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UNIVERSIDAD DE LA RIOJA
DEPARTAMENTO DE QUÍMICA
ÁREA DE QUÍMICA ORGÁNICA
Grupo de Síntesis Química de La Rioja
U.A. – C.S.I.C.
Trabajo de investigación.
Proyecto fin de Máster.
HACEN CONSTAR:
Abreviaturas I
1. Introducción 1
2. Antecedentes y objetivos 11
3. Discusión de resultados 21
4. Conclusiones 29
5. Experimental 33
G desplazamiento químico
1
H RMN resonancia magnética nuclear de protón
13
C RMN resonancia magnética nuçclear de carbono-13
Ac acetilo
Ac2O anhídrido acético
AcOEt acetato de etilo
Boc terc-butoxicarbonilo
Boc2O dicarbonato de di-terc-butilo
tBu terc-butilo
BuOH butanol
c concentración (g/100 mL)
Cbz benciloxicarbonilo
COSY COrrelated SpectroscopY
d doblete
DCC N,N’-diciclohexilcarbodiimida
dd doblete de dobletes
DIEA diisopropiletilamina
Et etilo
EtOH etanol
Fmoc 9-Fluorenilmetoxicarbonilo
Fmoc·OSu succinimida de N-(9-Fluorenilmetoxicarbonilo)
HSQC Heteronuclear Single Quantum Coherence
J constante de acoplamiento
m multiplete
Me metilo
MeOH metanol
MeONa metóxido de sodio
mmol milimol
NOESY Nuclear Overhauser Effect SpectroscopY
R sustituyente alquilo o arilo
Rdt rendimiento
RMN resonancia magnética nuclear
s singlete, ázucar (del inglés, sugar)
SPPS solid-phase peptide synthesis
t triplete, tiempo
TBTU tetrafluoroborato de O-benzotriazol-1-il-N,N,N´,N´-
tetrametiluronio
TFA ácido trifluoroacético
THF tetrahidrofurano
TMS trimetilsililo, tetrametilsilano
1.- Introducción
Introducción 3
1-I I
1
Qi, D.; Tann, C.-M.; Haring, D.; Distefano, M. D. Chem. Rev. 1, 101, 3081–3111.
2
(a) de Graaf, A. J.; Kooijman, M.; Hennink,W. E.; Mastrobattista, E. Bioconjugate Chem.
, 20, 1281–1295. (d) Ohta, A.; Yamagishi, Y.; Suga, H. Curr. Opin. Chem. Biol. ,
12, 159–167. (c) Johnson, J. A.; Lu, Y. Y.; Van Deventer, J. A.; Tirrell, D. A. Curr. Opin.
Chem. Biol. 1 , 14, 774–780. (b) Xie, J.; Schultz, P. G. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. ,
7, 775–782.
4 Introducción
para formar puentes disulfuro casi de manera instantánea y por ello es fácil
llevar a cabo la generación de productos de control cinético sin necesidad de
utilizar grandes excesos de reactivos. (Figura 1.2)
9
Davis, B. G. Chem. Commun. 1, 351– 352.
10
Rendle, P. M.; Seger, A.; Rodrigues, J.; Oldham, N. J.; Bott, R. R.; Jones, J. B.; Cowan,
M. M.; Davis, B. G. J. Am. Chem. Soc. , 126, 4750–4751.
11
Bernardes, G. J. L.; Marston, J. P.; Batsanov, A. S.; Howard, J. A. K.; Davis, B. G.
Chem. Commun. , 3145–3147.
6 Introducción
Como hemos visto los puentes disulfuro pueden llegar a ser lábiles
bajo condiciones reductoras. Cuando la modificación anclada es crítica para
la función específica de la proteína, se hace esencial un enlace estable.
Mediante el uso de fosfinas ricas en electrones como la HMPT se puede
aprovechar esa labilidad del puente disulfuro para generar el
correspondiente tioéter,13 con aumento de la estabilidad química y
resistencia enzimática.14 (Figura 1.4)
12
Pachamuthu, K.; Schmidt, R. R. Chem. Rev. , 106, 160–187.
