menunjukkan apa yang masing-masing asam amino dari 64 kodon menentukan.

Table 2 shows what codons specify each of the 20 standard amino acids involved in translation. Tabel 2 menunjukkan apa kodon menentukan masing-masing dari 20 asam amino standar yang terlibat dalam penerjemahan. These are called forward and reverse codon tables, respectively. Ini disebut maju dan mundur tabel kodon, masing-masing. For example, the codon AAU represents the amino acid asparagine , and UGU and UGC represent cysteine (standard three-letter designations, Asn and Cys, respectively). [ 8 ] :522 Sebagai contoh, AAU merupakan kodon asam amino asparagin , dan UGU UGC mewakili dan sistein (standar tiga huruf sebutan, Asn, dan Cys, masing-masing). [8] : 522

[ edit ] RNA codon table [ sunting ] kodon RNA tabel
nonpolar nonpolar polar kutub basic dasar acidic asam (stop codon) (Berhenti kodon) UU (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin 2nd base 2 dasar CC A Sebuah (Tyr/Y) (Ser/S) UAU Tyrosine Serine (Ser UAU (Tyr / Y) / S) serin Tirosin (Tyr/Y) (Ser/S) UAC Tyrosine Serine (Ser UAC (Tyr / Y) / S) serin Tirosin Stop ( (Ser/S) UAA Ochre ) Serine (Ser UAA Berhenti / S) serin (Ochre) Stop ( (Ser/S) UAG Amber ) Serine (Ser UAG Stop / S) serin (Amber) (Pro/P) (His/H) Proline CAU Histidine (/ (Pro / P) CAU Nya H) Proline histidin (Pro/P) (His/H) Proline CAC Histidine (/ (Pro / P) CAC Nya H) Proline histidin (Pro/P) (Gln/Q) Proline CAA Glutamine (Pro / P) CAA (GLN / T) Proline Glutamin GG (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina

UUU UUU

UCU UCU

UGU UGU

UUC UUC UU UUA UUA 1st base 1 dasar

UCC UCC

UGC UGC

(Leu/L) UCA Leucine (Leu / UCA L) Leusin (Leu/L) UCG Leucine (Leu / UCG L) Leusin (Leu/L) CCU Leucine (Leu / CCU L) Leusin (Leu/L) CCC Leucine (Leu / CCC L) Leusin (Leu/L) CCA Leucine (Leu / CCA L) Leusin

Stop ( Opal UGA ) Stop UGA (Opal) UGG UGG (Trp/W) Tryptophan (Trp / W) Tryptophan (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin

UUG UUG

CUU Cuu

CGU CGU

CC

CUC CUC

CGC LKP

CUA CUA

CGA CGA

(Pro/P) (Leu/L) CCG Proline Leucine (Leu / CCG (Pro / P) L) Leusin Proline (Thr/T) (Ile/I) AUU ACU Threonine Isoleucine (Ile AUU ACU (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Thr/T) (Ile/I) AUC ACC Threonine Isoleucine (Ile AUC ACC (Thr / T) / I) isoleucine treonin A Sebuah (Thr/T) (Ile/I) AUA ACA Threonine Isoleucine (Ile AUA ACA (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Met/M) (Thr/T) AUG [A] Methionine ACG Threonine Agustus ACG (Thr / T) (Met / M) [A] Metionin treonin CUG CUG (Gln/Q) CAG Glutamine CAG (GLN / T) Glutamin (Asn/N) AAU Asparagine AAU (Asn / N) Asparagin (Asn/N) AAC Asparagine AAC (Asn / N) Asparagin (Arg/R) CGG Arginine CGG (Arg / R) Arginin (Ser/S) AGU Serine (Ser / AGU S) serin (Ser/S) AGC Serine (Ser / AGC S) serin (Arg/R) (Lys/K) AAA AGA Arginine Lysine (Lys AAA AGA (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Arg/R) (Lys/K) AAG AGG Arginine Lysine (Lys AAG Agg (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUU GCU Alanine GAU GGU Glycine (Val / V) acid (Asp / GUU GCU (Ala / A) GAU GGU (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUC GCC Alanine GAC GGC Glycine (Val / V) acid (Asp / GUC GCC (Ala / A) GAC GGC (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat GG (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUA GCA Alanine GAA GGA Glycine (Val / V) acid (Glu / Gua GCA (Ala / A) GAA GGA (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUG GCG Alanine GAG GGG Glycine (Val / V) acid (Glu / GUG GCG (Ala / A) GAG GGG (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat A The codon AUG both codes for methionine and serves as an initiation site: the first AUG in an mRNA 's coding region is where translation into protein begins. [ 9 ] Sebuah kodon ini Agustus kedua kode untuk metionin dan berfungsi sebagai situs inisiasi: yang .

