Como produto da hidrólise das proteínas, são encontrados cerca de 20
aminoácidos e contém: um grupo α-carboxílico, um grupo α-amino e um gruopo R ou substituído no átomo de carbono α (assimétrico – com exceção da glicina). Os aminoácidos são classificados com base na polaridade de seus grupos R. Obtendo-se: • CLASSE ALIFÁTICA NÃO-POLAR: alanina, glicina, isoleucina, leucina, prolina e valina. -Possuem cadeias aromáticas e também hidrofóbicos: fenilalanina, tirosina e triptofano. • CLASSE NÃO-CARREGADA, MAS POLAR: asparagina, cisteína, glutamina, metionina, serina e treonina. • CARREGADOS NEGATIVAMENTE (ÁCIDOS): asparato e glutamamto. • CARREGADOS POSITIVAMENTE (BÁSICOS): arginina, histidina e lisina. Os aminoácidos monoamino-monocarboxílicos são ácidos dipróticos em pH baixo e a medida que se elevao pH, até próximo de 6, perde-se o próton do grupo carboxila para formar a espécie dipolar, eletricamente neutra. Aumentando-se mais ainda o pH, perde-se o segundo próton para liberar a espécie iônica H2+NCH(R)COO-. Os aminoácidos tem propriedades ácidobásicas muito variáveis, formam derivados coloridos quando reagem com a ninidrina, indicando também que, misturas complexas de aminoácidos podem ser resolvidas e seus componentes podem ser indicados por cromatografia ou por HPLC. Os aminoácidos ligam-se covalentemente, através de ligações peptídicas e formam peptídeos – que hidrolisados liberam seus aminoácidos – que podem ocorrer livremente no interior das células e dos tecidos, exercendo funções biológicas específicas, incluindo alguns hormônios e antibióticos. CAPÍTULO 06
UMA INTRODUÇÃO ÀS PROTEÍNAS
As enzimas são catalisadores efetivos e fazem esse trabalho em todas
as reações bioquímicas e em geral, são proteínas. Algumas requerem um cofator químico para serem ativadas e cada enzima é classificada de acordo com a reação que ela catalisa. Caracteriza-se a catálise enzimática pela formação do complexo ES. A função da enzima é reduzir a energia de ativação, aumentando a velocidade da reação. O equilíbrio de uma reação não é afetado por uma enzima. O grande tamanho das enzimas é explicado pela necessidade que elas possuem de fazer múltiplas interações. A energia de reação pode ser usada para: baixar a entropia do substrato, tensionar o substrato ou provocar uma mudança conformacional na substancia. A cinética é uma metodologia importante para o estudo dos mecanismos enzimáticos e as enzimas possuem muitas características cinéticas em comum. Por exemplo, ao aproximar-se de uma velocidade máxima, toda enzima está na forma de complexo ES. A concentração de substrato que produz a metade da velocidade máxima é a constabte de Michaelis-Menten ou Km, que é característica para cada enzima, agindo sobre um dado substrato. A equação de Michaelis-Menten Vmáx [S] Vo = ------------ Km + [S] relaciona a velocidade inicial de uma reação enzimática com a concentração de substrato e a Vmáx através da constante Km. Cada enzima também tem um pH ótimo, bem como uma especificidade característica pelos substratos sobre os quais elas agem. As enzimas podem ser inativadas por modificações irreversíveis em algum grupo funcional essencial para atividade catalítica. Elas também podem ser inibidas, reversivelmente, de forma competitiva ou não-competitiva. Algumas enzimas regulam a velocidade das vias metabólicas celulares. A inibição por retroalimentação ocorre quando o produto final de uma via, inibe a primeira enzima desta mesma via. Outras enzimas reguladoras são moduladas por modificação covalente de um grupo funcional específico necessário para a atividade, ou por clivagem proteolítica de um zimogênio.