Fungsi tanah bagi keberlangsungan

MH
KD:
3.11 Memahami pentingnya tanah dan
organisme yang hidup dalam tanah untuk
keberlanjutan kehidupan

4.10 Melakukan penyelidikan tentang fungsi

tanah bagi keberlangsungan kehidupan
 Cakupan materi
• Peran tanah
• Peran organisme tanah
• Proses pembentukan tanah
• Komponen tanah
 Proses pembentukan tanah
• Soils are generally formed from rock (called
parent material) that is gradually broken down,
or fragmented, into smaller and smaller particles
by biological, chemical, and physical weathering
processes. Two important factors that work
together in the weathering of rock are climate
and organisms. When plant roots and other
organisms living in the soil respire, they produce
carbon dioxide (CO2), which diffuses into the soil
and reacts with soil water to form carbonic acid
(H2CO3).
 Apakah “Tanah “ itu?
“Tanah” merupakan lapisan di permukaan bumi terdiri atas batuan
lapuk, mineral dan bahan organik yang mampu mendukung kehidupan
tumbuhan dan organisme lainnya.

Persentase
komposisi tanah
 Komponen tanah
• Soil comprises four distinct components—
inorganic mineral particles (which make up about
45% of a typical soil), organic matter (about 5%),
water (about 25%), and air (about 25%). The
plants, animals, fungi, and microorganisms that
inhabit soil interact with it, and minerals are
continually cycled from the soil to organisms,
which use them in their biological processes.
When the organisms die, bacteria and other soil
organisms decompose the remains, returning the
minerals to the soil.
• Ketika organisme mati akan didekomposisi
menjadi mineral dalam tanah.
• Tanah yang bervariasi mempunyai mineral
yang berbeda dan karakteristik kimia yang
berbeda karena tanah berasal dari weathering
process of the rock.
• The inorganic mineral particles, which come
from weathered rock, provide anchorage and
essential minerals for plants, as well as pore
space for water and air. Because different
rocks consist of different minerals, soils vary in
mineral composition and chemical properties.
• The inorganic mineral particles, which come
from weathered rock, provide anchorage and
essential minerals for plants, as well as pore
space for water and air. Because different
rocks consist of different minerals, soils vary in
mineral composition and chemical properties.
Rocks rich in aluminum form acidic soils.
 Struktur Tanah
Horison O, seresah dedaunan, bahan
organik

Horison B, Zone akumulasi

Horison R, bahan induk yang belum

terlapuk

Model profil tanah

 Profil tanah yang ideal

ANATOMI TANAH
Terorganisir menjadi lima lapisan
yang berbeda,

disebut

Horison Tanah

DIUNDUH DARI: smu.edu/earthsciences/academics/courses/geol3472/Lecture%202.ppt ……. 10/2/2013