ACG ACU. UGC Gln/Q CAA. UUC UUU. GAC Cys/C UGU. CCA. GCG Arg/R CGU. Ser/S Ser / S UCU. AGC GLN / CAA. CUG Ala / A GCC. Lys/K Lys / K AAA. GCC. AGG CGU. CUU. UCA. Agg Asn/N AAU.Agustus pertama dalam mRNA kawasan coding adalah di mana terjemahan dalam protein dimulai. GAG Gly/G GGU. [9] Inverse table Invers tabel Ala/A GCU. ACC. CGG. AAC Asp/D GAU. CUC. CCC. UUG. AGU. CGA. Met/M Met / M AUG Agustus Asn / N AAC AAU. GCA. CGC. CUA. CCG Cys / C UGC UGU. CGA. AAG Arg / R CGC. GCG GCU. Phe/F Phe / F UUU. ACC. ACG Glu / E GAG GAA. ACA. UCC. CGG. AGU. UUC Asp / D GAC GAU. UCA. ACA. Trp/W Trp / W UGG UGG . CCA. UUG. CUA. CCC. Pro/P Pro / P CCU. Cuu. UCC. UCG. Thr/T Thr / T ACU. T CAG Glu/E GAA. AAG AAA. CUC. GCA. CAG UCG. CCG CCU. AGA. AGC UCU. AGA. CUG UUA. Leu/L Leu / L UUA.

GUC. the string GGGAAACCC. and. AUA UAA. atau Glu-Thr. GUG AUC. jika membaca mulai dari posisi ketiga. Sebagai contoh. Gly-Lys-Pro. Gly-Asn. or Glu-Thr. Tabel kodon DNA pada dasarnya identik dengan bahwa untuk RNA. three in the forward . [ edit ] Salient features [ sunting ] fitur penting [ edit ] Sequence reading frame [ sunting ] Urutan bingkai membaca A codon is defined by the initial nucleotide from which translation starts. gua. GAA dan ACC. tetapi dengan U digantikan oleh T . GUC. For example. berisi GGG kodon. GGC. it contains the codons GGA and AAC. if read starting from the third position. if read from the first position. contains the codons GGG. GGA. berisi GGA kodon dan AAC. UAC UAU. Every sequence can thus be read in three reading frames . respectively).Gly / G GGC. GGA. UGA. if read from the second position. masing-masing akan menghasilkan urutan asam amino yang berbeda (dalam contoh yang diberikan. Gly-Asn. GGG His/H CAU. Val/V Val / V GUU. string GGGAAACCC. masingmasing). jika dibaca dari posisi pertama. Tyr/Y Tyr / Y UAU. but with U replaced by T . AAA dan CCC. GGG GGU. GUA. dan. UGA. UAC Nya / H CAC CAU. AUC. GAA and ACC. jika dibaca dari posisi kedua. each of which will produce a different amino acid sequence (in the given example. GUG GUU. AAA and CCC. UAG UAA. Setiap urutan sehingga dapat dibaca dalam tiga frame membaca . UAG START AUG STOP MULAI Agustus BERHENTI [ edit ] DNA codon table [ sunting ] DNA kodon tabel Main article: DNA codon table Artikel utama: DNA tabel kodon The DNA codon table is essentially identical to that for RNA. CAC Ile/I Ile AUU. /I AUA AUU. Sebuah kodon didefinisikan oleh nukleotida awal dari terjemahan mana yang dimulai. Gly-Lys-Pro. With double-stranded DNA there are six possible reading frames .

