PAR : NAME/NOM:
Internal use
SUMMARY/SOMMAIRE
1. IMPLEMENTATION GUIDELINE / OTHER REFERENCES:
LIGNES DIRECTRICES APPLIQUEES / AUTRES REFERENCES:
2. PURPOSE& SCOPE:
BUT ET DOMAINE D’APPLICATION:
3. RESPONSIBILITIES:
RESPONSABILITES:
4. REQUIREMENTS:
EXIGENCES:
5. CHANGE CONTROL :
CONTROLE DE CHANGEMENT :
6. DEFINITIONS / ABBREVIATIONS:
DEFINITIONS / ABREVIATIONS:
7. ANNEXURES :
ANNEXES:
8. PROCEDURE:
PROCEDURE:
Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
gallery system. service de microbiologie de l'établissement
injectable.
This Standard Operating Procedure is applicable at
Microbiology Department of injectable facility.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
6.1.1 SOP: A written authorized procedure,
which gives instructions for performing
operations.
6.2 ABBREVIATIONS :
6.2 ABRÉVIATIONS:
6.2.1 QC: Quality Control
6.2.1 QC: Contrôle de qualité
6.2.2 QA: Quality Assurance. 6.2.2 AQ: Assurance qualité.
6.2.3 SOP: Standard Operating Procedure. 6.2.3 SOP: Procédure opératoire standard.
6.2.4 FRM: Format
6.2.4 FRM: Format
6.2.5 GEN: Genres
6.2.5 GEN: Genera 6.2.6 API: INDICE DE PROFIL ANALYTIQUE
6.2.6 API: ANALYTICAL PROFILE INDEX
7.0 ANNEXURES :
7.0 ANNEXES:
NA
NA
8.0 PROCEDURE 8.0 PROCÉDURE
8.1 API 20 E® GALLERY:
8.1.1 The API 20 E® Gallery is a 8.1 GALERIE API 20 E®:
standardized system for the 8.1.1 L'API 20 E® Gallery est un système
identification of Enterobacteriaceae and standardisé pour l'identification des
other non-fastidious gram-negative Enterobacteriaceae et autres bacilles Gram négatif
bacilli. This system includes 21 non fastidieux. Ce système comprend 21 tests
miniaturized biochemical tests as well biochimiques miniaturisés ainsi qu'une base de
as a database. The list of bacteria that données. La liste des bactéries pouvant être
can be identified is shown in the table at identifiées est indiquée dans le tableau à la fin de la
the end of the leaflet. notice.
8.1.2 The API 20 E gallery comprises 20 8.1.2 La galerie API 20 E comprend 20 microtubes
microtubes containing dehydrated contenant des substrats déshydratés. Ces microtubes
substrates. These microtubes are sont inoculés avec une suspension bactérienne. Les
inoculated with a bacterial suspension. réactions produites pendant le temps d'incubation
The reactions produced during the entraînent des changements de couleur ou sont
incubation time result in color turns or révélées par l'ajout de réactifs. La lecture de ces
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
are revealed by the addition of reagents. réactions est l'interprétation des résultats et
The reading of these reactions is the l'identification est faite selon le logiciel apiweb.
interpretation of the results and the
identification is done according to the
apiweb software.
between 2 and 8° C. Once opened the Les galeries sont maintenues dans des sachets en
gallery can be kept for 8 months at a aluminium avec un sachet déshydratant. Après
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microorganisms. isolés sur des milieux de culture adaptés aux
entérobactéries ou bacilles gram-négatifs selon les
techniques usuelles d'isolement des
microorganismes.
8.1.6 Preparation of the
gallery:
Gather, bottom and lid of an incubation
box. Divide 5 ml of distilled or
deionized water into the cells to create a 8.1.6 Préparation de la galerie:
humid atmosphere. • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
Write the strain reference on the side tab
d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
of the box.
Remove the gallery from its packaging. déminéralisée dans les cellules pour créer une
Place the gallery in the incubation box atmosphère humide.
• Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
8.1.7 Preparation of the
latéral de la boîte.
inoculum:
Open a vial of NaCl 0.85% Medium • Retirez la galerie de son emballage.
(5ml) or API Suspension Medium • Placer la galerie dans la boîte d'incubation
(5ml).
