TEMA 2: ESTRUCTURA DE LOS

ÁCIDOS NUCLEICOS

CATALINA PINEDA MOLINA

Ingeniería Biomédica
EIA-CES
2010
 CONTENIDO

1. Componentes fundamentales de
los ácidos nucleicos.

2. Nucleósidos y nucleótidos.

3. Estructura del DNA.

4. Estructura del RNA.

Ynse
http://www.flickr.com/photos/ynse/542370154/
 F. Miescher (1865)

Estudió la composición química del pus:

Intentaba digerir proteínas de las células del pus,

observando que el núcleo de esas células no era
digerido, por lo que lo que había allí no eran
proteínas, sino otra sustancia a la que llamó
"nucleína" por su localización en el núcleo celular.
Encontró nucleina en el esperma de salmón:

Lo fraccionó:

Componente proteico Componente de carácter ácido

(protamina) contiene fósforo (ácido nucleico).
 Tipos de ácidos nucleicos

Los estudios posteriores a Miescher demuestran la

existencia de dos tipos de ácido nucleico:

Uno abundante en la levadura, que recibe el nombre de

ácido zimonucleico.

Otro, abundante en el timo, llamado ácido

timonucleico.
 Tipos de ácidos nucleicos

Posteriormente:

• Zimonucleico: contiene ribosa, y por eso

pasa a llamarse ácido ribonucleico (RNA,
ARN).

• Timonucleico: contiene desoxirribosa, por lo

que pasa a llamarse ácido desoxirribonucleico
(DNA, ADN).
 Primeros experimentos para
demostrar que el DNA era la sustancia génica
Oswald T Avery, Colin MacLeod y Maclyn McCarty
(1944)

Cepas de
neumococo
rodeadas
por una
cápsula de
polisacárido Madprime
http://www.google.com.co/imgres?
imgurl=http://upload.wikimedia.org/wikipedia/comm
ons/thumb/c/c8/Dead_mouse.svg/375px-
Dead_mouse.svg.png&imgrefurl=http://es.wikipedia.
org/wiki/Archivo:Dead_mouse.svg&usg=__cFl6aPf
M64rEFt3FvLZGSb--
6NA=&h=218&w=375&sz=35&hl=es&start=14&itbs
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&prev=/images%3Fq%3Ddead%2Bmouse%26hl
%3Des%26gbv%3D2%26tbs%3Disch:1
Cepas de
neumococo,
por falta de
una enzima
no producen
la cápsula.
No son Madprime
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mouse.svg

patógenas
Una cepa virulenta
sometida a calor es
inactivada.

Madprime
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mouse.svg
 Bacterias
inactivadas con
calor

Bacterias
vivas sin
cápsula

Madprime
http://www.google.com.co/imgres?
imgurl=http://upload.wikimedia.org/wikipedia/comm
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Dead_mouse.svg.png&imgrefurl=http://es.wikipedia.
org/wiki/Archivo:Dead_mouse.svg&usg=__cFl6aPf
M64rEFt3FvLZGSb--
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&prev=/images%3Fq%3Ddead%2Bmouse%26hl
%3Des%26gbv%3D2%26tbs%3Disch:1

Mezcla de bacterias vivas sin

cápsula e inactivadas por calor
 DNA de bacterias inactivadas con
calor
Bacterias vivas no virulentas

Madprime
http://www.google.com.co/imgres?
imgurl=http://upload.wikimedia.org/wikipedia/comm
ons/thumb/c/c8/Dead_mouse.svg/375px-
Dead_mouse.svg.png&imgrefurl=http://es.wikipedia.
Transformación org/wiki/Archivo:Dead_mouse.svg&usg=__cFl6aPf
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6NA=&h=218&w=375&sz=35&hl=es&start=14&itbs
=1&tbnid=XVYXOlhZ6aH6lM:&tbnh=71&tbnw=122
&prev=/images%3Fq%3Ddead%2Bmouse%26hl
%3Des%26gbv%3D2%26tbs%3Disch:1

Bacterias virulentas
encapsuladas
• En conclusión:

El DNA es el responsable de la síntesis de

la enzima necesaria para la formación de
la cápsula y, por lo tanto, es el portador de
la información genética.
 Hershey y Chase, 1952
Con medio 32 P, el virus se marca sólo en el DNA, que es la única molécula con
fósforo.

