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PREPARED BY/PRÉPARÉ MICROBIOLOGIST /MICROBIOLOGISTE DATE :

PAR : NAME/NOM:

REVIEWED BY/REVISE PAR : MICROBIOLOGY HEAD /RESPONSIBLE DATE :


MICROBIOLOGIE
NAME/NOM :

REVIEWED BY/REVISE PAR MICROBIOLOGY HEAD RESPONSIBLE / DATE :


RESPONSIBLE MICROBIOLOGIE
NAME/NOM :

APPROVED BY/APPROVER HEAD QUALITY CONTROL /


PAR: DIRECTORE QUALITY CONTROL
NAME/NOM : DATE

APPROVED BY/APPROVER QUALITY ASSURANCE MANAGER/ DATE :


PAR: MANAGER ASSURANCE QUALITE
NAME:

Internal use

SUMMARY/SOMMAIRE
1. IMPLEMENTATION GUIDELINE / OTHER REFERENCES:
LIGNES DIRECTRICES APPLIQUEES / AUTRES REFERENCES:

2. PURPOSE& SCOPE:
BUT ET DOMAINE D’APPLICATION:

3. RESPONSIBILITIES:
RESPONSABILITES:

4. REQUIREMENTS:
EXIGENCES:

5. CHANGE CONTROL :
CONTROLE DE CHANGEMENT :

6. DEFINITIONS / ABBREVIATIONS:
DEFINITIONS / ABREVIATIONS:

7. ANNEXURES :
ANNEXES:

8. PROCEDURE:
PROCEDURE:

9. CHANGES FROM LAST EDITION:


CHANGEMENTS DEPUIS LA DERNIERE EDITION:

1.0 APPLICATION GIDELINE / AUTRES


1.0 IMPLEMENTATION GIDELINE /
RÉFÉRENCES:
OTHER REFERENCE :
1.1 Instructions API Gallery ®. biomérieux
1.1 API Gallery ® instructions. biomerieux

2.0 OBJET ET CHAMP D'APPLICATION:


Le but de cette procédure est de décrire comment les
2.0 PURPOSE & SCOPE : micro-organismes sont identifiés par le système de
galerie API®.
The purpose of this procedure is to describe how
Cette procédure opératoire standard est applicable au
the microorganisms are identified by the API®

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
gallery system. service de microbiologie de l'établissement
injectable.
This Standard Operating Procedure is applicable at
Microbiology Department of injectable facility.

3.0 RESPONSIBILITY: 3.0 RESPONSABILITÉ:

3.1 Microbiologist of Microbiology shall be


3.1 Le microbiologiste de la microbiologie est
responsible for preparation of new or
responsable de la préparation de la nouvelle ou de la
revision of existing SOP.
révision des SOP existantes.
3.2 Head of the Department / Designee of
3.2 Le chef du département / désigné des zones
respective areas & QA shall be
respectives et l'assurance qualité sont responsables
responsible for reviewing the SOPs.
de l'examen des SOP.
3.3 Head QA shall be responsible for
3.3 L'AQ responsable sera responsable de
approval of SOP.
l'approbation des SOP.
3.4 QA is responsible to ensure the
3.4 L'AQ est responsable d'assurer la conformité
compliance of this SOP.

4.0 REQUIREMENTS : 4.0 EXIGENCES:

5.0 CHANGE CONTROL : 5.0 CONTRÔLE DE CHANGEMENT:


Les raisons du changement de la PON doivent être
Reasons for Change in the SOP must be specified
précisées et ce changement doit être autorisé par une
and such change must be authorized through formal
procédure officielle de contrôle des modifications.
change control procedure.

6.0 DÉFINITIONS / ABREVIATIONS:


6.1 DÉFINITIONS:
6.0 DEFINITIONS / ABBREVIATIONS
:
SOP: Une procédure autorisée écrite, qui donne des
6.1 DEFINITIONS :
instructions pour effectuer des opérations.

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
6.1.1 SOP: A written authorized procedure,
which gives instructions for performing
operations.

6.2 ABBREVIATIONS :
6.2 ABRÉVIATIONS:
6.2.1 QC: Quality Control
6.2.1 QC: Contrôle de qualité
6.2.2 QA: Quality Assurance. 6.2.2 AQ: Assurance qualité.

6.2.3 SOP: Standard Operating Procedure. 6.2.3 SOP: Procédure opératoire standard.
6.2.4 FRM: Format
6.2.4 FRM: Format
6.2.5 GEN: Genres
6.2.5 GEN: Genera 6.2.6 API: INDICE DE PROFIL ANALYTIQUE
6.2.6 API: ANALYTICAL PROFILE INDEX

7.0 ANNEXURES :
7.0 ANNEXES:
NA
NA
8.0 PROCEDURE 8.0 PROCÉDURE
8.1 API 20 E® GALLERY:
8.1.1 The API 20 E® Gallery is a 8.1 GALERIE API 20 E®:
standardized system for the 8.1.1 L'API 20 E® Gallery est un système
identification of Enterobacteriaceae and standardisé pour l'identification des
other non-fastidious gram-negative Enterobacteriaceae et autres bacilles Gram négatif
bacilli. This system includes 21 non fastidieux. Ce système comprend 21 tests
miniaturized biochemical tests as well biochimiques miniaturisés ainsi qu'une base de
as a database. The list of bacteria that données. La liste des bactéries pouvant être
can be identified is shown in the table at identifiées est indiquée dans le tableau à la fin de la
the end of the leaflet. notice.
8.1.2 The API 20 E gallery comprises 20 8.1.2 La galerie API 20 E comprend 20 microtubes
microtubes containing dehydrated contenant des substrats déshydratés. Ces microtubes
substrates. These microtubes are sont inoculés avec une suspension bactérienne. Les
inoculated with a bacterial suspension. réactions produites pendant le temps d'incubation
The reactions produced during the entraînent des changements de couleur ou sont
incubation time result in color turns or révélées par l'ajout de réactifs. La lecture de ces

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
are revealed by the addition of reagents. réactions est l'interprétation des résultats et
The reading of these reactions is the l'identification est faite selon le logiciel apiweb.
interpretation of the results and the
identification is done according to the
apiweb software.

8.1.3 Presentation of the


box. The box contains 25 tests:
 25 API Gallery 20 E 8.1.3 Présentation de la boîte. La boîte contient
 25 incubation boxes 25 tests:
 25 results sheets
 1 closing bar • 25 API Galerie 20 E
 1 record • 25 boîtes d'incubation

8.1.4 Storage: • 25 feuilles de résultats

The galleries are maintained in aluminum • 1 barre de fermeture

pouches with desiccant sachet. After • 1 enregistrement

opening, close the aluminum pouch with


the closure strip is stored in a refrigerator 8.1.4 Stockage:

between 2 and 8° C. Once opened the Les galeries sont maintenues dans des sachets en

gallery can be kept for 8 months at a aluminium avec un sachet déshydratant. Après

temperature between 2 and 8 ° C. ouverture, fermer la poche d'aluminium avec la


bande de fermeture est conservée au réfrigérateur
8.1.5 Sample preparation: entre 2 et 8 ° C. Une fois ouverte, la galerie peut être
The API 20 E gallery should not be used conservée 8 mois à une température comprise entre
directly from direct sampling. The 2 et 8 ° C.
microorganisms to be identified must
first be isolated on culture media 8.1.5 Préparation de l'échantillon
adapted to enterobacteriaceae or gram- La galerie API 20 E ne doit pas être utilisée
negative bacilli according to the usual directement à partir d'un échantillonnage direct. Les
techniques for isolating micro-organismes à identifier doivent d'abord être

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
microorganisms. isolés sur des milieux de culture adaptés aux
entérobactéries ou bacilles gram-négatifs selon les
techniques usuelles d'isolement des
microorganismes.
8.1.6 Preparation of the
gallery:
 Gather, bottom and lid of an incubation
box. Divide 5 ml of distilled or
deionized water into the cells to create a 8.1.6 Préparation de la galerie:
humid atmosphere. • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
 Write the strain reference on the side tab
d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
of the box.
 Remove the gallery from its packaging. déminéralisée dans les cellules pour créer une
 Place the gallery in the incubation box atmosphère humide.
• Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
8.1.7 Preparation of the
latéral de la boîte.
inoculum:
 Open a vial of NaCl 0.85% Medium • Retirez la galerie de son emballage.
(5ml) or API Suspension Medium • Placer la galerie dans la boîte d'incubation
(5ml).
 Using a pipette, collect a well isolated
colony on agar medium. Preferentially 8.1.7 Préparation de l'inoculum
use young cultures (18-24H). • Ouvrir un flacon de NaCl à 0,85% de milieu (5 ml)
 Perform a bacterial suspension by ou de milieu de suspension API (5 ml).
thoroughly homogenizing the bacteria.
• À l'aide d'une pipette, prélever une colonie bien

