élevages d’origine des animaux nouvellement introduits.
La contamination par résurgence peut survenir lors d’une récidive liée à la persistance
de l’infection à bas bruit suite un épisode de tuberculose, ou bien lors de l’introduction d’un
animal infecté non reconnu comme tel. La résurgence est donc directement liée au phénomène
d’anergie correspondant à l’absence de réaction à la tuberculination d’animaux infectés
chroniques. La tuberculose étant une maladie chronique et insidieuse, les signes cliniques ne
permettent pas de détecter ces individus infectés latents qui peuvent redevenir excréteurs et
propager la maladie dans l’élevage. (44)
Les trois risques vus précédemment n’interviennent pas de la même manière dans
chaque pays selon ses modalités de contrôle de la maladie et la prévalence de cette dernière.
Dans les pays développés, nous avons pu voir que la prévalence de la tuberculose
bovine est faible. Cela s’explique par la mise en application des différentes mesures de
contrôle et d’abattage des bovins infectés, associé à l’élimination des individus ayant été en
contact avec eux. Le risque de voisinage est donc peu élevé dans ce type de pays. Cependant,
la sensibilité du test à la tuberculination est de l’ordre de 0,8 à 0,9. Ainsi, le risque de ne pas
détecter un bovin infecté est de 10 à 20 %. Ceci, ajouté au phénomène d’anergie, explique
pourquoi le risque est essentiellement lié aux introductions d’animaux et à la résurgence dans
les pays où la tuberculose est sporadique.
- 45 -
ii) Dans l’espèce humaine
Dans les pays développés où la prévalence de M. bovis est faible, les rares cas de
tuberculose humaine concernent principalement des personnes âgées de plus de 60 ans et des
individus plus jeunes. (45) La localisation essentiellement extra-pulmonaire des lésions chez
les personnes âgées oriente prioritairement vers une contamination digestive ancienne, suivie
d’une réactivation de la maladie. Au contraire, la localisation principalement pulmonaire de la
tuberculose dans les tranches d’âge plus jeunes indique plutôt une contamination par voie
respiratoire. L’ensemble de ces éléments valide indirectement l’efficacité des mesures de
contrôle et de prévention de la maladie dans les pays développés. En effet, la contamination
digestive par M. bovis a pu être supprimée dans ces pays grâce à la mise en place des mesures
de pasteurisation systématique du lait et de contrôle des carcasses à l’abattoir. La voie
aérienne reste donc la seule voie de contamination pour les personnes plus jeunes à l’heure
actuelle. L’abattage systématique des animaux infectés réduit également la prévalence de la
tuberculose bovine dans les cheptels et par conséquent les risques de contamination directe de
l’homme par le bétail. Ainsi, la transmission interhumaine de M. bovis semble actuellement
représenter un enjeu plus important et pourrait devenir l’objet de recherches plus poussées à
l’avenir. (40)
Dans les pays en voie de développement où la tuberculose bovine n’est pas contrôlée,
une partie des cas humains concernent des individus jeunes ayant ingéré ou manipulé du lait
contaminé. Ainsi, la tuberculose extra-pulmonaire est assez courante dans ces pays.
Néanmoins, les personnes en contact direct avec le bétail ou du lait contaminé peuvent être
infectées par voie aérienne, qui reste la voie principale de contamination, et ainsi développer
une tuberculose pulmonaire. (45)
2) Facteurs de risque
a) A l’échelle de l’individu
- 46 -
La taille des cheptels est un facteur de risque bien identifié vis-à-vis de l’infection par
M. bovis car la présence d’un grand nombre d’animaux augmente la probabilité qu’au moins
un individu se contamine. La forte densité d’un élevage favorise la transmission par les
aérosols en augmentant les contacts entre animaux et peut être à l’origine d’un stress étant un
facteur de risque individuel de contamination. La vie en pâturage conduit à l’augmentation du
risque de voisinage avec les autres élevages, notamment en cas de proximité géographique.
Elle laisse aussi la possibilité de création d’un réservoir de M. bovis au sein de la faune
sauvage (sangliers, cerfs, blaireaux...). Le mode de distribution de l’alimentation ainsi que le
lieu de stockage des aliments doivent aussi être pensés afin d’en limiter l’accès aux animaux
sauvage pouvant être infectés. (3)
Le taux de réforme, c’est à dire le nombre de femelles reproductrices envoyées à
l’abattoir chaque année pour renouveler le troupeau, est variable d’un élevage à un autre. Plus
celui-ci est bas, moins le renouvellement du cheptel est rapide, ce qui est favorable à la
persistance et au développement de la tuberculose, qui est une maladie d’installation
chronique. Le temps passé dans l’élevage augmente le risque de pouvoir entrer en contact
avec M. bovis et en cas de contamination latente de certains individus, permet une résurgence
de la maladie. Un taux de réforme trop élevé est aussi un facteur de risque important car il
favorise les mouvements d’animaux dans l’élevage et donc la possibilité d’introduction de la
maladie. La pratique de la monte naturelle, par opposition avec l’insémination artificielle,
occasionne aussi de multiples échanges d’animaux entre élevages et augmente de ce fait le
risque d’introduction de M. bovis. (42) Enfin, le prêt ou la mise en commun de matériel
agricole et de pâtures sont des conduites à risque vis-à-vis de la transmission de la maladie.
Un des principaux facteurs de risque de contamination humaine par M. bovis dans les
pays en développement est la forte prévalence de tuberculose bovine. En outre,
respectivement 65 %, 70 % et 26 % de la population africaine, asiatique et latino-américaine
travaille dans l’agriculture et présente donc un risque accru vis-à-vis de la tuberculose. Le
contact physique étroit avec des animaux infectés, notamment dans certaines communautés,
constitue lui aussi un important facteur de risque dans ces pays où la tuberculose bovine est
largement répandue. Par exemple, dans certains pays d’Afrique, les bovins font partie
intégrante de la vie sociale humaine et se retrouvent au centre de nombreux événements, et
par conséquent de rassemblements.
L’absence de bonnes pratiques d’hygiène alimentaire est un facteur de risque
supplémentaire dans de nombreux pays en développement. Dans tous les pays d’Afrique
subsaharienne, il existe de grandes entreprises publiques de transformation et de
commercialisation du lait respectant les normes d’hygiène. Cependant, elles sont
concurrencées activement par le secteur informel. Ce dernier correspond à l’ensemble des
activités productrices de biens et de services échappant au regard et à la régulation de l’État ;
et dans le cas de la commercialisation du lait ; pouvant ignorer les normes d’hygiène et de
qualité.
L’infection par le VIH augmente le risque de développer la tuberculose. En effet, 90 %
des individus nouvellement contaminés par M. bovis sans être infectés par le VIH ne
développent pas de tuberculose car leurs défenses immunitaires sont suffisamment efficaces
pour éviter le passage à la maladie active suite à l’infection. En revanche, les personnes
infectées par les deux agents pathogènes ont un risque annuel de développer la maladie
augmenté de 5 % à 15 %, en fonction de l’avancement de leur immunosuppression. (45)
- 47 -
Nous avons pu voir que M. bovis appartient au Complexe Mycobacterium
Tuberculosis regroupant les bactéries tuberculeuses. La composition particulière de leur paroi
leur confère, entre autres, une bonne résistance aux agents physico-chimiques. Parmi les
mycobactéries, M. bovis possède le spectre d’hôte le plus large et peut donc infecter un grand
nombre d’espèces de mammifères. Nous avons ensuite étudié la distribution mondiale de M.
bovis et constaté qu’elle est assez similaire chez les bovins et l’Homme, avec une forte
prévalence dans les pays en voie de développement où les mesures de contrôle de la maladie
sont absentes ou insuffisantes. Les modalités de contamination restent variées mais la
transmission de la maladie à d’autres individus (bovins et Hommes) par voie respiratoire à
partir de bovins infectés reste la plus répandue à l’échelle mondiale. Nous allons maintenant
aborder la pathologie de la tuberculose à M. bovis. Nous nous pencherons d’abord sur la
primo-infection, en détaillant les différents mécanismes mis en jeu et les réactions
immunitaires associées. Nous nous intéresserons ensuite à la tuberculose pulmonaire et ses
différentes formes de généralisation, avec les différentes lésions macroscopiques engendrées.
