ROYAUME DU MAROC ‫ـ‬ ‫ا‬ ‫ـ‬ ‫ا‬

École Nationale d’Agriculture ‫ا‬ ‫ا ط‬ ‫ا ر‬

de Meknès ‫ـــــــ س‬

Unité de Zoologie Agricole

Département de Protection des Plantes
et de l’Environnement

Groupes zoologiques associés aux

cultures au Maroc

Pr Dr . BOUTALEB JOUTEI Abdelmalek

Mai 2021
1-Histoire de la vie
 Origine de la vie
• L’origine de la terre: ~ 4.6 milliards d'années
• L’origine de la vie: 4 grandes étapes
⇒La synthèse abiotique de molécules organiques
⇒
(Expériences Miller et Urey en 1953)
⇒De monomères en polymères
⇒
⇒Formation de protobiontes (forme ancienne de
vie avant la cellule)
⇒Apparition de molécules capables d’autoréplication
• L’origine de la vie: 3,6 milliards d’années l’ancêtre
commun du monde vivant était présent sur terre.
Histoire de la vie est un continuum

Evolution biologique = descendance avec

modification

Toute la vie sur terre partage un ancêtre

commun. De cet ancêtre commun, via le
processus de descendance avec modification,
une diversité de vie a évolué.

Comment classer cette diversité de vie

présente sur terre?
Classer: distinguer, identifier, nommer
Classer: établir des regroupements entre
des objets sur la base d’un critère donné,
afin de former des ensembles qui reflètent
une cause sous-jacente.
2- Définition de la
Systématique
La taxonomie ou taxinomie (En Grec: taxis: ordre,
nomie: arrangement) est une branche des sciences
naturelles (rebaptisées biologie au XXe siècle), qui a
pour objet de décrire la diversité des organismes
vivants et de les regrouper en entités appelées taxons
afin de les identifier (notamment grâce aux clés de
détermination), les décrire, les nommer et les classer.
Elle constitue une sous-branche de la systématique
qui a pour objet, tout d'abord de dénombrer et de
définir les liens de parentés entre les différents
organismes vivants, et de les classer en catégories
hiérarchisés (ex. genres, familles, ordres). Ces deux
disciplines sont tellement liées que la différence entre
taxinomie et systématique n'est pas toujours évidente.
La systématique est l’étude et la
description de la diversité des êtres
vivants, la recherche de la nature et
des causes de leurs différences et de
leurs ressemblances, la mise en
évidence des relations de parenté
entre eux et l’élaboration d’une
classification traduisant ces relations
de parenté.
(Société Française de Systématique, 1987)
Classification hiérarchique
 La notion d’espèce
• La construction systématique s’appuie sur des
concepts subjectifs, seule l’espèce a une
valeur biologique stable.
–Concept typologique (morphologique) de
l’espèce.
–Concept biologique (Mixiologique) de
l’espèce (Mayr: 1904-2005).
–Concept évolutif de l’espèce
(la Systématique Cladistique fondée par Henning: (1913-
1976).
Les critères morphologiques:
Ils reposent sur le nombre de caractères communs partagés entre les
individus. On estime que deux individus qui se ressemblent, ont plus de chance
d’appartenir à la même espèce que deux individus qui ne se ressemblent pas.

Les critères biologiques:

• L’interfécondité: On estime que deux individus capables de se reproduire
pour donner une descendance fertile appartiennent à la même espèce.

Les études moléculaires et génétiques:

Elles permettent d’étudier le flux de gènes entre deux populations vivant dans
la même aire géographique.

Les critères écologiques :

ils s’appliquent surtout aux espèces végétales qui sont caractérisées par des
périodes de floraison définies au cours des saisons. Deux populations qui n’ont
pas la même période de floraison ne peuvent pas se reproduire. Elles
forment donc deux espèces différentes.
La systématique moderne cherche à mettre
en évidence les relations de parenté entre
taxons, soit pour valider le groupement de
plusieurs taxons dans un taxon de rang
supérieur (plusieurs espèces dans un même
genre par exemple), soit pour construire de
véritables arbres phylogénétiques.
Un arbre phylogénétique est un
arbre schématique qui montre les
relations de parentés entre des
groupes d’êtres vivants.
La classification phylogénétique
ou classification cladistique est
un système de classification des
êtres vivants qui repose sur la
phylogénie, issu d'une école de
taxonomie appelée systématique
phylogénétique ou systématique
cladistique ou cladisme.
Cependant
 « Rien n’a de sens en
biologie, si ce n’est à la
lumière de l’évolution »
[T.Dobzhansky, 1900-1975]
 3- Organisation du
monde vivant selon la
taxinomie
 (Livre de G. Lecointre & H. Le Guyader –
édition Belin)

