Ces micro-organismes sont subdivisés en deux groupes :

 *Les micro –organismes commensaux , inoffensif et normalement

présent chez l’homme et les animaux.

 *Les micro –organismes pathogènes , qui détruisent les tissus ou

perturbent les activités physiologiques essentielles ce qui provoque une
réaction des défense chez l’hôte et occasionne des infections plus ou moins
sérieuses.

Remarque :
On connait des micro-organismes commensaux susceptibles de devenir
pathogènes des micro-organismes pathogènes qui ne causent pas toujours
de maladies.
Colonisation et établissement de la flore commensale.
LES micro-organismes commensaux sont des parasites
extracellulaires inoffensif qui coloinissent la peau et les
muqueuses des animaux et de l’homme.
La colonisation débute à la naissance et les
commensaux restent présent durant toute la vie d’un
individu. La première contamination survient au moment
de l’accouchement. Elle est rapidement complétée par
inhalation de l’air , par la déglutition des micro-
organisme présent dans la bouche. La colonisation est un
processus complexe qui se prolonge, une fois que les
espèces microbiennes sont installés. La flore est
généralement stable, surtout en ce qui concerne les
espèces dites résidentes, on trouve aussi les espèces
transitoires.
La relation hote –micro-organisme est une
relation complexe. Elle est le résultats d’un
processus évolutif entre un parasite et un
organisme plus ou moins adaptés à une vie
commune harmonieuse puisque dans
certains cas, la présence du micro-
organisme perturbe l’équilibre de l’hote.
Rôle de la flore commensale

On utilise pour étude du rôle des commensaux

des animaux axéniques et holoxéniques.
métabolique
Histologique
Physiologique
Immunitaire
Effet de barrière.
 Les micro-organismes détruisent certains
déchets comme urée et élaborent diverses
catégories de composés organiques: acides
aminés, vitamines
Rôle histologique :
La comparaison des coupes histologiques du
tube digestif d’animaux axéniques et
holxéniques fait ressortir des différences
spectaculaires : la paroi du tube digestif est
plus mince chez animal axénique avec moins
de cellules. On constate également que le
renouvellement des anthérocytes est deux fois
plus lent chez les animaux axéniques
Rôle de la flore commensale

On utilise pour étude du rôle des commensaux

des animaux axéniques et holoxéniques.
métabolique
Histologique
Physiologique
Immunitaire
Effet de barrière.
Effet barrière : la flore commensale empêche
les pathogène de s’installer dans intestin ou
limite leur prolifération ceci est du à la
remarquable stabilité de la flore commensale
 Les bactéries pathogènes.

Les micro –organismes pathogènes détruisent les

tissus ou perturbent les activités
physiologiques essentielles ce qui provoque
une réaction des défense chez l’hôte et
occasionne des infections plus ou moins
sérieuses.

La virulence et pouvoir pathogène

Micro-organismes pathogènes :
mode d’ action des bactéries
pathogènes.
endotoxine et exotoxine.
Les bactéries opportunistes
 - Les bactéries opportunistes ne donnent habituellement pas de maladie
chez les sujets sains. En revanche, elles peuvent devenir pathogènes chez
les sujets aux défenses immunitaires altérées.
- Ces bactéries sont souvent des bactéries commensales qui vivent à la
surface de la peau et des muqueuses de l'homme 
Chez le sujet normal, elles ne donnent pas d'infections, mais à la faveur
d'une immunodépression ou d 'une antibiothérapie, elles vont être contre-
sélectionnées et proliférer leur donnant ainsi un avantage sélectif.
- Le type de maladie (et donc le pouvoir pathogène) dont ces bactéries
sont responsables est, en général, monomorphe : colonisation de la porte
d'entrée avec développement d'une inflammation non spécifique à ce
niveau (pneumonie, infection urinaire, infection sur cathéter,.. ),
éventuellement suivie d'unegénéralisation, septicémie avec
des localisations secondaires possibles (endocardite, abcès profond,
ostéites, méningites...