- 48 -
DEUXIÈME PARTIE :
LA PATHOLOGIE
- 49 -
- 50 -
I) Formation du complexe primaire et réactions immunitaires
A) L’infection initiale
1) Le complexe primaire
Si cette réaction immunitaire initiale ne parvient pas à éliminer les mycobactéries, une
partie se multiplie localement dans les cellules phagocytaires. Il se forme ainsi en 8 à 15 jours
une lésion inflammatoire appelée chancre d’inoculation. (3) À la faveur du drainage
lymphatique, les macrophages infectés migrent jusqu’au le ganglion lymphatique local où la
réponse immunitaire Th1 cellulaire est initiée par recrutement et interaction avec les cellules
de l’immunité innée et acquise. (46) Une deuxième infection se met alors en place au niveau
du ganglion et forme avec la première le complexe primaire, ou complexe de Ghon. Ce
complexe sera qualifié de complet si les deux zones d’infection sont lésées et d’incomplet si
la lésion au niveau du site d’entrée est absente. Le complexe primaire est le plus souvent
retrouvé dans les voies respiratoires basses chez les ruminants. La lésion initiale est souvent
absente ou si petite qu’elle n’est pas retrouvée si elle n’est pas soigneusement recherchée à
l’autopsie ou à l’abattoir. (49)
- 51 -
Figure 10 : Structure et constituants cellulaires d’un granulome tuberculeux (50)
- 52 -
Le granulome organisé avec un centre nécrosé entouré de cellules géantes de Langhans et la
présence de lymphocytes et de fibres en périphérie est appelé follicule de Koëster. (51)
- 53 -
B) Mécanismes mis en jeu durant l’infection à M. bovis
Figure 12 : Schéma simplifié de la réponse immunitaire induite lors d’une infection par
les mycobactéries (d’après (46), (54) et (55))
- 54 -
2) La sécrétion des cytokines
Les mycobactéries pathogènes ont développé une gamme variée de mécanismes qui
facilitent leur survie et leur multiplication au sein des macrophages : la prévention de la fusion
entre le phagosome et les lysosomes, l’inhibition de l’apoptose et la suppression des
mécanismes de présentation et signalisation des antigènes dans les macrophages. (46)
- 55 -
Expérimentalement, des bacilles tuberculeux traités avec du sérum de lapins immunisés
contre le BCG ont été introduits dans des macrophages de souris pour étudier la formation
d’un phagolysosome ou son absence. Il est alors apparu que la fusion entre le phagosome et le
lysosome était favorisée après ce traitement. Il a aussi été démontré au cours de cette étude
que l’exposition des bacilles tuberculeux à un sérum immun spécifique ne réduisait pas leur
virulence et leur viabilité. Ainsi, il a été suggéré que la liaison spécifique des anticorps sur ces
bacilles les empêchait d’inhiber la formation d’un phagolysosome. (56) Cette inhibition a pu
être attribuée à deux composants de la paroi des mycobactéries : le lipoarabinomannane et le
tréhalose dimycolate. (48)
Les mycobactéries tuberculeuses sont aussi capables d’induire la sécrétion d’IL-10 par
les monocytes et les macrophages. L’IL-10 inhibe la maturation des phagosomes nécessaire à
la destruction de l’agent pathogène. Ainsi, sa production lors des infections mycobactériennes
favorise aussi la survie des bacilles au sein des macrophages. (57)
Figure 13 : Les deux modalités de mort cellulaire des macrophages et leurs conséquences
sur la multiplication des mycobactéries chez l’hôte (50)
- 56 -
La présence de lésions de la membrane interne des mitochondries des macrophages
peut conduire à leur nécrose. Un mécanisme hautement conservé dépendant de l’exocytose
d’endomembranes dérivées des lysosomes et de l’appareil de Golgi est alors rapidement mis
en place et permet de les réparer. Contrairement aux souches atténuées de mycobactéries, les
souches virulentes sont capables de déréguler cette réparation. Dans de telles conditions, les
lésions de la membrane interne des mitochondries ne sont plus réparées, ce qui provoque une
nécrose des macrophages. (58)
Plusieurs modifications dans les niveaux d’expression de certains gènes par les
macrophages ont pu être observées lorsqu’ils sont infectés par M. bovis. Nous avons déjà pu
voir que les mycobactéries pouvaient inhiber la synthèse de PGE2 et activer celle de LXA4 et
d’IL-10. C’est aussi le cas avec des gènes comme IFIT1, IFIT2, MX1 et MX2, nécessaires à la
synthèse d’IFN de type I et de type II, qui sont activés lors d’une infection par M. bovis.
L’utilisation d’un modèle murin a permis d’objectiver le fait que l’IFN de type I
favoriserait la progression de la maladie. À l’inverse, l’expression des gènes IL1A et IL1B,
responsables de la synthèse d’IL-1, est inhibée lors d’une infection par M. bovis. Or, les souris
déficientes en IL-1 sont plus sensibles aux mycobactéries virulentes. De plus, il a été montré
expérimentalement que l’induction de la production d’IFN de type I inhibe la sécrétion d’IL-
1. Ainsi, l’activation de l’expression des gènes codant pour l’IFN de type I et l’inhibition
concomitante de ceux responsables de la synthèse d’IL-1 lors de l’infection par M. bovis
suggère que la modification de l’expression génique est aussi impliquée dans les différentes
stratégies d’échappement au système immunitaire. (46)
La figure 13 regroupe l’ensemble des mécanismes mis en œuvre par les mycobactéries
pour échapper au système immunitaire développés jusqu’à présent.
- 57 -
Figure 14 : Schéma récapitulatif des principaux mécanismes d’échappement au système
immunitaire mis en œuvre par les mycobactéries (d’après (55))
Il est parfois difficile de démontrer la virulence d’un gène, en particulier car cette
démonstration nécessite l’accomplissement des postulats moléculaires de Koch correspondant
à quatre étapes distinctes. Tout d’abord, il est nécessaire de montrer que ce gène, codant pour
l’expression d’un facteur de virulence ou régulant sa production ou son exportation, est actif
chez les souches virulentes. Deuxièmement, l’agent pathogène doit perdre sa virulence
lorsque ce gène est inactivé. Troisièmement, l’introduction de ce gène cloné dans une souche
avirulente doit lui rendre sa virulence. Quatrièmement, ce gène doit être exprimé au moment
de l’infection. Il est pourtant parfois difficile de satisfaire toutes ces exigences dans certains
cas. Par exemple, lorsque les mutations de quelques gènes séparés ont les mêmes effets sur la
virulence, il peut être difficile d'identifier lesquels contribuent le plus à cette dernière. En
effet, dans ce cas de figure, la complémentation avec un seul gène ne restaurera le plus
souvent pas la virulence car la mutation produite dans un gène peut avoir des effets polaires
sur les gènes voisins, provoquant ainsi un arrêt ou une diminution de leur transcription. (47)
- 58 -
ii) Le locus RD1
RD1 est la région de différence la plus critique dans la virulence des souches
pathogènes. RD1 comprend 9 ORF (Rv3871 à Rv3879) dans un segment long de 9454 pb, et
est absent de toutes les souches BCG. (61) Il contient des gènes codant pour l’appareil de
sécrétion ESX-1 (ESAT-6 secretion system 1) responsable de l’exportation de deux puissants
antigènes et facteurs de virulence : CFP-10 (Culture Filtrate Protein 10 kDa) et ESAT-6
(Early Secretory Antigenic Target 6 kDa). (46) La suppression de RD1 à partir de souches
virulentes de M. tuberculosis conduit à une diminution de leur croissance ainsi qu’à
l'atténuation de leur virulence in vivo, entraînant une pathogénie de la maladie similaire à celle
du BCG. (61)
Les gènes Rv3874 et Rv3875 font partie du même opéron et codent respectivement
pour les protéines CFP-10 et ESAT-6 respectivement. Elles forment ensuite un hétérodimère
sous l’effet de la protéine ATP dépendante, ayant une activité chaperonne, codée par le gène
Rv3868. Les mycobactéries possédant des altérations de leur système d’excrétion d’ESAT-6 et
de CFP-10 présentent des défauts de croissance et une virulence altérée chez leur hôte. Elles
ne parviennent pas non plus à se reproduire dans les macrophages infectés in vitro et ne
peuvent pas bloquer les réponses inflammatoires induites au sein de ces derniers. Ainsi, cela
suggère que le système de sécrétion ESX-1 joue un rôle important dans la subversion des
réponses immunitaires réalisées par les macrophages. (61)
Les flèches montrent la direction transcriptionnelle des gènes. Les loci des gènes Rv3874 et 3875
codent respectivement pour CFP-10 et ESAT-6.
- 59 -
b) Rôle du dimère ESAT-6/CFP-10 dans les interactions avec l’hôte
Les molécules codées par RD1 jouent divers rôles dans la pathogénie de la
tuberculose, notamment dans la formation de granulomes, l'inhibition de la maturation du
phagosome et la migration des bactéries du phagosome vers le cytosol. Elles sont aussi
capables d’inhiber la production de ROS, qui ne peuvent donc pas activer le facteur de
transcription NF-κB responsable de la sécrétion de cytokines intervenant dans l’activation des
cellules immunitaires telles que les cellules dendritiques et les lymphocytes T. La protéine
ESAT-6 est aussi capable d’interagir avec les récepteurs TLR 2 intervenant dans l’expression
des molécules composant le CMH de type II. Par conséquent, elle interfère avec la
présentation des antigènes mycobactériens aux cellules T CD4. (61)
Les micro-ARN sont des régulateurs endogènes de l’expression des gènes. Ce sont de
petits ARN non codants de 18 à 25 nucléotides capables bloquer la traduction de leurs ARN
messagers cibles. Les micro-ARN régulent la différenciation et l’activation des monocytes et
des granulocytes et sont impliqués dans les réponses inflammatoires et la régulation de
l’immunité innée et acquise. Il a été clairement démontré que M. bovis activait la production
du micro-ARN miR29 par le biais de la protéine ESAT-6, inhibant ainsi la sécrétion d’IFN-γ
chez la souris. De même, la production de miR146a est activée dans les cellules dendritiques
par M. bovis. Ce micro-ARN est capable de supprimer l’activité du facteur de transcription
NF-κB et ainsi d’inhiber la synthèse de plusieurs cytokines telles que l’IL-6, l’IL-8, l’IL-1 et
le TNF-α. Or les animaux déficients en IL-6 sont hyper sensibles à l’infection par les bacilles
tuberculeux. Plusieurs micro-ARN contrôlant la production d’IL-6, comme par exemple
miR155, voient leur production régulée par ESAT-6. Ce mécanisme apparaît donc comme une
stratégie de survie supplémentaire développée par les mycobactéries tuberculeuses. (61)
- 60 -
Tableau V : Liste des principaux facteurs de virulence des mycobactéries tuberculeuses
(d’après (48))
- 61 -
D) Réponses immunitaires associées
Figure 16 : Représentation schématique des réponses immunitaires chez les bovins suite
à une infection par M. bovis (27)
Comme nous pouvons le voir sur la figure 15, les réponses immunitaires à médiation
cellulaire (CMI) se développent dès le début de l’infection. La production des anticorps
humoraux n’apparaît que tardivement, de manière presque concomitante avec l’apparition des
signes cliniques et l’augmentation de la charge bactérienne (de gauche à droite sur la figure
15). (27)
Nous avons vu que les lymphocytes T CD4 jouent un rôle majeur dans la résistance de
l’hôte contre la tuberculose en reconnaissant les antigènes protéiques présentés par les CMH
de type II. Les cellules responsables de la réponse immunitaire Th1 cellulaire produisent de
l’IFN-γ et du TNF-α, alors que les cellules Th2 responsables de l’immunité humorale
secrètent de l’IL-4, de l’IL-5 et de l’IL-13. Expérimentalement, des souris dépourvues d’IFN-
γ présentent une sensibilité accrue à la tuberculose tandis que celles ne produisant pas d’IL-4
y sont plus résistantes.