kodon saja tidak cukup untuk memulai proses. Kodon start paling umum adalah Agustus yang dibaca sebagai metionin atau. [10] : 330 frame yang sebenarnya di mana urutan protein diterjemahkan didefinisikan oleh kodon start . Ketiga kodon stop telah diberi nama: UAG menyala kuning. tetapi sebagai kodon start. UGA merupakan opal (kadang-kadang juga disebut Umber). usually the first AUG codon in the mRNA sequence. Alternative start codons (depending on the organism). [ 10 ] :330 The actual frame in which a protein sequence is translated is defined by a start codon . "Amber" disebut oleh penemu Richard Epstein dan Charles Steinberg setelah teman mereka Harris Bernstein. coli ) and initiation factors are also required to start translation. Dengan DNA beruntai ganda mungkin ada enam frame membaca . Urutan terdekat (seperti Shine-Dalgarno urutan dalam E. dan sehingga faktor rilis mengikat ribosom. yang terakhir namanya berarti "kuning" dalam bahasa Jerman. these codons normally represent valine and leucine. but as a start codon. respectively. Stop codons are also called "termination" or "nonsense" codons. as formylmethionine. [ 12 ] Mereka sinyal pelepasan polipeptida baru lahir dari ribosom karena tidak ada tRNA yang serumpun yang telah anticodons pelengkap untuk sinyal-sinyal berhenti. include "GUG" or "UUG". whose last name means "amber" in German. Kodon stop juga disebut "penghentian" atau "omong kosong" kodon. Tidak seperti kodon stop. [ 11 ] Kodon mulai Alternatif (tergantung pada organisme). and UAA is ochre . biasanya yang pertama Agustus di urutan kodon mRNA.. they are translated as methionine or formylmethionine. The most common start codon is AUG which is read as methionine or. Terjemahan dimulai dengan rantai kodon inisiasi (kodon start). tiga orientasi ke depan pada satu untai dan tiga mundur pada untai berlawanan. "Amber" was named by discoverers Richard Epstein and Charles Steinberg after their friend Harris Bernstein. Unlike stop codons. Dua lainnya kodon stop diberi nama "oker" dan "opal" untuk menjaga "nama warna" tema. in bacteria. coli ) dan faktor inisiasi juga dibutuhkan untuk memulai penerjemahan. bukan. the codon alone is not sufficient to begin the process. masing-masing. [ edit ] Start/stop codons [ sunting ] Mulai / stop kodon Translation starts with a chain initiation codon (start codon). termasuk "GUG" atau "UUG". Kodon ini biasanya mewakili valin dan leusin. UGA is opal (sometimes also called umber ). Nearby sequences (such as the Shine-Dalgarno sequence in E.orientation on one strand and three reverse on the opposite strand. They signal release of the nascent polypeptide from the ribosome because there is no cognate tRNA that has anticodons complementary to these stop signals. dan UAA adalah oker. and so a release factor binds to the ribosome instead. The other two stop codons were named "ochre" and "opal" in order to keep the "color names" theme. [12] [ edit ] Effect of mutations [ sunting ] Pengaruh mutasi . pada bakteri. mereka diterjemahkan sebagai metionin atau formilmetionin [11] The three stop codons have been given names: UAG is amber . sebagai formilmetionin.

[ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Clinically important missense mutations generally change the properties of the coded amino acid residue between being basic. These errors. [ 14 ] [ 15 ] Tingkat kesalahan biasanya kesalahan yang sangat rendah-1 di setiap 10-100 juta basis-karena kemampuan "proofreading" dari DNA polimerase . [16] [17] [18] mutasi missense klinis yang penting pada umumnya mengubah properti dari residu asam amino antara kode menjadi dasar. dan juga sangat mungkin untuk menyebabkan kodon stop untuk dibaca. and are thus rare in in vivo protein-coding sequences. These mutations usually result in a completely different translation from the original. [13] During the process of DNA replication . Mutasi yang mengganggu urutan frame membaca dengan indels ( insersi atau penghapusan ) dari non-kelipatan 3 basa nukleotida yang dikenal sebagai mutasi frameshift . [19] Mutasi ini dapat mengganggu fungsi dari protein yang dihasilkan. sedangkan mutasi nonsense menghasilkan kodon stop . yang dapat menyebabkan penyakit genetik seperti penyakit sel sabit dan talasemia masing-masing. which truncates the creation of the protein. and are also very likely to cause a stop codon to be read. [14] [15] Missense mutations and nonsense mutations are examples of point mutations . dapat memiliki dampak pada fenotipe organisme. yang disebut mutasi . acidic polar or non-polar. [ 20 ] Frameshift . dan demikian jarang terjadi di in vivo protein-coding urutan. Mutasi ini biasanya menghasilkan terjemahan yang sama sekali berbeda dari aslinya.Examples of notable mutations that can occur in humans. [ 19 ] These mutations may impair the function of the resulting protein. [ 13 ] Contoh terkenal mutasi yang dapat terjadi pada manusia. One reason inheritance of frameshift mutations is rare is that if the protein being translated is essential for growth under the selective pressures the organism faces. can have an impact on the phenotype of an organism. especially if they occur within the protein coding sequence of a gene. [10] : 266 Mutations that disrupt the reading frame sequence by indels ( insertions or deletions ) of a nonmultiple of 3 nucleotide bases are known as frameshift mutations . asam polar atau non polar. whereas nonsense mutations result in a stop codon . yang memotong penciptaan protein. kadang-kadang terjadi kesalahan dalam polimerisasi untai kedua. [ 10 ] :266 Missense mutasi dan mutasi nonsense adalah contoh dari mutasi titik . errors occasionally occur in the polymerization of the second strand. absence of a functional protein may cause death before the organism is viable. Selama proses replikasi DNA . which can cause genetic diseases such as sickle-cell disease and thalassemia respectively. called mutations . Error rates are usually very low²1 error in every 10±100 million bases²due to the "proofreading" ability of DNA polymerases . terutama jika mereka terjadi dalam urutan pengkode protein dari gen. Kesalahan ini.

