menunjukkan apa yang masing-masing asam amino dari 64 kodon menentukan.

Table 2 shows what codons specify each of the 20 standard amino acids involved in translation. Tabel 2 menunjukkan apa kodon menentukan masing-masing dari 20 asam amino standar yang terlibat dalam penerjemahan. These are called forward and reverse codon tables, respectively. Ini disebut maju dan mundur tabel kodon, masing-masing. For example, the codon AAU represents the amino acid asparagine , and UGU and UGC represent cysteine (standard three-letter designations, Asn and Cys, respectively). [ 8 ] :522 Sebagai contoh, AAU merupakan kodon asam amino asparagin , dan UGU UGC mewakili dan sistein (standar tiga huruf sebutan, Asn, dan Cys, masing-masing). [8] : 522

[ edit ] RNA codon table [ sunting ] kodon RNA tabel
nonpolar nonpolar polar kutub basic dasar acidic asam (stop codon) (Berhenti kodon) UU (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin (Phe/F) Phenylalanine (Phe / F) Fenilalanin 2nd base 2 dasar CC A Sebuah (Tyr/Y) (Ser/S) UAU Tyrosine Serine (Ser UAU (Tyr / Y) / S) serin Tirosin (Tyr/Y) (Ser/S) UAC Tyrosine Serine (Ser UAC (Tyr / Y) / S) serin Tirosin Stop ( (Ser/S) UAA Ochre ) Serine (Ser UAA Berhenti / S) serin (Ochre) Stop ( (Ser/S) UAG Amber ) Serine (Ser UAG Stop / S) serin (Amber) (Pro/P) (His/H) Proline CAU Histidine (/ (Pro / P) CAU Nya H) Proline histidin (Pro/P) (His/H) Proline CAC Histidine (/ (Pro / P) CAC Nya H) Proline histidin (Pro/P) (Gln/Q) Proline CAA Glutamine (Pro / P) CAA (GLN / T) Proline Glutamin GG (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina (Cys/C) Cysteine (Cys / C) Sisteina

UUU UUU

UCU UCU

UGU UGU

UUC UUC UU UUA UUA 1st base 1 dasar

UCC UCC

UGC UGC

(Leu/L) UCA Leucine (Leu / UCA L) Leusin (Leu/L) UCG Leucine (Leu / UCG L) Leusin (Leu/L) CCU Leucine (Leu / CCU L) Leusin (Leu/L) CCC Leucine (Leu / CCC L) Leusin (Leu/L) CCA Leucine (Leu / CCA L) Leusin

Stop ( Opal UGA ) Stop UGA (Opal) UGG UGG (Trp/W) Tryptophan (Trp / W) Tryptophan (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin (Arg/R) Arginine (Arg / R) Arginin

UUG UUG

CUU Cuu

CGU CGU

CC

CUC CUC

CGC LKP

CUA CUA

CGA CGA

[ 9 ] Sebuah kodon ini Agustus kedua kode untuk metionin dan berfungsi sebagai situs inisiasi: yang .(Pro/P) (Leu/L) CCG Proline Leucine (Leu / CCG (Pro / P) L) Leusin Proline (Thr/T) (Ile/I) AUU ACU Threonine Isoleucine (Ile AUU ACU (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Thr/T) (Ile/I) AUC ACC Threonine Isoleucine (Ile AUC ACC (Thr / T) / I) isoleucine treonin A Sebuah (Thr/T) (Ile/I) AUA ACA Threonine Isoleucine (Ile AUA ACA (Thr / T) / I) isoleucine treonin (Met/M) (Thr/T) AUG [A] Methionine ACG Threonine Agustus ACG (Thr / T) (Met / M) [A] Metionin treonin CUG CUG (Gln/Q) CAG Glutamine CAG (GLN / T) Glutamin (Asn/N) AAU Asparagine AAU (Asn / N) Asparagin (Asn/N) AAC Asparagine AAC (Asn / N) Asparagin (Arg/R) CGG Arginine CGG (Arg / R) Arginin (Ser/S) AGU Serine (Ser / AGU S) serin (Ser/S) AGC Serine (Ser / AGC S) serin (Arg/R) (Lys/K) AAA AGA Arginine Lysine (Lys AAA AGA (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Arg/R) (Lys/K) AAG AGG Arginine Lysine (Lys AAG Agg (Arg / R) / K) Lisin Arginin (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUU GCU Alanine GAU GGU Glycine (Val / V) acid (Asp / GUU GCU (Ala / A) GAU GGU (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat (Asp/D) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Aspartic GUC GCC Alanine GAC GGC Glycine (Val / V) acid (Asp / GUC GCC (Ala / A) GAC GGC (Gly / G) valine D) Asam Alanin Glycine aspartat GG (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUA GCA Alanine GAA GGA Glycine (Val / V) acid (Glu / Gua GCA (Ala / A) GAA GGA (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat (Glu/E) (Ala/A) (Gly/G) (Val/V) Valine Glutamic GUG GCG Alanine GAG GGG Glycine (Val / V) acid (Glu / GUG GCG (Ala / A) GAG GGG (Gly / G) valine E) asam Alanin Glycine glutamat A The codon AUG both codes for methionine and serves as an initiation site: the first AUG in an mRNA 's coding region is where translation into protein begins.