Magnus Manske
http://commons.wikimedia.org/wiki/F
ile:HersheyChaseEx.png

Con medio 32S, el virus se marca sólo en la cápside, las proteínas son las únicas
moléculas con azufre.
• En conclusión:

• El DNA introducido en la bacteria contiene

la información necesaria para generar
nuevos virus; es decir, El DNA es el
portador de la información genética
 1. Componentes de los ácidos nucleicos
La hidrólisis química completa de un ácido nucleico da lugar
a una mezcla equimolar de:

Purínico
A. Una base nitrogenada
Pirimidínico

Ribosa
B. Una pentosa
Desoxirribosa

C. Fosfato
 1. Componentes de los ácidos nucleicos

La hidrólisis enzimática
completa de un ácido nucleico
da lugar a una mezcla de
nucleótidos.

Los ácidos nucleicos son

polímeros (de altísimo peso
molecular) cuyos monómeros
son los nucleótidos.
1.1. Bases nitrogenadas:

1. Pirimidina
4

3N 5

2 6
N Praggue,

1
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:
Pyrimidine.jpeg

Anillo heterociclíco
 1.1. Bases nitrogenadas:

1. Pirimidina Derivados pirimidínicos:

RNA
DNA

CH3

Timina (T) Citosina (C) Uracilo (U)

5-metil uracilo 2-ceto, 4-amino pirimidina 2,4-diceto pirimidina
(2,4-diceto, 5-metil pirimidina)
 1.1. Bases nitrogenadas:

2. Purina

6
7
5 N
1N
8
2
N 4 NH
3 9
1.1. Bases nitrogenadas:

2. Purina
Derivados purínicos:

2-amino 6-ceto purina

6-amino purina
 Formas metabólicas de las purinas:

1. Hipoxantina: 2. Xantina:

O O

N N
HN HN

N NH O NH NH
6-ceto purina 2,6 diceto purina
 Forma degradativa final de las purinas en los
primates:

Ácido úrico:
OH
N
N
OH
HO NH
N
2,6,8-triceto purina
Propiedades de las bases

1. Carácter levemente básico.

2. Solubilidad escasa en agua.

3. Espectro de absorción con máximo a 260 nm.

4. Posibilidad de formas tautoméricas.

5. Todos los reactivos de las bases son potencialmente mutagénicos.

Formas tautoméricas del uracilo
O OH

HN N

O NH HO N
Forma Ceto Forma Enol
 Componentes de los ácidos nucleicos
La hidrólisis química completa de un ácido nucleico da lugar
a una mezcla equimolar de:

Purínico
A. Una base nitrogenada
Pirimidínico

Ribosa
B. Una pentosa
Desoxirribosa

C. Fosfato
1.2. Pentosas

La diferencia entre ambas reside en que el grupo hidroxilo (-OH) del

carbono 2´ de la ribosa es sustituido por un hidrógeno en la
desoxirribosa.
 Nucleósidos, 1 Unión de una base a una pentosa a través
de un enlace de tipo b-N-glicosídico:

H 2N
H 2N
N N
Enlace N N
HOCH2 N N b-N-glicosídico
O N
HOC H 2 N
O

OH OH
Adenosina
(pentosa es ribosa) OH H
Desoxiadenosina
9-(1’-betha-D-ribofuranosil) adenina (pentosa es desoxirribosa)
9-(2’-desoxi, 1’-betha-D-ribofuranosil) adenina
Purinas: enlace entre carbono anomérico (1’) y N9 de la base
Numeración de átomos en los nucleósidos púricos
H 2N
6
N 1
7N 5
5' 8 4 2
HOCH2 N9 N
O 3
4' 3' 2' 1 '

OH OH
Nucleósidos, 2
NH2 NH2
N N
O O
HOC H2 N
O HOC H2 N
O

OH OH
OH H

Citidina Desoxicitidina
1-(1’-betha-D-ribofuranosil) citosina
1-(2’desoxi,1’-betha-D-ribofuranosil) citosina

Pirimidinas: enlace entre carbono anomérico (1’) y N1 de la base

 Numeración de átomos en los nucleósidos pirimídicos

O4
3
HN
2
5' O 5
HOCH2 O
1 N 6
4' 1'
3' 2'
OH OH
Uridina
1-(1’-betha-D-ribofuranosil) uracilo
Nomenclatura de los ribonucleósidos
Base Nucleósido

• Adenina Adenosina
• Guanina Guanosina Bases purínicas,
sufijo osina
• Hipoxantina Inosina

• Citosina Citidina
• Uracilo Uridina Bases
pirimidínicas,
• Timina Timidina sufijo idina
 Propiedades químicas de los
nucleósidos

1. Incremento marcado en solubilidad

con respecto a la de la base.

2. Absorción a 260 nm como las bases

aisladas.
 Componentes de los ácidos nucleicos
La hidrólisis química completa de un ácido nucleico da lugar
a una mezcla equimolar de:

Purínico
A. Una base nitrogenada
Pirimidínico

Ribosa
B. Una pentosa
Desoxirribosa

C. Fosfato
DNA vs. RNA
Nucleótidos (ribonucleótidos)
NH2
N
O
O
-O P O CH N
2 O
O-

OH OH
5’-nucleótido (5’-CMP)
Nucleótidos (ribonucleótidos)
NH 2
N
O
HO C H 2 N
O

O OH
O P O-
O- 3’-nucleótido (3’-CMP)
Nucleótidos (ribonucleótidos)
NH2
N
O
HOC H2 O N

OH O
O P O-
2’-nucleótido (2’-CMP) O-
Nucleótidos
(desoxirribonucleótidos) O
HN
O O CH3
- O P O CH N
2 O
O-

5’-dTMP
OH H
Nucleótidos
(desoxirribonucleótidos) O
HN
O
HOC H2 O N

O H
O P O- 3’-dCMP
O-
 Nomenclatura de
Nucleósido
nucleótidos
Nucleótido*
Adenosina Adenilato
**Acido adenílico
**Adenosina (mono, di, tri) fosfato
Guanosina Guanilato
**Acido guanílico
**Guanosina (mono, di, tri) fosfato
Uridina Uridilato
**Acido uridílico
**Uridina (mono, di, tri) fosfato
Timidina Timidilato
**Acido timidílico
**Timidina (mono, di, tri) fosfato
Citidina Citidilato
**Acido citidílico
**Citidina (mono, di, tri) fosfato

*Para desoxirribonucleótidos se antepone el prefijo desoxi

**Se debe especificar además la posición de los fosfatos
Nucleósido fosfato NH2
N
O N
-O P O CH2 N
O N
O-

OH OH
5’-Adenosina monofosfato, AMP
Nucleósido polifosfatos NH2
N
O O N
O P O P O CH2 O N
N
O- O-

OH OH
5’-Adenosina difosfato, ADP
Nucleósido polifosfato
NH2
N
O O O N
-O P O P O P O CH N
2 O N
O- O- O-

OH OH
5’-Adenosina trifosfato, ATP
Propiedades de los nucleótidos

1. Carácter ácido debido al fosfato

2. Solubilidad incrementada respecto al
nucleósido
3. Máximo de absorbancia UV a 260 nm
 Muchas moléculas señalizadoras específicas
en la célula son nucleótidos NH 2
N
N
Nucleótidos cíclicos
O N
N

O O
O OH
P
-
O
3’,5’ Adenosin monofosfato cíclico, cAMP
 NH2
N
O O O N
-
O P O P O P O CH2 O N
N
- - -
O O O
Los nucleótidos
ATP
además de OH OH
participar en los
H2O Hidrólisis de alta energía
ácidos nucleicos
tienen otras DG = -7.6 kcal/mol
funciones: NH2
Pi N
ATP como fuente O O N
de energía O P O P O CH2 N
O N
- -
O O

ADP OH OH
Nicotinamida adenina dinucleótido, NAD+
NH2
N
O O N
N+ C H2 O P O P O C H2 O N
OH HO N
O- O-
O

OH OH
Flavina adenina dinucleótido, FAD
O

H 3C N
NH

H 3C N N O

CH 2

HC OH
NH 2
HC OH
N
HC OH O O N

CH 2 O P O P O C H2 N
O N
- -
O O

OH OH
 Coenzima A
NH 2
H H HO H N
O O
N N N
HS C C O P O P O C H2 O N
O O H 3C C H 3 O- O- N
H H
H H
OH OH
Panteteína
ADP
Polinucleótidos
 Extremo 5’
O
H
N N
H
Extremo 5 fosfato N
HOCH2 N
N
O H

-O O
P H H
-O
N
O
N
H2C
N O
O

-O O
P O
-O

Polinucleótido
O H3C H
N
H2C N O
Enlace O

fosfodiéster -O

P
O
H N
H

-O
O N
N

H2C N N
O
-O O
P O
-O H
O N N
H
N
H2C N N
O H

Extremo 3’ OH Extremo 3 hidroxilo

 Formas de representación de
polinucleótidos
5’- pCpApTpTpGpCpGpGpApApTpGpCpC -3’

5’-CATTGCGGAATGCC-3’
3’-GTAACGCCTTACGG-5’
 3’
H O

5’ -
O O H
N
N
O
P O N C H2
- H
O N O
O N O
H O-
N P
H 2C N N
O H O O-

N
- O N O
O O
H H C H2
P N
- N N
O O
O H O-
N
N P
H 2C H H
N O O O-
O
H N
N O
N

Polinucleótido
-
O O
H C H2
P O
- N N
O H 3C H O
O N O-
P

en doble hélice
H 2C N O H 3C O O-
O

O
-
O O H O
H N N C H2
P N
- H
O N O O
O N O-
P
H 2C N N
O H O O-
N
-
O O H O
N
O N C H2
P
- H
O N O
O N O
H O-
N P
H 2C N N
O H O O-

3’
O
5’
Ruptura enzimática de polinucleótidos
• Exonucleasas:

Cortan enlaces fosfodiéster situados en los

extremos (3’ o 5’) de una cadena
polinucleotídica, y suelen atacar
indistintamente ambos tipos de ácidos
nucleicos.
Ruptura enzimática de polinucleótidos

• Endonucleasas:
Cortan enlaces fosfodiéster situados en el
interior de una cadena polinucleotídica, y suelen
ser específicas de cada ácido nucleico:

– Ribonucleasas
– Desoxirribonucleasas
Endonucleasas de restricción, 1:
1. Reconocen secuencias específicas, por lo
general palindrómicas:
______
5’- ATCGTTGCCTACAATTGAATTCCCAATAACCCTT -3’
3’- TAGCAACGGATGTTAACTTAAGGGTTATTGGGAA -5’

La secuencia reconocida en este caso es GAATTC

Las endonucleasas de restricción fueron identificadas

en bacterias
Endonucleasas de restricción, 2:
2. Suelen romper el polinucleótido dejando extremos cohesivos:

5’- ATCGTTGCCTACAATTGAATTCCCAATAACCCTT -3’

3’- TAGCAACGGATGTTAACTTAAGGGTTATTGGGAA -5’

5’- ATCGTTGCCTACAATTG AATTCCCAATAACCCTT -3’

3’- TAGCAACGGATGTTAACTTAA GGGTTATTGGGAA -5’

Lo que permite la soldadura de fragmentos de DNA rotos por la

misma endonucleasa de restricción
Endonucleasas de restricción, 3:
3. Al reconocer secuencias relativamente largas, cortan el
DNA por un número muy limitado de sitios, lo que facilita
la manipulación experimental del mismo.

Algunas endonucleasas de restricción:

EcoRI GAATTC
ClaI ATCGAT
HaeIII GGCC
RsrII CGGATCCG
 Bibliografía
• Nelson Dl, Cox MM. Leninger Principles of biochemistry.
Worth Publishers, USA, 2004, 4E.

• Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick

R. Molecular Biology of the Gene. Pearson, 2004, USA,
5E.

• Cooper GM. The Cell a Molecular Approach. Sinauer,

2003, USA, 3E.

• Jimenez LF, Merchant H. Biología Celular y Molecular.

Prentice Hall, México, 2003, 5E.
 Bibliografía

• Spinel C. Biología Molecular de la Célula Eucariótica

Animal. Fondo Editorial Biogénesis, Medellín, 2002

• Brown TA. Genomes. Wiley-Liss. New York, 1999

• Klug WS, Cummings MR. Conceptos de Genética.

Prentice Hall, Madrid, 1999, 5E.