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SEMINARIO 5
ENZIMAS 1
Introducción
Cinética enzimática
Parámetros cinéticos
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
MATERIA QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2020
ENZIMAS
Las funciones vitales de una célula implican la existencia de un gran número de procesos y
vías metabólicas que consisten en secuencias de reacciones químicas que se llevan a cabo con la
presencia de una serie de catalizadores orgánicos denominados enzimas. Si las mismas
reacciones tuvieran que realizarse sin la presencia de dichos catalizadores, las velocidades con
las que ocurrirían serían tan lentas que serían incapaces de reconocer las necesidades
fisiológicas de la célula.
Una función tan compleja y específica como la de las enzimas, sólo podría ser cumplida
por moléculas estructuralmente también complejas y susceptibles a la acción de diversos factores
que modifiquen su actividad, como son las proteínas.
Una enzima es una proteína con propiedades catalíticas, elaborada por la célula,
susceptible de ser regulada y que además presenta, como veremos más adelante, un alto grado
de especificidad.
Como todo catalizador, aceleran notablemente la velocidad de una reacción química y
cumplen con las siguientes condiciones:
Son efectivas en cantidades pequeñas.
No sufren modificaciones ni cualitativas ni cuantitativas al final de la reacción. Es decir,
deben quedar químicamente inalteradas.
No afectan la posición del equilibrio de la reacción que catalizan. Es decir, se llega mucho
más rápidamente al equilibrio, pero el mismo es igual al que se llegaría en ausencia del
catalizador.
Además de cumplir estas condiciones propias de todos los catalizadores, las enzimas
presentan una serie de características, derivadas de su naturaleza proteica, que las diferencia
netamente de los catalizadores inorgánicos:
Son termolábiles.
Presentan una mayor eficiencia, entendiendo por eficiencia en este caso al número de
moles de sustrato transformado por mol de catalizador en la unidad de tiempo.
Alta especificidad en relación a la naturaleza de la reacción que catalizan y al sustrato que
utilizan.
Están sujetas a una gran variedad de controles celulares.
Energía de activación
Para que ocurra una reacción química en un sentido determinado debe producirse con un
G negativo, pero además debe producirse a una velocidad adecuada. Un valor negativo de G
no implica necesariamente que la reacción ocurra en ese sentido a alta velocidad. Para que esto
último ocurra es necesario que las moléculas del sistema estén en un estado especial de reacción
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denominado estado activado o excitado o de transición. Tal activación de las moléculas involucra
cierta energía adicional que es necesario entregar al sistema antes de la reacción propiamente
dicha. Esta energía adicional se denomina energía de activación (Ea).
Una vez vencida esta barrera energética, el sistema reacciona de tal forma que se
recobrará la energía de activación, liberándose
la energía libre propia del sistema (G). La
Estado activado
forma de actuar de todo catalizador, y en
G (cal/mol)
sin enzima
particular de las enzimas, es disminuyendo la Ea sin
con
energía de activación, lo cual se traduce en un enzima enzima
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específica de la enzima que se denomina centro activo. Es una zona relativamente pequeña y
restringida de la enzima que posee estructura tridimensional en forma de hueco. Es donde se
encuentran las cadenas laterales de los aminoácidos de unión al sustrato y los catalíticos.
El centro activo del enzima es el responsable directo de la acción catalítica y específica del
enzima, aunque el resto de la molécula de la enzima (constituida por los aminoácidos
estructurales) también tiene importancia en el mantenimiento de todo el conjunto.
Este centro activo es pues una zona relativamente pequeña y restringida de la molécula
proteica constituida por los grupos laterales de ciertos aminoácidos de la cadena polipeptídica
capaces de combinarse con diferentes partes de la molécula del o los sustratos y cofactores. Así
permiten una adaptación más o menos exclusiva de los mismos. A esos grupos responsables de
la unión del sustrato a la enzima se los denomina
sitios de unión. En la siguiente figura se muestra un
diagrama de la enzima fructosa 2,6 difosfatasa
(celeste claro) y la relación existente entre el sustrato
(azul) y los aminoácidos que conforman el centro
activo de la enzima. Los grupos laterales
responsables de la actividad catalítica propiamente
dicha reciben el nombre de sitios catalíticos. En
algunos casos esos grupos pueden corresponder a
los grupos prostéticos, de los cuales hablaremos más
adelante. Los grupos que constituyen el centro activo,
quizás situados bastante lejos unos de otros en la secuencia proteica, se aproximan y adoptan la
configuración característica del mismo. Por esa causa aquellos factores que hacen que la enzima
pierda su estructura terciaria nativa (por ejemplo en la desnaturalización proteica) producen una
alteración profunda del centro activo, y conducen a la pérdida de la actividad enzimática.
