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com
Biologie
UE1 moléculaire
et génétique
4e édition
Simon Beaumont
Professeur de biochimie et biologie
moléculaire en L1 santé au CAPPEC
de Lille, professeur agrégé de chimie
en classe préparatoire au lycée
Sainte Marie de Beaucamps-Ligny
Avant-propos
Cet ouvrage s’adresse donc avant tout aux étudiants en médecine, notamment
ceux préparant le PCEM, mais aussi à ceux de pharmacie et plus généralement
à tous ceux préparant les concours médicaux et paramédicaux.
La plupart des QCM sont issus des annales de faculté de médecine et sont cor-
rigés de manière détaillée.
J’espère que cet ouvrage aidera tous les étudiants dans leurs différents concours
et je leur souhaite bon courage.
Je remercie M. d’Engenières des éditions Dunod pour l’aide précieuse et les
conseils qu’il m’a prodigués durant toute la réalisation de cet ouvrage.
© Dunod. Toute reproduction non autorisée est un délit.
Simon Beaumont
III
érie
Concis, il aborde toutes les notions du
l’A
• Co l’ADN et de de ta
utom
ilibre ure
lan
de
P ier l’é
qu ruct
e la st
• Étud r/Connaîtr base
1. Le
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– Les
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• Étud éléments éiques :
ides nu
cl
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des programme et est enrichi de nombreuses
puriqu des ac sides et nu cture
– Les
2. Le
bases
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s
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la stru l’ADN
r/Conn primaire
• Ét la séquence s liaisons
de
illustrations.
s nucl ique de
nature
de
3. Le osphor et la
cide ph des
4. L’a ti
s nucléo s
5. Le éotide
po lynucl
6. Le
s es de
èse chaîn
Synth ngues
ès lo
o n en tr e phos-
QCM QCM sati acid acide
és des nden d’un ts
Corrig t de
la co base, oupemen struc-
’une is
es ré sultencléotides. m m un d n à trois gr e ces tro xes.
qu s nu co e u acune d p le
nucléi e appelée e en oir d s com
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Les acures de b t de en
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Les que et d al -c
Nous celles cléoti
phori horique. comment des
phosp puis voir O
O
Cours
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P 1
N
ses
O
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: NH
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Il exis p u riques
N
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O
:55 PM O 5´ N
6 12
3/16/1 O
H N
H H N
O
3´ H
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1.16
2 Ench
aînement
de pl R2
R1 et usieur
À no R
2 représ s nucl
dd 2
ter entent éotide
-01.in le rest s, ici
5_Ch
1007
4881 e de avec
9782
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cléoti
et un
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3′, et orient dique.
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si d u ontre lit par co
nucléo acide » bien nv
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3′ de
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l’autr e phosp e les deux cide pho cond nucl x liaison
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n hyd eur d d’un reste ec
seron nventio ro xy e d acide donc l’ose de
t don n, le lib eu n une fo son
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dans nes p r le ca ns ac l’une n
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rsque n t ré mité és 5′
Nous
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m
augm te, c’est qu ège dans ent par la
en le
Soyez ter la di e la chaîne s QCM. suite
que le
donc fficu Pa
très at lté, l’éno est écrite r conventi sens de
tentif ncé pe da on lect
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iliser uc
l’écrit convention une indi chaîne es
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9782 la ch l 5′ → 3′ on n’est
1007 aîne ,
4881
5_Ch dans mais pour
-01.in
dd l’autre
13 sens.
13
3/16/1
6 12
:57 PM
À noter
Attention
IV
cet ouvrage
Entraî
nemen
t La
struct
ure des nu
S
cléoti
ynth des
èse
Je sa
is
• Ba définir
se
• Éq s pyrimid
ui iq
• Nu libre de ta ues et ba
cl utom se
• Nu éoside ; érie ; s puriques Je co
cl ; nn
• Po éotide ; • La ais
lynucl formul
éotide azot e et la
.
