Processamento e Análise de Imagem - Cor - 1

Departamento de Fsica
1. Processamento e Anlise de Imagem

Pedro Vieira
(pmv@fct.unl.pt)
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Mtodos de Imagem Mdica
Introduo
A imagem mdica usa regularmente o mais complexo processamento de imagem existente normal que a informao para a imagem mdica seja obtida de formas muito indirectas, sendo a imagem apenas uma representao A imagem especialmente importante por os humanos serem essencialmente seres visuais O processamento de imagem muitas vezes aplicado de forma a colocar em evidncia uma Realidade
20112011-2012 Mtodos de Imagem Mdica 2
Nveis de Processamento
O processamento de imagem pode ser dividido em trs nveis:
Baixo Nvel Reduo de rudo, manipulao de contraste e brilho, obter estatsticas simples da imagem (processamento primrio) Nvel Intermdio Segmentao e medidas complexas Alto Nvel Anlise de imagem tais como a identificao automtica de estruturas e obteno de estatsticas complexas
Nveis de Processamento
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A Percepo Visual Humana

Dois de fotoreceptors disponveis:
Bastonetes (Rods): 75 Rods) a 150 milhes, muito sensveis luz mas no cor. Pouco detalhe Cones: Cones: 6 a 7 milhes, sensveis cor mas de baixa sensibilidade. Alta resoluo
Rodes & Cones

Cones concentrados na zona da fvea Rods concentrados fora da fvea (viso perifrica) No disco ptico onde o nervo ptico entra no olho, existe um ponto cego
Sensibilidade Espectral
Os rodes tem uma sensibilidade mais alta, excepto nos cdo de onda elevados A representao dos cones combina as 3 componentes espectrais a que so sensveis
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Resposta Espectral dos Cones

A combinao de sensores vermelhos, verdes e azuis permite a viso a cores Apesar de existir uma sobreposio dos vrias espectros, a descriminao em cor possvel
Resposta Espacial
A resoluo espacial dos cones na fvea muito superior a qualquer outra rea da retina Os cones permitem essa resoluo espacial superior
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Imagem do Fundus
1 2
1. 2. 3. 4.
Fovea Mcula Disco ptico Vasos Sanguneos
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Estrutura Neuronal
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Luminncia e Brilho
A Luminncia de um objecto uma medida absoluta e representa a intensidade da radiao (luminosa) emitida por esse objecto O Brilho a percepo que se tem da intensidade de radiao emitida pelo objecto. portanto uma medida subjectiva
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Luminncia e Brilho - Exemplo

A zona central de todos os quadrados possui a mesma Luminncia No entanto a nossa percepo de brilho no a mesma
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Luminncia e Brilho - Exemplo

Bandas claras aparentam ter mais brilho prximo de bandas escuras Bandas escuras aparentam ter menos brilho quanto prximas de bandas claras
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Iluses pticas
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Iluses pticas
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Aquisio de Imagens
Camera Digitiser
PC
Disk
As imagens so divididas em intervalos regulares (digitalizadas) a partir dos sinais analgicos originais
Aquisio de Imagens
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A imagem digital
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A imagem digital
X
I2 I1 I1 I2
I2 I1
I2 I2 I3
I2 I3 I3 I2
I2
I2
2D pixel, como na figura. Em 3D - voxel

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Cmaras CCD
Monochrome
Colour
Varrimento
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Tomografia
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Processo de Aquisio
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Processo de Aquisio
Em medicina os objectos so tipicamente 3D Muito do processamento acontece em representaes 2D u(x,y) Objecto u(x,y) Original v(m,n) Objecto v(m,n) observado
Parmetros Bsicos que se Podem Controlar numa Aquisio

Nmero dos nveis de intensidade Resoluo espacial Representao da cor
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Nveis de Intensidade (1)