Clade= Groupement de plusieurs embranchements de

plantes ou d'animaux ayant une organisation et une
origine communes.
4- Principales classes de
ravageurs animaux:
Vertébrés: Oiseaux,
Rongeurs; Invertébrés:
Mollusques, Arthropodes
Situation de la biodiversité
Nombre d’espèces Procaryotes et Eucaryotes
 Les ravageurs vertébrés
Quels sont les animaux
vertébrés ?
Les vertébrés sont des
animaux qui possèdent un
squelette interne comprenant
une colonne vertébrale pour
soutenir leur corps. Cette
colonne vertébrale contient
la moelle épinière.

Les vertébrés= Les poissons+Les amphibiens+Les reptiles

+Les oiseaux+Les mammifères.
Phylogénie
Le Maroc est certainement l’un des pays les
plus riches en oiseaux du domaine occidental.

https://ecologie.ma/liste-des-oiseaux/
 Classification des oiseaux

Plusieurs classifications: forme du bec, conformations des

pieds, régime alimentaire, etc.
Les classifications ont cherché surtout à tenir compte des
caractères anatomiques et particulièrement de l'ostéologie.

A la fin des années 1970 que la systématique des oiseaux a

commencé à se construire réellement sur la base des
hypothèses phylogénétiques. Des tests de proximité
génétique basés sur les comparaisons de l'ADN permettent
ainsi d'établir, au début des années 1980, plusieurs familles
dont certaines nouvelles ajoutées: P. Houde (1987); Sibley et
Monroe (1990), David P. Mindell (1997), etc.
Classification des oiseaux
 Espèces nuisibles au Maroc
• Moineau domestique: Passer domesticus (Linnaeus, 1758)
• Moineau espagnol: Passer hispaniolensis (Temminck 1820)
• Moineau friquet: Passer montanus (Linnaeus, 1758)

• Etourneau unicolore: Sturnus unicolor Temminck, 1820

• Etourneau sansonet: Sturnus vulgaris Linnaeus, 1758

•Corneille noire: Corvus corone Linnaeus, 1758

•Corbeau brun: Corvus ruficollis Lesson, 1831
Moineau domestique: mâle (Gauche), femelle (droite)

Moineau espagnol: mâle (droite), femelle (gauche)

Les rongeurs/ Rodentia
Phylogénie
Au Maroc, plusieurs espèces de rongeurs sont
considérés comme nuisibles à l’agriculture et ce en
raison des dégâts causés particulièrement sur des
cultures telles que les céréales, le tournesol, les
cultures maraichères, les cultures légumières,
l’arachide.

https://ecologie.ma/listes-des-
especes/liste-et-photos-des-
mammiferes/les-rongeurs-du-maroc/
 Classification de l’Ordre des Rongeurs

Mammifères caractérisés notamment par une paire

d'incisives supérieures, une paire d'incisives inférieures et
par l'absence de canines avec présence d'un espace vide
entre les incisives et les molaires. La croissance des
incisives est continue.
Les rongeurs représentent près de 40% des espèces de
Mammifères. Sur base des caractéristiques
anatomiques des muscles de la mâchoire, Carleton
(1984) divise l'Ordre des Rongeurs en deux Sous-Ordres:
les Sciurognathes (Sciuromorphes et Myomorphes) et les
Hystricognathes (Hystricomorphes).
Classification taxonomique des rongeurs (Lonley, 2008)
 Espèces nuisibles au Maroc
• Maroc: 32 espèces.
• Certaines espèces nuisibles pour les activités humaines.
• Espèces commensales ou anthropohiles (Mus musculus,
Rattus rattus, Rattus norvegicus).
• Espèces ravageuses de cultures (Meriones shawii,
Gerbillus campestris).
• La mérione de Shaw: cultures céréalières.
• La gerbille champêtre: cultures d’Arachide.
• Transmission de maladies virales, bactériennes et
parasitaires à l’Homme et aux animaux par les rongeurs.
• La Leishmaniose cutanée à Leishmania major, dont le
réservoir est la mérione de Shaw.
Espèces commensales
Description
 Les ravageurs invertébrés

Quels sont les animaux

invertébrés ?
Un invertébré désigne un
animal qui n'a pas de
colonne vertébrale.
1-Les mollusques
 Espèces nuisibles au Maroc
Classe: Gastéropodes
Super ordre: Heterobranchia / Ordre:Pulmonata
2- Les Arthropodes
Arbre phylogénétique simplifié
des Métazoaires
Classification des Arthropodes
Classification des Arthropodes
 5- Arthropodes:
Importance des
insectes & acariens
5.1.Importance des insectes
 Importance des ordres d’insectes

Ordres<2000 non représentés

 Pourquoi les insectes dominent?
• Dans le monde animal, les insectes constituent le
groupe le plus riche en espèces et le plus varié dans
ses formes, ses mœurs et ses habitats. Ils jouent un
rôle très important dans le recyclage de la biomasse,
la pollinisations et la sélection.

