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VETAGRO SUP

CAMPUS VÉTÉRINAIRE DE LYON


Année 2017 - Thèse n°073

ÉTUDE COMPARATIVE DE LA PATHOLOGIE ET DES


MÉTHODES DE DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE À
MYCOBACTERIUM BOVIS CHEZ LES BOVINS ET CHEZ
L’HOMME

THESE
Présentée à l’UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie)
et soutenue publiquement le 15 novembre 2017
pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire

par

LAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
VETAGRO SUP
CAMPUS VÉTÉRINAIRE DE LYON
Année 2017 - Thèse n°073

ÉTUDE COMPARATIVE DE LA PATHOLOGIE ET DES


MÉTHODES DE DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE À
MYCOBACTERIUM BOVIS CHEZ LES BOVINS ET CHEZ
L’HOMME

THESE
Présentée à l’UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie)
et soutenue publiquement le 15 novembre 2017
pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire

par

LAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
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Remerciements

À Monsieur le Professeur Jean-François Mornex


De la Faculté de Médecine de Lyon,
Qui nous a fait l’honneur d’accepter la présidence de notre jury de thèse,
Tous mes hommages les plus respectueux.

À Monsieur le Professeur Antonin Tortereau


De VetAgro Sup – Campus vétérinaire de Lyon,
Pour avoir accepté d’encadrer et de corriger ce travail,
Pour ses précieux conseils et sa disponibilité,
Pour ses qualités humaines et son enseignement de qualité,
Qu’il trouve ici l’expression de mon profond respect et de ma gratitude.

À Monsieur le Professeur Pierre Demont


De VetAgro Sup – Campus vétérinaire de Lyon,
Qui nous a fait l’honneur de juger ce travail et de prendre part à notre jury de thèse,
Pour sa bienveillance et sa disponibilité,
Mes plus sincères remerciements.

À Madame le Professeur Zorée Djelouadji


De VetAgro Sup – Campus vétérinaire de Lyon,
Pour avoir proposé de corriger ce travail,
Pour son enthousiasme et sa gentillesse,
Mes plus sincères remerciements.

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Remerciements

À toute ma famille
Quelles que soient les circonstances, vous avez toujours été présents pour moi,
Que vous trouviez ici l’expression de tout mon amour et de mon profond respect.

À mes parents
À qui je dois tout et bien plus encore,
Sans vous je ne serais pas là où j’en suis aujourd’hui,
Je vous aimerai toujours.

À ma sœur Fiona
Pour m’avoir soutenu et cru en moi toutes ces années et pour m’avoir poussé à me dépasser,
Je suis très fier de la femme que tu es devenue,
Rien ne pourra jamais remplacer notre complicité.

À ma grand-mère Jeanine
À qui je dédie cette thèse,
Tu aurais dû être présente à mes côtés aujourd’hui,
Tu étais et tu resteras à jamais dans mon cœur.

À Sarah
Pour tous les moments qui nous restent à vivre,
Pour être présente à mes côtés et dans mon cœur,
Je t’aime.

À mes amis
À William, Guillaume, Clémentine, Alexis, Chloé, Margot, Florence, Mélanie, Marie-Aude,
Thomas, Hugues et Martin,
Pour votre bonne humeur et tous les merveilleux moments passés en votre compagnie,
On a encore tellement à partager ensemble.

À toute l’équipe de la Clinique Vétérinaire du Haut Bugey


Pour votre confiance, votre bonne humeur et votre gentillesse,
Mes plus sincères remerciements.

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Table des matières

Liste des annexes ....................................................................................................................15


Liste des figures ......................................................................................................................17
Liste des tableaux ...................................................................................................................19
Liste des abréviations .............................................................................................................21

Introduction ............................................................................................................................23

Première partie : L’agent étiologique ...................................................................................25

I) Bactériologie ........................................................................................................................27
A) Classification des mycobactéries ........................................................................................27
1) La classification selon le pouvoir pathogène ...............................................................27
2) Autres types de classifications ......................................................................................27
B) Caractéristiques bactériologiques des mycobactéries .........................................................29
1) Morphologie .................................................................................................................29
2) Affinité tinctoriale .........................................................................................................30
3) Résistance aux agents physico-chimiques et aux antibiotiques ....................................31
i) Les agents physico-chimiques ................................................................................31
ii) Les antibiotiques antituberculeux .........................................................................31
iii) Le cas particulier du pyrazinamide chez Mycobacterium bovis .........................32
4) Croissance ....................................................................................................................33
5) Propriétés biochimiques des mycobactéries .................................................................35
C) Caractéristiques biologiques des mycobactéries .................................................................35
1) Habitat ..........................................................................................................................35
2) Espèces sensibles aux mycobactéries ...........................................................................36
3) Facteurs influençant le pouvoir pathogène ..................................................................38

II) Épidémiologie ....................................................................................................................39


A) Épidémiologie descriptive ..................................................................................................39
1) Évolution du MTC dans le temps ..................................................................................39
2) Distribution de la tuberculose à M. bovis ....................................................................40
i) Chez les bovins .......................................................................................................40
ii) Chez l’Homme ......................................................................................................41
B) Épidémiologie analytique ...................................................................................................42
1) Sources de contamination .............................................................................................42
2) Réceptivité ....................................................................................................................43

-9-
3) Mode de transmission ...................................................................................................43
i) Intraspécifique aux bovins .....................................................................................43
ii) Interspécifique des bovins à l’Homme ..................................................................43
C) Épidémiologie synthétique ..................................................................................................44
1) Modalités de contamination .........................................................................................44
i) Dans l’espèce bovine .............................................................................................44
a) Au sein d’un élevage ........................................................................................44
b) À l’échelle des différents pays .........................................................................45
ii) Dans l’espèce humaine .........................................................................................46
2) Facteurs de risque ........................................................................................................46
i) Dans l’espèce bovine .............................................................................................46
a) À l’échelle de l’individu ...................................................................................46
b) À l’échelle d’un troupeau ................................................................................46
ii) Dans l’espèce humaine .........................................................................................47

Deuxième partie : La pathologie ...........................................................................................49

I) Formation du complexe primaire et réactions immunitaires ............................................51


A) L’infection initiale ...............................................................................................................51
1) Le complexe primaire ...................................................................................................51
2) Lésions associées au complexe primaire ......................................................................51
B) Mécanismes mis en jeu durant l’infection à M. bovis .........................................................54
1) Le rôle des macrophages ..............................................................................................54
2) La sécrétion des cytokines ............................................................................................55
C) Les mécanismes d’échappement au système immunitaire ..................................................55
1) Inhibition de la lyse par les macrophages ....................................................................55
2) Modification des mécanismes de mort cellulaire .........................................................56
3) Subversion de la signalisation cellulaire ......................................................................57
4) Modification de l’expression de différents gènes .........................................................57
5) Les facteurs de virulence de M. bovis ...........................................................................58
i) Les différentes étapes de l’étude des facteurs de virulence ...................................58
ii) Le locus RD1 .........................................................................................................59
a) Organisation du locus RD1 .............................................................................59
b) Rôle du dimère ESAT-6/CFP-10 dans les interactions avec l’hôte .................60
c) La régulation des micro-ARN par ESAT-6/CFP-10 .........................................60
iii) Les autres facteurs de virulence ..........................................................................60

- 10 -
D) Réponses immunitaires associées .......................................................................................62
1) La réponse Th2 humorale .............................................................................................62
2) La réaction d’hypersensibilité retardée ........................................................................63
i) Les différents types d’hypersensibilité retardée .....................................................63
ii) Évolution de l’hypersensibilité retardée ...............................................................64
3) Le phénomène d’anergie ...............................................................................................64
E) Le phénomène de latence ....................................................................................................65

II) Les différentes évolutions du complexe primaire et les lésions associées .......................66
A) Les différentes évolutions du complexe primaire et la généralisation ................................66
1) La progression de l’infection ........................................................................................66
2) La tuberculose miliaire .................................................................................................67
3) Les autres formes de généralisation .............................................................................69
B) Tuberculose pulmonaire et tableau clinique général ...........................................................70
1) Le développement d’une tuberculose pulmonaire ........................................................70
2) Tableau clinique ............................................................................................................72
i) Chez les bovins .......................................................................................................72
ii) Chez l’Homme ......................................................................................................72
C) Les différentes localisations possibles de la tuberculose ....................................................73
1) La tuberculose ganglionnaire .......................................................................................73
2) La tuberculose cutanée .................................................................................................75
i) La tuberculose cutanée exogène ............................................................................75
a) Le chancre tuberculeux ....................................................................................75
b) La tuberculose verruqueuse .............................................................................76
ii) La tuberculose cutanée endogène .........................................................................76
a) Le scrofuloderme .............................................................................................76
b) La tuberculose orificielle .................................................................................76
iii) La tuberculose hématogène .................................................................................76
iv) La tuberculose éruptive ........................................................................................76
3) La tuberculose du système nerveux central ..................................................................77
4) La tuberculose ostéo-articulaire ...................................................................................78
5) La tuberculose de l’abdomen ........................................................................................80
i) La tuberculose digestive et viscérale .....................................................................80
ii) La tuberculose urogénitale ...................................................................................81
6) La tuberculose oculaire ................................................................................................82
7) Le cas particulier de la tuberculose de la mamelle ......................................................83

- 11 -
Troisième partie : Les méthodes de diagnostic et de dépistage ..........................................85

I) Diagnostic clinique et lésionnel ..........................................................................................87


A) Diagnostic clinique .............................................................................................................87
1) Les différents signes cliniques ......................................................................................87
2) Diagnostic différentiel clinique ....................................................................................88
B) Diagnostic anatomopathologique ........................................................................................89
1) Diagnostic morphologique macroscopique ..................................................................89
i) Chez les bovins .......................................................................................................89
a) Modalités de l’inspection à l’abattoir .............................................................89
b) Les différentes lésions suspectes à l’abattoir ..................................................90
c) Aspects réglementaires de l’inspection à l’abattoir ........................................91
ii) Chez l’Homme ......................................................................................................92
2) Diagnostic différentiel morphologique .........................................................................92
i) Chez les bovins .......................................................................................................92
ii) Chez l’Homme ......................................................................................................93
3) Diagnostic histologique ................................................................................................93
C) Mise en évidence indirecte des lésions par les techniques d’imagerie ...............................95
1) L’examen radiographique dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire ...............95
2) L’apport de l’imagerie dans le diagnostic de la tuberculose .......................................95

II) Diagnostic immunologique et dépistage ...........................................................................98


A) Mise en évidence de l’immunité cellulaire .........................................................................98
1) L’intradermotuberculination ........................................................................................98
i) Principe de l’intradermotuberculination ...............................................................98
ii) L’intradermotuberculination chez les bovins dans le cadre du dépistage ............98
a) La réalisation de l’intradermotuberculination simple chez les bovins ...........98
b) L’intradermotuberculination comparative ....................................................100
c) Interprétation des résultats ............................................................................101
iii) L’utilisation de l’intradermotuberculination chez l’Homme .............................102
2) Le test à l’interféron gamma ......................................................................................103
3) Aspects réglementaires du dépistage chez les bovins en France ................................104
B) Mise en évidence de l’immunité humorale .......................................................................106

III) Mise en évidence de l’agent pathogène .........................................................................107


A) L’examen microscopique ..................................................................................................107
1) Les prélèvements .........................................................................................................107

- 12 -
2) La mise en évidence de mycobactéries par différentes méthodes ...............................107
i) Les différentes méthodes de coloration ................................................................107
ii) Méthodes de lecture et interprétation des résultats ............................................108
iii) L’immunohistochimie ........................................................................................109
3) Les frottis d’expectorations chez l’Homme ................................................................110
B) Culture et identification de M. bovis .................................................................................111
1) Méthode de culture des mycobactéries .......................................................................111
2) Critères d’identification et expression des résultats ...................................................112
C) Méthodes d’identification par l’utilisation du génie génétique .........................................112
1) Hybridation directe avec une sonde spécifique ..........................................................112
2) L’hybridation inverse sur bandelettes ........................................................................113
3) Le séquençage de l’ADN ............................................................................................114
4) Méthodes basées sur l’utilisation de marqueurs génotypiques ..................................114

IV) Prophylaxie et traitement ................................................................................................115


A) Mesures prophylactiques ...................................................................................................115
1) Mesures hygiéniques et sanitaires ..............................................................................115
i) Chez les bovins .....................................................................................................115
ii) Chez l’Homme .....................................................................................................115
2) Mesures médicales applicables chez l’Homme ..........................................................116
i) L’antibioprophylaxie ............................................................................................116
ii) La vaccination avec le BCG ...............................................................................116
B) Le traitement de la tuberculose .........................................................................................117

Conclusion .............................................................................................................................119

Bibliographie ........................................................................................................................121

Annexes .................................................................................................................................131

- 13 -
- 14 -
Liste des annexes

Annexe 1 : Règlement (CE) n°854/2004 du parlement européen et du conseil du 29 avril ….


2004, annexe I viandes fraîches, section IV exigences spécifiques, chapitre I : animaux ….
domestiques de l’espèce bovine .............................................................................................129
Annexe 2 : Arrêté du 15 septembre 2003 fixant les mesures techniques et administratives ….
relatives à la prophylaxie collective et à la police sanitaire de la tuberculose des bovinés et ….
des caprins, chapitre III, section 1 : Définitions relatives aux animaux et aux troupeaux ….
des espèces de bovinés d’élevage ..........................................................................................131
Annexe 3 : Arrêté du 15 septembre 2003 fixant les mesures techniques et administratives ….
relatives à la prophylaxie collective et à la police sanitaire de la tuberculose des bovinés et ….
des caprins, chapitre V : Mesures de police sanitaire, section 2 : Mesures générales ….
applicables dans les troupeaux infectés ..................................................................................135
Annexe 4 : Posologie des médicaments antituberculeux essentiels ......................................137
Annexe 5 : Effets indésirables des médicaments antituberculeux .........................................137

- 15 -
- 16 -
Liste des figures

Figure 1 : Arbre phylogénétique non enraciné des principales mycobactéries à croissance ….


lente, basé sur l’alignement multiple des séquences des gènes présents sur l’ARN 16S ........26
Figure 2 : Schéma de la structure de la paroi des mycobactéries ...........................................27
Figure 3 : M. bovis vu au microscope optique après une coloration de Ziehl-Neelsen ..........28
Figure 4 : Mécanisme d’action du pyrazinamide sur les mycobactéries ................................30
Figure 5 : Aspect des colonies de M. bovis, M. tuberculosis et M. avium intracellulare sur ….
milieu de Löwestein-Jensen .....................................................................................................32
Figure 6 : Exemple de manuel de dépistage de la tuberculose à l’usage des chasseurs .........34
Figure 7 : Momie atteinte de la maladie de Pott accompagnée d’un modèle .........................37
Figure 8 : Carte de la répartition géographique mondiale de la tuberculose bovine entre ….
janvier et juin 2016 ..................................................................................................................39
Figure 9 : Modèle explicatif de l’origine d’un foyer de tuberculose dans un élevage bovin ….
indemne ....................................................................................................................................42
Figure 10 : Structure et constituants cellulaires d’un granulome tuberculeux ........................50
Figure 11 : Granulome tuberculeux en coupe histologique ....................................................51
Figure 12 : Schéma simplifié de la réponse immunitaire induite lors d’une infection par ….
les mycobactéries .....................................................................................................................52
Figure 13 : Les deux modalités de mort cellulaire des macrophages et leurs conséquences ….
sur la multiplication des mycobactéries chez l’hôte ................................................................54
Figure 14 : Schéma récapitulatif des principaux mécanismes d’échappement au système ….
immunitaire mis en œuvre par les mycobactéries ....................................................................56
Figure 15 : Diagramme de la région RD1 de M. tuberculosis ................................................57
Figure 16 : Représentation schématique des réponses immunitaires chez les bovins suite …..
à une infection par M. bovis .....................................................................................................60
Figure 17 : Les différentes voies d’évolution du complexe primaire .....................................64
Figure 18 : Tuberculose miliaire pulmonaire ..........................................................................65
Figure 19 : Signes cliniques orientant le diagnostic vers une tuberculose miliaire ................66
Figure 20 : Différentes formes de généralisation ....................................................................67
Figure 21 : Différentes formes de tuberculose pulmonaire .....................................................68
Figure 22 : Lésions cavitaires et bronchopneumonie tuberculeuse chez l’Homme ................69
Figure 23 : Lésions macroscopiques de tuberculose ganglionnaire ........................................72
Figure 24 : Différentes formes clinique de tuberculose cutanée .............................................75
Figure 25 : Lésions macroscopiques de tuberculose du système nerveux central ..................76
Figure 26 : Lésions macroscopiques de tuberculose du rachis ...............................................77

- 17 -
Figure 27 : Lésions macroscopiques de tuberculose abdominale ...........................................79
Figure 28 : Lésions macroscopiques de tuberculose uro-génitale ..........................................80
Figure 29 : Tuberculose de la mamelle chez un bovin ............................................................81
Figure 30 : Follicule fibreux calcifié ......................................................................................92
Figure 31 : Exemples d’images pouvant être observées lors de tuberculose pulmonaire ….
chez l’Homme ..........................................................................................................................95
Figure 32 : Localisation de l’injection de tuberculine lors d’une IDS ....................................97
Figure 33 : Différentes étapes de l’IDS ...................................................................................97
Figure 34 : Localisation des injections de tuberculine lors d’une IDC ...................................98
Figure 35 : Représentation graphique des résultats obtenus avec une IDC ............................99

Figure 36 : Arbre décisionnel de la conduite à tenir en fonction des résultats de ….


l’intradermotuberculination lors du dépistage chez les bovins ..............................................103
Figure 37 : Bacilles acido-alcoolo-résistantes vues au microscope à fluorescence après ….
une coloration à l’auramine ....................................................................................................106
Figure 38 : Mycobactéries mises en évidence par immunohistochimie au sein d’une ….
coupe histologique .................................................................................................................108
Figure 39 : Exemple de schéma utilisé pour le GenoType MTBC test permettant ….
l’identification des mycobactéries appartenant au MTC ........................................................111

- 18 -
Liste des tableaux

Tableau I : Principaux caractères distinctifs entre M. bovis et M. tuberculosis en culture ….


sur un milieu de Löwestein-Jensen ..........................................................................................31
Tableau II : Principales propriétés distinctives entre M. bovis, M. tuberculosis et les ….
mycobactéries atypiques ..........................................................................................................33
Tableau III : Liste non exhaustive des espèces sauvages chez lesquelles M. bovis a pu ….
être isolé, et leur rôle de réservoir ou de relais dans la transmission de la tuberculose ….
bovine à des troupeaux de bovins domestiques .......................................................................35
Tableau IV : Incidence et mortalité de la tuberculose due à M. bovis chez l’homme en ….
2015 selon les estimations de l’OMS .......................................................................................40
Tableau V : Liste des principaux facteurs de virulence des mycobactéries tuberculeuses .....59
Tableau VI : Les différents types d’hypersensibilité retardée ................................................61
Tableau VII : Symptômes de la tuberculose pulmonaire chez l’Homme ...............................71
Tableau VIII : Étapes de l‘évolution de l’aspect des ganglions périphériques affectés par ….
la tuberculose selon Jones et Campbell ....................................................................................72
Tableau IX : Classification des formes de tuberculose cutanée selon Byet ...........................73
Tableau X : Signes cliniques associés aux principales localisations des lésions de ….
tuberculose ...............................................................................................................................85
Tableau XI : Les organes « porte d’entrée » et les ganglions lymphatiques associés ............87
Tableau XII : Les différentes formes des lésions observées à l’abattoir ................................88
Tableau XIII : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel ….
morphologique de la tuberculose chez les bovins ....................................................................90
Tableau XIV : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel ….
morphologique de la tuberculose chez l’Homme .....................................................................91
Tableau XV : Principales anomalies radiographiques retrouvées lors de tuberculose ….
pulmonaire active .....................................................................................................................93
Tableau XVI : Les différents examens d’imagerie utilisables en fonction de la localisation ….
des lésions de tuberculose ........................................................................................................94
Tableau XVII : Grille de lecture de l’IDC ..............................................................................98
Tableau XVIII : Interprétation d’une réaction d’intradermotuberculination « non ….
négative » dans le cadre du dépistage de tuberculose ............................................................100
Tableau XIX : Aide à l’interprétation de l’intradermotuberculination dans le cadre ….
exclusif de la décision thérapeutique .....................................................................................101
Tableau XX : Interprétation des résultats de la lecture de lames colorées par la méthode ….
de Ziehl-Neelsen et par coloration à l’auramine ....................................................................107
Tableau XXI : Les différents schémas thérapeutiques pour le traitement de la tuberculose ….
humaine ..................................................................................................................................116

- 19 -
- 20 -
Liste des abréviations

ADN : Acide DésoxyriboNucléique


APDI : Arrêté Préfectoral portant Déclaration d’Infection
APMS : Arrêté Préfectoral de Mise sous Surveillance
ARN : Acide RiboNucléique
ATP : Adénosine Tri-Phosphate
BAAR : Bacille Acido-Alcoolo-Résistant
BCG : Bacille de Calmette et Guérin
BK : Bacille de Koch ou Mycobacterium tuberculosis
°C : degré Celsius
CD : Cluster of Differentiation
CFP-10 : Culture Filtrate Protein 10 kDa
CMH : Complexe Majeur d’Histocompatibilité
CMI : Cell-Mediated Immunity ou immunité à médiation cellulaire
CPA : Cellule Présentatrice d’Antigène
CT : Computed Tomography ou tomodensitométrie
DD(CS)PP : Direction Départementale de la Cohésion Sociale et de la Protection des
Populations
DGAL : Direction Générale de l’Alimentation
ELISA : Enzyme-Linked ImmunoabSorbent Assay
ESAT-6 : Early Secretory Antigenic Target 6 kDa
ESX-1 : ESAT-6 Secretion System 1
FAS I : Fatty Acid Synthase I
HSR : HyperSensibilité Retardée
IDC : IntraDermotuberculination Comparative
IDS : IntraDermotuberculination Simple
IFN : InterFéroN
IL : InterLeukine
IRM : Imagerie à Résonance Magnétique
kDa : kiloDalton
LT : Lymphocyte T
LXA4 : LipoXine A4
M. : Mycobacterium
MAC : Mycobacterium avium intracellulare Complex ou Complexe Mycobacterium avium
intracellulare

- 21 -
mm : millimètre
MTC : Mycobacterium Tuberculosis Complex ou Complexe Mycobacterium Tuberculosis
µm : micromètre
NALC : N-Acétyl-L-Cystéine
NaOH : Hydroxyde de sodium
NF-κB : Nuclear Factor kappa B
NK : Natural Killer
OIE : Office International des Épizooties (Organisation Mondiale de la Santé Animale)
OMS : Organisation Mondiale de la Santé
ORF : Open Reading Frame ou cadre de lecture ouvert
PAMP : Pathogen Associated Molecular Patterns ou motifs moléculaires associés aux
pathogènes
pb : Paire de Bases
PCR : Polymerase Chain Reaction ou réaction de polymérisation en chaîne
PGE2 : ProstaGlandine E2
pH : Potentiel Hydrogène
POA : Pyrazinoic Acid ou Acide Pyrazinoïque
PPD : Purified Protein Derivative ou dérivé protéique purifié
PRR : Patern Recognition Receptors ou récepteurs de reconnaissance de motifs moléculaires
PZA : Pyrazinamide
RD : Region of Difference ou région de différence
RNS : Reactive Nitrogen Species ou espèces réactives de l’azote
ROS : Reactive Oxygene Species ou espèces réactives de l’oxygène
RX : radiographie
sp. : species ou espèce
subsp. : subspecies ou sous-espèce
TGF : Transforming Growth Factor
Th : Lymphocyte T auxiliaire ou T helper
TLR : Toll Like Receptors ou récepteurs de type Toll
TNF : Tumor Necrosis Factor
UFC : Unités Formant de Colonie
UI : Unités Internationales
US : UltraSonography ou échographie
VIH : Virus de l’Immunodéficience Humaine
WAHIS : World Animal Health Information System

- 22 -
Introduction

La tuberculose est une maladie infectieuse chronique due à certaines bactéries du


genre Mycobacterium et caractérisée par des lésions appelées tubercules. On estime qu’elle
touche entre six et dix millions de personnes dans le monde chaque année. Plusieurs espèces
de mycobactéries peuvent être responsables de la maladie. En 1882, Robert Koch met en
évidence à partir de lésions humaines le bacille tuberculeux mais c’est seulement en 1889 que
les espèces Mycobacterium bovis et Mycobacterium tuberculosis sont identifiées.

La tuberculose bovine à M. bovis est une zoonose pouvant affecter pratiquement tous
les mammifères, et doit être différenciée de la tuberculose humaine à M. tuberculosis. Elle est
inscrite dans la liste des dangers sanitaires de première catégorie définis par l’arrêté du 29
juillet 2013 et fait partie des vices rédhibitoires chez les bovins. Bien que l’infection ait été
contrôlée dans la plupart des pays développés, elle représente un enjeu économique et de
santé publique majeur. En effet, de nombreux cas humains sont recensés par l’Organisation
Mondiale de la Santé (OMS) chaque année dans les pays en voie de développement. Depuis
quelques années, la prévalence de la tuberculose bovine augmente aux États-Unis et dans
certains pays européens comme le Royaume-Uni, entraînant la réapparition de cas humains de
tuberculose à M. bovis. Or, cette maladie peut causer une altération profonde de l’état général
et potentiellement être mortelle. De plus, son impact économique est très important car les
mesures de contrôle impliquent des saisies et des abattages totaux de troupeaux. Elle entre
aussi en compte dans les échanges commerciaux dans le cadre de la sécurité sanitaire et
alimentaire. Malgré les mesures de lutte mises en œuvre, l’éradication de la maladie demeure
difficile à cause de la présence de réservoirs sauvages comme les blaireaux au Royaume-Uni
ou les daims à queue blanche aux États-Unis.

Cette thèse a pour objectif d’étudier de manière comparative la tuberculose à M. bovis


chez les bovins et chez l’Homme. Dans une première partie, nous présenterons les différentes
caractéristiques bactériologiques et biologiques des mycobactéries. Nous étudierons
l’épidémiologie de la tuberculose à M. bovis chez les bovins et chez l’Homme afin de mieux
comprendre les différentes modalités de contamination ainsi que la distribution de la maladie
dans le monde. Dans une deuxième partie, nous présenterons les étapes du développement de
la tuberculose, avec les différents mécanismes mis en œuvre par la bactérie et les lésions
tissulaires qui en découlent dans le cadre d’une infection touchant un bovin ou un Homme.
Enfin, nous nous pencherons sur les différentes méthodes de dépistage et de diagnostic
pouvant être mises en œuvre chez les bovins et chez l’Homme.

- 23 -
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PREMIÈRE PARTIE :

L’AGENT ÉTIOLOGIQUE

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I) Bactériologie

A) Classification des mycobactéries

Les mycobactéries sont des Schizomycètes, appartenant à l’ordre des Actinomycétales


et à la famille des Mycobacteriaceae. Cette famille ne comprend qu’un seul genre,
Mycobacterium, comportant plus de cent cinquante espèces. (1) Les bactéries appartenant à ce
genre se distinguent par la présence d’acides mycoliques dans leur paroi et par le taux élevé
en guanine-cytosine de leur ADN (65.63% chez M. bovis). (2)

1) La classification selon le pouvoir pathogène

Il existe de nombreuses classifications des mycobactéries mais la plus intéressante


d’un point de vue médical est celle basée sur leur signification pathologique : les
mycobactéries pathogènes, opportunistes ou saprophytes. Ces deux dernières catégories sont
qualifiées d’atypiques.

Les mycobactéries pathogènes sont partagées en deux groupes : celui du Complexe


Mycobacterium Tuberculosis (MTC) auquel appartiennent notamment M. bovis et M.
tuberculosis, deux agents de la tuberculose ; et celui du Complexe Mycobacterium Avium
intracellulare (MAC) auquel appartiennent M. avium intracellulare et M. leprae, l’agent de la
lèpre.

