menunjukkan apa yang masing-masing asam amino dari 64 kodon menentukan.

Table 2 shows what codons specify each of the 20 standard amino acids involved in translation. Tabel 2 menunjukkan apa kodon menentukan masing-masing dari 20 asam amino standar yang terlibat dalam penerjemahan. These are called forward and reverse codon tables, respectively. Ini disebut maju dan mundur tabel kodon, masing-masing. For example, the codon AAU represents the amino acid asparagine , and UGU and UGC represent cysteine (standard three-letter designations, Asn and Cys, respectively). [ 8 ] :522 Sebagai contoh, AAU merupakan kodon asam amino asparagin , dan UGU UGC mewakili dan sistein (standar tiga huruf sebutan, Asn, dan Cys, masing-masing). [8] : 522

[ edit ] RNA codon table [ sunting ] kodon RNA tabel
nonpolar nonpolar polar kutub basic dasar acidic asam (stop codon) (Berhenti kodon) UU (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin 2nd base 2 dasar CC A Sebuah (Tyr/Y) (Ser/S) UAU Tyrosine Serine (Ser UAU (Tyr / Y) / S) serin Tirosin (Tyr/Y) (Ser/S) UAC Tyrosine Serine (Ser UAC (Tyr / Y) / S) serin Tirosin Stop ( (Ser/S) UAA Ochre ) Serine (Ser UAA Berhenti / S) serin (Ochre) Stop ( (Ser/S) UAG Amber ) Serine (Ser UAG Stop / S) serin (Amber) (Pro/P) (His/H) Proline CAU Histidine (/ (Pro / P) CAU Nya H) Proline histidin (Pro/P) (His/H) Proline CAC Histidine (/ (Pro / P) CAC Nya H) Proline histidin (Pro/P) (Gln/Q) Proline CAA Glutamine (Pro / P) CAA (GLN / T) Proline Glutamin GG (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina

UUU UUU

UCU UCU

UGU UGU

UUC UUC UU UUA UUA 1st base 1 dasar

UCC UCC

UGC UGC

(Leu/L) UCA Leucine (Leu / UCA L) Leusin (Leu/L) UCG Leucine (Leu / UCG L) Leusin (Leu/L) CCU Leucine (Leu / CCU L) Leusin (Leu/L) CCC Leucine (Leu / CCC L) Leusin (Leu/L) CCA Leucine (Leu / CCA L) Leusin

Stop ( Opal UGA ) Stop UGA (Opal) UGG UGG (Trp/W) Tryptophan (Trp / W) Tryptophan (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin

UUG UUG

CUU Cuu

CGU CGU

CC

CUC CUC

CGC LKP

CUA CUA

CGA CGA

[ 9 ] Sebuah kodon ini Agustus kedua kode untuk metionin dan berfungsi sebagai situs inisiasi: yang .(Pro/P) (Leu/L) CCG Proline Leucine (Leu / CCG (Pro / P) L) Leusin Proline (Thr/T) (Ile/I) AUU ACU Threonine Isoleucine (Ile AUU ACU (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Thr/T) (Ile/I) AUC ACC Threonine Isoleucine (Ile AUC ACC (Thr / T) / I) isoleucine treonin A Sebuah (Thr/T) (Ile/I) AUA ACA Threonine Isoleucine (Ile AUA ACA (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Met/M) (Thr/T) AUG [A] Methionine ACG Threonine Agustus ACG (Thr / T) (Met / M) [A] Metionin treonin CUG CUG (Gln/Q) CAG Glutamine CAG (GLN / T) Glutamin (Asn/N) AAU Asparagine AAU (Asn / N) Asparagin (Asn/N) AAC Asparagine AAC (Asn / N) Asparagin (Arg/R) CGG Arginine CGG (Arg / R) Arginin (Ser/S) AGU Serine (Ser / AGU S) serin (Ser/S) AGC Serine (Ser / AGC S) serin (Arg/R) (Lys/K) AAA AGA Arginine Lysine (Lys AAA AGA (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Arg/R) (Lys/K) AAG AGG Arginine Lysine (Lys AAG Agg (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUU GCU Alanine GAU GGU Glycine (Val / V) acid (Asp / GUU GCU (Ala / A) GAU GGU (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUC GCC Alanine GAC GGC Glycine (Val / V) acid (Asp / GUC GCC (Ala / A) GAC GGC (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat GG (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUA GCA Alanine GAA GGA Glycine (Val / V) acid (Glu / Gua GCA (Ala / A) GAA GGA (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUG GCG Alanine GAG GGG Glycine (Val / V) acid (Glu / GUG GCG (Ala / A) GAG GGG (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat A The codon AUG both codes for methionine and serves as an initiation site: the first AUG in an mRNA 's coding region is where translation into protein begins.

