2005
pour le
DOCTORAT VETERINAIRE
le
par
Mathieu DUTHEL
Né le 6 juin 1980 à Nancy (Meurthe-et-Moselle)
JURY
Président : M.
Professeur de la Faculté de Médecine de Créteil
Membres
Résumé :
JURY :
Président :
Directeur : Pr. BOULOUIS
Assesseur : Dr. MAUREY
Adresse :
Mathieu DUTHEL
36 les Nuguets - cidex 120
71570 LA CHAPELLE DE GUINCHAY
INFECTION OF URINARY TRACT BY CORYNEBACTERIUM
UREALYTICUM AMONG DOMESTIC SMALL ANIMALS:
RETROSPECTIVE STUDY FROM 14 CASES
SURNAME : DUTHEL
Given name : Mathieu
SUMMARY :
JURY :
President :
Director : Pr. BOULOUIS
Assessor : Dr MAUREY
Author’s address :
Mathieu DUTHEL
36 les Nuguets - cidex 120
71570 LA CHAPELLE DE GUINCHAY
Je remercie tout particulièrement Henri Jean BOULOUIS et Christelle MAUREY pour
leur aide durant la rédaction de cette thèse. Ils ont su me consacrer le temps nécessaire
et me prodiguer les conseils utiles pour le bon cheminement de mon travail.
A mes parents qui ont su me soutenir pendant ces longues années d’études,
A mes sœurs,
A Eva,
A Alexandre,
A Véronique,
A Ludovic, pour sa joie de vivre malgré les aléas de la vie et pour son franc parler,
A Audrey pour tout le temps passés ensemble depuis le bac et pour les premières
semaines de galères inoubliables en arrivant à l’ENVA,
A ma famille,
A mes grands-mères.
TABLE DES MATIERES
Introduction……………………………………………………………………………...7
1
D. Examens complémentaires et lésions ................................................................. 25
1 Analyse d’urine............................................................................................... 25
2 Examen bactériologique urinaire .................................................................... 25
3 La polymerase chain reaction (PCR) .............................................................. 25
4 Radiographie abdominale ............................................................................... 25
a) Sans produit de contraste ............................................................................ 25
b) Urétrographie intraveineuse........................................................................ 26
5 Echographie abdominale................................................................................. 26
6 Endoscopie vésicale........................................................................................ 27
7 Examen histologique....................................................................................... 28
8 Scanner............................................................................................................ 28
E. Diagnostic ........................................................................................................... 30
F. Complications ..................................................................................................... 30
G. Traitement........................................................................................................... 31
H. Prophylaxie ......................................................................................................... 33
I. Pronostic ............................................................................................................. 33
2
1 Bactérie isolée................................................................................................. 52
2 Prévalence de l’infection ................................................................................ 52
3 Antibiogramme ............................................................................................... 52
P. Traitement et suivi .............................................................................................. 53
Q. ITU causée par d’autres germes après C. urealyticum ....................................... 54
III. DISCUSSION ......................................................................................... 55
Conclusion……………………………………………………………………………...59
3
TABLES DES FIGURES ET DES TABLEAUX
FIGURES
FIGURE 1 : MECANISME D'ACTION DE L'UREASE BACTERIENNE ........................................ 22
FIGURE 2 : RADIOGRAPHIE SANS PREPARATION MONTRANT UNE CALCIFICATION DE LA
VESSIE ...................................................................................................................... 26
FIGURE 3 : ECHOGRAPHIE VESICALE MONTRANT UN EPAISSISSEMENT PARIETAL AVEC
DEUX COUCHES DISTINCTES. LA COUCHE SUPERFICIELLE (FLECHE BLANCHE) EST
ECHOGENE ET CORRESPOND A L’INCRUSTATION DE L’UROTHELIUM. LA COUCHE
PROFONDE (FLECHE NOIRE) EST HYPOECHOGENE ET CORRESPOND AU DETRUSOR.... 26
FIGURE 4 : A : COUPE LONGITUDINALE ECHOGRAPHIQUE DU REIN GAUCHE MONTRANT
DES STRUCTURES ECHOGENES (FLECHES) DANS LE BASSINET AVEC DES CONES
D’OMBRES ASSOCIES, POUVANT CORRESPONDRE A DES INCRUSTATIONS OU A DES
CALCULS. ................................................................................................................. 27
FIGURE 5 : CE SCANNER SANS PREPARATION MONTRE DES CALCIFICATIONS
MINUSCULES DE L’UROTHELIUM (FLECHES). CES INCRUSTATIONS SONT FINES,
REGULIERES ET SUPERFICIELLES. ............................................................................. 29
FIGURE 6 : A, CCANNER SANS PRODUIT DE CONTRASTE MONTRANT UNE CALCIFICATION
EPAISSE (FLECHES) DE LA PAROI UROTHELIALE RENALE .......................................... 29
FIGURE 7 : A, SCANNER SANS PRODUIT DE CONTRASTE MONTRANT UNE CALCIFICATION
EPAISSE DU LA PAROI UROTHELIALE RENALE (FLECHES) .......................................... 30
FIGURE 8 : CRISTAUX DE PHOSPHATE AMMONIACO MAGNESIEN .................................... 46
FIGURE 9 : 9A IMAGE ECHOGRAPHIQUE CARACTERISTIQUE D'UNE CYSTITE INCRUSTEE A
CORYNEBACTERIUM UREALYTICUM : PAROI EPAISSIE (6MM) AVEC UN CONTOUR
MUQUEUX TRES IRREGULIER ET DES INCRUSTATIONS MINERALISEES DE LA PAROI
VESICALE. LA LUMIERE VESICALE CONTIENT DE TRES NOMBREUX CALCULS. .......... 48
FIGURE 10 : CALCUL DE STRUVITE EXTRAIT DU CHIEN 3 PRESENTANT UNE INFECTION A
CORYNEBACTERIUM UREALYTICUM ............................................................................ 49
FIGURE 11 : DELAI ECOULE ENTRE LES MANIPULATIONS UROLOGIQUES ET LES
SYMPTOMES ............................................................................................................. 50
FIGURE 12 : DELAI ECOULE ENTRE L’APPARITION DES SYMPTOMES ET LE DIAGNOSTIC. .. 51
TABLEAUX
TABLEAU 1: CARACTERISTIQUES DES 7 CHIENS RETENUS ................................................ 39
TABLEAU 2 : CARACTERISTIQUES DES 7 CHATS RETENUS ................................................ 39
TABLEAU 3 : ANTECEDENTS PATHOLOGIQUES ET FACTEURS PREDISPOSANT A
L’INFECTION DE C. UREALYTICUM ............................................................................. 41
TABLEAU 4 : ITU PAR DIFFERENTS GERMES PRECEDANT L’ITU PAR C.UREALYTICUM...... 42
TABLEAU 5 : SYMPTOMATOLOGIE DES 14 ANIMAUX ATTEINTS PAR CORYNEBACTERIUM
UREALYTICUM ........................................................................................................... 44
TABLEAU 6: ANALYSE DES ECHANTILLONS D’URINE ....................................................... 45
TABLEAU 7 : COMPOSITION DES CALCULS ....................................................................... 49
TABLEAU 8 : DELAI ECOULE ENTRE LES MANIPULATIONS UROLOGIQUES ET
L'APPARITION DES SYMPTOMES ................................................................................ 50
TABLEAU 9 : DELAI ECOULE ENTRE LES SYMPTOMES ET LE DIAGNOSTIC .......................... 51
TABLEAU 10 : SYNTHESE DE L’ANTIBIOSENSIBILITE DES DIFFERENTS GERMES ISOLES .... 53
4
TABLE DES ANNEXES
ANNEXE 1 : RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 1 ...................................................... 63
ANNEXE 2 : ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 1 ............................................. 66
ANNEXE 3 : RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 1 ...................................................... 67
ANNEXE 4 : ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 1 ............................................. 68
ANNEXE 5: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 2 ....................................................... 69
ANNEXE 6: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 2 .............................................. 70
ANNEXE 7: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 2 ....................................................... 71
ANNEXE 8: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 3 ....................................................... 72
ANNEXE 9: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 3 .............................................. 73
ANNEXE 10: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 4 ..................................................... 74
ANNEXE 11: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 4 ............................................ 75
ANNEXE 12: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 5 ..................................................... 76
ANNEXE 13: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 5 ............................................ 77
ANNEXE 14: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 5 ..................................................... 78
ANNEXE 15: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 5 ............................................ 79
ANNEXE 16: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 6 ..................................................... 80
ANNEXE 17: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 6 ............................................ 81
ANNEXE 18: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHIEN 7 ..................................................... 82
ANNEXE 19: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHIEN 7 ............................................ 83
ANNEXE 20: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 1 ...................................................... 84
ANNEXE 21: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 1 ............................................. 85
ANNEXE 22: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 2 ...................................................... 86
ANNEXE 23: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 2 ............................................. 87
ANNEXE 24: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 3 ...................................................... 88
ANNEXE 25: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 3 ............................................. 89
ANNEXE 26: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 4 ...................................................... 90
ANNEXE 27: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 4 ............................................. 91
ANNEXE 28: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 4 ............................................. 92
ANNEXE 29: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 5 ...................................................... 93
ANNEXE 30: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 5 ............................................. 94
ANNEXE 31: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 6 ...................................................... 95
ANNEXE 32: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 6 ............................................. 96
ANNEXE 33: RESULTATS D’UROCULTURE DU CHAT 7 ...................................................... 97
ANNEXE 34: ANTIBIOGRAMME D’UROCULTURE DU CHAT 7 ............................................. 98
5
6
INTRODUCTION
Les corynébactéries sont peu connues dans les affections des carnivores
domestiques (chiens et chats). Considérées comme des opportunistes, elles deviennent
pathogènes chez les patients immunodéprimés. Décrit en médecine humaine, depuis les
années 1910, Corynebacterium urealyticum est identifié comme responsable d’infection
grave de l’appareil urinaire en particulier chez les patients présentant des facteurs
favorisants.
Le premier cas d’infection chez l’homme impliquant ce germe de façon certaine
a été rapporté en 1979 par JACOBS et PERLINO (12). Ce germe a été isolé par
aspiration transtrachéale sur un patient débilité atteint d’une pneumonie. Ce germe
identifié comme C. urealyticum était sensible à la pénicilline, seul cas décrit où ce
germe était sensible à cet antibiotique.
Le premier cas d’infection de l’appareil urinaire par cette bactérie fut décrit en
1985. SORIANO (12) recensait quatre cas de cystites incrustées alcalines dues à
Corynebacterium urealyticum isolé à partir d’uroculture et de la mise en culture des
calculs prélevés.
Elle est décrite chez le chien pour la première fois en 1992. Les conditions de
culture particulières de ce germe peuvent expliquer en partie le sous diagnostic de cette
infection. Les rares cas décrits (21 cas dont 7 chats et 14 chiens), font état d’infections
urinaires particulièrement sévères et invalidantes. Une meilleure connaissance des
particularités épidémiologiques, symptomatologiques et thérapeutiques de l’infection à
Corynebacterium urealyticum a justifié la réalisation de l’étude rétrospective qui vous
est présentée.
Entre 1998 et 2004, le laboratoire de bactériologie de l’Ecole Nationale
Vétérinaire d’Alfort a isolé différentes espèces de Corynebacterium à partir de
prélèvements urinaires réalisées en consultation d’urologie. Cette étude rétrospective
regroupe quatorze cas d’infection urinaire par Corynebacterium urealyticum, 7 chiens
(2 femelles et 5 mâles) et 7 chats mâles.
7
8
PREMIERE PARTIE : ETUDE
BIBLIOGRAPHIQUE
9
10
I. PRESENTATION DES CORYNEBACTERIES
Les corynebactéries ont été découvertes en 1883 quand Klebs identifia le bacille
diphtérique lors d’examens des fausses membranes issus des patients atteints de croups.
Elles sont également appelées bacilles corynéformes ou bacilles diphtéroïdes.
Ces bacilles, à coloration de gram positive, ont une forme irrégulière comportant
un renflement à une extrémité et ont été appelés corynébactéries, coryne signifiant
massue en grec.
Elle intègre un seul genre : Corynebacterium (32). Elle est caractérisée par la
présence dans la paroi bactérienne d’acide méso-diaminopimélique, d’arabinose et de
galactose et d’acides gras particuliers, les acides mycoliques dont la longueur des
chaînes carbonées permet une diagnose de genre et d’espèce. Ces critères définissent
une paroi cellulaire de type IV (31).
B. LE GENRE CORYNEBACTERIUM
Quatre groupes se distinguent selon l’étude de RUIMY et al. (32) définis grâce à
3 méthodes phylogénétiques (les méthodes utilisées sont : neighbor-joining method,
maximum probability method, parsimony maximum method) comparant les séquences
de sous-unités d’ADN ribosomal :
- Groupe I : cette unité monophylétique regroupe la majorité des individus du
genre.
- Groupe II : il est composé d’une seule bactérie. Elle est exclue du groupe I du
fait de son taux particulier de mutation qui rendait le groupe instable.
- Groupe III : il regroupe seulement 4 germes dont Corynebacterium urealyticum.
La robustesse de ce groupe est douteuse puisque les bactéries n’ont été
11
identifiées seulement par neighbor-joining method et par maximum probability
method. Tous sauf C. jeikeium ont une paroi composée d’acide
tuberculostéarique. De plus, C. jeikeium et C. urealyticum sont très proches l’un
de l’autre avec un type respiratoire aérobie stricte et des résistances aux mêmes
antibiotiques.
- Groupe IV : ce groupe robuste est assez proche des autres Corynebacteria avec
une corrélation ADN-ADN supérieure à 90%.
12
II. L’ESPECE CORYNEBACTERIUM UREALYTICUM
Décrite et reconnue pour la première fois en 1972 par KING et son équipe du
CDC (Centers Disease Control) d’Atlanta, cette espèce fut nommée tout d’abord
Corynebacterium du groupe D2. Sa nouvelle dénomination, Corynebacterium
urealyticum, est donnée en 1992 par RIEGEL et al.
A. Habitat
Cette bactérie semble faire partie de la flore cutanée de l’homme en tant que
saprophyte mais une incertitude subsiste tout de même sur son habitat. Néanmoins, 25 à
37% des sujets hospitalisés ont un portage cutané (10), contre 12% chez des individus
sains (22). Elle se situe plus particulièrement sous le creux de l’aisselle, en régions
inguinales, périnéales et rectales. Son habitat reste favorisé par une sélection aux
antibiotiques. Selon AGUADO et al., 90% des patients de son étude porteurs de C.
urealyticum ont subi une antibiothérapie auparavant (24, 38). Cette colonisation est
également favorisée par un séjour prolongé en hospitalisation. Les patients en
hospitalisation longue de 6 à 24 mois sont significativement plus contaminés que les
patients présents depuis moins de 6 mois (38).
SORIANO et al. trouvent une colonisation cutanée plus fréquente chez les
femmes que chez les hommes. Par contre, il n’existe pas de différence significative
entre la colonisation cutanée des immunocompétents et des immunodéficients (38).
Cette bactérie est aussi présente dans l’environnement. SORIANO et al. (27) ont
montré que l’ensemble des 48 échantillons prélevés dans l’air des chambres occupées
est positif. Par opposition, elle est très rarement présente sur les surfaces (un échantillon
parmi 64) et dans les salles autres que les chambres, comme la librairie ou le
laboratoire. De plus, aucun lien n’a été trouvé entre la présence d’un malade indemne de
C. urealyticum dans une chambre et la présence de ce germe dans l’air.
B. Caractères bactériologiques
1 Aspects microscopiques
C. urealyticum se présente sous forme de coccobacilles effilés ou en massue, de
0,5 à 1µm de diamètre, à coloration de Gram positive, non acido-résistants, groupés en
V, en « lettres chinoises » ou en palissade, jamais en chaînette, sans ramification ni
spore. Elles peuvent contenir des granules métachromatiques de polyphosphates. Elles
13
sont immobiles et aérobies strictes (30). Néanmoins une croissance très faible en
anaérobie est possible, la classant donc dans la catégorie aéro-anaérobie facultative (10).
2 Particularités phénotypiques
Les chaînes des acides mycoliques majoritaires comptent entre 28 et 32 atomes
de carbones et sont biinsaturées. De plus, la présence d’acide 10-méthylène stéarique est
relatée sur quelques souches de C. urealyticum (31).
Selon les études, le contenu G + C de l’ADN est compris entre 61-62% et 65-
66% (10, 31), valeur comprise dans la fourchette de valeur de la famille.
La présence d’un peptidoglycane de type A1γ (c’est-à-dire reliant un groupe
amine du troisième peptide d’un tétrapeptide au groupement carboxyle du D-alanine
d’un second tétrapeptide, avec la présence d’acide méso-diaminopimélique en position
3 du tétrapeptide) et d’une ménaquinone de type MK-9(H2) prouve l’appartenance au
genre Corynebacterium (10).
3 Caractères biochimiques
Une réponse positive est obtenue pour les tests catalase, pyrazinamidase, leucine
aminopeptidase et uréase. La réponse positive obtenue pour le test uréase est très
intense et rapide, de l’ordre de 30 à 60 minutes (30).
Une réponse négative est obtenue pour les tests oxydase, nitrate réductase,
pyrroindonyl arylamidase, bêta-glucuronidase, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase,
N-acétyl-bêta-glucosaminidase, hydrolyse de la gélatine et de l’esculine, test de cAMP
et acidification des sucres (30, 10).
Une réponse variable selon les souches est notée pour les tests de l’hydrolyse de
l’hippurate, phosphatase alcaline et la réaction de Voges-Proskauer (30, 10).
Sur une gélose au sang avec une atmosphère enrichie en CO2 et après 48 heures
d’incubation à 27°C, 37°C ou 42°C, les colonies sont petites, blanchâtres, opaques,
lisses, convexes et non hémolytiques. Sur une gélose CLED (cystine lactose électro-
déficient), les colonies sont minuscules et grisâtres (10).
Sur le milieu de MUELLER HINTON, toutes les bactéries poussent entre pH 7
et 9 mais pas à pH 10 alors que C. urealyticum est indifférente au pH (37).
La croissance est quasiment nulle sur milieu nutritif simple (29).
Après 48 heures d’incubation, aucune colonie n’est observée sur un milieu de
MacConkey ou sur une gélose au sang incubée en anaérobiose (10).
14
Un milieu sélectif pour l’isolement de C. urealyticum utilisé en médecine humaine
est composé de :
- tween 80 (10mL)
- fosfomycine (100mg)
- cefotaxime (32mg)
- 5-fluorocytosine (200mg)
- agar (20g)
- sang de mouton (50mL)
- eau distillée (qsp 1L)
Il est enrichi en lipide pour une meilleure croissance et en antibiotique pour éliminer les
germes contaminants.
C. Identification
1 Méthodes biochimiques
Les caractères biochimiques permettent une bonne identification. Ces caractères
sont décrits auparavant. Une autre particularité reste la lipophilie de cette espèce. Elle se
détecte par comparaison de la croissance sur un milieu nutritif simple (gélose trypticase-
soja, bouillon cœur-cervelle) et la croissance sur ce même milieu additionné de Tween
80 ou de sérum de cheval. On observe des colonies plus grosses sur milieu supplémenté
et un trouble uniquement dans le bouillon supplémenté en lipides. On peut aussi déposer
une goutte de Tween 80 sur une gélose et observer une augmentation de croissance en
regard de cette goutte (29).
15
Une partie de ces critères biochimiques est regroupée dans le système de galerie
API.
16
3 Méthodes chimiotaxonomiques
La chromatographie liquide haute performance (HPLC) permet la mise en
évidence des acides corynomycoliques ainsi que la chromatographie en couche mince et
en phase gazeuse (29). Son efficacité fait que cette technique est valable, comparée à
l’analyse G + C, pour identifier les espèces du genre Corynebacterium. Néanmoins, elle
est longue et délicate et est donc supplantée par l’identification génomique. De plus, elle
ne permet pas d’établir une corrélation entre le pic et sa composition en acide
corynomycoliques.
Une comparaison entre la HPLC et l’analyse G + C montre que la HPLC est plus
sensible pour l’identification du germe C. urealyticum (7).
4 Méthodes génomiques
Ces méthodes sont de plus en plus utilisées en identification bactérienne en
raison de l’avènement de l’amplification génique (Polymérase Chain Reaction, PCR) et
de progrès technologiques (séquenceurs automatiques, banque de données accessibles
par Internet…)
17
b) Le ribotypage
Le ribotypage est une méthode complémentaire aux examens biochimiques pour
l’identification des corynébactéries (4).
D. Antibiogramme
C. urealyticum est connu pour ses multirésistances et fait l’objet de nombreux
essais, majoritairement in vitro.
1 Les β-lactamines
Ce germe présente une résistance aux β-lactamines ; pénicillines et
céphalosporines ; avec des CMI (Concentration moyenne inhibitrice) supérieures à
32mg/l et 128mg/l respectivement selon PHILIPPON, ROUVEAU et ARLET (28).
Toutes les souches sont résistantes à l’ampicilline et à la céphalotine quelque
soit le pH du milieu de culture (pH de 7,4 ou 8,5) selon Margarita SANTAMARIA et al
(35).
Selon GARCIA RODRIGUEZ et al., Corynebacterium urealyticum est résistant
à l’ensemble des pénicillines, des combinaisons de pénicillines et aux inhibiteur de β-
lactamase (CMI >128 µg/l). Il est résistant également aux céphalosporines, qu’elles
soient à large spectre ou de quatrième génération, génération conçue pour être active sur
les bactéries à coloration de gram positive. Le mode de résistance reste inconnu. Seules
la céfoxitine et le latamoxef (céphalosporines de troisième génération) ont des
résistances partielles, respectivement de 74% et 88%. L’activité de la céfoxitine est
nettement meilleure que celle des autres β-lactamines mais reste néanmoins insuffisante
en vue d’un traitement. Des résistances ont également été décrites pour les pénèmes
(imipénème et méropénème) appartenant à la famille des β-lactamines (17).
2 Les quinolones
L’étude de PHILIPPON, ROUVEAU et ARLET démontre une action variable
de la ciprofloxacine (28). Ces résultats concordent avec ceux obtenus par les chercheurs
de l’hôpital universitaire de Salamanque. En effet, seulement 20,3% de C. urealyticum
sont sensibles à la ciprofloxacine, la majorité des souches étant résistantes (6). La
moxifloxacine a une activité accrue par rapport à celle de la ciprofloxacine mais
uniquement sur les souches sensibles à cette dernière.
Toutes les souches sont sensibles à la norfloxacine selon Margarita
SANTAMARIA et al. (35).
Les résistances de ce germe contre les quinolones sont supérieures à 50% pour
l’ensemble des quinolones avec des valeurs comprises entre 53% et 90%. En particulier,
76% des isolats sont résistants à la norfloxacine, ayant une CMI égale à 128 µg/ml. Ces
18
résultats divergent de l’étude réalisée par Margarita SANTAMARIA et al. montrant une
bonne sensibilité du germe à la norfloxacine. L’activité des fluoroquinolones reste
irrégulière (17).
3 Les glycopeptides
Aucune résistance n’a été décrite pour les glycopeptides (28, 35, 17, 34). Les
CMI de ces antibiotiques sont de 0,5 mg/l pour la vancomycine et la téicoplanine (17).
Ces molécules sont préconisées comme le traitement de choix des infections étendues et
systémiques mais aussi des infections du tractus urinaire à C. urealyticum. L’utilisation
de la téicoplanine est une bonne alternative à celle de la vancomycine, grâce à sa
pharmacocinétique et la possibilité d’une injection intramusculaire (17).
4 Les tétracyclines
Une position intermédiaire de résistance a été décrite pour la tétracycline, avec 4
souches sensibles, 20 souches ayant une CMI comprise entre 4 et 16 µg/ml et 6 souches
ayant une CMI comprise entre 32 et 64 µg/ml (35). La même constatation est faite par
l’équipe de l’hôpital de Salamanque, où 64% des souches testées sont résistantes à la
tétracycline.
La doxycycline donne de meilleurs résultats avec une efficacité sur 98% des
souches et la CMI de la seule souche résistante est une concentration facilement atteinte
dans les urines. Néanmoins son action bactériostatique est insuffisante sur des patients
atteints par cette bactérie, patients souvent immunodéprimés (17).
5 Les macrolides
L’activité de l’érythromycine est variable. Sur 30 souches, 5 ont une CMI < 0,25
µg/ml, 2 ont une CMI comprise entre 64 et 128 µg/ml et 23 sont résistantes (CMI >
1024 µg/ml). De plus, une seule souche parmi les 30 est sensible à la gentamicine (CMI
< 0,25 µg/ml) (35).
Une seconde étude montre que l’ensemble des souches est résistant à
l’érythromycine (CMI > 16 mg/l) et ces résultats concordent avec une autre étude
réalisées sur 20 souches testant l’érythromycine et la télithromycine (CMI > 16 mg/l).
Néanmoins une dernière étude vient nuancer ces résultats, montrant une majorité de
souches sensibles parmi les 27 testées. De plus, la télithromycine aurait une action 4
fois supérieure à celle de l’érythromycine (34).
Par conséquent, les souches de C. urealyticum ont une résistance variable aux
macrolides et surtout très hétérogène suivant les études (28). Il est donc conseillé de les
utiliser après avoir obtenu les résultats de l’antibiogramme et en aucun cas en première
intention.
19
6 Rifampicine
Elle est efficace sur 74% des souches selon GARCIA RODRIGUEZ et al. Mais
son utilisation seule n’est pas recommandée car elle peut provoquer une mutation
entraînant la résistance de ce germe à la rifampicine (17). Cette efficacité variable est
également décrite par PHILIPPON et al. (28) et sa CMI est de 0,5mg/l. Son intérêt est
l’utilisation en association d’antibiotique mais son utilisation comme antituberculeux
réduit son emploi.
7 Autres familles
C. urealyticum est résistant aux aminosides, au sulfaméthoxazole, au
triméthoprime, à la nitrofurantoïne (28), à la fosfomycine, la clindamycine et la
lincomycine.
Aucune résistance n’a été décrite pour la pristinamycine ou l’acide fusidique. La
CMI de ces antibiotiques est de 0,06 mg/l confirmant ainsi la sensibilité de ce germe à
ces antibiotiques (28). Le germe reste sensible à la novobiocine avec une CMI de
0,5mg/l (35) mais aussi à la quinipristine et dalfopristine, et au linézolide avec des
valeurs de CMI de 0,5 mg/l (35).
a) Environnement et antibiothérapie
Une étude de GARCIA BRAVO et al. (16) tente de prouver l’influence des
facteurs externes sur la résistance aux antibiotiques de C. urealyticum. Le pourcentage
de résistance de la majorité des antibiotiques testés est significativement supérieur sur
les prélèvements réalisés sur des patients hospitalisés que sur les patients non
hospitalisés. De même, la fréquence de résistance est supérieure chez les patients ayant
subi une antibiothérapie pendant le mois précédent l’infection que chez les autres. Cette
différence est néanmoins significative uniquement pour certains antibiotiques testés
comme les quinolones de troisième génération ou la gentamicine.
Une autre partie de cette étude consiste à comparer la sensibilité aux
antibiotiques des germes issus de la peau et des urines. Cette sensibilité est similaire
entre les deux lots. En conséquence, une colonisation du tractus urinaire par les germes
de la flore cutanée est une hypothèse à considérer.
b) pH et efficacité de l’antibiothérapie
L’efficacité des antibiotiques est liée au pH rencontré dans le milieu dans lequel
il doit agir. Pour vérifier l’efficacité des antibiotiques dans des milieux différents, deux
20
pH, 7,4 et 8,5, ont été utilisés dans l’étude de Margarita SANTAMARIA et al. Le pH le
plus basique se rapproche de celui de l’urine contaminée par des germes uréasiques et
plus particulièrement C. urealyticum.
Leur conclusion fut que l’activité de l’ensemble des antibiotiques fut altérée à
pH alcalin à plus ou moins grande échelle selon les antibactériens. La norfloxacine est
la moins atteinte par une augmentation du pH. Elle est donc préconisée dans la lutte
contre les infections du tractus urinaire à C. urealyticum. La tétracycline, la novobiocine
et la rifampicine peuvent également être utilisées dans le traitement des infections
urinaires puisque la concentration d’antibiotique dans les urines est supérieure à la CMI
pour la majorité des souches testées dans cette étude (35).
Dans les formes cliniques autres qu’urinaires, les endocardites ou les infections
généralisées en particulier, la vancomycine a fait ses preuves contrairement à la
pristinamycine ou l’acide fusidique (28, 35).
E. Pouvoir pathogène
1 Chez l’homme
a) Généralités
Cette bactérie est responsable de péritonites, d’endocardites, de bactériémies,
d’ostéomyélites, d’infections des tissus mous et de surinfections de plaie. Plus
particulièrement, elle provoque des infections urinaires chroniques et récurrentes
survenant chez des malades âgés (moyenne de 72 ans), affaiblis par une
immunodépression, ayant des cancers vésicaux, des antécédents de troubles génito-
urinaires, un diabète sucré… souvent hospitalisés depuis longtemps. Ils sont souvent
porteurs de sonde ou ont subi des manœuvres instrumentales ou une intervention
chirurgicale.
b) Tractus urinaire
- Lithiases :
La forte activité uréasique est le point essentiel de virulence pour l’infection du
tractus urinaire. Cette activité uréasique est retrouvée chez d’autres germes en
particulier chez Klebsiella, Proteus. Cette enzyme bactérienne, comme le montre la
figure 1, favorise la fabrication de lithiase grâce à son pouvoir de dégradation de l’urée
en ammonium comme le montre la figure 2. La précipitation de phosphate de
magnésium et d’ammonium nécessite un pH supérieur à 8, pH obtenu quand l’urée est
décomposée en ammonium par l’uréase bactérienne (12). On obtient donc des calculs de
struvite nommés également calculs de phosphate ammoniaco-magnésien, mais aussi des
calculs de carbapatite. L’analyse des calculs ou des incrustations révèle une
21
composition de 50% de struvite, 15 à 35% d’apatite et de composants mineurs comme
des protéines, de l’acide urique.
22
III. INFECTION DU TRACTUS URINAIRE PAR
CORYNEBACTERIUM UREALYTICUM CHEZ
L’HOMME
Cette infection du tractus urinaire s’exprime chez l’homme par deux grandes
anomalies : la cystite incrustée (CI) à urines alcalines et la pyélite incrustée (PI).
La cystite incrustée est décrite dès 1914 : « la CI se caractérise, en somme, au
point de vue fonctionnel, d’une part par les phénomènes habituels de cystites, d’autre
part mais d’une façon inconstante, par l’élimination de débris incrustés, voire de
véritable gravier ».
Aujourd’hui, la CI et la PI sont caractérisées par une inflammation de la
muqueuse et par une incrustation minérale de la vessie ou du haut appareil urinaire.
A. Facteurs de prédispositions
Une prédominance pour le sexe masculin (ratio homme / femme = 55/45) existe
mais n’est pas significative (22).
Les enfants sont également touchés par C. urealyticum et MERIA et al. (25) ont
montré que les prédispositions étaient les mêmes que pour les adultes.
B. Symptômes
SORIANO et al. (37) montre dans son étude rétrospective que les symptômes
apparaissent entre 5 et 36 mois après les manipulations urologiques. Tous les patients de
cette étude avait une atteinte chronique du tractus urinaire mais SORIANO et al. ne
tirent pas de conclusion générale quant à une nécessité de manipulations urologiques
pour déclarer une CI.
23
Les symptômes principaux de la CI se résument par (22, 24):
- Une pollakiurie
- Une dysurie
- Une incontinence
- Des brûlures urétérales
- Des urgences mictionnelles
- Un ténesme vésical
- Une hématurie souvent macroscopique voire une pyurie
- Une émission d’urines à l’odeur ammoniaquée
- Des éliminations de déchets minéralisés
C. Diagnostic différentiel
24
Enfin, des plaques de leucoplasie vésicale donnent les mêmes symptômes et des
images endoscopiques similaires à la CI. Cependant, une centrifugation des urines peut
permettre de favoriser une hypothèse. Des débris nécrotiques sont évocateurs d’une CI
alors que des cellules kératinisées sont évocatrices de leucoplasie.
1 Analyse d’urine
Un pH supérieur à 8 ainsi qu’une hématurie associée à une pyurie sont des
signes très évocateurs d’une infection à germes producteurs d’uréase. Des cristaux de
struvite sont très fréquemment associés à ses symptômes, ainsi qu’à une leucocyturie.
Des bactéries sont parfois visibles dans un culot (26).
4 Radiographie abdominale
25
Figure 2 : Radiographie sans préparation montrant une calcification de la vessie
Source : THOUMAS Denis et al. (42)
Elle est plus intéressante mais plus délicate pour la PI. Une calcification épaisse
du bassinet ou associée à un calcul libre peut être confondue avec un calcul
coralliforme. De plus, les calcifications du bassinet lors de PI peuvent être
radiotransparentes. La sensibilité de la radiographie est faible lors de PI (19).
b) Urétrographie intraveineuse
Le double intérêt de cette technique est une visualisation du haut appareil
urinaire ainsi que de la vessie.
MASSON (22) décrit chez un patient un liseré soulignant le contour vésical et la
loge prostatique correspondant à un liseré calcifié, associé à une urétérohydronéphrose
et une vessie piriforme aux contours déchiquetés.
5 Echographie abdominale
Cet examen sensible pour le diagnostic d’une CI permet de mettre en évidence
un épaississement de la paroi vésicale associé à des calcifications de l’urothélium et non
de la lumière du tractus urinaire. Une dilatation du haut appareil urinaire, uretères et
bassinet, est possiblement visible. La figure 3 montre un épaississement pariétal et une
visualisation des différentes couches vésicales.
26
La calcification du système pyélique est difficile à mettre en évidence et la
distinction entre incrustations et calculs coralliformes reste ardue du fait de la faible
sensibilité de cet examen pour la distinction d’une anomalie du système pyélique. Ceci
influe donc sur le délai diagnostic et sur la précocité d’installation du traitement (19). La
figure 4 nous montre des images échographiques du rein et plus particulièrement des
incrustations minérales pyéliques.
A B
Figure 4 : A : Coupe longitudinale échographique du rein gauche montrant des
structures échogènes (flèches) dans le bassinet avec des cônes d’ombres associés,
pouvant correspondre à des incrustations ou à des calculs.
B : Coupe sagittale du rein gauche montrant une dilatation pyélique avec une
calcification superficielle de la paroi du bassinet.
Source: THOUMAS Denis et al. (42)
6 Endoscopie vésicale
Elle peut mettre en évidence des lésions de nécrose et de calcifications de la
paroi vésicale et il est ainsi possible de biopser en vue d’un examen histologique (22).
Les calcifications visualisées varient en taille. Elles peuvent se limiter à un fragment
mal délimité sur la muqueuse comme être de réelles plaques calcifiées épaisses
enchâssées dans la paroi vésicale. De ceci, on visualise deux types de découvertes
endoscopiques :
- Le type 1 correspond à une CI localisée avec des plaques bien délimitées
- Le type 2 correspond à une CI diffuse, associée possiblement à une vessie de
petite capacité.
L’endoscopie a peu d’intérêt pour la PI mais elle est décrite par MERIA et al
(24). Ils réalisèrent un abord percutané du bassinet et découvrirent une consistance
molle, analogue à de la glu, de certaines portions, des plaques de calcifications et des
27
calculs coralliformes, ainsi que des adhérences intimes entre ces structures et le
bassinet.
7 Examen histologique
MASSON (22) remarque sur son prélèvement des lésions de nécrose ainsi
qu’une surcharge calcique diffuse plus ou moins nodulaire.
La cystite est soit aiguë, soit chronique, soit une combinaison des deux (5).
On distingue également trois couches dans le rein atteint de PI, rein obtenu après
exérèse ou perte de greffe (24):
1. la première couche est similaire à celle de la CI et la seule différence est un
ensemble de microcalcifications.
2. la deuxième couche compte des granulomes contenant de nombreuses cellules.
Des abcès parenchymenteux peuvent également être présents.
3. la troisième couche représente la couche saine.
8 Scanner
Cet examen reste l’examen de choix pour sa sensibilité (cf. figure 5) et la
précocité de son diagnostic, en particulier pour le haut appareil urinaire donc pour la PI
(22, 24, 42).
Le scanner peut mettre en évidence des calcifications minces ou radiotransparentes à la
radiographie (cf. figure 6, A et B). Il apporte une bonne visualisation de la muqueuse
urothéliale et de sa calcification. Ces calcifications peuvent être fines et régulières ou
épaisses et irrégulières. La mesure de l’épaississement de la paroi est possible.
28
Figure 5 : Ce scanner sans préparation montre des calcifications minuscules de
l’urothélium (flèches). Ces incrustations sont fines, régulières et superficielles.
Source: THOUMAS Denis et al. (42)
A B
Figure 6 : A, Ccanner sans produit de contraste montrant une calcification épaisse
(flèches) de la paroi urothéliale rénale
B, Radiographie abdominale après positionnement du tube de néphrostomie
(flèche) ne montre aucune calcification alors qu’elles sont visibles au scanner (cf.
A)
Source: THOUMAS Denis et al. (42)
29
A B
Figure 7 : A, Scanner sans produit de contraste montrant une calcification épaisse
du la paroi urothéliale rénale (flèches)
B, Scanner sans préparation après antibiothérapie et acidification locale par le
tube de néphrostomie, révèle des calcifications résiduelles (flèches)
Source: THOUMAS Denis et al. (42)
E. Diagnostic
Etant donnée la faible vitesse de croissance sur les milieux classiques utilisés
pour les examens bactériologiques des urines, cette bactérie et donc l’infection sont sous
diagnostiquées. Il est ainsi nécessaire de la suspecter face à un tableau clinique
évocateur associant plusieurs symptômes tels que des urines alcalines associées ou non
à des cristaux de struvite, une leucocyturie et, ou une hématurie et des facteurs
favorisants(10).
F. Complications
Elles sont de nature différente et on retrouve :
- des lésions vésicales de calcifications majoritairement, modifiant la compliance
de la vessie et entraînant ainsi une pollakiurie extrême par perte de réservoir.
Des dépôts calciques peuvent aussi être retrouvés dans la paroi urétérale et
pyélique entraînant ainsi une sténose urétérale. Des complications de dilatation
pyélique et urétérale en découlent (8),
- une hyperammoniémie est relatée sur un enfant de 7 ans suite à une manœuvre
sur le tractus urinaire. En effet, les germes producteurs d’uréase comme C.
urealyticum peuvent provoquer des encéphalopathies hyperammoniémiques car
ils augmentent la production et l’absorption de l’ammoniac. Cette
hyperammoniémie entraîne une tumescence des astrocytes, un œdème cérébral
et une augmentation de la pression intracrânienne. Ceci se traduisait par une
baisse de vigilance, une léthargie, une hypotonie générale et des vomissements
(15),
30
- des sténoses urétérales ou pyélourétérales sont relatées par la littérature et
constituent une des complications les plus graves du traitement conservateur.
Elle est décrite majoritairement sur des patients greffés. Une intervention
chirurgicale d’anastomose pyélopyélique ou de néphrostomie reste le traitement
de choix (23),
- une anémie,
- une insuffisance fonctionnelle rénale,
- une bactériémie ou une septicémie. Celle-ci est avérée lorsque deux cultures
sanguines sont positives ou lorsque la culture sanguine correspond à l’uroculture
(11).
G. Traitement
L’élimination des plaques rénales est plus délicate et fait l’objet d’études.
GARCIA-BRAVO et al. proposent une exploration chirurgicale et une
pyélotomie pour le retrait du matériel incrusté alors que MERIA et al.(24)
propose un traitement percutané par approche par le calice pour le traitement de
la PI et des calculs coralliformes. Malheureusement, des difficultés pour
fragmenter le calcul par ultrason furent rencontrées du fait de l’adhésion très
forte du calcul à la paroi du bassinet. De plus, des interventions répétées sont
nécessaires.
31
place après l’instauration d’un traitement antibiotique adéquat. Elles préviennent
également la formation d’ions ammonium et de carbonates (19).
Lorsque le traitement oral est insuffisant, il doit être complété par un traitement
topique comme par exemple des instillations intravésicales ou pyéliques. Des
solutions acides ont été proposées : l’acide phosphorique en solution à 1%,
solution d’acide acétique à 0,5% ou solution d’acide citrique. La solution G de
Suby associant acide citrique et oxyde de magnésium à pH 4, a été utilisée
pendant plusieurs années dans le but d’avoir une action acidifiante et
bactériostatique et de former des complexes de citrate de calcium. La solution
acidifiante de Thomas C24 à pH 2, composée de gluconate de sodium, d’acide
citrique et malique, lui est préférée maintenant.
L’administration se fait par sonde de Folley pour la CI et par néphrostomie pour
la PI. Une cathétérisation vésicale ou urétérale permet une acidification
continue. L’irrigation rénale est recommandée lorsque des incrustations épaisses
et extensives sont visibles au scanner. Elle doit être réalisée avec une pression
intrapyélique inférieure à 25 cm d’eau et nécessite un suivi pour limiter la
douleur et une diffusion dans le parenchyme. Elle peut être continue ou,
discontinue, si le patient est algique. Le volume maximal distribué par jour est
inférieur à 1 à 2 litres.
Ces traitements locaux nécessitent un suivi médical, une prise en charge en soins
intensifs ainsi qu’une indication très précise car ces acidifications surtout rénales
restent mal tolérées. Le suivi de la dissolution est suivi grâce aux clichés obtenus
par scanner.
32
H. Prophylaxie
Elle est surtout valable pour les patients porteurs de sondes à demeure. Une
attention particulière doit être apportée à la toilette périnéale et du méat urinaire, zones
porteuses de germes pathogènes ou commensaux introduits lors du sondage.
Cependant, cette prophylaxie a une limite puisque la contamination peut se faire par
voie endoluminale ou le long de la surface externe du cathéter (22).
I. Pronostic
Le suivi moyen selon MERIA et al. (25) est de 54 mois parmi les quatre enfants
atteints étudiés. Le suivi de ces enfants doit être réalisé par scanner et par analyse
bactérienne urinaire, répétés jusqu’à l’âge adulte car les récidives sont fréquentes.
33
34
DEUXIEME PARTIE : ETUDE
EXPERIMENTALE
35
36
I. MATERIELS ET METHODES
Quatorze dossiers ont été retenus parmi les dossiers de l’Ecole Nationale
Vétérinaire d’Alfort entre 1996 et 2004. Ces dossiers concernent deux espèces : le chien
et le chat.
La sélection a été faite sur plusieurs critères :
- L’espèce : chien et chat
- L’infection du tractus urinaire (ITU)
- Le germe incriminé : Corynebacterium du groupe D2, Corynebacterium
urealyticum et Corynebacterium sp
- La concentration de germe retrouvée dans les urines supérieure à 105CFU/ml
- Le mode de prélèvement urinaire : la cystocentèse
B. Méthodologie
37
- La glycosurie
- La présence de cristaux ou de cylindres
- La présence de cellules épithéliales
3 Identification de C. urealyticum
Les colonies isolées sont identifiées par des galeries API Coryne.
38
II. RESULTATS
A. Animaux
39
éventuelle entre les affections concomitantes, les atteintes urinaires et l’infection par C.
urealyticum.
Les chats ont tous été présentés pour une Affection du Bas Appareil Urinaire
(ABAU) obstructive. Ainsi, tous les chats ont subi un cathétérisme urétral avec pose
d’une sonde urinaire à demeure.
Pour 5 d’entre eux, les récidives d’obstruction ont conduit les cliniciens à
procéder à une urétrostomie périnéale.
Une sténose du méat urinaire a nécessité une réintervention sur le chat 2.
Deux autres chats (6 et 7) ont subi une cystotomie pour exérèse des calculs.
Trois chiens et cinq chats ont subi des interventions sur le tractus urinaire avant
la consultation au service d’urologie de l’école vétérinaire d’Alfort (ENVA).
Les chiens 1, 5 et 6 ont subi respectivement une urétrostomie, un cathétérisme
urétral et une cystotomie dans des cliniques vétérinaires extérieures à l’école. Le chien 7
n’a pas subi de manipulations urologiques mais son incontinence durait depuis deux ans
avant la consultation à l’ENVA.
Les cinq chats ont subi un sondage vésical.
40
Tableau 3 : Antécédents pathologiques et facteurs prédisposant à l’infection de C.
urealyticum
atteintes de l'appareil
antécédents pathologiques manœuvre urologique
urinaire
incontinence urinaire
chien 1 apparue 7 mois chirurgicale : urétrostomie
auparavant
SDTE (a), déhiscence de plaie,
chien 2 sondage vésical répété
bronchopneumonie, polydipsie
sondage vésical,
chien 3
chirurgicale : cystotomie
accident de la voie publique,
chien 4 kyste paraprostatique ou rétention urinaire
hypertrophie prostatique
syndrome de Wobbler,
chien 5 incontinence le matin sondage vésical
corpectomie C6-C7,
lactation de pseudogestation,
inflammation des glandes
chirurgicale : cystotomie,
chien 6 salivaires, syndrome
sondage urinaire
respiratoire supérieure des
brachycéphales
incontinence, souillure
MNC (b) postérieur avec
chien 7 urinaire, rétention
paralysie postérieure,
urinaire
chat 1 ABAU(c) obstructive sondage vésical
sondage vésical difficile,
chat 2 ABAU(c) obstructive chirurgicale : 2
urétrostomies périnéales
chat 3 ABAU(c) obstructive sondage vésical répété
sondage vésical,
Chute de la fenêtre d’un
chat 4 ABAU(c) obstructive chirurgicale : urétrostomie
immeuble
périnéale
sondage vésical,
chat 5 ABAU(c) obstructive chirurgicale : urétrostomie
périnéale
sondage vésical,
cystite chronique,
chat 6 chirurgicale : urétrostomie
ABAU(c) obstructive
périnéale et cystotomie
sondage vésical,
chat 7 ABAU(c) obstructive, chirurgicale : urétrostomie
périnéale, cystotomie
(a) SDTE : syndrome dilatation torsion de l’estomac
(b) MNC : motoneurone central
(c) ABAU : affection du bas appareil urinaire
41
C. Infections du tractus urinaire précédant celle à C.
urealyticum
Le tableau 4 nous montre que seulement 5 animaux ont été atteints par une ITU
avant celle par C. urealyticum. C. urealyticum a été isolé dès la première analyse sur les
autres animaux.
Le chien 1 a été infecté par un germe uréasique mais le nom du germe est
inconnu. Cependant, un délai de 122 jours s’est écoulé entre les deux infections.
Le chien 6 a présenté deux infections 45 jours et 17 jours avant l’ITU par C.
urealyticum. Les germes concernés la première fois étaient E.Coli, Bacillus et
Enterococcus puis Streptococcus non groupable, la deuxième fois. Le premier EBU
regroupe trois germes et il existe une contamination probable du prélèvement.
Le chien 7 a été atteint par 3 ITU successives, d’abord par Proteus et
Enterococccus sp puis par E.coli puis par E.faecalis respectivement 365j, 60 jours et 30
jours avant. Le délai entre la première contamination et celle par C. urealyticum est très
long et par conséquent, un lien entre les deux évènements est très peu probable. Par
opposition les deux autres infections se manifestent dans un délai assez court.
Le chat 4 a été infecté par Enterococcus puis par Corynebacterium.sp et
Enterococcus Faecalis. Ce chat représente le seul animal où Corynebacterium n’a pas
été retrouvé en culture pure. Le germe associé est Enterococcus faecalis.
Le chat 5 a développé des ITU suite aux infections par Staphylococcus
intermedius puis par Klebsiella pneumoniae pneumoniae et Enterococcus faecalis
respectivement 17 jours et 9 jours avant l’ITU à C. urealyticum.
Parmi les 9 ITU, 7 ITU sont diagnostiquées entre 9 jours de 60 jours avant
l’infection par C. urealyticum et 5 ITU entre 9 jours et 30 jours.
42
D. Antibiothérapie préalable
Tous les animaux ont été traités par des antibiotiques au cours des 12 mois
précédant le diagnostic d’infection par C. urealyticum. Les antibiotiques utilisés sont :
la marbofloxacine, l’ofloxacine, l’orbifloxacine, l’enrofloxacine, la céfalexine,
l’amoxicilline et l’acide clavulanique, la sulfaméthoxypyridazine et le triméthoprime, la
sulfadoxine et la gentamicine.
E. Caractéristiques cliniques
2 Symptômes urinaires
Les symptômes retrouvés chez ces animaux étaient ceux observés chez les
animaux atteints de cystite, ils sont regroupés dans le tableau 5. Parmi ces symptômes,
on a retrouvé une pollakiurie chez 5 chiens sur 7 (71%) et chez 6 chats sur 7 (86%), une
dysurie chez 4 chiens (56%) et 4 chats (56%), une strangurie chez 3 chiens (42%) et 3
chats (42%). Ces symptômes étaient associés sur les mêmes animaux.
L’hématurie était le seul symptôme présent chez l’ensemble des individus. Elle
était de nature différente selon les animaux. Une hématurie macroscopique était visible
chez l’ensemble des individus avec, chez 3 chiens (42%) et 2 chats (28%) une émission
de sang en nature. Elle était sévère chez 50% des animaux soit 7 sur 14.
Une pyurie a été observée sur 3 chiens (42%) et 2 chats (28%). Les urines
étaient verdâtres chez un chien.
43
Tableau 5 : Symptomatologie des 14 animaux atteints par Corynebacterium urealyticum
chien chat total /14
URINAIRES
Hématurie (a) 7/7 (100%) 7/7 (100%) 14 (100%)
dysurie 4/7 (56%) 4/7 (56%) 8 (57%)
pollakiurie 5/7 (71%) 6/7 (86%)° 11 (79%)
strangurie 3/7 (42%) 3/7 (42%) 6 (43%)
pyurie 3/7 (42%) 2/7 (28%) 5 (36%)
GENERAUX
abattement 5/7 (71%) 3/7 (42%) 8 (57%)
SYMPTOMES
1/7 (14%)
3/7 (42%) hyperthermie et
température
hyperthermies 1/7 (14%)
hypothermie
44
Tableau 6: Analyse des échantillons d’urine
total chien Chat
bandelette urinaire
pH (moyenne) 8,4 8,6 [7,5 - 9] 8,3 [6 - 9]
pH alcalin 11/12 (92%) 6/6 (100%) 5/6 (83%)
nitrites 3/11 (27%° 1/5 (20%) 2/6 (33%)
sang 11/11 (100%) 5/5 (100%) 6/6 (100%)
glucose 1/11 (9%) 0/5 (0%) 1/6 (17%)
protéines 10/11 (91%) 4/5 (80%) 6/6 (100%)
culot urinaire
cylindres 4/12 (33%) 1/6 (17%) 3/5 (60%)
6/6 (100%) dont 6
5/5 (100%) dont 5
cristaux 11/11 (100%) PAM et 3 oxalates de
PAM
Calcium associés
globules rouges 9/11 (82%) 4/6 (67%) 5/5 (100%)
45
Figure 8 : Cristaux de Phosphate Ammoniaco Magnésien
H. Analyse sanguine
1 Paramètres biochimiques
Les valeurs d’urémie et de créatininémie ont été mesurées au moment du
diagnostic bactériologique de C. urealyticum.
Les valeurs d’urémie ont été obtenues pour 6 chiens et les valeurs de
créatininémie pour 5 chiens. La moyenne de l’urémie est de 0,3 g/l [0,17-1,82]. La
moyenne de la créatininémie est de 10,0 mg/l [8-29].
Les valeurs d’urémie ont été obtenues pour 5 chats et les valeurs de
créatininémie pour 6 chats. La moyenne d’urémie est de 0,67 g/l [0,39-4]. La moyenne
de créatininémie est de 14,6 mg/l [10-80].
Une insuffisance rénale aiguë post-rénale a été observée chez tous les chats suite
à leur obstruction urinaire. Elle a été levée chez tous les chats mais les valeurs d’urée et
de créatinine ne sont pas revenues à leur valeur normale chez quatre chats. Un chat était
toujours en insuffisance rénale aiguë post-rénale suite à la sténose de sa plaie
d’urétrostomie. Un autre a retrouvé des valeurs subnormales. Les deux derniers ont des
valeurs d’urémie et de créatininémie augmentées suite à l’ITU par C. urealyticum. Cette
situation est également retrouvée chez trois chiens.
46
muqueuses pâles et une anorexie étaient associés à ces deux anomalies biochimiques.
Cet état était évocateur d’un choc septique.
I. Imagerie
1 Radiographie abdominale
Elle a été pratiquée sur 5 animaux. Deux calculs vésicaux triangulaires ont été
retrouvés sur un chien. Les deux autres examens, y compris une urétrographie
rétrograde, n’ont révélé aucune anomalie.
2 Echographie abdominale
Cet examen a été pratiqué sur 6 chiens et 5 chats. De plus, un suivi
échographique a été pratiqué lorsqu’il était nécessaire et accepté par le propriétaire.
Les anomalies constatées sont :
- un épaississement pariétal vésical chez 4 chiens et 2 chats. Chez deux autres chats,
la taille de l’épaississement atteignait 2,5 à 3 mm. Chez ces 6 premiers animaux,
l’épaississement est supérieur à 6 mm avec une moyenne de 9,5 mm et un écart-type
de 2,8. Cette image caractérise une cystite qui est qualifiée de grave chez plusieurs
chiens.
- une paroi irrégulière chez 5 chiens et 2 chats. On visualise des images des brides
hyperéchogènes, des images de prolifération tissulaire et des décollements de paroi.
- des caillots vésicaux chez deux chiens et un caillot urétral obstructif chez un autre
chien. Un chat avait des cristaux et des calculs urétraux. Chez ces deux derniers
animaux, un épaississement pariétal urétral est mis en évidence évoquant une
urétrite.
- des calculs vésicaux sont présents chez 3 chiens et 4 chats et une cristallurie chez 3
chiens et 2 chats.
- une inflammation du tissu adipeux périvésical chez le chat 1 et une accumulation de
liquide traduisant une péritonite suite à une fuite urinaire très probable.
- une ligne hyperéchogène dans la paroi vésicale traduit la présence d’une incrustation
minérale ou cystite incrustée chez 6 chiens et 2 chats.
Le suivi échographique réalisé sur un chien montre sur la figure 9A une atteinte
vésicale caractéristique d’une cystite incrustée alors que la seconde, figure 9B, évoque
une guérison après le traitement.
47
La première (figure 9 A) montre une vessie épaissie avec un contour muqueux
très irrégulier ainsi que de nombreux calculs enchâssés dans la muqueuse. Ces images
sont caractéristiques d’une cystite incrustée chez les carnivores domestiques et ces
images, en accord avec la symptomatologie peuvent fortement conduire au diagnostic.
9A 9B
Figure 9 : 9A Image échographique caractéristique d'une cystite incrustée à
Corynebacterium urealyticum : paroi épaissie (6mm) avec un contour muqueux très
irrégulier et des incrustations minéralisées de la paroi vésicale. La lumière vésicale
contient de très nombreux calculs.
9B : Image échographique obtenue sur le même animal que l'image précédente,
après la guérison de la cystite incrustée.
Cet aspect macroscopique du tractus urinaire est visible au cours des chirurgies
par laparotomie et plus particulièrement au cours des cystotomies.
Le chien 3 avait une cystite ulcéro-nécrosante associée à deux méga-uretères.
Le chien 6 avait une paroi vésicale très épaissie de couleur lie de vin, avec de
très nombreux replis, et des calculs de toutes tailles.
Le chat 6 avait un placard nécrotique sur le tiers de sa surface.
Le chat 7 a subi une cystotomie sur calculs mais aucune anomalie de la paroi
vésicale n’est remarquée pendant cette chirurgie.
K. Analyse histologique
Ces analyses histologiques ont été réalisées sur des tissus vésicaux réalisés
prélevés pendant les cystotomies.
48
Chez le chien, la cystite est ulcéro-nécrotique, profonde, très sévère et extensive.
Chez le chat, la lésion observée est une cystite nécrosante sévère (diphtéroïde)
chronique.
L’analyse a été réalisée sur les calculs de grande taille obtenus suite à la
cystotomie. Ces calculs, obtenus chez un chien et deux chats, ont été analysés. L’aspect
macroscopique des calculs est visualisable sur la figure 10.
Cette analyse révèle une composition similaire chez les trois animaux, résultats
fournis par le tableau 7. 90% du calcul contient du phosphate-ammoniaco-magnésien.
Les 10% restants sont composés soit :
- De 10% de protéines
- De 5% de protéines et 5% de carbapatite
PAM : phosphate-ammoniaco-magnésien
49
M. Délai écoulé entre les manipulations urologiques et les
symptômes
Nombre
d’animaux 4 1 1 0 2 0 0 0 0 2
concernés
4
nombre de cas
0
0à5 6 à 10 10 à 15 16 à 20 21 à 25 26 à 30 31 à 35 36 à 40 41 à 45 50 et +
temps en jours
50
N. Délai écoulé entre les symptômes et le diagnostic
Nombre
d’animaux 2 2 1 1 1 0 0 0 0 5
concernés
4
nombre de cas
0
0à5 6 à 10 10 à 15 16 à 20 21 à 25 26 à 30 31 à 35 36 à 40 41 à 45 50 et +
temps en jours
O. Résultats d’EBU
Les résultats d’EBU obtenus sont compilés dans les annexes 1 à 33. Des EBU
négatifs ont été obtenus à l’extérieur de l’école vétérinaire d’Alfort sur quatre chiens.
Un chien et 6 chats ont subi des interventions sur le tractus urinaire en dehors de l’école
51
vétérinaire d’Alfort durant les mois précédant l’ITU à C. urealyticum. Ils exprimaient
des symptômes mais aucun EBU n’a été réalisé.
1 Bactérie isolée
Toutes les cultures dénombraient au moins 105 CFU/ml.
La bactérie est ensuite identifiée par galerie API Coryne.
C. urealyticum, comprenant C. urealyticum et Corynebacterium du groupe D2, a
été isolé 9 fois et Corynebacterium sp. a été isolé 6 fois. Ils ont été isolés en culture pure
pour 14 des 15 EBU. En effet, Corynebacterium sp a été isolé une fois avec
Enterococcus faecalis.
2 Prévalence de l’infection
La prévalence de l’infection est de 0,96% (4 cas d’infection par C. urealyticum
sur 418 urocultures) en 2002 et de 0,41% (2 cas d’infection par C. urealyticum sur 478
urocultures).
3 Antibiogramme
Tout d’abord, la sensibilité de Corynebacterium sp est similaire à celle de C.
urealyticum. En effet, ils sont résistants aux mêmes antibiotiques comme les β-
lactamines. Ils ont des résistances partielles ou inexistantes envers la tétracycline, la
polymyxine B, l’érythromycine ou la rifampicine.
52
Le tableau 10 ci-après fait une synthèse de l’antibiosensibilité des germes isolés.
Une résistance
P. Traitement et suivi
53
Associée au traitement antibiotique, une alimentation acidifiante est ajoutée afin
de favoriser la dissolution des struvites. Quatre chiens et un chat ont été nourris avec du
s/d® de Hill’s. Deux chats ont été alimentés avec du c/d® de Hill’s. Un chat et un chien
ont été alimentés avec du Urinary® de Waltham. Ce dernier a en plus été traité par de
l’acide phosphorique (Phosophorme®) à la posologie de 10 gouttes mélangées dans 10
ml matin et soir.
Chez deux chiens et cinq chats, des EBU négatifs ont confirmé d’une part
l’éradication de l’infection à C. urealyticum et d’autre part l’absence de recolonisation
de la vessie par d’autres germes.
Le chien 6 a été infecté ensuite par E.coli et Proteus mirabilis.
Le chien 7 a subi ultérieurement de très nombreuses infections (E.coli, Proteus
mirabilis, Enterococcus faecalis).
Le chat 4 a été infecté par Entérococcus faecalis.
54
III. DISCUSSION
Dans notre étude, le nombre de mâle est dominant avec 5 chiens et 7 chats. Le
lien entre le sexe et l’infection est plus évident dans l’espèce féline car les affections du
bas appareil urinaire atteignent principalement les chats mâles. En ce qui concerne les
chiens, il est plus difficile de conclure sur cette disproportion. Une seule affection était
spécifique du sexe, il s’agissait du kyste paraprostatique du chien 4. Les autres chiens
ont des affections pouvant atteindre les deux sexes. Une raison pratique, parfois
envisageable, est que le sondage urinaire est plus fréquent chez le mâle en raison de sa
facilité.
Une hyperthermie est décrite entre 25 et 50% chez l’homme. Notre étude
recense 4 cas d’hyperthermie sur 14, soit 29%. Seuls deux cas d’hyperthermie sont
décrits par SUAREZ et al.(41) et ELAD et al(9). La calcification du méat urinaire
55
externe retrouvé chez un chat est un symptôme très évocateur d’une infection à C.
urealyticum chez l’homme. L’hématurie macroscopique retrouvée chez tous les
animaux et la pyurie (chez 36% des animaux) sont deux symptômes évocateurs en
médecine vétérinaire comme en médecine humaine. L’odeur ammoniacale des urines
ainsi que l’émission de particules calcifiées macroscopiques dans les urines sont rares
mais pathognomoniques d’une cystite à germes uréasiques. L’odeur ammoniacale des
urines n’a été retrouvée que chez un chien.
L’analyse urinaire doit évaluer 3 critères essentiels : le pH, la leucocyturie, la
présence de cristaux de PAM. 100% des animaux présentent ces anomalies sauf un chat
ayant des urines acides (pH= 6,5). Les autres études mettent en évidence un pH alcalin
mais l’ensemble des cas ne regroupe pas les 3 critères cités ci-dessus.
Comme le décrivent BAILIFF et al. (3), d’autres germes uréasiques, comme
Proteus mirabilis et Staphylococcus spp, sont des agents plus fréquents de cystite avec
des caractéristiques urinaires similaires. La suspicion de C. urealyticum comme agent
est le fait de la persistance des symptômes et des anomalies urinaires malgré une
antibiothérapie. De plus, un pH souvent très basique supérieur à 8 et atteignant souvent
9 est un symptôme évoquant une infection par C. urealyticum.
Le spectre de résistance est similaire à ceux décrits par DE BRIEL et al. (7),
ELAD et al. (9), GOMEZ et al. (18), KRAMER et al (21). Une résistance marquée
envers les pénicillines sauf pour un germe de notre étude, une résistance relative envers
les tétracyclines, la rifampicine et les quinolones. En médecine vétérinaire, l’emploi de
la rifampicine est déconseillé car il s’agit d’un antituberculeux. Il en est de même pour
les glycopeptides. Néanmoins, il aurait été intéressant de les tester en laboratoire pour
évaluer le spectre de résistance. De plus, SUAREZ et al.(41) et ELAD et al.(9) ont
utilisé des glycopeptides, et GOMEZ et al (18).ont utilisé de la rifampicine. Ces auteurs
obtiennent une guérison des animaux traités. Chez quatre animaux, le germe n’était
sensible qu’à la rifampicine ce qui débouchait sur une impasse thérapeutique. Ils ont été
traités par un antibiotique large spectre pour éviter les surinfections en attente des
résultats d’EBU. Ensuite le traitement a été poursuivi sans malheureusement de suivi
possible.
56
La cystoscopie est utilisable en médecine vétérinaire et BAILIFF et al. (21) l’utilise sur
3 animaux. Aucun de nos animaux n’a pu être suivi par cet examen.
L’échographie nous a permis d’identifier 8 cystites incrustées. Cette
minéralisation vésicale associée à des cristaux de struvite n’est pas spécifique d’une
infection par C. urealyticum mais cette infection doit être évoquée lors de cystite
incrustée. Le diagnostic d’atteinte vésicale suite à une infection par C. urealyticum a
ensuite été confirmé par un EBU. Les images échographiques obtenues sont variables
dans leur échotexture et leur forme. BAILIFF et al. (21) décrivent des images de
« sédiments le long de la paroi qui ne tombe pas quand l’animal est retourné ».
En médecine humaine, le scanner permet de réaliser un suivi, examen trop
onéreux pour la médecine vétérinaire, et supplanté par l’échographie. Ce suivi permet
de statuer sur la poursuite ou l’arrêt du traitement ainsi que son efficacité.
57
doxycycline n’est excrétée qu’à hauteur de 25% dans les urines ce qui ne permet pas
d’obtenir la concentration efficace. Deux animaux de notre étude ont une
antibiothérapie inadaptée car le germe n’était sensible qu’à la rifampicine. BAILIFF et
al. (3) ont souligné une guérison malgré une antibiothérapie inadaptée sur deux chiens
et la même constatation est faite en médecine humaine.
L’acidification des urines est un facteur important pour la guérison du fait de
l’élimination d’un des facteurs de croissance de C. urealyticum. Elle était peu mise en
place sur les premiers cas de notre étude puis fut instaurée. Elle est composée d’acide
phosphorique, de vitamine C en majorité. KRAMER et al. (21) définissent
l’acidification comme un élément très important. BAILIFF et al. (3) proposent d’utiliser
la solution de Suby en injection intravésicale.
Le débridement réalisé en médecine humaine est peu possible en médecine
vétérinaire étant donné l’étendue des lésions lors de la découverte de la cystite
incrustée. Elle est toutefois pratiquée par BAILIFF et al. (3) et ils ont considéré obtenir
une guérison totale grâce aux débridements et aux autres mesures thérapeutiques mises
en place.
Cette affection reste rare chez les carnivores domestiques. Les manipulations du
tractus urinaire et les affections neurologiques affectant la miction présentent sur
l’ensemble de nos cas, restent des facteurs majeurs de prédisposition. Cette affection
doit être suspectée sur un animal présentant des symptômes de cystite avec un pH
urinaire supérieur à 7 et des cristaux de PAM. Le milieu de culture doit être conservé
plus de 48 heures. Le pronostic de cette atteinte doit être réservé. Il est plutôt bon
lorsque le diagnostic est précoce et que les lésions vésicales ne sont pas trop étendues.
L’antibiothérapie adaptée à l’antibiogramme est une condition sine qua non pour obtenir
la guérison, associée à une acidification des urines.
58
CONCLUSION
59
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62
ANNEXES
63
64
Annexe 1 : Résultats d’uroculture du chien 1
65
Annexe 2 : Antibiogramme d’uroculture du chien 1
66
Annexe 3 : Résultats d’uroculture du chien 1
67
Annexe 4 : Antibiogramme d’uroculture du chien 1
68
Annexe 5: Résultats d’uroculture du chien 2
69
Annexe 6: Antibiogramme d’uroculture du chien 2
70
Annexe 7: Résultats d’uroculture du chien 2
71
Annexe 8: Résultats d’uroculture du chien 3
72
Annexe 9: Antibiogramme d’uroculture du chien 3
73
Annexe 10: Résultats d’uroculture du chien 4
74
Annexe 11: Antibiogramme d’uroculture du chien 4
75
Annexe 12: Résultats d’uroculture du chien 5
76
Annexe 13: Antibiogramme d’uroculture du chien 5
77
Annexe 14: Résultats d’uroculture du chien 5
78
Annexe 15: Antibiogramme d’uroculture du chien 5
79
Annexe 16: Résultats d’uroculture du chien 6
80
Annexe 17: Antibiogramme d’uroculture du chien 6
81
Annexe 18: Résultats d’uroculture du chien 7
82
Annexe 19: Antibiogramme d’uroculture du chien 7
83
Annexe 20: Résultats d’uroculture du chat 1
84
Annexe 21: Antibiogramme d’uroculture du chat 1
85
Annexe 22: Résultats d’uroculture du chat 2
86
Annexe 23: Antibiogramme d’uroculture du chat 2
87
Annexe 24: Résultats d’uroculture du chat 3
88
Annexe 25: Antibiogramme d’uroculture du chat 3
89
Annexe 26: Résultats d’uroculture du chat 4
90
Annexe 27: Antibiogramme d’uroculture du chat 4
91
Annexe 28: Antibiogramme d’uroculture du chat 4
92
Annexe 29: Résultats d’uroculture du chat 5
93
Annexe 30: Antibiogramme d’uroculture du chat 5
94
Annexe 31: Résultats d’uroculture du chat 6
95
Annexe 32: Antibiogramme d’uroculture du chat 6
96
Annexe 33: Résultats d’uroculture du chat 7
97
Annexe 34: Antibiogramme d’uroculture du chat 7
98
Résumé
L’infection du tractus urinaire par Corynebacterium urealyticum a été
décrite pour la première fois en 1992 chez les chiens et les chats. Elle reste une
2005 affection rare. Ce faible taux d’infection peut être du à un sous diagnostic
résultant de la difficulté à isoler C. urealyticum lors d’uroculture.
Quatorze cas d’infection du tractus urinaire par C. urealyticum (7chiens
et 7 chats) ont été diagnostiqués à l’Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort entre
CARNIVORE DOMESTIQUES : ETUDE RETROSPECTIVE A PARTIR DE 14 CAS
1998 et 2004. L’analyse des dossiers retenus montre que cette affection touche
INFECTION DU TRACTUS URINAIRE A CORYNEBACTERIUMCHEZ LES
Summary
The infection by Corynebacterium urealyticum of the urinary tract was
described for the first time in 1992 in dogs and cats. It is a rare affection. This
low rate of infection is probably due to an under diagnostic resulting to the
difficulty to isolate C. urealyticum from urine.
Fourteen cases of urinary tract infection due to C. urealyticum (7 dogs
and 7 cats) were diagnosed at Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort from 1998 to
2004. The study of the clinical informations shows that affection reaches
animals with cause of predisposition (surgery, manipulation or neurology
deficiency of urinary tract). A macroscopic hematury, a pyury were found in 13
animals (93%). Urine tests show an alkaline urinary pH (>8.5 for 67%), struvite
stones, a leucocytury and a hematury.
Scan allows suspecting strongly this infection since we see a thickness
of vesical wall and encrusted mineralizations (encrusted cystitis) discovered in 8
animals of our study.
Treatment is difficult because of belated diagnosis and severe
antibioresistance of this germ. Susceptibility to tetracycline stay the most
frequent and the only for 6 animals of our study. Resistant germs to all
antibiotics tested were found in 2 animals.
A recovery is obtained in 9 animals following adapted antibiotherapy,
DUTHEL M.