Thème 3 : Une Histoire du Vivant

Chapitre 1
La biodiversité et son évolution

Terminale - Enseignement Scientifique

 Qu'est-ce que la biodiversité ?
Comment l'estimer ? Comprendre son évolution ?
Comment et pourquoi la préserver ?
I -Estimer la biodiversité

A - Définitions
Quelle définition donnez-vous à la biodiversité ?
 Quelle définition donnez-vous à la biodiversité ?

Plusieurs niveaux (écosystèmes, espèces, intra-spécifique)

On parle le plus souvent du nombre d'espèces dans un milieu :
c'est la biodiversité spécifique
Mais le nombre d'individus composant une population est
également important : c'est l'abondance
 Quelle définition donnez-vous à la biodiversité ?

Plusieurs niveaux (écosystèmes, espèces, intra-spécifique)

On parle le plus souvent du nombre d'espèces dans un milieu :
c'est la biodiversité spécifique
Mais le nombre d'individus composant une population est
également important : c'est l'abondance

Comment évaluer cette abondance ?

Échantillonnage sur cadran / transect
Échantillonnage sur cadran / transect

Observation
Échantillonnage sur cadran / transect

Observation

Analyses génétiques
Échantillonnage sur cadran / transect

i r de
p a r t
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u l a t
e p o p
e r un n s ? Observation

s t i m n t i l l o
e n t e é ch a
m m c e s
Co

Analyses génétiques
I -Estimer la biodiversité
A - Définitions
B - Estimer la taille d'une
population
Q. 1 et 2 p.197 : Technique CMR (Capture, Marquage,
Recapture)
Q. 1 et 2 p.197 : Technique CMR (Capture,
Marquage, Recapture)
Q. 1 et 2 p.197 : Technique CMR (Capture,
Marquage, Recapture)
Q. 3 p.197 - Pois chiches et tableur Excel
(commun/SVT_Schwob/TGES/TP-Estimer une population)
=> Réaliser la modélisation puis remplir la page "Pois
chiches"
du tableur.
Quelle est votre estimation de la population ?
Que remarquez-vous ?
 Q. 3 p.197 - Pois chiches et tableur Excel
(commun/SVT_Schwob/TGES/TP-Estimer une population)
=> Réaliser la modélisation puis remplir la page "Pois chiches"
du tableur.
Quelle est votre estimation de la population ?
Que remarquez-vous ?
La technique CMR donne parfois des estimations très
variables : c'est la fluctuation de l'échantillonnage, due au
hasard
Q. 3 p.197 - Pois chiches et tableur Excel
(commun/SVT_Schwob/TGES/TP-Estimer une population)
=> Réaliser la modélisation puis remplir la page "Pois chiches"
du tableur.
Quelle est votre estimation de la population ?
Que remarquez-vous ?
La technique CMR donne parfois des estimations très
variables : c'est la fluctuation de l'échantillonnage, due au
hasard
Quels facteurs font varier cette fluctuation ?
Comment savoir si l'estimation est de confiance ?
I -Estimer la biodiversité
A - Définitions
B - Estimer la taille d'une
population
C - Niveau de confiance
d'une estimation
Doc 3 p.199 - Simulation sur tableur Excel
(toujours le même tableur)
=> Réaliser la simulation dans
les pages "C=20" et "C=100"
du tableur.
1.Pour lancer le calcul
aléatoire, taper sur F9
2.Puis remplissez le
tableau
situé en bas du tableur, en
notant combien de fois
apparaît chaque proportion
Doc 3 p.199 - Simulation sur tableur Excel
(toujours le même tableur)
=> Réaliser la simulation dans v e n t
s s o u
les pages "C=20" et "C=100" e p l u
c he l
p pr o 4 ) ?
du tableur.
n s'a e (=0 ,
l a t i o rée ll
1.Pour lancer s i le
m ucalcul o rt io n
u e l l e p ro p
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aléatoire, taper
de la
sur F9
2.Puis remplissez le
tableau
situé en bas du tableur, en
notant combien de fois
apparaît chaque proportion
Bilan :
La méthode Capture-Marquage-Recapture permet d'estimer
l'effectif d'une population à partir d'un échantillon, à 2 conditions :

1)La proportion d'individus marqués est identique dans l'échantillon

et la population (pas de biais d'échantillonnage)

2)L'échantillon est suffisamment grand (limite la fluctuation)

L'effectif s'obtient par la formule N=(MxC)/R
Estimation de la qualité de notre estimation :
(oui, on fait des estimations sur nos estimations...)
On utilise un intervalle de confiance à 95 %
Définition :

Attention : l'intervalle est calculé pour la proportion (R/C)

Utilisation dans le cas de comparaisons : si deux intervalles de
confiance se recoupent, alors on ne peut pas dire si deux
valeurs sont réellement différentes
Formule de l'intervalle de confiance à 95
%:

Avec :
f, la fré quence calculé e (=R/C)
C, la taille de l'é chantillon

Cet intervalle contiendra la valeur réelle dans 95 % des cas

Il dépend principalement de la taille de l'échantillon
Formule de l'intervalle de confiance à 95
%: oy e n
U N m
A U C !
n ch e nag e
reva ti llo n
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s qu ' l i té
Avec : s p a qu a
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f,Nla u
'o fré quence év al u
calculé e (=R/C)
l e d'
p
im de l'é chantillon
C, lastaille

Cet intervalle contiendra la valeur réelle dans 95 % des cas

Il dépend principalement de la taille de l'échantillon
Exemple
d'application :

Retour à nos pois chiches :

Captures de 8 pois chiches
Le plus souvent, 2 pois chiches marqué s
dans la capture
Exemple
d'application :

Retour à nos pois chiches :

Captures de 8 pois chiches
Le plus souvent, 2 pois chiches marqué s
dans la capture

Bonus pour les matheux : à partir de quel échantillon peut-

on commencer à déterminer l'intervalle ?
Exemple
d'application :
I.- Estimer la biodiversité
II.- Caractériser une population
A - Rappels de g énétique
I.- Es timer la biodivers ité
II.- Caractériser une population
A - Rappels de g énétique
B - C aractéris ation phénotypique,
génotypique et allélique
Calcul de la proportion d'un caractère
Calcul de la proportion d'un caractère
 Calcul de la fréquence
génotypique

La fré quence gé notypique s'obtient simplement avec la formule suivante :

 Calcul de la fréquence allélique

La fré quence allé lique s'obtient en deux temps

On utilise les fré quences gé notypiques
La fré quence d'un allè le A s'obtient par la
formule :
f(A//A)+1/2xf(A//B)
Bilan :

Une population peut se caractériser par sa structure génétique, grâce à la

diversité génétique engendré par l’existence des allèles.
En observant les phénotypes des individus de la population, on peut
déterminer les fréquences génotypiques et alléliques d’un gène donné.
I.- Estimer la biodiversité
II.- Caractériser une population
III - L'évolution des populations
A - L'équilibre de Hardy-Weinberg
Comment évoluent les fréquence génotypiques et alléliques ?

En 1908, deux scientifiques, Hardy et Weinberg, proposent un

modèle mathématique visant à modéliser l’évolution des fréquences
génotypiques et alléliques d’une population. Pour que leur loi
mathématique soit validée, elle doit respecter plusieurs conditions :
Comment évoluent les fréquence génotypiques et alléliques ?

-Population isolée (pas de

migration)
-Effectif illimité
-Pas de sélection naturelle
-Pas de mutation
-Accouplements aléatoires
Comment évoluent les fréquence génotypiques et alléliques ?
-Population isolée (pas de
migration)
-Effectif illimité
-Pas de sélection naturelle
-Pas de mutation
-Accouplements aléatoires

Si toutes ces conditions sont

respectées pour un gène donné ,
les fréquences génotypiques de la
génération 2 peuvent être déduites
à partir des fréquences alléliques
de la génération 1(les parents)
Comment évoluent les fréquence génotypiques et alléliques ?

Equilibre de Hardy Weinberg = les

fréquences alléliques et
génotypiques d’un gène donné au
sein d’une population restent
constantes au cours des
générations.
Comment évoluent les fréquence génotypiques et alléliques ?
En reprenant l’activité précédente, on a pour la génération 2:

Fréquence allélique génération 1:

p= q=

Fréquence génotypique
génération 2:
f(R//R)=
f(R//B)=
f(B//B)=

Fréquence allélique gén 2 :

f(R) =
f(B) =
En reprenant l’activité précédente, on a pour la génération 2:
Fréquence allélique génération 1:
p = 0,7 q=0,3

Fréquence génotypique
génération 2:
f(R//R)= 0,49
f(R//B)= 0,42
f(B//B)= 0,09

Les fréquences génotypiques et

alléliques à peu près similaires =>
pour ce gène, la population suit la
loi de Hardy-Weinberg.
Exercice : génétique de la population de loups de Yellowstone
Exercice : génétique de la population de loups de Yellowstone