Using a pipette, collect a well isolated
colony on agar medium. Preferentially 8.1.7 Préparation de l'inoculum
use young cultures (18-24H). • Ouvrir un flacon de NaCl à 0,85% de milieu (5 ml)
Perform a bacterial suspension by ou de milieu de suspension API (5 ml).
thoroughly homogenizing the bacteria.
• À l'aide d'une pipette, prélever une colonie bien
For CIT, VP and GEL tests fill tube and en inclinant légèrement la boîte. incubation en
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cup. avant:
For other tests, fill only the tubes. • Pour les tests CIT, VP et GEL, remplissez le tube
For ADH, LDC, ODC, H2S, URE tests
et la coupelle.
create anaerobiosis by filling their wells
with paraffin oil. • Pour les autres tests, ne remplissez que les tubes.
Close the incubation box and incubate at • Pour les tests ADH, LDC, ODC, H2S, URE créent
36 ° C ± 2 ° C for 18-24 hours. une anaérobiose en remplissant leurs puits d'huile de
paraffine.
8.1.9 Reading and • Fermez la boîte d'incubation et incuber à 36 ° C ±
interpretation: 2 ° C pendant 18-24 heures.
8.1.9.1 Reading the gallery:
After incubation, the reading of the
gallery must be done by referring to the 8.1.9 Lecture et interprétation:
reading board. 8.1.9.1 Lecture de la galerie:
If three or more tests are positive, record
• Après l'incubation, la lecture de la galerie doit se
on the results sheet all spontaneous
reactions and then reveal the tests faire en se référant au tableau de lecture.
requiring the addition of reagents: Si trois tests ou plus sont positifs, notez sur la feuille
TDA test: Add a drop of TDA reagent. de résultats toutes les réactions spontanées puis
A brownish-red color indicates a
révélez les tests nécessitant l'ajout de réactifs:
positive reaction.
IND test: add a drop of James reagent, a • Test TDA: Ajouter une goutte de réactif TDA. Une
diffuse pink color throughout the cup couleur brun-rouge indique une réaction positive.
indicates a positive reaction
• Test IND: ajouter une goutte de réactif de James,
VP test: Add a drop of VP1 and VP2
reagents. Wait at least ten minutes, a une couleur rose diffuse dans toute la tasse indique
pink or red color indicates a positive une réaction positive
reaction. A weak coloration occurring • Test VP: Ajouter une goutte de réactifs VP1 et
after ten minutes should be considered
VP2. Attendez au moins dix minutes, une couleur
negative.
rose ou rouge indique une réaction positive. Une
coloration faible apparaissant après dix minutes
devrait être considérée comme négative.
Nota Bene :
The indole production test must be
performed last because this reaction
releases gases that may affect the
interpretation of other tests in the
gallery. Do not replace the incubation
lid after adding the reagent. Nota Bene:
If the number of positive tests before
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reagent addition (including the GLU Le test de production d'indole doit être effectué en
test) is less than three: dernier car cette réaction libère des gaz qui peuvent
Re incubate the gallery 24 more hours
affecter l'interprétation d'autres tests dans la galerie.
without adding reagents
Reveal tests requiring the addition of Ne remplacez pas le couvercle d'incubation après
reagents. l'ajout du réactif.