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Recordar:
Unidad funcional: HOLOENZIMA = Apoenzima (proteína) + grupo prostético o
cofactor
APOENZIMA: Parte proteica de una holoenzima, no tiene actividad catalítica
Cofactores
- Iones metálicos
La forma en que dichos iones actúan en el proceso catalítico es más o menos compleja y
es imposible indicar un modo de acción común a todos ellos.
Cuando las enzimas requieren cationes para actuar, el requerimiento es estricto ya que en
su ausencia la actividad es prácticamente nula.
También los aniones (como sulfato, fosfato, cloruro, etc.) pueden actuar con ciertas
enzimas como activadores.
COFACTORES
ENZIMAS
(iones)
Alcohol deshidrogenasa
Zn2+
Anhidrasa carbónica
Hexoquinasa
2+
Mg Glucosa 6 fosfatasa
Piruvato quinasa (junto con K+)
Arginasa
Mn2+
Ribonucleótido reductasa
Citocromos
2+ 2+
Fe o Fe Peroxidasa
Catalasa
Tirosinasa
Cu2+
Citocromo oxidasa
2+
Ni Ureasa
Se Glutation peroxidasa
+
K Piruvato quinasa (junto con Mg2+)
Na+ ATPasa (junto con Na+ y Mg2+)
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- Coenzimas
Son moléculas orgánicas de estructura más o menos compleja que intervienen en la
reacción generalmente como transportadores de algún grupo químico. Se unen muy débilmente a
la enzima, por lo tanto, son fácilmente disociables. El proceso de asociación-disociación es
siempre reversible.7
Algunas coenzimas están unidas a la molécula de la enzima, y reciben entonces el nombre
de grupos prostéticos. Están fuertemente unidos a la proteína, a veces por uniones covalentes.
Son de difícil disociación y cuando esto ocurre, la enzima pierde su actividad.
Es interesante hacer notar que muchos grupos prostéticos y coenzimas están
estructuralmente relacionados con las denominadas vitaminas. Estas sustancias son utilizadas en
el organismo en esos casos como precursores de las coenzimas y grupos prostéticos respectivos
y, como el organismo carece de la capacidad de sintetizarlas, deben ser administradas en la dieta.
Especificidad enzimática
Se había mencionado anteriormente que una de las características distintivas que
presentan las enzimas con respecto a los catalizadores inorgánicos era su alto grado de
especificidad. Es ésta una propiedad de notable significación biológica, pues es la que hace
posible la coexistencia de diversas vías metabólicas perfectamente diferenciadas. Debemos
entender por especificidad enzimática a la limitación de acción de cada enzima hacia un sustrato
determinado (o un grupo de sustratos estructuralmente relacionados) y en relación a una reacción
química perfectamente definida. Así, por ejemplo, una enzima capaz de hidrolizar las uniones
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glicosídicas presentes en un polisacárido como el almidón, es incapaz de hidrolizar las uniones
peptídicas de una proteína, y viceversa. Más aún, una enzima como la α-amilasa pancreática,
principal responsable de la degradación del almidón y el glucógeno en el tracto gastrointestinal,
actúa hidrolizando las uniones α,1-4 glicosídicas de las mencionadas sustancias liberando
unidades del disacárido maltosa, pero es incapaz de hidrolizar a esta última en dos moléculas de
glucosa a pesar de que la unión también es α,1-4 glicosídica. Esa función es llevada a cabo
exclusivamente por otra enzima de origen intestinal, la maltasa.
Si bien todas las enzimas son específicas, el grado de especificidad puede variar de una
enzima a otra. Así, por ejemplo, algunas poseen especificidad absoluta. Estas enzimas tan sólo
pueden ejercer su acción sobre un sustrato determinado (o un par de sustratos, si la reacción es
bimolecular es decir donde la enzima utiliza dos sustratos). Como ejemplo podemos mencionar a
la ureasa, enzima que desdobla específicamente a la urea en amoníaco y CO2.
Ureasa
NH2-CO-NH2 + H2O CO2 + 2NH3
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V5
velocidad de reacción
V4
V3
V2
V1
0
0 E1 E2 E3 E4 E5
cantidad de enzima
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b) para una dada concentración de sustrato: cuantas más moléculas de enzima tenga,
mayor será la cantidad de moléculas de ES formadas y, en consecuencia, mayor será la
formación de producto.
Es posible expresar la cantidad de una enzima en términos de unidades enzimáticas,
entendiéndose por unidad de una enzima, la cantidad de la misma que produce una cierta
velocidad de reacción bajo óptimas condiciones. Esa velocidad de reacción se expresa como la
cantidad de sustrato transformado en cierto tiempo. Para evitar ambigüedades en la utilización de
distintas unidades, se ha definido por convención una unidad que puede ser aplicada a todas (o
casi todas) las enzimas, y que permite comparar las actividades de enzimas diferentes. La
definición recomendada es la siguiente:
Una unidad internacional (UI) de cualquier enzima es la cantidad de la misma que
cataliza la transformación de un micromol (mol) de sustrato por minuto bajo condiciones
definidas.
UI = mol / min
Existe otra unidad denominada Katal que se define como la cantidad de enzima que
transforma un mol de sustrato en producto en un segundo.
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Efecto de la temperatura
Cuando se estudia la variación de la actividad de
una enzima en función de la temperatura y los resultados
se representan en un sistema de coordenadas
cartesiana, se obtienen gráficos del tipo observado en la
siguiente figura.
Este tipo de curva es la resultante de dos factores
fundamentales. En primer lugar, las reacciones químicas,
catalizadas o no, aumentan su velocidad al aumentar la
temperatura. Pero en el caso particular de las reacciones
catalizadas por enzimas ese aumento tiene un límite:
debido a su naturaleza proteica, por encima de cierta temperatura (variable con cada enzima) las
mismas comienzan a desnaturalizarse convirtiendo ese proceso de inactivación térmica en un
factor más importante que el del incremento de la velocidad de la reacción. Por esa causa todas
las enzimas exhiben una temperatura, o un rango de temperaturas, a la cual la velocidad de la
reacción catalizada es máxima y se la denomina temperatura óptima. Para las enzimas de
animales de sangre caliente la temperatura óptima está por lo general comprendida entre 25º y
37ºC. Esta temperatura es lo suficientemente alta como para dar una actividad razonable, y lo
suficientemente baja como para evitar la desnaturalización térmica de la mayoría de ellas.
Efecto del pH
En general, cada enzima es activa tan sólo en un ámbito de pH más o menos restringido y
en la mayoría de los casos presenta un pH óptimo definido, es decir un pH para el cual la
actividad es máxima. A partir de ese punto, hacia un lado y hacia el otro en la escala de pH la
actividad disminuye. La curva de actividad enzimática en función del pH adopta, en general, una
forma característica de campana tal como se muestra en el ejemplo de la siguiente figura.
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Cabe destacar que no todas las enzimas presentan una curva de pH de tipo campana tan
característica. Por ejemplo, la papaína, una enzima fuertemente proteolítica que se encuentra en
el fruto de la papaya, tiene una actividad constante en el ámbito de pH de 4 a 9. La colinesterasa,
enzima que en el tejido nervioso hidroliza a la acetilcolina, mediador del impulso nervioso, en
ácido acético y colina, no presenta la rama descendente de la curva pH.
La dependencia de la actividad enzimática con el pH puede atribuirse a una serie más o
menos compleja de factores entre los cuales podemos mencionar a los siguientes:
Fuerza iónica
La fuerza iónica de una solución está relacionada con la cantidad y el tipo de iones
presentes en la misma. Como ya mencionamos anteriormente, fundamentalmente algunos
cationes son necesarios en el centro activo de algunas enzimas para su normal funcionamiento.
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En dicha curva puede observarse
Vo Vmáx Velocidad máxima
Velocidad que para valores muy pequeños de la
inicial
concentración del sustrato [S], la
velocidad de la reacción (V0) es
Vmáx directamente proporcional a [S]. Es decir
2
al duplicarse o triplicarse la
concentración del sustrato se duplica o
triplica respectivamente la velocidad de
la reacción.
Km [S] Concentración
Al seguir aumentando [S], el
de sustrato inicial incremento de V0 deja de ser lineal y va
haciéndose cada vez menor hasta que llega un momento en que permanece constante, es decir,
no aumenta por más que se incremente [S]. La velocidad alcanzada en ese momento se
denomina velocidad máxima de la reacción (Vmáx) para esa cantidad de enzima y sólo puede ser
aumentada aumentando la concentración de la enzima.
Basándose en este fenómeno, Michaelis y Menten enunciaron en 1913 una teoría general
de la acción enzimática que fue la base del desarrollo posterior de la moderna cinética enzimática.
En esa teoría se adoptó la primitiva sugestión, hecha por Henri en 1902, de que la enzima forma
primero un complejo con su sustrato, el cual se desdobla subsecuentemente en la enzima libre y
los productos de la reacción. Esquemáticamente el mecanismo de la reacción podría
representarse en la siguiente forma:
E + S ↔ E-S E + P
Vmáx x [S]
V0 =
Km + [S]
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Km es una nueva constante denominada constante de Michaelis, que depende del
sustrato y es independiente de la concentración de enzima, y cuyo significado nos referiremos
más adelante.
Un ligero análisis de la ecuación de Michaelis-Menten nos permitirá comprobar cómo la
misma se adapta a la curva experimental observada.
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correspondientes, tiene distinta afinidad por cada uno de ellas según se desprende del análisis de
los valores de las Km respectivas, indicadas a continuación:
Hexosa Km (M)
Glucosa 8 x 10-6
Es evidente que su afinidad por glucosa y manosa es
Manosa 5 x 10-6
muchísimo mayor que por fructosa y galactosa.
Fructosa 1,6 x 10-3
Galactosa 1 x 10-1
También puede darse el caso de dos enzimas distintas que pueden catalizar una reacción
semejante como, por ejemplo, la ya mencionada hexoquinasa cerebral y la glucoquinasa hepática.
Ambas enzimas catalizan la formación de
glucosa-6-fosfato a partir de glucosa. Mientras
que la hexoquinasa tiene un Km hacia la
glucosa de 1 10-4 M, el de la glucoquinasa
(hepática) es 1 10-2 M, es decir
aproximadamente 100 veces mayor. Si se tiene
en cuenta además el valor de la concentración de glucosa en sangre (3,8 a 6,1 mM) se puede
deducir que, en condiciones normales, la hexoquinasa cerebral estará saturada de su sustrato y
por lo tanto actuará a su máxima velocidad. En cambio, la actividad de la glucoquinasa hepática
sólo será significativa cuando la concentración de glucosa se eleve por encima de lo normal, como
cuando hay una ingesta considerable de glúcidos dietarios.
Los casos mencionados ejemplifican además otra característica de las enzimas con
respecto a las Km y es que enzimas similares, pero de distintos órganos pueden diferenciarse en
la afinidad hacia el mismo sustrato como ocurre con las hexoquinasas de cerebro e hígado ya
mencionadas. Esas enzimas que catalizan la misma reacción y pertenecen a la misma especie,
pero se distinguen en algún parámetro cinético o estructural, se denominan isoenzimas.
Debemos mencionar que también el conocimiento de las Vmáx puede aportar datos útiles
para la evaluación de la importancia fisiológica de una dada enzima ya que, conjuntamente con el
conocimiento del Km (o de los Km si la reacción involucra más de un sustrato), nos permitirá
determinar cuan efectivamente está funcionando la misma en los tejidos de un organismo vivo.
Establecida la importancia de ambos parámetros cinéticos (Km y Vmáx), veamos ahora
cómo pueden determinarse fácilmente por un método gráfico. Para ello hallaremos la inversa de la
ecuación de Michaelis-Menten.
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Vmáx x [S]
V0 =
Km + [S]
Km + [S] Km [S]
1 / V0 = = +
Vmáx x [S] Vmáx x [S] Vmáx x [S]
Km 1 1
1 / V0 = x +
Vmáx [S] Vmáx
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gráfico de Lineweaver-Burk (curva de dobles recíprocos o de 1/ V0 en función de 1/[S]), al ser una
recta, se pueden obtener valores precisos de Km y Vmáx a partir de pocos puntos experimentales.
- Para obtener los valores de Km y Vmáx para una
[S]1 < [S]2 < [S]3 < [S]4
determinada cantidad de enzima, se debe calcular la V0
[P]
para diferentes [S]: en un tubo de ensayo se colocan la
V0 4
solución con enzima y la solución que contiene el sustrato, y V0 3
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LEONOR MICHAELIS.
Fue un bioquímico y médico famoso nacido en Alemania el 16 de
enero de 1875. Estudió Medicina en Friburgo de Brisgovia, donde se
graduó en 1897. Luego se mudó a Berlín, donde recibió su doctorado.
Michaelis trabajó como asistente de Paul Ehrlich (1898-1899), Moritz
Litten (1899-1902) y Ernst Viktor von Leyden (1902-1906). En 1906
comenzó como director del laboratorio de bacteriología en el Hospital de la Charité en Berlín,
convirtiéndose en profesor extraordinario en la Universidad de Berlín en 1908. En 1922 se
trasladó a la Facultad de Medicina de la Universidad de Nagoya (Japón) como profesor de
bioquímica; en 1926 a la Universidad Johns Hopkins en Baltimore, Maryland como profesor
residente en la investigación médica; y en 1929, al Instituto Rockefeller de Investigación Médica
de Nueva York. Se retiró en 1941. Además de su papel en la formulación de la ecuación
Michaelis-Menten (1913) descubrió la tinción vital de la mitocondria con verde Jano y el cuerpo
de Michaelis-Gutmann en infecciones del tracto urinario (1902), y encontró que el ácido
tioglicólico podía disolver la queratina. Murió el 8 de octubre de 1849 en Nueva York.
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