GCG GCU. GCC. CCG CCU. CCA. AGU. CGC. UUG. Ser/S Ser / S UCU. AAG AAA. ACC. CUC. UCG. UUG. ACG ACU. Lys/K Lys / K AAA. CGG. [9] Inverse table Invers tabel Ala/A GCU. Leu/L Leu / L UUA. AAG Arg / R CGC. CAG UCG. ACA. Phe/F Phe / F UUU. CCA. GCA. AGU. CUA. Trp/W Trp / W UGG UGG .Agustus pertama dalam mRNA kawasan coding adalah di mana terjemahan dalam protein dimulai. CCC. UGC Gln/Q CAA. CGA. GCG Arg/R CGU. CGG. Thr/T Thr / T ACU. ACG Glu / E GAG GAA. AAC Asp/D GAU. CUU. UUC UUU. GCA. CGA. CUC. AGA. T CAG Glu/E GAA. AGA. CUG Ala / A GCC. AGC GLN / CAA. UCA. AGC UCU. CUG UUA. GAC Cys/C UGU. ACC. AGG CGU. UCC. UUC Asp / D GAC GAU. GAG Gly/G GGU. CCC. ACA. Pro/P Pro / P CCU. UCC. Met/M Met / M AUG Agustus Asn / N AAC AAU. Agg Asn/N AAU. UCA. CUA. Cuu. CCG Cys / C UGC UGU.

Gly-Asn. GGC. if read starting from the third position. CAC Ile/I Ile AUU. Sebuah kodon didefinisikan oleh nukleotida awal dari terjemahan mana yang dimulai. each of which will produce a different amino acid sequence (in the given example. jika dibaca dari posisi kedua. it contains the codons GGA and AAC. GGG GGU. tetapi dengan U digantikan oleh T . Gly-Lys-Pro. Tabel kodon DNA pada dasarnya identik dengan bahwa untuk RNA. UAC Nya / H CAC CAU. if read from the second position. respectively). GAA dan ACC. GGG His/H CAU. dan. For example. GUG GUU. With double-stranded DNA there are six possible reading frames . berisi GGG kodon. jika membaca mulai dari posisi ketiga. Gly-Asn. GUC. GAA and ACC. contains the codons GGG. AAA dan CCC. if read from the first position. UGA. berisi GGA kodon dan AAC. Gly-Lys-Pro. three in the forward . or Glu-Thr. atau Glu-Thr. AAA and CCC. but with U replaced by T . Setiap urutan sehingga dapat dibaca dalam tiga frame membaca . GUG AUC. [ edit ] Salient features [ sunting ] fitur penting [ edit ] Sequence reading frame [ sunting ] Urutan bingkai membaca A codon is defined by the initial nucleotide from which translation starts. Tyr/Y Tyr / Y UAU. /I AUA AUU. GUA. AUC. string GGGAAACCC. masingmasing). and.Gly / G GGC. UAC UAU. UGA. Every sequence can thus be read in three reading frames . Sebagai contoh. GGA. UAG UAA. UAG START AUG STOP MULAI Agustus BERHENTI [ edit ] DNA codon table [ sunting ] DNA kodon tabel Main article: DNA codon table Artikel utama: DNA tabel kodon The DNA codon table is essentially identical to that for RNA. gua. the string GGGAAACCC. GGA. GUC. Val/V Val / V GUU. jika dibaca dari posisi pertama. masing-masing akan menghasilkan urutan asam amino yang berbeda (dalam contoh yang diberikan. AUA UAA.

