Cette technique de séparation et purification est très populaire dans les laboratoires car ses avantages

sont nombreux mais aussi elle a des inconvénients:

-Grande rapidité de la purification, gain de temps important.

-Volume de collecte plus faible.

-Temps d’évaporation réduit.

-Coût de l’instrumentation très abordable.

-colonne économique.

-Grande capacité de charge des colonnes

-Colonne réutilisable de très nombreuses fois pour des silices greffés

-Grande diversité de phase stationnaire (Silice vierge, silice greffée (NH2, diol, Cn, …), Alumine, Echange
d’ion…)

-En raison du système ouvert, il peut être affecté par de nombreux facteurs tels que la température,
l'humidité, etc.

-Un autre inconvénient de la chromatographie flash est l'adsorption irréversible des solutés.

-Les inconvénients d'une longue phase stationnaire dans la colonne sont chronophages

-Une plus grande quantité de solvants est nécessaire pour la séparation, ce qui est plus coûteux.

-Le chargement manuel de silice peut entraîner des erreurs dans le processus.