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®
API / ID 32

Mise à jour de la
base de données
API® / ID 32
Brochure
d'information
technique pour le
logiciel
161150 – 745  – fr – A – 2016‐03— 161150 ‐ 745 

d'identification
 

FR

 
 

Informations générales
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Table des matières

1. Description ................................................................................................................................. 1
2. Base de données ....................................................................................................................... 2
Résumé des changements ................................................................................................................ 2
Rappels .............................................................................................................................................. 2
3. Liste des taxons ......................................................................................................................... 3
4. Liste des tests complémentaires .............................................................................................. 21
5. Liste des notes ......................................................................................................................... 29
6. Description de la Base de connaissances ............................................................................... 34
API 20 E™ ........................................................................................................................................ 34
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 34
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 36
Limites du test .............................................................................................................................. 36
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 36
RapiD 20 E™ ................................................................................................................................... 37
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 37
Performances ............................................................................................................................... 38
Limites du test .............................................................................................................................. 38
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 38
API® 10 S.......................................................................................................................................... 39
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 39
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 39
Limites du test .............................................................................................................................. 40
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 40
API® 20 NE ....................................................................................................................................... 41
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 41
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 42
Limites du test .............................................................................................................................. 42
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 42
API® Staph........................................................................................................................................ 43
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 43
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 43
Limites du test .............................................................................................................................. 43
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 43
API® 20 Strep ................................................................................................................................... 44
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 44
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 46
Limites du test .............................................................................................................................. 46
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 46
API® 20 C AUX ................................................................................................................................. 47
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 47
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 48
Limites du test .............................................................................................................................. 48
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 48
API® Candida ................................................................................................................................... 49
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 49
Performances ............................................................................................................................... 49
Limites du test .............................................................................................................................. 49
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 49

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification i


Table des matières

API® 20 A.......................................................................................................................................... 50
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 50
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 52
Limites du test .............................................................................................................................. 52
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 52
API® Coryne ..................................................................................................................................... 53
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 53
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 53
Limites du test .............................................................................................................................. 54
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 54
API® Campy ..................................................................................................................................... 55
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 55
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 55
Limites du test .............................................................................................................................. 55
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 55
API® Listeria ..................................................................................................................................... 56
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 56
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 56
Limites du test .............................................................................................................................. 56
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 56
API® NH ............................................................................................................................................ 57
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 57
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 58
Limites du test .............................................................................................................................. 58
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 58
API® 50 CHB .................................................................................................................................... 59
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 59
Performances ............................................................................................................................... 59
Limites du test .............................................................................................................................. 59
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 59
API® 50 CHE .................................................................................................................................... 60
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 60
Performances ............................................................................................................................... 61
Limites du test .............................................................................................................................. 61
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 61
API® 50 CHL ..................................................................................................................................... 62
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 62
Performances ............................................................................................................................... 62
Limites du test .............................................................................................................................. 63
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 63
ID 32 E ............................................................................................................................................. 64
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 64
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 66
Limites du test .............................................................................................................................. 66
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 66
rapid ID 32 E .................................................................................................................................... 67
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 67
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 68
Limites du test .............................................................................................................................. 68
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 68
ID 32 STAPH .................................................................................................................................... 69
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 69
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 69
Limites du test .............................................................................................................................. 70
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 70
rapid ID 32 STREP ........................................................................................................................... 71
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 71
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 73
Limites du test .............................................................................................................................. 73
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 73

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification ii


Table des matières

ID 32 C ............................................................................................................................................. 74
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 74
Performances (souches sélectionnées en 2012) ......................................................................... 75
Limites du test .............................................................................................................................. 75
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 75
rapid ID 32 A .................................................................................................................................... 76
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 76
Performances ............................................................................................................................... 77
Limites du test .............................................................................................................................. 77
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 77
ID 32 GN .......................................................................................................................................... 78
Modifications du contenu de la Base de connaissances ............................................................. 78
Performances ............................................................................................................................... 79
Limites du test .............................................................................................................................. 79
Tableau d'identification (en %) .................................................................................................... 79
7. Identification / méthodologies simplifiées ................................................................................. 80
Identification manuelle...................................................................................................................... 80
Réactifs à commander ................................................................................................................. 81
Identification automatique ................................................................................................................ 82
8. Annexes ................................................................................................................................... 83
Annexe A : Bibliographie des tests complémentaires ...................................................................... 83
Annexe B : Levures .......................................................................................................................... 86
Annexe C : Tableau d'identification .................................................................................................. 88
API 20 E™ V5.0 ........................................................................................................................... 88
RapiD 20 E™ V3.2 ....................................................................................................................... 92
API® 10 S V4.0 ............................................................................................................................. 95
API® 20 NE V8.0 .......................................................................................................................... 97
API® Staph V5.0 .........................................................................................................................100
API® 20 Strep V8.0 .....................................................................................................................102
API® 20 C AUX V5.0 ..................................................................................................................104
API® Candida V2.2 .....................................................................................................................106
API® 20 A V5.0 ...........................................................................................................................107
API® Coryne V4.0 .......................................................................................................................109
API® Campy V3.0 .......................................................................................................................111
API® Listeria V2.0 .......................................................................................................................112
API® NH V4.0 .............................................................................................................................113
API® 50 CHB V4.1 ......................................................................................................................114
API® 50 CHE V3.2 ......................................................................................................................117
API® 50 CHL V5.2 ......................................................................................................................129
ID 32 E V4.0 ...............................................................................................................................135
rapid ID 32 E V4.0 ......................................................................................................................140
ID 32 STAPH V3.0 .....................................................................................................................144
rapid ID 32 STREP V4.0 ............................................................................................................146
ID 32 C V4.0 ...............................................................................................................................150
rapid ID 32 A V3.3 ......................................................................................................................153
ID 32 GN V3.2 ............................................................................................................................157
Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires ........................................... 162
Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires ........................................... 171

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification iii


1. Description

Cette mise à jour des bases de données API®, ID 32 et rapid ID 32 intègre :

- l'évolution de la taxonomie internationale,


- la description des nouvelles espèces de microorganismes,

- les données microbiologiques récemment acquises (nouveaux profils de souches


ayant un impact sur la performance des données).

Suite à cette mise à jour, les versions des bases de données ont été modifiées et sont
mentionnées dans le tableau du Chapitre 2 Base de données.

Les galeries ID 32 GN ne peuvent être lues et interprétées qu'automatiquement.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 1


2. Base de données

Résumé des changements


Numéro de version Modification des thésaurus Modifications de la base de données
Bases de données
Tests
Ancien Nouveau Taxons Notes Identification
complémentaires

API 20 E™ V 4.1 V 5.0 X X X X

RapiD 20 ETM V 3.1 V 3.2 X - - -

API® 10 S V 3.1 V 4.0 X X X -

API® 20 NE V 7.0 V 8.0 X X X -

API® Staph V 4.1 V 5.0 - - X -

API® 20 Strep V 7.0 V 8.0 X X X X

API® 20 C AUX V 4.0 V 5.0 X X X -

API® Candida V 2.1 V 2.2 X X - -

API® 20 A V 4.0 V 5.0 X X X X

API® Coryne V 3.0 V 4.0 X X X -

API® Campy V 2.1 V 3.0 X - X -

API® Listeria V 1.2 V 2.0 - X X -

API® NH V 3.0 V 4.0 X X X -

API® 50 CHB V 4.0 V 4.1 X - - -

API® 50 CHE V 3.1 V 3.2 X - - -

API® 50 CHL V 5.1 V 5.2 X X - -

ID 32 E V 3.0 V 4.0 X - X X

Rapid ID 32 E V 3.1 V 4.0 X - X X

ID 32 STAPH V 2.1 V 3.0 X X X X

Rapid ID 32
V 3.0 V 4.0 X X X X
STREP
ID 32 C V 3.0 V 4.0 X X X X

Rapid ID 32 A V 3.2 V 3.3 X - - -

ID 32 GN V 3.1 V 3.2 X - - -

Rappels
Soit Vx.y la version d'une base de données :

- Si x est modifié, il s’agit d’une modification majeure de base de données, avec au


moins une modification de pourcentage, ajout ou suppression de taxon.
- Si y est modifié, il s’agit d’une modification mineure de base de données, liée à une
modification des thesaurus généraux (= fichiers) qui régissent l’ensemble des bases
de données. Les pourcentages des bases de données ne sont pas affectés, mais les
noms des germes, tests, ou intitulés de notes peuvent avoir changé.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 2


3. Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Abio.defectiva Abiotrophia defectiva API® 20 Strep ‐ rapid ID 32 Strep


Achro.denitrificans Achromobacter denitrificans API® 20 NE - ID 32 GN
Achro.xylosoxidans Achromobacter xylosoxidans API® 20 NE - ID 32 GN
Aci./Moraxella spp Acinetobacter/Moraxella spp ID 32 E
Aci./Pseudomonas spp Acinetobacter/Pseudomonas spp RapiD 20 ETM ‐ rapid ID 32 E
Aci.baumannii Acinetobacter baumannii API® 20 E ‐ API® 20 NE ‐ ID 32 E ‐ API® 10 S - ID 32 GN

Aci.baumannii/calco. Acinetobacter baumannii/calcoaceticus API 20 E™ ‐ API® 20 NE

Aci.calcoaceticus Acinetobacter calcoaceticus API 20 E™ ‐ API® 20 NE


Aci.haemolyticus Acinetobacter haemolyticus API® 20 NE - ID 32 GN
Aci.johnsonii Acinetobacter johnsonii API® 20 NE - ID 32 GN
Aci.junii Acinetobacter junii API® 20 NE - ID 32 GN
Aci.junii/johnsonii Acinetobacter junii/johnsonii API® 20 NE
Aci.lwoffii Acinetobacter lwoffii API® 20 NE - ID 32 GN
Aci.radioresistens Acinetobacter radioresistens API® 20 NE
Acinetobacter spp Acinetobacter spp RapiD 20 ETM ‐ ID 32 E
Act.pleuropneumoniae Actinobacillus pleuropneumoniae API® NH
Actino.israelii Actinomyces israelii rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
Actino.meyeri Actinomyces meyeri rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
Actino.meyeri/odont. Actinomyces meyeri/odontolyticus API® 20 A
Actino.naeslundii Actinomyces naeslundii rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
Actino.neuii anit. Actinomyces neuii ssp anitratus API® Coryne
Actino.neuii neuii Actinomyces neuii ssp neuii API® Coryne
Actino.odontolyticus Actinomyces odontolyticus rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
Actino.radingae Actinomyces radingae API® Coryne
Actino.turicensis Actinomyces turicensis API® Coryne
Actino.viscosus Actinomyces viscosus rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
API 20 E™ ‐ API® 20 NE ‐ API® 50 CHE – ID 32 E ‐
Aer.caviae Aeromonas caviae
rapid ID 32 E – ID 32 GN
Aer.hydro./caviae Aeromonas hydrophila/caviae API® 20 NE ‐ rapid ID 32 E – ID 32 GN
API 20 E™ ‐ RapiD 20 ETM ‐ API® 20 NE ‐ API® 50 CHE ‐
Aer.hydrophila Aeromonas hydrophila
ID 32 E ‐ API® 10 S ‐ rapid ID 32 E – ID 32 GN
Aer.hydrophila gr. Aeromonas hydrophila/caviae/sobria API 20 E™ ‐ ID 32 E
Aer.salm.achro. Aeromonas salmonicida ssp achromogenes API® 20 NE
Aer.salm.mas./achro. Aeromonas salmonicida masoucida/achromogenes API® 20 NE
Aer.salm.masoucida Aeromonas salmonicida ssp masoucida API® 20 NE
Aer.salm.salmonicida Aeromonas salmonicida ssp salmonicida API 20 E™ ‐ API® 20 NE ‐ API® 50 CHE – ID 32 GN
API 20 E™ ‐ API® 20 NE ‐ API® 50 CHE - ID 32 E ‐
Aer.sobria Aeromonas sobria
rapid ID 32 E – ID 32 GN
Aerc.urinae Aerococcus urinae API® 20 Strep ‐ rapid ID 32 STREP
API® 50 CHL ‐ ID 32 STAPH ‐ API® 20 Strep ‐
Aerc.viridans Aerococcus viridans
rapid ID 32 STREP

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 3


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Ag.actinomycetem. Aggregatibacter actinomycetemcomitans API® NH


Ag.aphrophilus Aggregatibacter aphrophilus API® NH
Alc.faecalis Alcaligenes faecalis API® 20 NE – ID 32 GN
Alcaligenes spp Alcaligenes spp API 20 E™ ‐ ID 32 E
Alloiococcus otitis Alloiococcus otitis API® 20 Strep ‐ rapid ID 32 STREP
Anaerob.succiniprod. Anaerobiospirillum succiniciproducens rapid ID 32 A
Anaeroc.prevotii Anaerococcus prevotii rapid ID 32 A ‐ API® 20 A
Aneur.aneurinilytic. Aneurinibacillus aneurinilyticus API® 50 CHB
Arcano.haemolyticum Arcanobacterium haemolyticum API® Coryne
Arco.cryaerophilus Arcobacter cryaerophilus API® Campy
Arthrobacter spp Arthrobacter spp API® Coryne
Avi.paragallinarum Avibacterium paragallinarum API® NH
B.amyloliquefaciens Bacillus amyloliquefaciens API® 50 CHB
B.anthracis Bacillus anthracis API® 50 CHB
B.badius Bacillus badius API® 50 CHB
B.cereus Bacillus cereus API® 50 CHB
B.circulans Bacillus circulans API® 50 CHB
B.coagulans Bacillus coagulans API® 50 CHB
B.firmus Bacillus firmus API® 50 CHB
B.lentus Bacillus lentus API® 50 CHB
B.licheniformis Bacillus licheniformis API® 50 CHB
B.megaterium Bacillus megaterium API® 50 CHB
B.mycoides Bacillus mycoides API® 50 CHB
B.pumilus Bacillus pumilus API® 50 CHB
B.smithii Bacillus smithii API® 50 CHB
B.subtilis Bacillus subtilis API® 50 CHB
B.subtilis/B.amylol. Bacillus subtilis/amyloliquefaciens API® 50 CHB
B.thuringiensis Bacillus thuringiensis API® 50 CHB
Bac.caccae Bacteroides caccae rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.eggerthii Bacteroides eggerthii rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.fragilis Bacteroides fragilis rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.ovatus Bacteroides ovatus rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.ovatus/thetaio. Bacteroides ovatus/thetaiotaomicron API® 20 A
Bac.ster./eggerthii Bacteroides stercoris/eggerthii API® 20 A
Bac.stercoris Bacteroides stercoris rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.thetaiotaomicron Bacteroides thetaiotaomicron rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.uniformis Bacteroides uniformis rapid ID 32 A - API® 20 A
Bac.vulgatus Bacteroides vulgatus rapid ID 32 A - API® 20 A
Bacillus non react. Bacillus non reactive API® 50 CHB
Bergeyella zoohelcum Bergeyella zoohelcum API® 20 NE - ID 32 E
Bib.trehalosi Bibersteinia trehalosi API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Bif.adolescentis Bifidobacterium adolescentis rapid ID 32 A - API® 20 A

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 4


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Bif.bifidum Bifidobacterium bifidum rapid ID 32 A - API® 20 A


Bif.breve Bifidobacterium breve rapid ID 32 A - API® 20 A
Bif.dentium Bifidobacterium dentium API® 20 A
Bif.longum Bifidobacterium longum rapid ID 32 A
Bifidobacterium spp Bifidobacterium spp rapid ID 32 A - API® 20 A
Bord./Alc./M.spp Bordetella/Alcaligenes/Moraxella spp API 20 E™
Bord.avium Bordetella avium API® 20 NE
Bord.bronchiseptica Bordetella bronchiseptica API® 20 NE- ID 32 E - ID 32 GN
Bordetella spp Bordetella spp API 20 E™
Brev.dim./O.urethr. Brevundimonas diminuta/Oligella urethralis API® 20 NE
Brev.diminuta Brevundimonas diminuta API® 20 NE - ID 32 GN
Brev.vesicularis Brevundimonas vesicularis API® 20 NE - ID 32 GN
Brevi.agri Brevibacillus agri API® 50 CHB
Brevi.borstelensis Brevibacillus borstelensis API® 50 CHB
Brevi.brevis Brevibacillus brevis API® 50 CHB
Brevi.centrosporus Brevibacillus centrosporus API® 50 CHB
Brevi.choshinensis Brevibacillus choshinensis API® 50 CHB
Brevi.laterosporus Brevibacillus laterosporus API® 50 CHB
Brevi.non reactive Brevibacillus non reactive API® 50 CHB
Brevibac.casei Brevibacterium casei API® Coryne
Brevibac.epidermidis Brevibacterium epidermidis API® Coryne
Brevibacterium spp Brevibacterium spp API® Coryne
Brocho.thermosphacta Brochothrix thermosphacta API® 50 CHL
Brucella spp Brucella spp API 20 E™
Budvicia aquatica Budvicia aquatica ID 32 E - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - ID 32 E -
Burkhol.cepacia Burkholderia cepacia
ID 32 GN
Burkhol.gladioli Burkholderia gladioli API® 20 NE
Burkhol.pseudomallei Burkholderia pseudomallei API® 20 NE - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Buttiaux.agrestis Buttiauxella agrestis
rapid ID 32 E - ID 32 GN
C.albicans Candida albicans ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.boidinii Candida boidinii ID 32 C - API® 20 C AUX
C.catenulata Candida catenulata ID 32 C
C.ciferrii Candida ciferrii ID 32 C - API® 20 C AUX
C.colliculosa Candida colliculosa ID 32 C - API® 20 C AUX
C.dattila Candida dattila ID 32 C
C.dubliniensis Candida dubliniensis ID 32 C - API® 20 C AUX
C.famata Candida famata ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.glabrata Candida glabrata ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.globosa Candida globosa ID 32 C
C.guilliermondii Candida guilliermondii ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.hellenica Candida hellenica ID 32 C
C.holmii Candida holmii ID 32 C

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 5


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

C.incons./norvegen. Candida inconspicua/norvegensis ID 32 C


C.inconspicua Candida inconspicua ID 32 C - API® CANDIDA- API® 20 C AUX
C.intermedia Candida intermedia ID 32 C
C.kefyr Candida kefyr ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.krusei Candida krusei ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.krusei/inconspicua Candida krusei/inconspicua API® 20 C AUX
C.lambica Candida lambica ID 32 C - API® 20 C AUX
C.lipolytica Candida lipolytica ID 32 C - API® 20 C AUX
C.lusitaniae Candida lusitaniae ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.magnoliae Candida magnoliae ID 32 C - API® 20 C AUX
C.melibiosica Candida melibiosica ID 32 C
C.membranifaciens Candida membranifaciens ID 32 C
C.norvegensis Candida norvegensis ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.norvegica Candida norvegica ID 32 C
C.parapsilosis Candida parapsilosis ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.pelliculosa Candida pelliculosa ID 32 C - API® 20 C AUX
C.pulcherrima Candida pulcherrima ID 32 C
C.rugosa Candida rugosa ID 32 C - API® 20 C AUX
C.sake Candida sake ID 32 C
C.silvicola Candida silvicola ID 32 C
C.spherica Candida spherica ID 32 C - API® 20 C AUX
C.thermophila Candida thermophila API® 20 C AUX
C.tropicalis Candida tropicalis ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
C.utilis Candida utilis ID 32 C - API® 20 C AUX
C.valida Candida valida ID 32 C
C.zeylanoides Candida zeylanoides ID 32 C - API® 20 C AUX
Camp.coli Campylobacter coli API® Campy
Camp.fetus fetus Campylobacter fetus ssp fetus API® Campy
Camp.fetus vener. Campylobacter fetus ssp venerealis API® Campy
Camp.hyointestinalis Campylobacter hyointestinalis API® Campy
Camp.jejuni doylei Campylobacter jejuni ssp doylei API® Campy
Camp.jejuni jejuni Campylobacter jejuni ssp jejuni API® Campy
Camp.lari Campylobacter lari API® Campy
Camp.lari UPTC Campylobacter lari UPTC API® Campy
Camp.mucosalis Campylobacter mucosalis API® Campy
Camp.sput.bubulus Campylobacter sputorum ssp bubulus API® Campy
Camp.sput.Fecalis Campylobacter sputorum bv Fecalis API® Campy
Camp.sput.Sput. Campylobacter sputorum bv Sputorum API® Campy
Camp.upsaliensis Campylobacter upsaliensis API® Campy
Camp.ureolyticus Campylobacter ureolyticus rapid ID 32 A - API® 20 A
Capno.gingivalis Capnocytophaga gingivalis rapid ID 32 A
Capno.ochracea Capnocytophaga ochracea rapid ID 32 A - API® 20 A

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 6


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Capno.sputigena Capnocytophaga sputigena rapid ID 32 A


Capnocytophaga spp Capnocytophaga spp rapid ID 32 A - API® 20 A
Carno.divergens Carnobacterium divergens API® 50 CHL
Carno.maltaromaticum Carnobacterium maltaromaticum API® 50 CHL
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Ced.davisae Cedecea davisae
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - ID 32 E - rapid ID 32 E - ID 32
Ced.lapagei Cedecea lapagei
GN
Ced.lapagei/neteri Cedecea lapagei/neteri API 50 CHE
Ced.neteri Cedecea neteri RapiD 20 ETM - ID 32 E - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Cedecea spp Cedecea spp RAPID 20 ETM - ID 32 GN
Cellulom./Micro.spp Cellulomonas spp/Microbacterium spp API® Coryne
Cellulomonas spp Cellulomonas spp API® Coryne
Cellulosi.cellulans Cellulosimicrobium cellulans API® Coryne
Chromo.violaceum Chromobacterium violaceum API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 GN
Chryse.indologenes Chryseobacterium indologenes API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Citro.ama./farmeri Citrobacter amalonaticus/farmeri RapiD 20 ETM - ID 32 E - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Citro.amalonaticus Citrobacter amalonaticus
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Citro.braakii Citrobacter braakii API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E - API® 10 S
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Citro.farmeri Citrobacter farmeri
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Citro.freundii Citrobacter freundii API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E - API® 10 S
Citro.freundii group Citrobacter freundii group RAPID 20 ETM - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Citro.kos./farmeri Citrobacter koseri/farmeri API 20 E™
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Citro.koseri Citrobacter koseri
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Citro.koseri/ama. Citrobacter koseri/amalonaticus API 20 E™ - API® 10 S
Citro.sedlakii Citrobacter sedlakii API 20 E™ - ID 32 E
Citro.youngae Citrobacter youngae API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E
Cl.acetobutylicum Clostridium acetobutylicum rapid ID 32 A
Cl.baratii Clostridium baratii rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.beijer./butyricum Clostridium beijerinckii/butyricum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.beijerinckii Clostridium beijerinckii rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.bifermentans Clostridium bifermentans rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.botulinum Clostridium botulinum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.botulinum/sporo. Clostridium botulinum/sporogenes API® 20 A
Cl.butyricum Clostridium butyricum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.cadaveris Clostridium cadaveris rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.clostridioforme Clostridium clostridioforme rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.difficile Clostridium difficile rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.fallax Clostridium fallax rapid ID 32 A
Cl.glycolicum Clostridium glycolicum rapid ID 32 A
Cl.histolyticum Clostridium histolyticum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.innocuum Clostridium innocuum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.limosum Clostridium limosum API® 20 A

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 7


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Cl.paraputrificum Clostridium paraputrificum rapid ID 32 A - API® 20 A


Cl.perfringens Clostridium perfringens rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.ramosum Clostridium ramosum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.septicum Clostridium septicum rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.sordellii Clostridium sordellii rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.sporogenes Clostridium sporogenes rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.subterminale Clostridium subterminale rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.tertium Clostridium tertium rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.tetani Clostridium tetani rapid ID 32 A - API® 20 A
Cl.tyrobutyricum Clostridium tyrobutyricum rapid ID 32 A
Clostridium spp Clostridium spp API® 20 A
Collin.aerofaciens Collinsella aerofaciens API® 20 A
Com.testo./Ps.alcal. Comamonas testosteroni/Pseudomonas alcaligenes API® 20 NE
Com.testosteroni Comamonas testosteroni API® 20 NE - ID 32 GN
Comamonas spp Comamonas spp ID 32 E
Coryn.accolens Corynebacterium accolens API® Coryne
Coryn.aferm./coyleae Corynebacterium afermentans/coyleae API® Coryne
Coryn.afermentans Corynebacterium afermentans API® Coryne
Coryn.amycolatum Corynebacterium amycolatum API® Coryne
Coryn.argentorat. Corynebacterium argentoratense API® Coryne
Coryn.auris Corynebacterium auris API® Coryne
Coryn.auris/Tur.oti. Corynebacterium auris/Turicella otitidis API® Coryne
Coryn.bovis Corynebacterium bovis API® Coryne
Coryn.coyleae Corynebacterium coyleae API® Coryne
Coryn.cystitidis Corynebacterium cystitidis API® Coryne
Coryn.diph.belfanti Corynebacterium diphtheriae biotype belfanti API® Coryne
Coryn.diph.gravis Corynebacterium diphtheriae biotype gravis API® Coryne
Coryn.diph.inter. Corynebacterium diphtheriae biotype intermedius API® Coryne
Coryn.diph.mit./bel. Corynebacterium diphtheriae mitis/belfanti API® Coryne
Coryn.diph.mitis Corynebacterium diphtheriae biotype mitis API® Coryne
Coryn.glucuronolyt. Corynebacterium glucuronolyticum API® Coryne
Coryn.group F-1 Corynebacterium group F-1 API® Coryne
Coryn.group G Corynebacterium group G API® Coryne
Coryn.jeikeium Corynebacterium jeikeium API® Coryne
Coryn.kutscheri Corynebacterium kutscheri API® Coryne
Coryn.macginleyi Corynebacterium macginleyi API® Coryne
Coryn.minutissimum Corynebacterium minutissimum API® Coryne
Coryn.pilosum Corynebacterium pilosum API® Coryne
Coryn.propinquum Corynebacterium propinquum API® Coryne
Coryn.pseudodipht. Corynebacterium pseudodiphtheriticum API® Coryne
Coryn.pseudotuber. Corynebacterium pseudotuberculosis API® Coryne
Coryn.renale Corynebacterium renale API® Coryne

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 8


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Coryn.renale group Corynebacterium renale group API® Coryne


Coryn.seminale Corynebacterium seminale (C.glucuronolyticum) API® Coryne
Coryn.striat./amyc. Corynebacterium striatum/amycolatum API® Coryne
Coryn.striatum Corynebacterium striatum API® Coryne
Coryn.ulcerans Corynebacterium ulcerans API® Coryne
Coryn.urealyticum Corynebacterium urealyticum API® Coryne
Cro.dub.dublinensis Cronobacter dublinensis ssp dublinensis API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
Cro.dub.lactaridi Cronobacter dublinensis ssp lactaridi ID 32 E - rapid ID 32 E
Cro.dub.lausannensis Cronobacter dublinensis ssp lausannensis API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
Cro.dublinensis Cronobacter dublinensis API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
Cro.malonaticus Cronobacter malonaticus API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
Cro.muytjensii Cronobacter muytjensii API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - ID 32 E - API® 10 S -
Cro.sakazakii Cronobacter sakazakii
rapid ID 32 E
Cro.sakazakii group Cronobacter sakazakii group API 20 E™
Cro.turicensis Cronobacter turicensis API 20 E™ - ID 32 E - rapid ID 32 E
Cronobacter spp Cronobacter spp API 20 E™ - API 50 CHE - ID 32 GN
Crypto.albidus Cryptococcus albidus ID 32 C - API® 20 C AUX
Crypto.curvatus Cryptococcus curvatus ID 32 C
Crypto.humicola Cryptococcus humicola ID 32 C - API® 20 C AUX
Crypto.laurentii Cryptococcus laurentii ID 32 C - API® 20 C AUX
Crypto.neoformans Cryptococcus neoformans ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
Crypto.terreus Cryptococcus terreus ID 32 C - API® 20 C AUX
Crypto.uniguttulatus Cryptococcus uniguttulatus ID 32 C - API® 20 C AUX
Cup.pauculus Cupriavidus pauculus API® 20 NE - ID 32 GN
Delftia acidovorans Delftia acidovorans API® 20 NE - ID 32 GN
Derma.nishinomiyaen. Dermacoccus nishinomiyaensis API® Staph - ID 32 STAPH
Dermabacter hominis Dermabacter hominis API® Coryne
Dietzia spp Dietzia spp API® Coryne
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E –
Edwardsiel.hoshinae Edwardsiella hoshinae
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Edwardsiel.tarda Edwardsiella tarda
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN

Eggerthella lenta Eggerthella lenta rapid ID 32 A - API® 20 A


Eikenella corrodens Eikenella corrodens API 20 E™ - API® 20 NE
Eliz.meningosept. Elizabethkingia meningoseptica API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Emp.brevis Empedobacter brevis API® 20 NE - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Ent.aerogenes Enterobacter aerogenes
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E - API® 10 S -
Ent.amnigenus Enterobacter amnigenus
rapid ID 32 E - ID 32 GN
Ent.asburiae Enterobacter asburiae API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Ent.cancerogenus Enterobacter cancerogenus
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Ent.cloacae Enterobacter cloacae
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 9


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -


Ent.gergoviae Enterobacter gergoviae
rapid ID 32 E - ID 32 GN
Ent.sp/Ecoli/Shi.son Enterobacter spp/E.coli/Shigella sonnei API® 10 S
Entero.avium Enterococcus avium API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.casseliflavus Enterococcus casseliflavus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.cecorum Enterococcus cecorum rapid ID 32 STREP
Entero.durans Enterococcus durans API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.faecalis Enterococcus faecalis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.faecium Enterococcus faecium API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.gallinarum Enterococcus gallinarum API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Entero.hirae Enterococcus hirae rapid ID 32 STREP
Entero.saccharolyt. Enterococcus saccharolyticus rapid ID 32 STREP
Enterobacter spp Enterobacter spp API® 10 S
Erwinia spp Erwinia spp API 20 E™ - API 50 CHE
Erysi.rhusiopathiae Erysipelothrix rhusiopathiae API® Coryne - rapid ID 32 STREP
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Esch.coli Escherichia coli
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Esch.fergusonii Escherichia fergusonii
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Esch.hermannii Escherichia hermannii
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Esch.vulneris Escherichia vulneris
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Eubac.limosum Eubacterium limosum rapid ID 32 A - API® 20 A
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Ewingella americana Ewingella americana
rapid ID 32 E - ID 32 GN
Finegoldia magna Finegoldia magna rapid ID 32 A - API® 20 A
Fuso.mortiferum Fusobacterium mortiferum rapid ID 32 A - API® 20 A
Fuso.necro./nucleat. Fusobacterium necrophorum/nucleatum API® 20 A
Fuso.necro.fundulif. Fusobacterium necrophorum ssp funduliforme API® 20 A
Fuso.necro.necropho. Fusobacterium necrophorum ssp necrophorum API® 20 A
Fuso.necrogenes Fusobacterium necrogenes rapid ID 32 A
Fuso.necrophorum Fusobacterium necrophorum rapid ID 32 A - API® 20 A
Fuso.nucleatum Fusobacterium nucleatum rapid ID 32 A - API® 20 A
Fuso.varium Fusobacterium varium rapid ID 32 A - API® 20 A
G.candidum Geotrichum candidum ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
G.fermentans Geotrichum fermentans ID 32 C
G.klebahnii Geotrichum klebahnii ID 32 C - API® 20 C AUX
Gardnerel.vaginalis Gardnerella vaginalis API® Coryne - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Gem.haemolysans Gemella haemolysans API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
rapid ID 32 A - API® 20 A - API® 20 STREP -
Gem.morbillorum Gemella morbillorum
rapid ID 32 STREP
Geo.stearothermoph. Geobacillus stearothermophilus API® 50 CHB
Geo.thermoglucosid. Geobacillus thermoglucosidasius API® 50 CHB
Geotrichum spp Geotrichum spp ID 32 C
Globi.sanguinis Globicatella sanguinis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Gordonia spp Gordonia spp API® Coryne

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 10


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Granuli.adiacens Granulicatella adiacens API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP


Grimontia hollisae Grimontia hollisae API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE
H.influenzae Haemophilus influenzae API® NH
H.influenzae I Haemophilus influenzae biotype I API® NH
H.influenzae II Haemophilus influenzae biotype II API® NH
H.influenzae III Haemophilus influenzae biotype III API® NH
H.influenzae IV Haemophilus influenzae biotype IV API® NH
H.influenzae V Haemophilus influenzae biotype V API® NH
H.influenzae VI Haemophilus influenzae biotype VI API® NH
H.influenzae VII Haemophilus influenzae biotype VII API® NH
H.influenzae VIII Haemophilus influenzae biotype VIII API® NH
H.parainfluenzae Haemophilus parainfluenzae API® NH
H.parainfluenzae I Haemophilus parainfluenzae biotype I API® NH
H.parainfluenzae II Haemophilus parainfluenzae biotype II API® NH
H.parainfluenzae III Haemophilus parainfluenzae biotype III API® NH
H.parainfluenzae IV Haemophilus parainfluenzae biotype IV API® NH
H.parainfluenzae VI Haemophilus parainfluenzae biotype VI API® NH
H.parainfluenzae VII Haemophilus parainfluenzae biotype VII API® NH
H.parainflu.VIII Haemophilus parainfluenzae biotype VIII API® NH
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Hafnia alvei Hafnia alvei
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
Helico.cinaedi Helicobacter cinaedi API® Campy
Helico.fennelliae Helicobacter fennelliae API® Campy
Helico.pylori Helicobacter pylori API® Campy
Histophilus somni Histophilus somni API® NH
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
K.oxytoca Klebsiella oxytoca
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
K.pneum.ozaenae Klebsiella pneumoniae ssp ozaenae
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
K.pneum.pneumoniae Klebsiella pneumoniae ssp pneumoniae
API® 10 S - rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
K.pneum.rhinosclero. Klebsiella pneumoniae ssp rhinoscleromatis
rapid ID 32 E - ID 32 GN
Kl.apis/apiculata Kloeckera apis/apiculata ID 32 C
Kloeckera apiculata Kloeckera apiculata ID 32 C - API® 20 C AUX
Kloeckera apis Kloeckera apis ID 32 C - API® 20 C AUX
Kloeckera japonica Kloeckera japonica ID 32 C - API® 20 C AUX
Kloeckera spp Kloeckera spp API® 20 C AUX
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Kluy.ascorbata Kluyvera ascorbata
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - ID 32 E -
Kluy.cryocrescens Kluyvera cryocrescens
rapid ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E - rapid ID 32 E -
Kluy.intermedia Kluyvera intermedia
ID 32 GN
Kluyvera spp Kluyvera spp API 20 E™ - RapiD 20 ETM
Koc.varians/rosea Kocuria varians/rosea API® Staph
Kocuria kristinae Kocuria kristinae API® Staph - ID 32 STAPH
Kocuria rosea Kocuria rosea API® Staph - ID 32 STAPH

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 11


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Kocuria varians Kocuria varians API® Staph - ID 32 STAPH


Kodamaea ohmeri Kodamaea ohmeri ID 32 C - API® 20 C AUX
Kytococ.sedentarius Kytococcus sedentarius API® Staph
Lac.kluyverii Lachancea kluyverii ID 32 C
Lacto.acid./jense. Lactobacillus acidophilus/jensenii API® 20 A
Lacto.acidophilus Lactobacillus acidophilus rapid ID 32 A - API® 20 A - API® 50 CHL
Lacto.brevis Lactobacillus brevis API® 50 CHL
Lacto.buchneri Lactobacillus buchneri API® 50 CHL
Lacto.casei Lactobacillus casei API® 50 CHL
Lacto.collinoides Lactobacillus collinoides API® 50 CHL
Lacto.coprophilus Lactobacillus coprophilus(Wei.confusa) API® 50 CHL
Lacto.crispatus Lactobacillus crispatus API® 50 CHL
Lacto.curvatus Lactobacillus curvatus API® 50 CHL
Lacto.delb.bulgar. Lactobacillus delbrueckii ssp bulgaricus API® 50 CHL
Lacto.delb.delb. Lactobacillus delbrueckii ssp delbrueckii API® 50 CHL
Lacto.delb.lactis Lactobacillus delbrueckii ssp lactis API® 50 CHL
Lacto.fermentum Lactobacillus fermentum API® 50 CHL
Lacto.fructivorans Lactobacillus fructivorans API® 50 CHL
Lacto.helveticus Lactobacillus helveticus API® 50 CHL
Lacto.jensenii Lactobacillus jensenii API® 20 A
Lacto.lindneri Lactobacillus lindneri API® 50 CHL
Lacto.para.paracasei Lactobacillus paracasei ssp paracasei API® 50 CHL
Lacto.pentosus Lactobacillus pentosus API® 50 CHL
Lacto.plantarum Lactobacillus plantarum API® 50 CHL
Lacto.rhamnosus Lactobacillus rhamnosus API® 50 CHL
Lacto.salivarius Lactobacillus salivarius API® 50 CHL
Lc.garvieae Lactococcus garvieae rapid ID 32 STREP
Lc.lactis cremoris Lactococcus lactis ssp cremoris API® 50 CHL - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Lc.lactis hordniae Lactococcus lactis ssp hordniae API® 50 CHL
Lc.lactis lactis Lactococcus lactis ssp lactis API® 50 CHL - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Lc.raffinolactis Lactococcus raffinolactis API® 50 CHL - rapid ID 32 STREP
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Lecl.adecarboxylata Leclercia adecarboxylata
ID 32 E - ID 32 GN
Leif.aquatica Leifsonia aquatica API® Coryne
Lepto.buccalis Leptotrichia buccalis rapid ID 32 A
Leuco.citreum Leuconostoc citreum API® 50 CHL
Leuco.lactis Leuconostoc lactis API® 50 CHL
Leuco.mes.dext. Leuconostoc mesenteroides ssp dextranicum API® 50 CHL
Leuconostoc mesenteroides ssp
Leuco.mes.mes./dext. API® 50 CHL
mesenteroides/dextranicum
Leuco.mesen.cremoris Leuconostoc mesenteroides ssp cremoris API® 50 CHL
Leuco.mesen.mesen. Leuconostoc mesenteroides ssp mesenteroides API® 50 CHL
Leuconostoc spp Leuconostoc spp API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Lind.saturnus Lindnera saturnus ID 32 C

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 12


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

List.grayi Listeria grayi API® Coryne - API® Listeria - rapid ID 32 STREP


API® Coryne - API® Listeria - API® 20 STREP -
List.innocua Listeria innocua
rapid ID 32 STREP
API® Coryne - API® Listeria - API® 20 STREP -
List.ivanovii Listeria ivanovii
rapid ID 32 STREP
List.monocy./innocua Listeria monocytogenes/innocua API® Coryne
API® Coryne - API® Listeria - API® 20 STREP -
List.monocytogenes Listeria monocytogenes
rapid ID 32 STREP
API® Coryne - API® Listeria - API® 20 STREP -
List.seeligeri Listeria seeligeri
rapid ID 32 STREP
API® Coryne - API® Listeria - API® 20 STREP -
List.welshimeri Listeria welshimeri
rapid ID 32 STREP
Listeria spp Listeria spp API® Coryne - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Lys.fusiformis Lysinibacillus fusiformis API® 50 CHB
Lys.sphaericus Lysinibacillus sphaericus API® 50 CHB
M.(Bran.)catarrhalis Moraxella (Branhamella) catarrhalis API® NH
M.lacunata Moraxella lacunata API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
M.nonliquefaciens Moraxella nonliquefaciens API® 20 NE - ID 32 GN
M.osloensis Moraxella osloensis API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
Mann.haem./Bib.treh. Mannheimia haemolytica/Bibersteinia trehalosi API® 20 NE - ID 32 E
Mann.haemolytica Mannheimia haemolytica API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Methylo.mesophilicum Methylobacterium mesophilicum API® 20 NE - ID 32 GN
Mic.luteus Micrococcus luteus API® Staph - ID 32 STAPH
Mic.lylae Micrococcus lylae API® Staph - ID 32 STAPH
Microbacterium spp Microbacterium spp API® Coryne
Micrococcus spp Micrococcus spp API® Staph
Millerozyma farinosa Millerozyma farinosa ID 32 C
Mobi.curtisii Mobiluncus curtisii rapid ID 32 A
Mobi.mulieris Mobiluncus mulieris rapid ID 32 A
Mobiluncus spp Mobiluncus spp rapid ID 32 A
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Moell.wisconsensis Moellerella wisconsensis
ID 32 E - ID 32 GN
Moraxella spp Moraxella spp API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Morg.morg.morganii Morganella morganii ssp morganii API® 50 CHE - ID 32 E
Morg.morg.sibonii Morganella morganii ssp sibonii API® 50 CHE
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - ID 32 E - API® 10 S -
Morg.morganii Morganella morganii
rapid ID 32 E - ID 32 GN
Myroides /Chrys.ind. Myroides spp/Chryseobacterium indologenes API 20 E™
Myroides spp Myroides spp API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
Neis.animaloris/zoo. Neisseria animaloris/zoodegmatis API® 20 NE
Neis.cinerea Neisseria cinerea API® NH
Neis.gonorrhoeae Neisseria gonorrhoeae API® NH
Neis.lactamica Neisseria lactamica API® NH
Neis.meningitidis Neisseria meningitidis API® NH
Neis.mucosa Neisseria mucosa API® NH
Neis.polysaccharea Neisseria polysaccharea API® NH
Neis.sicca Neisseria sicca API® NH

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 13


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Neis.subflava Neisseria subflava API® NH


Neisseria spp Neisseria spp API® NH
Nocardia spp Nocardia spp API® Coryne
Non-fermenter spp Non-fermenter spp API 20 E™
Ochrobac.anthropi Ochrobactrum anthropi API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
Oerskovia turbata Oerskovia turbata API® Coryne
Oligella spp Oligella spp ID 32 GN
Oligella ureolytica Oligella ureolytica API® 20 NE - ID 32 GN
Oligella urethralis Oligella urethralis API® 20 NE - ID 32 GN
Pae.alvei Paenibacillus alvei API® 50 CHB
Pae.amylolyticus Paenibacillus amylolyticus API® 50 CHB
Pae.glucanolytic. Paenibacillus glucanolyticus API® 50 CHB
Pae.lautus Paenibacillus lautus API® 50 CHB
Pae.macerans Paenibacillus macerans API® 50 CHB
Pae.pabuli Paenibacillus pabuli API® 50 CHB
Pae.polymyxa Paenibacillus polymyxa API® 50 CHB
Pae.thiaminolyt. Paenibacillus thiaminolyticus API® 50 CHB
Pae.validus Paenibacillus validus API® 50 CHB
Pantoea agglomerans Pantoea agglomerans API® 50 CHE
Pantoea dispersa Pantoea dispersa API® 50 CHE
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Pantoea spp Pantoea spp
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Parab.distasonis Parabacteroides distasonis rapid ID 32 A - API® 20 A
Parab.merdae Parabacteroides merdae rapid ID 32 A
Parvimonas micra Parvimonas micra rapid ID 32 A - API® 20 A
Past.aerogenes Pasteurella aerogenes API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Past.multocida Pasteurella multocida API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Past.pne./Mann.haem. Pasteurella pneumotropica/Mannheimia haemolytica API 20 E™
Past.pneumotropica Pasteurella pneumotropica API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E
Pecto.atrosepticum Pectobacterium atrosepticum rapid ID 32 E - ID 32 E
Pecto.betavasculorum Pectobacterium betavasculorum rapid ID 32 E - ID 32 E
Pecto.carot.carot. Pectobacterium carotovorum ssp carotovorum rapid ID 32 E - ID 32 E
Pecto.carotovorum Pectobacterium carotovorum rapid ID 32 E - ID 32 E
Pedio.acidilactici Pediococcus acidilactici API® 50 CHL
Pedio.damnosus Pediococcus damnosus API® 50 CHL
Pedio.pentosaceus Pediococcus pentosaceus API® 50 CHL
Pediococcus spp Pediococcus spp API® 50 CHL
Peptococcus niger Peptococcus niger API® 20 A
Peptoni.asacchar. Peptoniphilus asaccharolyticus rapid ID 32 A - API® 20 A
Peptoni.indolicus Peptoniphilus indolicus rapid ID 32 A - API® 20 A
Peptostrepto.group Peptostreptococcus group API® 20 A
Photo.dam.damselae Photobacterium damselae ssp damselae ID 32 E
Photo.dam.piscicida Photobacterium damselae ssp piscicida ID 32 E

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 14


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -


Photo.damselae Photobacterium damselae
ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
Plesio.shigelloides Plesiomonas shigelloides
rapid ID 32 E - ID 32 E - API® 10 S ID 32 GN
Por.asaccharolytica Porphyromonas asaccharolytica rapid ID 32 A - API® 20 A
Por.endodontalis Porphyromonas endodontalis rapid ID 32 A
Por.gingivalis Porphyromonas gingivalis rapid ID 32 A
Prev.bivia Prevotella bivia rapid ID 32 A - API® 20 A
Prev.buccae Prevotella buccae rapid ID 32 A
Prev.buccalis Prevotella buccalis rapid ID 32 A
Prev.denticola Prevotella denticola rapid ID 32 A
Prev.disiens Prevotella disiens rapid ID 32 A - API® 20 A
Prev.interm./disiens Prevotella intermedia/disiens API® 20 A
Prev.intermedia Prevotella intermedia rapid ID 32 A - API® 20 A
Prev.loescheii Prevotella loescheii rapid ID 32 A
Prev.melani./oralis Prevotella melaninogenica/oralis API® 20 A
Prev.melaninogenica Prevotella melaninogenica rapid ID 32 A - API® 20 A
Prev.oralis Prevotella oralis rapid ID 32 A - API® 20 A
Pri.carsonii Priceomyces carsonii ID 32 C
Pro.wickerhamii Prototheca wickerhamii ID 32 C - API® 20 C AUX
Prop.acnes Propionibacterium acnes rapid ID 32 A - API® 20 A - API® Coryne
Prop.avidum Propionibacterium avidum API® 20 A - API® Coryne
Prop.granulosum Propionibacterium granulosum rapid ID 32 A - API® 20 A
Prop.prop./avid. Propionibacterium propionicum/avidum API® 20 A
Prop.propionicum Propionibacterium propionicum rapid ID 32 A - API® 20 A
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Proteus mirabilis Proteus mirabilis
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Proteus penneri Proteus penneri
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Proteus vulgaris gr. Proteus vulgaris group
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Prov.alcal./rustig. Providencia alcalifaciens/rustigianii API 20 E™
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Prov.alcalifaciens Providencia alcalifaciens
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Prov.rettgeri Providencia rettgeri
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Prov.rustigianii Providencia rustigianii API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Prov.stuartii Providencia stuartii
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Prov.stuartii/alcal. Providencia stuartii/alcalifaciens API® 10 S
Ps.aer./fluo./putida Pseudomonas aeruginosa/fluorescens/putida API® 10 S
Ps.aeruginosa Pseudomonas aeruginosa API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Ps.alcaligenes Pseudomonas alcaligenes API® 20 NE - ID 32 GN
Ps.fluoresc./putida Pseudomonas fluorescens/putida API 20 E™
Ps.fluorescens Pseudomonas fluorescens API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Ps.luteola Pseudomonas luteola API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 GN
Ps.mendocina Pseudomonas mendocina API® 20 NE - ID 32 GN
Ps.oleovorans Pseudomonas oleovorans API® 20 NE

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 15


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Ps.oryzihabitans Pseudomonas oryzihabitans API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 GN


Ps.putida Pseudomonas putida API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Ps.stutzeri Pseudomonas stutzeri API® 20 NE - ID 32 GN
Pseudomonas spp Pseudomonas spp ID 32 E - API® 10 S
Pseudomonas/Com.spp Pseudomonas/Comamonas spp ID 32 E
Psflav.capillosus Pseudoflavonifractor capillosus rapid ID 32 A
Pstr.anaerobius Peptostreptococcus anaerobius rapid ID 32 A - API® 20 A
Psychro.phenylpyr. Psychrobacter phenylpyruvicus API® 20 NE - ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E –
Rahnella aquatilis Rahnella aquatilis
ID 32 GN
Ralst.pickettii Ralstonia pickettii API® 20 NE - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Raou.ornithinolytica Raoultella ornithinolytica
ID 32 E - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Raou.planticola Raoultella planticola
ID 32 E - ID 32 GN
Raoultella spp Raoultella spp ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Raou.terrigena Raoultella terrigena
ID 32 E - ID 32 GN
Rhodo.glutinis Rhodotorula glutinis ID 32 C - API® 20 C AUX
Rhodo.minuta Rhodotorula minuta ID 32 C - API® 20 C AUX
Rhodo.mucilaginosa Rhodotorula mucilaginosa ID 32 C - API® 20 C AUX
Rhodoc.equi Rhodococcus equi API® Coryne
Rhodococcus spp Rhodococcus spp API® Coryne
Rothia dentocariosa Rothia dentocariosa API® Coryne
Rothia mucilaginosa Rothia mucilaginosa API® Staph - ID 32 STAPH
Rzb.radiobacter Rhizobium radiobacter API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
S.putrefaciens gr. Shewanella putrefaciens group API 20 E™ - API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Saccharo.cerevisiae Saccharomyces cerevisiae ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Salm.enter.arizonae Salmonella enterica ssp arizonae
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Salm.enter.enterica Salmonella enterica ssp enterica
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Salm.Enteritidis Salmonella ser.Enteritidis API 20 E™
Salm.Gallinarum Salmonella ser.Gallinarum API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - API® 10 S
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Salm.Paratyphi A Salmonella ser.Paratyphi A
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Salm.Paratyphi B Salmonella ser.Paratyphi B API 20 E™
Salm.Pullorum Salmonella ser.Pullorum API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - API® 10 S
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Salm.Typhi Salmonella ser.Typhi
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Salm.Typhimurium Salmonella ser.Typhimurium API 20 E™ - API® 50 CHE
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Salmonella spp Salmonella spp
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Sap.capitata Saprochaete capitata ID 32 C - API® CANDIDA - API® 20 C AUX
Sch.etch./Pri.carso. Schwanniomyces etchellsii/Priceomyces carsonii ID 32 C
Sch.etchelsii Schwanniomyces etchellsii ID 32 C
Sch.polymorphus Schwanniomyces polymorphus ID 32 C
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.ficaria Serratia ficaria
ID 32 E - ID 32 GN

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 16


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -


Ser.fonticola Serratia fonticola
ID 32 E - ID 32 GN
Ser.grimesii Serratia grimesii rapid ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.liquefaciens Serratia liquefaciens
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Ser.liquef./plymuth. Serratia liquefaciens/plymuthica ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.marcescens Serratia marcescens
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.odorifera Serratia odorifera
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.plymuthica Serratia plymuthica
ID 32 E - ID 32 GN
Ser.proteamaculans Serratia proteamaculans API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Ser.rubidaea Serratia rubidaea
ID 32 E - ID 32 GN
Shigella boydii Shigella boydii API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E
Shigella dysenteriae Shigella dysenteriae API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E
Shigella flexneri Shigella flexneri API 20 E™ - API® 50 CHE - ID 32 E
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Shigella sonnei Shigella sonnei
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - rapid ID 32 E - ID 32 E -
Shigella spp Shigella spp
API® 10 S - ID 32 GN
Sphingo.multivorum Sphingobacterium multivorum API® 20 NE - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Sphingo.spiritivorum Sphingobacterium spiritivorum API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
Sphmon.paucimobilis Sphingomonas paucimobilis API® 20 NE - ID 32 E - ID 32 GN
Sporo.salmonicolor Sporobolomyces salmonicolor ID 32 C - API® 20 C AUX
Staph.arlettae Staphylococcus arlettae ID 32 STAPH
Staph.aureus Staphylococcus aureus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.auricularis Staphylococcus auricularis API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.capitis Staphylococcus capitis API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.caprae Staphylococcus caprae API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.carnosus Staphylococcus carnosus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.chromogenes Staphylococcus chromogenes API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.cohnii cohnii Staphylococcus cohnii ssp cohnii API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.cohnii ureal. Staphylococcus cohnii ssp urealyticus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.epidermidis Staphylococcus epidermidis API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.equorum Staphylococcus equorum ID 32 STAPH
Staph.gallinarum Staphylococcus gallinarum ID 32 STAPH
Staph.haemolyticus Staphylococcus haemolyticus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.hominis Staphylococcus hominis API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.hyicus Staphylococcus hyicus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.intermedius Staphylococcus intermedius API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.kloosii Staphylococcus kloosii ID 32 STAPH
Staph.lentus Staphylococcus lentus API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.lugdunensis Staphylococcus lugdunensis API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.pseudintermed. Staphylococcus pseudintermedius ID 32 STAPH
Staph.saccharolytic. Staphylococcus saccharolyticus API® 20 A
Staph.saprophyticus Staphylococcus saprophyticus API® Staph - ID 32 STAPH

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 17


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Staph.schleiferi Staphylococcus schleiferi API® Staph - ID 32 STAPH


Staph.sciuri Staphylococcus sciuri API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.simulans Staphylococcus simulans API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.warneri Staphylococcus warneri API® Staph - ID 32 STAPH
Staph.xylosus Staphylococcus xylosus API® Staph - ID 32 STAPH
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - ID 32 E -
Steno.maltophilia Stenotrophomonas maltophilia
API® 10 S - ID 32 GN
Str.acidominimus Streptococcus acidominimus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.agalactiae Streptococcus agalactiae API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.alactolyticus Streptococcus alactolyticus rapid ID 32 STREP
Str.anginosus Streptococcus anginosus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.bovis Streptococcus bovis rapid ID 32 STREP
Str.canis Streptococcus canis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.const.const. Streptococcus constellatus ssp constellatus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.const.pharyngis Streptococcus constellatus ssp pharyngis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.constellatus Streptococcus constellatus API® 20 A - rapid ID 32 STREP
Str.downei Streptococcus downei rapid ID 32 STREP
Str.downei/sobrinus Streptococcus downei/sobrinus rapid ID 32 STREP
Str.dys.dysgalactiae Streptococcus dysgalactiae ssp dysgalactiae API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.dys.equisimilis Streptococcus dysgalactiae ssp equisimilis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.equi equi Streptococcus equi ssp equi API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.equi zooepidem. Streptococcus equi ssp zooepidemicus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.equinus Streptococcus equinus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.gal.gallolyticus Streptococcus gallolyticus ssp gallolyticus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.gal.pasteurianus Streptococcus gallolyticus ssp pasteurianus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.gordonii Streptococcus gordonii rapid ID 32 STREP
Str.group L Streptococcus group L API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.infant.coli Streptococcus infantarius ssp coli (Str.lutetiensis) API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.infant.infant. Streptococcus infantarius ssp infantarius API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.intermedius Streptococcus intermedius API® 20 A - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.mitis Streptococcus mitis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.mutans Streptococcus mutans API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.oralis Streptococcus oralis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.parasanguinis Streptococcus parasanguinis rapid ID 32 STREP
Str.pluranimalium Streptococcus pluranimalium API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.pneumoniae Streptococcus pneumoniae API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.porcinus Streptococcus porcinus API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.pyogenes Streptococcus pyogenes API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.sal.salivarius Streptococcus salivarius ssp salivarius API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.sal.thermophilus Streptococcus salivarius ssp thermophilus API® 50 CHL - API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.sanguinis Streptococcus sanguinis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.sobrinus Streptococcus sobrinus rapid ID 32 STREP
Str.suis I Streptococcus suis I API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 18


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

Str.suis II Streptococcus suis II API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP


Str.uberis Streptococcus uberis API® 20 STREP - rapid ID 32 STREP
Str.vestibularis Streptococcus vestibularis rapid ID 32 STREP
Tatumella ptyseos Tatumella ptyseos rapid ID 32 E
Tetragen.halophilus Tetragenococcus halophilus API® 50 CHL
Tricho.asahii Trichosporon asahii ID 32 C - API® 20 C AUX
Tricho.asteroides Trichosporon asteroides ID 32 C
Tricho.inkin Trichosporon inkin ID 32 C - API® 20 C AUX
Tricho.mucoides Trichosporon mucoides ID 32 C - API® 20 C AUX
Tricho.ovoides Trichosporon ovoides ID 32 C
Trichosporon spp Trichosporon spp API® CANDIDA
Truep.bernardiae Trueperella bernardiae API® Coryne
Truep.pyogenes Trueperella pyogenes API® Coryne
Turicella otitidis Turicella otitidis API® Coryne
V.algino./parahae. Vibrio alginolyticus/parahaemolyticus API® 10 S
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.alginolyticus Vibrio alginolyticus
rapid ID 32 E - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.cholerae Vibrio cholerae
rapid ID 32 E - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - RapiD 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.fluvialis Vibrio fluvialis
rapid ID 32 E - ID 32 E
V.metschnikovii Vibrio metschnikovii API® 20 NE - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E
API 20 E™ - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.mimicus Vibrio mimicus
ID 32 E
API 20 E™ - RAPID 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.parahaemolyticus Vibrio parahaemolyticus
rapid ID 32 E - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
V.vuln./cholerae Vibrio vulnificus/cholerae API® 10 S
API 20 E™ - RAPID 20 ETM - API® 20 NE - API® 50 CHE -
V.vulnificus Vibrio vulnificus
rapid ID 32 E - ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Veillonella parvula Veillonella parvula API® 20 A
Veillonella spp Veillonella spp rapid ID 32 A
Virgi.pantothenticus Virgibacillus pantothenticus API® 50 CHB
W.virosa Weeksella virosa API® 20 NE - ID 32 E
W.virosa/Ber.zoohel. Weeksella virosa/Bergeyella zoohelcum ID 32 E
W.virosa/Emp.brevis Weeksella virosa/Empedobacter brevis API® 20 NE
Weis.confusa Weissella confusa API® 50 CHL
Weis.viridescens Weissella viridescens API® 50 CHL
Xantho.campestris Xanthomonas campestris ID 32 GN
Y.aldovae Yersinia aldovae API® 50 CHE - ID 32 GN
API 20 E™ - RAPID 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -
Y.enterocolitica Yersinia enterocolitica
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
Y.frederik./interm. Yersinia frederiksenii/intermedia API 20 E™
API 20 E™ - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E -
Y.frederiksenii Yersinia frederiksenii
ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E -
Y.intermedia Yersinia intermedia
ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E -
Y.kristensenii Yersinia kristensenii
ID 32 GN
Y.pestis Yersinia pestis API 20 E™ - RAPID 20 ETM - API 50 CHE

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 19


Liste des taxons

Taxon court Taxon Galerie concernée (base de données)

API 20 E™ - RAPID 20 ETM - API® 50 CHE - rapid ID 32 E -


Y.pseudotuberculosis Yersinia pseudotuberculosis
ID 32 E - API® 10 S - ID 32 GN
API 20 E™ - API® 50 CHE - rapid ID 32 E - ID 32 E -
Y.ruckeri Yersinia ruckeri
ID 32 GN

Zygosacch.spp Zygosaccharomyces spp ID 32 C

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 20


4. Liste des tests complémentaires

L'origine du test complémentaire provient :

- de la littérature : les numéros indiqués renvoient aux articles bibliographiques


mentionnant les résultats obtenus avec ces tests (Voir Annexe A),
- de la base de données d'un autre système d'identification (ex : test « X »).