mereka diterjemahkan sebagai metionin atau formilmetionin [11] The three stop codons have been given names: UAG is amber . [ 10 ] :330 The actual frame in which a protein sequence is translated is defined by a start codon . but as a start codon. Stop codons are also called "termination" or "nonsense" codons. Tidak seperti kodon stop. UGA is opal (sometimes also called umber ). dan sehingga faktor rilis mengikat ribosom. Kodon start paling umum adalah Agustus yang dibaca sebagai metionin atau. coli ) and initiation factors are also required to start translation. tetapi sebagai kodon start. [ 11 ] Kodon mulai Alternatif (tergantung pada organisme). Alternative start codons (depending on the organism). [ 12 ] Mereka sinyal pelepasan polipeptida baru lahir dari ribosom karena tidak ada tRNA yang serumpun yang telah anticodons pelengkap untuk sinyal-sinyal berhenti. in bacteria. "Amber" disebut oleh penemu Richard Epstein dan Charles Steinberg setelah teman mereka Harris Bernstein. they are translated as methionine or formylmethionine. They signal release of the nascent polypeptide from the ribosome because there is no cognate tRNA that has anticodons complementary to these stop signals. Urutan terdekat (seperti Shine-Dalgarno urutan dalam E. masing-masing. The most common start codon is AUG which is read as methionine or. Unlike stop codons. Kodon stop juga disebut "penghentian" atau "omong kosong" kodon. biasanya yang pertama Agustus di urutan kodon mRNA. [ edit ] Start/stop codons [ sunting ] Mulai / stop kodon Translation starts with a chain initiation codon (start codon). usually the first AUG codon in the mRNA sequence. kodon saja tidak cukup untuk memulai proses. tiga orientasi ke depan pada satu untai dan tiga mundur pada untai berlawanan. as formylmethionine. Dua lainnya kodon stop diberi nama "oker" dan "opal" untuk menjaga "nama warna" tema. yang terakhir namanya berarti "kuning" dalam bahasa Jerman. respectively. and UAA is ochre . coli ) dan faktor inisiasi juga dibutuhkan untuk memulai penerjemahan. and so a release factor binds to the ribosome instead. pada bakteri. The other two stop codons were named "ochre" and "opal" in order to keep the "color names" theme. UGA merupakan opal (kadang-kadang juga disebut Umber). dan UAA adalah oker. these codons normally represent valine and leucine. Ketiga kodon stop telah diberi nama: UAG menyala kuning. "Amber" was named by discoverers Richard Epstein and Charles Steinberg after their friend Harris Bernstein. the codon alone is not sufficient to begin the process. [10] : 330 frame yang sebenarnya di mana urutan protein diterjemahkan didefinisikan oleh kodon start . termasuk "GUG" atau "UUG". include "GUG" or "UUG". Dengan DNA beruntai ganda mungkin ada enam frame membaca . Kodon ini biasanya mewakili valin dan leusin.orientation on one strand and three reverse on the opposite strand. bukan. Terjemahan dimulai dengan rantai kodon inisiasi (kodon start). sebagai formilmetionin.. Nearby sequences (such as the Shine-Dalgarno sequence in E. [12] [ edit ] Effect of mutations [ sunting ] Pengaruh mutasi . whose last name means "amber" in German.

[13] During the process of DNA replication . These mutations usually result in a completely different translation from the original. One reason inheritance of frameshift mutations is rare is that if the protein being translated is essential for growth under the selective pressures the organism faces. dan demikian jarang terjadi di in vivo protein-coding urutan. Selama proses replikasi DNA . yang dapat menyebabkan penyakit genetik seperti penyakit sel sabit dan talasemia masing-masing. sedangkan mutasi nonsense menghasilkan kodon stop . dan juga sangat mungkin untuk menyebabkan kodon stop untuk dibaca.Examples of notable mutations that can occur in humans. Error rates are usually very low²1 error in every 10±100 million bases²due to the "proofreading" ability of DNA polymerases . terutama jika mereka terjadi dalam urutan pengkode protein dari gen. [ 10 ] :266 Missense mutasi dan mutasi nonsense adalah contoh dari mutasi titik . [19] Mutasi ini dapat mengganggu fungsi dari protein yang dihasilkan. [10] : 266 Mutations that disrupt the reading frame sequence by indels ( insertions or deletions ) of a nonmultiple of 3 nucleotide bases are known as frameshift mutations . especially if they occur within the protein coding sequence of a gene. yang memotong penciptaan protein. Mutasi ini biasanya menghasilkan terjemahan yang sama sekali berbeda dari aslinya. dapat memiliki dampak pada fenotipe organisme. absence of a functional protein may cause death before the organism is viable. [16] [17] [18] mutasi missense klinis yang penting pada umumnya mengubah properti dari residu asam amino antara kode menjadi dasar. can have an impact on the phenotype of an organism. kadang-kadang terjadi kesalahan dalam polimerisasi untai kedua. which can cause genetic diseases such as sickle-cell disease and thalassemia respectively. errors occasionally occur in the polymerization of the second strand. [ 13 ] Contoh terkenal mutasi yang dapat terjadi pada manusia. yang disebut mutasi . and are also very likely to cause a stop codon to be read. whereas nonsense mutations result in a stop codon . [ 19 ] These mutations may impair the function of the resulting protein. Mutasi yang mengganggu urutan frame membaca dengan indels ( insersi atau penghapusan ) dari non-kelipatan 3 basa nukleotida yang dikenal sebagai mutasi frameshift . [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Clinically important missense mutations generally change the properties of the coded amino acid residue between being basic. called mutations . Kesalahan ini. acidic polar or non-polar. and are thus rare in in vivo protein-coding sequences. These errors. which truncates the creation of the protein. asam polar atau non polar. [14] [15] Missense mutations and nonsense mutations are examples of point mutations . [ 14 ] [ 15 ] Tingkat kesalahan biasanya kesalahan yang sangat rendah-1 di setiap 10-100 juta basis-karena kemampuan "proofreading" dari DNA polimerase . [ 20 ] Frameshift .

AGU. AGC (perbedaan dalam posisi pertama. [ 26 ] Fenomena ini disebut gangguan klonal dan menyebabkan persaingan di antara mutasi. E. In these cases a mutation will tend to become more common in a population through natural selection . UCC. tapi tidak ada ambiguitas (lihat tabel kodon di atas untuk korelasi penuh). CUC. [20] mutasi frameshift dapat mengakibatkan berat penyakit genetik seperti penyakit Tay-Sachs . UCU. CUA. coli . mutasi yang menguntungkan beberapa mungkin co-terjadi. coli. CUA. beberapa mutasi memiliki efek positif pada suatu organisme. meskipun kodon GAA dan GAG baik tentukan asam glutamat (redundansi). or reproduce more quickly. CUU. CUG codons (difference in the first or third position). [ 21 ] Salah satu alasan warisan mutasi frameshift jarang adalah bahwa jika protein yang diterjemahkan sangat penting untuk pertumbuhan di bawah tekanan selektif wajah organisme. [24] yang dapat keuntungan karena virus ini akan berkembang terus-menerus dan cepat . For example the amino acid glutamic acid is specified by GAA and GAG codons (difference in the third position). [25] Dalam populasi besar organisme aseksual reproduksi. multiple beneficial mutations may cooccur. The genetic code has redundancy but no ambiguity (see the codon tables above for the full correlation). UUG. [8] :521-522 . UCG. asam amino leusin ditentukan oleh UUA. Kodon pengkodean satu asam amino dapat berbeda dalam setiap dari tiga posisi. while the amino acid serine is specified by UCA. Degenerasi adalah redundansi kode genetik. Meskipun sebagian besar mutasi yang mengubah urutan protein berbahaya atau netral. [ 25 ] In large populations of asexually reproducing organisms. [22] Mutasi ini dapat mengaktifkan organisme untuk menahan tekanan mutan lingkungan tertentu lebih baik dari tipe liar organisme. dan dengan demikian menghindari tanggapan defensif misalnya manusia sistem kekebalan tubuh . for example. Kode genetik memiliki redundansi. E. kedua atau ketiga). some mutations have a positive effect on an organism. This phenomenon is called clonal interference and causes competition among the mutations. UCU. CUG kodon (perbedaan dalam posisi pertama atau ketiga) . [ 23 ] Viruses that use RNA as their genetic material have rapid mutation rates.mutations may result in severe genetic diseases such as Tay-Sachs disease . UCC. AGC (difference in the first. and thus evade the defensive responses of eg the human immune system . misalnya. For example. sedangkan asam amino serin ditentukan oleh UCA. [ 8 ] :521±522 Misalnya asam amino asam glutamat ditentukan oleh kodon GAA dan GAG (perbedaan dalam posisi ketiga). UUG. AGU. neither of them specifies any other amino acid (no ambiguity). [26] [ edit ] Degeneracy [ sunting ] degenerasi Degeneracy is the redundancy of the genetic code. although codons GAA and GAG both specify glutamic acid (redundancy). the amino acid leucine is specified by UUA. Cuu. adanya protein fungsional dapat menyebabkan kematian sebelum organisme yang layak. Sebagai contoh. [23] Virus yang menggunakan RNA sebagai bahan genetik mereka memiliki tingkat mutasi cepat. [21] Although most mutations that change protein sequences are harmful or neutral. UCG. [ 22 ] These mutations may enable the mutant organism to withstand particular environmental stresses better than wild-type organisms. CUC. The codons encoding one amino acid may differ in any of their three positions. keduanya tidak merinci setiap asam amino lain (ambiguitas). [ 24 ] which can be an advantage since these viruses will evolve constantly and rapidly. atau mereproduksi lebih cepat. Dalam kasus ini mutasi akan cenderung menjadi lebih umum pada populasi melalui seleksi alam . second or third position).

tapi Agustus mengkodekan metionin . posisi ketiga dari glisin kodon (GGA. In computation this position is often treated as a twofold degenerate site. GAG) is a twofold degenerate site. mereka tidak mengubah asam amino. sehingga hanya substitusi transversional (purin atau pirimidin ke pirimidin untuk purin) di dua situs yang nonsynonymous merosot. Salah satunya adalah asam amino metionin . and arginine . GGG. GAG) adalah situs merosot dua kali lipat. The degeneracy of the genetic code is what accounts for the existence of synonymous mutations . sedangkan perubahan ke yang mungkin keempat nukleotida selalu menghasilkan sebuah substitusi asam amino. ditentukan oleh kodon Agustus. AUC. Ini adalah posisi ketiga dari isoleusin kodon: AUU. atau AUA semua menyandikan isoleusin. the equivalent nucleotides are always either two purines (A/G) or two pyrimidines (C/U). There is only one threefold degenerate site where changing to three of the four nucleotides may have no effect on the amino acid (depending on what it is changed to). the third position of the glutamic acid codons (GAA. so only transversional substitutions (purine to pyrimidine or pyrimidine to purine) in twofold degenerate sites are nonsynonymous. One of these is the amino-acid methionine . Only two amino acids are specified by a single codon. which also specifies the start of translation. [ 8 ] :Chp 15 Degenerasi dari kode genetik adalah apa account untuk keberadaan mutasi sinonim . [8] :521-522 There are three amino acids encoded by six different codons: serine . posisi ketiga dari asam glutamat kodon (GAA. dan arginin . Dalam dua merosot situs. the other is tryptophan . because all nucleotide substitutions at this site are synonymous. or AUA all encode isoleucine. leusin . [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot ganda jika hanya dua dari empat nukleotida mungkin pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. karena semua substitusi nukleotida di situs ini adalah sama. Hasil degenerasi karena ada lebih dari kodon asam amino encodable. Misalnya. while changing to the fourth possible nucleotide always results in an amino acid substitution. Ada tiga asam amino dikode oleh enam kodon berbeda: serin . leucine . nukleotida setara selalu baik dua purin (A / G) atau dua pirimidin (C / U). Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot empat kali lipat jika ada nukleotida pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. GGG. Hanya posisi ketiga dari beberapa kodon mungkin empat kali lipat merosot. ie. Misalnya. This is the third position of an isoleucine codon: AUU. specified by the codon AUG. yang juga menentukan awal terjemahan. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a non-degenerate site if any mutation at this position results in amino acid substitution. specified by the codon UGG. For example. ditentukan oleh UGG kodon. For example. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a twofold degenerate site if only two of four possible nucleotides at this position specify the same amino acid. [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs non-merosot jika ada mutasi pada hasil posisi di substitusi asam amino. For example. [ 8 ] :521±522 Dalam perhitungan posisi ini sering dianggap sebagai situs merosot dua kali lipat. GGU) adalah situs merosot empat kali lipat. Hanya dua asam amino ditentukan oleh kodon tunggal. Hanya ada satu tiga merosot situs mana perubahan ke tiga dari empat nukleotida mungkin tidak memiliki efek pada asam amino (tergantung pada apa itu diubah menjadi). In twofold degenerate sites. if there were two bases per . yang lain adalah triptofan . yaitu. they do not change the amino acid. [8] : CHP 15 Degeneracy results because there are more codons than encodable amino acids. but AUG encodes methionine .A position of a codon is said to be a fourfold degenerate site if any nucleotide at this position specifies the same amino acid. GGU) is a fourfold degenerate site. the third position of the glycine codons (GGA. AUC. Only the third positions of some codons may be fourfold degenerate. GGC. GGC.

maka hanya 16 asam amino bisa dikodekan untuk (4 = 16). kesetaraan purin atau pirimidin yang dari pada dua merosot situs menambahkan toleransi kesalahan-lanjut. dan jumlah terbesar berikutnya pangkalan adalah tiga. meskipun penggunaan kodon bias yang membatasi praktek di dalam banyak organisme. the equivalence of purines or that of pyrimidines at twofold degenerate sites adds a further fault-tolerance. Konsekuensi praktis dari redundansi adalah bahwa beberapa kesalahan dalam kode genetik hanya menyebabkan mutasi diam atau kesalahan yang tidak akan mempengaruhi protein karena hidrofilisitas atau hidrofobik dipertahankan dengan substitusi setara dengan asam amino. yang berarti bahwa degenerasi beberapa harus ada. a codon of NUN (where N = any nucleotide) tends to code for hydrophobic amino acids. fourfold degenerate codons can tolerate any point mutation at the third position. [8 ] :531-532 Grouping of codons by amino acid residue molar volume and hydropathy . for example. then only 16 amino acids could be coded for (4 =16). Since transition mutations (purine to purine or pyrimidine to pyrimidine mutations) are more likely than transversion (purine to pyrimidine or vice-versa) mutations. dalam teori. [8] :521-522 These properties of the genetic code make it more fault-tolerant for point mutations . Because at least 21 codes are required (20 amino acids plus stop). empat kali lipat merosot kodon dapat mentolerir setiap mutasi titik pada posisi ketiga. For example. kemudian 4 ³ memberikan 64 kodon mungkin. [ 8 ] :531±532 Sejak transisi mutasi (purin atau pirimidin untuk purin untuk mutasi pirimidin) lebih mungkin dibandingkan transversi (purin untuk pirimidin atau sebaliknya) mutasi. twofold degenerate codons can tolerate one out of the three possible point mutations at the third position. jika ada dua basis per kodon. meaning that some degeneracy must exist. then 4³ gives 64 possible codons. A practical consequence of redundancy is that some errors in the genetic code only cause a silent mutation or an error that would not affect the protein because the hydrophilicity or hydrophobicity is maintained by equivalent substitution of amino acids. dua merosot kodon bisa mentolerir satu dari tiga kemungkinan mutasi titik pada posisi ketiga. .codon. Pengelompokan kodon oleh residu asam amino Volume molar dan pengobatan air . Misalnya. in theory. although codon usage bias restricts this in practice in many organisms. and the next largest number of bases is three. [ 8 ] :521±522 Karena setidaknya 21 kode yang diperlukan (20 asam amino ditambah berhenti). Sifat-sifat dari kode genetik membuatnya lebih fault-tolerant untuk mutasi titik . Sebagai contoh.