8.1.8 Inoculation of the isolée sur un milieu gélosé. Préférentiellement


gallery: utiliser de jeunes cultures (18-24H).
 Introduce the bacterial suspension in the • Effectuer une suspension bactérienne en
tubes of the gallery, using the same
pipette to avoid the formation of homogénéisant soigneusement les bactéries.
bubbles at the bottom of the tubes, put
the tip of the pipette on the tip of the 8.1.8 Inoculation de la galerie:
cup by slightly tilting the box. forward
• Introduire la suspension bactérienne dans les tubes
incubation:
de la galerie, en utilisant la même pipette pour éviter
la formation de bulles au fond des tubes, placer
l'extrémité de la pipette sur l'extrémité de la cupule

 For CIT, VP and GEL tests fill tube and en inclinant légèrement la boîte. incubation en

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cup. avant:
 For other tests, fill only the tubes. • Pour les tests CIT, VP et GEL, remplissez le tube
 For ADH, LDC, ODC, H2S, URE tests
et la coupelle.
create anaerobiosis by filling their wells
with paraffin oil. • Pour les autres tests, ne remplissez que les tubes.
 Close the incubation box and incubate at • Pour les tests ADH, LDC, ODC, H2S, URE créent
36 ° C ± 2 ° C for 18-24 hours. une anaérobiose en remplissant leurs puits d'huile de
paraffine.
8.1.9 Reading and • Fermez la boîte d'incubation et incuber à 36 ° C ±
interpretation: 2 ° C pendant 18-24 heures.
8.1.9.1 Reading the gallery:
 After incubation, the reading of the
gallery must be done by referring to the 8.1.9 Lecture et interprétation:
reading board. 8.1.9.1 Lecture de la galerie:
If three or more tests are positive, record
• Après l'incubation, la lecture de la galerie doit se
on the results sheet all spontaneous
reactions and then reveal the tests faire en se référant au tableau de lecture.
requiring the addition of reagents: Si trois tests ou plus sont positifs, notez sur la feuille
 TDA test: Add a drop of TDA reagent. de résultats toutes les réactions spontanées puis
A brownish-red color indicates a
révélez les tests nécessitant l'ajout de réactifs:
positive reaction.
 IND test: add a drop of James reagent, a • Test TDA: Ajouter une goutte de réactif TDA. Une
diffuse pink color throughout the cup couleur brun-rouge indique une réaction positive.
indicates a positive reaction
• Test IND: ajouter une goutte de réactif de James,
 VP test: Add a drop of VP1 and VP2
reagents. Wait at least ten minutes, a une couleur rose diffuse dans toute la tasse indique
pink or red color indicates a positive une réaction positive
reaction. A weak coloration occurring • Test VP: Ajouter une goutte de réactifs VP1 et
after ten minutes should be considered
VP2. Attendez au moins dix minutes, une couleur
negative.
rose ou rouge indique une réaction positive. Une
coloration faible apparaissant après dix minutes
devrait être considérée comme négative.
Nota Bene :
The indole production test must be
performed last because this reaction
releases gases that may affect the
interpretation of other tests in the
gallery. Do not replace the incubation
lid after adding the reagent. Nota Bene:
 If the number of positive tests before

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reagent addition (including the GLU Le test de production d'indole doit être effectué en
test) is less than three: dernier car cette réaction libère des gaz qui peuvent
 Re incubate the gallery 24 more hours
affecter l'interprétation d'autres tests dans la galerie.
without adding reagents
 Reveal tests requiring the addition of Ne remplacez pas le couvercle d'incubation après
reagents. l'ajout du réactif.
 To complete the identification, it may be • Si le nombre de tests positifs avant l'ajout du
useful to carry out additional tests
réactif (y compris le test GLU) est inférieur à trois:

8.1.10 Interpretation: • Incubez la galerie 24 heures supplémentaires sans


The identification is obtained from the ajouter de réactifs
digital profile • Révéler des tests nécessitant l'ajout de réactifs.
 Determination of the digital profile:
• Pour compléter l'identification, il peut être utile
On the results sheet, the tests are
separated into groups of three and a d'effectuer des tests supplémentaires
value of 1, 2 or 4 is indicated for each.
 The API 20 E gallery comprising 20 8.1.10 Interprétation:
tests by adding within each group the L'identification est obtenue à partir du profil
values corresponding to positive numérique
• Détermination du profil numérique:
reactions, 7 digits are obtained; the
Sur la feuille de résultats, les tests sont séparés en
reaction of the oxidase, which groupes de trois et une valeur de 1, 2 ou 4 est
constitutes the 21 st test, is assigned a indiquée pour chacun.
value of 4 when it is positive • La galerie API 20 E comprenant 20 tests en
ajoutant dans chaque groupe les valeurs
correspondant aux réactions positives, 7 chiffres
sont obtenus; la réaction de l'oxydase, qui constitue
READING TABLE
le 21 ème test, est affectée d'une valeur de 4
lorsqu'elle est positive
Tests Active QTE Reaction / Results
components (mg/ Enzymes Positiv Positive
cup) e Negative
Negati
ve
TABLEAU DE LECTURE
ONP 2- 0.223 Β- Colorle Colorles
G nitrophenyl- Galactosidade ss s Yellow Test Composant QTE Reaction / Resultats
βD- (Ortho Yellow (1) actif (mg/ Enzymes Negati Positive
galactopyran Nitrophenyl (1) cup) ve/pos /negativ
oside βD- tive e
Galacropyrano ONP 2- 0.223 Β- Jaune Jaune
sidade G nitrophenyl- Galactosidade incolor incolore
ADH L-arginine 1.9 Arginine Yellow Yellow βD- (Ortho e (1) (1)
Dihydrolase Orange Orange galactopyran Nitrophenyl
Red (2) Red (2) oside βD-
LDC L-lysine 1.9 L-Lysine Yellow Yellow Galacropyrano
Decarboxylase Red Red sidade
Orange Orange ADH L-arginine 1.9 Arginine Jaune Jaune
(2) (2) Dihydrolase Orange Orange
ODC L-ornithine 1.9 Ornithine Yellow Yellow Rouge Rouge
Decarboxylase Red Red (2) (2)
Orange Orange LDC L-lysine 1.9 L-Lysine Jaune Jaune
(2) (2) Decarboxylase Orange Orange

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
CIT Trisodium 0.756 Using citrate Light Light Rouge Rouge
Citrate Green Green / (2) (2)
/ Yellow ODC L-ornithine 1.9 Ornithine Jaune Jaune
Yellow Blue Decarboxylase Rouge Rouge
Blue Green / Orange Orange
Green Blue (3) (2) (2)
/ Blue CIT Trisodium 0.756 Using citrate Vert Vert
(3) Citrate clair / clair /
H2S Sodium 0.075 H2S Colorle Colorles Jaune Jaune
Thiosulfate production ss s Bleu Bleu
Grayish Grayish Vert / Vert /
Black Black Bleu Bleu (3)
deposit deposit (3)
/ fine / fine H2S Sodium 0.075 production du Dépôt Dépôt
edging edging Thiosulfate H2S noir noir
ERUs Urea 0.76 urease Yellow Yellow grisâtr grisâtre
Red Red e incolore
Orange Orange incolor /
(2) (2) e/ bordure
TDA L-Tryptophan 0.38 Tryptophan Immediate ADD bordur fine
deaminase Yellow Yellow e fine
reddish reddish ERUs Urea 0.76 urease Jaune Jaune
brown brown Rouge Rouge
IND L-Tryptophan 0.19 Indole James Immediate Orange Orange
production Color Color (2) (2)
less pale less TDA L-Tryptophan 0.38 Tryptophan ADD immédiat
green / pale deaminase Brun Brun
yellow green / rougeât rougeât
yellow re re jaune
VP Sodium 1.9 Acetoin VP1 + VP2 / 10 mi jaune
pyruvate production Color Color IND L-Tryptophan 0.19 production du James Immédiat
(Voges less / less / indole Couleur Couleu
Proskauer) Light Light moins r moins
Pink Pink vert vert
Pink / Pink / pâle / pâle /
Red (5) Red (5) jaune jaune
VP Sodium 1.9 production VP1 + VP2 / 10 mi
pyruvate d’acetoin(Voge Couleur Couleu
s Proskauer) moins / r moins
Rose / Rose
clair clair
Tests Active QTE Reaction / Results Rose / Rose /
components (mg/ enzymes Positiv Positive Rouge Rouge
cup) e Negative (5) (5)
Negati
ve
GEL Gelatin 0.6 Gelatinase Non Non
(bovine (GELatin) diffusi diffusion
origin) on Diffusio
Test Composants QTE Reaction / Resultats
Diffusi n of
actifs (mg/ enzymes Positiv Positive
on of black
cup) e Negative
black pigments
pigme Negati
nts ve
GLU D-Glucose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- GEL Gelatin 0.6 Gelatinase Diffusi Diffusio
E oxidation Blue Blue (bovine (GELatin) on n /sans
GLUcose (4) green green origin) /sans diffusion
Yellow Yellow / diffusi de
/ yellow on de pigments
yellow gray pigme noirs
gray nts
MA D-Mannitol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- noirs
N oxidation Blue Blue GLU D-Glucose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
MANnitol (4) green green E oxidation Bleu Bleu
Yellow Yellow GLUcose (4) Vert Vert
INO inositol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- Jaune / Jaune /
oxidation Blue Blue Jaune Jaune
INOsitol (4) green green Gris Gris.
Yellow Yellow MA D-Mannitol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
ORS D-Sortbitol 1.9 Fermentation / Blue- Blue- N oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue MANnitol (4) vert Jaune
SORbitol (4) green green Jaune
Yellow Yellow INO inositol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
RHA L-rhamnose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue INOsitol (4) vert Jaune
RHAmnose green green Jaune
(4) Yellow Yellow ORS D-Sortbitol 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
BAG D-Sucrose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue SORbitol (4) vert Jaune
SACcharose green green Jaune
(4) Yellow Yellow RHA L-rhamnose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
MEL D-melibiose 1.9 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
oxidation Blue Blue RHAmnose vert Jaune
MELbiose (4) green green (4) Jaune
Yellow Yellow BAG D-Sucrose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
AM amygdalin 0.57 Fermentation / Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
Y oxidation Blue Blue SACcharose vert Jaune
Amygdalin green green (4) Jaune
(4) Yellow Yellow MEL D-melibiose 1.9 Fermentation / Bleu- Bleu-
ARA L-arabinose 1.9 Fermentation Blue- Blue- oxidation Bleu Bleu vert
/ oxidation Blue Blue MELbiose (4) vert Jaune
ARAbinose4) green green Jaune
Yellow Yellow AM amygdalin 0.57 Fermentation / Bleu- Bleu-
OX (see Cytochrome Color Color Y oxidation Bleu Bleu vert
instructions OXydase less / less / Amygdalin vert Jaune
for the Light Light (4) Jaune
oxidase test) Pink Pink Pink ARA L-arabinose 1.9 Fermentation Bleu- Bleu-
Pink / / Red (5) / oxidation Bleu Bleu vert
Red (5) ARAbinose4) vert Jaune
Jaune
 A very light yellow color is also positive OX (voir Cytochrome Couleu Couleur
 An orange color appears after 36-48H instructions
pour
OXydase r
moins
moins /
Rose
incubation should be considered oxidase test) / Rose clair
clair Rose /
negative Rose / Rouge
 Reading in the cup (aerobic zone) Rouge
(5)
(5)

 The fermentation begins in the lower


part of the tube, the oxidation in the cup
 5) A slight yellow color appearing after
10 minutes should be read negative. • Une couleur jaune très claire est également
positive
Additional tests • Une couleur orange apparaît après
l'incubation 36-48H devrait être considéré comme
Tests Active QTE Reaction / Results négatif
component (mg enzymes negati negative • Lecture dans la tasse (zone aérobie)
s /cup ve Positive
) Positiv
• La fermentation commence dans la partie
e inférieure du tube, l'oxydation dans la tasse
Glu Potassium 0.07 NO2 NIT1-NIT2 2-5min • 5) Une légère couleur jaune apparaissant
nitrate nitrate 6 production Yellow Yellow
reducti Stage N2 Red Red
après 10 minutes devrait être lue en négatif.
on tube reduction In / 5 min
Orange Orange Tests supplémentaires
red red
Test Composant QTE Reaction Resultats
yellow yellow s actifs (mg enzymes negative negative
MOB API M Mobile /cup Positive Positive
medium or Mobil )
microscope e motionless
Glu Potassium 0.07 Production NIT1-NIT2 2-5min
nitrate nitrate 6 de NO2 Jaune Jaune
motio reducti Réduction de Rouge Rouge
nless
on tube l'étape N2 pendant / 5 min

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
McC Macconkey' Absen Absence Orange Orange
s middle ce rouge rouge
Prese Presence jaune jaune
nce MOB API M
OF-F Glucose API Reading Green milieu ou Mobile Mobile
of Medium Green microscope immobil immobil
e e
McC Milieu Absence
Macconkey Presence Absence

Presenc
e
OF-F Glucose API Lecture vert vert
8.2 API 20 A Gallery: Du milieu
8.2.1 The API 20 A gallery
makes it easy to search 21 characters for the
8.2 API 20 A Galerie:
biochemical identification of anaerobic bacteria.
8.2.1 La galerie API 20 A
8.2.2 Reagents and facilite la recherche de 21 caractères pour
materials needed but not provided l'identification biochimique des bactéries anaérobies.
• Paraffin oil 8.2.2 Réactifs et
• BCP reagent matériel nécessaire mais non fourni
• EHR Reagent • Huile de paraffine
• XYL reagent • Réactif BCP
• Réactif EHR
• Mc Farland Standard
• Réactif XYL
• 3% oxygenated water. • Mc Farland Standard
• 3% d'eau oxygénée.

8.2.3 Operating mode:


8.2.3 Mode de fonctionnement:
• Open the API 20 Medium ampoule
• Ouvrez l'ampoule API 20 Medium
Using a swab, take all the colonies En utilisant un tampon, prendre toutes les colonies
obtained on anaerobic blood agar plate. obtenues sur une plaque de gélose au sang
Use preferentially (18-24H). Check the anaérobie. Utilisez préférentiellement (18-24H).
purity of the strain, make a subculture Vérifiez la pureté de la souche, faites une sous-
from a well isolated colony. culture à partir d'une colonie bien isolée.
• Hold the ampoule vertically and • Tenir l'ampoule à la verticale et émulsionner les
germes en frottant l'écouvillon contre les parois de
emulsify the germs by rubbing the swab
l'ampoule. L'opacité finale doit être supérieure ou
against the walls of the ampoule. The égale à celle de la norme 3 de Mc Farland. Afin de
final opacity must be greater than or maintenir une certaine anaérobiose, il est nécessaire
equal to that of Mc Farland's Standard 3. d'éviter l'introduction d'air pendant
In order to maintain a certain l'homogénéisation du milieu.
anaerobiosis it is necessary to avoid the
introduction of air during the
homogenization of the medium.
8.2.4 Preparation of the
gallery: 8.2.4 Préparation de la galerie:
 Bring bottom and lid of an incubation

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
box and distribute about 5 ml of distilled
or deionized water without additives. • Apporter le fond et le couvercle d'une boîte
 Enter the references of the stumps on d'incubation et distribuer environ 5 ml d'eau distillée
ou désionisée sans additifs.
the lateral tongue of the box
• Entrer les références des souches sur la languette
 Remove the API 20 A gallery from its latérale de la boîte
packaging and place in the incubation • Retirer la galerie API 20 A de son emballage et la
box. placer dans la boîte d'incubation.
 Using a sterile pipette, inoculate the • À l'aide d'une pipette stérile, ensemencer la galerie
gallery with the medium API 20 A avec le médium API 20 A ensemencé en évitant la
formation de bulles et en inclinant légèrement la
seeded avoiding the formation of
galerie.
bubbles and slightly tilting the gallery. • Pour le tube de remplissage de test GEL et la tasse
 For the GEL test fill tube and cup • Pour le test d'indole, remplir uniquement le tube
 For the indole test, fill only the tube avec le milieu API et remplir la tasse d'huile de
with API medium and fill the cup with paraffine pour éviter l'évaporation de l'indole.
paraffin oil to prevent evaporation of the • Fermez la boîte d'incubation et incuber 24H ± 2H à
36 ° C ± 2 ° C dans une chambre anaérobie dans un
indole. bocal.
 Close the incubation box and incubate
24H ± 2H at 36 ° C ± 2 ° C in an
anaerobic chamber in a jar.

8.2.5 Reading and


interpretation:
 Reading the gallery:
8.2.5 Lecture et interprétation:
 Many anaerobic bacteria give a clear
• Lire la galerie:
and easy-to-interpret response in 24 • De nombreuses bactéries anaérobies donnent une
hours, but some strains grow slowly and réponse claire et facile à interpréter en 24 heures,
are identifiable only after 48 hours. mais certaines souches se développent lentement et
 After incubation, the reading of the ne sont identifiables qu'après 48 heures.
gallery must be done by referring to the • Après l'incubation, la lecture de la galerie doit se
reading board. faire en se référant au tableau de lecture.
• Enregistrer sur la feuille de résultats toutes les
 Record on the results sheet all réactions spontanées (ne nécessitant pas l'ajout de
spontaneous reactions (not requiring the réactifs)
addition of reagents) • Révéler des tests nécessitant l'ajout de réactifs
 Reveal tests requiring the addition of
reagents
 The BCP of the reaction medium can be
decolorized by reduction. In this case, • Le BCP du milieu réactionnel peut être décoloré
reveal the reaction by adding 1 drop of par réduction. Dans ce cas, révélez la réaction en
BCP reagent to all microtubes ajoutant 1 goutte de réactif BCP à tous les
containing carbohydrates. A yellow or microtubes contenant des hydrates de carbone. Une
yellow-green color indicates a positive couleur jaune ou jaune-vert indique une réaction
positive. Notez les résultats sur la feuille de résultats

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
reaction. Note the results on the results
sheet
 Indole test: Add 1 drop of XYL reagent.
• Test d'indole: Ajouter 1 goutte de réactif XYL.
Mix and wait 2 to 3 minutes. Add 1
Mélangez et attendez 2 à 3 minutes. Ajouter 1 goutte
drop of EHR reagent. The reagent must de réactif EHR. Le réactif doit rester sur la surface
remain on Xylene / Paraffin Oil surface Xylène / Huile de paraffine afin de ne pas diluer la
in order not to dilute the staining. A red coloration. Une couleur rouge indique une réaction
color indicates a positive reaction. positive.
 CAT test: the catalase production is
highlighted after 30 minutes exposure of
• Test CAT: la production de catalase est mise en
the galleries in the open air. Add 2 drops évidence après 30 minutes d'exposition des galeries
of 3% H202. The appearance of bubbles en plein air. Ajouter 2 gouttes de H202 à 3%.
indicates a positive reaction to be noted L'apparition de bulles indique une réaction positive à
on the results sheet. noter sur la feuille de résultats.

 Interpretation:
The identification is obtained from • Interprétation:
the digital profile. L'identification est obtenue à partir du profil
The results sheet reproduces the numérique.
drawing of the API 20 A gallery with its La feuille de résultats reproduit le dessin de la
galerie API 20 A avec ses 20 tests plus la réaction de
20 tests plus the catalase reaction and 3
catalase et 3 tests de morphologie: SPOR pour les
morphology tests: SPOR for spore (+, - spores (+, -), GRAM (+, -) et COCC pour les coccus
), GRAM (+, -) and COCC for coccus (+, -). Sur la feuille de résultats, les tests sont
(+, -). On the results sheet, the tests are séparés par groupes de trois et une valeur de 1, 2 ou
separated in groups of three and a value 4 est indiquée pour chacun. En ajoutant à l'intérieur
of 1, 2 or 4 indicated for each one. By de chaque groupe les valeurs correspondant aux
réactions positives.
adding within each group the values
corresponding to positive reactions.

READING TABLE
TABLEAU DE LECTURE

Test ACTIVE QTE Réaction/ Résultats


s COMPONEN (mg/ enzymes Negati Positif
T cup) f
IND L- 0.98 Formation XYL-mix/ 2-3 min+
Tryptophan d’INDole EHR /5 min Test ACTIVE QTE Réaction/ Résultats
e Rouge s COMPONEN (mg/ enzymes Negati Positif
URE Urée 0.64 Urease Yellow Red T cup) f
8 -
orang IND L- 0.98 Formation XYL-mix/ 2-3 min+
e Tryptophan d’INDole EHR /5 min
e Rouge

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
GLU BCP URE Urée 0.64 Urease Yellow Red
MAN D-Glucose 1.96 Acidification 8 -
LAC D-Mannitol 1.96 (GLUcose) orang
D-Lactose 1.96 Acidification e
SAC (Origine (MANnitol) GLU BCP
MAL bovine) 1.86 Acification MAN D-Glucose 1.96 Acidification
Pourp Yellow-
SAL D- 1.96 (LACtose) LAC D-Mannitol 1.96 (GLUcose)
re green
XYL Saccharose 1.64 D-Lactose 1.96 Acidification
yellow
ARA D-maltose 1.64 Acidification SAC (Origine (MANnitol)
Salicine 1.64 (SACcharose) MAL bovine) 1.86 Acification
D-xylose Acidfication Pourp Yellow-
SAL D- 1.96 (LACtose)
L-arabinose (MALtose) re green
XYL Saccharose 1.64
Acidification yellow
ARA D-maltose 1.64 Acidification
(SALicine) Salicine 1.64 (SACcharose)
Acidification D-xylose Acidfication
(XYLose) L-arabinose (MALtose)
Acidification Acidification
(ARAbinose) (SALicine)
GEL Gélatine 0.6 Hydrolyse Pas de Diffusion Acidification
(Bovine (protéase) diffusi of the (XYLose)
origin) (GELatine) on de black Acidification
pigme pigment (ARAbinose)
nt (1) (1) GEL Gélatine 0.6 Hydrolyse Pas de Diffusion
(Bovine (protéase) diffusi of the
origin) (GELatine) on de black
pigme pigment
nt (1) (1)
ESC esculin 0.36
iron citrate 0.11 Hydrolyse (β- yellow Brown
Glucosidase) (2) black (2)
(ESCuline) Under UV 365 nm ESC esculin 0.36
iron citrate 0.11 Hydrolyse (β- jaune Brun noir
Fluores No
Glucosidase) (2) (2)
cence fluorescen
(ESCuline) Sous UV 365 nm
ce
Test active QTE Réaction/ Résults Fluores No
s component (mg/ enzymes cence fluorescen
cup) Negatif Positif ce
GL BCP Test composant QTE Réaction/ Résultats
Y Glycérol 1.82 Acidification actif (mg/ enzymes
cup) Negatif Positif
CEL D- 1.86 (GLYcérol)
MN Cellobiose 1.96 Acidification GL BCP
E D-Mannose 1.96 (CELlbiosel) Y Glycérol 1.82 Acidification
ML D- 2.18 Acification CEL D- 1.86 (GLYcérol)
Z Mélézitose 2.18 (ManNose) purple Yellow / MN Cellobiose 1.96 Acidification
RAF D- 1.96 Acidification Green- E D-Mannose 1.96 (CELlbiosel)
SOR Raffinose 1.96 (MéléZitose) Yellow ML D- 2.18 Acification
RH D-sorbitol Acidfication Z Mélézitose 2.18 (ManNose) violet Jaune /
A D- (RAFfinose) RAF D- 1.96 Acidification Vert-Jaune
TRE rhamnose Acidification SOR Raffinose 1.96 (MéléZitose)
L-Tréhalose (SORbitol) RH D-sorbitol Acidfication
Acidification A D- (RAFfinose)
(RHAmnose) TRE rhamnose Acidification
Acidification L-Tréhalose (SORbitol)
(TREhalose) Acidification
CAT CATalase (RHAmnose)
Acidification
(TREhalose)
CAT CATalase
No Presence
bubbles of bubbles
SPO - Spores Absenc Présence
R e Pas de Presence
bulles de bulles
GR - Coloration Pink Purple SPO - Spores Absenc Présence
AM Gram R e

CO - Morphologie Bacille Coque GR - Coloration de Rose Violet


CC AM Gram

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
CO - Morphologie Bacille Coque
CC
 In incubation in round jar, the pigment
diffuses only in the lower part tube. • En incubation en pot rond, le pigment diffuse dans
 The brown-black color sometimes le tube de la partie inférieure.
develops only in the open air (take into • La couleur brun-noir se développe à l'air libre. La
account the reading). The black color couleur noire peut être due à la formation de FeS, le
may be due to the formation of FeS, the H2S réagissant avec le citrate de fer. La faible
production est limitée à la fin du tube; une
H2S reacting with the iron citrate. Low
production importante utilise l'utilisation de la
production is limited at the end of the lecture de lumière UV.
tube; a large production requires the use
of UV light reading.

8.3 API Staph Gallery 8.3 Galerie API Staph


8.3.1 API Staph is a 8.3.1 API Staph est un système normalisé
standardized system for the d'identification des genres Staphylococcus,
identification of Staphylococcus, Micrococcus et Kocuria, y compris les tests
Micrococcus and Kocuria genera, d'identification biochimique miniaturisés.
including miniaturized
biochemical identification tests.
8.3.2 Reagents required not 8.3.2 Réactifs requis non fournis.
provided. •Huile de paraffine
• Paraffin oil • VP1 + VP2
• VP1 + VP2 • NIT1 + NIT2
• NIT1 + NIT2 • ZYM A
• ZYM A • ZYMB
• ZYMB • Mc Farland standard
• Mc Farland standard • Logiciel d'authentification Apiweb TM
• Apiweb TM authentication software

8.3.3 Operating mode 8.3.3 Mode de fonctionnement


8.3.3.1 Preparation of the gallery: 8.3.3.1 Préparation de la galerie:
• Gather, bottom and lid of an incubation • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
box. Divide 5 ml of distilled or d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
deionized water into the cells to create a déminéralisée dans les cellules pour créer une
humid atmosphere. atmosphère humide.
• Write the strain reference on the side tab • Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
of the box. latéral de la boîte.
• Remove the gallery from its packaging. • Retirez la galerie de son emballage.
• Place the gallery in the incubation box. • Placez la galerie dans la boîte d'incubation.
8.3.3.2 Preparation of the inoculum: 8.3.3.2 Préparation de l'inoculum
• Perform preculture on columbia agarose • Effectuer la préculture sur columbia agarose sur
on blood or agar P 18-24 H at 36 ° C ± 2 sang ou gélose P 18-24 H à 36 ° C ± 2 ° C
°C

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
• Verify the belonging of the strain to the • Vérifier l'appartenance de la souche à la famille
family of micrococcaceae (morphology, des micrococcaceae (morphologie, gram, catlase ...)
gram, catlase ...) as well as its purity ainsi que sa pureté
• Open a bulb of API Staph Medium. • Ouvrez une ampoule d'API Staph Medium.
• Prepare a homogeneous bacterial • Préparer une suspension bactérienne homogène
suspension of opacity equal to 0.5 of Mc d'opacité égale à 0,5 de Mc Farland. Préférez les
Farland. Prefer young cultures from 18- jeunes cultures de 18-24H
24H
8.3.4 Inoculation of the 8.3.4 Inoculation de la galerie:
gallery: • À l'aide d'une pipette stérile, remplissez les tubes
 Using a sterile pipette, fill the gallery de la galerie avec le milieu API Staph ensemencé.
tubes with API Staph medium seeded. Remplissez seulement les tubes et non les tasses,
Fill only the tubes and not the cups, sans dépasser le niveau du tube.
without exceeding the level of the tube. • Créer une anoreorose dans les tests ADH. URE en
 Create anoreorosis in ADH tests. URE remplissant leurs tasses avec de l'huile de
by filling their cups with oil of paraffine.Fermer la boîte d'incubation
paraffin.Close the incubation box • Incuber à 36 ° C ± 2 ° C pendant 18-24H.
 Incubate at 36 ° C ± 2 ° C for 18-24H.

8.3.5 Reading and


interpretation:
8.3.5.1 Reading the gallery:
• After incubation, read the reactions
according to the reading table by adding 8.3.5 Lecture et interprétation:
one drop of each of the following 8.3.5.1 Lecture de la galerie:
reagents: • Après incubation, lire les réactions selon le tableau
• VP1 and VP2 test: Wait ten minutes, a de lecture en ajoutant une goutte de chacun des
deep pink or purple color indicates a réactifs suivants:
positive reaction. A pale pink or light • Test VP1 et VP2: Attendez dix minutes, une
color obtained after ten minutes should couleur rose ou violet foncé indique une réaction
be considered negative. positive. Une couleur rose pâle ou claire obtenue
• Test Nit1 and Nit 2: wait ten minutes, a après dix minutes devrait être considérée comme
red color indicates a positive reaction. négative.
• PAL test: ZYM A and ZYM B. Wait ten • Test Nit1 et Nit 2: attendez dix minutes, une
minutes, a purple color indicates a couleur rouge indique une réaction positive.
positive reaction • Test PAL: ZYM A et ZYM B. Attendez dix
• Record the results on the results sheet. minutes, une couleur pourpre indique une réaction
• Lysostaphine resistance test positive
• Determine lysostaphin resistance on P • Notez les résultats sur la feuille de résultats.
agar medium according to the following • Test de résistance à la lysostaphine
procedure or as recommended by the • Déterminer la résistance à la lysostaphine sur le
manufacturer. milieu P agar selon la procédure suivante ou tel que
• For this purpose, flood the surface of recommandé par le fabricant.
Agar P agar with a bacterial suspension
of approximately 10 7 germs / ml. • A cette fin, inonder la surface de l'agar P agar avec
• Allow to dry for 10-20 min at 36 ° C ± 2 une suspension bactérienne d'environ 10 7 germes /

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
° C. ml.
• Place on the surface of the agar a drop • Laisser sécher pendant 10-20 min à 36 ° C ± 2 ° C.
of lysostaphin solution at 200 μg / ml. • Déposer à la surface de l'agar une goutte de
• Incubate 18-24 hours at 35-37 ° C. solution de lysostaphine à 200 μg / ml.
 Result: Total or subtotal lysis of the • Incuber 18-24 heures à 35-37 ° C.
bacterial culture indicates sensitivity to • Résultat: La lyse totale ou subtotale de la culture
the enzyme. This test is the 21st test of bactérienne indique une sensibilité à l'enzyme. Ce
the gallery, it is considered positive in test est le 21ème test de la galerie, il est considéré
case of resistance to lysostaphin. comme positif en cas de résistance à la lysostaphine.

8.3.6 Identification :
8.3.6 Identification:

Using the APIWEB TM identification Utilisation du logiciel d'identification APIWEB TM:


Entrez le profil numérique à 7 chiffres
software: Tableau de lecture
Enter the 7-digit numeric profile manually
Reading board.

Test Composants Reactions / Résults


Test Active Reactions / Résults
actifs enzymes Négatifs Positif
components enzymes Négatifs Positif
0 Aucun témoin négatif Rouge * -
0 Nothing negative witness Red * -
GLU D-glucose Témoin positif (D-
GLU D-glucose Positif witness
GLUcose)
(D-GLUcose)
FRU D-fructose acidification (D-
FRU D-fructose acidification (D-
FRUctose)
FRUctose)
MNE D-mannose acidification (D-
MNE D-mannose acidification (D- MAnNose)
MAnNose) Rouge yellow
Red yellow MAL D-maltose acidification (D-
MAL D-maltose acidification (D- MALtose)
MALtose) LAC D-lactose (origine acidification (D-
LAC D-lactose (origine acidification (D- LACtose)
LACtose) bovine)
bovine)
TRE D-tréhalose acidification (D-
TRE D-tréhalose acidification (D- TREhalose)
TREhalose) MAN D-mannitol acidification (D-
MAN D-mannitol acidification (D- MANnitol)
MANnitol) XLT Xylitol acidification
XLT Xylitol acidification (XyLiTol)
(XyLiTol) MEL D-mélibiose acidification (D-
MEL D-mélibiose acidification (D- MELibiose)
MELibiose) NIT 1+ NIT 2 / 10
NIT 1+ NIT 2 / 10
NIT Potassium nitrate Reduction du min
NIT Potassium nitrate Reduction of min
NITrates au Incolore-rose pâle
NITrates to Colorless-pale pink
nitrites Rouge
nitrites Red

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
ZYM A + ZYM B / 10 ZYM A + ZYM B / 10
PAL β-naphtyl Phosphatase min PAL β-naphtyl Phosphatase min
phosphate ALcaline yellow phosphate ALcaline Violet jaune
Purple
VP 1 + VP 2/ 10 mi VP 1 + VP 2/ 10 mi
VP Sodium pyruvate production of Colorless-pale pink VP Sodium pyruvate production acetyl Rose pâle incolore
acetyl methyl Violet- rose methyl carbinol Violet- rose
carbinol (Vosges (Vosges

RAF D –raffinose Proskauer)


acidification (D- Proskauer)
RAFfinose)
XYL D-xylose acidification (D- RAF D –raffinose acidification (D-
XYLose) Red yellow RAFfinose)
SAC D-saccharose acidification (D- XYL D-xylose acidification (D-
XYLose) Rouge jaune
SACcharose)
MDG Méthyl-αD- acidification SAC D-saccharose acidification (D-
(Méthyl-αD- SACcharose)
glucopuranoside MDG Méthyl-αD- acidification
Glucopuranoside)
NAG N-acétyl- acidification (N- (Méthyl-αD-
glucopuranoside
Acétyl- Glucopuranoside)
glucosamine NAG N-acétyl- acidification (N-
Glucosamine
ADH L-arginine Arginine Yellow Orang Acétyl-
glucosamine
Glucosamine
DiHydrolase e-red ADH L-arginine Arginine jaune Orang
URE Urée UREase yellow Red DiHydrolase e-
purple rouge
URE Urée UREase jaune Rouge
pourpr
Acidification tests should be read
e
compared to negative (0) and positive
(GLU) controls.
MNE and XLT tests can be orange,
when surrounded or positive test Les tests d'acidification doivent être lus par rapport
aux contrôles négatifs (0) et positifs (GLU).
methods. We must then consider them
Les tests MNE et XLT peuvent être orange,
negative. lorsqu'ils sont entourés ou positifs. Nous devons
IV. Gallery API 20 NE. ensuite les considérer comme négatifs.

8.4 The NE 20 gallery is a standardized


IV. Galerie API 20 NE.
system for the identification of non-
enterobacterial gram-negative bacilli
ex Pseudomonas. 8.4 La galerie NE 20 est un système normalisé
8.4.1 Reagents not d'identification des bacilles à Gram négatif non
provided: entérobactériens ex Pseudomonas.
• MacFarland Stallion (0.5 MacFarland) 8.4.1 Réactifs non fournis:
• Paraffin oil
• JAMES Reagent
• Reagents: NIT1 + NIT2 • MacFarland Stallion (0,5 MacFarland)
• ZINC powder (Zn reagent) • Huile de paraffine
• Oxidase disc • Réactif JAMES
• Réactifs: NIT1 + NIT2

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
• NaCl 0.85% Medium API in 2 ml • Poudre de zinc (réactif Zn)
ampoule • Disque d'oxydase
8.4.2 Operating mode • NaCl 0,85% Medium API en ampoule de 2 ml
8.4.2.1 Preparation of the gallery:
• Gather, bottom and lid of an incubation 8.4.2 Mode de fonctionnement
box. Divide 5 ml of distilled or 8.4.2.1 Préparation de la galerie:
deionized water into the cells to create a • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
humid atmosphere. d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
• Write the strain reference on the side tab déminéralisée dans les cellules pour créer une
of the box. atmosphère humide.
• Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
• Remove the gallery from its packaging.
latéral de la boîte.
 Preparation of the inoculum: • Retirez la galerie de son emballage.
• Open a ampoule of API API NaCl • Préparation de l'inoculum:
0.85% Medium 2 ml • Ouvrir une ampoule d'API API NaCl 0,85%
• Using a pipette to collect one to four Medium 2 ml
colonies of identical morphology, • En utilisant une pipette pour collecter une à quatre
colonies de morphologie identique, utiliser de
preferentially use young cultures (18-
préférence des cultures jeunes (18-24H).
24H). • Atteindre une suspension d'opacité égale à 0,5 de
• Achieve a suspension of opacity equal Mc Farland.
to 0.5 of Mc Farland.

8.4.3 Inoculation of the


gallery:
• Fill microtubes (not cups) from PNPG
8.5.2 Inoculation de la galerie:
NO3 tests with prepared suspension
well adjusted to 0.5 MacFarland. • Remplir les microtubes (et non les cupules) des
tests PNPG NO3 avec une suspension préparée bien
• Then transfer approximately 200 μl of ajustée à 0,5 MacFarland.
the previous suspension into an ampoule
of API AUX Medium and homogenize
• Transférer ensuite environ 200 μl de la suspension
with the pipette, avoiding the formation
précédente dans une ampoule d'API AUX Medium
of bubbles. et homogénéiser avec la pipette, en évitant la
• Fill the microtubes and cups with GLU formation de bulles.
PAC tests, making sure to create a • Remplir les microtubes et les cupules avec des
horizontal or slightly convex level. tests GLU PAC, en veillant à créer un niveau
horizontal ou légèrement convexe.

• Fill the wells of the three underlined


tests (GLU, ADH, URE) with paraffin
oil to form a convex meniscus.
• Incubate the gallery in its incubation • Remplir les puits des trois tests soulignés (GLU,

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
box at 29 ± 2 ° C for 24 ± 2 hours. ADH, URE) avec de l'huile de paraffine pour former
• Note: If necessary, consult the un ménisque convexe.
manufacturer's technical data sheet for • Incuber la galerie dans sa boîte d'incubation à 29 ±
2 ° C pendant 24 ± 2 heures.
additional information on the
• Remarque: Si nécessaire, consulter la fiche
preparation of the inoculum and the technique du fabricant pour des informations
inoculation of this gallery. complémentaires sur la préparation de l'inoculum et
l'inoculation de cette galerie.

8.4.4 Reading and


interpretation:
8.4.4.1 Reading the gallery:
• After incubation, the reading of the
gallery must be done by refraining on 8.4.4 Lecture et interprétation:
the reading board. 8.4.4.1 Lecture de la galerie:
• Record on the results sheet all • Après incubation, la lecture de la galerie doit se
spontaneous reactions (GLU, ADH, faire en s'abstenant sur le tableau de lecture.
• Enregistrer sur la feuille de résultats toutes les
URE, GEL, and PNPG).
réactions spontanées (GLU, ADH, URE, GEL et
• The revelation of the two assimilation PNPG).
tests protected from air contamination; • La révélation des deux tests d'assimilation protégés
to do this, place the lid of the incubation de la contamination de l'air; Pour ce faire, placer le
box below these tests, during the period couvercle de la boîte d'incubation en dessous de ces
of revelation of the NO3 and TRP tests. tests, pendant la période de révélation des tests NO3
et TRP.
• NO3 tests:
Add a drop of NIT 1 and NIT 2 reagents
into the NO3 well.
After 5 minutes, a red color indicates a
positive reaction (nitrite production): • Tests NO3:
positive nitrate reduction test. Ajouter une goutte de réactifs NIT 1 et NIT 2 dans
A negative reaction can be due to the le puits NO3.
Après 5 minutes, une couleur rouge indique une
nitrogen production (possibly indicated
réaction positive (production de nitrite): test de
by the presence of microbubbles: add 2- réduction du nitrate positif.
3 mg of Zn reagent in the NO3 cup. Une réaction négative peut être due à la production
• After 5 min, a cup which remained d'azote (éventuellement indiquée par la présence de
colorless indicates a positive reaction; if microbulles: ajouter 2-3 mg de réactif Zn dans la
the cup becomes pink-red, the reaction coupelle NO3.
is negative because the nitrates still • Après 5 min, une tasse qui reste incolore indique
une réaction positive; si la coupe devient rose-rouge,
present in the tube were then reduced to la réaction est négative car les nitrates encore
nitrites by the zinc. présents dans le tube sont alors réduits en nitrites par
The reaction used for the identification le zinc.
of the bacterium is the reduction of La réaction utilisée pour l'identification de la
nitrates; it is positive if either of the two bactérie est la réduction des nitrates; il est positif si

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
previous reactions (production of NO2 l'une des deux réactions précédentes (production de
or N2). NO2 ou N2).

• TRP test:
- Add a drop of James's reagent. A pink
color diffusing throughout the cup
indicates a positive reaction.
• GLU to PAC test:
- It is test of assimilation of sugars, acid • Test TRP:
- Ajouter une goutte de réactif de James. Une
or other substrate. Inoculated with a
couleur rose diffusant à travers la coupe indique une
minimum medium, bacteria grow only if réaction positive.
they are able to use the corresponding • Test GLU à PAC:
substrate. - C'est un test d'assimilation des sucres, des acides
- Observe the bacterial growth. A ou autres substrats. Inoculées avec un milieu
cloudy cup indicates a positive reaction. minimum, les bactéries ne se développent que si
Intermediate intensity shoots can be elles sont capables d'utiliser le substrat
correspondant.
observed and noted +/- or - / +.
- Observez la croissance bactérienne. Une coupe
- Proceed to the identification of the trouble indique une réaction positive. Les pousses
bacterial strain. However in two cases, a d'intensité intermédiaire peuvent être observées et
new incubation is necessary notées +/- ou - / +.
- Procéder à l'identification de la souche bactérienne.
Cependant dans deux cas, une nouvelle incubation
est nécessaire
- If the profile is not found in the
Analytical Catalog API 20 NE;
- If the following note is given for the
profile obtained: "Identification not
valid before 48 hours of incubation". - Si le profil n'est pas trouvé dans l'API du catalogue
In both cases, pipette NIT 1, NIT 2 and analytique 20 NE;
- Si la note suivante est donnée pour le profil
JAMES reagents by aspiration,
obtenu: "Identification non valide avant 48 heures
immediately cover the NO3 and TRP d'incubation".
tests with paraffin oil to form a convex Dans les deux cas, pipeter les réactifs NIT 1, NIT 2
meniscus. et JAMES par aspiration, couvrir immédiatement les
Incubate again at 29 ± 2 ° C for 24 tests NO3 et TRP avec de l'huile de paraffine pour
hours. Record gallery test results except former un ménisque convexe.
for TRP and GLU NO3 tests that are Incuber à nouveau à 29 ± 2 ° C pendant 24 heures.
Enregistrer les résultats des tests en galerie à
only read at first reading at 24 hours. l'exception des tests TRP et GLU NO3 qui sont
seulement lus en première lecture à 24 heures.

8.4.4.2 Identification :
Using the apiweb identification

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
software: Manually key in the 7-digit
numeric profile.
The reaction of the oxidase, which 8.4.4.2 Identification:
Utilisation du logiciel d'identification apiweb:
constitutes the 21st test of the gallery, is
saisissez manuellement le profil numérique à 7
assigned a value of 4 when it is positive. chiffres.
La réaction de l'oxydase, qui constitue le 21ème test
de la galerie, est affectée d'une valeur de 4
lorsqu'elle est positive.
Reading board
Tableau de lecture

Tests Réactions/enzymes Résultats


Tests Réactions/enzymes Résultats
Composa Nég Positif
Composa Néga Positif
nts actifs atif
nts actifs tif

reduction de Nitrates NIT 1 + NIT 2/5 min


reduction of Nitrates NIT 1+NIT 2/ 5 min
NO3 Potassium au nitrites Incolore Rose rouge
NO3 Potassium to nitrites IncoloreRose red
nitrate Nitrate reduction en Zn/ 5 min
nitrate Nitrate reduction in Zn/ 5 min
nitrogen Zn / 5 min
nitrogen pink
Incolore rose
Incolore

JAME/ immédiat
JAME/ immédiat
TRP L- formation d’indole Incolore à Rose
TRP L- formation indole Colorless to
tryptopha (TRpytoPhane) vert pâle / jaune
tryptopha (TRpytoPhane) Rose
ne
ne pale green / yellow

GLU D-glucose Fermentation Bleu à jaune


GLU D-glucose Fermentation Blue to yellow
(Glucose) vert
(Glucose) green
ADH L- Arginine DiHydrolase jaune Orange /
ADH L- Arginine DiHydrolase yellow Orange /
arginine rose /
arginine pink / red
URE Urée UREase jaune Orange
rouge /
URE Urée UREase yellow Orange /
rose /
pink / red
ESC esculin hydrolyse (β- jaune Gris
rouge /
ESC esculin hydrolyse (β- yellow Gray /
iron glucosidasee) marron /
iron glucosidasee) brown /
citrate (ESCuline) noir
citrate (ESCuline) black

GEL Gélatine Hydrolyse (protéase) No Diffusion


GEL Gélatine Hydrolyse (protéase) Pas de Diffusion
(origine (GELatine) diffusion of the black
(origine (GELatine) diffusion of the
bovine) of the pigment
bovine) du black
pigment.
pigment pigment
PNP 4- β-galactosidase(Para- Incolore yellow
G nitrophén NitroPhényl-βD-

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
yl-βD- Galactopyranoside) PNP 4- β-galactosidase(Para- Incolore jaune
galactopy G nitrophén NitroPhényl-βD-
ranoside yl-βD- Galactopyranoside)
GLU D-glucose assimilation galactopy
(GLUcose) ranoside
ARA L- assimilation Trouble GLU D-glucose assimilation
arabinose (ARAbinose) Transpar (GLUcose)
MNE D- assimilation ency ARA L- assimilation Transpar Trouble
mannose (ManNosE) arabinose (ARAbinose) ent
MAN D- assimilation MNE D- assimilation
mannitol (MAnNitol) mannose (ManNosE)
NAG N- assimilation (N- MAN D- assimilation
acétylgluc AcétylGlucosamine) mannitol (MAnNitol)
osamine NAG N- assimilation (N-
MAL D- assimilation acétylgluc AcétylGlucosamine)
maltose (MALtose) osamine

GNT Potassium assimilation(Potassium MAL D- assimilation

gluconate GlucoNaTe) maltose (MALtose)

CAP Acide assimilation (acide GNT Potassium assimilation(Potassium

caprique CAPrique) gluconate GlucoNaTe)

ADI Acide assimilation (acide CAP Acide assimilation (acide


adipique ADIpique) caprique CAPrique)
Test Active Réactions/enzymes Résultats ADI Acide assimilation (acide
s compone Négatif Positif adipique ADIpique)
nts Test Active Réactions/enzymes Résultats
MLT Acide assimilation (MaLaTe) s componen Négatif Positif

malique Transpar Trouble ts


CIT Trisodium assimilation ency MLT Acide assimilation (MaLaTe)
citrate (trisodiumCITrate) malique Transpar Trouble
PAC Acide assimilation (acide CIT Trisodium assimilation en
phénylacé PhénylACétique) citrate (trisodiumCITrate)
tique PAC Acide assimilation (acide
phénylacét PhénylACétique)
OX Off-gallery oxidase test
ique

OX Off-gallery oxidase test

8.5 API Candida Gallery :


8.5 Galerie API Candida:
8.5.1 The API candida
gallery is a standardized system 8.5.1 L'API candida
for 18-24H identification of
yeasts. la galerie est un système standardisé
Reagents not provided: pour 18-24H identification de levures.

Mc Farland standard, point 3 Réactifs non fournis

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
Paraffin oil Norme Mc Farland, point 3
APIWEB Tm Software
Huile de paraffine
 Operating mode:
 Preparation of the gallery: Logiciel APIWEB Tm
 Gather, bottom and lid of an incubation
box. Divide 5 ml of distilled or •Mode de fonctionnement:
deionized water into the cells to create a • Préparation de la galerie:
humid atmosphere.
 Write the strain reference on the side tab • Rassembler, fond et couvercle d'une boîte
of the box. d'incubation. Diviser 5 ml d'eau distillée ou
déminéralisée dans les cellules pour créer une
 Remove the gallery from its packaging.
atmosphère humide.
 Place the gallery in the incubation box.
 Preparation of the inoculum: • Écrivez la référence de déformation sur l'onglet
 Open a 0.85% NaCl 0.85% API latéral de la boîte.
ampoule (2 ml) and using a pipette or a
• Retirez la galerie de son emballage.
swab, take one or more well-isolated
identical colonies and obtain a • Placez la galerie dans la boîte d'incubation.
suspension of opacity equal to that of
the MacFarland Standard 3 • Préparation de l'inoculum:
(preferentially use 18- to 24-hour-old • Ouvrir une ampoule de 0,85% NaCl 0,85% API
cultures) (2 ml) et, à l'aide d'une pipette ou d'un tampon,
prélever une ou plusieurs colonies identiques bien
isolées et obtenir une suspension d'opacité égale à
celle du MacFarland Standard 3
(préférentiellement 18- aux cultures de 24 heures)

 Mix the yeast suspension well and use it


extemporaneously. • Bien mélanger la suspension de levure et l'utiliser
 Inoculation of the gallery: extemporanément.
 Distribute the previous yeast suspension • Inoculation de la galerie:
only in the tubes, avoiding bubbles (for
this, tilt the incubation box forward and • Distribuer la suspension de levure précédente
place the pipette or PSIpette on the side uniquement dans les tubes, en évitant les bulles
(pour cela, incliner la boîte d'incubation vers
of the cup).
l'avant et placer la pipette ou la pipette sur le côté
 Cover the first 5 tests (GLU to RAF) de la tasse).
and the last test (URE) of paraffin oil
after inoculation of the gallery. • Couvrir les 5 premiers tests (GLU à RAF) et le
 Close the incubation box. dernier test (URE) d'huile de paraffine après
inoculation de la galerie.
 Incubate 18-24 hours at 36 ° C ± 2 ° C
in an aerobic atmosphere. • Fermez la boîte d'incubation.
 Note: The quality of the filling is very

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
important; insufficiently or excessively • Incuber 18-24 heures à 36 ° C ± 2 ° C dans une
filled tubes result in false positive or atmosphère aérobie.
negative results.
• Remarque: La qualité du remplissage est très
 19.0. Reading and interpretation: importante; des tubes insuffisamment ou trop
 19.0. Reading the gallery: remplis conduisent à des résultats faussement
 After 18-24 hours of incubation: The list positifs ou négatifs.
of 20 biochemical tests of this gallery is
• 19,0. Lecture et interprétation:
given in the reading table.
 Note: The tubes 8 and 9 are bifunctional • 19,0. Lire la galerie:
and allow the realization of two
reactions in the same tube: • Après 18-24 heures d'incubation: La liste des 20
tests biochimiques de cette galerie est donnée dans
 Tube 8: βXYL (Test No. 8) / βNAG
le tableau de lecture.
(Test No. 11).
 Tube 9: ßGUR (test n ° 9) / ßGAL (test • Note: Les tubes 8 et 9 sont bifonctionnels et
n ° 12). permettent la réalisation de deux réactions dans le
même tube:

• Tube 8: βXYL (essai n ° 8) / βNAG (essai n °


11).

• Tube 9: ßGUR (test n ° 9) / ßGAL (test n ° 12).


 19.1. Interpretation:
 The identification is obtained from the
digital profile. • 19.1. Interprétation:
 Determination of the digital profile:
• L'identification est obtenue à partir du profil
 On the results sheet, the tests are
numérique.
separated into groups of three and a
value of 1,2 or 4 is indicated for each. • Détermination du profil numérique:
By adding within each group values
corresponding to positive reactions, we • Sur la feuille de résultats, les tests sont séparés en
groupes de trois et une valeur de 1,2 ou 4 est
obtain 4 digits which constitute the
indiquée pour chacun. En ajoutant à l'intérieur de
numerical profile. chaque groupe des valeurs correspondant à des
 Identification : réactions positives, on obtient 4 chiffres qui
 Using the Apiweb TM identification constituent le profil numérique.
software: Enter the 4-digit digital profile
• Identification :
manually.
• Utilisation du logiciel d'identification Apiweb
TM: Entrer le profil numérique à 4 chiffres
manuellement.

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
Test Composa Réactions Résultats
nts actifs Négative Positive
Test Composa Réactions Résultats
nts actifs Négatif Positif
1) GLU D-glucose acidificatio
n(GLUcose)
1) GLU D-glucose acidificatio
n(GLUcose)
Purple Yellow
2) GAL D- acidificatio
galactose n(GALactose Gray- Gray 2) GAL D- acidificatio
Violet Jaune
) Violet green galactose n(GALactose
3) SAC D- acidificatio ) Gris- Gris
saccharose n(SACcharos 3) SAC D- acidificatio Violet vert
e) saccharose n(SACcharos
4) TRE D- acidificatio
trehalose n(TREhalose e)

) 4) TRE D- acidificatio
5) RAF D- acidificatio
trehalose n(TREhalose
raffinose n(RAFfinose)
)
5) RAF D- acidificatio

6) ßMAL 4-nitrophényl- ßMALtosid Incolore bright raffinose n(RAFfinose)

ßD- ase yellow 6) ßMAL 4-nitrophényl- ßMALtosid Incolore jaune


maltopyran pale ßD- ase pâle
oside yellow maltopyran
7) αAMY 2-chloro-4- αAMYlase In colore bright oside
nitrophényl yellow 7) αAMY 2-chloro-4- αAMYlase En colore jaune

-αD- pale nitrophényl pâle

maltotriosi yellow -αD-


8) ßXYL 4-
maltotriosi ßXYLosidas Incolore jaune
de
nitrophényl
de e jaune pâle pâle

8) ßXYL 4- ßXYLosidas Colorless- bright -ßD- / bleu /

nitrophényl e very pale yellow xylopyrano vert *

-ßD- yellow / pale side


9) ßGUR 4- ßGlUcuRon Clair / jaune
xylopyrano blue / yellow
nitrophényl idase Bleu / Vert pâle
side green **
9) ßGUR 4- ßGlUcuRon Clear / bright
-ßD-
nitrophényl idase Blue / yellow
glucuronid
-ßD- Green pale
e
glucuronid yellow 10) URE Urée UREase Jaune- Rouge
e orange

10) URE Urée UREase Jaune- Red pâle

orange 11) ßNAG 5-bromo- N-Acétyl-ß- Incolore / Bleu


pâle 4-chloro-3- Glucosamini jaune vert **
( in tube n
indoxyl-N- dase
8)*
acétyl-ßD-
glucosamin
ide

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
11) ßNAG 5-bromo- N-Acétyl-ß- Colorless Blue 12) ßGAL 5-bromo- ß- Incolore / Bleu vert
4-chloro-3- Glucosamini / yellow green** (in tube n°9)* 4-chloro-3- GALactosida jaune
( in tube n
indoxyl-N- dase indolyl-N- se
8)*
acétyl-ßD- ßD-
glucosamin galactopyra
ide noside

12) ßGAL 5-bromo- ß- Colorless / Blue


(in tube n°9)* 4-chloro-3- GALactosida yellow green
indolyl-N- se
ßD- * Les tubes 8 et 9 sont bifonctionnels: Tube 8:
galactopyra
βXYL (test n ° 8) / βNAG (test n ° 11).
noside
Tube 9: ßGUR (essai n ° 9) / ßGAL (essai n ° 12).

** Toute trace verte dans le puits 8 = ßXYL (-)


ßNAG (+)
* Tubes 8 and 9 are bifunctional: Tube
8: βXYL (Test No. 8) / βNAG (Test No.
11).
Tube 9: βGUR (Test No. 9) / βGAL
(Test No. 12).
** Any green trace in well 8 = ßXYL (-)
ßNAG (+)

9.CHANGES FROM LAST ADDITION 9.CHANGEMENT DEPUIS LA DERNIERE


: EDITION :

Ed.No. Date of Revision / Modification Reason for Done by/ Fait par
/No Date de révision modification / Raison
Ed de modification

Author (sign & date) Department Head (sign & date) QA (sign & date)
FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001
1 New SOP New SOP New SOP SOUFIANE TAYEB
1 Nouveau SOP Nouveau SOP SOP No : SOUFIANE TAYEB
SOP/QC/MB/062 is
replaced by current
SOP
No :SOP/QC/MB/149
for harmonisation as
per LNCPP and all
details are mentioned
in the change control
DCR/15/18

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FRM/QA/GEN /001, v. 1 For internal use Reference: SOP/ QA/GEN/ 001

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