Thr/T Thr / T ACU. CAG UCG. Pro/P Pro / P CCU. AGA. GCC. AGC UCU. UCC. AAG Arg / R CGC. Leu/L Leu / L UUA. Cuu. [9] Inverse table Invers tabel Ala/A GCU. UCC. Met/M Met / M AUG Agustus Asn / N AAC AAU. GCG GCU. CUA. UUC Asp / D GAC GAU. GAC Cys/C UGU. GAG Gly/G GGU. Lys/K Lys / K AAA. AGG CGU. AGU. GCG Arg/R CGU. ACC. CUA. Trp/W Trp / W UGG UGG .Agustus pertama dalam mRNA kawasan coding adalah di mana terjemahan dalam protein dimulai. GCA. AAC Asp/D GAU. Ser/S Ser / S UCU. CCC. UCG. CUC. CCC. AGC GLN / CAA. CGA. AAG AAA. CGG. ACC. Agg Asn/N AAU. CCG CCU. UUG. ACA. UCA. UUG. Phe/F Phe / F UUU. CGC. CUC. T CAG Glu/E GAA. UCA. AGU. UUC UUU. CUG Ala / A GCC. CGG. CCA. GCA. CGA. CUU. CCG Cys / C UGC UGU. ACA. CUG UUA. CCA. AGA. ACG Glu / E GAG GAA. UGC Gln/Q CAA. ACG ACU.

GUA. Gly-Asn. jika membaca mulai dari posisi ketiga. GUC. GUG AUC. but with U replaced by T . if read starting from the third position. Tabel kodon DNA pada dasarnya identik dengan bahwa untuk RNA. three in the forward . AUA UAA. or Glu-Thr. With double-stranded DNA there are six possible reading frames . For example. GUC. UAG UAA. AAA dan CCC. if read from the second position. berisi GGA kodon dan AAC. the string GGGAAACCC. GGC. Gly-Lys-Pro. AUC. GGA. and. GGA. CAC Ile/I Ile AUU. string GGGAAACCC. Gly-Lys-Pro. jika dibaca dari posisi pertama. Val/V Val / V GUU. UGA. GGG GGU. jika dibaca dari posisi kedua. GAA and ACC. atau Glu-Thr. tetapi dengan U digantikan oleh T . berisi GGG kodon. masing-masing akan menghasilkan urutan asam amino yang berbeda (dalam contoh yang diberikan. respectively). Every sequence can thus be read in three reading frames . Tyr/Y Tyr / Y UAU. AAA and CCC. /I AUA AUU. Gly-Asn. UAG START AUG STOP MULAI Agustus BERHENTI [ edit ] DNA codon table [ sunting ] DNA kodon tabel Main article: DNA codon table Artikel utama: DNA tabel kodon The DNA codon table is essentially identical to that for RNA. gua. [ edit ] Salient features [ sunting ] fitur penting [ edit ] Sequence reading frame [ sunting ] Urutan bingkai membaca A codon is defined by the initial nucleotide from which translation starts. dan. if read from the first position. UAC UAU. GGG His/H CAU. UGA. each of which will produce a different amino acid sequence (in the given example. UAC Nya / H CAC CAU. Sebagai contoh. GAA dan ACC. contains the codons GGG. Setiap urutan sehingga dapat dibaca dalam tiga frame membaca . masingmasing). it contains the codons GGA and AAC.Gly / G GGC. Sebuah kodon didefinisikan oleh nukleotida awal dari terjemahan mana yang dimulai. GUG GUU.

