menunjukkan apa yang masing-masing asam amino dari 64 kodon menentukan.

Table 2 shows what codons specify each of the 20 standard amino acids involved in translation. Tabel 2 menunjukkan apa kodon menentukan masing-masing dari 20 asam amino standar yang terlibat dalam penerjemahan. These are called forward and reverse codon tables, respectively. Ini disebut maju dan mundur tabel kodon, masing-masing. For example, the codon AAU represents the amino acid asparagine , and UGU and UGC represent cysteine (standard three-letter designations, Asn and Cys, respectively). [ 8 ] :522 Sebagai contoh, AAU merupakan kodon asam amino asparagin , dan UGU UGC mewakili dan sistein (standar tiga huruf sebutan, Asn, dan Cys, masing-masing). [8] : 522

[ edit ] RNA codon table [ sunting ] kodon RNA tabel
nonpolar nonpolar polar kutub basic dasar acidic asam (stop codon) (Berhenti kodon) UU (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin 2nd base 2 dasar CC A Sebuah (Tyr/Y) (Ser/S) UAU Tyrosine Serine (Ser UAU (Tyr / Y) / S) serin Tirosin (Tyr/Y) (Ser/S) UAC Tyrosine Serine (Ser UAC (Tyr / Y) / S) serin Tirosin Stop ( (Ser/S) UAA Ochre ) Serine (Ser UAA Berhenti / S) serin (Ochre) Stop ( (Ser/S) UAG Amber ) Serine (Ser UAG Stop / S) serin (Amber) (Pro/P) (His/H) Proline CAU Histidine (/ (Pro / P) CAU Nya H) Proline histidin (Pro/P) (His/H) Proline CAC Histidine (/ (Pro / P) CAC Nya H) Proline histidin (Pro/P) (Gln/Q) Proline CAA Glutamine (Pro / P) CAA (GLN / T) Proline Glutamin GG (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina

UUU UUU

UCU UCU

UGU UGU

UUC UUC UU UUA UUA 1st base 1 dasar

UCC UCC

UGC UGC

(Leu/L) UCA Leucine (Leu / UCA L) Leusin (Leu/L) UCG Leucine (Leu / UCG L) Leusin (Leu/L) CCU Leucine (Leu / CCU L) Leusin (Leu/L) CCC Leucine (Leu / CCC L) Leusin (Leu/L) CCA Leucine (Leu / CCA L) Leusin

Stop ( Opal UGA ) Stop UGA (Opal) UGG UGG (Trp/W) Tryptophan (Trp / W) Tryptophan (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin

UUG UUG

CUU Cuu

CGU CGU

CC

CUC CUC

CGC LKP

CUA CUA

CGA CGA

[ 9 ] Sebuah kodon ini Agustus kedua kode untuk metionin dan berfungsi sebagai situs inisiasi: yang .(Pro/P) (Leu/L) CCG Proline Leucine (Leu / CCG (Pro / P) L) Leusin Proline (Thr/T) (Ile/I) AUU ACU Threonine Isoleucine (Ile AUU ACU (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Thr/T) (Ile/I) AUC ACC Threonine Isoleucine (Ile AUC ACC (Thr / T) / I) isoleucine treonin A Sebuah (Thr/T) (Ile/I) AUA ACA Threonine Isoleucine (Ile AUA ACA (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Met/M) (Thr/T) AUG [A] Methionine ACG Threonine Agustus ACG (Thr / T) (Met / M) [A] Metionin treonin CUG CUG (Gln/Q) CAG Glutamine CAG (GLN / T) Glutamin (Asn/N) AAU Asparagine AAU (Asn / N) Asparagin (Asn/N) AAC Asparagine AAC (Asn / N) Asparagin (Arg/R) CGG Arginine CGG (Arg / R) Arginin (Ser/S) AGU Serine (Ser / AGU S) serin (Ser/S) AGC Serine (Ser / AGC S) serin (Arg/R) (Lys/K) AAA AGA Arginine Lysine (Lys AAA AGA (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Arg/R) (Lys/K) AAG AGG Arginine Lysine (Lys AAG Agg (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUU GCU Alanine GAU GGU Glycine (Val / V) acid (Asp / GUU GCU (Ala / A) GAU GGU (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUC GCC Alanine GAC GGC Glycine (Val / V) acid (Asp / GUC GCC (Ala / A) GAC GGC (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat GG (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUA GCA Alanine GAA GGA Glycine (Val / V) acid (Glu / Gua GCA (Ala / A) GAA GGA (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUG GCG Alanine GAG GGG Glycine (Val / V) acid (Glu / GUG GCG (Ala / A) GAG GGG (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat A The codon AUG both codes for methionine and serves as an initiation site: the first AUG in an mRNA 's coding region is where translation into protein begins.

