5.2.1CLASIFICACIN DE LAS BACTERIAS POR SU ALIMENTACIN 5.2.

2 NOMENCLATURA Y TAXONOMA DE LAS BACTERIAS Bacterias auttrofas: Pueden fabricar sustancia orgnica a partir de la energa de la luz del sol, pues poseen una sustancia parecida a la clorofila, y de materia inorgnica, como las plantas. Son de color verdeazulado, por eso tambin se les llama cianofceas. Bacterias hetertrofas: Viven a partir de sustancias fabricadas por otros seres vivos, tal como hacen los animales. Estas sustancias se pueden conseguir de varias formas: Bacterias saprofitas: se alimentan de sustancias en descomposicin. Tienen una gran importancia en la naturaleza, ellas realizan la putrefaccin de los restos de otros seres vivos. Bacterias parsitas: viven a costa de otro organismo, causando numerosas enfermedades (meningitis, ttanos, lepra) Bacterias simbiticas: se asocian con otros organismos intercambiando funciones necesarias para la vida. Algunas viven en el aparato vivo de los rumiantes y les ayudan a digerir la celulosa. Otras viven en las races de las plantas y les consiguen nutrientes. Bacterias de la fermentacin: transforman sustancias orgnicas por medio de un proceso llamado fermentacin. As se obtiene el queso y el yogur de la leche o el vino del mosto de uva.

El origen de esta fuente de carbono sirve como criterio de clasificacin para las bacterias. Adems, se necesita una fuente de energa que sirva para poder construir sus propias molculas; el tipo de fuente de energa utilizada tambin sirve como criterio de clasificacin.

El xito evolutivo de las bacterias se debe en parte a su versatilidad metablica. Todos los mecanismos posibles de obtencin de materia y energa podemos encontrarlos en las bacterias. Segn la fuente de carbono que utilizan, los seres vivos se dividen en auttrofos, cuya principal fuente de carbono es el CO2 , y hetertrofos cuando su fuente de carbono es materia orgnica. Por otra parte segn la fuente de energa, los seres vivos pueden ser fototrofos, cuya principal fuente de energa es la luz, y los organismos quimiotrofos, cuya fuente de energa es un compuesto qumico que se oxida.

Atendiendo a las anteriores categoras, entre las bacterias podemos encontrar las siguientes formas, como puede apreciarse en el esquema: Las bacterias quimiohetertrofas, utilizan un compuesto qumico como fuente de carbono , y a su vez, este mismo compuesto es la fuente de energa. La mayor parte de las bacterias cultivadas en laboratorios y las bacterias patgenas son de este grupo.

 Las bacterias quimioauttrofas, utilizan compuestos inorgnicos reducidos como fuente de energa y el CO2 como fuente de carbono. Como por ejemplo, Nitrobacter, Thiobacillus. Las bacterias fotoauttrofas, utilizan la luz como fuente de energa y el CO2 como fuente de carbono. Bacterias purpureas. Las bacterias fotohetertrofas, utilizan la luz como fuente de energa y biomolculas como fuente de carbono. Ejemplos como Rodospirillum y Cloroflexus. Las bacterias necesitan de un aporte energtico para desarrollarse.

Se distinguen distintos tipos nutricionales segn la fuente de energa utilizada: las bacterias que utilizan la luz son fottrofas y las que utilizan los procesos de oxirreduccin son quimitrofas. Las bacterias pueden utilizar un sustrato mineral (littrofas) u orgnico (organtrofas). Las bacterias patgenas que viven a expensas de la materia orgnica son quimioorgantrofas. La energa en un sustrato orgnico es liberada en la oxidacin del mismo mediante sucesivas deshidrogenaciones. El aceptor final del hidrgeno puede ser el oxgeno: se trata entonces de una respiracin. Cuando el aceptor de hidrgeno es una sustancia orgnica (fermentacin) o una sustancia inorgnica, estamos frente a una anaerobiosis.