NAN encodes average size hydrophilic residues. a mutated hemoglobin gene causes sickle-cell disease . The modified bases include inosine and the Non-Watson-Crick UG basepair. Penyakit sel sabit pada umumnya tidak disebabkan oleh de novo mutasi . that is. causing sickle-cell deformation of erythrocytes . In the mutant hemoglobin a hydrophilic glutamate (Glu) is substituted by the hydrophobic valine (Val). Sickle-cell disease is generally not caused by a de novo mutation . [ 29 ] Melainkan dipilih dalam wilayah geografis di mana malaria adalah umum (dalam cara yang mirip dengan talasemia ). NAN mengkodekan ukuran rata-rata residu hidrofilik. The substitution of glutamate by valine reduces the solubility of -globin which causes hemoglobin to form linear polymers linked by the hydrophobic interaction between the valine groups. menyebabkan sel sabit deformasi dari eritrosit . Many slight variants have been discovered since then. GAA or GAG becomes GUA or GUG. [ 31 ] none were discovered until 1979. [ 32 ] including various alternative mitochondrial codes. Sementara sedikit variasi pada kode standar yang telah diprediksi sebelumnya. suatu kodon dari NUN (di mana N = ada) nukleotida cenderung untuk kode untuk asam amino hidrofobik. Kode-kode variabel untuk asam amino yang diperbolehkan karena basis dimodifikasi di dasar pertama dari antikodon tRNA. bermutasi hemoglobin gen penyebab penyakit sel sabit . [ 27 ] [ 28 ] These tendencies may result from the shared ancestry of the aminoacyl tRNA synthetases related to these codons. Kaya akan menghasilkan residu asam amino yang dalam ukuran kecil dan sedang di pengobatan air. Substitusi glutamat oleh valin mengurangi kelarutan -globin yang menyebabkan hemoglobin untuk membentuk polimer linier dihubungkan oleh interaksi hidrofobik antara kelompok valin. Meskipun redundansi kode genetik. as heterozygous people have some resistance to the malarial Plasmodium parasite ( heterozygote advantage ). NCN yields amino acid residues that are small in size and moderate in hydropathy. sebagai heterozigot orang memiliki beberapa perlawanan terhadap malaria Plasmodium parasit ( heterozigot keuntungan ). and the base-pair formed is called a wobble base pair . [27] [28] Kecenderungan ini mungkin hasil dari keturunan bersama dari tRNA aminoasil sintetase terkait dengan kodon. dan pasangan basa yang terbentuk disebut pasangan basa goyangan . mutasi titik tunggal masih dapat menyebabkan protein disfungsional. yaitu GAA atau GAG menjadi gua atau GUG.misalnya. Rather it is selected for in geographic regions where malaria is common (in a way similar to thalassemia ). [ 33 ] and small variants such as translation of the codon UGA as tryptophan in the species Mycoplasma . single point mutations can still cause dysfunctional proteins. Misalnya. [31] tidak ada yang ditemukan sampai 1979. when researchers studying human mitochondrial genes discovered they used an alternative code. Despite the redundancy of the genetic code. [ 30 ] Basis dimodifikasi termasuk inosin dan basepair UG Non-Watson-Crick. [30] [ edit ] Variations to the standard genetic code [ sunting ] Variasi pada kode genetik standar While slight variations on the standard code had been predicted earlier. Dalam hemoglobin mutan hidrofilik glutamat (Glu) diganti oleh hidrofobik valin (Val). For example. ketika para peneliti mempelajari gen mitokondria manusia menemukan mereka menggunakan kode alternatif. [29] These variable codes for amino acids are allowed because of modified bases in the first base of the anticodon of the tRNA.

and UAG can code for pyrrolysine . tRNA. [32] termasuk berbagai kode mitokondria alternatif. dan mekanisme pengkodean adalah sama untuk semua organisme: tiga-basa kodon. ribosom. non-standard amino acids are substituted for standard stop codons. [36] [37] [ edit ] Origin [ sunting ] Asal Despite the minor variations that exist. protein tertentu dapat menggunakan kodon mulai alternatif biasanya tidak digunakan oleh spesies. kode genetik yang digunakan oleh semua bentuk kehidupan yang diketahui hampir universal. [ 32 ] Selenocysteine sekarang dipandang sebagai asam amino ke-21. [ 34 ] [ 35 ] In bacteria and archaea . tergantung pada urutan sinyal yang terkait di messenger RNA. [ edit ] Expanded genetic code [ sunting ] kode genetik Diperluas Main article: Expanded genetic code Artikel utama: kode genetik Diperluas Since 2001. and the coding mechanism is the same for all organisms: three-base codons. semua kode yang dikenal sangat mirip satu sama lain. there are a huge number of possible . tRNA. tetapi dalam kasus yang jarang. dan UAG dapat kode untuk pyrrolysine .and translation of CUG as a serine rather than a leucine in the genus Candida . UGA can code for selenocysteine . Dalam protein tertentu. all known codes are very similar to each other. dan pyrrolysine dipandang sebagai 22. [33] dan varian kecil seperti terjemahan kodon UGA dari sebagai triptofan pada spesies Mycoplasma dan terjemahan dari CUG sebagai serin daripada leusin dalam genus Candida . GUG and UUG are common start codons. 40 non-natural amino acids have been added into protein by creating a unique codon (recoding) and a corresponding transfer-RNA:aminoacyl ± tRNA-synthetase pair to encode it with diverse physicochemical and biological properties in order to be used as a tool to exploring protein structure and function or to create novel or enhanced proteins. reading the code in the same direction and translating the code three letters at a time into sequences of amino acids. [32] Despite these differences. the genetic code used by all known forms of life is nearly universal. UGA dapat kode untuk selenocysteine . and pyrrolysine is viewed as the 22nd. [34] [35] Dalam bakteri dan archaea .tRNA-sintetase pasangan untuk menyandikan dengan sifat fisikokimia dan biologi yang beragam untuk digunakan sebagai alat untuk mengeksplorasi struktur protein dan fungsi atau untuk membuat protein baru atau ditingkatkan. GUG dan UUG merupakan kodon mulai umum. certain proteins may use alternative start codons not normally used by that species. [ 32 ] Varian sedikit banyak telah ditemukan sejak saat itu. ribosomes. depending on associated signal sequences in the messenger RNA. Meskipun perbedaan ini. but in rare cases. Sebagai contoh. membaca kode dalam arah yang sama dan menerjemahkan kode tiga huruf pada suatu waktu menjadi urutan asam amino. However. [ 36 ] [ 37 ] Sejak tahun 2001. Meskipun variasi kecil yang ada. non-standar asam amino yang diganti untuk kodon stop standar. Selenocysteine is now viewed as the 21st amino acid. [32] In certain proteins. 40 non-alami asam amino ini telah ditambahkan ke dalam protein dengan menciptakan kodon yang unik (pengodean ulang) dan yang sesuai transfer-RNA: aminoasil . For example.

There are enough data to refute the first possibility. The stereochemical code could have created an ancient core of assignments. [46] [ 47] Hal ini telah disebut kode stereokimia.5 x 10 84 possible genetic codes.genetic codes. completely non-random (optimal) or a combination of random and nonrandom. as by-products of metabolism ) and later incorporated some of these into the . tampilan cepat di meja dari kode genetik menunjukkan pengelompokan tugas asam amino. a quick view on the table of the genetic code shows a clustering of amino acid assignments. [ 38 ] Jika asam amino secara acak terkait dengan kodon triplet. [ 46 ] [ 47 ] This has been called the stereochemical code. [ 45 ] Recent experiments show that of the 8 amino acids tested. [41] dan asam amino dengan sifat fisik yang sama cenderung memiliki kodon yang sama. ada sejumlah besar kode genetik mungkin. the genetic code could be completely random (a "frozen accident"). [ 42 ] [ 43 ] Selanjutnya. [39] Theoretically. The current complex translation mechanism involving tRNA and associated enzymes may be a later development. If amino acids are randomly associated with triplet codons.5 x 10 84 kode genetik mungkin. dan mungkin urutan protein secara langsung templated pada urutan basa. Biosynthetic expansion . [ 39 ] Analisis filogenetik RNA transfer menunjukkan molekul tRNA yang berkembang sebelum menetapkan sekarang aminoasil-tRNA sintetase . The standard modern genetic code grew from a simpler earlier code through a process of "biosynthetic expansion". akan ada 1. Prinsip-prinsip kimia mengatur interaksi spesifik RNA dengan asam amino. [ 40 ] For a start. Experiments with aptamers showed that some amino acids have a selective chemical affinity for the base triplets that code for them. Here the idea is that primordial life "discovered" new amino acids (for example. there will be 1. Secara teoritis. 6 menunjukkan beberapa asosiasi RNA triplet-asam amino. Percobaan dengan aptamers menunjukkan bahwa beberapa asam amino memiliki afinitas kimia selektif untuk kembar tiga dasar yang kode untuk mereka. Kode genetik standar modern tumbuh dari kode sebelumnya sederhana melalui proses "ekspansi biosintesis". [40] Untuk memulai. asam amino yang berbagi jalur biosintesis yang sama cenderung memiliki dasar yang sama dalam kodon pertama mereka. amino acids that share the same biosynthetic pathway tend to have the same first base in their codons. Furthermore. and maybe protein sequences were directly templated on base sequences. [38] Phylogenetic analysis of transfer RNA suggests that tRNA molecules evolved before the present set of aminoacyl-tRNA synthetases . benar-benar non-acak (optimal) atau kombinasi dari acak dan nonrandom. [ 41 ] and amino acids with similar physical properties tend to have similar codons. Mekanisme terjemahan saat ini kompleks yang melibatkan tRNA dan enzim terkait mungkin perkembangan kemudian. Ada data yang cukup untuk membantah kemungkinan pertama. Kode stereokimia bisa menciptakan inti kuno tugas. 6 show some RNA triplet-amino acid association. kode genetik bisa benar-benar acak (suatu "kecelakaan beku"). [42] [43] There are four themes running through the many theories about the evolution of the genetic code (and hence the origin of these patterns): [ 44 ] Ada empat tema berjalan melalui banyak teori tentang evolusi kode genetik (dan karenanya asal pola-pola ini): [44] y y Chemical principles govern specific RNA interaction with amino acids. Namun. Biosintesis ekspansi. [45] percobaan terbaru menunjukkan bahwa dari 8 asam amino diuji.