Thr/T Thr / T ACU. ACC. UCC. CGG. CCG Cys / C UGC UGU. ACC. Trp/W Trp / W UGG UGG . CUA. UUC Asp / D GAC GAU. Leu/L Leu / L UUA. ACA. UUG. GCC. CGC. Ser/S Ser / S UCU. ACG Glu / E GAG GAA. AGA. CCC. CCC. AGC UCU. Met/M Met / M AUG Agustus Asn / N AAC AAU. GAG Gly/G GGU. Lys/K Lys / K AAA. GCA. UCA. UCC. CGG. AGG CGU. AAG Arg / R CGC. AGU. [9] Inverse table Invers tabel Ala/A GCU. UUG. CCG CCU. GCG Arg/R CGU. AAC Asp/D GAU. UUC UUU. CUC. AGU. UCG. ACG ACU. Pro/P Pro / P CCU.Agustus pertama dalam mRNA kawasan coding adalah di mana terjemahan dalam protein dimulai. CUU. Cuu. CGA. AGA. CGA. UCA. AGC GLN / CAA. GAC Cys/C UGU. CAG UCG. CUG UUA. CUA. UGC Gln/Q CAA. CCA. ACA. CCA. CUG Ala / A GCC. T CAG Glu/E GAA. Agg Asn/N AAU. CUC. GCA. AAG AAA. Phe/F Phe / F UUU. GCG GCU.

CAC Ile/I Ile AUU. GGC. Sebuah kodon didefinisikan oleh nukleotida awal dari terjemahan mana yang dimulai. Every sequence can thus be read in three reading frames . gua. /I AUA AUU. AUA UAA. UAG START AUG STOP MULAI Agustus BERHENTI [ edit ] DNA codon table [ sunting ] DNA kodon tabel Main article: DNA codon table Artikel utama: DNA tabel kodon The DNA codon table is essentially identical to that for RNA. masingmasing).Gly / G GGC. respectively). GAA dan ACC. contains the codons GGG. AUC. Gly-Lys-Pro. UGA. [ edit ] Salient features [ sunting ] fitur penting [ edit ] Sequence reading frame [ sunting ] Urutan bingkai membaca A codon is defined by the initial nucleotide from which translation starts. tetapi dengan U digantikan oleh T . the string GGGAAACCC. Gly-Asn. GUA. jika dibaca dari posisi kedua. UAG UAA. AAA and CCC. GAA and ACC. UAC UAU. jika dibaca dari posisi pertama. and. if read from the second position. masing-masing akan menghasilkan urutan asam amino yang berbeda (dalam contoh yang diberikan. Val/V Val / V GUU. Tyr/Y Tyr / Y UAU. For example. AAA dan CCC. atau Glu-Thr. if read starting from the third position. but with U replaced by T . each of which will produce a different amino acid sequence (in the given example. GUG AUC. GGG His/H CAU. UAC Nya / H CAC CAU. or Glu-Thr. three in the forward . dan. Tabel kodon DNA pada dasarnya identik dengan bahwa untuk RNA. it contains the codons GGA and AAC. Gly-Lys-Pro. Gly-Asn. GGA. berisi GGG kodon. GUC. GUG GUU. Setiap urutan sehingga dapat dibaca dalam tiga frame membaca . GGG GGU. UGA. string GGGAAACCC. Sebagai contoh. berisi GGA kodon dan AAC. GUC. GGA. if read from the first position. jika membaca mulai dari posisi ketiga. With double-stranded DNA there are six possible reading frames .