Dua lainnya kodon stop diberi nama "oker" dan "opal" untuk menjaga "nama warna" tema. Unlike stop codons. Stop codons are also called "termination" or "nonsense" codons. The other two stop codons were named "ochre" and "opal" in order to keep the "color names" theme. as formylmethionine. they are translated as methionine or formylmethionine. Terjemahan dimulai dengan rantai kodon inisiasi (kodon start). Nearby sequences (such as the Shine-Dalgarno sequence in E. tetapi sebagai kodon start. and so a release factor binds to the ribosome instead. dan sehingga faktor rilis mengikat ribosom. Ketiga kodon stop telah diberi nama: UAG menyala kuning. but as a start codon. dan UAA adalah oker.. include "GUG" or "UUG". [10] : 330 frame yang sebenarnya di mana urutan protein diterjemahkan didefinisikan oleh kodon start . usually the first AUG codon in the mRNA sequence. masing-masing. Kodon stop juga disebut "penghentian" atau "omong kosong" kodon. UGA merupakan opal (kadang-kadang juga disebut Umber). respectively. Dengan DNA beruntai ganda mungkin ada enam frame membaca . whose last name means "amber" in German. biasanya yang pertama Agustus di urutan kodon mRNA. yang terakhir namanya berarti "kuning" dalam bahasa Jerman.orientation on one strand and three reverse on the opposite strand. bukan. tiga orientasi ke depan pada satu untai dan tiga mundur pada untai berlawanan. [ 12 ] Mereka sinyal pelepasan polipeptida baru lahir dari ribosom karena tidak ada tRNA yang serumpun yang telah anticodons pelengkap untuk sinyal-sinyal berhenti. coli ) dan faktor inisiasi juga dibutuhkan untuk memulai penerjemahan. UGA is opal (sometimes also called umber ). and UAA is ochre . the codon alone is not sufficient to begin the process. termasuk "GUG" atau "UUG". [ 11 ] Kodon mulai Alternatif (tergantung pada organisme). Kodon ini biasanya mewakili valin dan leusin. in bacteria. pada bakteri. Urutan terdekat (seperti Shine-Dalgarno urutan dalam E. [ edit ] Start/stop codons [ sunting ] Mulai / stop kodon Translation starts with a chain initiation codon (start codon). Kodon start paling umum adalah Agustus yang dibaca sebagai metionin atau. Tidak seperti kodon stop. "Amber" was named by discoverers Richard Epstein and Charles Steinberg after their friend Harris Bernstein. The most common start codon is AUG which is read as methionine or. [12] [ edit ] Effect of mutations [ sunting ] Pengaruh mutasi . "Amber" disebut oleh penemu Richard Epstein dan Charles Steinberg setelah teman mereka Harris Bernstein. [ 10 ] :330 The actual frame in which a protein sequence is translated is defined by a start codon . these codons normally represent valine and leucine. sebagai formilmetionin. coli ) and initiation factors are also required to start translation. mereka diterjemahkan sebagai metionin atau formilmetionin [11] The three stop codons have been given names: UAG is amber . kodon saja tidak cukup untuk memulai proses. They signal release of the nascent polypeptide from the ribosome because there is no cognate tRNA that has anticodons complementary to these stop signals. Alternative start codons (depending on the organism).

which can cause genetic diseases such as sickle-cell disease and thalassemia respectively. Kesalahan ini. especially if they occur within the protein coding sequence of a gene. These mutations usually result in a completely different translation from the original. acidic polar or non-polar. One reason inheritance of frameshift mutations is rare is that if the protein being translated is essential for growth under the selective pressures the organism faces. kadang-kadang terjadi kesalahan dalam polimerisasi untai kedua.Examples of notable mutations that can occur in humans. can have an impact on the phenotype of an organism. These errors. Mutasi yang mengganggu urutan frame membaca dengan indels ( insersi atau penghapusan ) dari non-kelipatan 3 basa nukleotida yang dikenal sebagai mutasi frameshift . Selama proses replikasi DNA . dan demikian jarang terjadi di in vivo protein-coding urutan. sedangkan mutasi nonsense menghasilkan kodon stop . [13] During the process of DNA replication . [ 13 ] Contoh terkenal mutasi yang dapat terjadi pada manusia. called mutations . yang memotong penciptaan protein. whereas nonsense mutations result in a stop codon . and are also very likely to cause a stop codon to be read. [10] : 266 Mutations that disrupt the reading frame sequence by indels ( insertions or deletions ) of a nonmultiple of 3 nucleotide bases are known as frameshift mutations . terutama jika mereka terjadi dalam urutan pengkode protein dari gen. [ 10 ] :266 Missense mutasi dan mutasi nonsense adalah contoh dari mutasi titik . yang dapat menyebabkan penyakit genetik seperti penyakit sel sabit dan talasemia masing-masing. [19] Mutasi ini dapat mengganggu fungsi dari protein yang dihasilkan. dapat memiliki dampak pada fenotipe organisme. asam polar atau non polar. [ 19 ] These mutations may impair the function of the resulting protein. [ 14 ] [ 15 ] Tingkat kesalahan biasanya kesalahan yang sangat rendah-1 di setiap 10-100 juta basis-karena kemampuan "proofreading" dari DNA polimerase . dan juga sangat mungkin untuk menyebabkan kodon stop untuk dibaca. Mutasi ini biasanya menghasilkan terjemahan yang sama sekali berbeda dari aslinya. errors occasionally occur in the polymerization of the second strand. [14] [15] Missense mutations and nonsense mutations are examples of point mutations . [ 20 ] Frameshift . yang disebut mutasi . and are thus rare in in vivo protein-coding sequences. [16] [17] [18] mutasi missense klinis yang penting pada umumnya mengubah properti dari residu asam amino antara kode menjadi dasar. absence of a functional protein may cause death before the organism is viable. Error rates are usually very low²1 error in every 10±100 million bases²due to the "proofreading" ability of DNA polymerases . which truncates the creation of the protein. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] Clinically important missense mutations generally change the properties of the coded amino acid residue between being basic.

