Millora Gentica

Seminarios Estadstica
Millora Gentica, 3
er
Jess Piedrafita Arilla
Departament de Cincia Animal i dels
Aliments, UAB
Millora Gentica
Contenidos
Definiciones
Estadsticosdetendenciacentralydedispersin
Distribucinnormaleintervalosdeconfianza
Asociacinentrevariables:Correlacin
Prediccin:Regresin
Anlisisdelavarianza(ANOVA):efectosfijosy
estimacindecomponentesdevarianza
Millora Gentica
Definiciones preliminares
Poblacin: La totalidad de la informacin o
de los objetos que conciernen a una
investigacin particular
Muestra: Subconjunto de una poblacin
Aleatoria, si todos los elementos tienen la misma
probabilidad de ser escogidos
No aleatoria, en caso contrario
Parmetro: Cualquier caracterstica de la
poblacin (letras griegas)
Estadstico: Cualquier caracterstica de una
muestra (letra latinas)
Millora Gentica
Estadsticos de tendencia central
Variables aleatorias continuas
Media
Mediana
Valor central de la distribucin muestral
Moda
Valor ms frecuente
n
x
x
n
i
i

=
=
1
Tamao de la muestra
Estimador de
Millora Gentica
Estadsticos de dispersin
Variables aleatorias continuas
2
s s =
a) Varianza
Estimador de
2
Suma de cuadrados
b) Desviacin estndar
( )
1 1
) (
2
2
1
2
2

=
n
n
x
x
n
x x
s
i
i
n
i
i
Estimador de
Millora Gentica
Distribucin normal
2
2
2
) (
2
1
) (
o

t o

=
x
e x f
Funcin de densidad
Siendo y
2
la media y la varianza de la poblacin respectivamente
) , ( ~
2
o N X
Variable normal (gaussiana)
Millora Gentica
Distribucin normal reducida
-3 -2 -1 0 1 2 3
68,2%
95% (1,96-2)

) 1 , 0 ( ~ ) , ( ~
2
N
X
Z N X
o

o

=
Millora Gentica
Inferencia estadstica
Intervalos de confianza
n
s
Z x
2
1
o

Intervalo de confianza
Siendo el nivel de confianza
) , ( ~
2
n
N x
o

Distribucin de la media muestral

1,96 para un nivel de confianza del 95%
Millora Gentica
Medida de asociacin: correlacin
1 1
) )( (
cov

n
n
y x
y x
n
y y x x
i i
i i
i i
xy
Siendo el numerador la covarianza
| |
2 2
) 1 ( ) )( (
y x
i i
s s
n y y x x
r

=

Coeficiente de correlacin
Estimador de
Suma de productos
Millora Gentica
Prediccin: regresin lineal
2
cov
x
xy
yx
s
b =
bx a y + =
x b y a =
Siendo b y a respectivamente
Recta de regresin
Ordenada en el origen
Coeficiente de regresin
Estimador de
Prediccin lineal
) (

) ( ) ( x x b y y x x b y y
yx yx
+ = =
Variable independiente
Variable dependiente
Millora Gentica
Regresin: interpretacin geomtrica
b indica lo que aumenta la
variable y por cada unidad
que aumenta la variable x
b = tg
b se estima por
mnimos cuadrados: se
minimiza el sumatorio
del cuadrado de las
desviaciones al valor
predicho (las flechas)

i
= a + bx
i
y
x
+
+
+
+
+

a
y
Millora Gentica
Problema 1, Estadsticos descriptivos y de
asociacin
Datos altura (cm) Estadsticos
Padre Hijo Padre Hijo
165 173 Media 169,25 171,75
160 168 Moda 170 173
170 173 Mediana 170 173
162 165
173 175 Varianza 51,11 22,39
157 168 Des. Est. 7,15 4,73
178 173
168 165 Correlacin, r 0,701
173 180 Pendiente, b 0,464
170 170 Ordenada, a 93,258
175 173
180 178
Millora Gentica
Problema 1, correlacin
160
168
176
184
150 160 170 180 190
Altura padre (cm)
A
l
t
u
r
a

h
i
j
o

(
c
m
)
r = 0,701
Nube de
puntos
Millora Gentica
Problema 1, regresin
y = 0,4638x + 93,258
R
2
= 0,4911
160
168
176
184
150 160 170 180 190
Altura padre (cm)
A
l
t
u
r
a

h
i
j
o

(
c
m
)
Millora Gentica
Anlisis de la varianza, ANOVA (Prob.4)
M1 M2 M3 M4 M5
8 9 8 13 10
9 8 11 10 11
10 9 12 10 8
6 10 10 9 6
7 11 9 9 12
10 6 9 10 8
10 9 7 9 9
8 10 10 13 11
Datos prolificidad
y
ij
g
i
Son significativamente diferentes las medias
de los verracos, ?
5 2 1 0
... : y y y H
= = =
Millora Gentica
ANOVA: Diseo a una va (o jerrquico a 2
niveles)
ij i ij
e g y + + =
) ( ) (
.. . . ..
y y y y y y
i i ij ij
+ =
Modelo lineal FIJO
SC total
donde i) 1 t
j) 1 n
SC entre grupos
SC dentro de grupos
Sumas de cuadrados (SC)
Elevando al
cuadrado y
sumando,
tras diversas
simplificaciones
Efecto fijo
DESCOMPONEMOS LA VARIACIN!
Millora Gentica
ANOVA: Diseo a una va (cont.)
SC
T
/ (tn1) SC
T
tn1 Total
SC
W
/ (tnt) SC
W
t(n1) Dentro de
grupos (error)
CM
B
/ CM
W
SC
B
/ (t1) SC
B
t1 Entre grupos
F Cuadrado
medio
Suma de
cuadrados
Grados de
libertad
Fuente de
variacin
tn
y
n
y
SC
i i
B
2
..
2
.
=

n
y
y SC
i i
ij ij W

=
2
.
2
2
tn
y
y SC
ij ij T
..
2
=

SC
T
= SC
B
+ SC
W
Trmino de
correccin
Millora Gentica
ANOVA a una va (datos prob. 4)
113,10 / 39 = 2,9 3610 3496,9 =
113,10
5*8 1 = 39
Total
97,75 / 35 = 2,79 3610 3512,25 =
97,75
5*(81) = 35
Dentro de
grupos (error)
3,84 / 2,79 =
1,38
15,35 / 4 = 3,84 3512,25 3496,9 =
15,35
5 1 = 4
Entre grupos
F Cuadrado
medio
Suma de
cuadrados
Grados de
libertad
Fuente de
variacin
9 , 3496
8 5
) 11 9 ... 9 8 (
2 2
..
=

+ + + +

tn
y
25 , 3512
8
75 83 76 72 68
2 2 2 2 2 2
.
=
+ + + +

n
y
i i
3610 11 9 ... 9 8
2 2 2 2 2
= + + + +

ij ij
y
1,38 < F
4,35
(2,63-2,67)
Aceptamos H
0
,
las medias no difieren
Millora Gentica
Estimacin de componentes de varianza
(Prob. 5)
0 ) ( ) ( ; ) ( ; 0 ) (
0 ) ( ; ) ( ; 0 ) (
' ' '
2 2
2 2
= = = =
= = =
j i ij ij ij W ij ij
k i B i i
e e E e e E e E e E
g g E g E g E
o
o
Modelo lineal ALEATORIO
ij i ij
e g y + + =
Efectos aleatorios e independientes
La variabilidad de la prolificidad atribuible a
los verracos es significativa, H
0
: = 0?
2
B
o
Millora Gentica
Estimacin de componentes de varianza (cont.)
2
2 2
) (
) (
W W
W B B
CM E
n CM E
o
o o
=
+ =
n
CM CM
CM
W B
B
W W

~
~
2
2
o
o
0 si 0
2
2
2 2
) )
+
~ =
B
W
W B
W
B
n
CM
CM
F o
o
o o
Esperanzas de los Cuadrados Medios
Calculamos la esperanza de los
cuadrados medios del modelo fijo,
de acuerdo con la definicin de los
efectos aleatorios, y despejamos
Componentes de varianza
CM
W
es un estimador insesgado de
2
W
o
Millora Gentica
Estimacin de componentes de varianza
(datos prob. 5)
N.S. 38 , 1
79 , 2
84 , 3
= = =
W
B
CM
CM
F
131 , 0
8
79 , 2 84 , 3
79 , 2
2
2
=

~
= ~
n
CM CM
CM
W B
B
W W
o
o
% 5 , 4 045 , 0
92 , 2
131 , 0
79 , 2 131 , 0
131 , 0
2 2
2
= =
+
=
+
=
W B
B
i
r
o o
o
Componentes de varianza
Correlacin intraclase
Como
2
2 2
W
W B
n
F
o
o o +
~
0 es no
2
=
B
o
Aceptamos H
0
,