To complete the identification, it may be • Si le nombre de tests positifs avant l'ajout du
useful to carry out additional tests
réactif (y compris le test GLU) est inférieur à trois:
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
CIT Trisodium 0.756 Using citrate Light Light Rouge Rouge
Citrate Green Green / (2) (2)
/ Yellow ODC L-ornithine 1.9 Ornithine Jaune Jaune
Yellow Blue Decarboxylase Rouge Rouge
Blue Green / Orange Orange
Green Blue (3) (2) (2)
/ Blue CIT Trisodium 0.756 Using citrate Vert Vert
(3) Citrate clair / clair /
H2S Sodium 0.075 H2S Colorle Colorles Jaune Jaune
Thiosulfate production ss s Bleu Bleu
Grayish Grayish Vert / Vert /
Black Black Bleu Bleu (3)
deposit deposit (3)
/ fine / fine H2S Sodium 0.075 production du Dépôt Dépôt
edging edging Thiosulfate H2S noir noir
ERUs Urea 0.76 urease Yellow Yellow grisâtr grisâtre
Red Red e incolore
Orange Orange incolor /
(2) (2) e/ bordure
TDA L-Tryptophan 0.38 Tryptophan Immediate ADD bordur fine
deaminase Yellow Yellow e fine
reddish reddish ERUs Urea 0.76 urease Jaune Jaune
brown brown Rouge Rouge
IND L-Tryptophan 0.19 Indole James Immediate Orange Orange
production Color Color (2) (2)
less pale less TDA L-Tryptophan 0.38 Tryptophan ADD immédiat
green / pale deaminase Brun Brun
yellow green / rougeât rougeât
yellow re re jaune
VP Sodium 1.9 Acetoin VP1 + VP2 / 10 mi jaune
pyruvate production Color Color IND L-Tryptophan 0.19 production du James Immédiat
(Voges less / less / indole Couleur Couleu
Proskauer) Light Light moins r moins
Pink Pink vert vert
Pink / Pink / pâle / pâle /
Red (5) Red (5) jaune jaune
VP Sodium 1.9 production VP1 + VP2 / 10 mi
pyruvate d’acetoin(Voge Couleur Couleu
s Proskauer) moins / r moins
Rose / Rose
clair clair
Tests Active QTE Reaction / Results Rose / Rose /
components (mg/ enzymes Positiv Positive Rouge Rouge
cup) e Negative (5) (5)
Negati
ve
GEL Gelatin 0.6 Gelatinase Non Non
(bovine (GELatin) diffusi diffusion
origin) on Diffusio
Test Composants QTE Reaction / Resultats
Diffusi n of
actifs (mg/ enzymes Positiv Positive
on of black
cup) e Negative
black pigments
pigme Negati
nts ve
GLU D-Glucose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- GEL Gelatin 0.6 Gelatinase Diffusi Diffusio
E oxidation Blue Blue (bovine (GELatin) on n /sans
GLUcose (4) green green origin) /sans diffusion
Yellow Yellow / diffusi de
/ yellow on de pigments
yellow gray pigme noirs
gray nts
MA D-Mannitol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- noirs
N oxidation Blue Blue GLU D-Glucose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
MANnitol (4) green green E oxidation Bleu Bleu
Yellow Yellow GLUcose (4) Vert Vert
INO inositol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- Jaune / Jaune /
oxidation Blue Blue Jaune Jaune
INOsitol (4) green green Gris Gris.
Yellow Yellow MA D-Mannitol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
ORS D-Sortbitol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- N oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue MANnitol (4) vert Jaune
SORbitol (4) green green Jaune
Yellow Yellow INO inositol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
RHA L-rhamnose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue INOsitol (4) vert Jaune
RHAmnose green green Jaune
(4) Yellow Yellow ORS D-Sortbitol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
BAG D-Sucrose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue SORbitol (4) vert Jaune
SACcharose green green Jaune
(4) Yellow Yellow RHA L-rhamnose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
MEL D-melibiose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue RHAmnose vert Jaune
MELbiose (4) green green (4) Jaune
Yellow Yellow BAG D-Sucrose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
AM amygdalin 0.57 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
Y oxidation Blue Blue SACcharose vert Jaune
Amygdalin green green (4) Jaune
(4) Yellow Yellow MEL D-melibiose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
ARA L-arabinose 1.9 Fermentation Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
/ oxidation Blue Blue MELbiose (4) vert Jaune
ARAbinose4) green green Jaune
Yellow Yellow AM amygdalin 0.57 Fermentation / Bleu- Bleu-
OX (see Cytochrome Color Color Y oxidation Bleu Bleu vert
instructions OXydase less / less / Amygdalin vert Jaune
for the Light Light (4) Jaune
oxidase test) Pink Pink Pink ARA L-arabinose 1.9 Fermentation Bleu- Bleu-
Pink / / Red (5) / oxidation Bleu Bleu vert
Red (5) ARAbinose4) vert Jaune
Jaune
A very light yellow color is also positive OX (voir Cytochrome Couleu Couleur
An orange color appears after 36-48H instructions
pour
OXydase r
moins
moins /
Rose
incubation should be considered oxidase test) / Rose clair
clair Rose /
negative Rose / Rouge
Reading in the cup (aerobic zone) Rouge
(5)
(5)
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
McC Macconkey' Absen Absence Orange Orange
s middle ce rouge rouge
Prese Presence jaune jaune
nce MOB API M
OF-F Glucose API Reading Green milieu ou Mobile Mobile
of Medium Green microscope immobil immobil
e e
McC Milieu Absence
Macconkey Presence Absence
Presenc
e
OF-F Glucose API Lecture vert vert
8.2 API 20 A Gallery: Du milieu
8.2.1 The API 20 A gallery
makes it easy to search 21 characters for the
8.2 API 20 A Galerie:
biochemical identification of anaerobic bacteria.
8.2.1 La galerie API 20 A
8.2.2 Reagents and facilite la recherche de 21 caractères pour
materials needed but not provided l'identification biochimique des bactéries anaérobies.
• Paraffin oil 8.2.2 Réactifs et
• BCP reagent matériel nécessaire mais non fourni
• EHR Reagent • Huile de paraffine
• XYL reagent • Réactif BCP
• Réactif EHR
• Mc Farland Standard
• Réactif XYL
• 3% oxygenated water. • Mc Farland Standard
• 3% d'eau oxygénée.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
box and distribute about 5 ml of distilled
or deionized water without additives. • Apporter le fond et le couvercle d'une boîte
Enter the references of the stumps on d'incubation et distribuer environ 5 ml d'eau distillée
ou désionisée sans additifs.
the lateral tongue of the box
• Entrer les références des souches sur la languette
Remove the API 20 A gallery from its latérale de la boîte
packaging and place in the incubation • Retirer la galerie API 20 A de son emballage et la
box. placer dans la boîte d'incubation.
Using a sterile pipette, inoculate the • À l'aide d'une pipette stérile, ensemencer la galerie
gallery with the medium API 20 A avec le médium API 20 A ensemencé en évitant la
formation de bulles et en inclinant légèrement la
seeded avoiding the formation of
galerie.
bubbles and slightly tilting the gallery. • Pour le tube de remplissage de test GEL et la tasse
For the GEL test fill tube and cup • Pour le test d'indole, remplir uniquement le tube
For the indole test, fill only the tube avec le milieu API et remplir la tasse d'huile de
with API medium and fill the cup with paraffine pour éviter l'évaporation de l'indole.
paraffin oil to prevent evaporation of the • Fermez la boîte d'incubation et incuber 24H ± 2H à
36 ° C ± 2 ° C dans une chambre anaérobie dans un
indole. bocal.
Close the incubation box and incubate
24H ± 2H at 36 ° C ± 2 ° C in an
anaerobic chamber in a jar.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
reaction. Note the results on the results
sheet
Indole test: Add 1 drop of XYL reagent.
• Test d'indole: Ajouter 1 goutte de réactif XYL.
Mix and wait 2 to 3 minutes. Add 1
Mélangez et attendez 2 à 3 minutes. Ajouter 1 goutte
drop of EHR reagent. The reagent must de réactif EHR. Le réactif doit rester sur la surface
remain on Xylene / Paraffin Oil surface Xylène / Huile de paraffine afin de ne pas diluer la
in order not to dilute the staining. A red coloration. Une couleur rouge indique une réaction
color indicates a positive reaction. positive.
CAT test: the catalase production is
highlighted after 30 minutes exposure of
• Test CAT: la production de catalase est mise en
the galleries in the open air. Add 2 drops évidence après 30 minutes d'exposition des galeries
of 3% H202. The appearance of bubbles en plein air. Ajouter 2 gouttes de H202 à 3%.
indicates a positive reaction to be noted L'apparition de bulles indique une réaction positive à
on the results sheet. noter sur la feuille de résultats.
Interpretation:
The identification is obtained from • Interprétation:
the digital profile. L'identification est obtenue à partir du profil
The results sheet reproduces the numérique.
drawing of the API 20 A gallery with its La feuille de résultats reproduit le dessin de la
galerie API 20 A avec ses 20 tests plus la réaction de
20 tests plus the catalase reaction and 3
catalase et 3 tests de morphologie: SPOR pour les
morphology tests: SPOR for spore (+, - spores (+, -), GRAM (+, -) et COCC pour les coccus
), GRAM (+, -) and COCC for coccus (+, -). Sur la feuille de résultats, les tests sont
(+, -). On the results sheet, the tests are séparés par groupes de trois et une valeur de 1, 2 ou
separated in groups of three and a value 4 est indiquée pour chacun. En ajoutant à l'intérieur
of 1, 2 or 4 indicated for each one. By de chaque groupe les valeurs correspondant aux
réactions positives.
adding within each group the values
corresponding to positive reactions.
READING TABLE
TABLEAU DE LECTURE
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
GLU BCP URE Urée 0.64 Urease Yellow Red
MAN D-Glucose 1.96 Acidification 8 -
LAC D-Mannitol 1.96 (GLUcose) orang
D-Lactose 1.96 Acidification e
SAC (Origine (MANnitol) GLU BCP
MAL bovine) 1.86 Acification MAN D-Glucose 1.96 Acidification
Pourp Yellow-
SAL D- 1.96 (LACtose) LAC D-Mannitol 1.96 (GLUcose)
re green
XYL Saccharose 1.64 D-Lactose 1.96 Acidification
yellow
ARA D-maltose 1.64 Acidification SAC (Origine (MANnitol)
Salicine 1.64 (SACcharose) MAL bovine) 1.86 Acification
D-xylose Acidfication Pourp Yellow-
SAL D- 1.96 (LACtose)
L-arabinose (MALtose) re green
XYL Saccharose 1.64
Acidification yellow
ARA D-maltose 1.64 Acidification
(SALicine) Salicine 1.64 (SACcharose)
Acidification D-xylose Acidfication
(XYLose) L-arabinose (MALtose)
Acidification Acidification
(ARAbinose) (SALicine)
GEL Gélatine 0.6 Hydrolyse Pas de Diffusion Acidification
(Bovine (protéase) diffusi of the (XYLose)
origin) (GELatine) on de black Acidification
pigme pigment (ARAbinose)
nt (1) (1) GEL Gélatine 0.6 Hydrolyse Pas de Diffusion
(Bovine (protéase) diffusi of the
origin) (GELatine) on de black
pigme pigment
nt (1) (1)
ESC esculin 0.36
iron citrate 0.11 Hydrolyse (β- yellow Brown
Glucosidase) (2) black (2)
(ESCuline) Under UV 365 nm ESC esculin 0.36
iron citrate 0.11 Hydrolyse (β- jaune Brun noir
Fluores No
Glucosidase) (2) (2)
cence fluorescen
(ESCuline) Sous UV 365 nm
ce
Test active QTE Réaction/ Résults Fluores No
s component (mg/ enzymes cence fluorescen
cup) Negatif Positif ce
GL BCP Test composant QTE Réaction/ Résultats
Y Glycérol 1.82 Acidification actif (mg/ enzymes
cup) Negatif Positif
CEL D- 1.86 (GLYcérol)
MN Cellobiose 1.96 Acidification GL BCP
E D-Mannose 1.96 (CELlbiosel) Y Glycérol 1.82 Acidification
ML D- 2.18 Acification CEL D- 1.86 (GLYcérol)
Z Mélézitose 2.18 (ManNose) purple Yellow / MN Cellobiose 1.96 Acidification
RAF D- 1.96 Acidification Green- E D-Mannose 1.96 (CELlbiosel)
SOR Raffinose 1.96 (MéléZitose) Yellow ML D- 2.18 Acification
RH D-sorbitol Acidfication Z Mélézitose 2.18 (ManNose) violet Jaune /
A D- (RAFfinose) RAF D- 1.96 Acidification Vert-Jaune
TRE rhamnose Acidification SOR Raffinose 1.96 (MéléZitose)
L-Tréhalose (SORbitol) RH D-sorbitol Acidfication
Acidification A D- (RAFfinose)
(RHAmnose) TRE rhamnose Acidification
Acidification L-Tréhalose (SORbitol)
(TREhalose) Acidification
CAT CATalase (RHAmnose)
Acidification
(TREhalose)
CAT CATalase
No Presence
bubbles of bubbles
SPO - Spores Absenc Présence
R e Pas de Presence
bulles de bulles
GR - Coloration Pink Purple SPO - Spores Absenc Présence
AM Gram R e
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CO - Morphologie Bacille Coque
CC
In incubation in round jar, the pigment
diffuses only in the lower part tube. • En incubation en pot rond, le pigment diffuse dans
The brown-black color sometimes le tube de la partie inférieure.
develops only in the open air (take into • La couleur brun-noir se développe à l'air libre. La
account the reading). The black color couleur noire peut être due à la formation de FeS, le
may be due to the formation of FeS, the H2S réagissant avec le citrate de fer. La faible
production est limitée à la fin du tube; une
H2S reacting with the iron citrate. Low
production importante utilise l'utilisation de la
production is limited at the end of the lecture de lumière UV.
tube; a large production requires the use
of UV light reading.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
• Verify the belonging of the strain to the • Vérifier l'appartenance de la souche à la famille
family of micrococcaceae (morphology, des micrococcaceae (morphologie, gram, catlase ...)
gram, catlase ...) as well as its purity ainsi que sa pureté
• Open a bulb of API Staph Medium. • Ouvrez une ampoule d'API Staph Medium.
• Prepare a homogeneous bacterial • Préparer une suspension bactérienne homogène
suspension of opacity equal to 0.5 of Mc d'opacité égale à 0,5 de Mc Farland. Préférez les
Farland. Prefer young cultures from 18- jeunes cultures de 18-24H
24H
8.3.4 Inoculation of the 8.3.4 Inoculation de la galerie:
gallery: • À l'aide d'une pipette stérile, remplissez les tubes
Using a sterile pipette, fill the gallery de la galerie avec le milieu API Staph ensemencé.
tubes with API Staph medium seeded. Remplissez seulement les tubes et non les tasses,
Fill only the tubes and not the cups, sans dépasser le niveau du tube.
without exceeding the level of the tube. • Créer une anoreorose dans les tests ADH. URE en
Create anoreorosis in ADH tests. URE remplissant leurs tasses avec de l'huile de
by filling their cups with oil of paraffine.Fermer la boîte d'incubation
paraffin.Close the incubation box • Incuber à 36 ° C ± 2 ° C pendant 18-24H.
Incubate at 36 ° C ± 2 ° C for 18-24H.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
° C. ml.
• Place on the surface of the agar a drop • Laisser sécher pendant 10-20 min à 36 ° C ± 2 ° C.
of lysostaphin solution at 200 μg / ml. • Déposer à la surface de l'agar une goutte de
• Incubate 18-24 hours at 35-37 ° C. solution de lysostaphine à 200 μg / ml.
Result: Total or subtotal lysis of the • Incuber 18-24 heures à 35-37 ° C.
bacterial culture indicates sensitivity to • Résultat: La lyse totale ou subtotale de la culture
the enzyme. This test is the 21st test of bactérienne indique une sensibilité à l'enzyme. Ce
the gallery, it is considered positive in test est le 21ème test de la galerie, il est considéré
case of resistance to lysostaphin. comme positif en cas de résistance à la lysostaphine.
8.3.6 Identification :
8.3.6 Identification:
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
ZYM A + ZYM B / 10 ZYM A + ZYM B / 10
PAL β-naphtyl Phosphatase min PAL β-naphtyl Phosphatase min
phosphate ALcaline yellow phosphate ALcaline Violet jaune
Purple
VP 1 + VP 2/ 10 mi VP 1 + VP 2/ 10 mi
VP Sodium pyruvate production of Colorless-pale pink VP Sodium pyruvate production acetyl Rose pâle incolore
acetyl methyl Violet- rose methyl carbinol Violet- rose
carbinol (Vosges (Vosges
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• NaCl 0.85% Medium API in 2 ml • Poudre de zinc (réactif Zn)
ampoule • Disque d'oxydase
8.4.2 Operating mode • NaCl 0,85% Medium API en ampoule de 2 ml
8.4.2.1 Preparation of the gallery:
• Gather, bottom and lid of an incubation 8.4.2 Mode de fonctionnement
box. Divide 5 ml of distilled or 8.4.2.1 Préparation de la galerie:
deionized water into the cells to create a • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
humid atmosphere. d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
• Write the strain reference on the side tab déminéralisée dans les cellules pour créer une
of the box. atmosphère humide.
• Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
• Remove the gallery from its packaging.
latéral de la boîte.
Preparation of the inoculum: • Retirez la galerie de son emballage.
• Open a ampoule of API API NaCl • Préparation de l'inoculum:
0.85% Medium 2 ml • Ouvrir une ampoule d'API API NaCl 0,85%
• Using a pipette to collect one to four Medium 2 ml
colonies of identical morphology, • En utilisant une pipette pour collecter une à quatre
colonies de morphologie identique, utiliser de
preferentially use young cultures (18-
préférence des cultures jeunes (18-24H).
24H). • Atteindre une suspension d'opacité égale à 0,5 de
• Achieve a suspension of opacity equal Mc Farland.
to 0.5 of Mc Farland.
Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
box at 29 ± 2 ° C for 24 ± 2 hours. ADH, URE) avec de l'huile de paraffine pour former
• Note: If necessary, consult the un ménisque convexe.
manufacturer's technical data sheet for • Incuber la galerie dans sa boîte d'incubation à 29 ±
2 ° C pendant 24 ± 2 heures.
additional information on the
• Remarque: Si nécessaire, consulter la fiche
preparation of the inoculum and the technique du fabricant pour des informations
inoculation of this gallery. complémentaires sur la préparation de l'inoculum et
l'inoculation de cette galerie.
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
previous reactions (production of NO2 l'une des deux réactions précédentes (production de
or N2). NO2 ou N2).
• TRP test:
- Add a drop of James's reagent. A pink
color diffusing throughout the cup
indicates a positive reaction.
• GLU to PAC test:
- It is test of assimilation of sugars, acid • Test TRP:
- Ajouter une goutte de réactif de James. Une
or other substrate. Inoculated with a
couleur rose diffusant à travers la coupe indique une
minimum medium, bacteria grow only if réaction positive.
they are able to use the corresponding • Test GLU à PAC:
substrate. - C'est un test d'assimilation des sucres, des acides
- Observe the bacterial growth. A ou autres substrats. Inoculées avec un milieu
cloudy cup indicates a positive reaction. minimum, les bactéries ne se développent que si
Intermediate intensity shoots can be elles sont capables d'utiliser le substrat
correspondant.
observed and noted +/- or - / +.
- Observez la croissance bactérienne. Une coupe
- Proceed to the identification of the trouble indique une réaction positive. Les pousses
bacterial strain. However in two cases, a d'intensité intermédiaire peuvent être observées et
new incubation is necessary notées +/- ou - / +.
- Procéder à l'identification de la souche bactérienne.
Cependant dans deux cas, une nouvelle incubation
est nécessaire
- If the profile is not found in the
Analytical Catalog API 20 NE;
- If the following note is given for the
profile obtained: "Identification not
valid before 48 hours of incubation". - Si le profil n'est pas trouvé dans l'API du catalogue
In both cases, pipette NIT 1, NIT 2 and analytique 20 NE;
- Si la note suivante est donnée pour le profil
JAMES reagents by aspiration,
obtenu: "Identification non valide avant 48 heures
immediately cover the NO3 and TRP d'incubation".
tests with paraffin oil to form a convex Dans les deux cas, pipeter les réactifs NIT 1, NIT 2
meniscus. et JAMES par aspiration, couvrir immédiatement les
Incubate again at 29 ± 2 ° C for 24 tests NO3 et TRP avec de l'huile de paraffine pour
hours. Record gallery test results except former un ménisque convexe.
for TRP and GLU NO3 tests that are Incuber à nouveau à 29 ± 2 ° C pendant 24 heures.
Enregistrer les résultats des tests en galerie à
only read at first reading at 24 hours. l'exception des tests TRP et GLU NO3 qui sont
seulement lus en première lecture à 24 heures.
8.4.4.2 Identification :
Using the apiweb identification
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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
software: Manually key in the 7-digit
numeric profile.
The reaction of the oxidase, which 8.4.4.2 Identification:
Utilisation du logiciel d'identification apiweb:
constitutes the 21st test of the gallery, is
saisissez manuellement le profil numérique à 7
assigned a value of 4 when it is positive. chiffres.
La réaction de l'oxydase, qui constitue le 21ème test
de la galerie, est affectée d'une valeur de 4
lorsqu'elle est positive.
Reading board
Tableau de lecture
JAME/ immédiat
JAME/ immédiat
TRP L- formation d’indole Incolore à Rose
TRP L- formation indole Colorless to
tryptopha (TRpytoPhane) vert pâle / jaune
tryptopha (TRpytoPhane) Rose
ne
ne pale green / yellow
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yl-βD- Galactopyranoside) PNP 4- β-galactosidase(Para- Incolore jaune
galactopy G nitrophén NitroPhényl-βD-
ranoside yl-βD- Galactopyranoside)
GLU D-glucose assimilation galactopy
(GLUcose) ranoside
ARA L- assimilation Trouble GLU D-glucose assimilation
arabinose (ARAbinose) Transpar (GLUcose)
MNE D- assimilation ency ARA L- assimilation Transpar Trouble
mannose (ManNosE) arabinose (ARAbinose) ent
MAN D- assimilation MNE D- assimilation
mannitol (MAnNitol) mannose (ManNosE)
NAG N- assimilation (N- MAN D- assimilation
acétylgluc AcétylGlucosamine) mannitol (MAnNitol)
osamine NAG N- assimilation (N-
MAL D- assimilation acétylgluc AcétylGlucosamine)
maltose (MALtose) osamine
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Paraffin oil Norme Mc Farland, point 3
APIWEB Tm Software
Huile de paraffine
Operating mode:
Preparation of the gallery: Logiciel APIWEB Tm
Gather, bottom and lid of an incubation
box. Divide 5 ml of distilled or •Mode de fonctionnement:
deionized water into the cells to create a • Préparation de la galerie:
humid atmosphere.
Write the strain reference on the side tab • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
of the box. d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
déminéralisée dans les cellules pour créer une
Remove the gallery from its packaging.
atmosphère humide.
Place the gallery in the incubation box.
Preparation of the inoculum: • Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
Open a 0.85% NaCl 0.85% API latéral de la boîte.
ampoule (2 ml) and using a pipette or a
• Retirez la galerie de son emballage.
swab, take one or more well-isolated
identical colonies and obtain a • Placez la galerie dans la boîte d'incubation.
suspension of opacity equal to that of
the MacFarland Standard 3 • Préparation de l'inoculum:
(preferentially use 18- to 24-hour-old • Ouvrir une ampoule de 0,85% NaCl 0,85% API
cultures) (2 ml) et, à l'aide d'une pipette ou d'un tampon,
prélever une ou plusieurs colonies identiques bien
isolées et obtenir une suspension d'opacité égale à
celle du MacFarland Standard 3
(préférentiellement 18- aux cultures de 24 heures)
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important; insufficiently or excessively • Incuber 18-24 heures à 36 ° C ± 2 ° C dans une
filled tubes result in false positive or atmosphère aérobie.
negative results.
• Remarque: La qualité du remplissage est très
19.0. Reading and interpretation: importante; des tubes insuffisamment ou trop
19.0. Reading the gallery: remplis conduisent à des résultats faussement
After 18-24 hours of incubation: The list positifs ou négatifs.
of 20 biochemical tests of this gallery is
• 19,0. Lecture et interprétation:
given in the reading table.
Note: The tubes 8 and 9 are bifunctional • 19,0. Lire la galerie:
and allow the realization of two
reactions in the same tube: • Après 18-24 heures d'incubation: La liste des 20
tests biochimiques de cette galerie est donnée dans
Tube 8: βXYL (Test No. 8) / βNAG
le tableau de lecture.
(Test No. 11).
Tube 9: ßGUR (test n ° 9) / ßGAL (test • Note: Les tubes 8 et 9 sont bifonctionnels et
n ° 12). permettent la réalisation de deux réactions dans le
même tube:
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Test Composa Réactions Résultats
nts actifs Négative Positive
Test Composa Réactions Résultats
nts actifs Négatif Positif
1) GLU D-glucose acidificatio
n(GLUcose)
1) GLU D-glucose acidificatio
n(GLUcose)
Purple Yellow
2) GAL D- acidificatio
galactose n(GALactose Gray- Gray 2) GAL D- acidificatio
Violet Jaune
) Violet green galactose n(GALactose
3) SAC D- acidificatio ) Gris- Gris
saccharose n(SACcharos 3) SAC D- acidificatio Violet vert
e) saccharose n(SACcharos
4) TRE D- acidificatio
trehalose n(TREhalose e)
) 4) TRE D- acidificatio
5) RAF D- acidificatio
trehalose n(TREhalose
raffinose n(RAFfinose)
)
5) RAF D- acidificatio
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11) ßNAG 5-bromo- N-Acétyl-ß- Colorless Blue 12) ßGAL 5-bromo- ß- Incolore / Bleu vert
4-chloro-3- Glucosamini / yellow green** (in tube n°9)* 4-chloro-3- GALactosida jaune
( in tube n
indoxyl-N- dase indolyl-N- se
8)*
acétyl-ßD- ßD-
glucosamin galactopyra
ide noside
Ed.No. Date of Revision / Modification Reason for Done by/ Fait par
/No Date de révision modification / Raison
Ed de modification
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1 New SOP New SOP New SOP SOUFIANE TAYEB
1 Nouveau SOP Nouveau SOP SOP No : SOUFIANE TAYEB
SOP/QC/MB/062 is
replaced by current
SOP
No :SOP/QC/MB/149
for harmonisation as
per LNCPP and all
details are mentioned
in the change control
DCR/15/18
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