UUG. some mutations have a positive effect on an organism. [ 26 ] Fenomena ini disebut gangguan klonal dan menyebabkan persaingan di antara mutasi. AGU. UCU. This phenomenon is called clonal interference and causes competition among the mutations. The codons encoding one amino acid may differ in any of their three positions. atau mereproduksi lebih cepat. meskipun kodon GAA dan GAG baik tentukan asam glutamat (redundansi). Degenerasi adalah redundansi kode genetik. UCC. For example the amino acid glutamic acid is specified by GAA and GAG codons (difference in the third position). CUU. CUA. CUG codons (difference in the first or third position). adanya protein fungsional dapat menyebabkan kematian sebelum organisme yang layak. [ 24 ] which can be an advantage since these viruses will evolve constantly and rapidly. sedangkan asam amino serin ditentukan oleh UCA. UCU. CUG kodon (perbedaan dalam posisi pertama atau ketiga) . UCG. second or third position). [ 8 ] :521±522 Misalnya asam amino asam glutamat ditentukan oleh kodon GAA dan GAG (perbedaan dalam posisi ketiga). tapi tidak ada ambiguitas (lihat tabel kodon di atas untuk korelasi penuh). [22] Mutasi ini dapat mengaktifkan organisme untuk menahan tekanan mutan lingkungan tertentu lebih baik dari tipe liar organisme.mutations may result in severe genetic diseases such as Tay-Sachs disease . [20] mutasi frameshift dapat mengakibatkan berat penyakit genetik seperti penyakit Tay-Sachs . Sebagai contoh. mutasi yang menguntungkan beberapa mungkin co-terjadi. AGC (difference in the first. Dalam kasus ini mutasi akan cenderung menjadi lebih umum pada populasi melalui seleksi alam . dan dengan demikian menghindari tanggapan defensif misalnya manusia sistem kekebalan tubuh . neither of them specifies any other amino acid (no ambiguity). [21] Although most mutations that change protein sequences are harmful or neutral. [25] Dalam populasi besar organisme aseksual reproduksi. The genetic code has redundancy but no ambiguity (see the codon tables above for the full correlation). UUG. coli . Cuu. UCC. the amino acid leucine is specified by UUA. keduanya tidak merinci setiap asam amino lain (ambiguitas). Kodon pengkodean satu asam amino dapat berbeda dalam setiap dari tiga posisi. [8] :521-522 . In these cases a mutation will tend to become more common in a population through natural selection . misalnya. CUC. CUA. [ 22 ] These mutations may enable the mutant organism to withstand particular environmental stresses better than wild-type organisms. [26] [ edit ] Degeneracy [ sunting ] degenerasi Degeneracy is the redundancy of the genetic code. or reproduce more quickly. [ 23 ] Viruses that use RNA as their genetic material have rapid mutation rates. for example. [23] Virus yang menggunakan RNA sebagai bahan genetik mereka memiliki tingkat mutasi cepat. coli. [24] yang dapat keuntungan karena virus ini akan berkembang terus-menerus dan cepat . Meskipun sebagian besar mutasi yang mengubah urutan protein berbahaya atau netral. AGU. E. beberapa mutasi memiliki efek positif pada suatu organisme. AGC (perbedaan dalam posisi pertama. [ 21 ] Salah satu alasan warisan mutasi frameshift jarang adalah bahwa jika protein yang diterjemahkan sangat penting untuk pertumbuhan di bawah tekanan selektif wajah organisme. asam amino leusin ditentukan oleh UUA. UCG. CUC. although codons GAA and GAG both specify glutamic acid (redundancy). and thus evade the defensive responses of eg the human immune system . [ 25 ] In large populations of asexually reproducing organisms. kedua atau ketiga). E. For example. while the amino acid serine is specified by UCA. Kode genetik memiliki redundansi. multiple beneficial mutations may cooccur.