Although much circumstantial evidence has been found to suggest that fewer different amino acids were used in the past than today. Longer than triplet decoding has higher degree of codon redundancy and is more error resistant than the triplet decoding. [ 57 ] Munculnya kode diatur oleh topologi didefinisikan oleh kesalahan yang mungkin dan terkait dengan masalah pewarnaan peta . [48] hipotesis yang tepat dan rinci tentang mana asam amino memasukkan kode dalam rangka apa telah terbukti jauh lebih kontroversial. Ini "tingkat-distorsi" model [55] menunjukkan bahwa kode genetik berasal sebagai akibat dari interaksi dari tiga kekuatan evolusi yang bertentangan: kebutuhan untuk beragam asam amino. This feature could allow accurate decoding in the absence of highly complex translational machinery such as the ribosome . The code emerges at a coding transition when the mapping of codons to amino-acids becomes nonrandom. [ 49 ] [ 50 ] Meskipun banyak bukti telah ditemukan untuk menunjukkan bahwa lebih sedikit asam amino yang berbeda yang digunakan di masa lalu dari hari ini. sebagai produk dari metabolisme ) dan kemudian dimasukkan beberapa ini ke dalam mesin pengkodean genetik. errors) in the channel poses the organism with a fundamental question: how to construct a genetic code that can withstand the impact of noise [ 54 ] while accurately and efficiently translating information? Informasi saluran: Informasi-teori pendekatan melihat kode genetik sebagai saluran rawan kesalahan informasi. [57] [ edit ] See also [ sunting ] Lihat juga y DNA .y y machinery of genetic coding. Information channels: Information-theoretic approaches see the genetic code as an error-prone information channel. [53] Suara melekat (yaitu. Kode muncul pada transisi pengkodean ketika pemetaan kodon untuk asam amino menjadi nonrandom. [ 48 ] precise and detailed hypotheses about which amino acids entered the code in what order have proved far more controversial. [51] Sebuah hipotesis baru [52] menunjukkan bahwa kode triplet berasal dari kode yang digunakan lebih dari kodon triplet. [ 56 ] for error-tolerance [ 51 ] and for minimal cost of resources. [56] untuk kesalahan-toleransi [51] dan untuk minim biaya sumber daya. Berikut gagasan adalah bahwa kehidupan purba "menemukan" asam amino baru (misalnya. kesalahan) dalam saluran pose organisme dengan pertanyaan mendasar: bagaimana membangun sebuah kode genetik yang dapat menahan dampak kebisingan [54] sementara secara akurat dan informasi secara efisien menerjemahkan? These rate-distortion´ models [ 55 ] suggest that the genetic code originated as a result of the interplay of the three conflicting evolutionary forces: the needs for diverse amino-acids. Fitur ini dapat memungkinkan decoding akurat dalam ketiadaan mesin translasi yang sangat kompleks seperti ribosom . [ 53 ] The inherent noise (that is. Seleksi alam telah menyebabkan tugas kodon dari kode genetik yang meminimalkan efek mutasi . The emergence of the code is governed by the topology defined by the probable errors and is related to the map coloring problem . [ 51 ] A recent hypothesis [ 52 ] suggests that the triplet code was derived from codes that used longer than triplet codons. [49] [50 ] Natural selection has led to codon assignments of the genetic code that minimize the effects of mutations . Lebih lama dari triplet decoding memiliki tingkat yang lebih tinggi kodon redundansi dan lebih tahan daripada kesalahan triplet decoding.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful