TEMA 15. Introduccin al metabolismo y bioenergtica. Panormica del metabolismo energtico. Anabolismo y catabolismo. Rutas centrales del metabolismo.

Principios generales sobre regulacin metablica. Principios de bioenergtica. Energa libre. Procesos irreversibles. Reacciones acopladas. Papel central del ATP en el metabolismo energtico. Hidrlisis de ATP. Otros compuestos ricos en energa. Transferencia de grupos fosfato. Reacciones de oxido-reduccin biolgica. Coenzimas transportadoras de electrones. Vitaminas.

BIOQUMICA-1 de Medicina Departamento de Biologa Molecular M. Dolores Delgado

INTRODUCIN AL METABOLISMO

QUE ES EL METABOLISMO? El conjunto de todas las transformaciones qumicas que se producen en una clula u organismo Cientos de reacciones organizadas en rutas metablicas QU ES UNA RUTA METABLICA? Una serie de reacciones catalizadas enzimticamente. En una ruta, un precursor se convierte en un producto a travs de una serie de intermediarios: los metabolitos Las rutas metablicas pueden ser convergentes, divergentes o cclicas

TEMA 15

Ejemplo de ruta metabolica: GLUCOLISIS

GLUCOSA
Hexoquinasa

GLUCOSA-6-P
Fosfoglucoisomerasa

FRUCTOSA-6-P
Fosfofructoquinasa

FRUCTOSA-1,6-BP
Aldolasa

DHAP
TPI

GLICERALDEHIDO-3P

NADH
1,3-BPG

GAPDH

ATP
3-PG

PGK

PGM

2-PG
Enolasa

PEP

ATP
(2) PIRUVATO
TEMA 15

Piruvatoquinasa

FUNCIONES DEL METABOLISMO -Obtener energa qumica (ATP) degradando nutrientes ricos en energa (o a partir de la energa solar) -Convertir molculas nutrientes en molculas celulares (fabricar los componentes celulares) -Polimerizar precursores monomricos a protenas, cidos nucleicos, polisacridos, etc. -Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones celulares especializadas (hormonas, neurotransmisores, etc.) CARACTERSTICAS DEL METABOLISMO -Las reacciones bioqumicas son muchas, pero las reacciones importantes son relativamente pocas -Las rutas metablicas centrales son pocas y son similares en todas las formas vivas -Las molculas importantes del metabolismo no son mas de 100 -Todas las rutas se regulan de forma similar.

TEMA 15

RUTAS METABLICAS

TEMA 15

"Biochemistry" Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Saunders College Publishing. 2005
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FUENTES DE CARBONO Y ENERGA PARA EL METABOLISMO

Energa solar

Dixido de Carbono Otros nutrientes

AUTTROFOS Fotosintticos (plantas)

Polisacridos Lpidos Protenas Ac. Nucleicos

Dixido de Carbono Agua

HETERTROFOS Quimiosintticos (animales)

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TEMA 15

PRINCIPALES CARACTERSTICAS DEL CATABOLISMO Y EL ANABOLISMO

Nutrientes que contienen energa Glcidos Grasas Protenas Macromolculas celulares Protenas Polisacridos Lpidos Acidos Nucleicos

CATABOLISMO Degradativo, oxidativo Genera energa, produce ATP. Los productos finales e intermedios son materias primas del anabolismo Genera desechos que se excretan al entorno LISIS
Catabolismo ADP+Pi NAD+ NADP+

ANABOLISMO Sinttico, reductivo

ATP NADH NADPH Energa qumica Productos finales no energticos

Utiliza energa, consume ATP.

Anabolismo

Los productos finales son materias primas del catabolismo GENESIS

Molculas precursoras Aminocidos Monosacridos cidos grasos Bases nitrogenadas

CO2, H2O NH3

TEMA 15

Modificado del Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006.

ESQUEMA GENERAL DEL METABOLISMO

Protenas Acidos Nucleicos Polisacridos Lpidos

Monosacridos Nucletidos Aminocidos Glucosa

Glicerol

Acidos Grasos

Urea

Piruvato

AcetilCoA

CATABOLISMO

ANABOLISMO

CO2 O2 H2O

e-

ATP
TEMA 15 8

REGULACIN DE LAS RUTAS METABLICAS

Sirve para: Que la velocidad de la va est adaptada a las necesidades de la clula Que las vas de sntesis y degradacin no est activas a la vez. Las rutas catablicas y anablicas no son inversas las unas de las otras. Ambas rutas tienen a menudo localizacin diferente en las clulas.

Se d a tres niveles: 1. Por los enzimas alostricos, capaces de cambiar la actividad cataltica en respuesta a moduladores estimuladores o inhibidores. 2. Mediante regulacin hormonal.. 3. Por regulacin de la concentracin de un enzima en la clula (regulacin gentica)

TEMA 15

LAS RUTAS METABLICAS SE DESARROLLAN EN LUGARES ESPECFICOS DE LAS CLULAS

NCLEO
Replicacin del DNA Sntesis tRNA y mRNA NUCLEOLO sntesis rRNA

RETCULO ENDOPLSMICO
Sntesis de lpidos, transporte intracelular

RIBOSOMAS
Sntesis de protenas

GOLGI
Maduracin de glucoprotenas y otros componentes de las membranas

MITOCONDRIAS
Oxidacin del piruvato Ciclo Krebs Fosforilacin oxidativa Oxidacin de cidos grasos Catabolismo de aminocidos

CITOSOL
Glucolisis, parte de gluconeognesis; pentosas fosfato; sntesis de cidos grasos, sntesis de nucletidos
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TEMA 15

SISTEMAS MULTIENZIMTICOS
Enzimas individuales. Los intermediarios fluyen de un enzima a otro. Ej: glucolisis Complejos multienzimticos Enzimas fsicamente asociados. A menudo los intermediarios estn unidos covalentemente a los complejos. Ej PirDH

Enzimas asociados a grandes estructuras, membranas o ribosomas. Ej: cadena electrnica mitocondrial

TEMA 15

"Biochemistry" Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Saunders College Publishing. 2005
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REACCIONES BIOQUMICAS

Muchas reacciones qumicas requieren condiciones no compatibles con los organismos vivos: solventes no acuosos alta temperatura y presin presencia de cidos o bases fuertes

Las reacciones bioqumicas tienen lugar bajo condiciones especiales: soluciones acuosas condiciones suaves: presin y temperatura prcticamente constantes pH fisiolgico catalizadas enzimticamente

TEMA 15

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TIPOS DE REACCIONES BIOQUMICAS

1. Oxidacin-reduccin

2. Formar o romper enlaces carbono-carbono

3. Reordenamientos internos, isomerizaciones, eliminaciones

4. Transferencia de grupo 5. Reacciones de radicales libres

TEMA 15
Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006.

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BIOENERGTICA

TEMA 15

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TRABAJO Y ENERGA BIOLGICOS

Los seres vivos captan ENERGA de diversas fuentes Utilizan la energa para desarrollar TRABAJO BIOLGICO Los organismos realizan gran cantidad de transformaciones de energa Convierten la energa qumica (ATP) de los combustibles en: Calor, energa mecnica, energa elctrica, otras fuentes de energa qumica

ENERGA

NUTRIENTES DEL ENTORNO.....quimiosintticos LUZ SOLAR ...................................fotosintticos Transformaciones qumicas en el interior de las clulas

TRANSDUCCIONES DE ENERGA

TRABAJO BIOLGICO: Biosntesis (anabolismo) Trabajo mecnico (contraccin muscular) Gradientes osmticos (transporte contra gradiente) Trabajo elctrico (transmisin del impulso nervioso) etc.
PRODUCTOS FINALES DEL METABOLISMO (molculas simples CO2, H2O) CALOR
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AUMENTO DE ENTROPA
TEMA 15

PRINCIPIOS BSICOS DE BIOENERGTICA

Bioenergtica: Rama de la bioqumica que estudia la transferencia y utilizacin de energa en los sistemas biolgicos. Comprende el estudio cuantitativo de los cambios de energa de las reacciones bioqumicas. Aplica los principios bsicos de la termodinmica a los sistemas biolgicos. Sistema: se denomina sistema termodinmico a aquella parte del universo que se est observando. El entorno es el resto del universo. El sistema y su entorno constituyen el universo. Las clulas vivas y los organismos son sistemas abiertos que intercambian materia y energa con el entorno

ENTORNO
TEMA 15

SISTEMA

UNIVERSO
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Estado de un sistema: forma de comportarse el sistema en un instante dado. Cuando se produce una variacin en el estado de un sistema, se dice que este ha sufrido una transformacin, un proceso en el que existe un estado inicial y un estado final. El incremento () es la diferencia entre el valor de una variable en el estado inicial y en el estado final. Ej.: Transformacin de un gas Estado inicial V1, P1 Cambios: V =V2-V1 P =P2-P1 Estado final V2, P2

Funciones de estado: aquellas funciones termodinmicas cuyo valor depende slo del estado del sistema. Si en un sistema se produce una transformacin, la variacin de las funciones de estado depende nicamente del estado inicial y del estado final, y no del camino por el que se realiza la transformacin. Volmen V, Presin P, Entalpa H, Energa libre G, etc.
TEMA 15 17

1er PRINCIPIO: conservacin de la energa

La energa ni se crea ni se destruye, solo se transforma de una forma a otra Ej: los animales convierten la E qumica (ATP) en - calor (mantenimiento T) -Trabajo(E mecnica, E elctrica, otras formas de E qumica) En todas estas conversiones de E, esta no se crea ni se destruye. H = ENTALPA (contenido calrico del sistema) (J/mol) H = calor que se libera o se absorbe durante una reaccin H (-).... EXOTERMICA (libera calor) H (+) .... ENDOTERMICA (absorbe calor)

2 PRINCIPIO: analiza la direccin de los procesos favorables o espontneos

"en todo proceso el desorden total del universo aumenta S = entropa (medida cuantitativa del desorden) (J/mol K) ( Ssistema + Sentorno ) > 0 = proceso espontneo Entropa= la energa de un sistema que no puede utilizarse para realizar un trabajo til
TEMA 15 18

ENERGA LIBRE O ENERGA DE GIBBS (G)

- La energa libre (G) es la parte de energa de un sistema capaz de hacer trabajo biolgico. Las reacciones espontneas van en la direccin de ms baja energa libre G (-), EXERGNICA, favorable o espontnea G (+), ENDERGNICA, no espontnea. G=0, equilibrio

TEMA 15

Procesos exergnicos

Procesos endergnicos

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G = H - T S (relaciona los dos principios)

G = variacin de la E libre H = variacin de la entalpa (cambio calorfico) T = T absoluta S= variacin de la entropa (grado de orden)

TEMA 15

Koolman, Rohm. Bioqumica Texto y Atlas Panamericana 2003

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 G Es una funcin de estado: depende del estado inicial y final, no del camino seguido o mecanismo

A
Glucosa

G
= - 2840 kJ/mol

C
metabolismo

combustin

CO2 + H2O

D
G no proporciona informacin sobre la velocidad de la reaccin, slo si se dar o no espontneamente G se expresa en J/mol (o cal/mol)

TEMA 15

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RELACIN ENTRE G y Keq

A+B
Keq =

C+ D
[C]eq [D]eq [A]eq [B]eq G= variacin de E libre en condiciones estandar (pH=7, 25C, 1atm de presin, conc. inicial de R y P 1 M)

G= - RT LnKeq

G y Keq son constantes y caractersticas de cada reaccin G es una forma alternativa de expresar la constante de equilibrio G (-) G (+)

Keq > 1 Keq < 1

TEMA 15

R R

P P

Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed.. Omega. 2006.

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RELACIN ENTRE G y G

G= variacin de energa libre en condiciones estandar. Es una CONSTANTE, tiene un valor fijo para cada reaccin G = variacin de energa libre real . Es variable, depende de las concentraciones de reactivos y productos y de la temperatura

G = G+ RT Ln

[P] [R]

TEMA 15

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LAS G SON ADITIVAS

G1

G2

G3

Reacciones qumicas secuenciales

GTOTAL

= G1 +G2 +G3

Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas: la energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las endergnicas, que no se produciran espontneamente

TEMA 15

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RESMEN ENERGA LIBRE

- La energa libre (G) es la parte de energa de un sistema capaz de hacer trabajo biolgico. G = H - T S (relaciona los dos principios) - Las reacciones espontneas van en la direccin de ms baja energa libre (estado final, menor energa libre que estado inicial) Si se conoce G de una reaccin, se podr predecir si es espontnea o no: G (-), exergnica, favorable o espontnea G (+), endergnica, no espontnea. G=0, equilibrio - G0 es el valor de G para una reaccin a pH7, 25C, 1 atm de presin y [R]i y [P]i = 1M (condiciones estandar): G0 = -RT ln Keq G0 es constante y caracterstica de cada reaccin

- En las clulas las condiciones no son las estandar (sobre todo por las distintas concentraciones de reactivos y productos) [P] Greal = G0 + RT ln

[R]

- G0 son aditivas. Las reacciones exergnicas se acoplan a reacciones endergnicas: la energa liberada por las exergnicas se usa para dar lugar a las endergnicas, que no se produciran espontneamente.
TEMA 15 25

TEMA 15

Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006.

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ATP

TEMA 15

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ATP: nexo entre procesos biolgicos dadores de energa y procesos biolgicos consumidores de energa
NUTRIENTES PRODUCTORES DE ENERGA

CO2, H2O, NH3

catabolismo
TRABAJO BIOLGICO

ADP + Pi

ATP

Contraccin muscular Transmisin impulso nerviosos Transporte activo Biosntesis

anabolismo
MACROMOLCULAS COMPLEJAS

PRECURSORES SENCILLOS

La hidrlisis del ATP proporciona energa libre para impulsar reacciones endergnicas, energticamente desfavorables

TEMA 15

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HIDRLISIS DEL ATP

- Enlaces fosfoanhidro

adenina

ATP

ribosa H2O
Hidrlisis con disminucin de la repulsin de cargas

ATPasa

OH

Pi
(Estabilizacin por resonancia)

ADP
(Ionizacin)

G 0 = - 30,5 kJ/mol G real = - 50 a -65 kJ/mol

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TEMA 15

LA HIDRLISIS DEL ATP PROPORCIONA ENERGIA LIBRE PARA IMPULSAR REACCIONES ENDERGNICAS

G 0 = - 30,5 kJ/mol ATP + H2O ADP + Pi (ortofosfato) G real = - 50 a -65 kJ/mol

ATP + H2O

AMP + PPi (pirofosfato) PPi 2 Pi

G 0 = - 45,6 kJ/mol G 0 = - 19 kJ/mol

G 0 = - 64,6 kJ/mol

LOS NUCLESIDOS TRIFOSFATO SON ENERGTICAMENTE EQUIVALENTES

Los otros nuclesidos trifosfato: GTP, UTP y CTP y los deoxinuclesidos trifosfato: dATP, dGTP, dTTP, dCTP son energticamente equivalentes al ATP Se producen transfosforilaciones entre nucletidos: ATP + NDP
TEMA 15

Nuclesido difosfato quinasa

ADP + NTP
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OTROS COMPUESTOS DE ALTA ENERGA

FOSFOENOL PIRUVATO 1,3-BISFOSFOGLICERATO FOSFOCREATINA ACETIL-CoA tiosteres SUCCINIL-CoA SUCCINATO + CoA-SH G0=- 36 kJ/mol PIRUVATO + Pi 3-FOSFOGLICERATO + Pi CREATINA + Pi ACETATO + CoA-SH G0=- 61,9 kJ/mol G0=- 49,3 kJ/mol G0=- 43 kJ/mol G0=- 32,2 kJ/mol

-Compuestos de alta energa = altos potenciales de transferencia de fosforilo (tendencia a ceder el P ) - ATP = valor intermedio

-Compuestos de alta energa.....transfieren su grupo fosfato al ADP para formar ATP -- ATP.......transfiere su grupo fosfato a compuestos de baja energa y los activa
TEMA 15

G0 de hidrlisis (kJ/mol)

REACCIONES DE TRANSFERENCIA DE FOSFORILO

Ej:

PEP + ADP Glucosa + ATP

PK

ATP + Pir Glucosa-6-P +ADP

31

HK

PROCESOS CELULARES DONDE SE FORMA O SE CONSUME ATP

El ATP est contnuamente consumindose y regenerndose

Formacin de ATP: - Fosforilacin a nivel de sustrato (1): transferencia de grupo fosfato desde un compuesto de alta energa al ATP - Fosforilacin oxidativa (2): transferencia de electrones al O2 acoplado a la biosntesis de ATP en la membrana mitocondrial Consumo de ATP:
ATP

ATP

Intermedios -P

ATP

Fosfocreatina

ATP

ATP

-Primeras etapas glucolisis -Reacciones de Biosntesis (4) -Transporte activo (5)

ATP

UTP UDP-glucosa

-Contraccin muscular (6) -muchos otros procesos

Modificado de: Basic Medical Biochemistry. A Clinical Approach. Marks, D.B, Marks, A.D and Smith, C.M. Williams and Wilkins.1996. TEMA 15 32

Reacciones Redox biolgicas

TEMA 15

33

CONCEPTOS GENERALES DE REACCIONES REDOX

Reacciones de transferencia electrnica, son reacciones de oxidacin reduccin: -prdida de e- por una especie qumica reducida (que se oxida) -ganancia de e- por una especie qumica oxidada (que se reduce)

3 etapas del catabolismo: 1. La fuente de e- son compuestos reducidos (ej: glucosa, ac.grasos) 2. Reacciones de oxidacin: los e- pasan de distintos intermediarios metablicos a transportadores electrnicos con liberacin de energa 3. Transporte de e- al O2 (aceptor final) acoplado a sntesis de ATP (fosforilacin oxidativa)

TEMA 15

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ESQUEMA GENERAL DEL METABOLISMO

Protenas Acidos Nucleicos Polisacridos Lpidos

1
Monosacridos Glicerol Acidos Grasos

Nucletidos Aminocidos Glucosa

Urea

Piruvato

AcetilCoA

CATABOLISMO

ANABOLISMO

CO2 O2 H2O

e3

ATP
TEMA 15 35

REACCIONES REDOX BIOLGICAS

Oxidacin = prdida de eReduccin = ganancia de e- Oxidacin y reduccin se producen simultneamente: el e- que pierde la molcula oxidada se capta por otra que se reduce. - En los sistemas biolgicos frecuentemente la transferencia de un e- se produce unida a la transferencia de un protn (tomo de H) H+ + eOxidacin = prdida de tomos de H (deshidrogenacin) Reduccin = ganancia de tomos de H - Los e- tambien se pueden transferir en forma de in hidruro (:H-), que incluye 2 e- + H+

Un e- transferido en cualquiera de esas formas se denomina equivalente de reduccin

TEMA 15

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ESTADOS DE OXIDACIN DEL CARBONO

N de epertenecientes aC

Ms reducido

Ms oxidado
Modificado del Lehninger Principios de Bioqumica", 4 ed. Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006. TEMA 15 37

COENZIMAS TRANSPORTADORAS DE ELECTRONES

1. Cofactores principales: hidrosolubles, intervienen en muchas reacciones Redox del metabolismo

NAD+ y NADP+. Cofactores mviles, se trasladan de un enzima a otro FAD y FMN: grupo prosttico de las flavoprotenas, a las que estn fuertemente unidas.
2. Otros cofactores: algunos solubles, otros protenas de membrana quinonas liposolubles, protenas ferrosulfuradas, citocromos Equivalentes de reducin (e-) del catabolismo

NAD+ FAD

NADH FADH2

NADP+

NADPH

TEMA 15

Sntesis de ATP

Reacciones anablicas
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NAD+ y NADP+
nicotinamida

+ H+
NADH reducido

NAD+ oxidado

NAD+ + 2H+ + 2 e-

NADH + H+

Ej.

NAD+ + R C R OH

NADH + H+ + R C R O

Ms de 200 enzimas utilizan NAD o NADP como coenzimas. Se denominan oxidoreductasas o deshidrogenasas.
TEMA 15 39

FAD y FMN

FAD y FMN

Grupo prosttico de flavoprotenas

FAD + 2H+ + 2 e-

FADH2

H H FAD + R C C R H H

H FADH2 + R C C R H

TEMA 15

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VITAMINAS Y COENZIMAS

VITAMINA B1, Tiamina

COENZIMA TPP

ENZIMA

Grupo transportado Aldehido

Piruvato deshidrogenasa -ceto -glutarato DH -cetocido DH Deshidrogenasas (flavoprotenas) Deshidrogenasas Pir-DH, -KG-DH, acil CoA sintetasas... Aminotransferasas (Glucgeno fosforilasa) Carboxilasas metab. aminocidos oxidacin propionato

B2, Riboflavina B3, Niacina

FAD,FMN NAD, NADP

electrones electrones acilos amino CO2 grupos monocarbonados hidrgenos

B5, Pantotenato CoA B6, Piridoxina B8, Biotina B9, Folato Piridoxal fosfato Biotina Tetrahidrofolato

B12, cobalamina CoenzimaB12

TEMA 15

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A los mdicos les gusta prescribir vitaminas, y millones de personas las toman, pero se necesita una buena cultura bioqumica para entender porqu se necesitan y cmo las utiliza el organismo.
Fritz Lipman (1899-1986), Descubridor del CoA
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1953
"for his discovery of the citric acid cycle" "for his discovery of coenzyme A and its importance for intermediary metabolism"

http://nobelprize.org/

Hans Adolf Krebs TEMA 15

Fritz Albert Lipmann 42

TEMA 15

FIN de la BIOENERGTICA

43