Vous êtes sur la page 1sur 14

La RNA polymérase d'Ecoli

α σ70 β

α
β'

L'holoenzyme est constituée de 5 sous unités:


ααββ'σ70
Le complexe de base : "core" est constitué
des 4 sous unités ααββ'
Fixation de la RNA polymérase de E.coli

α σ70 β
5' 3'
I
3' -84 α +1 +39 5'
région -35 région -10 β'

La sous unité σ70 se fixe aux régions -35 et Pribnow box (-10) du promoteur.

Les 2 sous unités ββ' sont associées au site d'initiation de la transcription.

Les 2 sous unités α se trouvent à proximité de l'ADN en 5' de la région -35.

La transcription initiée (¡10 nt), la sous unité σ70 se dissocie du complexe


Fixation de la RNA polymérase

Molécules de RNA polymérase


fixées sur différents promoteurs
vues en microscopie électronique
Initiation

L'extrémité 5' des ARN de procaryotes est presque toujours une purine, A étant plus
fréquent que G.

La réaction qui initie la transcription est le couplage de 2 nucléosides triphosphates :

pppA + pppN pppApN + PPi

Une fois que la transcription est initiée par l'holoenzyme, le facteur σ se dissocie de
l'ensemble : "core" – DNA – RNA et peut aller se fixer à un autre complexe de
base ("core") pour former un nouveau complexe d'initiation
Elongation
N1 N2 Nx N x+1

OH OH OH OH

OH
+ OH
ppp P P ppp

N1 N2 Nx N x+1

OH OH OH OH

ppp P P
OH + pp
i
P
La terminaison

Deux types de terminaison:

● La terminaison ρ (rho) indépendante


● La terminaison ρ (rho) dépendante
Signal de terminaison de l'opéron tryptophane
Opéron trp site de terminaison

signal de terminaison

U CC
U G
G-C
A-U
C-G
C-G
G-C
C-G
C-G
RNA UAAUCCCACAG-CAUUUU
Mécanisme de la Terminaison
Rho indépendante
A la fin de l'élongation, près du site de terminaison,
U C C
U G
G-C
l'ARN se structure en une tige-boucle très stable A-U
qui interagit avec la RNA polymerase. C-G
C-G
G-C
C-G
C-G
RNA UAAUCCCACAG-CAUUUU
AAAA

L'enzyme s'arrête et le RNA se dissocie de AAAA


sa matrice car l'appariement UUUU/AAAA
est très peu stable.
Terminaison ρ (Rho) dépendante

Dans certains cas, le site de terminaison ne comporte


pas de séquence capable de former une structure
en "épingle à cheveux"

Une protéine : le facteur Rho est alors


nécessaire pour augmenter l'efficacité du site
de terminaison
Le facteur Rho

Le facteur ρ est une protéine héxamérique

Sous unité de
419 aa
Le facteur ρ est une enzyme qui
catalyse la séparation des Hélicase
duplex DNA/RNA et RNA/RNA

La réaction est favorisée par l'hydrolyse d'un NTP


en NDP + Pi.
Mécanisme de la terminaison Rho dépendante

RNA
Mécanisme de la terminaison Rho dépendante

Le facteur Rho se fixe sur un site spécifique de la chaîne


d'ARN nouvellement synthétisée.

Le facteur Rho migre alors sur le brin d'ARN dans


la direction 5' Æ 3' jusqu'à ce qu'il rencontre une
molécule de RNA polymérase stoppée ou ralentie.

Le facteur Rho déroule et dissocie le duplex RNA/DNA


libérant la molécule d'ARN.
Inhibition du facteur Rho

Le
Leβ,γ-
β,γ- Imido
Imidonucleoside
nucleosidetriphosphate
triphosphate
qui
quiest
estsubstrat
substratpour
pourla
laRNA
RNApolymérase
polymérase
inhibe
inhibel'action
l'actiondu
dufacteur
facteur Rho.
Rho.

β,γ- Imido nucleoside triphosphate

La RNA polymérase induit la rupture de la liaison αβ


le facteur Rho induit la coupure de la liaison βγ
Gènes en cours de transcription

Terminaison

Initiation