- 62 -
Un moyen efficace de prévenir l’apparition de la maladie consisterait donc à moduler la
production de certaines interleukines de la réponse immunitaire humorale comme l’IL-4 pour
promouvoir une réponse immunitaire cellulaire. (61) La réponse immunitaire humorale
semble néanmoins impliquée dans le contrôle de la maladie. Expérimentalement, les souris
déficientes en cellules B, et donc en anticorps, présentent une charge bactérienne plus élevée
et des lésions pulmonaires exacerbées par rapport aux autres. De même, l’immunisation
passive de souris grâce au sérum d’individus traités avec des extraits de M. tuberculosis
permet une diminution du nombre de bacilles dans les poumons et une baisse de l’étendue de
l’infiltration granulomateuse. Les mycobactéries opsonisées par des anticorps sont plus
efficacement internalisées et tuées par les macrophages, et l'apprêtement de l’antigène est
facilité. Il est intéressant de noter que bien que la production d’anticorps soit généralement
associée à un décalage vers une réponse de type Th2, les anticorps produits suite à
l’exposition au BCG activeraient la production d’IFN-γ dans les LT CD4 et LT CD8
spécifiques des mycobactéries, favorisant ainsi une réponse immunitaire de type Th1. (48)
- 63 -
L’hypersensibilité tuberculinique correspond à une réaction inflammatoire cutanée
caractérisée par une tuméfaction ferme et rouge de la peau apparaissant en 48 à 72 heures.
Cette réaction peut être distinguée d’un œdème par l’absence du signe du godet.
L’hypersensibilité tuberculinique intervient lors de l’injection intradermique de tuberculine
chez un individu infecté par des mycobactéries tuberculeuses (et donc préalablement
sensibilisé à leurs antigènes). La tuberculine contient un ensemble de molécules extraites à
partir d’un filtrat de bacilles tuberculeux, regroupé sous le nom de dérivé protéique purifié
(PPD pour Purified Protein Derivative). L’intradermotuberculination sera développée dans la
partie 3 de cette thèse.
La réaction d’HSR se déroule en trois phases. Dans un premier temps, la phase ante-
allergique, d’une durée de 15 jours à 6 mois, correspond au délai entre la pénétration de M.
bovis dans l’organisme et l’apparition de l’HSR. Durant cette période,
l’intradermotuberculination ne permet pas de dépister les individus infectés. Ensuite, la
période allergique se développe en deux à quatre semaines et peut persister pendant quelques
semaines à plusieurs années. L’intensité de l’allergie peut fluctuer en fonction de plusieurs
facteurs d’ordre physiologique (âge, proximité du part pour les femelles gestantes),
pathologique (maladie intercurrente) ou thérapeutique (immunosuppresseurs). Ainsi, certains
individus en période d’allergie peuvent présenter une HSR insuffisante pour être détectée par
intradermotuberculination. La troisième phase de l’HSR correspond à une période dite
d’anergie au cours de laquelle il n’est plus possible de détecter la tuberculose par une méthode
se basant sur l’allergie. Les sujets infectés à un stade avancé de la maladie échappent donc
aux méthodes classiques de dépistage. (3)
3) Le phénomène d’anergie
Dans certains cas, lorsque la maladie est assez avancée, et éventuellement disséminée,
une anergie du système immunitaire peut se mettre en place. Dans ces conditions, aucune
réponse immunitaire cellulaire n’est détectable chez les individus infectés, notamment avec
les tests cutanés. Ils peuvent en revanche posséder un taux d’anticorps circulants élevé. Chez
l’Homme, l’anergie est assez répandue, et le test cutané est négatif chez 25 % des patients
atteints de la maladie active. Le mécanisme de l’anergie liée aux bacilles tuberculeux n’est
pas encore clairement défini. Dans le cas de la tuberculose humaine, les monocytes pourraient
avoir un effet inhibiteur sur les lymphocytes T spécifiques des antigènes mycobactériens. Ces
derniers pourraient ainsi se mettre à produire de l’IL-10 en absence de d’IFN-γ, induisant
alors une anergie du système immunitaire. (27) La présence d’affections concomitantes à la
tuberculose peut aussi expliquer cette d’anergie. C’est le cas notamment pour plusieurs
infections bactériennes ou virales (comme le SIDA, la mononucléose ou la grippe…), ou
encore pour certaines hémopathies malignes. Une anergie iatrogène provoquée par un
traitement immunosuppresseur, une corticothérapie au long cours ou encore une
chimiothérapie anticancéreuse est aussi possible. (67)
- 64 -
E) Le phénomène de latence
Dans l’espèce humaine, nous avons vu que l’immunité initiale permettait de contrôler
l’infection chez 90 % des individus immunocompétents. En effet, les macrophages activés et
les lymphocytes T CD4 spécifiques parviennent le plus souvent à éliminer la bactérie ou à
inhiber sa multiplication et conduire à une tuberculose latente. En l’absence de maladie
progressive, un individu infecté peut dans ce dernier cas rester asymptomatique pendant des
années. Environ 10 % des personnes chez lesquelles l’infection est latente développent une
tuberculose secondaire à un moment de leur vie. Elles représentent jusqu’à 80 % des formes
cliniques dans les pays développés. Une réactivation ou une tuberculose secondaire pourraient
être induites par toute condition affectant le système immunitaire, comme l’infection par le
VIH ou d’autres agents pathogènes, une prise de médicaments immunosuppresseurs ou encore
une dégradation de l’état général due à la vieillesse ou à une malnutrition. Les modalités
exactes de la réactivation ne sont pas encore connues. Deux hypothèses principales semblent
se détacher : soit la réactivation viendrait d’une reprise de la prolifération des bacilles
« latents », soit elle serait due à une réinfection ou à la remise en circulation de bacilles
provenant de sites éloignés de la lésion primaire car les malades restent porteurs de bacilles
tuberculeux, même après une guérison clinique. (48)
- 65 -
II) Les différentes évolutions du complexe primaire et les lésions associées
1) La progression de l’infection
- 66 -
Au cours de la période de surinfection, les défenses immunitaires de l’hôte peuvent
être plus ou moins altérées. Lorsque ces dernières sont complètement abolies suite à un
affaiblissement général, une généralisation tardive peut se développer. Elle se traduit soit par
une tuberculose miliaire aiguë de surinfection, soit par une tuberculose caséeuse de
surinfection caractérisée par la nécrose caséeuse de plusieurs organes. Ces deux formes
peuvent elles aussi se stabiliser définitivement ou se réactiver par la suite. Lorsque les
défenses immunitaires de l’hôte sont efficaces, une tuberculose chronique d’organe peut
néanmoins se développer. Elle apparaît à la faveur de contacts répétés avec des bacilles
provenant des lésions de primo-infection (surinfection endogène) ou du milieu extérieur, au
contact d’individus infectés par exemple (surinfection exogène). La tuberculose chronique
d’organe se développe par propagation via les voies canaliculaires (bronches, voies biliaires,
etc.) ou lymphatiques d’un organe porteur d’une lésion initiale. Elle peut faire suite au
complexe primaire ou à une tuberculose de généralisation progressive et peut se stabiliser ou
encore évoluer en une forme de généralisation tardive. (6) Les différentes voies d’évolution
du complexe primaire (Fig. 17) ont déjà été proposées par Nieberle dans un rapport au
Congrès vétérinaire international de Zurich en 1938. (68)
2) La tuberculose miliaire
- 67 -
Dans plus de 90 % des cas, la tuberculose miliaire concerne l’ensemble du corps. Elle
peut néanmoins rester cantonnée à un seul organe dans environ cinq cas sur cent. Malgré la
grande quantité de lésions disséminées, jusqu’à 50 % des cas ne sont pas diagnostiqués de
manière ante-mortem. La forte ressemblance clinique entre la tuberculose miliaire et d’autres
maladies comme les pneumonies virales ou bactériennes permet d’expliquer les difficultés à
établir son diagnostic. (69)
A : Examen du fond d’œil mettant en évidence la présence de tubercules choroïdiens dans le pôle
postérieur de l’orbite (Homme) (71) ; B : Enfant présentant des lésions cutanées de tuberculose
miliaire (71)
La mortalité associée à la tuberculose miliaire est proche de 100 % si elle n’est pas
traitée, contre moins de 10 % avec un traitement précoce et approprié. Le taux de rechute est
faible (de l’ordre de 0 à 4%) avec la bonne observance d’une thérapie adaptée. La plupart des
rechutes surviennent au cours des 24 premiers mois suivant la fin de la thérapie. (69)
- 68 -
3) Les autres formes de généralisation
Les autres localisations des lésions de tuberculose généralisée seront développées dans
la partie II.C., car les organes atteints peuvent l’être dans le cadre d’une généralisation ou
d’une tuberculose chronique d’organe.
- 69 -
B) Tuberculose pulmonaire et tableau clinique général
Chez certains animaux, l’existence d’une bonne immunité à médiation cellulaire peut
prévenir l’extension des lésions pulmonaires à d’autres organes. Cependant, la réponse
immunitaire systémique, qui agit par l’intermédiaire du sang et des compartiments
lymphatiques, est habituellement incapable d’arrêter la propagation de l’infection par les
voies anatomiques pré-existantes dans des organes, comme les voies respiratoires inférieures.
Ainsi, les lésions tissulaires peuvent progresser avec le temps à partir du site d’infection
initial. On entre alors dans le cadre d’une tuberculose chronique d’organe. Chez les bovins et
les humains, ces lésions chroniques ont souvent pour origine les poumons ou les nœuds
lymphatiques médiastinaux, la voie de pénétration des bacilles tuberculeux étant
essentiellement respiratoire. (49) Néanmoins, nous avons vu que les poumons pouvaient aussi
être atteints par des lésions de tuberculose lors d’une généralisation primaire et tardive.
