Dogme central Le “dogme central”, introduit par Francis Crick (co-découvreur de la structure de FADN) a la fin des années 50, veut que chez tous les dtres vivants, Minformation ne sot ransmise que dans un sens: de IADN, 00 repose finformation, 4 I'ARN, une structure transitoire — Ppermeitant sa transmission 4 une machine de traduction, aux protéines, les constituants de — ase qui font fonctionner Ia cellule et forganisme entier.ll existe deux types d’AN LADN essentieliement localisé dans je noyau mais aussi dans la cytoplasme des organites Cellulaires ( mitochondries et chioroplastes) des cellules eucaryotes, dans le cytoplasme des procaryotes et la capside viraie_ LARN essentiellement retrouvé au niveau du cytoplasme des cellules et dans les virus, mais il existe aussi dans le noyau, LADN et FARN sont une longue moiécule en forma de filament contenant des bases puriques et pyrimidiques, des sucres et des groupements phosphates Les bases sont je support do l'information génétique c’est-A- 3°. + Les polynuciéotides sont faits de I addition successive de monoméres dans une configuration S' - 3‘ générale. ntation se trouve définie par la position du phosphate libre du premier nuciéotide, \t fe phosphate porté par le carbone 5’, et par * Je groupe OH libre porté par le carbone 3° du demierLa double hélice « B » de 'ADN * En 1953, Rosalind Franklin a démontré que IADN posséde une structure hélicoldale grace a sa radiographie par diffraction de fayons X. * Elle en conclue que les squeleties désoxyribose-phosphale sont 4 Fextérieur de la double hélice * Dans la méme année Watson et Crick ont décrit la structure en double hélice de TADN. * Cette structure est appelée hélice Walson/Crick ou hélice B. Elle posséde les caractéristiques sulvantes * Les deux brins sont antiparalléles et associés en palre de bases * La double hélice B est « droite » * ily a deux silions différents deux brins sont anUparalléie set associés en palre de bases Nélice, les deux brins sont orientés de maniére it dits antiparalidies,La double hélice « B » de 'ADN Les deux brins sont antiparaliéies et associ¢és en paire de bases Les liaisons hydrogéne s’établissent toujours entre une purine de Tun des brins et une pyrimidine de l'autre brin pour former une molécule d'ADN double brin (ou ADN bicaténaire). Lassociation des deux brins par des liaisons hydrogéne génére une contrainte physique qui impose & [ensemble [adoption d'une structure en double hélice * La double hélice B est « droite » v Lélice B est dite « droite »carle sens du pas de INélice est & droite. ¥ Son diamétre est denvirons 2.4 nm ~ La distance séparant deux paires de bases successives est de ‘de hélice est de3.4y nm, il couvre une longueur deLa double hélice « B iy a deux sitions différents Les deux brins de la double hélice de TADN ne sont pas symétrique par rapport a l'axe central, Sur un plan de coupe, on vois que les deux brins sont proches d'un coté que fautre. La face ou Jes deux brins sont le (ou sillon mineur), Fautre est. and s Cette particularité 4 une conséq' i te pulsque les bases Présentes dans |e petit silion seron ’@ pourront pas interagir avec les protéines de liaison 4 |, comme par exemple Jes protéines de régulation. Les interaction avec ces protéines se feront essentiellement avec les bases accessibles du cété du grand silion. silion pA *Les isoformes de la double hélice B B que nous venons de décrire est ta forme majoritaire rouvée dans les -élica A est renconirée dans des solutions ou Hy a peu d'eau (apres extraction) ou inv forsque TADN est associé & des complexes protéiques. * La forme A est observée notamment dans les hélices hydrides ADN-ARN. Cotte forme est plus « resserrée » que la forme B avec un dlamétre plus large (2.6 nm). ‘est plus compacte avec une distance de 0.23nm entre deux paires de Dase ‘et un nombre de_paire de base par tours plus important (11 pbviour). Thélice B, le sens du pas de Mhélice A est 4 droite,Les isoformes de la double hélice BAcide ribonuciéique « ARN » * Les ARN sont une classe de moiécules extrémement importantes dans la cellule. * Ce sont des composés trés abondants. ex: ils représent % du poids sec d'Escherichia Coli, alors que TADN ne représente que 2 %. + Plusieurs réles dans la cellule: > Role génétique _ » Réle enzymatique > ARN guide Roles génétiques : Comme TADN, ARN joue un réje bien connu de support de information génétique. Les ARN messagers sont des copies de l'information contenue dans I'ADN qui va servir a la _ fabrication des protéines. * LARN constitut le matériel génétique exclusif de certains organismes comme les virus: _ © Rétrovirus (ex. je VIH): pour se répliquer, iis passent par un intermédiaire constitué , de la poliomyéiite, de la dengue, de [hépatite C, ...etc. res Afétat CARN.ribonucléique * Les ARN sont une classe de molécules extrémement importantes dans Ia cellule. Mt 25 See ee eee ae Col, alors que FADN ne représente que 2%. 4 * Plusieurs roles dans la cellule: > Réle génétique __ >» Réle enzymatique > ARN guide 1. Roles géné! Comme lADN, I'ARN joue un réle bien connu de suj ide information génétique. Les ARN messagers sont des copies de l'informa! contenue dans FADN qui va servir & la fabrication des protéines. CARN constitut le matériel génétique exctusif de certains organismes comme les virus: yea (ex. Je VIH): pour se répliquer, is passent par un intermédiaire constitué . de la potiomyéiite, de la dengue, de [hépatite C, etc.Acide ribonucléique « ARN » * 2. Réles enzymatiques * Les ARN messagers constituent ils 'essentiel des ARN cellulaires? NON *La fonction trés importante des ARN messagers dans Ia cellule est trompeuse car elle donne souvent rimpression que ceux-ci constituent essentiel des ARN cellulaires, alors que ce n'ai pas le cas. * La majorité des ARN dans Ia cellule sont des ARN non codants. * Les ARN non codants sont les ARN qui ne sont pas traduits en protéines. Parmi les ARN non-codants, on trouve : * ARN ribosomiques: constituants majoritaires du ribosome. PAN ce transfert: participent la traduction au niveau du ribosome. ARN nuciéaires (small nuclear ARN snRNA): constituants de la machinerie dépissage rs.éteindre | expression | d'un géne. TARN messsoe du géne cidle,Petes AI ea od Miers ARN {ontARN) e/ aia FARM: (Pat ARN: PoC ARN) (A AlN ne eile Taxa), anne, ‘pay wendenet CayEffets sur la stabilité chimique * Le 2-OH rend la molécule d'ARN intrins¢quement plus labile (instable) que la molécule dADN. * En conditions alcalines: % Une base arrache le proton du 2'-OH qui réagit alors avec le phosphate. > Le phosphate se cyclise sur les positions C2’ et C3‘ du ribose > Coupure du squelette phosphodiester libérant une extrémité 5-OH et une extrémité 2,3" - At A oei + un mot-valise composé de deux mots: acide ribonuciéique et enzyme. * Les ribozymes sont des ARN qui possédent la propriété de catalyser une réaction chimique Spécifique. * Les protéines ne sont donc pas les seules molécules qui catalysent jes réactions chimiques. ’ Propriétés catalytiques dues & la capacité de FARN de se replier pour former une structure qui permetient ia fixation de ligands. * Parmi les ribozymes, nous avons: + La nibonuciéase P (RNAse P) > Enzyme présente dans toutes les cellules, chez tous les organismes vivants. > Formée de deux composants : un ARN long eon 200 S00 Ee cee eee e@spéces). et une ou plusieurs protéines. La RNAse P assure la maturation des ARN de transfert.* Suivant les espéces, factivité Rnase P peut étre réalis¢e par une protéine (il s'agit alors ridozyme). une enzyme) ou par fARN (i s'agit alorsd'un | + Chez les eucaryotes, activité RNase P est produite = Chez les bactéries, l'activité RNase P est produiteEucaryotes: + Ridosome de 80s * Deux sous unités: 60S et 40S * Quatre ARNr- 28S, 18S. 5.8S et 5S et p’ + La masse des ribosomes est constitute Traduction des ARNm en protéines: * Petite sous unité => lecture du code inscrit sur [ARNM. La grande sous-unité contient [ARNr catalytique 23S (procaryotes) Ou 28S (eucaryotes) qui sont impliqués dans la formation des liaisons Peptidiques. Linison peme des acides aminés jusqu'aux ribosomes lors de la traduction Fee ied vir cri ck: hed raid de tagon spécifique. é aeoaaabaoran tiie oan trols nucitotides, nommée ariécodon, qui reconnaft 8 % codon correspondant a facide aminé quill transporte + RAPPEL Chaque ARNI est caractérisé par son anticodon, Un ARNI ne transporte pas n'importe quel acide aminé: ¢a dépend de Fanticodonar r ; La ribothymidine ou rT est un ribonuciéotide rare qu’on trouve essentiellement dans le bras des ARNt, auquel ll donne son nom. Constituée d'un résidu de thymine et de ribose. On Fappellie aussi 5-méthyle uridine, car ia ribothymidine aitiere furidine que par Faddition fun groupement méthy'e (- CH3) en position 5 du cycle pyrimidine. fla modification d'une uridine dans le précurseur de fARNI par une enzyme TARN! (uracil 5.) méthyttranstérase,pt pse ine La pseudouridine (notée w) est un ribonuciéoside dérivé de ruridine. Présente dans certains ARN non-codants (ex. ARNt. ARN‘). Résulte d'une modification post-transcriptionneliede certains résidus d'uridine par des pseudouridine synthases. 9 ree ra ek ei’ Loe % ae No Oo o Uridine Prseudouridine Les pseudouridine synthases catalysent risomérisation du cycle uracile. Le cycle uracile fait une rotation de 180* autour de axe passant par les atomes N3 et C6 dt tion du cycle uracile ne modifie pas lappariement Watson-Crick, mais modifie | liaison glycosidique entre je ribose et la base: C-C pour la pseudouridine C-N pour les bases naturellestruct Les quatre tiges de FARNt se repent pour former une Structure en forme de "L" empilement du bras T sur je bras accepteur et du bras anticodon sur ie bras D Dans ta conformation « L », les bases sont orient#es de facon & optimiser les interactions hydrophobes. La structure en « | » est stabilisée par des interactions entre ja boucie T et D faisant intervenir les nuciéotides modifia La Structure « L » est maintenue par des faisons H. Plusieurs taisons H impliquent des appariements non canoniques