respectively. whose last name means "amber" in German. they are translated as methionine or formylmethionine. They signal release of the nascent polypeptide from the ribosome because there is no cognate tRNA that has anticodons complementary to these stop signals. tiga orientasi ke depan pada satu untai dan tiga mundur pada untai berlawanan. Kodon stop juga disebut "penghentian" atau "omong kosong" kodon. in bacteria. [ edit ] Start/stop codons [ sunting ] Mulai / stop kodon Translation starts with a chain initiation codon (start codon). dan UAA adalah oker. UGA merupakan opal (kadang-kadang juga disebut Umber). and UAA is ochre . [12] [ edit ] Effect of mutations [ sunting ] Pengaruh mutasi . [ 12 ] Mereka sinyal pelepasan polipeptida baru lahir dari ribosom karena tidak ada tRNA yang serumpun yang telah anticodons pelengkap untuk sinyal-sinyal berhenti. "Amber" disebut oleh penemu Richard Epstein dan Charles Steinberg setelah teman mereka Harris Bernstein. Kodon start paling umum adalah Agustus yang dibaca sebagai metionin atau. yang terakhir namanya berarti "kuning" dalam bahasa Jerman. Unlike stop codons. these codons normally represent valine and leucine. [10] : 330 frame yang sebenarnya di mana urutan protein diterjemahkan didefinisikan oleh kodon start . Nearby sequences (such as the Shine-Dalgarno sequence in E. usually the first AUG codon in the mRNA sequence. termasuk "GUG" atau "UUG". coli ) and initiation factors are also required to start translation. bukan. Terjemahan dimulai dengan rantai kodon inisiasi (kodon start). "Amber" was named by discoverers Richard Epstein and Charles Steinberg after their friend Harris Bernstein. Alternative start codons (depending on the organism). [ 10 ] :330 The actual frame in which a protein sequence is translated is defined by a start codon . include "GUG" or "UUG". as formylmethionine. The most common start codon is AUG which is read as methionine or. Ketiga kodon stop telah diberi nama: UAG menyala kuning. kodon saja tidak cukup untuk memulai proses. dan sehingga faktor rilis mengikat ribosom. masing-masing. coli ) dan faktor inisiasi juga dibutuhkan untuk memulai penerjemahan.. Tidak seperti kodon stop. Kodon ini biasanya mewakili valin dan leusin. Urutan terdekat (seperti Shine-Dalgarno urutan dalam E. tetapi sebagai kodon start. pada bakteri. UGA is opal (sometimes also called umber ). Dengan DNA beruntai ganda mungkin ada enam frame membaca . and so a release factor binds to the ribosome instead. the codon alone is not sufficient to begin the process. but as a start codon. [ 11 ] Kodon mulai Alternatif (tergantung pada organisme). The other two stop codons were named "ochre" and "opal" in order to keep the "color names" theme.orientation on one strand and three reverse on the opposite strand. Stop codons are also called "termination" or "nonsense" codons. biasanya yang pertama Agustus di urutan kodon mRNA. sebagai formilmetionin. Dua lainnya kodon stop diberi nama "oker" dan "opal" untuk menjaga "nama warna" tema. mereka diterjemahkan sebagai metionin atau formilmetionin [11] The three stop codons have been given names: UAG is amber .

[ 10 ] :266 Missense mutasi dan mutasi nonsense adalah contoh dari mutasi titik . yang memotong penciptaan protein. [14] [15] Missense mutations and nonsense mutations are examples of point mutations . errors occasionally occur in the polymerization of the second strand. [ 14 ] [ 15 ] Tingkat kesalahan biasanya kesalahan yang sangat rendah-1 di setiap 10-100 juta basis-karena kemampuan "proofreading" dari DNA polimerase . Mutasi ini biasanya menghasilkan terjemahan yang sama sekali berbeda dari aslinya. These mutations usually result in a completely different translation from the original. terutama jika mereka terjadi dalam urutan pengkode protein dari gen. [10] : 266 Mutations that disrupt the reading frame sequence by indels ( insertions or deletions ) of a nonmultiple of 3 nucleotide bases are known as frameshift mutations . Mutasi yang mengganggu urutan frame membaca dengan indels ( insersi atau penghapusan ) dari non-kelipatan 3 basa nukleotida yang dikenal sebagai mutasi frameshift . dan juga sangat mungkin untuk menyebabkan kodon stop untuk dibaca. which can cause genetic diseases such as sickle-cell disease and thalassemia respectively. [ 13 ] Contoh terkenal mutasi yang dapat terjadi pada manusia. acidic polar or non-polar. Error rates are usually very low²1 error in every 10±100 million bases²due to the "proofreading" ability of DNA polymerases . and are also very likely to cause a stop codon to be read.Examples of notable mutations that can occur in humans. dapat memiliki dampak pada fenotipe organisme. yang disebut mutasi . These errors. [ 20 ] Frameshift . sedangkan mutasi nonsense menghasilkan kodon stop . which truncates the creation of the protein. One reason inheritance of frameshift mutations is rare is that if the protein being translated is essential for growth under the selective pressures the organism faces. yang dapat menyebabkan penyakit genetik seperti penyakit sel sabit dan talasemia masing-masing. Selama proses replikasi DNA . dan demikian jarang terjadi di in vivo protein-coding urutan. called mutations . whereas nonsense mutations result in a stop codon . [16] [17] [18] mutasi missense klinis yang penting pada umumnya mengubah properti dari residu asam amino antara kode menjadi dasar. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Clinically important missense mutations generally change the properties of the coded amino acid residue between being basic. especially if they occur within the protein coding sequence of a gene. absence of a functional protein may cause death before the organism is viable. and are thus rare in in vivo protein-coding sequences. kadang-kadang terjadi kesalahan dalam polimerisasi untai kedua. Kesalahan ini. can have an impact on the phenotype of an organism. [ 19 ] These mutations may impair the function of the resulting protein. [19] Mutasi ini dapat mengganggu fungsi dari protein yang dihasilkan. asam polar atau non polar. [13] During the process of DNA replication .

CUA. This phenomenon is called clonal interference and causes competition among the mutations. [26] [ edit ] Degeneracy [ sunting ] degenerasi Degeneracy is the redundancy of the genetic code. Kode genetik memiliki redundansi. AGC (perbedaan dalam posisi pertama. while the amino acid serine is specified by UCA. Cuu. keduanya tidak merinci setiap asam amino lain (ambiguitas). UCG. adanya protein fungsional dapat menyebabkan kematian sebelum organisme yang layak. multiple beneficial mutations may cooccur. AGU. Degenerasi adalah redundansi kode genetik.mutations may result in severe genetic diseases such as Tay-Sachs disease . UCC. AGC (difference in the first. [23] Virus yang menggunakan RNA sebagai bahan genetik mereka memiliki tingkat mutasi cepat. the amino acid leucine is specified by UUA. some mutations have a positive effect on an organism. [8] :521-522 . neither of them specifies any other amino acid (no ambiguity). kedua atau ketiga). [25] Dalam populasi besar organisme aseksual reproduksi. UCU. CUA. coli . beberapa mutasi memiliki efek positif pada suatu organisme. [20] mutasi frameshift dapat mengakibatkan berat penyakit genetik seperti penyakit Tay-Sachs . For example the amino acid glutamic acid is specified by GAA and GAG codons (difference in the third position). [21] Although most mutations that change protein sequences are harmful or neutral. Meskipun sebagian besar mutasi yang mengubah urutan protein berbahaya atau netral. [ 24 ] which can be an advantage since these viruses will evolve constantly and rapidly. although codons GAA and GAG both specify glutamic acid (redundancy). UCC. [22] Mutasi ini dapat mengaktifkan organisme untuk menahan tekanan mutan lingkungan tertentu lebih baik dari tipe liar organisme. CUU. In these cases a mutation will tend to become more common in a population through natural selection . Sebagai contoh. [ 22 ] These mutations may enable the mutant organism to withstand particular environmental stresses better than wild-type organisms. or reproduce more quickly. CUC. UCG. CUG codons (difference in the first or third position). [ 21 ] Salah satu alasan warisan mutasi frameshift jarang adalah bahwa jika protein yang diterjemahkan sangat penting untuk pertumbuhan di bawah tekanan selektif wajah organisme. For example. Dalam kasus ini mutasi akan cenderung menjadi lebih umum pada populasi melalui seleksi alam . CUC. AGU. atau mereproduksi lebih cepat. mutasi yang menguntungkan beberapa mungkin co-terjadi. coli. E. Kodon pengkodean satu asam amino dapat berbeda dalam setiap dari tiga posisi. for example. sedangkan asam amino serin ditentukan oleh UCA. dan dengan demikian menghindari tanggapan defensif misalnya manusia sistem kekebalan tubuh . second or third position). tapi tidak ada ambiguitas (lihat tabel kodon di atas untuk korelasi penuh). The codons encoding one amino acid may differ in any of their three positions. [ 25 ] In large populations of asexually reproducing organisms. and thus evade the defensive responses of eg the human immune system . misalnya. The genetic code has redundancy but no ambiguity (see the codon tables above for the full correlation). [ 8 ] :521±522 Misalnya asam amino asam glutamat ditentukan oleh kodon GAA dan GAG (perbedaan dalam posisi ketiga). meskipun kodon GAA dan GAG baik tentukan asam glutamat (redundansi). [ 23 ] Viruses that use RNA as their genetic material have rapid mutation rates. UCU. E. [24] yang dapat keuntungan karena virus ini akan berkembang terus-menerus dan cepat . asam amino leusin ditentukan oleh UUA. [ 26 ] Fenomena ini disebut gangguan klonal dan menyebabkan persaingan di antara mutasi. CUG kodon (perbedaan dalam posisi pertama atau ketiga) . UUG. UUG.

