EFOR : fiche-tomate
 La tomate
 
 Contact  tomate un modèle d'excellence pour les
Mathilde CAUSSE, UR 1052, GAFL-Unité
de Génétique et Amélioration des Fruits
et Légumes, Avignon,
Mathilde.Causse(at)avignon.inra.fr
 
 Mode de reproduction  Solanum lycopersicum
Période de reproduction : toute l'année.
Cycle de développement : 100-120
jours.
La fleur de tomate est hermaphrodite, le
tube staminique qui renferme et protège
les organes sexuels mâle et femelle,
offre une pollinisation autogame
dominante et allogame à pourcentage
variable.  
 Disciplines principales  Génétiques
Physiologie
Génétique
Agronomie
Améliorations technologiques : qualité
des produits frais et transformés
Pathologies du fruit
 Infrastructures  Grande collection d'ESTs (>250 000
Unité de Recherche en Génomique
Végétale (URGV), Evry, groupe « crop
genomics » et plate-forme de tilling :
http://www-
urgv.versailles.inra.fr/analysis-
cropFunctionalGen.htm
http://www-
urgv.versailles.inra.fr/tilling.htm
Etude du Polymorphisme des Génomes
Végétaux (EPGV), Evry :
http://www.cng.fr/fr/teams/genoinra/home.html
UR1052, Unité de Génétique et
Amélioration des Fruits et Légumes
(GAFL), Avignon :  
http://www.avignon.inra.fr/les_recherches__1/...
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites/...
Sécurité et Qualité des Produits
d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon :
http://www.avignon.inra.fr/les_recherches__1/...
Plantes et Systèmes de culture
http://www.efor.fr/fiche-tomate.php
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Introduction 
La tomate est une espèce de plante
herbacée originaire du nord-ouest de
l'Amérique du Sud. Elle est cultivée pour
son fruit charnu, l'un des fruits les plus
consommés dans l'alimentation humaine.
Elle appartient à la famille des
solanacées, dont les membres les plus
utilisés par l'homme sont par exemple la
pomme de terre, le poivre, l'aubergine,
ou encore le tabac. Son cycle de vie
court, la possibilité de diriger les
croisements, sa robustesse face à
différentes conditions climatiques, et la
facilité avec laquelle il est possible de la
transformer génétiquement, font de la
recherches sur les fruits charnus, tels
que le raisin, la pomme, la pêche, la
fraise ou encore le melon.
Données générales 
Classification phylogénétique : plante
herbacée de la famille des solanaceae
Génome en cours de séquençage
950 millions de paires de bases sur 12
paires de chromosomes
Nombre de gènes : environ 35 000
Outils disponibles 
Collections importantes de Ressources
Collections importantes de variants
naturels et de mutants (mutagenèses par
EMS révélés par méthode de TILLING
notamment)
Nombreux marqueurs génétiques : RFLPs
(Restriction Fragment Length
Polymorphism), AFLPs (Amplified
Fragment Length Polymorphism), SSRs
(simple sequence repeat), SNPs
Banques de BACs et YACs
environ)
Analyses QTLs, protéomes et
transcriptomiques possibles
Marqueurs COS (Conserved Ortholog Set)
permettant des études de synténie avec
le génome d'Arabidopsis thaliana
Production de mutations gain de
fonction grâce à des transformations
(par insertions de T-DNA ou des
transposons provenant d'autres espèces)
et extinction de gènes par RNAi ou par
VIGS (Virus Induced Gene Silencing)
Databases 
Bases de données génomiques :
http://sgn.cornell.edu/
http://ted.bti.cornell.edu/cgi-
bin/TFGD/order/home.cgi
http://mips gsf de/proj/plant/jsf/tomato/index jsp
29/07/2010
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Plantes et Systèmes de culture http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/tomato/index.jsp

Horticoles (PSH), Avignon : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/...
http://www.avignon.inra.fr/les_recherches__1/... Banque de variants naturels et de
Unité de Pathologie végétale, Avignon : mutants :
http://www.avignon.inra.fr/les_recherches__1/... http://tgrc.ucdavis.edu/
UR0407, Pathologie Végétale, Sophia- http://zamir.sgn.cornell.edu/mutants/
Antipolis, Pathology (SPE): Base de données QTLs :
http://www.avignon.inra.fr/les_recherches__1/... http://zamir.sgn.cornell.edu/Qtl/Html/home.htm
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites/... Base de données de microarrays :
UMRA 990 INRA INP-ENSAT, Laboratoire http://www.ebi.ac.uk/Databases/microarray.html
de Génomique et Biotechnologie des http://www.jcvi.org/potato/
fruits (GBF), Toulouse : Base de données sur le métabolisme :
http://gbf.ensat.fr/ http://solcyc.sgn.cornell.edu/LYCO/server.html
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites/...
UMR619 Biologie du Fruit (BF) INRA-
Univ. Bordeaux I-Univ. Bordeaux II,
Bordeaux :
https://www.bordeaux.inra.fr/umr619/
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites/...
UMR1065 Santé végétale (SV) INRA-
ENITAB, Bordeaux :
https://www.bordeaux.inra.fr/umrsv/
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites/...
Unité de recherche Biopolymères
Interactions Assemblages (BIA) :
http://www.angers-
nantes.inra.fr/unites_de_recherche_unites...
https://www-
admin.nantes.inra.fr/nantes/les_recherches/...

 Bibliographie 
Sites web :
http://fr.wikipedia.org/wiki/Solanum_lycopersicum
http://espace.canoe.ca/group/horticultureetjardinage/blog/view/295772
Articles :
“ Tomato : a model plant for Solanaceae genomics. ”, Stevens R, M. Bouzayen, M. Causse, C. Etienne, C. Rothan, Functional Plant
Genomics, éditeurs : J.F. Morot-Gaudry, P Lea, J.F. Briat, Science Publishers (USA), 708 p, 2007
Tomato. In “Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants”, Volume 5, Vegetables, Labate JA, S Grandillo, T Fulton, S Muños, AL
Caicedo, I Peralta, Y Ji, RT Chetelat, JW Scott, MJ Gonzalo, D Francis, W Yang, E van der Knaap, AM Baldo, B Smith-White, LA Mueller, JP
Prince, NE Blanchard, DB Storey, MR Stevens, MD Robbins, J Fen Wang, BE Liedl, MA O’Connell, JR Stommel, K Aoki, Y Iijima, AJ Slade, SR
Hurst, D Loeffler, MN Steine, D Vafeados, C McGuire, C Freeman, A Amen, J Goodstal, D Facciotti, J Van Eck, M Causse, Editeur : C. Kole,
Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 11-135, 2007.
“ Traditional and enhanced breeding for fruit quality traits in tomato. ”, Causse M, R Damidaux, P Rousselle, Genetic Improvement of
Solanaceous Crops, Vol.2: Tomato. Editeurs : M.K.Razdan and A. K. Mattoo, Science Publishers, Enfield, USA, 637 pp, 2007.
“Genomic databases for tomato”, K. Yano, K. Aoki, D. Shibata, Plant Biotechnology, 24, 17-25, 2007.

http://www.efor.fr/fiche-tomate.php 29/07/2010