BioC 3 - 2020-2021

Biocarburants
Sébastien Leveneur
Laboratoire de Sécurité des Procédés Chimiques
sebastien.leveneur@insa-rouen.fr
Sébastien Leveneur-Bioc-MRIE5
Plan
I. Introduction
II. Production d’énergie à partir de réactions biochimiques
III. Génie de la réaction « biochimique »
IV. Matières premières pour les biocarburants
V. Production de bio-alcool et bio-éther de première génération
VI. Production de biodiesel de première génération
VII. Transformation de la biomasse ligno-cellulosique
VIII. Production de biocarburants de troisième génération
IX. Production de bio-hydrogène
X. Production de bio-gaz (bio-méthane)
XI. Production de carburants de quatrième génération

Plan
I. Introduction
II. Production d’énergie à partir de réactions biochimiques
IV. Matières premières pour les biocarburants
V. Production de bio-alcool et bio-éther de première génération
VI. Production de biodiesel de première génération
VII. Transformation de la biomasse ligno-cellulosique
VIII. Production de biocarburants de troisième génération
IX. Production de bio-hydrogène
X. Production de bio-gaz (bio-méthane)
XI. Production de carburants de quatrième génération

Biomass Feedstock Conversion Routes to
Chemicals
3.1 Introduction
3.2 Croissance cellulaire
3.3 Formation des produits
3.4 « Stœchiométrie »
Sébastien Leveneur-BIOC-MRIE5
3.1 Introduction
3.2 Modèles de croissance cellulaire
3.3 Présence de plusieurs substrats
3.4 Rendement
3.5 Expression cinétique
3.6 Conception et opération de bioréacteurs pour la production de

biocarburants
3.7 Stratégies
3.8 Exemples
3.1 Introduction
• Concept de bioréacteurs
• Large quantité de biocarburants peut être

produite par bioconversion
• Trouver un modèle mathématique pour exprimer

la vitesse de production:
– Formation des produits : Ethanol, CH4, H2..
– Croissance, stagnation et mort cellulaire
• Effet du pH, Température et cisaillement

3.1 Introduction
3.3 Présence de plusieurs substrats
3.4 Rendement
3.5 Expression cinétique

biocarburants
3.7 Stratégies
3.8 Exemples
• Croissance d’un organisme
[Cellules] + [Source de Carbone] + [Source de N]

+ [Source O2 ou inorganique ou fermentation] + [Source
Phosphore]
Culture (pH, T°C,…)
[CO2] + [H2O] + [Produits]

+ [Cellules]
• Version abrégée
Substrat/Nutriment [Produits] + [Cellules]
Phase de latence : peu de croissance, cellules s’adaptent à leurs

milieux (synthèse d’enzymes)
Phase stationnaire : manque de nutriments/substrats et/ou inhibition
Phase de déclin : accumulation de déchets
Quand les produits (Ethanol, H2, CH4…) se forment-ils ?

Produits (Ethanol, H2, CH4…)


Facteurs affectant la croissance cellulaire :

Substrats inhibiteurs, composés xénobiotiques ou produits inhibiteurs
Vitesse de la croissance de la biomasse lors de la phase exponentielle :

rg = .CC Equation 1

rg : biomasse produite mg.L-1.h -1 
CC : concentrat ion biomasse mg.L-1 
 : taux de croissance de la biomasse h -1 
Comment exprimer μ ?
Vitesse de la croissance de la biomasse lors de la phase exponentielle

rg = .CC

CC : concentrat ion biomasse mg.L-1  
Cinétique de Monod
max .S Equation 2
=
KS + S
max : taux de croissance de la biomasse max. h -1 
S : concentrat ion substrat/n utriment mg.L 
-1
KS : constante de Monod ou coefficien t de demi - saturation
-Largement répandu pour décrire la

croissance microbienne
-Valable pour cultures
hétérotrophiques ou autotrophiques
-Phase exponentielle
Cinétique de Monod
max .S
=
KS + S
max : taux de croissance de la biomasse max. h -1 
S : concentrat ion substrat/n utriment mg.L 
-1
KS : constante de Monod ou coefficien t de demi - saturation
Si KS >>> [S] : premier ordre