 Tekstur tanah
• texture, or structural characteristic, of a soil is
determined by the percentages (by weight) of
the different-sized inorganic mineral articles—
sand, silt, and clay—in it.
 Ukuran partikel mineral tanah
• The largest soil particles are called
sand (0.02 to 2 mm in diameter); the medium-sized
particles, silt (0.002 to 0.02 mm in diameter); and
the smallest particles, clay (less than 0.002 mm in
diameter). Sand particles are large enough to be
seen easily with the eye, and silt particles (about
the size of fl our particles) are barely visible. Most
individual clay particles are too small to be seen
with an ordinary light microscope; they can be
seen only under an electron microscope.
 Tanah yang ideal untuk pertanian.
• Soil always contains a mixture of different-sized
particles, but the proportions vary from one soil
to another. A loam, which is an ideal agricultural
soil, has an optimum combination of different soil
particle sizes: it contains approximately 40% each
of sand and silt and about 20% of clay. Generally,
the larger particles provide structural support,
aeration, and permeability to the soil, whereas
the smaller particles bind into aggregates, or
clumps, and hold minerals and water.
• Coba tentukan letak 50% pasir, 20% debu dan
30% liat!
• Jenis tanah loam, merupakan tanah yang ideal
untuk pertanian yang mempunyai
perbandingan persentase pasir dan debu
masing masing 40 % dan clay 20 %.
• Partikel tanah yang besar akan memberikan
dukungan struktur, menyediakan aerasi tanah,
permeabilitas
• Partikel tanah yang kecil akan berperan dalam
mengikat mineral dan air.
• Soils with larger proportions of sand are not as
desirable for most plants, because they do not
hold water and mineral ions well. Plants grown in
such soils are more susceptible to drought and
mineral deficiencies. Soils with larger proportions
of clay are also not desirable for most plants
because they provide poor drainage and often do
not provide enough oxygen. Clay soils used in
agriculture tend to compact, which reduces the
number of soil spaces that can be filled by water
and air.
 Soil organic matter
• The organic matter in soil is composed of litter
(dead leaves and branches on the soil’s
surface); droppings (animal dung (kotoran);
and the dead remains of plants, animals, and
microorganisms in various stages of
decomposition.
• Organic matter is decomposed by
microorganisms, particularly bacteria and
fungi, that inhabit the soil.
• During decomposition, essential mineral ions
are released into the soil, where they may be
bound by soil particles or absorbed by plant
roots.
• 50 % volume tanah tersusun dari pori tanah
• Pore spaces occupy roughly 50% of a soil’s
volume and are filled with varying roportions
of air and water. Both soil air and soil water
are necessary to produce a moist but aerated
soil that sustains plants and other soil-
dwelling (tempat tinggal) organisms. Water is
usually held in the smaller pores, whereas air
is found in the larger pores.
 Jenis Gas di Tanah
• As a result of respiration by soil organisms,
there is less oxygen and more carbondioxide
in soil air than in atmospheric air. (Aerobic
respiration uses oxygen and produces carbon
dioxide.) Among the important gases in soil
are oxygen (O2), required by soil organisms for
aerobic respiration; nitrogen (N2), used by
nitrogen-fi xing bacteria; and carbon dioxide
(CO2), involved in soil weathering.
 Organisme dalam Tanah
• soil may contain millions of microorganisms,
such as bacteria, fungi, algae, protozoa, and
microscopic nematodes and other worms.
Many other organisms also colonize the soil
ecosystem, including plant roots, earthworms,
insects, moles, snakes, and groundhogs (❚
Fig. 35-13). Most numerous in soil are
bacteria, which number in the hundreds of
millions per gram of soil
 Fungsi organisme tanah
• Aliran energi dan dekomposisi bahan organik
– Aliran energi terkait erat dengan proses akumulasi
dan dekomposisi bahan organik
– Jumlah bahan organik yang diperoleh dalam suatu
ekosistem dapat digunakan sebagai ukuran
produktivitas ekosistem tsb
– Proses dekomposisi sangat dipengaruhi oleh faktor
lingkungan; mikroba paling dominan cendawan dan
bakteri
• Siklus Hara: pertukaran unsur kimia antara bagian
ekosistem yang mati ke bagian yang hidup disebut
siklus hara, pada skala global disebut biogeokimia
 Keasaman tanah
• Acidity is measured using the pH scale, which
extends from 0 (extremely acidic) through 7.0
(neutral) to 14.0 (extremely alkaline). The pH
of most soils ranges from 4.0 to 8.0, but some
soils are outside this range
• Plants are affected by soil pH, partly because the
solubility of certain minerals varies with
differences in pH. Soluble minerals can be
absorbed by the plant, whereas insoluble forms
cannot. At a low pH, for example, aluminum and
manganese in soil water are more soluble and
are sometimes absorbed by the roots in toxic
concentrations. At a higher pH, certain mineral
salts essential for plant growth, such as calcium
phosphate, become less soluble and thus less
available to plants.
• The optimum soil pH for most plant growth is
6.0 to 7.0, because most essential minerals
are available to plants in that pH range.
 Mineral tanah
• Nineteen elements have been found essential for most,
if not all, plants (❚ Table 35-1). Ten of these are
required in fairly large quantities (greater than 0.05%
dry weight) and are therefore known as
macronutrients. Macronutrients include carbon,
hydrogen, oxygen, nitrogen, potassium, calcium,
magnesium, phosphorus, sulfur, and silicon. The
remaining nine micronutrients are needed in trace
amounts (less than 0.05% dry weight) for normal plant
growth and development. Micronutrients include
chlorine, iron, boron, manganese, sodium, zinc, copper,
nickel, and molybdenum.
 Siklus C
• Sebagian besar kabon di bumi ini dalam bentuk
terikat (terutama dalam bentuk karbonat), baik
dalam batuan induk maupun karbon fosil.
• bahan organik tanah (BOT) merupakan cadangan
karbon global yang jumlahnya bisa mencapai 2
kali di atmosfer.
• perubahan pada pool BOT akan sangat
mempengaruhi kadar CO2 global.
Siklus C: fotosintesis menyebabkan asimilasi CO2 atmosfer yang diimbangi
oleh dekomposisi sisa tanaman dan seresah, dan bahan organik tanah
 Sumber C dalam Tanah
• Sumber utama: CO2 atmosfer yang difiksasi oleh
tanaman dan organisme fotoautotrof lainnya.
– CO2 atmosfer difiksasi menjadi bentuk karbon organik
penyusun jaringan tanaman melalui reaksi: CO2+H2O

