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• 8 genres (poissons, insectes,….). Seul le genre rotavirus (forme de roue) a une importance médicale (> 750000
morts/an dans le monde)
• Absence d’enveloppe, capside icosaédrique, ARN double segmenté (10 à 12), 11 pour le rotavirus, chaque segment
porte un gène codant une protéine
• Réplication cytoplasmique: ARN polymérase virale
• Propriété +++: échange de segments entre 2 virus distincts du même genre (réassortiment) → variabilité génomique
Rotavirus
• VP4, VP6 et VP7: protéines antigéniques
• VP6 = porte déterminants → 7groupes A à G, les rotavirus humains = surtout A, et VP6 porte déterminants → sous-
groupes I et II
• VP4: protéine d’attachement aux cellules et porte spécificité génotype P.
• VP7: Ag majeur de neutralisation
• En plus, VP7 → génotypes (G1,G2,….)
• Un virus: génotype/groupe A/sous-groupe I
• Plusieurs cocirculent, infectent une même cellule et réassortent
• Groupe A: souches ubiquitaires, principale étiologie des diarrhées de l’enfant avant 5 ans. Morbidité, mortalité
• Diarrhée surtout entre 6mois et 2 ans (rôle protecteur des Ac maternels) puis immunité progressive (IgA
sécrétoires) au fil des réinfections → moins symptomatique → Ac protecteurs
• Première cause d’infection nosocomiale en pédiatrie
• Transmission oro-fécale, surfaces, eau et alimentation
• Abondance du virus dans les selles (10 milliards/g en phase aigue), résistance dans le milieu extérieur
• Gastroentérite aigue: incubation 1-2j, diarrhée aqueuse avec vomissement et fièvre (épidémies surtout l’hiver)
• Principale complication: déshydratation → hospitalisation
• Vaccin: d’abord animal vivant monovalent puis humain (G1,G2,G4 réassortants atténués ne gardant chacun que le
gène du génotype) + simien G3 = tétravalent: efficace contre GE sévères (Rotashield 1998) mais stoppé car IIA.
• Actuellement: pentavalent (G1,G2, G3, G4 et G9). Rotateq 2006 et Rotarix (Glaxosmithkline’s) = efficacité à
87.1%. Lancet 2007;370:1739-40,1757-1763
• Entre 6 semaines de vie et 6 mois.
• Mars 2015: en France n’est plus recommandé ni remboursé. Depuis 2006 → 10/14: 1 million doses dont 508 EI
dont 201 graves dont 47 IIA.
AUTRES VIRUS
• Caliciviridae (Norovirus = tous ages, sapovirus = enfants)
• Astroviridae (Astrovirus = enfants > adultes)
• Parvoviridae (Bocavirus = nourrissons)
• Coronaviridae (Coronavirus = nourrissons, torovirus)
Gastroentérite aigue
• Enfants: rotavirus (30-40% des diarrhées aigues) puis norovirus humains puis adénovirus
• Astrovirus
• Autres virus
• Causes bactériennes et parasitaires
• Causes non infectieuses