- 70 -
Les poumons sont les organes les plus fréquemment atteints par la tuberculose. Chez
les bovins adultes, ils sont affectés dans 90 à 95 % des cas. (6) La tuberculose pulmonaire
découle le plus souvent de la réactivation et de la propagation de bacilles à partir d’une lésion
primaire suite à une diminution des défenses immunitaires ou du passage de mycobactéries
dans le compartiment sanguin. Les lésions de tuberculose surviennent alors essentiellement
dans les lobes pulmonaires crâniaux car la croissance des mycobactéries y est favorisée par
une pression partielle en dioxygène plus élevée. Les lobes médians et caudaux des poumons
peuvent néanmoins être impliqués suite à la progression d’une lésion primaire. (73)
Les tubercules constituent la lésion initiale. Ils peuvent ensuite s’enkyster dans une
capsule scléreuse ou s’abcéder. La coalescence et la propagation des foyers de tuberculose
pulmonaire entraînent le développement de grandes zones de pneumonie tuberculeuse. (6)
L’infection se propage par les voies aériennes en affectant des groupes alvéolaires contigus
partageant les mêmes ramifications bronchiques. La zone affectée présente alors une nette
délimitation avec la zone saine en respectant l’architecture des septa lobulaires. (Fig. 21, A) À
ce stade, des ulcères des bronches et de la trachée peuvent aussi se former mais la
minéralisation reste quant à elle peu développée. De même, les ganglions lymphatiques
affectés peuvent être sévèrement hypertrophiés. Leur centre est alors caséeux, granulomateux
et entouré de trabécules irrégulières constituées de tissu fibreux. (49)
- 71 -
Des lésions cavitaires à l’intérieur du lobe pulmonaire infecté initialement peuvent
aussi se développer au fur et à mesure. La progression des lésions au sein des poumons
aboutit à leur caséification puis à leur liquéfaction. On parle alors de foyer de ramollissement.
(Fig. 21, B) Lors de la toux, le matériel liquide peut être expectoré, laissant place à une cavité
remplie d’air. (Fig. 22) Les bacilles peuvent ensuite se multiplier rapidement dans cette cavité
et envahir de nouvelles zones pulmonaires. Les lésions peuvent être disséminées ou
regroupées et former une pneumonie tuberculeuse entraînant l’apparition de nouvelles cavités.
La formation d’un pneumothorax spontané peut survenir suite à un passage d’air dans
l’espace pleural lors de la rupture d’une cavité tuberculeuse ou d’un foyer caséeux sous-
pleural. Du matériel caséeux et des bacilles peuvent aussi se retrouver dans l’espace pleural et
occasionnellement y former un empyème si la charge bactérienne est très élevée. (73)
2) Tableau clinique
- 72 -
Tableau VII : Symptômes de la tuberculose pulmonaire chez l’Homme (d’après (73))
La tuberculose peut affecter une grande variété d’organes. Ces derniers peuvent être
atteints dans le cadre d’une généralisation primaire ou tardive, suite à un passage systémique
de M. bovis, ou encore dans le cadre d’une tuberculose chronique d’organe. Les différentes
localisations des lésions de tuberculose peuvent toutes être retrouvées chez l’Homme et les
bovins. Néanmoins, elles sont souvent beaucoup plus décrites dans l’espèce humaine car les
mesures de détection de la maladie et d’abattage des animaux atteints empêchent le
développement de lésions dans certains organes. (76)
1) La tuberculose ganglionnaire
- 73 -
Figure 23 : Lésions macroscopiques de tuberculose ganglionnaire
A, B : Ganglions d’un même groupe adhérents entre eux lors d’une lymphadénite tuberculeuse
(Homme) (70) ; C : Tubercules dans un ganglion lymphatique médiastinal (Bovin) (Photographie :
DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; D : Lymphadénite
tuberculeuse cervicale avec formation d’abcès (Homme) (79) ; E : Lymphadénite tuberculeuse
cervicale avec formation d’abcès (Kudu) (80)
Jones et Campbell ont défini en 1962 cinq étapes pour décrire l’évolution de l’aspect
des ganglions périphériques affectés par la tuberculose. (81)
Tableau VIII : Étapes de l‘évolution de l’aspect des ganglions périphériques affectés par
la tuberculose selon Jones et Campbell (d’après (81))
Les signes cliniques sont variables en fonction des ganglions impliqués. L’apparition
de masses indolores en région cervicale ou supra-claviculaire est assez courante. Une
fistulisation peut aussi être observée dans 10 % des cas de lymphadénite mycobactérienne
cervicale. La lymphadénite tuberculeuse médiastinale peut provoquer une compression des
vaisseaux sanguins ou des nerfs laryngé récurent et phrénique, ou encore causer une érosion
des bronches et donc induire des signes cliniques variés. Les symptômes peuvent évoluer
pendant quelques semaines à plusieurs mois avant l’établissement d’un diagnostic. (77)
- 74 -
2) La tuberculose cutanée
La tuberculose cutanée chez les bovins est assez peu décrite dans la littérature car elle
n’est que très rarement rencontrée. (82) Cliniquement, elle se présente sous la forme de
lésions chroniques indurées de la peau au niveau des membres ou de nodules en regard des
ganglions lymphatiques. (83)
M. bovis peut pénétrer dans la peau à la faveur d’une plaie ou d’une abrasion. Ces lésions
surviennent le plus souvent sur les surfaces exposées comme le visage et les membres. (73)
a) Le chancre tuberculeux
- 75 -
b) La tuberculose verruqueuse
a) Le scrofuloderme
b) La tuberculose orificielle
La tuberculose éruptive peut avoir plusieurs présentations cliniques. Ces formes sont
paucibacillaires et peuvent concerner soit l’hypoderme (comme l’érythème induré de Bazin et
l’érythème noueux), soit l’épiderme et le derme (comme le lichen scrofulosorum et les
tuberculides). (85)
- 76 -
Figure 24 : Différentes formes de tuberculose cutanée (d’après (85))
La tuberculose du système nerveux central est rare chez les bovins. Elle se traduit
majoritairement par une méningite, affectant plus fréquemment les méninges crâniennes que
vertébrales. L’implication des méninges se fait essentiellement par voie hématogène. Les
lésions primaires apparaissent généralement dans les méninges basilaires, puis s’étendent
ensuite par l’espace sous-arachnoïdien aux plexus choroïdes et aux ventricules. Dans une
certaine limite, l’infection peut aussi se propager par les espaces de Virchow-Robin dans le
parenchyme cérébral. L’implication des méninges vertébrales peut quant à elle se faire par
voie hématogène ou à partir d’une ostéomyélite vertébrale. Les lésions du système nerveux
central sont semblables à celles des membranes séreuses mais plus exsudatives et nécrosantes.
De nombreux nodules de deux à 15 millimètres de diamètre peuvent être retrouvés, ainsi
qu’un exsudat fibrineux et opaque (Fig. 25, A). La formation de quelques granulomes reste
néanmoins possible. (86)
Chez l’Homme, l’atteinte du système nerveux central se fait, comme pour les bovins,
par voie hématogène. Plusieurs petits foyers de tuberculose peuvent se développer dans le
cerveau, la moelle épinière ou encore dans les méninges. L’emplacement exact de ces foyers
ainsi que les capacités de l’hôte à contrôler leur évolution déterminent la forme finale que
prendra la tuberculose du système nerveux central. Cette dernière se manifestera
principalement comme une méningite tuberculeuse et moins souvent comme une encéphalite,
un tuberculome intracrânien ou un abcès cérébral. (87)
- 77 -
L’inflammation des méninges est particulièrement importante à la base du cerveau
(Fig. 25, B) où elle peut faire barrage au flux de liquide cérébro-spinal et ainsi induire la
formation d’une hydrocéphalie. En l’absence de traitement, la pression intracrânienne risque
par la suite d’augmenter, induisant des lésions cérébrales. (73) La complication la plus grave
de la méningite tuberculeuse est le développement d’une vascularite au niveau du polygone de
Willis, de l’artère vertébro-basilaire ou des branches perforantes de l’artère cérébrale
moyenne. Cette dernière peut induire une ischémie dans les territoires desservis par ces
vaisseaux et donc être à l’origine de lésions nerveuses. (87)
4) La tuberculose ostéo-articulaire
Les os et les articulations peuvent être atteints par la tuberculose lors d’une
généralisation précoce ou tardive. Chez les bovins, les vertèbres, les côtes et les os plats du
bassin sont les plus fréquemment impliqués. Une caséification étendue suivie d’une
liquéfaction peuvent s’y développer, et l’exsudat en résultant peut ensuite s’écouler dans la
corticale des os affectés. Le cartilage articulaire peut être atteint de la même façon, entraînant
son érosion puis le développement consécutif d’une arthrite tuberculeuse. (6)
- 78 -
Chez l’Homme, la plupart des atteintes osseuses ou articulaires liées à la tuberculose
se développent dans les trois ans suivant l’infection initiale, même si elles peuvent survenir
plus tardivement. Tous les os ou articulations peuvent être impliqués. Cependant, la colonne
vertébrale est la plus fréquemment affectée. Ensuite, par ordre de fréquence décroissante,
l’articulation de la hanche, celle du genou, puis les os du pied, du bras et de la main peuvent
être affectés. Les gonflements articulaires apparaissent lentement sans engendrer de douleur
ou d’inflammation exacerbées. (73)
- 79 -
5) La tuberculose de l’abdomen
La tuberculose viscérale ne concernant qu’un seul organe de manière isolée est assez
rare. L’appareil urogénital est le plus couramment impliqué, suivi du foie, de la rate et du
pancréas. (90) Les lésions de tuberculose hépatique peuvent avoir l’aspect de multiples foyers
caséeux gris à jaunâtres, ou de masses volumineuses constituées d’une coque de tissu sclérosé