13
Bernardes, G. J. L.; Gamblin, D. P.; Davis, B. G. Angew. Chem. Int. Ed. , 45, 4007–
4011.
14
(a) Galonic D. P.; van der Donk, W.A.; Gin, D. Y. Chem. –Eur. J., , 9, 5997–6006.
(b) Zhu, X,; Pachamuthu, K.; Schmidt, R.R. J. Org. Chem., , 68, 5641. (c)
Pachamuthu, K.; Schmidt, R.R. Chem. Rev., , 106, 160–187. (d) Comegna, D.; De
Riccardis, F. Org. Lett. , 11, 3898–3901.
Introducción 7
i ur 1. . Formación de un tioéter.
15
Bernardes, G. J. L.; Grayson, E. J.; Thompson, S.; Chalker, J. M.; Errey, J. C.; El Oualid,
F.; Claridge, T. D. W.; Davis, B. G. Angew. Chem. Int. Ed. , 47, 2244–2247.
8 Introducción
16
Bernardes, G. J. L.; Chalker, J. M.; Errey, J. C.; Davis, B. G. J. Am. Chem. Soc. ,
130, 5052–5053.
Introducción 9
17
Moll, G.N.; Kuipers, A.; Rink, R. Antonie Leeuwenhoek 1 , 97, 319–333.
18
(a) Avenoza, A.; Busto, J. H.; Jiménez-Osés, G.; Peregrina, J. M. Org. Lett. , 8,
2855–2858. (b) Aydillo, C.; Avenoza, A.; Busto, J. H.; Jiménez-Osés, G.; Peregrina, J. M.;
Zurbano, M. M. Org. Lett. 1 , 14, 334–337.
19
(a) Oman, T. J.; Boettcher, J. M; Wang, H.; Okalibe, X. N.; van der Donk, W. A. Nat.
Chem. Biol. 11, 7, 78–80. (b) Wang, H.; van der Donk, W. A. J. Am. Chem. Soc. 11,
133, 16394–16397. (c) Katayama, H.; Asahina, Y.; Hojo, H. J. Pept. Sci. 11, 17, 818–
821. (d) Stepper, J.; Shastri, S.; Loo, T. S.; Preston, J. C.; Novak, P.; Man, P.; Moore, C.
H.; Havlicek, V.; Patchett, M. L.; Norris, G. E. FEBS Lett. 11, 585, 645–650. (e)
Venugopal, H.; Edwards, P. J. B.; Schwalbe, M.; Claridge, J. K.; Libich, D. S.; Stepper, J.;
Loo, T.; Patchett. M. L.; Norris, G. E.; Pascal, S. M. Biochemistry 11, 50, 2748–2755.
10 Introducción
i ur .1
1
Monsigny, M. L. P.; Vaculik, D. D. M. Carbohydr. Res. 1 , 59, 589–593.
2
Zhu, X.; Schmidt, R. R. Tetrahedron Lett. , 44, 6603–6067.
14 Antecedentes y Objetivos
i ur .
3
Thayer, D. A.; Yu, H. N.; Galan, M. C.; Wong, C.-H. Angew. Chem., Int. Ed. , 44,
4596–4599.
4
Cohen, S. B.; Halcomb, R. L. J. Am. Chem. Soc. , 124, 2534–2543.
5
Cohen, S. B.; Halcomb, R. L. Org. Lett. 1, 3, 405–407.
Antecedentes y Objetivos 15
i ur .
i ur .
6
Pachamuthu, K.; Schmidt, R. R. Chem. Rev. , 106, 160–187
16 Antecedentes y Objetivos
i ur .
7
Aydillo, C.; Avenoza, A.; Busto, J.H.; Jimenez-Osés, G.; Peregrina, J.M.; Zurbano, M.M.
Org. Lett. 1 , 14, 334–337.
Antecedentes y Objetivos 17
i ur .
-. I
8
Tesis de Carlos Aydillo Miguel 11
18 Antecedentes y Objetivos
.1 nt i d roducto d rtid
La síntesis del derivado de deshidroalanina 1 se llevó a cabo
siguiendo la metodología que ya se había empleado anteriormente en
nuestro grupo de investigación. A partir de (S)-serina comercial se obtiene
(S)-N-Boc-serinato de metilo, al que se adicionó 2,2,3,3-tetrametoxibutano
en presencia de ácido p-toluensulfónico como catalizador a reflujo de
tolueno.1 De esta forma se obtiene el N,O-acetalbiciclico con buen
rendimiento. A partir de él se pudo obtener el deshidroalinato quiral 1, con
excelente rendimiento, por tratamiento con la base KHDMS.
(Figura 3.1).
i ur .1
. ccion d tio- ic o r d ri do d
d idro nin
Una vez que se llevó a cabo la síntesis del precursor 1 se pasó a
ensayar la reacción de adición conjugada con diferentes tioglicósidos.
Teniendo en cuenta la experiencia de nuestro grupo, las condiciones
iniciales elegidas fueron emplear atmósfera de argón a -78 ºC y THF como
disolvente, con el fin de poder mantener un control cinético de la reacción y
asi obtener un exceso diasteromérico elevado.
i ur .
i ur .
2
Tesis de Carlos Aydillo Miguel 11
Discusión de resultados 23
i ur .
En ese caso el rendimiento obtenido fue del 56%, algo menor que en
los casos anteriores, sin embargo el exceso diasteromérico siguió siendo
muy elevado al no observarse ningún otro isómero por 1H RMN.
Posiblemente, la desprotonación del grupo amida haga disminuir la eficacia
catalítica de la DBU.
i ur .
3
Tesis de Gonzalo Jiménez Osés
24 Discusión de resultados
i ur .
. nt i d di id od o
A la hora de estudiar las conformaciones espaciales que adoptan los
aminoácidos glicosilados en disolución acuosa lo correcto es acercarnos lo
más posible a la situación real. En la naturaleza los aminoácidos se unen
entre sí para formar péptidos, esta unión se realiza a través de los conocidos
enlaces peptídicos de tipo amida, tanto por el extremo del grupo carboxilo
como por el extremo del grupo amino.
i ur .
i ur .
i ur .
26 Discusión de resultados
i ur .1
i ur .11
Figura 3.12
. ui
Conclusiones 31
g ra a i i uga a 1 i r el α,β
i r a i i uira
ሾߙሿଶହ
ୈ = – 34.5 (c 1.03, CHCl3)
ሾߙሿଶହ
ୈ = – 24.6 (c 1.00, CHCl3)
S 3 N i i ar i 3 ri O a i gu a i a 1’’ β i
2 ((4’S,5’R 4’ i r i 5’ i 4’,5’ i i 2’ ai i 3’ i
r a a i
ሾߙሿଶହ
ୈ = – 27.4 (c 1.00, CHCl3)
C NMR (100 MHz, CDCl3) G (ppm) 15.7 (CH3), 19.9 (CH3), 20.6, 20.7, 20.7
13
(Ac), 30.8 (CHCH2), 51.0 (OCH3), 53.1 (CO2CH3), 55.6 (CHCH2), 56.0 (C4-Glc),