asam amino leusin ditentukan oleh UUA. CUC. while the amino acid serine is specified by UCA. For example the amino acid glutamic acid is specified by GAA and GAG codons (difference in the third position). mutasi yang menguntungkan beberapa mungkin co-terjadi. [8] :521-522 . adanya protein fungsional dapat menyebabkan kematian sebelum organisme yang layak. Kodon pengkodean satu asam amino dapat berbeda dalam setiap dari tiga posisi. For example. UCC. CUA. UCU. the amino acid leucine is specified by UUA. coli . kedua atau ketiga). [26] [ edit ] Degeneracy [ sunting ] degenerasi Degeneracy is the redundancy of the genetic code. Dalam kasus ini mutasi akan cenderung menjadi lebih umum pada populasi melalui seleksi alam . multiple beneficial mutations may cooccur.mutations may result in severe genetic diseases such as Tay-Sachs disease . UCG. [ 21 ] Salah satu alasan warisan mutasi frameshift jarang adalah bahwa jika protein yang diterjemahkan sangat penting untuk pertumbuhan di bawah tekanan selektif wajah organisme. second or third position). CUU. E. CUA. CUG kodon (perbedaan dalam posisi pertama atau ketiga) . tapi tidak ada ambiguitas (lihat tabel kodon di atas untuk korelasi penuh). AGU. dan dengan demikian menghindari tanggapan defensif misalnya manusia sistem kekebalan tubuh . Kode genetik memiliki redundansi. or reproduce more quickly. [ 23 ] Viruses that use RNA as their genetic material have rapid mutation rates. [ 26 ] Fenomena ini disebut gangguan klonal dan menyebabkan persaingan di antara mutasi. Degenerasi adalah redundansi kode genetik. [25] Dalam populasi besar organisme aseksual reproduksi. for example. The codons encoding one amino acid may differ in any of their three positions. although codons GAA and GAG both specify glutamic acid (redundancy). [24] yang dapat keuntungan karena virus ini akan berkembang terus-menerus dan cepat . UCG. [ 24 ] which can be an advantage since these viruses will evolve constantly and rapidly. [21] Although most mutations that change protein sequences are harmful or neutral. The genetic code has redundancy but no ambiguity (see the codon tables above for the full correlation). UCU. Cuu. misalnya. AGC (difference in the first. atau mereproduksi lebih cepat. In these cases a mutation will tend to become more common in a population through natural selection . E. AGU. meskipun kodon GAA dan GAG baik tentukan asam glutamat (redundansi). This phenomenon is called clonal interference and causes competition among the mutations. [22] Mutasi ini dapat mengaktifkan organisme untuk menahan tekanan mutan lingkungan tertentu lebih baik dari tipe liar organisme. neither of them specifies any other amino acid (no ambiguity). Sebagai contoh. [20] mutasi frameshift dapat mengakibatkan berat penyakit genetik seperti penyakit Tay-Sachs . UCC. coli. UUG. and thus evade the defensive responses of eg the human immune system . [ 25 ] In large populations of asexually reproducing organisms. [23] Virus yang menggunakan RNA sebagai bahan genetik mereka memiliki tingkat mutasi cepat. beberapa mutasi memiliki efek positif pada suatu organisme. UUG. CUG codons (difference in the first or third position). keduanya tidak merinci setiap asam amino lain (ambiguitas). CUC. some mutations have a positive effect on an organism. AGC (perbedaan dalam posisi pertama. sedangkan asam amino serin ditentukan oleh UCA. [ 8 ] :521±522 Misalnya asam amino asam glutamat ditentukan oleh kodon GAA dan GAG (perbedaan dalam posisi ketiga). Meskipun sebagian besar mutasi yang mengubah urutan protein berbahaya atau netral. [ 22 ] These mutations may enable the mutant organism to withstand particular environmental stresses better than wild-type organisms.