remplie de pus épais, caséeux et grumeleux. La présence de ces lésions conduisent soit à la
destruction du parenchyme hépatique, soit à la dissémination des bacilles par les veines porte
et hépatique ou suite à une rupture des voies biliaires. La rate peut aussi présenter de multiples
petits abcès de taille variable, disséminés dans toute l’épaisseur de l’organe. (6)
- 80 -
Figure 27 : Lésions macroscopiques de tuberculose abdominale
A : Foyer de nécrose caséeuse tuberculeuse dans un foie (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service
de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; B : Tuberculose intestinale (Bovin)
(Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; C :
Multiples tubercules spléniques (Homme) (70) ; D : Tuberculose intestinale (Homme) (70)
Chez les bovins, les organes génitaux comme les testicules, le pénis ou la gaine
vaginale peuvent être atteints par des lésions de tuberculose suite à une dissémination
hématogène. Elles se traduisent par la présence de multiples nodules dans les espaces
lymphatiques sous-séreux ou sous-muqueux. Les lésions sont parfois très étendues dans le cas
de l’ovaire, qui apparaît alors volumineux, bosselé et parsemé d’amas caséocalcaires à
purulents. Les trompes utérines sont alors souvent envahies par de multiples petits granulomes
gris à blanchâtres. L’utérus peut être infecté par dissémination hématogène mais aussi par voie
génitale ou lors de l’extension d’une péritonite tuberculeuse. De même, un envahissement du
rein par des tubercules miliaires est possible et leur accumulation aboutit souvent à la
formation de volumineuses cavités contenant du matériel caséocalcaire. (6)
- 81 -
Les testicules et l’épididyme peuvent être affectés dans le cadre d’une dissémination
hématogène des bacilles tuberculeux, induisant une augmentation progressive et indolore de
leur taille. Comme chez les bovins, le développement de tubercules dans l’utérus à la faveur
d’une dissémination sanguine ou suite à la rupture d’un ganglion lymphatique mésentérique
est possible. (73)
A : Volumineux nodules caséeux envahissant deux lobules adjacents du rein avec adénite caséeuse du
ganglion lymphatique rénal (Bovin) (6); B : Tuberculose rénale (Homme) (70) ; C : Tuberculose de la
vessie (Homme) (70) ; D : Épididymite et orchite tuberculeuses (Homme) (70)
6) La tuberculose oculaire
La tuberculose oculaire est définie comme l’infection de l’œil ou de sa surface par des
bacilles tuberculeux, et constitue un défi diagnostique en raison de son large éventail de
présentations cliniques. La tuberculose oculaire est soit primaire, lorsque l’œil représente la
voie d’entrée des mycobactéries, soit secondaire à une dissémination hématogène. La maladie
primaire est rare et occasionne des lésions des paupières, de la conjonctive, de la cornée et de
la sclère. En revanche, une atteinte secondaire touchera plutôt le tractus uvéal, la rétine et le
nerf optique. (91)
- 82 -
L’uvéite postérieure est la présentation la plus commune de tuberculose intra-oculaire,
avec des lésions affectant principalement la choroïde. Ces lésions peuvent être de nature
variée : choroïdite focale ou multifocale, nodules ou granulomes choroïdaux... Des abcès
sous-rétiniens ou une vascularite rétinienne sont aussi parfois retrouvés et peuvent conduire à
une rétinopathie vasculaire. L’uvéite tuberculeuse antérieure évolue quant à elle de manière
insidieuse et se présente comme une maladie granulomateuse chronique. Elle se manifeste
sous la forme d’une inflammation granulomateuse de la membrane de Descemet, parfois
associée à des nodules ou des granulomes au niveau de l’iris. Le développement de synéchies
irido-cristalliniennes et d’une cataracte est une complication assez classique de l’uvéite
tuberculeuse antérieure. (91) Une panophtalmie tuberculeuse peut aussi se développer, avec
formation d’un abcès détruisant l’œil dans son ensemble. L’énucléation est éventuellement
nécessaire lors d’une telle atteinte. (73)
Chez les bovins, on observe couramment un envahissement de l’iris et de la choroïde
par des masses caséeuses enveloppées de tissu fibreux lors de tuberculose oculaire. (6)
La tuberculose de la mamelle est très fréquente chez les bovins. L’infection se fait
généralement par voie hématogène et peut induire une tuméfaction. La tuberculose de la
mamelle peut être présente dans le cadre d’une tuberculose miliaire disséminée, d’une
infection chronique ou d’une mammite tuberculeuse. La tuberculose chronique de la mamelle
est la forme la plus fréquente. Elle se caractérise par le développement de gros nodules très
fermes dans sa partie profonde. Les ganglions lymphatiques sont alors rarement impliqués. La
forme miliaire disséminée a le même aspect que celle des autres organes, avec de multiples
tubercules subissant une nécrose caséeuse et une calcification précoce. Les ganglions
lymphatiques supra-mammaires sont systématiquement affectés et contiennent un nombre
varié de tubercules présentant une caséification et une calcification centrales. Lors d’une
mammite tuberculeuse, de grandes zones irrégulières de tissu nécrotique caséeux jaunâtre et
sec se développent. Un exsudat fibrineux contenant de nombreux leucocytes est présent dans
les zones de nécrose. (6) Même si une induration sévère de la mamelle (mamelle « de bois »)
permet de soupçonner la présence de tuberculose, il est difficile de distinguer cliniquement
une mammite tuberculeuse de celles imputables à d’autres germes. L’infection de la mamelle
présente donc un risque de propagation de la maladie si le lait infecté n’est pas bouilli ou
pasteurisé avant sa consommation. (74)
- 83 -
Nous avons pu voir que lors de l’infection par M. bovis, un complexe primaire
conduisant à la formation d’un granulome caractéristique de la tuberculose se mettait en
place. Ce phénomène s’explique par la capacité des mycobactéries tuberculeuses à infecter et
à se multiplier au sein des macrophages par le biais de plusieurs mécanismes d’échappement
au système immunitaire. La réponse immunitaire de l’hôte est essentiellement cellulaire, et la
persistance des mycobactéries dans l’organisme induit une réponse d’hypersensibilité retardée
expliquant la formation de granulomes. Nous avons ensuite étudié les différentes évolutions
possibles de la maladie à partir du complexe primaire. Ainsi, une tuberculose chronique
d’organe, une généralisation précoce ou tardive, ou encore une stabilisation de ces formes
sont toutes envisageables et dépendent de facteurs individuels et environnementaux. Nous
avons constaté que les poumons représentent la localisation préférentielle de la tuberculose,
mais que tous les organes pouvaient être atteints par dissémination hématogène, par extension
des lésions aux organes adjacents ou parfois lors d’une contamination primaire. Nous allons
maintenant aborder les différentes méthodes de dépistage et de diagnostic de la tuberculose à
M. bovis. Nous nous pencherons d’abord sur l’ensemble des éléments cliniques et lésionnels
permettant d’émettre l’hypothèse de tuberculose. Nous nous intéresserons ensuite aux
différentes méthodes de dépistage et de diagnostic utilisées pour rechercher la présence de
cette maladie. Enfin, nous étudierons les différentes alternatives prophylactiques et
thérapeutiques pouvant être mises en œuvre à l’heure actuelle pour lutter contre la
tuberculose.
- 84 -
TROISIÈME PARTIE :
LES MÉTHODES DE
DIAGNOSTIC ET DE DÉPISTAGE
- 85 -
- 86 -
I) Diagnostic clinique et lésionnel
A) Diagnostic clinique
- 87 -
La tuberculose constitue ainsi un véritable défi diagnostique. De nombreux éléments
épidémiologiques doivent aussi être pris en compte dans la démarche, comme par exemple
l’évaluation des probabilités d’exposition et les facteurs de risque. (93) Étant donné la
fréquence des infections inapparentes (10 à 15 % des sujets porteurs de tuberculose (95)) et le
manque de spécificité des signes cliniques, il est généralement nécessaire d’associer au
diagnostic clinique l’étude des lésions macroscopiques lorsque cela est possible, ou de réaliser
plusieurs examens complémentaires. (6)
Nous avons déjà vu que le diagnostic clinique de la tuberculose est très difficile à
établir, les symptômes étant variés et peu spécifiques. Le diagnostic différentiel se fait
essentiellement avec les maladies respiratoires. Chez les bovins, elles sont généralement
d’origine virale (Herpèsvirus Bovin de type 1, Virus Respiratoire Syncytial bovin,
ParaInfluenza 3, Adénovirus, Bovine Viral Diarrhea), bactérienne (Pasteurella multocida,
Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis, Histophilus somni), fongique (Aspergillus sp.)
ou encore parasitaire (strongles pulmonaires). Ces agents pathogènes peuvent agir isolément
ou en interaction les uns avec les autres. (96) D’autres affections peuvent entrer dans le
diagnostic différentiel de la tuberculose chez les bovins. C’est le cas par exemple de la
theilériose bovine (ou fièvre de la côte orientale) causée par Theileria parva. Ce protozoaire
entraîne l’apparition d’une adénopathie hypertrophique, d’une anorexie et d’une dyspnée
rappelant les signes cliniques de la tuberculose pulmonaire. De même, la réticulo-péricardite
traumatique par corps étranger ou la péripneumonie contagieuse bovine due à Mycoplasma
mycoides peuvent aussi provoquer une dyspnée, couramment retrouvée lors de tuberculose
pulmonaire. (97) L’ensemble des maladies d’évolution chronique entraînant une altération de
l’état général, telles que la leucose bovine enzootique ou la paratuberculose (due à M.
paratuberculosis), sont aussi à prendre en compte lors d’une suspicion clinique de
tuberculose. (96)
Chez l’Homme, le diagnostic différentiel clinique se fait aussi essentiellement avec les
affections respiratoires. Lorsque les symptômes évoluent depuis plus de trois semaines, le
diagnostic différentiel doit prendre en compte les maladies respiratoires chroniques telles que
la bronchectasie en période de surinfection (pouvant s’accompagner d’expectorations
mucopurulentes abondantes), la bronchite chronique ou les bronchopathies chroniques
obstructives, ou encore l’asthme (se présentant comme des épisodes récidivants de dyspnée
avec sibilants). D’autres affections plus rares peuvent être évoquées dans le cadre du
diagnostic différentiel comme un rétrécissement mitral, s’accompagnant d’accès dyspnéiques
et d’hémoptysie, ou une insuffisance cardiaque accompagnée de dyspnée et de râles
pulmonaires disséminés. Lorsque les symptômes évoluent depuis moins de trois semaines,
l’hypothèse de tuberculose est moins probable. On retrouve alors plus souvent des trachéites,
bronchites et pneumonies bactériennes ou virales rétrocédant avec un traitement antipyrétique,
anti-inflammatoire et antitussif, associé à l’utilisation d’un antibiotique lorsqu’une origine
bactérienne est suspectée. (98)
- 88 -
B) Diagnostic anatomopathologique
L’anatomie pathologique permet d’étudier les tissus et organes présentant des lésions
évocatrices de tuberculose, grâce à des prélèvements obtenus par biopsie ou dans le cadre
d’une autopsie chez l’Homme, et à l’abattoir dans le cas des bovins. Le diagnostic
anatomopathologique comprend une étude macroscopique des lésions pouvant évoquer la
tuberculose puis un examen histologique des prélèvements. (98)
Les modalités d’inspection des carcasses bovines sont décrites dans l’annexe I, section
IV, chapitre I du règlement n°854/2004 du Parlement Européen et du Conseil du 29 avril 2004
(Annexe 1 de cette thèse). Ce référentiel impose notamment un examen visuel des poumons,
de la tête, du tractus gastro-intestinal, du foie, de la rate et des reins. Il est également
obligatoire de procéder systématiquement à l’observation de tous les ganglions lymphatiques
des organes dits « porte d’entrée » (Tableau XI) en réalisant des coupes multiples permettant
de détecter des lésions de petite taille. (99)
Organes « porte
Ganglions lymphatiques associés
d’entrée »
Tête Ganglions sous-maxillaires (mandibulaires) et rétro-pharyngiens
Poumons Ganglions trachéo-bronchiques et médiastinaux
Tractus digestif Ganglions gastriques et mésentériques
Foie Ganglions hépatiques et hépatiques accessoires
- 89 -
b) Les différentes lésions suspectes à l’abattoir
Tableau XII : Les différentes formes des lésions observées à l’abattoir (d’après (99))
Formes stabilisées
Tubercule caséo- Tubercules présentant un caséum sec, friable, crissant à la coupe à
Formes circonscrites
Tubercule gris
entouré d’un liseré congestif.
Il est de la taille d’un grain de mil, plus sombre que le tubercule
Tubercule miliaire gris, avec un centre comportant une nécrose de caséification de
couleur jaune.
Il est de la taille d’un petit pois avec un contenu pâteux,
Tubercule caséeux
homogène et ayant l’aspect et la consistance du mastic.
Elle peut concerner le parenchyme de nombreux organes ou tissus
Infiltration des
et se développe généralement à la faveur d’une baisse importante
parenchymes
des défenses immunitaires de l’animal.
Infiltration Elle correspond à une inflammation congestive, séro-
exsudative des hémorragique ou fibrineuse non spécifique. Cette forme demeure
grandes séreuses néanmoins rarement observée seule.
Formes de réveil et de surinfection
Il se développe à la faveur d’une baisse importante des défenses
immunitaires de l’animal. On observera d’abord une auréole
Foyer de congestive et hémorragique autour d’une lésion stabilisée, puis
ramollissement une ré-imbibition centripète du caséum qui était sec voire calcifié.
Le liquide peut alors rester sur place ou s’évacuer et laisser place
à une caverne tuberculeuse.
- 90 -
Les lésions de tuberculose sont le plus souvent discrètes et localisées au niveau des
ganglions lymphatiques associés aux organes « porte d’entrée ». Néanmoins, l’absence de
lésion au niveau de ces sites spécifiques ne permet pas d’exclure une infection par les
mycobactéries tuberculeuses. De plus, il est important de différencier les lésions stabilisées
des formes évolutives car cela conditionne le type de saisie réalisée suite à l’inspection post-
mortem. (99)
- 91 -
ii) Chez l’Homme
D’autres affections plus rares peuvent aussi évoquer des lésions de tuberculose comme
la lymphadénite caséeuse à Corynebacterium pseudotuberculosis, habituellement retrouvée
chez les petits ruminants. Cette maladie se caractérise par la formation d’abcès caséeux au
sein des ganglions lymphatiques et des organes, et peut ainsi avoir un aspect macroscopique
similaire à celui des lésions de tuberculose. (104)
- 92 -
ii) Chez l’Homme
3) Diagnostic histologique
Lors de la découverte de lésions suspectes, une analyse histologique peut être conduite
afin de conforter le diagnostic de tuberculose. L’atteinte d’un organe par M. bovis provoque
une inflammation locale se manifestant à l’histologie différemment selon le stade de la
maladie. Lors de la phase aiguë, ou exsudative, l’inflammation est fugace et non spécifique.
De nombreux macrophages sont observables au sein d’un exsudat séro-fibrineux. M. bovis
peut alors être mis en évidence à partir de ce foyer inflammatoire. En l’absence de nécrose
caséeuse, ces lésions sont susceptibles de régresser. (98)
- 93 -
Au cours de la phase subaiguë, ou cellulaire, les phospholipides présents dans la paroi
des bacilles lysés provoquent une réaction tissulaire spécifique à l’origine de la formation de
follicules de Koëster. Deux types de follicules peuvent se développer à ce stade. Le follicule
épithélio-gigantocellulaire correspond à un foyer constitué de nombreuses cellules
épithélioïdes, de quelques cellules géantes de Langhans et d’une couronne périphérique de
lymphocytes (décrit plus en détail dans la partie 2.I.A.2. de cette thèse). Ce follicule n’est pas
spécifique de la tuberculose car il est fréquemment retrouvé dans le cadre d’autres
granulomatoses comme la sarcoïdose chez l’Homme par exemple. Le follicule épithélio-
gigantofolliculaire possède quant à lui une structure similaire mais présente en plus une
nécrose caséeuse centrale très spécifique de la tuberculose. À l’histologie, cette nécrose a un
aspect éosinophile finement granuleux et anhiste, c’est à dire non organisé en tissu.
Lorsqu’elle est récente, on peut aussi y retrouver des débris nucléaires. (98)
- 94 -
C) Mise en évidence indirecte des lésions par les techniques d’imagerie
Lésion Description
Zones d’opacité tissulaire à limites nettes, de forme arrondie et de taille
Nodules
variable (de cinq millimètres à plus d’un centimètre)
Zones d’opacité tissulaire aux contours irréguliers dégradés en périphérie et
Infiltrations
de taille variable, parfois étendues à tout un lobe.
Zones d’hyperclarté souvent prolongées à leur pôle inférieur par des lignes
opaques parallèles dirigées vers le hile du poumon, correspondant à la
Cavités bronche de drainage. Un fond d’opacité liquidienne peut parfois être observé à
l’intérieur, correspondant à du caséum liquéfié. Les images de cavités sont les
plus évocatrices de tuberculose.
Les différentes lésions décrites dans le tableau XV sont couramment présentes lors
d’une tuberculose active et peuvent coexister chez le même malade. Lorsque la maladie
évolue, le processus de fibrose et de destruction du parenchyme pulmonaire peut conduire à la
rétraction des structures anatomiques adjacentes et entraîner une déviation de la trachée, la
rétraction de lobes pulmonaires ou encore une déformation et un déplacement de la silhouette
cardiaque. Les images radiographiques peuvent alors évoquer des séquelles de tuberculose,
avec la présence d’éléments d’opacité minérale correspondant à des nodules calcifiés ou
encore des zones d’opacité tissulaire correspondant à une fibrose cicatricielle. (98)
Néanmoins, aucune image radiographique ne permet d’établir le diagnostic de certitude car
diverses affections (pneumonies, sarcoïdose, etc.) peuvent produire de telles images. Il est
donc nécessaire d’effectuer des examens bactériologiques pour conclure.
La tuberculose peut impliquer une grande variété d’organes et donc se traduire par de
multiples signes aux différents examens d’imageries. Les techniques utilisables pour orienter
le diagnostic sont la radiographie (RX), l’échographie (US pour UltraSonography) et la
tomodensitométrie (CT pour Computed Tomography).
- 95 -
Pour l’examen des patients pédiatriques ou les femmes enceintes, chez qui les rayonnements
doivent être évités, l’imagerie à résonance magnétique (IRM) peut également être indiquée à
la place de la tomodensitométrie. (111)
Localisation de
Technique utilisable et images observables
la tuberculose
RX Des calcifications peuvent apparaître dans les stades tardifs.
Péricarde CT / Un amincissement ou des calcifications du péricarde peuvent être
IRM mis en évidence, ainsi qu’un épanchement péricardique.
RX Des cavités, des nodules et des infiltrations peuvent être retrouvées.
Poumon Permet d’évaluer l’atteinte des ganglions pulmonaires et les lésions
CT /
du parenchyme. Un épanchement pleural ou des caséifications
IRM
peuvent aussi être observées.
Adhérence de ganglions juxtaposés parfois associée à une
US
Ganglions vascularisation de leur centre et à un œdème périphérique.
lymphatiques CT / Adhérence de ganglions juxtaposés dont la densité dépend de
IRM l’avancement de leur caséification.
Les méninges apparaissent hyper-intenses en pondération T1 lors de
Système
IRM méningite tuberculeuse. Des tubercules cérébraux peuvent aussi être
nerveux central
observés. Ils apparaissent différemment selon leur caséification.
RX Une scoliose ou une gibbosité peuvent être retrouvées.
Rachis C’est l’examen de choix car il permet d’observer les lésions
IRM osseuses ainsi qu’une éventuelle compression médullaire, ou la
présence d’un abcès du muscle ilio-psoas ou paravertébral.
Os RX Observation de foyers d’ostéolyse et de réaction périostée.
US Peut mettre en évidence une effusion articulaire non spécifique.
Articulations
CT Permet d’établir le degré de destruction osseuse de l’articulation.
Un épaississement de la paroi intestinale est classiquement retrouvé,
Estomac et CT /
notamment au niveau de l’iléon terminal et du cæcum. Le pylore
intestins IRM
peut aussi présenter une lésion similaire.
La nécrose apparaît comme des zones d’opacité diminuée par
Foie et rate CT rapport au parenchyme. Des nodules peuvent être visibles et se
manifestent par des structures circulaires d’opacité plus élevée.
RX Des foyers de calcification peuvent être présents.
Une corticale irrégulière peut être observée dans les stades précoces
US de la maladie puis évoluer vers le développement de masses
Rein
hyperéchogènes. Le parenchyme rénal peut être déformé et calcifié.
CT / Une hydronéphrose ou des cicatrices et des lésions du parenchyme
IRM rénal peuvent être observées.
- 96 -
Figure 31 : Exemples d’images pouvant être observées lors de tuberculose pulmonaire
chez l’Homme
- 97 -
II) Diagnostic immunologique et dépistage
Nous avons vu que l’étude des lésions de tuberculose permet souvent d’orienter le
diagnostic. Néanmoins, elle est plus facilement réalisée de manière post mortem car elle
nécessite généralement la mise en œuvre de mesures très invasives, difficiles à envisager du
vivant du patient. Ainsi, d’autres méthodes sont utilisables chez des individus vivants afin de
détecter la présence de tuberculose. C’est le cas notamment des techniques permettant de
mettre en évidence la présence d’une immunité dirigée contre M. bovis.
1) L’intradermotuberculination
i) Principe de l’intradermotuberculination
Pour réaliser une IDS, le vétérinaire doit d’abord s’assurer auprès de l’éleveur
qu’aucun traitement ou injection n’a été administré au niveau de la zone où la tuberculination
aura lieu. De plus, aucune lésion cutanée ne doit être présente dans cette zone car les résultats
de la tuberculination pourraient alors être faussés. L’IDS doit être pratiquée au niveau du tiers
médian d’une des faces de l’encolure, approximativement à égale distance des bords supérieur
et inférieur de celle-ci. (Fig. 32) (3)
- 98 -
Figure 32 : Localisation de l’injection de tuberculine lors d’une IDS (3)
La zone d’injection doit être nettoyée et rasée. L’épaisseur du pli de peau est mesurée
à l’aide d’un cutimètre. L’équivalent de 2 000 UI de tuberculine bovine (soit environ 0,1 mL)
est ensuite injecté au moyen d’un pistolet injecteur de type McClintock ND, avec un angle
d’environ 15° entre la peau et la seringue afin que le produit soit bien administré dans le
derme. Un léger renflement de la peau caractéristique de la présence intradermique de la
tuberculine doit être visible. Si ce dernier est absent, une nouvelle injection doit être effectuée
à un autre endroit car le produit a probablement été injecté dans le tissu sous-cutané. (3)
- 99 -
L’IDS est un examen facile à réaliser, relativement peu coûteux, inoffensif et non
sensibilisant. Elle possède une sensibilité individuelle plutôt bonne (de l’ordre de 0,84) ce qui
lui procure une excellente sensibilité à l’échelle du troupeau. En effet, il suffit qu’un seul
animal infecté donne un résultat positif pour qu’un cheptel infecté soit détecté, ce qui fait de
l’IDS un excellent test de dépistage. En revanche, l’IDS est un examen chronophage car il
nécessite deux déplacements et la lecture des résultats reste dépendante de l’opérateur, même
avec l’utilisation d’un cutimètre, ce qui empêche une standardisation de ce test. De plus,
même si la spécificité moyenne est de 0,97, la valeur de cette dernière chute avec le nombre
d’animaux testés. Pour un troupeau de 50 individus, la spécificité troupeau correspondante est
seulement de 0,22. De façon générale, un animal qui présente une réaction positive ou « non
négative » à l’IDS est alors ensuite soumis à une intradermotuberculination comparative
(IDC) qui est un examen moins sensible (autour de 0,8) mais beaucoup plus spécifique (de
l’ordre de 0,995). L’IDC ne peut être effectuée qu’au moins six semaines après la première
IDS afin d’éviter d’éventuels phénomènes de désensibilisation. (3)
b) L’intradermotuberculination comparative
L’IDC fonctionne sur le même principe que l’IDS et consiste à comparer l’intensité
des réactions vis-à-vis de deux tuberculines. Une injection de tuberculine aviaire est pratiquée
sur une face de l’encolure, dix à quinze centimètres crânialement à celle de tuberculine
bovine. (Fig. 34) (3)
- 100 -
Les résultats doivent être interprétés à l’échelle du troupeau en reportant sur un
graphique les différents épaississements mesurés sur les animaux (Fig. 35). Si plusieurs points
sont répartis dans la zone de positivité, le résultat global est positif. Si les résultats sont plutôt
retrouvés dans les secteurs négatif et douteux, le résultat global est douteux. (3)
Figure 35 : Représentation graphique des résultats obtenus avec une IDC (d’après (3))
- 101 -
Tableau XVIII : Interprétation d’une réaction d’intradermotuberculination « non
négative » dans le cadre du dépistage de la tuberculose (d’après (115))
Critères
Contexte favorable Contexte défavorable
d’interprétation
Circonstance de - Prophylaxie de routine - Investigation de lien
dépistage - Contrôle d’introduction épidémiologique
- Troupeau classé à risque sanitaire
Historique du - Troupeau régulièrement dépisté - Troupeau suspect
troupeau avec des résultats négatifs - Introductions fréquentes d’animaux
en provenance d’origines différentes
- Relations de voisinage avec des
Voisinage de - Absence de voisinage avec des élevages infectés depuis moins de
foyers foyers récents de tuberculose cinq ans ou des zones où la faune
sauvage a été infectée
Nombre et
- Réactions faiblement positives et - Réactions nettement positives et
intensité des
peu nombreuses nombreuses
réactions
Suspicion faible : Suspicion forte :
Décision
Animal à statut non déterminé Animal positif
- 102 -
À l’inverse, dans les zones où la prévalence de la tuberculose est plus limitée, un
épaississement cutané compris entre cinq et neuf millimètres est plus souvent le reflet de la
sensibilisation avec d’autres mycobactéries non tuberculeuses. De même, dans les premières
années suivant la vaccination par le BCG, une induration pouvant dépasser les dix millimètres
peut apparaître lors d’une intradermotuberculination. On considère qu’un épaississement de
plus de dix millimètres signe une infection par un bacille tuberculeux sauvage dans plus de
90 % des cas au-delà de dix ans après la vaccination. Le tableau XIX présente les bases de
l’interprétation d’une intradermotuberculination chez l’Homme. (67)
Induration de
BCG < 10 ans BCG ≥ 10 ans Absence de BCG
la peau
< 5 mm NÉGATIF : pas de traitement
POSITIF
Entre 5 et 9
millimètres En faveur d’une
réaction due au BCG En faveur d’une infection
En faveur d’une
ou d’une infection plutôt ancienne par un
réaction due au BCG
par un bacille bacille tuberculeux
tuberculeux
Pas de traitement sauf pour
Pas de traitement, surveillance à 3 mois.
les enfants de moins de 15
À adapter selon le risque d’exposition
ans. Surveillance à 3 mois
POSITIF
Entre 10 et 14
millimètres En faveur d’une
réaction due au BCG En faveur d’une infection ancienne ou récente par
ou d’une infection par un bacille tuberculeux
un bacille tuberculeux
Traitement si enfant de moins de 15 ans ou si le contexte est en faveur
d’une infection récente, sinon surveillance à 3 mois
POSITIF
≥ 15 mm
Infection probablement récente par un bacille tuberculeux : traitement
- 103 -
L’IFN-γ est une interleukine intervenant dans le recrutement et la mobilisation des
macrophages. Chez les individus infectés par des mycobactéries tuberculeuses, les
lymphocytes T circulant dans le sang sont sensibilisés aux antigènes mycobactériens. Lorsque
ces cellules sont mises en contact in vitro avec ces derniers, elles se mettent à excréter de
l’IFN-γ qui peut ensuite être dosé par une méthode immunologique ELISA. (Enzyme-Linked
ImmunoabSorbent Assay). Un relargage élevé d’IFN-γ sera alors le témoin d’une
sensibilisation des lymphocytes T par des antigènes mycobactériens. Le délai entre le
prélèvement sanguin et la mise en œuvre du dosage ne doit pas excéder 12 heures car après 16
heures d’incubation, les lymphocytes T vont commencer à produire de l’IFN-γ, même en
absence de contact avec des antigènes mycobactériens. (116)
L’emploi du dosage de l'IFN-γ dans l’espèce bovine à l’heure actuelle peut être
effectué en parallèle à une intradermotuberculination dans le cadre de procédures d’abattage
sélectif, dans les cheptels en suivi renforcé ou encore en remplacement de l’IDS dans certains
départements comme la Camargue sur des animaux de combat où la contention est
impossible. Les avantages chez les bovins du dosage de l’IFN-γ sont de ne nécessiter qu’une
seule intervention dans l’élevage, de posséder une sensibilité équivalente voire supérieure à
celle de l’IDS (de l’ordre de 0,88) et de fournir un résultat objectif au bout de 24 heures.
L’inconvénient majeur de cette méthode tient à sa spécificité moins bonne que pour l’IDS (de
l’ordre de 0,966). De plus, les prélèvements doivent être analysés rapidement et le prix de ce
test est beaucoup plus élevé que pour une intradermotuberculination. (3) Les tests disponibles
pour l’espèce bovine comme le BOVIGAM® font intervenir des PPD comme antigènes
mycobactériens. Il a été prouvé que l’utilisation des protéines ESAT-6 et CFP-10 comme
antigènes pour le test à l'IFN-γ permettait d’améliorer sa spécificité et pouvait constituer une
perspective pour améliorer le test. (117)
Il existe deux tests actuellement disponibles en médecine humaine : le QuantiFERON-
TB-Gold® de Cellestis et le T-SPOT.TB® d’Oxford Immunotec. Les antigènes utilisés par
ces deux tests sont les protéines ESAT-6 et CFP-10 se trouvant dans la région génomique
RD1. Cette région de différence étant absente chez les souches de M. bovis BCG, le résultat
de ces tests n’est pas modifié par la vaccination. La spécificité varie entre 0,76 et 1, en étant
un peu meilleure pour le QuantiFERON-TB-Gold® et la sensibilité autour de 0,92, le T-
SPOT.TB® étant un peu plus sensible. (116)
- 104 -
Certaines exploitations classées à risque en raison de l’existence de liens épidémiologiques
avec un élevage infecté peuvent aussi être dépistées annuellement pendant une période de
trois à cinq ans indépendamment du rythme départemental. Un dépistage systématique à
l’introduction doit être effectué pour les animaux transitant depuis plus de six jours, quittant
une exploitation classée à risque ou transitant par une exploitation à fort taux de rotation.
(119)
La recherche des animaux tuberculeux se faisant principalement par
intradermotuberculination, la vaccination ou toute administration de produit à effet
sensibilisant ou désensibilisant à l’égard de la réaction à la tuberculine sont interdites. Le test
de dosage à l’IFN-γ, l’examen histologique, la culture bactérienne et la méthode PCR agréée
sont également autorisées pour la recherche de tuberculose bovine, dans la mesure où ces
examens sont conduits conformément aux méthodes et techniques recommandées par le
laboratoire national de référence. L’arrêté du 15 septembre 2003 définit ensuite les différents
types d’animaux et d’élevages en fonction des résultats obtenus lors du dépistage. (Annexe 2)
Un animal indemne provient d’un troupeau officiellement qualifié d’indemne. Ce dernier
correspond à un cheptel ne présentant pas de signes cliniques, ayant des bovins de plus de six
semaines négatifs à deux intradermotuberculinations (IDS ou IDC) de six mois à un an
d’intervalle, n’introduisant que des animaux de plus de six semaines venant d’élevages
indemnes, isolés à leur arrivée et ayant des résultats négatifs à deux
intradermotuberculinations de suite. Un animal suspect présente à l’abattoir des lésions
évocatrices de tuberculose ou une intradermotuberculination non négative. Le troupeau sera
alors qualifié de suspect lui aussi. Un animal infecté présente au moins deux critères
d’infection par un bacille tuberculeux : des signes cliniques évocateurs, une
intradermotuberculination positive, une PCR positive ou encore des lésions histologiques. Le
troupeau sera aussi qualifié d’infecté et les animaux de ce dernier n’appartenant pas à la
définition de l’animal infecté seront qualifiés de contaminés. (118) Tous les troupeaux
suspects d’être infectés suite au dépistage sont placés sous arrêté préfectoral de mise sous
surveillance (APMS) et plusieurs examens peuvent alors être conduits afin de déterminer la
présence ou non de la maladie dans ces troupeaux. (118)
- 105 -
Si la présence de la maladie est avérée, le troupeau est mis sous arrêté préfectoral
portant déclaration d’infection (APDI) et plusieurs mesures d’assainissement sont alors
prescrites. (Annexe 3) L’abattage total d’un cheptel déclaré infecté de tuberculose est
obligatoire sur l’ensemble du territoire et doit être pratiqué dans un délai limité à 30 jours
pour les bovins infectés. De nouveaux individus ne peuvent être introduits que lorsque le
dernier animal dont l’abattage a été ordonné a été abattu, que les locaux et le matériel à
l’usage des animaux ont été désinfectés et qu’une période de vide sanitaire a été appliquée. Le
troupeau de renouvellement pourra ensuite retrouver la qualification « d’officiellement
indemne » après la réalisation des tests prévus et des exigences de l’article 13 de l’arrêté du
15 septembre 2003. (Annexe 2) (118)
La réaction humorale après une infection par un bacille tuberculeux peut être mesurée
au moyen d’un test sérologique. Le principe est de mesurer le taux d’anticorps spécifiques des
antigènes de mycobactéries tuberculeuses présents dans le sérum d’un individu par ELISA
pour ainsi déterminer la présence ou non d’une infection. Même si cette méthode permet de
de différencier les patients tuberculeux des autres, elle manque fortement de spécificité
(variant entre 0,74 et 0,85) et de sensibilité (variant entre 0,61 et 0,75) menant respectivement
à de nombreux résultats faux positifs et faux négatifs. (120) Ceci est dû à la grande
hétérogénéité de la réponse humorale chez les individus atteints de tuberculose, à l’apparition
tardive des divers anticorps en cas d’infection par un bacille tuberculeux et aux réactions
croisées avec d’autres antigènes de mycobactéries environnementales. Plusieurs essais ont été
menés afin d’améliorer les tests sérologiques. Les mycobactéries étant des micro-organismes
intracellulaires, elles sont donc protégées de l’effet biologique des anticorps. Néanmoins, le
fait que certains antigènes soient sécrétés dans le compartiment extracellulaire justifie
l’évaluation de la réponse humorale et son application dans le diagnostic de la tuberculose.
Ainsi, des tests sérologiques efficaces contenant différents antigènes spécifiques pourraient
voir le jour à l’avenir afin d’évaluer la réponse immunitaire humorale. (121)
- 106 -
III) Mise en évidence de l’agent pathogène
A) L’examen microscopique
1) Les prélèvements
Nous avons déjà vu que les mycobactéries possèdent des affinités tinctoriales
particulières du fait de leur acido-alcoolo-résistance. Ainsi, la coloration à l’hématoxyline et à
l’éosine couramment utilisée en anatomopathologie n’est pas adaptée pour la mise en
évidence des mycobactéries. La coloration de Ziehl-Neelsen (Fig. 3) est la plus classiquement
utilisée pour cet objectif. Elle exploite les propriétés des mycobactéries pour les colorer
spécifiquement. Les acides mycoliques de ces dernières fixent directement la fuschine
assurant l’intensité de la coloration. Ils constituent ensuite une barrière physique prévenant
l’action décolorante de l’acide sulfurique et de l’alcool à 90°. La contre coloration au bleu de
méthylène permet une lecture simplifiée de la lame car elle ne pénètre pas dans les
mycobactéries qui apparaissent alors rouges sur fond bleu. Une coloration à l’auramine peut
aussi être réalisée. Cette dernière repose sur le même principe que la coloration de Ziehl-
Neelsen. Les bacilles fixent le colorant fluorescent et le conservent après effet de l’acide et de
l’alcool. La lecture des lames est simplifiée avec cette coloration car les mycobactéries
émettent une fluorescence jaune sur un fond noir. L’inconvénient principal de cette technique
est qu’elle nécessite l’utilisation d’un microscope à fluorescence plus onéreux. (122)
- 107 -
La spécificité de ces techniques de coloration est plutôt bonne, bien que des
confusions peuvent être faites à cause de mycobactéries non tuberculeuses étant elles aussi
mises en évidence par ces méthodes. De plus, certaines bactéries du genre Nocardia et
Rhodococcus peuvent présenter des degrés variables d’acido-alcoolo-résistance et ainsi mener
à des erreurs d’interprétations. La sensibilité de ces méthodes de coloration est assez faible.
Elle est de l’ordre de 50 % à 70 % lorsqu’elles sont appliquées à des échantillons
d’expectorations chez l’Homme. De plus, les lésions de tuberculose sont qasi exclusivement
paucibacillaires, ainsi la présence de bacilles acido-alcoolo-résistantes n’est pas toujours
détectée. Le diagnostic bactériologique de la tuberculose est donc amélioré par le nombre
d’échantillons examinés. (110)
- 108 -
Tableau XX : Interprétation des résultats de la lecture de lames colorées par la méthode
de Ziehl-Neelsen et par coloration à l’auramine (d’après (98))
Lorsque le résultat semble douteux suite à la lecture en fluorescence d’une lame, il est
possible de la recolorer au Ziehl-Neelsen et refaire une lecture pour conclure.
iii) L’immunohistochimie
- 109 -
Figure 38 : Mycobactéries mises en évidence par immunohistochimie au sein d’une
coupe histologique (124)
L’analyse microscopique des frottis d’expectorations est technique simple, rapide, peu
coûteuse et particulièrement spécifique dans les pays où la prévalence de la tuberculose est
élevée. Elle possède aussi l’avantage d’identifier les individus fortement contagieux et fait
donc partie intégrante de la stratégie globale de lutte contre la maladie. Cependant, la
sensibilité de l’examen microscopique de frottis d’expectorations est fortement diminuée
lorsque la charge bactérienne de l’échantillon est inférieure à 10 000 UFC (Unités Formant
Colonie) par millilitre ou pour les cas de tuberculose extra-pulmonaire. De plus, certains
patients ne reviennent pas pour leur deuxième ou leur troisième prélèvement, ou pour recevoir
leurs résultats d’analyse. Dans ces cas-là, le suivi de la maladie et son traitement ne peuvent
alors pas être effectués. (126)
- 110 -
B) Culture et identification de M. bovis
La culture est traditionnellement réalisée sur des milieux solides à base d’œuf tels que
le milieu de Löwenstein-Jensen, aussi composé de farine de pomme de terre, de sel et de
glycérol. L’usage d’un tel milieu soutient une croissance rapide des mycobactéries
tuberculeuses bien que la présence de glycérine ne soit pas favorable à celle de M. bovis.
Ainsi, certains laboratoires utilisent désormais des milieux de culture à base de gélose et de
divers constituants chimiques permettant une croissance encore plus rapide des
mycobactéries. Néanmoins, ces milieux sont moins stables et plus susceptibles de se
détériorer. L’exposition à une chaleur ou une lumière excessive peut par exemple conduire à
la libération de formaldéhyde toxique pour