62.3 (C6-Glc), (68.5C2-Glc), 73.2(C3-Glc), 76.3(C5-Glc), 86.0 (C1-Glc), 90.3 (CNCH3OH),
108.6 (CCH3OCH3), 128.2, 128.4, 128.7 (Ph), 154.8 (NCO2), 155.9 (NCO2Bn),
169.6, 169.6, 170.7 (Ac), 170.8 (CO2CH3)
40 Parte experimental
S 3 β ra O a i ga a ira i ri a i
gu ira a 1’’ β i 2 ((4’S,5’R 4’ i r i 5’ i 4’,5’ i i
2’ a i i 3’ i r a a i
ሾߙሿଶହ
ୈ = – 21.0 (c 1.00, CHCl3)
13
C NMR (100 MHz, CDCl3) G (ppm) 15.6 (CH3), 19.8 (CH3), 20.5, 20.7,
20.7, 20.7, 20.7, 20.7, 20.8 (Ac), 30.6 (CHCH2), 50.9 (OCH3), 53.0
(CO2CH3), 55.9 (CHCH2), 60.9 (C6-Gal), 62.1 (C6-Glc), 66.7 (C4-Gal), 69.1
(C2-Gal), 70.3 (C5-Gal), 70.8(C3-Gal), 71.0 (C2-Glc), 73.4 ( C3-Glc), 75.9 ( C4-Glc),
77.2 ( C5-Glc), 84.8 (C1-Glc), 90.1 (CNCH3OH), 101.1 (C1-Gal), 108.5
(CCH3OCH3), 154.5 (NCO2), 169.1, 169.4, 169.7, 169.7, 170.1, 170.2,
170.3 (Ac), 170.4 (CO2CH3)
(S) β u ira i i a
ሾߙሿଶହ
ୈ = + 43.0 (c 0.56, H2O)
Cys(β u ira i
1
H NMR (400 MHz, D2O) G (ppm) 2.08 (s, 3H; Ac), 2.76 (s, 3H;
CONHCH3), 3.06 – 3.19 (m, 2 H; CHCH2), 3.33 (dd, J = 8.2, 17.4 Hz, 1H;
H2-Glc), 3.39 – 3.44 (m, 1 H; H4-Glc), 3.48 – 3.52 (m, 2 H; H3-Glc; H5-Glc), 3.72
(dd, J = 5.8, 12.5 Hz, 1H; H6-Glc), 3.91 (d, J = 12.7 Hz, 1H; H6-Glc), 4.55
(dd, J = 8.1, 5.5 Hz, 1H; CHCH2), 4.60 (d, J = 9.9 Hz, 1H; H1-Glc)
1
H NMR (400 MHz, H2O/D2O 9:1 Región de amidas) G (ppm) 8.09 (d, J =
4.4 Hz, 1H; NHAc) , 8.40 (d, J = 7.1 Hz, 1H; CONHCH3)
13
C NMR (100 MHz, D2O) G (ppm) 21.8 (COCH3), 25.9 (CONHCH3), 31.8
(CHCH2), 54.2 (CHCH2), 60.9 (C6-Glc), 69.4 (C4-Glc), 72.2 (C2-Glc), 77.1 (C5-
Glc), 79.9 (C3-Glc), 86.0(C1-Glc), 172.6 (COCH3), 174.5 (CONHMe)
r
ANEXO: Espectros de RMN 47
1
H RMN 400 MHz en CDCl3
13
C RMN 100 MHz en CDCl3
ANEXO: Espectros de RMN 49
COSY en CDCl3
HSQC en CDCl3
50 ANEXO: Espectros de RMN
1
H RMN 400 MHz en CDCl3
13
C RMN 100 MHz en CDCl3
ANEXO: Espectros de RMN 51
COSY en CDCl3
HSQC en CDCl3
52 ANEXO: Espectros de RMN
1
H RMN 400 MHz en CDCl3
13
C RMN 100 MHz en CDCl3
ANEXO: Espectros de RMN 53
COSY en CDCl3
HSQC en CDCl3
54 ANEXO: Espectros de RMN
1
H RMN 400 MHz en CDCl3
13
C RMN 100 MHz en CDCl3
ANEXO: Espectros de RMN 55
COSY en CDCl3
HSQC en CDCl3
56 ANEXO: Espectros de RMN
1
H RMN 400 MHz en D2O
13
C RMN 100 MHz en D2O
ANEXO: Espectros de RMN 57
COSY en D2O
HSQC en D2O
58 ANEXO: Espectros de RMN
1
H RMN 400 MHz en D2O
1
H RMN 400 MHz en H2O/D2O (9:1)
ANEXO: Espectros de RMN 59
13
C RMN 100 MHz en H2O/D2O (9:1)
COSY en D2O
60 ANEXO: Espectros de RMN
HSQC en D2O