Si KS <<< [S] : ordre zéro, ne dépend
pas de la concentration en substrat
Cinétique de Monod
Exemple pour la croissance d’Escherichia coli avec le glucose
μmax=1,3 h-1 et KS =2,2.10-5 mol.dm-3
La combinaison des équations 1 et 2 donne :
max .S
. C
rg =
KS + S
Dans un certain nombre de cas, la constante KS est petite :
rg = max .C
Cinétique de Monod
Μmax=1,3 h-1 et KS =2,2.10-5 mol.dm-3
max .S
. C
rg =
KS + S
Cinétique de Monod
Μmax=1,3 h-1 et KS =2,2.10-5 mol.dm-3
max .S
. C
rg =
KS + S
Cinétique de Monod
Μmax=1,3 h-1 et KS =2,2.10-5 mol.dm-3
max .S
. C
rg =
KS + S μmax et KS : linéarisation de
Lineweaver-Burk
Cinétique de Monod
Il existe plusieurs équations empiriques pour prendre en compte

cette inhibition :
max .S
. C
n
 CP 
rg = kobs. avec kobs = 1 − * 
KS + S  CP 
CP* : concentrat ion du produit où tout métabolism e s' arrête
n : constante empirique
Pour la fermentation du glucose par saccharomyces cerevisiae

Cp*= 93 g.dm-3 et n =0,5
Equation de mort cellulaire :

Résulte de conditions drastiques et/ou présence de substances
toxiques
rd = (kd + kc .Ct ).C

Ct : concentrat ion de substance toxique
kd : constante se référant à la mort naturelle d' une cellule
(ordre de grandeur 0,1 - 0,0005h-1 )
kt : constante se référant à la mort par empoisonne ment
(dépend de la nature de la substance toxique)
Effet de la température :
Loi empirique donnée par Abida et al. (Biochemical
engineering, 1973)
rg =  (T ).CC


CC : concentrat ion biomasse mg.L-1 
E1
−
RT
 (T ) =  (Tmax ). I ' avec I ' =
a.T .e
E2
−
1 + b.e RT
I ' : fraction
Tmax : températu re à laquelle la croissance est maximale
 (Tmax ) : taux de croissance à Tmax
3.1 Introduction
3.3 Formation des produits : Mécanisme des enzymes

biocarburants
3.7 Stratégies
3.8 Exemples
A. Fondamentaux de la réaction enzymatique

B. Mécanisme
C. Equation de Michaelis-Menten
D. Autres équations
E. Réacteur fermé
F. Effet de la température
G. Inhibition

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition
Jöns Jacob Berzelius

(20 août 1779 - 7 août 1848)
A catalyst is a substance that speeds up a chemical reaction, but

is not consumed by the reaction; hence a catalyst can be
recovered chemically unchanged at the end of the reaction it has
been used to speed up, or catalyze.
Jöns Jacob Berzelius

(20 août 1779 - 7 août 1848)
A catalyst is a substance that speeds up a chemical reaction, but

is not consumed by the reaction; hence a catalyst can be
recovered chemically unchanged at the end of the reaction it has
been used to speed up, or catalyze.

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition
Protéase hydrolyse les liaisons des fonctions amino-acides des protéines
Amylase travaille sur les liaisons entre les molécules de glucose

de l’amidon
Lipase attaque les « graisses » en acides gras libres et en glycérol
Approximation des états stationnaires (steady-state

approximation) [Bodenstein 1913] : intermédiaires [H* et Br*], présent
en faible quantité et dont la variation de quantité dans le temps est
constante
Approximation des états quasi-stationnaires ou de léquilibre

partiel (quasi steady-state approach) [Semenov] : une étape est plus
lente que les autres (étape limitante ou « rate determining step »). Les
autres étapes sont rapides et peuvent être considérée comme en
équilibre
Sébastien Leveneur 39