Ce tableau présente les abréviations des tests complémentaires (en anglais


uniquement).

Veuillez consulter l'Annexe D-1 (anglais, français, chinois, danois, allemand, grec,
hongrois, italien) et l'Annexe D-2 (japonais, coréen, polonais, portugais, russe, espagnol,
suédois) pour les tableaux d'équivalence avec les abréviations traduites des tests
complémentaires disponibles dans le logiciel.

Abréviations Signification Galeries Origine du test

API® 20 A
αFUC alpha Fucosidase rapid ID 32 A test
rapid ID 32 A
αGAL alpha Galactosidase rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
αMAL alpha Maltosidase ID 32 E ID 32 E test
API® 20 A rapid ID 32 A test
ßGAL bêta Galactosidase
API® Staph 19
API® Staph
ßGLU bêta Glucosidase ID 32 STAPH 19
API® 20 STREP
ßGP bêta Galactosidase 6 Phosphatase API® 20 A rapid ID 32 A test
API® Staph ID 32 STAPH test
ßGUR bêta Glucuronidase
ID 32 E ID 32 E test
α-HEM Hémolyse alpha API® 20 A 7, 19
API® 20 A 7, 19
ß-HEM Hémolyse bêta
rapid ID 32 STREP 19, 34, 35
ßMAN bêta Mannosidase rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test
RapiD 20 ETM
API® 20 NE
Résistance à l'agent vibriostatique API 20 E™
0/129 R 16
O/129 rapid ID 32 E
ID 32 E
ID 32 GN
rapid ID 32 STREP 17, 19, 34, 35
10 °C Test de croissance à 10 °C
API® 20 Strep 19, 34, 35
ID 32 STAPH
15 °C Test de croissance à 15 °C API® Staph 19
API® 50 CHL
25 °C Test de croissance à 25 °C API® Campy 3, 13, 20
30 °C Test de croissance à 30 °C ID 32 C 2
ID 32 C
37 °C Test de croissance à 37 °C API® 20 C AUX 2
API® Candida
40 % BILE Croissance en présence de 40 % de bile API® 20 Strep 19, 34, 35

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 21


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

40 °C Test de croissance à 40 °C ID 32 C 2
API 20 E™ 9, 10, 28
API® 20 NE 9, 10, 28
42 °C Test de croissance à 42 °C API® Coryne 9, 10
ID 32 E 9, 10
ID 32 GN 9, 10, 28
44 °C Test de croissance à 44 °C API® 20 NE 4
API® 50 CHL 19
45 °C Test de croissance à 45 °C API® 20 Strep 19, 34, 35
rapid ID 32 STREP 17, 19, 34, 35
5KG 5-céto-gluconate API 20 E™ 28
ACTIDION.R Résistance à la cycloheximide API® 20 C AUX 2
rapid ID 32 E API 20 E™ Test
ADH Arginine dihydrolase API® 50 CHB API 20 E™ Test
API® 20 A rapid ID 32 A Test
API 20 E™ 5
ADONITOL Adonitol (acidification) ID 32 E ID 32 E test
ID 32 GN 5
ADONITOLa Adonitol (assimilation) ID 32 C 2
AEROBIC Gr Croissance en aérobiose API® Campy 3, 13, 20
Test de croissance sur gélose nutritive à
AGAR 35 °C API® NH 1
35 °C
Croissance en anaérobiose avec
ANA+TMAO API® Campy 3, 13, 20
triméthylamine N-oxyde (à 1 %)
ANAEROB.Gr Croissance en anaérobiose API® Campy 3, 13, 20
rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test
lARABINOSE L‐Arabinose (acidification)
rapid ID 32 A 7, 14, 19
RapiD 20 ETM
dARABITOL D‐Arabitol (acidification) rapid ID 32 E 5
rapid ID 32 STREP
ARBUTINa Arbutine (assimilation) ID 32 C 2
rapid ID 32 STREP 11, 17, 19
ARBUTIN Arbutine (acidification)
API® 20 Strep 19, 28
ArgA Arginine‐arylamidase API® Staph ID 32 STAPH test
ARTS Arthrospores API® Candida 21, 2
rapid ID 32 E
API 20 E™
ASCORBATE ASCORBATE (acidification) 12
RapiD 20 ETM
ID 32 GN
AspA L‐Aspartate arylamidase ID 32 E ID 32 E test
lASNa L‐Asparagine (assimilation) API® Coryne 24
CADAVER.a Cadavérine (assimilation) ID 32 C 2
rapid ID 32 STREP 19, 34, 35
CAMP(S.au) CAMP test à Staphylococcus aureus API® 20 Strep 19, 34, 35
API® Coryne 15
CASEINhyd. Caséine (hydrolyse) API® Coryne 19, 25, 30
rapid ID 32 A
API® 50 CHL
CATALASE Catalase 19
ID 32 STAPH
API® NH
CDEX Cyclodextrine (acidification) rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 22


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

API® 20 NE 10
rapid ID 32 A 19
API 20 E™ 5
dCELLOBIO. D‐Cellobiose (acidification)
ID 32 E ID 32 E test
ID 32 STAPH ID 32 STAPH test
ID 32 GN 5, 10
CFTR R Résistance à la céfalotine API® Campy 3, 13, 20
CHEESE SM. Odeur de fromage API® Coryne 30
CHLS Chlamydospores API® Candida 21, 2
CITRATE Citrate (utilisation) API® 50 CHB API 20 E™ test
CITRATEa Citrate (assimilation) ID 32 C 2
rapid ID 32 A
COAGULASE Coagulase API® Staph 19
ID 32 STAPH
rapid ID 32 A
COCCI Cocci API® Staph 19
API® 20 Strep
COL.>1mm Diamètre des colonies > 1mm API® Coryne 19, 23, 26, 27, 30, 31
ID 32 STAPH
COL.>5mm Diamètre des colonies > 5 mm 19
API® Staph
rapid ID 32 STREP 11, 19, 34, 35
DEXTRAN Production de dextrane
API® 20 Strep 19, 34, 35
RapiD 20 ETM 5
rapid ID 32 E 5
DésoxyriboNucleAse (Production de API 20 E™ 5
DNAse
DNase) API® 20 NE 9
ID 32 E 12
ID 32 GN 5
API® Staph
DNAse H.ST DNase thermostable 19
ID 32 STAPH
rapid ID 32 E 5
DULCITOL Dulcitol (acidification)
ID 32 E 12
ERYTHRITa Érythritol (assimilation) API® 20 C AUX 2
API® 20 C AUX ID 32 C test
ID 32 C ID 32 C test
API 20 E™ 5
ESC (HYD.) Esculine (hydrolyse) rapid ID 32 A 19
ID 32 E 12, 38
API® 20 NE API® 20 NE test
ID 32 GN 5
rapid ID 32 A
dFRUCTOSE Fructose (acidification) 19
API® Coryne
API® 20 NE
dFRUCTOSEa Fructose (assimilation) 10
ID 32 GN
ID 32 STAPH
dGALACTOSE Galactose (acidification) 19
API® Staph
GDC Glutamate décarboxylase rapid ID 32 A rapid ID 32 A test
rapid ID 32 A 19
GELATINE Hydrolyse de la gélatine
API® 50 CHB API 20 E™ test
GGA Acide glutamyl-glutamique Arylamidase rapid ID 32 A rapid ID 32 A test
API® 20 C AUX 2
GLN Glucosamine (assimilation)
ID 32 C ID 32 C test
rapid ID 32 A 19
dGLUCOSE D‐Glucose (acidification)
ID 32 C ID 32 C test
dGLUCOSEa D‐Glucose (assimilation) API 20 E™ 9

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 23


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

GLUCOSEac Glucose (acidification) API® 20 C AUX 2


rapid ID 32 E 5
RapiD 20 ETM 5
API® 20 NE 9
Glucose (fermentation avec production
GLUCOSEg API 20 E™ 9
de gaz)
API® 50 CHL 19
ID 32 E 12
ID 32 GN 9
GlyA Glycine arylamidase API® 20 A rapid ID 32 A test
RapiD 20 E TM
5
API 20 E™
5
GLYCEROL Glycérol (acidification) rapid ID 32 STREP
17, 19, 34, 37, 35
API® 20 Strep
19, 34, 37, 35
ID 32 GN
Croissance en présence de 1 % de
GLYCINE 1 % API® Campy 3, 13, 20
glycine
GLYCOGEN Glycogène (acidification) API® 20 A 7, 12, 19
Croissance en bouillon GMB
GMB API® 20 A 7
(Glucose‐sels minéraux Biotine)
GRAM Coloration de Gram rapid ID 32 A 19
Glucuronate (assimilation) API® 20 C AUX 2
GRT
Glucuronate (acidification) rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
RapiD 20 ETM 5
H2S Production de H2S
API® 50 CHB API 20 E™ test
Lyse par le phage spécifique de Hafnia RapiD 20 ETM
HAFNIA Ph 12
alvei ID 32 GN
API® 20 NE 9
rapid ID 32 A 19
HEMOLYSIS Hémolyse
API® Coryne 15, 19, 30
ID 32 GN 9
API® Coryne 19
HIPPURATE Hippurate (hydrolyse)
API® 20 A 19
HisA Histidine arylamidase rapid ID 32 A rapid ID 32 A test
ID 32 C 2
HYPH/PH Formation d'hyphes ou pseudo‐hyphes
API® Candida 2
IDP Indoxyl phosphate rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
API® NH 1
INDOLE Production d'indole
API® CHB API 20 E™ test
INOSITOL Myo‐inositol (assimilation) ID 32 C ID 32 C test
INULIN Inuline (acidification) rapid ID 32 STREP 32, 36, 37, 35
dlLACTATEa Lactate (assimilation) API® 20 C AUX 2

Lactose (acidification) API 20 E™ 5


RapiD 20 ETM 5
LACTOSE
ID 32 C ID 32 C test
Lactose (assimilation) ID 32 GN 5
LDC Lysine décarboxylase API® 50 CHB API 20 E™ test
API® 20 NE 9
API® 20 A 7, 14, 19
LECITHIN. Lécithinase (sur gélose à l'œuf)
rapid ID 32 A 19
ID 32 GN 9
LeuA Leucine arylamidase API® 20 A rapid ID 32 A test
rapid ID 32 STREP 11, 19, 34, 35
LEVAN Production de lévane
API® 20 Strep 19, 34, 35
LIPASE Lipase API® 20 A 7, 14, 19 , 33

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 24


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

LIPOPHILY Lipophilie API® Coryne 19, 30


LSTR R Résistance à la lysostaphine ID 32 STAPH 19
lLYSINEa L‐Lysine (assimilation) ID 32 C 2
API® Staph
LYSOZYME R Lysozyme (résistance) 19
ID 32 STAPH
Méthyl‐β‐D‐Glucopyranoside
MßDG rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test
(acidification)
API® 20 NE 9, 10 , 28
MAC CONKEY Croissance sur milieu de MacConkey API 20 E™ API 20 E™ test
ID 32 GN 9, 10 , 28
MALONATE Malonate (acidification) ID 32 E ID 32 E test
rapid ID 32 A 19
RapiD 20 ETM 5
dMALTOSE D‐Maltose (acidification)
API® 20 NE 9
rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
dMANNOSEa D‐Mannose (assimilation) API® Coryne 24
dMANNITOL D‐Mannitol (assimilation) ID 32 C ID 32 C test
dMANNITOLa Mannitol (assimilation) API® 20 C AUX 2
dMANNOSE D‐Mannose (acidification) rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
API 20 E™ 5
MDG alpha méthyl‐D‐Glucoside (acidification) API® 20 Strep 18,34,35
ID 32 GN 5
dMELa D‐Mélibiose (assimilation) API® 20 C AUX 2
dMELIBIOSE D‐Mélibiose (acidification) ID 32 C 2
API 20 E™ 5
Acidification du glucose révélée par le
METHYL RED rapid ID 32 E 5
rouge de méthyle
ID 32 E 12
API® 20 Strep
MILK(A) Lait (acidification) 18, 34, 35
rapid ID 32 STREP
MILK(C) Lait (coagulation) API® 20 A 7, 14, 19
MILK(D) Lait (digestion) API® 20 A 7, 14, 19
API® 20 Strep 11, 17, 19 , 28, 34, 35
dMLZ D‐Mélézitose (acidification) ID 32 STAPH 11, 17, 19
ID 32 E 12
dMLZa D‐Mélézitose (assimilation) API® Candida ID 32 C test
API® Coryne 8 , 19
RapiD 20 ETM 5
rapid ID 32 E 5
API® 20 NE 9, 10
MOTILITY Mobilité API 20 E™ 28, API 20 E™ test
API® 20 A 7, 14, 19
rapid ID 32 A 19
ID 32 E 12
ID 32 GN 9, 10
Présence d'un mycélium aérien
MYCELIUM API® Coryne 19 , 28
macroscopique
NaCl 0 % Croissance sans NaCl API® Coryne 8
Croissance en présence de 1,5 % de
NaCl 1.5 % API® Campy 3, 13, 20
NaCl
RapiD 20 ETM 10
NaCl 10 % Croissance en présence de 10 % de NaCl rapid ID 32 E 10
ID 32 E 1, 12

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 25


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

Croissance en présence de 3,5 % de


NaCl 3.5 % API® Campy 3, 13, 20
NaCl
API® 20 Strep 19
API® 20 NE 9
NaCl 4 % Croissance en présence de 4 % de NaCl
API 20 E™ 9
ID 32 GN 9
NaCl 6 % Croissance en présence de 6 % de NaCl API® Coryne 8
Croissance en présence de 6,5 % de API® 20 Strep 19, 34, 35
NaCl 6.5 %
NaCl rapid ID 32 STREP 11, 17, 19, 34, 35
Croissance en présence de 7,5 % de
NaCl 7.5 % ID 32 STAPH 19
NaCl
API® Coryne 29 , 31
NAGa N‐acétyl‐Glucosamine (assimilation)
API® Candida ID 32 C test
ID 32 C
NITRATEa Nitrate (assimilation) 2
API® 20 C AUX
rapid ID 32 STREP 19
NO2-->N2 Réduction des nitrites en azote API® 20 Strep 19
API® NH 1, 12
API® 20 NE 19, API 20 E™ test
NO3-->N2 Réduction des nitrates en azote
API 20 E™ 9, 10, 28
API® Campy 3, 13, 20
API® 20 A 7, 14, 19
API® 20 Strep 19
NO3-->NO2 Réduction des nitrates en nitrites API® NH 1, 12
API 20 E™ API 20 E™ test
API® 20 NE 9, 10, 28
ID 32 GN 19, API 20 E™ test
API® 20 A 1, 19
NO3 (RED.) Réduction du nitrate API® NH 1, 19
API® 50 CHB API 20 E™ test
NOVO R Novobiocine (résistance) API® Staph 19
API® Staph ID 32 STAPH test
ODC Ornithine Décarboxylase API® NH 12
API® 50 CHB API 20 E™ test
API® Coryne 8 , 28 , 29
OF/F Fermentation du glucose RapiD 20 ETM API 20 E™ test
API 20 E™ API 20 E™ test
API® 20 NE
OF/O Oxydation du glucose API 20 E™ API 20 E™ test
ID 32 GN
API® 50 CHB
ONPG bêta Galactosidase API 20 E™ test
API® 10 S
rapid ID 32 STREP 19, 34
OPTOCHIN R Résistance à l'optochine
API® 20 Strep 1, 19, 34
API® Staph 19
ID 32 STAPH 19
OXIDASE Oxydase ID 32 E 12
API® NH 12
rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
PACa Phényl acétate (assimilation) API® Coryne 29, 31
PALATINOSE Palatinose (acidification) ID 32 E ID 32 E test
pH 5.4 Croissance à pH = 5,4 API® Coryne 19
API® 20 Strep
pH 9.6 Croissance à pH = 9,6 19, 34, 35
rapid ID 32 STREP
API® 20 NE 4
PHEa Phénylalanine (assimilation)
ID 32 GN 4
PINK Pigment (rose) API® Coryne 15 , 28

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 26


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

POLYSACCH. Production de polysaccharides API® NH 1


ProA Proaline arylamidase API® 20 A rapid ID 32 A test
PYGBILE Croissance dans le milieu PYG-Bile API® 20 A 7, 14
dRAFa D‐Raffinose (assimilation) API® Candida 22
dRAFFINOSE D‐Raffinose (acidification) rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
API® Staph
RED Pigment (rouge) 19
ID 32 STAPH
rapid ID 32 STREP 19
lRHAMNOSE L‐Rhamnose (acidification)
API® 20 Strep 19, 34, 35
lRHAMNOSEa L‐Rhamnose (assimilation) API® 20 C AUX 2
rapid ID 32 A 19
dRIBOSE D‐Ribose (acidification) API® Staph 19
ID 32 STAPH ID 32 STAPH test
dRIBOSEa D‐Ribose (assimilation) API® 20 C AUX 2
API® 20 Strep 19, 34, 35, 36, 37
rapid ID 32 A 19
SALICIN Salicine (acidification) rapid ID 32 E 5
rapid ID 32 STREP 11, 17, 19, 36, 37
ID 32 E 12
SerA Sérine arylamidase rapid ID 32 A rapid ID 32 A test
dSORBITOL D‐Sorbitol (acidification) ID 32 E ID 32 E test
API® 20 NE
dSORBITOLa D‐Sorbitol (assimilation) 9
API® Candida
lSORBOSE L‐Sorbose (assimilation) ID 32 C ID 32 C test
lSORBOSEa L‐Sorbose (assimilation) API® Candida 22
SPORE Spores rapid ID 32 A 19
SPORE ST Spores subterminales API® 20 A 7, 14, 19
SPORE T Spores terminales API® 20 A 7, 14, 19
rapid ID 32 A 19
STAR.(HYD) Amidon (hydrolyse)
API® 20 A 7
API® 20 NE 12
SUCROSE Sucrose (acidification) API® Coryne 25, 30
rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test
SUCROSEa Sucrose (assimilation) API® 20 NE 9
dTAGATOSE D‐Tagatose (acidification) rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test
TDA Tryptophane désaminase API® 50 CHB API 20 E™ test
ID 32 C
THIAMIN Croissance sans thiamine 2
API® 20 C AUX
API® Coryne 19
rapid ID 32 A 19
dTREHALOSE D‐Trehalose (acidification) API 20 E™ 19, 5
rapid ID 32 E rapid ID 32 E test
ID 32 GN 19, 5
dTURANOSE D-Turanose (acidification) API® Staph ID 32 STAPH test
API® 20 NE 9
API 20 E™ 9
Tween 80 Production de lipase
API® Coryne 15 , 19 , 28
ID 32 GN 9
API® NH 12
URE Uréase API® 50 CHB API 20 E™ test
rapid ID 32 STREP rapid ID 32 STREP test

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 27


Liste des tests complémentaires

Abréviations Signification Galeries Origine du test

V FACTOR Besoin en Facteur V (NAD) API® NH 12


VITAMIN Croissance sans vitamines ID 32 C 2
API® Coryne 15
VP Voges Proskauer
API® 50 CHB API 20 E™ test
X FACTOR Besoin en Facteur X (Hémine) API® NH 12
ID 32 STAPH 19
API 20 E™ 5
rapid ID 32 E 5
dXYLOSE D‐Xylose (acidification)
API® 20 NE 9
ID 32 E 12
ID 32 GN 5
API 20 E™ 5
RapiD 20 ETM 5
rapid ID 32 E 5
API® 50 CHL 19
ID 32 STAPH 19
API® 20 Strep 19, 34, 35
YELLOW Pigment (jaune)
API® Staph 19, 34, 35
API® 20 NE 9
rapid ID 32 STREP 17, 19
ID 32 E 6, 12
API® NH 1, 12
ID 32 GN 5

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 28


5. Liste des notes

Pour le détail des modifications des notes, se référer au chapitre 6 Description de la Base de connaissances.

rapid ID 32 STREP
API® 20 C AUX
API® 20 Strep
API® Candida
rapid ID 32 A
RapiD 20 ETM

rapid ID 32 E

API® Listeria
ID 32 STAPH
API® 50 CHE

API® Coryne

API® 50 CHB
API® 50 CHL

API® Campy
API® 20 NE
API® Staph
API 20 E™

API® 20 A

API® 10 S

ID 32 GN
API® NH
ID 32 C

ID 32 E
Notes

Vérifier la catalase/Possibilité de Aggrega.actinomycetem. X

Confirmer par Camp test la possibilité de List.monocytogenes X

Confirmer par des tests sérologiques X X X X X X X X X

Confirmer tests séro./Espèce hautement pathogène X X X X X X X

Confirmer tests séro./Espèce pathogène critique X

Confirmer tests séro./Possibilité de Ser.liquefaciens X

Confirmer tests séro./Possibilité de Shigella sonnei X

Espèce Pathogène critique X

Possibilité de Gordonia ou Dietzia ouNocardia X

Espèce hautement pathogène/Non valide avant 48 h X


Esp. hautement pathogène/Confirmer par des tests sérol./Pos.
X
Salm.Gallinarum
Espèce hautement pathogène X X X X X X X X

Id. non valide avant 24 h/Possibilité de Gem.morbillorum X

Id. non valide avant 24 h/Possibilité de Str.pneumoniae X

Id. non valide avant 24 h/Possibilité de Str.saliv.thermophilus X

Id. non valide avant 24 h X

Id. non valide avant 48 h/Confirmer par des tests sérologiques X

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de T.asteroides ou ovoides X

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 29


Liste des notes

rapid ID 32 STREP
API® 20 C AUX
API® 20 Strep
API® Candida
rapid ID 32 A
RapiD 20 ETM

rapid ID 32 E

API® Listeria
ID 32 STAPH
API® 50 CHE

API® Coryne

API® 50 CHB
API® 50 CHL

API® Campy
API® 20 NE
API® Staph
API 20 E™

API® 20 A

API® 10 S

ID 32 GN
API® NH
ID 32 C

ID 32 E
Notes

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de B.diminuta X

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de Brucella spp X

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de Eik.corrodens X

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de Ochrob.anthropi X

Id. non valide avant 48 h/Possibilité de Ps.oleovorans X

Id. non valide avant 48 heures X X X X

Id. non valide avant 72 h/Possibilité de C.colliculosa X

Id. non valide avant 72 heures X

Taxonomie officielle : Staph.schleiferi ssp schleiferi X


Taxonomie officielle : Ser.marcescens ssp marcescens X
Possibilité de Acinetobacter baumannii/calcoaceticus X
Possibilité de Actinomyces israelii X
Possibilité de Bacillus megaterium X
Possibilité de Bacillus thuringiensis X
Possibilité de Bibersteinia trehalosi X
Possibilité de Bordetella hinzii X
Possibilité de Brucella spp X X

Possibilité de Brucella spp ou B.diminuta/Incuber 48 h X


Possibilité de Burkholderia gladioli X
Possibilité de C.inconspicua ou C.norvegensis X

Possibilité de C.lambica ou C.lipolytica X


Possibilité de Candida famata X
Possibilité de Candida tropicalis X

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 30


Liste des notes

rapid ID 32 STREP
API® 20 C AUX
API® 20 Strep
API® Candida
rapid ID 32 A
RapiD 20 ETM

rapid ID 32 E

API® Listeria
ID 32 STAPH
API® 50 CHE

API® Coryne

API® 50 CHB
API® 50 CHL

API® Campy
API® 20 NE
API® Staph
API 20 E™

API® 20 A

API® 10 S

ID 32 GN
API® NH
ID 32 C

ID 32 E
Notes

Possibilité de Capnocytophaga spp X


Possibilité de Citrobacter sedlakii X
Possibilité de Coryn.diphtheriae intermedius X
Possibilité de Corynebacterium jeikeium X
Possibilité de Corynebacterium minutissimum X

Possibilité de Cronobacter sakazakii X X


Possibilité de Cryptococcus gattii X X
Possibilité de Dermacoccus spp ou Kytococcus spp X

Possibilité de Eikenella corrodens X


Possibilité de Elizabethkingia meningoseptica X
Possibilité de Ent.gallinarum ou Ent.casseliflavus si VancoR X
Possibilité de Enterobacter cloacae X
Possibilité de Erwinia spp X X
Possibilité de Gem.morbillorum ou Str.const.pharyngis X
Possibilité de Geotrichum candidum X
Possibilité de Lactobacillus casei X
Possibilité de Microbacterium spp X

Possibilité de Moraxella spp X


Possibilité de Myroides spp X
Possibilité de Oerskovia turbata X

Possibilité de Paenibacillus pabuli X


Possibilité de Peptococcus niger X
Possibilité de Peptoniphilus indolicus X

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 31


Liste des notes

rapid ID 32 STREP
API® 20 C AUX
API® 20 Strep
API® Candida
rapid ID 32 A
RapiD 20 ETM

rapid ID 32 E

API® Listeria
ID 32 STAPH
API® 50 CHE

API® Coryne

API® 50 CHB
API® 50 CHL

API® Campy
API® 20 NE
API® Staph
API 20 E™

API® 20 A

API® 10 S

ID 32 GN
API® NH
ID 32 C

ID 32 E
Notes

Possibilité de Pseudo.pseudomallei X
Possibilité de R.planticola ou R.terrigena X
Possibilité de Raoultella planticola X X X
Possibilité de Raoultella terrigena X
Possibilité de Rhodococcus equi X

Possibilité de Rothia mucilaginosa X


Possibilité de Saprochaete capitata X
Possibilité de Serratia ficaria X

Possibilité de Serratia grimesii X


Possibilité de Serratia marcescens X
Possibilité de Serratia proteamaculans X
Possibilité de Sphingobacterium spp X
Possibilité de Sphmon.trueperi ou adhaesiva X

Possibilité de S.intermedius si vétérinaire X


Possibilité de Staph.pseudintermedius X
Possibilité de Str.acidominimus ou Str.pluranimalium X X
Possibilité de Str.anginosus ou Str.intermedius X

Possibilité de Str.constellatus ssp pharyngis X


Possibilité de Str.mitis ou Str.parasanguinis X
Possibilité de Streptococcus mitis X

Possibilité de Streptococcus pneumoniae X


Possibilité de V.mimicus ou V.vulnificus X
Possibilité de Vibrio fluvialis X X

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 32


Liste des notes

rapid ID 32 STREP
API® 20 C AUX
API® 20 Strep
API® Candida
rapid ID 32 A
RapiD 20 ETM

rapid ID 32 E

API® Listeria
ID 32 STAPH
API® 50 CHE

API® Coryne

API® 50 CHB
API® 50 CHL

API® Campy
API® 20 NE
API® Staph
API 20 E™

API® 20 A

API® 10 S

ID 32 GN
API® NH
ID 32 C

ID 32 E
Notes

Possibilité de Yersinia enterocolitica X


Possibilité de Yersinia ruckeri X

Rhodo.: pigmentation/Possibilité de R.glutinis X

Rhodotorula : présence de pigment rouge, rose ou orange X X

Tests sérologiques et possibilité de Salm.Pullorum X

Sporobolomyces : colonies satellites (8 jours) X X

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 33


6. Description de la Base de
connaissances

API 20 E™
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API 20 E™ V4.1 (Ancienne) API 20 E™ V5.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Chryseobacterium meningosepticum Elizabethkingia meningosepticum #1

Enterobacter intermedius Kluyvera intermedia #2

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica


#3
Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae
Bibersteinia trehalosi (espèce
associée au taxon Pasteurella
Pasteurella trehalosi pneumotropica/ Mannheimia #4
haemolytica identifiable par tests
complémentaires)

Enterobacter sakazakii Cronobacter spp #5

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 34


Description de la Base de connaissances API 20 E™

Bibliographie

#1: Elizabethkingia meningoseptica


KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) and LEE (S.T.): Transfer of Chryseobacterium meningosepticum
and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and
Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.

#2: Kluyvera intermedia


PAVAN (M.E.), FRANCO (R.J.), RODRIGUEZ (J.M.), GADALETA (P.), ABBOTT (S.L.), JANDA (J.M.) and ZORZÓPULOS
(J.): Phylogenetic relationships of the genus Kluyvera: transfer of Enterobacter intermedius Izard et al. 1980 to
the genus Kluyvera as Kluyvera intermedia comb. nov. and reclassification of Kluyvera cochleae as a later
synonym of K. intermedia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 437-442.

#3: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

#4: Bibersteinia trehalosi


BLACKALL (P.J.), BOJESEN (A.M.), CHRISTENSEN (H.) and BISGAARD (M.): Reclassification of [Pasteurella]
trehalosi as Bibersteinia trehalosi gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 666-674.

#5: Cronobacter spp


IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447

Modification des notes

Type de Notes Germes concernés


modification

Klebsiella pneumoniae ssp


Ajout Possibilité de Raoultella terrigena
pneumoniae

Ajout Possibilité de Citrobacter sedlakii Citrobacter koseri/amalonaticus

Possibilité de Bibersteinia trehalosi Pasteurella pneumotropica /


Ajout
Mannheimia haemolytica

Suppression Possibilité de Klebsiella pneumoniae ssp pneumoniae Klebsiella terrigena

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 35


Description de la Base de connaissances API 20 E™

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 5 544 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 86,2 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 8,1 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 5,6 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API 20 E™ est destiné à l'identification des Enterobacteriaceae et des
bacilles à Gram négatif non fastidieux présents dans la base de données et à eux seuls.
Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes ou exclure leur présence.

Des discordances par rapport aux méthodes conventionnelles peuvent être observées.
Elles sont dues aux différences de principe des réactions utilisées en technique API®.
Des écarts de pourcentages peuvent également être observés et s'expliquent par des
variations de substrat.

Pour certaines espèces (ex. Klebsiella ou Proteus), des réactions du test glucose
initialement positives peuvent parfois devenir négatives (apparition d'une coloration bleu-
vert). Dans ce cas, cette réaction doit être considérée comme négative. Les
pourcentages indiqués dans le Tableau d'Identification prennent en compte ce genre de
phénomène.

Dans le cas d’identification à Salmonella ou Shigella ,une identification sérologique doit


être effectuée pour confirmer l’identification bactérienne.

Les bacilles à Gram négatif non fermentants, isolés de patients atteints de


mucoviscidose, peuvent générer des profils biochimiques atypiques susceptibles d’altérer
leur identification.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API 20 E™ V5.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 36


Description de la Base de connaissances RapiD 20 E™

RapiD 20 E™
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
RapiD 20 E™ V3.1 (Ancienne) RapiD 20 E™ V3.2 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Cronobacter sakazakii (espèce
associée au taxon Enterobacter
Enterobacter sakazakii #1
cloacae et identifiables à l'aide de
tests complémentaires)
Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica
#2
Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae

Bibliographie

#1 : Cronobacter spp
IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447.

#2 : Salmonella spp
TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

Modification des notes

Pas de modification

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 37


Description de la Base de connaissances RapiD 20 E™

Performances
Après 4 heures d'incubation, 2 365 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 95,52 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 2,75 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 1,73 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
La galerie RapiD 20 E™ s'applique à l'identification des Enterobacteriaceae. Quelques
autres bactéries à Gram négatif et oxydase positive ayant le double métabolisme oxydo-
fermentatif (aeromonas, Vibrio) donnent des résultats interprétables. D'une manière
générale, seules les bactéries à Gram négatif et oxydase négative devront être testées
sur cette galerie.

L'identification biochimique des Salmonella, Shigella ainsi que celle des Escherichia coli
responsables de gastroentérites devront être considérées comme présomptives et être
confirmées sérologiquement.

La galerie RapiD 20 E™ a été conçue pour l'identification des Enterobacteriaceae en


4 H - 4 H 30. Respecter le temps d'incubation.

Une dérive de méthodologie (inoculum trop faible, tubes insuffisamment ou trop remplis)
peut conduire à des résultats faussement négatifs, pouvant générer des erreurs
d’identification.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir RapiD 20 E™ V3.2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 38


Description de la Base de connaissances API® 10 S

API® 10 S
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® 10 S V3.1 (Ancienne) API® 10 S V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Chryseobacterium meningosepticum Elizabethkingia meningoseptica #1

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica


#2
Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae

Bibliographie

#1: Elizabethkingia meningoseptica:


KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) and LEE (S.T.): Transfer of Chryseobacterium meningosepticum
and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and
Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.

#2: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

Modification des notes


Type de modification Notes Germes concernés

Confirmer par tests sérologiques/Possibilité de Shigella


Ajout Salmonella Paratyphi A
sonnei

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 4 481 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 84,6 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 11,2 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 4,2 % des souches ont été mal identifiées.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 39


Description de la Base de connaissances API® 10 S

Limites du test
Le système API® 10 S est destiné à l’identification des Enterobacteriaceae et bacilles à
Gram négatif non fastidieux les plus fréquemment rencontrés dans des prélèvements sur
échantillons cliniques ou autres, et à eux seuls.

Des tests complémentaires sont parfois nécessaires pour séparer deux espèces. Pour
choisir l’une de ces espèces, il faudra tenir compte du contexte clinique ou autre, de
l’origine du prélèvement, des aspects micro et macroscopisques de la souche et
éventuellement des résultats d’autres tests, ainsi que des valeurs des pourcentages
d’identification ( % ID) et de l’indice de typicité (T) (Ex : pour un échantillon clinique, une
faible discrimination entre Escherichia coli et Serratia odorifera orientera vers Escherichia
coli, surtout si les % ID et valeur de l’indice T sont élevées et en faveur de cette espèce,
E. coli étant fréquent et S. odorifera très rare dans les échantillons cliniques). La galerie
API 20 E™peut être utilisée pour des identifications plus approfondies.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 10 S V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 40


Description de la Base de connaissances API® 20 NE

API® 20 NE
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliographi
API® 20 NE V7.1 (Ancienne) API® 20 NE V8.0 (Nouvelle)
ques (ci-
dessous)
Mannheimia haemolytica / Pasteurella trehalosi Mannheimia haemolytica / Bibersteinia trehalosi

Bibersteinia trehalosi (identifiable par tests #1


Pasteurella trehalosi
complémentaires)
#2
Chryseobacterium meningosepticum Elizabethkingia meningoseptica
#3
Wautersia paucula Cupriavidus pauculus

Neisseria animaloris / Neisseria zoodegmatis (espèces


associées au taxon Pasteurella spp identifiables par #4
CDC group EF-4
tests complémentaires)

Pseudomonas oleovorans (espèce associée au taxon


#5
Pseudomonas pseudoalcaligenes Comamonas testosteroni/Pseudo.alcaligenes
identifiable par tests complémentaires)

Bibliographie

#1: Bibersteinia trehalosi


BLACKALL (P.J.), BOJESEN (A.M.), CHRISTENSEN (H.) and BISGAARD (M.): Reclassification of [Pasteurella]
trehalosi as Bibersteinia trehalosi gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 666-674.

# 2: Elizabethkingia meningoseptica
KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) and LEE (S.T.): Transfer of Chryseobacterium meningosepticum
and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and
Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.

#3: Cupriavidus pauculus


VANDAMME (P.) and COENYE (T.): Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2004, 54, 2285-2289

#4: Neisseria animaloris/ zoodegmatis


VANDAMME (P.), HOLMES (B.), BERCOVIER (H.) and COENYE (T.): Classification of Centers for Disease Control
Group Eugonic Fermenter (EF)-4a and EF-4b as Neisseria animaloris sp. nov. and Neisseria zoodegmatis sp.
nov., respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 1801-1805

#5 : Pseudomonas oleovorans
SAHA (R.), SPRÖER (C.), BECK (B.) and BAGLEY (S.): Pseudomonas oleovorans subsp. lubricantis subsp. nov., and
reclassification of Pseudomonas pseudoalcaligenes ATCC 17440T as later synonym of Pseudomonas oleovorans
ATCC 8062T. Curr. Microbiol., 2010, 60, 294-300.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 41


Description de la Base de connaissances API® 20 NE

Modification des notes

Type de
Notes Germes concernés
modification

Possibilité de Vibrio mimicus ou Vibrio


Ajout Vibrio cholerae
vulnificus

Ajout Possibilité de Pseudo.pseudomallei Chromobacterium violaceum

Possibilité de Sphmon.trueperi ou
Ajout Sphingomonas paucimobilis
adhaesiva

Ajout Possibilité de Bordetella hinzii Bordetella avium

Suppression Possibilité de Vibrio mimicus Vibrio cholerae

Id. non valide avant 48 h/possibilité de Comamonas


Modification
Ps.oleovorans testosteroni/Ps.alcaligenes

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 4 848 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 87,4 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,3 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 8,3 % des souches ont été mal identifiées.

Après 48 heures d'incubation, 4 305 souches de diverses origines et souches de


collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 91,8 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 2,7 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 5,5 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 20 NE est destiné à l'identification des bacilles à Gram négatif non
entérobactéries et non fastidieux présents dans la base de données et à eux seuls. Il ne
peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes ou exclure leur présence.

Les bacilles à Gram négatif non fermentants, isolés de patients atteints de


mucoviscidose, peuvent générer des profils biochimiques atypiques susceptibles d’altérer
leur identification.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 20 NE V8.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 42


Description de la Base de connaissances API® Staph

API® Staph

Modifications du contenu de la Base de connaissances


Modification des taxons

Pas de modification

Modification des notes

Pas de modification

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 1689 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 88,6 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,6 % des souches n'ont pas été identifiées.
- 6,7 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® Staph est destiné à l'identification des espèces mentionnées dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® Staph V5.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 43


Description de la Base de connaissances API® 20 Strep

API® 20 Strep
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliograph
API® 20 Strep V7.0 (Ancienne) API® 20 Strep V8.0 (Nouvelle)
iques (ci-
dessous)
Streptococcus salivarius Streptococcus salivarius ssp salivarius #1

Streptococcus salivarius ssp thermophilus (espèce


Streptococcus thermophilus associée au taxon Lacto.lactis ssp cremoris identifiable #2
par tests complémentaires)

Streptococcus bovis I Streptococcus gallolyticus ssp gallolyticus

Streptococcus bovis II/1 Streptococcus infantarius ssp infantarius

Streptococcus bovis II/2 Streptococcus gallolyticus ssp pasteurianus #3

Streptococcus bovis II/3 Streptococcus infantarius ssp coli

Streptococcus bovis II/4 Streptococcus equinus 2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 44


Description de la Base de connaissances API® 20 Strep

Bibliographie

#1: Streptococcus salivarius ssp salivarius


HOWEY (R.T.), LOCK (C.M.) and MOORE (L.V.H.): Subspecies names automatically created by Rule 46. Int. J.
Syst. Bacteriol., 1990, 40, 317-319.

#2: Streptococcus salivarius ssp thermophilus


VALIDATION LIST N° 54. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 619-620. [SCHLEIFER (K.H.), EHRMANN (M.), KRUSCH
(U.) and NEVE (H.): Revival of the species Streptococcus thermophilus (ex Orla-Jensen, 1919) nom. rev. Syst.
Appl. Microbiol., 1991, 14, 386-388.]

#3 : Streptococcus bovis
Streptococcus gallolyticus ssp gallolyticus
Streptococcus gallolyticus ssp pasteurianus
Streptococcus infantarius ssp coli
Streptococcus infantarius ssp infantarius
Streptococcus equinus

SCHLEGEL (L.), GRIMONT (F.), COLLINS (M.D.), RÉGNAULT (B.), GRIMONT (P.A.D.) and BOUVET (A.):
Streptococcus infantarius sp. nov., Streptococcus infantarius subsp. infantarius subsp. nov. and Streptococcus
infantarius subsp. coli subsp. nov., isolated from humans and food. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1425-
1434. ASSOCIATE EDITOR, IJSB: Notification that new names and new combinations have appeared in volume
50, part 4, of the IJSEM. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1701-1702.

POYART (C.), QUESNE (G.) and TRIEU-CUOT (P.): Taxonomic dissection of the Streptococcus bovis group by
analysis of manganese-dependent superoxide dismutase gene (sodA) sequences: reclassification of
'Streptococcus infantarius subsp. coli' as Streptococcus lutetiensis sp. nov. and of Streptococcus bovis biotype
II.2 as Streptococcus pasteurianus sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1247-1255.

SCHLEGEL (L.), GRIMONT (F.), AGERON (E.), GRIMONT (P.A.D.) and BOUVET (A.): Reappraisal of the taxonomy
of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus complex and related species: description of Streptococcus
gallolyticus subsp. gallolyticus subsp. nov., S. gallolyticus subsp. macedonicus subsp. nov. and S. gallolyticus
subsp. pasteurianus subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 631-645.

Modification des notes

Type de modification Notes Germes concernés

Streptococcus constellatus ssp


Ajout Possibilité de Str.anginosus ou Str. Intermedius
constellatus

Suppression Taxonomie officielle : Str.gallolyticus ssp gallolyticus Streptococcus bovis I

Suppression Taxonomie officielle : Str.infantarius ssp infantarius Streptococcus bovis II / 1

Suppression Taxonomie officielle : Str.gallolyticus ssp pasteurianus Streptococcus bovis II / 2

Suppression Taxonomie officielle : Str.infantarius ssp coli Streptococcus bovis II / 3

Suppression Taxonomie officielle : Streptococcus bovis Streptococcus bovis II / 4

Suppression Taxonomie officielle : Str.constellatus ssp constellatus Streptococcus constellatus

Suppression Possibilité de Lactobacillus spp Leuconostoc spp

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 45


Description de la Base de connaissances API® 20 Strep

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 4 heures d'incubation, 1 821 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 86,2 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 6,3 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 7,5 % des souches ont été mal identifiées.

Après 24 heures d'incubation, 2 974 souches de diverses origines et souches de


collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 93,3 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 3,4 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 3,2 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 20 Strep est destiné à l'identification des espèces présentes dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 20 Strep V8.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 46


Description de la Base de connaissances API® 20 C AUX

API® 20 C AUX
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliographi
API® 20 C AUX V4.0 (Ancienne) API® 20 C AUX V5.0 (Nouvelle)
ques (ci-
dessous)
Geotricum capitatum Saprochaete capitata

Candida sphaerica Candida spherica


#1, #2, #3
Stephanoascus ciferrii Candida ciferrii

Pichia angusta Candida thermophila

Bibliographie et Nomenclature des levures

#1 : Freydiere AM.: Yeast identification in the clinical microbiology laboratory: phenotypical methods.
Medical Mycology, 2001, Vol39, (1), p9-33

#2 : Budak A.: Epidemiology of Candida infection. II. Application of biochemical methods for typing of Candida
albicans strains.
Arch Immunol Ther Exp (Warsz).1990, Vol 38, (5-6), p369-77

#3 : C.P.Kurtzman: The Yeast, a taxonomic study. 5ème Edition

Modification des notes

Type de modification Notes Germes concernés

Ajout Possibilité de Cryptococcus gattii Cryptococcus neoformans

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 47


Description de la Base de connaissances API® 20 C AUX

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 48 heures d'incubation, 3 898 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 90,4 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 5,3 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 4,2 % des souches ont été mal identifiées.

Après 72 heures d'incubation, 3 128 souches de diverses origines et souches de


collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 91,4 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,9 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 3,7 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 20 C AUX est destiné à l'identification des levures présentes dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 20 C AUX V5.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 48


Description de la Base de connaissances API® Candida

API® Candida
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliographiq
API® Candida V2.1 (Ancienne) API® Candida V2.2 (Nouvelle)
ues (ci-
dessous)

Geotricum capitatum Saprochaete capitata #1

Geotrichum spp Geotrichum candidum NA

The species Geotrichum candidum and Saprochaete capitata were included in the taxon
Geotrichum spp. A note was added to enable the taxon name to be changed to
Geotrichum candidum.

Bibliographie et Nomenclature des levures

#1: Saprochaete capitata


Book: The Yeasts, Fifth Edition: A Taxonomic Study by C.P. Kurtzman, J.W. Fell

Modification des notes

Type de modification Notes Germes concernés

Ajout Possibilité de Saprochaete capitata Geotrichum candidum

Performances
646 souches de diverses origines et souches de collection appartenant aux espèces de
la base de données ont été testées :

- 97,99 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 0,46 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 1,55 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® Candida est destiné à l'identification des espèces de la base de
données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes
ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® Candida V2.2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 49


Description de la Base de connaissances API® 20 A

API® 20 A
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliographiq
API® 20 A V4.0 (Ancienne) API® 20 A V5.0 (Nouvelle)
ues (ci-
dessous)
Bacteroides distasonis Parabacteroides distasonis #1

Bacteroides ureolyticus Campylobacter ureolyticus #2

Parvimonas micra (espèce associée au taxon


Micromonas micros Peptostreptococcus group identifiable par tests #3
complémentaires)

Propionibacterium propionicus Propionibacterium propionicum #4

Ajout

Références
bibliographiq
API® 20 A V5.0 (Nouvelle)
ues (ci-
dessous)
Capnocytophaga spp (espèce associée au taxon Prev. melaninogenica/oralis identifiable par tests
#5
complémentaires)

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 50


Description de la Base de connaissances API® 20 A

Bibliographie

#1: Parabacteroides distasonis


SAKAMOTO (M): Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as
Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. Nov., Parabacteroides goldsteinii comb. Nov. and Parabacteroides
merdae comb; nov. – International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2006,56,1599-1605

#2: Campylobacter ureolyticus


VANDAMME (P) : Reclassification of Bacteroides ureolyticus as Campylobacter ureolyticus comb. nov., and
emended description of the genus Campylobacter – International Journal of Systematic and Evolutionary
Microbiology, 2010,60,2016-2022

#3: Parvimonas micra


TINDALL (B.J.) and EUZÉBY (J.P.): Proposal of Parvimonas gen. nov. and Quatrionicoccus gen. nov. as
replacements for the illegitimate, prokaryotic, generic names Micromonas - Murdoch and Shah 2000 and
Quadricoccus Maszenan et al. 2002, respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 2711-2713.

#4: Propionibacterium propionicum


MOORE (W.E.C.) and MOORE (L.V.H.): Index of the bacterial and yeast nomenclatural changes published in the
International Journal of Systematic Bacteriology since the 1980 Approved Lists of bacterial names (1 January
1980 to 1 January 1992). American Society for Microbiology, Washington, D.C., 1992.

#5: Capnocytophaga species


FRANDSEN (EVG): Diversity of Capnocytophaga species in children and description of Capnocytophaga
leadbetteri sp. Nov. and Capnocytophaga genospecies AHN8471 – International Journal of Systematic and
Evolutionary Microbiology, 2008,58,324-336.

GILLIGAN (PH): Capnocytophaga ochracea Septicemia - Journal of Clinical Microbiology, 1981,13,4,643-645.

WINN (RE): Septic arthritis involving Capnocytophaga ochracea - Journal of Clinical Microbiology,
1984,19,4,538-540.

HAWKEY (PM): Capnocytophaga ochracea infection: two cases and a review of the published work - Journal
Clin Pathol, 1984,37,1066-1070.

TANNER (ACR): API® ZYM and API® an-ident reactions of fastidious oral Gram-negative species - Journal of
Clinical Microbiology, 1985,22,3,333-335.

RUMMENS (JL): Isolation of Capnocytophaga species with a new selective medium- Journal of Clinical
Microbiology, 1985,22,3,375-378.

BUU-HOI (AY): Endocarditis caused by Capnocytophaga ochracea - Journal of Clinical Microbiology,


1988,26,5,1061-1062.