CH2O+O2.
– Jaringan tanaman kemudian dikonsumsi oleh herbivora.
– Sisa tanaman merupakan sumber karbon langsung untuk
tanah, sedangkan tubuh hewan herbivora dan limbahnya
merupakan sumber karbon yang tidak langsung.
 Sumber C dalam Tanah
• Sumber lain:
– bentuk hidrokarbon aromatik polisiklik dari pembakaran
bahan bakar fosil
– bentuk produk industri seperti pestisida.
• Pada ekosistem yang produktif, pergantian (turnover)
karbon umumnya berjalan cepat. Misalnya, hutan
tropika basah mempunyai pool karbon tanah lima
kali lebih besar daripada ekosistem pertanian.
• Semakin tidak produktif suatu ekosistem semakin
rendah kecepatan turnover karbon dalam tanah.
 Bentuk Karbon Organik dalam Tanah
• 50% karbon organik dalam tanah berada dalam
bentuk aromatik
• 20% berasosiasi dengan nitrogen
• sekitar 30% berada dalam bentuk karbon
karbohidrat, asam lemak, dan karbon alkan.
• Secara sederhana karbon organik tanah dapat
dikelompokkan menjadi 3 pool,
– karbon tidak larut (insoluble),
– karbon larut (soluble),
– karbon biomasa.
 Dekomposisi Berbagai Bentuk Karbon
Organik dalam Tanah
• tiga proses yang berkaitan
– Pencucian / pelindian (leaching) senyawa mudah
larut
– katabolisme (catabolisms) organisme perombak
– pelumatan (comminution) bahan oleh fauna
tanah.
 Faktor-faktor yang Mempengaruhi
Dekomposisi
• Kualitas Bahan Organik
– Komposisi kimia: N, C/N, P, C/P, Lignin, Polifenol, Asam
organik (fulvat, humat)
– Fisik: kekerasan, kelenturan
• Kondisi lingkungan
– Iklim: curah hujan & kelembaban
• Organisme perombak (decomposers)
– Jenis, diversitas
– Asesibilitas
 Siklus Nitrogen
• Nitrogen berada dalam bentuk gas dinitrogen (N2),
nitrogen organik (dalam tanaman, hewan, biomasa
mikroba, dan bahan organik tanah), ion amonium
(NH4+) dan nitrat (NO3-)
• Organisme tanah merubah satu bentuk nitrogen ke
bentuk nitrogen lainnya melalui berbagai proses.
– N2 dirubah menjadi NH4+ melalui proses penambatan
nitrogen, kemudian nitrogen yang ditambat tersebut
diubah menjadi bentuk nitrogen lainnya melalui proses
amonifikasi, imobilisasi, nitrifikasi dan denitrifikasi.
Siklus N
 Mineralisasi Nitrogen
(Amonifikasi/imobilisasi)
• Mineralisasi = produksi nitrogen anorganik, baik
amonium dan nitrat, tetapi kadang-kadang dinyatakan
untuk amonium saja.
• Peningkatan (atau kadang penurunan) nitrogen
anorganik seringkali disebut net nitrogen mineralization
karena mencerminkan jumlah proses produksi dan
konsumsi amonium.
• Istilah yang lebih benar untuk menyatakan proses
transformasi nitrogen organik menjadi amonium adalah
amonifikasi atau gross nitrogen mineralization.
• Imobilisasi menggambarkan konversi amonium menjadi
nitrogen organik, sebagai akibat dari asimilasi amonium
oleh biomasa mikroba.
– Imobilisasi kadang-kadang juga digunakan untuk menyatakan
asimilasi amonium dan nitrat
 Amonifikasi
• Konversi senyawa nitrogen organik menjadi amonium dipacu
oleh enzim yang dihasilkan oleh organisme tanah.
• Produksi amonium melalui berberapa langkah.
1. Enzim-enzim ekstraseluler memecah polimer nitrogen organik
menghasilkan monomer yang dapat lolos membran sel untuk
kemudian dimetabolisme lebih lanjut dengan hasil akhir amonium
yang dilepaskan ke larutan tanah.
2. Enzim ekstraseluler yang dihasilkan oleh mikroorganisme
mendegradasi protein, aminopolisakarida (dinding sel
mikroorganisme), dan asam nukleat serta menghidrolisa urea
Enzim ekstraseluler yang terlibat dalam mineralisasi
nitrogen

Substrat Enzim Produk

Protein Proteinase, protease Peptida, asam amino
Peptida Peptidase Asam amino
Khitin Khitinase Chitobiose
Khitobiose Khitobiase N-acetylglucosamine
Peptidoglikan Lisozim N-acetylglucosamine dan N-asam
acetylmuramic
DNA dan RNA Endonuklease dan Nukleotida
Eksonuklease
Urea Urease NH3 dan CO 2
 Nitrifikasi
• Nitrifikasi adalah oksidasi senyawa nitrogen tereduksi
yang dilakukan oleh organisme tanah.
• Proses nitrifikasi berlangsung dalam dua tahap yang
dilakukan oleh dua organisme tanah yang
mengoksidasi amonium menjadi nitrat, dimana
nitrogen anorganik berperan sebagai sumber energi
untuk bakteri nitrifikasi.
– Tahap pertama proses nitrifikasi adalah oksidasi amonium,
konversi amoium menjadi nitrit dilakukan oleh bakteri
pengoksidasi amoinum dari genus “Nitroso”
– Kemudian nitrit dioksidasi menjadi nitrat oleh bakteri
pengoksidasi nitrit dari genus “Nitro”.
 Oksidasi Amonium
• Bakteri pengoksidasi amonium yang terkenal adalah
Nitrosomonas; pada tanah masam bakteri
pengoksidasi amonium yang dominan adalah
Nitrosospira
• reaksi konversi amonium menjadi nitrit adalah
– NH3- + 1.5 O2
NO2- + H+ + H2O
– Oksidasi ini mentransfer 6e- yang menghasilkan 271 kj (65
kcal) /mol NH3.
 Oksidasi Nitrit
• Bakteri pengoksidasi nitrit yang terkenal adalah Nitrobacter
spp.
• Oksidasi nitrit menjadi nitrat merupakan reaksi satu langkah:
– NO2- + 1,5O2
NO3-
• Nitrit dioksidasi menjadi nitrat oleh nitrit oksidoreduktase
yang terikat pada membran, yang memindahkan oksigen dari
air dan memindahkan sepasang elektron ke rantai transpor
elektron untuk menghasilkan ATP melalui fosforilasi oksidatif,
– NO2- +H2O
NO3- + 2H+ + 2 e-
 Denitrifikasi
• Denitrifikasi adalah proses reduksi nitrat menjadi gas
nitrogen, terutama dalam bentuk dinitrogen dan nitro oksida.
• Reaksi denitrifikasi adalah,
– 2NO3- + 5 H2 + 2 H+
N2 + 6 H2O
• Denitrifikasi dilakukan oleh bakteri denitrifikasi didominasi
oleh genus Pseudomonas dengan spesies Alcaligenes,
Flavobacterium, dan juga genus Bacillus, tetapi sulit untuk
diketahui mana yang aktif.
• Bakteri tersebut dapat juga berasosiasi dengan transformator
nitrogen lainnya (misalnya Azospirillum, Nitrosomonas dan
Rhizobium) pada kondisi tertentu
 Penambatan Nitrogen

• Semua organisme memerlukan nitrogen agar supaya

tetap hidup.
• Sebagian besar organisme hanya dapat
menggunakan combined nitrogen, NH4+ atau nitrat
NO3-
• Konsentrasi nitrogen yang terbesar di bumi adalah
N2;
gas yang sangat stabil yang menyusun hampir
80% atmosfer.
• Penambatan nitrogen merupakan proses biologi
kedua terbesar setelah fotosintensis
 Definisi
• Penambatan N adalah reduksi N2 atmosfer
menjadi bentuk combined amonia yang
bermanfaat untuk proses biologi.
• N2 atmosfer sangat stabil, maka reaksi
penambatan N sangat mahal jika ditinjau dari
tingginya energi yang diperlukan
 Organisme penambat nitrogen

• dapat hidup bebas (tidak bersimbiosis)

• dapat bersimbiosis dengan organisme,
tanaman dan hewan.
– Organisme yang dapat menggunakan N2 atmosfer
sebagai satu-satunya sumber nitrogen untuk
tumbuhnya disebut diazotrof (diazo – dinitrogen).
 Enzim Nitrogenase
• Penambatan N secara biologi dilakukan oleh komplek
enzim nitrogenase, yang seringkali disebut sebagai
komplek nitrogenase.
• Komplek enzim ini terdiri atas dua komponen
protein,
– protein molibdenum-besi (MoFe protein) yang disebut
dinitrogenase,
sisi aktif dimana N2 direduksi,
– protein besi (Fe protein) yang disebut dinitrogen reduktase

menyediakan elektron untuk MeFe protein untuk
mereduksi N2
 Reaksinya
• Dinitrogen reduktase (Fe protein) menerima elektron dari donor yang
mempunyai redoks rendah seperti feredoksin tereduksi atau
flavodoksin dan mengikat dua MgATP; dinitrogen reduktase
mentransfer elektron sekali saja ke nitrogenase (MoFe protein).
• Dinitrogen reduktase dan dinitrogenase membentuk komplek,
elektronnya ditransfer, dan dua MgATP dihidrolisa menjadi dua Ma ADP
+ Pi (fosfat).
• Dinitrogen reduktase dan dinitrogenase berdisosiasi, dan prosesnya
kemudian diulang lagi.
• Jika dinitrogenase telah mengumpulkan cukup elektron, dinitrogenase
mengikat molekul dinitrogen, mereduksinya, dan melepaskan
amonium.
• Dinitrogenase kemudian menerima tambahan elektron dari dinitrogen
reduktase untuk mengulangi siklus di atas.
 Enzim Nitrogenase
• Penambatan N secara biologi dilakukan oleh komplek
enzim nitrogenase, yang seringkali disebut sebagai
komplek nitrogenase.
• Komplek enzim ini terdiri atas dua komponen
protein,
– protein molibdenum-besi (MoFe protein) yang disebut
dinitrogenase,
sisi aktif dimana N2 direduksi,
– protein besi (Fe protein) yang disebut dinitrogen reduktase

menyediakan elektron untuk MeFe protein untuk
mereduksi N2
 Reaksinya
• Dinitrogen reduktase (Fe protein) menerima elektron dari donor yang
mempunyai redoks rendah seperti feredoksin tereduksi atau
flavodoksin dan mengikat dua MgATP; dinitrogen reduktase
mentransfer elektron sekali saja ke nitrogenase (MoFe protein).
• Dinitrogen reduktase dan dinitrogenase membentuk komplek,
elektronnya ditransfer, dan dua MgATP dihidrolisa menjadi dua Ma ADP
+ Pi (fosfat).
• Dinitrogen reduktase dan dinitrogenase berdisosiasi, dan prosesnya
kemudian diulang lagi.
• Jika dinitrogenase telah mengumpulkan cukup elektron, dinitrogenase
mengikat molekul dinitrogen, mereduksinya, dan melepaskan
amonium.
• Dinitrogenase kemudian menerima tambahan elektron dari dinitrogen
reduktase untuk mengulangi siklus di atas.
 Substrat untuk Nitrogenase
• Substrat utama nitrogenase adalah dinitrogen
• nitrogenase juga mereduksi gas acetylene
menjadi ethylene
– karena acetylene dan ethylene dapat dengan
mudah diamati dengan gas kromatografi.
– cara sederhana, peka dan cepat, yaitu acetylene
reduction assay (ARA) untuk pengamatan aktivitas
nitrogenase
 Beberapa Organisme Hidup Bebas Penambat N2
Genus atau Tipe Contoh Spesies
Aerob Azotobacter A. chroococcum1 A. vinelandii
Azomonas A. macrocytogenes
Beijerinckia B. indica, B.fluminis
Pseudomonas R stutzeri, F saccbaropbila
Anaerob Clostridium Cpasteuilanum, C butyricum
Desulfovibrio D. vulgails, D. desu0curicans
Metbanosarcina M barken
Sianobakteri Fototrof Anabaena A. cylindrica, A. inaequalis
(aerob) Nostoc N. muscorum
Gloeothece G. alpicola
Sianobakteri Fototrof Plectonema P. boryanum
(mikroaerofil) Lyngbya L. aestuarii
Bakteri Fototrof Rbodosphillum R. rubrum
(fakultatif) Rbodopseudomonas R. palustris
Bakteri Fototrof Cbromatimn C vinosum
(anaerob) Cb1orobium C limicola
Ectotbiospira E. sbapovnikovii
Penambatan N2 secara simbiosis
Rbizobium R. leguminosarum
R. loti
R. tropici
R. galegae
R. ciceri
R. mediterraneum
Sinorbizobium S. meliloti
S. fredii
S. sabeli
S. teranga
Bradyrbizobium B.japonicum
B. elkanii
B. flaoningense
Azorbizobium A. cautinodans
 Pembentukan Nodul Akar
• Kelompok organisme (bakteri) yang menambat N2
dengan akar tanaman (terutama legum) secara
kolektif disebut ‘rhizobia’.
• Rhizobia termasuk dalam suatu famili bakteri yang
disebut Rhizobiaceae.
• Pembentuan nodul akar merupakan rangkaian proses
dimana rhizobia berinteraksi dengan akar tanaman
legum untuk membentuk nodul akar.
 Pembentukan Nodul Akar
• Rhizobia tertarik ke permukaan akar tanaman, kemudian
memperbanyak diri, lalu menyerang sel-sel dengan cara yang
spesifik yang melibatkan interaksi antar makromolekul yang
terdiri atas karbohidrat (gliko-) protein yang disebut dengan
lektin yang berada di dalam akar tanaman legum.
• Simbion yang cocok satu dengan lainnya memproduksi suatu
senyawa ekstraseluler, yaitu polisakarida yang bersifat asam,
senyawa ini bereaksi dengan lektin.
• Reaksi ini berlangsung dalam dua arah, yaitu dari bakteri ke
tanaman dan dari tanaman ke bakteri.
 Pembentukan Nodul Akar
• Respon akar terhadap keberadaan rhizobia
menyebabkan akar melengkung.
• Infeksi rhizobia terhadap akar akan berlanjut sampai
ke korteks, kemudian membelah diri membentuk sel-
sel akar.
• Bentuk batang dari bakteri berubah menjadi bentuk
“Pleomorfik”, yaitu seperti tongkat (club-shape)