• La ées ; struct
ure de
stru s base
noms cture des s
• La ; nucléo
stru sides
Je sa et leur
is noms cture des s
• Éc • Le ; nucléo
Le bloc synthèse
rire la s liais tides et
• Do struct base, ons qui s’ leurs
nner
la stru ure d’une le sucr ét
cture ch e et le ablissent
chimiq aîne polynu groupe entre la
ue de cl phosph
chaque éotidique ate.
À la fin de chaque chapitre, il présente base ;
suivan
Q
t ses
deux
uest formes
ions ta
les définitions et notions à retenir ainsi
utom
ères.
à ch
1 Par oix m
mi ltiple u
que les savoir-faire à maîtriser. corres les stru
pond
(ent)
ctures
à l’adé représenté
nine ? es ci
s
O -desso
us, qu
elle (s) es
HN t (son
N NH t) celle(s
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N i
NH
2
N
NH NH
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8 ❒ a. NH N
N
traî nemen N
DN En
de l’A NH ❒ b.
rrec tions H3 C 2
N
s et co NH
Lésion N ❒ c.
N O
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ns à
r
er pa ❒ d.
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se tran
Q anine
en te
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,
dans
l’AD
?
N peut
14
❒ e.
N
NH
2
1 La gu autre base
e
en un
ne.
Adéni autre(
s)
❒ a. le. e (d’)
Uraci e.
9782
t en un
1007
❒ b. 4881
in némen
5_Ch
Xanth e.
sponta
-01.in
anthin
dd 14
❒ c.
d. Hypox an sf ormer
❒ e. tr
Inosin ut se
❒ e. ne pe :
cytosi esquelles)
les, la (l
s cellu ez laquelle
ans le
2 D se(s). Indiqu sine.
ba to
hyl cy
5-mét .
❒ a. ne
Adéni tosine
? 3/16/1
❒ b. le. hyl cy
6 12
:57
Uraci 5-mét
PM
❒ c. in e. de la
d. Thym th in e. m in ation
❒ an sa
Hypox r la dé
❒ e. ée pa
se form
la ba
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3 Que ytosine.
C orrigés
C
❒ a. le. V ?
Uraci les U
❒ b. ine. e par La stru
Thym -uracile. oqué cture
❒ c. t prov des nu
Dihyd
ro qui es cléoti
❒ d. an thine. es t celle 1 Bon des
Entraî
Hypox quelle ne(s) nemen
❒ e. DN, Les fo répons t
s de l’A rmes e(s) : 1
s lésion e. La m a et c co b. et c.
rmi le ymin olécul rrespo
4 Pa imères de th moléc e
ule e a correspo
nden
t à l’a
❒ a.
D n. sine. mifèr
es dénine
inatio la cyto . mam (sys-
à la gu nd à , sous
Dépur ation de ne hélice. ez les des
anine. l’hyp
oxan sa form
❒ b. in l’adéni la double sée ch cléoti n thine,
Désam ation de e utili on de nu la formatio 2 Bon la mol e imin
❒ c. am in br ins de l’e nz ym ci si de ne(s) écule o pour
b et am
❒ d.
Dés
e des
deux quez tion par ex paration La fo
rm répons d à la
Pontag s, indi ra ré sa form e b corres e(s) : 1-mét ino po
❒ e. su ivante me de répa ple pour la e énol pond
b. hyl ad
énine
ur c.
ns
ositio écanis r exem La m (ou so à la et la
s prop apes du m ployé pa olécul us sa guanine m
rmi le ét , em form e
e « sp a correspo forme lact ais sous sa
5 Pa ur l’une des tion NER éciale nd à ime). form
po ra ine). Atten » e
de répa , la 2- la
oxo 6- purine, c
la moi
tème ères de thym sigma. tion
amin à ns stab
de dim érase o puri l’adénine le, c’es
t-à-di
polym ase delta. ne. ,dà
la 7-m re sous
ADN ér a. On vo éthyl
❒ a. polym ase gamm 123 it
permet ici toute guan
ADN ér ine, et
❒ b.
D N polym ase bêta. de co d’écrire de mportance
l’i e à un
A lymér mpliq e
❒ c. N po e al pha. uer le s formules des formes
AD éras s ques di
❒ d. polym 6 1:0
6 PM
tions fférentes de tautom
ADN 3/16/1 d’exam des fo ér
rmules ie pour le
❒ e. 3 Bon en.
« clas s base
ne (s ) répo si qu es » de s, pu is
La m
ol nse(s) s base que cela
5-mét écule e co : e. s, et do
hyl cy rr nc
tosine espond à
, c à l’u la
racile cytosine. L
4 Bon et d à la a m
ne (s dihydr olécule a
3 a. La ) répo o-urac corres
dd 12 struct nse(s) ile. pond
-08.in : e.
4881
5_Ch ure re à la th
9782
1007 présen ymin
te l’hyp e, b à
5 Bon oxan la
ne thine.
La fo (s ) répo
9782
1007
4881
5_Ch
-01.in
dd 19
19
Les corrigés
3/16/1
6 12
:57
Avant-proposIII
Chapitre 1
La structure des nucléotides 2
1. Les bases 2
QCM et corrigés 14
Chapitre 2
Métabolisme des nucléotides 22
1. Biosynthèse des ribonucléotides puriques 23
QCM et corrigés 32
VI
Chapitre 3
Structures de l’ADN 38
1. Structure primaire 38
Chapitre 4
Organisation du génome 56
1. L’ADN des différents êtres vivants 57
2. L’ADN procaryotique 58
3. Le génome humain 59
QCM et corrigés 64
Chapitre 5
Structure tridimensionnelle et
composition de la chromatine 70
1. La fibre de 10 nm 71
2. La fibre de 30 nm 73
3. Niveaux supérieurs d’organisation de la chromatine 75
4. Contrôle de la compaction de l’ADN 75
QCM et corrigés 76
Chapitre 6
Les topo-isomérases 84
1. Topologie de l’ADN ; notion de topo-isomères 84
VII
Chapitre 7
Réplication de l’ADN 89
1. Réplication chez les Eucaryotes 90
Chapitre 8
Lésions et corrections de l’ADN 111
1. Les agents mutagènes 112
Chapitre 9
Instabilité et évolution de l’ADN 131
1. Les mutations ponctuelles 132
Chapitre 10
Organisation des gènes humains 144
1. Gènes non traduits : les ARNs 145
VIII
Chapitre 11
Les outils et techniques de la
biologie moléculaire 148
1. Les enzymes de restriction 148
Chapitre 12
Applications de la biologie moléculaire 176
1. Cas de génétique inverse : la mucoviscidose 176
Chapitre 13
La transcription 180
1. Transcription procaryotique 182
Chapitre 14
La régulation de la transcription 209
1. Contrôle au niveau du site promoteur 210
IX
Chapitre 15
La traduction 233
1. Le code génétique 234
Chapitre 16
Contrôle post-transcriptionnel 261
1. Contrôle de la durée de vie des ARNm 261
Chapitre 17
Contrôle post-traductionnel des protéines 266
1. Clivage de la chaîne peptidique 267
Chapitre 18
Pathologies lors de l’expression des gènes 279
1. Syndrome de Rett 279
2. Syndrome HNPCC 280
3. Dystrophie myotonique congénitale (dite de Steinert) 280
4. Phénylcétonurie (PCU) 280
5. Drépanocytose 280
6. Myopathie de Duchenne 281
7. Maladie de Parkinson 281
QCM et corrigés 282
Annexes
Annexe 1
Les phages 284
A1.1 Le phage lambda λ 284
Annexe 2
Plasmides et cosmides 291
A2.1 Les plasmides 291
Annexe 3
Enzymes de restriction 292
Annexe 4
Régulation de la synthèse des protéines
procaryotiques. Opérons lactose
et tryptophane 294
A4.1 L’opéron lactose 294
Annexe 5
Code génétique 299
Annexe 6
Bref historique de la biologie moléculaire 301
Annexe 7
Représentations tridimensionnelles des sucres 302
A7.1 Cyclisation du glucose 302
Index 305
XII
Partie 1
Les acides
nucléiques
1 La structure
des nucléotides
Plan Objectifs
1. Les bases : • Connaître les formules des bases
––Les bases pyrimidiques de l’ADN et de l’ARN
––Les bases puriques • Étudier l’équilibre de tautomérie
2. Les oses • Étudier/Connaître la structure
des éléments de base
3. Les nucléosides
des acides nucléiques :
4. L’acide phosphorique nucléosides et nucléotides
5. Les nucléotides • Étudier/Connaître la structure
6. Les polynucléotides de la séquence primaire de l’ADN
Synthèse et la nature des liaisons
QCM
Corrigés des QCM
Ces bases prennent leur nom de composés chimiques dont nous rappelons
quelques formules (Fig. 1.1).
N N
N N
N
N N
N N H
H
Pyridine Pyrimidine Purine Imidazole
NH2 O O
H3 C
N NH NH
NH O NH O NH O
Comme l’indique leur nom, elles sont toutes constituées d’un noyau de pyrimi-
dine. Ce noyau possédant des doubles liaisons conjuguées, celles-ci absorberont
vers 260 nm, ce qui peut permettre de les identifier et de les doser.
Les règles de numérotation impliquent que l’un des atomes d’azote porte l’indice
1 et l’autre l’indice 3 quelle que soit la façon de représenter la molécule (Fig. 1.3).
4 4
5 N3 3 N 5
6 2 2 6
N N
1 1
Attention
Soyez vigilant lors de l’examen : dans l’énoncé de la question, la formule peut être
inversée, ce qui modifie la numérotation. C’est un piège classique à éviter.
Les formules écrites plus haut pour ces trois bases correspondent à la forme pré-
pondérante au pH physiologique, mais il faut savoir qu’un équilibre, appelé équi-
libre de tautomérie1, permet à la molécule de basculer sous d’autre(s) forme(s) ;
ce sont des migrations de doublets et d’atomes d’hydrogènes qui engendrent
l’existence de cet équilibre (Fig. 1.4).
O OH
NH N
NH O N OH
Attention
L’existence de cet équilibre complique encore les questions d’examen puisque l’énoncé
de l’épreuve peut choisir indifféremment l’une ou l’autre des formes, sans que la
molécule ne soit différente. Prenez l’habitude d’écrire les bases sous leurs différentes
formes de tautomérie.
L’une des techniques pour vérifier sa connaissance des formules est d’écrire toutes les
possibilités sur des fiches, puis de tirer au sort régulièrement ces fiches et de vérifier
que vous êtes capable d’identifier la molécule qui s’y trouve écrite. Le travail inverse
peut évidemment être fait, c’est-à-dire partir du nom pour retrouver la formule.
Cet équilibre correspond à l’équilibre entre la forme cétone et la forme énol (de
-ène double liaison et -ol de la fonction alcool) et s’appelle donc l’équilibre céto-
énolique.
On dit également, lorsque la base porte des fonctions cétones, qu’elle se trouve
sous la forme lactame, et que lorsqu’elle porte des fonctions énols qu’elle se
trouve sous la forme lactime.
NH2 NH
N NH
NH O NH O
Amino Imino
Erreurs d’appariement
On constate que si une base est sous sa forme lactame ou imino, il se produit
des erreurs d’appariement ou de réplication.
Par exemple, la forme imino de la cytosine provoque un appariement avec
l’adénine au lieu de la guanine. Ces erreurs seront cependant corrigées pen-
dant la réplication, mais ne le seront pas lors de la transcription.