YAMAMOTO (T): Capnocytophaga haemolytic asp. Nov. and Capnocytophaga granulosa sp. Nov., from human
dental plaque – International Journal of Systematic Bacteriology, 1994,44,2,324-329.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 51


Description de la Base de connaissances API® 20 A

Modification des notes

Type de modification Notes Germes concernés

Ajout Possibilité de Capnocytophaga spp Prevotella melaninogenica/oralis

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 2 468 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 87,0 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,9 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 8,2 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 20 A est destiné à l'identification biochimique des bactéries anaérobies
présentes dans la base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier
d'autres microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 20 A V5.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 52


Description de la Base de connaissances API® Coryne

API® Coryne
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
bibliographiq
API® Coryne V3.0 (Ancienne) API® Coryne V4.0 (Nouvelle)
ues (ci-
dessous)
Arcanobacterium pyogenes Trueperella pyogenes
#1
Arcanobacterium bernardiae Trueperella bernardiae

Bibliographie

#1: YASSIN (A.F.), HUPFER (H.), SIERING (C.) and SCHUMANN (P.): Comparative chemotaxonomic and
phylogenetic studies on the genus Arcanobacterium Collins et al. 1982 emend. Lehnen et al. 2006: proposal for
Trueperella gen. nov. and emended description of the genus Arcanobacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.,
2011, 61, 1265-1274.

Modification des notes


Type de
Notes Germes concernés
modification

Ajout Possibilité de Corynebacterium jeikeium Corynebacterium auris / Turicella otitidis

Ajout Possibilité de Microbacterium spp Leifsonia aquatica

Suppression Possibilité de Leifsonia aquatica Cellulomonas spp / Microbacterium spp

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 1 639 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 93,4 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 3,7 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 2,9 % des souches ont été mal identifiées.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 53


Description de la Base de connaissances API® Coryne

Limites du test
Le système API® Coryne est destiné à l'identification des bactéries corynéformes (genre
Corynebacterium et genres apparentés) présentes dans la base de données et à elles
seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes ou exclure leur
présence. La base de données de ce produit concerne essentiellement les bactéries
corynéformes les plus souvent isolées des prélèvements cliniques.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Si C. diphtheriae est identifié, des tests toxogéniques doivent être réalisés afin de
déterminer si le microorganisme est pathogène.

L'opacité de la suspension bactérienne doit être égale ou supérieure à 6 de McFarland.


Avec une suspension d'opacité inférieure à 6 de McFarland, les performances de la
galerie API® Coryne isquent d'être affectées. Des suspensions d'opacité supérieure à 6
de McFarland améliorent les performances.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® Coryne V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 54


Description de la Base de connaissances API® Campy

API® Campy
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® Campy V2.1 (Ancienne) API® Campy V3.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Campylobacter sputorum ssp bubulus Campylobacter sputorum bv Sputorum #1

Bibliographie

#1: Campylobacter sputorum


ON (S.L.W.), ATABAY (H.I.), CORRY (J.E.L.), HARRINGTON (C.S.) and VANDAMME (P.):
Emended description of Campylobacter sputorum and revision of its infrasubspecific (biovar) divisions,
including C. sputorum biovar paraureolyticus, a urease-producing variant from cattle and humans. Int. J. Syst.
Bacteriol., 1998, 48, 195-206.
VANDAMME (P.) and ON (S.L.W.): Recommendations of the Subcommittee on the taxonomy
of Campylobacter and related bacteria. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 719-721.

Modification des notes

Pas de modification

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 1 258 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 93,2 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 3,2 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 3,7 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® Campy est destiné à l'identification des bactéries du genre
Campylobacter et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® Campy V3.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 55


Description de la Base de connaissances API® Listeria

API® Listeria
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons

Pas de modification

Modification des notes


Type de
Notes Germes concernés
modification

Confirmer par Camp test la possibilité de


Ajout Listeria innocua
L.monocytogenes

Ajout Espèce Pathogène critique Listeria monocytogenes

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 641 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 98,6 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 0,5 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 0,9 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® Listeria est destiné à l'identification des bactéries du genre Listeria
présentes dans la base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier
d'autres microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® Listeria V2.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 56


Description de la Base de connaissances API® NH

API® NH
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® NH V3.0 (Ancienne) API® NH V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Haemophilus paragallinarum Avibacterium paragallinarum #1

Aggregatibacter actinomycetemcomitans
(espèce associée au taxon Aggregatibacter
Haemophilus actinomycetemcomitans
aphrophilus identifiable par tests
complémentaires) #2

Haemophilus aphrophilus
Aggregatibacter aphrophilus
Haemophilus paraphrophilus

Bibliographie

#1: Avibacterium paragallinarum


BLACKALL (PJ): Reclassification of Pasteurella gallinarum, [Haemophilus] paragallinarum, Pasteurella avium and
Pasteurella volantium as Avibacterium gallinarum gen. nov., comb. nov., Avibacterium paragallinarum comb.
nov., Avibacterium avium comb. nov. and Avibacterium volantium comb. nov.– International Journal of
Systematic and Evolutionary Microbiology, 2005,55,353-62

#2: Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Aggregatibacter aphrophilus


NORSKOV-LAURITSEN (N): Reclassification of Actinobacillus actinomycetemcomitans, Haemophilus aphrophilus,
Haemophilus paraphrophilus and Haemophilus segnis as Aggregatibacter actinomycetemcomitans gen. nov.,
comb. nov., Aggregatibacter aphrophilus comb. nov. and Aggregatibacter segnis comb. nov., and emended
description of Aggregatibacter aphrophilus to include V factor-dependent and V factor-independent isolates -
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2006,56,2135-46.

Modification des notes


Type de
Notes Germes concernés
modification

Ajout Confirmer par tests séro./Espèce Pathogène critique Neisseria meningitidis

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 57


Description de la Base de connaissances API® NH

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 2 heures d'incubation, 606 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 96,9 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 0,7 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 2,5 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® NH est destiné à l'identification des espèces de la base de données,
c'est-à-dire appartenant aux genres Neisseria, Haemophilus (et genres apparentés), et à
l'espèce Moraxella catarrhalis (Branhamella catarrhalis) et à elles seules. Il ne peut être
utilisé pour identifier d'autres microorganismes ou exclure leur présence.

Certaines espèces des genres Moraxella, Oligella peuvent être identifiées à tort comme
des Neisseria meningitidis du fait de leurs profils biochimiques similaires sur la galerie
API® NH. Les profils de Neisseria meningitidis nécessitent d'être confirmés par des tests
sérologiques.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® NH V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 58


Description de la Base de connaissances API® 50 CHB

API® 50 CHB
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® 50 CHB V4.0 (Ancienne) API® 50 CHB V4.1 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Bacillus fusiformis Lysinibacillus fusiformis
#1
Bacillus sphaericus Lysinibacillus sphaericus

Ces deux espèces sont associées avec le taxon « Bacillus non réactif » identifiables par
tests complémentaires.

Bibliographie

#1: Lysinibacillus fusiformis and Lysinibacillus sphaericus


AHMED (I), YOKOTA (A) : Proposal of Lysinibacillus boronitolerans gen. nov. sp. nov., and transfer of Bacillus
fusiformis to Lysinibacillus fusiformis comb. nov. and Bacillus sphaericus to Lysinibacillus sphaericus comb. nov.
Int J Syst Evol Microbiol. 2007 May;57(Pt 5):1117-25.

Modification des notes

Pas de modification

Performances
Pour Bacillus et apparentés, 1 378 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 91,1 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 3,9 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 5,0 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 50 CHB est destiné à l'identification des espèces présentes dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 50 CHB V4.1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 59


Description de la Base de connaissances API® 50 CHE

API® 50 CHE
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® 50 CHE V3.1 (Ancienne) API® 50 CHE V3.2 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Enterobacter intermedius Kluyvera intermedia #1

Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae

Salmonella typhi Salmonella ser.Typhi


#2
Salmonella typhimurium Salmonella ser.Typhimurium

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica

Enterobacter sakazakii Cronobacter spp #3

Bibliographie

#1: Kluyvera intermedia


PAVAN (M.E.), FRANCO (R.J.), RODRIGUEZ (J.M.), GADALETA (P.), ABBOTT (S.L.), JANDA (J.M.) and ZORZÓPULOS
(J.): Phylogenetic relationships of the genus Kluyvera: transfer of Enterobacter intermedius Izard et al. 1980 to
the genus Kluyvera as Kluyvera intermedia comb. nov. and reclassification of Kluyvera cochleae as a later
synonym of K. intermedia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 437-442.

#2: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

#3: Cronobacter spp


IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447.

Modification des notes

Pas de modification

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 60


Description de la Base de connaissances API® 50 CHE

Performances
2 930 souches de diverses origines et souches de collection appartenant aux espèces de
la base de données ont été testées :

- 93,93 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,47 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 1,60 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système API® 50 CHE est destiné uniquement à l'identification des espèces présentes
dans la base de données. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes
ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 50 CHE V3.2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 61


Description de la Base de connaissances API® 50 CHL

API® 50 CHL
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
API® 50 CHL V5.1 (Ancienne) API® 50 CHL V5.2 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Streptococcus thermophilus Streptococcus salivarius ssp thermophilus #1

Lactobacillus curvatus ssp curvatus Lactobacillus curvatus #2

Bibliographie

#1: Streptococcus salivarius


FARROW (JA), COLLINS (MD) : DNA base composition, DNA-DNA homology and long-chain fatty acid studies on
Streptococcus thermophilus and Streptococcus salivarius. J Gen Microbiol. 1984 Feb;130(2):357-62.

VALIDATION LIST N° 54. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 619-620. [SCHLEIFER (K.H.), EHRMANN (M.), KRUSCH
(U.) and NEVE (H.): Revival of the species Streptococcus thermophilus (ex Orla-Jensen, 1919) nom. rev. Syst.
Appl. Microbiol., 1991, 14, 386-388.]

#2: Lactobacillus curvatus


TORRIANI (S), VAN REENEN (CA), KLEIN (G) : Lactobacillus curvatus subsp. curvatus subsp. nov. and
Lactobacillus curvatus subsp. melibiosus subsp. nov. and Lactobacillus sake subsp. sake subsp. nov. and
Lactobacillus sake subsp. carnosus subsp. nov., New Subspecies of Lactobacillus curvatus Abo-Elnaga and
Kandler 1965 and Lactobacillus sake Katagiri, Kitahara, and Fukami 1934 (Klein et al. 1996, Emended
Descriptions), Respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. , 1996, 46, 4, 1158-1163

Modification des notes


Type de
Notes Germes concernés
modification

Ajout Possibilité de Lactobacillus casei Lactobacillus paracasei ssp paracasei 1

Performances
944 souches de diverses origines et souches de collection appartenant aux espèces de
la base de données ont été testées :

- 81,36 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 6,99 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 11,65 % des souches ont été mal identifiées.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 62


Description de la Base de connaissances API® 50 CHL

Limites du test
Le système API® 50 CHL est destiné à l'identification des espèces présentes dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir API® 50 CHL V5.2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 63


Description de la Base de connaissances ID 32 E

ID 32 E
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
ID 32 E V3.0 (Ancienne) ID 32 E V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Chryseobacterium meningosepticum Elizabethkingia meningoseptica #1

Mann.haemo./P.treha. Mannheimia haemolytica / Bibersteinia trehalosi #2

Enterobacter intermedius Kluyvera intermedia #3

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica

Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae #4

Salmonella typhi Salmonella ser.Typhi

Proteus vulgaris Proteus vulgaris group N/A

Ajout

Références
ID 32 E V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Pectobacterium atrosepticum

Pectobacterium carotovorum #5

Pectobacterium betavasculorum

Cronobacter dublinensis

Cronobacter malonaticus

Cronobacter muytjensii #6

Cronobacter sakazakii

Cronobacter turicensis

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 64


Description de la Base de connaissances ID 32 E

Suppression

ID 32 E V4.0 (Nouvelle)

Enterobacter sakazakii remplacée par les espèces de Cronobacter

Bibliographie

#1: Elizabethkingia meningoseptica


KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) and LEE (S.T.): Transfer of Chryseobacterium meningosepticum
and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and
Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.

#2: Bibersteinia trehalosi


BLACKALL (P.J.), BOJESEN (A.M.), CHRISTENSEN (H.) and BISGAARD (M.): Reclassification of [Pasteurella]
trehalosi as Bibersteinia trehalosi gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 666-674.

#3: Kluyvera intermedia


PAVAN (M.E.), FRANCO (R.J.), RODRIGUEZ (J.M.), GADALETA (P.), ABBOTT (S.L.), JANDA (J.M.) and ZORZÓPULOS
(J.): Phylogenetic relationships of the genus Kluyvera: transfer of Enterobacter intermedius Izard et al. 1980 to
the genus Kluyvera as Kluyvera intermedia comb. nov. and reclassification of Kluyvera cochleae as a later
synonym of K. intermedia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 437-442.

#4: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

#5: Pectobacterium species


GARDAN (L): Elevation of three subspecies of Pectobacterium carotovorum to species level: Pectobacterium
atrosepticum sp. nov., Pectobacterium betavasculorum sp. nov. and Pectobacterium wasabiae sp. nov..-
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2003, 53, p381-391.

SPROER (C) : The phylogenetic position of Serratia, Buttiauxella and some other genera of the family
Enterobacteriaceae - International Journal of Systematic Bacteriology, 1999, 49, p1433-1438.

HAUBEN (L): Phylogenetic position of Phytopathogens within the Enterobacteriaceae


System. Appl. Microbiol., 1998, 21, p384-397.

MERGAERT (J): Reclassification of non-pigmented Erwinia herbicola strains from trees as Erwinia billingiae sp.
nov. - International Journal of Systematic Bacteriology, 1999, 49, p377-383.

#6: Cronobacter spp


IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 65


Description de la Base de connaissances ID 32 E

Modification des notes

Pas de modification

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 4 931 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 94,5 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 3,2 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 2,3 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système ID 32 E est destiné à l'identification des espèces mentionnées dans la base
de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Only pure cultures of a single organism should be used.

Tableau d'identification (en %)


Voir ID 32 E V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 66


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 E

rapid ID 32 E
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
rapid ID 32 E V3.1 (Ancienne) rapid ID 32 E V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Enterobacter intermedius Kluyvera intermedia #1

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica

Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae #2

Salmonella typhi Salmonella ser.Typhi

Ajout

Références
rapid ID 32 E V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Pectobacterium atrosepticum

Pectobacterium carotovorum #3

Pectobacterium betavasculorum

Cronobacter dublinensis

Cronobacter malonaticus

Cronobacter muytjensii #4

Cronobacter sakazakii

Cronobacter turicensis

Suppression

rapid ID 32 E V4.0 (Nouvelle)

Enterobacter sakazakii remplacée par les espèces de Cronobacter

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 67


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 E

Bibliographie

#1: Kluyvera intermedia


PAVAN (M.E.), FRANCO (R.J.), RODRIGUEZ (J.M.), GADALETA (P.), ABBOTT (S.L.), JANDA (J.M.) and ZORZÓPULOS
(J.): Phylogenetic relationships of the genus Kluyvera: transfer of Enterobacter intermedius Izard et al. 1980 to
the genus Kluyvera as Kluyvera intermedia comb. nov. and reclassification of Kluyvera cochleae as a later
synonym of K. intermedia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 437-442.

#2: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

#3: Pectobacterium species


GARDAN (L): Elevation of three subspecies of Pectobacterium carotovorum to species level: Pectobacterium
atrosepticum sp. nov., Pectobacterium betavasculorum sp. nov. and Pectobacterium wasabiae sp. nov..-
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2003, 53, p381-391.

#4: Cronobacter spp


IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447

Modification des notes

Pas de modification

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 4 heures d'incubation, 1 773 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 91,8 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires)
- 5,5 % des souches n'ont pas été identifiées.
- 2,7 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système rapid ID 32 E est destiné à l'identification des espèces mentionnées dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir rapid ID 32 E V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 68


Description de la Base de connaissances ID 32 STAPH

ID 32 STAPH
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Ajout

Références
ID 32 STAPH V3.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Staphylococcus pseudintermedius (espèce associée au taxon Staphylococcus intermedius identifiable
#1
par tests complémentaires)

Bibliographie

#1Staphylococcus pseudintermedius :
VAN HOOVELS (L): The first case of Staphylococcus pseudintermedius in humans isolated from an ICD lead –
ESCMID, Nice, 2006,P1698

DEVRIESE (LA): Staphylococcus pseudintermedius sp. Nov., a coagulase-positive species from animals – IJSEM,
2005,55,1569-1573.

SASAKI (T): Reclassification of phenotypically identified Staphylococcus intermedius strains – JCM,


2007,45,2770-2778

HAJEK (V): Staphylococcus intermedius, a new species isolated from animals – IJSB, 1976,26,401-408

Modification des notes


Type de
Notes Germes concernés
modification

Ajout Possibility of Staph. pseudintermedius Staph.intermedius

Ajout Official Taxonomy: Staph.schleiferi ssp schleiferi Staph.schleiferi

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 2 734 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 90,9 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 5,9 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 3,2 % des souches ont été mal identifiées.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 69


Description de la Base de connaissances ID 32 STAPH

Limites du test
Le système ID 32 STAPH est destiné à l'identification des espèces mentionnées dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir ID 32 STAPH V3.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 70


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 STREP

rapid ID 32 STREP
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
rapid ID 32 STREP V3.0 (Ancienne) rapid ID 32 STREP V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Streptococcus salivarius Streptococcus salivarius ssp salivarius #1

Streptococcus thermophilus Streptococcus salivarius ssp thermophilus #2

Streptococcus bovis I Streptococcus gallolyticus ssp gallolyticus

Streptococcus bovis II/1 Streptococcus infantarius ssp infantarius

Streptococcus bovis II/2 Streptococcus gallolyticus ssp pasteurianus


#3
Streptococcus bovis II/3 Streptococcus infantarius ssp coli

Streptococcus bovis II/4 Streptococcus equinus 2

Streptococcus equinus Streptococcus equinus 1

Streptococcus constellatus ssp constellatus N/A


Streptococcus constellatus

Bibliographie

#1: Streptococcus salivarius ssp salivarius


HOWEY (R.T.), LOCK (C.M.) and MOORE (L.V.H.): Subspecies names automatically created by Rule 46. Int. J.
Syst. Bacteriol., 1990, 40, 317-319.

#2: Streptococcus salivarius ssp thermophilus


VALIDATION LIST N° 54. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 619-620. [SCHLEIFER (K.H.), EHRMANN (M.), KRUSCH
(U.) and NEVE (H.): Revival of the species Streptococcus thermophilus (ex Orla-Jensen, 1919) nom. rev. Syst.
Appl. Microbiol., 1991, 14, 386-388.]

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 71


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 STREP

#3 : Streptococcus bovis
Streptococcus gallolyticus ssp gallolyticus
Streptococcus gallolyticus ssp pasteurianus
Streptococcus infantarius ssp coli
Streptococcus infantarius ssp infantarius
Streptococcus equinus

SCHLEGEL (L.), GRIMONT (F.), COLLINS (M.D.), RÉGNAULT (B.), GRIMONT (P.A.D.) and BOUVET (A.):
Streptococcus infantarius sp. nov., Streptococcus infantarius subsp. infantarius subsp. nov. and Streptococcus
infantarius subsp. coli subsp. nov., isolated from humans and food. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1425-
1434. ASSOCIATE EDITOR, IJSB: Notification that new names and new combinations have appeared in volume
50, part 4, of the IJSEM. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2000, 50, 1701-1702.

POYART (C.), QUESNE (G.) and TRIEU-CUOT (P.): Taxonomic dissection of the Streptococcus bovis group by
analysis of manganese-dependent superoxide dismutase gene (sodA) sequences: reclassification of
'Streptococcus infantarius subsp. coli' as Streptococcus lutetiensis sp. nov. and of Streptococcus bovis biotype
II.2 as Streptococcus pasteurianus sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1247-1255.

SCHLEGEL (L.), GRIMONT (F.), AGERON (E.), GRIMONT (P.A.D.) and BOUVET (A.): Reappraisal of the taxonomy
of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus complex and related species: description of Streptococcus
gallolyticus subsp. gallolyticus subsp. nov., S. gallolyticus subsp. macedonicus subsp. nov. and S. gallolyticus
subsp. pasteurianus subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 631-645.

Modification des notes


Type de modification Notes Germes concernés

Suppression Taxonomie officielle : Str.gallolyticus ssp gallolyticus Streptococcus bovis I

Suppression Taxonomie officielle : Str.infantarius ssp infantarius Streptococcus bovis II / 1

Suppression Taxonomie officielle : Str.gallolyticus ssp pasteurianus Streptococcus bovis II / 2

Suppression Taxonomie officielle : Str.infantarius ssp coli Streptococcus bovis II / 3

Suppression Taxonomie officielle : Streptococcus bovis Streptococcus bovis II / 4

Suppression Taxonomie officielle : Str.constellatus ssp constellatus Streptococcus constellatus

Ajout Str.dys.equisimilis
Confirmer par des tests sérologiques Str.pyogenes
Str.agalactiae

Ajout Possibilité de Streptococcus pneumoniae Str.mitis

Ajout Possibilité de Streptococcus constellatus ssp pharyngis Str.anginosus

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 72


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 STREP

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 4 heures d'incubation, 3 963 souches de diverses origines et souches de collection
appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 93,5 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,3 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 2,2 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système rapid ID 32 STREP est destiné à l'identification des espèces présentes dans
la base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Les milieux géloses au sang, à base Schaedler, TSA ou Mueller Hinton ne doivent pas
être utilisés pour la subculture. En effet, ils modifient les réactions biochimiques obtenues
sur la galerie rapid ID 32 STREP.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir rapid ID 32 STREP V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 73


Description de la Base de connaissances ID 32 C

ID 32 C
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
ID 32 C V3.0 (Ancienne) ID 32 C V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Pichia farinosa Millerozyma farinosa

Geotricum capitatum Saprochaete capitata

Candida sphaerica Candida spherica

Saccharomyces kluyverii Lacancea kluyverii


#1, #2, #3
Debaryomyces polymorphus Schwanniomyces polymorphus

Debaryo.etch./carso. Schwanniomyces etchelsii/Priceomyces carsonii

Stephanoascus ciferrii Candida ciferrii

Williopsis saturnus Lindnera saturnus

Ajout

Références
ID 32 C V4.0 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Prototheca wickerhamii #4

Bibliographie et Nomenclature des levures

#1: Freydiere AM.: Yeast identification in the clinical microbiology laboratory: phenotypical methods.
Medical Mycology, 2001, Vol39, (1), p9-33

#2: Budak A.: Epidemiology of Candida infection. II. Application of biochemical methods for typing of Candida
albicans strains. Arch Immunol Ther Exp (Warsz).1990, Vol 38, (5-6), p369-77

#3: C.P.Kurtzman: The Yeast , a taxonomic study. Volume1

#4: Prototheca wickerhamii :


PADHYE (A): Rapid identification of Prototheca species by API® 20C - Journal of Clinical Microbiology,
1979,10,4,579-582.
McMULLAN (B): Prototheca wicherhamii mimicking yeast: a cautionary tale - Journal of Clinical Microbiology,
2011,49,8,3078-3081.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 74


Description de la Base de connaissances ID 32 C

Modification des notes


Modification

Type de modification Notes Germes concernés

Ajout Possibilité de Cryptococcus gatii Cryptococcus neoformans

Ajout Id. non valide avant 48 heures d'incubation ! Prototheca wickerhamii

Performances (souches sélectionnées en 2012)


Après 24 heures d'incubation, 2 707 souches de diverses origines et souches de
collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 69,5 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 22,1 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 8,4 % des souches ont été mal identifiées.

Après 48 heures d'incubation, 2 421 souches de diverses origines et souches de


collection appartenant aux espèces de la base de données ont été testées :

- 89,2 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 7,4 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 3,4 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système ID 32 C est destiné à l'identification des levures contenues dans la base de
données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres microorganismes
ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir ID 32 C V4.0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 75


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 A

rapid ID 32 A
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
Rapid ID 32 A V3.2 (Ancienne) Rapid ID 32 A V3.3 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
Bacteroides distasonis Parabacteroides distasonis
#1
Bacteroides merdae Parabacteroides merdae

Bacteroides ureolyticus Campylobacter ureolyticus #2

Parvimonas micra #3
Micromonas micros

Propionibacterium propionicum #4
Propionibacterium propionicus

#5
Bacteroides capillosus Pseudoflavonifractor capillosus

Bibliographie

#1: Parabacteroides distasonis and Parabacteroides merdae


SAKAMOTO (M): Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as
Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. Nov., Parabacteroides goldsteinii comb. Nov. and Parabacteroides
merdae comb; nov. - International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2006,56,1599-1605

#2: Campylobacter ureolyticus


VANDAMME (P.), DEBRUYNE (L.), DE BRANDT (E.) and FALSEN (E.): Reclassification of Bacteroides ureolyticus as
Campylobacter ureolyticus comb. nov., and emended description of the genus Campylobacter. Int. J. Syst. Evol.
Microbiol., 2010, 60, 2016-2022.

#3 : Parvimonas micra
TINDALL (B.J.) and EUZÉBY (J.P.): Proposal of Parvimonas gen. nov. and Quatrionicoccus gen. nov. as
replacements for the illegitimate, prokaryotic, generic names Micromonas Murdoch and Shah 2000 and
Quadricoccus Maszenan et al. 2002, respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56, 2711-2713.

#4: Propionibacterium propionicum


MOORE (W.E.C.) and MOORE (L.V.H.): Index of the bacterial and yeast nomenclatural changes published in the
International Journal of Systematic Bacteriology since the 1980 Approved Lists of bacterial names (1 January
1980 to 1 January 1992). American Society for Microbiology, Washington, D.C., 1992

#5: Pseudoflavonifractor capillosus


CARLIER (J.P.), BEDORA-FAURE (M.), K'OUAS (G.), ALAUZET (C.) and MORY (F.): Proposal to unify Clostridium
orbiscindens Winter et al. 1991 and Eubacterium plautii (Seguin 1928) Hofstad and Aasjord 1982, with
description of Flavonifractor plautii gen. nov., comb. nov., and reassignment of Bacteroides capillosus to
Pseudoflavonifractor capillosus gen. nov., comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2010, 60, 585-590.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 76


Description de la Base de connaissances rapid ID 32 A

Modification des notes

No modification

Performances
3 013 souches de diverses origines et souches de collection appartenant aux espèces de
la base de données ont été testées :

- 93,96 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,22 % des souches n'ont pas été identifiées,
- 1,83 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système rapid ID 32 A est destiné à l'identification des espèces mentionnées dans la
base de données et à elles seules. Il ne peut être utilisé pour identifier d'autres
microorganismes ou exclure leur présence.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir rapid ID 32 A V3.3

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 77


Description de la Base de connaissances ID 32 GN

ID 32 GN
Modifications du contenu de la Base de connaissances
Modification des taxons
Modification

Références
ID 32 GN V3.1 (Ancienne) ID 32 GN V3.2 (Nouvelle) bibliographiques
(ci-dessous)
#1
Chryseobacterium meningosepticum Elizabethkingia meningoseptica
#2
Enterobacter intermedius Kluyvera intermedia

Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis Salmonella enterica ssp enterica


#3
Salmonella choleraesuis ssp arizonae Salmonella enterica ssp arizonae
#4
Enterobacter sakazakii Cronobacter spp

Wautersia paucula Cupriavidus pauculus #5

Bibliographie

#1: Elizabethkingia meningoseptica


KIM (K.K.), KIM (M.K.), LIM (J.H.), PARK (H.Y.) and LEE (S.T.): Transfer of Chryseobacterium meningosepticum
and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and
Elizabethkingia miricola comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 1287-1293.

#2: Kluyvera intermedia


PAVAN (M.E.), FRANCO (R.J.), RODRIGUEZ (J.M.), GADALETA (P.), ABBOTT (S.L.), JANDA (J.M.) and ZORZÓPULOS
(J.): Phylogenetic relationships of the genus Kluyvera: transfer of Enterobacter intermedius Izard et al. 1980 to
the genus Kluyvera as Kluyvera intermedia comb. nov. and reclassification of Kluyvera cochleae as a later
synonym of K. intermedia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 437-442.

#3: Salmonella spp


TINDALL (B.J.), GRIMONT (P.A.D.), GARRITY (G.M.) and EUZÉBY (J.P.): Nomenclature and taxonomy of the genus
Salmonella. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 521-524.

#4: Cronobacter spp


IVERSEN (C.), MULLANE (N.), McCARDELL (B.), TALL (B.D.), LEHNER (A.), FANNING (S.), STEPHAN (R.) and
JOOSTEN (H.): Cronobacter gen. nov., a new genus to accommodate the biogroups of Enterobacter sakazakii,
and proposal of Cronobacter sakazakii gen. nov., comb. nov., Cronobacter malonaticus sp. nov., Cronobacter
turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov., Cronobacter
genomospecies 1, and of three subspecies, Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis subsp. nov., Cronobacter
dublinensis subsp. lausannensis subsp. nov. and Cronobacter dublinensis subsp. lactaridi subsp. nov. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2008, 58, 1442-1447

#5: Cupriavidus pauculus


VANDAMME (P.) and COENYE (T.): Taxonomy of the genus Cupriavidus: a tale of lost and found. Int. J. Syst.
Evol. Microbiol., 2004, 54, 2285-2289

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 78


Description de la Base de connaissances ID 32 GN

Modification des notes

Pas de modification

Performances
3 028 souches de collection et souches de diverses origines appartenant aux espèces
présentes dans la base de données ont été testées :

- 91,61 % des souches ont été correctement identifiées (avec ou sans tests
complémentaires),
- 4,85 % des souches n'ont pas été identifiées.
- 3,53 % des souches ont été mal identifiées.

Limites du test
Le système ID 32 GN est destiné à l'identification des bacilles à Gram négatif présents
dans la base de données et à eux seuls. Il ne peut être utilisé pour identifier aucun autre
microorganisme ou pour exclure sa présence.

Les bacilles à Gram négatif, non fermentants, isolés à partir de patients présentant une
mucoviscidose peuvent générer des profils biochimiques atypiques susceptibles
d'affecter leur identification.

Seules des cultures pures contenant un seul type de microorganisme doivent être
utilisées.

Tableau d'identification (en %)


Voir ID 32 GN V3.2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 79


7. Identification / méthodologies
simplifiées

Identification manuelle

Réf Microorganismes Suspension Mc Transfert Milieu Incubation Atmosphère


Farland
20100 Entérobactéries et 5 ml NaCl 0.85 % Medium
37 °C 18-
API 20 ETM autres bacilles Gram ou 5 ml Suspension 1 colonie NA NA Aérobie
20160 24h/48h
négatif non fastidieux Medium

RapiD 20 ETM 20701 Entérobactéries 2 ml NaCl 0.85 % Medium 0.5 McF NA NA 37 °C 4h Aérobie

®
Entérobactéries et 5 ml NaCl 0.85 % Medium
API 10 S 10100 autres bacilles Gram ou 5 ml Suspension 1 colonie NA NA 37 °C 18-24h Aérobie
négatif non fastidieux Medium
Non-entérobactéries et ®
® API AUX
API 20 NE 20050 bacilles Gram négatif non 2 ml NaCl 0.85 % Medium 0.5 McF 200 µL 30 °C 24-48h Aérobie
Medium
fastidieux
® Genres Staphylococcus, ®
API Staph 20500 API Staph Medium 0.5 McF NA NA 37 °C 18-24h Aérobie
Kocuria, Micrococcus
®
®
API 20 Strep 20600 Streptococci 2 ml Suspension Medium 4 McF 500 µl API GP 37 °C 4h-24h Aérobie
Medium
®
®
API Coryne 20900 Bactéries corynéformes 3 ml Suspension Medium >6 McF 500 µl API GP 37 °C 24h Aérobie
Medium
®
API Listeria 10300 Listeria 2 ml Suspension Medium 1 McF NA NA 37 °C 24h Aérobie

®
API Candida 10500 Levures 2 ml NaCl 0.85 % Medium 3 McF NA NA 37 °C 18-24h Aérobie

®
2 ml NaCl 0.85 % Medium ®

API 20 C AUX ou 2 ml Suspension API C


20210 Levures 2 McF 100 µl 30 °C 48-72h Aérobie
Medium
Medium
® ®
API 20 A 20300 Anaérobies API 20 A Medium 3 McF NA NA 37 °C 24h Anaérobie
®
®
API Campy 20800 Campylobacter 3 ml NaCl 0.85 % Medium 6 McF 150 µl API AUX 37 °C 24h Aérobie/CO2
Medium

®
Neisseria – Haemophilus
API NH 10400 et Branhamella catarrhalis 2 ml NaCl 0.85 % Medium 4 McF NA NA 37 °C 2h Aérobie

2 ml NaCl 0.85 % Medium


® Recherche semi-
API ZYM* 25200 ou 2 ml Suspension 5-6 McF NA NA 37 °C 4h Aérobie
quantitative d'activité
Medium
enzymatique
®
API 50 CH 50300 5 ml NaCl 0.85 % Medium 2 McF 30 °C 24-48h
® Bacillus ® NA NA Aérobie
API 50 CHB/E 50430 + API 50 CHB/E Medium 2 McF 55 °C 3/6-24h
®
API 50 CH 50300 5 ml NaCl 0.85 % Medium 0.5 McF
® Entérobactéries ® NA NA 37 °C 24-48h Aérobie
API 50 CHB/E 50430 + API 50 CHB/E Medium 0.5 McF
®
API 50 CH 50300 ®
® Lactobacillus API 50 CHL Medium 2 McF NA NA 30/37 °C 48h Aérobie
API 50 CHL 50410

 : API® ZYM n'est pas une galerie d'identification. Elle peut être utilisée comme test complémentaire afin de détermine l'activité enzymatique.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 80


Identification / méthodologies simplifiées Identification manuelle

Réactifs à commander

API 20 C AUX – Ref. 20210

API 50 CHB/E – Ref. 50430


API Candida – Ref. 10500
API 20 Strep – Ref. 20600

API Listeria – Ref. 10300


RapiD 20 ETM – Ref. 20701

API 50 CHL – Ref. 50410


API Coryne – Ref. 20900

API Campy – Ref. 20800

API ZYM** – Ref. 25200

API 50 CH – Ref. 50300


API 20 NE – Ref. 20050

API 50 CH – Ref. 50300


API Staph – Ref. 20500
API 20 ETM* – Ref. 20100

API 20 A – Ref. 20300

API 20 E – Ref. 20100


API 10 S – Ref. 10100

API NH – Ref. 10400


®

®
®
®

®
®
®

®
®
®

®
RÉACTIFS COMPLÉMENTAIRES - chiffres = quantité recommandée de réactifs complémentaires pour
chaque coffret de galeries commandé.
X = produit
complémentaire
nécessaire.

Zn (2x10 g) X X X

TDA (2x1 ampoule) 1/8 1/4 1/20

VP 1
(2x2 ampoules) 1/8 1/8 1/8 1/8 1/20
VP 2
NIT 1
(2x2 ampoules) 1/8 1/4 1/8 1/8 1/20 1/20 1/20
NIT 2
ZYM A (2x1 ampoule) 1/8 1/8 1/20 1/5
ZYM B (2x1 ampoule) 1/8 1/8 1/20 1/5
NIN (2 ampoules) 1/4 1/4
BCP (1 ampoule) 1/2
EHR (1 ampoule) 1/2
XYL (2 ampoules) 1/8
James (2x1 ampoule) 1/8 1/8 1/4 1/8 1/20
FB (2x1 ampoule) 1/4
PYZ (2 ampoules) 1/20 X

SUSPENSION MEDIUM
Milieu NaCl à 0,85 % (5 ml) X 1/10

Milieu NaCl à 0,85 % (3 ml) X


Milieu NaCl à 0,85 % (2 ml) 1/4 1/4
Suspension Medium (5 ml) 1/4 1/2 1/4 1/10
Suspension Medium (2 ml) 1/4 1/4 1/10 1/10

RÉACTIFS
COMPLÉMENTAIRES

Réactif oxydase X X X X X
®
Medium API OF X
®
Medium API M X
Huile de paraffine X X X X X X X X X X X X X
Portoir de 12 ampoules X X X X X X X X X X X X X X X X
PSIpettes stériles (5 ml) X X X X X X X X X X X X X X X X
Écouvillons X X X X X X X X
Standard Mc Farland X X X X X X X X X X X X

 : pour la galerie API 20 E™, utiliser le coffret de réactifs complémentaires réf. 20120 (7 ampoules).
®
 : API ZYM n'est pas une galerie d'identification. Elle peut être utilisée comme test complémentaire afin de détermine l'activité enzymatique.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 81


Identification / méthodologies simplifiées Identification manuelle

Identification automatique
Suspension :
Inoculateur Volume Volume Temps Température
Galeries Microorganismes McFarland Milieu Atmosphère
3 ml transféré délivré d'incubation d'incubation
Manuel 2 ml
NaCl 0.85 %
rapid ID 32 E Entérobactéries 0.5 - - 55 µl x 32 4h 37 °C Aérobie
medium
Suspension 4
rapid ID 32 A Anaérobies - - 55 µl x 32 4h 37 °C Aérobie
medium (diode 30)*
Suspension 4
rapid ID 32 STREP Streptococci - - 55 µl x 32 4h 37 °C Aérobie
medium (diode 30)*
Entérobactéries NaCl 0.85 % Aérobie +
ID 32 E 0.5 - - 55 µl x 32 24 h 37 °C
Non-entérobactéries medium humidité
Suspension Aérobie +
ID 32 STAPH Staphylococci 0.5 - - 55 µl x 32 24 h 37 °C
medium humidité
Entérobactéries NaCl 0.85 % API AUX Aérobie +
®

ID 32 GN 0.5 200 µl 135 µl x 32 24/48 h 30 °C


Non-entérobactéries medium medium humidité
Suspension API C Aérobie +
®

ID 32 C Levures 2 250 µl 135 µl x 32 24/48 h 30 °C


medium medium humidité

Réactifs :
rapid ID 32 E: IND (James)
rapid ID 32 A: IND (James), NIT (NIT1 + NIT2), de PAL à Ser A (FB)
rapid ID 32 STREP: VP (VPA + VPB), de APPA à GTA (FB), HIP (NIN)
ID 32 E: IND (James)
ID 32 STAPH: NIT (NIT1 + NIT2), VP (VPA + VPB), from ßGAL to Pyr A (FB)
ID 32 GN: Pas de réactif
ID 32 C: Pas de réactif
* Pour le densitomètre ATB™ 1550

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 82


8. Annexes

Annexe A : Bibliographie des tests complémentaires


1. LENNETTE E.H., BALOWS A., HAUSLER (JR) W. J., SHADOMY H.J.
Manual of Clinical Microbiology Fifth Edition (1991) Amer. Soc. Microbiol., Washington, D. C.

2. BARNETT J.H., PAYNE R. W., YARROW D.


Yeasts: Characteristics and Identification (First edition 1983 , Second 1990 , Third 2000) Cambridge University
Press – London

3. BARRETT T. J., PATTON C.M., MORRIS G.K.


Differentiation of Campylobacter species Using Phenotypic Characterization (1988) Laboratory Medicine, 19,
96-102

4. BOUVET P.J.M., GRIMONT P.A.D.


Taxonomy of the Genus Acinetobacter with the Recognition of Acinetobacter baumannii sp. Nov.,
Acinetobacter haemophilus sp. Nov., Acinetobacter johnsonii sp.nov., and Acinetobacter junii sp. Nov. And
Amended Descriptions of Acinetobacter calcoaceticus and Acinetobacter lwoffi (1986) Int. J. Syst. Bacteriol., 36,
228-240

5. FARMER J.J. III, DAVIS B.R., HICKMAN-BRENNER F.W., McWHORTER A., HUNTLEY-CARTER G.P., ASBURY M.A.,
WATHEN-GRADY H.G., ELIAS C., FANNING G.R., STEIGERWALT A.G., O’HARA C.M., MORRIS G.K., SMITH P.B.,
DON BRENNER J.
Biochemical Identification of New Species and Biogroups of Enterobacteriaceae Isolated from Clinical
Specimens (1985) J. Clin. Microbiol., 21, 46-76
6. GILARDI G.L.
Identification of Glucose Nonfermenting Gram Negative
(1989) - Document Interne

7. HOLDEMAN L.V., CATO E.P., MODRE W.E.C.


Anaerobe Laboratory Manual 4th Edition (1977) Virginia Polytechnic Institute and State University - Virginia –
USA

8. HOLLIS D.G., WEAVER R.E.


Gram Positive organisms: a guide to identification
Atlanta Special Bacteriology Section(1984) Center for Disease Control

9. HOLMES B., PINNING C.A., DAWSON C.A.


A Probability Matrix for the Identification of Gram-negative, Aerobic, Non-fermentative Bacteria that Grow on
Nutrient agar (1986) J. Gen. Microbiol., 132, 1827-1842
10. HOLMES B., PINNING C.A., DAWSON C.A.
A Revised Probability Matrix for the Identification of Gram-negative, Aerobic Rod-shaped, Fermentative
Bacterial (1986) J. Gen. Microbiol., 132, 3113-3135
11. KILIAN M., MIKKELSEN L., HENRICHSEN J.
Taxonomic Study of Viridans Streptococci: Description of Streptococcus gordonii sp. Nov. and Emended
Descriptions of Streptococcus sanguis (White and Niven (1946)), Streptococcus oralis (Bridge and Sneath1982),
and Streptococcus mitis (Andrews and Horder 1906).
(1986) Int. J. Bacteriol., 39, 471-484

12. KRIEG N.R., HOLT J.G.


Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology Ninth Edition - Volume 1 (1984) Williams & Wilkins Co., Baltimore,
Md

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 83


Annexes Annexe A : Bibliographie des tests complémentaires

13. MEGRAUD F., CHEVRIER D., DESPLACES N., SEDALLIAN A., GUESDON J.L.
Urease-Positive Thermophilic Campylobacter Isolated from an Appendix and from Human Feces.
(1988) J. Clin. Microbiol., 26, 1050-1051

14. MOORE L.V.H., MOORE W.E.C.


Anaerobe Lab Manual Update (1991) Virginia Polytechnic Institute and State University. Blacksburg, Virginia,
USA

15. PELOUX Y,CANIAUX I.


Identification des corynebacteries et germes apparentés. Apport d’une nouvelle galerie d’identification : API®
Coryne (1990) Feuillets de Biologie, XXXI, 27-34

16. RICHARD C.
Nouvelles Espèces de Enterobacteriaceae (1984) Bull. Institut Pasteur, 82, 255-277

17. SCHLEIFER K.H., KRAUS J., DVORAK C., KILPER-BAELTZ R., COLLINS M.D.
Transfer of Streptococcus lactis and Related Streptococci to the Genus Lactococcus gen. Nov. (1985) System.
Appl. Microbiol., 6, 183-195

18. SKINNER F.A., QUESNEL L.B.


Streptococci (1978) Soc. Appl. Bacteriol. Symposium Série N° 7 - Academic Press

19. SNEATH P.H.A., MAIR N.S., SHARPE M.E., HOLT J.G.


Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology Ninth Edition - Volume 2 (1986) Williams & Wilkins Co., Baltimore,
Md

20. STEELE T. W., OWEN R.J.


Campylobacter jejuni subsp. doylei subsp. nov., a Subspecies of Nitrate-Negative Campylobacters Isolated from
Human Clinical Specimens (1988) Int. J. Syst. Bacteriol., 38, 316-318

21. KREGER VAN RIJ N. J. W.


"The Yeasts - A Taxonomic Study." Livre Ed. ELSEVIER (1984)

22. Base de Données ID 32 C Pourcentages de la Base de Données

23. COYLE M.B., NOWOWIEJSKI D.J., RUSSEL J.Q., GROMAN N.B.


"Laboratory review of reference strains of Corynebacterium diphtheriae indicates mistyped intermedius
strains." (1993) J. Clin. Microbiol. 31, 11, 3060-3062.

24. FUNKE G, LAWSON P.A, COLLINS M.D.


"Heterogeneity within human-derived centers for disease control and prevention (CDC) Coryneform group
ANF- 1 - like bacteria and description of Corynebacterium auris sp. nov."
(1981) Int. J. Syst. Bact. 45, 4, 735-739.

25. RIEGEL P., RUIMY R., DE BRIEL D., PREVOST G., JEHL F., CHRISTEN R., MONTEIL H.
"Corynebacterium seminale sp. nov., a new species of Coryneform organism associated with genital infection in
male patients." (1995) J. Clin. Microbiol. 33, 2244-2249.

26. RIEGEL P., DE BRIEL D., PREVOST G., JEHL F., MONTEIL H., MINCK R.
"Taxonomic Study of Corynebacterium group ANF-1 strains : Proposal of Corynebacterium afermentans sp. nov.
containing the Subspecies Corynebacterium afermentans subsp. afermentans subsp. nov. and Corynebacterium
afermentans subsp. nov. lipophilum subsp. nov." (1993) Int. J. Syst. Bact. Vol.43, N°2, 287-292.

27. RIEGEL P., DE BRIEL D., PREVOST G., JEHL F., MONTIEL H.
"Proposal of Corynebacterium propinquum sp. nov. for Corynebacterium group ANF-3 strains."
(1993) FEMS Microbiology Letters Vol. 113

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 84


Annexes Annexe A : Bibliographie des tests complémentaires

28. MURRAY P.R., BARON E.J., PFALLER M.A., TENOVER F.C., YOLKEN R.H.
"Manual of clinical microbiology". (Sixth edition 1995 , 7th 1999 , 8th 2003 Livre ED. ASM PRESS.)

29. RENAUD F.N.R.,DUTAUR M., DAOUD S., AUBEL D.,RIEGEL P., MONGET D., FRENEY J.,
Differentiation Of Corynebacterium amycolatum, C.minutissimum , and C.striatum by carbon assimilation tests.
(1998) J.Clin.Microbiol., 36, 3698-3702.

30. FUNKE G., VON GRAEVENITZ A., CLARRIDGE J.E., BERNARD K.A.
"Clinical microbiology of Coryneform bacteria". (1997) Clinical microbiology reviews Vol10, 1, 125-159.

31. DAOUD S.E


"Apport des tests auxanotrophiques dans l'identification de quatre espèces de Corynebacteries."
(1996) Diplome d'études approfondies de Génie Biologique et Médical.

32. R. A. WHILEY, H. Y. FRASER, C. W. I. DOUGLAS, J. M. HARDIE, A. M. WILLIAMS, and M. D. COLLINS


Streptococcus parasanguis sp. nov., an atypical viridans Streptococcus from human clinical specimens.FEMS
Microbiology Letters 68 (1990) p. 115-121

33. SHINJO (T.), FUJISAWA (T.) and MITSUOKA (T.): Proposal of two subspecies of Fusobacterium necrophorum
(Flügge) Moore and Holdeman: Fusobacterium necrophorum subsp. necrophorum subsp. nov., nom. rev. (ex
Flügge 1886), and Fusobacterium necrophorum subsp. funduliforme subsp. nov., nom. rev. (ex Hallé 1898). Int.
J. Syst. Bacteriol., 1991, 41, 395-397

34. SCHLEGEL (L.), GRIMONT (F.), AGERON (E.), GRIMONT (P.A.D.) and BOUVET (A.): Reappraisal of the
taxonomy of the Streptococcus bovis/Streptococcus equinus complex and related species: description of
Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus subsp. nov., S. gallolyticus subsp. macedonicus subsp. nov. and S.
gallolyticus subsp. pasteurianus subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 631-645.

35. POYART (C.), QUESNE (G.) and TRIEU-CUOT (P.): Taxonomic dissection of the Streptococcus bovis group by
analysis of manganese-dependent superoxide dismutase gene (sodA) sequences: reclassification of
'Streptococcus infantarius subsp. coli' as Streptococcus lutetiensis sp. nov. and of Streptococcus bovis biotype
II.2 as Streptococcus pasteurianus sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1247-1255.

36. AGUIRRE (M.) and COLLINS (M.D.): Phylogenetic analysis of some Aerococcus-like organisms for urinary
tract infections: description of Aerococcus urinae sp. nov. J. Gen. Microbiol., 1992, 138, 401-405.

37. COLLINS (M.D.), AGUIRRE (M.), FACKLAM (R.R.), SHALLCROSS (J.) and WILLIAMS (A.M.): Globicatella sanguis
gen. nov., sp. nov., a new gram-positive catalase-negative bacterium from human sources. J. Appl. Bacteriol.
1992, 73, 433-437.]