the third position of the glutamic acid codons (GAA. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a non-degenerate site if any mutation at this position results in amino acid substitution. posisi ketiga dari glisin kodon (GGA. There is only one threefold degenerate site where changing to three of the four nucleotides may have no effect on the amino acid (depending on what it is changed to). [8] :521-522 There are three amino acids encoded by six different codons: serine . GGC. and arginine . GGU) adalah situs merosot empat kali lipat. sedangkan perubahan ke yang mungkin keempat nukleotida selalu menghasilkan sebuah substitusi asam amino. the third position of the glycine codons (GGA. Salah satunya adalah asam amino metionin . Ini adalah posisi ketiga dari isoleusin kodon: AUU. sehingga hanya substitusi transversional (purin atau pirimidin ke pirimidin untuk purin) di dua situs yang nonsynonymous merosot. specified by the codon UGG. For example. GGG. ditentukan oleh kodon Agustus. Misalnya. leusin . [ 8 ] :Chp 15 Degenerasi dari kode genetik adalah apa account untuk keberadaan mutasi sinonim . For example. or AUA all encode isoleucine. so only transversional substitutions (purine to pyrimidine or pyrimidine to purine) in twofold degenerate sites are nonsynonymous. [8] : CHP 15 Degeneracy results because there are more codons than encodable amino acids. GGG. karena semua substitusi nukleotida di situs ini adalah sama. the other is tryptophan . dan arginin . [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot ganda jika hanya dua dari empat nukleotida mungkin pada posisi ini menentukan asam amino yang sama. GGC. the equivalent nucleotides are always either two purines (A/G) or two pyrimidines (C/U). In twofold degenerate sites. yang juga menentukan awal terjemahan. yaitu. AUC. GAG) adalah situs merosot dua kali lipat. The degeneracy of the genetic code is what accounts for the existence of synonymous mutations . if there were two bases per . In computation this position is often treated as a twofold degenerate site. One of these is the amino-acid methionine . but AUG encodes methionine . GAG) is a twofold degenerate site. This is the third position of an isoleucine codon: AUU. Dalam dua merosot situs. specified by the codon AUG. atau AUA semua menyandikan isoleusin. [ 8 ] :521±522 A position of a codon is said to be a twofold degenerate site if only two of four possible nucleotides at this position specify the same amino acid. which also specifies the start of translation. Only the third positions of some codons may be fourfold degenerate. ie. ditentukan oleh UGG kodon. AUC. Hanya ada satu tiga merosot situs mana perubahan ke tiga dari empat nukleotida mungkin tidak memiliki efek pada asam amino (tergantung pada apa itu diubah menjadi). For example. Only two amino acids are specified by a single codon. Ada tiga asam amino dikode oleh enam kodon berbeda: serin . because all nucleotide substitutions at this site are synonymous. Hanya dua asam amino ditentukan oleh kodon tunggal. GGU) is a fourfold degenerate site. [8] :521-522 Sebuah posisi kodon dikatakan situs non-merosot jika ada mutasi pada hasil posisi di substitusi asam amino. yang lain adalah triptofan . Hasil degenerasi karena ada lebih dari kodon asam amino encodable. [ 8 ] :521±522 Dalam perhitungan posisi ini sering dianggap sebagai situs merosot dua kali lipat. posisi ketiga dari asam glutamat kodon (GAA. tapi Agustus mengkodekan metionin . leucine . Hanya posisi ketiga dari beberapa kodon mungkin empat kali lipat merosot. Misalnya. they do not change the amino acid. Sebuah posisi kodon dikatakan situs merosot empat kali lipat jika ada nukleotida pada posisi ini menentukan asam amino yang sama.A position of a codon is said to be a fourfold degenerate site if any nucleotide at this position specifies the same amino acid. while changing to the fourth possible nucleotide always results in an amino acid substitution. nukleotida setara selalu baik dua purin (A / G) atau dua pirimidin (C / U). mereka tidak mengubah asam amino.

Since transition mutations (purine to purine or pyrimidine to pyrimidine mutations) are more likely than transversion (purine to pyrimidine or vice-versa) mutations. and the next largest number of bases is three. Pengelompokan kodon oleh residu asam amino Volume molar dan pengobatan air . dan jumlah terbesar berikutnya pangkalan adalah tiga. Sebagai contoh. fourfold degenerate codons can tolerate any point mutation at the third position. yang berarti bahwa degenerasi beberapa harus ada. [8] :521-522 These properties of the genetic code make it more fault-tolerant for point mutations . kemudian 4 ³ memberikan 64 kodon mungkin. [8 ] :531-532 Grouping of codons by amino acid residue molar volume and hydropathy . twofold degenerate codons can tolerate one out of the three possible point mutations at the third position. For example. . meskipun penggunaan kodon bias yang membatasi praktek di dalam banyak organisme. for example. meaning that some degeneracy must exist. [ 8 ] :531±532 Sejak transisi mutasi (purin atau pirimidin untuk purin untuk mutasi pirimidin) lebih mungkin dibandingkan transversi (purin untuk pirimidin atau sebaliknya) mutasi. Misalnya. maka hanya 16 asam amino bisa dikodekan untuk (4 = 16). kesetaraan purin atau pirimidin yang dari pada dua merosot situs menambahkan toleransi kesalahan-lanjut. the equivalence of purines or that of pyrimidines at twofold degenerate sites adds a further fault-tolerance. Konsekuensi praktis dari redundansi adalah bahwa beberapa kesalahan dalam kode genetik hanya menyebabkan mutasi diam atau kesalahan yang tidak akan mempengaruhi protein karena hidrofilisitas atau hidrofobik dipertahankan dengan substitusi setara dengan asam amino. A practical consequence of redundancy is that some errors in the genetic code only cause a silent mutation or an error that would not affect the protein because the hydrophilicity or hydrophobicity is maintained by equivalent substitution of amino acids. Because at least 21 codes are required (20 amino acids plus stop). jika ada dua basis per kodon.codon. dalam teori. empat kali lipat merosot kodon dapat mentolerir setiap mutasi titik pada posisi ketiga. in theory. a codon of NUN (where N = any nucleotide) tends to code for hydrophobic amino acids. then 4³ gives 64 possible codons. Sifat-sifat dari kode genetik membuatnya lebih fault-tolerant untuk mutasi titik . [ 8 ] :521±522 Karena setidaknya 21 kode yang diperlukan (20 asam amino ditambah berhenti). although codon usage bias restricts this in practice in many organisms. dua merosot kodon bisa mentolerir satu dari tiga kemungkinan mutasi titik pada posisi ketiga. then only 16 amino acids could be coded for (4 =16).