A intensidade do sinais de entrada quantificado de forma a se gerar o equivalente digital O nmero de nveis de intensidade dado por 2n em n o nmero de bits por pixel
23 = 8 nveis 24 = 16 nveis 28 = 256 nveis 216 = 65536 nveis
32 levels
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16 levels
8 levels
4 levels
Medicina Nuclear.
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200 levels 50 levels
12 levels
6 levels
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Imagem MRI.
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170 levels
20 levels
80 levels
8 levels
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Imagem da retina
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Nveis de Intensidade na Imagem Mdica

Normalmente o nmero de bits guardados por pixel revelam sensibilidade da tcnica a variao dos nveis de intensidade Valores tpicos:
Cmara de vdeo (no mdica) MRI Medicina nuclear Raio X e TAC 8 bits 12 bits 16 bits 12 bits
Estes valores variam com o fabricante

Representao dos Nveis de Intensidade

16 bits so guardados em 2 bytes (8 bits cada) A ordem desses bytes varia com os sistemas operativos
Windows little-endian byte menos significativo littleprimeiro Unix big-endian byte mais significativo primeiro big-
Formatos de imagem medica modernos, como o DICOM, possuem informao de como a informao est guardada
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Resoluo Espacial (1)
2N
As imagens digitalizadas so constitudas por pixels, mas as reais so contnuas. Quantos pixels se devem utilizar?
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Signal sampled at 10 x frequency Signal sampled at 5 x frequency
Signal sampled at 1.5 x frequency

Distance
Uma imagem nunca pode ser amostrada a menos de 2x a frequncia mais baixa que se quer observar (Teorema de Nyquist)

256 x 256 pixels 128 x 128 pixels
64 x 64 pixels
32 x 32 pixels
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18
256 x 256
128 x 128
64 x 64
MRI
Nota: A limitao da resoluo espacial surge sempre que se amplie (zoom) a imagem
200 x 300 pixels

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100 x 150 pixels
50 x 75 pixels
25 x 37 pixels
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Medicina Nuclear
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256 x 256 pixels 128 x 128 pixels
64 x 64 pixels
32 x 32 pixels
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Nunca se deve adquirir imagens com mais resoluo do que o estritamente necessrio. Se se aumentar a resoluo de 2x:
Espao de memria aumenta 4x (8x se 3D) Pixels (voxels) correspondentes a uma rea (volume menor implica um diminuio da relao sinal-rudo) sinalQuanto maior a imagem maior o tempo de processamento
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Efeito Moir
A resoluo espacial de uma imagem nunca pode ser infinita num sistema digital A limitao da representao de frequncias elevadas faz surgir os padres de Moir
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Cor
O mundo a cores O olho humano consegue descriminar milhares de cores e apenas dezenas de tons de cinzento Cor ajuda na segmentao, identificao e classificao das tarefas, quer quando feitas automaticamente quer manualmente
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Cor Espectro Visvel
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Cor Sensibilidade do Olho Humano
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Cor - Representao
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Cor Diagrama Cromtico

X Vermelho Y Verde Z Azul
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Cor - Diagrama Cromtico

Monitor CRT
Impressora
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Cor - Representao
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Hue e Saturation
Hue Representa a cor dominante Saturation Representa a pureza da cor
R 255 G0 B0
R 181 G 75 B 75
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Cor
Imagem a cores
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Imagem monocromtica
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Cor em Imagem Mdica

Preto e Branco Binria Escala de cinzento Brilho proporcional ao valor. Tipicamente 256 escalas. Cor Falsa pixel de valor N vai corresponder uma determinada cor numa tabela previamente definida. A imagem original pode ser monocromtica Cor Verdadeira. 3 matrizes. uma para cada cor Verdadeira. primordial: vermelho (R), verde (G), azul (B) RGB.
Cor Verdadeira
Tem como objectivo a representao o mais correcta possvel da realidade Os dispositivos de aquisio so normalmente cmaras fotogrficas ou de vdeo, digitais ou analgicas A cor normalmente representada pelos modelos:
RGB - Red (R), Green (G) e Blue (B) CMY Cyan (C), Magenta (M) e Yellow (Y)
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Armazenamento da Cor
Tipicamente 3 imagens monocromticas
6 bits Red, 5 bits Green, 5 bits Blue (16 bits) 216 = 65535 cores Red, Green, 8 bits por cor 2 (3*8) = 16777216 cores 10 bits por cor 2 (3*10) = 1073741824 cores
Espao ocupado por uma imagem (S)

S = X*Y*C (X,Y Resoluo; C Bytes de Cor)
Se a imagem de 1024x1024 (1M) pixeis

16 bits 2097152 bytes ~2.0 Mbytes 24 bits 3145728 bytes ~3.1 Mbytes 30 bits 3932160 bytes ~3.9 Mbytes
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Cor Verdadeira
Imagem oftalmolgica Imagem histolgica
Imagem Endoscpia
Imagem de queimadura
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Cor Falsa
Evidencia informao disponvel nas imagens a preto e branco, atribuindo uma cor a cada nvel de cinzento Melhora a interpretao da imagem
Objecto especficos mais visveis til para adicionar informao sobre a imagem
Piora a interpretao da imagem

Introduz contornos artificiais Pode reduzir o contraste Aproximadamente 4% dos homens e 0.8% das mulheres possuem alguma forma de deficincia na viso a cores
Cor Falsa
Imagem de SPECT
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Cor Falsa
Ultrasom em modo-B + Doppler

Cor Falsa
Marcao de Bactrias
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Processamento de Intensidade
Pertencem classe mais simples de processamento:
Um nico pixel processado e tem como resultado um nico pixel
Permite ajustar com a imagem usa os nveis de intensidade disponveis para a sua representao De uma forma geral:
B[x, y ] = f ( A[x, y ])
A[x,y] A[x,y] Imagem original; B[x,y] imagem processada B[x,y]
Imagem Negativa
B[x,y] = -A[x,y]+255 B[x,y] A[x,y]+255
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Ajuste de Brilho
Brilho Brilho
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Valor do Pixel Mtodos de Imagem Mdica
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Ajuste de Brilho
No ajuste de brilho, a inclinao da funo de transferncia mantm-se mantmFuno aplicada:
B[x, y ] = A[x, y ] + C
(+C aumenta o brilho, -C diminui o brilho)
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Ajuste de Contraste
Brilho Brilho
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Valor do Pixel Mtodos de Imagem Mdica
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Ajuste de Contraste
No ajuste de contraste, a inclinao da funo de transferncia no se mantm Funo aplicada:
B[x, y ] = A[x, y ] C
(C > 1 aumenta o contraste, C<1 diminui o contraste)
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Normalizao da Intensidade
Tambm conhecido por expanso do histograma Maximiza o contraste entre o mnimo e mximo de intensidade presente na imagem Funo aplicada:
B[x, y ] =
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( A[x, y ] Amin ) 255

Amax Amin
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Processamento de Intensidade: Funes Transferncia

Ajuste dos limites mximos e mnimos (thresholds) representados (thresholds)
Aumento de contraste Aumento de contraste no linear
Diminuio de contraste Diminuio de contraste no linear

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Correco Gama
Funo aplicada
B[x, y ] = ( A[x, y ])
=1
Esta uma curva no linear

Aumente o contraste nas rea escuras ( < 1) ou nas zonas claras ( > 1)
=0.4
O nvel mximo e mnimo de intensidade representada no se altera

=1.5
Correco Gama
Gama < 1: Contraste aumenta nas rea escuras e diminui nas claras Gama > 1: Contraste aumenta nas rea claras e diminui nas escuras No processamento de imagem normalmente usausase gamas entre [0.3, 3]
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Histogramas
O histograma de uma imagem uma representao grfica do nmero de pixels com uma determinada intensidade A rea do grfico corresponde ao nmero total de pixels O histograma pode ser normalizado dividindo-se pelo dividindonmero de pixels. (Funo de densidade de probabilidade)
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Histogramas 2D
possvel construir histogramas (densidades de probabilidade) que relacionem mais que uma varivel Pode por exemplo relacionar:
a componente vermelha vs azul de uma imagem a cores A componente T1 e T2 de uma imagem de MRI
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Histogramas
Por anlise da distribuio dos pixels no histograma pode-se retirar concluses imediatas podesobre algumas caractersticas da imagem:
Maior probabilidade dos pixels corresponderem a valores de intensidade elevados imagem brilhante Maior probabilidade dos pixels corresponderem a valores de intensidade baixos imagem escura Maior probabilidade dos pixels corresponderem a a um numero limitados de nveis de intensidade imagem com baixo contraste
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Histogramas
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Histograma
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Histograma Cumulativo
Da integrao do histograma obtm-se o obtmhistograma cumulativo Se o histograma cumulativo for normalizado obtm-se uma probabilidade obtmde densidade cumulativa f(g) A funo f(g) representa a probabilidade de um pixel ter o valor g ou menos O histograma cumulativo sempre uma funo no negativa e crescente
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Histograma - Equalizao
A equalizao do histograma consiste transformar o histograma cumulativo original em um que seja uma recta Esta transformao maximiza o contraste da imagem Normalmente no possvel solues perfeitas
Cumulative Pixels
5000 20000 15000 10000 2000 1000 0 0 1 2 3 4 5 6 7 5000 0 5000 20000 15000 10000 2000 1000
No of Pixels
4000 3000
4000 3000
5000 0
0 1 2 3 4 5 6 7
0 Pixel Value
Pixel Value
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Cumulative Pixels
75 76
No of Pixels
38
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77
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78
39
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Histograma Equalizao Adaptativa

Equalizao do histograma global pode ter distribuies de probabilidades muito assimtricas, por exemplo reas de fundo muito grandes A alternativa e realizar a equalizao do histograma em reas locais e adaptar essa equalizao medida que se move ao longo da imagem Para fazer isto escolhe-se uma regio de m x n escolhepixels e equaliza-se essa regio equaliza20112011-2012 Mtodos de Imagem Mdica 80
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Histograma Equalizao Adaptativa

O tamanho da regio considerada um factor importante neste tipo de filtro Tende a por evidncia as altas frequncias espaciais da imagem
Original
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Equalizao global
31x31 equalizao adaptativa
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Equalizao do Histograma Consideraes Finais

A equalizao dos histogramas assume que todos os nveis de luminncia so avaliados de igual forma, o que no verdade no caso dos observadores humanos Muitas vezes desejvel fazer a equalizao seja feita em termos de brilho e no luminncia Muitas vezes usa-se um modelo logartmico de usarepresentao da luminncia o que leva a uma funo de densidade de probabilidade hiperblica. No entanto, existem outros modelos utilizados muitas vezes dependente do problema em causa
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2D pixel, como na figura. Em 3D - voxel

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Nveis de Intensidade (1)

Nveis de Intensidade (2)

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Nveis de Intensidade (3)

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Nveis de Intensidade (4)

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Nveis de Intensidade na Imagem Mdica

Estes valores variam com o fabricante

Representao dos Nveis de Intensidade

Resoluo Espacial (1)

Resoluo Espacial (2)

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Resoluo Espacial (3)

Signal sampled at 1.5 x frequency

Resoluo Espacial (4)

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Resoluo Espacial (5)

Resoluo Espacial (6)

200 x 300 pixels

100 x 150 pixels

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Resoluo Espacial (7)

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Resoluo Espacial (8)

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Cor Espectro Visvel

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Cor Sensibilidade do Olho Humano

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Cor Diagrama Cromtico

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Cor - Diagrama Cromtico

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