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition
Déterminez les paramètres de Michaelis-Menten pour la réaction :
k1
Urée + Uréase [Urée.Uréase]* k3 2NH3+CO2+ Uréase
k2
3
[Urée] (kmol/m ) 0,2 0,02 0,01 0,005 0,002
-1 -3
-rUrée (kmol. s .m ) 1,08 0,55 0,38 0,2 0,09
12
1/[-rUrée]
10
y = 0.0207x + 0.7531
R² = 0.9992
8
6
Série1
Linéaire (Série1)
0
0 100 200 300 400 500 600
1/[Urée]

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition
E. Réacteur fermé
Calculer le temps nécessaire pour convertir 99% d’urée en ammoniac

et en CO2 dans un réacteur fermé de 0,5 dm3. La concentration initiale
en urée est de 0,2 kmol/m3.
KM=0,0266 kmol/m3
X=0,99
Curée=0,2 kmol/m3
Vmax=1,33 kmol/m3/s
[Urée] (kmol/m3) 0,2 0,02 0,01 0,005 0,002

-1 -3
-rUrée (kmol. s .m ) 1,08 0,55 0,38 0,2 0,09

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition

B. Mécanisme
E. Réacteur fermé
G. Inhibition
G. Inhibition
Une équipe de recherche a étudié l’hydrolyse enzymatique de l’amidon en
présence d’un inhibiteur à différentes concentrations. A partir des données
ci-dessous:
-Quelle inhibition est mise en jeu ?
-S’agit-il d’un mécanisme de Michaelis-Menten ?
-S’il s’’agit d’un mécanisme de Michaelis-Menten, déterminez les
paramètres associés ainsi que les paramètres d’inhibition ?
Sans inhibition Inhibition expérience 1
I = 3,34 mol/dm3
Camidon [kmol/dm3] -ramidon [kmol/dm3/h] Camidon [kmol/dm3] -ramidon [kmol/dm3/h]
12,5 100,00 33,00 116,00
9,00 92,00 10,00 85,00
4,25 70,00 3,6 55,00
1.00 29,00 1,6 32,00
Inhibition expérience 2
I = 12,7mol/dm3
Camidon [kmol/dm3] -ramidon [kmol/dm3/h]
10,00 67,66
5,25 47,61
2,00 23,64
1,67 20,37
Amidon Starch
Dextrine Dextrin
Maltose Maltose
3.1 Introduction

biocarburants
Exercice 1
Afin de déterminer les constantes gouvernant la production d’éthanol en
utilisant l’enzyme Saccharomyces cerevisiae en utilisant du glucose comme
substrat, une expérience est réalisée en réacteur fermé et les
concentrations des cellules, glucose et éthanol sont suivies. Le tableau ci-
dessous résume les données obtenues.
Temps, t(hr) Cellules, Cc (g/dm3) Glucose, Cs (g/dm3) Ethanol, Cp (g/dm3)
0 1 250 0
1 1.37 245 2.14
2 1.87 238.7 5.03
3 2.55 229.8 8.96
Déterminer les paramètres YS/C, YC/S, YS/P, YP/S et µmax. Le paramètre Ks

pourra être estimé à 1,7 g/dm3. La période de latence ainsi que la
maintenance cellulaire pourront être négligée.
A partir des données obtenues, déterminez la concentration en éthanol
après 10 heures de fermentation dans un réacteur fermé dont les
concentrations initiales en cellule, glucose et éthanol sont de 1,5 g/dm3; 600
g/dm3 et 0 g/dm3 respectivement,.
10 255
Cellules, Cc (g/dm3)
9
Ethanol, Cp (g/dm3)
250
8 Glucose, Cs (g/dm3)
Concentration g/dm3
245
Concentration g/dm3
5 240
4
235
3
2
230
1
0 225
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5
Temps [heure]
Temps, t(hr) Yc/s Ys/c Yp/s Ys/p Yc/p Yp/c
0-1 0.074 13.514 0.428 2.336 0.173 5.784
1-2 0.079 12.600 0.459 2.180 0.173 5.780
2-3 0.076 13.088 0.442 2.265 0.173 5.779
moyenne 0.077 13.067 0.443 2.260 0.173 5.781
Données expérimentales
Résolution de le système d’équations

différentielles
Support visuelle
Loi cinétique + bilan matière
Fichier Excel nomme donnes
ATTENTION placer au même
endroit que le fichier matlab
Conditions initiales !

