Le sol provient de la décomposition et de l’altération des
roches par l’action de l’eau, de l’air et des êtres vivants. Au cours du temps, le sol s’épaissit et se modifie ; il acquiert des constituants (matières organiques, argiles...) et des structures (couleurs, agrégats, horizons...) qui lui sont spécifiques. Le sol est divers : ses caractéristiques et ses propriétés changent en fonction des roches, des reliefs, des climats, des végétations, de leurs âges Trop souvent considéré comme un environnement minéral, le sol est aussi un lieu de vie. Il héberge une très forte diversité d’espèces, des vers de terre aux amibes qui participent à son fonctionnement et à la fourniture de services écosystémiques nécessaires à notre Parmi ces espèces, les microorganismes sont, sans conteste, les plus nombreux et les plus divers. Composés de bactéries et de champignons, ils assurent des fonctions essentielles comme la biodégradation de la matière organique, la production de nutriments pour les plantes, la fixation d’azote, la dégradation des polluants, etc. Les cycles biogéochimiques comme le cycle du carbone de l’azote ou du phosphore sont sous la dépendance (à plus de 90 %) des microorganismes. Ils sont ainsi responsables de l’émission des gaz à effet de serre comme le CO2, le N2O et le CH4. Pourtant, malgré cette importance écologique, ils restent mal connus. Cette méconnaissance a de multiples origines, mais la En effet, seul 1 % des bactéries du sol sont cultivables, or, jusqu’à récemment, la culture sur un milieu spécifique constituait la seule méthode de caractérisation des espèces microbiennes. Ce verrou méthodologique a été levé grâce à l’essor des outils moléculaires qui permettent de caractériser et dénombrer les microorganismes dans leur milieu naturel sans passer par l’étape de la culture. Grâce à ces techniques, on sait, actuellement qu’un seul gramme de sol peut héberger jusqu’à 10 000 espèces bactériennes différentes et près d’un milliard de bactéries. La plupart appartiennent à des embranchements (ou phylum) pour lesquels n’existe aucun ou quelques rares représentants cultivés, d’où l’impossibilité de déterminer précisément leurs rôles. D’autant plus, qu’une espèce peut assurer plusieurs fonctions et inversement une Chapitre I la faune du sol dans son contexte écologique Une très grande diversité
6 Localisation, nature, nutrition et productivité de la faune du sol La majorité de la faune du sol, se localise où se situe le potentiel énergétiques des apports végétaux (environ 90% dans la litière, soit l’horizon de fragmentation) Épiédaphon------ faune épigée -----surface du sol Hémiédaphon---- couche humifère Euédaphon------- faune endogée ---- profondeur du sol Selon la taille des individus, nous pouvons diviser la faune du sol en; - Microfaune (inferieur à 0.2 mm); vivent dans un film d’eau (sp hydrophiles, avec des formes résistantes à la sécheresse-vie ralentie, déshydratation, enkystement. Protozoaires, nématodes, rotifères, tardigrades et turbellariés. - Mésofaune (0.2 à 4 mm); sp hydrophiles et xérophytes - Macrofaune (4 à 80 mm); vers de terre, insectes supérieurs, Myriapodes, arachnides, Mollusques, et crustacées. - Mégafaune (de 80mm à 1.06m); reptiles, batraciens, rongeurs. Tous ces animaux possèdent des régimes alimentaires différents et plus ou moins stricts; - Les phytophages (mycophages) - Les saprophages - Les prédateurs (carnivores, insectivores, parasites) - Les nécrophages Colonisation des sols par la faune Les possibilités d’installation des animaux dans les sols sont diverses; 1. Les animaux peuvent être transportés par le vent 2. Par l’eau courante (surtout la faune épigée) 3. Presque la totalité des animaux de la méso et macrofaune peuvent se déplacer par eux même Il y a également les conditions historico-géographiques qui déterminent dans le sol la nature possible des peuplements (Ex: introduction accidentelle d’une espèce par l’homme) Les facteurs écologiques sont déterminants