Ces petits animaux à six pattes se sont adaptés à tous les

milieux, terrestres ou aquatiques, et à tous les climats,
polaires, tempérés, tropicaux ou désertiques. Cette
omniprésence fait des insectes de bons indicateurs du
passé, car chaque espèce est associée à un climat et à un
milieu spécifique dans lequel elle trouve les ressources
nécessaires à son métabolisme.
 Importance économique et
agronomique des Insectes

Insectes=base
de la chaine Pollinisateurs
alimentaire

Ravageurs de Vecteurs de
cultures pathogènes

Décomposeurs Agents de
de la matière lutte
organique biologique
Importance des ordres d’arachnides
Importance des ordres d’arachnides

S.Ordre
10 Ordres
Distinction entre Acariformes et
parasitiformes
Phylogénie des Arachnides selon Giribet et al., (2002)
 Importance économique et
agronomique des arachnides
Arachnides= Décomposeurs
base de la de la matière
chaine Agents de organique
alimentaire lutte
biologique

Vecteurs
Parasites de
d’abeilles= Ravageurs Cause
de cultures d’allergies pathogènes
Varroase = Tiques
6- Systématique des
principaux ordres
d’insectes
 Phylogénie
L'arbre présenté est
issu d'une analyse du
maximum de
vraisemblance de 8
gènes, calibrés par 89
fossiles.
L'appartenance aux
clades majeurs est
indiquée par la
coloration de l'anneau:
gris: Entognatha,
noir: insectes primitifs,
cyan: paléoptères,
magenta: polynéoptères,
vert: paranéoptères,
rouge: holométaboles

James L. Rainford , Michael Hofreiter, David B. Nicholson, Peter J. Mayhew - Rainford JL, Hofreiter
M, Nicholson DB, Mayhew PJ (2014). Phylogenetic Distribution of Extant Richness Suggests
Metamorphosis Is a Key Innovation Driving Diversification in Insects.
 Les 5 ordres numériquement
majeurs (Coleoptera,
Lepidoptera, Diptera,
Hymenoptera et Hemiptera).

Fabien Fohrer, Michel Martinez et Isabelle Meusnier, 2017

 Ordres d’insectes

3 4

1 7

Ordres<2000 non représentés

 Outils actuels pour l’identification

les outils
Clés de moléculaires et
détermination le principe du
barcoding
Clés de détermination
 Le code-barre du vivant ou barcoding moléculaire
Actuellement, la reconnaissance des insectes se réalise par une
identification morphologique.

Le problème est que cette identification requiert des clés complexes

qui sont différentes pour tous les groupes taxonomiques et devient
encore plus complexe lorsque l’on travaille sur des stades précoces
du développement tels que : œuf, larve et nymphe. Elle nécessite
donc, le plus souvent, les compétences spécifiques des entomologistes
et a longtemps été basée uniquement sur ces critères anatomo-
morphologiques. Mais depuis plusieurs années, un nouvel outil, le
barcoding moléculaire, a été mis au point suite au progrès en
biologie moléculaire. La découverte de la structure en double hélice
de l’acide désoxyribonucléique (ADN), par le Britannique Francis
Crick et l'Américain James Watson5 en 1953 a permis à cette
discipline d’évoluer et de développer un grand nombre de techniques
moléculaires qui ne cessent de se perfectionner.
 Qu’est-ce que le barcoding ?
• Définition: C’est une méthode qui tente de caractériser les espèces
animales et végétales par le minimum de séquences d’ADN.
• Rôle:
- Aider à la taxonomie lorsque les critères anatomo-morphologiques sont
peu distinctifs des espèces.
- Mettre en évidence de nouvelles espèces dans un souci de meilleure
connaissance de la biodiversité.
* Dans les groupes où la taxonomie est bien connue (Mammifères,
Oiseaux et Lépidoptères) on peut identifier un spécimen à partir d’une
séquence d’ADN (expertise taxonomique). Dans les autres groupes, il
reste à consolider la taxonomie avec tous les outils dont disposent les
scientifiques (anatomies, morphologies, molécules…) avant de pouvoir
se contenter de n’utiliser qu’un seul gène pour attacher un spécimen à un
nom d’espèce.
http://v3.boldsystems.org/
1- Clé de détermination Coléoptères
 Espèces nuisibles de Coléoptères
Capnodis tenebrionis (Linnaeus, 1760)
Conorhynchus (Pycnodactylus) mendicus (Gyllenhal 1834)
Cassida vittata Villers, 1789
Sitona lineatus (Linnaeus, 1758)
Tropinota hirta (Poda, 1761), Tropinota squalida (Scopoli, 1763)
Otiorhynchus cribricollis Gyllenhal, 1834
Phloeotribus scarabaeoides (Bernard, 1788), Hylesinus oleiperda
(Fabricius, 1792)
Sphodroxia maroccana Ley, Rhizotrogus sp., Geotrupes sp.
Agriotes lineatus L. (1767), Agriotes obscurus (Linnaeus, 1758),
Agriotes sputator (Linnaeus, 1758)
Oulema melanopus (Linnaeus, 1758)
Psylliodes chrysocephalus (Linnaeus, 1758)
Melanobaris quadraticollis (Boheman, 1836)
2- Clé de détermination Lépidoptères
 Espèces nuisibles de Lépidoptères
Spodoptera littoralis (Boisduval, 1833)
Agrotis segetum (Denis & Schiffermüller, 1775)
Agrotis ipsilon (Hufnagel, 1766)
Agrotis exigua Kollar, 1844
Helicoverpa armigera (Hübner, 1808)
Autographa (Plusia) gamma (Linnaeus, 1758)
Earias sp. Hübner, 1825
Sesamia nonagrioides (Lefebvre, 1827)
Zeuzera pyrina (Linnaeus, 1761)
Cossus cossus (Linnaeus, 1758)
Deilephila elpenor (Linnaeus, 1758)
Pieris brassicae (Linnaeus, 1758)
Vanessa cardui (Linnaeus, 1758)
Phyllocnistis citrella Stainton, 1856
3- Clé de détermination Diptères
 Espèces nuisibles de Diptères

Mayetiola destructor Say, 1817

Mayetiola avenae (Marchal, 1895)
Mayetiola hordei Kieffer, 1909
Dasineura oxycoccana (Johnson, 1899)
Bactrocera oleae (Rossi, 1790)
Ceratitis capitata (Wiedemann, 1824)
Pegomya betae (Curtis, 1847)
Liriomyza cicerina (Rondani, 1875)
4- Clé de détermination Hyménoptères
 Espèces nuisibles et utiles
d’Hyménoptères

Cephus pygmaeus (Linnaeus, 1767)

Tapinoma simrothi Krausse, 1911
Abeilles
Guêpes
5- Clé de détermination Hémiptères
S. O. Coleorrhyncha
(Une seule Famille: Peloridiidae)
5-1- Sous ordre HETEROPTERA
 Espèces nuisibles Hétéroptères
Nezara viridula(Linnaeus, 1758)
Aelia germari (Küster, 1852)
Aelia rostrata cognata (Fieber, 1868)
Aelia acuminata (Linnaeus, 1758)
Eurygaster maura(Linnaeus, 1758)
Eurygaster austriaca (Schrank, 1776)
Eurygaster hottentotta (Fabricius, 1775)
Stephanitis pyri(Fabricius, 1775)
Monosteira unicostata (Mulsant & Rey 1852)
5-2- Sous ordres: AUCHENORRHYNCHA
STERNORRHYNCHA
Espèces nuisibles AUCHENORRHYNCHA
STERNORRHYNCHA
Empoasca vitis (Gothe 1875)
Empoasca fabae (Harris, 1841)
Metcalfa pruinosa (Say, 1830)
Myzus persicae (Sulzer, 1776)
Aphis gossypii (Glover, 1877)
Aphis fabae (Scopoli, 1763)
Aphis pomi (De Geer, 1773)
Euphyllura olivina (Costa, 1839)
Saissetia oleae (Olivier, 1791)
Aonidiella aurantii (Maskell, 1879)
Diaspidiotus perniciosus (Comstock,1881)
Bemisia tabaci (Gennadius, 1889)
Aleurothrixus floccosus (Maskell, 1896)
6- Clé de détermination Orthoptères
 Espèces nuisibles Orthoptères
Gryllotalpa gryllotalpa (Linnaeus, 1758)
Eugaster fernandezi (Graells, 1878)
Ephippiger ephippiger (Fiebig, 1784)
Gryllus bimaculatus De Geer, 1773
Anacridium aegyptium (Linnaeus, 1764)
Schistocerca gregaria (Forskål, 1775)
Locusta migratoria (Linnaeus, 1758)
Dociostaurus maroccanus (Thunberg, 1815)
Calliptamus italicus (Linnaeus, 1758)
Acanthacris ruficornis citrina (Serville, 1838)
Pyrgomorpha conica (Olivier, 1791)
7- Clé de détermination Thysanoptères
Thripidae TEREBRANTIA Aelothripidae
TUBULIFERA Phlaeothripidae
 Espèces nuisibles Thysanoptères

Frankliniella occidentalis Pergande, 1895

Thrips tabaci Lindemann, 1888

Scirtothrips citri (Moulton, 1909)

7- Classification des
Arachnides et clé
d’identification des
ordres d’Arachnides
 7-1- Identité des Arachnides
Les arachnides, dont les plus célèbres représentants sont
les araignées, les scorpions et les acariens, composent une
classe d'arthropodes. Ils sont pour la plupart terrestres et
insectivores, mais quelques exceptions existent. En effet,
certains acariens sont dulçaquicoles (eaux douces) ou
marins.
Ils se distinguent au sein de l’embranchement des
arthropodes par le fait qu'ils possèdent quatre paires de
pattes, qu'ils n'ont ni ailes ni antennes, et que leurs yeux
sont simples et non composés. La plupart des arachnides
sont ovipares et les sexes sont généralement de
morphologies distinctes (dimorphisme sexuel).
 7-2- Systématique des Arachnides
La classe des Arachnides comprend un certain nombre d’ordre. Selon
Integrated Taxonomic Information System (ITIS), la liste des ordres
actuels est comme suit:
•Sous-classe Acari (les acariens)
•super-ordre Acariformes
•super-ordre Parasitiformes (avec les tiques)
•Amblypygi (les amblypyges)
•Araneae (les araignées)
•Opiliones (les opilions)
•Palpigradi (les microscorpions)
•Pseudoscorpiones (les pseudoscorpions)
•Ricinulei (les ricinulides)
•Schizomida (les schizomides)
•Scorpiones (les scorpions)
•Solifugae ou Solpugida (les solifuges)
•Uropygi ou Thelyphonida (les uropyges)
Les scorpions (n°1),
les amblypyges (n°2),
les schizomides (n°3),
les uropyges (n°4),
les ricinules (n°5),
les palpigrades (n°6),
les pseudoscorpions (n°7),
les opilions (n°8),
les solifuges (n°9),
les acariens (n°10),
les araignées (n°11).
7-3- Morphologie des Acariens
7-5- Reconnaissance des Acariens/araignées
7-6- Classification actuelle= 2 super-ordres

- Les Anactinotriches (sans

actinopiline) (= parasitiformes)
avec des orifices génitaux pas au
même endroit pour les mâles et
les femelles
- Les Actinotriches (avec
actinopiline) (= Acariformes)
avec des orifices génitaux au
même endroit.
Distinction entre Acariformes et
parasitiformes
Phylogénie des Arachnides selon Giribet et al., (2002)
ANACTINOTRICHES (= PARASITIFORMES):
OPILIOACARIDA (Notostigmata)
HOLOTHYRIDA (Tetrastigmata)
GAMASIDA (Mesostigmata) = Phytoseiides
IXODIDA (Metastigmata) = tiques

ACTINOTRICHES (= ACARIFORMES):
ACTINEDIDA (Prostigmata)(tous les acariens phytophages)
ACARIDIDA (Astigmata) = Acariens des poussières
ORIBATIDA (Cryptostigmata) = Acariens du sol
 7-7- Importance économique et
agronomique des arachnides
Arachnides= Décomposeurs
base de la de la matière
chaine Agents de organique
alimentaire lutte
biologique

Vecteurs
Parasites de
d’abeilles= Ravageurs Cause
de cultures d’allergies pathogènes
Varroase = Tiques
 7-8- Espèces nuisibles Acariens
Tetranychus urticae (Koch, 1836)

Panonychus ulmi (Koch, 1836)

Panonychus citri (McGregor, 1916)

Eutetranychus orientalis (Klein, 1936)

Aculops lycopersici (A. M. Massee, 1937)

Acalitus phloeocoptes (Nalepa, 1890)

Aceria sheldoni (Ewing, 1937)

Aceria oleae (Nalepa, 1900)

Polyphagotarsonemus latus (Banks, 1904)

Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939)