différentielles
Fichier Excel nomme donnes
ATTENTION placer au même
endroit que le fichier matlab
Conditions initiales !

différentielles
Optimisation par la
méthode des moindres
carrés de k (ymod-yexp)2
Optimisation par la
Optimisation par la
Optimisation par la
Données calculées par le

solveur ode en faisant
varier k1
Optimisation par la
fminsearch finds the minimum of a scalar

function of several variables, starting at an
initial estimate. This is generally referred to
as unconstrained nonlinear optimization.
Support visuelle
Permet de visualiser
l’optimisation

différentielles
Support visuelle
Loi cinétique + bilan matière
Concentration en fonction du temps
10
8
CCmodel
Concentration (g/dm3
CCexp
6
CPmodel
CPexp
4
0
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3
Temps (hrs)

250
CSmodel
245 CSexp
Concentration (g/dm3)
240
235
230
225
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3
Temps (hrs)
t= C=
0 1.5000 600.0000 0
0.5000 1.7542 596.6782 1.4696
1.0000 2.0515 592.7935 3.1882
1.5000 2.3992 588.2505 5.1981
2.0000 2.8057 582.9379 7.5485
2.5000 3.2812 576.7250 10.2971
3.0000 3.8372 569.4597 13.5114
3.5000 4.4874 560.9636 17.2702
4.0000 5.2477 551.0284 21.6657
4.5000 6.1368 539.4105 26.8055
5.0000 7.1765 525.8254 32.8157
5.5000 8.3921 509.9403 39.8435
6.0000 9.8136 491.3668 48.0607
6.5000 11.4755 469.6505 57.6682
7.0000 13.4184 444.2617 68.9005
7.5000 15.6898 414.5817 82.0313
8.0000 18.3447 379.8898 97.3794
8.5000 21.4474 339.3470 115.3160
9.0000 25.0723 291.9807 136.2715
9.5000 29.3050 236.6718 160.7408
10.0000 34.2422 172.1578 189.2826
200
Concentration (g/dm3
150 CC
CP
100
50
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Temps (hrs)

600
CS
500
400
300
200
100
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Temps (hrs)
Exercice 2
La fermentation du glucose en éthanol est réalisée dans un réacteur fermé en utilisant l’enzyme
Saccharomyces cerevisiae. Déterminer l’évolution des concentrations en cellule, glucose et
éthanol sur une période de 12 heures.
La concentration initiale en cellule est de 1,0 g/dm3, en glucose est de 250 g/dm3 et il n’y a pas
d’éthanol initialement.
Les données suivantes sont fournies:

- La concentration d’éthanol où tout métabolisme cellulaire cesse de fonctionner est CP* = 93
g/dm3
- La constante empirique n décrivant la croissance en cas d’inhibition due au produit est
égale à 0,52
- Le coefficient YC/S est de 0,08 g/g
- Le coefficient YP/S est de 0,45 g/g
- Le coefficient YP/C est de 5,6 g/g
- Taux de croissance maximale µmax est de 0,33 h-1
- La constante de Monod Ks est de 1,7 g/dm3
- La constante de mort naturelle kd est de 0,01 h-1
- La constante de maintenance cellulaire m est de 0,03 gramme de substrats/(gramme de
cellules.h)
100
Concentration (g/dm3 CC
CP
50
0
0 2 4 6 8 10 12
Temps (hrs)
300
CS
200
100
0
0 2 4 6 8 10 12
Temps (hrs)
C=
t=
0 1.0000 250.0000 0
0.5000 1.1717 247.7700 0.9917
1.0000 1.3715 245.1744 2.1461
1.5000 1.6034 242.1596 3.4867
2.0000 1.8721 238.6670 5.0398
2.5000 2.1823 234.6326 6.8336
3.0000 2.5392 229.9889 8.8981
3.5000 2.9481 224.6652 11.2647
4.0000 3.4143 218.5913 13.9645
4.5000 3.9429 211.6997 17.0272
5.0000 4.5381 203.9306 20.4793
5.5000 5.2033 195.2385 24.3407
6.0000 5.9401 185.5980 28.6222
6.5000 6.7475 175.0143 33.3211
7.0000 7.6216 163.5309 38.4175
7.5000 8.5548 151.2404 43.8693
8.0000 9.5346 138.2922 49.6093
8.5000 10.5438 124.8991 55.5420
9.0000 11.5602 111.3372 61.5434
9.5000 12.5570 97.9423 67.4633
10.0000 13.5040 85.0944 73.1316
10.5000 14.3694 73.1967 78.3680
11.0000 15.1218 62.6479 82.9947
11.5000 15.7339 53.8003 86.8547
12.0000 16.1841 46.9352 89.8229