Adems de los elementos indispensables para la sntesis de sus constituyentes y de una fuente de energa, ciertas bacterias precisan de unas sustancias especficas: los factores de crecimiento. Son stos unos elementos indispensables para el crecimiento de un organismo incapaz de llevar a cabo su sntesis. Las bacterias que precisan de factores de crecimiento se llaman "auttrofas". Las que pueden sintetizar todos sus metabolitos se llaman "prottrofas". Ciertos factores son especficos, tal como la nicotinamida (vitamina B,) en Proteus. Existen unos niveles en la

exigencia de las bacterias. Segn Andr Lwoff, se pueden distinguir verdaderos factores de crecimiento, absolutamente indispensables, factores de partida, necesarios al principio del crecimiento y factores estimulantes. El crecimiento bacteriano es proporcional a la concentracin de los factores de crecimiento. As, las vitaminas, que constituyen factores de crecimiento para ciertas bacterias, pueden ser dosificadas por mtodos microbiolgicos (B12 y Lactobacillus lactis Doraren). Lourdes Luengo http://www.arrakis.es/~lluengo/microbio.html

Otro criterio de clasificacin de las bacterias es el medio en el que podemos encontrarlas: Bacterias que degradan materia orgnica en descomposicin. Cumplen un papel esencial en el ciclo del carbono. Simbiticas: bacterias asociadas a otro ser vivo. Esta relacin genera un beneficio mutuo. Un ejemplo de estas bacterias son las bacterias de la flora intestinal que producen vitamina K. El hospedador, es decir, el individuo al que parasita, le otorga a cambio, energa en forma de materia orgnica y un medio apropiado para vivir. Comensales: bacterias asociadas a otro ser vivo, sin desprenderse de esta relacin, ni un beneficio, ni un perjuicio para el hospedador. Ejemplo de este tipo de bacterias podemos encontrarlo en las bacterias que viven sobre nuestra piel, alimentndose de clulas descamadas. muchas bacterias de este tipo son bacterias oportunistas, ya que pueden causar enfermedad en el hospedador Parsitas: bacterias que sobreviven a expensas de otro ser al que causan un perjuicio. Ejemplo de este tipo de bacterias sera cualquiera de ellas que nos produzca una enfermedad.

Otro criterio de clasificacin de bacterias hace referencia al consumo de oxgeno: Bacterias aerobias: son aquellas que necesitan oxgeno para su metabolismo. Realizan la oxidacin de la materia orgnica en presencia de oxgeno molecular, es decir, realizan la respiracin celular. Bacterias anaerobias: son aquellas que no utilizan oxgeno molecular en su actividad biolgica. La obtencin de energa la realizan mediante catabolismo fermentativo. Se pueden distinguir dos grupos dentro de ellas: Bacterias anaerobias facultativas: Pueden vivir en ambientes con oxgeno o sin l. Bacterias anaerobias estrictas: slo pueden sobrevivir en ambientes carentes de oxgeno. Como ejemplo, del ttanos Clostridium, causante.

TAXONOMA Y NOMENCLATURA DE LAS BACTERIAS La identificacin de las bacterias es tanto ms precisa cuanto mayor es el nmero de criterios utilizados. Esta identificacin se realiza a base de modelos, agrupados en familias y especies en la clasificacin bacteriolgica. Las bacterias se renen en 11 rdenes:

1.-- Las eubacteriales, esfricas o vacilares, que comprenden casi todas las bacterias patgenas y las formas fottrofas. 2.-- Las pseudomonadales, orden dividido en 10 familias entre las que cabe citar las Pseudomonae y las Spirillacae. 3.-- Las espiroqueta les (treponemas, leptospiras). 4..- Las actinomicetales (mico bacterias, actinomicetes). 5.-- Las rickettsiales. 6.-- Las micoplasmales. 7.-- Las clamidobacteriales. 8.-- Las hifomicrobiales. 9.- Las beggiatoales. 10.- Las cariofanales. 11.- Las mixobacteriales. http://www.monografias.com/trabajos/bacterias/bacterias.shtml

Taxonoma bacteriana

Una clasificacin basada en estos principios es lo que se llama sistema natural o filogentico. Las formas ms estrechamente relacionadas se ordenan como especies de un mismo gnero; los grupos relacionados algo menos ntimamente, como gneros de una misma familia; los que lo hacen ms distantemente, como familias del mismo orden y as sucesivamente. La ciencia de clasificacin de los seres vivos recibe el nombre de taxonoma y atiende a dos aspectos:

