24.09.

2015

Fonctions cellulaires et compartimentation des cellules

I. Nécessité de la compartimentation cellulaire

Compartiment : espace cellulaire défini/délimité par une membrane.
Toute cellule est un compartiment, mais il y a aussi une séparation à l’intérieur des cellules qui
impacte leurs fonctions. Chaque compartiment est un organite qui possède son propre groupe de
molécules et d’enzymes, et une fonction propre. La compartimentation a des impacts positifs et
négatifs sur la cellule.
Les mêmes fonctions sont effectuées par les eubactéries et les eucaryotes, pourtant elles diffèrent
par leur compartimentation.

Les contraintes de l’accroissement de la taille

Eubactérie =2microm
Eucaryote = 20microm
Ce qui implique une plus grande surface et un plus grand volume (x1000). Ces différences font que
chez les eucaryotes les molécules sont concentrées dans certains endroits, sinon il y a une nécessité
d’en produire plus.
De plus, il y a une possibilité que les réactions soient amoindries dans une grande cellule sans
compartiments ! Créer des organites résous ce problème (microenvironnement adapté, séparation
avec d’autres fonctions et molécules dans la cellule, membrane semi-perméable avec des
interactions avec l’environnement).
Il y a spécialisation de chaque compartiment au niveau du métabolisme. Les endroits toxiques de la
cellule ne contaminent pas les autres, ils sont isolés par des membranes plasmiques. Chaque partie
peut augmenter/diminuer sa concentration en ion sans affecter le fonctionnement des autres
parties.
Par exemple : avec une compartimentation, il est possible de voir se dérouler différentes réactions
nécessitant un pH changeant au même instant dans une seule cellule. La compartimentation
cellulaire est donc une nécessité fonctionnelle.

Problème  : compartiments non autonomes qui nécessitent des voies de transport et de

communication entre eux !
Les membranes des organites suivent les mêmes règles que la membrane plasmique. Tout cela existe
à l’intérieur du cytoplasme, ou les organites ont un endroit fixe dans l’architecture de la cellule.

II. Organisation fonctionnelle des compartiments cellulaires

La plus grande place revient au noyau, où est stockée et utilisée l’information génétique (c’est à cet
endroit que se passe la réplication et la transcription). Il est séparé par une double bicouche lipidique
(enveloppe nucléaire) qui possède des pores nucléaires qui permettent des échanges de matériel
avec le cytoplasme. Une molécule nécessite des codes spécifiques pour y entrer. Le nucléole est le
milieu de la maturation et de fabrication des ARN, et de synthèse et assemblage des ribosomes.
Le réticulum endoplasmique : c’est un système membranaire en contact avec le noyau (en
continuité). Il sert au stockage du calcium.
- Lisse : synthèse des lipides
- Rugueux : il est associé avec les ribosomes, synthèse de certaines protéines (la voie sécrétoire) que
l’on trouve au niveau des membranes ou sécrétées. Il est en relation avec l’appareil de Golgi.

L’appareil de Golgi en continuité (= système endo-membranaire). C’est un empilement de

membranes, appelées citernes ou diclyosomes (dans une cellule végétale), avec des vésicules qui
permettent le transport de molécules vers la membrane plasmique ou le réticulum. C’est un organite
polarisé qui présente des faces cis (du côté du réticulum endoplasmique) et trans (du côté de la
membrane plasmique). Il n’y a en général qu’un appareil de Golgi par cellule. Toutes les protéines
synthétisées au niveau du réticulum passent vers le Golgi par des vésicules qui les modifient (post
réticulum) pour leur donner leur forme mature, et il y a formation de sucres soit synthèse de certains
glucides.
La mitochondrie : elle a la taille d’une bactérie (1micro) et contient une membrane externe et une
membrane interne qui fait des « plis ». Il y a formation des molécules d’ATP (phosphorylation
oxydative) -> le nombre de mitochondrie est important dans nos cellules (40 à 30 kg d’ATP/jour).
Demi-vie pas énorme et division propre.

Chloroplastes (végétal) : transformation d’énergie photosynthèse et formation d’oxygène. Elle

contient un système endomembranaire important, avec des empilements qui sont importants pour
la photosynthèse. Synthèse de glucides !
Ces deux organites ont la même fonction (formation apport gestion de l’énergie).
Lysosome et vacuole (d’un ordre de grandeur beaucoup plus petit que les mitochondries) : Ils sont
très importants : ils ont un pH acide entre 3 et 5. Il y a beaucoup de protons à l’intérieur (transports à
l’aide de pompes). C’est une usine à déchets où ils sont détruits et recyclés.
La vacuole est beaucoup plus grande, mais les réactions sont du même type. Elle sert à stocker de
l’eau, se charge de la pression pour garder la cellule intacte. Elle joue un rôle sur le maintien de la
taille cellulaire.

III. Contraintes de la compartimentation cellulaire

Trafic cellulaire dans le cytoplasme :
Il y a un transport important à l’intérieur (contrainte de la compartimentation) qui est effectué par le
cytosquelette par des filaments de différentes tailles : ils ont une influence sur la mise en place des
organites, sur le transport des molécules dans les vésicules d’un organite à l’autre, et sur
l’architecture de la cellule.

IV. L’énergie dans la cellule

Généralités
L’entropie augmente avec le temps dans un système isolé, et le retour à l’ordre nécessite un apport
d’énergie.
Energie : capacité d’effectuer un travail, cinétique ou sous la forme d’une réserve. Le monde vivant
est alimenté par un flux d’énergie qui provient du Soleil.
Une cellule a besoin d’énergie solaire et d’énergie chimique (dans la matière organique et les
nutriments). Il y a beaucoup de combinaisons entre les deux ! Comment un organisme transforme-t-il
l’énergie du soleil en utilisable pour la cellule, et comment stocke-t-il l’énergie ?
-> L’énergie est dans les liaisons chimiques est surtout covalentes ! C’est l’énergie de potentiel (que
l’on peut utiliser quand nécessaire). Réactions chimiques = liaisons détruites et énergie qui sort. La
cellule y stocke son énergie !

Métabolisme : ensemble des réactions à l’intérieur d’un organisme vivant. Ça le maintien en vie, il se
développe, se reproduit et interagit avec son environnement ….
Catabolisme : je détruis les molécules pour récupérer de l’énergie, puis la stocke. -> transporteur
(molécules spécialisées pour transporter et garder une énergie, l’ATP et autres molécules).
Anabolisme : par des éléments de base, on fabrique une molécule ou accompli une fonction, soit on
dépense de l’énergie.

Alimentation = protéines, sucres, lipides qui sont des polymères. Première étape : dégrader ces
macromolécules pour avoir les unités qui les fabriquent (acides aminés, glycérol, acides gras …) et les
dégrader de nouveau en acétylcoA. C’est le Cycle de Krebs ! A la fin, on fabrique de l’ATP. On
fabrique de l’énergie à travers ces réactions cataboliques.

Toutes les réactions cataboliques sont des oxydations (décomposition de matière organique). On a
besoin d’une enzyme spécifique pour se faire.
La photosynthèse
Mécanismes autotrophes : ils ont la capacité à partie des éléments de base (eau, sels minéraux et
CO2) de fabriquer des composés organiques. Ils utilisent l’énergie du soleil pour leur anabolisme.
Dans ces composés, il y a les liaisons covalentes ou est stockée l’énergie. A la suite de ces
transformations, ils produisent de l’oxygène qui nous est nécessaire pour vivre. Mais ! Il y a d’autres
types de photosynthèse.

Pour récupérer l’énergie solaire, les cellules de la lignée verte ont des pigments qui permettent
d’absorber les photons.

 Dégradation des molécules organiques ou synthèse par photosynthèse