[ 8 ] :Chp 15 Degenerasi dari kode genetik adalah apa account untuk keberadaan mutasi sinonim . [8] :521-522 There are three amino acids encoded by six different codons: serine . The degeneracy of the genetic code is what accounts for the existence of synonymous mutations . [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs non-merosot jika ada mutasi pada hasil posisi di substitusi asam amino. GGC. nukleotida setara selalu baik dua purin (A / G) atau dua pirimidin (C / U). while changing to the fourth possible nucleotide always results in an amino acid substitution. GGU) adalah situs merosot empat kali lipat. GGC. In computation this position is often treated as a twofold degenerate site. they do not change the amino acid. because all nucleotide substitutions at this site are synonymous. [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot ganda jika hanya dua dari empat nukleotida mungkin pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. atau AUA semua menyandikan isoleusin.A position of a codon is said to be a fourfold degenerate site if any nucleotide at this position specifies the same amino acid. ditentukan oleh UGG kodon. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a twofold degenerate site if only two of four possible nucleotides at this position specify the same amino acid. posisi ketiga dari asam glutamat kodon (GAA. the equivalent nucleotides are always either two purines (A/G) or two pyrimidines (C/U). [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a non-degenerate site if any mutation at this position results in amino acid substitution. Hanya ada satu tiga merosot situs mana perubahan ke tiga dari empat nukleotida mungkin tidak memiliki efek pada asam amino (tergantung pada apa itu diubah menjadi). There is only one threefold degenerate site where changing to three of the four nucleotides may have no effect on the amino acid (depending on what it is changed to). karena semua substitusi nukleotida di situs ini adalah sama. ditentukan oleh kodon Agustus. [8] : CHP 15 Degeneracy results because there are more codons than encodable amino acids. yang lain adalah triptofan . Ada tiga asam amino dikode oleh enam kodon berbeda: serin . which also specifies the start of translation. mereka tidak mengubah asam amino. but AUG encodes methionine . GGG. GGU) is a fourfold degenerate site. specified by the codon UGG. This is the third position of an isoleucine codon: AUU. the third position of the glutamic acid codons (GAA. Only two amino acids are specified by a single codon. the third position of the glycine codons (GGA. Only the third positions of some codons may be fourfold degenerate. Ini adalah posisi ketiga dari isoleusin kodon: AUU. yang juga menentukan awal terjemahan. leucine . Hasil degenerasi karena ada lebih dari kodon asam amino encodable. Dalam dua merosot situs. AUC. so only transversional substitutions (purine to pyrimidine or pyrimidine to purine) in twofold degenerate sites are nonsynonymous. GGG. yaitu. ie. Hanya posisi ketiga dari beberapa kodon mungkin empat kali lipat merosot. dan arginin . or AUA all encode isoleucine. [ 8 ] :521±522 Dalam perhitungan posisi ini sering dianggap sebagai situs merosot dua kali lipat. AUC. Misalnya. specified by the codon AUG. sehingga hanya substitusi transversional (purin atau pirimidin ke pirimidin untuk purin) di dua situs yang nonsynonymous merosot. In twofold degenerate sites. Hanya dua asam amino ditentukan oleh kodon tunggal. For example. sedangkan perubahan ke yang mungkin keempat nukleotida selalu menghasilkan sebuah substitusi asam amino. Misalnya. the other is tryptophan . One of these is the amino-acid methionine . GAG) is a twofold degenerate site. GAG) adalah situs merosot dua kali lipat. For example. if there were two bases per . tapi Agustus mengkodekan metionin . leusin . For example. Salah satunya adalah asam amino metionin . Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot empat kali lipat jika ada nukleotida pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. posisi ketiga dari glisin kodon (GGA. and arginine .

Sebagai contoh. dan jumlah terbesar berikutnya pangkalan adalah tiga. [8] :521-522 These properties of the genetic code make it more fault-tolerant for point mutations . kemudian 4 ³ memberikan 64 kodon mungkin. dua merosot kodon bisa mentolerir satu dari tiga kemungkinan mutasi titik pada posisi ketiga. yang berarti bahwa degenerasi beberapa harus ada. For example. Konsekuensi praktis dari redundansi adalah bahwa beberapa kesalahan dalam kode genetik hanya menyebabkan mutasi diam atau kesalahan yang tidak akan mempengaruhi protein karena hidrofilisitas atau hidrofobik dipertahankan dengan substitusi setara dengan asam amino.codon. kesetaraan purin atau pirimidin yang dari pada dua merosot situs menambahkan toleransi kesalahan-lanjut. twofold degenerate codons can tolerate one out of the three possible point mutations at the third position. jika ada dua basis per kodon. meskipun penggunaan kodon bias yang membatasi praktek di dalam banyak organisme. for example. the equivalence of purines or that of pyrimidines at twofold degenerate sites adds a further fault-tolerance. [8 ] :531-532 Grouping of codons by amino acid residue molar volume and hydropathy . and the next largest number of bases is three. [ 8 ] :521±522 Karena setidaknya 21 kode yang diperlukan (20 asam amino ditambah berhenti). [ 8 ] :531±532 Sejak transisi mutasi (purin atau pirimidin untuk purin untuk mutasi pirimidin) lebih mungkin dibandingkan transversi (purin untuk pirimidin atau sebaliknya) mutasi. . Pengelompokan kodon oleh residu asam amino Volume molar dan pengobatan air . Misalnya. meaning that some degeneracy must exist. in theory. dalam teori. then 4³ gives 64 possible codons. although codon usage bias restricts this in practice in many organisms. a codon of NUN (where N = any nucleotide) tends to code for hydrophobic amino acids. then only 16 amino acids could be coded for (4 =16). fourfold degenerate codons can tolerate any point mutation at the third position. A practical consequence of redundancy is that some errors in the genetic code only cause a silent mutation or an error that would not affect the protein because the hydrophilicity or hydrophobicity is maintained by equivalent substitution of amino acids. Sifat-sifat dari kode genetik membuatnya lebih fault-tolerant untuk mutasi titik . Since transition mutations (purine to purine or pyrimidine to pyrimidine mutations) are more likely than transversion (purine to pyrimidine or vice-versa) mutations. maka hanya 16 asam amino bisa dikodekan untuk (4 = 16). empat kali lipat merosot kodon dapat mentolerir setiap mutasi titik pada posisi ketiga. Because at least 21 codes are required (20 amino acids plus stop).

NAN mengkodekan ukuran rata-rata residu hidrofilik. The modified bases include inosine and the Non-Watson-Crick UG basepair. when researchers studying human mitochondrial genes discovered they used an alternative code. causing sickle-cell deformation of erythrocytes . Dalam hemoglobin mutan hidrofilik glutamat (Glu) diganti oleh hidrofobik valin (Val). The substitution of glutamate by valine reduces the solubility of -globin which causes hemoglobin to form linear polymers linked by the hydrophobic interaction between the valine groups. that is. [ 33 ] and small variants such as translation of the codon UGA as tryptophan in the species Mycoplasma . GAA or GAG becomes GUA or GUG. [27] [28] Kecenderungan ini mungkin hasil dari keturunan bersama dari tRNA aminoasil sintetase terkait dengan kodon. For example. [ 29 ] Melainkan dipilih dalam wilayah geografis di mana malaria adalah umum (dalam cara yang mirip dengan talasemia ). Kode-kode variabel untuk asam amino yang diperbolehkan karena basis dimodifikasi di dasar pertama dari antikodon tRNA. Substitusi glutamat oleh valin mengurangi kelarutan -globin yang menyebabkan hemoglobin untuk membentuk polimer linier dihubungkan oleh interaksi hidrofobik antara kelompok valin. [ 31 ] none were discovered until 1979. Rather it is selected for in geographic regions where malaria is common (in a way similar to thalassemia ). mutasi titik tunggal masih dapat menyebabkan protein disfungsional. Penyakit sel sabit pada umumnya tidak disebabkan oleh de novo mutasi . yaitu GAA atau GAG menjadi gua atau GUG. as heterozygous people have some resistance to the malarial Plasmodium parasite ( heterozygote advantage ). Misalnya. [31] tidak ada yang ditemukan sampai 1979. Meskipun redundansi kode genetik. menyebabkan sel sabit deformasi dari eritrosit . [29] These variable codes for amino acids are allowed because of modified bases in the first base of the anticodon of the tRNA. ketika para peneliti mempelajari gen mitokondria manusia menemukan mereka menggunakan kode alternatif. Despite the redundancy of the genetic code. suatu kodon dari NUN (di mana N = ada) nukleotida cenderung untuk kode untuk asam amino hidrofobik. a mutated hemoglobin gene causes sickle-cell disease . Many slight variants have been discovered since then. In the mutant hemoglobin a hydrophilic glutamate (Glu) is substituted by the hydrophobic valine (Val).misalnya. NCN yields amino acid residues that are small in size and moderate in hydropathy. [ 27 ] [ 28 ] These tendencies may result from the shared ancestry of the aminoacyl tRNA synthetases related to these codons. bermutasi hemoglobin gen penyebab penyakit sel sabit . Kaya akan menghasilkan residu asam amino yang dalam ukuran kecil dan sedang di pengobatan air. [ 30 ] Basis dimodifikasi termasuk inosin dan basepair UG Non-Watson-Crick. Sickle-cell disease is generally not caused by a de novo mutation . NAN encodes average size hydrophilic residues. and the base-pair formed is called a wobble base pair . sebagai heterozigot orang memiliki beberapa perlawanan terhadap malaria Plasmodium parasit ( heterozigot keuntungan ). [ 32 ] including various alternative mitochondrial codes. [30] [ edit ] Variations to the standard genetic code [ sunting ] Variasi pada kode genetik standar While slight variations on the standard code had been predicted earlier. Sementara sedikit variasi pada kode standar yang telah diprediksi sebelumnya. dan pasangan basa yang terbentuk disebut pasangan basa goyangan . single point mutations can still cause dysfunctional proteins.

non-standard amino acids are substituted for standard stop codons. and UAG can code for pyrrolysine . all known codes are very similar to each other. Selenocysteine is now viewed as the 21st amino acid. non-standar asam amino yang diganti untuk kodon stop standar. dan pyrrolysine dipandang sebagai 22. Meskipun perbedaan ini. certain proteins may use alternative start codons not normally used by that species. the genetic code used by all known forms of life is nearly universal. [ 32 ] Varian sedikit banyak telah ditemukan sejak saat itu. UGA dapat kode untuk selenocysteine . Sebagai contoh. tRNA. tetapi dalam kasus yang jarang. [32] Despite these differences. kode genetik yang digunakan oleh semua bentuk kehidupan yang diketahui hampir universal. protein tertentu dapat menggunakan kodon mulai alternatif biasanya tidak digunakan oleh spesies. [34] [35] Dalam bakteri dan archaea . [32] In certain proteins. but in rare cases. tRNA. GUG and UUG are common start codons. and pyrrolysine is viewed as the 22nd. dan mekanisme pengkodean adalah sama untuk semua organisme: tiga-basa kodon. Dalam protein tertentu. ribosom. GUG dan UUG merupakan kodon mulai umum. [36] [37] [ edit ] Origin [ sunting ] Asal Despite the minor variations that exist.tRNA-sintetase pasangan untuk menyandikan dengan sifat fisikokimia dan biologi yang beragam untuk digunakan sebagai alat untuk mengeksplorasi struktur protein dan fungsi atau untuk membuat protein baru atau ditingkatkan. reading the code in the same direction and translating the code three letters at a time into sequences of amino acids. However. [32] termasuk berbagai kode mitokondria alternatif.and translation of CUG as a serine rather than a leucine in the genus Candida . UGA can code for selenocysteine . [33] dan varian kecil seperti terjemahan kodon UGA dari sebagai triptofan pada spesies Mycoplasma dan terjemahan dari CUG sebagai serin daripada leusin dalam genus Candida . [ edit ] Expanded genetic code [ sunting ] kode genetik Diperluas Main article: Expanded genetic code Artikel utama: kode genetik Diperluas Since 2001. Meskipun variasi kecil yang ada. there are a huge number of possible . For example. ribosomes. [ 32 ] Selenocysteine sekarang dipandang sebagai asam amino ke-21. semua kode yang dikenal sangat mirip satu sama lain. 40 non-natural amino acids have been added into protein by creating a unique codon (recoding) and a corresponding transfer-RNA:aminoacyl ± tRNA-synthetase pair to encode it with diverse physicochemical and biological properties in order to be used as a tool to exploring protein structure and function or to create novel or enhanced proteins. tergantung pada urutan sinyal yang terkait di messenger RNA. 40 non-alami asam amino ini telah ditambahkan ke dalam protein dengan menciptakan kodon yang unik (pengodean ulang) dan yang sesuai transfer-RNA: aminoasil . and the coding mechanism is the same for all organisms: three-base codons. membaca kode dalam arah yang sama dan menerjemahkan kode tiga huruf pada suatu waktu menjadi urutan asam amino. [ 34 ] [ 35 ] In bacteria and archaea . [ 36 ] [ 37 ] Sejak tahun 2001. depending on associated signal sequences in the messenger RNA. dan UAG dapat kode untuk pyrrolysine .

Percobaan dengan aptamers menunjukkan bahwa beberapa asam amino memiliki afinitas kimia selektif untuk kembar tiga dasar yang kode untuk mereka. [38] Phylogenetic analysis of transfer RNA suggests that tRNA molecules evolved before the present set of aminoacyl-tRNA synthetases . [ 42 ] [ 43 ] Selanjutnya. there will be 1. [39] Theoretically. The stereochemical code could have created an ancient core of assignments. [ 45 ] Recent experiments show that of the 8 amino acids tested. Furthermore. 6 menunjukkan beberapa asosiasi RNA triplet-asam amino. If amino acids are randomly associated with triplet codons. Experiments with aptamers showed that some amino acids have a selective chemical affinity for the base triplets that code for them. kode genetik bisa benar-benar acak (suatu "kecelakaan beku"). Mekanisme terjemahan saat ini kompleks yang melibatkan tRNA dan enzim terkait mungkin perkembangan kemudian. Prinsip-prinsip kimia mengatur interaksi spesifik RNA dengan asam amino. akan ada 1. Biosintesis ekspansi. benar-benar non-acak (optimal) atau kombinasi dari acak dan nonrandom.5 x 10 84 possible genetic codes. There are enough data to refute the first possibility. Namun. [ 39 ] Analisis filogenetik RNA transfer menunjukkan molekul tRNA yang berkembang sebelum menetapkan sekarang aminoasil-tRNA sintetase . The current complex translation mechanism involving tRNA and associated enzymes may be a later development. Secara teoritis. [41] dan asam amino dengan sifat fisik yang sama cenderung memiliki kodon yang sama. Here the idea is that primordial life "discovered" new amino acids (for example. [ 46 ] [ 47 ] This has been called the stereochemical code. dan mungkin urutan protein secara langsung templated pada urutan basa. as by-products of metabolism ) and later incorporated some of these into the .genetic codes. amino acids that share the same biosynthetic pathway tend to have the same first base in their codons. [ 38 ] Jika asam amino secara acak terkait dengan kodon triplet. [ 40 ] For a start. 6 show some RNA triplet-amino acid association. completely non-random (optimal) or a combination of random and nonrandom. [46] [ 47] Hal ini telah disebut kode stereokimia. and maybe protein sequences were directly templated on base sequences. ada sejumlah besar kode genetik mungkin. [ 41 ] and amino acids with similar physical properties tend to have similar codons.5 x 10 84 kode genetik mungkin. Kode genetik standar modern tumbuh dari kode sebelumnya sederhana melalui proses "ekspansi biosintesis". Kode stereokimia bisa menciptakan inti kuno tugas. tampilan cepat di meja dari kode genetik menunjukkan pengelompokan tugas asam amino. [42] [43] There are four themes running through the many theories about the evolution of the genetic code (and hence the origin of these patterns): [ 44 ] Ada empat tema berjalan melalui banyak teori tentang evolusi kode genetik (dan karenanya asal pola-pola ini): [44] y y Chemical principles govern specific RNA interaction with amino acids. Biosynthetic expansion . [40] Untuk memulai. The standard modern genetic code grew from a simpler earlier code through a process of "biosynthetic expansion". Ada data yang cukup untuk membantah kemungkinan pertama. asam amino yang berbagi jalur biosintesis yang sama cenderung memiliki dasar yang sama dalam kodon pertama mereka. [45] percobaan terbaru menunjukkan bahwa dari 8 asam amino diuji. the genetic code could be completely random (a "frozen accident"). a quick view on the table of the genetic code shows a clustering of amino acid assignments.

kesalahan) dalam saluran pose organisme dengan pertanyaan mendasar: bagaimana membangun sebuah kode genetik yang dapat menahan dampak kebisingan [54] sementara secara akurat dan informasi secara efisien menerjemahkan? These rate-distortion´ models [ 55 ] suggest that the genetic code originated as a result of the interplay of the three conflicting evolutionary forces: the needs for diverse amino-acids. [56] untuk kesalahan-toleransi [51] dan untuk minim biaya sumber daya. Kode muncul pada transisi pengkodean ketika pemetaan kodon untuk asam amino menjadi nonrandom. Berikut gagasan adalah bahwa kehidupan purba "menemukan" asam amino baru (misalnya. Information channels: Information-theoretic approaches see the genetic code as an error-prone information channel. The emergence of the code is governed by the topology defined by the probable errors and is related to the map coloring problem . [ 53 ] The inherent noise (that is. sebagai produk dari metabolisme ) dan kemudian dimasukkan beberapa ini ke dalam mesin pengkodean genetik. errors) in the channel poses the organism with a fundamental question: how to construct a genetic code that can withstand the impact of noise [ 54 ] while accurately and efficiently translating information? Informasi saluran: Informasi-teori pendekatan melihat kode genetik sebagai saluran rawan kesalahan informasi. [48] hipotesis yang tepat dan rinci tentang mana asam amino memasukkan kode dalam rangka apa telah terbukti jauh lebih kontroversial. [49] [50 ] Natural selection has led to codon assignments of the genetic code that minimize the effects of mutations . Seleksi alam telah menyebabkan tugas kodon dari kode genetik yang meminimalkan efek mutasi . [57] [ edit ] See also [ sunting ] Lihat juga y DNA . [ 57 ] Munculnya kode diatur oleh topologi didefinisikan oleh kesalahan yang mungkin dan terkait dengan masalah pewarnaan peta . [53] Suara melekat (yaitu. [ 56 ] for error-tolerance [ 51 ] and for minimal cost of resources. [51] Sebuah hipotesis baru [52] menunjukkan bahwa kode triplet berasal dari kode yang digunakan lebih dari kodon triplet.y y machinery of genetic coding. Although much circumstantial evidence has been found to suggest that fewer different amino acids were used in the past than today. This feature could allow accurate decoding in the absence of highly complex translational machinery such as the ribosome . Fitur ini dapat memungkinkan decoding akurat dalam ketiadaan mesin translasi yang sangat kompleks seperti ribosom . Longer than triplet decoding has higher degree of codon redundancy and is more error resistant than the triplet decoding. Lebih lama dari triplet decoding memiliki tingkat yang lebih tinggi kodon redundansi dan lebih tahan daripada kesalahan triplet decoding. [ 49 ] [ 50 ] Meskipun banyak bukti telah ditemukan untuk menunjukkan bahwa lebih sedikit asam amino yang berbeda yang digunakan di masa lalu dari hari ini. Ini "tingkat-distorsi" model [55] menunjukkan bahwa kode genetik berasal sebagai akibat dari interaksi dari tiga kekuatan evolusi yang bertentangan: kebutuhan untuk beragam asam amino. The code emerges at a coding transition when the mapping of codons to amino-acids becomes nonrandom. [ 48 ] precise and detailed hypotheses about which amino acids entered the code in what order have proved far more controversial. [ 51 ] A recent hypothesis [ 52 ] suggests that the triplet code was derived from codes that used longer than triplet codons.