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MISE À JOUR RONÉOS 2019/2020 – BIOCHIMIE STRUCTURALE

I. ACIDE AMINÉS & PROTÉINES

Le professeur distingue légèrement le catabolisme total producteur d’énergie du catabolisme partiel donnant des
précurseurs qui seront ré-utilisés par l’anabolisme (++ au niveau du métabolisme protéique qui n’est pas vraiment
réalisé dans le but de produire de l’énergie)

Concernant la sélénocystéine, il est essentiel de retenir qu’elle dérive d’une sérine mais possède une structure
analogue à celle d’une cystéine
§ Remplacement du thiol par un groupe sélénol (soit le remplacement d’un souffre par un sélénium)

La Proline qui est un acide cyclique et correspond en somme à un alpha imino-acide avec un groupement amine
secondaire (R2NH) au lieu d’un groupement amine primaire (RNH2). On parlera donc de structure commune à tous
les AA sauf la proline pour décrire le schéma de base de tous les AA

Tous les acides aminés alpha ont cette structure SAUF la PROLINE qui est un acide CYCLIQUE –et correspond en
somme à un alpha imino-acide avec un groupement amine secondaire ( R2NH) au lieu d’un groupement amine
primaire (RNH2)

Molécule APOLAIRE : si le barycentre des charges partielles positives et celui des charges partielles négatives
coïncident, la répartition des charges est symétrique dans la molécule et celle-ci est apolaire on parlera alors de
distribution homogène des électrons

Molécule POLAIRE : si les deux barycentres ne coïncident pas il y a dans la molécule deux pôles distincts de charges
opposées. On parlera alors de distribution non homogène des électrons

Notions de groupement remarquables :

La tyrosine possède un groupement phénol / aromatique (cf image diapo)


Le tryptophane possède un cycle indole (benzène +pyrrole)

Hélice alpha - Nouvelles explications :

Si on regarde l’hélice dans le sens de la séquence primaire elle tourne dans le sens des aiguilles d’une montre on parle
de pas à droite ainsi que de sens de la main droite

Protéines globulaires : 1/3 des AA participent à la formation de coude pour assurer la persistance de la structure
compacte qu’elles représentent
§ Myoglobine : molécule très compacte ayant 80% du polypeptide plié en 8 domaines avec hélices alpha. Ces
domaines se terminent avec proline ou coude béta. L’intérieur de la molécule contient presque tous les AA non-
polaires ; ils forment une structure compacte stabilisée par interactions hydrophobes. Cependant les AA
polaires sont pratiquement tous à la surface de la molécule, où ils forment des liaisons hydrogène entre eux ou
avec l’eau.

Protéines fibrillaires : Deux hélices peuvent s’associer et se stabiliser mutuellement via des liaisons hydrophobes

NB : Je vous conseille fortement de réviser soit avec la fiche + recap soit directement avec la diapo du prof
disponible sur Jalon. C’est le seul support officiel du cours pour l’évaluation finale. Pensez aussi à bien check
les réponses u prof sur le forum des carabins
MISE À JOUR RONÉOS 2019/2020 – BIOCHIMIE STRUCTURALE
II. GLUCIDES

Détails concernant l’anomérie a/ b :

L’anomère a a le OH hémiacétal du C1 du même côté que le OH porté par le C4


L’anomère b a le OH hémiacétal du C1 de l’autre côté que le OH porté par le C4
On ne parle JAMAIS d’énantiomères concernant l’anomérie

On en déduit donc une incohérence dans les schémas de la suite du cours (diholosides) avec le galactose du lactose.
Le plus sur serait de demander au professeur de vous répondre

Comparatif GP/PG :

Liaison des protéoglycanes :

On parlera de pont tétra-saccharide (glucuronate – galactose – galactose – xylose) et plus du tout de pont
tétrahexoside sachant que la xylose est un pentose et pas un hexose. C’était donc bien une erreur du cours de l’année
précédente.

Schéma récapitulatif sympathique :


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III. LIPIDES

Complément d’information :

C22 est un acide gras simple saturé aussi appelé acide béhénique
C24 est un acide gras simple saturé aussi appelé acide lignocérique

Signalisation cellulaire : PIP2/IP3

Petite notion sympa :


§ La sphingosine est un amino-alcool qui peut fixer soit un acide gras saturé soit insaturé au niveau
de sa fonction amine