38. G GAUTHIER, B LAFAY, R RUIMY, V BREITTMAYER, JL NICOLAS, M GAUTHIER, and R CHRISTEN Small-subunit
rRNA sequences and whole DNA relatedness concur for the reassignment of Pasteurella piscicida (Snieszko et
al.) Janssen and Surgalla to the genus Photobacterium as Photobacterium damsela subsp.piscicida comb. Nov
Int. J. Syst. Bacteriol., Jan 1995; 45: 139 - 144.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 85


Annexes Annexe B : Levures

Annexe B : Levures
Nom courant/Forme imparfaite/Forme parfaite/Autres dénominations

Nom courant Forme imparfaite Forme parfaite Autres dénominations


Candida albicans Candida albicans
Candida boidinii Candida boidinii
Candida catenulata Candida catenulata
Candida ciferrii Candida ciferrii Trichomonascus ciferrii Stephanoascus ciferrii
Candida colliculosa Candida colliculosa Torulaspora delbrueckii
Lachancea Kluyveromyces
Candida dattila Candida dattila
thermotolerans thermotolerans
Candida dubliniensis Candida dubliniensis
Candida famata Candida famata Debaryomyces hansenii
Candida glabrata Candida glabrata
Candida globosa Candida globosa Citeromyces matritensis
Meyerozyma
Candida guilliermondii Candida guilliermondii
guilliermondii
Candida hellenica Candida hellenica Zygoascus meyerae
Candida holmii Candida holmii Kazachstania exigua Saccharomyces exiguus
Candida inconspicua Candida inconspicua
Candida intermedia Candida intermedia
Kluyveromyces
Candida kefyr Candida kefyr
marxianus
Candida krusei Candida krusei Pichia kudriavzevii
Candida lambica Candida lambica Pichia fermentans
Candida lipolytica Candida lipolytica Yarrowia lipolytica
Candida lusitaniae Candida lusitaniae Clavispora lusitaniae
Candida magnoliae Candida magnoliae
Candida melibiosica Candida melibiosica
Candida Candida
membranifaciens membranifaciens
Candida norvegensis Candida norvegensis Pichia norvegensis
Candida norvegica Candida norvegica
Candida parapsilosis Candida parapsilosis
Wickerhamomyces
Candida pelliculosa Candida pelliculosa
anomalus
Metschnikowia
Candida pulcherrima Candida pulcherrima
pulcherrima
Candida rugosa Candida rugosa
Candida sake Candida sake
Candida silvicola Candida silvicola Nakazawaea holstii
Kluyveromyces lactis var
Candida spherica Candida spherica
lactis
Hansenula
Candida thermophila Candida thermophila Ogataea polymorpha polymorpha,Pichia
angusta
Candida tropicalis Candida tropicalis
Candida utilis Candida utilis Lindnera jadinii
Candida valida Candida valida Pichia membranifaciens

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 86


Annexes Annexe B : Levures

Nom courant Forme imparfaite Forme parfaite Autres dénominations


Candida zeylanoides Candida zeylanoides
Cryptococcus albidus Cryptococcus albidus
Cryptococcus curvatus Cryptococcus curvatus
Cryptococcus humicola Cryptococcus humicola
Cryptococcus laurentiiCryptococcus laurentii
Cryptococcus Cryptococcus Filobasidiella
neoformans neoformans neoformans
Cryptococcus terreus Cryptococcus terreus
Cryptococcus Cryptococcus Filobasidium
uniguttulatus uniguttulatus uniguttulatum
Geotrichum candidum Geotrichum candidum Galactomyces candidus
Geotrichum
Geotrichum fermentans
fermentans
Geotrichum klebahnii Geotrichum klebahnii
Kloeckera apiculata Kloeckera apiculata Hanseniaspora uvarum
Hanseniaspora
Kloeckera apis Kloeckera apis
guilliermondii
Hanseniaspora
Kloeckera japonica Kloeckera japonica
valbyensis
Kodamaea ohmeri Kodamaea ohmeri
Lachancea kluyverii Lachancea kluyverii Saccharomyces kluyveri
Lindnera saturnus Lindnera saturnus
Millerozyma farinosa Millerozyma farinosa
Priceomyces carsonii Priceomyces carsonii Pichia carsonii
Prototheca
Prototheca wickerhamii
wickerhamii
Rhodotorula glutinis Rhodotorula glutinis
Rhodotorula minuta Rhodotorula minuta
Rhodotorula Rhodotorula
mucilaginosa mucilaginosa
Saccharomyces Saccharomyces
cerevisiae cerevisiae
Magnusiomyces
Saprochaete capitata Saprochaete capitata
capitatus
Schwanniomyces Schwanniomyces
Pichia etchelsii
etchellsii etchellsii
Schwanniomyces Schwanniomyces Debaryomyces
polymorphus polymorphus polymorphus
Sporobolomyces Sporobolomyces Sporidiobolus
salmonicolor salmonicolor salmonicolor
Trichosporon asahii Trichosporon asahii
Trichosporon
Trichosporon asteroides
asteroides
Trichosporon inkin Trichosporon inkin
Trichosporon
Trichosporon mucoides
mucoides
Trichosporon ovoides Trichosporon ovoides

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 87


Annexe C : Tableaux d'identification
API 20 E™ V5.0

Taxon ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RHA SAC MEL AMY ARA OX

Buttiaux.agrestis 100 0 0 85 25 0 0 0 0 0 0 100 99 0 1 99 0 92 99 100 0


Ced.davisae 99 89 0 99 75 0 0 0 0 89 0 100 99 10 0 0 100 0 100 1 0
Ced.lapagei 99 99 0 0 75 0 0 0 0 90 0 100 99 1 1 0 0 1 100 1 0
Citro.braakii 50 45 0 99 75 81 1 0 4 0 0 100 100 1 100 100 1 91 99 99 0
Citro.freundii 90 24 0 1 75 75 1 0 1 0 0 100 99 25 99 99 99 82 40 99 0
Citro.kos./farmeri 99 2 0 100 25 0 1 0 99 0 0 100 100 1 99 99 99 80 99 99 0
Citro.koseri/ama. 99 75 0 100 97 0 1 0 99 1 0 100 100 25 99 99 1 1 98 99 0
Citro.youngae 100 50 0 1 80 80 1 0 1 0 0 100 100 1 95 100 1 1 25 99 0
Cronobacter spp 100 96 0 91 94 0 1 0 25 91 10 99 100 75 1 99 99 99 99 99 0
Edwardsiel.hoshinae 0 0 100 99 50 94 0 0 99 0 0 100 100 0 0 1 100 0 0 1 0
Edwardsiel.tarda 0 0 100 99 1 75 0 0 99 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Ent.aerogenes 99 0 99 98 82 0 1 0 0 85 0 99 99 99 99 99 99 99 99 99 0
Ent.amnigenus 1 99 25 0 99 40 0 0 0 0 75 1 100 100 0 1 99 99 99 99 99 0
Ent.amnigenus 2 99 80 0 99 80 0 0 0 0 75 1 100 100 0 99 99 1 99 99 99 0
Ent.asburiae 100 25 0 99 80 0 0 0 0 10 0 100 99 25 100 1 99 1 100 100 0
Ent.cancerogenus 100 75 0 99 99 0 0 0 0 89 0 100 100 0 1 100 1 1 100 100 0
Ent.cloacae 98 82 1 92 90 0 1 0 0 85 1 99 99 12 90 85 96 90 99 99 0
Ent.gergoviae 99 0 32 100 75 0 99 0 0 90 0 100 99 23 1 100 99 100 99 100 0
Esch.coli 1 90 1 74 70 0 1 3 0 89 1 0 99 98 1 91 82 36 75 3 99 0
Esch.coli 2 26 1 45 20 0 1 1 0 50 1 0 99 90 1 42 30 3 3 1 70 0
Esch.fergusonii 96 1 99 100 1 0 0 0 99 0 0 99 99 1 0 87 0 1 99 99 0
Esch.hermannii 100 0 1 100 1 0 0 0 99 0 0 100 100 0 0 99 25 0 99 99 0
Esch.vulneris 100 30 50 0 0 0 0 0 0 0 1 100 100 0 1 95 7 95 95 99 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 88


Annexes API 20 E™ V5.0

Taxon ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RHA SAC MEL AMY ARA OX

Ewingella americana 98 0 0 0 75 0 0 0 0 95 1 99 99 1 0 1 0 1 50 1 0
Hafnia alvei 1 75 1 99 98 50 0 10 0 0 50 0 99 99 0 1 99 0 1 25 99 0
Hafnia alvei 2 50 1 99 99 1 0 1 0 0 10 0 99 98 0 1 1 1 1 1 1 0
K.oxytoca 99 0 80 0 89 0 78 0 99 80 0 99 100 99 100 99 99 99 100 100 0
K.pneum.ozaenae 94 18 25 1 18 0 1 0 0 1 0 99 96 57 66 58 20 80 97 85 0
K.pneum.pneumoniae 1 99 1 73 0 86 0 90 0 0 90 0 99 99 99 99 99 99 99 99 99 0
K.pneum.pneumoniae 2 99 1 94 1 50 0 1 0 0 85 1 99 99 98 99 99 99 99 99 99 0
K.pneum.rhinosclero. 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 100 90 90 75 75 1 99 10 0
Kluy.intermedia 99 0 0 99 1 0 0 0 0 2 0 100 97 0 88 99 40 100 99 99 0
Kluyvera spp 95 0 25 99 60 0 0 0 80 0 0 100 99 0 25 93 89 99 99 99 0
Lecl.adecarboxylata 99 0 0 0 0 0 1 0 99 0 1 100 99 0 2 100 66 99 99 100 0
Moell.wisconsensis 97 0 0 0 40 0 0 0 15 1 0 100 1 0 0 0 100 99 0 0 0
Morg.morganii 1 0 10 98 1 1 99 93 99 0 0 99 0 0 0 0 1 0 0 0 0
Pantoea spp 1 85 1 0 0 13 0 1 0 1 9 1 100 99 1 26 1 98 26 59 61 0
Pantoea spp 2 99 1 0 0 99 0 1 0 53 62 4 100 99 36 82 90 98 81 99 99 0
Pantoea spp 3 99 1 0 0 21 0 1 0 1 86 15 100 99 34 1 97 93 23 65 97 0
Pantoea spp 4 86 1 0 0 29 0 1 0 59 1 1 99 99 10 32 99 72 89 99 99 0
Proteus mirabilis 1 0 0 99 50 75 99 98 1 1 82 98 0 0 0 0 1 0 0 0 0
Proteus penneri 1 0 0 0 1 20 100 99 0 0 50 99 0 0 0 0 99 0 1 0 0
Proteus vulgaris gr. 1 0 0 1 12 83 99 99 92 1 74 99 1 1 0 1 89 0 66 1 0
Prov.alcal./rustig. 0 0 0 0 80 0 0 100 99 0 0 99 1 1 0 0 1 0 0 1 0
Prov.rettgeri 1 1 0 0 74 1 99 99 90 1 0 98 82 78 1 50 25 0 40 1 0
Prov.stuartii 1 0 0 0 85 1 30 98 95 1 0 98 3 80 0 0 15 0 1 0 0
Rahnella aquatilis 100 0 0 0 50 0 0 1 0 99 0 100 100 0 98 99 99 97 100 98 0
Raou.ornithinolytica 100 0 99 99 99 0 85 0 100 65 0 99 100 99 100 100 100 100 100 100 0
Salm.enter.arizonae 98 75 97 98 75 99 0 0 1 1 1 100 99 1 99 99 1 78 1 99 0
Salm.enter.enterica 0 15 99 99 6 64 0 0 0 1 0 100 99 0 98 99 0 20 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 89


Annexes API 20 E™ V5.0

Taxon ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RHA SAC MEL AMY ARA OX

Salm.Gallinarum 0 1 100 1 0 25 0 0 0 0 0 100 99 0 0 1 1 0 1 99 0


Salm.Paratyphi A 0 5 0 99 1 1 0 0 0 0 0 100 99 1 99 98 0 96 0 99 0
Salm.Pullorum 0 1 75 99 0 85 0 0 0 0 0 100 99 0 0 100 0 1 0 75 0
Salm.Typhi 0 1 99 0 0 8 0 0 0 1 0 100 99 0 99 0 0 99 0 1 0
Salmonella spp 1 56 82 93 65 83 0 0 1 1 1 99 99 40 99 86 1 90 1 99 1
Ser.ficaria 99 0 0 1 100 0 0 0 0 40 90 100 100 50 99 74 99 99 100 99 0
Ser.fonticola 99 0 73 99 75 0 0 0 0 0 0 100 100 97 100 99 30 99 99 99 0
Ser.liquefaciens 95 1 70 98 80 0 2 0 0 59 65 100 99 80 98 2 99 72 97 97 0
Ser.marcescens 94 0 95 95 96 0 25 0 1 70 87 100 99 85 98 1 99 68 97 25 0
Ser.odorifera 1 95 0 95 99 95 0 0 0 99 50 99 99 99 99 99 99 99 99 99 99 0
Ser.odorifera 2 95 0 96 1 95 0 0 0 99 50 99 99 99 99 99 99 1 99 99 95 0
Ser.plymuthica 99 0 0 0 65 0 0 0 0 65 50 100 90 70 70 1 99 85 98 98 0
Ser.rubidaea 99 0 30 0 92 0 1 0 1 71 82 99 99 75 1 3 99 95 99 99 0
Shigella sonnei 96 0 0 93 0 0 0 0 0 1 0 99 99 0 1 75 1 1 0 99 0
Shigella spp 1 0 0 1 0 0 0 0 29 1 0 99 63 0 7 7 1 20 0 50 0
Y.enterocolitica 80 0 0 90 0 0 98 0 50 5 0 99 99 25 98 1 99 4 75 75 0
Y.frederik./interm. 99 0 0 75 1 0 99 0 99 1 0 100 99 25 99 99 99 1 99 99 0
Y.kristensenii 80 0 0 80 0 0 99 0 97 0 0 100 99 10 99 0 0 0 99 99 0
Y.pestis 68 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 99 99 0 70 0 0 0 30 30 0
Y.pseudotuberculosis 98 0 0 0 1 0 99 0 0 0 0 99 97 0 0 75 0 50 25 50 0
Aer.hydrophila gr. 1 98 90 25 1 25 0 0 0 85 25 90 99 99 1 3 5 97 1 75 75 100
Aer.hydrophila gr. 2 99 97 80 1 80 0 0 0 85 80 97 97 99 9 9 1 80 1 75 5 100
Aer.salm.salmonicida 1 60 1 0 0 0 0 0 1 0 75 50 54 0 0 0 0 0 1 0 100
Grimontia hollisae 1 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 100
Photo.damselae 1 99 75 0 1 0 98 0 0 10 1 50 0 0 0 0 1 0 0 0 100
Plesio.shigelloides 95 99 100 100 0 0 0 0 100 0 0 99 0 99 0 0 0 1 0 0 100
V.alginolyticus 0 0 98 75 60 0 1 0 100 10 75 99 100 0 1 0 99 0 10 1 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 90


Annexes API 20 E™ V5.0

Taxon ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RHA SAC MEL AMY ARA OX

V.cholerae 98 1 94 97 75 0 0 0 99 58 92 98 98 1 0 0 94 0 5 0 100
V.fluvialis 95 99 0 0 1 0 0 0 80 0 75 75 80 0 1 0 75 0 36 75 100
V.mimicus 99 0 99 99 50 0 0 0 99 1 99 99 99 0 0 0 0 0 0 0 100
V.parahaemolyticus 4 1 99 99 50 0 1 0 100 1 75 100 99 0 0 1 3 1 26 50 100
V.vulnificus 99 0 91 90 25 0 0 0 99 1 99 99 75 0 0 0 1 0 90 0 99
Past.aerogenes 99 0 0 80 0 0 99 0 0 1 0 99 0 97 0 1 99 0 0 75 75
Past.multocida 1 4 0 0 25 0 0 0 0 99 1 0 29 1 0 1 0 75 0 0 0 99
Past.multocida 2 7 0 0 45 0 0 0 0 99 1 0 44 99 0 99 0 99 0 0 0 89
Past.pne./Mann.haem. 60 0 1 10 0 0 25 0 15 7 3 35 12 12 12 1 35 1 2 1 80
Aci.baumannii/calco. 0 0 0 0 51 0 1 0 0 5 5 99 0 0 0 1 0 99 1 99 0
Bord./Alc./M.spp 0 0 0 0 52 0 14 1 0 25 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95
Burkhol.cepacia 50 0 25 16 78 0 0 0 0 1 43 60 1 0 0 0 13 0 7 20 90
Chromo.violaceum 0 99 0 0 75 0 0 0 14 0 99 99 0 0 0 0 10 0 0 0 99
Chryse.indologenes 5 0 0 0 12 0 90 0 75 1 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99
Eikenella corrodens 0 0 75 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100
Eliz.meningosept. 77 0 0 0 20 0 1 0 85 1 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99
Myroides /Chrys.ind. 0 0 0 0 50 0 75 0 0 1 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99
Non-fermenter spp 1 1 0 0 37 0 1 0 0 15 9 9 0 0 0 1 1 1 1 1 93
Ochrobac.anthropi 15 0 0 0 30 0 25 1 0 15 0 1 0 0 0 0 0 0 0 10 90
Ps.aeruginosa 0 89 0 0 92 0 25 0 0 1 75 50 1 0 0 1 1 10 1 25 97
Ps.fluoresc./putida 0 75 0 0 75 0 0 0 0 10 27 25 1 0 0 1 1 25 1 20 99
Ps.luteola 86 75 0 0 94 0 0 0 0 25 13 84 0 1 0 1 1 15 1 85 0
Ps.oryzihabitans 0 0 0 0 89 0 0 0 0 25 1 10 0 1 1 1 0 10 0 45 0
S.putrefaciens gr. 0 0 0 80 75 75 1 0 0 0 75 1 0 0 0 0 1 0 0 2 99
Steno.maltophilia 70 0 75 1 75 1 0 0 0 0 90 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 91


Annexes RapiD 20 E™ V3.2

RapiD 20 E™ V3.2
Taxon ONPG LDC ODC URE CIT PPA MNT ESC ARA XYL ADO RHA CEL MEL SAC TRE RAF GLU IND VP OX
Aci./Pseudomonas spp 0 2 0 0 65 2 2 0 39 41 0 0 0 19 2 0 0 36 0 0 19
Aer.hydrophila 92 19 0 0 41 1 0 26 26 1 0 8 41 1 96 99 0 98 99 59 100
Buttiaux.agrestis 100 0 54 0 66 0 89 99 97 89 0 89 100 89 0 97 75 100 0 0 0
Cedecea spp 69 0 34 0 83 0 73 38 1 26 0 0 76 0 65 96 0 99 0 34 0
Citro.ama./farmeri 89 0 92 1 60 0 1 70 97 91 0 99 99 5 4 99 1 100 99 0 0
Citro.freundii group 86 0 30 0 50 0 10 4 92 94 1 88 24 62 60 97 46 100 1 0 0
Citro.koseri 96 0 99 0 99 0 75 53 96 94 99 99 94 0 38 99 0 100 99 0 0
Edwardsiel.hoshinae 0 100 100 0 3 0 33 0 3 0 0 0 0 0 99 100 0 100 85 0 0
Edwardsiel.tarda 0 100 100 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 99 0 0
Ent.aerogenes 100 99 99 1 95 0 90 99 99 99 99 98 99 85 99 99 98 100 0 94 0
Ent.asburiae 100 0 92 0 13 0 0 96 100 100 0 0 98 0 100 100 66 100 0 13 0
Ent.cancerogenus 100 1 55 1 97 0 99 70 100 98 0 98 55 1 5 100 1 100 0 96 0
Ent.cloacae 99 2 87 1 95 0 71 51 99 84 25 81 98 79 88 99 81 100 1 81 0
Ent.gergoviae 90 85 100 80 68 0 99 99 99 75 2 97 1 90 99 85 75 100 0 75 0
Esch.coli 1 96 82 57 3 0 0 1 2 79 66 7 70 2 59 30 76 23 100 91 0 0
Esch.coli 2 10 41 22 2 2 0 1 1 70 70 8 33 1 14 5 88 8 100 96 0 0
Esch.fergusonii 87 95 96 0 0 0 0 0 52 87 57 61 87 0 0 74 0 100 100 0 0
Esch.hermannii 75 0 100 0 25 0 0 14 100 87 0 87 99 0 1 99 0 100 100 0 0
Esch.vulneris 100 74 33 0 8 0 74 11 91 82 16 16 83 83 0 99 83 100 0 0 0
Ewingella americana 90 0 0 0 95 0 0 40 0 1 0 1 10 0 0 100 0 100 0 80 0
Grimontia hollisae 9 0 0 4 0 0 0 0 65 0 0 0 4 0 0 4 0 96 100 0 100
Hafnia alvei 25 98 93 1 5 0 35 24 46 26 0 19 1 1 5 95 1 100 0 15 0
K.oxytoca 100 98 1 58 73 0 46 99 99 95 93 97 100 99 100 98 100 100 100 94 0
K.pneum.ozaenae 95 23 1 1 65 0 3 88 67 62 95 35 55 75 10 88 66 99 0 1 0
K.pneum.pneumoniae 96 84 1 65 97 0 70 99 94 98 90 90 100 94 99 100 100 100 0 95 0
K.pneum.rhinosclero. 0 0 0 0 1 0 96 50 90 90 90 90 50 50 50 92 89 99 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 92


Annexes RapiD 20 E™ V3.2

Taxon ONPG LDC ODC URE CIT PPA MNT ESC ARA XYL ADO RHA CEL MEL SAC TRE RAF GLU IND VP OX
Kluyvera spp 80 70 90 0 50 0 83 85 90 50 0 50 85 80 60 100 95 98 81 4 0
Lecl.adecarboxylata 100 0 0 0 27 0 99 100 100 100 79 99 100 100 55 98 58 98 98 0 0
Moell.wisconsensis 75 0 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 0 100 100 0 100 100 0 0 0
Morg.morganii 1 5 95 98 1 83 1 0 1 1 0 0 0 0 0 27 0 97 98 1 0
Pantoea spp 1 99 0 0 3 40 0 96 85 96 87 12 44 99 96 1 96 13 100 71 1 0
Pantoea spp 2 99 0 0 0 80 0 76 66 99 92 4 83 90 42 98 99 47 100 28 47 0
Pantoea spp 3 70 0 0 0 35 0 8 28 71 15 0 16 3 0 84 96 4 99 4 50 0
Photo.damselae 11 50 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 56 11 99 0 0 94
Plesio.shigelloides 100 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 99 0 99 100 0 100
Proteus mirabilis 0 2 96 98 44 99 1 6 1 24 0 1 1 0 1 85 1 98 1 15 0
Proteus penneri 1 0 0 100 0 100 0 0 0 4 0 0 0 0 75 2 1 83 0 0 0
Proteus vulgaris gr. 1 0 0 98 8 99 0 64 1 5 0 1 0 0 89 1 1 97 90 1 0
Prov.alcalifaciens 1 0 1 0 83 97 0 0 1 1 75 0 1 0 3 2 1 100 99 0 0
Prov.rettgeri 2 0 0 99 73 99 0 60 1 1 87 29 0 1 26 1 1 99 98 0 0
Prov.stuartii 2 0 0 34 67 96 0 5 1 1 1 0 1 0 13 96 1 98 83 0 0
Raou.ornithinolytica 100 88 100 45 100 0 100 100 100 100 88 99 91 100 100 100 100 100 100 55 0
Salm.Paratyphi A 0 0 91 0 11 0 0 0 99 11 0 98 0 7 0 99 0 100 0 0 0
Salm.Typhi 0 99 0 0 2 0 0 0 1 1 0 0 0 30 0 70 0 99 0 1 0
Salm.enter.arizonae 92 99 92 0 85 0 93 0 82 99 0 98 0 23 0 84 0 100 0 0 0
Salm.enter.enterica 0 99 92 0 7 0 0 0 8 39 0 69 0 5 0 28 0 100 0 0 0
Salmonella spp 2 99 99 0 83 0 1 0 93 69 0 92 2 53 3 94 2 100 1 0 0
Ser.ficaria 82 0 0 0 100 0 0 100 55 0 0 0 0 0 95 96 0 100 0 3 0
Ser.fonticola 100 75 99 1 40 0 98 99 90 51 97 55 1 98 20 99 98 100 0 1 0
Ser.liquefaciens 88 76 94 1 66 0 1 84 47 26 3 1 10 23 97 99 74 100 0 70 0
Ser.marcescens 57 98 99 1 82 2 0 83 0 2 25 0 0 1 96 99 2 100 1 72 0
Ser.odorifera 1 90 97 81 1 90 0 0 98 66 66 1 5 75 91 100 99 99 100 66 11 0
Ser.odorifera 2 90 97 5 0 90 0 0 5 66 66 1 5 15 60 0 99 11 100 66 60 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 93


Annexes RapiD 20 E™ V3.2

Taxon ONPG LDC ODC URE CIT PPA MNT ESC ARA XYL ADO RHA CEL MEL SAC TRE RAF GLU IND VP OX
Ser.plymuthica 97 0 0 0 70 0 1 77 50 30 0 0 40 15 100 96 30 90 1 18 0
Ser.rubidaea 98 73 0 1 81 0 47 99 73 73 92 1 2 92 99 99 99 100 0 89 0
Shigella sonnei 82 0 99 0 0 0 0 0 99 6 0 65 0 1 0 99 2 100 0 0 0
Shigella spp 1 0 0 0 1 0 0 0 18 1 0 3 0 1 0 60 0 95 24 0 0
V.alginolyticus 1 1 0 0 1 0 0 7 0 0 0 0 1 0 98 92 0 82 92 0 98
V.cholerae 95 89 80 1 72 1 1 0 3 10 0 0 0 0 100 70 0 100 98 70 100
V.fluvialis 40 0 0 0 16 0 0 3 93 0 0 0 30 1 100 100 0 100 13 0 100
V.parahaemolyticus 0 2 2 4 14 40 0 0 84 0 0 0 0 0 0 99 0 100 99 0 100
V.vulnificus 73 2 1 1 13 13 0 5 1 0 0 0 73 1 7 80 1 73 73 0 100
Y.enterocolitica 65 0 77 85 1 0 0 31 40 30 0 1 31 1 70 61 7 98 41 1 0
Y.pestis 61 0 0 1 0 0 0 99 1 1 0 1 0 1 0 1 0 100 0 0 0
Y.pseudotuberculosis 61 0 0 99 1 0 0 98 1 1 0 10 1 1 0 1 1 98 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 94


Annexes API® 10 S V4.0

API® 10 S V4.0
Taxon ONPG GLU ARA LDC ODC CIT H2S URE TDA IND OX NO2
Aci.baumannii 0 86 75 0 0 54 0 0 0 0 0 3
Aer.hydrophila 96 98 61 50 0 50 0 0 0 85 99 98
Chryse.indologenes 20 0 0 0 0 14 0 92 0 70 99 20
Citro.braakii 51 100 99 0 99 75 81 1 0 1 0 99
Citro.farmeri 98 100 99 0 100 0 0 0 0 100 0 99
Citro.freundii 90 100 94 0 0 75 65 1 0 1 0 98
Citro.koseri/ama. 97 100 95 0 86 87 0 2 0 92 0 99
Edwardsiel.tarda 0 99 1 99 100 1 94 0 0 99 0 99
Eliz.meningosept. 70 0 0 0 0 20 0 0 0 81 100 6
Ent.aerogenes 99 99 99 98 99 84 0 2 0 0 0 99
Ent.amnigenus 99 98 98 0 95 56 0 0 0 0 0 99
Ent.cloacae 99 99 99 1 93 94 0 1 0 0 0 99
Ent.sp/Ecoli/Shi.son 99 99 100 0 99 0 0 0 0 0 0 99
Esch.coli 1 76 95 80 98 56 1 3 4 0 70 0 99
Esch.coli 2 74 99 90 0 32 1 1 2 0 50 0 98
Esch.vulneris 100 99 99 15 0 0 0 4 0 0 0 99
Hafnia alvei 60 99 75 100 98 40 0 5 0 0 0 99
K.oxytoca 99 99 96 78 2 90 0 40 0 100 0 99
K.pneum.pneumoniae 99 99 99 72 0 90 0 60 0 0 1 99
Morg.morganii 2 97 1 5 96 2 1 99 91 97 0 88
Pantoea spp 1 100 100 80 0 0 28 0 0 1 0 0 85
Pantoea spp 2 96 100 99 0 0 68 0 0 0 100 0 85
Plesio.shigelloides 95 99 0 100 100 0 0 1 0 99 99 99
Proteus mirabilis 1 96 1 1 98 57 83 99 98 2 0 93
Proteus penneri 0 100 0 0 0 1 15 100 100 0 0 99
Proteus vulgaris gr. 0 97 1 0 1 31 83 98 99 94 0 99

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 95


Annexes API® 10 S V4.0

Taxon ONPG GLU ARA LDC ODC CIT H2S URE TDA IND OX NO2
Prov.rettgeri 1 99 1 0 0 70 0 94 99 88 0 98
Prov.stuartii/alcal. 1 99 2 0 0 91 0 15 100 98 0 99
Ps.aer./fluo./putida 0 30 11 0 0 68 1 15 0 0 99 14
Pseudomonas spp 1 7 8 0 0 54 1 4 0 0 98 48
S.putrefaciens gr. 0 6 1 0 80 83 90 1 0 0 100 96
Salm.Gallinarum 0 100 100 100 1 0 33 0 0 0 0 99
Salm.Paratyphi A 0 100 99 0 100 0 5 0 0 0 0 99
Salm.Pullorum 0 100 68 75 99 0 85 0 0 0 0 99
Salm.Typhi 0 99 0 98 0 0 8 0 0 0 0 99
Salm.enter.arizonae 97 100 99 96 97 50 96 0 0 1 0 99
Salm.enter.enterica 0 99 0 97 97 4 70 0 0 0 1 99
Salmonella spp 4 100 94 92 95 74 85 0 0 3 0 99
Ser.liquefaciens 94 100 98 70 99 85 0 5 0 0 0 99
Ser.marcescens 94 100 19 98 95 97 0 28 0 1 0 95
Ser.odorifera 95 99 95 97 43 87 1 0 0 99 0 99
Shigella spp 26 99 40 0 0 0 0 0 0 20 0 99
Sphingo.multivorum 96 46 17 0 0 30 0 92 0 0 96 1
Steno.maltophilia 60 1 0 48 0 76 1 0 0 0 4 26
V.algino./parahae. 1 99 19 98 75 61 0 5 0 99 100 47
V.vuln./cholerae 97 98 1 82 92 56 0 1 0 99 100 96
Y.enterocolitica 1 41 100 98 0 74 0 0 98 0 49 0 98
Y.enterocolitica 2 85 97 0 0 58 0 0 99 0 0 0 98
Y.pseudotuberculosis 77 98 29 0 0 13 0 96 0 0 0 95

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 96


Annexes API® 20 NE V8.0

API® 20 NE V8.0
Taxon NO3 TRP GLU ADH URE ESC GEL PNPG GLUa ARAa MNEa MANa NAGa MALa GNTa CAPa ADIa MLTa CITa PACa OX
Achro.denitrificans 93 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 86 20 96 99 94 93 100
Achro.xylosoxidans 81 0 1 1 0 0 1 0 99 0 30 1 1 1 100 81 94 99 98 96 100
Aci.baumannii/calco. 2 0 8 0 1 1 1 0 67 70 1 1 1 1 20 98 80 100 99 87 0
Aci.haemolyticus 1 0 14 0 1 0 95 0 1 0 0 0 0 0 0 99 2 99 81 1 0
Aci.junii/johnsonii 1 0 0 0 1 0 0 0 24 8 2 0 0 0 0 99 4 95 70 0 0
Aci.lwoffii 3 0 0 0 2 0 0 0 11 1 0 1 1 0 0 70 20 46 1 36 0
Aci.radioresistens 2 2 0 2 0 0 0 0 19 2 0 0 2 0 0 97 100 2 2 97 0
Aer.hydro./caviae 99 89 99 78 1 89 97 98 99 80 78 99 99 99 95 84 1 99 37 1 99
Aer.salm.mas./achro. 100 21 9 0 0 2 33 0 66 0 33 50 2 21 2 0 0 2 0 0 100
Aer.salm.salmonicida 100 0 57 36 0 99 99 18 84 1 0 96 84 99 99 1 1 99 1 0 100
Aer.sobria 99 86 96 86 0 1 99 99 100 12 99 99 99 100 100 93 0 99 81 0 100
Alc.faecalis 1 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 3 77 7 100 97 97 98
Alc.faecalis 2 78 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 99 73 91 100 69 73 100
Bergeyella zoohelcum 0 1 0 0 99 0 74 0 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 99
Bord.avium 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1 0 0 0 0 0 0 99 100 100 100 95
Bord.bronchiseptica 76 0 0 0 96 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 94 85 91 80 100
Brev.dim./O.urethr. 1 0 1 0 1 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 2 1 99 33 0 100
Brev.vesicularis 16 0 0 0 0 98 12 34 72 1 1 3 10 72 1 1 1 40 0 0 98
Burkhol.cepacia 39 0 24 1 1 46 70 72 100 75 99 96 99 8 97 99 93 100 99 99 91
Burkhol.pseudomallei 100 0 0 98 0 5 100 0 100 0 99 100 100 0 100 100 99 100 99 94 100
Chromo.violaceum 97 1 99 100 0 0 100 0 100 0 66 10 97 0 100 75 0 100 36 0 97
Chryse.indologenes 20 81 1 0 70 98 99 22 55 12 37 1 0 66 1 0 1 1 12 12 99
Com.testo./Ps.alcal. 75 0 0 6 4 0 4 1 11 3 3 4 1 2 42 55 38 87 32 3 98
Cup.pauculus 1 0 0 0 23 0 1 0 1 1 0 1 0 1 89 89 86 99 96 14 98
Delftia acidovorans 96 0 0 0 1 0 1 0 1 1 1 76 0 0 99 71 89 99 28 83 100
Eliz.meningosept. 0 83 1 0 5 99 95 93 86 1 80 76 70 61 0 0 1 0 25 0 99
Grimontia hollisae 100 100 31 0 0 0 0 3 10 67 68 0 24 1 41 0 0 94 0 1 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 97


Annexes API® 20 NE V8.0

Taxon NO3 TRP GLU ADH URE ESC GEL PNPG GLUa ARAa MNEa MANa NAGa MALa GNTa CAPa ADIa MLTa CITa PACa OX
M.lacunata 90 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 1 0 99
Mann.haem./Bib.treh. 95 0 2 0 0 2 0 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85
Methylo.mesophilicum 21 0 0 0 76 0 0 0 21 40 0 0 1 0 7 0 5 75 8 0 99
Moraxella spp 34 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 17 1 0 1 1 99
Myroides spp 0 1 0 0 94 1 99 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 100
Ochrobac.anthropi 80 0 0 0 84 1 0 1 82 75 60 20 75 76 34 34 4 99 47 1 99
Oligella ureolytica 71 0 0 0 99 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 95 95 26 96
Past.aerogenes 100 0 97 0 100 0 0 100 99 75 97 1 80 99 97 0 0 95 0 0 77
Past.multocida 96 96 1 0 0 0 0 10 1 0 2 1 1 2 1 0 1 1 0 0 86
Past.pneumotropica 100 61 26 0 85 0 0 83 6 1 6 0 6 3 6 0 1 6 0 0 84
Pasteurella spp 96 1 2 2 1 1 1 4 19 1 1 1 1 1 1 0 1 13 1 0 87
Photo.damselae 99 0 94 99 99 2 1 11 11 0 6 0 1 6 1 0 0 63 0 0 100
Plesio.shigelloides 99 99 98 98 0 0 0 86 94 0 12 0 77 98 99 77 0 94 0 0 99
Ps.aeruginosa 96 1 0 80 20 1 92 1 99 1 1 89 84 1 97 98 91 98 99 1 98
Ps.fluorescens 27 1 0 80 1 1 39 1 99 71 97 89 85 1 99 99 10 99 99 16 99
Ps.luteola 78 0 13 71 1 100 30 98 99 99 99 88 12 76 85 62 1 94 94 1 2
Ps.mendocina 100 0 0 94 0 0 1 0 100 0 0 0 1 0 99 100 0 100 100 0 100
Ps.oryzihabitans 0 0 0 0 1 0 11 1 100 99 99 100 0 84 99 88 2 99 99 0 1
Ps.putida 3 0 1 88 1 0 1 1 99 56 57 5 2 1 97 99 1 100 99 58 99
Ps.stutzeri 94 1 0 1 1 0 1 0 98 1 10 67 0 75 87 87 1 99 85 1 100
Psychro.phenylpyr. 60 0 0 0 95 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 3 1 0 100
Ralst.pickettii 32 0 1 1 3 0 1 0 96 35 1 10 14 1 99 86 62 99 98 16 99
Rzb.radiobacter 98 0 0 0 65 99 1 99 100 99 100 100 99 99 90 2 0 100 1 1 99
S.putrefaciens gr. 96 0 1 0 1 71 95 0 6 11 0 0 95 10 1 71 1 90 2 0 100
Sphingo.multivorum 1 0 1 0 95 100 1 99 99 91 99 0 99 99 0 0 0 1 0 0 99
Sphingo.spiritivorum 0 0 0 0 1 100 0 100 100 1 99 10 99 99 0 0 1 0 0 0 99
Sphmon.paucimobilis 10 0 0 0 1 97 1 90 99 83 75 15 64 95 34 9 3 61 45 1 73
Steno.maltophilia 37 1 0 0 0 99 99 87 84 3 95 2 98 99 2 1 0 99 98 0 7
V.alginolyticus 98 93 93 0 0 65 91 10 76 1 18 75 57 74 76 1 0 99 1 0 99

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 98


Annexes API® 20 NE V8.0

Taxon NO3 TRP GLU ADH URE ESC GEL PNPG GLUa ARAa MNEa MANa NAGa MALa GNTa CAPa ADIa MLTa CITa PACa OX
V.cholerae 99 100 99 0 0 1 99 99 88 0 30 78 75 97 98 1 1 99 97 1 100
V.metschnikovii 1 50 64 1 0 7 99 50 99 0 71 99 99 99 99 17 0 99 50 0 0
V.parahaemolyticus 99 99 100 1 6 1 98 97 90 81 82 99 51 98 90 0 1 99 21 1 99
V.vulnificus 100 95 95 0 1 95 99 99 9 0 10 9 1 6 28 0 0 95 91 0 100
W.virosa/Emp.brevis 12 5 0 0 0 1 100 0 1 1 1 0 0 0 1 1 0 3 1 1 98

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 99


Annexes API® Staph V5.0

API® Staph V5.0


Taxon GLU FRU MNE MAL LAC TRE MAN XLT MEL NIT PAL VP RAF XYL SAC MDG NAG ADH URE LSTR

Kocuria varians/rosea 91 92 8 1 1 8 1 0 0 75 4 8 4 8 4 0 1 1 29 95

Kocuria kristinae 99 96 99 90 9 84 3 0 0 6 3 93 0 0 90 12 0 0 0 97

Micrococcus spp 2 4 0 1 0 1 0 0 0 8 15 1 0 0 1 0 1 11 11 91

Staph.aureus 100 100 95 96 88 91 80 0 1 83 97 78 1 0 97 2 90 80 80 1

Staph.auricularis 100 99 36 72 10 90 9 0 0 81 0 1 0 0 40 0 15 90 1 1

Staph.capitis 100 99 80 43 22 2 36 0 0 86 23 90 0 0 50 0 1 85 35 10

Staph.caprae 100 99 70 10 75 74 10 1 0 99 95 99 0 0 0 0 1 99 60 1

Staph.carnosus 100 100 99 0 99 99 99 0 0 99 83 83 0 0 0 0 100 100 0 1

Staph.chromogenes 100 100 99 79 100 100 13 0 0 96 96 1 0 1 99 0 31 89 95 1

Staph.cohnii cohnii 100 99 66 99 2 97 88 33 0 21 66 94 0 0 2 0 9 2 1 1

Staph.cohnii ureal. 100 100 99 98 98 99 94 64 0 1 94 87 0 0 1 0 98 0 99 1

Staph.epidermidis 100 99 70 99 81 2 0 0 1 80 84 68 1 0 97 4 18 73 88 10

Staph.haemolyticus 99 75 5 99 80 91 60 0 1 78 15 57 0 0 98 13 83 85 1 1

Staph.hominis 98 94 41 97 50 86 28 0 1 82 27 70 1 0 97 4 50 43 84 1

Staph.hyicus 100 99 99 0 87 99 0 1 0 90 90 15 0 0 99 2 93 100 68 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 100


Annexes API® Staph V5.0

Taxon GLU FRU MNE MAL LAC TRE MAN XLT MEL NIT PAL VP RAF XYL SAC MDG NAG ADH URE LSTR

Staph.lentus 100 100 100 100 100 100 100 7 99 92 21 57 100 99 100 28 100 0 1 1

Staph.lugdunensis 100 89 88 99 66 99 0 0 0 99 16 99 0 0 100 0 90 1 50 1

Staph.saprophyticus 100 99 2 97 90 99 88 22 1 35 79 1 0 96 1 70 30 65 1

Staph.schleiferi 100 80 100 0 1 71 0 0 0 99 97 99 0 0 0 0 94 99 0 1

Staph.sciuri 99 99 99 99 70 93 98 0 0 83 67 30 0 16 95 7 68 0 0 1

Staph.simulans 100 100 57 11 95 92 73 4 0 83 27 38 0 4 97 2 90 97 84 1

Staph.warneri 99 99 50 98 19 96 70 0 0 23 16 90 0 0 99 0 6 77 97 1

Staph.xylosus 100 100 92 81 85 95 90 30 9 82 75 67 11 82 87 10 80 5 90 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 101


Annexes API® 20 Strep V8.0

API® 20 Strep V8.0

ßGUR
αGAL

ßGAL

GLYG
PYRA

MAN

AMD

HEM
ADH

ARA

SOR

RAF
LAC

INU
LAP

TRE
PAL
ESC
HIP

RIB
VP
Taxon

Abio.defectiva 25 0 15 99 100 0 100 0 92 0 0 0 0 0 98 100 5 92 99 0 0


Aerc.urinae 3 99 24 12 0 52 41 50 92 28 28 0 32 13 56 64 1 1 40 0 0
Aerc.viridans 1 13 50 96 54 33 16 37 1 5 1 83 33 85 70 83 99 33 41 70 33 1
Aerc.viridans 2 15 70 50 76 10 20 25 1 5 5 25 1 35 2 70 89 1 5 24 1 5
Aerc.viridans 3 22 88 99 40 85 48 14 14 1 1 8 2 82 5 91 99 37 99 14 1 1
Alloiococcus otitis 0 25 0 100 0 3 100 1 90 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0
Entero.avium 99 60 99 94 15 0 24 1 99 0 99 40 100 95 95 99 1 40 15 0 1
Entero.durans 100 43 99 97 32 2 76 1 91 99 99 15 2 0 84 76 0 1 56 0 18
Entero.faecalis 99 46 99 97 1 1 21 4 99 92 98 1 98 92 92 100 0 1 96 2 1
Entero.faecium 94 43 99 95 42 1 89 1 97 93 85 70 78 18 84 98 15 10 60 3 1
Gardnerel.vaginalis 0 95 0 1 0 1 53 0 99 0 46 6 1 0 1 0 0 0 73 53 0
Gem.haemolysans 25 0 0 70 0 0 1 84 40 1 1 0 20 10 5 2 0 0 10 5 1
Gem.morbillorum 3 0 0 35 0 0 10 35 86 4 5 0 1 0 1 11 3 1 20 5 0
Globi.sanguinis 4 40 98 40 52 16 100 0 9 0 76 95 71 47 76 100 71 95 100 90 0
Granuli.adiacens 0 0 10 80 0 25 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lc.lactis cremoris 98 25 41 1 23 0 18 4 88 0 27 0 17 0 97 30 0 15 25 0 0
Lc.lactis lactis 90 40 99 35 3 0 35 3 96 95 95 15 45 1 72 87 4 5 90 3 1
Leuconostoc spp 91 1 60 5 55 0 65 2 70 10 37 35 29 4 35 65 0 42 11 0 0
Listeria spp 97 79 98 0 0 0 0 0 85 0 6 0 0 0 49 92 1 1 72 0 26
Str.agalactiae 99 99 1 1 4 79 1 96 99 99 98 0 1 1 50 87 0 1 35 4 75
Str.anginosus 100 0 100 0 44 0 1 99 100 100 0 0 33 0 99 88 1 44 97 0 37
Str.canis 0 1 25 4 95 1 80 100 100 100 100 0 0 0 99 1 0 1 99 0 100
Str.const.const. 98 1 27 0 0 0 5 99 100 100 0 0 0 0 10 72 0 0 12 0 61
Str.dys.dysgalactiae 0 0 1 1 1 99 0 100 99 100 99 0 1 50 86 100 0 1 99 30 2
Str.dys.equisimilis 0 1 25 1 1 99 1 99 100 97 97 1 1 2 45 99 0 1 98 40 94

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 102


Annexes API® 20 Strep V8.0

ßGUR
αGAL

ßGAL

GLYG
PYRA

MAN

AMD

HEM
ADH

ARA

SOR

RAF
LAC

INU
LAP

TRE
PAL
ESC
HIP

RIB
VP
Taxon

Str.equi equi 1 0 1 0 0 100 0 100 100 99 0 0 0 0 0 1 0 0 100 99 100


Str.equi zooepidem. 0 1 15 0 0 100 1 99 100 99 85 0 0 99 100 0 0 0 99 99 99
Str.equinus 1 100 0 95 0 28 0 1 1 100 0 0 0 30 0 25 7 25 15 17 10 0
Str.equinus 2 98 1 100 0 97 2 10 0 100 1 1 32 1 1 98 40 84 99 99 97 0
Str.gal.gallolyticus 99 1 100 1 34 2 1 0 100 0 0 1 97 1 100 100 65 98 98 98 1
Str.gal.pasteurianus 100 2 100 0 89 97 99 0 100 0 0 0 0 0 100 100 0 72 31 5 0
Str.group L 1 75 1 0 0 100 1 100 100 100 100 0 0 0 75 100 0 0 100 98 94
Str.infant.coli 99 1 99 0 99 0 6 0 100 0 0 0 0 0 100 6 6 100 93 0 0
Str.infant.infant. 100 0 1 0 58 0 0 0 100 0 0 0 0 0 90 0 0 97 97 97 0
Str.intermedius 100 0 87 0 0 0 44 99 100 100 0 0 1 0 99 99 3 3 99 0 40
Str.mitis 1 1 0 3 2 21 0 25 35 99 19 14 2 0 1 94 7 3 26 67 5 0
Str.mitis 2 0 0 3 0 31 0 35 50 100 99 1 0 1 0 100 1 1 31 84 0 0
Str.mutans 99 0 99 1 64 0 1 1 100 18 0 0 99 90 90 100 81 81 1 0 1
Str.oralis 0 0 1 1 50 0 46 72 100 5 1 0 1 0 99 32 1 72 96 1 0
Str.pneumoniae 0 0 39 60 70 3 79 3 100 57 4 1 0 0 99 97 64 87 84 10 1
Str.porcinus 99 25 99 1 19 99 1 97 97 100 98 0 88 88 83 99 0 0 50 0 99
Str.pyogenes 0 1 5 98 0 15 0 100 100 99 0 0 8 1 99 98 0 1 61 22 98
Str.sal.salivarius 85 0 98 1 8 0 70 20 100 0 1 0 5 1 86 67 34 88 74 1 1
Str.sanguinis 0 1 42 0 63 0 1 5 100 90 0 0 1 48 83 98 33 55 67 0 0
Str.suis I 0 1 82 53 80 94 76 1 100 91 0 0 7 0 94 100 75 0 100 89 0
Str.suis II 0 1 70 41 91 91 52 3 100 95 0 0 3 1 99 98 63 93 99 96 2
Str.uberis 99 98 100 35 10 86 5 30 99 98 99 0 99 98 99 99 87 10 50 20 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 103


Annexes API® 20 C AUX V5.0

API® 20 C AUX V5.0


Taxon 0 GLU GLY 2KG ARA XYL ADO XLT GAL INO SOR MDG NAG CEL LAC MAL SAC TRE MLZ RAF HYPH
C.albicans 1 0 100 14 99 2 88 94 90 99 0 94 85 90 0 1 99 97 97 5 0 99
C.albicans 2 0 100 1 99 1 90 1 75 99 0 70 1 90 0 1 90 1 5 1 0 99
C.boidinii 0 100 55 1 1 89 70 89 25 0 95 1 55 0 0 1 1 1 0 0 99
C.ciferrii 0 100 80 80 99 99 71 60 100 100 43 0 99 60 0 99 100 99 0 99 99
C.colliculosa 0 100 96 100 0 0 0 5 13 0 60 1 0 0 0 3 99 60 0 96 25
C.dubliniensis 0 100 96 99 0 1 99 50 100 1 99 0 40 0 0 100 60 10 0 0 99
C.famata 0 100 96 98 60 60 98 75 99 0 100 99 99 89 70 100 100 96 78 75 1
C.glabrata 0 99 20 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 1
C.guilliermondii 0 100 99 97 79 85 97 92 99 0 97 88 99 95 0 94 100 99 90 95 46
C.kefyr 0 100 27 0 1 18 1 25 100 0 34 0 0 1 95 1 100 1 1 96 75
C.krusei/inconspicua 0 99 73 1 1 1 0 0 6 0 2 0 64 0 0 0 0 0 0 0 79
C.lusitaniae 0 100 90 95 1 65 95 20 30 0 99 60 95 80 1 100 99 100 99 0 75
C.magnoliae 0 100 32 50 0 0 0 0 10 0 60 0 0 0 0 2 97 10 1 75 1
C.norvegensis 0 100 85 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 25 0 0 0 0 0 0 93
C.parapsilosis 0 100 94 88 89 89 93 3 99 0 99 89 99 0 0 100 100 93 99 1 99
C.pelliculosa 0 100 99 0 0 67 1 1 56 0 70 95 1 70 0 97 99 87 96 30 70
C.rugosa 0 100 74 0 1 70 1 26 99 0 94 0 59 0 0 0 0 0 0 0 99
C.spherica 1 0 100 31 2 0 2 0 62 99 0 99 68 1 35 1 95 99 99 29 76 99
C.spherica 2 0 100 88 1 0 1 0 36 94 0 99 50 1 31 99 80 99 53 80 64 1
C.thermophila 0 100 84 0 1 1 66 36 0 0 90 1 1 20 0 94 90 46 97 0 2
C.tropicalis 0 100 9 99 1 96 99 12 99 1 99 69 99 17 1 99 73 100 72 5 99
C.utilis 0 100 99 0 0 60 0 1 5 0 1 3 0 37 1 98 96 16 72 79 69
C.zeylanoides 0 100 100 87 0 0 1 0 1 0 99 0 99 0 0 0 0 74 0 0 75
Crypto.albidus 0 100 0 98 80 81 0 1 6 30 60 65 1 99 10 98 100 82 81 51 1
Crypto.humicola 0 100 82 100 100 100 36 64 100 100 95 100 100 98 100 100 99 99 95 99 99
Crypto.laurentii 0 100 6 92 99 99 69 76 99 84 53 76 92 96 99 92 99 92 96 99 25

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 104


Annexes API® 20 C AUX V5.0

Taxon 0 GLU GLY 2KG ARA XYL ADO XLT GAL INO SOR MDG NAG CEL LAC MAL SAC TRE MLZ RAF HYPH
Crypto.neoformans 0 100 0 100 14 91 71 1 93 97 100 99 88 10 0 99 99 75 97 88 25
Crypto.terreus 0 100 0 100 87 100 0 0 45 50 99 0 96 96 36 0 0 54 0 0 1
Crypto.uniguttulatus 0 100 3 99 99 99 3 0 1 99 50 99 100 0 0 100 100 75 100 7 25
G.klebahnii 0 100 100 0 0 92 0 0 75 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92
Kloeckera spp 0 100 0 50 1 0 0 0 0 0 0 0 0 96 0 0 0 0 0 0 1
Kodamaea ohmeri 0 100 99 96 0 0 66 0 84 0 93 98 99 56 0 99 99 93 0 80 84
Pro.wickerhamii 0 100 100 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 1
Rhodo.glutinis 0 100 15 91 0 0 8 0 50 0 84 3 0 1 0 91 100 59 84 96 1
Rhodo.minuta 0 100 100 99 98 95 3 1 0 0 5 0 85 60 1 0 95 95 95 0 1
Rhodo.mucilaginosa 1 0 100 5 4 15 33 92 61 10 0 5 0 0 0 0 33 100 5 1 87 25
Rhodo.mucilaginosa 2 0 100 60 1 80 80 64 52 80 0 60 1 0 1 0 98 100 95 86 98 25
Saccharo.cerevisiae 1 0 100 8 0 0 0 0 0 78 0 1 13 0 0 0 75 90 2 1 62 30
Saccharo.cerevisiae 2 0 100 1 0 0 0 0 0 99 0 1 29 0 0 0 99 99 99 85 81 25
Sap.capitata 0 95 92 0 0 0 0 0 25 0 10 0 2 0 0 0 0 0 0 0 95
Sporo.salmonicolor 0 100 1 0 0 0 1 0 5 0 80 0 0 0 0 0 100 85 0 70 90
Tricho.asahii 0 100 20 100 100 100 0 5 100 0 1 94 100 100 100 100 98 66 20 0 95
Tricho.inkin 0 100 4 100 0 98 0 0 95 98 0 100 57 100 95 100 100 95 89 0 95
Tricho.mucoides 0 100 40 99 74 100 53 65 100 92 78 100 94 100 100 100 100 78 82 99 95

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 105


Annexes API® Candida V2.2

API® Candida V2.2


Taxon GLU GAL SAC TRE RAF ßMAL αAMY ßXYL ßGUR URE ßNAG ßGAL

C.albicans 100 100 100 90 3 3 90 0 0 0 99 0

C.famata 100 70 96 93 1 1 0 1 0 0 0 5

C.glabrata 100 1 0 100 1 0 0 0 0 0 0 0

C.guilliermondii 100 100 100 35 99 93 0 99 0 0 0 0

C.kefyr 100 100 100 3 100 0 0 88 0 0 0 100

C.krusei 100 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0

C.lusitaniae 100 100 100 98 0 99 0 99 0 0 0 0

C.parapsilosis 100 99 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0

C.tropicalis 100 100 100 100 0 94 99 1 0 0 1 0

Crypto.neoformans 1 100 82 96 9 97 50 35 1 99 100 10 0

Crypto.neoformans 2 100 99 47 1 1 1 5 1 98 100 52 0

G.candidum 100 100 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0

Saccharo.cerevisiae 100 96 100 66 98 0 1 0 0 0 0 0

Trichosporon spp 1 99 99 99 15 80 99 95 1 70 99 99 30

Trichosporon spp 2 85 50 1 1 1 99 75 1 9 80 99 20

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 106


Annexes API® 20 A V5.0

API® 20 A V5.0

Taxon IND URE GLU MAN LAC SAC MAL SAL XYL ARA GEL ESC GLY CEL MNE MLZ RAF SOR RHA TRE CAT SPOR GRAM COCC

Actino.israelii 0 0 99 99 89 99 99 99 99 97 0 30 25 90 90 38 82 40 45 90 1 0 100 0
Actino.meyeri/odont. 1 0 99 1 72 98 93 31 62 37 5 5 50 0 0 0 10 1 15 0 2 0 100 1
Actino.naeslundii 0 5 99 26 72 96 94 55 0 0 16 21 47 50 70 5 60 16 0 46 11 0 99 0
Actino.viscosus 1 0 0 99 0 65 99 99 22 0 0 7 1 60 17 95 0 99 0 0 5 90 0 100 0
Actino.viscosus 2 0 0 60 0 0 60 0 5 0 0 0 0 0 0 60 0 0 0 0 0 80 0 100 0
Bac.caccae 0 0 100 0 100 100 75 0 100 100 0 90 10 0 100 25 100 0 60 70 0 0 0 0
Bac.fragilis 0 0 99 0 99 99 99 0 99 0 1 99 1 41 99 0 99 0 2 0 96 0 0 1
Bac.ovatus/thetaio. 80 1 99 7 99 99 99 28 99 99 3 95 1 65 99 23 99 2 99 83 65 0 0 0
Bac.ster./eggerthii 99 0 99 1 92 25 90 10 75 70 10 65 0 30 99 0 30 0 65 0 50 0 0 0
Bac.uniformis 91 0 99 0 99 99 95 97 99 95 3 99 0 99 99 1 98 0 42 1 9 0 0 0
Bac.vulgatus 0 0 99 0 99 98 98 0 99 92 5 23 1 8 99 0 94 0 77 3 2 1 0 1
Bifidobacterium spp 1 0 0 99 30 99 99 99 70 60 75 2 40 0 40 70 20 91 25 0 35 0 0 99 0
Bifidobacterium spp 2 0 0 99 99 99 99 99 99 90 80 1 75 45 99 99 85 100 75 50 99 0 0 99 0
Camp.ureolyticus 1 99 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0
Cl.baratii 0 0 99 8 75 99 80 99 0 0 0 75 54 99 99 0 0 8 8 8 0 99 99 0
Cl.beijer./butyricum 1 0 99 47 95 99 98 97 97 80 10 76 54 95 95 20 80 31 25 90 0 100 89 0
Cl.bifermentans 90 0 75 0 0 0 70 10 0 0 90 6 5 0 50 0 0 4 0 0 0 97 99 0
Cl.botulinum/sporo. 20 0 55 0 0 1 72 0 0 0 99 20 1 1 1 0 0 1 0 40 0 99 99 0
Cl.cadaveris 98 0 87 0 0 6 6 0 0 1 84 0 0 0 40 0 0 1 0 5 0 99 97 0
Cl.clostridioforme 0 0 90 0 77 99 99 88 91 94 5 75 1 77 99 75 94 1 86 88 25 75 75 0
Cl.difficile 0 0 99 80 0 0 0 20 5 0 44 30 1 5 66 83 0 5 1 5 0 98 99 0
Cl.histolyticum 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 90 0
Cl.innocuum 0 0 99 99 0 46 0 99 5 15 1 45 1 99 99 4 1 0 0 25 0 99 99 0
Cl.paraputrificum 0 0 99 0 99 92 99 99 0 0 0 99 0 99 99 0 7 7 0 21 0 99 99 1
Cl.perfringens 0 0 99 2 95 95 99 1 0 0 99 4 54 4 99 0 16 10 0 76 1 84 99 0
Cl.ramosum 1 0 99 80 99 99 99 99 0 0 0 40 0 99 99 0 60 0 57 94 0 92 75 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 107