aussi L’évolution du sol modifie en permanence les conditions de vie des animaux, ces conditions de vie peuvent à la fois être Les facteurs abiotiques Les sols diffèrent des autres biotopes de par leurs conditions très particulières d’atmosphère humide, d’uniformité thermique, d’obscurité, et de calme. Les caractéristiques pédologiques pouvant être un élément de sélection de la faune du sol sont; Humidité du sol: c’est un facteur primordial pour la faune, le manque d’eau peut provoquer la dessiccation des animaux, et l’excès peut provoquer des phénomènes d’endosmose. on distingue des faunes hydrophiles, hygrophiles, ou xérophiles Porosité et atmosphère du sol: la circulation de l’eau et de l’air de la faune dépendent de la porosité. un sol très compact s’oppose aux phénomènes migratoires. Température du sol: les températures du sol varient de moins en moins lorsqu’on s’oriente vers la profondeur du sol. Chaque espèce a une température préférentielle pour son activité, il existe des espèces Eurythermes (Sp. Euryèce) et des espèces Sténothermes. les variations de températures déterminent aussi les migrations verticales dans le sol. le froid ralentit les activités des animaux, et le gel peut provoquer la mort d’un bon nombre d’espèces. (le feu également)
Autres facteurs du milieu: la texture, le pH, la nature
chimique des litières, le potentiel d’oxydo-réduction, la salinité, la nature des argiles, et la lumière. Les interactions entre organismes Dans le déterminisme de la faune du sol, le potentiel énergétique des apports végétaux détermine d'abord la somme de vie possible, puis viennent les facteurs écologiques du milieu qui sélectionnent les espèces composant le peuplement. il existe un autre facteur qui régit la sélection des communautés; les interactions entre organismes qui permet de former des communautés organisées (ou biocénoses). ces interaction entre organismes sont d’une variété Parmi les interactions on compte; l’amensalisme; interaction biologique interspécifique (entre deux espèces différentes) dans laquelle une espèce inhibe le développement de l'autre.
compétition; Une compétition intra spécifique est une
concurrence au sein d'une même population pour la même ressource. C'est l'inverse de la compétition interspécifique, qui elle, est une concurrence entre deux populations différentes.
prédation; exprime l'acte d'un animal ou végétal, un
prédateur, capturant ou se nourrissant d'un autre organisme, la proie, appartenant à une espèce différente parasitisme; est une relation biologique entre deux êtres vivants, où un des protagonistes (le parasite) tire profit (en se nourrissant, en s'abritant ou en se reproduisant) aux dépens de l'autre (l'hôte).
commensalisme; une interaction durable entre des individus
d'espèces différentes où l'un des partenaires retire un bénéfice de l'association tandis que l'autre n'y trouve ni avantage ni véritable inconvénient
symbiose; est une association intime, durable entre deux
organismes hétérospécifiques (appartenant à des espèces déterminisme des biocénoses, diversité et stabilité
Le déterminisme des biocénoses dépend de;
1. l’apport énergétique a un rôle fondamental car il commande la somme de vie possible 2. l’importance des divers facteurs abiotiques du milieu qui participent à la sélection des organismes susceptibles de coloniser le milieu et dont l’évolution se reflète sur la végétation 3. les interactions entre les organismes qui organisent le la diversité et la stabilité; les deux premières lois biocénotiques fondamentales disent que: 1. Loi N°1: plus les conditions de vie sont variables dans un milieu biologique, plus grand est le nombre d’espèces de la communauté vivante qui le caractérise 2. Loi N°2: plus les conditions de vie d’un biotope s’écartent de la normale et des conditions optimales de la plupart des animaux, plus la biocénose devient pauvre en espèces, plus elle devient caractéristique et plus la densité des espèces présente s’élève
