Le 

Métabolisme

Une vue globale 

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 1
 Métabolisme ­ une vue globale

Macromolécules

Anabolisme Catabolisme
Molécules de Couplage
ATP, NAD(P)H

Petites molécules

Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 2
 Métabolisme ­ une vue globale

Macromolécules Macromolécules Macromolécules

Protéines ARN/ADN Protéines ARN/ADN

Lipides Polygluc. Lipides Polygluc.

Monoméres Monoméres
Amino   Acides Nucléo Gluc Molécules de Couplage Amino   Acides Nucléo Gluc
Acides Gras ­tides ­ides ATP NAD(P)H Acides Gras ­tides ­ides

Petites molécules Petites molécules

Petites molécules
CO2 CO2

Biochimie Structurale 2.1 James Sturgis 3
 Le Métabolisme

Lysosome Golgi
Noyau

Mitochondrie
Les différents 
compartiments de 
la cellule sont 
spécialisés dans 
différents aspects 
du métabolisme Cytosol

Réticulum 
endoplasmique

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 Le Métabolisme
Macromolécules
Lysosome Golgi
Noyau
Protéines ARN/ADN
Lipides Polygluc.
Mitochondrie

Monoméres
Amino   Acides Nucléo Gluc
Acides Gras ­tides ­ides

Petites molécules Cytosol

Réticulum 
CO2 endoplasmique

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 Le Métabolisme

Les différents  Lysosome Golgi

Noyau
compartiments et 
les membranes ne  Mitochondrie
sont pas  
homogènes mais 
sont structurés 
avec des machines 
moléculaires qui 
ont souvent des  Cytosol

rôles métaboliques 
Réticulum 
spécifiques... endoplasmique

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 6
 Le Métabolisme

Les différents 
compartiments et 
les membranes ne 
sont pas  
homogènes mais 
sont structurés 
avec des machines 
moléculaires qui 
ont souvent des 
rôles métaboliques 
spécifiques...
Beck et al. Science 2004

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 7
 Le Métabolisme

Les différents 
compartiments et 
les membranes ne 
sont pas  
homogènes mais 
sont structurés 
avec des machines 
moléculaires qui 
ont souvent des 
rôles métaboliques 
spécifiques...
Baumeister Biol.Chem.  2004

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 8
 Le Métabolisme

Les différents 
compartiments et 
les membranes ne 
sont pas  
homogènes mais 
sont structurés 
avec des machines 
moléculaires qui  Un Protéosome
ont souvent des 
rôles métaboliques 
spécifiques...
Baumeister Biol.Chem.  2004

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 Le Métabolisme
Macromolécules
Lysosome Golgi
Noyau
Protéines ARN/ADN
Lipides Polygluc. Ribosomes
Mitochondrie

Monoméres
Amino   Acides Nucléo Gluc
Acides Gras ­tides ­ides

Petites molécules Cytosol

Réticulum 
CO2 endoplasmique

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 10
 Le Métabolisme des ARN
Le différentes  Macromolécules
interconversions et  ARN
Protéines ARN/ADN
synthèses sont  Lipides Polygluc.
ARN polymerase
1 ATP
organisées en voie  ATP GTP CTP UTP
métabolique... 2 ATP
Monoméres
Amino   Acides Nucléo Gluc AMP GMP   UMP
C'est une petite  Acides Gras ­tides ­ides
simplification  Adenine
Uracil

pour rendre la  Guanine
Petites molécules PRPP
compréhension  2 ATP
plus facile. Glucose 6 P Ribose 5 P
CO2 2 NADPH + CO2

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 11
 Le Métabolisme des ARN

ARN

ARN polymerase
1 ATP
Beaucoup de composés phosphorylés ATP GTP CTP UTP
2 ATP
Beaucoup d'ATP utilisé AMP GMP   UMP

Plein de petites étapes simples pour  Adenine
Uracil

faire des réactions complexes. Guanine
PRPP
2 ATP

Glucose 6 P Ribose 5 P
2 NADPH + CO2

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 12
 Le Métabolisme

Une voie : 
La Glycolyse

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 Une réaction chimique

Substrats Catalyseurs Produits

Maltose
CO2
Saccarose Levure et eau
Ethanol
Amidon

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 14
 Une réaction chimique

Substrats Catalyseurs Produits

Maltose
Enzymes
CO2
Saccarose Glucose
Ethanol
Amidon

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 Une réaction chimique
Les réactions cataboliques
Glucose  Ethanol
O H CH3 CH2OH
C
H C OH
HO C H
H C OH Gaz Carbonique
H C OH
O=C=O
CH2OH
Stoechiomètrie
Glucose (C6H12O6) ­> 2 x CO2 + 2 x ethanol (C2H6O) 

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 16
 Une voie métabolique – Les étapes

Les premières étapes : activation du substrat

Glucose  Fructose 1,6 bis Phosphate 
Activation du 
substrat O H CH2OPO32­
C C O
Récupération  H C OH
d'énergie HO C H
HO C H
H C OH
Élimination des  H C OH
déchets H C OH
H C OH
CH2OPO32­
CH2OH

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 17
 La voie metabolique – Les reactions

Ensuite récupération d'énergie

Fructose 1,6 bis Phosphate  Pyruvate
Activation du  X2
substrat CH2OPO32­ ­
C O O O
Récupération 
d'énergie HO C H C
H C OH C O
Élimination des 
déchets H C OH CH3
CH2OPO32­

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 18
 La voie metabolique – Les reactions

Elimination des déchets

Pyruvate Ethanol +
Activation du  CO2
substrat
­
O O O C O
Récupération 
d'énergie C
C O CH2OH
Élimination des 
déchets CH3 CH3

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 Transport du glucose
Activation du  Localisation importante pour le métabolisme
substrat
Import HXT1/2

Hexokinase Glucose (extracellulaire)  Glucose (intracellulaire) 

Phosphoglucoisomerase

Phosphofructokinase O H O H
Récupération  C C
d'énergie H C OH H C OH
HO C H HO C H
Élimination des 
déchets H C OH H C OH
H C OH H C OH
CH2OH CH2OH

Biochimie Structurale 2.2 James Sturgis 20
 Activation du glucose
Activation du  Hexokinase
substrat Investissement d'énergie.
Import HXT1/2
Glucose Glucose­6­Phosphate
Hexokinase

Phosphoglucoisomerase
O H O H
Phosphofructokinase C C
Récupération  H C OH H C OH
d'énergie HO C H HO C H
Élimination des 
H C OH H C OH
déchets H C OH H C OH
CH2OH CH2OPO32­

ATP ADP

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 Une isomérisation
Activation du  Phosphoglucoisomerase
substrat
Import HXT1/2

Hexokinase Glucose­6­Phosphate Fructose­6­Phosphate 

Phosphoglucoisomerase
O H
Phosphofructokinase
C CH2OH
Récupération 
H C OH C O
d'énergie
HO C H HO C H
Élimination des  H C OH H C OH
déchets H C OH
H C OH
CH2OPO32­ CH2OPO32­

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 Une deuxième activation
Activation du  Phosphofructokinase
substrat
Import HXT1/2 Fructose­6­Phosphate  Fructose 1,6 bis Phosphate 
Hexokinase

Phosphoglucoisomerase CH2OH CH2OPO32­

Phosphofructokinase
C O C O
Récupération  HO C H HO C H
d'énergie
H C OH H C OH
Élimination des  H C OH H C OH
déchets
CH2OPO32­ CH2OPO32­

ATP ADP

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