BAC3 BIOMED 2017-2018 Elias Aajja Julie Bailly Alexis Chasseur

Organismes modèles et développement

Les organismes modèles nous permettent d’étudier des développements, mutations,

méthylations, tout domaine de la génétique/biologie grâce à leurs spécificités,
particularités et parfois simplicité.

Ils ne découlent pas toujours d’un choix rationnel, mais lorsqu’ils apportent une
spécificité légitime alors ils sont répertoriés comme OM.

Le concept d’organisme modèle reste donc assez flou.

En fonction de ce que l’on recherche et de nos moyens, nous choisirons l’organisme qui
correspond le plus à nos attentes d’observations.

La levure nous a appris que démarrer d’un organisme simple est une des meilleurs idées
pour aller vers la complexité. Elle nous a permis de constater que malgré l’évolution et la
complexité, les cascades de signalisation sont très bien conservées.

Elle a permis la découverte d’un régulateur les plus important des cycles cellulaires.

Les recombinaisons homologues étant assez facile à faire dans les levures, cela nous
permet d’étudier l’utilité d’un gène, l’impact d’une mutation, knock-out ou in d’un gène.

Un changement de sa forme et de la durée de son cycle nous mettra vite la puce à

l’oreille quant à un changement dans sa génétique.

Le C.Elegans (vers) est un organisme plus complexe de part sa pluricellularité qui nous
apporte des infos plus complexes que la levure.

On utilisera sa transparence, sa résistance à la congélation, le fait qu’il mange des

bactéries et qu’on puisse faire une PCR directement dessus comme atout.

On pourra introduire des ARNi via bactérie (dont il se nourrit) pour observer le turn off de
n’importe quel gène.

On étudiera également le CTD (c terminal domaine) contenu dans l’ARN Pol II. Il nous
permettra d’étudier la phosphorylation des protéines impliquées dans le cycle cellulaire.

La transparence du vers nous permet de suivre le développement embryonnaire.

C’est un organisme avec un développement stéréotypé, la suppression d’une seule
cellule empêche son développement, pas de système compensatoire, on voit directement
si il y a un problème.

Cartographie de tous les territoires grâce au marquage cellulaire (ce que chaque cellule
advient)

Le Zebra Fish, l’embryon est surtout utilisé pour sa transparence. Il nous permettra de
marquer la lignée cellulaire du système cardiovasculaire et la lignée cellulaire du
développement de la thyroïde. Cela aboutira à la relation étroite entre les 2 lignées.

On peut donc suivre le développement embryonnaire sans tuer l’embryon (>< souris).

Il nous permettra d’étudier les relations de différents développements de système ou

autre.

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Les gènes HOX, ce sont des gènes architecturaux.

choix de l’OM très important, on doit visualiser l’influence des gènes HOX.

Pas la levure car unicellulaire

C.elegans n’est pas assez spécialisé, trop simple

ZebraFish : interessant car on a les nageoires, branchies…

Drosophile : parfait car insecte à 3 parties : tête-thorax-abdomen et les pattes. On peut

dès lors modifier l’ordre des gènes HOX (ex : faire pousser patte sur la tête). On remarque
la colinéarité de l’ordre des gènes HOX : très conservé d’un organisme à l’autre.

Souris : on peut étudier aussi, l’impact sur leur vertèbres -> pas très éthique et cher.

Épitranscriptomique : modification sur l’ARNm (méthylations,..)

On peut l’étudier sur tous les organismes

Drosophile : Il coupait les ailes -> obligée de marcher mais quand un certain gène était
méthyle -> ne sait plus marcher. Il s’est rendu compte que le sexe de la drosophile était
déterminé par des méthylations

Le choix du OM dépend de ce qu’on veut observer et de nos moyens.

Levure :

+ -

Nous ressemblent en plus simple Absence de système : pas de SNC, cardiovascu..

Recombinaison homologue facile Unicellulaire

Non pathogène : facile et agréable à manipuler

Haploide : facilite l’étude des gènes

Reproduction sexuée

Cascades de signalisations conservées

formation carte génétique

formation protéome

Facile à mettre en culture (reproduction etc)

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C.Elegans :

+ -

Système nerveux, TD Absence système cardiovascu, ressui

Translucide Hermaphrodite

multicellulaire + simple recombinaison homologue difficile

congelable (L1) Cuticule épaisse : immunohistochimie difficile

cartographie territoires, axones.. Ne sait pas isoler une lignée cellulaire = dvplmt
stéréotypé

CRISPR CAS9 pr recombinaison homologue biochimie mal connue

découverte ARNi

étude CTD dans ARN Pol II : phosphorylation

mange bactérie : facile à mettre sur boite de pétri et

muter bactéries -> apport ARNi

3,5 jours entre naissance et génération suivante

Zebra Fish :

+ -

Entre mammifères/ rongeurs et C.Elegans Peu d’Ac contre ses prot’ (on utilise son ARNm)

Embryons transparent : suivre dvlpmt systeme respi rudimentaire

200 oeufs par reproduction : TOP pr stat transgénèse svt mosaïcisme

Adulte pas très utile

Attendre 3 mois pr activité sexuelle

Gènes HOX : souris

+ -

Même organe que être humain : étude absence peu éthique

HOX A1

études co-interactant HOX prend de la place : cout élevé

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