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Les virus entériques

humains rejetés dans
les eaux usées sont très
résistants dans le milieu
extérieur et peuvent
être retrouvés dans les
eaux de surface, les
eaux littorales ou les
aliments. Parmi les virus
entériques, les virus
des hépatites A et E,
qui ont longtemps été
confondus, occupent
une place importante.

© SPL / BSIP
Virus et environnement : les hépatites A et E
Hépatite A
Le virus de l’hépatite A (VHA) est un virus à transmission entérique de la famille des Picornaviridae, du genre Hepatovirus.
Dans le sang les particules virales sont pseudo-enveloppées mais dans les selles, le VHA est un virus nu, possédant
une capside lisse très résistante.

La conservation antigénique de ce virus pour lequel il n’existe qu’un seul sérotype

est très importante. Le VHA est un virus cultivable ce qui a permis l’élaboration d’un
vaccin pour prévenir l’hépatite A.

Épidémiologie
La transmission du VHA est presque toujours féco-orale, soit par contact direct, soit par
l’intermédiaire d’aliments, de boissons ou de surfaces contaminées (tasse, cuillères).
L’endémicité de l’hépatite A est liée aux facteurs socio-économiques, les pays où cette
endémicité est la plus élevée étant les pays d’Afrique, d’Asie du sud et d’Amérique
centrale et du sud.
Dans les pays où l’endémicité est élevée, la prévalence est > 90 % à l’âge de 10 ans.
Les infections sont le plus souvent asymptomatiques et les épidémies sont rares.
Dans ces pays l’amélioration des conditions d’hygiène, la réduction de la taille des
familles et donc une amélioration socio-économique globale entraînent actuellement
une évolution dans le sens de la diminution de la prévalence.
© STAREKASE / STOCK.ADOBE.COM

Une vaccination universelle a été mise en place dans 16 pays en 2016, pays où la
prévalence de l’hépatite A est élevée ou intermédiaire.
Dans les pays où la prévalence est faible cette vaccination est ciblée et ne concerne
que les groupes à risque (voyageurs dans les zones de forte endémie, milieux à
risque…).
L’Europe et la France sont des zones de très faible endémie. En France la séroprévalence
(< 50 % à l’âge de 50 ans) et l’incidence (2/100 000 h) de l’hépatite A sont faibles.

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| Figure 1. Nombre de cas d’hépatite A notifiés en France entre 2006 et 2017.
Référence : ecdc.europa.eu
La mortalité de l’hépatite A est de 0,1 % avant 15 ans et aug-
mente avec l’âge (2,1 % > 40 ans).
La transmission de l’hépatite A pouvant être interhumaine, un
risque épidémique existe en Europe, le VHA pouvant diffuser à
partir de groupes à risque non immuns en population générale.
En 2017, 21 pays de l’Union européenne ont été touchés par
une épidémie concernant au départ les homosexuels masculins.
En France cette épidémie a causé en 2017 un nombre impor-
tant de cas (figure 1).
Transmission alimentaire du VHA
La transmission alimentaire est en Europe la 2e cause des épi-
démies principalement liées à la consommation de fruits de mer
(surtout les huîtres et les palourdes). Les fruits et légumes sont
également souvent incriminés bien que moins souvent respon-
sables que les fruits de mer. Ce sont surtout des baies rouges
surgelées et des légumes semi-séchés (tomates séchées
importées de Turquie) qui sont à l’origine de ces épidémies.
La contamination des végétaux impliqués dans les épidémies
d’hépatite A est dans > 50 des cas rapportés due à des mani-
pulateurs infectés (élimination de 107 particules virales /mg de
selles et VHA restant infectieux plusieurs heures sur les mains).
Les épidémies d’hépatite A en relation avec l’alimentation
peuvent également être liées à des contaminations environ-
nementales des aliments (boues fertilisantes, eaux d’irrigation
non potables, eau de mer quand dysfonctionnement ou absence
de traitement des eaux usées).
La surveillance du VHA dans les eaux usées en France n’est
pas systématique contrairement à ce qui est appliqué pour
les indicateurs usuels de contamination fécale comme E. coli.
La persistance du VHA dans l’environnement (eaux, sols et
surfaces) est très longue et la perte d’Infectiosité très lente.
Cette persistance est favorisée par l’humidité et les tempéra-
tures basses.
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Sur les fruits et légumes la persistance du VHA est également
longue, la congélation ne détruisant pas les virus (aucune
altération à 90 jours sur des fruits rouges congelés à -20 °C).
Par ailleurs les nombreux cas groupés observés notamment
aux États-Unis et liés à la consommation de fruits rouges
congelés montrent une persistance d’Infectiosité de plusieurs
mois (framboises récoltées et congelées très en amont de la
consommation).
Quelle est la part de la transmission alimentaire
dans l’hépatite A
La détection des cas alimentaires d’hépatite A est compliquée.
La transmission est rarement rapportée sauf en cas d’épidé-
mies de grande envergure. De plus seuls les pays industrialisés
effectuent une surveillance active avec notification des cas,
or les aliments impliqués sont souvent produits en zone de
moyenne et forte endémie où la surveillance est inexistante.
Le produit source est rarement mis en évidence malgré la pos-
sibilité de détection du VHA par RT-qPCR.
En dehors des plans spéciaux il n’existe pas à l’heure actuelle
de surveillance de la contamination naturelle des fruits,
légumes et coquillages.
Grâce à l’épidémiologie moléculaire il est possible de connaître
aujourd’hui la provenance des souches, 3 génotypes humains
différents étant identifiés (un génotype Inde/Madagascar,
un génotype Afrique de l’Ouest, un génotype de distribution
mondiale).
La surveillance de l’hépatite A en France montre une différence
considérable entre le nombre de cas infectés (déterminés par
des études de séroprévalence), le nombre de cas symptoma-
tiques (évalué par le nombre d’hospitalisations et de décès), le
nombre de cas diagnostiqués et de cas notifiés pour lesquels il
existe une sous-déclaration importante malgré la DO.
Conclusion
La part alimentaire des infections VHA est faible alors que la
transmission interhumaine du virus est prédominante.
La surveillance des épidémies permet d’identifier les sources
alimentaires en combinant épidémiologie clinique et molécu-
laire ainsi que l’origine géographique des souches.
Actuellement le nombre d’investigations est faible. Des études
cas-témoins ponctuelles sur des cas sporadiques permettraient
de hiérarchiser les voies de transmission, les aliments à risque
et les pratiques des consommations. |
Déclaration d’intérêt : l’auteure déclare ne pas avoir de liens d’intérêts.
CHANTAL BERTHOLOM
Professeur de microbiologie
École nationale de physique-chimie-biologie – Paris
bertholom44@orange.fr
source
D’après une communication d’Anne-Marie Roque-Afonso (Paris).
Congrès national de la Société française de microbiologie, 1-3 octobre 2018, Paris
(France).
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