[ 8 ] :521±522 Dalam perhitungan posisi ini sering dianggap sebagai situs merosot dua kali lipat. dan arginin . Ini adalah posisi ketiga dari isoleusin kodon: AUU. nukleotida setara selalu baik dua purin (A / G) atau dua pirimidin (C / U). mereka tidak mengubah asam amino. which also specifies the start of translation. In twofold degenerate sites. so only transversional substitutions (purine to pyrimidine or pyrimidine to purine) in twofold degenerate sites are nonsynonymous. yang lain adalah triptofan . posisi ketiga dari asam glutamat kodon (GAA. yaitu. For example. GGG. [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs non-merosot jika ada mutasi pada hasil posisi di substitusi asam amino. GGC. while changing to the fourth possible nucleotide always results in an amino acid substitution. because all nucleotide substitutions at this site are synonymous. tapi Agustus mengkodekan metionin . The degeneracy of the genetic code is what accounts for the existence of synonymous mutations . GAG) is a twofold degenerate site. GAG) adalah situs merosot dua kali lipat. Salah satunya adalah asam amino metionin . if there were two bases per . the equivalent nucleotides are always either two purines (A/G) or two pyrimidines (C/U). AUC. For example. For example. but AUG encodes methionine . leucine . or AUA all encode isoleucine. Hanya posisi ketiga dari beberapa kodon mungkin empat kali lipat merosot. sehingga hanya substitusi transversional (purin atau pirimidin ke pirimidin untuk purin) di dua situs yang nonsynonymous merosot. specified by the codon AUG. Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot empat kali lipat jika ada nukleotida pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. GGC. sedangkan perubahan ke yang mungkin keempat nukleotida selalu menghasilkan sebuah substitusi asam amino. [8] :521-522 There are three amino acids encoded by six different codons: serine . atau AUA semua menyandikan isoleusin. This is the third position of an isoleucine codon: AUU. Misalnya. [8] : CHP 15 Degeneracy results because there are more codons than encodable amino acids. the other is tryptophan . the third position of the glycine codons (GGA. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a twofold degenerate site if only two of four possible nucleotides at this position specify the same amino acid. specified by the codon UGG. One of these is the amino-acid methionine . Dalam dua merosot situs. Hanya ada satu tiga merosot situs mana perubahan ke tiga dari empat nukleotida mungkin tidak memiliki efek pada asam amino (tergantung pada apa itu diubah menjadi). leusin . karena semua substitusi nukleotida di situs ini adalah sama. Only two amino acids are specified by a single codon. Hasil degenerasi karena ada lebih dari kodon asam amino encodable. Ada tiga asam amino dikode oleh enam kodon berbeda: serin . GGU) is a fourfold degenerate site. posisi ketiga dari glisin kodon (GGA. ditentukan oleh kodon Agustus. ditentukan oleh UGG kodon. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a non-degenerate site if any mutation at this position results in amino acid substitution. Hanya dua asam amino ditentukan oleh kodon tunggal. Only the third positions of some codons may be fourfold degenerate. GGU) adalah situs merosot empat kali lipat. ie. they do not change the amino acid. AUC. yang juga menentukan awal terjemahan. [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot ganda jika hanya dua dari empat nukleotida mungkin pada posisi ini menentukan asam amino yang sama.A position of a codon is said to be a fourfold degenerate site if any nucleotide at this position specifies the same amino acid. [ 8 ] :Chp 15 Degenerasi dari kode genetik adalah apa account untuk keberadaan mutasi sinonim . There is only one threefold degenerate site where changing to three of the four nucleotides may have no effect on the amino acid (depending on what it is changed to). In computation this position is often treated as a twofold degenerate site. GGG. the third position of the glutamic acid codons (GAA. and arginine . Misalnya.

[8] :521-522 These properties of the genetic code make it more fault-tolerant for point mutations . dan jumlah terbesar berikutnya pangkalan adalah tiga. a codon of NUN (where N = any nucleotide) tends to code for hydrophobic amino acids. yang berarti bahwa degenerasi beberapa harus ada. Because at least 21 codes are required (20 amino acids plus stop). in theory. although codon usage bias restricts this in practice in many organisms. . for example. dalam teori. twofold degenerate codons can tolerate one out of the three possible point mutations at the third position. Sebagai contoh.codon. A practical consequence of redundancy is that some errors in the genetic code only cause a silent mutation or an error that would not affect the protein because the hydrophilicity or hydrophobicity is maintained by equivalent substitution of amino acids. dua merosot kodon bisa mentolerir satu dari tiga kemungkinan mutasi titik pada posisi ketiga. [8 ] :531-532 Grouping of codons by amino acid residue molar volume and hydropathy . the equivalence of purines or that of pyrimidines at twofold degenerate sites adds a further fault-tolerance. Pengelompokan kodon oleh residu asam amino Volume molar dan pengobatan air . maka hanya 16 asam amino bisa dikodekan untuk (4 = 16). empat kali lipat merosot kodon dapat mentolerir setiap mutasi titik pada posisi ketiga. fourfold degenerate codons can tolerate any point mutation at the third position. meskipun penggunaan kodon bias yang membatasi praktek di dalam banyak organisme. [ 8 ] :521±522 Karena setidaknya 21 kode yang diperlukan (20 asam amino ditambah berhenti). Konsekuensi praktis dari redundansi adalah bahwa beberapa kesalahan dalam kode genetik hanya menyebabkan mutasi diam atau kesalahan yang tidak akan mempengaruhi protein karena hidrofilisitas atau hidrofobik dipertahankan dengan substitusi setara dengan asam amino. kesetaraan purin atau pirimidin yang dari pada dua merosot situs menambahkan toleransi kesalahan-lanjut. Misalnya. For example. Since transition mutations (purine to purine or pyrimidine to pyrimidine mutations) are more likely than transversion (purine to pyrimidine or vice-versa) mutations. [ 8 ] :531±532 Sejak transisi mutasi (purin atau pirimidin untuk purin untuk mutasi pirimidin) lebih mungkin dibandingkan transversi (purin untuk pirimidin atau sebaliknya) mutasi. and the next largest number of bases is three. kemudian 4 ³ memberikan 64 kodon mungkin. then 4³ gives 64 possible codons. jika ada dua basis per kodon. Sifat-sifat dari kode genetik membuatnya lebih fault-tolerant untuk mutasi titik . then only 16 amino acids could be coded for (4 =16). meaning that some degeneracy must exist.

[ 33 ] and small variants such as translation of the codon UGA as tryptophan in the species Mycoplasma .misalnya. single point mutations can still cause dysfunctional proteins. Substitusi glutamat oleh valin mengurangi kelarutan -globin yang menyebabkan hemoglobin untuk membentuk polimer linier dihubungkan oleh interaksi hidrofobik antara kelompok valin. causing sickle-cell deformation of erythrocytes . For example. Rather it is selected for in geographic regions where malaria is common (in a way similar to thalassemia ). mutasi titik tunggal masih dapat menyebabkan protein disfungsional. [27] [28] Kecenderungan ini mungkin hasil dari keturunan bersama dari tRNA aminoasil sintetase terkait dengan kodon. The substitution of glutamate by valine reduces the solubility of -globin which causes hemoglobin to form linear polymers linked by the hydrophobic interaction between the valine groups. and the base-pair formed is called a wobble base pair . bermutasi hemoglobin gen penyebab penyakit sel sabit . yaitu GAA atau GAG menjadi gua atau GUG. Penyakit sel sabit pada umumnya tidak disebabkan oleh de novo mutasi . [29] These variable codes for amino acids are allowed because of modified bases in the first base of the anticodon of the tRNA. Many slight variants have been discovered since then. menyebabkan sel sabit deformasi dari eritrosit . ketika para peneliti mempelajari gen mitokondria manusia menemukan mereka menggunakan kode alternatif. [ 27 ] [ 28 ] These tendencies may result from the shared ancestry of the aminoacyl tRNA synthetases related to these codons. a mutated hemoglobin gene causes sickle-cell disease . when researchers studying human mitochondrial genes discovered they used an alternative code. Despite the redundancy of the genetic code. that is. [ 30 ] Basis dimodifikasi termasuk inosin dan basepair UG Non-Watson-Crick. GAA or GAG becomes GUA or GUG. Kaya akan menghasilkan residu asam amino yang dalam ukuran kecil dan sedang di pengobatan air. Dalam hemoglobin mutan hidrofilik glutamat (Glu) diganti oleh hidrofobik valin (Val). In the mutant hemoglobin a hydrophilic glutamate (Glu) is substituted by the hydrophobic valine (Val). Sementara sedikit variasi pada kode standar yang telah diprediksi sebelumnya. NAN encodes average size hydrophilic residues. Sickle-cell disease is generally not caused by a de novo mutation . as heterozygous people have some resistance to the malarial Plasmodium parasite ( heterozygote advantage ). Meskipun redundansi kode genetik. Misalnya. sebagai heterozigot orang memiliki beberapa perlawanan terhadap malaria Plasmodium parasit ( heterozigot keuntungan ). NAN mengkodekan ukuran rata-rata residu hidrofilik. dan pasangan basa yang terbentuk disebut pasangan basa goyangan . [31] tidak ada yang ditemukan sampai 1979. NCN yields amino acid residues that are small in size and moderate in hydropathy. [30] [ edit ] Variations to the standard genetic code [ sunting ] Variasi pada kode genetik standar While slight variations on the standard code had been predicted earlier. suatu kodon dari NUN (di mana N = ada) nukleotida cenderung untuk kode untuk asam amino hidrofobik. The modified bases include inosine and the Non-Watson-Crick UG basepair. Kode-kode variabel untuk asam amino yang diperbolehkan karena basis dimodifikasi di dasar pertama dari antikodon tRNA. [ 32 ] including various alternative mitochondrial codes. [ 29 ] Melainkan dipilih dalam wilayah geografis di mana malaria adalah umum (dalam cara yang mirip dengan talasemia ). [ 31 ] none were discovered until 1979.

tRNA-sintetase pasangan untuk menyandikan dengan sifat fisikokimia dan biologi yang beragam untuk digunakan sebagai alat untuk mengeksplorasi struktur protein dan fungsi atau untuk membuat protein baru atau ditingkatkan. ribosom. [34] [35] Dalam bakteri dan archaea . dan pyrrolysine dipandang sebagai 22. membaca kode dalam arah yang sama dan menerjemahkan kode tiga huruf pada suatu waktu menjadi urutan asam amino. 40 non-alami asam amino ini telah ditambahkan ke dalam protein dengan menciptakan kodon yang unik (pengodean ulang) dan yang sesuai transfer-RNA: aminoasil . and UAG can code for pyrrolysine . [ 32 ] Varian sedikit banyak telah ditemukan sejak saat itu. UGA can code for selenocysteine . For example. all known codes are very similar to each other. there are a huge number of possible . [33] dan varian kecil seperti terjemahan kodon UGA dari sebagai triptofan pada spesies Mycoplasma dan terjemahan dari CUG sebagai serin daripada leusin dalam genus Candida . Dalam protein tertentu. Meskipun variasi kecil yang ada. [32] termasuk berbagai kode mitokondria alternatif. GUG and UUG are common start codons. and the coding mechanism is the same for all organisms: three-base codons. tRNA. [36] [37] [ edit ] Origin [ sunting ] Asal Despite the minor variations that exist. [ edit ] Expanded genetic code [ sunting ] kode genetik Diperluas Main article: Expanded genetic code Artikel utama: kode genetik Diperluas Since 2001. 40 non-natural amino acids have been added into protein by creating a unique codon (recoding) and a corresponding transfer-RNA:aminoacyl ± tRNA-synthetase pair to encode it with diverse physicochemical and biological properties in order to be used as a tool to exploring protein structure and function or to create novel or enhanced proteins. Selenocysteine is now viewed as the 21st amino acid. Meskipun perbedaan ini. but in rare cases. protein tertentu dapat menggunakan kodon mulai alternatif biasanya tidak digunakan oleh spesies. depending on associated signal sequences in the messenger RNA. semua kode yang dikenal sangat mirip satu sama lain. tRNA. [ 34 ] [ 35 ] In bacteria and archaea . GUG dan UUG merupakan kodon mulai umum. However. dan UAG dapat kode untuk pyrrolysine . [32] Despite these differences. UGA dapat kode untuk selenocysteine . ribosomes. kode genetik yang digunakan oleh semua bentuk kehidupan yang diketahui hampir universal. dan mekanisme pengkodean adalah sama untuk semua organisme: tiga-basa kodon. certain proteins may use alternative start codons not normally used by that species. non-standard amino acids are substituted for standard stop codons. reading the code in the same direction and translating the code three letters at a time into sequences of amino acids. Sebagai contoh.and translation of CUG as a serine rather than a leucine in the genus Candida . [32] In certain proteins. tetapi dalam kasus yang jarang. [ 32 ] Selenocysteine sekarang dipandang sebagai asam amino ke-21. the genetic code used by all known forms of life is nearly universal. [ 36 ] [ 37 ] Sejak tahun 2001. non-standar asam amino yang diganti untuk kodon stop standar. tergantung pada urutan sinyal yang terkait di messenger RNA. and pyrrolysine is viewed as the 22nd.

The stereochemical code could have created an ancient core of assignments. [40] Untuk memulai.5 x 10 84 possible genetic codes. Secara teoritis. 6 show some RNA triplet-amino acid association. Prinsip-prinsip kimia mengatur interaksi spesifik RNA dengan asam amino. [ 41 ] and amino acids with similar physical properties tend to have similar codons. There are enough data to refute the first possibility. amino acids that share the same biosynthetic pathway tend to have the same first base in their codons. Biosintesis ekspansi. If amino acids are randomly associated with triplet codons. [42] [43] There are four themes running through the many theories about the evolution of the genetic code (and hence the origin of these patterns): [ 44 ] Ada empat tema berjalan melalui banyak teori tentang evolusi kode genetik (dan karenanya asal pola-pola ini): [44] y y Chemical principles govern specific RNA interaction with amino acids. Kode genetik standar modern tumbuh dari kode sebelumnya sederhana melalui proses "ekspansi biosintesis".5 x 10 84 kode genetik mungkin. and maybe protein sequences were directly templated on base sequences. [38] Phylogenetic analysis of transfer RNA suggests that tRNA molecules evolved before the present set of aminoacyl-tRNA synthetases . a quick view on the table of the genetic code shows a clustering of amino acid assignments. [41] dan asam amino dengan sifat fisik yang sama cenderung memiliki kodon yang sama. Percobaan dengan aptamers menunjukkan bahwa beberapa asam amino memiliki afinitas kimia selektif untuk kembar tiga dasar yang kode untuk mereka. [ 40 ] For a start. asam amino yang berbagi jalur biosintesis yang sama cenderung memiliki dasar yang sama dalam kodon pertama mereka. Ada data yang cukup untuk membantah kemungkinan pertama. 6 menunjukkan beberapa asosiasi RNA triplet-asam amino. [45] percobaan terbaru menunjukkan bahwa dari 8 asam amino diuji. Kode stereokimia bisa menciptakan inti kuno tugas. completely non-random (optimal) or a combination of random and nonrandom. Biosynthetic expansion . Furthermore. Mekanisme terjemahan saat ini kompleks yang melibatkan tRNA dan enzim terkait mungkin perkembangan kemudian. Namun. as by-products of metabolism ) and later incorporated some of these into the . there will be 1. benar-benar non-acak (optimal) atau kombinasi dari acak dan nonrandom. The current complex translation mechanism involving tRNA and associated enzymes may be a later development. Here the idea is that primordial life "discovered" new amino acids (for example. akan ada 1. Experiments with aptamers showed that some amino acids have a selective chemical affinity for the base triplets that code for them. tampilan cepat di meja dari kode genetik menunjukkan pengelompokan tugas asam amino. [46] [ 47] Hal ini telah disebut kode stereokimia. ada sejumlah besar kode genetik mungkin. [ 46 ] [ 47 ] This has been called the stereochemical code. [ 42 ] [ 43 ] Selanjutnya. [ 38 ] Jika asam amino secara acak terkait dengan kodon triplet. The standard modern genetic code grew from a simpler earlier code through a process of "biosynthetic expansion". dan mungkin urutan protein secara langsung templated pada urutan basa. [ 45 ] Recent experiments show that of the 8 amino acids tested.genetic codes. the genetic code could be completely random (a "frozen accident"). [ 39 ] Analisis filogenetik RNA transfer menunjukkan molekul tRNA yang berkembang sebelum menetapkan sekarang aminoasil-tRNA sintetase . kode genetik bisa benar-benar acak (suatu "kecelakaan beku"). [39] Theoretically.

y y machinery of genetic coding. Fitur ini dapat memungkinkan decoding akurat dalam ketiadaan mesin translasi yang sangat kompleks seperti ribosom . sebagai produk dari metabolisme ) dan kemudian dimasukkan beberapa ini ke dalam mesin pengkodean genetik. Kode muncul pada transisi pengkodean ketika pemetaan kodon untuk asam amino menjadi nonrandom. This feature could allow accurate decoding in the absence of highly complex translational machinery such as the ribosome . Information channels: Information-theoretic approaches see the genetic code as an error-prone information channel. The emergence of the code is governed by the topology defined by the probable errors and is related to the map coloring problem . [ 49 ] [ 50 ] Meskipun banyak bukti telah ditemukan untuk menunjukkan bahwa lebih sedikit asam amino yang berbeda yang digunakan di masa lalu dari hari ini. [56] untuk kesalahan-toleransi [51] dan untuk minim biaya sumber daya. [49] [50 ] Natural selection has led to codon assignments of the genetic code that minimize the effects of mutations . errors) in the channel poses the organism with a fundamental question: how to construct a genetic code that can withstand the impact of noise [ 54 ] while accurately and efficiently translating information? Informasi saluran: Informasi-teori pendekatan melihat kode genetik sebagai saluran rawan kesalahan informasi. Lebih lama dari triplet decoding memiliki tingkat yang lebih tinggi kodon redundansi dan lebih tahan daripada kesalahan triplet decoding. Berikut gagasan adalah bahwa kehidupan purba "menemukan" asam amino baru (misalnya. The code emerges at a coding transition when the mapping of codons to amino-acids becomes nonrandom. Seleksi alam telah menyebabkan tugas kodon dari kode genetik yang meminimalkan efek mutasi . [ 56 ] for error-tolerance [ 51 ] and for minimal cost of resources. [ 48 ] precise and detailed hypotheses about which amino acids entered the code in what order have proved far more controversial. kesalahan) dalam saluran pose organisme dengan pertanyaan mendasar: bagaimana membangun sebuah kode genetik yang dapat menahan dampak kebisingan [54] sementara secara akurat dan informasi secara efisien menerjemahkan? These rate-distortion´ models [ 55 ] suggest that the genetic code originated as a result of the interplay of the three conflicting evolutionary forces: the needs for diverse amino-acids. [ 53 ] The inherent noise (that is. [ 51 ] A recent hypothesis [ 52 ] suggests that the triplet code was derived from codes that used longer than triplet codons. [53] Suara melekat (yaitu. Although much circumstantial evidence has been found to suggest that fewer different amino acids were used in the past than today. Ini "tingkat-distorsi" model [55] menunjukkan bahwa kode genetik berasal sebagai akibat dari interaksi dari tiga kekuatan evolusi yang bertentangan: kebutuhan untuk beragam asam amino. [ 57 ] Munculnya kode diatur oleh topologi didefinisikan oleh kesalahan yang mungkin dan terkait dengan masalah pewarnaan peta . [51] Sebuah hipotesis baru [52] menunjukkan bahwa kode triplet berasal dari kode yang digunakan lebih dari kodon triplet. [48] hipotesis yang tepat dan rinci tentang mana asam amino memasukkan kode dalam rangka apa telah terbukti jauh lebih kontroversial. [57] [ edit ] See also [ sunting ] Lihat juga y DNA . Longer than triplet decoding has higher degree of codon redundancy and is more error resistant than the triplet decoding.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful