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l'Education pour la Santé désire évaluer l'impact d'une séance d'information sur la

nécessité de la consultation médicale des personnes souffrant de l’épilepsie dans la


circonscription du troisième arrondissement de Libreville. Un questionnaire a été
administré avant la séance, puis 8 mois après l'intervention. A la question « Etes vous
d’accord de consulter un médecin pour la prise en charge de l’épilepsie ?" Parmi 30
personnes favorables pour consulter un médecin 20 n’ont pas changé d’avis, alors que 12
des 27 personnes ayant un penchant pour une recherche de soin hors du milieu hospitalier
ont aussi gardé leur position initiale. La séance d’éducation a-t-elle modifié l’approche de
recherche des soins dans la prise en charge de l’épilepsie ?
Après
Oui Non
Avant
Oui 20 10
Non 15 12
Comparaison des variables qualitatives observées
Cas des séries appariées
Test du Chi2 de Mac Nemar
l'Education pour la Santé désire évaluer l'impact d'une séance d'information sur la
nécessité de la consultation médicale des personnes souffrant de l’épilepsie dans la
circonscription du troisième arrondissement de Libreville. Un questionnaire a été
administré avant la séance, puis 8 mois après l'intervention. A la question « Etes vous
d’accord de consulter un médecin pour la prise en charge de l’épilepsie ?" Parmi 30
personnes favorable pour consulter un médecin 20 n’ont pas change d’avis, alors que 12 des
27 personnes ayant un penchant pour une recherche de soin hors du milieu ont aussi gardés
leur position initiale. La séance d’éducation a-t-elle modifié l’approche de recherche des
soins dans la prise en charge de l’épilepsie ?
Après
Oui Non
Avant
Oui 20 10
Non 15 12
Test du Chi2 de Mac Nemar

Deux séries de réponses appariées


Mêmes répondants à 8 mois d'intervalles
Données concordantes non informatives,
Importance accordée aux paires discordantes : oui, non et non, oui.

Après
Oui Non
Avant
Oui 20 (e) 10 (f)
Non 15 (g) 12 (h)
Test du Chi2 de Mc Nemar
Deux séries de variables qualitatives binaires appariées X1 et X2
Tester l'égalité de répartition de ces deux variables
Information apportée par les paires discordantes à partir du croisement de ces deux
variables discordantes
On note n le nombre de paires discordantes

Deux types de paires discordantes,


f est le nombre de paires pour lesquelles X1= oui et X2= non
g est le nombre de paires pour lesquelles X1=non et X2= oui
l'écart entre n et le nombre attendu (f+g)/2, apprécie si la différence est significative ou
non entre les deux séries.

Oui/non Non/oui
Effectifs observés f = 10 g = 15
Test du Chi2 de Mac Nemar

Enoncé de l’hypothèse nulle H0 et de l’hypothèse alternative H1


H0 : les variables X1 et X2 ont la même répartition
H1 : les variables X1 et X2 n'ont pas la même répartition

Choix d’un risque α : α = 5%

Enoncé de la statistique de test f g


(f-g)2 Effectifs observés 10 15
χ2 = Ddl=1
(f+g) Effectifs théoriques (f+g)/2 (f+g)/2
12,5 12,5
Région critique 3,84
Test du Chi2 de Mac Nemar

Calcul de la statistique de test

(10-15)2 χ2 = 1
χ2 =
(10+15)

Conclusion
χ2c < χα2

H0 non rejeté.
On n’a pas pu démonter une différence sur l’attitude des personnes souffrant de l’épilepsie
en rapport avec la consultation en milieu hospitalier
Analyse de variance
Principaux tests statistiques
Variables Situation Echantillons Test paramétriques Test non paramétriques

2 Qualitatives Comparaisons de Indépendants Test Z ou e Test du Chi 2 de Pearson ou Test


pourcentages du Chi 2 corrigé de Yates ou Test
exact de Fisher

Appariés Test Z ou e apparié Test du Chi2 de Mac Nemar

1 Qualitative binaire et 1 Comparaisons de 2 Indépendants Test Z ou e Test de Mann-Whitney


Quantitative moyennes Test t de Student

Appariés Test Z ou e apparié Test de Wilcoxon apparié


Test t de Student apparié

1 Qualitative nominale et 1 Comparaisons de > 2 Indépendants Analyse de variance Test de Kruskal-Wallis


Quantitative moyennes

Appariés Analyse de variance à 2 Test de Friedman


facteurs

2 Quantitatives Corrélation Appariés Coefficient de corrélation Test de Spearman


linéaire + test t
Introduction

Etudier la modification de la moyenne µ d’un phénomène Y suivant l’influence d’un facteur

Facteur : une variable qualitative présentant un nombre de modalités supérieur à 2 .


Le nombre de modalité de la variable qualitative sera noté P
La taille de l’échantillon dans chaque groupe sera noté ni
Exemple

Le traitement des onychomycoses pose des problèmes à cause de sa durée et du désire de


récupérer rapidement l’esthétique unguéale.
Plusieurs traitement sont proposés sur le marché. Pour se faire une idée précise de la durée du
traitement le service de mycologie a décidé d’évaluer le délai de guérison des onychomycoses
dermatophytiques de trois antifongiques administrés par voie orale (Terbinafine, Fluconazole,
Kétoconazole et Grizéofulvine). Les traitements ont été aléatoirement administrés à 40 femmes
à raison de 10 femmes par groupe de traitement.
La durée moyenne de guérison est-elle différente entre ces traitements?
Tableau 1: durée des traitements

Patient Durée de traitement (semaines)


Grizéofulvine Terbinafine Kétoconazole Fluconazole
1 7 6 8 10
2 9 7 6 6
3 8 10 7 8
4 8 8 9 7
5 6 11 12 10
6 12 9 13 11
7 9 9 8 9
8 14 11 9 8
9 12 12 11 9
10 13 12 14 12
Enoncer la situation
IL s’agit de comparer les délais moyens (μ) de guérison des onychomycoses dans 4
échantillons indépendants

Conditions de validité
On admettra que
• la distribution que la variable suit une loi normale dans chacune des populations .
• les variances de la variable dans les populations sont égales

Enoncé des hypothèses


• H0 : µ1 = µ2 = ... = µ5
• H1 : au moins deux délais moyens sont différents
Quelques notations

Au sein de chaque groupe

ni : effectif du groupe

yi,k : kème observation au sein d’un groupe

Ti = σ𝒏𝒊
𝒌=𝟏 𝒚 𝒊, 𝒌 ; somme des valeurs observées au sein d’un groupe

𝑻𝒊
ഥ=
𝒚 ; moyenne des valeurs observées au sein d’un groupe
𝒏𝒊

𝒔𝒊𝟐 : variance des valeurs observées au sein du groupe

𝟏 𝒏𝒊 𝑻𝟐
𝒔𝟐𝒊 = ഥ𝒊)𝟐
෍ (𝒚𝒊, 𝒌 − 𝒚 σ𝒏𝒊
𝒌=𝟏 𝒚𝒊, 𝒌
𝟐
−( )
𝒏𝒊 − 𝟏 𝒌=𝟏
𝒏−𝟏
𝒏−𝟏
Quelques notations

Pour l’ensemble des observations

𝒑
N = σ𝒊=𝟏 𝒏𝒊 ; effectif total

𝟏 𝒑 𝒑
𝑻𝑮
ഥ=
𝒚 = ෍ 𝒏𝒊𝒚ഥ𝒊 TG= σ𝒊=𝟏 𝑻𝒊
𝑵 𝑵 𝒊=𝟏

Variance générale

𝒑 𝒏𝒊 𝑻𝟐
𝒔𝟐𝑻 =෍ ෍ (𝒚𝒊𝒌 − ഥ)𝟐
𝒚 σ𝒑𝒊=𝟏 σ𝒏𝒊 𝒚𝟐
−( )
𝟏 𝒊,𝒌
𝒊=𝟏 𝒌=𝟏
𝑵
𝑵−𝟏
Variabilité des observations et équation de l’ANOVA
La variabilité des n observations est mesurée par la somme totale des carrés des écarts, définie par:

𝑝 𝑛𝑖 𝑝 𝑛𝑖
SCET = ෍ ෍ (𝑦𝑖𝑘− 𝑦)
ത 2 2
=෍ ෍ 𝑦𝑖,𝑘 − 𝑇𝐺2 Τ𝑁
𝑖=1 𝑘=1 𝑖=1 𝑘=1

La variabilité a deux sources


- la variabilité intragroupe
- la variabilité intergroupe

𝒏𝒊
SCEi = ෍ (𝒚𝟐𝒊,𝒌 − 𝒚
ഥ 𝒊 )𝟐 =(𝒏𝒊 − 𝟏)𝒔𝟐𝒊
𝒌=𝟏
La variabilité résiduelle est obtenue en faisant la sommes des variabilités intra groupe

𝑝 𝐩 𝐧𝐢 𝐩 𝐧𝐢 𝐩

SCER =෍ 𝑆𝐶𝐸𝑖 ത 𝟐
෍ ෍ (𝐲𝐢𝐤− 𝐲) 𝟐
෍ ෍ 𝐲𝐢,𝐤 − ෍ (𝐓𝐢𝟐 Τ𝐧𝐢 )
𝑖=1 𝐢=𝟏 𝐤=𝟏 𝐢=𝟏 𝐤=𝟏 𝐢=𝟏

La variabilité inter groupe ou variabilité factorielle est obtenue par la somme pondérée par les
effectifs des carrés des écarts entre les moyennes des groupes et la moyenne générale

𝐩 𝐩

𝐲𝐢 − 𝐲ത)𝟐
SCEA = ෍ 𝐧𝐢 (ത ෍(𝐓𝐢𝟐 ൗ𝐧𝐢 ) − (𝐓𝐆𝟐 Τ𝐍)
𝐢=𝟏 𝐢=𝟏

𝐒𝐂𝐄𝐑
CMR =
𝐧−𝐩
Equation de l’analyse de variance

SCET = SCER + SCEA

Variabilité totale est égale à la somme des variabilités intra et inter groupe

A chaque somme des carrés est associé un degré de liberté


SCET = SCER + SCEA

ddlT = ddlR + ddlA

n-1 = n-p + p-1

𝒑 𝒏𝒊 𝒑 𝒏𝒊
SCET = ෍ ෍ ഥ)𝟐
(𝒚𝒊,𝒌 − 𝒚 ෍ ෍ 𝒚𝟐𝒊,𝒌 − 𝑻𝟐𝑮 Τ𝑵
𝒊=𝟏 𝒌=𝟏 𝒊=𝟏 𝒌=𝟏
Table de l’Anova à un facteur
Source de Ddl Somme des carrés Carrés moyens statistique
variation
𝑝
Intergroupe P-1
ത 2
෍ 𝑛𝑖 (𝑦ത𝑖 − 𝑦)
𝑖=1 𝑆𝐶𝐸𝐴
CMA =
𝑝 𝑝−1
෍(𝑇𝑖2 Τ𝑛𝑖 ) − (𝑇𝐺2 Τ𝑁)
𝑖=1

Intragroupe n-p 𝑝 𝑛𝑖

ത 2
෍ ෍ (𝑦𝑖𝑘− 𝑦)
𝑖=1 𝑘=1
𝑆𝐶𝐸𝑅
𝑝 𝑛𝑖 𝑝 CMR =
𝑛−𝑝
2
෍ ෍ 𝑦𝑖,𝑘 − ෍ (𝑇𝑖2 Τ𝑛𝑖 )
𝑖=1 𝑘=1 𝑖=1

Totale n-1 𝑝 𝑛𝑖
෍ ෍ ത 2
(𝑦𝑖,𝑘 − 𝑦)
𝑖=1 𝑘=1
𝑝 𝑛𝑖
2
෍ ෍ 𝑦𝑖,𝑘 − 𝑇𝐺2 Τ𝑁
𝑖=1 𝑘=1
Application numérique

Patient Durée de traitement (semaines)


Grizéofulvine Terbinafine Kétoconazole Fluconazole
1 7 6 8 10
2 9 6 6
3 8 10 7 8
4 8 8 9 7
5 6 11 12 10
6 12 9 13 11
7 9 9 8 9
8 14 11 9 8
9 12 12 11 9
10 13 12 14 12
𝒏𝒊 10 10 10 10 40
𝑇𝑖 98 95 98 90 𝑇𝐺= 381
𝑦ത𝑖 9,8 9,5 9,8 9,0 𝑦ത𝑖= 9,5

𝑇𝑖2 9604 9025 9604 8100


𝑇𝑖2 Τ𝑛 960,4 902,5 960,4 810 3633,3
𝑝 𝑛𝑖 1028 941 1005 840 3814
2
෍ ෍ 𝑦𝑖,𝑘
𝑖=1 𝑘=
Source de Ddl Somme des carrés Carrés moyens Statistique
variation

Intergroupe 4 – 1=3 3633,3 – 381x381/40 =4,3 4,3/3= 1,43 F= 5,02/1,43


3,51

Intragroupe 40 – 4 =36 3814-3633,8 = =180,7 180,7/36= 5,02

Totale 40 – 1= 39 185

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