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Biocarburants

II. Production d’énergie à partir de réactions biochimiques

III. Génie de la réaction « biochimique »

IV. Matières premières pour les biocarburants

V. Production de bio-alcool et bio-éther de première génération

VI. Production de biodiesel de première génération

VII. Transformation de la biomasse ligno-cellulosique

VIII. Production de biocarburants de troisième génération

IX. Production de bio-hydrogène

X. Production de bio-gaz (bio-méthane)

XI. Production de carburants de quatrième génération

II. Production d’énergie à partir de réactions biochimiques

III. Génie de la réaction « biochimique »

IV. Matières premières pour les biocarburants

V. Production de bio-alcool et bio-éther de première génération

VI. Production de biodiesel de première génération

VII. Transformation de la biomasse ligno-cellulosique

VIII. Production de biocarburants de troisième génération

IX. Production de bio-hydrogène

X. Production de bio-gaz (bio-méthane)

XI. Production de carburants de quatrième génération

3.2 Croissance cellulaire

3.3 Formation des produits

3.2 Modèles de croissance cellulaire

3.3 Présence de plusieurs substrats

3.5 Expression cinétique

3.6 Conception et opération de bioréacteurs pour la production de

• Large quantité de biocarburants peut être

• Trouver un modèle mathématique pour exprimer

• Effet du pH, Température et cisaillement

3.2 Croissance cellulaire

3.3 Présence de plusieurs substrats

3.5 Expression cinétique

3.6 Conception et opération de bioréacteurs pour la production de

[Cellules] + [Source de Carbone] + [Source de N]

[CO2] + [H2O] + [Produits]

Substrat/Nutriment [Produits] + [Cellules]

Phase de latence : peu de croissance, cellules s’adaptent à leurs

Quand les produits (Ethanol, H2, CH4…) se forment-ils ?

Phase de latence : peu de croissance, cellules s’adaptent à leurs

Phase de latence : peu de croissance, cellules s’adaptent à leurs

Phase de latence : peu de croissance, cellules s’adaptent à leurs

Facteurs affectant la croissance cellulaire :

Vitesse de la croissance de la biomasse lors de la phase exponentielle :

Vitesse de la croissance de la biomasse lors de la phase exponentielle

KS : constante de Monod ou coefficien t de demi - saturation

-Largement répandu pour décrire la

KS : constante de Monod ou coefficien t de demi - saturation

Si KS >>> [S] : premier ordre

Dans un certain nombre de cas, la constante KS est petite :

Dans un certain nombre de cas, la constante KS est petite :

Dans un certain nombre de cas, la constante KS est petite :

Il existe plusieurs équations empiriques pour prendre en compte

Pour la fermentation du glucose par saccharomyces cerevisiae

Equation de mort cellulaire :

rd = (kd + kc .Ct ).C

3.2 Croissance cellulaire

3.3 Formation des produits : Mécanisme des enzymes

3.5 Conception et opération de bioréacteurs pour la production de

A. Fondamentaux de la réaction enzymatique

A. Fondamentaux de la réaction enzymatique