ketika para peneliti mempelajari gen mitokondria manusia menemukan mereka menggunakan kode alternatif. sebagai heterozigot orang memiliki beberapa perlawanan terhadap malaria Plasmodium parasit ( heterozigot keuntungan ). [31] tidak ada yang ditemukan sampai 1979. yaitu GAA atau GAG menjadi gua atau GUG. Kode-kode variabel untuk asam amino yang diperbolehkan karena basis dimodifikasi di dasar pertama dari antikodon tRNA. mutasi titik tunggal masih dapat menyebabkan protein disfungsional. [ 29 ] Melainkan dipilih dalam wilayah geografis di mana malaria adalah umum (dalam cara yang mirip dengan talasemia ). dan pasangan basa yang terbentuk disebut pasangan basa goyangan . Sementara sedikit variasi pada kode standar yang telah diprediksi sebelumnya. [29] These variable codes for amino acids are allowed because of modified bases in the first base of the anticodon of the tRNA. when researchers studying human mitochondrial genes discovered they used an alternative code. Sickle-cell disease is generally not caused by a de novo mutation . Meskipun redundansi kode genetik. The substitution of glutamate by valine reduces the solubility of -globin which causes hemoglobin to form linear polymers linked by the hydrophobic interaction between the valine groups. NAN encodes average size hydrophilic residues. that is. [ 31 ] none were discovered until 1979. bermutasi hemoglobin gen penyebab penyakit sel sabit . [27] [28] Kecenderungan ini mungkin hasil dari keturunan bersama dari tRNA aminoasil sintetase terkait dengan kodon. as heterozygous people have some resistance to the malarial Plasmodium parasite ( heterozygote advantage ). Substitusi glutamat oleh valin mengurangi kelarutan -globin yang menyebabkan hemoglobin untuk membentuk polimer linier dihubungkan oleh interaksi hidrofobik antara kelompok valin. [ 27 ] [ 28 ] These tendencies may result from the shared ancestry of the aminoacyl tRNA synthetases related to these codons. GAA or GAG becomes GUA or GUG. Penyakit sel sabit pada umumnya tidak disebabkan oleh de novo mutasi . Rather it is selected for in geographic regions where malaria is common (in a way similar to thalassemia ). [ 30 ] Basis dimodifikasi termasuk inosin dan basepair UG Non-Watson-Crick. [ 32 ] including various alternative mitochondrial codes. and the base-pair formed is called a wobble base pair . Dalam hemoglobin mutan hidrofilik glutamat (Glu) diganti oleh hidrofobik valin (Val). menyebabkan sel sabit deformasi dari eritrosit . NCN yields amino acid residues that are small in size and moderate in hydropathy. Kaya akan menghasilkan residu asam amino yang dalam ukuran kecil dan sedang di pengobatan air. suatu kodon dari NUN (di mana N = ada) nukleotida cenderung untuk kode untuk asam amino hidrofobik. For example. [30] [ edit ] Variations to the standard genetic code [ sunting ] Variasi pada kode genetik standar While slight variations on the standard code had been predicted earlier. a mutated hemoglobin gene causes sickle-cell disease . In the mutant hemoglobin a hydrophilic glutamate (Glu) is substituted by the hydrophobic valine (Val). [ 33 ] and small variants such as translation of the codon UGA as tryptophan in the species Mycoplasma .misalnya. Despite the redundancy of the genetic code. causing sickle-cell deformation of erythrocytes . single point mutations can still cause dysfunctional proteins. The modified bases include inosine and the Non-Watson-Crick UG basepair. Many slight variants have been discovered since then. Misalnya. NAN mengkodekan ukuran rata-rata residu hidrofilik.

[ 32 ] Selenocysteine sekarang dipandang sebagai asam amino ke-21. [32] In certain proteins. ribosomes. dan mekanisme pengkodean adalah sama untuk semua organisme: tiga-basa kodon. non-standard amino acids are substituted for standard stop codons. tRNA. Meskipun variasi kecil yang ada. [36] [37] [ edit ] Origin [ sunting ] Asal Despite the minor variations that exist. [33] dan varian kecil seperti terjemahan kodon UGA dari sebagai triptofan pada spesies Mycoplasma dan terjemahan dari CUG sebagai serin daripada leusin dalam genus Candida . certain proteins may use alternative start codons not normally used by that species. GUG and UUG are common start codons. [34] [35] Dalam bakteri dan archaea . Dalam protein tertentu. reading the code in the same direction and translating the code three letters at a time into sequences of amino acids. tetapi dalam kasus yang jarang. 40 non-natural amino acids have been added into protein by creating a unique codon (recoding) and a corresponding transfer-RNA:aminoacyl ± tRNA-synthetase pair to encode it with diverse physicochemical and biological properties in order to be used as a tool to exploring protein structure and function or to create novel or enhanced proteins. Selenocysteine is now viewed as the 21st amino acid. dan pyrrolysine dipandang sebagai 22. UGA can code for selenocysteine . [32] termasuk berbagai kode mitokondria alternatif.and translation of CUG as a serine rather than a leucine in the genus Candida . kode genetik yang digunakan oleh semua bentuk kehidupan yang diketahui hampir universal. there are a huge number of possible . depending on associated signal sequences in the messenger RNA. tRNA. However. semua kode yang dikenal sangat mirip satu sama lain. protein tertentu dapat menggunakan kodon mulai alternatif biasanya tidak digunakan oleh spesies. 40 non-alami asam amino ini telah ditambahkan ke dalam protein dengan menciptakan kodon yang unik (pengodean ulang) dan yang sesuai transfer-RNA: aminoasil . tergantung pada urutan sinyal yang terkait di messenger RNA. Meskipun perbedaan ini. the genetic code used by all known forms of life is nearly universal. ribosom. all known codes are very similar to each other. non-standar asam amino yang diganti untuk kodon stop standar. GUG dan UUG merupakan kodon mulai umum. [ edit ] Expanded genetic code [ sunting ] kode genetik Diperluas Main article: Expanded genetic code Artikel utama: kode genetik Diperluas Since 2001. Sebagai contoh. membaca kode dalam arah yang sama dan menerjemahkan kode tiga huruf pada suatu waktu menjadi urutan asam amino. For example. and pyrrolysine is viewed as the 22nd. [ 32 ] Varian sedikit banyak telah ditemukan sejak saat itu. UGA dapat kode untuk selenocysteine . [32] Despite these differences. [ 34 ] [ 35 ] In bacteria and archaea . and UAG can code for pyrrolysine . and the coding mechanism is the same for all organisms: three-base codons.tRNA-sintetase pasangan untuk menyandikan dengan sifat fisikokimia dan biologi yang beragam untuk digunakan sebagai alat untuk mengeksplorasi struktur protein dan fungsi atau untuk membuat protein baru atau ditingkatkan. dan UAG dapat kode untuk pyrrolysine . but in rare cases. [ 36 ] [ 37 ] Sejak tahun 2001.

Ada data yang cukup untuk membantah kemungkinan pertama. [ 45 ] Recent experiments show that of the 8 amino acids tested. Kode genetik standar modern tumbuh dari kode sebelumnya sederhana melalui proses "ekspansi biosintesis". as by-products of metabolism ) and later incorporated some of these into the . Secara teoritis. Percobaan dengan aptamers menunjukkan bahwa beberapa asam amino memiliki afinitas kimia selektif untuk kembar tiga dasar yang kode untuk mereka. [45] percobaan terbaru menunjukkan bahwa dari 8 asam amino diuji. [38] Phylogenetic analysis of transfer RNA suggests that tRNA molecules evolved before the present set of aminoacyl-tRNA synthetases . 6 menunjukkan beberapa asosiasi RNA triplet-asam amino. Prinsip-prinsip kimia mengatur interaksi spesifik RNA dengan asam amino. [39] Theoretically. There are enough data to refute the first possibility. [ 40 ] For a start. The stereochemical code could have created an ancient core of assignments. The standard modern genetic code grew from a simpler earlier code through a process of "biosynthetic expansion". Mekanisme terjemahan saat ini kompleks yang melibatkan tRNA dan enzim terkait mungkin perkembangan kemudian. Experiments with aptamers showed that some amino acids have a selective chemical affinity for the base triplets that code for them. Kode stereokimia bisa menciptakan inti kuno tugas. [ 41 ] and amino acids with similar physical properties tend to have similar codons. kode genetik bisa benar-benar acak (suatu "kecelakaan beku"). benar-benar non-acak (optimal) atau kombinasi dari acak dan nonrandom. amino acids that share the same biosynthetic pathway tend to have the same first base in their codons. a quick view on the table of the genetic code shows a clustering of amino acid assignments. there will be 1. dan mungkin urutan protein secara langsung templated pada urutan basa. completely non-random (optimal) or a combination of random and nonrandom. and maybe protein sequences were directly templated on base sequences. Biosynthetic expansion . [41] dan asam amino dengan sifat fisik yang sama cenderung memiliki kodon yang sama. akan ada 1. Biosintesis ekspansi. asam amino yang berbagi jalur biosintesis yang sama cenderung memiliki dasar yang sama dalam kodon pertama mereka. If amino acids are randomly associated with triplet codons. Namun. [46] [ 47] Hal ini telah disebut kode stereokimia. [ 38 ] Jika asam amino secara acak terkait dengan kodon triplet.5 x 10 84 kode genetik mungkin. tampilan cepat di meja dari kode genetik menunjukkan pengelompokan tugas asam amino. ada sejumlah besar kode genetik mungkin. [ 42 ] [ 43 ] Selanjutnya. [ 39 ] Analisis filogenetik RNA transfer menunjukkan molekul tRNA yang berkembang sebelum menetapkan sekarang aminoasil-tRNA sintetase . Furthermore. 6 show some RNA triplet-amino acid association. Here the idea is that primordial life "discovered" new amino acids (for example. [40] Untuk memulai.5 x 10 84 possible genetic codes. [42] [43] There are four themes running through the many theories about the evolution of the genetic code (and hence the origin of these patterns): [ 44 ] Ada empat tema berjalan melalui banyak teori tentang evolusi kode genetik (dan karenanya asal pola-pola ini): [44] y y Chemical principles govern specific RNA interaction with amino acids. The current complex translation mechanism involving tRNA and associated enzymes may be a later development. [ 46 ] [ 47 ] This has been called the stereochemical code.genetic codes. the genetic code could be completely random (a "frozen accident").

