CHAP I: LE MONDE MICROBIEN

Cours de Microbiologie 2016/2017

Proposé par :

Mr LADJOUZI R. Mr KECHA M. Mme BENACHOUR

 Plan du cours

Objectif :
Découverte du monde
microbien

 La cellule procaryote

 Place des microorganismes dans le monde vivant:

 Chronologie d’évolution et leur place dans la classification
 microorganismes & environnement
microorganismes & Applications

 Naissance de la microbiologie :
 Définition de la microbiologie et ses domaines
 Historique
I. Historique et domaines de la microbiologie

Qu’est-ce que la microbiologie ?

 C’est l’étude des organismes trop petits invisibles à l’œil nu
appelés « micro-organismes »

 Les micro-organismes comprennent :

Protozoaires
virus bactéries archéobactéries Certaines algues champignons
1. Domaine de la microbiologie

Microbiologie

Microbiologie Microbiologie
fondamentale Appliquée

 L’étude la compréhension  L’application des microorganismes

des mécanismes microbiens dans différents domaines:
(physiologie, structures
moléculaires…) - Alimentaire & agroalimentaire
L’étude des
- Bactéries : bactériologie - Industriel & Biotechnologique
- Champignons : mycologie
- Parasites : parasitologie
- Médical (clinique)
- Virus : virologie
2. Historique : quelques grands noms de la microbiologie

Antony van Leeuwenhoek (1632-1723)

 Drapier hollandais, constructeur de compte-fils.
Intérêt pour la biologie : observation des tissus, cheveux, eau…
Premier à observer des micro-organismes « animalicules » .

Francesco Redi (1626-1697) : Médecin italien.

Conteste la génération spontanée : les organismes vivants peuvent se
développer à partir des matières non vivantes ou en décomposition
Louis Pasteur ( 1822- 1895) : la microbiologie moderne
Chimiste Français, professeur dans de nombreuses universités.
1. Met un terme à la génération spontanée.
2. Il découvre les fermentations réalisées par différents
microorganismes (butyrique, acétique, lactique).
3. Lutte contre la contamination: pasteurisation.
4. Invention de la stérilisation par chaleur humide sous pression
(autoclave) avec Chamberland.
5. Etude pour prévenir par immunisation le choléra chez les poulets.
6. Vaccin contre la rage.
7. Fondement de l'immunologie.
8. Création de l'institut Pasteur 1886.

John Tyndall ( 1820- 1865) :

Physicien anglais, invente un procédé de stérilisation appelé la
tyndallisation: 2 chauffages à 80-100°C espacés de 24 à 48 heures. Ce
processus permet l’élimination de bactéries sporulentes.
 Robert koch ( 1843 – 1910)
Médecin microbiologiste allemand, postule que l’existence
d’une relation de cause à effet ( bactérie – maladie) doit
répondre à 4 critères : POSTULAT DE KOCH
1) Le micro-organisme doit être présent dans chaque cas de
maladie, mais absent chez des organismes sains.

2) Le micro-organisme suspecté doit être isolé et cultivé en

culture pure.

3) La même maladie doit se développer quand le micro-

organisme isolé est inoculé à un hôte sain.

4) Le même micro-organisme doit être à nouveau isolé de

l’hôte infecté expérimentalement.

 Isolement de Mycobacterium tuberculosis (bacille de Koch)

NB :C’est dans son laboratoire que son assistant RJ Pétri a mis au point la boîte portant son nom boite de Pétri
Quelques dates repères de la microbiologie
II. Place des microorganismes dans le monde vivant

Les micro-organismes existent sur terre depuis des milliards d’années

Chronologie d’évolution biologique

 II. 1. Ancienne classification

Virus ?
Archée ? Monde vivant

Règne des Protistes Règne Animal Règne Végétale

Protistes inférieures Protistes supérieures

(Procaryotes) (Eucaryotes)

Algues bleues Algues (sauf algues bleues)

Bactéries Protozoaires
Champignons (moisissures, levures)
II. 2. L’arbre phylogénétique universel
La classification de tous les organismes vivants la plus
acceptée est désormais basée sur la comparaison des
séquences d’ARN ribosomiques (ARNr).
Cette classification comprend 3 domaines:

 Bacteria

 Archaea

 Eucarya
 II.3. Les micro-organismes & environnement naturel

 Habitats microbiens
en Antarctique

 Cyanobactéries thermophiles d’une source

chaude du parc national de Yellowstone USA
(70/74°C)
a) Communauté microbienne dans les profondeurs d’un lac

b) Communauté microbienne dans des eaux d’assainissement après colorations spécifiques

Autres habitats:

 La flore intestinale : plus de 100 000 milliard de bactéries

 Les mers & océans (les halophiles)
 Sols
 II. 4. Les micro-organismes & Applications
a) Agriculture

Fixation de l’azote Exemple d’effets de la nodulation sur la croissance des plantes.

atmosphérique Plants de soja inoculés par B. japonicum (à droite) et non inoculés (à gauche) dans un sol
pauvre en azote.

b) Alimentation
c) Energie et environnement

Biodégradation du pétrole Biolixiviation de l’or

Réservoirs contenant un mélange d’Acidithiobacillus

ferrooydans, Acidithiobacillus thiooxydans et Leptospirillum
ferrooxydans et de minérai formé de pyrite, d’arsenic et d’or.

Lixiviation de minerais à faible teneur en cuivre à

l’aide de bactéries (Acidithiobacillus ferrooxydans)
d) Médecine & Industrie pharmaceutique
 III. Caractéristiques générale de la cellule procaryote

Cellules procaryotes

Morphologie simple
Leur noyau n’est pas limité par une enveloppe
Eubactéries et Archéobactéries

Cellules eucaryotes

Morphologie complexe.
Noyau entouré par une enveloppe.
Protistes, champignons, plantes et animaux.
Comparaison entres les cellules eucaryotes et les cellules procaryotes

Structure cellulaire eucaryote procaryote

Taille 2 – 20 mm 0,3 - 2,5 µm

Noyau présence absence

(plusieurs chromosomes) (un seul chromosome)

Nucléole présence absence

Membrane nucléaire présence absence

Mitochondrie présence absence

Lysosome présence absence

Appareil de Golgi présence absence

Réticulum endoplasmique présence absence

Ribosome Présence présence

association au RE
rugueux
IV. Morphologie bactérienne

 Taille • La taille approximative varie entre 0.1 µm et 10 µm

• Le poids d’une bactérie est d’environ 10-12 g

 Différentes formes de bactéries : les plus retrouvées

Treponema, Borrelia

 Groupement : Isolée, par 2, amas, chaînettes, palissades…etc.

 Taille + forme + Groupement = caractéristique de l’espèce

 1. Forme coque (cocci)

Staphylococcus Enterococcus

Streptococcus
 2. Forme bâtonnet (bacille)

Bacillus subtilis Lactobacillus

(bacilles Gram+) (bacilles Gram+)

Mycobacterium tuberculosis Pseudomonas aeruginosa

(bacilles Gram+) (bacilles Gram -)
3. Forme coccobacille

Coccobacilles:
courts bâtonnets
Ex : E. coli

4. Forme vibrion

Vibrions
bâtonnets incurvés
(virgules)
 5. Forme de mycélium

Mycélium: réseau de long

filaments multinucléés ramifiés

6. Forme spirille

Spirilles: hélices rigides

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7. Forme spirochète

Spirochètes: hélices flexibles

8. Forme pléomorphe

Pléomorphes : organismes qui changent de forme

9. Formes flagellée

Bactéries flagellées
V. Structure cellulaire d’une bactérie
Schéma simplifié

Chromosome

Cytoplasme

Plasmides
  Les éléments constants et inconstants des cellules procaryotes

Plasmides: matériel génétique en plus de

l’ADN génomique. Il peut être transférable
Structure cellulaire d’une bactérie : éléments constants

Chromosome

Cytoplasme

Plasmides