Les mycobactéries opportunistes peuvent causer des troubles cliniquement similaires à


la tuberculose dans certaines conditions mal définies. On trouve par exemple chez les bovins
la thélite nodulaire tuberculoïde de la vache laitière due à M. gordonae et les affections
pulmonaires et ganglionnaires à M. kansasii. Elles sont habituellement bénignes et ne
répondent souvent pas aux médicaments antituberculeux comme la rifampicine ou
l'isoniazide. (3)

Les mycobactéries saprophytes sont très nombreuses dans les environnements


hydriques comme les eaux de surface, les sols (M. terrae…) et les boues riches en matière
organiques. La forte hydrophobicité de leur surface facilite la formation d’aérosols, ce qui
explique qu’elles soient aussi retrouvées dans l’air, sur les végétaux, la surface de la peau et
les muqueuses des animaux. Il faut toujours tenir compte de ces mycobactéries non-
pathogènes lors de l’interprétation des résultats de laboratoire car elles peuvent contaminer
des prélèvements. De plus, elles sont parfois responsables de réactions non spécifiques à la
tuberculine au moment du dépistage chez les bovins, lorsqu’elles transitent accidentellement
dans certains tissus. (3)

2) Autres types de classification

On peut classer les mycobactéries selon d’autres critères que leur pathogénicité
comme par exemple leur vitesse de croissance. Celles à croissance rapide ne sont
généralement pas pathogènes. Parmi les mycobactéries à croissance lente, on retrouve les
bactéries du MTC dont M. bovis. Elles ont besoin de plus de 7 jours pour former des colonies
lorsqu’elles sont repiquées sur un milieu de Löwenstein-Jensen. Ce milieu spécifique contient
du vert de malachite qui inhibe la croissance de nombreux contaminants, favorisant ainsi celle
des mycobactéries. Il contient aussi des éléments nutritifs indispensables à la constitution de
leur paroi particulière. (4)

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De nombreuses classifications des mycobactéries basées sur les distances entre
différents gènes existent. Elles permettent un classement des différentes espèces de
mycobactéries en fonction de leur éloignement génétique pour un ensemble de gènes choisis.
La figure 1 donne un exemple d’arbre provenant d’une étude où quatre gènes de l’ARN 16S
(564 paires de bases) ont été séquencés et analysés pour 44 espèces de mycobactéries à
croissance lente. (5)
Comme nous pouvons le remarquer sur cette figure (Fig 1), les espèces de
mycobactéries pathogènes sont également proches d’un point de vue phylogénétique.

Figure 1 : Arbre phylogénétique non enraciné des principales mycobactéries à


croissance lente, basé sur l’alignement multiple des séquences des gènes présents sur
l’ARN 16S (5)

L’échelle longitudinale 0,01 correspond à 1 % de variation entre les différentes séquences


nucléotidiques analysées.

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B) Caractéristiques bactériologiques des mycobactéries

1) Morphologie

Les mycobactéries se présentent sous la forme de petits bacilles fins, droits ou


légèrement incurvés, ayant parfois des éléments renflés, cunéiformes ou ramifiés. Elles
mesurent entre un et dix micromètres de long pour un diamètre compris entre 0,2 à 0,6 μm et
ne sont ni sporulées, ni encapsulées. M. bovis en particulier, est un bacille petit, trapu et
granuleux à l’aspect variable selon les souches. (6)

Sur le plan structural, les mycobactéries se caractérisent par une paroi épaisse de sept à
huit nanomètres, riche en lipides (60 % des constituants) et dont la constitution explique, au
moins partiellement, leurs propriétés tinctoriales, leur pathogénicité et leur résistance à divers
antibiotiques. Les mycobactéries sont rattachées aux bactéries à Gram positif, sans en être à
proprement parler. Leur paroi a une structure particulière comprenant trois couches. La plus
interne est formée d'un peptidoglycane à la périphérie duquel est fixé un arabinogalactane
(polymère de molécules d'arabinose et de galactose). L’arabinogalactane s’attache par des
liaisons esters à des acides mycoliques, acides gras à longue chaîne carbonée (60 à 90
carbones), situés dans la couche intermédiaire de la paroi. La partie externe de la paroi est
constituée d'une matrice de phospholipides, de glycolipides (comme le tréhalose dimycolate
notamment), de protéines dont certaines sont sans doute des porines, et de mycosides, ces
derniers formant une pseudo-capsule. La paroi est traversée de part en part par des molécules
de lipoarabinomannane dont la partie lipidique est ancrée dans la membrane cytoplasmique et
dont la partie polysaccharidique gagne la surface de la pseudo-capsule. (7)

Figure 2 : Schéma de la structure de la paroi des mycobactéries (8)

MurNac/GC : Murnac-(Pentapeptide)-N-Acetylglucosamine ; Man : Mannopyranose ; Ara :


Arabinose ; GlcNAc : Glucosamine-N-acétyl ; Galf : Galactofuranose.

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2) Affinité tinctoriale

Nous avons pu voir qu’une des particularités des mycobactéries résidait dans la
composition de leur paroi. Sa richesse en lipides et en acides mycoliques lui confère une
grande hydrophobicité et donne ainsi aux mycobactéries une propriété particulière : ce sont
des Bacilles Acido-Alcoolo-Résistants (BAAR). Elles sont de ce fait difficilement colorées
par les colorations classiques de type Gram. En effet, leur paroi hydrophobe empêche le
violet de gentiane d’accéder au cytoplasme. Ensuite, lors du traitement à l’alcool, ce dernier
ne parvient pas dissoudre les lipides pariétaux. Ainsi, lors de la dernière étape de la coloration
de Gram, le second colorant (safranine ou fuchsine) ne parvient pas non plus jusqu’au
cytoplasme. (9) Les mycobactéries n’apparaissent donc pas ou peu colorées.

Une coloration spécifique permet la mise en évidence des bactéries de l’ordre des
Actinomycétales, c’est la coloration de Ziehl-Neelsen (Fig 3). Elle utilise d’abord de la
fuchsine phéniquée de Ziehl à 0,3 % qui colore les mycobactéries en rouge. La fuchsine est
chauffée jusqu’à formation de vapeur afin d’augmenter sa cinétique de pénétration au sein de
la paroi. Il y a alors formation de complexes mycolate-fuschine dans cette dernière. Si les
mycobactéries ont absorbé le colorant, elles le retiennent encore après le traitement intensif à
l’acide sulfurique à 25 % qui survient ensuite. Ce dernier a notamment pour but de décolorer
les bactéries n’étant pas Acido-Alcoolo-Résistantes qui pourraient se trouver sur la lame. Une
contre-coloration au bleu de méthylène à 3 % est alors réalisée pour simplifier la lecture de la
lame, car ce produit ne colore pas les mycobactéries. Elles apparaissent ainsi de couleur rouge
sur fond bleu au microscope optique, tandis que tous les autres micro-organismes non
résistants à l'acide se teintent en fonction de la contre-coloration. (10) (11)
Il faut toutefois garder à l’esprit que toutes les mycobactéries sont colorées de la
même façon par cette méthode. Il faudra donc toujours être prudent dans l’interprétation de
cette coloration car elle n’indique pas si on a affaire à des mycobactéries pathogènes ou non.

Figure 3 : M. bovis vu au microscope optique après une coloration de Ziehl-Neelsen (12)

Les bacilles apparaissent en rouge vif sur fond bleu et sont colorés de façon homogène.

- 30 -
3) Résistance et sensibilité aux agents physico-chimiques et aux antibiotiques

i) Les agents physico-chimiques

La structure de la paroi des mycobactéries explique leur résistance aux agents physico-
chimiques. Elles sont en effet résistantes à la dessiccation, aux détergents, aux acides et bases
dilués, au froid (plusieurs années à 4°C) et à la chaleur (20 minutes à 70°C mais elles sont
détruites à 80°C). Les mycobactéries sont sensibles au glutaraldéhyde, aux dérivés
phénoliques (comme le Crézyl par exemple), à l’eau de Javel (hypochlorite de sodium), à
l’éthanol à 70° et à l’acide peracétique. Néanmoins, des temps de contact plus longs qu’avec
les autres bactéries seront nécessaires pour obtenir un effet bactéricide. (13)

ii) Les antibiotiques antituberculeux

Il existe plusieurs antimicrobiens actifs sur les mycobactéries, répartis entre les
antituberculeux dits « essentiels » et ceux de réserve. Les médicaments antituberculeux ont
trois propriétés principales : ils sont bactéricides, stérilisants et capables de prévenir
l’apparition d’une résistance. Les médicaments antituberculeux essentiels possèdent ces trois
caractéristiques à des degrés divers :
La rifampicine inhibe la synthèse de l’acide ribonucléique (ARN) chez un grand
nombre d’agents pathogènes en se liant spécifiquement à leur ARN polymérase. C’est un
bactéricide puissant qui se trouve être le stérilisant le plus efficace dont nous disposons à
l’heure actuelle. Il est en effet capable d’agir sur toutes les populations de bacilles
tuberculeux, qu’ils se trouvent en position extracellulaire ou intracellulaire.
L’isoniazide (hydrazide de l’acide isonicotinique) exerce un effet bactéricide puissant
sur les bacilles tuberculeux en phase de réplication en inhibant la synthèse des acides
mycoliques. C’est une prodrogue qui pour être efficace doit être activée par une catalase
peroxydase bactérienne. Comme la rifampicine, l’isoniazide est actif contre toutes les
populations de bacilles tuberculeux.
La streptomycine est un antimicrobien inhibiteur de la synthèse des protéines. Il agit
en se fixant sur l’ARN ribosomique 16S. Il appartient à la famille des aminosides et possède
une activité bactéricide contre certaines populations bacillaires qui se multiplient rapidement.
Il est historiquement le premier antibiotique ayant eu une action contre M. tuberculosis.
L’éthambutol et la thioacétazone sont utilisés en association avec des médicaments
plus puissants pour éviter l’apparition de bacilles résistants. (14)
Le pyrazinamide sera étudié à part dans la partie I.B.3.iii.

Les antituberculeux de réserve sont utilisés dans certains cas particuliers et leur
utilisation doit être strictement interdite en dehors de quelques services spécialisés. On peut
les utiliser pour les cas de tuberculose chronique où le test de dépistage rapide par lecture
d’un frottis d’expectoration au microscope revient positif à l’issue d’un traitement bien
conduit avec des médicaments antituberculeux essentiels. On les utilise aussi pour les
tuberculoses multirésistantes où les bacilles sont au moins résistants à la rifampicine et à
l’isoniazide.
Le terme « réserve » est utilisé à la place de « deuxième intention » pour se conformer
à la Liste modèle de Médicaments Essentiels (LME) de l’OMS. La LME a été créée en 1977
en vue d’offrir un modèle auquel les gouvernements puissent se référer pour sélectionner les
médicaments et établir des listes nationales. Parmi les antituberculeux de réserve, on trouve la
kanamycine, l’éthionamide, le protionamide, l’amikacine, l’ofloxacine et la ciprofloxacine.
(14)

- 31 -
iii) Le cas particulier du pyrazinamide chez Mycobacterium bovis

Le pyrazinamide (PZA) fait partie des antituberculeux essentiels. C’est un analogue de


synthèse du nicotinamide, faiblement bactéricide pour M. tuberculosis. C’est une prodrogue
qui nécessite l’action d’une pyrazinamidase pour le convertir en acide pyrazinoïque (POA)
actif (Étape B sur la figure 4). Il n’est actif qu’en milieu acide où il peut former un acide
conjugué qui est accumulé dans les bacilles. (15) Il inhibe alors la FAS I, protéine nécessaire à
la synthèse des acides gras par la bactérie (Étape E sur la figure 4). L’acide pyrazinoïque peut
également se lier à la protéine ribosomique S1 (RpsA) et ainsi inhiber la traduction de l’ARN
à l’origine des protéines bactériennes. (Étape G sur la figure 4) (16) Le pyrazinamide possède
une activité stérilisante puissante, notamment dans le milieu intracellulaire relativement acide
des macrophages et dans les zones d’inflammation aiguë. Il est donc très efficace au cours des
2 premiers mois après l’infection, lorsque les réactions inflammatoires aiguës sont toujours
présentes.

Figure 4 : Mécanisme d’action du pyrazinamide sur les mycobactéries (17)

La bactérie est ici schématisée par sa double paroi.

A : Entrée par transport actif et passif du PZA dans la bactérie. B : Conversion du PZA en POA par
la protéine PncA. C : En milieu acide, le POA devient actif (POAH sur le schéma). D : Réduction du
potentiel membranaire de la bactérie. E : Inhibition de la FAS entraînant une rupture de la membrane.
F : Acidification du cytoplasme. G : Inhibition de la synthèse des protéines bactériennes.

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Chez M. bovis, il existe une mutation caractéristique à point unique en position 169 du
nucléotide du gène pncA codant pour la pyrazinamidase. Une cytosine est remplacée par une
guanine par rapport à la séquence pncA de M. tuberculosis. Cela entraîne une substitution des
acides aminés en position 57 de la séquence PncA, rendant la pyrazinamidase de M. bovis
inactive. Cela confère à M. bovis une résistance naturelle au pyrazinamide car ce dernier n’est
pas converti en POA actif (Inhibition de l’étape B sur la figure 4). Cette caractéristique est
habituellement utilisée pour distinguer M. bovis de M. tuberculosis. Il est aussi intéressant de
noter que la plupart des résistances au pyrazinamide ont pour origine une mutation du gène
pncA. (18)

4) Croissance

Comme nous avons pu le voir précédemment dans la partie I.A.2, la croissance de M.


bovis et de M. tuberculosis est lente. Ce sont des germes très exigeants, comme beaucoup
d’autres mycobactéries. De ce fait, ils sont incapables d’assurer leur croissance sur les milieux
bactériologiques usuels et nécessitent donc l’emploi de milieux spéciaux. Les milieux de
croissance à l’œuf coagulé comme le milieu de Coletsos ou de Löwenstein-Jensen sont les
plus utilisés pour la mise en évidence des mycobactéries. Ils contiennent du vert de malachite
à 0,025% pour inhiber la croissance des germes contaminants et sont enrichis en éléments
nutritifs utiles aux mycobactéries.
La croissance de M. bovis est favorisée par rapport à celle de M. tuberculosis sur le
milieu de Coletsos car il est enrichi en pyruvate de sodium, mais leur différenciation se fait
classiquement par culture sur le milieu de Löwenstein-Jensen. Sur ce dernier, les colonies de
M. bovis sont assez typiques car elles poussent en six semaines à l’isolement et possèdent des
caractéristiques permettant de les différencier de celles de M. tuberculosis.

Tableau I : Principaux caractères distinctifs entre M. bovis et M. tuberculosis en culture


sur un milieu de Löwestein-Jensen (d’après (13) et (19))

M. bovis M. tuberculosis
Température optimale
38,5°C 37,5°C
de croissance
pH Entre 6 et 6,5 unités pH Entre 5,8 et 6,7 unités pH
Délai de culture 1 à 2 mois 2 à 4 semaines
Eugoniques (colonies à
Dysgoniques (colonies restant développement progressif
toujours de petite taille) pouvant atteindre 1 cm de
diamètre)
Aspect des colonies
Arrondies aux bords irréguliers, En forme de « chou-fleur », de
de teinte blanche, à surface teinte crème beige, à surface
brillante et lisse (Smooth) sèche et rugueuse (Rough)

Les colonies de M. bovis sont petites, non pigmentées, lisses et dysgoniques. D’abord
plates, elles deviennent ensuite bombées et brillantes mais ne dépassent pas la taille d’une tête
d’épingle (6) sauf si le milieu de culture est enrichi en pyruvate de sodium (comme le milieu
de Coletsos). Elles n’apparaissent jamais avant un mois à l’isolement mais, après repiquage,
la croissance peut être plus rapide et les colonies peuvent devenir rugueuses, bien développées
et se confondre avec celles de M. tuberculosis.

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Figure 5 : Aspect des colonies de M. bovis, M. tuberculosis et M. avium intracellulare sur
milieu de Löwestein-Jensen

(Photographie : Laboratoire de microbiologie de l’hôpital de la Timone, unité des mycobactéries.


Marseille)

Les colonies de M. bovis et de M. avium intracellulare sont assez similaires ce qui


représente un risque de confusion entre ces deux bactéries. M. avium intracellulare fait partie
des mycobactéries non photochromogènes, c’est à dire formant des colonies blanchâtres ne se
pigmentant pas lors d’une exposition à la lumière. Néanmoins, contrairement aux colonies de
M. bovis, une pigmentation jaune peut se développer si elles sont conservées longtemps. (20)

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5) Propriétés biochimiques des mycobactéries
Les mycobactéries sont des bacilles aérobies strictes à micro-aérobies, possédant des
propriétés biochimiques variées pouvant permettre de faire la distinction entre elles. M. bovis
et M. tuberculosis possèdent une peroxydase et une catalase thermolabile. Cela diffère des
mycobactéries atypiques qui ont en commun l’absence de peroxydase et la présence d’une
catalase résistante à 75°C pendant 15 minutes. Les mycobactéries atypiques ont aussi la
particularité d’être résistantes au thioacétazone.
M. tuberculosis possède une nicotinamidase qui n’est pas retrouvée chez les autres
mycobactéries telles que M. bovis qui ne peuvent donc pas convertir le nicotinamide en acide
nicotinique (ou niacine). Cela explique pourquoi M. tuberculosis est la seule pouvant donner
un test de Konno (ou niacine-test) positif. Ce test est spécifique de ce dernier bacille et se
réalise sur une culture de 40 jours. (21) De plus, M. bovis est aussi incapable de réduire les
nitrates contrairement à M. tuberculosis qui possède une nitrate réductase.
Il est intéressant de noter que la glycérine présente dans les milieux de culture a
tendance à inhiber la croissance de M. bovis alors que cette dernière est stimulée par le
pyruvate de sodium. Cela explique la croissance plus longue de M. bovis par rapport à M.
tuberculosis sur le milieu de Löwenstein-Jensen contenant de la glycérine. De même, malgré
la présence de glycérine sur le milieu de Coletsos, la croissance de M. bovis y est favorisée car
il contient du pyruvate de sodium. (13)
Tableau II : Principales propriétés distinctives entre M. bovis, M. tuberculosis et les
mycobactéries atypiques (d’après (13) et (21))

M. bovis M. tuberculosis Mycobactéries


atypiques
22°C + + +
Catalase
75°C - - +
Nicotinamidase - + -
Peroxydase + + -
Thioacétazone S S R
Nitrate réductase - + Variable
Glycérine à 5 % Défavorable Favorable Favorable

S: sensible ; R : résistant; + : présence ; - : absence

C) Caractéristiques biologiques des mycobactéries


1) Habitat

De nombreuses mycobactéries non tuberculeuses sont ubiquistes, ce qui révèle une


tolérance élevée vis-à-vis des variations des paramètres physico-chimiques et
microbiologiques de leur milieu. Cette capacité d’adaptation explique pourquoi on les
retrouve partout dans l’environnement : dans l’air, sur les végétaux, dans les eaux de surface,
les sols et les boues riches en matières organiques. Ces mycobactéries peuvent survivre et se
multiplier dans une large gamme de pH et de température. Seul un nombre restreint de
mycobactéries n’a encore jamais été isolé dans l’environnement. (22) Il a été prouvé
expérimentalement que M. bovis peut aussi survivre longtemps en dehors de son hôte dans un
environnement contaminé par un animal infecté. Cela s’explique par l’imperméabilité de sa
paroi et sa croissance lente. (23)

- 35 -
Le climat influence la survie de M. bovis dans l’environnement. Une température juste
au-dessus de 0°C et une forte hygrométrie la favorisent tandis qu’un temps chaud et sec la
diminue. Cependant, aucun cas d’infection humaine par M. bovis directement à partir de
l’environnement n’a encore été répertorié. De plus, l’infection de troupeaux par des bacilles
présents dans l’environnement est probablement négligeable car un bovin doit ingérer 10 7
bacilles pour se contaminer alors que quelques bacilles en aérosol suffisent pour infecter un
veau de 4 à 7 mois. (24) Il est donc plutôt bien établi que la niche écologique des bacilles
tuberculeux est restreinte à l’Homme et à quelques animaux. M. bovis est considéré comme
un pathogène intracellulaire dont la voie de contamination la plus courante est la transmission
par contact direct entre les animaux.

2) Espèces sensibles aux mycobactéries

M. bovis possède le spectre d’hôte le plus large de tous les bacilles du MTC. Par exemple, en
France, une proportion non négligeable de Cerfs (Cervus elaphus) contaminés par M. bovis
ont été trouvés dans des régions où des cas d’infection de cheptels ont été rapportés. Cela
nous permet de suspecter le rôle de la faune sauvage dans la transmission de la maladie d’où
l’importance de sa détection. (23) Les fèces, l’urine et le pus peuvent se retrouver facilement
sous forme d’aérosols capables de propager l’infection dans les troupeaux par voie aérienne.
Ainsi, la limitation des contacts entre les animaux sauvages potentiellement infectés et les
troupeaux de bovins semble être la base de tout programme de lutte contre la tuberculose
bovine. (24)
Il existe de nombreuses mesures facilitant la détection de la maladie chez les animaux
de la faune sauvage, comme par exemple des guides de reconnaissance des lésions de
tuberculose à l’usage des chasseurs. En Suisse, les chasseurs et organismes de surveillance de
la chasse ont l’obligation de signaler à un vétérinaire officiel toute lésion suspecte. (25) En
France, il existe deux réseaux acteurs de la surveillance de la tuberculose dans la faune
sauvage. Le réseau SAGIR s’occupe de la détection des agents pathogènes zoonotiques ou
partagés par la faune sauvage et les animaux domestiques. Il fait intervenir les Fédérations des
chasseurs et l’Office National de la Chasse et de la faune sauvage. Le réseau Sylvatub quant à
lui a été lancé en 2011 par le Ministère de l’Agriculture pour faire face à la recrudescence de
la tuberculose bovine en élevage. Il s’appuie sur le réseau SAGIR et son principal objectif est
la détection de la présence de tuberculose au sein de la faune sauvage. (26)

Figure 6 : Exemple de manuel de dépistage de la tuberculose à l’usage des chasseurs (25)

- 36 -
Deux catégories d’hôtes sont à distinguer : les espèces réservoir capables d’entretenir
et de propager l’infection et les espèces relais, dites « spill over species », qui ne font que
propager la maladie sans l’entretenir. Chez les espèces réservoir, l’infection peut persister par
transmission horizontale en l’absence de source de M. bovis et peut être transmise à d’autres
hôtes sensibles. Les espèces relais peuvent être infectées par M. bovis mais l’infection
survient de manière sporadique et ne persiste dans leur population qu’en présence d’une
espèce réservoir atteinte dans leur écosystème. Si la source de l’infection est éliminée, la
prévalence de la maladie est réduite et ne peut être maintenue sur le long terme que par
l’apparition d’une nouvelle source ou bien par la présence d’un réservoir. (23)

Tableau III : Liste non exhaustive des espèces sauvages chez lesquelles M. bovis a pu être
isolé, et leur rôle de réservoir ou de relais dans la transmission de la tuberculose bovine à
des troupeaux de bovins domestiques (d’après (23))

Espèces 1 2 Espèces 1 2
Cervidés Ruminants Sauvages
Cerf de Virginie (Odocoileus X X Buffle d'Afrique (Syncerus X
virginianus) caffer)
Cerf élaphe (Cervus elaphus) X X Buffle d’Asie (Bubalus arnee) X
Cerf sika (Cervus nippon) X X Bison (Bison bison) X
Daim (Dama dama) X X Kudu (Tragelaphus imberbis) X
Chevreuil (Capreolus capreolus) X ? Grand Kudu (Tragelaphus X
strepsiceros)
Wapiti (Cervus canadensis) X X Cobe de Lechwe (Kobus leche) X
Suidés Chèvre (Capra hircus) X
Sanglier (Sus scrofa) X Gnou (Connochaetes taurinus) X X
Phacochère (Phacochoerus X X Sassabi (Damaliscus lunatus) X
aethiopicus)
Porc (Sus domesticus) X Petits mammifères
Carnivores Hérisson (Erinaceus europaeus) X
Renard roux (Vulpes vulpes) X Taupe (Talpa europaea) X
Furet (Mustela furo) X ? Rat (Rattus norvegicus) X ?
Hermine (Mustela erminea) X Musaraigne (Sorex araneus) X
Putois (Mustela putorius) X Écureuil (Sciurus carolinensis) X
Vison (Mustela vison) X Campagnol (Clethrionomys X
glareolus)
Lion (Panthera leo) X ? Mulot (Apodemus flavicollis) X
Guépard (Acinonyx jubatus) X Autres
Chat Sauvage (Felis catus) X Blaireau (Meles meles) X
Léopard (Panthera pardus) X Possum (Trichosurus vulpecula) X
Hyène (Crocuta crocuta) X Babouin (Papio cynocephalus) X
Lynx roux (Lynx rufus) X
1 : Relais (« Spill over species »)
Coyote (Canis latrans) X
Ours noir (Ursus americanus) X 2 : Réservoir (« Maintenance species »)
Raton laveur (Procyon lotor) X

- 37 -
La localisation des lésions chez les animaux atteints permet de savoir à quelle
catégorie d’hôtes ils appartiennent. Les lésions majoritairement localisées en région
thoracique suggèrent une infection par voie aérienne, ce qui est couramment observé chez les
espèces réservoir. Les lésions localisées au niveau du tractus digestif évoquent quant à elles
une contamination orale par ingestion de carcasses contaminées. Elles sont plutôt retrouvées
chez les espèces relais. Néanmoins, la limite entre ces deux catégories d’hôtes n’est pas
encore clairement établie. La capacité d’excrétion de M. bovis, l’éthologie (comme par
exemple la vie en groupe ou en solitaire) et l’écologie (alimentation, comportement, la densité
de population et les interactions interspécifiques) sont des facteurs pouvant amener une
espèce à devenir, dans un biotope particulier, un réservoir de la tuberculose bovine. Le tableau
III est une liste non exhaustive décrivant les principales espèces réservoirs et relais pour M.
bovis dans la faune sauvage. (24)

3) Facteurs influençant le pouvoir pathogène

De nombreux facteurs ont une influence sur le pouvoir pathogène de M. bovis. Ils
peuvent être regroupés en deux grandes catégories : les facteurs liés à l’hôte et ceux liés au
bacille lui-même.

L’influence de l’hôte sur le pouvoir pathogène se traduit majoritairement par les


facteurs pouvant modifier son immunité, comme c’est le cas pour d’autres infections
bactériennes. Par exemple, la prédominance de lymphocytes T γδ chez le veau diminue de
manière significative la progression de la maladie. Au contraire, le système immunitaire
devient moins performant pour contrer les mycobactéries avec l’âge, d’où l’augmentation de
l’incidence de la tuberculose bovine dans les troupeaux constitués d’individus plus âgés. Les
animaux ayant des carences protéiques et énergétiques montrent un nombre significativement
plus bas de lymphocytes et sont aussi plus susceptibles de transmettre M. bovis. Enfin, toute
source de stress chez l’animal entraîne le relargage d’hormone adrénocorticotrope et de
cortisol, connus pour leurs effets dépresseurs sur le système immunitaire. (27)

Plusieurs paramètres liés à M. bovis sont à prendre en compte dans son pouvoir
pathogène. Tout d’abord, le nombre de lésions induites suite à une contamination par voie
respiratoire est proportionnel à la quantité de mycobactéries inhalée. De même, il existe une
relation inversement exponentielle entre la quantité de bacilles inhalée et le délai avant
l’excrétion des bactéries par l’hôte, qui est en moyenne de 87 jours dans les conditions
naturelles. (28) La taille et la viscosité des particules présentes dans les aérosols vecteurs de
bacilles semblent également être des paramètres importants dans l’installation de l’infection.
Des gouttes fines de faible viscosité sont ainsi les plus aptes à délivrer les mycobactéries
qu’elles contiennent. (27) Il est aussi intéressant de noter que seules des particules dont le
diamètre est inférieur à cinq microns sont capables d’atteindre les alvéoles pulmonaires. (29)
Les propriétés des mycobactéries liées à leur virulence sont relativement complexes et
concernent leur capacité à infecter, survivre et se répliquer dans les cellules de l’hôte. Elles
sont peu définies pour les bacilles tuberculeux mais plusieurs facteurs de virulence ont été
identifiés. Les mycosides et les lipoarabinomannanes permettent par exemple une persistance
de la bactérie dans les macrophages. (27)

L’objectif de ce travail étant d’étudier la tuberculose à M. bovis chez les bovins et chez
l’Homme, nous ne nous intéresserons plus qu’à cette mycobactérie spécifiquement dans les
parties à venir.

- 38 -
II) Épidémiologie
A) Épidémiologie descriptive
1) Évolution du MTC dans le temps

La tuberculose est une maladie très ancienne car M. prototuberculosis, l’ancêtre qui
serait à l’origine du MTC, serait apparu il y a 40 000 ans. Une étude reposant sur l’utilisation
de marqueurs génétiques hypervariables sur différentes lignées de bactéries appartenant au
MTC tend à prouver que le complexe aurait émergé en Mésopotamie. Il se serait ensuite
répandu avec les migrations humaines en Asie, en Afrique et en Europe il y a 10 000 ans. (30)
La présence de déformations vertébrales sur des momies égyptiennes datant d’environ
5 000 ans ont pu être rattachées à la maladie de Pott, une spondylodiscite due au bacille de la
tuberculose. Grâce aux techniques du génie génétique comme la PCR (Polymerase Chain
Reaction), de l’ADN de M. tuberculosis a pu être amplifié à partir de tissus appartenant à ces
momies. Des manuscrits décrivent la présence de tuberculose en Inde et en Chine il y a
respectivement 3 300 ans et 2.300 ans. Grâce aux mêmes techniques que celles employées
pour les momies égyptiennes, l’étude de momies péruviennes a permis de mettre en évidence
la présence de tuberculose en Amérique bien avant l’arrivée des premiers explorateurs
européens. Il existait au niveau du détroit de Béring un pont terrestre reliant la Sibérie et
l'Alaska il y a plus de 10 000 ans, ce qui aurait permis les migrations humaines ayant emmené
la tuberculose sur le continent américain. (31)

Figure 7 : Momie atteinte de la maladie de Pott accompagnée d’un modèle (32)

- 39 -
La sédentarisation et la domestication d’animaux dans des milieux de vie différents
ont ensuite permis l’émergence de nouvelles espèces de mycobactéries telles que M. bovis ou
M. caprae, ainsi que le développement de leur capacité à se transmettre à un large spectre
d’hôtes. L’ensemble de ces données explique la vaste répartition de la tuberculose dans le
monde et indiquerait que la transmission de cette maladie s’est faite de l’Homme aux animaux
domestiques à l’origine. (33)

2) Distribution de la tuberculose à M. bovis


.
i) Chez les bovins

La répartition géographique de la tuberculose bovine a fortement évolué entre la fin du


XIXème siècle et aujourd’hui. En 1895, l’utilisation de la tuberculine de Koch à des fins de
dépistage a permis d’estimer la proportion de bêtes infectées entre 30 % et 60 % en France.
Néanmoins, cette proportion est officiellement estimée à 1 % en 1896. La crainte des saisies
pousse les éleveurs à présenter leurs meilleurs animaux à l’abattoir, les autres suspects étant
abattus à l’écart de toute surveillance. Ainsi, les abattoirs contrôlés par les services d’hygiène
fournissent des données officielles erronées sous-estimant la prévalence de M. bovis dans les
troupeaux. En Allemagne, en Hollande, en Angleterre et aux États-Unis, la proportion de
bovins infectés varie de 10 % à 30 % jusqu’à atteindre 80 % dans certaines régions. (34)
Le développement de l’industrie laitière a par la suite été la principale cause de
dissémination de la maladie au sein des élevages au début du XX ème siècle. L’augmentation de
la taille des troupeaux favorisait la transmission de la maladie et le lait d’une seule vache
excrétrice pouvait contaminer de grandes quantités de lait dans les laiteries. Le lait contaminé
non destiné à la consommation humaine était acheté par les éleveurs pour nourrir leurs veaux
ce qui a favorisé la dissémination de M. bovis dans les cheptels. Lorsque la pasteurisation de
tout le lait a été rendue obligatoire dans les laiteries, l'incidence de la tuberculose bovine a
régressé. (35)

Des programmes d’éradication basés sur la surveillance ainsi que des mesures de
dépistage et d’abattage visant à éliminer les animaux infectés des troupeaux ont pratiquement
éradiqué la tuberculose des élevages de nombreux pays développés. Aujourd’hui, de
nombreux pays en Europe et en Amérique du Nord, ainsi que l’Australie, sont indemnes de
tuberculose bovine ou proches de son éradication complète chez le bétail. Néanmoins, la
présence de réservoirs sauvage de M. bovis ont gravement compromis les programmes
d ‘éradication dans des pays comme l’Irlande, la Nouvelle-Zélande, le Royaume-Uni et
l’Irlande du Nord, ainsi que dans certaines parties des États-Unis d’Amérique. Il a été prouvé
que les animaux sauvages se contaminaient au contact des troupeaux et entretenaient ensuite
la maladie. Des analyses génétiques ont montré que les troupeaux étaient infectés par les
mêmes souches que la faune sauvage qui les entourait, et que le niveau de contamination des
cheptels était directement relié à la prévalence de la maladie dans la faune sauvage. (36)

Dans plusieurs pays en développement d’Afrique, d’Asie et d’Amérique du Sud,


l’incidence de la maladie chez le bétail reste extrêmement élevée. Les données sur la
prévalence de la tuberculose bovine sont infimes, et l’information disponible sous-estime la
situation épidémiologique réelle de la maladie. Malgré le fait que la tuberculose soit une
maladie à déclaration obligatoire dans de nombreux pays, sa chronicité et son évolution à bas
bruit affaiblissent grandement les processus de reconnaissance et de signalement des foyers.
De nombreux indices tendent à prouver que sa prévalence reste néanmoins élevée dans ces
pays. (36) Selon la base de données mondiale d’informations sanitaires (WAHIS) de
l’Organisation Mondiale de la Santé animale (OIE), 61 pays ont signalé des cas de
tuberculose bovine dans leurs cheptels entre janvier et juin 2016 (Fig 8).

- 40 -
Figure 8 : Carte de la répartition géographique mondiale de la tuberculose bovine entre
janvier et juin 2016 (d’après (37))

ii) Chez l’homme

À l’heure actuelle, l’OMS estime le nombre de nouveaux cas de tuberculose humaine


entre six et dix millions chaque année. Cependant, seulement 60 % de ces nouveaux cas sont
réellement notifiés. Par exemple en 2015, seulement 6,1 millions de nouveaux cas de
tuberculose ont été notifiés alors qu’on estime son incidence à 10,4 millions cette même
année. Cette différence est due à deux facteurs principaux. Le premier est la non-notification
de nouveaux cas diagnostiqués dans certaines structures privées ou dans des pays ne
possédant pas de politique de notification obligatoire. Le second facteur est le sous-diagnostic
qui peut survenir pour de multiples raisons, comme un accès financier ou géographique aux
soins difficile, un échec dans la démarche diagnostique ou encore une insuffisance des tests de
détection pour assurer l’identification de la maladie. (38)

Il est difficile de faire un état des lieux précis de la tuberculose zoonotique à M. bovis.
La majorité des données disponibles ne différencient pas la tuberculose due à M. bovis de
celle liée à M. tuberculosis. L’identification de l’espèce exacte nécessite une culture
bactérienne et l’utilisation de techniques moléculaires qui sont très rarement employées. Le
nombre cas humains de tuberculose à M. bovis peut donc s’avérer fortement sous-évalué. (39)

- 41 -
Tableau IV : Incidence et mortalité de la tuberculose due à M. bovis chez l’homme en
2015 selon les estimations de l’OMS (d’après (38))
Région Incidence Mortalité
Afrique 76 300 (20 300 – 168 000) 10 000 (2 570 – 22 500)
Amérique 804 (218 – 1 770) 46 (12 – 98)
Est de la Méditerranée 7 490 (1 883 – 16 900) 639 (113 – 1 610)
Europe 1 290 (350 – 2 840) 103 (28 – 225)
Asie du Sud-Est 47 400 (11 300 – 109 000) 2 280 (602 – 5 050)
Ouest du Pacifique 15 900 (4 290 – 34 900) 286 (77 – 630)
Global 149 000 (71 600 – 255 000) 13 400 (5 050 – 25 700)
L’intervalle de confiance à 95 % est indiqué entre parenthèses.
Avant la mise en place d’un programme de contrôle de la tuberculose, une proportion
significative des cas humains était due à M. bovis dans la plupart des pays développés. En
France, les mesures obligatoires de pasteurisation du lait et d’abattage systématique des
bovidés contrôlés positifs au test à la tuberculine datent respectivement de 1955 et de 1963.
La prévalence de M. bovis à cette époque était de l’ordre de 1,5 % en Europe alors que seuls
quelques cas sporadiques sont observables de nos jours. (40) La situation est différente pour
les pays en voie de développement. Dans la plupart des pays d’Afrique, la tuberculose bovine
est présente et aucune mesure de contrôle de la maladie telle que la pasteurisation du lait ou
l’inspection des carcasses à l’abattoir n’est mise en place. Ce phénomène est aggravé par la
présence de nombreux facteurs de risque tels que la forte prévalence de l’infection par le HIV.
Une étude de juin 2013 rapporte que la tuberculose à M. bovis représente en moyenne 2,8 %
des cas de tuberculose en Afrique, 0,3 % des cas sur l’ensemble du continent américain et
0,4 % des cas en Europe. La consommation de lait cru dans certains pays d’Afrique,
d’Amérique du Sud et d’Asie où la maladie est fortement prévalente chez les bovins permet
d’expliquer la proportion plus élevée de cas de tuberculose humaine imputables à M. bovis.
C’est le cas notamment en Éthiopie, en Tanzanie et au Mexique où la proportion de cas de
tuberculose à M. bovis s’élève respectivement à 17 %, 26,1 % et 7,8 %. (39)

B) Épidémiologie analytique
1) Sources de contamination
L’homme et les animaux infectés peuvent excréter M. bovis par plusieurs voies et
représentent la principale source de contamination pour les individus sains et
l’environnement. L’excrétion est présente pendant toute la durée de l’infection, même si son
intensité est irrégulière. Elle peut se faire par le biais du jetage et des expectorations lors
d’une atteinte des poumons ou des nœuds lymphatiques céphaliques, par les matières fécales
dans le cas d’une localisation digestive ou par l’urine si l’infection est généralisée. Le passage
de bacilles dans les fèces en l’absence de lésions gastro-intestinales est aussi possible, par
déglutition de mucus chargé en bactéries dans le cadre d’une atteinte pulmonaire. (41) Les
tissus et organes infectés constituent aussi une source de contamination. Selon la proximité du
muscle avec les lésions, la viande peut se contaminer et donc devenir impropre à la
consommation. Il est intéressant de noter que le sang n’est que très rarement contaminé par
M. bovis, ce dernier ne s’y trouvant que transitoirement avant d’infiltrer les macrophages.
L’ensemble des éléments environnementaux souillés par M. bovis, tels que l’eau, le sol
ou les mangeoires, peut aussi devenir une source de contamination. (3)

- 42 -
2) Réceptivité

Pratiquement tous les mammifères peuvent être atteints par la tuberculose mais la
sensibilité à l’infection varie selon les individus. Chaque espèce possède une réceptivité
propre à M. bovis. Par exemple, les bovins sont plus fréquemment touchés par ce bacille que
les caprins ou les ovins. Tous les facteurs entraînant une altération de l’état général peuvent
diminuer les défenses de l’hôte et le rendre ainsi plus sensible au bacille tuberculeux. C’est le
cas notamment lors de carences alimentaires, de surmenage physique ou de conditions de vie
en promiscuité dans certains élevages intensifs. La maladie est aussi plus grave et plus
fréquente chez les animaux jeunes ou âgés. La présence de lésions tissulaires locales
préexistantes peut aussi favoriser l’implantation de M. bovis. (3) (13)

3) Mode de transmission

i) Intraspécifique aux bovins

M. bovis se transmet principalement de manière horizontale directe parmi les bovins,


par voie respiratoire. La transmission se fait par inhalation de gouttelettes infectées expulsées
par les animaux atteints lorsqu’ils toussent. La taille des particules expulsées ainsi que leur
charge bactérienne en mycobactéries apparaissent comme les facteurs principaux déterminant
la transmission de la maladie. Une étude visant à déterminer un modèle mathématique pour
l’excrétion de M. bovis par les bovins a montré qu’il existait une relation inversement
exponentielle entre le nombre de bactéries délivrées à l’animal et la période avant qu’il
devienne contagieux. Un bovin contaminé par un grand nombre de bactéries deviendra donc
contagieux beaucoup plus rapidement. Grâce à ce modèle, on a pu estimer qu’en conditions
naturelles, une seule mycobactérie était souvent responsable de l’infection et qu’un bovin
mettait en moyenne 87 jours pour devenir excréteur. (28)
La transmission horizontale directe peut également s’effectuer par le biais de fluides corporels
infectés comme le lait, l’urine ou les fèces, ou encore par transmission vénérienne. Cependant,
ces voies de contamination restent très rares.
La contamination verticale par passage de la bactérie via le cordon ombilical a été
décrit mais cela reste anecdotique. Le plus souvent, les veaux issus de mères tuberculeuses
naissent sains. Ils peuvent en revanche être contaminés à la naissance dès la prise de
colostrum.

La contamination horizontale indirecte par ingestion de M. bovis est considérée


comme la deuxième voie d’infection la plus courante. Nous avons pu voir que M. bovis était
une bactérie très résistante dans l’environnement et pouvait y survivre plus de 178 jours.
Néanmoins, dans les conditions naturelles, il est rare de parvenir à isoler M. bovis à partir de
sols ou de pâturages peuplés d’animaux infectés. (29) La contamination se ferait donc plutôt
par le biais des abreuvoirs, mangeoires et pierres à lécher fréquentés par des animaux infectés.
Ce mode de contamination reste toutefois beaucoup moins efficace que la voie aérienne. (42)

ii) Interspécifique des bovins à l’Homme

La transmission de M. bovis d’un animal à l’homme peut s’effectuer par voie aérienne
directement à partir des animaux infectés, par contact direct entre des tissus animaux infectés
et la peau humaine lésée ou encore par consommation de lait contaminé non pasteurisé. (43)
Comme chez les bovins, la localisation des lésions de tuberculose est souvent liée à la voie de
pénétration du bacille.

- 43 -
La contamination horizontale directe par inhalation de particules très fines aboutit à
une tuberculose pulmonaire. Il arrive néanmoins que la tuberculose puisse s’étendre à d’autres
organes secondairement à une infection du poumon.
La tuberculose extra-pulmonaire résulte habituellement de l’invasion transitoire du
sang circulant par M. bovis suite à un contact direct ou à l’ingestion de lait contaminé. Le lait
a été historiquement le moyen de dissémination principal du bacille car la mise en place d’une
politique de pasteurisation obligatoire a permis une diminution de la prévalence de la
tuberculose dans les pays développés. Le lait constitue un vecteur idéal pour M. bovis car ce
dernier peut former une émulsion avec les graisses, facilitant ainsi sa migration à travers le
mucus et le tissu lymphoïde de l’intestin. La consommation de viande contaminée est interdite
dans plusieurs pays développés, bien que le danger qu’elle représente soit peu décrit. (35)

La contamination interhumaine par M. bovis est peu documentée. Cependant, en cas


de tuberculose pulmonaire, l’homme peut aussi excréter le bacille par voie aérienne et
potentiellement contaminer d’autres individus ou des animaux. La tuberculose extra-
pulmonaire, quant à elle, évolue habituellement sans être contagieuse à l’exception de ses
formes cutanée et génito-urinaire. (35)

C) Épidémiologie synthétique

1) Modalités de contamination

i) Dans l’espèce bovine

a) Au sein d’un élevage

L’apparition de l’infection tuberculeuse dans un élevage indemne peut se faire selon


trois mécanismes : l’introduction d’un animal infecté ; la présence d’animaux contaminés
dans le voisinage ou encore la résurgence d’un foyer antérieur que l’on croyait assaini.

Figure 9 : Modèle explicatif de l’origine d’un foyer de tuberculose dans un élevage bovin
indemne (d’après (44))

- 44 -
Le premier risque correspond à l’introduction d’un animal infecté dans un élevage
indemne, que se soit à des fins de reproduction, de renouvellement de troupeau ou de mise en
pension transitoire. Dans les pays développés, les documents d’exploitation ainsi que les
passeports accompagnant les animaux permettent de limiter ce risque en témoignant du statut
indemne de tuberculose des élevages d’origine des animaux nouvellement introduits.

Il existe de nombreuses modalités de contamination par le voisinage. Elle peut se faire


par contacts directs entre deux cheptels voisins ou de manière indirecte lors du partage d’une
pâture ou d’un échange de matériel entre deux exploitations. Les autres animaux domestiques
peuvent aussi servir de relais et doivent être pris en compte dans les mesures de gestion d’un
élevage contaminé pour en éradiquer la maladie. Enfin, la faune sauvage peut aussi être une
cause d’infection d’un cheptel par voisinage.

La contamination par résurgence peut survenir lors d’une récidive liée à la persistance
de l’infection à bas bruit suite un épisode de tuberculose, ou bien lors de l’introduction d’un
animal infecté non reconnu comme tel. La résurgence est donc directement liée au phénomène
d’anergie correspondant à l’absence de réaction à la tuberculination d’animaux infectés
chroniques. La tuberculose étant une maladie chronique et insidieuse, les signes cliniques ne
permettent pas de détecter ces individus infectés latents qui peuvent redevenir excréteurs et
propager la maladie dans l’élevage. (44)

L’évolution classique de la tuberculose dans un cheptel sain suite à la contamination


d’un animal se fait à la manière d’une enzootie, compte tenu du délai d’incubation, du
mécanisme de propagation et de la répétition des contaminations dues à la cohabitation. Une
évolution explosive à la manière d’une épizootie reste néanmoins possible en cas de
contamination de plusieurs individus du cheptel par l’intermédiaire d’une source commune
particulièrement contagieuse. (3)

b) À l’échelle des différents pays

Les trois risques vus précédemment n’interviennent pas de la même manière dans
chaque pays selon ses modalités de contrôle de la maladie et la prévalence de cette dernière.

Dans les pays développés, nous avons pu voir que la prévalence de la tuberculose
bovine est faible. Cela s’explique par la mise en application des différentes mesures de
contrôle et d’abattage des bovins infectés, associé à l’élimination des individus ayant été en
contact avec eux. Le risque de voisinage est donc peu élevé dans ce type de pays. Cependant,
la sensibilité du test à la tuberculination est de l’ordre de 0,8 à 0,9. Ainsi, le risque de ne pas
détecter un bovin infecté est de 10 à 20 %. Ceci, ajouté au phénomène d’anergie, explique
pourquoi le risque est essentiellement lié aux introductions d’animaux et à la résurgence dans
les pays où la tuberculose est sporadique.

Dans les pays en voie de développement, la prévalence de M. bovis est généralement


élevée. Les cheptels indemnes ont donc plus de risques d’être en contact avec d’autres
troupeaux contaminés. Ainsi, le risque de voisinage est plus important dans les zones où
l’infection sévit de manière active. (44)

- 45 -
ii) Dans l’espèce humaine

Dans les pays développés où la prévalence de M. bovis est faible, les rares cas de
tuberculose humaine concernent principalement des personnes âgées de plus de 60 ans et des
individus plus jeunes. (45) La localisation essentiellement extra-pulmonaire des lésions chez
les personnes âgées oriente prioritairement vers une contamination digestive ancienne, suivie
d’une réactivation de la maladie. Au contraire, la localisation principalement pulmonaire de la
tuberculose dans les tranches d’âge plus jeunes indique plutôt une contamination par voie
respiratoire. L’ensemble de ces éléments valide indirectement l’efficacité des mesures de
contrôle et de prévention de la maladie dans les pays développés. En effet, la contamination
digestive par M. bovis a pu être supprimée dans ces pays grâce à la mise en place des mesures
de pasteurisation systématique du lait et de contrôle des carcasses à l’abattoir. La voie
aérienne reste donc la seule voie de contamination pour les personnes plus jeunes à l’heure
actuelle. L’abattage systématique des animaux infectés réduit également la prévalence de la
tuberculose bovine dans les cheptels et par conséquent les risques de contamination directe de
l’homme par le bétail. Ainsi, la transmission interhumaine de M. bovis semble actuellement
représenter un enjeu plus important et pourrait devenir l’objet de recherches plus poussées à
l’avenir. (40)
Dans les pays en voie de développement où la tuberculose bovine n’est pas contrôlée,
une partie des cas humains concernent des individus jeunes ayant ingéré ou manipulé du lait
contaminé. Ainsi, la tuberculose extra-pulmonaire est assez courante dans ces pays.
Néanmoins, les personnes en contact direct avec le bétail ou du lait contaminé peuvent être
infectées par voie aérienne, qui reste la voie principale de contamination, et ainsi développer
une tuberculose pulmonaire. (45)

2) Facteurs de risque

i) Dans l’espèce bovine

a) A l’échelle de l’individu

Comme vu précédemment, les facteurs de risques existant à l’échelle de l’individu


sont ceux influençant le pouvoir pathogène de M. bovis. Ainsi les animaux âgés,
immunodéprimés ou dont l’état général est altéré sont plus à risque que les autres car moins
susceptibles de se défendre en cas de contamination. Néanmoins, les facteurs de risques
individuels ont un faible impact comparativement à ceux pouvant agir à l’échelle d’un
cheptel.

b) A l’échelle d’un troupeau

Au niveau d’un troupeau, il faut tout d’abord prendre en compte l’historique de


l’élevage vis-à-vis de la tuberculose dans les facteurs de risque. Un cheptel sera plus à même
d’être à nouveau infecté s’il a déjà été contaminé par le passé. En effet, un tel élevage possède
nécessairement un ensemble de caractéristiques épidémiologiques associées à plusieurs
facteurs de risque ayant entraîné l’infection. De plus, cette dernière peut réapparaître à cause
du phénomène de résurgence décrit précédemment.
La conduite d’élevage est reconnue comme étant le facteur de risque principal vis-à-
vis de la tuberculose, car elle conditionne un grand nombre d’éléments ayant un impact
majeur sur le risque d’infection. Ces éléments constituent pour la plupart une application
pratique des trois risques de contamination par la tuberculose d’un élevage sain ;
l’introduction, le voisinage et la résurgence ; décrits dans la partie II.C.1.i.a.

- 46 -
La taille des cheptels est un facteur de risque bien identifié vis-à-vis de l’infection par
M. bovis car la présence d’un grand nombre d’animaux augmente la probabilité qu’au moins
un individu se contamine. La forte densité d’un élevage favorise la transmission par les
aérosols en augmentant les contacts entre animaux et peut être à l’origine d’un stress étant un
facteur de risque individuel de contamination. La vie en pâturage conduit à l’augmentation du
risque de voisinage avec les autres élevages, notamment en cas de proximité géographique.
Elle laisse aussi la possibilité de création d’un réservoir de M. bovis au sein de la faune
sauvage (sangliers, cerfs, blaireaux...). Le mode de distribution de l’alimentation ainsi que le
lieu de stockage des aliments doivent aussi être pensés afin d’en limiter l’accès aux animaux
sauvage pouvant être infectés. (3)
Le taux de réforme, c’est à dire le nombre de femelles reproductrices envoyées à
l’abattoir chaque année pour renouveler le troupeau, est variable d’un élevage à un autre. Plus
celui-ci est bas, moins le renouvellement du cheptel est rapide, ce qui est favorable à la
persistance et au développement de la tuberculose, qui est une maladie d’installation
chronique. Le temps passé dans l’élevage augmente le risque de pouvoir entrer en contact
avec M. bovis et en cas de contamination latente de certains individus, permet une résurgence
de la maladie. Un taux de réforme trop élevé est aussi un facteur de risque important car il
favorise les mouvements d’animaux dans l’élevage et donc la possibilité d’introduction de la
maladie. La pratique de la monte naturelle, par opposition avec l’insémination artificielle,
occasionne aussi de multiples échanges d’animaux entre élevages et augmente de ce fait le
risque d’introduction de M. bovis. (42) Enfin, le prêt ou la mise en commun de matériel
agricole et de pâtures sont des conduites à risque vis-à-vis de la transmission de la maladie.

ii) Dans l’espèce humaine

Un des principaux facteurs de risque de contamination humaine par M. bovis dans les
pays en développement est la forte prévalence de tuberculose bovine. En outre,
respectivement 65 %, 70 % et 26 % de la population africaine, asiatique et latino-américaine
travaille dans l’agriculture et présente donc un risque accru vis-à-vis de la tuberculose. Le
contact physique étroit avec des animaux infectés, notamment dans certaines communautés,
constitue lui aussi un important facteur de risque dans ces pays où la tuberculose bovine est
largement répandue. Par exemple, dans certains pays d’Afrique, les bovins font partie
intégrante de la vie sociale humaine et se retrouvent au centre de nombreux événements, et
par conséquent de rassemblements.
L’absence de bonnes pratiques d’hygiène alimentaire est un facteur de risque
supplémentaire dans de nombreux pays en développement. Dans tous les pays d’Afrique
subsaharienne, il existe de grandes entreprises publiques de transformation et de
commercialisation du lait respectant les normes d’hygiène. Cependant, elles sont
concurrencées activement par le secteur informel. Ce dernier correspond à l’ensemble des
activités productrices de biens et de services échappant au regard et à la régulation de l’État ;
et dans le cas de la commercialisation du lait ; pouvant ignorer les normes d’hygiène et de
qualité.
L’infection par le VIH augmente le risque de développer la tuberculose. En effet, 90 %
des individus nouvellement contaminés par M. bovis sans être infectés par le VIH ne
développent pas de tuberculose car leurs défenses immunitaires sont suffisamment efficaces
pour éviter le passage à la maladie active suite à l’infection. En revanche, les personnes
infectées par les deux agents pathogènes ont un risque annuel de développer la maladie
augmenté de 5 % à 15 %, en fonction de l’avancement de leur immunosuppression. (45)

- 47 -
Nous avons pu voir que M. bovis appartient au Complexe Mycobacterium
Tuberculosis regroupant les bactéries tuberculeuses. La composition particulière de leur paroi
leur confère, entre autres, une bonne résistance aux agents physico-chimiques. Parmi les
mycobactéries, M. bovis possède le spectre d’hôte le plus large et peut donc infecter un grand
nombre d’espèces de mammifères. Nous avons ensuite étudié la distribution mondiale de M.
bovis et constaté qu’elle est assez similaire chez les bovins et l’Homme, avec une forte
prévalence dans les pays en voie de développement où les mesures de contrôle de la maladie
sont absentes ou insuffisantes. Les modalités de contamination restent variées mais la
transmission de la maladie à d’autres individus (bovins et Hommes) par voie respiratoire à
partir de bovins infectés reste la plus répandue à l’échelle mondiale. Nous allons maintenant
aborder la pathologie de la tuberculose à M. bovis. Nous nous pencherons d’abord sur la
primo-infection, en détaillant les différents mécanismes mis en jeu et les réactions
immunitaires associées. Nous nous intéresserons ensuite à la tuberculose pulmonaire et ses
différentes formes de généralisation, avec les différentes lésions macroscopiques engendrées.

- 48 -
DEUXIÈME PARTIE :

LA PATHOLOGIE

- 49 -
- 50 -
I) Formation du complexe primaire et réactions immunitaires

Lors de la primo-infection, la réponse immunitaire de l’hôte et les mécanismes de


survie mis en œuvre par M. bovis sont similaires chez les bovins et chez l’Homme. (46) De
plus, la pathogénie de l’infection et de la maladie causée par M. bovis et M. tuberculosis étant
globalement similaires, la plupart des propriétés permettant à ces deux espèces d’infecter, de
survivre et de provoquer la maladie chez leur hôte sont identiques elles aussi. Le support
génétique à l’origine de ces propriétés communes est ainsi porté par des gènes de virulence,
dont la plupart sont identiques chez les deux espèces. (47)

A) L’infection initiale

1) Le complexe primaire

Lors de la primo-infection, il y a formation de ce qu’on appelle le complexe primaire.


Dans la partie 1, nous avons pu voir qu’il existait plusieurs voies de contamination possibles
pour M. bovis. Sa pénétration à travers les muqueuses ou les espaces alvéolaires conduit à la
reconnaissance par le système immunitaire des composants de sa paroi bactérienne, ce qui
initie une réponse inflammatoire locale. Les mycobactéries sont alors phagocytées par les
macrophages qui se mettent à produire des cytokines et des chimiokines pro-inflammatoires,
entraînant le recrutement d’un plus grand nombre de leucocytes au niveau du site d’infection.
Les neutrophiles sont les premières cellules recrutées lors de l’infection par les mycobactéries
tuberculeuses. Ils sont capables de produire de nombreuses molécules microbicides telles que
des espèces réactives de l’oxygène (ROS pour Reactive Oxygene Species) et réactives de
l’azote (RNS pour Reactive Nitrogen Species) ainsi que des peptides antimicrobiens. (48)

Si cette réaction immunitaire initiale ne parvient pas à éliminer les mycobactéries, une
partie se multiplie localement dans les cellules phagocytaires. Il se forme ainsi en 8 à 15 jours
une lésion inflammatoire appelée chancre d’inoculation. (3) À la faveur du drainage
lymphatique, les macrophages infectés migrent jusqu’au le ganglion lymphatique local où la
réponse immunitaire Th1 cellulaire est initiée par recrutement et interaction avec les cellules
de l’immunité innée et acquise. (46) Une deuxième infection se met alors en place au niveau
du ganglion et forme avec la première le complexe primaire, ou complexe de Ghon. Ce
complexe sera qualifié de complet si les deux zones d’infection sont lésées et d’incomplet si
la lésion au niveau du site d’entrée est absente. Le complexe primaire est le plus souvent
retrouvé dans les voies respiratoires basses chez les ruminants. La lésion initiale est souvent
absente ou si petite qu’elle n’est pas retrouvée si elle n’est pas soigneusement recherchée à
l’autopsie ou à l’abattoir. (49)

2) Lésions associées au complexe primaire

La lésion typique associée au complexe primaire est le tubercule, ou granulome, qui se


présente sous la forme d’un nodule jaunâtre granulomateux circonscrit, d’environ 2 à 20 mm
de diamètre, plus ou moins encapsulé par le tissu conjonctif. (49) Histologiquement, les petits
granulomes sont formés de plusieurs macrophages infectés au centre, entourés par des
macrophages épithélioïdes, des cellules spumeuses et occasionnellement des cellules géantes
multinucléés de type Langhans. L’ensemble est associé à un recrutement périphérique de
lymphocytes. Progressivement, la prolifération de fibroblastes induite par les cytokines et la
présence de tissu fibreux pré-existant entraîne la formation d’une capsule de tissu conjonctif
plus ou moins complète autour de cette structure. (48)

- 51 -
Figure 10 : Structure et constituants cellulaires d’un granulome tuberculeux (50)

Les macrophages épithélioïdes possèdent des membranes cellulaires étroitement


interdigitées les rendant adhérents aux cellules adjacentes suite à une transformation
spécialisée. Ces macrophages peuvent être phagocytaires même si dans la plupart des cas ils
ne contiennent pas de bactéries. Les macrophages présents dans le granulome peuvent aussi se
différencier en cellules spumeuses caractérisées par l’accumulation de lipides dans leur
cytoplasme. Ces cellules sont fréquemment retrouvées à la jonction avec le centre nécrotique
du granulome. (50) Les macrophages spumeux deviennent prédominants dans les cas de
tuberculose avancés et sont produits sous l’effet des acides mycoliques mycobactériens
oxygénés. Ces cellules constituent un réservoir idéal pour la persistance des bacilles au sein
de l’organisme, étant riches en nutriments et possédant une activité microbicide et
phagocytaire réduite. Les cellules géantes multinucléées de type Langhans sont quant à elles
le résultat de de la fusion de macrophages épithélioïdes sous l’action de composants pariétaux
des mycobactéries, et sont reconnaissables à la disposition particulière périphérique de leurs
noyaux selon un modèle de fer à cheval. (48) Beaucoup d’autres types de cellules sont
retrouvés dans les granulomes comme les cellules tueuses NK (NK pour Natural Killer), les
fibroblastes ou encore les cellules dendritiques. (50)
La formation du granulome découle de l’équilibre se mettant en place entre les
mécanismes de défense de l’hôte face à l’infection et la capacité des mycobactéries
tuberculeuses à y échapper. Leur capacité à survivre dans les macrophages et dans le milieu
extracellulaire au sein du granulome est à l’origine de la persistance d’antigènes et de lipides
immunostimulateurs, conduisant à une hypersensibilité retardée permanente. Ainsi, au fil du
temps, la taille du granulome va augmenter et son centre va subir une nécrose dont
l’apparence caséeuse est due à la teneur élevée en lipides et en protéines provenant des
macrophages lysés. (48) Cette nécrose caséeuse apparaît à l’histologie comme du matériel
éosinophilique amorphe avec des débris cellulaires, et est souvent associée à une
minéralisation centrale. (49)

- 52 -
Le granulome organisé avec un centre nécrosé entouré de cellules géantes de Langhans et la
présence de lymphocytes et de fibres en périphérie est appelé follicule de Koëster. (51)

Figure 11 : Granulome tuberculeux en coupe histologique (d’après (52) et (53))

(coloration hématoxyline et éosine)

La notion de confinement de l’infection au sein des granulomes est assez répandue


dans la littérature. Néanmoins, une étude utilisant comme modèle le poisson zèbre (Danio
rerio), chez qui il est possible de visualiser les événements cellulaires au niveau de l’ensemble
de l’animal, a permis d’émettre de nouvelles hypothèses. Chez cet animal, la formation de
granulomes coïncide avec une accélération de la multiplication bactérienne. De plus, l’analyse
répétée des modes de propagation de l’infection au sein de larves de poissons zèbres suggère
une forte implication du granulome primaire. En effet, certains macrophages infectés
provenant du granulome primaire participeraient, par dissémination hématogène, au
développement de granulomes secondaires dans d’autres sites éloignés. Plusieurs mécanismes
inhérents à la formation du granulome primaire restent néanmoins nécessaires au contrôle de
la dissémination de la bactérie chez son hôte, comme par exemple la mort cellulaire de
macrophages infectés. L’inhibition complète de la formation du granulome primaire ne
semble donc pas être la manière la plus optimale de contrôler l’infection. (50)

- 53 -
B) Mécanismes mis en jeu durant l’infection à M. bovis

1) Le rôle des macrophages

La persistance de M. bovis chez son hôte découle de sa capacité à infecter, persister et


se multiplier dans ses macrophages. (46) La reconnaissance des mycobactéries par les
macrophages se fait par interaction entre les motifs moléculaires associés aux pathogènes
(PAMP pour Pathogen Associated Patterns) mycobactériens ; tels que les lipopolysaccharides
ou les lipoarabinomannanes ; et les récepteurs de reconnaissance de motifs moléculaires (PRR
pour Pathogen Recognition Receptors) tels que les récepteurs de type Toll (TLR pour Toll like
receptors) exprimés à la surface des macrophages. (46) La reconnaissance des PAMP par les
PRR entraîne l’activation du facteur de transcription NF-κB responsable de la production
endogène de cytokines et chimiokines par les macrophages. (54) Ces dernières favorisent une
réponse immunitaire de type Th1 cellulaire caractérisée par la libération d’interféron gamma
(IFN-γ) pro-inflammatoire, principalement à partir de lymphocytes T CD4 (LT CD4), ainsi
que la lyse des macrophages infectés et des bacilles extracellulaires par l’action des perforines
et des granzymes produites par les lymphocytes T CD8 (LT CD8) cytotoxiques. L’IFN-γ
stimule une activité microbicide dans les macrophages infectés et accélère l’expression des
molécules de classe I et II du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) sur la surface des
macrophages, nécessaires à la présentation des antigènes mycobactériens respectivement aux
LT CD8 et aux LT CD4. Ces mécanismes peuvent conduire soit à la destruction immédiate de
l’agent pathogène, soit au confinement de l’infection par la formation de granulomes. (46)

Figure 12 : Schéma simplifié de la réponse immunitaire induite lors d’une infection par
les mycobactéries (d’après (46), (54) et (55))

- 54 -
2) La sécrétion des cytokines

Les cytokines servent de médiateurs permettant la coordination entre les cellules du


système immunitaire inné et acquis. Nous avons déjà pu voir que l’IFN-γ occupait une place
centrale dans la réponse immunitaire aux mycobactéries. Il permet notamment d’activer la
production de ROS et de RNS microbicides et de stimuler la production des molécules du
CMH de type I et II. Cette cytokine est principalement sécrétée par les LT CD4 mais aussi par
les LT CD8, les cellules tueuses NK et dans une moindre mesure par les lymphocytes B. (48)

Après la phagocytose de mycobactéries tuberculeuses, les macrophages sont stimulés


par la liaison entre les PAMP et leur TLR et commencent à sécréter des cytokines pro-
inflammatoires telles que l’interleukine (IL) 1, l’IL-6, l’IL-12 ou encore le TNF-α (TNF pour
Tumor Necrosis Factor).
Le TNF-α est une cytokine essentielle dans l’infection par M. bovis. En effet, il peut
stimuler la production de ROS et de RNS par les neutrophiles et les macrophages, et favoriser
leur apoptose, entraînant la destruction de certains bacilles phagocytés. Il possède également
un rôle dans la formation du granulome organisé en activant le recrutement des leucocytes.
L’IL-1, tout comme le TNF-α, agit de manière paracrine et autocrine, et intervient dans
la formation du granulome. Il peut stimuler la production de TNF- α et d’IL-6 par les
macrophages et celle d’IL-2 par les lymphocytes T augmentant ainsi leur prolifération.
L’IL-12 est une cytokine importante induisant la différenciation des lymphocytes Th1
et favorisant la production d’FN-γ. Elle permet aussi d’activer la prolifération des cellules
tueuses NK et des LT CD8 cytotoxiques. (48)

Certaines cytokines ont en revanche des effets délétères dans le contrôle de la


tuberculose, comme par exemple l’IL-10 et le TGF-β (TGF pour Transforming Growth
Factor) inhibant les réponses immunitaires Th1. Elles favorisent donc le passage de
l’infection à la maladie. Un nombre plus élevé de cellules T régulatrices produisant ces
cytokines sont retrouvées dans le sang périphérique des patients en phase de tuberculose
active. Le TGF-β est également associé à la fibrose lors des infections chroniques par les
bacilles tuberculeux. (48)

C) Les mécanismes d’échappement au système immunitaire

Les mycobactéries pathogènes ont développé une gamme variée de mécanismes qui
facilitent leur survie et leur multiplication au sein des macrophages : la prévention de la fusion
entre le phagosome et les lysosomes, l’inhibition de l’apoptose et la suppression des
mécanismes de présentation et signalisation des antigènes dans les macrophages. (46)

1) Inhibition de la lyse par les macrophages

Le processus de phagocytose par un macrophage commence par l’internalisation des


bactéries par endocytose, formant ainsi un phagosome. Les lysosomes présents dans le
macrophage peuvent ensuite fusionner avec le phagosome pour former un phagolysosome où
les bactéries sont détruites par les lysozymes et autres enzymes lysosomiales. Il a été mis en
évidence que lors des premiers jours d’infection, les mycobactéries tuberculeuses étaient
viables au sein des phagosomes. Ces derniers ne présentaient alors aucun signe de fusion avec
les lysosomes. (56) L’inhibition de cette fusion est un processus actif car la phagocytose de
mycobactéries tuberculeuses préalablement tuées aboutit à la formation d’un phagolysosome.
(48)

- 55 -
Expérimentalement, des bacilles tuberculeux traités avec du sérum de lapins immunisés
contre le BCG ont été introduits dans des macrophages de souris pour étudier la formation
d’un phagolysosome ou son absence. Il est alors apparu que la fusion entre le phagosome et le
lysosome était favorisée après ce traitement. Il a aussi été démontré au cours de cette étude
que l’exposition des bacilles tuberculeux à un sérum immun spécifique ne réduisait pas leur
virulence et leur viabilité. Ainsi, il a été suggéré que la liaison spécifique des anticorps sur ces
bacilles les empêchait d’inhiber la formation d’un phagolysosome. (56) Cette inhibition a pu
être attribuée à deux composants de la paroi des mycobactéries : le lipoarabinomannane et le
tréhalose dimycolate. (48)

Les mycobactéries tuberculeuses sont aussi capables d’induire la sécrétion d’IL-10 par
les monocytes et les macrophages. L’IL-10 inhibe la maturation des phagosomes nécessaire à
la destruction de l’agent pathogène. Ainsi, sa production lors des infections mycobactériennes
favorise aussi la survie des bacilles au sein des macrophages. (57)

2) Modification des mécanismes de mort cellulaire

Il existe deux modalités de mort cellulaire : la nécrose, aboutissant à la lyse de la


cellule, et l’apoptose, une forme de mort sans libération du contenu cellulaire dans l’espace
péri-cellulaire. Le fait que les macrophages infectés par des souches de mycobactéries
virulentes subissent une nécrose et que ceux infectés par des souches mutantes atténuées
s’orientent plutôt vers une apoptose suggère une inhibition de cette dernière par les souches
virulentes. Il a été démontré que pendant l’infection mycobactérienne, la mort cellulaire est
régulée par deux molécules appartenant aux eicosanoïdes : la prostaglandine E2 (PGE2) pro-
apoptotique et la lipoxine A4 (LXA4) pro-nécrotique. Ainsi, l’équilibre de production entre
ces deux eicosanoïdes détermine la modalité de mortalité des macrophages infectés par des
mycobactéries. Or, ces dernières stimulent la production de LXA4 et inhibent celle de PGE2,
induisant par conséquent la nécrose des macrophages infectés plutôt que leur apoptose. La
nécrose permet aux bactéries de sortir du macrophage et de se multiplier dans le milieu
extracellulaire, alors que l’apoptose est associée à une diminution de la viabilité des agents
pathogènes. Ainsi, l’induction d’une nécrose par les mycobactéries est favorable à leur survie
chez l’hôte. (58)

Figure 13 : Les deux modalités de mort cellulaire des macrophages et leurs conséquences
sur la multiplication des mycobactéries chez l’hôte (50)

- 56 -
La présence de lésions de la membrane interne des mitochondries des macrophages
peut conduire à leur nécrose. Un mécanisme hautement conservé dépendant de l’exocytose
d’endomembranes dérivées des lysosomes et de l’appareil de Golgi est alors rapidement mis
en place et permet de les réparer. Contrairement aux souches atténuées de mycobactéries, les
souches virulentes sont capables de déréguler cette réparation. Dans de telles conditions, les
lésions de la membrane interne des mitochondries ne sont plus réparées, ce qui provoque une
nécrose des macrophages. (58)

Les mycobactéries pathogènes activent donc la nécrose des macrophages en régulant


la production d’eicosanoïdes et en inhibant les réparations membranaires mitochondriales.
Ces mécanismes permettent donc à M. bovis de se soustraire à l’apoptose et favorisent ainsi sa
diffusion à d'autres cellules. (46)

3) Subversion de la signalisation cellulaire

L’apprêtement de l’antigène est un processus faisant intervenir sa protéolyse, suivie de


l’association des fragments générés à des molécules du CMH, puis à l’expression des
complexes peptide-CMH à la surface des cellules. Les CMH assurent ensuite la présentation
des antigènes aux lymphocytes T afin de les activer et possèdent donc un rôle clef dans la
communication entre les différentes cellules intervenant dans l’immunité cellulaire. Toutes les
cellules nucléées expriment le CMH de classe I alors que seul un groupe restreint de cellules
comme les cellules dendritiques et les macrophages expriment le CMH de type II. (59) Il a pu
être mis en évidence que les mycobactéries étaient capables d’inhiber l’apprêtement des
antigènes pour les CMH de classe I et II et donc de limiter la présence de complexes peptide-
CMH à la surface des cellules. L’activation des lymphocytes T est ainsi inhibée, permettant
aux mycobactéries tuberculeuses d’échapper aux réponses immunitaires de l’hôte. (60)

4) Modification de l’expression de différents gènes

Plusieurs modifications dans les niveaux d’expression de certains gènes par les
macrophages ont pu être observées lorsqu’ils sont infectés par M. bovis. Nous avons déjà pu
voir que les mycobactéries pouvaient inhiber la synthèse de PGE2 et activer celle de LXA4 et
d’IL-10. C’est aussi le cas avec des gènes comme IFIT1, IFIT2, MX1 et MX2, nécessaires à la
synthèse d’IFN de type I et de type II, qui sont activés lors d’une infection par M. bovis.
L’utilisation d’un modèle murin a permis d’objectiver le fait que l’IFN de type I
favoriserait la progression de la maladie. À l’inverse, l’expression des gènes IL1A et IL1B,
responsables de la synthèse d’IL-1, est inhibée lors d’une infection par M. bovis. Or, les souris
déficientes en IL-1 sont plus sensibles aux mycobactéries virulentes. De plus, il a été montré
expérimentalement que l’induction de la production d’IFN de type I inhibe la sécrétion d’IL-
1. Ainsi, l’activation de l’expression des gènes codant pour l’IFN de type I et l’inhibition
concomitante de ceux responsables de la synthèse d’IL-1 lors de l’infection par M. bovis
suggère que la modification de l’expression génique est aussi impliquée dans les différentes
stratégies d’échappement au système immunitaire. (46)

La figure 13 regroupe l’ensemble des mécanismes mis en œuvre par les mycobactéries
pour échapper au système immunitaire développés jusqu’à présent.

- 57 -
Figure 14 : Schéma récapitulatif des principaux mécanismes d’échappement au système
immunitaire mis en œuvre par les mycobactéries (d’après (55))

5) Les facteurs de virulence de M. bovis

La virulence des bacilles tuberculeux est directement liée à un ensemble de


composants et de caractéristiques qui leur est propre, permettant l’invasion, leur survie et leur
réplication au sein des macrophages. Les facteurs de virulence sont soit des constituants
pariétaux, soit des protéines sécrétées par les bacilles. (46)

i) Les différentes étapes de l’étude des facteurs de virulence

Il est parfois difficile de démontrer la virulence d’un gène, en particulier car cette
démonstration nécessite l’accomplissement des postulats moléculaires de Koch correspondant
à quatre étapes distinctes. Tout d’abord, il est nécessaire de montrer que ce gène, codant pour
l’expression d’un facteur de virulence ou régulant sa production ou son exportation, est actif
chez les souches virulentes. Deuxièmement, l’agent pathogène doit perdre sa virulence
lorsque ce gène est inactivé. Troisièmement, l’introduction de ce gène cloné dans une souche
avirulente doit lui rendre sa virulence. Quatrièmement, ce gène doit être exprimé au moment
de l’infection. Il est pourtant parfois difficile de satisfaire toutes ces exigences dans certains
cas. Par exemple, lorsque les mutations de quelques gènes séparés ont les mêmes effets sur la
virulence, il peut être difficile d'identifier lesquels contribuent le plus à cette dernière. En
effet, dans ce cas de figure, la complémentation avec un seul gène ne restaurera le plus
souvent pas la virulence car la mutation produite dans un gène peut avoir des effets polaires
sur les gènes voisins, provoquant ainsi un arrêt ou une diminution de leur transcription. (47)

- 58 -
ii) Le locus RD1

a) Organisation génétique du locus RD1

La comparaison génomique de M. bovis BCG avec des souches mycobactériennes


virulentes a révélé la suppression de plusieurs gènes codant pour des cadres de lecture ouverts
(ORF pour Open Reading Frame) de son génome. Un ORF correspond à une suite de triplets
de nucléotides sur un ARN messager pouvant être traduit en une protéine ou un peptide. Les
produits de la traduction de ces ORF jouent un rôle critique dans la virulence des
mycobactéries et sont essentiels pour l’établissement d’une immunité protectrice chez l’hôte.
Les rapports basés sur des comparaisons génomiques de M. bovis, M. tuberculosis et M. bovis
BCG ont permis de mettre en évidence la délétion de 129 ORF dans le cas du BCG. Ces
délétions résultent des multiples passages in vitro de M. bovis ayant donnés à long terme le
BCG. Ces régions du génome de M. bovis BCG manquantes sont communément appelées
régions de différence (RD pour Region of Difference). (61)

RD1 est la région de différence la plus critique dans la virulence des souches
pathogènes. RD1 comprend 9 ORF (Rv3871 à Rv3879) dans un segment long de 9454 pb, et
est absent de toutes les souches BCG. (61) Il contient des gènes codant pour l’appareil de
sécrétion ESX-1 (ESAT-6 secretion system 1) responsable de l’exportation de deux puissants
antigènes et facteurs de virulence : CFP-10 (Culture Filtrate Protein 10 kDa) et ESAT-6
(Early Secretory Antigenic Target 6 kDa). (46) La suppression de RD1 à partir de souches
virulentes de M. tuberculosis conduit à une diminution de leur croissance ainsi qu’à
l'atténuation de leur virulence in vivo, entraînant une pathogénie de la maladie similaire à celle
du BCG. (61)

Les gènes Rv3874 et Rv3875 font partie du même opéron et codent respectivement
pour les protéines CFP-10 et ESAT-6 respectivement. Elles forment ensuite un hétérodimère
sous l’effet de la protéine ATP dépendante, ayant une activité chaperonne, codée par le gène
Rv3868. Les mycobactéries possédant des altérations de leur système d’excrétion d’ESAT-6 et
de CFP-10 présentent des défauts de croissance et une virulence altérée chez leur hôte. Elles
ne parviennent pas non plus à se reproduire dans les macrophages infectés in vitro et ne
peuvent pas bloquer les réponses inflammatoires induites au sein de ces derniers. Ainsi, cela
suggère que le système de sécrétion ESX-1 joue un rôle important dans la subversion des
réponses immunitaires réalisées par les macrophages. (61)

Figure 15 : Diagramme de la région RD1 de M. tuberculosis (d’après (61) et (62))

Les flèches montrent la direction transcriptionnelle des gènes. Les loci des gènes Rv3874 et 3875
codent respectivement pour CFP-10 et ESAT-6.

- 59 -
b) Rôle du dimère ESAT-6/CFP-10 dans les interactions avec l’hôte

Les molécules codées par RD1 jouent divers rôles dans la pathogénie de la
tuberculose, notamment dans la formation de granulomes, l'inhibition de la maturation du
phagosome et la migration des bactéries du phagosome vers le cytosol. Elles sont aussi
capables d’inhiber la production de ROS, qui ne peuvent donc pas activer le facteur de
transcription NF-κB responsable de la sécrétion de cytokines intervenant dans l’activation des
cellules immunitaires telles que les cellules dendritiques et les lymphocytes T. La protéine
ESAT-6 est aussi capable d’interagir avec les récepteurs TLR 2 intervenant dans l’expression
des molécules composant le CMH de type II. Par conséquent, elle interfère avec la
présentation des antigènes mycobactériens aux cellules T CD4. (61)

c) La régulation des micro-ARN par ESAT-6/CFP-10

Les micro-ARN sont des régulateurs endogènes de l’expression des gènes. Ce sont de
petits ARN non codants de 18 à 25 nucléotides capables bloquer la traduction de leurs ARN
messagers cibles. Les micro-ARN régulent la différenciation et l’activation des monocytes et
des granulocytes et sont impliqués dans les réponses inflammatoires et la régulation de
l’immunité innée et acquise. Il a été clairement démontré que M. bovis activait la production
du micro-ARN miR29 par le biais de la protéine ESAT-6, inhibant ainsi la sécrétion d’IFN-γ
chez la souris. De même, la production de miR146a est activée dans les cellules dendritiques
par M. bovis. Ce micro-ARN est capable de supprimer l’activité du facteur de transcription
NF-κB et ainsi d’inhiber la synthèse de plusieurs cytokines telles que l’IL-6, l’IL-8, l’IL-1 et
le TNF-α. Or les animaux déficients en IL-6 sont hyper sensibles à l’infection par les bacilles
tuberculeux. Plusieurs micro-ARN contrôlant la production d’IL-6, comme par exemple
miR155, voient leur production régulée par ESAT-6. Ce mécanisme apparaît donc comme une
stratégie de survie supplémentaire développée par les mycobactéries tuberculeuses. (61)

iii) Les autres facteurs de virulence

Il existe de nombreux facteurs de virulence différents qui peuvent se regrouper en


deux catégories : les protéines synthétisées et les constituants pariétaux. Les principaux
facteurs de virulence sont listés dans le tableau V.

- 60 -
Tableau V : Liste des principaux facteurs de virulence des mycobactéries tuberculeuses
(d’après (48))

Facteur de virulence (gène) Mécanisme


Protéines
- Active la formation de granulome
- Inhibe de la maturation du phagosome
ESAT-6 (Rv3875) / CFP-10 (Rv3874) - Diminue la production de ROS
- Bloque les récepteurs TLR 2
- Diminue la production d’IL-6 et d’IFN- γ
- Permet la liaison avec les macrophages
Antigen 85 complex (fbpA, fbpB, fbpC)
- Propriétés antigéniques
- Permet la croissance au sein des cellules de
Erp (erp)
l’hôte
- Système majeur d’absorption du cholestérol
Transporteur du cholestérol (Mce4) - Permet la survie lors de la phase chronique de
la maladie
Support enzymatique et lipidique (Igr - Permet le métabolisme du cholestérol
locus) - Permet la croissance de la bactérie
- Permet l’utilisation des acides gras comme
principale source de carbone
Isocitrate lyase (Icl I)
- Permet la survie lors de la phase chronique de
la maladie
Oxyde nitrique réductase (noxR3) - Protection contre les RNS
Composants de la paroi bactérienne
- Induit la production d’IL-10
- Bloque la transcription de gènes inductibles
par l’IFN- γ
Lipoarabinomannane
- Inhibe la fusion phagosome/lysosome
- Inhibe la maturation des cellules dendritiques
- Protège contre les ROS et les RNS
- Active la formation de granulome
Acides mycoliques - Permet la survie de la bactérien
- Permet la formation d’un biofilm
Glycopeptidolipides - Permet la formation d’un biofilm
- Active la formation de granulome
- Inhibe la fusion phagosome/lysosome
Tréhalose dimycolate - Provoque des lésions de la membrane
cellulaire et des mitochondries
- Pro-inflammatoire
Glycolipides phénoliques - Immunosuppresseur
- Augmente l’infectiosité dans les macrophages
Sulfolipides
- Inhibe la maturation du phagosome

- 61 -
D) Réponses immunitaires associées

1) La réponse Th2 humorale

Si les mycobactéries tuberculeuses parviennent à survivre au sein de l’hôte malgré la


mise en place de la réponse immunitaire cellulaire (CMI pour Cell Mediated Immunity) Th1,
les antigènes sécrétés ou les produits de la lyse bactérienne sont présentés aux cellules T,
initiant une réponse immunitaire humorale Th2 acquise. Les lymphocytes T activés se
différencient puis une multiplication clonale à la base de la mémoire immunologique se met
en place. (27) La production d’anticorps (principalement des immunoglobulines G et M (63))
se développe généralement dans les stades les plus avancés de la tuberculose bovine et est
souvent associée à une progression de la maladie. (3)

Figure 16 : Représentation schématique des réponses immunitaires chez les bovins suite
à une infection par M. bovis (27)

Comme nous pouvons le voir sur la figure 15, les réponses immunitaires à médiation
cellulaire (CMI) se développent dès le début de l’infection. La production des anticorps
humoraux n’apparaît que tardivement, de manière presque concomitante avec l’apparition des
signes cliniques et l’augmentation de la charge bactérienne (de gauche à droite sur la figure
15). (27)

Nous avons vu que les lymphocytes T CD4 jouent un rôle majeur dans la résistance de
l’hôte contre la tuberculose en reconnaissant les antigènes protéiques présentés par les CMH
de type II. Les cellules responsables de la réponse immunitaire Th1 cellulaire produisent de
l’IFN-γ et du TNF-α, alors que les cellules Th2 responsables de l’immunité humorale
secrètent de l’IL-4, de l’IL-5 et de l’IL-13. Expérimentalement, des souris dépourvues d’IFN-
γ présentent une sensibilité accrue à la tuberculose tandis que celles ne produisant pas d’IL-4
y sont plus résistantes.

- 62 -
Un moyen efficace de prévenir l’apparition de la maladie consisterait donc à moduler la
production de certaines interleukines de la réponse immunitaire humorale comme l’IL-4 pour
promouvoir une réponse immunitaire cellulaire. (61) La réponse immunitaire humorale
semble néanmoins impliquée dans le contrôle de la maladie. Expérimentalement, les souris
déficientes en cellules B, et donc en anticorps, présentent une charge bactérienne plus élevée
et des lésions pulmonaires exacerbées par rapport aux autres. De même, l’immunisation
passive de souris grâce au sérum d’individus traités avec des extraits de M. tuberculosis
permet une diminution du nombre de bacilles dans les poumons et une baisse de l’étendue de
l’infiltration granulomateuse. Les mycobactéries opsonisées par des anticorps sont plus
efficacement internalisées et tuées par les macrophages, et l'apprêtement de l’antigène est
facilité. Il est intéressant de noter que bien que la production d’anticorps soit généralement
associée à un décalage vers une réponse de type Th2, les anticorps produits suite à
l’exposition au BCG activeraient la production d’IFN-γ dans les LT CD4 et LT CD8
spécifiques des mycobactéries, favorisant ainsi une réponse immunitaire de type Th1. (48)

2) La réaction d’hypersensibilité retardée

i) Les différents types d’hypersensibilité retardée

L’hypersensibilité de type IV de la classification de Gell et Coombs est aussi appelée


hypersensibilité retardée (HSR) car elle se manifeste plusieurs jours après le contact
déclenchant. L’HSR est la seule hypersensibilité à médiation cellulaire et pouvant être
transférée avec les lymphocytes T d’un individu allergique à un individu sain. (64)
Après la pénétration des pathogènes dans l’organisme, les LT CD4 entrant en contact
avec les antigènes se différencient en lymphocytes Th1, qui vont alors commencer à produire
de l’IFN-γ responsable de l’activation des macrophages. L’IL-2 et le TNF-α possèdent eux
aussi un rôle central dans l’HSR car ils induisent respectivement la prolifération des cellules
Th1 et la production d’un plus grand nombre de cytokines pour recruter des leucocytes au
niveau du site de réaction. (48) L’ensemble de ces cytokines entraîne le recrutement et
l‘activation d’un grand nombre de leucocytes localement, à l’origine de l’HSR. Les lésions
retrouvées en cas d’HSR sont essentiellement dues aux cellules T cytotoxiques activées par
les cellules Th1. On peut distinguer trois types d’HSR : l’hypersensibilité de contact,
tuberculinique et granulomateuse. Dans le cadre de la tuberculose, seules les deux dernières
HSR sont rencontrées. (65)
Tableau VI : Les différents types d’hypersensibilité retardée (65)

Présentation Cellules impliquées Localisation


Type d’HSR Délai
clinique (histologie) (type d’antigène)
Lymphocytes et Épidermique
Contact 48 à 72h Eczéma macrophages (produits chimiques,
(œdème de l’épiderme) métaux lourds...)
Lymphocytes,
Induration Intradermique
Tuberculinique 48 à 72h monocytes et
locale (tuberculine)
macrophages
Macrophages Antigène ou corps
21 à 28
Granulomateuse Durcissement épithélioïdes et cellules étranger persistant
jours
géantes (fibrose) (tuberculose, lèpre...)

- 63 -
L’hypersensibilité tuberculinique correspond à une réaction inflammatoire cutanée
caractérisée par une tuméfaction ferme et rouge de la peau apparaissant en 48 à 72 heures.
Cette réaction peut être distinguée d’un œdème par l’absence du signe du godet.
L’hypersensibilité tuberculinique intervient lors de l’injection intradermique de tuberculine
chez un individu infecté par des mycobactéries tuberculeuses (et donc préalablement
sensibilisé à leurs antigènes). La tuberculine contient un ensemble de molécules extraites à
partir d’un filtrat de bacilles tuberculeux, regroupé sous le nom de dérivé protéique purifié
(PPD pour Purified Protein Derivative). L’intradermotuberculination sera développée dans la
partie 3 de cette thèse.

L’hypersensibilité granulomateuse est associée à l’accumulation des macrophages


localement, due à la stimulation permanente par les antigènes, ce qui entraîne la formation
d’un granulome en 21 à 28 jours. Ce type d’HSR est donc le principal mécanisme impliqué
dans la pathogénie de la tuberculose. (66)

ii) Évolution de l’hypersensibilité retardée

La réaction d’HSR se déroule en trois phases. Dans un premier temps, la phase ante-
allergique, d’une durée de 15 jours à 6 mois, correspond au délai entre la pénétration de M.
bovis dans l’organisme et l’apparition de l’HSR. Durant cette période,
l’intradermotuberculination ne permet pas de dépister les individus infectés. Ensuite, la
période allergique se développe en deux à quatre semaines et peut persister pendant quelques
semaines à plusieurs années. L’intensité de l’allergie peut fluctuer en fonction de plusieurs
facteurs d’ordre physiologique (âge, proximité du part pour les femelles gestantes),
pathologique (maladie intercurrente) ou thérapeutique (immunosuppresseurs). Ainsi, certains
individus en période d’allergie peuvent présenter une HSR insuffisante pour être détectée par
intradermotuberculination. La troisième phase de l’HSR correspond à une période dite
d’anergie au cours de laquelle il n’est plus possible de détecter la tuberculose par une méthode
se basant sur l’allergie. Les sujets infectés à un stade avancé de la maladie échappent donc
aux méthodes classiques de dépistage. (3)

3) Le phénomène d’anergie

Dans certains cas, lorsque la maladie est assez avancée, et éventuellement disséminée,
une anergie du système immunitaire peut se mettre en place. Dans ces conditions, aucune
réponse immunitaire cellulaire n’est détectable chez les individus infectés, notamment avec
les tests cutanés. Ils peuvent en revanche posséder un taux d’anticorps circulants élevé. Chez
l’Homme, l’anergie est assez répandue, et le test cutané est négatif chez 25 % des patients
atteints de la maladie active. Le mécanisme de l’anergie liée aux bacilles tuberculeux n’est
pas encore clairement défini. Dans le cas de la tuberculose humaine, les monocytes pourraient
avoir un effet inhibiteur sur les lymphocytes T spécifiques des antigènes mycobactériens. Ces
derniers pourraient ainsi se mettre à produire de l’IL-10 en absence de d’IFN-γ, induisant
alors une anergie du système immunitaire. (27) La présence d’affections concomitantes à la
tuberculose peut aussi expliquer cette d’anergie. C’est le cas notamment pour plusieurs
infections bactériennes ou virales (comme le SIDA, la mononucléose ou la grippe…), ou
encore pour certaines hémopathies malignes. Une anergie iatrogène provoquée par un
traitement immunosuppresseur, une corticothérapie au long cours ou encore une
chimiothérapie anticancéreuse est aussi possible. (67)

- 64 -
E) Le phénomène de latence

Dans l’espèce humaine, nous avons vu que l’immunité initiale permettait de contrôler
l’infection chez 90 % des individus immunocompétents. En effet, les macrophages activés et
les lymphocytes T CD4 spécifiques parviennent le plus souvent à éliminer la bactérie ou à
inhiber sa multiplication et conduire à une tuberculose latente. En l’absence de maladie
progressive, un individu infecté peut dans ce dernier cas rester asymptomatique pendant des
années. Environ 10 % des personnes chez lesquelles l’infection est latente développent une
tuberculose secondaire à un moment de leur vie. Elles représentent jusqu’à 80 % des formes
cliniques dans les pays développés. Une réactivation ou une tuberculose secondaire pourraient
être induites par toute condition affectant le système immunitaire, comme l’infection par le
VIH ou d’autres agents pathogènes, une prise de médicaments immunosuppresseurs ou encore
une dégradation de l’état général due à la vieillesse ou à une malnutrition. Les modalités
exactes de la réactivation ne sont pas encore connues. Deux hypothèses principales semblent
se détacher : soit la réactivation viendrait d’une reprise de la prolifération des bacilles
« latents », soit elle serait due à une réinfection ou à la remise en circulation de bacilles
provenant de sites éloignés de la lésion primaire car les malades restent porteurs de bacilles
tuberculeux, même après une guérison clinique. (48)

La forme la plus fréquente de tuberculose secondaire est habituellement limitée aux


poumons, et les lésions commencent par une bronchopneumonie exsudative et progressent
vers la formation d’un granulome classique, suivie d'une nécrose massive associée à la
formation d’une cavité. Il est intéressant de noter que des tissus à distance des lésions peuvent
être infectés par les mycobactéries tuberculeuses. Presque 15 % des cas de tuberculose
secondaire concernent des sites extra-pulmonaires comme la peau, les organes internes et les
voies génito-urinaires. Chez les individus immunocompétents, la tuberculose secondaire peut
entraîner dans 50 % des cas une dissémination du bacille puis la mort ou dans 25 % à 30 %
des cas une infection chronique. (48)

On ignore encore si les infections latentes ou l’élimination des mycobactéries suite à


une infection primaire peuvent se produire chez les bovins. L’hypothèse de l’existence
d’infections latentes chez les bovins présentant un test cutané positif repose sur notre
incapacité à retrouver des lésions tuberculeuses ou mettre en évidence la bactérie à partir de
plusieurs organes de ces individus. Cependant, il n’existe aucun moyen pratique pour détecter
les infections latentes chez les bovins. Plusieurs épreuves de diagnostic expérimentales
comme la mise en culture de nombreux ganglions lymphatiques différents sont nécessaires
avant de pouvoir déclarer une carcasse infectée ou non. Indépendamment du statut réel des
animaux présentant un test cutané positif, un abattage de ces individus suspects est effectué
afin de contrôler et d’éradiquer l’infection dans les troupeaux. (49)

- 65 -
II) Les différentes évolutions du complexe primaire et les lésions associées

Dans la partie I, nous avons étudié la formation du complexe primaire, ou de Ghon, et


les différents mécanismes mis en jeu lors d’une infection par M. bovis. Dans cette partie, nous
allons aborder les différentes manières dont la tuberculose peut évoluer à partir du complexe
primaire, ainsi que les lésions qui leur sont associées.

A) Les différentes évolutions du complexe primaire et la généralisation

1) La progression de l’infection

Lors de la période de primo-infection, nous avons vu qu’un complexe primaire,


constitué du chancre d’inoculation associé à l’adénopathie du nœud lymphatique
correspondant, se formait. (6) Dans les cas les plus défavorables, lorsque la réponse
immunitaire est inefficace, l’infection initiale n’est pas contrôlée et aboutit à une
généralisation primaire précoce. La généralisation résulte de la dissémination systémique de
M. bovis. Cette dernière peut survenir en cas de lésions de vaisseaux sanguins ou
lymphatiques lors de la croissance des tubercules, ou encore de manière iatrogène suite à la
chirurgie d’un organe contenant des bacilles tuberculeux, permettant ainsi leur dissémination
sanguine. (49) La tuberculose de généralisation précoce peut se traduire soit par une
tuberculose miliaire aiguë, soit par une tuberculose de généralisation progressive évoluant par
poussées successives. Ces formes peuvent ensuite s’enkyster, se calcifier ou subir un
remaniement fibreux, ce qui a pour effet de les stabiliser. Elles pourront par la suite cesser
d’évoluer ou induire une généralisation tardive à la faveur d’une surinfection
mycobactérienne. (6)

Figure 17 : Les différentes voies d’évolution du complexe primaire (d’après (6))

- 66 -
Au cours de la période de surinfection, les défenses immunitaires de l’hôte peuvent
être plus ou moins altérées. Lorsque ces dernières sont complètement abolies suite à un
affaiblissement général, une généralisation tardive peut se développer. Elle se traduit soit par
une tuberculose miliaire aiguë de surinfection, soit par une tuberculose caséeuse de
surinfection caractérisée par la nécrose caséeuse de plusieurs organes. Ces deux formes
peuvent elles aussi se stabiliser définitivement ou se réactiver par la suite. Lorsque les
défenses immunitaires de l’hôte sont efficaces, une tuberculose chronique d’organe peut
néanmoins se développer. Elle apparaît à la faveur de contacts répétés avec des bacilles
provenant des lésions de primo-infection (surinfection endogène) ou du milieu extérieur, au
contact d’individus infectés par exemple (surinfection exogène). La tuberculose chronique
d’organe se développe par propagation via les voies canaliculaires (bronches, voies biliaires,
etc.) ou lymphatiques d’un organe porteur d’une lésion initiale. Elle peut faire suite au
complexe primaire ou à une tuberculose de généralisation progressive et peut se stabiliser ou
encore évoluer en une forme de généralisation tardive. (6) Les différentes voies d’évolution
du complexe primaire (Fig. 17) ont déjà été proposées par Nieberle dans un rapport au
Congrès vétérinaire international de Zurich en 1938. (68)

2) La tuberculose miliaire

La forme de généralisation la plus courante est la tuberculose miliaire. Elle est


présente chez 1,5 % des patients cliniquement atteints de tuberculose. (69) Elle se caractérise
par un grand nombre de petites lésions caséeuses grises à blanc-jaunâtre ressemblant à des
grains de millet. Ces formes résultent d’une libération massive de mycobactéries dans la
circulation sanguine, qui peuvent alors envahir de nombreux organes comme par exemple les
poumons, le foie, la rate ou le cerveau. (49)

Figure 18 : La tuberculose miliaire pulmonaire


A : Aspect macroscopique (Homme) (70) ; B : Aspect macroscopique (Bovin) (Photographie :
DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; C : Coupe transversale
tomodensitométrique de poumons atteints de tuberculose miliaire (Homme) (71)

- 67 -
Dans plus de 90 % des cas, la tuberculose miliaire concerne l’ensemble du corps. Elle
peut néanmoins rester cantonnée à un seul organe dans environ cinq cas sur cent. Malgré la
grande quantité de lésions disséminées, jusqu’à 50 % des cas ne sont pas diagnostiqués de
manière ante-mortem. La forte ressemblance clinique entre la tuberculose miliaire et d’autres
maladies comme les pneumonies virales ou bactériennes permet d’expliquer les difficultés à
établir son diagnostic. (69)

Les manifestations cliniques de la tuberculose miliaire ne sont en général pas


spécifiques. On retrouve classiquement de la fièvre, de la toux et une anorexie associée à une
perte de poids. Les autres signes cliniques sont très variés et dépendent des organes atteints.
L’examen du fond d’œil est très intéressant pour aider au diagnostic précoce de la tuberculose
miliaire, car la présence de tubercules choroïdiens en est pathognomonique. Ces derniers se
présentent sous la forme de lésions bilatérales, grises à jaunâtres, généralement inférieures à
un quart du disque optique et situées à moins de deux centimètres du nerf optique. Un examen
ophtalmologique après administration d’un mydriatique doit donc être systématiquement
effectué en cas de suspicion de tuberculose miliaire. Les lésions cutanées constituent aussi un
indice précieux pour le diagnostic de cette dernière. Elles se présentent sous la forme de
papules et macules érythémateuses (tuberculosis miliaria cutis). Cette atteinte cutanée est
néanmoins rarement observée chez les individus non-immunodéprimés. Plusieurs facteurs
prédisposants ont pu être mis en évidence, tels que la malnutrition, la gestation ou encore
l’utilisation de molécules immunosuppressives. (72)

Figure 19 : Signes cliniques orientant le diagnostic vers une tuberculose miliaire

A : Examen du fond d’œil mettant en évidence la présence de tubercules choroïdiens dans le pôle
postérieur de l’orbite (Homme) (71) ; B : Enfant présentant des lésions cutanées de tuberculose
miliaire (71)

La mortalité associée à la tuberculose miliaire est proche de 100 % si elle n’est pas
traitée, contre moins de 10 % avec un traitement précoce et approprié. Le taux de rechute est
faible (de l’ordre de 0 à 4%) avec la bonne observance d’une thérapie adaptée. La plupart des
rechutes surviennent au cours des 24 premiers mois suivant la fin de la thérapie. (69)

- 68 -
3) Les autres formes de généralisation

Certaines formes de généralisation semblent particulièrement fulminantes et étendues,


aboutissant à de larges lésions caséeuses souvent peu minéralisées. Ces formes sont
fréquemment rencontrées dans les poumons et sont généralement appelées « formes de
rupture ». La généralisation au niveau des surfaces séreuses, en particulier sur la plèvre, le
péricarde ou le péritoine, peut également survenir. (49) Elle se caractérise par de multiples
tubercules blancs grisâtres, regroupés en îlots ou en nappes dans l’épaisseur de la séreuse, qui
s’épaississent peu à peu pour donner de petites masses charnues rosées ressemblant à des
polypes. (6) La lésion des séreuses est assez rare chez les bovins et peut se produire par
dissémination lympho-hématogène ou par extension locale dans les espaces cavitaires à partir
de granulomes érosifs situés sur des organes adjacents. (49) La rupture d’un ganglion
lymphatique médiastinal dans le péricarde est aussi possible, pouvant conduire à un
épanchement péricardique. Une tamponnade peut alors se développer pendant plusieurs mois
et se manifester cliniquement au bout de plusieurs années, en empêchant le retour veineux au
cœur lors de la diastole. (73)

Figure 20 : Différentes formes de généralisation

A : Tuberculose pulmonaire caséeuse sévère ou « forme de rupture » (Bovin) (49) ; B : Tubercules


dans l’espace pleural (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des
Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; C : Tuberculose miliaire sur la face pleurale du diaphragme (Homme)
(70) ; D : Tuberculose péritonéale (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité
des Aliments, VetAgro Sup, Lyon)

Les autres localisations des lésions de tuberculose généralisée seront développées dans
la partie II.C., car les organes atteints peuvent l’être dans le cadre d’une généralisation ou
d’une tuberculose chronique d’organe.

- 69 -
B) Tuberculose pulmonaire et tableau clinique général

1) Le développement d’une tuberculose pulmonaire

Chez certains animaux, l’existence d’une bonne immunité à médiation cellulaire peut
prévenir l’extension des lésions pulmonaires à d’autres organes. Cependant, la réponse
immunitaire systémique, qui agit par l’intermédiaire du sang et des compartiments
lymphatiques, est habituellement incapable d’arrêter la propagation de l’infection par les
voies anatomiques pré-existantes dans des organes, comme les voies respiratoires inférieures.
Ainsi, les lésions tissulaires peuvent progresser avec le temps à partir du site d’infection
initial. On entre alors dans le cadre d’une tuberculose chronique d’organe. Chez les bovins et
les humains, ces lésions chroniques ont souvent pour origine les poumons ou les nœuds
lymphatiques médiastinaux, la voie de pénétration des bacilles tuberculeux étant
essentiellement respiratoire. (49) Néanmoins, nous avons vu que les poumons pouvaient aussi
être atteints par des lésions de tuberculose lors d’une généralisation primaire et tardive.

Figure 21 : Différentes formes de tuberculose pulmonaire


A : Pneumonie tuberculeuse lobulaire (Bovin) (49) ; B : Foyer de ramollissement pulmonaire entouré
d’une cloison de tissu conjonctif dense (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et
Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; C : Foyers de nécrose caséeuse pulmonaire (Bovin)
(Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon)

- 70 -
Les poumons sont les organes les plus fréquemment atteints par la tuberculose. Chez
les bovins adultes, ils sont affectés dans 90 à 95 % des cas. (6) La tuberculose pulmonaire
découle le plus souvent de la réactivation et de la propagation de bacilles à partir d’une lésion
primaire suite à une diminution des défenses immunitaires ou du passage de mycobactéries
dans le compartiment sanguin. Les lésions de tuberculose surviennent alors essentiellement
dans les lobes pulmonaires crâniaux car la croissance des mycobactéries y est favorisée par
une pression partielle en dioxygène plus élevée. Les lobes médians et caudaux des poumons
peuvent néanmoins être impliqués suite à la progression d’une lésion primaire. (73)

Les tubercules constituent la lésion initiale. Ils peuvent ensuite s’enkyster dans une
capsule scléreuse ou s’abcéder. La coalescence et la propagation des foyers de tuberculose
pulmonaire entraînent le développement de grandes zones de pneumonie tuberculeuse. (6)
L’infection se propage par les voies aériennes en affectant des groupes alvéolaires contigus
partageant les mêmes ramifications bronchiques. La zone affectée présente alors une nette
délimitation avec la zone saine en respectant l’architecture des septa lobulaires. (Fig. 21, A) À
ce stade, des ulcères des bronches et de la trachée peuvent aussi se former mais la
minéralisation reste quant à elle peu développée. De même, les ganglions lymphatiques
affectés peuvent être sévèrement hypertrophiés. Leur centre est alors caséeux, granulomateux
et entouré de trabécules irrégulières constituées de tissu fibreux. (49)

Figure 22 : Lésions cavitaires et bronchopneumonie tuberculeuse chez l’Homme (70)

- 71 -
Des lésions cavitaires à l’intérieur du lobe pulmonaire infecté initialement peuvent
aussi se développer au fur et à mesure. La progression des lésions au sein des poumons
aboutit à leur caséification puis à leur liquéfaction. On parle alors de foyer de ramollissement.
(Fig. 21, B) Lors de la toux, le matériel liquide peut être expectoré, laissant place à une cavité
remplie d’air. (Fig. 22) Les bacilles peuvent ensuite se multiplier rapidement dans cette cavité
et envahir de nouvelles zones pulmonaires. Les lésions peuvent être disséminées ou
regroupées et former une pneumonie tuberculeuse entraînant l’apparition de nouvelles cavités.
La formation d’un pneumothorax spontané peut survenir suite à un passage d’air dans
l’espace pleural lors de la rupture d’une cavité tuberculeuse ou d’un foyer caséeux sous-
pleural. Du matériel caséeux et des bacilles peuvent aussi se retrouver dans l’espace pleural et
occasionnellement y former un empyème si la charge bactérienne est très élevée. (73)

2) Tableau clinique

i) Chez les bovins

La grande majorité des bovins infectés qui réagissent positivement au test à la


tuberculine ne présentent aucun signe clinique. La tuberculose en fin d’évolution entraîne
principalement une atteinte importante de l’état général dominée par un amaigrissement. Cela
reste néanmoins peu spécifique car l’altération progressive de l’état général est couramment
rencontrée lors de maladies chroniques. (74)
Dans le cas des jeunes animaux tuberculeux, la croissance s’effectue irrégulièrement et
de manière tardive. Ils gardent donc un aspect malingre et chétif tout au long de leur vie. Les
adultes sévèrement atteints sont quant à eux maigres, avec un pelage terne et piqué et une
peau sèche adhérente aux plans musculaires sous-jacents. Ces individus sont fréquemment
sujet à la diarrhée et au météorisme, puis voient ensuite leur masse musculaire s’atrophier
progressivement jusqu’à ce qu’ils deviennent cachectiques. (6) Ces signes cliniques mettent
plusieurs mois à se développer mais peuvent plus facilement être mis en évidence à la faveur
d’un stress ou d’un effort physique intense comme le vêlage. (74)
Les manifestations cliniques de la tuberculose sont très variées, cette dernière pouvant
intéresser tous les tissus et organes. Néanmoins, en dehors de certaines localisations
particulières, ces signes restent eux aussi peu spécifiques. (6) En cas d’infection avancée des
poumons, une toux humide peut être présente, notamment le matin après l’exercice ou dans
une atmosphère froide ou poussiéreuse. Les difficultés respiratoires deviennent évidentes dans
les cas les plus avancés, lorsqu’une grande partie du tissu pulmonaire a déjà été endommagée.
Le gonflement des ganglions lymphatiques bronchiques peut aussi entraîner une dyspnée en
faisant pression sur les voies respiratoires. (74)

ii) Chez l’Homme

Chez l’Homme, la symptomatologie de la tuberculose la plus décrite concerne les


infections par M. tuberculosis. Cependant, la tuberculose humaine causée par M. bovis est
cliniquement indifférenciable de celle causée par le pathogène humain classique. (47) Comme
pour les bovins, les signes cliniques chez l’Homme sont quasiment absents lors de la période
de latence. En cas de tuberculose active, les symptômes varient en fonction des tissus et
organes atteints. Les poumons restent néanmoins la localisation la plus courante des lésions.
Le signe clinique principal de la tuberculose pulmonaire est une toux évoluant depuis plus de
trois semaines. (75) Des expectorations parfois teintées de sang ainsi qu’une altération de
l’état général sont aussi classiquement retrouvées. (73) Les symptômes couramment observés
lors de tuberculose pulmonaire humaine sont listés dans le tableau VII.

- 72 -
Tableau VII : Symptômes de la tuberculose pulmonaire chez l’Homme (d’après (73))

Symptômes respiratoires Symptômes généraux


Toux + + + Perte de poids ++
Expectorations + + + Fièvre et transpiration ++
Crachat teinté de sang + + Fatigue +
Essoufflement + Perte d’appétit +
Respiration sifflante +
Le nombre de croix indique la fréquence
Rhumes fréquents +
relative de chaque symptôme.
Douleur thoracique +

L’ensemble de ces symptômes demeure assez peu spécifique. L’essoufflement peut


être dû à l’extension des lésions pulmonaires ou à un épanchement pleural venant compliquer
la maladie. L’apparition d’un pneumothorax lors de la rupture d’une lésion cavitaire peut aussi
créer de manière aiguë un essoufflement et une douleur thoracique violente. Le signe clinique
le plus couramment retrouvé au niveau du thorax reste néanmoins la présence de légers
crépitements dans la partie crâniale des poumons. (73)

C) Les différentes localisations possibles de la tuberculose

La tuberculose peut affecter une grande variété d’organes. Ces derniers peuvent être
atteints dans le cadre d’une généralisation primaire ou tardive, suite à un passage systémique
de M. bovis, ou encore dans le cadre d’une tuberculose chronique d’organe. Les différentes
localisations des lésions de tuberculose peuvent toutes être retrouvées chez l’Homme et les
bovins. Néanmoins, elles sont souvent beaucoup plus décrites dans l’espèce humaine car les
mesures de détection de la maladie et d’abattage des animaux atteints empêchent le
développement de lésions dans certains organes. (76)

1) La tuberculose ganglionnaire

La lymphadénite est la présentation clinique la plus fréquente de la tuberculose extra-


pulmonaire. Chez l’Homme, elle implique le plus souvent les ganglions lymphatiques
cervicaux mais elle peut aussi concerner par ordre de fréquence décroissante les ganglions
médiastinaux, axillaires, mésentériques, hépatiques et inguinaux. (77) Chez les bovins, les
ganglions médiastinaux, pulmonaires et rétro-pharyngiens sont les plus souvent affectés. (78)
M. bovis peut aussi être responsable d’une atteinte généralisée des ganglions en cas
d’immunodépression sévère comme par exemple lors d’une infection par le VIH chez
l’Homme. (73)
Dans la phase initiale de l’atteinte ganglionnaire, l’apparition d’une hypersensibilité
retardée se produit, faisant suite à la multiplication progressive des bacilles tuberculeux. Ce
phénomène s’accompagne du gonflement, de la nécrose et de la caséification du centre des
ganglions. À la faveur de l’inflammation et du gonflement progressif du ganglion, ce dernier
peut ensuite devenir adhérent aux ganglions voisins. (Fig. 23, A et B). (77) Les ganglions
atteints peuvent plus tardivement former des foyers de ramollissement puis évoluer en abcès
froids se développant lentement, de manière quasi indolore et peu inflammatoire. Le pus est
alors très abondant et une fistule peut se former à travers la peau, à l’origine de l’apparition
d’un scrofuloderme. Ce processus sera détaillé dans la partie II.C.2.ii.a. (73)

- 73 -
Figure 23 : Lésions macroscopiques de tuberculose ganglionnaire
A, B : Ganglions d’un même groupe adhérents entre eux lors d’une lymphadénite tuberculeuse
(Homme) (70) ; C : Tubercules dans un ganglion lymphatique médiastinal (Bovin) (Photographie :
DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; D : Lymphadénite
tuberculeuse cervicale avec formation d’abcès (Homme) (79) ; E : Lymphadénite tuberculeuse
cervicale avec formation d’abcès (Kudu) (80)

Jones et Campbell ont défini en 1962 cinq étapes pour décrire l’évolution de l’aspect
des ganglions périphériques affectés par la tuberculose. (81)

Tableau VIII : Étapes de l‘évolution de l’aspect des ganglions périphériques affectés par
la tuberculose selon Jones et Campbell (d’après (81))

Étape Description du ganglion


1 Élargi, ferme, mobile, discrète hyperplasie réactive
2 Fortement élargi, adhérent aux tissus environnants en raison de l’inflammation locale
3 Formation d’un abcès froid suite au ramollissement central
4 Rupture de l’abcès sous la peau, ressemblant superficiellement à un collier
5 Fistulisation de l’abcès à travers la peau

Les signes cliniques sont variables en fonction des ganglions impliqués. L’apparition
de masses indolores en région cervicale ou supra-claviculaire est assez courante. Une
fistulisation peut aussi être observée dans 10 % des cas de lymphadénite mycobactérienne
cervicale. La lymphadénite tuberculeuse médiastinale peut provoquer une compression des
vaisseaux sanguins ou des nerfs laryngé récurent et phrénique, ou encore causer une érosion
des bronches et donc induire des signes cliniques variés. Les symptômes peuvent évoluer
pendant quelques semaines à plusieurs mois avant l’établissement d’un diagnostic. (77)

- 74 -
2) La tuberculose cutanée

La tuberculose cutanée chez les bovins est assez peu décrite dans la littérature car elle
n’est que très rarement rencontrée. (82) Cliniquement, elle se présente sous la forme de
lésions chroniques indurées de la peau au niveau des membres ou de nodules en regard des
ganglions lymphatiques. (83)

Chez l’Homme, il existe un large éventail de présentations cliniques comme des


papules inflammatoires, des nodules suppuratifs ou encore des ulcères chroniques. Ainsi,
plusieurs classifications ont été proposées selon différents critères cliniques, immunologiques,
histologiques ou bactériologiques. Il est possible par exemple de faire une dichotomie en se
basant sur la charge bactérienne cutanée. Le diagnostic microbiologique est plus aisé pour les
formes multibacillaires, car les bacilles sont présents en grande quantité dans la peau et donc
facilement isolés. À l’inverse, il est plus difficile dans le cas de formes paucibacillaires.
Néanmoins, la classification la plus souvent employée se base sur le mode d’infection par les
mycobactéries. (84)

Tableau IX : Classification des formes de tuberculose cutanée selon Byet (85)

Mode d’infection Formes cliniques


- Chancre tuberculeux
Source exogène : tuberculose - Tuberculose verruqueuse ou tuberculosis
d’inoculation verrucosa cutis
- Lupus vulgaris (rarement)
Source endogène : tuberculose - Par contiguïté : scrofuloderme
secondaire - Par auto-inoculation : tuberculose orificielle
- Lupus vulgaire ou Lupus vulgaris
Tuberculose hématogène - Gomme tuberculeuse
- Tuberculose miliaire aiguë
- Lichen scrofulosorum
- Tuberculides papulaires ou papulo-nécrotiques
Tuberculose éruptive : tuberculides
- Érythème induré de Bazin
- Vascularite nodulaire

i) La tuberculose cutanée exogène

M. bovis peut pénétrer dans la peau à la faveur d’une plaie ou d’une abrasion. Ces lésions
surviennent le plus souvent sur les surfaces exposées comme le visage et les membres. (73)

a) Le chancre tuberculeux

Le chancre tuberculeux peut apparaître suite à l’inoculation directe du bacille


tuberculeux dans la peau. Un nodule ferme, indolore et érythémateux se développe alors en
deux à quatre semaines puis s’ulcère. Une dissémination lymphatique est fréquemment
rencontrée trois à huit semaines après l’établissement du chancre tuberculeux. Le chancre peut
évoluer soit vers une cicatrisation au bout de trois à douze mois, soit aboutir à un lupus
vulgaris, un scrofuloderme ou une tuberculose miliaire par dissémination. (84)

- 75 -
b) La tuberculose verruqueuse

La tuberculose verruqueuse résulte de l’inoculation cutanée de bacilles tuberculeux à


un individu déjà sensibilisé à M. bovis ou M. tuberculosis. La lésion initiale correspond à un
petit groupe de papules entouré par un halo inflammatoire violacé, évoluant en une plaque
verruqueuse d’un à cinq centimètres de diamètre pouvant dans certains cas s’ulcérer. En
l’absence de traitement, ces plaques peuvent persister plusieurs années, voire se compliquer
par une surinfection bactérienne. (84)

ii) La tuberculose cutanée endogène

a) Le scrofuloderme

Le scrofuloderme est la forme de tuberculose cutanée la plus courante. Il correspond à


un abcès froid tuberculeux, se développant dans un ganglion lymphatique satellite, dont le pus
s’écoule à travers la peau en créant une fistule. Des ulcères déprimés à bord irréguliers
peuvent apparaître secondairement à la fistule avant de finalement cicatriser. La taille
moyenne des lésions est de trois à cinq centimètres mais certaines ulcérations, en regard d’une
adénopathie sous-maxillaire par exemple, peuvent s’étendre sur 15 centimètres. Ce type de
lésion se localise préférentiellement au niveau des ganglions lymphatiques cervicaux. (85)

b) La tuberculose orificielle

La tuberculose orificielle est une affection touchant essentiellement les adultes


présentant une tuberculose pulmonaire, intestinale ou génitale avancée ou une altération
sévère de l’immunité cellulaire. Les lésions apparaissent au niveau des orifices naturels et font
suite à une auto-inoculation. Elles correspondent à des papules érythémateuses, friables et
douloureuses mesurant un à trois centimètres de diamètre. Comme elle est le témoin d’une
tuberculose avancée, le pronostic est sombre. (84)

iii) La tuberculose hématogène

Le lupus vulgaire est la forme de tuberculose cutanée la plus répandue en Europe et en


Inde. C’est une affection progressive s’accompagnant d’une destruction tissulaire importante
et se rencontrant chez des individus immunisés contre le bacille. (84) Le lupus vulgaire se
développe classiquement au niveau de la face, du cou et des oreilles. Plusieurs formes
cliniques sont décrites, comme le lupus plan, squameux et violacé ; le lupus vorax très
mutilant et agressif ; le lupus psoriasiforme ou encore serpigineux. (85)
Les gommes tuberculeuses sont des lésions rares, se présentant sous la forme d’abcès
froids disséminés. Elles surviennent habituellement chez des individus débilités ou
immunodéprimés et peuvent appartenir à un tableau clinique de tuberculose miliaire, étant la
conséquence d’une dissémination hématogène. Il convient de rechercher d’autres lésions de
tuberculose lorsque l’une de ces deux formes cliniques se présente. (85)

iv) La tuberculose éruptive

La tuberculose éruptive peut avoir plusieurs présentations cliniques. Ces formes sont
paucibacillaires et peuvent concerner soit l’hypoderme (comme l’érythème induré de Bazin et
l’érythème noueux), soit l’épiderme et le derme (comme le lichen scrofulosorum et les
tuberculides). (85)

- 76 -
Figure 24 : Différentes formes de tuberculose cutanée (d’après (85))

A : Scrofuloderme d’une adénopathie cervicale ; B : Lupus vulgaire de la face; C : Lichen


scrofulosorum de l’abdomen ; D : Gomme tuberculeuse sur la face dorsale d’un pied ; E :
Tuberculose verruqueuse d’un doigt ; F : Érythème induré de Bazin

3) La tuberculose du système nerveux central

La tuberculose du système nerveux central est rare chez les bovins. Elle se traduit
majoritairement par une méningite, affectant plus fréquemment les méninges crâniennes que
vertébrales. L’implication des méninges se fait essentiellement par voie hématogène. Les
lésions primaires apparaissent généralement dans les méninges basilaires, puis s’étendent
ensuite par l’espace sous-arachnoïdien aux plexus choroïdes et aux ventricules. Dans une
certaine limite, l’infection peut aussi se propager par les espaces de Virchow-Robin dans le
parenchyme cérébral. L’implication des méninges vertébrales peut quant à elle se faire par
voie hématogène ou à partir d’une ostéomyélite vertébrale. Les lésions du système nerveux
central sont semblables à celles des membranes séreuses mais plus exsudatives et nécrosantes.
De nombreux nodules de deux à 15 millimètres de diamètre peuvent être retrouvés, ainsi
qu’un exsudat fibrineux et opaque (Fig. 25, A). La formation de quelques granulomes reste
néanmoins possible. (86)

Chez l’Homme, l’atteinte du système nerveux central se fait, comme pour les bovins,
par voie hématogène. Plusieurs petits foyers de tuberculose peuvent se développer dans le
cerveau, la moelle épinière ou encore dans les méninges. L’emplacement exact de ces foyers
ainsi que les capacités de l’hôte à contrôler leur évolution déterminent la forme finale que
prendra la tuberculose du système nerveux central. Cette dernière se manifestera
principalement comme une méningite tuberculeuse et moins souvent comme une encéphalite,
un tuberculome intracrânien ou un abcès cérébral. (87)

- 77 -
L’inflammation des méninges est particulièrement importante à la base du cerveau
(Fig. 25, B) où elle peut faire barrage au flux de liquide cérébro-spinal et ainsi induire la
formation d’une hydrocéphalie. En l’absence de traitement, la pression intracrânienne risque
par la suite d’augmenter, induisant des lésions cérébrales. (73) La complication la plus grave
de la méningite tuberculeuse est le développement d’une vascularite au niveau du polygone de
Willis, de l’artère vertébro-basilaire ou des branches perforantes de l’artère cérébrale
moyenne. Cette dernière peut induire une ischémie dans les territoires desservis par ces
vaisseaux et donc être à l’origine de lésions nerveuses. (87)

Les tuberculomes cérébraux se développent à partir des petits foyers de tuberculose


qui parviennent à s’élargir sans se rompre dans l’espace sous-arachnoïdien. Généralement, un
seul tuberculome se développe mais des tuberculomes multiples peuvent être observés. (87)
Les tuberculomes, en comprimant le cerveau, induisent l’apparition de signes cliniques
comparables à ceux retrouvés lors de la présence d’une tumeur cérébrale. (73)

La formation d’abcès cérébraux est une manifestation rare de la tuberculose du


système nerveux central. Ils se développent soit à partir de granulomes présents dans
parenchyme cérébral, soit par propagation des petits foyers tuberculeux à partir des méninges.
Un abcès cérébral se caractérise par une collection encapsulée de pus contenant des bacilles
viables, et doit donc être distingué du granulome classique avec sa nécrose caséeuse centrale
pouvant se liquéfier et imiter du pus. (87)

Figure 25 : Lésions macroscopiques de tuberculose du système nerveux central

A : Méningite à la base du cerveau et du tronc cérébral avec multiples nodules fermes et


accumulation d’un exsudat fibrineux (Bovin) (86) ; B : Méningite tuberculeuse au niveau de la base
du cerveau (Homme) (70)

4) La tuberculose ostéo-articulaire

Les os et les articulations peuvent être atteints par la tuberculose lors d’une
généralisation précoce ou tardive. Chez les bovins, les vertèbres, les côtes et les os plats du
bassin sont les plus fréquemment impliqués. Une caséification étendue suivie d’une
liquéfaction peuvent s’y développer, et l’exsudat en résultant peut ensuite s’écouler dans la
corticale des os affectés. Le cartilage articulaire peut être atteint de la même façon, entraînant
son érosion puis le développement consécutif d’une arthrite tuberculeuse. (6)

- 78 -
Chez l’Homme, la plupart des atteintes osseuses ou articulaires liées à la tuberculose
se développent dans les trois ans suivant l’infection initiale, même si elles peuvent survenir
plus tardivement. Tous les os ou articulations peuvent être impliqués. Cependant, la colonne
vertébrale est la plus fréquemment affectée. Ensuite, par ordre de fréquence décroissante,
l’articulation de la hanche, celle du genou, puis les os du pied, du bras et de la main peuvent
être affectés. Les gonflements articulaires apparaissent lentement sans engendrer de douleur
ou d’inflammation exacerbées. (73)

La maladie de Pott est une spondylodiscite caractéristique de la tuberculose du rachis.


Généralement, deux vertèbres sont affectées (chez environ 70 % des patients) ce qui induit un
rétrécissement ou une absence de l’espace intervertébral. Les lésions osseuses sont
fréquemment retrouvées au niveau de l’angle antérieur supérieur ou inférieur du corps
vertébral, et fréquemment associées à une atteinte de la vertèbre adjacente. La dixième
vertèbre thoracique (T10) est la plus souvent lésée. La fréquence d’implication des autres
vertèbres diminue au fur et à mesure qu’on s’éloigne de T10. (73) La destruction progressive
des corps vertébraux peut être à l’origine de fractures, d’un tassement ou d’une déformation
rachidienne provoquant l’apparition d’une scoliose secondaire ou d’une gibbosité pottique.
(88) La spondylodiscite tuberculeuse ou la protrusion de granulomes vertébraux dans le canal
médullaire peuvent être à l’origine d’une épidurite et ainsi entraîner des symptômes
neurologiques. (89)

Figure 26 : Lésions macroscopiques de tuberculose du rachis

A :Aspect macroscopique d’une spondylodiscite (Homme) (70) ; B : Coupe sagittale


tomodensitométrique du rachis d’un homme présentant une spondylodiscite au niveau de T10 (la
flèche indique une collection purulente paravertébrale) (88) ; C : Multiples lésions de tuberculose
osseuse dans les corps vertébraux et les processus épineux de vertèbres thoraciques (Bovin)
(Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; D :
Foyer de nécrose tuberculeuse d’un corps vertébral (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service de
Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon)

- 79 -
5) La tuberculose de l’abdomen

La tuberculose de l’abdomen peut se présenter sous quatre formes : la


lymphadénopathie tuberculeuse, la tuberculose péritonéale, gastro-intestinale et viscérale. (90)
Les modalités de contamination de l’abdomen sont multiples : dissémination hématogène lors
d’une généralisation, ingestion de lait contaminé, ou déglutition de matériel infecté remontant
à partir des poumons lors d’une infection respiratoire. Les ganglions mésentériques peuvent
alors être affectés et parfois se rompre en déversant leur contenu dans la cavité péritonéale,
induisant ainsi la contamination des organes abdominaux. Des fistules entre l’intestin et la
vessie ou d’autres organes peuvent aussi se former et conduire à la propagation de l’infection.
(73)

i) La tuberculose digestive et viscérale

L’invasion de la muqueuse gastro-intestinale par des bacilles tuberculeux peut induire


la formation de tubercules. Une nécrose caséeuse se met alors en place en deux à quatre
semaines entraînant une ulcération de la muqueuse pouvant ensuite se propager dans les
couches profondes de la paroi, jusqu’aux ganglions adjacents et au péritoine. Les bacilles
peuvent aussi rejoindre la circulation portique ou hépatique et ainsi infecter des organes
comme le foie, le pancréas et la rate. L’iléon et le cæcum constituent les deux localisations
préférentielles des lésions de tuberculose gastro-intestinale, suivis par le jéjunum et le colon.
L’œsophage, l’estomac et le duodénum ne sont que très rarement impliqués. Les lésions de
tuberculose gastro-intestinale sont classées en fonction de leur morphologie, d’ulcéreuses à
hypertrophiques. Néanmoins, la distinction entre ces lésions n’est pas clairement définie et les
deux types peuvent coexister. (90)

La lymphadénopathie tuberculeuse est la présentation la plus courante de tuberculose


abdominale. Elle fait habituellement suite au drainage lymphatique de différents organes
infectés et peut donc affecter n’importe quel ganglion abdominal. Les ganglions
mésentériques et péritonéaux sont les plus fréquemment impliqués. Leur taille est alors
augmentée et une nécrose caséeuse se développe en leur centre. (90) L’inflammation des
ganglions mésentériques peut aussi entraîner la formation d’adhérences entre les anses
intestinales et provoquer une obstruction digestive. (73)

Plusieurs présentations existent pour la tuberculose péritonéale. La plus fréquente est


le développement d’une ascite, généralement de forte densité de par sa forte teneur en
protéines. Une réaction péritonéale fibreuse caractérisée par la présence de nodules
péritonéaux et d’adhérences peut aussi se mettre en place. Parfois, une ascite localisée
associée à une fibrose impliquant l’omentum et le mésentère peut se développer, induisant
l’adhérence de plusieurs anses intestinales entre elles. (90)

La tuberculose viscérale ne concernant qu’un seul organe de manière isolée est assez
rare. L’appareil urogénital est le plus couramment impliqué, suivi du foie, de la rate et du
pancréas. (90) Les lésions de tuberculose hépatique peuvent avoir l’aspect de multiples foyers
caséeux gris à jaunâtres, ou de masses volumineuses constituées d’une coque de tissu sclérosé
remplie de pus épais, caséeux et grumeleux. La présence de ces lésions conduisent soit à la
destruction du parenchyme hépatique, soit à la dissémination des bacilles par les veines porte
et hépatique ou suite à une rupture des voies biliaires. La rate peut aussi présenter de multiples
petits abcès de taille variable, disséminés dans toute l’épaisseur de l’organe. (6)

- 80 -
Figure 27 : Lésions macroscopiques de tuberculose abdominale
A : Foyer de nécrose caséeuse tuberculeuse dans un foie (Bovin) (Photographie : DEMONT P. Service
de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; B : Tuberculose intestinale (Bovin)
(Photographie : DEMONT P. Service de Qualité et Sécurité des Aliments, VetAgro Sup, Lyon) ; C :
Multiples tubercules spléniques (Homme) (70) ; D : Tuberculose intestinale (Homme) (70)

ii) La tuberculose uro-génitale

Chez les bovins, les organes génitaux comme les testicules, le pénis ou la gaine
vaginale peuvent être atteints par des lésions de tuberculose suite à une dissémination
hématogène. Elles se traduisent par la présence de multiples nodules dans les espaces
lymphatiques sous-séreux ou sous-muqueux. Les lésions sont parfois très étendues dans le cas
de l’ovaire, qui apparaît alors volumineux, bosselé et parsemé d’amas caséocalcaires à
purulents. Les trompes utérines sont alors souvent envahies par de multiples petits granulomes
gris à blanchâtres. L’utérus peut être infecté par dissémination hématogène mais aussi par voie
génitale ou lors de l’extension d’une péritonite tuberculeuse. De même, un envahissement du
rein par des tubercules miliaires est possible et leur accumulation aboutit souvent à la
formation de volumineuses cavités contenant du matériel caséocalcaire. (6)

Chez l’Homme, la tuberculose de l’appareil urinaire apparaît généralement cinq à


quinze ans après l’infection initiale. Les bacilles atteignent le rein par voie sanguine et les
lésions se développent d’abord dans le cortex rénal avant d’atteindre le bassinet. Leur
progression peut induire la formation de cavités. Du matériel caséeux est souvent acheminé
par l’urine jusqu’à la vessie où des ulcères peuvent se former. L’infection peut également se
propager de cette manière à la prostate, aux vésicules séminales et à l’épididyme. En cas
d’obstruction de la jonction entre le rein et l’uretère, la pression augmente entraînant la
destruction généralisée du parenchyme rénal (73)

- 81 -
Les testicules et l’épididyme peuvent être affectés dans le cadre d’une dissémination
hématogène des bacilles tuberculeux, induisant une augmentation progressive et indolore de
leur taille. Comme chez les bovins, le développement de tubercules dans l’utérus à la faveur
d’une dissémination sanguine ou suite à la rupture d’un ganglion lymphatique mésentérique
est possible. (73)

Figure 28 : Lésions macroscopiques de tuberculose uro-génitale

A : Volumineux nodules caséeux envahissant deux lobules adjacents du rein avec adénite caséeuse du
ganglion lymphatique rénal (Bovin) (6); B : Tuberculose rénale (Homme) (70) ; C : Tuberculose de la
vessie (Homme) (70) ; D : Épididymite et orchite tuberculeuses (Homme) (70)

6) La tuberculose oculaire

La tuberculose oculaire est définie comme l’infection de l’œil ou de sa surface par des
bacilles tuberculeux, et constitue un défi diagnostique en raison de son large éventail de
présentations cliniques. La tuberculose oculaire est soit primaire, lorsque l’œil représente la
voie d’entrée des mycobactéries, soit secondaire à une dissémination hématogène. La maladie
primaire est rare et occasionne des lésions des paupières, de la conjonctive, de la cornée et de
la sclère. En revanche, une atteinte secondaire touchera plutôt le tractus uvéal, la rétine et le
nerf optique. (91)

L’uvéite est la manifestation la plus fréquente lors de tuberculose oculaire en raison de


la bonne vascularisation du tractus uvéal. Cette inflammation peut être unilatérale ou
bilatérale, et siéger dans la partie antérieure ou postérieure de l’œil. (91)

- 82 -
L’uvéite postérieure est la présentation la plus commune de tuberculose intra-oculaire,
avec des lésions affectant principalement la choroïde. Ces lésions peuvent être de nature
variée : choroïdite focale ou multifocale, nodules ou granulomes choroïdaux... Des abcès
sous-rétiniens ou une vascularite rétinienne sont aussi parfois retrouvés et peuvent conduire à
une rétinopathie vasculaire. L’uvéite tuberculeuse antérieure évolue quant à elle de manière
insidieuse et se présente comme une maladie granulomateuse chronique. Elle se manifeste
sous la forme d’une inflammation granulomateuse de la membrane de Descemet, parfois
associée à des nodules ou des granulomes au niveau de l’iris. Le développement de synéchies
irido-cristalliniennes et d’une cataracte est une complication assez classique de l’uvéite
tuberculeuse antérieure. (91) Une panophtalmie tuberculeuse peut aussi se développer, avec
formation d’un abcès détruisant l’œil dans son ensemble. L’énucléation est éventuellement
nécessaire lors d’une telle atteinte. (73)
Chez les bovins, on observe couramment un envahissement de l’iris et de la choroïde
par des masses caséeuses enveloppées de tissu fibreux lors de tuberculose oculaire. (6)

7) Le cas particulier de la tuberculose de la mamelle

La tuberculose de la mamelle est très fréquente chez les bovins. L’infection se fait
généralement par voie hématogène et peut induire une tuméfaction. La tuberculose de la
mamelle peut être présente dans le cadre d’une tuberculose miliaire disséminée, d’une
infection chronique ou d’une mammite tuberculeuse. La tuberculose chronique de la mamelle
est la forme la plus fréquente. Elle se caractérise par le développement de gros nodules très
fermes dans sa partie profonde. Les ganglions lymphatiques sont alors rarement impliqués. La
forme miliaire disséminée a le même aspect que celle des autres organes, avec de multiples
tubercules subissant une nécrose caséeuse et une calcification précoce. Les ganglions
lymphatiques supra-mammaires sont systématiquement affectés et contiennent un nombre
varié de tubercules présentant une caséification et une calcification centrales. Lors d’une
mammite tuberculeuse, de grandes zones irrégulières de tissu nécrotique caséeux jaunâtre et
sec se développent. Un exsudat fibrineux contenant de nombreux leucocytes est présent dans
les zones de nécrose. (6) Même si une induration sévère de la mamelle (mamelle « de bois »)
permet de soupçonner la présence de tuberculose, il est difficile de distinguer cliniquement
une mammite tuberculeuse de celles imputables à d’autres germes. L’infection de la mamelle
présente donc un risque de propagation de la maladie si le lait infecté n’est pas bouilli ou
pasteurisé avant sa consommation. (74)

Figure 29 : Tuberculose de la mamelle chez un bovin (92)

- 83 -
Nous avons pu voir que lors de l’infection par M. bovis, un complexe primaire
conduisant à la formation d’un granulome caractéristique de la tuberculose se mettait en
place. Ce phénomène s’explique par la capacité des mycobactéries tuberculeuses à infecter et
à se multiplier au sein des macrophages par le biais de plusieurs mécanismes d’échappement
au système immunitaire. La réponse immunitaire de l’hôte est essentiellement cellulaire, et la
persistance des mycobactéries dans l’organisme induit une réponse d’hypersensibilité retardée
expliquant la formation de granulomes. Nous avons ensuite étudié les différentes évolutions
possibles de la maladie à partir du complexe primaire. Ainsi, une tuberculose chronique
d’organe, une généralisation précoce ou tardive, ou encore une stabilisation de ces formes
sont toutes envisageables et dépendent de facteurs individuels et environnementaux. Nous
avons constaté que les poumons représentent la localisation préférentielle de la tuberculose,
mais que tous les organes pouvaient être atteints par dissémination hématogène, par extension
des lésions aux organes adjacents ou parfois lors d’une contamination primaire. Nous allons
maintenant aborder les différentes méthodes de dépistage et de diagnostic de la tuberculose à
M. bovis. Nous nous pencherons d’abord sur l’ensemble des éléments cliniques et lésionnels
permettant d’émettre l’hypothèse de tuberculose. Nous nous intéresserons ensuite aux
différentes méthodes de dépistage et de diagnostic utilisées pour rechercher la présence de
cette maladie. Enfin, nous étudierons les différentes alternatives prophylactiques et
thérapeutiques pouvant être mises en œuvre à l’heure actuelle pour lutter contre la
tuberculose.

- 84 -
TROISIÈME PARTIE :

LES MÉTHODES DE
DIAGNOSTIC ET DE DÉPISTAGE

- 85 -
- 86 -
I) Diagnostic clinique et lésionnel

A) Diagnostic clinique

1) Les différents signes cliniques

Comme nous avons pu le voir dans la partie 2, la tuberculose peut être


asymptomatique ou entraîner l’apparition de signes cliniques de manière progressive sur
plusieurs semaines. Les symptômes majoritairement retrouvés comprennent une fièvre
chronique, une perte de poids associée à une amyotrophie et de la fatigue. D’autres signes
plus spécifiques peuvent compléter ce tableau clinique en fonction de la localisation des
lésions. (93)

Tableau X : Signes cliniques associés aux principales localisations des lésions de


tuberculose (d’après (93), (94) et (95))

Localisation de la tuberculose Signes cliniques observables


Fièvre, hépatomégalie, splénomégalie, lymphadénopathie,
Miliaire
lésions cutanées, choroïdite
Diminution des bruits respiratoires, pleurésie associée ou
Plèvre
non à un épanchement, empyème
Essoufflements, tachycardie, insuffisance cardiaque droite,
Péricarde
épanchement, tamponnade
Poumons Toux, expectorations, essoufflements, dyspnée
Tuméfaction et/ou induration locale, abcès associés parfois
Ganglions lymphatiques
à la formation de fistules
Chancre d’inoculation, ulcérations cutanées, lupus
Peau
vulgaire, tuberculides, érythème
Changements comportementaux, vomissements, raideur de
Système nerveux central la nuque, photophobie, altération de l’état général, troubles
de la conscience, convulsions, hydrocéphalie
Scoliose, fracture ou tassement vertébral, paraparésie,
Rachis
paraplégie, douleurs rachidiennes
Altérations fonctionnelles des articulations, gonflement,
Os et articulations
déformations osseuses localisées
Douleur abdominale, signes d’obstruction de l’intestin
Estomac et intestins grêle, distension abdominale, vomissements, diarrhée
intermittente ou constipation
Système urinaire Cystite, hématurie, dysurie
Épididymite, gonflements testiculaires, prostatite,
Organes génitaux
salpingite, stérilité
Œil Choroïdite nodulaire, conjonctivite

- 87 -
La tuberculose constitue ainsi un véritable défi diagnostique. De nombreux éléments
épidémiologiques doivent aussi être pris en compte dans la démarche, comme par exemple
l’évaluation des probabilités d’exposition et les facteurs de risque. (93) Étant donné la
fréquence des infections inapparentes (10 à 15 % des sujets porteurs de tuberculose (95)) et le
manque de spécificité des signes cliniques, il est généralement nécessaire d’associer au
diagnostic clinique l’étude des lésions macroscopiques lorsque cela est possible, ou de réaliser
plusieurs examens complémentaires. (6)

2) Diagnostic différentiel clinique

Nous avons déjà vu que le diagnostic clinique de la tuberculose est très difficile à
établir, les symptômes étant variés et peu spécifiques. Le diagnostic différentiel se fait
essentiellement avec les maladies respiratoires. Chez les bovins, elles sont généralement
d’origine virale (Herpèsvirus Bovin de type 1, Virus Respiratoire Syncytial bovin,
ParaInfluenza 3, Adénovirus, Bovine Viral Diarrhea), bactérienne (Pasteurella multocida,
Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis, Histophilus somni), fongique (Aspergillus sp.)
ou encore parasitaire (strongles pulmonaires). Ces agents pathogènes peuvent agir isolément
ou en interaction les uns avec les autres. (96) D’autres affections peuvent entrer dans le
diagnostic différentiel de la tuberculose chez les bovins. C’est le cas par exemple de la
theilériose bovine (ou fièvre de la côte orientale) causée par Theileria parva. Ce protozoaire
entraîne l’apparition d’une adénopathie hypertrophique, d’une anorexie et d’une dyspnée
rappelant les signes cliniques de la tuberculose pulmonaire. De même, la réticulo-péricardite
traumatique par corps étranger ou la péripneumonie contagieuse bovine due à Mycoplasma
mycoides peuvent aussi provoquer une dyspnée, couramment retrouvée lors de tuberculose
pulmonaire. (97) L’ensemble des maladies d’évolution chronique entraînant une altération de
l’état général, telles que la leucose bovine enzootique ou la paratuberculose (due à M.
paratuberculosis), sont aussi à prendre en compte lors d’une suspicion clinique de
tuberculose. (96)

Chez l’Homme, le diagnostic différentiel clinique se fait aussi essentiellement avec les
affections respiratoires. Lorsque les symptômes évoluent depuis plus de trois semaines, le
diagnostic différentiel doit prendre en compte les maladies respiratoires chroniques telles que
la bronchectasie en période de surinfection (pouvant s’accompagner d’expectorations
mucopurulentes abondantes), la bronchite chronique ou les bronchopathies chroniques
obstructives, ou encore l’asthme (se présentant comme des épisodes récidivants de dyspnée
avec sibilants). D’autres affections plus rares peuvent être évoquées dans le cadre du
diagnostic différentiel comme un rétrécissement mitral, s’accompagnant d’accès dyspnéiques
et d’hémoptysie, ou une insuffisance cardiaque accompagnée de dyspnée et de râles
pulmonaires disséminés. Lorsque les symptômes évoluent depuis moins de trois semaines,
l’hypothèse de tuberculose est moins probable. On retrouve alors plus souvent des trachéites,
bronchites et pneumonies bactériennes ou virales rétrocédant avec un traitement antipyrétique,
anti-inflammatoire et antitussif, associé à l’utilisation d’un antibiotique lorsqu’une origine
bactérienne est suspectée. (98)

- 88 -
B) Diagnostic anatomopathologique

L’anatomie pathologique permet d’étudier les tissus et organes présentant des lésions
évocatrices de tuberculose, grâce à des prélèvements obtenus par biopsie ou dans le cadre
d’une autopsie chez l’Homme, et à l’abattoir dans le cas des bovins. Le diagnostic
anatomopathologique comprend une étude macroscopique des lésions pouvant évoquer la
tuberculose puis un examen histologique des prélèvements. (98)

1) Diagnostic morphologique macroscopique

i) Chez les bovins

a) Modalités de l’inspection à l’abattoir

Les modalités d’inspection des carcasses bovines sont décrites dans l’annexe I, section
IV, chapitre I du règlement n°854/2004 du Parlement Européen et du Conseil du 29 avril 2004
(Annexe 1 de cette thèse). Ce référentiel impose notamment un examen visuel des poumons,
de la tête, du tractus gastro-intestinal, du foie, de la rate et des reins. Il est également
obligatoire de procéder systématiquement à l’observation de tous les ganglions lymphatiques
des organes dits « porte d’entrée » (Tableau XI) en réalisant des coupes multiples permettant
de détecter des lésions de petite taille. (99)

Tableau XI : Les organes « porte d’entrée » et les ganglions lymphatiques associés


(d’après (99))

Organes « porte
Ganglions lymphatiques associés
d’entrée »
Tête Ganglions sous-maxillaires (mandibulaires) et rétro-pharyngiens
Poumons Ganglions trachéo-bronchiques et médiastinaux
Tractus digestif Ganglions gastriques et mésentériques
Foie Ganglions hépatiques et hépatiques accessoires

En cas de découverte de lésions suspectes, des prélèvements des organes ou des


ganglions lymphatiques lésés doivent être effectués afin d’être envoyés dans un laboratoire
agréé pour la réalisation d’analyses. Pour le transport, le conditionnement doit respecter la
règle du triple emballage applicable au transport des matières biologiques contaminées (UN
3373 pour les matières biologiques de catégorie B). Les prélèvements sont donc placés dans
des flacons fermés et correctement identifiés, déposés dans un sac scellé lui aussi portant le
numéro de l’animal. L’ensemble est placé dans une boîte isotherme avec des poches
réfrigérantes préalablement congelées. Les prélèvements doivent être accompagnés d’un
document comportant le compte rendu d’abattage décrivant les lésions observées ainsi que le
stade évolutif et leur localisation. (99)

- 89 -
b) Les différentes lésions suspectes à l’abattoir

Les lésions évocatrices de tuberculose correspondent aux tubercules décrits dans la


partie 2 de cette thèse. Un tubercule présente en général une couleur jaune à grise et un centre
caséeux à calcifié, voire purulent. Les tubercules peuvent être de taille très variable et se
forment isolément ou en groupe. Lorsqu’un organe est affecté, le ganglion lymphatique voisin
est généralement lui aussi atteint. Lors de la palpation des organes, la tuberculose se traduit
par la présence de nodules plus ou moins fermes, qui peuvent néanmoins passer inaperçus
lorsque les lésions sont trop petites. Au moment de l’incision de lésions de tuberculose, il est
possible de ressentir une résistance plus ou moins importante. La surface de coupe est alors
caséeuse à calcifiée et de couleur blanc jaunâtre à gris verdâtre. La caséification peut être de
consistance crémeuse ou d’aspect granuleux. Les coupes des poumons présentent
occasionnellement des cavités d’aspect purulent. (100)

Tableau XII : Les différentes formes des lésions observées à l’abattoir (d’après (99))

Formes stabilisées
Tubercule caséo- Tubercules présentant un caséum sec, friable, crissant à la coupe à
Formes circonscrites

calcaire cause de la calcification.


Tubercules entourés d’une coque fibreuse très épaisse et
Tubercule enkysté
présentant un caséum calcifié au centre.
Tubercules caséeux à caséo-calcaires faisant saillie à la surface
Tuberculose
d’une séreuse (péritoine ou plèvre), en forme de perle ou de chou-
perlière ou
fleur. Cette forme de tuberculose est associée à une inflammation
pommelière
diffuse de la séreuse qu’elle affecte.
Formes évolutives
Il est de la taille d’une tête d’épingle et translucide, parfois
Formes diffuses Formes circonscrites

Tubercule gris
entouré d’un liseré congestif.
Il est de la taille d’un grain de mil, plus sombre que le tubercule
Tubercule miliaire gris, avec un centre comportant une nécrose de caséification de
couleur jaune.
Il est de la taille d’un petit pois avec un contenu pâteux,
Tubercule caséeux
homogène et ayant l’aspect et la consistance du mastic.
Elle peut concerner le parenchyme de nombreux organes ou tissus
Infiltration des
et se développe généralement à la faveur d’une baisse importante
parenchymes
des défenses immunitaires de l’animal.
Infiltration Elle correspond à une inflammation congestive, séro-
exsudative des hémorragique ou fibrineuse non spécifique. Cette forme demeure
grandes séreuses néanmoins rarement observée seule.
Formes de réveil et de surinfection
Il se développe à la faveur d’une baisse importante des défenses
immunitaires de l’animal. On observera d’abord une auréole
Foyer de congestive et hémorragique autour d’une lésion stabilisée, puis
ramollissement une ré-imbibition centripète du caséum qui était sec voire calcifié.
Le liquide peut alors rester sur place ou s’évacuer et laisser place
à une caverne tuberculeuse.

- 90 -
Les lésions de tuberculose sont le plus souvent discrètes et localisées au niveau des
ganglions lymphatiques associés aux organes « porte d’entrée ». Néanmoins, l’absence de
lésion au niveau de ces sites spécifiques ne permet pas d’exclure une infection par les
mycobactéries tuberculeuses. De plus, il est important de différencier les lésions stabilisées
des formes évolutives car cela conditionne le type de saisie réalisée suite à l’inspection post-
mortem. (99)

c) Aspects réglementaires de l’inspection à l’abattoir

La recherche de lésions de tuberculose à l’abattoir est très réglementée et possède un


double objectif. Elle assure d’abord la salubrité des aliments en retirant de la consommation
les produits susceptibles de représenter un risque pour la santé publique. Elle permet de plus
de détecter les animaux infectés de tuberculose bovine, notamment dans les départements où
la situation sanitaire vis-à-vis de la maladie est favorable et où l’essentiel de la surveillance se
fait à l’abattoir. Il est ainsi fondamental de garantir une forte sensibilité de cette surveillance.
Compte tenu de la variabilité de l’aspect des lésions, il est nécessaire de ne pas écarter des
lésions évocatrices n’étant pas parfaitement caractéristiques et d’effectuer un diagnostic
d’exclusion grâce à plusieurs méthodes de laboratoire (bactériologie, PCR, histologie). (99)
Les lésions sont soit retrouvées de façon fortuite dans le cadre des opérations
courantes d’abattage d’animaux issus de troupeaux officiellement indemnes de tuberculose
bovine, soit de façon ciblée dans le cadre des abattages diagnostiques ou de l’assainissement
de cheptels infectés par abattages totaux ou partiels. Dans ce dernier cas, les animaux peuvent
être infectés sans être porteurs de lésions visibles. Ainsi, on prélèvera systématiquement les
ganglions rétro-pharyngiens, trachéo-bronchiques et médiastinaux pour les envoyer au
laboratoire, où une analyse histologique et une recherche de mycobactéries par bactériologie
et par PCR par exemple seront effectuées. Dans tous les cas où des lésions évocatrices de
tuberculose ont pu être mises en évidence, il convient de procéder à une inspection renforcée
de la carcasse et des abats de l’animal suspect et des animaux issus du même troupeau
présents le jour de l’abattage. Cette inspection renforcée permet de rechercher la présence
d’éventuelles lésions chez ces individus ayant été en contact direct avec une potentielle source
de contamination. (99)
Le devenir des carcasses suspectes de tuberculose est précisé par le règlement
n°854/2004 du Parlement Européen et du Conseil du 29 avril 2004 (annexe I, section IV,
chapitre IX, point E, alinéa 2). Les viandes provenant de carcasses comportant des lésions au
fort potentiel de dissémination de bacilles dans l’organisme sont déclarées impropres à la
consommation humaine. Les saisies totales concernent donc les bovins présentant des signes
évocateurs d’une infection généralisée ou de multiples lésions situées sur des appareils
distincts. La saisie totale doit également être pratiquée pour toutes les formes évolutives ou de
réveil de tuberculose avec des lésions en cours d’extension. En revanche, on pourra effectuer
seulement des saisies partielles dans le cas de lésions stabilisées localisées sur un seul organe
« porte d’entrée » et ses ganglions associés. La saisie concernera alors l’organe lésé ainsi que
le territoire drainé par le ganglion lymphatique associé lorsqu’il est atteint. Dans tous les cas,
il est impossible de conclure à une tuberculose sur la base d’observations faites à l’abattoir :
on ne peut que décrire la présence de lésions fortement évocatrices d’une forme localisée ou
généralisée de cette maladie, mais d’autres affections peuvent éventuellement provoquer des
lésions similaires. Des examens complémentaires (examen histologique, PCR) doivent donc
obligatoirement être réalisés pour établir un diagnostic de certitude. (99)

- 91 -
ii) Chez l’Homme

Un examen lésionnel macroscopique peut être conduit chez un patient suspect de


tuberculose soit après son décès, à l’autopsie, soit de son vivant sur des pièces d’exérèse.
Cette maladie peut être évoquée suite à la découverte de lésions macroscopiques diverses
telles que des tubercules, une nécrose caséeuse, des ulcérations ou encore des fistules. La
présence de cavernes tuberculeuses se présentant sous la forme de cavités remplies ou
tapissées de caséum peut aussi être observée. Ce sont les lésions les plus caractéristiques de la
maladie. De manière générale, plusieurs types de lésions peuvent coexister sur la même pièce
d’exérèse. Néanmoins, l’examen visuel doit obligatoirement être complété par des coupes
tissulaires après coloration spécifique ou des analyses de laboratoire pour chercher à mettre en
évidence l’agent pathogène. (98)

2) Diagnostic différentiel morphologique

Nous avons pu voir que l’examen morphologique macroscopique des lésions ne


permet pas d’établir de manière sûre le diagnostic de tuberculose. En effet, plusieurs agents
pathogènes sont capables d’induire l’apparition de lésions comparables, d’où la possibilité de
commettre des erreurs. Le diagnostic différentiel comprend donc différentes affections à
l’origine de granulomatoses et d’adénopathies.

i) Chez les bovins

Dans l’espèce bovine, le diagnostic différentiel morphologique de la tuberculose doit


être fait avec les affections responsables d’une adénopathie hypertrophique ou de la formation
de lésions évoquant des tubercules. (101)
Tableau XIII : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel
morphologique de la tuberculose chez les bovins (d’après (6), (97), (102), (103))

Maladie locale ou systémique, chronique, suppurative et granulomateuse


Actinomycose due à Actinomyces bovis. Elle peut provoquer la formation de lésions
granulomateuses de la cavité buccale, de l’œsophage et du réseau.
Maladie dite de la « langue de bois » due à Actinobacillus ligneresii. Des
Actinobacillose lésions granulomateuses peuvent se former dans le parenchyme pulmonaire
et les ganglions lymphatiques, comme le ganglion rétro-pharyngien.
Lymphome malin viro-induit se traduisant par une lymphadénopathie
Leucose bovine
diffuse. L’hypertrophie ganglionnaire peut alors être confondue avec des
enzootique
lésions granulomateuses tuberculeuses.
Tumeur maligne primaire des cellules mésothéliales se développant au
Mésothéliome
niveau des séreuses, d’aspect similaire à des lésions de tuberculose.
Péripneumonie Maladie due à Mycoplasma mycoïdes pouvant mener dans sa forme
contagieuse chronique à une nécrose pulmonaire. Cette dernière est entourée d’une
bovine capsule de tissu conjonctif fibreux mimant un granulome tuberculeux.

D’autres affections plus rares peuvent aussi évoquer des lésions de tuberculose comme
la lymphadénite caséeuse à Corynebacterium pseudotuberculosis, habituellement retrouvée
chez les petits ruminants. Cette maladie se caractérise par la formation d’abcès caséeux au
sein des ganglions lymphatiques et des organes, et peut ainsi avoir un aspect macroscopique
similaire à celui des lésions de tuberculose. (104)

- 92 -
ii) Chez l’Homme

Dans l’espèce humaine, plusieurs agents pathogènes peuvent être à l’origine de la


formation de granulomes et donc entrer dans le diagnostic différentiel morphologique de la
tuberculose. C’est le cas par exemple pour Helicobacter pylori, pouvant être responsable
d’une gastrite granulomateuse ou encore pour Yersinia enterocolitica et pseudotuberculosis,
induisant parfois l’apparition d’une appendicite granulomateuse. (105) Les principales
affections entrant dans le diagnostic différentiel morphologique de la tuberculose chez
l’Homme sont listées dans le tableau XIV.

Tableau XIV : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel


morphologique de la tuberculose chez l’Homme (d’après (106), (107), (108), (109))

Maladie systémique idiopathique se caractérisant par la formation de


Sarcoïdose granulomes immunitaires et affectant principalement la sphère
médiastino-pulmonaire.
Maladie infectieuse due au champignon Histoplasma capsulatum,
Histoplasmose pouvant se présenter dans certains cas sous la forme d’une pneumopathie
chronique pseudo-tuberculeuse.
Maladie auto-immune induisant une vascularite systémique à l’origine de
Maladie de
la formation de granulomes à localisations pulmonaire et oto-rhino-
Wegener
laryngologiques prédominantes.
Inflammation chronique des poumons due à une exposition au béryllium
Bérylliose
pouvant entraîner l’apparition d’une granulomatose systémique avec une
pulmonaire
atteinte médiastino-pulmonaire et hépatique fréquente.
Maladie idiopathique se caractérisant par une infiltration d’un ou
Granulomatose
plusieurs organes par des cellules dendritiques de type Langerhans, le
langerhansienne
plus souvent organisées en granulomes et pouvant affecter les poumons.
Maladie se manifestant par une lymphoprolifération angiocentrique
Granulomatose
atteignant préférentiellement les poumons. Elle est actuellement
lymphomatoïde
considérée comme un lymphome de type B.

La formation de granulomes peut aussi être due à une réaction inflammatoire


entretenue par la présence d’un corps étranger persistant ou d’une tumeur. (107)

3) Diagnostic histologique

Lors de la découverte de lésions suspectes, une analyse histologique peut être conduite
afin de conforter le diagnostic de tuberculose. L’atteinte d’un organe par M. bovis provoque
une inflammation locale se manifestant à l’histologie différemment selon le stade de la
maladie. Lors de la phase aiguë, ou exsudative, l’inflammation est fugace et non spécifique.
De nombreux macrophages sont observables au sein d’un exsudat séro-fibrineux. M. bovis
peut alors être mis en évidence à partir de ce foyer inflammatoire. En l’absence de nécrose
caséeuse, ces lésions sont susceptibles de régresser. (98)

- 93 -
Au cours de la phase subaiguë, ou cellulaire, les phospholipides présents dans la paroi
des bacilles lysés provoquent une réaction tissulaire spécifique à l’origine de la formation de
follicules de Koëster. Deux types de follicules peuvent se développer à ce stade. Le follicule
épithélio-gigantocellulaire correspond à un foyer constitué de nombreuses cellules
épithélioïdes, de quelques cellules géantes de Langhans et d’une couronne périphérique de
lymphocytes (décrit plus en détail dans la partie 2.I.A.2. de cette thèse). Ce follicule n’est pas
spécifique de la tuberculose car il est fréquemment retrouvé dans le cadre d’autres
granulomatoses comme la sarcoïdose chez l’Homme par exemple. Le follicule épithélio-
gigantofolliculaire possède quant à lui une structure similaire mais présente en plus une
nécrose caséeuse centrale très spécifique de la tuberculose. À l’histologie, cette nécrose a un
aspect éosinophile finement granuleux et anhiste, c’est à dire non organisé en tissu.
Lorsqu’elle est récente, on peut aussi y retrouver des débris nucléaires. (98)

Lors de la phase chronique, aussi appelée phase de réparation, le follicule tuberculeux


subit une fibrose cicatricielle. Des fibres de collagène envahissent le foyer tuberculeux pour
former un follicule fibreux. Le caséum présent dans les follicules épithélio-
gigantofolliculaires n’est jamais résorbé spontanément. Il peut soit persister et subir par la
suite une calcification, soit être éliminé par fistulisation dans une cavité ou par effraction
cutanée. Parmi toutes ces lésions, seuls les follicules avec une nécrose caséeuse sont
suffisamment spécifiques pour confirmer le diagnostic de tuberculose, de même que la
détection du bacille sur des coupes histologiques après l’utilisation d’une coloration ou d’une
technique appropriée. Ces méthodes seront étudiées plus en détail dans la partie III.A.2. (98)

Figure 30 : Follicule fibreux calcifié (70)

(coloration hématoxyline et éosine)

- 94 -
C) Mise en évidence indirecte des lésions par les techniques d’imagerie

Différentes techniques d’imagerie peuvent être utilisées. Même si elles ne permettent


pas à elles seules d’identifier la maladie, elles peuvent orienter le diagnostic en faveur d’une
tuberculose ou non. L’ensemble de ces techniques n’est pas mis en œuvre chez les bovins
pour des raisons budgétaires et matérielles ; de tels examens ne sont donc pratiqués qu’en
médecine humaine.

1) L’examen radiographique dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire

La radiographie du thorax est un examen fréquemment réalisé dans le cadre de la


recherche de tuberculose chez l’Homme. Elle permet d’identifier parmi les malades
présentant des signes respiratoires ceux dont les lésions peuvent être évocatrices de
tuberculose pulmonaire. Les anomalies radiographiques sont retrouvées classiquement dans le
segment postérieur du lobe pulmonaire supérieur ou le segment apical du lobe inférieur. (110)

Tableau XV : Principales anomalies radiographiques retrouvées lors de tuberculose


pulmonaire active (d’après (98) et (110))

Lésion Description
Zones d’opacité tissulaire à limites nettes, de forme arrondie et de taille
Nodules
variable (de cinq millimètres à plus d’un centimètre)
Zones d’opacité tissulaire aux contours irréguliers dégradés en périphérie et
Infiltrations
de taille variable, parfois étendues à tout un lobe.
Zones d’hyperclarté souvent prolongées à leur pôle inférieur par des lignes
opaques parallèles dirigées vers le hile du poumon, correspondant à la
Cavités bronche de drainage. Un fond d’opacité liquidienne peut parfois être observé à
l’intérieur, correspondant à du caséum liquéfié. Les images de cavités sont les
plus évocatrices de tuberculose.

Les différentes lésions décrites dans le tableau XV sont couramment présentes lors
d’une tuberculose active et peuvent coexister chez le même malade. Lorsque la maladie
évolue, le processus de fibrose et de destruction du parenchyme pulmonaire peut conduire à la
rétraction des structures anatomiques adjacentes et entraîner une déviation de la trachée, la
rétraction de lobes pulmonaires ou encore une déformation et un déplacement de la silhouette
cardiaque. Les images radiographiques peuvent alors évoquer des séquelles de tuberculose,
avec la présence d’éléments d’opacité minérale correspondant à des nodules calcifiés ou
encore des zones d’opacité tissulaire correspondant à une fibrose cicatricielle. (98)
Néanmoins, aucune image radiographique ne permet d’établir le diagnostic de certitude car
diverses affections (pneumonies, sarcoïdose, etc.) peuvent produire de telles images. Il est
donc nécessaire d’effectuer des examens bactériologiques pour conclure.

2) L’apport de l’imagerie dans le diagnostic de la tuberculose

La tuberculose peut impliquer une grande variété d’organes et donc se traduire par de
multiples signes aux différents examens d’imageries. Les techniques utilisables pour orienter
le diagnostic sont la radiographie (RX), l’échographie (US pour UltraSonography) et la
tomodensitométrie (CT pour Computed Tomography).

- 95 -
Pour l’examen des patients pédiatriques ou les femmes enceintes, chez qui les rayonnements
doivent être évités, l’imagerie à résonance magnétique (IRM) peut également être indiquée à
la place de la tomodensitométrie. (111)

Tableau XVI : Les différents examens d’imagerie utilisables en fonction de la


localisation des lésions de tuberculose (d’après (111), (112))

Localisation de
Technique utilisable et images observables
la tuberculose
RX Des calcifications peuvent apparaître dans les stades tardifs.
Péricarde CT / Un amincissement ou des calcifications du péricarde peuvent être
IRM mis en évidence, ainsi qu’un épanchement péricardique.
RX Des cavités, des nodules et des infiltrations peuvent être retrouvées.
Poumon Permet d’évaluer l’atteinte des ganglions pulmonaires et les lésions
CT /
du parenchyme. Un épanchement pleural ou des caséifications
IRM
peuvent aussi être observées.
Adhérence de ganglions juxtaposés parfois associée à une
US
Ganglions vascularisation de leur centre et à un œdème périphérique.
lymphatiques CT / Adhérence de ganglions juxtaposés dont la densité dépend de
IRM l’avancement de leur caséification.
Les méninges apparaissent hyper-intenses en pondération T1 lors de
Système
IRM méningite tuberculeuse. Des tubercules cérébraux peuvent aussi être
nerveux central
observés. Ils apparaissent différemment selon leur caséification.
RX Une scoliose ou une gibbosité peuvent être retrouvées.
Rachis C’est l’examen de choix car il permet d’observer les lésions
IRM osseuses ainsi qu’une éventuelle compression médullaire, ou la
présence d’un abcès du muscle ilio-psoas ou paravertébral.
Os RX Observation de foyers d’ostéolyse et de réaction périostée.
US Peut mettre en évidence une effusion articulaire non spécifique.
Articulations
CT Permet d’établir le degré de destruction osseuse de l’articulation.
Un épaississement de la paroi intestinale est classiquement retrouvé,
Estomac et CT /
notamment au niveau de l’iléon terminal et du cæcum. Le pylore
intestins IRM
peut aussi présenter une lésion similaire.
La nécrose apparaît comme des zones d’opacité diminuée par
Foie et rate CT rapport au parenchyme. Des nodules peuvent être visibles et se
manifestent par des structures circulaires d’opacité plus élevée.
RX Des foyers de calcification peuvent être présents.
Une corticale irrégulière peut être observée dans les stades précoces
US de la maladie puis évoluer vers le développement de masses
Rein
hyperéchogènes. Le parenchyme rénal peut être déformé et calcifié.
CT / Une hydronéphrose ou des cicatrices et des lésions du parenchyme
IRM rénal peuvent être observées.

- 96 -
Figure 31 : Exemples d’images pouvant être observées lors de tuberculose pulmonaire
chez l’Homme

A : Coupe transversale tomodensitométrique de poumons atteints de tuberculose milliaire (113) ; B :


Radiographie pulmonaire mettant en évidence la présence d’une cavité tuberculeuse (flèche blanche)
(114) ; C : Coupe transversale tomodensitométrique de poumons présentant une volumineuse cavité
remplie d’air (113)

Les différents examens endoscopiques (laparoscopie, fibroscopie, thoracoscopie,


cœlioscopie, etc.) peuvent aussi permettre d’observer directement certaines lésions. Ils
peuvent être effectués dans le cadre du diagnostic de la tuberculose afin de pratiquer des
biopsies ou des exérèses pour analyses. Des nodules isolés ou des lésions diffuses peuvent
aussi être retrouvés au cours de ces examens de façon fortuite et mener à la réalisation de
plusieurs examens complémentaires. (98)

- 97 -
II) Diagnostic immunologique et dépistage

Nous avons vu que l’étude des lésions de tuberculose permet souvent d’orienter le
diagnostic. Néanmoins, elle est plus facilement réalisée de manière post mortem car elle
nécessite généralement la mise en œuvre de mesures très invasives, difficiles à envisager du
vivant du patient. Ainsi, d’autres méthodes sont utilisables chez des individus vivants afin de
détecter la présence de tuberculose. C’est le cas notamment des techniques permettant de
mettre en évidence la présence d’une immunité dirigée contre M. bovis.

A) Mise en évidence de l’immunité cellulaire

1) L’intradermotuberculination

i) Principe de l’intradermotuberculination

L’intradermotuberculination est la méthode de dépistage de la tuberculose la plus


couramment utilisée en médecine bovine et humaine. Elle consiste à injecter dans le derme de
la tuberculine, puis apprécier au bout de 72 heures la réaction obtenue au point d’inoculation.
La tuberculine est constituée d’un ensemble d’haptènes, également appelés PPD (Purified
Protein Derivative ou dérivés protéiques purifiés), extraits d’une culture de bacilles
tuberculeux. Une fois injectés, les haptènes peuvent réagir avec les anticorps correspondants
si ces derniers sont présents au niveau du derme, sans pour autant induire leur formation chez
un individu naïf. (3) En réaction aux antigènes mycobactériens apportés par la tuberculine, la
formation de complexes antigène-anticorps chez les individus infectés mène à l’activation des
clones de lymphocytes T spécifiques qui commencent alors à produire des cytokines
entraînant un afflux massif de macrophages et de LT CD4. Parallèlement à cette réaction, les
kératinocytes se mettent à proliférer dans la couche basale de l’épiderme. L’ensemble de ces
phénomènes se traduit par une réaction cutanée caractérisée par un aspect typique de papule
indurée érythémateuse. Ce test permet donc de révéler l’état d’hypersensibilité retardée d’un
organisme infecté par des bacilles tuberculeux sans engendrer de mémoire immunitaire pour
les antigènes introduits. (67)
Les tuberculines existantes chez les bovins sont celles préparées à partir de M. bovis
pour l’intradermotuberculination simple (IDS) et à partir de M. avium, utilisable en
complément de la tuberculine bovine pour effectuer une intradermotuberculination
comparative (IDC). La tuberculine humaine est quant à elle préparée à partir de M.
tuberculosis mais peut néanmoins mettre en évidence une infection par M. bovis. La dose
moyenne utilisée pour réaliser une intradermotuberculination chez les bovins est de 2 000 UI,
tandis qu’elle est de l’ordre de dix à cinquante UI chez l’Homme. (3)

ii) L’intradermotuberculination chez les bovins dans le cadre du dépistage

a) La réalisation de l’intradermotuberculination simple chez les bovins

Pour réaliser une IDS, le vétérinaire doit d’abord s’assurer auprès de l’éleveur
qu’aucun traitement ou injection n’a été administré au niveau de la zone où la tuberculination
aura lieu. De plus, aucune lésion cutanée ne doit être présente dans cette zone car les résultats
de la tuberculination pourraient alors être faussés. L’IDS doit être pratiquée au niveau du tiers
médian d’une des faces de l’encolure, approximativement à égale distance des bords supérieur
et inférieur de celle-ci. (Fig. 32) (3)

- 98 -
Figure 32 : Localisation de l’injection de tuberculine lors d’une IDS (3)

La zone d’injection doit être nettoyée et rasée. L’épaisseur du pli de peau est mesurée
à l’aide d’un cutimètre. L’équivalent de 2 000 UI de tuberculine bovine (soit environ 0,1 mL)
est ensuite injecté au moyen d’un pistolet injecteur de type McClintock ND, avec un angle
d’environ 15° entre la peau et la seringue afin que le produit soit bien administré dans le
derme. Un léger renflement de la peau caractéristique de la présence intradermique de la
tuberculine doit être visible. Si ce dernier est absent, une nouvelle injection doit être effectuée
à un autre endroit car le produit a probablement été injecté dans le tissu sous-cutané. (3)

Figure 33 : Différentes étapes de l’IDS (d’après (74))


A : Mesure du pli de peau avant l’injection de tuberculine ; B : Pistolet injecteur de type McClintock ;
C : Injection intradermique de tuberculine ; D : Exemple de résultat positif : présence d’une réaction
inflammatoire provoquant une tuméfaction elliptique et chaude de la peau.

La réaction apparaît au bout de 48 heures et atteint son maximum au bout de 72


heures. La lecture des résultats peut être qualitative (présence d’un œdème, exsudation,
nécrose, etc.), mais ceci n’est pas réglementaire. Une appréciation quantitative de
l’augmentation de l’épaisseur du pli de peau doit être réalisée. Si un épaississement
circonscrit de moins de deux millimètres est présent, la réaction est considérée comme
négative. Une augmentation de l’épaisseur du pli de peau atteignant quatre millimètres ou
plus correspond à une réponse positive. Le résultat est considéré comme « non négatif » si
l’épaississement cutané est compris entre deux et quatre millimètres. (74)

- 99 -
L’IDS est un examen facile à réaliser, relativement peu coûteux, inoffensif et non
sensibilisant. Elle possède une sensibilité individuelle plutôt bonne (de l’ordre de 0,84) ce qui
lui procure une excellente sensibilité à l’échelle du troupeau. En effet, il suffit qu’un seul
animal infecté donne un résultat positif pour qu’un cheptel infecté soit détecté, ce qui fait de
l’IDS un excellent test de dépistage. En revanche, l’IDS est un examen chronophage car il
nécessite deux déplacements et la lecture des résultats reste dépendante de l’opérateur, même
avec l’utilisation d’un cutimètre, ce qui empêche une standardisation de ce test. De plus,
même si la spécificité moyenne est de 0,97, la valeur de cette dernière chute avec le nombre
d’animaux testés. Pour un troupeau de 50 individus, la spécificité troupeau correspondante est
seulement de 0,22. De façon générale, un animal qui présente une réaction positive ou « non
négative » à l’IDS est alors ensuite soumis à une intradermotuberculination comparative
(IDC) qui est un examen moins sensible (autour de 0,8) mais beaucoup plus spécifique (de
l’ordre de 0,995). L’IDC ne peut être effectuée qu’au moins six semaines après la première
IDS afin d’éviter d’éventuels phénomènes de désensibilisation. (3)

b) L’intradermotuberculination comparative

L’IDC fonctionne sur le même principe que l’IDS et consiste à comparer l’intensité
des réactions vis-à-vis de deux tuberculines. Une injection de tuberculine aviaire est pratiquée
sur une face de l’encolure, dix à quinze centimètres crânialement à celle de tuberculine
bovine. (Fig. 34) (3)

Figure 34 : Localisation des injections de tuberculine lors d’une IDC (3)

Au bout de 72 heures, on compare les épaississements cutanés respectifs. M. avium


ayant une plus grande parenté avec les autres mycobactéries atypiques qu’avec M. bovis et M.
tuberculosis, les mycobactérioses non spécifiques s’exprimeront de manière plus intense par
l’intradermotuberculination à la tuberculine aviaire. Les résultats peuvent être interprétés à
l’aide du tableau XVII. (3)

Tableau XVII : Grille de lecture de l’IDC (d’après (3))

Différence d’épaississement entre


Tuberculine bovine Réaction
réactions aux tuberculine bovine et aviaire
(DB – DA) > 4 mm POSITIVE
Si DB > 2 mm 1 mm < (DB – DA) < 4 mm DOUTEUSE
(DB – DA) < 1 mm NÉGATIVE
Si DB ≤ 2 mm Quelle que soit (DB - DA) NÉGATIVE

DA = épaississement cutané au point d’injection de la tuberculine aviaire ; DB = épaississement


cutané au point d’injection de la tuberculine bovine

- 100 -
Les résultats doivent être interprétés à l’échelle du troupeau en reportant sur un
graphique les différents épaississements mesurés sur les animaux (Fig. 35). Si plusieurs points
sont répartis dans la zone de positivité, le résultat global est positif. Si les résultats sont plutôt
retrouvés dans les secteurs négatif et douteux, le résultat global est douteux. (3)

Figure 35 : Représentation graphique des résultats obtenus avec une IDC (d’après (3))

En pratique, l’IDC est pratiquée en deuxième intention lorsqu’un résultat « non


négatif » est obtenu lors du dépistage avec une IDS, ou en première intention dans les
départements où la fréquence des réactions non spécifiques est élevée. Il faut néanmoins se
méfier des résultats faussement négatifs, la sensibilité de l’IDC étant moins importante que
celle de l’IDS. (3)

c) Interprétation des résultats

Les résultats d’intradermotuberculination doivent obligatoirement être transmis à la


DD(CS)PP (Direction Départementale de la Cohésion Sociale et de la Protection des
Populations) par le vétérinaire sanitaire. Suite au dépistage par intradermotuberculination, une
réaction « non négative » pour un individu donné peut correspondre soit à un « animal
positif », lorsque le contexte d’interprétation est défavorable et que le résultat est a priori
spécifique, soit à un « animal à statut non déterminé » lorsque le contexte est favorable et que
le résultat est probablement lié à une réaction faussement positive. Un contexte défavorable
ou favorable est défini selon un ensemble de critères permettant de déterminer si la présence
de tuberculose est respectivement probable ou non dans un élevage donné. Le recours au test
à l’IFN-γ est aussi réalisable dans les cinq jours suivant la lecture de
l’intradermotuberculination pour aider à l’interprétation de la suspicion. Néanmoins, lorsque
le test réalisé en première intention est une IDC, un résultat positif est forcément associé à un
« animal positif ». (115)

- 101 -
Tableau XVIII : Interprétation d’une réaction d’intradermotuberculination « non
négative » dans le cadre du dépistage de la tuberculose (d’après (115))

Critères
Contexte favorable Contexte défavorable
d’interprétation
Circonstance de - Prophylaxie de routine - Investigation de lien
dépistage - Contrôle d’introduction épidémiologique
- Troupeau classé à risque sanitaire
Historique du - Troupeau régulièrement dépisté - Troupeau suspect
troupeau avec des résultats négatifs - Introductions fréquentes d’animaux
en provenance d’origines différentes
- Relations de voisinage avec des
Voisinage de - Absence de voisinage avec des élevages infectés depuis moins de
foyers foyers récents de tuberculose cinq ans ou des zones où la faune
sauvage a été infectée
Nombre et
- Réactions faiblement positives et - Réactions nettement positives et
intensité des
peu nombreuses nombreuses
réactions
Suspicion faible : Suspicion forte :
Décision
Animal à statut non déterminé Animal positif

iii) L’utilisation de l’intradermotuberculination chez l’Homme

L’intradermotuberculination peut avoir plusieurs indications en médecine humaine.


Elle est utilisée dans les enquêtes autour d’un cas de tuberculose pour le dépistage de
personnes fréquemment exposées à la maladie ou encore en test pré-vaccinal chez l’enfant de
plus de quatre semaines. L’injection de 0,1 ml de solution de tuberculine doit être effectuée
par voie intradermique stricte au niveau du tiers proximal de la face antérieure de l’avant-bras,
à distance de toute cicatrice ou lésion éventuelle. Une papule dermique blanche surélevée
donnant un aspect de « peau d’orange » doit alors se former si les modalités techniques ont
rigoureusement été maîtrisées. La lecture de la réaction s’effectue idéalement dans les 72
heures suivant l’injection et l’induration est mesurée précisément de manière transversale par
rapport au sens de l’injection. (98)

L’interprétation de l’intradermotuberculination chez l’Homme repose d’une part sur la


taille de l’induration et d’autre part sur un ensemble de considérations épidémiologiques. Le
test est considéré comme positif lorsque le diamètre d’induration est supérieur à cinq
millimètres. Néanmoins, plusieurs éléments sont à prendre en compte pour interpréter
correctement le test. Dans les zones d’endémie de tuberculose, la majorité des
intradermotuberculinations positives témoignent d’une véritable infection. Un diamètre
d’induration supérieur à cinq millimètres semble donc un seuil de positivité valide. De même,
l’altération de l’immunité cellulaire chez les patients infectés par le VIH ou immunodéprimés
justifie un seuil de positivité du test pour un épaississement cutané de plus de cinq
millimètres. Il est d’ailleurs recommandé de pratiquer un dépistage de la tuberculose dès la
découverte de la séropositivité pour le VIH d’un patient afin d’en optimiser l’interprétation.

- 102 -
À l’inverse, dans les zones où la prévalence de la tuberculose est plus limitée, un
épaississement cutané compris entre cinq et neuf millimètres est plus souvent le reflet de la
sensibilisation avec d’autres mycobactéries non tuberculeuses. De même, dans les premières
années suivant la vaccination par le BCG, une induration pouvant dépasser les dix millimètres
peut apparaître lors d’une intradermotuberculination. On considère qu’un épaississement de
plus de dix millimètres signe une infection par un bacille tuberculeux sauvage dans plus de
90 % des cas au-delà de dix ans après la vaccination. Le tableau XIX présente les bases de
l’interprétation d’une intradermotuberculination chez l’Homme. (67)

Tableau XIX : Aide à l’interprétation de l’intradermotuberculination dans le cadre


exclusif de la décision thérapeutique (d’après (67))

Induration de
BCG < 10 ans BCG ≥ 10 ans Absence de BCG
la peau
< 5 mm NÉGATIF : pas de traitement
POSITIF
Entre 5 et 9
millimètres En faveur d’une
réaction due au BCG En faveur d’une infection
En faveur d’une
ou d’une infection plutôt ancienne par un
réaction due au BCG
par un bacille bacille tuberculeux
tuberculeux
Pas de traitement sauf pour
Pas de traitement, surveillance à 3 mois.
les enfants de moins de 15
À adapter selon le risque d’exposition
ans. Surveillance à 3 mois
POSITIF
Entre 10 et 14
millimètres En faveur d’une
réaction due au BCG En faveur d’une infection ancienne ou récente par
ou d’une infection par un bacille tuberculeux
un bacille tuberculeux
Traitement si enfant de moins de 15 ans ou si le contexte est en faveur
d’une infection récente, sinon surveillance à 3 mois
POSITIF
≥ 15 mm
Infection probablement récente par un bacille tuberculeux : traitement

2) Le test à l’interféron gamma

Nous avons pu voir que l’intradermotuberculination est le test de dépistage de


référence chez les bovins et chez l’Homme. Néanmoins, il possède un certain nombre de
limites. Par exemple ce test n’est pas fiable chez des individus immunodéprimés, vaccinés
(chez l’Homme) ou exposés à des mycobactéries non-tuberculeuses donnant lieu à des
résultats difficilement interprétables. De plus, les conditions de réalisation, de lecture et
d’interprétation de l’intradermotuberculination peuvent varier selon l’expertise du praticien.
Ainsi, un test sanguin basé sur la mesure de l’IFN-γ a été développé. (116)

- 103 -
L’IFN-γ est une interleukine intervenant dans le recrutement et la mobilisation des
macrophages. Chez les individus infectés par des mycobactéries tuberculeuses, les
lymphocytes T circulant dans le sang sont sensibilisés aux antigènes mycobactériens. Lorsque
ces cellules sont mises en contact in vitro avec ces derniers, elles se mettent à excréter de
l’IFN-γ qui peut ensuite être dosé par une méthode immunologique ELISA. (Enzyme-Linked
ImmunoabSorbent Assay). Un relargage élevé d’IFN-γ sera alors le témoin d’une
sensibilisation des lymphocytes T par des antigènes mycobactériens. Le délai entre le
prélèvement sanguin et la mise en œuvre du dosage ne doit pas excéder 12 heures car après 16
heures d’incubation, les lymphocytes T vont commencer à produire de l’IFN-γ, même en
absence de contact avec des antigènes mycobactériens. (116)
L’emploi du dosage de l'IFN-γ dans l’espèce bovine à l’heure actuelle peut être
effectué en parallèle à une intradermotuberculination dans le cadre de procédures d’abattage
sélectif, dans les cheptels en suivi renforcé ou encore en remplacement de l’IDS dans certains
départements comme la Camargue sur des animaux de combat où la contention est
impossible. Les avantages chez les bovins du dosage de l’IFN-γ sont de ne nécessiter qu’une
seule intervention dans l’élevage, de posséder une sensibilité équivalente voire supérieure à
celle de l’IDS (de l’ordre de 0,88) et de fournir un résultat objectif au bout de 24 heures.
L’inconvénient majeur de cette méthode tient à sa spécificité moins bonne que pour l’IDS (de
l’ordre de 0,966). De plus, les prélèvements doivent être analysés rapidement et le prix de ce
test est beaucoup plus élevé que pour une intradermotuberculination. (3) Les tests disponibles
pour l’espèce bovine comme le BOVIGAM® font intervenir des PPD comme antigènes
mycobactériens. Il a été prouvé que l’utilisation des protéines ESAT-6 et CFP-10 comme
antigènes pour le test à l'IFN-γ permettait d’améliorer sa spécificité et pouvait constituer une
perspective pour améliorer le test. (117)
Il existe deux tests actuellement disponibles en médecine humaine : le QuantiFERON-
TB-Gold® de Cellestis et le T-SPOT.TB® d’Oxford Immunotec. Les antigènes utilisés par
ces deux tests sont les protéines ESAT-6 et CFP-10 se trouvant dans la région génomique
RD1. Cette région de différence étant absente chez les souches de M. bovis BCG, le résultat
de ces tests n’est pas modifié par la vaccination. La spécificité varie entre 0,76 et 1, en étant
un peu meilleure pour le QuantiFERON-TB-Gold® et la sensibilité autour de 0,92, le T-
SPOT.TB® étant un peu plus sensible. (116)

3) Aspects réglementaires du dépistage chez les bovins en France

Le décret n°2012-854 du 30 juin 2012 définit la tuberculose due à M. bovis ou M.


tuberculosis comme un danger sanitaire de première catégorie chez tous les mammifères.
Néanmoins, les bases réglementaires du contrôle de la tuberculose bovine remontent au décret
du 19 mars 1963 et l’arrêté ministériel du 23 juin 1965 rend les mesures de lutte obligatoires
sur l’ensemble du territoire. La réglementation a ensuite subi des modifications importantes
pour parvenir aux mesures prophylactiques collectives appliquées actuellement, définies par
l’arrêté ministériel du 15 septembre 2003 et consolidé le 3 septembre 2017. (3)
Dans le cadre de la prophylaxie collective, les détenteurs d’animaux sur l’ensemble du
territoire ont l’obligation de prendre toutes les dispositions nécessaires pour aider à la
réalisation des mesures de dépistage sur leurs animaux. (118) Bien que la surveillance à
l’abattoir soit systématique, le rythme de dépistage par tuberculination varie d’un département
à l’autre en fonction de la prévalence annuelle des cheptels bovins infectés. Ce rythme peut
aller d’un test annuel sur tous les individus de plus de six semaines jusqu’à un arrêt de la
prophylaxie. Un zonage du département peut aussi être effectué avec le renforcement du
dépistage dans certaines communes en fonction d’une analyse de risque sanitaire.

- 104 -
Certaines exploitations classées à risque en raison de l’existence de liens épidémiologiques
avec un élevage infecté peuvent aussi être dépistées annuellement pendant une période de
trois à cinq ans indépendamment du rythme départemental. Un dépistage systématique à
l’introduction doit être effectué pour les animaux transitant depuis plus de six jours, quittant
une exploitation classée à risque ou transitant par une exploitation à fort taux de rotation.
(119)
La recherche des animaux tuberculeux se faisant principalement par
intradermotuberculination, la vaccination ou toute administration de produit à effet
sensibilisant ou désensibilisant à l’égard de la réaction à la tuberculine sont interdites. Le test
de dosage à l’IFN-γ, l’examen histologique, la culture bactérienne et la méthode PCR agréée
sont également autorisées pour la recherche de tuberculose bovine, dans la mesure où ces
examens sont conduits conformément aux méthodes et techniques recommandées par le
laboratoire national de référence. L’arrêté du 15 septembre 2003 définit ensuite les différents
types d’animaux et d’élevages en fonction des résultats obtenus lors du dépistage. (Annexe 2)
Un animal indemne provient d’un troupeau officiellement qualifié d’indemne. Ce dernier
correspond à un cheptel ne présentant pas de signes cliniques, ayant des bovins de plus de six
semaines négatifs à deux intradermotuberculinations (IDS ou IDC) de six mois à un an
d’intervalle, n’introduisant que des animaux de plus de six semaines venant d’élevages
indemnes, isolés à leur arrivée et ayant des résultats négatifs à deux
intradermotuberculinations de suite. Un animal suspect présente à l’abattoir des lésions
évocatrices de tuberculose ou une intradermotuberculination non négative. Le troupeau sera
alors qualifié de suspect lui aussi. Un animal infecté présente au moins deux critères
d’infection par un bacille tuberculeux : des signes cliniques évocateurs, une
intradermotuberculination positive, une PCR positive ou encore des lésions histologiques. Le
troupeau sera aussi qualifié d’infecté et les animaux de ce dernier n’appartenant pas à la
définition de l’animal infecté seront qualifiés de contaminés. (118) Tous les troupeaux
suspects d’être infectés suite au dépistage sont placés sous arrêté préfectoral de mise sous
surveillance (APMS) et plusieurs examens peuvent alors être conduits afin de déterminer la
présence ou non de la maladie dans ces troupeaux. (118)

Figure 36 : Arbre décisionnel de la conduite à tenir en fonction des résultats de


l’intradermotuberculination lors du dépistage chez les bovins (d’après (115))

- 105 -
Si la présence de la maladie est avérée, le troupeau est mis sous arrêté préfectoral
portant déclaration d’infection (APDI) et plusieurs mesures d’assainissement sont alors
prescrites. (Annexe 3) L’abattage total d’un cheptel déclaré infecté de tuberculose est
obligatoire sur l’ensemble du territoire et doit être pratiqué dans un délai limité à 30 jours
pour les bovins infectés. De nouveaux individus ne peuvent être introduits que lorsque le
dernier animal dont l’abattage a été ordonné a été abattu, que les locaux et le matériel à
l’usage des animaux ont été désinfectés et qu’une période de vide sanitaire a été appliquée. Le
troupeau de renouvellement pourra ensuite retrouver la qualification « d’officiellement
indemne » après la réalisation des tests prévus et des exigences de l’article 13 de l’arrêté du
15 septembre 2003. (Annexe 2) (118)

B) Mise en évidence de l’immunité humorale

La réaction humorale après une infection par un bacille tuberculeux peut être mesurée
au moyen d’un test sérologique. Le principe est de mesurer le taux d’anticorps spécifiques des
antigènes de mycobactéries tuberculeuses présents dans le sérum d’un individu par ELISA
pour ainsi déterminer la présence ou non d’une infection. Même si cette méthode permet de
de différencier les patients tuberculeux des autres, elle manque fortement de spécificité
(variant entre 0,74 et 0,85) et de sensibilité (variant entre 0,61 et 0,75) menant respectivement
à de nombreux résultats faux positifs et faux négatifs. (120) Ceci est dû à la grande
hétérogénéité de la réponse humorale chez les individus atteints de tuberculose, à l’apparition
tardive des divers anticorps en cas d’infection par un bacille tuberculeux et aux réactions
croisées avec d’autres antigènes de mycobactéries environnementales. Plusieurs essais ont été
menés afin d’améliorer les tests sérologiques. Les mycobactéries étant des micro-organismes
intracellulaires, elles sont donc protégées de l’effet biologique des anticorps. Néanmoins, le
fait que certains antigènes soient sécrétés dans le compartiment extracellulaire justifie
l’évaluation de la réponse humorale et son application dans le diagnostic de la tuberculose.
Ainsi, des tests sérologiques efficaces contenant différents antigènes spécifiques pourraient
voir le jour à l’avenir afin d’évaluer la réponse immunitaire humorale. (121)

- 106 -
III) Mise en évidence de l’agent pathogène

Les arguments cliniques, anatomopathologiques et immunologiques ne sont pas


suffisamment spécifiques de la tuberculose et ne permettent d’avoir qu’une suspicion. C’est la
mise en évidence de bacilles tuberculeux à partir de produits pathologiques qui permet
d’établir le diagnostic de certitude de la maladie. Les méthodes bactériologiques réalisables
comprennent la recherche de BAAR par l’examen microscopique, la mise en culture sur des
milieux spécifiques ou l’identification par des méthodes moléculaires du génie génétique.

A) L’examen microscopique

1) Les prélèvements

L’étape initiale d’un examen bactériologique correspond au recueil de prélèvements.


Chez un individu vivant suspect de tuberculose, M. bovis peut être mis en évidence à partir de
lésions suspectes retrouvées sur un organe suite à une ponction, une biopsie ou une exérèse
chirurgicale. D’autres échantillons peuvent être adressés au laboratoire en fonction de la
localisation suspectée de la maladie chez un individu. Par exemple, pour le diagnostic de
méningite tuberculeuse, du liquide cérébro-spinal est prélevé par ponction lombaire. Les
urines peuvent aussi être analysées pour vérifier la présence ou non d’une tuberculose rénale.
Dans le cas de formes pulmonaires chez l’Homme, le recueil du produit d’expectorations
spontané est pratiqué de manière courante afin de rechercher la présence de bacilles
tuberculeux. En cas de négativité dans un contexte clinique évocateur, il est aussi possible de
prélever du contenu gastrique par « tubage » chez un patient à jeun qui aura pu déglutir des
bacilles ou encore d’effectuer une aspiration des secrétions bronchiques. Un lavage broncho-
alvéolaire est aussi réalisable après trois prélèvements négatifs par « tubage » chez un patient
suspect ou chez les bovins. (110) Suite au décès d’un individu potentiellement atteint de
tuberculose, le prélèvement d’un tissu pathologique suspect peut être analysé à partir de
lésions visibles à l’abattoir ou lors d’une autopsie. (98)

2) La mise en évidence de mycobactéries par différentes méthodes

i) Les différentes méthodes de coloration

Nous avons déjà vu que les mycobactéries possèdent des affinités tinctoriales
particulières du fait de leur acido-alcoolo-résistance. Ainsi, la coloration à l’hématoxyline et à
l’éosine couramment utilisée en anatomopathologie n’est pas adaptée pour la mise en
évidence des mycobactéries. La coloration de Ziehl-Neelsen (Fig. 3) est la plus classiquement
utilisée pour cet objectif. Elle exploite les propriétés des mycobactéries pour les colorer
spécifiquement. Les acides mycoliques de ces dernières fixent directement la fuschine
assurant l’intensité de la coloration. Ils constituent ensuite une barrière physique prévenant
l’action décolorante de l’acide sulfurique et de l’alcool à 90°. La contre coloration au bleu de
méthylène permet une lecture simplifiée de la lame car elle ne pénètre pas dans les
mycobactéries qui apparaissent alors rouges sur fond bleu. Une coloration à l’auramine peut
aussi être réalisée. Cette dernière repose sur le même principe que la coloration de Ziehl-
Neelsen. Les bacilles fixent le colorant fluorescent et le conservent après effet de l’acide et de
l’alcool. La lecture des lames est simplifiée avec cette coloration car les mycobactéries
émettent une fluorescence jaune sur un fond noir. L’inconvénient principal de cette technique
est qu’elle nécessite l’utilisation d’un microscope à fluorescence plus onéreux. (122)

- 107 -
La spécificité de ces techniques de coloration est plutôt bonne, bien que des
confusions peuvent être faites à cause de mycobactéries non tuberculeuses étant elles aussi
mises en évidence par ces méthodes. De plus, certaines bactéries du genre Nocardia et
Rhodococcus peuvent présenter des degrés variables d’acido-alcoolo-résistance et ainsi mener
à des erreurs d’interprétations. La sensibilité de ces méthodes de coloration est assez faible.
Elle est de l’ordre de 50 % à 70 % lorsqu’elles sont appliquées à des échantillons
d’expectorations chez l’Homme. De plus, les lésions de tuberculose sont qasi exclusivement
paucibacillaires, ainsi la présence de bacilles acido-alcoolo-résistantes n’est pas toujours
détectée. Le diagnostic bactériologique de la tuberculose est donc amélioré par le nombre
d’échantillons examinés. (110)

Figure 37 : Bacilles acido-alcoolo-résistantes vues au microscope à fluorescence après


une coloration à l’auramine (123)

ii) Méthodes de lecture et interprétation des résultats

Après une coloration de Ziehl-Neelsen, la lecture des lames s’effectue avec un


microscope optique binoculaire muni d’un objectif à immersion permettant un grossissement
de 100. Cette technique est simple, peu onéreuse et rapide. Les bacilles acido-alcoolo-
résistants sont alors comptabilisés.
Après une coloration à l’auramine, la lame est examinée au microscope à fluorescence
avec un objectif à sec un grossissement de 25. Le microscope est équipé d’une lampe à rayons
ultraviolets permettant de mettre en évidence les bacilles ayant fixé l’auramine. Même si la
lecture est plus rapide avec cette technique, cette dernière nécessite de disposer de techniciens
formés et d’un équipement plus onéreux.
Après la lecture des lames, les résultats sont ensuite exprimés de façon semi-
quantitative. (Tableau XX) (98)

- 108 -
Tableau XX : Interprétation des résultats de la lecture de lames colorées par la méthode
de Ziehl-Neelsen et par coloration à l’auramine (d’après (98))

Nombre de BAAR Interprétation


Coloration de Ziehl-Neelsen (objectif à immersion X100)
Pas de BAAR sur la lame 0
Un à neuf BAAR sur la lame Nombre exact de BAAR
10 à 99 BAAR sur la lame +
Un à dix BAAR par champ ++
Plus de dix BAAR par champ +++
Coloration à l’auramine (objectif X25)
Pas de BAAR sur la lame 0
Un à dix BAAR sur la lame Douteux
Moins de un BAAR par champ mais plus de dix sur la lame +
Un à dix BAAR par champ ++
10 à 99 BAAR par champ +++
Plus de 100 BAAR par champ ++++

Lorsque le résultat semble douteux suite à la lecture en fluorescence d’une lame, il est
possible de la recolorer au Ziehl-Neelsen et refaire une lecture pour conclure.

iii) L’immunohistochimie

L’immunohistochimie est une méthode de localisation de certaines protéines au sein


d’une coupe de tissu au moyen d’anticorps. Dans le cas de la recherche de M. bovis, des
anticorps polyclonaux dirigés contre ses antigènes et conjugués à une peroxydase sont utilisés.
Les mycobactéries sont ensuite visualisées grâce à la réaction enzymatique colorée permise
par la peroxydase fixée aux anticorps. Cette méthode est plus sensible que les deux
précédentes car elle détecte les antigènes mycobactériens dans des coupes de tissus en
reconnaissant les bactéries entières et les fragments partiels. En effet, les débris dérivés des
mycobactéries conservent leurs propriétés antigéniques mais pas leur acido-alcoolo-
résistance. L’immunohistochimie est donc particulièrement pertinente dans les cas où seuls
des fragments de mycobactéries sont présents. Néanmoins, la longueur de fixation des
prélèvements dans le formol ne doit pas excéder 48 heures car elle entraverait la capacité des
anticorps de se fixer sur les antigènes. Cela pourrait alors expliquer la négativité
immunohistochimique d’un échantillon positif avec une méthode de coloration classique.
(122)
L’immunohistochimie étant plus onéreuse peut donc être utilisée sur des échantillons
provenant de lésions évocatrices de tuberculose négatifs à la coloration de Ziehl-Neelsen ou à
l’auramine. (122)

- 109 -
Figure 38 : Mycobactéries mises en évidence par immunohistochimie au sein d’une
coupe histologique (124)

3) Les frottis d’expectorations chez l’Homme

Selon l’OMS, l’étape essentielle dans la recherche de tuberculose pulmonaire chez un


patient est l’examen microscopique de son frottis d’expectorations. Cette méthode consiste à
étaler sur une lame un échantillon des expectorations d’un individu suspect d’être infecté. Les
BAAR pouvant se trouver sur le frottis sont ensuite mises en évidence par une coloration
spécifique comme Ziehl-Neelsen ou l’auramine, ou encore par immunohistochimie. Ce test
est d’autant plus efficace que le nombre d’échantillons examinés est élevé. Dans l’idéal,
l’échantillonnage s’effectue le matin au réveil des patients car la concentration de
mycobactéries est alors plus élevée. Pour les enfants ou les malades ayant des difficultés à
produire des expectorations, il est aussi possible de pratiquer un lavage broncho-alvéolaire ou
encore une aspiration du contenu gastrique afin de récupérer des mycobactéries préalablement
dégluties. Initialement, trois échantillons d’expectorations devaient être recueillis sur trois
jours pour tout malade suspect de tuberculose. L’analyse globale de plusieurs études a permis
de montrer qu’en pratique 95 % des individus infectés étaient détectés par les deux premiers
échantillonnages. Ainsi, les guides internationaux fournis par l’OMS recommandent depuis
2007 de pratiquer seulement deux examens microscopiques. (125)

L’analyse microscopique des frottis d’expectorations est technique simple, rapide, peu
coûteuse et particulièrement spécifique dans les pays où la prévalence de la tuberculose est
élevée. Elle possède aussi l’avantage d’identifier les individus fortement contagieux et fait
donc partie intégrante de la stratégie globale de lutte contre la maladie. Cependant, la
sensibilité de l’examen microscopique de frottis d’expectorations est fortement diminuée
lorsque la charge bactérienne de l’échantillon est inférieure à 10 000 UFC (Unités Formant
Colonie) par millilitre ou pour les cas de tuberculose extra-pulmonaire. De plus, certains
patients ne reviennent pas pour leur deuxième ou leur troisième prélèvement, ou pour recevoir
leurs résultats d’analyse. Dans ces cas-là, le suivi de la maladie et son traitement ne peuvent
alors pas être effectués. (126)

- 110 -
B) Culture et identification de M. bovis

1) Méthode de culture des mycobactéries

La culture d’un produit pathologique est le moyen le plus rigoureux de faire le


diagnostic de la tuberculose. L’isolement bacilles tuberculeux à partir de prélèvements
souillés nécessite la mise en œuvre de procédés de décontamination. En effet, Les
mycobactéries ayant une vitesse de division peu élevée, la contamination d’un échantillon par
des bactéries à croissance plus rapide peut empêcher leur détection lors de la mise en culture.
Le processus de décontamination doit pouvoir éliminer efficacement les bactéries
contaminantes sans pour autant affecter la viabilité des bacilles tuberculeux. L’hydroxyde de
sodium (NaOH) utilisé à une concentration de 2 % est le décontaminant le plus couramment
employé. Il est souvent associé à la N-Acétyl-L-Cystéine (NALC) qui est un agent
mucolytique permettant de libérer les mycobactéries, éventuellement présentes dans le mucus
des échantillons respiratoires, afin qu’elles puissent accéder aux nutriments fournis par le
milieu de culture. Il est néanmoins nécessaire de ne pas dépasser un certain temps de
traitement par le NaOH car même si les mycobactéries sont plus robustes à son action grâce
aux propriétés de leur paroi, leur viabilité peut être altérée dans le cas d’une exposition
prolongée. Après traitement au NALC-NaOH, le produit pathologique est centrifugé, le
liquide surnageant éliminé et le culot contenant les mycobactéries ramené à un pH neutre par
l’emploi d’un acide faible. Les échantillons peuvent aussi être traités par un mélange
d’antibiotiques et d’antifongiques comme le PANTA (Polymyxine B, Amphotéricine B, acide
Nalixidique, Triméthoprime et Azlocilline) afin de supprimer la croissance de contaminants.
Dans le cas de lésions fermées ou lors d’interventions chirurgicales, le prélèvement peut être
recueilli de manière aseptique puis directement ensemencé sur le milieu de culture sans
décontamination préalable. (125)

La culture est traditionnellement réalisée sur des milieux solides à base d’œuf tels que
le milieu de Löwenstein-Jensen, aussi composé de farine de pomme de terre, de sel et de
glycérol. L’usage d’un tel milieu soutient une croissance rapide des mycobactéries
tuberculeuses bien que la présence de glycérine ne soit pas favorable à celle de M. bovis.
Ainsi, certains laboratoires utilisent désormais des milieux de culture à base de gélose et de
divers constituants chimiques permettant une croissance encore plus rapide des
mycobactéries. Néanmoins, ces milieux sont moins stables et plus susceptibles de se
détériorer. L’exposition à une chaleur ou une lumière excessive peut par exemple conduire à
la libération de formaldéhyde toxique pour