Berikut gagasan adalah bahwa kehidupan purba "menemukan" asam amino baru (misalnya. Although much circumstantial evidence has been found to suggest that fewer different amino acids were used in the past than today. [49] [50 ] Natural selection has led to codon assignments of the genetic code that minimize the effects of mutations . Seleksi alam telah menyebabkan tugas kodon dari kode genetik yang meminimalkan efek mutasi . [ 48 ] precise and detailed hypotheses about which amino acids entered the code in what order have proved far more controversial. [48] hipotesis yang tepat dan rinci tentang mana asam amino memasukkan kode dalam rangka apa telah terbukti jauh lebih kontroversial. The emergence of the code is governed by the topology defined by the probable errors and is related to the map coloring problem . errors) in the channel poses the organism with a fundamental question: how to construct a genetic code that can withstand the impact of noise [ 54 ] while accurately and efficiently translating information? Informasi saluran: Informasi-teori pendekatan melihat kode genetik sebagai saluran rawan kesalahan informasi. [ 49 ] [ 50 ] Meskipun banyak bukti telah ditemukan untuk menunjukkan bahwa lebih sedikit asam amino yang berbeda yang digunakan di masa lalu dari hari ini. This feature could allow accurate decoding in the absence of highly complex translational machinery such as the ribosome . Ini "tingkat-distorsi" model [55] menunjukkan bahwa kode genetik berasal sebagai akibat dari interaksi dari tiga kekuatan evolusi yang bertentangan: kebutuhan untuk beragam asam amino. [56] untuk kesalahan-toleransi [51] dan untuk minim biaya sumber daya. Information channels: Information-theoretic approaches see the genetic code as an error-prone information channel. [51] Sebuah hipotesis baru [52] menunjukkan bahwa kode triplet berasal dari kode yang digunakan lebih dari kodon triplet. [ 57 ] Munculnya kode diatur oleh topologi didefinisikan oleh kesalahan yang mungkin dan terkait dengan masalah pewarnaan peta . [ 51 ] A recent hypothesis [ 52 ] suggests that the triplet code was derived from codes that used longer than triplet codons. Kode muncul pada transisi pengkodean ketika pemetaan kodon untuk asam amino menjadi nonrandom. sebagai produk dari metabolisme ) dan kemudian dimasukkan beberapa ini ke dalam mesin pengkodean genetik. [ 53 ] The inherent noise (that is. The code emerges at a coding transition when the mapping of codons to amino-acids becomes nonrandom. Fitur ini dapat memungkinkan decoding akurat dalam ketiadaan mesin translasi yang sangat kompleks seperti ribosom . [57] [ edit ] See also [ sunting ] Lihat juga y DNA .y y machinery of genetic coding. [ 56 ] for error-tolerance [ 51 ] and for minimal cost of resources. Longer than triplet decoding has higher degree of codon redundancy and is more error resistant than the triplet decoding. [53] Suara melekat (yaitu. Lebih lama dari triplet decoding memiliki tingkat yang lebih tinggi kodon redundansi dan lebih tahan daripada kesalahan triplet decoding. kesalahan) dalam saluran pose organisme dengan pertanyaan mendasar: bagaimana membangun sebuah kode genetik yang dapat menahan dampak kebisingan [54] sementara secara akurat dan informasi secara efisien menerjemahkan? These rate-distortion´ models [ 55 ] suggest that the genetic code originated as a result of the interplay of the three conflicting evolutionary forces: the needs for diverse amino-acids.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful