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RAPPORT D’AVANCEMENT DE LA THESE
De
DIBI WILFRIED GAUTHIER
Thème : Acquisition de Données de Fluorescence et de
Réflectance pour le Suivi de la Croissance des
Plantes Agricoles
21/03/2016
Résumé de l’état d’avancement des travaux de la thèse
Les travaux de recherche menés et ceux envisagés laissent entrevoir une soutenance pour
novembre 2016.
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1. Renseignements administratifs
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2. Renseignements scientifiques
a- Contexte
b- Objectifs
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2. Elaborer un indicateur de diagnostic du stress hydrique des plants de bananier
plantain mycorhizés par spectrométrie de fluorescence et de réflectance active.
c- Méthodologie
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Acquisition des données spectrales de l’expérimentation sur le gombo au champ
et fertilisés par trois types d’engrais chimiques (N, P, K).
Travail de recherche effectué à temps libre du fait des cours à dispenser dans
l’enseignement secondaire.
- Découverte d’un nouvel indice de réflectance très sensible à la teneur en eau des
plants de bananier plantain : Normalized Water Index 5 (NW5).
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2.7. Publication
2.8. Divers:
b- Résumé d’article
Sustainable agriculture with use of Arbuscular Mycorrhizal Fungi (AMF) is an emerging farm
management that improves crops nutrient and water use efficiency. Decision making on the
effect of AMF is still dependent on agronomic diagnosis which is long, tedious, expensive
and destructive. This study demonstrates the applicability of proximal fluorescence and
reflectance spectroscopy for evaluating and detecting at early stage distinct types of
mycorrhized plantain from two cultivars (Musa paradisiaca).
Visible-near infrared (400-1000nm) reflectance and fluorescence data were collected from
control and three levels mycorrhized plants designed in randomized and complete block
under greenhouse conditions. Two spectral measurements at a week interval were
performed on plant leaves by using an USB spectrometer mounted with an Arduino-based
LED driver clip.
A new normalized reflectance water NWI5 index shows with Datt5 alone highly significant
differences at P<0.001 respectively for Orishele and fhia21 cultivars. dNIRmin920_980,
NDVI3 and GI reflectance index are significant at P<0.01. Seven other reflectance and 3
fluorescence indices ANTH, FRF_R and NBI_R are significant at P<0.05. The two first
principal components for each cultivar spectral features explaining 94.1 % of variance were
used to build predictive classification models. LogitBoost algorithm indicates accuracy of
90.27% on stratified cross-validation and 87.5% on test split. Our results confirm that
fluorescence and reflectance spectroscopy is a valuable tool for early assessment of
mycorrhization success rate evaluation and pattern recognition. They also show promise for
the development of non-destructive and cost-effective detectors in monitoring crops under
biofertilizers with arbuscular mycorrhizae.
Keywords: classification, fluorescence and reflectance spectroscopy, LogitBoost algorithm,
mycorrhized plantain plants.
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3. Conclusion et calendrier prévisionnel de finalisation
Le thème d’étude présente d’énormes intérêts aussi bien dans une approche appliquée que
fondamentale en spectroscopie optique et dans le domaine agricole. Il a nécessité
l’acquisition de nouvelles compétences en expérimentation agricole, en électronique et un
approfondissement des analyses statistiques multivariées. Un deuxième article est en cours
de traitement afin d’achever le travail de rédaction du manuscrit de la thèse.
Le Directeur de Thèse Le Co‐Directeur de Thèse Le Doctorant
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