Annexes API® 20 A V5.0

Taxon IND URE GLU MAN LAC SAC MAL SAL XYL ARA GEL ESC GLY CEL MNE MLZ RAF SOR RHA TRE CAT SPOR GRAM COCC

Cl.septicum 0 0 99 1 99 0 94 94 0 1 75 35 0 76 99 0 0 0 1 84 1 99 99 0
Cl.sordellii 99 99 95 0 0 0 90 0 0 0 95 0 0 1 4 0 0 4 0 0 0 99 99 0
Cl.tertium 0 0 99 99 99 99 99 99 70 0 0 35 0 99 99 62 0 1 0 85 0 99 99 0
Clostridium spp 10 1 1 0 0 0 1 0 0 0 90 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 99 0
Collin.aerofaciens 0 0 100 0 99 90 90 75 0 0 0 40 0 75 99 0 0 0 0 70 0 0 100 0
Eggerthella lenta 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 60 0 100 0
Eubac.limosum 0 0 100 70 0 0 0 4 1 1 4 4 10 0 4 0 0 0 0 0 5 0 100 0
Fuso.mortiferum 1 0 99 0 0 70 15 75 5 0 5 25 25 25 75 0 75 0 0 23 3 0 0 0
Fuso.necro./nucleat. 94 0 1 0 1 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0
Fuso.varium 70 0 81 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Gem.morbillorum 0 0 100 8 5 90 100 8 0 0 0 5 0 5 100 0 5 5 0 20 0 0 100 99
Lacto.acid./jense. 0 0 99 3 80 99 96 99 1 0 3 75 8 99 99 5 15 5 3 90 0 0 100 0
Parab.distasonis 0 0 99 1 99 99 93 73 86 27 1 80 4 60 95 65 98 1 80 70 77 0 0 0
Peptoni.asacchar. 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 0 0 0 0 0 0 0 1 18 0 98 99
Peptostrepto.group 0 5 5 0 1 0 1 1 0 0 27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 94 100
Por.asaccharolytica 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 1 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3
Prev.bivia 1 0 99 1 99 0 99 1 1 1 50 0 80 0 99 0 0 0 1 0 0 0 0 1
Prev.interm./disiens 32 0 99 0 0 35 98 0 0 0 70 1 4 1 85 0 19 0 1 1 1 0 0 3
Prev.melani./oralis 0 0 97 1 97 83 97 31 2 1 20 51 18 53 97 1 89 0 12 4 0 0 0 1
Prop.acnes 67 0 97 20 1 5 0 0 0 0 69 0 97 0 97 0 0 10 0 1 89 0 100 1
Prop.granulosum 0 0 99 41 1 82 31 0 0 1 18 0 99 0 98 25 35 0 4 67 79 0 100 0
Prop.prop./avid. 0 0 92 50 50 73 80 0 2 5 40 0 45 0 50 2 75 0 1 30 30 0 82 0
Staph.saccharolytic. 0 25 87 0 5 0 0 0 0 5 0 5 75 0 75 0 0 0 5 5 99 0 100 100
Str.constellatus 0 0 100 0 22 100 100 100 0 0 0 22 0 33 100 0 0 0 0 66 0 0 100 100
Str.intermedius 0 0 99 20 99 99 99 95 0 0 0 75 0 90 99 6 26 0 0 99 0 0 100 100
Veillonella parvula 0 0 1 0 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 0 1 0 1 0 50 0 1 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 108


Annexes API® Coryne V4.0

API® Coryne V4.0

Taxon NIT PYZ PYRA PAL ßGUR ßGAL αGLU ßNAG ESC URE GEL 0 GLU RIB XYL MAN MAL LAC SAC GLYG CAT

Actino.neuii anit. 0 100 0 63 0 100 100 0 1 0 0 0 75 89 90 90 90 0 90 0 99


Actino.neuii neuii 99 100 0 1 0 100 100 0 0 0 0 0 97 89 24 89 89 1 75 0 100
Actino.radingae 0 100 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 42 50 35 0 42 0 1 0 0
Actino.turicensis 1 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 99 95 95 0 63 0 99 1 0
Arcano.haemolyticum 4 90 59 90 18 85 87 83 0 0 1 0 100 83 1 1 99 99 50 0 1
Arthrobacter spp 31 100 62 56 37 56 75 14 31 1 50 0 1 1 0 0 0 0 0 0 100
Brevibacterium spp 25 70 70 92 0 20 62 20 20 0 66 0 25 20 7 0 25 20 20 0 100
Cellulom./Micro.spp 42 100 31 22 1 82 100 68 98 0 25 0 100 22 68 65 98 31 98 20 99
Cellulosi.cellulans 98 100 90 98 1 98 100 90 100 0 95 0 98 98 95 0 98 33 98 76 100
Coryn.accolens 100 50 42 0 0 0 0 1 0 0 0 0 100 98 0 7 1 0 28 0 100
Coryn.aferm./coyleae 0 100 76 100 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 100
Coryn.argentorat. 0 100 0 55 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 100
Coryn.auris/Tur.oti. 0 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100
Coryn.bovis 1 42 58 99 0 90 0 0 1 60 0 0 42 1 0 0 0 0 0 0 100
Coryn.diph.gravis 99 1 0 12 0 0 99 0 0 0 0 0 100 100 0 0 99 1 1 99 100
Coryn.diph.mit./bel. 46 0 0 1 0 0 96 0 0 0 0 0 100 99 0 0 100 0 3 3 100
Coryn.glucuronolyt. 58 100 27 1 100 14 1 0 37 62 1 0 100 47 33 0 27 2 97 0 100
Coryn.group F-1 71 100 0 1 0 0 0 0 0 99 0 0 99 28 0 0 99 0 100 0 99
Coryn.group G 17 99 42 99 0 0 0 0 1 0 0 0 100 100 0 1 50 0 92 0 99
Coryn.jeikeium 3 86 5 100 0 0 0 0 1 1 0 0 98 83 0 0 21 0 1 1 99
Coryn.kutscheri 82 64 100 0 0 0 100 0 100 100 0 0 100 100 0 0 99 0 100 0 100
Coryn.macginleyi 93 0 38 99 0 0 1 0 0 3 0 0 100 87 0 3 6 1 93 1 99
Coryn.propinquum 71 71 35 60 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100
Coryn.pseudodipht. 98 93 58 53 0 0 1 0 1 92 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 100
Coryn.pseudotuber. 2 1 0 50 0 0 50 0 0 100 1 0 100 99 0 0 81 0 0 1 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 109


Annexes API® Coryne V4.0

Taxon NIT PYZ PYRA PAL ßGUR ßGAL αGLU ßNAG ESC URE GEL 0 GLU RIB XYL MAN MAL LAC SAC GLYG CAT

Coryn.renale group 6 85 0 10 100 0 0 0 0 100 0 0 100 99 3 0 0 1 0 0 93


Coryn.striat./amyc. 57 91 15 97 0 0 1 0 2 26 0 0 100 45 0 1 71 0 69 1 99
Coryn.ulcerans 1 1 1 99 0 1 99 1 1 99 1 0 100 99 1 1 99 1 13 99 100
Coryn.urealyticum 1 98 0 50 0 1 1 0 4 100 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 100
Dermabacter hominis 0 0 99 96 0 100 100 100 99 0 1 0 100 99 31 0 99 99 100 0 100
Erysi.rhusiopathiae 1 7 70 3 0 8 0 96 0 14 0 0 67 45 0 0 1 60 1 1 0
Gardnerel.vaginalis 4 89 1 0 0 43 65 18 2 1 0 0 99 91 4 2 97 1 13 53 6
Leif.aquatica 26 99 10 57 0 63 100 80 95 0 52 0 0 0 0 0 0 0 1 0 99
List.grayi 42 92 0 7 0 0 42 92 100 0 0 0 100 100 0 99 100 92 17 0 98
List.monocy./innocua 2 66 0 69 0 4 99 99 100 0 0 0 100 1 3 0 100 64 8 0 99
Listeria spp 2 29 0 58 0 1 94 73 100 0 0 0 100 28 95 0 100 32 2 0 99
Prop.acnes 24 0 63 36 54 89 63 100 0 0 1 0 89 63 0 2 0 0 0 0 100
Prop.avidum 0 9 66 0 0 100 66 97 90 0 78 0 97 90 0 2 78 0 66 0 100
Rhodococcus spp 53 71 13 97 0 1 86 1 50 20 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99
Rothia dentocariosa 99 100 99 21 0 0 100 0 99 0 2 0 100 0 0 0 100 0 100 0 100
Truep.bernardiae 0 100 71 0 0 0 99 0 0 0 0 0 50 100 0 0 100 0 0 100 0
Truep.pyogenes 1 1 98 71 99 96 98 47 1 0 99 0 100 100 96 1 99 94 56 19 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 110


Annexes API® Campy V3.0

API® Campy V3.0

Taxon URE NIT EST HIP GGT TTC PyrA ArgA AspA PAL H2S GLUa SUT NAL CFZ ACE PROP MLTa CITa ERO CAT

Arco.cryaerophilus 20 82 68 0 0 42 0 0 0 82 0 0 57 5 1 76 35 6 0 0 99
Camp.coli 0 99 80 0 1 63 0 73 0 77 1 0 98 10 79 61 73 20 25 30 100
Camp.fetus fetus 1 97 26 0 1 54 0 55 0 14 0 0 98 78 35 71 3 55 7 2 100
Camp.fetus vener. 0 91 1 0 0 30 0 27 0 0 0 0 94 43 2 36 0 26 0 0 100
Camp.hyointestinalis 0 70 9 0 0 50 0 28 0 27 72 0 98 75 5 95 4 60 4 4 100
Camp.jejuni doylei 0 0 29 100 55 33 0 11 3 92 0 0 55 0 6 40 0 37 25 0 99
Camp.jejuni jejuni 1 0 98 68 91 0 43 10 4 1 81 0 1 91 4 84 47 2 84 33 1 99
Camp.jejuni jejuni 2 0 92 78 99 100 39 15 9 2 73 0 0 96 4 93 59 4 84 25 4 99
Camp.jejuni jejuni 3 0 100 100 1 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99
Camp.lari 0 84 5 0 21 18 0 65 1 9 13 0 6 3 1 2 0 2 1 0 100
Camp.lari UPTC 100 80 0 0 0 47 0 4 14 0 4 0 4 0 0 0 0 0 0 0 100
Camp.mucosalis 0 0 30 0 0 2 0 7 85 45 80 0 96 48 0 96 0 87 0 3 1
Camp.sput.Fecalis 0 99 45 0 1 75 0 37 90 15 99 0 99 45 0 99 1 82 0 2 99
Camp.sput.Sput. 0 72 20 0 0 60 0 1 72 4 88 0 52 20 4 44 0 32 0 0 1
Camp.upsaliensis 0 78 7 8 1 35 0 1 20 70 2 0 30 0 1 16 1 5 1 0 30
Helico.cinaedi 0 81 5 0 0 3 0 0 0 14 0 0 15 0 0 31 5 6 0 0 99
Helico.fennelliae 0 5 88 0 0 1 0 25 1 90 0 0 40 0 0 0 12 70 0 0 99
Helico.pylori 98 1 1 0 91 1 0 4 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 111


Annexes API® Listeria V2.0

API® Listeria V2.0

Taxon DIM ESC αMAN DARL DXYL RHA MDG RIB G1P TAG

List.grayi 99 100 99 99 1 16 33 100 0 0

List.innocua 99 100 98 100 2 66 98 0 0 0

List.ivanovii 88 100 0 99 97 4 99 33 91 0

List.monocytogenes 0 100 98 97 0 98 99 0 5 0

List.seeligeri 97 100 5 99 99 0 99 0 0 0

List.welshimeri 90 100 96 100 98 76 99 0 0 97

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 112


Annexes API® NH V4.0

API® NH V4.0

Taxon GLU FRU MAL SAC ODC URE LIP PAL ßGAL PRO GGT IND

Act.pleuropneumoniae 100 100 100 100 0 100 0 100 100 0 0 0


Ag.aphrophilus 100 96 99 96 0 0 0 100 88 0 29 0
Avi.paragallinarum 100 100 0 100 0 0 0 100 0 0 1 0
H.influenzae 100 89 12 1 40 92 0 100 0 0 5 74
H.parainfluenzae 100 94 94 97 73 55 0 97 30 0 5 11
Histophilus somni 100 100 0 0 100 0 0 0 0 0 0 50
M.(Bran.)catarrhalis 1 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0
Neis.cinerea 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0
Neis.gonorrhoeae 97 0 0 0 0 1 0 0 0 99 0 0
Neis.lactamica 100 0 100 0 0 0 0 0 100 100 0 0
Neis.meningitidis 97 0 90 0 0 0 0 0 0 44 100 0
Neis.polysaccharea 100 0 100 75 0 0 0 0 0 99 0 0
Neisseria spp 100 80 86 65 0 0 0 0 1 99 7 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 113


Annexes API® 50 CHB V4.1

API® 50 CHB V4.1


Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Aneur.aneurinilytic. 0 50 0 0 9 33 9 0 0 0 33 33 33 9 0 0 0 0 9 0
B.anthracis 0 49 1 0 1 99 1 0 0 0 0 100 79 2 0 0 0 1 0 1
B.cereus 1 0 74 0 1 1 99 1 0 0 1 8 100 99 26 0 1 0 1 1 1
B.cereus 2 0 11 1 0 0 77 1 0 0 0 3 100 99 1 0 0 0 0 0 0
B.circulans 0 48 0 18 96 80 98 1 1 68 94 100 97 97 1 45 1 20 89 20
B.coagulans 0 71 0 4 47 66 52 0 1 1 98 100 100 98 1 42 1 9 28 38
B.firmus 0 41 0 0 4 20 7 0 0 0 1 88 50 11 0 0 0 1 66 2
B.lentus 0 40 0 1 50 55 10 0 0 10 55 95 95 95 0 40 17 1 60 17
B.licheniformis 0 90 1 1 99 97 87 1 1 1 75 100 100 99 8 32 1 69 99 92
B.megaterium 0 80 1 1 87 86 76 1 1 1 82 100 99 28 1 8 1 55 97 39
B.mycoides 0 20 0 0 1 98 1 0 0 0 28 100 99 4 0 0 0 1 4 1
B.pumilus 0 72 1 1 88 97 65 0 0 0 49 99 100 99 1 14 1 11 99 2
B.smithii 0 89 0 0 36 97 97 0 0 0 36 100 100 75 0 45 0 2 100 2
B.subtilis/B.amylol. 0 77 0 0 84 91 56 0 0 0 12 95 98 87 1 1 1 65 95 86
Bacillus non react. 0 1 1 0 1 1 2 0 1 1 2 6 10 2 1 1 0 2 9 1
Brevi.agri 0 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42 42 0 0 0 0 21 94 0
Brevi.laterosporus 0 72 0 0 1 61 20 0 0 0 0 98 98 66 0 1 0 1 61 5
Brevi.non reactive 0 13 0 0 1 8 2 0 0 1 0 23 19 1 0 1 1 3 22 1
Geo.stearothermoph. 0 45 0 0 4 17 1 0 0 0 25 100 98 98 1 0 1 1 10 4
Geo.thermoglucosid. 0 36 0 0 47 68 73 0 0 0 31 100 95 95 0 63 0 4 63 26
Pae.alvei 0 100 0 0 0 100 0 0 96 0 28 87 3 28 0 0 0 40 0 0
Pae.amylolyticus 0 26 0 0 84 84 100 0 0 93 100 100 100 100 0 53 0 1 99 0
Pae.glucanolytic. 0 61 0 38 100 100 99 11 0 72 88 88 100 88 0 29 11 14 94 11
Pae.lautus 0 73 0 46 100 93 100 0 26 66 100 100 100 99 0 0 6 6 99 6
Pae.macerans 0 77 0 51 99 82 99 1 1 82 100 100 100 99 0 58 0 11 93 22
Pae.polymyxa 0 83 0 2 93 100 97 0 0 83 97 100 99 97 0 2 0 1 99 0
Pae.thiaminolyt. 0 94 0 0 0 87 0 0 22 0 100 100 94 94 0 0 0 58 0 0
Pae.validus 0 93 0 0 6 100 93 0 0 6 100 100 100 43 0 0 85 100 100 6
Virgi.pantothenticus 0 55 0 44 0 88 0 0 0 0 98 100 100 98 0 79 0 20 0 50

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 114


Annexes API® 50 CHB V4.1

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN

Aneur.aneurinilytic. 9 0 9 9 9 9 9 9 9 33 9 33 9 0 0 9 0 0 0 9
B.anthracis 0 0 99 0 79 97 33 71 99 1 1 99 99 1 1 1 51 84 0 1
B.cereus 1 1 3 97 30 99 99 88 88 100 3 1 55 99 1 1 2 83 77 1 3
B.cereus 2 0 0 99 0 43 68 24 2 100 10 0 74 97 0 0 0 65 63 0 0
B.circulans 32 64 84 99 96 100 99 99 99 92 92 99 99 52 50 96 99 92 26 98
B.coagulans 4 66 100 71 76 83 76 76 100 66 100 95 98 1 1 61 95 23 0 61
B.firmus 0 2 63 1 4 55 1 11 92 1 1 77 58 1 0 1 48 3 0 1
B.lentus 1 35 82 65 82 98 75 75 98 82 55 82 82 25 30 75 75 55 0 50
B.licheniformis 1 99 62 99 99 100 99 99 100 44 26 99 99 50 1 44 99 87 1 60
B.megaterium 3 30 87 73 80 97 84 83 99 76 90 98 99 60 49 89 94 95 11 81
B.mycoides 0 1 99 12 80 77 80 31 98 20 1 57 98 1 1 1 99 99 0 0
B.pumilus 37 27 64 62 98 100 99 99 35 14 15 99 99 1 0 15 1 1 1 67
B.smithii 0 89 0 0 2 24 10 24 100 0 10 54 100 0 0 0 0 0 0 0
B.subtilis/B.amylol. 0 83 29 70 80 100 86 97 98 23 48 90 88 58 0 62 78 79 1 52
Bacillus non react. 1 1 24 1 1 19 1 1 5 2 1 6 5 2 1 1 1 1 1 1
Brevi.agri 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 21 0 0 0 0 0 0 0
Brevi.laterosporus 0 1 98 38 88 94 79 66 88 0 0 5 98 0 0 0 5 11 0 12
Brevi.non reactive 0 1 6 1 2 37 2 5 6 1 0 5 8 1 0 2 1 1 1 1
Geo.stearothermoph. 0 50 4 1 4 30 25 17 100 10 55 95 75 0 75 55 95 82 0 4
Geo.thermoglucosid. 0 63 73 31 31 89 42 63 100 0 10 73 100 0 1 10 52 0 0 31
Pae.alvei 0 50 96 71 87 100 87 50 100 0 50 40 28 0 0 40 50 28 0 40
Pae.amylolyticus 46 100 93 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 6 53 100 100 100 0 100
Pae.glucanolytic. 20 94 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 55 75 100 99 99 5 100
Pae.lautus 6 98 100 100 100 100 100 100 100 100 100 100 98 33 53 100 99 93 6 100
Pae.macerans 22 77 40 97 99 100 97 99 100 100 100 100 100 88 62 99 99 99 5 97
Pae.polymyxa 6 71 46 100 100 100 100 99 100 97 100 100 100 69 22 99 99 93 0 97
Pae.thiaminolyt. 35 70 70 87 98 98 98 87 100 94 70 94 87 0 77 70 87 70 0 87
Pae.validus 0 100 0 0 0 100 0 25 100 6 25 100 100 50 0 43 68 68 6 6
Virgi.pantothenticus 1 100 100 88 100 100 100 38 100 20 0 94 100 0 0 0 98 5 0 27

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 115


Annexes API® 50 CHB V4.1

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL NIT
Aneur.aneurinilytic. 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 9 9 0 0 66 0 9 0 0 9 9 90
B.anthracis 1 0 1 0 1 0 1 14 0 2 1 1 1 1 31 1 1 1 0 26 98 78
B.cereus 1 2 1 0 0 1 0 1 47 0 1 4 71 1 1 28 1 2 1 1 43 98 74
B.cereus 2 1 0 0 0 1 0 0 20 0 0 1 52 1 1 54 1 2 1 1 30 99 61
B.circulans 85 1 1 1 21 21 10 61 11 8 87 1 1 1 4 1 1 1 1 28 15 13
B.coagulans 61 0 0 0 1 57 0 61 4 0 73 19 1 1 1 1 1 1 1 57 1 17
B.firmus 0 0 1 0 0 0 0 7 0 0 18 4 1 2 13 1 2 1 2 39 48 70
B.lentus 40 0 10 0 0 4 0 1 0 0 98 0 1 0 25 0 30 0 0 25 40 60
B.licheniformis 75 1 91 1 1 1 1 39 0 0 99 91 1 1 48 1 15 1 1 83 86 68
B.megaterium 73 0 1 0 1 11 0 4 0 1 92 1 1 1 11 1 1 1 1 40 95 15
B.mycoides 4 1 0 0 0 0 0 12 0 0 27 48 1 1 34 1 1 1 1 55 89 68
B.pumilus 31 3 90 1 1 0 0 1 1 0 99 1 1 1 40 1 1 1 1 86 95 2
B.smithii 54 0 0 0 0 24 0 10 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 3 85 3
B.subtilis/B.amylol. 50 0 0 1 1 1 0 7 0 0 73 1 1 1 44 1 2 1 1 90 99 57
Bacillus non react. 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 12 1 1 1 23 1 32 1 1 17 49 18
Brevi.agri 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 0 0 94 100 0
Brevi.laterosporus 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 11 0 1 0 5 66 66 42
Brevi.non reactive 1 0 1 1 0 1 0 0 0 1 19 7 1 1 15 1 9 1 1 40 41 39
Geo.stearothermoph. 50 1 4 0 0 0 0 0 0 1 10 1 1 1 1 1 1 1 1 10 57 11
Geo.thermoglucosid. 73 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27 99 66
Pae.alvei 28 0 0 0 0 0 0 12 0 0 87 0 0 0 0 0 12 0 100 96 3 1
Pae.amylolyticus 100 0 0 0 6 0 0 0 0 0 99 1 1 1 1 1 8 1 1 30 2 69
Pae.glucanolytic. 100 0 0 0 27 0 0 27 0 1 91 1 1 1 1 1 5 1 1 1 12 35
Pae.lautus 97 0 6 0 40 6 0 53 0 0 99 7 1 1 1 1 7 1 1 64 1 8
Pae.macerans 93 1 0 0 37 51 0 74 1 3 93 1 1 1 1 1 1 1 1 76 30 12
Pae.polymyxa 99 0 0 0 2 0 0 35 0 1 97 2 1 1 2 6 1 1 1 56 70 37
Pae.thiaminolyt. 94 0 0 0 47 0 0 58 0 0 71 7 1 1 1 71 92 1 92 1 71 42
Pae.validus 100 0 25 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98 0 62
Virgi.pantothenticus 66 0 98 0 61 0 0 33 0 0 22 5 1 1 29 12 1 1 1 1 70 25

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 116


Annexes API® 50 CHE V3.2

API® 50 CHE V3.2


Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Aer.caviae 0 84 0 0 90 95 0 0 0 0 100 100 100 81 0 1 0 0 100 1
Aer.hydrophila 0 98 0 1 76 97 1 0 0 0 99 99 99 80 0 5 0 1 99 19
Aer.salm.salmonicida 0 89 0 0 0 100 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 0 0 100 0
Aer.sobria 0 100 0 0 1 99 0 0 0 0 100 100 100 100 0 3 0 0 99 0
Buttiaux.agrestis 0 97 0 58 100 99 100 0 0 0 100 100 100 100 9 100 2 0 100 0
Ced.davisae 0 71 0 0 0 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 25 100 0
Ced.lapagei/neteri 0 100 0 0 1 100 38 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 25 99 30
Citro.amalonaticus 0 97 0 97 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 95 100 1 1 100 100
Citro.braakii 0 100 0 100 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 20 100 62 4 100 100
Citro.farmeri 0 100 0 100 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 100 100 0 0 100 100
Citro.freundii 0 100 0 84 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 91 100 15 99 100 100
Citro.koseri 0 100 0 50 100 100 99 0 99 0 100 100 100 100 0 99 50 50 100 100
Citro.youngae 0 100 0 100 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 100 100 94 0 100 100
Cronobacter spp 0 86 0 5 97 95 98 0 0 0 100 100 100 100 0 100 29 43 100 0
Edwardsiel.hoshinae 0 67 0 0 1 100 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 80 0
Edwardsiel.tarda 0 99 0 0 50 100 0 0 0 0 100 100 100 99 0 0 0 0 10 0
Ent.aerogenes 0 100 0 1 100 100 100 0 99 0 100 100 100 100 0 100 25 100 100 100
Ent.amnigenus 1 0 60 0 0 100 92 100 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 1 100 7
Ent.amnigenus 2 0 93 0 0 100 99 100 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 1 100 99
Ent.asburiae 0 98 0 0 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 0 1 0 66 99 100
Ent.cancerogenus 0 91 0 80 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 0 100 1
Ent.cloacae 0 85 1 45 99 99 98 1 20 0 100 100 100 100 1 91 11 40 99 91
Ent.gergoviae 0 100 1 1 100 100 100 0 0 0 100 100 100 99 0 99 0 50 100 0
Erwinia spp 0 1 0 29 99 99 99 0 0 1 100 100 100 100 0 87 0 10 99 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 117


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Esch.coli 1 0 91 1 42 99 99 98 1 0 0 99 100 99 99 68 88 61 8 99 93
Esch.coli 2 0 92 1 28 95 92 85 4 12 0 100 100 99 99 4 89 36 0 92 93
Esch.coli 3 0 99 1 60 99 99 98 0 21 0 100 100 99 99 19 91 55 11 96 99
Esch.fergusonii 0 99 0 1 100 100 100 0 99 0 100 100 100 100 50 99 26 0 99 0
Esch.hermannii 0 80 0 99 100 100 100 0 0 0 99 100 100 100 0 100 25 0 100 0
Esch.vulneris 0 90 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 93 0 0 100 1
Ewingella americana 0 83 0 0 0 100 9 0 0 0 100 100 100 100 0 2 0 0 100 0
Hafnia alvei 0 98 0 38 85 100 99 0 0 0 100 100 100 100 1 93 1 0 100 1
K.oxytoca 0 99 1 100 100 100 100 0 100 1 100 100 100 100 92 99 69 98 100 99
K.pneum.ozaenae 0 64 0 1 97 99 97 0 97 0 97 100 100 100 55 58 1 55 99 81
K.pneum.pneumoniae 0 97 1 16 99 99 99 0 88 0 100 100 100 99 40 98 33 95 99 98
K.pneum.rhinosclero. 0 10 0 1 99 100 100 0 99 0 100 100 100 100 0 75 0 83 100 99
Kluy.ascorbata 0 90 0 1 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 0 100 1 0 100 5
Kluy.cryocrescens 0 50 0 50 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 0 99 50
Kluy.intermedia 0 100 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 99 95 0 99 99
Lecl.adecarboxylata 0 99 0 0 100 100 100 0 80 0 100 100 100 100 0 100 75 0 100 1
Moell.wisconsensis 0 99 0 0 0 100 0 0 100 0 100 100 100 100 0 0 0 0 33 0
Morg.morg.morganii 0 50 0 0 1 100 0 0 0 0 99 100 100 100 0 0 0 0 1 0
Morg.morg.sibonii 0 50 0 0 1 100 0 0 0 0 99 100 100 100 0 0 0 0 1 0
Pantoea agglomerans 0 41 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 99 97 2
Pantoea dispersa 0 97 1 1 100 100 100 0 1 0 100 100 100 100 0 89 0 100 100 0
Pantoea spp 1 0 1 0 1 100 100 99 0 2 0 100 100 100 100 1 80 1 8 100 1
Pantoea spp 2 0 75 0 10 100 99 97 0 1 0 100 100 100 100 13 95 26 18 100 71
Photo.damselae 0 0 0 0 0 1 4 0 0 0 100 100 99 100 0 0 0 0 0 0
Plesio.shigelloides 0 88 0 0 0 100 0 0 0 0 100 100 11 22 0 0 0 100 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 118


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Proteus mirabilis 0 100 0 100 0 100 100 0 0 0 100 100 20 0 0 1 0 0 0 0
Proteus penneri 0 99 0 100 1 100 100 0 0 0 100 100 75 1 1 1 0 0 0 0
Proteus vulgaris gr. 0 71 1 90 0 100 99 0 0 0 100 100 15 0 0 1 0 0 0 0
Prov.alcalifaciens 0 67 0 0 0 100 1 0 98 0 0 100 100 100 0 0 0 1 1 1
Prov.rettgeri 0 80 70 0 10 100 1 0 100 0 80 100 100 100 0 70 0 99 99 1
Prov.rustigianii 0 50 0 0 0 100 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Prov.stuartii 0 75 0 0 0 100 1 0 1 0 99 100 100 99 0 0 0 80 1 1
Rahnella aquatilis 0 93 0 1 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 1 99 94 0 100 99
Raou.ornithinolytica 0 100 0 0 100 100 100 0 100 0 100 100 100 100 100 100 1 98 100 100
Raou.planticola 0 100 0 7 100 100 100 0 100 0 100 100 100 100 100 99 3 100 100 100
Raou.terrigena 0 100 0 0 100 100 100 0 100 0 100 100 100 100 99 100 1 91 100 100
Salm.Gallinarum 0 99 0 0 99 100 99 0 0 0 100 100 100 100 0 75 100 0 100 0
Salm.Paratyphi A 0 99 0 0 100 100 0 0 0 0 100 100 100 100 0 100 99 1 100 99
Salm.Pullorum 0 91 0 0 100 100 95 0 0 0 100 100 100 100 0 100 0 0 100 72
Salm.Typhi 0 99 1 0 1 100 92 0 0 0 100 100 100 100 0 0 1 0 100 99
Salm.Typhimurium 0 99 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 75 100 50 100 100
Salm.enter.arizonae 0 98 0 40 96 100 100 0 0 0 100 100 100 100 1 100 12 0 100 100
Salm.enter.enterica 0 99 0 0 1 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 100 10 0 100 100
Salmonella spp 0 86 0 33 86 100 96 0 0 1 100 100 99 99 1 100 93 34 95 95
Ser.ficaria 0 74 71 0 100 100 100 0 74 0 95 100 100 100 0 74 0 74 100 100
Ser.fonticola 0 100 91 10 100 100 75 1 100 0 100 100 100 100 0 90 99 90 100 100
Ser.liquefaciens 0 98 1 1 99 100 99 0 1 0 100 100 100 100 0 1 1 85 99 99
Ser.marcescens 0 99 17 1 0 100 21 0 92 0 99 100 100 100 0 0 0 99 100 99
Ser.odorifera 1 0 100 1 1 100 100 100 0 99 0 100 100 100 100 0 99 0 100 100 100
Ser.odorifera 2 0 100 99 20 100 100 100 0 99 0 100 100 100 100 0 99 0 100 100 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 119


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Ser.plymuthica 0 94 0 0 100 100 99 0 0 0 100 100 100 100 0 1 0 99 100 65
Ser.proteamaculans 0 80 2 0 80 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 4 1 97 100 69
Ser.rubidaea 0 100 83 1 100 100 99 0 100 0 96 100 100 100 0 1 0 99 100 1
Shigella boydii 0 94 0 1 100 99 0 0 0 0 100 100 100 100 25 0 0 0 75 75
Shigella dysenteriae 0 99 0 0 15 75 0 0 0 0 100 100 100 100 30 25 0 0 0 10
Shigella flexneri 0 44 0 0 99 44 1 0 0 0 100 100 100 100 0 1 44 0 67 1
Shigella sonnei 0 71 0 1 100 98 1 0 0 0 100 100 100 100 0 71 0 0 100 1
V.alginolyticus 0 95 0 0 4 99 0 0 0 0 73 100 100 97 0 0 0 0 99 67
V.cholerae 0 98 0 0 0 100 0 0 0 0 100 100 100 43 0 0 0 0 100 0
V.fluvialis 0 75 0 0 100 100 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 1 100 3
V.metschnikovii 0 60 0 0 0 60 0 0 0 0 30 100 100 99 0 0 0 50 99 10
V.mimicus 0 99 0 0 0 100 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 100 0
V.parahaemolyticus 0 20 0 0 60 60 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 60 20
V.vulnificus 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 99 100 100 99 0 0 0 0 50 0
Y.aldovae 0 57 0 0 99 100 43 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 1 99 99
Y.enterocolitica 0 99 0 0 98 99 60 0 0 0 100 100 100 100 99 1 0 65 100 100
Y.frederiksenii 0 100 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 100 99 0 99 100 100
Y.intermedia 0 100 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 100 99 0 99 100 100
Y.kristensenii 0 99 0 0 100 100 60 0 0 0 100 100 100 100 92 0 0 68 100 100
Y.pestis 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 98 1
Y.pseudotuberculosis 0 99 0 0 99 100 100 0 1 0 100 100 100 100 1 99 0 0 100 0
Y.ruckeri 0 63 0 0 1 95 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 100 13

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 120


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Aer.caviae 0 1 100 0 99 100 98 90 100 66 1 99 100 0 0 1 100 84 0 15
Aer.hydrophila 0 33 100 1 84 87 69 53 99 41 1 88 99 0 1 1 99 99 0 14
Aer.salm.salmonicida 0 95 100 0 100 100 2 0 100 2 0 1 52 0 0 0 100 100 0 0
Aer.sobria 0 50 100 1 1 1 0 71 100 6 3 93 100 1 0 3 100 100 0 0
Buttiaux.agrestis 0 25 99 25 100 100 100 100 99 100 99 22 100 0 0 75 25 0 0 100
Ced.davisae 0 10 100 43 100 90 99 100 100 1 0 100 100 0 0 5 0 0 0 100
Ced.lapagei/neteri 0 0 100 23 99 100 100 100 99 90 1 30 100 0 0 0 8 0 0 100
Citro.amalonaticus 0 1 100 1 97 1 89 100 100 63 5 1 100 0 0 0 10 1 0 100
Citro.braakii 0 71 100 0 1 0 0 99 99 51 99 4 100 0 0 17 1 0 0 98
Citro.farmeri 0 99 100 6 100 50 93 100 100 100 100 100 100 0 0 100 0 0 0 100
Citro.freundii 0 8 100 0 15 0 3 99 99 99 84 96 100 1 0 72 1 1 0 91
Citro.koseri 0 99 100 1 99 17 80 100 100 99 0 17 100 0 0 0 1 0 0 100
Citro.youngae 0 0 100 0 0 0 5 93 100 78 0 0 100 0 0 0 0 0 0 78
Cronobacter spp 0 71 100 1 100 100 100 100 100 100 100 100 100 0 0 100 9 0 0 99
Edwardsiel.hoshinae 0 0 100 0 0 1 10 0 99 0 0 100 100 0 0 0 0 1 0 0
Edwardsiel.tarda 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 0 10 0 0 0 0 10 0 0 0
Ent.aerogenes 0 75 99 33 100 100 100 100 99 100 100 100 100 0 0 100 33 0 0 100
Ent.amnigenus 1 0 99 100 0 99 94 99 100 99 94 99 99 100 0 0 99 1 0 0 99
Ent.amnigenus 2 0 99 100 0 93 93 72 100 99 72 93 1 100 0 0 1 6 0 0 99
Ent.asburiae 0 100 100 1 100 99 100 100 100 98 0 100 100 0 0 90 6 0 0 100
Ent.cancerogenus 0 1 100 0 99 90 95 100 100 50 0 0 100 0 0 0 1 0 0 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 121


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Ent.cloacae 0 93 100 7 98 65 82 99 99 91 92 96 100 0 1 96 10 0 0 99
Ent.gergoviae 0 1 100 2 100 100 100 99 100 50 100 100 100 0 0 100 20 1 0 88
Erwinia spp 0 1 100 15 100 100 100 92 2 68 90 100 40 1 1 86 0 0 0 58
Esch.coli 1 1 0 99 0 10 17 10 4 98 78 70 42 99 1 1 34 17 1 1 10
Esch.coli 2 1 0 97 0 4 4 1 1 94 18 44 8 97 1 0 8 16 4 0 1
Esch.coli 3 1 0 99 2 87 89 96 2 99 94 96 38 99 1 0 40 21 2 2 19
Esch.fergusonii 0 0 100 0 99 50 97 99 99 21 1 0 99 21 0 0 1 0 0 35
Esch.hermannii 0 0 100 0 99 40 99 100 100 40 0 40 100 0 0 20 20 0 0 99
Esch.vulneris 0 6 100 1 99 50 50 100 100 50 100 20 99 1 0 90 20 0 0 100
Ewingella americana 0 0 100 0 99 83 83 10 16 83 0 0 99 0 0 0 0 0 0 100
Hafnia alvei 0 1 100 1 20 20 20 15 98 5 0 1 99 1 0 1 1 0 1 85
K.oxytoca 0 99 100 26 99 100 100 100 100 100 100 100 100 1 62 100 85 23 1 99
K.pneum.ozaenae 1 45 99 15 98 97 97 91 97 75 97 30 99 0 0 79 58 15 0 94
K.pneum.pneumoniae 0 98 99 35 96 99 99 99 99 99 99 99 99 0 0 99 65 3 1 99
K.pneum.rhinosclero. 0 0 100 0 99 90 99 99 99 0 99 99 99 0 0 99 25 1 0 25
Kluy.ascorbata 5 99 100 15 100 99 100 100 100 99 100 100 100 0 1 99 0 1 0 100
Kluy.cryocrescens 0 95 100 25 100 100 100 100 100 99 100 99 100 0 1 100 0 1 0 100
Kluy.intermedia 0 100 100 67 100 100 100 100 100 100 100 99 100 0 0 100 1 0 0 100
Lecl.adecarboxylata 0 0 100 15 100 100 100 100 100 99 100 85 100 0 0 95 15 15 0 100
Moell.wisconsensis 0 0 100 0 0 0 0 0 1 100 99 100 0 0 2 99 0 0 0 100
Morg.morg.morganii 0 0 100 1 1 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 97 1
Morg.morg.sibonii 0 0 100 1 1 0 0 0 0 1 0 1 99 0 0 0 0 0 99 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 122


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Pantoea agglomerans 0 0 100 0 100 100 100 21 66 0 2 100 100 0 0 0 1 0 0 0
Pantoea dispersa 0 0 100 1 24 1 1 97 97 45 63 85 97 0 0 0 0 0 1 95
Pantoea spp 1 1 1 100 1 71 66 68 60 80 35 11 98 99 1 1 1 1 1 1 20
Pantoea spp 2 1 26 100 25 100 90 96 99 99 95 77 79 99 1 10 73 7 1 1 98
Photo.damselae 0 0 99 0 0 1 0 0 82 17 0 0 50 0 0 0 1 1 0 0
Plesio.shigelloides 0 0 100 0 1 1 1 0 100 99 66 22 88 0 0 0 0 0 0 0
Proteus mirabilis 0 0 100 0 0 0 0 1 0 1 0 1 98 0 0 1 0 0 0 0
Proteus penneri 0 99 100 0 0 0 0 0 100 1 0 100 80 0 25 1 0 0 0 1
Proteus vulgaris gr. 0 71 100 0 98 70 70 0 99 1 0 100 57 0 29 1 0 0 0 0
Prov.alcalifaciens 0 0 100 0 0 0 1 1 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0
Prov.rettgeri 0 1 100 0 92 90 75 1 1 1 1 15 0 0 0 1 0 0 0 0
Prov.rustigianii 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 0
Prov.stuartii 0 0 99 0 0 1 0 0 0 0 0 20 99 0 0 1 0 1 99 0
Rahnella aquatilis 0 1 100 1 99 100 99 100 99 99 100 100 100 1 22 100 29 1 0 99
Raou.ornithinolytica 0 100 100 1 100 100 100 100 100 100 100 100 100 0 0 100 1 0 0 100
Raou.planticola 0 99 100 9 100 100 100 100 100 100 100 100 100 1 0 100 60 5 0 100
Raou.terrigena 0 100 100 1 100 100 100 100 100 100 100 100 100 1 91 100 74 5 0 100
Salm.Gallinarum 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0
Salm.Paratyphi A 0 0 100 0 1 0 0 1 99 0 100 0 99 0 0 0 1 0 0 0
Salm.Pullorum 0 0 100 0 0 0 0 0 4 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0
Salm.Typhi 0 0 100 0 1 1 0 1 99 1 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0
Salm.Typhimurium 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 123


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Salm.enter.arizonae 0 1 100 0 1 1 1 1 100 94 100 3 100 0 0 2 0 0 0 28
Salm.enter.enterica 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 100 0 10 0 0 0 0 0 0 0
Salmonella spp 0 0 95 0 7 3 3 2 97 2 90 2 99 0 0 2 8 1 0 1
Ser.ficaria 0 25 100 0 100 100 100 99 100 14 74 100 100 0 74 74 0 0 0 74
Ser.fonticola 0 90 100 0 100 100 100 25 99 95 90 50 100 1 0 99 50 0 55 100
Ser.liquefaciens 0 25 100 1 99 99 99 40 92 25 75 99 100 0 75 87 22 0 1 50
Ser.marcescens 0 0 99 0 96 96 99 17 96 4 13 100 100 0 0 1 4 4 79 4
Ser.odorifera 1 0 0 100 1 99 99 99 100 100 99 100 100 100 0 1 100 60 0 0 80
Ser.odorifera 2 0 0 100 1 60 60 99 100 100 80 100 0 100 0 1 10 60 0 0 20
Ser.plymuthica 0 96 100 35 100 96 99 99 92 99 99 100 100 1 99 99 1 0 0 99
Ser.proteamaculans 0 30 100 2 95 99 91 30 69 25 25 97 100 0 8 25 1 0 0 10
Ser.rubidaea 0 75 100 1 100 96 99 99 99 100 99 99 100 1 32 96 1 0 0 100
Shigella boydii 0 0 100 0 0 0 0 0 75 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0
Shigella dysenteriae 0 0 100 0 0 0 0 0 30 0 0 0 99 0 0 0 10 0 0 0
Shigella flexneri 0 0 100 0 0 0 0 0 94 0 25 33 99 0 0 56 1 0 0 0
Shigella sonnei 0 0 99 0 0 1 0 0 86 14 1 1 99 0 0 1 1 0 0 1
V.alginolyticus 0 4 99 0 2 84 34 84 98 1 0 100 99 0 0 1 98 99 1 1
V.cholerae 0 0 100 0 1 0 0 1 100 6 1 99 100 0 1 1 99 99 0 0
V.fluvialis 0 3 100 5 65 82 5 65 100 3 0 100 100 0 0 0 100 95 0 0
V.metschnikovii 0 1 99 0 0 50 1 1 100 25 0 100 100 0 0 0 99 99 0 0
V.mimicus 0 0 100 0 5 0 0 1 100 1 0 1 100 0 1 0 95 1 0 1
V.parahaemolyticus 0 0 99 0 0 0 1 20 99 0 10 0 99 0 0 0 80 70 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 124


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
V.vulnificus 0 0 99 99 99 100 99 99 100 6 0 1 100 6 0 0 100 100 0 99
Y.aldovae 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 1 99 0 0 0 0 0 0 0
Y.enterocolitica 0 0 100 1 81 50 50 99 98 24 0 99 100 0 0 1 1 0 0 98
Y.frederiksenii 0 0 100 1 100 99 99 100 100 1 0 100 100 0 0 1 0 0 0 99
Y.intermedia 0 82 100 15 100 100 100 100 100 0 99 100 100 0 0 99 0 0 0 100
Y.kristensenii 0 0 100 0 27 1 1 100 90 1 0 0 100 3 0 0 1 0 0 90
Y.pestis 0 0 100 0 100 100 95 0 95 0 0 0 100 0 0 1 89 0 0 0
Y.pseudotuberculosis 0 0 100 0 100 99 90 0 100 0 90 0 100 0 0 1 1 0 0 0
Y.ruckeri 0 0 100 0 0 0 0 1 99 0 0 0 99 0 0 1 0 0 0 0

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL
Aer.caviae 1 0 0 0 13 0 0 93 0 1 99 87 1 0 26 0 0 0 75 1 79
Aer.hydrophila 1 0 0 0 9 0 1 97 1 1 99 86 25 1 28 0 0 0 84 43 86
Aer.salm.salmonicida 0 0 0 0 0 0 0 100 0 1 1 80 1 0 0 0 0 0 1 0 95
Aer.sobria 1 0 0 0 23 0 0 100 0 0 99 99 81 0 73 0 0 0 76 68 99
Buttiaux.agrestis 1 1 0 0 25 1 0 100 99 50 100 0 0 80 50 0 0 0 0 0 0
Ced.davisae 2 0 0 0 0 100 0 86 86 14 99 90 0 99 98 0 0 0 0 99 0
Ced.lapagei/neteri 0 0 8 0 0 99 0 90 90 0 99 95 0 0 99 0 0 0 0 85 0
Citro.amalonaticus 0 0 0 0 97 0 0 100 100 99 99 24 0 100 96 0 1 0 99 0 0
Citro.braakii 1 25 0 0 98 0 0 100 100 99 51 45 0 92 82 80 1 0 1 0 0
Citro.farmeri 0 0 27 0 100 6 0 100 100 100 99 27 0 100 1 0 1 0 99 0 0
Citro.freundii 0 19 3 0 99 1 0 100 96 100 99 61 0 1 96 72 1 0 1 0 0
Citro.koseri 0 50 0 0 100 100 0 100 100 100 100 75 0 100 99 0 1 0 100 0 0
Citro.youngae 0 1 0 0 100 0 0 100 94 100 100 91 0 1 99 94 0 0 1 0 0
Cronobacter spp 1 0 0 1 0 0 0 99 86 0 100 98 0 90 86 0 0 0 71 95 1
Edwardsiel.hoshinae 0 0 0 0 100 0 0 100 0 0 0 0 100 99 1 99 0 0 99 0 0
Edwardsiel.tarda 0 0 0 0 100 0 0 100 0 0 0 0 100 99 1 75 0 0 99 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 125


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL
Ent.aerogenes 67 0 67 1 33 100 0 67 67 67 98 0 99 99 60 0 1 0 0 75 0
Ent.amnigenus 1 1 12 0 0 2 0 0 99 96 2 99 44 0 92 60 0 0 0 0 76 0
Ent.amnigenus 2 1 1 0 0 6 0 0 93 50 1 93 72 0 93 72 0 0 0 0 93 0
Ent.asburiae 1 1 0 0 0 0 0 100 100 0 100 14 0 99 99 0 0 0 0 2 0
Ent.cancerogenus 0 0 0 0 95 0 0 99 100 0 100 91 0 99 99 0 0 0 0 99 0
Ent.cloacae 8 18 1 1 49 22 0 88 93 5 99 84 1 90 92 0 1 0 0 85 0
Ent.gergoviae 0 0 0 0 1 99 0 50 100 100 99 0 33 100 70 0 99 0 0 91 0
Erwinia spp 1 0 1 0 0 1 0 21 0 0 100 1 0 0 93 0 0 0 46 78 22
Esch.coli 1 0 2 36 1 95 1 1 99 2 50 83 4 68 58 0 1 9 0 93 0 0
Esch.coli 2 0 0 3 1 91 16 0 98 2 24 21 1 48 4 0 1 1 0 72 0 0
Esch.coli 3 0 11 6 2 87 23 2 99 2 36 91 2 83 46 2 4 15 0 90 0 0
Esch.fergusonii 0 1 0 0 0 100 0 100 100 10 99 1 99 100 1 0 0 0 99 0 0
Esch.hermannii 0 99 0 0 10 1 0 100 100 0 100 0 1 100 1 0 0 0 99 0 0
Esch.vulneris 0 40 0 0 0 0 0 100 98 0 100 50 86 0 0 0 0 0 0 0 0
Ewingella americana 0 0 0 0 0 99 0 50 99 100 90 0 0 0 95 0 0 0 0 99 0
Hafnia alvei 0 0 1 1 73 1 1 98 98 10 65 0 99 93 62 0 25 0 0 54 0
K.oxytoca 15 1 74 0 99 100 73 99 97 99 98 0 99 0 89 0 75 0 99 50 0
K.pneum.ozaenae 1 0 1 1 70 98 1 97 70 1 94 15 20 1 21 0 1 0 0 1 0
K.pneum.pneumoniae 25 1 25 0 81 95 1 50 59 1 99 0 82 0 94 0 82 0 0 92 0
K.pneum.rhinosclero. 0 0 0 0 60 99 0 99 25 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Kluy.ascorbata 50 0 0 0 4 0 0 100 100 97 99 0 97 100 95 0 0 0 99 0 0
Kluy.cryocrescens 5 0 1 0 64 0 0 100 100 100 100 0 1 99 25 0 0 0 90 0 0
Kluy.intermedia 50 0 67 0 5 0 0 82 89 99 99 0 0 99 11 0 0 0 0 33 0
Lecl.adecarboxylata 0 50 0 0 0 80 0 100 100 0 99 0 0 0 0 0 1 0 99 0 0
Moell.wisconsensis 0 0 0 0 0 99 0 100 0 0 99 0 0 0 20 0 0 0 30 1 0
Morg.morg.morganii 0 43 0 0 0 0 1 99 0 0 21 0 1 86 9 1 97 99 99 0 0
Morg.morg.sibonii 0 99 0 0 0 0 1 99 0 0 1 0 78 50 0 0 67 99 100 0 0
Pantoea agglomerans 0 0 0 41 0 90 0 97 100 0 97 0 0 0 1 0 0 0 0 97 41
Pantoea dispersa 0 36 0 54 0 95 0 100 100 100 100 0 0 0 75 0 0 0 0 85 0
Pantoea spp 1 1 1 1 1 1 51 0 28 29 5 99 1 0 1 51 1 1 0 1 77 1
Pantoea spp 2 14 24 1 1 18 26 0 79 71 57 99 10 0 14 83 1 1 0 40 53 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 126


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL
Photo.damselae 0 0 4 0 0 0 0 0 0 4 4 99 62 1 1 0 99 0 0 82 0
Plesio.shigelloides 11 0 0 0 88 0 0 100 33 0 99 99 100 100 0 0 0 0 100 0 0
Proteus mirabilis 0 0 0 0 0 0 0 100 60 0 1 0 0 99 80 75 99 98 1 1 80
Proteus penneri 97 0 0 0 0 0 0 99 99 0 1 0 0 0 1 99 100 99 0 0 88
Proteus vulgaris gr. 71 0 0 0 0 0 0 100 99 0 1 0 0 0 14 86 99 99 95 0 67
Prov.alcalifaciens 0 0 0 0 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 98 0 0 99 99 0 0
Prov.rettgeri 0 0 0 0 0 99 99 100 80 0 1 1 0 0 75 0 99 99 99 0 0
Prov.rustigianii 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 15 0 0 99 99 0 0
Prov.stuartii 0 87 0 0 0 1 0 100 0 0 1 0 0 0 92 0 30 92 97 0 0
Rahnella aquatilis 12 1 1 0 15 0 0 46 50 99 100 0 0 0 69 0 0 2 0 99 0
Raou.ornithinolytica 1 0 1 0 100 100 0 100 89 100 100 0 99 99 99 0 89 0 100 75 0
Raou.planticola 0 0 0 0 100 100 0 100 97 99 100 0 100 0 100 0 75 0 20 100 0
Raou.terrigena 0 0 0 0 100 99 1 80 50 90 100 0 99 20 90 0 0 0 0 91 0
Salm.Gallinarum 0 0 0 0 100 0 0 100 0 100 0 1 100 1 1 1 0 0 0 0 0
Salm.Paratyphi A 0 0 100 0 99 0 0 100 0 100 0 1 0 99 0 1 0 0 0 0 0
Salm.Pullorum 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 1 99 100 0 82 0 0 0 0 0
Salm.Typhi 0 0 0 0 1 0 0 100 0 0 0 1 99 0 0 8 0 0 0 0 0
Salm.Typhimurium 0 0 100 0 100 0 0 100 0 100 0 72 100 100 99 100 0 0 0 0 0
Salm.enter.arizonae 0 0 0 0 95 1 0 100 0 50 97 99 99 99 99 60 0 0 1 0 0
Salm.enter.enterica 0 0 1 0 100 0 0 100 0 100 0 35 99 99 5 65 0 0 0 0 0
Salmonella spp 0 0 48 1 97 1 0 100 3 93 4 61 93 90 82 90 0 0 0 1 1
Ser.ficaria 96 1 0 0 1 100 74 100 100 100 99 0 0 0 100 0 0 0 0 50 85
Ser.fonticola 1 55 99 0 0 98 99 100 99 45 99 0 50 99 82 0 0 0 0 0 0
Ser.liquefaciens 75 3 0 0 1 0 1 99 98 99 94 1 75 99 84 0 1 0 0 49 49
Ser.marcescens 0 79 0 1 1 1 67 100 99 99 75 0 96 75 99 0 13 0 1 71 83
Ser.odorifera 1 0 0 0 20 0 0 99 100 100 0 99 0 99 80 99 0 0 0 99 10 99
Ser.odorifera 2 0 0 0 20 0 0 100 100 100 0 99 0 80 1 99 0 0 0 99 80 80
Ser.plymuthica 99 0 0 0 1 0 0 99 99 77 99 0 0 0 65 0 0 0 0 68 54
Ser.proteamaculans 4 0 0 0 0 0 0 100 100 85 99 1 95 100 80 0 1 0 0 61 38
Ser.rubidaea 99 0 0 43 0 99 0 99 100 12 99 0 50 0 97 0 1 0 0 96 79
Shigella boydii 0 0 0 0 1 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 127


Annexes API® 50 CHE V3.2

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL
Shigella dysenteriae 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0
Shigella flexneri 0 0 0 0 0 0 0 78 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0
Shigella sonnei 1 0 1 1 57 0 0 93 0 36 99 0 0 85 0 0 0 0 0 0 0
V.alginolyticus 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 99 80 63 0 1 0 100 13 90
V.cholerae 0 0 0 0 0 0 0 100 1 0 98 1 98 99 93 0 0 0 99 84 90
V.fluvialis 0 0 0 0 0 65 0 100 0 0 99 82 0 0 50 0 0 0 95 0 50
V.metschnikovii 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 95 60 75 0 1 0 0 0 1 99 90
V.mimicus 0 0 37 0 1 0 0 100 0 0 99 0 99 99 50 0 0 0 99 0 99
V.parahaemolyticus 0 0 0 0 0 0 0 100 0 10 0 0 100 99 21 0 5 0 100 1 99
V.vulnificus 0 0 0 0 27 0 0 100 0 0 99 0 72 75 75 0 0 0 72 1 50
Y.aldovae 0 0 0 0 35 0 0 1 0 0 17 0 1 40 0 0 99 0 0 1 0
Y.enterocolitica 0 0 0 0 25 50 0 99 15 90 82 0 0 89 0 0 99 0 65 8 0
Y.frederiksenii 0 0 0 0 100 100 0 100 0 100 99 0 0 99 1 0 99 0 99 1 0
Y.intermedia 0 0 1 0 82 86 0 100 0 100 99 0 0 100 1 0 99 0 99 2 0
Y.kristensenii 0 0 0 0 8 8 0 90 0 54 85 0 0 85 0 0 99 0 30 0 0
Y.pestis 0 19 0 0 0 95 0 19 0 57 52 0 0 0 0 0 0 0 0 1 50
Y.pseudotuberculosis 0 30 0 0 0 1 1 80 1 90 99 0 0 0 1 0 99 0 0 0 0
Y.ruckeri 0 0 0 0 0 0 0 44 0 0 81 1 99 100 0 0 0 0 0 5 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 128


Annexes API® 50 CHL V5.2

API® 50 CHL V5.2


Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Aerc.viridans 0 29 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 100 0
Brocho.thermosphacta 0 21 0 0 0 100 0 0 0 0 25 100 100 100 0 36 0 65 86 0
Carno.divergens 0 33 0 0 0 100 0 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Carno.maltaromaticum 0 14 0 0 0 86 0 0 0 0 57 100 100 100 0 0 0 0 100 0
Lacto.acidophilus 1 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 75 100 100 96 0 0 0 0 4 0
Lacto.acidophilus 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 99 100 100 99 0 0 0 0 40 0
Lacto.acidophilus 3 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 71 100 100 64 0 0 0 0 1 0
Lacto.brevis 1 0 0 0 0 71 71 56 0 0 1 99 99 99 99 0 0 0 0 28 14
Lacto.brevis 2 0 0 0 0 99 99 83 0 0 1 99 99 99 7 0 0 0 0 1 1
Lacto.brevis 3 0 0 0 1 86 98 92 0 0 5 89 95 92 1 0 0 0 0 2 1
Lacto.buchneri 0 0 0 0 92 100 57 0 0 7 85 100 92 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.collinoides 0 1 0 0 50 99 99 0 0 0 99 100 100 10 5 1 0 0 25 1
Lacto.crispatus 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76 100 100 76 0 0 0 0 0 0
Lacto.curvatus 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 100 100 100 94 0 0 0 0 12 0
Lacto.delb.bulgar. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 98 98 25 0 0 0 0 0 0
Lacto.delb.delb. 0 0 0 0 0 24 0 0 0 0 24 98 99 81 0 0 0 0 0 0
Lacto.delb.lactis 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42 100 81 84 0 0 0 0 3 0
Lacto.delb.lactis 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Lacto.fermentum 1 0 0 0 0 31 95 50 0 0 1 92 100 80 50 0 0 0 0 0 0
Lacto.fermentum 2 0 0 0 0 100 100 36 10 0 0 64 97 100 50 0 0 0 0 0 0
Lacto.fructivorans 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 90 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.helveticus 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 100 70 85 0 0 0 0 0 0
Lacto.lindneri 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.para.paracasei 1 0 20 0 1 0 100 0 0 13 0 100 100 100 100 53 1 13 6 100 86
Lacto.para.paracasei 2 0 16 0 16 0 100 0 0 33 0 100 100 100 100 50 1 50 33 100 100
Lacto.para.paracasei 3 0 0 0 0 0 98 0 0 0 1 100 100 100 100 20 1 0 0 80 20
Lacto.pentosus 0 75 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 25 0 0 100 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 129


Annexes API® 50 CHL V5.2

Taxon 0 GLY ERY DARA LARA RIB DXYL LXYL ADO MDX GAL GLU FRU MNE SBE RHA DUL INO MAN SOR
Lacto.plantarum 1 0 1 0 0 74 92 2 0 0 0 92 100 100 100 2 33 0 0 99 78
Lacto.plantarum 2 0 0 0 0 1 83 1 0 0 0 75 100 100 100 1 1 0 0 80 17
Lacto.rhamnosus 0 42 0 9 8 100 0 0 0 0 100 100 100 100 92 100 14 42 100 100
Lacto.salivarius 0 0 0 0 28 28 14 0 0 0 85 100 100 100 0 71 0 0 100 98
Lc.lactis cremoris 1 0 0 0 0 0 50 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 50 0
Lc.lactis cremoris 2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 1 0
Lc.lactis hordniae 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 99 0 0 0 0 0 0
Lc.lactis lactis 1 0 1 0 5 30 95 40 0 0 0 90 100 100 100 0 0 0 0 50 5
Lc.lactis lactis 2 0 1 0 4 4 85 1 0 0 0 100 100 100 100 0 1 0 0 20 0
Lc.raffinolactis 0 0 0 0 33 16 83 0 0 0 100 100 100 100 16 0 0 0 66 0
Leuco.citreum 0 0 0 0 95 0 5 0 0 0 5 100 100 100 0 0 0 0 25 0
Leuco.lactis 0 0 0 0 15 10 3 0 0 0 66 100 82 83 5 2 0 0 5 0
Leuco.mes.mes./dext. 1 0 0 0 0 90 30 80 0 0 0 80 99 100 99 1 0 0 0 12 0
Leuco.mes.mes./dext. 2 0 0 0 0 80 75 75 0 0 0 59 100 99 100 0 0 0 0 1 0
Leuco.mesen.cremoris 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 90 0 0 0 0 0 0 0 0
Pedio.acidilactici 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 100 100 100 100 0 75 0 0 0 0
Pedio.damnosus 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Pedio.damnosus 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Pedio.pentosaceus 1 0 0 0 0 83 100 42 0 0 0 100 100 100 92 0 33 0 0 0 0
Pedio.pentosaceus 2 0 0 0 0 100 100 60 0 0 0 100 100 100 100 0 40 0 0 0 0
Pediococcus spp 0 0 0 0 11 22 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 0 0
Str.sal.thermophilus 0 0 0 0 0 33 0 0 0 0 5 100 50 16 0 0 0 0 0 0
Tetragen.halophilus 0 11 0 0 100 0 0 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 11 0
Weis.confusa 0 0 0 0 19 19 100 0 0 0 100 100 100 100 0 0 0 0 4 9
Weis.viridescens 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 130


Annexes API® 50 CHL V5.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Aerc.viridans 0 0 86 0 14 14 14 14 29 100 0 100 86 0 0 0 0 0 0 0
Brocho.thermosphacta 0 1 100 100 86 93 100 100 100 0 0 64 100 0 0 0 0 0 0 100
Carno.divergens 0 0 100 67 100 100 100 100 100 0 0 100 100 0 100 0 0 0 0 100
Carno.maltaromaticum 57 99 100 100 100 100 100 100 99 57 43 100 100 86 0 0 0 0 0 100
Lacto.acidophilus 1 0 0 79 67 67 99 85 96 83 73 4 100 77 1 0 25 21 1 0 99
Lacto.acidophilus 2 0 0 99 20 1 99 40 80 99 99 1 100 1 20 0 80 80 20 0 99
Lacto.acidophilus 3 0 0 75 1 1 36 29 71 75 64 1 100 43 1 0 21 9 7 0 4
Lacto.brevis 1 0 14 99 99 99 83 99 99 85 71 57 81 71 28 14 42 0 0 0 99
Lacto.brevis 2 0 35 7 61 1 23 7 1 96 30 99 93 1 7 38 99 0 0 0 53
Lacto.brevis 3 0 51 69 1 1 7 1 3 98 13 76 7 2 1 1 1 0 0 0 1
Lacto.buchneri 0 42 14 0 0 7 0 0 100 25 85 90 0 0 81 64 7 0 0 0
Lacto.collinoides 0 1 75 5 5 50 5 5 99 1 25 25 25 1 1 1 1 5 1 10
Lacto.crispatus 0 0 100 76 76 100 100 100 100 76 24 100 60 0 0 60 100 60 0 40
Lacto.curvatus 0 25 100 28 28 37 50 28 94 50 0 25 25 0 12 0 0 0 0 28
Lacto.delb.bulgar. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.delb.delb. 0 0 53 0 10 24 10 10 75 20 0 87 20 0 0 0 10 0 0 24
Lacto.delb.lactis 1 0 0 81 0 0 0 10 0 52 97 10 81 90 0 0 6 0 0 0 0
Lacto.delb.lactis 2 0 0 100 50 100 50 100 100 100 100 0 99 100 0 0 0 0 0 0 100
Lacto.fermentum 1 0 6 6 2 0 5 0 1 95 87 90 86 16 0 0 76 1 0 0 1
Lacto.fermentum 2 0 0 0 50 0 81 50 50 100 50 70 100 50 0 0 70 0 0 0 0
Lacto.fructivorans 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.helveticus 0 0 86 0 0 0 0 0 28 85 1 1 35 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.lindneri 0 0 0 33 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.para.paracasei 1 0 46 100 98 100 99 100 93 99 99 0 93 99 26 93 0 0 6 0 80
Lacto.para.paracasei 2 0 83 100 75 100 83 99 66 99 0 0 99 99 66 99 0 0 0 0 66
Lacto.para.paracasei 3 0 0 100 99 100 80 100 100 80 80 0 60 99 20 20 0 0 0 0 100
Lacto.pentosus 1 50 100 100 99 100 100 100 100 100 100 100 100 0 25 75 0 0 0 99

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 131


Annexes API® 50 CHL V5.2

Taxon MDM MDG NAG AMY ARB ESC SAL CEL MAL LAC MEL SAC TRE INU MLZ RAF AMD GLYG XLT GEN
Lacto.plantarum 1 55 33 100 94 99 99 99 99 100 99 94 88 96 0 92 74 7 7 0 98
Lacto.plantarum 2 1 1 100 83 67 67 67 67 100 75 1 17 1 0 1 1 18 1 0 83
Lacto.rhamnosus 7 85 100 99 100 85 100 100 99 100 9 71 99 0 99 7 0 7 0 85
Lacto.salivarius 0 0 100 14 28 28 28 14 100 85 85 100 99 0 14 85 0 0 1 14
Lc.lactis cremoris 1 0 0 100 0 1 66 50 16 99 100 0 16 99 0 0 0 50 50 0 99
Lc.lactis cremoris 2 0 0 100 0 11 55 22 55 1 100 0 1 11 0 0 0 1 1 0 1
Lc.lactis hordniae 0 0 100 0 100 100 100 1 0 0 0 100 75 0 0 0 0 0 0 0
Lc.lactis lactis 1 1 22 100 75 85 90 85 95 95 90 13 50 90 1 0 9 50 0 0 81
Lc.lactis lactis 2 0 20 100 30 91 91 91 91 91 99 4 20 100 0 0 4 60 4 0 91
Lc.raffinolactis 0 16 100 33 83 100 100 100 100 100 100 100 100 50 33 100 100 0 0 66
Leuco.citreum 0 100 100 90 95 100 95 95 100 0 5 100 100 0 0 1 0 0 0 90
Leuco.lactis 0 5 100 2 5 0 10 10 100 99 66 95 30 0 5 32 1 1 0 11
Leuco.mes.mes./dext. 1 0 100 99 80 95 97 100 99 95 40 85 100 100 0 0 40 0 0 0 90
Leuco.mes.mes./dext. 2 0 99 100 0 5 50 10 20 95 15 95 99 99 0 0 75 0 0 0 15
Leuco.mesen.cremoris 0 0 90 0 0 0 0 0 1 26 0 25 0 0 0 0 0 0 0 1
Pedio.acidilactici 0 0 100 0 50 100 75 100 0 0 0 0 75 0 0 0 0 0 0 100
Pedio.damnosus 1 0 0 99 1 1 75 1 1 1 1 1 1 99 0 0 0 0 0 0 25
Pedio.damnosus 2 0 0 50 75 33 95 94 99 25 1 1 1 67 0 0 0 0 0 0 99
Pedio.pentosaceus 1 0 0 100 99 99 100 100 100 99 1 1 1 99 8 0 1 0 0 0 100
Pedio.pentosaceus 2 0 0 100 99 99 100 100 100 99 60 100 100 99 20 0 100 0 0 0 100
Pediococcus spp 67 22 100 56 78 100 100 100 99 100 0 11 100 0 0 0 0 0 0 100
Str.sal.thermophilus 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 100 16 0 0 0 0 0 0 0
Tetragen.halophilus 0 11 100 100 100 100 100 100 90 11 10 10 100 0 10 10 0 0 0 100
Weis.confusa 9 14 100 96 100 100 100 100 96 28 14 90 14 0 9 9 0 0 0 95
Weis.viridescens 0 0 100 0 0 0 0 0 100 0 0 80 93 0 0 0 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 132


Annexes API® 50 CHL V5.2

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG
Aerc.viridans 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Brocho.thermosphacta 16 0 64 0 0 0 0 0 0 0
Carno.divergens 0 0 0 0 0 0 0 67 0 0
Carno.maltaromaticum 29 0 0 0 0 0 0 43 0 0
Lacto.acidophilus 1 4 0 46 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.acidophilus 2 1 0 20 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.acidophilus 3 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.brevis 1 14 0 14 0 0 28 14 85 20 14
Lacto.brevis 2 46 0 1 0 0 38 1 76 1 32
Lacto.brevis 3 1 0 1 0 0 3 1 87 1 55
Lacto.buchneri 0 0 0 0 0 0 0 85 0 64
Lacto.collinoides 0 0 5 0 0 0 0 99 0 99
Lacto.crispatus 24 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.curvatus 12 0 28 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.delb.bulgar. 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
Lacto.delb.delb. 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
Lacto.delb.lactis 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.delb.lactis 2 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.fermentum 1 4 0 0 0 0 0 0 73 1 1
Lacto.fermentum 2 0 0 0 0 0 0 0 70 0 70
Lacto.fructivorans 0 0 0 0 0 0 0 90 0 0
Lacto.helveticus 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.lindneri 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lacto.para.paracasei 1 80 20 100 0 1 0 40 93 0 0
Lacto.para.paracasei 2 100 16 100 0 0 0 0 83 0 0
Lacto.para.paracasei 3 20 0 60 0 0 0 0 20 1 0
Lacto.pentosus 50 0 1 0 0 0 0 50 0 0
Lacto.plantarum 1 62 0 7 0 0 36 0 62 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 133


Annexes API® 50 CHL V5.2

Taxon TUR LYX TAG DFUC LFUC DARL LARL GNT 2KG 5KG
Lacto.plantarum 2 1 0 1 0 0 1 0 1 0 0
Lacto.rhamnosus 92 42 99 0 7 0 7 85 0 0
Lacto.salivarius 0 0 0 0 0 1 28 42 0 14
Lc.lactis cremoris 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lc.lactis cremoris 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Lc.lactis hordniae 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0
Lc.lactis lactis 1 0 0 9 0 0 0 0 30 0 0
Lc.lactis lactis 2 0 0 4 0 0 0 0 1 0 0
Lc.raffinolactis 50 0 1 0 0 0 0 0 0 0
Leuco.citreum 100 0 0 0 0 0 0 90 0 0
Leuco.lactis 5 0 5 0 0 0 0 5 0 0
Leuco.mes.mes./dext. 1 99 1 0 0 0 0 0 25 0 0
Leuco.mes.mes./dext. 2 90 0 0 0 0 0 0 4 0 5
Leuco.mesen.cremoris 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Pedio.acidilactici 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0
Pedio.damnosus 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Pedio.damnosus 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Pedio.pentosaceus 1 0 0 67 0 0 0 0 0 1 0
Pedio.pentosaceus 2 0 0 99 0 0 0 0 0 1 0
Pediococcus spp 0 0 67 0 0 0 0 0 0 0
Str.sal.thermophilus 16 16 0 0 0 0 0 0 0 33
Tetragen.halophilus 90 0 100 0 0 10 0 0 0 0
Weis.confusa 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0
Weis.viridescens 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 134


Annexes ID 32 E V4.0

ID 32 E V4.0

αMAL
ßNAG

ßGUR
αGLU
ßGLU

αGAL
ßGAL

DARL
LARA
MAN

AspA
MNT
LARL

MAL

ADO
ODC

ADH

RHA
GAT

GLU
URE

5KG

SOR
SAC
LDC

INO
IND

TRE

CEL
PLE
LIP

RP
Taxon

Aci./Moraxella spp 0 0 0 26 0 0 0 26 0 0 0 0 0 0 0 2 0 5 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 42
Aci.baumannii 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 79 0 89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 69 96
Aer.hydrophila gr. 0 40 1 0 0 27 0 94 72 94 75 84 68 69 99 98 94 84 0 12 1 87 1 0 0 8 0 51 2 50 0 45
Aer.sobria 0 25 1 0 0 0 0 23 28 13 27 54 59 35 100 83 61 6 0 6 4 54 0 0 0 36 0 33 0 27 0 6
Alcaligenes spp 0 0 21 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 96
Bord.bronchiseptica 0 0 0 100 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100
Budvicia aquatica 0 0 0 75 0 99 89 0 25 0 1 0 0 0 100 100 0 100 99 0 45 0 24 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Burkhol.cepacia 40 2 59 2 1 0 0 38 1 3 0 2 0 40 38 64 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 2 1 0 77 96
Buttiaux.agrestis 62 0 1 0 0 100 16 0 100 100 100 77 1 1 100 100 0 100 1 70 94 100 100 5 1 64 1 100 1 1 87 1
Ced.davisae 98 40 0 0 0 33 0 98 59 100 100 98 0 30 93 100 98 0 100 58 0 100 0 71 0 93 0 100 1 0 100 1
Ced.lapagei 0 97 0 0 0 2 0 99 1 100 97 91 0 54 97 99 0 0 97 2 0 100 0 1 0 0 0 100 0 0 97 1
Ced.neteri 0 93 0 0 0 72 0 100 28 100 100 100 0 8 100 100 100 0 100 1 0 100 0 8 0 72 0 100 93 0 100 0
Chryse.indologenes 0 0 0 96 0 0 0 87 0 60 0 0 40 1 3 0 0 0 0 96 1 0 0 0 0 0 0 0 0 96 0 99
Citro.ama./farmeri 93 44 0 0 0 100 96 0 100 93 100 100 100 0 100 100 14 99 0 1 40 100 100 0 0 12 0 100 96 1 3 37
Citro.braakii 97 64 2 0 0 100 97 1 100 57 100 100 8 0 67 100 17 100 0 0 97 100 97 0 0 82 2 79 99 0 0 63
Citro.freundii 13 43 0 0 0 98 99 1 100 20 99 99 1 0 98 100 91 99 1 1 91 99 99 68 0 4 14 60 88 1 4 45
Citro.koseri 100 99 0 0 0 100 99 0 99 73 100 99 89 0 100 100 17 99 100 4 0 100 99 89 99 95 1 89 65 1 99 1
Citro.sedlakii 100 100 0 0 0 100 0 0 100 21 100 100 97 0 100 99 0 100 0 0 99 100 100 50 0 0 0 90 99 0 97 9
Citro.youngae 1 78 0 0 0 100 99 0 100 1 100 99 1 0 99 100 1 100 0 0 42 100 100 0 0 0 0 21 21 0 5 72
Cro.dublinensis 100 100 1 0 0 100 0 100 0 100 100 100 99 100 100 100 100 100 0 100 100 100 100 50 0 0 0 100 0 100 6 0
Cro.malonaticus 92 78 0 0 0 100 0 92 0 100 100 92 0 78 100 100 100 92 0 100 100 100 100 61 0 38 0 100 0 66 92 0
Cro.muytjensii 100 100 0 0 0 100 0 60 0 100 100 80 100 100 100 100 100 100 0 100 100 100 100 100 0 0 0 100 0 60 100 0
Cro.sakazakii 77 96 1 0 0 100 0 60 9 100 100 100 0 75 100 100 99 93 0 100 100 100 96 99 0 87 0 100 0 56 3 0
Cro.turicensis 99 100 1 0 0 100 0 99 0 100 100 100 0 100 100 100 100 100 0 100 100 100 100 100 0 75 0 100 0 99 100 0
Edwardsiel.hoshinae 100 0 100 0 0 42 0 0 100 0 64 100 45 2 0 99 100 0 0 50 98 100 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0
Edwardsiel.tarda 99 0 100 0 0 82 0 0 100 0 3 99 99 2 0 100 1 7 0 0 46 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 135


Annexes ID 32 E V4.0

αMAL
ßNAG

ßGUR
αGLU
ßGLU

αGAL
ßGAL

DARL
LARA
MAN

AspA
MNT
LARL

MAL

ADO
ODC

ADH

RHA
GAT

GLU
URE

5KG

SOR
SAC
LDC

INO
IND

TRE

CEL
PLE
LIP

RP
Taxon

Eliz.meningosept. 0 0 0 37 0 0 0 58 0 97 12 3 84 89 97 2 0 0 0 100 97 1 0 0 0 0 2 1 0 100 10 98


Ent.aerogenes 98 11 99 1 0 94 1 1 1 100 100 100 1 17 99 100 100 99 99 1 99 100 99 99 99 98 1 100 100 1 99 96
Ent.amnigenus 97 53 0 0 0 99 0 0 22 97 100 100 0 1 99 100 46 100 0 0 99 100 100 0 0 91 0 100 46 0 99 0
Ent.asburiae 99 20 0 0 0 98 0 0 95 100 99 100 0 1 100 100 99 100 0 1 1 100 1 94 0 98 0 98 61 15 5 0
Ent.cancerogenus 99 98 0 0 0 99 0 0 1 100 100 100 0 1 100 100 1 100 0 0 0 100 100 0 0 1 0 99 0 1 100 1
Ent.cloacae 94 91 1 1 0 97 1 1 9 87 98 100 1 1 96 100 97 100 40 1 99 99 98 29 40 83 2 100 40 1 96 0
Ent.gergoviae 100 0 61 100 0 98 99 0 3 100 98 98 0 9 92 100 100 100 100 0 100 100 98 60 1 0 0 91 1 0 98 1
Esch.coli 69 3 81 1 0 97 44 1 99 5 98 96 84 0 91 99 31 99 5 1 97 99 95 2 6 0 90 1 38 1 0 1
Esch.fergusonii 100 1 100 0 0 100 1 0 100 7 98 92 97 0 98 98 0 98 98 0 0 100 82 0 98 0 1 35 0 1 0 0
Esch.hermannii 100 2 0 0 0 100 0 0 100 50 100 100 99 0 99 100 22 99 1 0 0 99 100 0 0 0 0 99 0 0 0 1
Esch.vulneris 1 37 39 0 0 100 0 0 99 100 100 98 0 0 100 100 7 100 0 3 99 99 96 0 0 7 1 100 0 8 86 1
Ewingella americana 0 0 0 0 0 1 96 26 62 99 99 1 0 22 99 100 0 0 100 52 0 100 8 0 0 0 0 1 0 0 0 1
Hafnia alvei 97 1 88 1 0 97 0 1 69 19 98 99 1 1 73 100 1 75 0 13 0 99 36 0 0 0 0 0 0 0 56 51
K.oxytoca 1 1 99 91 88 99 97 1 7 99 100 99 94 3 99 100 100 100 100 18 99 100 99 99 99 99 0 100 99 1 99 61
K.pneum.ozaenae 0 24 10 36 0 97 0 0 99 99 100 97 1 0 89 99 24 89 99 12 100 100 96 97 100 63 0 100 75 1 2 10
K.pneum.pneumoniae 1 1 98 97 1 89 2 1 11 99 99 99 1 1 99 99 98 99 95 1 99 100 98 97 92 99 1 99 99 10 89 9
K.pneum.rhinosclero. 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 99 99 0 0 0 96 71 100 100 0 100 99 71 87 60 0 0 57 55 0 99 0
Kluy.ascorbata 100 0 63 0 0 100 97 1 100 100 99 100 97 3 100 100 100 100 1 89 100 100 100 0 0 100 0 100 2 3 97 50
Kluy.cryocrescens 99 0 1 0 0 100 100 0 100 100 96 100 93 1 100 100 40 100 1 5 100 100 100 0 0 100 0 100 40 0 96 93
Kluy.intermedia 99 0 0 0 0 98 83 0 77 100 98 92 0 0 99 100 28 100 0 33 71 100 95 0 0 100 0 100 50 1 98 2
Lecl.adecarboxylata 0 0 0 1 1 99 0 0 100 100 100 99 80 1 100 100 52 99 57 0 100 100 100 0 57 0 0 100 4 1 100 1
Mann.haem./Bib.treh. 0 0 0 0 0 0 0 0 5 3 50 71 0 0 96 71 87 3 0 33 28 28 3 50 0 0 3 0 66 3 0 0
Moell.wisconsensis 0 0 0 0 0 0 0 0 100 99 0 0 0 0 99 100 100 0 100 0 96 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0
Morg.morg.morganii 97 0 1 100 0 0 0 0 99 1 0 0 94 0 1 97 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
Ochrobac.anthropi 0 0 0 99 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 1 0 0 0 0 80 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0
Pantoea spp 1 0 0 0 0 0 8 5 1 1 100 100 73 3 2 97 100 94 100 33 0 8 100 99 65 0 5 0 40 3 3 76 0
Pantoea spp 2 6 0 0 0 0 6 50 6 73 1 100 72 0 0 91 100 99 100 50 1 0 100 50 6 1 0 0 27 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 136


Annexes ID 32 E V4.0

αMAL
ßNAG

ßGUR
αGLU
ßGLU

αGAL
ßGAL

DARL
LARA
MAN

AspA
MNT
LARL

MAL

ADO
ODC

ADH

RHA
GAT

GLU
URE

5KG

SOR
SAC
LDC

INO
IND

TRE

CEL
PLE
LIP

RP
Taxon

Pantoea spp 3 10 0 0 0 0 100 65 0 40 95 90 100 40 0 99 100 92 100 6 0 45 100 98 8 1 64 0 99 98 35 64 0


Pantoea spp 4 0 0 0 0 0 50 0 0 13 100 100 100 87 0 100 100 100 100 100 0 100 100 87 100 12 0 12 100 50 0 0 0
Past.aerogenes 78 0 0 97 0 2 0 0 100 0 0 97 0 0 100 78 78 50 0 0 0 0 0 66 0 0 0 0 0 0 0 0
Past.multocida 21 0 0 0 0 0 0 0 59 0 2 0 90 0 1 3 33 0 0 0 0 10 0 0 0 0 1 0 1 0 1 2
Past.pneumotropica 2 0 0 97 0 0 0 0 10 0 2 58 66 0 90 50 54 9 0 0 2 9 0 2 0 0 0 0 2 0 0 2
Pecto.atrosepticum 0 0 0 0 0 8 0 0 8 100 91 0 0 0 100 100 100 60 0 8 100 8 60 1 0 0 0 50 0 0 0 0
Pecto.betavasculorum 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 0 0 0 0 100 100 100 0 100 0 0 100 0 0 100 0 100 0 0 0 0
Pecto.carotovorum 0 0 0 0 0 50 0 0 50 100 100 12 12 0 100 100 100 100 0 12 100 87 100 12 0 0 0 87 12 0 0 0
Photo.damselae 0 96 0 71 0 0 0 42 100 55 0 96 0 94 3 96 0 0 0 3 0 50 0 0 0 3 0 14 0 0 0 87
Plesio.shigelloides 100 99 99 0 0 0 0 0 99 17 0 97 80 21 92 100 0 0 0 63 64 92 0 41 0 0 0 0 0 50 0 0
Proteus mirabilis 98 1 1 100 0 0 0 1 69 0 0 1 1 0 0 99 1 0 0 1 1 99 0 0 0 1 0 0 0 1 0 98
Proteus penneri 0 1 0 99 1 0 0 0 100 0 0 100 0 0 0 100 99 0 0 100 0 58 0 0 0 99 0 0 0 100 0 99
Proteus vulgaris gr. 1 1 1 98 0 1 0 0 99 69 1 99 87 0 1 99 94 1 0 99 1 53 1 0 0 96 0 0 1 96 0 95
Prov.alcalifaciens 0 0 0 0 99 0 0 0 100 0 0 0 74 0 0 100 1 0 0 0 0 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 99
Prov.rettgeri 0 0 0 99 99 0 0 0 100 58 64 0 40 0 1 99 1 0 94 0 0 0 64 98 100 0 0 0 1 0 0 58
Prov.rustigianii 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 74 0 0 100 12 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 96
Prov.stuartii 0 1 0 19 0 0 0 0 98 1 1 0 78 24 1 97 6 0 1 0 0 97 0 87 1 0 0 0 0 0 0 3
Ps.aeruginosa 1 99 1 78 0 0 0 86 0 1 0 0 0 0 1 69 0 5 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 81 41
Ps.fluorescens 0 35 0 9 0 0 0 40 0 1 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22 12
Ps.putida 0 99 0 0 0 0 0 58 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 0
Pseudomonas/Com.spp 0 16 0 5 0 0 0 21 0 4 0 0 0 0 3 7 0 0 0 13 1 0 0 0 0 0 2 0 0 1 11 33
Rahnella aquatilis 0 1 0 0 0 100 93 6 44 100 100 98 0 1 100 100 100 100 0 1 100 94 100 0 0 6 1 98 93 0 99 24
Raou.ornithinolytica 100 1 100 100 0 100 98 0 62 100 100 100 92 42 100 100 100 100 100 1 100 100 100 99 100 100 2 100 100 0 100 100
Raou.planticola 0 0 99 99 1 100 99 0 14 100 100 100 56 52 100 100 100 100 100 7 100 100 100 100 100 100 0 100 100 1 99 99
Raou.terrigena 0 0 99 0 0 92 99 0 8 100 100 100 1 1 100 100 100 100 100 8 100 100 100 99 100 100 0 100 53 0 100 28
Rzb.radiobacter 0 0 0 100 40 0 0 0 0 100 0 0 0 36 100 0 0 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 6 0 75 0 0
S.putrefaciens gr. 81 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 1 0 3 84 99

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 137


Annexes ID 32 E V4.0

αMAL
ßNAG

ßGUR
αGLU
ßGLU

αGAL
ßGAL

DARL
LARA
MAN

AspA
MNT
LARL

MAL

ADO
ODC

ADH

RHA
GAT

GLU
URE

5KG

SOR
SAC
LDC

INO
IND

TRE

CEL
PLE
LIP

RP
Taxon

Salm.Paratyphi A 89 2 0 0 0 0 99 1 100 0 100 99 0 0 0 100 0 100 0 0 100 99 100 0 0 0 0 0 24 0 0 1


Salm.Typhi 0 1 7 0 0 0 0 12 100 0 100 100 0 0 0 100 0 0 0 7 99 92 0 0 0 0 0 0 92 0 0 0
Salm.enter.arizonae 99 91 97 0 0 38 38 24 100 1 100 99 1 0 97 100 2 100 0 0 100 99 99 1 0 0 38 0 80 0 100 1
Salm.enter.enterica 10 3 99 0 0 0 100 87 100 0 100 100 0 0 0 100 0 0 0 0 100 12 100 0 0 0 0 0 99 0 0 0
Salmonella spp 99 98 99 0 0 0 98 92 100 0 100 100 1 0 1 100 1 98 0 1 99 99 99 84 0 0 1 0 99 0 1 2
Ser.ficaria 0 0 0 0 61 9 94 0 12 100 100 100 0 2 89 100 100 100 100 50 89 100 69 99 87 46 0 97 99 41 0 94
Ser.fonticola 98 0 1 1 98 99 1 40 100 98 98 80 0 41 100 100 19 98 98 4 98 100 98 98 98 73 0 1 95 0 98 89
Ser.liquefaciens 99 1 64 1 0 1 100 24 7 100 99 97 0 40 94 100 100 99 0 94 99 100 2 99 0 53 0 1 97 99 1 99
Ser.marcescens 99 1 97 1 34 29 98 60 5 100 92 99 0 50 95 100 99 0 0 69 1 99 0 79 62 0 0 1 76 0 0 97
Ser.odorifera 60 1 93 0 64 33 0 1 58 100 100 99 100 66 100 100 66 99 1 8 100 100 100 100 99 0 0 100 100 2 0 99
Ser.plymuthica 0 0 0 0 0 1 85 1 44 100 93 62 0 98 100 100 99 100 0 84 84 100 1 75 0 37 0 98 56 37 0 75
Ser.proteamaculans 99 0 33 0 0 0 100 9 91 97 100 19 0 50 80 100 100 91 0 97 80 100 0 97 0 2 0 8 38 21 0 33
Ser.rubidaea 1 2 54 1 2 40 2 2 3 100 97 100 0 89 100 100 99 100 89 50 100 100 1 99 89 2 0 96 2 55 75 2
Shigella sonnei 96 0 0 0 0 12 68 0 100 3 100 60 0 0 99 100 0 99 0 3 92 99 52 0 1 0 96 0 1 1 0 1
Shigella spp 1 0 0 0 0 0 2 1 0 99 0 75 0 2 0 0 100 0 97 0 0 97 54 0 0 0 0 36 0 10 0 0 0
Shigella spp 2 0 0 0 0 0 0 0 0 99 1 0 1 33 0 19 99 0 0 0 17 33 33 33 0 0 0 15 0 0 0 0 0
Shigella spp 3 0 0 0 0 0 63 0 0 99 0 73 1 1 0 0 98 0 47 0 0 63 63 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0
Sphmon.paucimobilis 0 0 0 0 0 0 0 6 1 90 0 0 0 17 68 0 0 0 0 93 68 0 0 0 0 0 6 0 0 43 0 85
Steno.maltophilia 1 1 0 0 0 0 0 99 0 100 0 0 0 0 1 0 0 0 0 99 13 0 0 0 0 0 1 0 0 99 89 6
V.alginolyticus 75 0 1 0 0 0 0 1 46 99 60 89 99 0 0 99 99 0 0 24 2 100 0 0 0 0 0 17 1 97 0 0
V.cholerae 99 0 1 0 0 0 1 44 40 97 10 99 100 1 99 96 44 0 0 10 0 28 0 0 0 0 0 0 0 50 28 1
V.fluvialis 0 72 0 0 0 100 0 0 99 100 100 100 100 1 100 100 100 99 99 1 1 99 0 0 0 0 0 50 1 1 0 0
V.metschnikovii 0 3 1 0 0 0 0 1 44 93 50 93 50 42 71 96 93 0 0 28 87 100 0 50 0 0 0 3 12 60 1 3
V.mimicus 99 0 1 0 0 0 0 1 100 0 5 95 100 1 100 95 0 0 0 0 0 37 0 0 0 0 0 0 0 1 1 42
V.parahaemolyticus 97 0 1 8 0 0 0 1 100 97 24 99 97 0 21 97 1 80 0 0 9 100 0 0 0 0 0 2 0 97 0 0
V.vulnificus 91 0 1 0 0 0 0 41 100 100 1 99 97 1 100 97 0 0 0 36 91 100 0 0 0 0 0 99 0 97 0 0
W.virosa/Ber.zoohel. 0 0 0 69 0 0 0 71 0 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 4 96

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 138


Annexes ID 32 E V4.0

αMAL
ßNAG

ßGUR
αGLU
ßGLU

αGAL
ßGAL

DARL
LARA
MAN

AspA
MNT
LARL

MAL

ADO
ODC

ADH

RHA
GAT

GLU
URE

5KG

SOR
SAC
LDC

INO
IND

TRE

CEL
PLE
LIP

RP
Taxon

Y.enterocolitica 85 0 0 99 0 99 40 1 100 66 99 70 73 3 98 100 99 99 58 1 1 99 1 80 1 4 10 99 99 0 0 1


Y.frederiksenii 57 0 0 98 0 100 75 1 100 100 100 80 90 2 99 100 99 100 98 1 0 100 31 80 0 2 4 98 100 0 0 1
Y.intermedia 98 0 0 96 0 100 90 1 100 100 100 100 85 1 100 100 99 99 57 26 40 100 1 76 1 83 0 100 100 0 0 0
Y.kristensenii 36 0 0 80 0 99 63 0 100 60 100 89 10 1 90 100 0 75 63 0 0 100 0 45 0 0 24 89 89 0 0 0
Y.pseudotuberculosis 0 0 0 100 12 0 0 0 100 96 99 75 0 1 99 99 0 48 66 0 96 92 48 0 1 0 0 0 0 0 0 0
Y.ruckeri 100 0 19 0 0 98 0 0 99 0 95 98 0 6 98 98 0 0 0 95 0 98 0 0 0 0 0 0 4 1 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 139


Annexes rapid ID 32 E V4.0

rapid ID 32 E V4.0

ONAG

PNPG

αGAL
MAN

MNT

MNE
CMT
ADO

MAL
ODC

MEL
RHA
ARA

GAT
URE

SOR

GRT
5KG

COL
PPA

RAF
SAC
LDC

TRE
IND

TTR
ESC

FER

CEL

PLE

IDP

OX
Taxon

Aci./Pseudomonas spp 4 7 2 9 2 1 1 0 0 0 0 2 1 1 2 0 0 0 0 2 2 1 7 7 5 1 0 4 15 0 0 37

Aer.hydro./caviae 0 2 0 30 99 54 0 5 99 0 33 2 97 0 0 98 0 10 12 24 100 6 97 90 0 86 99 42 7 2 100 99

Aer.sobria 0 1 0 2 99 0 0 0 72 0 38 2 98 0 6 99 0 33 0 0 89 0 93 88 0 98 99 41 47 0 100 99

Budvicia aquatica 67 0 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 33 0 0 0 0 100 95 0 0 0 1 0 0 0

Buttiaux.agrestis 0 0 71 100 100 95 0 93 100 13 100 80 0 88 0 0 7 88 43 0 80 27 0 100 73 100 95 87 0 67 100 0

Ced.davisae 1 0 89 0 100 0 0 0 100 0 89 0 0 100 0 100 0 100 0 89 100 0 0 88 0 100 38 0 75 0 100 0

Ced.lapagei 0 0 0 99 100 0 0 0 88 0 100 0 0 88 0 0 0 0 0 99 100 0 25 88 0 100 83 0 99 0 100 0

Ced.neteri 0 0 0 50 100 0 0 0 100 100 100 0 0 100 0 100 0 100 3 100 100 0 0 100 1 100 100 0 42 0 100 0

Citro.ama./farmeri 0 0 99 1 100 97 0 100 100 100 100 0 100 1 0 5 67 19 100 0 100 100 0 89 100 100 100 0 0 0 100 0

Citro.freundii group 0 0 30 0 100 92 0 95 100 88 8 60 0 3 0 60 87 18 80 8 77 99 0 97 45 100 92 30 0 44 90 0

Citro.koseri 1 0 99 0 100 96 98 100 99 99 94 0 100 99 0 27 100 100 99 0 100 0 0 100 100 100 100 0 0 0 99 0

Cro.dublinensis 0 0 99 100 100 99 0 100 100 0 100 100 95 33 0 96 0 100 96 0 1 0 0 100 99 100 100 100 0 96 100 0

Cro.malonaticus 0 0 95 78 100 99 1 100 100 1 100 100 0 100 0 100 1 100 100 0 1 0 62 100 93 100 98 100 0 100 100 0

Cro.muytjensii 0 0 37 50 100 99 0 100 100 0 100 100 100 100 0 100 0 0 100 0 17 0 62 100 91 100 100 95 0 100 100 0

Cro.sakazakii 1 0 48 8 100 99 1 97 100 1 100 100 0 0 0 100 0 100 99 0 24 0 61 100 87 100 99 97 0 100 100 0

Cro.turicensis 0 0 5 100 100 99 0 100 100 1 100 100 0 100 0 100 0 100 100 0 0 0 60 100 99 100 100 100 0 100 100 0

Edwardsiel.hoshinae 0 100 100 0 100 0 0 0 100 0 0 0 60 0 0 100 0 0 41 97 100 97 2 0 100 100 100 0 0 0 100 0

Edwardsiel.tarda 0 100 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 53 100 92 12 0 100 97 97 0 0 0 0 0

Ent.aerogenes 1 100 100 100 100 100 100 99 100 100 99 100 0 99 0 97 0 99 100 64 15 0 33 100 100 100 99 99 11 100 100 0

Ent.amnigenus 0 0 70 99 100 100 0 99 100 20 98 99 0 89 0 78 0 100 33 0 90 0 0 90 33 100 67 92 0 76 98 0

Ent.cancerogenus 1 0 83 67 100 98 0 98 99 0 83 0 0 99 0 0 0 17 98 67 20 0 1 98 90 98 98 0 1 0 98 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 140


Annexes rapid ID 32 E V4.0

ONAG

PNPG

αGAL
MAN

MNT

MNE
CMT
ADO

MAL
ODC

MEL
RHA
ARA

GAT
URE

SOR

GRT
5KG

COL
PPA

RAF
SAC
LDC

TRE
IND

TTR
ESC

FER

CEL

PLE

IDP

OX
Taxon

Ent.cloacae 1 0 75 8 100 98 35 83 99 83 97 88 1 95 0 100 0 93 90 26 15 1 8 100 95 99 97 15 1 95 99 1

Ent.gergoviae 85 70 100 100 100 100 0 95 100 0 1 90 0 100 0 100 95 0 86 5 90 0 1 90 95 100 86 0 71 76 100 0

Esch.coli 1 83 57 1 99 87 4 82 99 88 1 61 93 1 0 24 1 1 90 7 100 1 0 89 88 99 92 74 1 17 91 0

Esch.fergusonii 1 67 100 2 100 5 99 86 100 0 80 0 99 0 0 0 0 0 100 0 100 0 0 86 100 100 99 0 0 0 99 0

Esch.hermannii 1 7 100 13 100 100 7 95 100 0 100 0 99 0 0 1 0 0 100 0 100 38 0 95 100 100 100 0 0 1 100 0

Esch.vulneris 0 45 0 0 100 95 1 22 99 1 99 95 0 73 0 0 0 36 95 0 1 1 0 100 95 100 95 90 1 95 99 0

Ewingella americana 0 0 0 40 100 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 43 71 0 1 100 0 100 0 0 100 0 100 0

Hafnia alvei 1 100 90 18 100 71 0 11 99 1 0 0 0 60 0 0 0 0 51 90 20 8 2 17 36 100 90 0 90 3 99 1

K.oxytoca 58 97 0 98 99 100 99 98 100 100 96 100 94 94 0 100 99 95 96 28 1 5 1 99 100 99 100 74 66 100 100 0

K.pneum.ozaenae 13 10 0 80 98 67 100 16 92 67 33 85 0 0 0 8 0 80 96 0 40 0 0 95 78 100 100 84 52 70 90 0

K.pneum.pneumoniae 1 67 99 0 99 100 89 99 90 100 99 98 99 0 70 0 99 0 100 99 60 43 1 1 95 98 100 99 97 63 93 99 0

K.pneum.pneumoniae 2 99 100 0 99 100 100 10 99 100 99 99 100 0 90 0 99 90 100 99 99 44 1 1 100 99 100 99 89 43 100 100 0

K.pneum.rhinosclero. 1 0 0 100 100 78 100 80 100 99 6 30 0 90 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 90 13 95 30 70 0

Kluy.ascorbata 1 96 99 100 100 100 0 87 97 13 100 100 87 99 0 99 99 100 93 47 20 0 0 100 93 100 89 93 1 100 100 0

Kluy.cryocrescens 0 25 98 100 100 100 0 94 78 33 100 100 85 89 0 56 100 100 44 31 1 0 0 100 56 100 89 100 1 100 100 0

Kluy.intermedia 0 0 86 100 100 86 0 98 98 50 100 99 0 100 0 29 98 98 58 7 1 0 0 100 97 100 86 86 0 99 100 0

Lecl.adecarboxylata 0 0 0 100 100 100 81 50 100 9 100 100 94 100 0 44 0 0 88 0 91 0 1 100 88 100 100 92 0 31 94 0

Moell.wisconsensis 0 0 0 0 100 0 100 0 2 0 0 75 0 0 0 100 0 0 0 100 100 50 0 100 0 100 1 67 0 99 0 0

Morg.morganii 97 5 70 0 100 0 0 0 0 0 0 0 95 0 70 0 0 0 0 96 95 97 0 0 86 99 0 0 90 0 10 0

Pantoea spp 1 0 0 0 25 100 2 1 1 60 1 1 1 0 20 0 84 1 20 1 1 3 1 1 1 1 60 1 1 3 1 20 0

Pantoea spp 2 0 0 0 88 100 63 1 40 99 6 13 1 1 94 0 94 1 1 1 13 1 1 13 81 1 75 19 6 13 1 81 0

Pantoea spp 3 0 0 0 43 100 57 1 29 99 3 1 1 17 1 0 57 1 3 1 3 86 1 14 85 1 99 43 1 43 1 99 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 141


Annexes rapid ID 32 E V4.0

ONAG

PNPG

αGAL
MAN

MNT

MNE
CMT
ADO

MAL
ODC

MEL
RHA
ARA

GAT
URE

SOR

GRT
5KG

COL
PPA

RAF
SAC
LDC

TRE
IND

TTR
ESC

FER

CEL

PLE

IDP

OX
Taxon

Pantoea spp 4 0 0 0 91 100 92 17 72 99 67 92 67 58 75 0 75 36 9 72 28 8 36 1 99 83 99 99 28 17 58 83 0

Pecto.atrosepticum 0 0 0 1 100 0 0 0 91 0 0 1 0 0 0 35 0 0 0 0 1 0 0 99 0 12 0 8 0 1 0 0

Pecto.betavasculorum 0 0 0 0 100 0 0 0 100 1 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0

Pecto.carotovorum 0 0 0 87 100 12 0 99 100 0 100 100 12 0 0 100 12 0 19 0 50 0 0 100 1 99 0 12 12 100 50 0

Plesio.shigelloides 1 91 91 0 100 0 0 0 0 0 0 1 100 0 0 0 0 0 0 5 91 0 95 82 0 27 100 5 0 0 73 99

Proteus mirabilis 97 0 94 1 100 0 0 0 0 0 0 0 0 1 99 0 0 0 0 95 99 98 1 0 0 0 0 0 1 0 85 0

Proteus penneri 100 1 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 90 0 40 0 100 95 99 0 0 0 0 99 0 0 0 0 0

Proteus vulgaris gr. 100 3 0 50 100 0 0 1 0 0 0 3 90 1 89 89 0 4 0 93 89 97 0 0 0 0 78 0 1 0 0 0

Prov.alcalifaciens 0 0 1 0 92 0 40 0 0 0 0 0 92 1 97 20 0 0 0 100 56 90 4 0 0 90 0 0 99 0 4 0

Prov.rettgeri 100 0 0 40 99 0 82 55 60 0 0 0 90 1 99 15 0 0 0 91 48 85 6 12 1 91 0 0 77 0 3 0

Prov.stuartii 33 0 0 1 97 0 3 0 1 0 0 0 77 0 99 13 0 0 0 100 78 90 89 3 0 95 0 0 89 0 96 0

Rahnella aquatilis 1 0 0 100 100 56 0 63 100 94 29 100 0 94 0 100 50 0 33 11 6 0 0 100 0 100 100 86 67 90 78 0

Raou.ornithinolytica 99 95 99 100 100 100 100 100 100 100 100 100 91 100 0 100 90 100 100 82 50 0 1 100 100 100 100 57 38 99 100 0

Raou.terrigena 0 100 0 100 100 100 98 100 100 98 99 100 0 100 0 100 100 100 27 7 1 67 0 100 20 100 100 33 83 100 100 0

Salm.enter.arizonae 0 100 85 0 100 98 0 92 100 90 1 50 0 100 0 0 0 0 0 0 100 100 0 100 90 100 60 100 1 0 70 0

Salm.enter.enterica 0 100 75 0 100 0 0 71 100 90 0 47 0 0 0 0 0 0 0 26 100 100 0 0 90 100 95 29 95 0 21 0

Salm.Paratyphi A 0 0 71 0 100 100 0 99 100 97 0 38 0 0 0 0 1 0 0 11 100 4 0 0 100 100 100 0 54 0 98 0

Salm.Typhi 1 95 0 0 100 0 0 0 100 95 0 79 0 0 0 0 0 0 0 0 100 38 0 0 95 100 89 63 71 0 89 0

Salmonella spp 0 93 99 0 100 97 0 96 100 96 0 96 0 1 1 1 1 0 0 33 99 85 1 0 99 100 96 91 91 0 81 0

Ser.ficaria 0 0 0 98 100 60 62 0 100 50 0 0 0 0 0 100 87 0 0 100 94 1 0 75 1 98 66 1 5 15 100 0

Ser.fonticola 1 75 99 100 100 78 97 100 100 100 0 100 0 100 0 22 0 100 15 78 100 91 79 100 15 100 56 5 10 100 100 0

Ser.grimesii 2 100 97 38 100 1 0 0 100 97 0 69 0 0 0 100 100 0 0 100 100 1 50 96 0 100 80 97 100 69 100 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 142


Annexes rapid ID 32 E V4.0

ONAG

PNPG

αGAL
MAN

MNT

MNE
CMT
ADO

MAL
ODC

MEL
RHA
ARA

GAT
URE

SOR

GRT
5KG

COL
PPA

RAF
SAC
LDC

TRE
IND

TTR
ESC

FER

CEL

PLE

IDP

OX
Taxon

Ser.liquefaciens 1 82 84 91 100 3 0 0 99 80 0 3 0 0 0 99 84 0 0 88 99 28 82 65 0 100 62 47 83 15 100 0

Ser.marcescens 1 0 99 92 92 98 0 74 0 99 95 0 0 0 0 0 95 67 0 0 93 95 35 95 57 0 98 67 1 14 1 99 0

Ser.marcescens 2 0 63 84 67 99 43 0 0 88 71 5 5 0 5 0 99 67 10 10 83 91 8 33 77 10 100 42 10 1 10 99 0

Ser.odorifera 1 96 50 56 100 72 67 4 100 92 56 100 92 0 0 56 0 0 4 80 100 0 80 99 8 100 88 100 1 56 100 0

Ser.plymuthica 3 0 0 99 100 38 0 0 90 50 19 5 0 0 0 95 70 14 0 37 88 0 89 97 0 92 22 8 99 20 92 0

Ser.rubidaea 1 73 0 97 100 73 92 0 99 0 12 94 0 63 0 100 0 0 0 79 94 0 88 100 0 90 81 100 3 100 100 0

Shigella sonnei 1 0 98 0 100 98 0 59 100 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 2 100 0 0 99 0 100 54 75 1 2 100 0

Shigella spp 0 0 1 0 100 13 1 6 61 6 0 6 26 0 0 0 0 0 19 0 94 0 0 10 14 94 8 17 16 0 61 0

Tatumella ptyseos 0 0 0 1 100 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 60 80 0 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 0 1 80 0

V.alginolyticus 0 0 0 15 100 5 0 0 97 0 0 0 95 0 0 99 0 0 0 26 97 15 90 0 0 72 79 0 0 0 100 100

V.cholerae 0 20 10 0 100 0 0 0 79 0 0 0 98 0 0 99 0 0 0 100 94 0 100 97 6 60 100 0 0 0 82 100

V.fluvialis 2 0 0 8 100 94 0 0 100 10 50 0 90 0 0 100 0 4 62 2 97 57 42 99 40 94 100 0 0 0 100 99