Identificar y describir de la manera ms completa posible, las unidades taxonmicas bsicas, las especies. Desarrollar un sistema para ordenar y catalogar estas unidades

Taxonoma: (taxis = orden, rango). Es la rama de la biologa que se ocupa de la clasificacin de los seres vivos. Las especies como unidades de clasificacin Una especie constituye un grupo de individuos (o poblaciones clonales, en el caso de los microorganismos) que presentan un grado elevado de semejanza fenotpica, siendo, al mismo tiempo, claramente diferenciable de los integrantes de otros conjuntos del mismo tipo general. Cada conjunto de individuos muestra un cierto grado de diversidad fenotpica interna a causa de la variacin gentica. Por lo tanto, es la capacidad de apreciacin cientfica la que permite decir que grado de similitud fenotpica pueden justificar el dividir un determinado conjunto en dos o ms especies, o dicho de otra forma, que grado de diversidad interna es admisible dentro de una especie. Las opiniones sobre esta cuestin son muy distintas, de ah que los propios taxonmos clasifican en trminos generales en dos grupos: < los unificadores> que fijan lmites amplios a cada especie y <los disgregadores> que distinguen unas especies de otras por motivos ms sutiles De un modo ideal, las especies deberan caracterizarse basndose en la descripcin completa de sus fenotipos o incluso de sus genotipos. La prctica taxonmica no llega a estos ideales ya que en la mayor parte de los grupos de seres vivos la descripcin del fenotipo es fragmentaria y la caracterizacin del genotipo es incompleta. Los caracteres fenotpicos de ms fcil determinacin son los estructurales y anatmicos que pueden observarse directamente. La clasificacin de las bacterias constituye una excepcin dada su extrema simplicidad estructural, esto hace que se disponga de un rasgo demasiado reducido de caracteres para poder hacer una caracterizacin adecuada.

Por ello, los taxnomos bacterianos se vieron forzados a buscar otros tipos de propiedades, bioqumicas, fisiolgicas, ecolgicas, para aadir a las propiedades estructurales. La clasificacin de las bacterias se basa en atributos funcionales, la mayor parte de las bacterias slo pueden identificarse por lo que hacen y no simplemente por su apariencia. Esto representa un problema adicional para el taxnomo bacteriano, el estudio de estas propiedades funcionales conlleva a la realizacin de experimentos, por lo tanto ste nunca podr estar seguro de haber llevado a cabo los experimentos adecuados con fines taxonmicos: podra ocurrir que omitiera la realizacin de ciertos experimentos que indicaran la existencia de agrupamientos significativos dentro de una coleccin de cepas. Sin embargo, est tomando auge una nueva alternativa que podra resolver pronto el problema, son las tcnicas moleculares para la caracterizacin genotpica bacteriana, que proporcionan una posible base objetiva para la definicin de especie bacteriana. De acuerdo con la convencin que establece el sistema binomial de nomenclatura, cada especie biolgica lleva un nombre latinizado que consiste en dos palabras: la primera indica en grupo (gnero) a que pertenece la especie, y la segunda palabra indica la especie de ese gnero: por ejemplo, Escherichia coli, Escherichia (nombre genrico gnero) y coli (nombre especfico especie). En la ordenacin taxonmica de un grupo biolgico, las distintas especies se van agrupando sucesivamente en una serie de categoras de orden superior: gnero, familia, orden clase, y divisin (o phylum). Esta es la llamada ordenacin jerrquica, porque cada categora, en la serie descendente, agrupa un nmero cada vez mayor de unidades taxonmicas, basndose en un nmero cada vez menor de propiedades compartidas. El reconocimiento del hecho de la evolucin biolgicas aadi una nueva dimensin al concepto de la clasificacin natural. Para los bilogos del siglo XVIII los agrupamientos basados en la tipologa expresaban simplemente parecidos, sin embargo para los postdarwinianos, indicaron relaciones. En el siglo XIX el concepto de sistema natural cambi y pas a ser el agrupamiento de los organismos en funcin de sus afinidades evolutivas. "La jerarqua taxonmica, en algn sentido, llego a ser el reflejo de un rbol genealgico y la taxonoma adquiri de repente una nueva meta: la reestructuracin de las jerarquas para acomodarlas a relaciones evolutivas". Este sistema taxonmico recibe el nombre de clasificacin filogentica

TAXONOMA BACTERIANA Definiciones. Clasificacin: Agrupacin de seres u objetos de acuerdo con los caracteres o atributos que posean. Nomenclatura: Asignacin de nombres a los grupo taxonmicos (taxa) de acuerdo con las normas internacionales establecidas. Identificacin: Conjunto de procesos por los que a un objeto o ser, se le asigna a un determinado taxn. En Microbiologa las caractersticas morfolgicas poseen menos relevancia que en el caso de los organismos superiores. La unidad bsica en taxonoma bacteriana es la especie. Especie: coleccin de cepas similares que defieren lo suficiente de otros grupos de cepas para asegurar su reconocimiento como unidad bsica taxonmica. Las especies se definen a partir de las caractersticas comunes de varias cepas o clones. Cepa: conjunto de descendientes de una aislamiento en cultivo puro y que normalmente se origina a partir de sucesivos cultivos derivados a partir de una inicial colonia. Clon: poblacin de clulas genticamente idnticas entre si y que proceden de una nica clula (ancestro comn). Cepa tipo: cepa representante de la especie y acta como ejemplo permanente de la especie. TIPOS DE CLASIFICACIN EN BACTERIAS. FENTICA. Las agrupaciones se realizan en funcin de la semejanza en sus caractersticas fenotpicas. (morfologa, tincin de gram, movilidad, tolerancia al Oxgeno, fermentacin de azcares, etc). NUMRICA. Agrupamiento mediante mtodos numricos de unidades taxonmicas basadas en la semejanza general determinada por comparacin de numerosas caractersticas, recibiendo cada una de las cuales el mismo valor (deben compararse muchas caractersticas, a veces cientos).

Una vez realizado el anlisis de caracteres, se calcula, para cada par de cepas del grupo, un coeficiente de asociacin que determina la concordancia de los caracteres que presentan ambas bacterias. Coeficiente de emperejamiento simple (SSM): proporcin de factores concordantes tanto (+) como (-). Coeficiente de Jaccard (SJ): slo tiene en cuenta las concordancias positivas. Ambos coeficientes aumentan linealmente de valor desde 0,0 (no hay existe ninguna concordancia hasta 1,0 (100% de concordancias). Con los coeficientes obtenidos se elabora una MATRIZ DE SEMEJANZA y con la matriz se realiza un DENDOGRAMA. FILOGENTICA. Est basada en las relaciones evolutivas ms que en las semejanzas generales. En bacterias, donde no existe abundancia de fsiles que permita conocer su evolucin, se hizo muy complicado. En la actualidad la comparacin directa del material gentico y sus productos, ARN y protenas, permite superar muchos de estos problemas. CARACTERSTICAS UTILIZADAS EN TAXONOMA 1.-CLSICAS. Morfologa (bacilos, cocos, espirilos ...). Fisiologa y Metabolismo (aero-anaerobiosis, fermentacin azcares). Ecologa. Anlisis gentico (capacidad transferencia por transformacin). 2.- MOLECULARES. Secuencia de aminocidos de protenas con la misma funcin. Movilidad electrofortica Hibridacin de cidos nucleicos Comparacin de cidos nucleicos: % G+C = [(G+G) / (A+T+G+C)] 100 Secuenciacin de cidos nucleicos NOMENCLATURA BACTERIANA : binomial Gnero especie ( G. especie); Gnero especie ( G. Especie) Gnero especie ( G. Especie) (negrita) Principales Taxones bacterianos. Dominio Reino Seccin Clase Orden Familia Gnero Especie Morfovar Biovar Serovar Fagovar Bacteria (Eubacteria) Proteobacteria -Proteobacteria Zymobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Escherichia E. coli propiedades morfolgicas propiedades bioqumicas propiedades antignicas sensibilidad a fagos

Patovar

propiedades patognicas

http://www.ujaen.es/dep/ciesal/microbiol_biologia.htm

Brock. BIOLOGA de los MICROORGANISMOS. M.T. Madigan, J.M. Martinko, J. Parker. 2003. 10 edicin. Prentice Hall.

- MICROBIOLOGA L.M. Prescott, J.P. Harley, D.A. Klein. 2004. 5 edicin. McGraw-Hill/Interamericana de Espaa.