V.metschnikovii 0 0 0 0 100 0 0 0 75 11 0 0 57 0 0 97 0 3 0 0 92 0 88 50 0 64 100 38 0 0 100 0

V.parahaemolyticus 14 1 0 0 100 59 0 0 100 0 0 0 99 0 1 0 0 0 0 93 100 12 95 5 56 98 93 0 80 0 100 100

V.vulnificus 0 0 0 0 100 0 0 0 61 0 100 0 87 0 13 0 0 0 0 96 91 9 75 99 65 100 100 9 0 0 100 100

Y.enterocolitica 78 0 70 27 100 30 1 0 100 98 11 0 41 0 0 70 4 9 69 5 89 0 3 21 59 95 12 0 67 1 71 0

Y.frederiksenii 83 0 67 87 100 67 0 1 100 99 0 0 99 0 0 100 0 0 67 5 100 0 0 58 90 83 33 0 95 1 83 0

Y.intermedia 99 0 99 99 100 90 0 0 100 99 67 0 99 0 0 100 5 80 80 5 100 0 0 80 67 99 40 0 99 0 99 0

Y.kristensenii 33 0 0 0 92 0 0 0 100 100 0 0 7 0 0 0 0 0 13 0 50 0 0 8 7 100 5 0 50 0 71 0

Y.pseudotuberculosis 73 0 0 89 100 0 0 8 92 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76 61 0 0 18 0 100 60 0 1 0 1 0

Y.ruckeri 0 0 0 0 100 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 94 83 17 0 0 0 75 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 143


Annexes ID 32 STAPH V3.0

ID 32 STAPH V3.0

NOVO

ßGUR
ßGAL

PYRA
MAN
MNE

ArgA
MAL

NAG
ADH

ODC

ARA
GLU
URE

TUR
FRU

RAF

SAC
LAC

TRE

PAL
ESC

CEL
NIT

RIB
VP
Taxon

Aerc.viridans 0 0 0 44 100 100 100 100 78 90 70 26 0 18 0 0 0 30 26 100 61 44 39 39 52 4

Derma.nishinomiyaen. 0 10 0 1 10 0 0 0 10 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0

Kocuria kristinae 1 0 0 0 100 100 99 87 20 99 0 0 0 13 20 7 7 93 7 100 0 27 7 0 7 1

Kocuria rosea 33 0 0 0 1 33 0 0 0 0 0 0 100 0 1 67 0 0 0 0 0 0 0 33 0 0

Kocuria varians 99 0 0 0 100 40 0 0 74 20 0 0 80 0 90 0 0 10 0 1 0 0 0 0 0 0

Mic.luteus 38 0 0 0 0 1 0 0 0 5 0 0 5 1 1 92 10 74 0 1 0 0 0 0 0 0

Mic.lylae 0 11 0 1 0 11 0 0 0 1 0 0 11 0 1 44 0 44 0 1 11 11 0 0 0 0

Rothia mucilaginosa 8 0 0 67 92 100 100 100 1 92 0 0 99 100 25 92 33 75 8 92 0 92 8 0 8 0

Staph.arlettae 0 0 0 1 100 100 67 100 100 100 100 50 0 0 50 0 5 0 75 100 0 33 100 99 99 0

Staph.aureus 74 82 0 1 100 100 100 99 95 99 94 2 96 97 1 1 99 35 1 98 98 84 3 0 1 1

Staph.auricularis 0 40 0 0 100 99 0 30 0 40 0 0 74 0 1 100 0 12 0 40 0 1 0 0 0 0

Staph.capitis 10 53 1 0 97 100 86 47 26 0 30 1 88 81 0 1 5 3 7 72 0 1 0 0 7 0

Staph.caprae 70 99 0 0 100 99 100 29 83 75 26 0 99 87 0 0 91 67 0 0 1 1 0 0 1 0

Staph.carnosus 0 100 0 0 100 100 99 0 100 90 100 0 100 1 100 0 99 67 1 0 26 0 0 0 0 0

Staph.chromogenes 92 99 1 0 99 100 99 65 95 95 11 1 100 1 14 0 88 26 0 99 38 11 0 0 84 0

Staph.cohnii cohnii 1 0 0 0 97 100 21 83 1 90 75 0 5 75 1 1 20 1 92 0 8 1 0 5 4 0

Staph.cohnii ureal. 99 0 0 1 100 100 90 99 75 100 99 0 1 67 67 0 75 75 99 0 75 0 0 99 1 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 144


Annexes ID 32 STAPH V3.0

NOVO

ßGUR
ßGAL

PYRA
MAN
MNE

ArgA
MAL

NAG
ADH

ODC

ARA
GLU
URE

TUR
FRU

RAF

SAC
LAC

TRE

PAL
ESC

CEL
NIT

RIB
VP
Taxon

Staph.epidermidis 1 94 74 1 1 100 99 39 100 79 1 1 0 74 97 1 0 94 1 2 98 1 87 0 0 1 1

Staph.epidermidis 2 86 20 13 1 100 100 53 100 46 1 1 0 90 95 1 0 6 1 1 99 9 53 0 0 1 1

Staph.equorum 98 0 0 40 98 99 94 95 75 95 98 0 100 0 65 0 20 0 82 100 65 1 27 99 10 4

Staph.gallinarum 100 0 0 99 100 100 100 100 43 96 96 86 100 1 43 0 99 4 57 100 100 86 100 99 1 86

Staph.haemolyticus 1 91 0 1 99 77 1 100 80 97 64 0 89 95 1 0 3 98 1 99 94 45 1 29 18 0

Staph.hominis 1 92 6 0 1 100 99 1 100 45 89 5 0 92 93 0 0 1 5 5 91 73 93 1 1 7 0

Staph.hominis 2 81 73 0 1 100 99 75 100 94 98 1 0 94 99 0 0 94 1 6 99 13 99 1 0 6 0

Staph.hyicus 33 100 0 0 100 100 100 0 96 99 0 0 100 4 0 0 100 1 0 99 99 1 1 96 96 0

Staph.intermedius 99 74 0 1 100 100 100 100 99 94 47 0 99 18 99 1 99 88 1 99 100 3 1 0 99 0

Staph.kloosii 50 0 0 1 99 100 0 50 50 89 96 5 0 44 33 0 56 56 98 5 5 0 33 44 56 0

Staph.lentus 7 0 0 100 100 99 100 85 99 100 100 100 99 5 1 0 35 10 26 100 80 70 26 0 26 100

Staph.lugdunensis 65 1 99 0 100 99 94 88 74 94 1 0 99 99 1 0 1 99 1 100 76 1 0 0 1 0

Staph.saprophyticus 97 0 0 0 99 99 0 99 93 99 84 0 4 96 93 1 4 29 93 99 68 85 0 1 1 1

Staph.schleiferi 0 97 0 0 100 80 100 0 3 66 1 0 89 97 26 0 100 49 0 1 74 0 0 0 1 0

Staph.sciuri 0 0 0 100 100 100 100 99 73 95 100 0 99 1 1 0 74 0 43 86 82 75 60 39 60 75

Staph.simulans 90 99 0 0 100 100 49 8 97 97 74 0 95 18 79 0 2 82 5 94 90 0 1 74 21 1

Staph.warneri 94 30 0 0 99 99 14 98 19 93 70 0 33 92 0 0 1 1 4 100 10 26 0 67 16 0

Staph.xylosus 85 0 0 26 100 100 76 90 88 90 89 1 89 26 88 0 83 60 85 99 89 37 50 89 19 10

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 145


Annexes rapid ID 32 STREP V4.0

rapid ID 32 STREP V4.0

MßDG

ßMAN
ßNAG
ßGUR
ßGAR
ßGLU

αGAL

APPA

GLYG
ßGAL

DARL

CDEX
PYRA

LARA
MAN

MAL
ADH

MEL

MLZ

TAG
GTA

URE
SOR

RAF

SAC
PUL
LAC

TRE
PAL

HIP
RIB

VP
Taxon

Abio.defectiva 1 0 50 0 99 0 0 0 0 50 99 50 0 50 99 75 0 0 0 0 95 100 5 0 100 0 0 0 1 0 0 0

Aerc.urinae 0 0 0 99 0 0 91 100 78 0 0 0 1 1 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 97 0 81 0 0 0 0 0

Aerc.viridans 1 70 3 30 60 0 28 75 25 79 91 42 1 0 10 83 0 0 92 10 10 95 4 0 100 1 0 65 1 1 1 0

Alloiococcus otitis 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 0 0 0 99 99 0 0 25 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Entero.avium 0 99 0 0 20 0 100 100 80 95 100 10 99 99 0 88 0 1 1 0 0 100 3 97 10 96 96 98 98 0 5 0

Entero.casseliflavus 70 100 26 1 95 0 99 99 26 100 100 90 95 0 99 69 75 80 1 0 0 100 95 5 97 99 1 100 35 95 7 0

Entero.cecorum 0 100 11 88 100 94 98 38 11 99 99 88 66 0 33 0 88 94 1 27 0 100 98 55 100 0 0 98 64 41 66 0

Entero.durans 100 90 2 0 30 0 99 0 0 95 46 0 99 1 61 99 74 40 15 0 0 99 1 0 26 15 0 85 26 80 61 0

Entero.faecalis 99 99 2 1 1 5 99 99 80 98 95 1 99 1 1 99 50 50 26 1 0 99 0 74 95 1 1 99 95 50 99 0

Entero.faecium 1 99 99 10 1 50 0 99 98 1 99 95 0 99 1 95 99 50 8 38 1 0 99 30 0 99 99 1 83 8 15 90 1

Entero.faecium 2 99 88 1 0 99 0 99 99 1 99 99 99 99 0 66 99 2 1 25 1 0 99 99 0 66 99 1 44 2 17 91 1

Entero.gallinarum 99 99 26 10 93 1 99 99 2 100 100 74 99 1 99 98 95 90 99 0 0 100 90 0 99 99 1 99 74 50 90 0

Entero.hirae 100 99 7 0 70 1 99 1 0 80 99 7 99 1 82 99 50 50 15 0 1 100 70 0 99 1 0 100 57 50 99 0

Entero.saccharolyt. 0 100 1 0 100 0 0 100 99 99 100 100 1 0 1 0 99 99 0 0 0 100 100 100 100 0 99 100 0 0 100 0

Erysi.rhusiopathiae 42 1 99 0 0 28 0 0 0 75 0 0 0 64 0 100 80 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Gardnerel.vaginalis 0 0 82 0 0 99 95 0 0 1 1 0 0 99 82 0 0 0 74 50 50 100 0 0 1 10 0 0 0 0 70 0

Gem.haemolysans 0 0 0 0 0 55 1 15 5 0 0 0 10 10 0 70 0 10 0 0 0 95 0 0 44 1 0 0 0 0 0 0

Gem.morbillorum 2 1 0 0 0 8 0 1 0 0 9 2 2 55 0 25 0 44 0 0 15 100 0 0 81 0 0 0 10 0 0 2

Globi.sanguinis 1 70 17 17 95 4 75 82 35 60 95 89 0 25 95 40 0 0 60 82 50 95 89 0 100 45 0 70 35 45 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 146


Annexes rapid ID 32 STREP V4.0

MßDG

ßMAN
ßNAG
ßGUR
ßGAR
ßGLU

αGAL

APPA

GLYG
ßGAL

DARL

CDEX
PYRA

LARA
MAN

MAL
ADH

MEL

MLZ

TAG
GTA

URE
SOR

RAF

SAC
PUL
LAC

TRE
PAL

HIP
RIB

VP
Taxon

Granuli.adiacens 1 3 0 30 1 0 0 1 0 3 0 0 0 99 0 70 25 1 0 0 0 90 0 0 99 0 0 0 60 0 0 0

Lc.garvieae 100 100 0 0 0 0 35 75 0 50 100 0 100 100 0 74 10 0 0 0 0 75 0 0 50 0 0 85 50 0 50 0

Lc.lactis cremoris 0 26 30 0 0 30 0 0 0 96 1 0 96 99 0 1 0 0 66 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0

Lc.lactis lactis 99 100 5 0 0 0 95 26 0 50 75 0 74 100 26 1 50 0 26 0 0 100 0 0 26 1 0 85 3 50 95 0

Lc.raffinolactis 0 100 5 0 100 74 0 50 5 100 100 74 99 100 0 0 74 0 0 0 0 100 25 5 100 26 0 5 0 0 90 0

Leuconostoc spp 2 36 44 0 72 5 25 36 0 44 55 50 94 33 91 0 0 0 2 0 0 80 61 0 72 16 2 13 0 0 19 0

List.grayi 0 100 0 0 0 0 100 99 0 99 99 0 99 1 0 0 99 50 1 0 0 100 0 0 0 0 99 99 0 100 100 0

Listeria spp 1 100 0 0 0 30 1 0 0 22 97 1 70 1 5 0 99 95 74 0 0 99 0 1 1 0 80 99 5 100 92 0

Str.agalactiae 100 0 1 50 10 99 85 0 1 30 74 1 90 98 0 1 1 1 99 4 99 99 0 0 100 0 0 90 26 0 0 0

Str.alactolyticus 0 50 0 1 89 1 0 74 5 0 26 83 100 100 0 0 0 1 1 1 1 100 10 0 99 0 0 50 0 0 0 50

Str.anginosus 99 100 22 0 27 97 5 25 0 62 92 27 97 97 2 0 1 2 0 0 60 99 20 1 100 5 0 89 7 5 0 1

Str.canis 99 1 1 26 85 100 99 0 0 85 26 1 1 100 74 0 0 1 5 0 99 100 0 0 99 0 0 99 0 0 0 0

Str.const.const. 99 11 2 0 0 100 2 2 0 19 80 0 99 100 5 0 2 5 0 0 2 99 0 0 97 2 0 77 0 0 0 0

Str.downei/sobrinus 0 1 0 0 0 0 0 99 1 99 100 1 100 99 0 0 0 0 1 0 0 100 0 0 99 0 0 0 95 0 0 0

Str.dys.dysgalactiae 99 0 1 100 0 100 99 1 26 99 100 1 0 100 1 0 0 1 1 15 100 99 0 0 100 0 0 0 74 0 1 0

Str.dys.equisimilis 99 3 5 85 0 98 97 0 0 50 99 0 1 99 1 0 0 1 2 30 99 100 0 0 99 1 0 60 1 0 24 1

Str.equi equi 100 1 0 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 100 100 100 0 0 100 0 0 99 0 26 70 0

Str.equi zooepidem. 100 1 0 100 0 100 25 0 90 98 0 0 0 100 0 0 0 0 0 100 99 100 0 0 100 0 0 98 0 2 98 0

Str.equinus 1 0 99 0 0 1 0 0 0 0 0 26 1 100 100 0 0 1 1 0 1 1 100 1 0 100 0 0 95 0 0 0 0

Str.equinus 2 1 100 0 1 99 2 0 0 0 31 37 55 97 100 1 0 1 0 0 91 57 100 48 0 100 8 0 98 0 10 1 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 147


Annexes rapid ID 32 STREP V4.0

MßDG

ßMAN
ßNAG
ßGUR
ßGAR
ßGLU

αGAL

APPA

GLYG
ßGAL

DARL

CDEX
PYRA

LARA
MAN

MAL
ADH

MEL

MLZ

TAG
GTA

URE
SOR

RAF

SAC
PUL
LAC

TRE
PAL

HIP
RIB

VP
Taxon

Str.gal.gallolyticus 0 100 1 0 42 1 1 99 0 99 100 61 99 99 1 1 1 1 0 98 95 100 3 0 100 0 0 100 1 58 0 0

Str.gal.pasteurianus 0 100 1 99 90 1 0 0 0 100 100 67 99 100 99 0 9 0 1 0 0 100 9 22 100 0 0 100 1 94 0 0

Str.gordonii 95 95 90 0 28 100 0 0 0 85 99 4 0 100 1 0 0 35 1 1 0 99 1 0 100 0 0 74 1 90 1 0

Str.group L 100 0 0 99 0 99 99 0 0 85 100 0 0 100 0 0 1 1 74 95 100 100 0 0 100 0 0 0 0 1 70 0

Str.infant.coli 0 93 0 0 100 0 0 0 0 100 1 40 98 100 0 0 1 1 0 0 0 100 0 0 100 0 0 93 0 1 0 0

Str.infant.infant. 1 1 7 0 92 0 0 0 0 82 0 98 100 100 0 0 1 1 0 82 82 100 64 0 100 0 0 0 0 1 0 0

Str.intermedius 86 90 99 0 0 99 4 2 0 100 99 0 100 100 89 0 97 51 0 0 97 97 0 2 100 2 0 27 1 20 0 0

Str.mitis 1 1 0 65 0 10 39 17 0 1 97 9 11 4 99 1 1 1 30 1 0 98 99 5 0 100 0 0 0 1 0 1 0

Str.mitis 2 14 1 20 0 24 8 1 0 1 60 45 60 9 100 1 0 0 28 0 0 34 70 0 0 89 0 0 1 3 0 0 0

Str.mutans 1 99 0 0 99 1 0 99 80 98 99 99 99 74 0 1 1 0 1 1 0 99 95 1 100 0 1 74 50 0 0 0

Str.oralis 1 2 4 98 0 93 93 0 1 1 99 40 93 3 100 23 1 26 99 1 3 99 100 80 0 100 0 0 1 40 5 3 0

Str.oralis 2 1 1 89 0 8 62 1 1 1 97 26 40 22 100 17 0 9 70 0 0 90 99 7 0 100 0 0 0 27 6 1 0

Str.oralis 3 0 0 89 0 6 11 5 0 0 68 13 68 7 100 0 0 0 0 0 0 0 24 0 0 47 6 0 0 6 0 0 0

Str.parasanguinis 72 34 99 0 65 89 0 0 1 94 50 65 0 100 27 1 10 39 10 0 0 100 55 0 100 0 0 20 31 19 1 0

Str.pneumoniae 26 26 88 1 84 1 0 0 0 99 95 84 1 99 2 23 74 90 1 1 74 79 5 0 98 1 0 14 2 0 0 0

Str.porcinus 100 85 0 100 80 100 80 99 74 30 100 0 99 100 0 1 1 0 1 0 74 99 0 0 99 0 0 50 0 0 0 0

Str.pyogenes 98 0 0 15 0 100 1 8 0 99 99 1 1 99 0 99 0 1 0 35 85 99 0 0 99 0 0 97 0 0 35 0

Str.sal.salivarius 0 99 71 0 2 1 0 0 1 78 70 64 99 100 74 0 0 1 0 0 95 100 5 0 100 0 0 70 2 0 0 70

Str.sal.thermophilus 0 0 100 0 0 5 0 0 0 100 0 0 80 100 100 0 0 5 0 0 0 1 0 0 99 0 0 0 0 0 0 75

Str.sanguinis 1 86 38 23 0 54 0 5 3 93 89 99 46 1 99 3 0 1 97 6 0 100 100 38 0 100 3 0 19 37 1 1 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 148


Annexes rapid ID 32 STREP V4.0

MßDG

ßMAN
ßNAG
ßGUR
ßGAR
ßGLU

αGAL

APPA

GLYG
ßGAL

DARL

CDEX
PYRA

LARA
MAN

MAL
ADH

MEL

MLZ

TAG
GTA

URE
SOR

RAF

SAC
PUL
LAC

TRE
PAL

HIP
RIB

VP
Taxon

Str.sanguinis 2 70 58 10 0 60 2 2 4 4 81 97 52 0 98 2 0 2 74 0 0 77 100 26 0 100 1 0 21 18 1 1 2

Str.suis I 95 60 36 99 85 9 0 5 0 98 100 0 0 100 15 50 40 45 0 85 100 85 0 0 100 0 0 70 5 20 2 0

Str.suis II 99 85 25 90 100 1 0 1 0 99 99 99 0 100 36 30 10 41 0 99 100 99 5 0 100 0 0 90 2 20 5 2

Str.uberis 1 100 100 30 99 15 5 99 100 99 100 99 20 100 100 1 30 1 1 90 5 1 100 1 1 100 0 0 100 5 1 0 0

Str.uberis 2 100 100 1 1 15 1 99 100 99 100 99 10 100 100 0 10 1 0 50 1 1 100 1 10 100 0 0 100 30 30 0 0

Str.vestibularis 5 99 95 0 0 0 1 0 0 100 1 2 95 100 95 0 0 0 0 1 2 100 0 0 99 0 0 10 2 0 0 95

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 149


Annexes ID 32 C V4.0

ID 32 C V4.0

MDG

MAN
NAG

MAL

MEL

GNT
RHA

MLZ
ARA

GLU

GLN
2KG

SOR

GRT
GAL

ACT

SAC

RAF

INO
GLY

LAC
ERY
TRE
LAT

SBE
LVT
CEL

XYL

PLE
RIB
Taxon

C.albicans 1 98 99 100 99 96 0 0 1 100 97 100 98 99 98 1 10 0 100 0 0 0 0 2 1 99 1 1 98 1 99


C.albicans 2 100 100 1 50 0 0 0 0 99 67 100 0 67 67 0 0 0 33 0 0 0 0 0 0 99 0 0 100 0 50
C.boidinii 5 100 0 86 75 0 0 0 0 0 0 0 99 99 100 99 0 0 100 0 0 0 0 1 100 0 0 100 1 67
C.catenulata 100 74 1 67 75 0 0 0 33 33 0 0 74 2 0 91 0 0 0 0 0 0 17 0 100 0 0 100 0 74
C.ciferrii 99 100 100 100 99 100 75 99 100 100 99 0 100 100 99 100 100 75 100 75 50 0 100 0 99 0 100 100 99 100
C.colliculosa 26 19 78 0 82 0 15 78 31 74 80 31 72 4 4 59 4 33 0 4 0 27 31 0 78 1 0 96 1 0
C.dattila 43 0 100 0 0 0 14 100 99 99 1 100 99 20 0 86 0 100 0 0 0 83 0 0 71 1 0 100 33 0
C.dubliniensis 100 100 100 90 10 0 0 1 100 11 99 0 100 3 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 100 0 0 100 0 60
C.famata 100 13 100 97 43 83 91 93 100 99 99 100 100 75 2 99 38 100 66 19 40 100 52 1 100 31 0 100 75 75
C.glabrata 0 0 1 0 3 0 0 0 1 99 0 0 0 1 0 30 1 0 0 1 3 0 31 0 0 0 1 100 0 0
C.globosa 0 0 60 33 0 0 0 60 50 0 75 60 80 0 0 60 0 60 0 0 0 0 60 0 60 0 0 60 60 25
C.guilliermondii 100 53 100 97 30 99 99 100 100 99 97 97 92 99 11 99 3 97 0 72 0 97 9 2 94 0 0 100 85 97
C.hellenica 100 100 100 100 33 67 100 67 99 100 0 0 100 100 67 99 100 99 0 0 99 0 67 0 100 0 100 100 100 100
C.holmii 88 50 88 0 0 0 0 88 0 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 88 0 0
C.incons./norvegen. 1 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 91 0 0 0 0 0 0 0 1 6 0 0 99 1 86
C.intermedia 99 0 100 100 50 10 85 85 100 100 100 67 100 99 5 10 50 100 0 1 50 100 85 33 100 75 0 100 85 99
C.kefyr 99 100 99 1 99 72 12 99 1 1 5 0 85 83 1 51 0 0 0 1 0 1 0 0 77 96 0 100 1 1
C.krusei 1 3 1 90 99 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 95 1 1 1 1 0 0 3 1 1 1 0 100 1 5
C.lambica 0 0 0 96 100 0 0 0 0 0 0 0 4 97 0 89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 89
C.lipolytica 0 100 0 97 97 0 0 0 0 0 0 0 54 0 11 100 0 0 100 0 0 0 77 0 84 0 0 100 0 3
C.lusitaniae 94 1 100 91 14 5 99 7 100 100 91 93 99 94 11 82 99 100 5 0 0 100 84 1 100 0 0 100 95 86
C.magnoliae 0 0 98 0 0 0 0 75 0 0 63 0 100 0 20 100 0 0 0 0 0 0 99 0 100 0 0 100 83 0
C.melibiosica 100 0 100 50 1 0 100 50 100 100 100 2 100 99 50 50 35 100 0 50 1 100 89 1 100 0 0 100 50 50
C.membranifaciens 100 0 100 99 50 100 100 100 100 99 100 80 100 100 99 100 0 100 100 99 20 100 100 1 100 20 0 100 60 60
C.norvegica 0 0 0 0 83 0 80 0 0 0 0 0 50 67 0 83 33 0 0 0 0 0 0 1 83 0 0 83 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 150


Annexes ID 32 C V4.0

MDG

MAN
NAG

MAL

MEL

GNT
RHA

MLZ
ARA

GLU

GLN
2KG

SOR

GRT
GAL

ACT

SAC

RAF

INO
GLY

LAC
ERY
TRE
LAT

SBE
LVT
CEL

XYL

PLE
RIB
Taxon

C.parapsilosis 100 25 100 100 1 96 2 1 100 96 93 98 100 96 1 93 1 100 0 0 1 99 92 70 100 1 0 100 72 97


C.pelliculosa 43 0 100 0 96 0 70 99 100 97 0 96 97 85 9 100 0 96 90 0 1 96 19 0 100 0 0 100 0 0
C.pulcherrima 99 0 100 100 0 0 83 0 100 99 100 99 100 83 80 100 20 100 0 0 1 100 83 0 100 0 0 100 100 99
C.rugosa 75 0 1 36 75 1 0 0 0 0 0 0 99 75 0 67 0 0 0 0 0 0 18 0 99 0 0 99 64 30
C.sake 80 26 90 90 30 0 28 2 90 85 80 31 85 74 20 83 0 85 2 0 1 70 30 5 85 0 0 85 67 70
C.silvicola 40 100 90 60 50 75 100 0 75 100 1 20 100 80 100 100 99 75 60 0 0 75 40 0 100 0 0 100 1 60
C.spherica 88 96 100 4 96 0 51 92 67 74 4 61 98 43 0 90 0 65 0 0 0 64 4 0 96 92 0 100 64 4
C.tropicalis 99 30 100 100 50 4 91 9 100 99 99 99 100 99 21 9 3 100 0 0 0 99 33 7 100 5 0 100 17 95
C.utilis 0 0 100 0 100 0 100 100 100 99 0 57 25 88 0 100 0 100 0 0 0 100 75 0 50 0 0 100 0 0
C.valida 0 0 0 79 14 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 86
C.zeylanoides 0 46 0 99 0 0 0 0 0 53 87 0 97 0 0 100 0 0 0 0 0 0 1 0 100 0 0 100 53 50
Crypto.albidus 40 0 91 0 0 91 91 82 91 82 91 64 91 91 10 0 70 82 0 0 82 91 50 0 55 30 50 82 10 0
Crypto.curvatus 100 17 100 100 75 17 100 75 50 67 100 33 83 100 100 99 33 50 67 0 99 50 100 0 60 100 67 100 0 83
Crypto.humicola 99 71 100 92 100 86 100 43 100 100 100 100 100 100 100 99 99 100 99 100 100 50 100 71 99 100 99 100 71 99
Crypto.laurentii 100 20 100 75 25 100 100 100 100 99 100 77 100 88 99 40 99 100 60 99 100 80 99 0 99 100 99 100 20 60
Crypto.neoformans 99 0 100 95 0 75 65 81 100 75 100 99 100 81 71 0 91 100 52 0 100 96 76 0 100 0 99 100 50 64
Crypto.terreus 83 0 0 100 0 100 100 0 1 58 100 0 99 100 99 0 67 0 0 0 99 1 100 0 100 85 69 100 91 33
Crypto.uniguttulatus 0 0 100 100 0 99 0 99 100 100 100 100 99 100 0 33 33 100 0 0 100 100 67 0 99 0 100 100 0 99
Geotrichum spp 90 100 0 0 94 5 0 0 0 0 0 0 99 99 0 99 0 0 0 0 0 0 0 1 95 1 0 100 99 0
Kl.apis/apiculata 0 99 0 0 0 0 100 0 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 0 0 0 0 100 0 0
Kloeckera japonica 0 100 0 0 0 0 75 0 0 74 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85 0 0
Kodamaea ohmeri 99 0 100 100 0 0 99 99 100 100 100 100 100 0 20 100 0 100 0 0 0 0 0 0 100 0 0 100 80 99
Lac.kluyverii 80 0 100 40 60 0 5 100 80 75 70 60 87 20 0 0 0 87 0 75 20 25 40 0 99 1 20 100 20 0
Lind.saturnus 0 0 100 0 90 0 100 100 20 20 0 20 60 100 0 99 20 20 0 0 0 15 70 0 20 0 0 100 0 0
Millerozyma farinosa 99 0 1 100 0 0 20 0 0 99 0 0 99 40 40 100 0 0 99 0 0 0 75 1 100 0 0 100 1 50
Pro.wickerhamii 99 1 1 1 20 1 1 1 1 99 1 1 1 1 1 99 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99 1 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 151


Annexes ID 32 C V4.0

MDG

MAN
NAG

MAL

MEL

GNT
RHA

MLZ
ARA

GLU

GLN
2KG

SOR

GRT
GAL

ACT

SAC

RAF

INO
GLY

LAC
ERY
TRE
LAT

SBE
LVT
CEL

XYL

PLE
RIB
Taxon

Rhodo.glutinis 80 9 99 0 0 61 28 92 84 97 30 25 55 70 68 66 9 74 0 0 3 84 28 0 55 0 0 99 20 0
Rhodo.minuta 8 0 86 57 14 86 71 0 3 86 97 0 43 86 29 100 0 0 0 0 99 86 99 1 43 8 0 99 1 0
Rhodo.mucilaginosa 95 0 100 0 0 85 15 100 72 85 0 0 38 90 92 50 5 71 0 0 0 71 26 0 57 0 0 100 8 0
Saccharo.cerevisiae 63 1 89 4 65 1 7 89 91 34 0 28 2 0 2 5 2 28 1 5 0 15 4 0 2 2 2 100 1 2
Saprochaete capita 31 92 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92 25 0
Sch.etch./Pri.carso. 90 0 100 91 36 18 50 0 100 64 99 100 100 60 12 60 0 100 12 0 0 99 12 0 100 0 0 100 91 30
Sch.polymorphus 100 98 100 100 1 50 99 100 100 100 100 100 100 95 25 40 1 100 60 60 0 100 63 0 100 60 0 100 99 99
Sporo.salmonicolor 20 0 30 0 0 0 0 30 0 85 0 0 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85 0 85 0 0 85 0 0
Tricho.asahii 99 99 99 100 100 98 100 0 100 95 100 99 30 100 100 75 75 100 98 1 98 70 100 1 17 100 25 100 17 98
Tricho.inkin 95 50 100 99 100 0 100 0 100 97 100 100 1 100 100 50 0 100 70 1 75 95 100 1 97 100 97 100 25 70
Tricho.mucoides 100 99 100 100 100 100 99 99 100 100 100 99 99 100 100 99 99 100 99 100 100 94 100 1 99 100 100 100 94 99
Zygosacch.spp 17 1 1 0 6 0 1 6 6 1 1 1 65 1 0 59 1 6 0 1 1 6 1 0 63 0 0 99 0 6

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 152


Annexes rapid ID 32 A V3.3

rapid ID 32 A V3.3

ßNAG
ßGUR
αARA
αGLU

ßGLU

αFUC
αGAL

ßGAL

PYRA
PheA

LeuA
MNE

ArgA

ProA

GlyA

SerA
AlaA
TyrA

GGA
ADH

HisA
GDC
URE

ßGP

LGA
RAF

IND

PAL
NIT
Taxon

0
Actino.israelii 0 36 100 90 54 100 100 81 0 0 54 36 45 0 0 0 100 0 100 100 0 90 36 45 0 0 0 0 9 0
Actino.meyeri 0 7 0 92 15 100 7 0 7 53 7 7 15 0 7 100 100 76 100 100 7 90 58 100 0 0 0 69 46 91
Actino.naeslundii 9 20 100 100 9 60 100 9 9 10 80 81 54 0 1 26 79 0 80 90 18 81 37 45 9 9 0 20 0 9
Actino.odontolyticus 0 28 0 78 35 92 64 0 0 0 0 0 100 0 0 100 92 71 100 100 0 100 92 85 0 0 0 100 21 78
Actino.viscosus 18 10 100 100 27 100 100 18 0 9 63 90 81 0 9 9 90 18 100 100 9 90 70 81 0 0 0 9 9 9
Anaerob.succiniprod. 0 0 0 25 0 25 0 0 0 100 0 0 0 0 0 85 0 0 0 5 0 0 83 100 0 2 0 0 0 15
Anaeroc.prevotii 0 4 0 0 0 20 0 0 5 0 5 0 0 0 1 100 0 5 0 75 53 35 1 3 0 0 0 57 1 5
Bac.caccae 1 0 100 100 2 67 91 99 3 100 100 99 0 0 100 100 0 100 33 100 0 90 100 3 67 95 0 91 92 5
Bac.eggerthii 0 0 11 100 1 100 100 89 0 100 98 5 0 95 100 0 0 100 0 0 0 0 100 10 99 10 0 1 94 0
Bac.fragilis 0 1 100 100 3 99 88 2 4 99 98 98 1 0 100 85 0 99 55 94 4 80 99 4 97 97 0 40 85 2
Bac.ovatus 0 0 99 99 1 100 99 99 1 99 99 97 0 96 100 3 1 97 0 6 0 0 100 0 51 31 0 1 90 0
Bac.stercoris 0 0 15 100 1 100 90 3 0 100 100 99 0 100 100 1 0 100 1 1 1 1 100 1 22 17 0 1 100 0
Bac.thetaiotaomicron 0 0 99 99 2 100 99 95 2 100 99 85 0 99 100 76 0 100 25 77 0 21 100 3 80 75 0 49 97 2
Bac.uniformis 0 1 98 100 1 100 99 96 1 100 99 97 0 99 100 2 1 100 1 2 0 1 100 0 68 85 0 1 99 0
Bac.vulgatus 0 0 100 100 20 100 0 100 25 100 97 99 0 0 100 5 0 100 0 0 40 0 100 97 70 85 0 1 99 0
Bif.adolescentis 1 0 0 100 100 99 100 100 50 0 0 1 25 0 0 1 50 100 0 25 25 0 25 0 50 0 1 0 25 1 1
Bif.adolescentis 2 0 0 100 100 50 100 100 99 0 0 90 99 0 0 1 90 100 0 90 88 0 90 0 90 0 1 0 10 1 1
Bifidobacterium spp 0 0 100 100 9 100 91 45 0 64 99 93 0 1 5 100 99 27 99 91 9 99 64 99 0 9 0 91 1 91
Camp.ureolyticus 82 30 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 32 0 41 41 13 8 5 41 0 5 22 24 43 0 0 5 3 1
Capnocytophaga spp 0 80 40 90 90 100 90 0 0 90 90 90 60 0 99 100 100 100 100 100 50 100 100 100 50 0 0 100 100 100
Cl.acetobutylicum 1 0 3 28 50 75 83 73 1 28 90 50 0 0 10 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 5 0
Cl.baratii 0 0 100 75 100 1 75 0 100 75 10 0 1 0 1 0 0 0 0 0 50 0 0 0 1 1 0 0 0 0
Cl.beijer./butyricum 0 0 93 87 76 95 28 49 3 10 30 28 1 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 1 3 0 0 0 0 0
Cl.bifermentans 0 0 0 0 0 10 2 0 0 10 0 0 0 67 0 0 65 0 8 21 0 17 0 0 0 10 0 0 0 0
Cl.botulinum 1 0 43 43 0 0 0 4 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29 0 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 153


Annexes rapid ID 32 A V3.3

ßNAG
ßGUR
αARA
αGLU

ßGLU

αFUC
αGAL

ßGAL

PYRA
PheA

LeuA
MNE

ArgA

ProA

GlyA

SerA
AlaA
TyrA

GGA
ADH

HisA
GDC
URE

ßGP

LGA
RAF

IND

PAL
NIT
Taxon

0
Cl.botulinum 2 0 13 0 17 0 99 4 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0
Cl.botulinum 3 0 99 0 0 0 96 50 0 0 1 0 0 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0
Cl.cadaveris 0 0 0 1 0 0 1 0 0 100 0 0 0 96 0 0 3 0 0 0 97 0 0 0 0 5 0 0 0 0
Cl.clostridioforme 0 0 89 100 6 63 72 54 22 54 72 45 0 6 1 0 0 54 0 0 45 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Cl.difficile 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0 63 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0
Cl.fallax 73 5 25 90 79 15 5 0 70 20 25 0 0 0 10 5 0 0 0 0 15 5 0 4 0 4 0 0 0 4
Cl.glycolicum 1 0 1 2 0 3 0 0 2 0 0 0 0 0 91 0 100 0 0 50 6 0 1 0 1 0 0 2 0 0
Cl.histolyticum 0 50 25 25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0 0 0 100 20 0 0 0 1 0 0 0 0
Cl.innocuum 0 0 0 0 10 0 90 0 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 0 1 0 0 0 0 0
Cl.paraputrificum 0 0 0 100 80 35 90 0 0 100 26 0 0 5 0 0 0 0 0 0 47 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Cl.perfringens 1 62 95 97 14 75 57 0 52 95 97 95 24 1 95 10 0 0 5 10 98 5 5 5 48 24 0 0 0 0
Cl.ramosum 0 0 30 100 85 82 80 0 0 100 25 25 0 0 0 0 0 50 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Cl.septicum 0 5 0 100 3 25 3 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 1 0 0 0 0 0
Cl.sordellii 1 97 1 1 1 1 15 0 0 0 0 0 0 0 99 1 0 99 0 0 8 15 0 1 0 1 1 0 1 0 0
Cl.sordellii 2 97 89 1 99 1 99 0 0 0 0 0 0 0 99 11 0 99 0 0 1 78 0 11 0 89 78 0 1 0 0
Cl.sporogenes 0 70 0 1 0 54 50 0 0 1 0 0 0 0 0 0 73 0 0 0 73 1 0 0 23 1 0 0 1 1
Cl.subterminale 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 46 0 54 38 100 90 90 90 62 15 0 0 0 0 8
Cl.tertium 0 1 93 100 88 75 75 0 3 75 50 15 10 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 3 0 0 0 0 0
Cl.tetani 0 21 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 50 0 0 10 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0
Cl.tyrobutyricum 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 50 0 85 0 0 0 0 0 0 0 32 0 0 5 0 0 0 0 0 0
Eggerthella lenta 7 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 1 70 20 0 20 20 0 20 20 5 10 5 0 12 0 30
Eubac.limosum 0 4 0 0 0 0 7 0 0 0 22 4 0 0 25 5 9 88 0 0 0 0 0 26 50 4 0 0 0 0
Finegoldia magna 0 37 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 25 98 1 55 2 98 98 28 64 83 0 9 0 72 6 60
Fuso.mortiferum 0 10 100 100 90 25 10 0 0 0 90 90 0 1 100 0 0 0 0 10 93 0 0 0 1 15 0 0 3 0
Fuso.necrogenes 0 0 98 75 75 25 25 0 0 0 30 0 0 0 100 0 0 0 0 0 1 0 0 2 25 1 0 0 0 0
Fuso.necrophorum 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0 0 0 100 95 0 0 0 0 0 25 0 1 0 25 1 0 0 0 0

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 154


Annexes rapid ID 32 A V3.3

ßNAG
ßGUR
αARA
αGLU

ßGLU

αFUC
αGAL

ßGAL

PYRA
PheA

LeuA
MNE

ArgA

ProA

GlyA

SerA
AlaA
TyrA

GGA
ADH

HisA
GDC
URE

ßGP

LGA
RAF

IND

PAL
NIT
Taxon

0
Fuso.nucleatum 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 40 17 0 0 0 0
Fuso.varium 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 0 0 90 0 0 0 0 0 0 99 0 0 0 50 1 0 0 0 0
Gem.morbillorum 0 28 0 58 0 78 20 0 6 50 83 0 13 0 7 86 26 13 66 71 0 93 92 20 0 0 0 70 0 75
Lacto.acidophilus 0 0 50 75 0 100 100 0 0 50 100 0 0 0 0 100 50 0 100 100 10 100 100 99 0 0 0 100 1 100
Lepto.buccalis 0 0 50 10 99 95 100 0 0 13 100 50 10 0 99 0 0 0 0 0 50 3 0 0 10 3 0 3 0 0
Mobiluncus spp 0 83 42 8 0 67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 100 42 8 50 0 0 0 100 0 0 0 75 0 1
Parab.distasonis 0 0 100 100 9 100 99 99 0 100 100 99 1 0 100 100 0 100 73 100 91 36 100 91 98 2 0 98 99 36
Parab.merdae 0 0 100 100 70 81 0 100 15 100 69 15 0 0 100 100 0 100 23 100 53 33 100 100 30 46 0 54 76 30
Parvimonas micra 0 10 0 0 0 0 10 0 0 0 10 0 0 0 100 99 90 90 99 100 90 80 100 90 10 1 0 100 80 100
Peptoni.asacchar. 5 11 0 0 0 9 2 0 2 0 9 0 0 92 12 83 3 3 0 57 0 70 0 22 0 11 0 79 1 4
Peptoni.indolicus 0 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 100 100 100 0 1 0 25 0 62 0 25 0 18 0 100 0 1
Por.asaccharolytica 0 0 0 1 0 0 4 0 0 1 0 0 0 100 100 14 0 100 14 74 0 0 100 0 0 85 0 29 80 0
Por.endodontalis 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 100 100 0 0 99 0 1 0 0 100 0 0 1 0 1 1 0
Por.gingivalis 0 50 0 100 71 0 0 0 0 100 0 0 0 100 93 100 0 100 0 0 21 0 100 0 14 0 0 0 93 1
Prev.bivia 0 0 0 100 99 99 1 0 1 100 92 15 0 0 100 46 0 100 8 31 0 8 100 96 46 98 0 46 98 1
Prev.buccae 0 0 100 100 67 89 89 99 0 3 67 67 0 0 100 0 0 100 0 0 0 0 100 0 0 5 0 0 56 0
Prev.buccalis 0 0 100 100 100 100 99 0 0 100 0 5 0 0 100 100 0 100 0 5 0 0 100 0 5 99 0 95 99 0
Prev.denticola 0 0 89 100 100 100 36 0 0 100 72 63 0 0 100 17 0 100 0 30 0 0 100 0 0 90 0 10 85 0
Prev.disiens 0 0 10 0 0 100 0 0 0 0 20 0 0 0 98 98 0 100 1 25 0 10 100 98 0 0 0 85 100 0
Prev.intermedia 0 0 17 0 0 100 0 0 0 0 31 69 0 97 92 62 0 99 0 8 0 0 100 0 0 92 0 15 82 0
Prev.loescheii 0 0 100 100 60 100 95 0 0 100 60 60 0 0 100 11 0 100 0 0 0 0 100 0 0 40 0 9 95 0
Prev.melaninogenica 0 0 99 100 100 100 19 2 0 100 76 81 0 0 100 90 0 100 0 19 0 0 100 0 10 94 0 24 90 0
Prev.oralis 0 0 66 95 77 100 77 0 0 95 66 44 0 0 100 44 0 100 0 16 0 0 100 3 0 48 0 33 62 0
Prop.acnes 0 62 0 69 0 23 0 0 0 90 46 0 85 62 0 88 100 54 8 69 1 8 85 91 0 0 0 8 0 69
Prop.granulosum 0 1 40 20 0 99 20 20 0 20 50 1 0 0 0 0 95 20 0 0 0 0 95 93 0 0 0 0 0 25
Prop.propionicum 10 1 100 90 10 100 30 14 0 0 40 40 86 0 0 70 30 30 100 70 30 100 60 60 10 50 0 50 10 50

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 155


Annexes rapid ID 32 A V3.3

ßNAG
ßGUR
αARA
αGLU

ßGLU

αFUC
αGAL

ßGAL

PYRA
PheA

LeuA
MNE

ArgA

ProA

GlyA

SerA
AlaA
TyrA

GGA
ADH

HisA
GDC
URE

ßGP

LGA
RAF

IND

PAL
NIT
Taxon

0
Psflav.capillosus 0 0 100 100 86 12 100 0 33 100 33 33 0 0 100 0 0 100 0 33 0 0 100 0 33 86 0 0 67 0
Pstr.anaerobius 0 8 0 0 0 100 0 0 0 0 4 1 1 0 0 4 99 0 0 0 0 0 0 16 16 1 0 0 1 1
Veillonella spp 1 69 0 1 0 0 3 0 0 0 0 0 100 0 6 0 0 0 0 6 63 0 0 0 0 1 0 1 0 1

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 156


Annexes ID 32 GN V3.2

ID 32 GN V3.2

mOBE

3OBU
PROP

pOBE
GLYG
MAN

VALT
MNT
NAG

MAL

MEL
RHA

PRO
ARA
GLU

SOR

5KG

2KG
SUB

FUC

CAP
ACE

ALA
SAC
INO

SER
LAT

SAL
RIB

HIS
ITA

CIT
Taxon

Achro.denitrificans 0 0 0 0 0 0 100 100 2 100 100 85 1 0 0 0 0 0 0 99 90 99 99 90 0 0 50 0 99 1 90 100

Achro.xylosoxidans 3 0 0 0 0 0 99 99 0 99 99 99 0 99 0 0 0 0 0 75 99 99 99 75 0 0 25 2 96 2 75 99

Aci.baumannii 1 1 77 0 0 1 0 88 72 100 99 99 0 79 1 0 4 0 93 100 100 100 99 100 0 0 4 1 99 88 47 99

Aci.haemolyticus 0 0 0 0 0 8 0 8 17 99 0 99 0 0 0 0 0 0 0 60 100 99 65 73 0 0 0 1 13 52 95 99

Aci.johnsonii 0 0 0 0 0 0 0 37 8 100 99 68 1 1 0 0 0 0 0 99 100 99 97 4 0 0 0 0 56 14 8 99

Aci.junii 0 0 0 0 0 0 1 17 1 100 100 55 0 0 0 0 17 0 0 100 100 100 77 99 0 0 0 2 35 10 20 100

Aci.lwoffii 0 1 0 0 0 0 0 77 1 100 99 91 0 1 0 0 1 0 0 60 63 99 7 0 0 0 1 0 18 1 0 71

Aer.hydro./caviae 8 100 89 1 98 100 0 0 0 90 34 79 100 100 70 2 11 5 74 6 98 31 29 99 0 90 1 3 0 1 99 99

Aer.salm.salmonicida 0 52 72 0 20 72 0 0 4 0 0 4 72 92 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 4 72 0 0 4 0 68 4

Aer.sobria 10 100 100 0 100 100 0 0 0 99 0 60 97 100 2 10 21 0 0 0 84 84 89 80 0 100 2 1 2 2 99 100

Alc.faecalis 0 0 0 0 0 0 0 0 95 100 100 100 1 0 0 0 0 1 0 100 90 100 100 74 0 0 0 0 90 11 1 100

Bord.bronchiseptica 0 0 0 0 0 0 100 0 0 99 99 25 0 0 0 0 0 0 0 99 1 75 95 0 1 0 0 0 99 0 14 99

Brev.diminuta 0 0 0 0 8 0 0 0 1 90 0 24 1 0 0 0 0 0 0 72 33 77 0 92 0 8 8 8 85 18 0 92

Brev.vesicularis 15 20 10 0 1 93 0 1 0 25 1 0 1 94 5 1 1 0 0 25 0 25 0 1 0 1 0 1 82 0 3 60

Budvicia aquatica 99 100 100 0 0 0 0 0 0 0 99 0 99 99 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 99 0 0 99 0 0 0 0

Burkhol.cepacia 3 100 74 99 60 26 3 85 99 99 99 99 99 99 74 1 99 100 74 99 100 99 99 99 74 1 74 100 100 99 99 99

Burkhol.pseudomallei 0 100 10 100 60 1 1 100 60 100 100 100 100 100 0 0 99 100 0 100 100 100 99 100 1 100 1 100 100 100 100 100

Buttiaux.agrestis 99 100 99 10 8 98 0 0 60 78 99 89 100 100 100 90 80 10 99 3 2 1 90 13 7 2 0 100 1 91 100 97

Cedecea spp 0 100 100 99 50 99 0 0 25 99 99 99 100 100 99 1 0 1 0 0 0 0 99 25 0 1 0 100 0 0 100 99

Chromo.violaceum 0 88 100 24 35 0 0 0 0 100 100 100 24 100 12 0 0 24 0 85 88 90 41 100 0 25 0 0 25 0 99 100

Chryse.indologenes 1 1 0 0 1 100 0 0 0 50 0 0 1 99 15 0 0 0 25 20 0 0 40 1 7 100 0 0 0 0 1 99

Citro.ama./farmeri 100 100 100 0 12 89 11 0 0 99 100 100 89 100 98 11 100 100 99 96 43 11 75 1 89 22 96 100 0 96 100 88

Citro.freundii group 94 100 100 61 67 100 0 0 6 99 99 100 100 100 1 80 99 98 100 94 27 6 99 75 99 0 78 100 96 0 99 94

Citro.koseri 99 100 100 99 29 100 0 0 92 93 99 99 100 100 69 1 86 99 100 93 44 0 99 77 100 0 93 100 1 0 100 69
Com.testosteroni 0 0 0 0 0 0 65 95 0 100 100 24 0 0 0 0 0 0 0 90 56 99 10 24 0 1 47 1 90 97 6 95

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 157


Annexes ID 32 GN V3.2

mOBE

3OBU
PROP

pOBE
GLYG
MAN

VALT
MNT
NAG

MAL

MEL
RHA

PRO
ARA
GLU

SOR

5KG

2KG
SUB

FUC

CAP
ACE

ALA
SAC
INO

SER
LAT

SAL
RIB

HIS
ITA

CIT
Taxon

Cronobacter spp 93 100 98 90 99 100 0 0 10 95 97 97 100 100 94 100 25 25 99 0 1 0 98 1 0 0 0 99 1 0 96 99


Cup.pauculus 0 0 0 0 0 0 90 99 90 100 100 67 0 0 0 0 0 0 0 99 99 99 99 99 50 0 0 0 100 1 2 100
Delftia acidovorans 10 0 0 1 0 0 95 100 73 100 99 99 95 1 0 0 8 0 0 99 100 99 76 99 1 1 99 9 100 92 0 100
Edwardsiel.hoshinae 1 100 100 25 100 100 0 0 0 0 99 0 90 100 1 1 100 0 1 0 0 0 99 0 0 0 0 1 0 1 99 10
Edwardsiel.tarda 0 100 100 0 0 100 1 0 0 0 100 0 0 100 0 0 100 0 1 0 0 0 75 0 1 0 0 1 0 0 99 90
Eliz.meningosept. 0 80 0 0 0 99 0 0 0 25 0 0 93 100 1 50 25 10 8 25 0 10 20 0 0 14 0 0 0 0 1 99
Emp.brevis 0 0 0 0 0 100 0 0 0 75 0 1 0 75 0 0 0 1 0 25 0 1 1 0 0 90 0 1 0 0 75 90
Ent.aerogenes 100 100 100 97 99 100 5 0 75 90 100 100 90 100 100 100 100 100 100 10 10 10 100 100 0 1 99 97 97 97 100 100
Ent.amnigenus 99 99 99 1 75 100 0 0 25 95 92 99 100 100 100 97 5 30 99 0 0 0 99 60 2 1 0 100 0 0 99 76
Ent.cancerogenus 100 100 100 0 0 100 0 0 11 100 80 100 100 100 99 0 100 0 100 0 0 0 100 99 0 0 0 100 0 0 100 100
Ent.cloacae 88 100 100 32 97 100 0 0 70 93 100 100 99 100 74 85 60 91 98 0 9 0 99 96 2 1 1 99 11 2 100 98
Ent.gergoviae 100 100 100 99 99 99 6 15 90 100 100 90 100 100 100 100 60 44 100 73 80 0 83 92 100 7 48 100 86 100 100 100
Esch.coli 1 81 95 98 8 35 89 1 1 2 92 88 89 85 95 21 78 90 91 97 69 5 3 2 0 32 1 7 28 1 1 98 84
Esch.coli 2 11 81 38 1 1 46 0 0 0 23 34 11 70 84 3 42 38 46 86 0 0 0 0 0 0 11 3 3 0 0 11 5
Esch.fergusonii 99 100 100 0 0 100 0 0 0 100 97 98 100 100 95 0 0 0 100 98 70 10 5 0 0 0 0 100 0 95 100 100
Esch.hermannii 95 100 100 0 5 100 0 0 0 100 100 100 100 100 95 0 8 0 99 1 0 0 0 0 0 0 5 100 5 0 99 99
Esch.vulneris 99 100 100 0 11 100 0 1 50 93 100 100 100 100 99 100 0 0 100 0 1 0 0 0 3 0 0 100 0 0 97 97
Ewingella americana 9 100 100 0 0 100 0 0 0 25 0 99 100 100 99 0 67 95 0 0 0 0 100 99 100 0 0 100 0 1 95 100
Hafnia alvei 71 100 92 0 0 92 1 0 19 88 87 82 88 100 18 1 75 1 71 1 0 1 0 88 0 4 1 92 0 1 99 99
K.oxytoca 100 100 100 100 100 100 0 51 88 96 100 100 100 100 100 100 100 100 100 0 33 3 100 96 99 29 99 100 1 99 100 99
K.pneum.ozaenae 25 100 100 99 1 99 0 0 1 8 99 99 91 99 91 99 66 66 100 1 1 0 41 98 0 1 0 100 1 66 100 98
K.pneum.pneumoniae 99 100 100 99 100 100 1 40 93 100 100 97 100 100 99 100 92 100 100 9 54 1 98 98 11 15 1 98 88 92 100 98
K.pneum.rhinosclero. 92 100 100 99 99 100 0 0 0 0 100 91 100 91 100 83 33 100 99 0 0 0 26 66 0 0 0 91 0 0 100 97
Kluy.ascorbata 99 100 100 0 100 100 0 0 75 98 100 99 100 100 99 100 1 50 100 50 10 0 99 0 98 0 96 68 0 96 100 67
Kluy.cryocrescens 99 100 100 0 95 100 0 0 50 95 95 95 100 99 100 99 50 50 100 0 8 0 50 0 100 0 1 98 0 79 99 55
Kluy.intermedia 100 100 100 0 24 99 0 0 50 99 100 91 100 100 100 100 15 75 100 0 10 0 99 0 99 0 0 100 0 71 99 12

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 158


Annexes ID 32 GN V3.2

mOBE

3OBU
PROP

pOBE
GLYG
MAN

VALT
MNT
NAG

MAL

MEL
RHA

PRO
ARA
GLU

SOR

5KG

2KG
SUB

FUC

CAP
ACE

ALA
SAC
INO

SER
LAT

SAL
RIB

HIS
ITA

CIT
Taxon

Lecl.adecarboxylata 100 100 100 0 24 100 0 0 50 96 100 99 100 100 100 99 0 10 100 1 0 1 0 88 1 17 0 100 1 0 99 100
M.lacunata 0 0 0 0 1 0 0 1 1 37 30 12 0 0 0 0 6 25 1 1 1 6 12 31 0 0 1 6 0 6 25 68
M.osloensis 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 67 0 1 0 0 0 0 0 99 53 93 0 0 0 0 0 0 99 0 77 1
Methylo.mesophilicum 0 1 0 0 0 0 0 10 50 5 100 0 0 10 0 0 0 0 25 0 0 1 1 0 0 0 0 0 100 0 5 1
Moell.wisconsensis 5 100 100 0 100 2 0 1 1 5 100 1 90 100 2 100 0 5 5 1 1 1 100 5 2 0 0 25 0 0 100 100
Morg.morganii 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 99 99 0 100 0 0 0 0 0 99 0 0 12 0 0 0 0 5 0 0 100 99
Myroides spp 0 0 0 0 1 30 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 0 2 0 1 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 2 98
Ochrobac.anthropi 100 100 100 100 100 100 0 0 0 100 100 100 89 100 7 0 100 23 100 89 100 67 99 99 83 0 0 100 73 99 100 100
Oligella spp 0 0 0 0 0 5 78 0 0 68 84 99 0 0 0 0 0 0 0 42 0 78 68 0 0 0 5 0 89 21 0 89
Pantoea spp 1 91 99 100 90 86 99 0 0 3 51 79 82 100 100 75 30 24 30 99 0 0 0 73 82 48 0 0 98 0 0 89 98
Pantoea spp 2 100 100 100 0 46 100 0 0 46 92 92 100 92 100 100 99 8 69 100 0 0 0 46 84 7 7 0 100 15 7 100 100
Plesio.shigelloides 1 99 100 100 0 100 0 0 0 8 0 0 0 100 0 14 57 1 0 0 64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 50
Proteus mirabilis 0 99 85 0 25 2 0 0 0 90 85 99 0 85 1 1 0 0 0 0 0 1 90 13 0 0 1 0 0 1 100 99
Proteus penneri 5 100 99 5 100 100 0 0 0 95 95 95 5 95 0 5 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 95
Proteus vulgaris gr. 0 100 95 1 99 95 1 0 0 90 90 90 1 99 60 1 1 1 0 0 1 1 30 1 1 0 1 1 0 0 99 99
Prov.alcalifaciens 0 100 100 0 5 0 0 0 0 100 0 55 0 100 0 0 0 0 0 0 33 0 100 100 0 0 0 0 0 0 85 96
Prov.rettgeri 56 100 100 100 11 0 0 0 0 89 1 86 99 99 44 0 0 0 0 0 75 0 99 99 0 0 0 78 0 0 99 100
Prov.rustigianii 0 100 100 0 6 0 0 0 0 100 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 100 93 0 0 0 0 0 0 100 100
Prov.stuartii 3 99 94 89 26 10 0 0 0 91 6 92 6 91 12 12 6 3 3 13 55 13 89 88 0 3 6 6 3 6 96 99
Ps.aeruginosa 1 5 95 50 1 0 1 90 20 94 99 100 99 85 95 1 1 1 0 0 95 99 99 95 95 0 1 1 95 94 90 50 99
Ps.aeruginosa 2 0 27 18 0 0 0 90 0 45 45 72 90 18 81 0 0 0 0 9 9 63 45 81 27 9 0 9 54 36 36 1 90
Ps.alcaligenes 0 0 0 0 0 10 70 20 0 100 100 99 0 0 0 0 0 0 1 98 99 94 75 50 0 10 1 0 78 5 70 100
Ps.fluorescens 1 6 99 85 1 7 0 1 11 64 100 100 100 99 100 0 0 0 0 28 99 100 100 100 85 0 0 0 97 99 99 85 100
Ps.fluorescens 2 6 81 99 72 72 0 99 11 72 100 99 100 100 100 0 0 27 36 90 98 100 98 90 100 81 0 9 97 99 99 99 100
Ps.luteola 90 0 99 100 0 95 1 0 25 40 95 90 95 100 50 1 99 0 100 50 90 10 75 0 0 0 0 100 40 66 100 100
Ps.mendocina 0 5 0 0 0 1 90 5 89 99 90 100 1 90 0 0 0 0 0 90 95 100 90 100 0 5 5 5 90 5 100 100

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 159


Annexes ID 32 GN V3.2

mOBE

3OBU
PROP

pOBE
GLYG
MAN

VALT
MNT
NAG

MAL

MEL
RHA

PRO
ARA
GLU

SOR

5KG

2KG
SUB

FUC

CAP
ACE

ALA
SAC
INO

SER
LAT

SAL
RIB

HIS
ITA

CIT
Taxon

Ps.oryzihabitans 85 10 90 90 20 90 5 9 25 99 100 90 81 90 0 10 25 90 90 10 85 18 81 80 10 1 0 90 90 90 90 90
Ps.putida 1 2 73 6 2 2 14 0 56 98 100 96 15 100 1 1 0 10 53 98 96 99 96 96 0 1 2 76 90 86 80 100
Ps.stutzeri 5 5 0 0 5 70 76 15 85 99 90 100 76 90 0 0 0 0 1 48 76 95 90 22 0 76 10 4 90 25 50 99
Rahnella aquatilis 100 100 95 0 100 100 0 0 26 74 74 90 100 100 96 99 97 97 100 0 0 0 96 56 97 0 0 100 0 1 94 99
Ralst.pickettii 0 25 0 0 0 0 10 90 85 100 100 99 1 99 0 0 1 0 95 90 90 90 99 80 0 0 0 90 99 80 10 100
Raoultella spp 100 100 100 100 100 100 0 18 99 100 97 100 99 100 97 100 98 100 100 0 62 2 100 97 99 30 30 99 97 98 100 97
Rzb.radiobacter 100 100 100 99 100 100 0 0 0 99 90 99 100 100 100 99 100 99 100 90 25 25 0 99 25 5 0 100 75 99 80 100
S.putrefaciens gr. 0 97 5 0 0 0 0 0 0 99 100 86 0 0 0 0 0 0 14 99 99 100 0 10 0 0 0 0 75 0 99 30
Salm.Paratyphi A 100 100 100 0 0 100 0 0 1 80 100 1 100 100 0 100 99 92 99 75 0 1 75 0 73 9 100 38 0 0 100 99
Salm.Typhi 0 100 100 0 0 100 0 10 0 0 100 89 100 100 0 90 0 99 1 90 0 11 99 0 1 1 80 95 0 0 98 97
Salm.enter.arizonae 94 100 94 33 6 94 35 0 83 100 94 100 94 100 11 72 94 99 94 99 1 6 94 25 18 6 18 1 1 0 100 99
Salm.enter.enterica 98 99 100 0 0 100 0 0 0 99 100 99 100 100 0 100 100 100 1 33 0 0 99 14 75 0 99 14 0 0 100 99
Salmonella spp 90 100 99 50 1 99 7 1 0 99 99 96 99 100 3 95 99 99 100 90 26 1 99 50 50 1 99 10 0 1 100 95
Ser.fonticola 89 100 100 98 34 100 0 9 90 95 79 98 100 100 100 100 15 96 100 0 50 3 89 95 6 0 2 100 0 14 95 77
Ser.liquef./plymuth. 27 100 100 99 99 99 0 5 1 96 98 99 100 100 99 98 96 83 98 0 97 1 99 99 98 3 1 100 3 18 98 100
Ser.marcescens 22 100 100 90 83 100 17 0 0 90 99 96 90 86 99 33 90 93 22 13 75 20 83 91 82 17 57 90 73 57 99 99
Ser.odorifera 99 100 100 100 55 91 9 0 0 86 99 99 91 99 90 100 99 100 92 9 60 9 91 99 1 1 9 91 30 9 100 98
Ser.rubidaea 0 100 99 98 98 100 0 0 17 93 100 100 100 100 98 98 83 0 99 0 83 0 100 98 0 0 0 98 0 0 96 96
Shigella sonnei 63 100 100 0 1 95 0 0 0 0 94 0 100 100 0 1 79 0 100 0 0 0 0 0 39 0 0 1 0 0 99 83
Shigella spp 5 94 52 7 5 40 0 0 0 22 90 32 58 98 5 40 14 40 58 5 0 0 0 0 0 0 0 13 0 1 57 28
Sphingo.multivorum 50 99 0 0 99 100 0 0 0 0 0 0 0 100 100 99 1 0 99 0 0 0 0 1 0 90 0 0 0 0 0 75
Sphingo.spiritivorum 99 100 0 0 99 100 0 0 0 0 0 0 1 100 100 100 0 0 10 0 0 0 0 1 10 0 0 0 0 0 0 10
Sphmon.paucimobilis 22 72 1 0 95 100 1 15 0 21 39 21 6 100 77 68 32 1 74 10 0 0 27 2 0 1 0 1 50 27 1 72
Steno.maltophilia 1 0 97 0 0 15 92 0 0 23 82 94 6 0 43 12 10 0 0 0 30 0 2 87 0 0 0 0 0 0 0 0 74
Steno.maltophilia 2 0 96 0 0 75 100 0 0 68 100 93 84 0 90 75 81 1 1 1 96 21 65 87 53 0 1 0 0 0 0 9 99
V.alginolyticus 1 99 99 0 90 90 0 0 0 25 90 75 91 100 0 0 0 1 1 0 0 0 10 100 0 82 0 0 0 0 94 95

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 160


Annexes ID 32 GN V3.2

mOBE

3OBU
PROP

pOBE
GLYG
MAN

VALT
MNT
NAG

MAL

MEL
RHA

PRO
ARA
GLU

SOR

5KG

2KG
SUB

FUC

CAP
ACE

ALA
SAC
INO

SER
LAT

SAL
RIB

HIS
ITA

CIT
Taxon

V.cholerae 0 68 77 0 86 100 0 0 0 60 75 7 80 99 0 0 0 0 0 0 0 1 98 99 0 98 0 0 0 0 98 100


V.parahaemolyticus 10 99 99 0 0 86 0 18 0 80 100 71 100 100 10 5 1 1 75 0 0 0 25 99 0 90 0 1 0 0 100 100
V.vulnificus 0 100 99 0 0 100 0 0 0 10 99 99 64 99 1 0 10 0 1 0 0 0 91 50 0 99 0 0 0 0 82 99
Xantho.campestris 0 99 0 0 100 40 0 0 30 35 10 1 5 75 0 25 55 0 15 1 0 0 60 0 0 35 0 0 0 1 1 35
Y.aldovae 50 100 100 100 0 0 0 0 0 90 0 99 100 100 0 0 50 100 100 0 0 0 99 25 0 0 0 1 0 0 99 100
Y.enterocolitica 1 100 99 95 98 92 0 0 0 25 0 50 99 99 25 1 19 100 97 0 1 0 1 56 50 0 0 25 1 1 92 25
Y.frederiksenii 99 100 100 99 100 100 0 0 0 99 0 99 100 100 100 0 100 100 100 0 0 0 95 95 95 0 0 50 0 0 100 99
Y.intermedia 99 100 100 100 100 100 0 0 0 99 0 99 100 100 100 100 90 100 100 0 1 0 99 90 99 0 0 25 0 0 99 99
Y.kristensenii 1 100 99 99 5 100 0 0 0 80 50 90 100 100 50 5 50 100 100 1 1 1 1 5 80 0 0 25 0 5 99 50
Y.pseudotuberculosis 90 95 99 10 0 95 0 0 0 95 98 25 95 95 75 84 0 0 95 0 0 0 10 25 1 0 0 50 0 5 99 99
Y.ruckeri 0 100 69 0 0 95 0 0 0 71 95 50 100 100 0 0 0 1 0 0 0 0 14 0 0 0 2 0 1 0 98 71

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 161


Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires
Supplementary Test Abbreviations
Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

αFUC αFUC αFUC α-岩藻糖 αFUC αFUC αFUC αFUC αFUC


αGAL αGAL αGAL α-半乳酸苷酶 αGAL αGAL αGAL αGAL αGAL
αMAL αMAL αMAL α-麦芽糖 αMAL αMAL αMAL αMAL αMAL
ßGAL ßGAL ßGAL β-半乳糖苷酶 ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL
ßGLU ßGLU ßGLU β-葡萄糖苷酶 ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU
ßGP ßGP ßGP β 半乳糖苷 6 磷酸酶 ßGP ßGP ßGP ßGP ßGP
ßGUR ßGUR ßGUR β 葡萄糖醛酸酶 ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR
α-HEM α-HEM α-HEMOLYSE α-溶血 α-HEM α-HÄMOLYSE α-HEMOLYSE α-HEM α-EMOLISI
ß-HEM ß-HEM B-HEM β-溶血 ß-HEM B-HEM B-HEM ß-HEM ß-EMOLISI
ßMAN ßMAN ßMAN β-甘露醇 ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN
0/129 R 0/129 R O/129 R 耐 0/129 0/129 R O/129 R O/129 R 0/129 R O/129 R
10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 生长 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C
15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 生长 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C
25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 生长 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C
30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 生长 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C
37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 生长 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C
40 % BILE 40 % BILE 40 % BILE 40 %胆汁长 40 % BILE 40 % GALLE 40 % BILE 40 % BILE 40 % BILE
40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 生长 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C
42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 生长 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C
44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 生长 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 162


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 生长 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C
5KG 5KG 5KG 5 酮基葡糖酸盐 5KG 5KG 5KG 5KG 5KG
ACTIDION.R ACTIDION.R ACTIDIONE 耐放线菌酮 ACTIDION.R ACTIDION ACTIDIONE ACTIDION.R ACTIDIONE
ADH ADH ADH 精氨酸双水解酶 ADH ADH ADH ADH ADH
ADONITOL ADONITOL ADONITOLac 侧金盏花醇 ADONITOL ADONITOLac ADONITOL ADONITOL ADONITOLac
ADONITOLa ADONITOLa ADONITOLas 侧金盏花醇同化 ADONITOLa ADONITOLas ADONITOLas ADONITOLa ADONITOLas
AEROBIC Gr AEROBIC Gr AEROBIE 有氧环境生长 AEROBIC Gr AER.WACHSTUM AER.GROWTH AEROBIC Gr CRESCITA AER.
AGAR 35 °C AGAR 35"C AGAR 35 °C 琼脂 35 °C AGAR 35"C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35"C AGAR 35 °C
ANA+TMAO ANA+TMAO ANA.+TMAO 厌氧+三甲胺-N 氧化物中生长 ANA+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA+TMAO ANA.+TMAO
ANAEROB.Gr ANAEROB.Gr ANAEROBIE 厌氧环境生长 ANAEROB.Gr ANA.WACHSTUM ANA.GROWTH ANAEROB.Gr ANAEROB.
ARAac 阿拉伯糖 ARAac ARAac ARAac
lARABINOSE lARABINOSE lARABINOSE lARABINOSE
LARAac L-阿拉伯糖 LARAac LARAac LARAac
dARABITOL dARABITOL DARLac D-阿拉伯醇 dARABITOL DARLac DARLac dARABITOL DARLac
ARBUTINa ARBUTINa ARBas 杨梅酸同化 ARBUTINa ARBas ARBas ARBUTINa ARBas
ARBUTIN ARBUTIN ARBUTIN.ac 杨梅酸 ARBUTIN ARBUTIN.ac ARBUTIN ARBUTIN ARBUTIN.ac
ArgA ArgA ArgA 精氨酸芳胺酶 ArgA ArgA ArgA ArgA ArgA
ARTS ARTS ART 分生孢子 ARTS ART ART ARTS ART
ASCORBATE ASCORBATE ASCORB.ac 抗坏血酸盐 ASCORBATE ASCORB.ac ASCORB.ac ASCORBATE ASCORB.ac
AspA AspA AspA L 天冬氨酸芳胺酶 AspA AspA AspA AspA AspA
lASNa lASNa LASPas 天冬酰胺酸同化 lASNa LASPas LASPas lASNa LASPas
CADAVER.a CADAVER.a CADAVER.as 尸胺同化 CADAVER.a CADAVER.as CADAVER.as CADAVER.a CADAVER.as
CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) 金葡 CAMP 试验 CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au)

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 163


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

CASEINhyd. CASEINhyd. CASEINhyd 酪蛋白水解 CASEINhyd. CASEINhyd CASEINhyd CASEINhyd. CASEINAidr


CATALASE CATALASE CATALASE 触酶 CATALASE KATALASE CATALASE CATALASE CATALASI
CDEX CDEX CDEX 环氏糊精 CDEX CDEX CDEX CDEX CDEX
dCELLOBIO. dCELLOBIO. CELac d-纤维二糖 dCELLOBIO. CELac dCELLOBIO. dCELLOBIO. CELac
CFTR R CFTR R CFTR 头孢噻吩耐药 CFTR R CFTR CFTR CFTR R CFTR
FORMAGGIO
CHEESE SM. CHEESE SM. OD.FROMAGE 奶酪味 CHEESE SM. CHEESE SM. CHEESE SM. CHEESE SM.
SM.
CHLS CHLS CHL 厚壁孢子 CHLS CHL CHL CHLS CHL
CITRATE CITRATE CITRATE 柠檬酸盐利用 CITRATE CITRAT CITRATE CITRATE CITRATO
CITRATEa CITRATEa CITRATEas 柠檬酸盐同化 CITRATEa CITRATEas CITRATEas CITRATEa CITRATOas
COAGULASE COAGULASE COAGULASE 凝固酶 COAGULASE KOAGULASE COAGULASE COAGULASE COAGULASI
COCCI COCCI COCCI 球菌 COCCI KOKKEN COCCI COCCI COCCHI
COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm 菌落>1mm COL.>1mm KOL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm
COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm 菌落>5mm COL.>5mm KOL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm
DEXTRAN DEXTRAN DEXTRANE 右旋糖苷产生 DEXTRAN DEXTRANE DEXTRANE DEXTRAN DESTRANO
DNAse DNAse DNAse 脱氧核糖核酸酶 DNAse DNAse DNAse DNAse DNAsi
DNAse H.ST DNAse H.ST DNAse Th 热稳定脱氧核糖核酸酶 DNAse H.ST DNAse Th DNAse Th DNAse H.ST DNAsi Th
DULCITOL DULCITOL DULCITOLac 卫矛醇 DULCITOL DULCITOLac DULCITOLac DULCITOL DULCITOLac
ERYTHRITa ERYTHRITa ERYas 赤癣糖同化 ERYTHRITa ERYas ERYas ERYTHRITa ERYas
ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (HYD.) 七叶灵(水解) ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (IDR.)
dFRUCTOSE dFRUCTOSE FRUCTOSEac d-果糖 dFRUCTOSE FRUCTOSEac dFRUCTOSE dFRUCTOSE FRUTTOSIOac
dFRUCTOSEa dFRUCTOSEa FRUCTOSEas d-果糖同化 dFRUCTOSEa FRUCTOSEas FRUCTOSEas dFRUCTOSEa FRUTTOSIOas
dGALACTOSE dGALACTOSE GALac d-半乳糖 dGALACTOSE GALac GALac dGALACTOSE GALac A

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 164


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

GDC GDC GDC 谷氨酸脱羧酶 GDC GDC GDC GDC GDC


GELATINE GELATINE GELATINASE 明胶 GELATINE GELATINASE GELATINASE GELATINE GELATINASI
GGA GGA GGA 谷氨酰谷氨酸芳胺酶 GGA GGA GGA GGA GGA
GLN GLN GLN 氨基葡萄糖 GLN GLN GLN GLN GLN
dGLUCOSE dGLUCOSE GLUCOSEac d-葡萄糖 dGLUCOSE GLUCOSEac GLUCOSEac dGLUCOSE GLUCOSOac
dGLUCOSEa dGLUCOSEa GLUCOSEas d-葡萄糖同化 dGLUCOSEa GLUCOSEas dGLUCOSEa dGLUCOSEa GLUCOSIOas
GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSEac 葡萄糖产酸 GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSIOac
GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSEg 葡糖发酵产气 GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSIOg
GlyA GlyA GlyA 甘氨酸芳胺酶 GlyA GlyA GlyA GlyA GlyA
GLYCEROL GLYCEROL GLYCEROLac 甘油 GLYCEROL GLYCEROLac GLYCEROL GLYCEROL GLICEROLac
GLYCINE 1 % GLYCINE 1 % GLYCINE 1 % 1 %甘氨酸生长 GLYCINE 1 % GLYZIN 1 % GLYCINE 1 % GLYCINE 1 % GLICINA 1 %
GLYCOGEN GLYCOGEN GLYGac 糖原 GLYCOGEN GLYGOGENac GLYGOGENac GLYCOGEN GLICOGENac
GMB GMB GMB GMB(葡萄糖-矿物质-盐-维生素)生长 GMB GMB GMB GMB GMB
GRAM GRAM GRAM 革兰氏 GRAM GRAM GRAM GRAM GRAM
GRT GRT GRTas 葡萄糖醛酸 GRT GRTas GRTas GRT GRTas
H2S H2S H2S 硫化氢产生 H2S H2S H2S H2S H2S
HAFNIA Ph HAFNIA Ph Ph.HAFNIA HAFNIAPh HAFNIA Ph Ph.HAFNIA HAFNIA Ph HAFNIA Ph Ph.HAFNIA
HEMOLYSIS HEMOLYSIS HEM 溶血 HEMOLYSIS HAEM HAEMOLYSIS HEMOLYSIS EMOLISI
HIPPURATE HIPPURATE HIPPURATE 马尿酸盐 HIPPURATE HIPPURATE HIPPURATE HIPPURATE IPPURATO
HisA HisA HisA 组氨酸芳胺酶 HisA HisA HisA HisA HisA
HYPH/PH HYPH/PH HYPH/PH 真假菌丝形成 HYPH/PH HYPH/PH HYPH/PH HYPH/PH IFE/P-I
IDP IDP IDP 磷酸吲哚吩 IDP IDP IDP IDP IDP

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 165


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN
肌醇
INDOLE INDOLE IND INDOLE IND IND INDOLE IND
吲哚
INOSITOL INOSITOL INO 肌醇 INOSITOL INO INO INOSITOL INO
INULIN INULIN INU 菊糖 INULIN INU INULIN INULIN INU
dlLACTATEa dlLACTATEa LACTATEas DL-乳酸盐同化 dlLACTATEa LACTATas LACTATEas dlLACTATEa DILATTATOas
LACTOSE LACTOSE LACTOSEac 乳糖 LACTOSE LACTOSEac LACTOSEac LACTOSE LATTOSIOac
LDC LDC LDC 赖氨酸脱羧酶 LDC LDC LDC LDC LDC
LECITHIN. LECITHIN. LECITHIN. 卵磷脂酶 LECITHIN. LECITHIN. LECITHIN. LECITHIN. LECITINA
LeuA LeuA LeuA 亮氨酸芳胺酶 LeuA LeuA LeuA LeuA LeuA
LEVAN LEVAN LEVANE 果聚糖 LEVAN LEVANE LEVANE LEVAN LEVANO
LIPASE LIPASE LIPASE 脂酶 LIPASE LIPASE LIPASE LIPASE LIPASI
LIPOPHILY LIPOPHILY LIPOPHILIE 脂溶性 LIPOPHILY LIPOPHILIE LIPOPHILY LIPOPHILY LIPOFILIA
LSTR R LSTR R LSTR 耐溶葡萄球菌素 LSTR R LSTR LSTR LSTR R LSTR
lLYSINEa lLYSINEa LYSINEas 赖氨酸同化 lLYSINEa LYSINas LYSINEas lLYSINEa LISINAas
LYSOZYME R LYSOZYME R LYSOZYME R 耐溶菌酶 LYSOZYME R LYSOZYME R LYSOZYME R LYSOZYME R LISOZIMA R
MßDG MßDG MßDGac 甲基-β-D 葡萄糖吡喃苷 MßDG MßDGac MßDGac MßDG MßDGac
MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY 麦凯康上生长 MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY
MALONATE MALONATE MALONATE 丙二酸盐 MALONATE MALONATE MALONATE MALONATE MALONATO
dMALTOSE dMALTOSE MALTOSEac d-麦芽糖 dMALTOSE MALTOSEac dMALTOSE dMALTOSE MALTOSIOac
dMANNOSEa dMANNOSEa DMANNOSEas d-甘露糖同化 dMANNOSEa DMANNOSEas DMANNOSEas dMANNOSEa DMANNOSIOas
dMANNITOL dMANNITOL MANNITOLac d-甘露醇 dMANNITOL MANNITOLac MANNITOLac dMANNITOL MANNITOLac
dMANNITOLa dMANNITOLa MANNITOLas d-甘露醇同化 dMANNITOLa MANNITOLas MANNITOLas dMANNITOLa MANNITOLOas
dMANNOSE dMANNOSE MANNOSEac d-甘露糖 dMANNOSE MANNOSEac MANNOSEac dMANNOSE MANNOSIOac
MDG MDG MDGac 甲基-D-葡萄糖苷 MDG MDGac MDGac MDG MDGac

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 166


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

dMELa dMELa MELas d-蜜二糖同化 dMELa MELas MELas dMELa MELas


dMELIBIOSE dMELIBIOSE MELIBIOSE d-蜜二糖 dMELIBIOSE MELIBIOSE MELIBIOSE dMELIBIOSE MELIBIOSIO
METHYL RED METHYL RED RM 甲基红试验 METHYL RED RM/MR METHYL RED METHYL RED RM
MILK(A) MILK(A) LAIT(A) 牛奶(产酸) MILK(A) MILCH(A) MILK(A) MILK(A) LATTE(A)
MILK(C) MILK(C) LAIT (C) 牛奶(凝固) MILK(C) MILCH(C) MILK(C) MILK(C) LATTE(C)
MILK(D) MILK(D) LAIT (D) 牛奶(消化) MILK(D) MILCH(D) MILK(D) MILK(D) LATTE(D)
dMLZ dMLZ MLZac d-松三糖 dMLZ MLZac MLZac dMLZ MLZac
dMLZa dMLZa MLZas d-松三糖同化 dMLZa MLZas MLZas dMLZa MLZas
MOTILITY MOTILITY MOB 动力 MOTILITY MOT MOTILITY MOTILITY MOB
MYCELIUM MYCELIUM MYCELIUM 肉眼见菌丝体 MYCELIUM MYCELIUM MYCELIUM MYCELIUM MICELIO
NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % 0 % NaCl 长 NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 %
NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % 1.5 % NaCl 长 NaCl 1.5 % NaCl 1,5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 %
NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % 10 % NaCl 长 NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 %
NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % 3.5 % NaCl 长 NaCl 3.5 % NaCl 3,5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 %
NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % 4 %NaCl 生长 NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 %
NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % 6 % NaCl 长 NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 %
NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % 6.5 %NaCl 长 NaCl 6.5 % NaCl 6,5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 %
NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % 7.5 % NaCl 长 NaCl 7.5 % NaCl 7,5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 %
NAGa NAGa NAGas N-乙酰葡萄糖胺同化 NAGa NAGas NAGa NAGa NAGas
NITRATEa NITRATEa NITRATEas 硝酸盐同化 NITRATEa NITRATas NITRATEas NITRATEa NITRATOas
NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2
NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2
NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 167


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

NO3 (RED.) NO3 (RED.) NO3(RED.) 硝酸盐还原 NO3 (RED.) NO3(RED.) NO3(RED.) NO3 (RED.) NO3(RID.)
NOVO R NOVO R NOVO R 新生霉素耐受 NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R
ODC ODC ODC 鸟氨酸脱羧酶 ODC ODC ODC ODC ODC
OF/F OF/F OF/F 葡萄糖发酵 OF/F OF/F OF/F OF/F OF/F
OF/O OF/O OF/O 葡萄糖氧化 OF/O OF/O OF/O OF/O OF/O
ONPG ONPG ONPG β-半乳糖苷酶 ONPG ONPG ONPG ONPG ONPG
OPTOCHIN R OPTOCHIN R OPTOCHIN.R 耐奥普托欣 OPTOCHIN R OPTOCHIN.R OPTOCHIN.R OPTOCHIN R OPTOCHIN.R
OXIDASE OXIDASE OX 氧化酶 OXIDASE OXIDASE OXIDASE OXIDASE OSSIDASI
PACa PACa PACas 苯乙酸盐同化 PACa PACas PACa PACa PACas
PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSE 古老糖 PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSIO
pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 PH=5.4 长 pH 5.4 pH 5,4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4
pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH=9.6 长 pH 9.6 pH 9,6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6
PHEa PHEa Phe.as 苯丙氨酸同化 PHEa Phe.as Phe.as PHEa Phe.as
PINK PINK ROSE 粉红色色素 PINK PINK PINK PINK ROSA
POLYSACCH. POLYSACCH. POLYSACCH. 多聚糖产生 POLYSACCH. POLYSACCH. POLYSACCH. POLYSACCH. POLISACC.
ProA ProA ProA 脯氨酸芳胺酶 ProA ProA ProA ProA ProA
PYGBILE PYGBILE PYG+BILE 胆汁培养基长 PYGBILE PYG+GALLE PYG+BILE PYGBILE PYG+BILE
dRAFa dRAFa RAFas d-棉籽糖同化 dRAFa RAFas RAFas dRAFa RAFas
dRAFFINOSE dRAFFINOSE RAFac d-棉籽糖 dRAFFINOSE RAFac RAFac dRAFFINOSE RAFac
RED RED ROUGE 红色 RED RED RED RED ROSSO
lRHAMNOSE lRHAMNOSE RHAMNOSEac L-鼠李糖 lRHAMNOSE RHAMNOSEac lRHAMNOSE lRHAMNOSE RAMNOSIOac
lRHAMNOSEa lRHAMNOSEa RHAMNOSEas L-鼠李糖同化 lRHAMNOSEa RHAMNOSEas RHAMNOSEas lRHAMNOSEa RAMNOSIOas

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 168


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

dRIBOSE dRIBOSE RIBOSEac d-核糖 dRIBOSE RIBOSEac RIBOSEac dRIBOSE RIBOSIOac


dRIBOSEa dRIBOSEa RIBOSEas d-核糖同化 dRIBOSEa RIBOSEas RIBOSEas dRIBOSEa RIBOSIOas
SALICIN SALICIN SALICIN.ac 水杨素 SALICIN SALICIN.ac SALICIN SALICIN SALICIN.ac
SerA SerA SerA 丝氨酸芳胺酶 SerA SerA SerA SerA SerA
dSORBITOL dSORBITOL SORBITOLac d-山梨醇 dSORBITOL SORBITOLac SORBITOLac dSORBITOL SORBITOLac
dSORBITOLa dSORBITOLa SORBITOLas d-山梨醇同化 dSORBITOLa SORBITOLas dSORBITOLa dSORBITOLa SORBITOLOas
lSORBOSE lSORBOSE SORBOSEac 山梨糖 lSORBOSE SORBOSEac SORBOSEac lSORBOSE SORBOSOac
lSORBOSEa lSORBOSEa SORBOSEas L-山梨糖同化 lSORBOSEa SORBOSEas lSORBOSEa lSORBOSEa SORBOSIOas
SPORE SPORE SPORE 芽孢 SPORE SPOREN SPORE SPORE SPORE
SPORE ST SPORE ST SPORE ST 次极端 芽孢 SPORE ST SPOREN ST SPORE ST SPORE ST SPORE ST
SPORE T SPORE T SPORE T 末端芽孢 SPORE T SPOREN T SPORE T SPORE T SPORE T
STAR.(HYD) STAR.(HYD) AMD 淀粉水解 STAR.(HYD) STAR.(HYD) STAR.(HYD) STAR.(HYD) AMIDO(IDR)
SUCROSE SUCROSE SACCHAROSE 蔗糖 SUCROSE SUCROSEac SUCROSE SUCROSE SACCAROSIOac
SUCROSEa SUCROSEa SACas 蔗糖同化 SUCROSEa SACas SUCROSEa SUCROSEa SACas
dTAGATOSE dTAGATOSE TAGac d-塔格糖 dTAGATOSE TAGac TAGac dTAGATOSE TAGac
TDA TDA TDA 色氨酸脱氨酶 TDA TDA TDA TDA TDA
THIAMIN THIAMIN THIAMINE 无 B1 时生长 THIAMIN THIAMIN THIAMINE THIAMIN TIAMINA
dTREHALOSE dTREHALOSE TREac d-海藻糖 dTREHALOSE TREac dTREHALOSE dTREHALOSE TREac
dTURANOSE dTURANOSE TURANOSEac d-羽红糖 dTURANOSE TURANOSEac dTURANOSE dTURANOSE TURANOSIOac
Tween 80 Tween 80 Tween 80 吐温 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80
URE URE URE 尿素酶 URE URE URE URE URE
V FACTOR V FACTOR FACT.V 需要 V 因子 V FACTOR V FAKTOR V FACTOR V FACTOR FATTORE V
VITAMIN VITAMIN VITAMINE 无维生素时长 VITAMIN VITAMIN VITAMIN VITAMIN VITAMINA
VP VP VP VP 试验 VP VP VP VP VP

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 169


Annexes Annexe D-1 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure ENGLISH FRENCH CHINESE DANISH GERMAN GREEK HUNGARIAN ITALIAN

X FACTOR X FACTOR FACT.X 需要 X 因子 X FACTOR X FAKTOR X FACTOR X FACTOR FATTORE X


dXYLOSE dLYXOSE LYX d 戊醛糖 dLYXOSE LYX LYX dLYXOSE LYX
YELLOW YELLOW JAUNE 黄色素 YELLOW GELB YELLOW YELLOW GIALLO

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 170


Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires
Supplementary Test Abbreviations
Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
αFUC αFUC αFUC αFUC αFUC αFUC αFUC αFUC
αGAL αGAL αGAL αGAL αGAL αGAL αGAL αGAL
αMAL αMAL αMAL αMAL αMAL αMAL αMAL αMAL
ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL ßGAL
ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU ßGLU
ßGP ßGP ßGP ßGP ßGP ßGP ßGP ßGP
ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR ßGUR
α-HEM α-HEMOLYSE α-HEMOLYSE α-HEMOLIZA α-HEMÓLISE α-HEM α-HEMOLYSE α-HEMOLYS
ß-HEM ß-HEM B-HEM ß-HEM B-HEM B-HEM B-HEM B-HEM
ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN ßMAN
0/129 R O/129 R O/129 R O/129 R O/129 R O/129 R O/129 R O/129 R
10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C 10 °C
15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C 15 °C
25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C 25 °C
30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C 30 °C
37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C 37 °C
40 % BILE 40 % BILE 40 % BILE 40 % ŻÓŁĆ 40 % BILES 40 % BILE 40 % BILE 40 % GALLA
40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C 40 °C
42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C 42 °C
44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C 44 °C
45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C 45 °C
5KG 5KG 5KG 5KG 5KG 5KG 5KG 5KG
ACTIDION.R ACTIDION.R ACTIDIONE AKTYDION ACTIDIONA ACTIDION.R ACTIDIONA ACTIDION

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 171


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
ADH ADH ADH ADH ADH ADH ADH ADH
ADONITOL ADONITOL ADONITOLac ADONITOL zakw. ADONITOLac ADONITOL ADONITOLac ADONITOLac
ADONITOLa ADONITOLas ADONITOLas ADONITOL asym. ADONITOLas ADONITOLas ADONITOLas ADONITOLas
AEROBIC Gr AER.GROWTH AER.GROWTH WZROST TLEN. AERÓBIO AER.GROWTH AER.CREC. AER.TILLVÄXT
AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C AGAR 35 °C
ANA+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO ANA.+TMAO
ANAEROB.Gr ANA.GROWTH ANA.GROWTH WZROST BEZTLEN. ANAERÓBIO ANA.GROWTH ANA.CREC. ANA.TILLVÄXT
ARAac ARAac ARA zakw. ARAac ARAac ARAac ARAac
lARABINOSE
LARAac LARAac L-ARA zakw. LARAac LARAac LARAac LARAac
dARABITOL DARLac DARLac D-ARABITOL zakw. DARLac DARLac DARLac DARLac
ARBUTINa ARBas ARBas ARB asym. ARBas ARBas ARBas ARBas
ARBUTIN ARBUTIN ARBUTIN.ac ARBUTYNA zakw. ARBUTIN.ac ARBUTIN ARBUTINA.ac ARBUTIN.ac
ArgA ArgA ArgA ArgA ArgA ArgA ArgA ArgA
ARTS ARTS ART ART ART ARTS ART ART
ASCORBATE ASCORB.ac ASCORB.ac KW.ASKORB.zakw. ASCORB.ac ASCORB.ac ASCORB.ac ASKORB.ac
AspA AspA AspA AspA AspA AspA AspA AspA
lASNa LASPas LASPas LASP asym. LASPas LASPas LASPas LASPas
CADAVER.a CADAVER.as CADAVER.as CADAWER.asym. CADAVER.as CADAVER.as CADAVER.as KADAVER.as
CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au) CAMP(S.au)
CASEINhyd. CASEINhyd. CASEINhyd KAZEINA hydrol. CASEINhid CASEINhyd CASEINAhyd KASEINhyd
CATALASE CATALASE CATALASE KATALAZA CATALASE CATALASE CATALASA KATALAS
CDEX CDEX CDEX CDEX CDEX CDEX CDEX CDEX
dCELLOBIO. dCELLOBIO. CELac CEL zakw. CELac dCELLOBIO. CELac CELac
CFTR R CFTR CFTR CFTR CFTR CFTR CFTR CFTR
CHEESE SM. CHEESE SM. CHEESE SM. ZAPACH SERA OD.QUEIJO CHEESE SM. OLOR QUESO CHEESE SM.

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 172


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
CHLS CHL CHL CHL CHL CHL CHL CHL
CITRATE CITRATE CITRATE CYTRYNIAN CITRATO CITRATE CITRATO CITRAT
CITRATEa CITRATEas CITRATEas CYTRYNIAN zakw. CITRATOas CITRATEas CITRATOas CITRATas
COAGULASE COAGULASE COAGULASE KOAGULAZA COAGULASE COAGULASE COAGULASA KOAGULAS
COCCI COCCI COCCI ZIARNIAKI COCOS COCCI COCOS COCCI
COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm COL.>1mm KOL.>1mm
COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm COL.>5mm
DEXTRAN DEXTRAN DEXTRANE DEKSTRAN DEXTRANO DEXTRANE DEXTRANO DEXTRAN
DNAse DNAse DNAse DNAza DNAse DNAse DNAsa DNAse
DNAse H.ST DNAse Th DNAse Th DNAza Termost. DNAse Th DNAse Th DNAsa Th DNAse Th
DULCITOL DULCITOLac DULCITOLac DULCYTOL zakw. DULCITOLac DULCITOLac DULCITOLac DULCITOLac
ERYTHRITa ERYas ERYas ERY asym ERYas ERYas ERYas ERYas
ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESC (HYDROLIZA) ESC (HID.) ESC (HYD.) ESC (HYD.) ESK (HYD.)
dFRUCTOSE dFRUCTOSE FRUCTOSEac FRUKTOZA zakw. FRUCTOSEac dFRUCTOSE FRUCTOSAac FRUKTOSac
dFRUCTOSEa FRUCTOSEas FRUCTOSEas FRUKTOZA asym. FRUCTOSEas FRUCTOSEas FRUCTOSAas FRUKTOSas
dGALACTOSE GALac GALac GAL zakw. GALac GALac GALac GALac
GDC GDC GDC GDC GDC GDC GDC GDC
GELATINE GELATINASE GELATINASE ŻELATYNAZA GELATINASE GELATINASE GELATINASA GELATINAS
GGA GGA GGA GGA GGA GGA GGA GGA
GLN GLN GLN GLN GLN GLN GLN GLN
dGLUCOSE GLUCOSEac GLUCOSEac GLUKOZA zakw. GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSAac GLUKOSac
dGLUCOSEa dGLUCOSEa GLUCOSEas GLUKOZA asym. GLUCOSEas dGLUCOSEa GLUCOSAas GLUKOSas
GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSEac GLUKOZA zakw. GLUCOSEac GLUCOSEac GLUCOSAac GLUKOSac
GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSEg GLUKOZA gaz GLUCOSEg GLUCOSEg GLUCOSAg GLUKOSg
GlyA GlyA GlyA GlyA GlyA GlyA GlyA GlyA

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 173


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
GLYCEROL GLYCEROL GLYCEROLac GLICEROL zakw. GLICEROLac GLYCEROL GLICEROLac GLYCEROLac
GLYCINE 1 % GLYCINE 1 % GLYCINE 1 % GLICYNA 1 % GLICINA 1 % GLYCINE 1 % GLICINA 1 % GLYCIN 1 %
GLYCOGEN GLYGOGENac GLYGOGENac GLIKOGEN zakw. GLIGac GLYGOGENac GLIGOGENOac GLYKOGENac
GMB GMB GMB GMB GMB GMB GMB GMB
GRAM GRAM GRAM GRAM GRAM GRAM GRAM GRAM
GRT GRTas GRTas GRT asym. GRTas GRTas GRTas GRTas
H2S H2S H2S H2S H2S H2S H2S H2S
HAFNIA Ph HAFNIA Ph Ph.HAFNIA FAG HAFNIA Ph.HAFNIA Ph.HAFNIA Ph.HAFNIA HAFNIA fag
HEMOLYSIS HEMOLYSIS HAEM HEMOLIZA HEM HEMOLYSIS HAEM HEMOLYSIS
HIPPURATE HIPPURATE HIPPURATE HIPURAN HIPURATO HIPPURATE HIPURATO HIPPURAT
HisA HisA HisA HisA HisA HisA HisA HisA
HYPH/PH HYPH/PH HYPH/PH STRZĘPKI/PSEUDOSTRZ. HIF/PH HYPH/PH HYPH/PH HYPH/PH
IDP IDP IDP IDP IDP IDP IDP IDP
INDOLE IND IND IND IND IND IND IND
INOSITOL INO INO INO INO INO INO INO
INULIN INULIN INU INU INU INULIN INU INU
dlLACTATEa dlLACTATEa LACTATEas MLECZAN asym. LACTATOas dlLACTATEa LACTATOas LAKTATas
LACTOSE LACTOSEac LACTOSEac LAKTOZA zakw. LACTOSEac LACTOSEac LACTOSAac LAKTOSac
LDC LDC LDC LDC LDC LDC LDC LDC
LECITHIN. LECITHIN. LECITHIN. LECYTYNA LECITIN. LECITHIN. LECITINA. LECITIN.
LeuA LeuA LeuA LeuA LeuA LeuA LeuA LeuA
LEVAN LEVANE LEVANE LEWAN LEVANO LEVANE LEVANO LEVAN
LIPASE LIPASE LIPASE LIPAZA LIPASE LIPASE LIPASA LIPAS
LIPOPHILY LIPOPHILY LIPOPHILIE LIPOFILNOŚĆ LIPOFILIA LIPOPHILIE LIPOFILIA LIPOFILI
LSTR R LSTR LSTR LST R LSTR LSTR LSTR LSTR

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 174


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
lLYSINEa LYSINEas LYSINEas LIZYNA asym. LISINAas LYSINEas LISINAas LYSINas
LYSOZYME R LYSOZYME R LYSOZYME R LIZOZYM R LISOZIMA R LYSOZYME R LISOZIMA R LYSOZYM R
MßDG MßDGac MßDGac MßDG zakw. MßDGac MßDGac MßDGac MßDGac
MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY MAC CONKEY
MALONATE MALONATE MALONATE MALONIAN MALONATO MALONATE MALONATO MALONAT
dMALTOSE dMALTOSE MALTOSEac MALTOZA zakw. MALTOSEac dMALTOSE MALTOSAac MALTOSac
dMANNOSEa DMANNOSEas DMANNOSEas D-MANNOZA asym. DMANOSEas DMANNOSEas DMANOSAas DMANNOSas
dMANNITOL MANNITOLac MANNITOLac MANNITOL zakw. MANITOLac MANNITOLac MANITOLac MANNITOLac
dMANNITOLa MANNITOLas MANNITOLas MANNITOL zakw. MANITOLas MANNITOLas MANITOLas MANNITOLas
dMANNOSE MANNOSEac MANNOSEac MANNOZA zakw. MANOSEac MANNOSEac MANOSAac MANNOSac
MDG MDGac MDGac MDG zakw. MDGac MDGac MDGac MDGac
dMELa dMELa MELas MEL asym. MELas dMELa MELas MELas
dMELIBIOSE MELIBIOSE MELIBIOSE MELIBIOZA zakw. MELIBIOSE MELIBIOSE MELOBIOSA MELIBIOS
METHYL RED METHYL RED RM/MR RM/MR RM METHYL RED ROJO METILO RM/MR
MILK(A) MILK(A) MILK(A) MLEKO zakw. LEITE(A) MILK(A) LECHE(A) MjöLK(A)
MILK(C) MILK(C) MILK(C) MLEKO(ścinanie) LEITE (C) MILK(C) LECHE(C) MJöLK(C)
MILK(D) MILK(D) MILK(D) MLEKO(trawienie) LEITE (D) MILK(D) LECHE(D) MJöLK(D)
dMLZ MLZac MLZac MLZ zakw. MLZac MLZac MLZac MLZac
dMLZa MLZas MLZas MLZ asym. MLZas MLZas MLZas MLZas
MOTILITY MOTILITY MOT RUCH MOB MOTILITY MOT MOTILITET
MYCELIUM MYCELIUM MYCELIUM GRZYBNIA MICÉLIO MYCELIUM MICELIO MYCELIUM
NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 % NaCl 0 %
NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 % NaCl 1.5 %
NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 % NaCl 10 %
NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 % NaCl 3.5 %

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 175


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 % NaCl 4 %
NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 % NaCl 6 %
NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 % NaCl 6.5 %
NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 % NaCl 7.5 %
NAGa NAGa NAGas NAG zakw. NAGas NAGa NAGas NAGas
NITRATEa NITRATEa NITRATEas AZOTAN asym. NITRATOas NITRATEa NITRATOas NITRATas
NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2 NO2-->N2
NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2 NO3-->N2
NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2 NO3-->NO2
NO3 (RED.) NO3(RED.) NO3(RED.) NO3(REDUKCJA) NO3(RED.) NO3(RED.) NO3(RED.) NO3(RED.)
NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R NOVO R
ODC ODC ODC ODC ODC ODC ODC ODK
OF/F OF/F OF/F OF/F OF/F OF/F OF/F OF/F
OF/O OF/O OF/O OF/O OF/O OF/O OF/O OF/O
ONPG ONPG ONPG ONPG ONPG ONPG ONPG ONPG
OPTOCHIN R OPTOCHIN R OPTOCHIN.R OPTOCHINA R OPTOQUINAR OPTOCHIN.R OPTOQUINA.R OPTOCHIN.R
OXIDASE OXIDASE OXIDASE OKSYDAZA OX OXIDASE OXIDASA OXIDAS
PACa PACa PACas PAC zakw. PACas PACa PACas PACas
PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSE PALATYNOZA PALATINOSE PALATINOSE PALATINOSA PALATINOS
pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4 pH 5.4
pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6 pH 9.6
PHEa Phe.as Phe.as FENYLOALA. asym. Phe.as Phe.as Phe.as Fen.as
PINK PINK PINK RÓŻOWY ROSA PINK PINK ROSA
POLYSACCH. POLYSACCH. POLYSACCH. POLISACH. POLISAC. POLYSACCH. POLISACAR. POLYSACK.
ProA ProA ProA ProA ProA ProA ProA ProA

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 176


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
PYGBILE PYG+BILE PYG+BILE PYG+ŻÓŁĆ PIG+BILES PYG+BILE PYG+BILIS PJG+GALLA
dRAFa RAFas RAFas RAF asym. RAFas RAFas RAFas RAFas
dRAFFINOSE RAFac RAFac RAF zakw. RAFac RAFac RAFac RAFac
RED RED RED CZERWONY VERMELHO RED ROJO RED
lRHAMNOSE lRHAMNOSE RHAMNOSEac RAMNOZA zakw. RAMNOSEac lRHAMNOSE RHAMNOSAac RAMNOSac
lRHAMNOSEa lRHAMNOSEa RHAMNOSEas RAMNOZA asym. RAMNOSEas IRHAMNOSEa RAMNOSAas RAMNOSas
dRIBOSE RIBOSEac RIBOSEac RYBOZA zakw. RIBOSEac RIBOSEac RIBOSAac RIBOSac
dRIBOSEa RIBOSEas RIBOSEas RYBOZA asym. RIBOSEas RIBOSEas RIBOSAas RIBOSas
SALICIN SALICIN SALICIN.ac SALICYNA zakw. SALICIN.ac SALICIN SALICINA.ac SALICIN.ac
SerA SerA SerA SerA SerA SerA SerA SerA
dSORBITOL SORBITOLac SORBITOLac SORBITOL zakw. SORBITOLac SORBITOLac SORBITOLac SORBITOLac
dSORBITOLa dSORBITOLa SORBITOLas SORBITOL asym. SORBITOLas dSORBITOLa SORBITOLas SORBITOLas
lSORBOSE SORBOSEac SORBOSEac SORBOZA zakw. SORBOSEac SORBOSEac SORBOSAac SORBOSac
lSORBOSEa lSORBOSEa SORBOSEas SORBOZA asym. SORBOSEas lSORBOSEa SORBOSAas SORBOSas
SPORE SPORE SPORE PRZETRWALNIKI ESPORO SPORE ESPORA SPOR
PRZETRWALNIKI
SPORE ST SPORE ST SPORE ST ESPORO ST SPORE ST ESPORA ST SPOR ST
SUBTERM.
SPORE T SPORE T SPORE T PRZETRWALNIKI TERM. ESPORO T SPORE T ESPORA T SPOR T
STAR.(HYD) STAR.(HYD) STAR.(HYD) SKROBIA(HYDROL.) AMD STAR.(HYD) STAR.(HID) STAR.(HYD)
SUCROSE SUCROSE SUCROSEac SACHAROZA zakw. SACAROSE SUCROSE SUCROSAac SACKAROSac
SUCROSEa SUCROSEa SACas SAC asym. SACas SUCROSEa SACas SACas
dTAGATOSE TAGac TAGac TAG zakw. TAGac TAGac TAGac TAGac
TDA TDA TDA TDA TDA TDA TDA TDA
THIAMIN THIAMINE THIAMINE TIAMINA TIAMINA THIAMIN TIAMINA TIAMIN
dTREHALOSE dTREHALOSE TREac TRE zakw. TREac dTREHALOSE TREac dTREHALOSE

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 177


Annexes Annexe D-2 : Tableau des équivalences des tests complémentaires

Supplementary Test Abbreviations


Technical Software
Brochure JAPANESE KOREAN POLISH PORTUGUESE RUSSIAN SPANISH SWEDISH
dTURANOSE dTURANOSE TURANOSEac TURANOZA zakw. TURANOSEac dTURANOSE TURANOSAac TURANOSac
Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80 Tween 80
URE URE URE URE URE URE URE URE
V FACTOR V FACTOR V FACTOR CZYNNIK V FACT.V V FACTOR V FACTOR V FAKTOR
VITAMIN VITAMIN VITAMIN WITAMINA VITAMINA VITAMIN VITAMINA VITAMIN
VP VP VP VP VP VP VP VP
X FACTOR X FACTOR X FACTOR CZYNNIK X FACT.X X FACTOR X FACTOR X FAKTOR
dXYLOSE LYX LYX LYX LYX LYX LYX LYX
YELLOW YELLOW YELLOW ŻÓŁTY AMARELO YELLOW AMARILLO GUL

Brochure d'information technique pour le logiciel d'identification 178


 

bioMérieux SA
376 Chemin de l’Orme 69280 Marcy-l'Etoile – France
Tel. 33 (0)4 78 87 20 00 Fax 33 (0)4 78 87 20 90
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