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La

taxonomie canadienne : expLorer


Le comit dexperts sur les sciences de la biodiversit

La biodiversit , crer des possibiLits

Le savoir au service du public

LA TAXONOMIE CANADIENNE : EXPLORER LA BIODIVERSIT, CRER DES POSSIBILITS

Le comit dexperts sur les sciences de la biodiversit

Il est intressant de contempler un rivage luxuriant, tapiss de nombreuses plantes appartenant de nombreuses espces abritant des oiseaux qui chantent dans les buissons, des insectes varis qui voltigent et l, des vers qui rampent dans la terre humide, si lon songe que ces formes si admirablement construites, si diffremment conformes, et dpendantes les unes des autres dune manire si complexe, ont toutes t produites par des lois qui agissent autour de nous. [] Ny a-t-il pas une vritable grandeur dans cette manire denvisager la vie, avec ses puissances diverses attribues primitivement [] un petit nombre de formes, ou mme une seule? Or, tandis que notre plante, obissant la loi fixe de la gravitation, continue tourner dans son orbite, une quantit infinie de belles et admirables formes, sorties dun commencement si simple, nont pas cess de se dvelopper et se dveloppent encore!
Darwin, Charles H. 1887. Lorigine des espces au moyen de la slection naturelle ou la lutte pour lexistence dans la nature. Traduit sur ldition anglaise dfinitive par E. Barbier, Paris, C. Reinwald, libraire-diteur.

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Le Conseil des acadmies canadiennes 180, rue Elgin, bureau 1401, Ottawa (Ontario) Canada K2P 2K3

AVIS : Le projet sur lequel porte ce rapport a t entrepris avec lapprobation du conseil des gouverneurs du Conseil des acadmies canadiennes (CAC). Les membres de ce conseil des gouverneurs sont issus de la SRC : Les Acadmies des arts, des lettres et des sciences du Canada, de lAcadmie canadienne du gnie (ACG) et de lAcadmie canadienne des sciences de la sant (ACSS), ainsi que du grand public. Les membres du comit dexperts responsable du rapport ont t choisis par le CAC en raison de leurs comptences spcifiques et en vue dobtenir un quilibre des points de vue. Ce rapport a t prpar pour le gouvernement du Canada en rponse une demande soumise par le ministre du Patrimoine canadien et des Langues officielles, par lintermdiaire du ministre de lIndustrie. Les opinions, constatations, conclusions et recommandations prsentes dans cette publication sont celles de leurs auteurs, savoir des membres du comit dexperts sur les sciences de la biodiversit. [NDT] Afin de faciliter la lecture du prsent texte, nous avons employ le masculin comme genre neutre pour dsigner aussi bien les femmes que les hommes.
Catalogage avant publication de Bibliothque et Archives Canada

La taxonomie canadienne [ressource lectronique] : explorer la biodiversit, crer des possibilits / Comit dexperts sur les sciences de la biodiversit. Publ. aussi en anglais sous le titre: Canadian taxonomy. Comprend des rf. bibliogr. Monographie lectronique en format PDF. galement publ. en version imprime. ISBN 978-1-926558-32-5 1. BiologieCanadaClassification. 2. BiodiversitCanada. I. Conseil des acadmies canadiennes. Comit dexperts sur les sciences de la biodiversit QH83.C36 2010b 578.0971 C2010-905758-9

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Avis de non-responsabilit : Les donnes et informations tires dInternet qui figurent dans le prsent rapport taient correctes, notre connaissance, la date de publication du rapport. En raison de la nature dynamique dInternet, les ressources qui sont gratuites et accessibles au public peuvent par la suite faire lobjet de restrictions daccs ou exiger des frais, et lemplacement des lments dinformation peut changer lorsque les menus et le contenu des sites font lobjet de modifications. Les opinions et extrapolations exprimes dans ce document sont celles des auteurs en tant quexperts du domaine et ne reprsentent pas ncessairement celles de leur employeur ou organisme daffiliation.

2010 Conseil des acadmies canadiennes Imprim Ottawa, Canada

Cette valuation a t rendue possible grce au soutien du gouvernement du Canada.

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Le Conseil des acadmies canadiennes www.sciencepourlepublic.ca

Le Conseil des acadmies canadiennes (CAC) est un organisme indpendant but non lucratif qui soutient des valuations scientifiques, effectues par des experts, qui alimentent llaboration de politiques publiques au Canada. Dirig par un conseil de 12 gouverneurs et conseill par un comit consultatif scientifique de 16 membres, le CAC a pour champ daction la science prise au sens large, qui englobe les sciences naturelles, les sciences humaines, la sant, le gnie et les lettres. Les valuations du CAC sont effectues par des comits pluridisciplinaires indpendants dexperts venant du Canada et de ltranger. Ces valuations visent faire connatre les problmes nouveaux, les lacunes des connaissances, les points forts du Canada, de mme que les tendances et les pratiques internationales dans les domaines tudis. Ces tudes fournissent aux dcideurs gouvernementaux, aux universitaires et aux parties prenantes linformation de grande qualit dont ils ont besoin pour laborer des politiques publiques claires et innovatrices. Toutes les valuations du CAC subissent un examen formel par des pairs. Elles sont publies en franais et en anglais, et accessibles au public sans frais. Des fondations, des organismes non gouvernementaux, le secteur priv ou tout palier de gouvernement peuvent soumettre au CAC des questions susceptibles de faire lobjet dvaluations. Le CAC bnficie du soutien de ses trois acadmies membres fondatrices :
La SRC : Les Acadmies des arts, des lettres et des sciences du Canada est

le principal organisme regroupant dminents scientifiques, chercheurs et gens de lettres au Canada. Considre comme lacadmie nationale du Canada, la SRC a pour objectif premier de promouvoir lacquisition du savoir et la recherche en arts et en sciences. La Socit est compose de prs de 2 000 membres, hommes et femmes, choisis par leurs pairs pour leurs ralisations exceptionnelles en sciences naturelles, en sciences humaines et en arts. La SRC sattache reconnatre lexcellence, conseiller les gouvernements et les organisations, ainsi qu promouvoir la culture canadienne. LAcadmie canadienne du gnie (ACG) est lorganisme national par lentremise duquel les ingnieurs les plus chevronns et expriments du Canada offrent au pays des conseils stratgiques sur les enjeux dimportance primordiale. LACG est un organisme indpendant, autonome et but non lucratif qui a t fond en 1987. Les membres de lACG sont nomms et lus par leurs pairs

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titre de membres honoraires, en fonction de leurs ralisations exceptionnelles et de leurs longs tats de service au sein de la profession dingnieur. Les membres de lACG sengagent faire en sorte que les connaissances expertes en gnie du Canada soient appliques pour le plus grand bien de tous les Canadiens et de toutes les Canadiennes. LAcadmie canadienne des sciences de la sant (ACSS) reconnat les personnes qui ont leur actif de grandes ralisations savantes dans le domaine des sciences de la sant au Canada. LACSS fournit en temps voulu des valuations claires et indpendantes sur des questions urgentes qui touchent la sant des Canadiens et des Canadiennes. De plus, lACSS reprsente le Canada au sein de lInterAcademy Medical Panel (IAMP), consortium mondial dacadmies nationales des sciences de la sant qui vise allger le fardeau des soins de sant des peuples les plus pauvres du monde, renforcer les capacits scientifiques dans le domaine de la sant, ainsi qu fournir aux gouvernements nationaux et aux organisations internationales des avis scientifiques indpendants sur la promotion des sciences de la sant et sur les politiques de soins de sant.

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Thomas E. Lovejoy (prsident), chaire de recherche en biodiversit, Centre Heinz pour la science, lconomie et lenvironnement, Washington D.C. Luc Brouillet, professeur titulaire et conservateur de lHerbier Marie-Victorin, Institut de recherche en biologie vgtale, Universit de Montral, Qubec W. Ford Doolittle, MSRC, professeur, Universit Dalhousie, Halifax, Nouvelle-cosse Andrew Gonzalez, professeur et titulaire de la chaire de recherche du Canada en biodiversit, et directeur du Centre de la science de la biodiversit, Universit McGill, Montral, Qubec David M. Green, professeur et directeur, Muse Redpath, Universit McGill, Montral, Qubec Peter Hall, agrg de recherche honoraire, Agriculture et Agroalimentaire Canada (retrait), Ottawa Ontario Paul Hebert, MSRC, professeur et directeur, Institut de la biodiversit de lOntario, Universit de Guelph, Ontario Thora Martina Herrmann, professeure et titulaire de la chaire de recherche du Canada en ethnocologie et conservation de la biodiversit, Universit de Montral, Qubec Douglas Hyde, directeur gnral, NatureServe Canada, Ottawa, Ontario Jihyun Lee, agente des affaires environnementales pour la biodiversit marine et ctire et pour lapproche cosystmique, Secrtariat de la Convention sur la diversit biologique du Programme des Nations Unies pour lenvironnement, Montral, Qubec Wayne P. Maddison, professeur et titulaire dune chaire de recherche du Canada en biodiversit et systmatique et directeur du Muse Beaty de la biodiversit, Universit de la Colombie-Britannique, Vancouver

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Sarah P. Otto, MSRC, professeure et directrice du Centre de recherche sur la biodiversit, Universit de la Colombie-Britannique, Vancouver Felix Sperling, professeur et conservateur au Muse dentomologie E.H. Strickland, Universit de lAlberta, Edmonton R. Paul Thompson, professeur, Universit de Toronto, Ontario

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Remerciements
Pendant ses dlibrations, le comit dexperts a demand lassistance de plusieurs personnes et organismes qui lui ont soumis de prcieux renseignements aux fins dvaluation. Le comit dexperts remercie notamment le personnel du Muse royal de lOntario, du Muse Beaty de la biodiversit, du Muse Redpath, du Jardin botanique de Montral et du Muse canadien de la nature, qui ont bien voulu nous ouvrir leurs portes. Le comit dexperts a de plus grandement bnfici de discussions en personne avec Henry Lickers, du Conseil mohawk dAkwesasne, Robert Hft, du Secrtariat de la Convention sur la diversit biologique, des membres du Partenariat fdral en matire dinformation sur la biodiversit, et Donald McAlpine, de lAlliance des muses dhistoire naturelle. Nous dsirons remercier James Edwards pour les nombreuses ides quil a mises au dbut des travaux du comit dexperts. Le comit dexperts souhaite galement souligner lapport des donnes et renseignements fournis par des organisations et des individus, tout au long de ses dlibrations. Le comit dexperts souhaite remercier chacun des 432 rpondants lenqute sur lexpertise taxonomique, des 120 gestionnaires de collections qui ont rpondu lenqute sur les collections, et des 17 individus qui ont rpondu lappel public dinformations. Plusieurs ayant requis lanonymat, nous navons pas nomm les rpondants; il nen demeure pas moins que toutes les contributions ont t utiles et ont aliment la rflexion du comit dexperts. Le prsident de comit dexperts sur les sciences de la biodiversit,

Thomas E. Lovejoy

Personnel responsable du projet au Conseil des acadmies canadiennes


Coordination de lvaluation : Eleanor Fast, directrice de programme Marc M. Dufresne, associ de recherche Emmanuel Mongin, associ de recherche Wendy Y. Shen, coordonnatrice des programmes Accurate Communications, conception graphique Jean-Sbastien Albert, Tralogik communications, rvision du texte franais Harriet Gorham, rvision du texte anglais Lara Mainville, Llama Communications, traduction Clare Walker, rvision du texte anglais

Avec la participation de : (en ordre alphabtique)

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Examen du rapport
Ce rapport a t examin, ltat dbauche, par les personnes mentionnes ci-dessous, qui ont t choisies par le Conseil des acadmies canadiennes en raison de la diversit de leurs points de vue, de leurs domaines de spcialisation et de leur reprsentativit de diverses disciplines et organisations. Ces examinateurs ont valu lobjectivit et la qualit du rapport. Leurs avis qui demeureront confidentiels ont t pleinement pris en considration par le comit, et beaucoup de leurs suggestions ont t incorpores dans le rapport. Nous navons pas demand ces personnes dapprouver les conclusions du rapport, et elles nont pas vu la version dfinitive du rapport avant sa publication. Le comit dexperts et le CAC assument lentire responsabilit du contenu dfinitif de ce rapport. Le CAC tient remercier les personnes suivantes davoir bien voulu examiner le rapport : Suzanne Carrire, biologiste, Environnement et ressources naturelles, gouvernement des Territoires du Nord-Ouest, Yellowknife Brock Fenton, professeur de biologie, Universit Western Ontario, London, Ontario Jeremy Kerr, professeur agrg, Dpartement de biologie, Universit dOttawa, Ontario Richard P. Lane, directeur scientifique, Muse dhistoire naturelle, Londres, Royaume-Uni Jeffrey B. Marliave, vice-prsident, Sciences de la mer, Aquarium de Vancouver, Colombie-Britannique Stephen A. Marshall, professeur, cole des sciences de lenvironnement, Universit de Guelph, Ontario William W. Mohn, professeur, Dpartement de microbiologie et dimmunologie, Universit de la Colombie-Britannique, Vancouver Laurence Packer, professeur, Dpartement de biologie, Universit York, Toronto, Ontario

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Peter H. Raven, prsident, Jardin botanique du Missouri, Saint-Louis, Missouri, tats-Unis Murray A. Rudd, confrencier, Dpartement de lenvironnement, Universit de York, Royaume-Uni Gary W. Saunders, titulaire de la Chaire de recherche du Canada en systmatique molculaire et en biodiversit, Universit du Nouveau-Brunswick, Fredericton Marcia J. Waterway, professeure agrge, Dpartement de sciences vgtales, Universit McGill, Sainte-Anne-de-Bellevue, Qubec La procdure dexamen du rapport a t supervise, au nom du conseil des gouverneurs et du comit consultatif scientifique du CAC, par le professeur John Smol, MSRC. Son rle tait de sassurer que le comit dexperts prenne en considration de faon entire et quitable les avis des examinateurs. Le conseil des gouverneurs du CAC nautorise la publication du rapport dun comit dexperts quune fois que la personne responsable du contrle de lexamen du rapport confirme que le rapport satisfait bien aux exigences du CAC. Le CAC remercie le professeur Smol de la diligence dont il a fait preuve dans la supervision de lexamen du rapport. La prsidente du Conseil des acadmies canadiennes,

Elizabeth Dowdeswell

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Table des matires


Sommaire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1

Chapitre 1 Prface et mandat confi au comit dexperts . . . . . . . . . . . . 9

1.1 Comprendre et soumettre le mandat au comit dexperts . . . . . . . . . . . . . 9 1.2 Les approches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.3 La structure du rapport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15

2.1 Une richesse immense : la valeur de la biodiversit canadienne. . . . . . . . 17 2.2 Lrosion gnralise de la biodiversit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 2.3 Le rle essentiel de la taxonomie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

3.1 Limportance de dcouvrir et de diffrencier les espces . . . . . . . . . . . . . . . 3.2 La faon de dcouvrir et de diffrencier le espces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.3 Larchivage despces dans les collections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.4 La tendance la collaboration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

32 36 41 44

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique . . . . . . . 49

4.1 4.2 4.3 4.4 4.5

Les contributions du Canada la recherche taxonomique. . . . . . . . . . . . Les experts canadiens, par groupe dge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Lapport de PHQ lexpertise taxonomique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . La tendance en matire de publication . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Les autres dtenteurs du savoir taxonomique au Canada. . . . . . . . . . . . .

50 53 54 64 68

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada . . . . . . . . . . . . . . . 77

5.1 Les spcimens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 5.2 Les installations des collections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 5.3 Les institutions taxonomiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90

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Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit . . . . . . . . 99

6.1 Augmenter les informations sur la biodiversit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101 6.2 Laccs aux informations sur la biodiversit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits . . . . . . . . 113

7.1 Les actifs et les lacunes de la taxonomie canadienne . . . . . . . . . . . . . . . 7.2 La taxonomie : une science en transition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.3 Les sciences de la biodiversit au Canada : une lance qui sintensifie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.4 Le rle futur de la taxonomie dans un Canada ax sur le savoir . . . . . .
Glossaire

113 115 116 118

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123

Rfrences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127

Appendice 1 (en ligne seulement) : Enqute sur lexpertise taxonomique au Canada Appendice 2 (en ligne seulement) : Enqute sur les collections canadiennes Appendice 3 (en ligne seulement) : Stations de recherche de dcouvertes en biodiversit diriges par des universits Appendice 4 ( en ligne seulement) : Tendances en matire demplois, de financement et de publication dans les sciences de la biodiversit au Canada Les appendices sont disponibles au www.sciencepourlepublic.ca/biodiversite.

Sommaire

Sommaire
La diversit de la vie sur Terre est un patrimoine naturel irremplaable qui est essentiel au fonctionnement de la biosphre et au bien-tre humain. Au Canada, comme partout au monde, la biodiversit subit une rosion plus soutenue qu tout autre moment de lhistoire de lhumanit, ce qui entrane des consquences majeures pour les cosystmes, la culture, lconomie, le potentiel dinnovation et la socit. Les cinq principales causes de cette perte de diversit sont la perte dhabitats, lexploitation, la pollution, les changements climatiques et les espces envahissantes.
L a Ta x o n o m iE : L E f o n dE m En T d ES SCi EnCES d E La b i o d i vE R Si T

Les problmes environnementaux qui sont prsentement associs aux changements rapides que subit la biodiversit ne sauraient tre rgls au moyen dapproches conventionnelles et trs cibles. Les sciences de la biodiversit sont devenues un domaine transdisciplinaire qui a recours aux outils et thories de diffrentes disciplines. La taxonomie la science qui dcouvre, diffrencie, classifie et documente les tres vivants est ce titre une recherche fondamentale. Les progrs raliss par les sciences de la biodiversit sont tributaires de la dcouverte et de lexactitude de lidentification des espces qui composent nos cosystmes (voir la figure 1). Cest sur cette toile de fond que le ministre du Patrimoine canadien, au nom du Muse canadien de la nature, a demand au Conseil des acadmies canadiennes de crer un comit dexperts multidisciplinaire qui aurait pour mandat dvaluer ltat de la taxonomie au Canada, de mme que les tendances qui se profilent dans ce domaine. La dcouverte et la caractrisation despces ncessitent des scientifiques canadiens qui, sappuyant sur les technologies de pointe, contribuent aux collections et aux bases de donnes, dans une perspective de contribution globale aux sciences de la biodiversit. Le comit dexperts sur les sciences de la biodiversit estime que ce rapport savre lvaluation la plus exhaustive et jour qui soit sur lexpertise taxonomique canadienne et les collections de biodiversit au Canada, ainsi que sur les efforts visant rendre librement disponibles les informations taxonomiques au moyen dun accs en ligne.
LE x P E RTi S E C a n a d iE n nE E n R E ChERC h E Taxonomiqu E

Malgr les contributions passes de calibre mondial du Canada la recherche taxonomique, le constat que fait le comit dexperts du personnel hautement qualifi (PHQ) dans ce domaine est source de proccupations. Lenqute en ligne qua prpare le comit dexperts, et laquelle ont rpondu 432 rpondants,

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cologie
Changements de la biodiversit Identification et suivis de changements
at ific ion des sib ilit s

conomie
Services et valuations

u risq

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Taxonomie
Dcouvrir la biodiversit Identification des cibles et valuation des rsultats
Inv et d enta v ire p alu erm er l et es tan rs t d erv e s es le c

Gestion
Ressources, biocontrles

Gouvernance de la biodiversit
chelles locale, nationale, mondiale

Observation des rsultats de lvolution

tion

ner

Biologie de lvolution
Origines de la biodiversit

Biologie de la conservation
Rserves, restauration

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 1 Les composantes des sciences de la biodiversit et leurs interrelations

montre que si les tudiants continuent de sintresser la taxonomie et de suivre une formation dans cette discipline, la plupart des taxonomistes sont forms dans une poigne de laboratoires seulement, ce qui a pour rsultat de limiter lexpertise un groupe circonscrit despces. Le comit dexperts a galement tabli une perte dexpertise taxonomique en ce qui a trait des groupes taxonomiques trs diversifis et encore peu compris, et a not qu mesure que les taxonomistes partent la retraite, ils ne sont pas remplacs. Les ouvertures de postes en taxonomie sont pour ainsi dire inexistantes, malgr une tendance la hausse de cration de postes dans les sciences gnrales de la biodiversit. Les taxonomistes qui russissent se trouver un emploi dans leur domaine dcouvrent que leur discipline souffre des niveaux stagnants de financement par chercheur, ajust pour linflation alors mme que les cots lis la recherche montent en flche. Une analyse bibliomtrique des descriptions despces a permis de constater que parmi les pays du G20 et de lUnion europenne, le Canada est pass du 6e rang, quil occupait dans les annes 1980, au 14e, au cours des annes 2000.

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mesure que les experts partent la retraite, une collaboration accrue est essentielle pour combler cette lacune sur le plan de lexpertise. Les taxonomistes canadiens uvrant au sein duniversits, de gouvernements et du secteur priv devraient chercher dvelopper des partenariats novateurs avec (a) les dtenteurs du savoir traditionnel autochtone, qui ont cumul beaucoup dinformation sur la biodiversit passe et actuelle au Canada; (b) les taxonomistes de premire ligne (baccalaurat et matrise) qui effectuent les identifications despces dans le cadre dtudes environnementales et qui assurent la surveillance despces envahissantes; et (c) les naturalistes et les programmes Citoyens de la science. Il nen demeure pas moins que de telles collaborations ncessitent des experts en taxonomie pour intgrer ces diffrentes sources de connaissances. Si cette lacune sur le plan de lexpertise continue de saccentuer, le Canada risque de faire face deux problmatiques : lidentification errone des espces introduites et linexactitude des informations concernant leur diffusion et leur potentiel de nuire aux environnements daccueil. De plus, le Canada pourrait galement ne plus tre en mesure dvaluer le dclin de certaines espces indignes. Par exemple, dans un cosystme donn, les pollinisateurs rendent un fier service (au moyen de la fertilisation des cultures) lagriculture; on constate nanmoins une lacune croissante sur le plan de lexpertise taxonomique en matire didentification des pollinisateurs.
LE S Co L L E C Ti o nS Ta x o n o m i q uE S C anadi Enn ES

Les nombreux spcimens que contiennent les collections biologiques du Canada sont une ressource essentielle la recherche taxonomique la fois la somme patrimoniale du travail pass et la pierre de lance des recherches futures et doivent tre prservs pour les gnrations futures. Le comit dexperts a amass des informations sur ces collections par le biais dune enqute en ligne, laquelle ont particip 120 collections de partout au pays tmoignant de la biodiversit du Canada. Les collections canadiennes comptent plus de 50 millions de spcimens. Certaines collections peuvent compter quelques centaines de spcimens, alors que dautres (celles dAgriculture et Agroalimentaire Canada) en ont prs de 17 millions. Plusieurs spcimens sont irremplaables. Mme en attribuant aux spcimens une valeur moyenne trs conservatrice de 5 dollars chacun, la valeur totale des collections canadiennes dpasserait les 250 millions de dollars. Le fait de conserver des spcimens dans plusieurs collections travers le pays facilite la recherche et lenseignement, expose les nouvelles gnrations la recherche ayant recours aux collections et sert de protection contre les catastrophes. Les stations de recherche des universits et des gouvernements facilitent, souvent en rgion loigne, la cueillette de spcimens despces attestant la biodiversit; certaines de ces stations cumulent des donnes sur des espces et des cosystmes depuis plusieurs dcennies.

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Les conditions dentreposage des spcimens des collections canadiennes sont trs variables. Dans la plupart des collections, plus de 75 % des spcimens sont entreposs dans des conditions adquates, mais plusieurs collections sont toujours loges dans des installations vieillissantes quil serait difficile dagrandir. Il manque plusieurs organisations un financement stable long terme; de plus, ces organisations doivent composer avec une capacit de prservation limite ou inadquate. Lorsquun employ part la retraite, il arrive souvent quil ne soit pas remplac, ce qui donne lieu des collections orphelines. Les collections sont diriges et gres en vertu de diffrentes structures organisationnelles et non en vertu de stratgies ou de normes nationales de gestion des collections. Si cette lacune touchant les collections saccentue, le Canada pourrait voir disparatre des informations essentielles la comprhension long terme des changements de la biodiversit canadienne et la prise de dcision claire en matire dlaboration de politiques et de gestion.
faC iLi T E R L aC C S L i n f oRm aT i o n S u R La biodiv ERS iT

Ltude et la gestion des ressources de la biodiversit du Canada y compris la comprhension des changements environnementaux, lidentification et le contrle despces envahissantes, et lidentification et la conservation despces risque ncessitent un accs libre, en ligne, aux donnes taxonomiques. Les lacunes du Canada sont importantes en matire de numrisation de ses collections, dinventaires de la biodiversit et dinventaires de donnes de rgions loignes. Le Canada est opportuniste plutt que systmatique en ce qui a trait la cueillette sur le terrain de nouvelles donnes sur la biodiversit et, lexception de certains groupes taxonomiques, notamment les vertbrs, il accuse dimportantes lacunes dans le domaine des observations sur le terrain. La communaut taxonomique du Canada a souvent t tmoin de donnes qui taient retenues afin quelles servent uniquement dans le cadre de recherches individuelles. Ou encore, il arrive que des donnes puissent tre disperses dans plusieurs bases de donnes ou ntre disponibles que sur des documents imprims, des tiquettes de spcimens, et sur dautres supports qui sont peu utiles la recherche ou la dcouverte interactives. mesure que la communaut de recherche vieillit et part la retraite, de plus en plus de donnes sont perdues. Les efforts canadiens de mise en commun des donnes font figure de parent pauvre lchelle mondiale, comme en tmoigne la faible participation du Canada au Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB). En mai 2010, le Canada figurait au 18e rang mondial, et seul 1,69 million des fiches du SMIB provenait dinstitutions canadiennes ce qui, mme en tant gnreux, reprsente seulement

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3 % des donnes de spcimens disponibles. Des 6,35 millions de fiches du SMIB portant sur des espces canadiennes, seules 1,33 million dentre elles sont tenues par des institutions canadiennes 3,80 millions sont tenues par des institutions amricaines alors quune large part est tenue par dautres pays. Cela signifie quenviron 80 % des renseignements sur la biodiversit canadienne disponibles en ligne manent de lextrieur du Canada. Bien que le Canada se soit dot dimpressionnantes collections de spcimens et dune solide infrastructure numrique, une bonne partie des renseignements sur les spcimens est enfouie dans des placards plutt que dtre libre et accessible sur le Web. Cette situation dficitaire doit tre rsolue, non seulement pour le bien de la taxonomie, mais aussi pour celui dautres branches de la biologie qui dpendent de ces informations. Cette lacune sur le plan des donnes signifie que le processus dlaboration des politiques du Canada en matire de gestion des ressources en biodiversit risque de reposer sur des donnes inadquates, ce qui pourrait avoir dimportantes rpercussions sur lconomie et le bien-tre des Canadiens.
LE C a n a d a E S T- iL o uT iL L P o uR Com PRE ndRE S E S R E S Sou R C E S E n b i o d i vE R S i T ?

Le Canada dispose dacquis taxonomiques de premire importance, dont dimportantes collections dhistoire naturelle et du moins pour le moment lexpertise taxonomique ncessaire pour sen servir bon escient. Le savoir que possdent les peuples autochtones et le secteur non gouvernemental du Canada contribue de faon apprciable la capacit taxonomique des secteurs gouvernemental et universitaire. Les jeunes Canadiens, qui grandissent dans un magnifique et vaste pays, en grande partie encore ltat naturel, sont trs attirs par des carrires en sciences de la biodiversit. Le Canada a une capacit danalyse de calibre mondial dans trois domaines linformatique, la gnomique et la tldtection qui vient soutenir llaboration dune nouvelle approche la dcouverte, la documentation et lvaluation de la biodiversit. Le comit dexperts a pourtant braqu les projecteurs sur le fait que malgr ces acquis, non seulement certaines forces sont-elles menaces et certains bienfaits potentiels ne sont-ils pas pleinement raliss, mais encore quil existe des lacunes dterminantes associes lexpertise taxonomique, aux collections et aux donnes (voir la figure 2). En rponse la question qui lui a t pose, le comit dexperts conclut que le Canada nest pas encore outill pour pleinement comprendre les dfis que prsentent nos ressources en biodiversit.

La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Lacunes actuelles
Au Canada, il existe des lacunes sur les plans de la description despces et de la distribution gographique. Le Canada est galement la trane par rapport dautres pays en ce qui concerne la numrisation, les inventaires systmatiques, de mme que le soutien en matire de contributions nationales aux initiatives internationales de partage de donnes sur la biodiversit. On constate labsence dune stratgie et de normes nationales en matire de collections. Plusieurs collections sont entreposes dans des installations dsutes et inadquates, dont la capacit de croissance est limite. Le personnel hautement qualifi se perd en raison de possibilits demploi peu prometteuses et de niveaux de financement de recherche stagnants. Les taxonomistes et les naturalistes sont vieillissants et ne sont pas remplacs au moment de leur dpart. Les connaissances traditionnelles et communautaires sont risque.

Consquences
Une capacit insuffisante grer, conserver et se servir adquatement de la biodiversit canadienne. Une capacit limite valuer la rponse de la biodiversit canadienne aux changements mondiaux, et son importance dans la capacit dattnuation et dadaptation. Une capacit limite ragir la menace des espces envahissantes et la prolifration dorganismes nuisibles. Une capacit limite de la taxonomie fournir un soutien de base dautres volets des sciences de la biodiversit. Une capacit limite identifier les composantes de la biodiversit dans un contexte canadien. Une baisse dintrt, notamment de la part de jeunes Canadiens, lendroit de la biodiversit et des cosystmes.

Rsultats
Une capacit rduite comprendre la biodiversit, sa perte et lrosion de services cologiques connexes. Cette biodiversit est source de bienfaits pour lconomie, la sant et la culture des Canadiens. La biotechnologie et les industries primaires comme lindustrie forestire, lagriculture et la pche sont particulirement vulnrables.

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 2 Lacunes sur le plan de la taxonomie canadienne, consquences de ces lacunes et rsultats potentiels long terme

Sommaire

LE R L E d E L a Ta x o n o m iE d a nS Lav EniR dun Canada f o n d S u R L E S av o iR

La taxonomie est en pleine volution : les progrs rcents, surtout dans les disciplines de la gnomique et de linformatique, rvolutionnent la fois la cadence du travail qui se fait en taxonomie et laccs aux informations taxonomiques. De nouvelles approches prometteuses mergent, certaines se dveloppant au Canada, dont lintgration dapproches morphologiques des techniques gntiques comme les codes-barres dADN. De plus en plus de nations investissent massivement dans la taxonomie, en rponse aux possibilits que laissent entrevoir ces nouvelles pratiques. Le comit dexperts en conclut donc que non seulement le Canada est-il bien positionn pour pallier ses lacunes sur le plan de son expertise taxonomique, de ses collections et de ses donnes, mais quil pourrait aussi miser sur ses forces pour devenir un leader international dans ce domaine, condition quune vision audacieuse soit mise de lavant et soutenue par sa communaut scientifique, ses dcideurs, ses dtenteurs du savoir traditionnel, ses organisations non gouvernementales (ONG) et son secteur industriel. Depuis une dcennie, de nouveaux liens scientifiques ont t tablis et la capacit administrative a t accrue la suite dinitiatives de collaboration rgionales au Qubec, en Ontario et en Colombie-Britannique. On a aussi assist la mise sur pied de Canadensys et de fructueuses collaborations sous lgide du Conseil de recherches en sciences naturelles et en gnie (CRSNG). Ces initiatives ont mis la table, pour ainsi dire, et la communaut scientifique canadienne spcialise en biodiversit est prsent fin prte donner le coup denvoi une initiative majeure. Bien que le fait de proposer des mcanismes dtaills et des modles de financement qui pourraient venir structurer cette initiative outrepasse largement le mandat confi au comit dexperts, les Rseaux de centres dexcellence (RCE) et les sous-produits du Programme des chaires de recherche du Canada ont permis au Canada de se dmarquer, lchelle internationale, dans dautres domaines dintrt national, dont les sciences de lArctique. Une stratgie de financement similaire pourrait transformer la capacit du Canada dans le domaine des sciences de la biodiversit. Du point de vue des besoins, le fait que le Canada sinvestit beaucoup dans la rcolte de ressources naturelles signifie que la taxonomie surtout si le domaine se porte bien est dune grande pertinence stratgique au bien-tre conomique, au statut de citoyen du monde responsable et la protection de ses ressources naturelles du pays. Investir dans la taxonomie viendrait soutenir linnovation et permettrait

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au Canada de lancer un programme denvergure ax sur la dcouverte de composants et de voies biochimiques ncessaires llaboration de biocarburants, la protection de la sant humaine et au dveloppement de nouveaux processus de fabrication. Une taxonomie forte aiderait le Canada respecter ses engagements nationaux et internationaux en matire de conservation de la biodiversit tout en protgeant le pays des effets dvastateurs despces envahissantes.

Chapitre 1 Prface et mandat confi au comit dexperts

Chapitre 1

Prface et mandat confi au comit dexperts

La diversit biologique de la vie, y compris la varit de gnes, despces et dcosystmes, est essentielle au systme de maintien de la vie de la Terre, de mme qu la sant humaine et au bien-tre culturel, social et conomique de lhumanit. Les sciences de la biodiversit ont relev le dfi de dcrire et de quantifier cette diversit de la vie sur Terre et ont fait de remarquables progrs en ce qui a trait lexplication de ses origines, des facteurs qui influent sur sa distribution gographique, ainsi que ses fluctuations dune poque lautre. Les sciences de la biodiversit ont galement identifi une tendance la baisse en ce qui a trait la diversit biologique dans plusieurs endroits travers le monde, tendance qui concide avec lexpansion des activits agricoles et industrielles humaines, et qui y est causalement lie. Cette croissance remarquable de lconomie mondiale repose sur lexploitation soutenue de diverses ressources biologiques et de processus cologiques. Les projections actuelles indiquent quune croissance conomique soutenue acclrera le taux de perte de biodiversit durant les prochaines dcennies et diminuera de faon importante la capacit quont les cosystmes naturels dassurer la subsistance de la socit humaine. Comprendre et prvoir les consquences de cette rapide transformation de la biosphre pose un dfi de taille aux sciences de la biodiversit. Les donnes de rfrence fondamentales sont limites nous nen savons tout simplement pas assez sur les espces du Canada, et encore moins sur la faon dont elles interagissent entre elles au sein dcosystmes. Il faut des progrs trs rapides en thorie et en informatique pour pouvoir laborer des prvisions fiables quant au taux et la distribution du changement en biodiversit pour le prochain sicle. Lintgration de lconomie, de la sant et des sciences sociales permettra aux sciences de la biodiversit de prdire limpact des changements en biodiversit sur le bien-tre humain et de proposer des mesures correctives. Dimportantes ressources et infrastructures scientifiques sont ncessaires pour dcouvrir, consigner, cataloguer et suivre les changements en biodiversit, lchelle locale, rgionale et mondiale.
1.1 C o mP R E n dR E E T S o u m E T T RE LE m a n d aT a u C o m iT d E x P ERTS

Cest donc en mai 2009, sur cette toile de fond, que le gouvernement du Canada, par le biais de son ministre du Patrimoine canadien, a demand au Conseil des acadmies canadiennes de mettre sur pied un comit dexperts pour raliser lvaluation suivante : Quels sont ltat et les tendances de la biodiversit au Canada : sommes-nous outills pour comprendre les dfis que prsentent nos ressources en biodiversit?

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En outre, les sous-questions suivantes ont t poses : 1. Les techniques molculaires supplantent-elles rellement la taxonomie traditionnelle, ou permettent-elles de mieux concentrer les efforts? 2. Que faut-il pour complter la taxonomie traditionnelle? 3. la lumire de ce quexige le domaine de la recherche en biodiversit, que doit faire le Canada? 4. Quelles sont les lacunes entre ce que le Canada doit faire et ses capacits actuelles? Cette question a t soumise par le Muse canadien de la nature, en collaboration avec le Partenariat fdral en matire dinformation sur la biodiversit et lAlliance des muses dhistoire naturelle du Canada. Avant de constituer le comit dexperts, le Conseil des acadmies canadiennes a consult la documentation fournie et a eu des discussions pousses avec le commanditaire pour sassurer de bien comprendre la nature de la question. partir de ces discussions, il est devenu clair que lon demandait au Conseil des acadmies canadiennes (CAC) de raliser une valuation qui porterait spcifiquement sur la taxonomie. Le CAC a donc mis sur pied un comit dexperts dont les membres dtenaient une expertise en taxonomie, en sciences de la biodiversit (notamment en cologie et en biologie de lvolution), en sciences sociales, en technologies de linformation et en laboration de politiques. Les membres du comit dexperts sont issus des milieux universitaire, musal, gouvernemental, de mme que dorganisations non gouvernementales (ONG) et dorganisations internationales; ils ont sig au comit dexperts titre dindividus dtermins mettre leur expertise au service du public, et non pas titre de parties intresses. Comme pour tout comit dexperts du Conseil des acadmies canadiennes, la gamme dexpertise a permis daborder la question sous plusieurs angles. Le comit dexperts a dlibrment t compos de faon ne pas comprendre uniquement une expertise en taxonomie. Une fois convoqu, le comit dexperts a investi beaucoup de temps veiller ce quil comprenne bien le mandat qui lui tait confi. Pour ce faire, il a tenu des discussions en personne avec les reprsentants du Muse canadien de la nature et dagences et de ministres fdraux ayant un intrt quelconque lendroit des sciences de la biodiversit. Il a galement examin attentivement la documentation fournie. Les membres du comit dexperts ont compris que bien que la question demandait une valuation des sciences de la biodiversit, lintention du commanditaire tait de cibler plus troitement lanalyse sur ltat et les tendances de la taxonomie au Canada la recherche qui dcouvre, diffrencie, classifie et documente les tres vivants. Dans ce contexte, il tait clair que pour bien comprendre les dfis que prsentent nos ressources en biodiversit, il fallait se doter de lexpertise ncessaire, avoir accs aux collections de biodiversit appropries

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et pouvoir consulter facilement les donnes. Le comit dexperts navait pas formuler de recommandations explicites sur le plan de llaboration des politiques, mais il devait plutt entreprendre une valuation fonde sur les preuves de ltat de la discipline taxonomique au Canada et qui servirait de ressource permettant dclairer les dcisions stratgiques futures.
1.2 LE S aP P R oC h E S

Aprs avoir bien compris le mandat qui leur tait confi, le comit dexperts a abord lvaluation en commenant par dterminer quelles donnes devaient tre prises en compte et quelles donnes supplmentaires le comit devait assembler. En consultant la documentation, le comit dexperts a repr plusieurs rapports importants portant sur des volets spcifiques de la taxonomie canadienne, des valuations de collections canadiennes (p. ex., Gagnon et Fitzgerald, 2004), des monographies, comme La systmatique, une crise vidente (Groupe fdral de la biosystmatique, 1995), et des analyses du changement qui intervient dans le domaine des sciences taxonomiques (p. ex., Packer et al., 2009) et de la ncessit de procder une coordination rgionale de muses (par ex, Sperling et al., 2003). Le comit dexperts na pas russi trouver des tudes pousses et rcentes sur la taxonomie canadienne portant la fois sur les gouvernements, les universits et dautres secteurs, et pouvant servir de rfrence de base cette valuation. Le comit dexperts a tout particulirement tent de reprer des donnes sur deux importantes composantes de la taxonomie au Canada : dune part, les personnes qui dtiennent lexpertise, y compris les chercheurs, les conservateurs, les techniciens, les dtenteurs de savoir traditionnel et les naturalistes et, dautre part, les collections de biodiversit, y compris les spcimens qui composent ces collections, les donnes qui dcrivent ces spcimens et les institutions qui en ont la charge. Pour valuer ltat actuel de la taxonomie au Canada et pour aider cerner les tendances, le comit dexperts a conu deux enqutes en ligne. La premire mettait laccent sur lexpertise taxonomique et sollicitait des rponses de la part de personnes qui dtiennent une expertise dans ce domaine et qui sont issues de tous les secteurs (voir lappendice 1 pour les mthodes et les rsultats). Cette enqute a donn lieu 432 rponses compltes. La deuxime enqute, qui portait sur les spcimens, les collections et leur institution dappartenance, interrogeait des individus responsables des collections canadiennes (voir lappendice 2 pour les mthodes et les rsultats). Cette enqute a permis de recueillir 120 rponses compltes. Ces deux enqutes ont fourni au comit dexperts des donnes quantitatives et qualitatives primaires. De plus, le comit dexperts a visit cinq collections canadiennes fdrales, provinciales et universitaires. Ces visites ont permis au comit dexperts dtre mme de constater en personne ltat de ces

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collections. Le comit dexperts sest galement servi de donnes historiques pour faire lanalyse des tendances en matire de taxonomie; les donnes permettant de discerner les tendances en matire de financement ont t fournies par le Conseil de recherches en sciences naturelles et en gnie (CRSNG). Une analyse bibliomtrique a t effectue dans le but de rvler des tendances sur le plan des publications signes par les chercheurs en taxonomie. Le comit dexperts a galement bnfici de soumissions de divers individus et organisations en rponse lappel public dinformations affich sur le site Web du CAC. Ce processus a permis la communaut de la biodiversit daborder des questions juges pertinentes dans le cadre de cette valuation. Le comit dexperts a par ailleurs tenu des rencontres en face face avec des reprsentants internationaux du milieu de la biodiversit et des communauts possdant les connaissances traditionnelles autochtones afin dapprofondir davantage la question. Ces discussions sont venues sajouter une analyse des publications, dont des tudes internationales parues rcemment. Nommons, entre autres, le rapport amricain de 2009 sur linfrastructure des collections scientifiques fdrales (National Science and Technology Council, 2009), le rapport de la Chambre des lords britannique de 2008 sur la systmatique et la taxonomie (Chambre des lords, 2008), lenqute australienne sur la capacit taxonomique (Australian Department of the Environment, Water, Heritage and the Arts, 2003), et le rapport amricain, Teaming with Life, paru en 1998 (PCAST, 1998). Ces sources ont cependant leurs limites. La qualit des donnes gnres dans le cadre des enqutes est, par exemple, fonction de la qualit et de lexhaustivit des rponses des rpondants, de mme que de la rigueur de la distribution de lenqute. Les donnes sur le financement sont modules par les descriptions changeantes des codes de financement. Les renseignements recueillis par lentremise de lappel public dinformation sont forcment le reflet de dcisions individuelles dy rpondre, dune part, et du choix du contenu qui est soumis, dautre part. Enfin, les donnes obtenues grce aux rencontres en face face partent du processus de slection, par le comit dexperts, des individus rencontrer. Malgr ces limitations, inhrentes la cueillette des lments probants sur lesquels repose ce genre dtude, le comit dexperts estime que cette valuation est le rapport le plus exhaustif et jour qui soit sur ltat et les tendances en taxonomie au Canada. Il est important de noter que pour les besoins de cette valuation, le comit dexperts a choisi dexclure une analyse dtaille de collections de spcimens vivants. Les dfis propres aux collections danimaux vivants (p. ex., les zoos et les aquariums) sont considrablement diffrents de ceux des collections constitues

Chapitre 1 Prface et mandat confi au comit dexperts

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de spcimens conservs. Le comit dexperts sest pench sur la question des dfis propres aux microbes, mais a conclu que les constatations de ce rapport ne seraient peut-tre pas pertinentes pour les collections microbiennes, puisque les techniques de recherche et les installations des collections de microbes sont dissemblables celles des organismes multicellulaires. Les collections danimaux vivants, de mme que les collections de cultures types et les banques de semences, jouent un rle de conservation crucial, et les microbes constituent un aspect important de la biodiversit canadienne. Chacun mrite dtre tudi plus fond, au-del de ce quil aurait t possible de faire dans le cadre de cette valuation.
1.3 L a S T Ru C T u R E d u Ra P P oRT

La suite du rapport est organise comme suit : Le chapitre 2 expose le contexte gnral dans lequel sinscrit le rapport. Il brosse un tableau du concept de la biodiversit et tablit sa valeur au Canada et dans le monde. Il dcrit en quoi la taxonomie est essentielle la gestion et la conservation de la biodiversit. Le chapitre 3 propose un survol de la discipline taxonomique, ses principaux rles et activits, ainsi que les nouvelles possibilits, prometteuses, nes des avances technologiques rcentes et de la tendance en faveur dinitiatives de collaboration. Le chapitre 4 prsente une valuation exhaustive de ltat et des tendances lis lexpertise taxonomique au Canada, qui est fonde sur une enqute en ligne effectue par le comit dexperts, sur une analyse de donnes de financement, et sur les tendances bibliomtriques, entre autres lments. Le comit dexperts a tent dtablir sil y avait embouteillage du rseau dapprovisionnement de personnel hautement qualifi (PHQ) et, le cas chant, quel endroit il se situait. Il expose par ailleurs les risques lis cette carence croissante sur le plan de lexpertise. Le chapitre se conclut par un examen dautres prcieuses sources du savoir taxonomique au Canada : les dtenteurs du savoir traditionnel autochtone, les naturalistes engags dans les programmes Citoyens de la science de leur collectivit, et les taxonomistes (baccalaurat et matrise). Le chapitre 5 procde lvaluation de ltat et des tendances des collections au Canada, y compris les spcimens et les institutions qui en ont la charge. Le comit dexperts donne une vue densemble de la valeur des collections canadiennes et des dfis auxquels font face diffrents genres de collections. Une bonne partie des donnes est fonde sur les rponses obtenues la suite de lenqute sur les collections.

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Laccs aux donnes sur la biodiversit canadienne, quil sagisse de spcimens qui se trouvent dans des collections ou de donnes sur le terrain, est essentiel pour permettre la prise de dcisions claires de gestion de la biodiversit. Le chapitre 6 value la gestion de linformation de la biodiversit au Canada, nos efforts de numrisation et nos progrs en matire daccessibilit des connaissances sur la biodiversit canadienne, pour les chercheurs, les dcideurs et le public. Le chapitre 7 value, dune part, les forces de la taxonomie canadienne, et de lautre, les consquences considrables de ses lacunes et faiblesses actuelles, pour aborder la deuxime moiti de la question qui avait t soumise au comit dexperts savoir si le Canada est outill pour comprendre ses ressources dans le domaine de la biodiversit. Le comit dexperts dcrit les possibilits de collaboration accrue en taxonomie ainsi que les retombes de telles possibilits pour linnovation, les engagements internationaux et la protection des ressources naturelles.

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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Chapitre 2

La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

La diversit de la vie sur Terre est un patrimoine naturel irremplaable. Or, au Canada comme ailleurs dans le monde, la biodiversit subit une rosion plus soutenue qu aucun autre moment de lhistoire de lhumanit, ce qui a une incidence majeure sur la biosphre, lconomie et le bien-tre humain. Les sciences de la biodiversit se sont tablies comme tant un domaine transdisciplinaire, dont la taxonomie est le fondement mme.

Le concept de la diversit biologique fait rfrence la grande varit de vie, dans toutes ses manifestations des gnes aux cosystmes, des bactries aux ours polaires, et des ocans la toundra arctique. Il a captur notre imaginaire et fait lobjet dtudes scientifiques depuis des sicles. Lexpression diversit biologique (voir lencadr 2.1) est employe par les scientifiques depuis le dbut des annes 1980 (p. ex., Lovejoy, 1980), et sa contraction, biodiversit, depuis le Forum national amricain sur la BioDiversit, en 1986 (Wilson, 1988). Ltat de la biodiversit sur Terre tant de plus en plus proccupant et sa valeur tant de plus en plus reconnue, ce terme est dsormais utilis non seulement par la communaut scientifique, mais aussi par les dcideurs, les mdias et le grand public. Limportance sociale et politique de la biodiversit a t officiellement tablie en 1992 avec la mise sur pied de la Convention sur la diversit biologique (CDB) de lOrganisation des Nations Unies (ONU), dont le Canada est signataire, dans le cadre de la Confrence des Nations Unies sur lenvironnement et le dveloppement, qui sest tenue Rio de Janeiro. Ce domaine de recherche dsormais tabli, les sciences de la biodiversit, ont beaucoup rehauss notre comprhension de la vie sur Terre, et continueront de le faire. La taxonomie, qui est au cur de ce rapport et qui est dcrite plus en dtail au chapitre 3, est la cl de la comprhension de la biodiversit, puisquelle nomme, identifie, dcrit et repre les espces, tout en jetant un clairage supplmentaire sur les autres sciences de la biodiversit.

Encadr 2 .1 Dfinir la biodiversit


La Convention sur la diversit biologique dfinit la biodiversit comme tant la variabilit des tres vivants de toutes origines , acception qui comprend la diversit au sein des espces et entre espces, de mme que la variabilit dautres niveaux dorganisation, par exemple entre cosystmes et paysages. Cette variabilit biologique fait appel trois notions distinctes : la richesse, la rgularit et lhtrognit.

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La richesse fait rfrence la multiplicit dlments au sein dune composante de biodiversit donne par exemple, le nombre de gnes au sein dune espce ou le nombre despces au sein dun cosystme. Lexemple ci-dessous montre que lchantillon A est plus diversifi parce quil contient plus despces que lchantillon B : il est donc plus riche.
La rgularit est lquitabilit des lments au sein de composantes de biodiversit. La rgularit est un aspect de la biodiversit que lon peut observer ou chantillonner. Dans lexemple qui suit, il y a de fortes chances que deux individus choisis au hasard partir de lchantillon B soient de diffrentes espces que deux individus choisis au hasard parmi ceux de lchantillon A. Si les deux chantillons sont reprsentatifs de leur cosystme respectif, cest que dans lchantillon B, lcosystme affiche une plus grande rgularit dabondance despces que celui de lchantillon A, qui est manifestement compos dune seule espce abondance leve.

Lhtrognit concerne les diffrences entre les lments dun ensemble. Dans lexemple qui suit, lchantillon B comprend plusieurs espces de hiboux, alors que lchantillon A est compos de cardinaux, de hiboux et doies. Par consquent, lchantillon A affiche une plus grande htrognit.
Il existe plusieurs formules mathmatiques, dont lindice de Shannon et lindice de Simpson, qui permettent de calculer les valeurs relatives de la biodiversit dun lieu gographique donn et entre ceux-ci (p. ex., Magurran, 2004). Nanmoins, la biodiversit ne peut, lheure actuelle, tre mesure selon ces notions ou indices moins que les chercheurs narrivent identifier et affecter de manire fiable les lments une composante. Pour y arriver, il faut la taxonomie.

chantillon A

chantillon B

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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2.1

un E R iC h E S S E i m m E nS E : L a va LEuR dE L a b i o d i vE R S i T Ca n a di Enn E

La richesse de la biodiversit du pays est ancre dans limmensit des paysages du Canada. titre de nation occupant la deuxime plus importante superficie au monde, constitue dcosystmes vastes et diversifis, le Canada reprsente prs de 7 % de la surface terrestre, 10 % de la couverture forestire totale, 25 % des milieux humides et 7 % des sources dapprovisionnement renouvelable deau douce de la Terre (CDB, 2006). LArctique canadien reprsente environ 20 % de la rgion circumarctique de la Terre. Chacun de ces paysages loge plusieurs assemblages uniques despces et de communauts cologiques. leur tour, ceux-ci sous-tendent une valeur conomique et culturelle significative (nous le verrons plus loin dans cette section), et sont source de plaisir, fiert, identit culturelle et inspiration motionnelle, artistique et spirituelle pour les Canadiens. La biodiversit est essentielle au bien-tre des humains. La qualit de lair, de leau et des aliments dpend de cycles renouvelables et de stocks caractristiques dcosystmes sains qui sont mus par la biodiversit. Les forts sont importantes pour la qualit de lair ainsi que la prvisibilit et la viabilit des cycles de leau, tout comme le sont les organismes prsents dans le sol, des bactries aux vers, pour la qualit du sol, qui, son tour, est importante pour la production de la chane alimentaire humaine. Les plantes, y compris celles que nous mangeons, dpendent de la qualit du sol; les animaux y compris que ceux que nous consommons dpendent, au final, des plantes. De plus, les changements de biodiversit dans les cosystmes les populations de plantes et danimaux aux interactions complexes peuvent souvent influer sur lincidence et la propagation des maladies humaines. Lencadr 2.2 explique en quoi une meilleure comprhension de la diversit locale pourrait contribuer attnuer le risque de contraction par les humains de la maladie de Lyme. La biodiversit offre une profusion dorganismes desquels glaner de nouvelles connaissances biomdicales. Lminent biologiste E.O. Wilson (2002) a attir lattention sur cette possibilit lorsquil a lanc cet avertissement : [Traduction] Ce nest pas une exagration que daffirmer que la recherche de plantes mdicinales est une course entre la science et lextinction, et atteindra un point critique mesure que les forts tombent et que les rcifs coralliens blanchissent et se dsagrgent.
La valeur conomique

Notre conomie mondiale sous-value massivement le rle de soutien la vie que joue la biodiversit. En guise dexemple, une tude innovatrice, mais controverse de Costanza et al. (1997) a valu des billions de dollars la valeur des services cosystmiques mondiaux. Bien quune grande incertitude plane sur ces montants, plusieurs tudes plus rcentes concluent quil y aurait des arguments

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conomiques convaincants en faveur de la conservation et de lutilisation durable de la biodiversit (p. ex., Balmford et al., 2002; Rudd, 2009). Selon le quatrime rapport national du Canada la Convention sur la diversit biologique (CDB, 2006), une part apprciable du produit national brut (PNB) du Canada repose sur lutilisation des ressources naturelles qui sont dpendantes de la biodiversit canadienne, dont 2,7 % des forts, 8 % de lagriculture et de lagroalimentaire, et 1,5 % du secteur ocanique. La biodiversit au Canada est essentielle tant au style de vie traditionnel des communauts autochtones, qui dpendent des ressources biologiques pour assurer leur subsistance, quaux nouvelles possibilits conomiques et dinnovation, comme la gnomique, la biotechnologie et la pharmaceutique (que lon abordera plus en dtail au chapitre 7).

Encadr 2 .2 La biodiversit et la maladie de Lyme


La maladie de Lyme, ou borrliose, est la plus importante maladie transmission vectorielle dAmrique du Nord. Elle illustre la ncessit de comprendre comment les diffrentes composantes de la biodiversit interagissent et affectent le bien-tre humain (Ostfeld, 2010). Cette maladie est relativement facile traiter si elle est diagnostique tt, mais peut tre fort dbilitante si elle nest pas traite rapidement. Consquence du changement climatique mondial, la bactrie (Borrelia) lorigine de cette maladie se rpand vers le nord, dans plusieurs rgions du Canada (Ogden et al., 2010). Les principaux vecteurs de la maladie de Lyme sont les tiques du genre Ixodes, et leurs htes habituels, une varit de mammifres et doiseaux. Les tiques, qui sont vitales la transmission de la maladie, sont particulirement difficiles identifier correctement avant quils natteignent la maturit. En Amrique du Nord, la composition des htes indignes des tiques varie normment dune rgion lautre, ce qui peut grandement influer sur la probabilit que la maladie soit transmise aux humains. Cela vient du fait que lon a pu dmontrer que la prsence dune gamme de petits mammifres htes offrait une espce de service cosystmique en diluant lefficacit de la transmission des borrlies (LoGiudice et al., 2003, 2008). titre dexemple, lorsque les souris pattes blanches (Peromyscus leucopus (Rafinesque)) sont le principal rservoir naturel de la bactrie, le risque de contracter la maladie de Lyme dans une rgion donne augmente. Bien comprendre les fondements taxonomiques de cette grande diversit de souches et despces qui sont la cause de la maladie de Lyme et qui viennent la compliquer nest pas encore chose faite, et llaboration dun diagnostic fiable de la maladie est entrave par la variation immunologique occasionne par cette diversit gntique (Sperling et Sperling, 2009).

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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Outre cette valeur directe, les services que rendent divers systmes naturels fonctionnels dans le nettoyage de lair et de leau sont normes, bien que nous en soyons venus les tenir pour acquis. La qualit et la quantit deau douce ont une valeur conomique relativement facile calculer, tant pour lagriculture, laquaculture, la sant humaine et la production dnergie. Le prix de ces produits et activits est tabli en analyse, mais leau dont ils dpendent est soit non comptabilise, soit sous-value; par voie de consquence, la valeur de leau est sous-estime. La qualit et la quantit de leau dpendent des interactions entre espces qui se droulent dans des cosystmes complexes, o lon trouve des forts, des milieux humides et des prairies. Ceux-ci dpendent pour leur part de bactries, de myctes et de la vie animale pour assurer la dcomposition, la pollinisation et le recyclage des nutriments. Comme la dmontr Dasgupta (2001, 2010), le fait de fixer un prix et donc daccorder une valeur conomique la biodiversit nest pas chose courante; il est pourtant essentiel den reconnatre la valeur conomique pour assurer le maintien des cosystmes. cette fin, Dasgupta avance un argument probant, selon lequel lattribution de prix au capital naturel vient uniquement avec la cration de marchs et de droits privs de proprit dans ce domaine. Linstitut de la Banque mondiale illustre ces problmatiques en tablissant clairement le lien causal suivant :

[Traduction] Lexemple classique dune externalit de production est celui dune usine qui dcharge des effluents, des sous-produits de production, dans une rivire, rduisant ainsi la qualit de leau qui est utilise par un producteur situ en aval (un pcheur, par exemple). Cet effet ngatif nest pas pris en compte lorsque les propritaires dune usine dterminent les quantits produire et, par ricochet, la quantit de pollution produite. Aussi est-il probable que lusine pollue trop. Par trop , nous voulons dire que la valeur totale de la production de lusine et de celle du pcheur pourrait tre augmentes si lusine produisait moins, ce qui permettrait au pcheur de produire plus, relativement parlant (Jack, 1999).
La valeur de la biodiversit na pas prsance sur lensemble des autres problmatiques qui sont en lien avec cette question, mais doit tre prise en compte dans lanalyse conomique. En 2007, les dirigeants du G8+5 ont ralis une tude de grande envergure sur lconomie des cosystmes et de la biodiversit (TEEB, pour The Economics of Ecosystems and Biodiversity). Les rapports qui en dcoulent avaient pour objectif de contribuer mieux intgrer les connaissances cologiques et conomiques au processus dlaboration des politiques qui touchent la biodiversit et les services cosystmiques, en recommandant des mthodologies dvaluation adaptes diffrents contextes et en examinant le cot conomique du dclin de la biodiversit, et les cots et avantages des actions visant rduire ces pertes (TEEB, 2009) (voir lencadr 2.3).

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 2 .3 Quelques constatations tires du rapport Lconomie des cosystmes et de la biodiversit (2009) [Traduction] :
La perte de la biodiversit et des cosystmes menace le fonctionnement de notre plante, de notre conomie et de la socit humaine. Les ressources naturelles, comme les cosystmes qui les produisent, sous-tendent notre activit conomique, notre qualit de vie et notre cohsion sociale. La faon dont nous organisons nos conomies ne permet pas suffisamment de reconnatre le lien de dpendance de cette relation il ny a pas dconomies sans environnements, mais il existe des environnements sans conomies. tablir une chelle fiable de prix est la rgle dor de toute conomie robuste. Puisque la plupart des avantages lis la biodiversit et aux cosystmes sont en fait des biens publics sans prix, on peut en tablir le prix de deux faons : en instituant des politiques appropries qui rcompensent le mouvement de ces biens publics et qui pnalisent leur destruction, et en encourageant les marchs appropris (principalement des marchs de conformit ), qui attribuent des valeurs prives changeables lapprovisionnement et lutilisation de ces biens et crent des structures incitatives pour payer celles-ci. De nouveaux marchs, qui soutiennent et rcompensent les services de biodiversit et cosystmiques, mergent; certains dentre eux ont le potentiel de procder une mise niveau. Pour y parvenir, toutefois, ces marchs doivent se doter dinfrastructures, de mesures incitatives, de financement et de gouvernance institutionnels en gros, ils doivent bnficier dinvestissements. (TEEB, 2009)

La biodiversit est trs importante pour lconomie du Canada. Une tude parue en 2005, intitule Counting Canadas Natural Capital (Anielski et Wilson, 2005), a valu les services environnementaux de nos cosystmes boraux qui reprsentent 58,5 % de la superficie du pays et a tabli la valeur de ces services 93 milliards de dollars par anne, soit environ 9 % du PNB. Ltude porte croire que les avantages cologiques et socioconomiques des services cosystmiques boraux actuels pourraient tre beaucoup plus importants que les valeurs marchandes combines de son dveloppement industriel actuel

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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foresterie, ptrole et gaz naturel, mines et nergie hydrolectrique. Eu gard aux proccupations grandissantes au sujet du changement climatique, lattention qui est actuellement accorde la faune, aux espces en voie de disparition et aux aires protges semble galement tre porte sur des proccupations globales lies aux systmes, telles que le climat, leau, et la propagation mondiale dorganismes nuisibles et de maladies. Cest pourquoi la comprhension de la biodiversit, comprise dans un contexte de biens et services cosystmiques, est essentielle la scurit cologique et conomique du Canada. Il est possible de faire la dmonstration de la valeur conomique de la biodiversit au Canada au moyen dexemples. Leffondrement de lindustrie morutire de Terre-Neuve-et-Labrador a occasionn la perte de 35 000 emplois, de mme quune rduction de 200 millions de dollars par anne de prises de morue (MacGarvin, 2001), pour ne pas parler de limpact cologique plus long terme. Dans le mme ordre dides, les espces envahissantes (voir lencadr 5.2) sont la source, au Canada, de dommages conomiques qui atteignent les milliards de dollars annuellement (p. ex., dans le secteur agricole, Colautti et al., (2006) estiment que les pertes slveraient 4,5 milliards de dollars par anne). Ces mmes espces envahissantes modifient silencieusement le paysage biologique du Canada et pourraient avoir des rpercussions long terme que nous naurions pas encore entrevues. La biodiversit est galement une source apprciable dinnovation, par exemple, de dcouvertes pharmaceutiques et de procds biologiques. Limportance conomique de la biodiversit en regard de linnovation est sous-estime, mais dune importance critique lheure actuelle; aussi fait-elle lobjet dun examen plus approfondi au chapitre 7.
La valeur culturelle

La biodiversit est importante pour la diversit culturelle, puisque les cultures humaines du monde entier ont de tout temps t et continueront dtre inspires et mme dfinies par leurs interactions avec le monde naturel. De nombreuses valeurs spirituelles, croyances et pratiques culturelles dont des chansons, histoires et lgendes qui codifient et qui portent en elles les relations quentretient lhumanit avec lenvironnement comptent sur la biodiversit pour assurer leur prennit. De grands ensembles de diversit biologique sont grs par des groupes culturels (Posey, 1999). Des valeurs esthtiques sont aussi ancres dans la biodiversit : des paysages naturels intacts sont un plaisir admirer et offrent des activits rcratives comme lornithologie, la photographie et lcotourisme, qui gnrent des revenus supplmentaires pour les jardins botaniques, les parcs nationaux et les aires de conservation de la faune, par exemple.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

La diversit biologique et la diversit culturelle sont interdpendantes. Les cultures des peuples autochtones et les socits de traditions locales sont particulirement touches par la perte de la biodiversit. Lorsquun environnement naturel est chang ou perdu, le savoir culturel et les pratiques traditionnelles vitales au maintien des moyens de subsistance autochtones en milieu agricole, pastoral, ctier et marin sont galement perdus. Au Canada, un exemple parmi dautres de la diminution, au fil des ans, de lutilisation et du savoir traditionnel concernant la biodiversit, est celui des plantes comestibles valeur culturelle, dont les algues marines, les porphyres (Porphyra abbottiae V. Krishnamurthy), et le pommetier du Pacifique (Malus fusca (Raf.) C.K. Schneid). Ces deux plantes taient autrefois cultives et consommes en grande quantit par les Premires nations de la cte ouest (Turner et Turner, 2008). De plus, un savoir et des valeurs cologiques et culturels taient associs la rcolte, la transformation et la manire dapprter ces aliments (Kuhnlein et Turner, 1991). Les deux peuvent tre considrs comme ayant t, nagure, des espces cls, au plan culturel , sur une partie ou sur lensemble de leur tendue (Garibaldi et Turner, 2004). Aujourdhui, ces espces rpondent toutes deux la dsignation risque, au plan culturel . Les langues sont considres comme tant un des indicateurs cls du lien entre le dclin de la diversit culturelle et la baisse de la diversit biologique (UNESCO, 2002). Des 6 900 langues parles dans le monde, 22 % comptent moins de 1 000 locuteurs (Butchart et al., 2010). Les personnes qui ne parlent pas leur langue maternelle ne peuvent accder au savoir culturel traditionnel (voir la section 3.4) et sont donc exclues de linformation vitale concernant leur subsistance, leur sant et lutilisation durable de leurs ressources naturelles. La perte de la diversit culturelle, qui est marque par la disparition des langues, prive lhumanit au complet dun savoir unique sur lenvironnement et sur ses nombreux bienfaits (Maffi et Woodley, 2010). Au Canada, seules 3 des 50 langues autochtones sont suffisamment parles pour tre considres comme tant vritablement labri de la disparition, long terme (Statistique Canada, 1998). Selon les donnes du recensement de 2001, des 976 000 rpondants qui se sont identifis comme tant Autochtones, seul le quart (235 000, ou 24 %) a rapport tre capable de converser dans une langue autochtone (Statistique Canada, 2006a). Il sagit dune diminution par rapport au 29 % qui avait t enregistr en 1996, et semble confirmer les propos des chercheurs, qui estiment quil y a eu une importante rosion de lutilisation des langues autochtones au cours des dernires dcennies. La diversit bioculturelle au Canada est encore compromise par le changement climatique. Les socits autochtones qui habitent le Nord canadien sont parmi les premires devoir composer avec les consquences directes du changement

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climatique sur la biodiversit en raison de leur dpendance et de leur relation troite avec les ressources de biodiversit arctique sensibles au changement climatique, dont ils tirent leur subsistance (p. ex., la rcolte du poisson et des animaux, et la cueillette des baies) (ACIA, 2005; Furgal et Prowse, 2008). Jusqu 50 % des aliments qui sont consomms par les communauts inuites de lArctique proviennent danimaux ayant t chasss. Le changement climatique affecte le flux migratoire des animaux, ce qui, de pair avec les conditions changeantes de la neige et de la glace, peut avoir des consquences ngatives sur les pratiques de chasse (Berkes et Jolly, 2002; Krupnik et Ray, 2007). Les changements de vgtation provoqus par le changement climatique auront probablement un effet majeur sur les collectivits vulnrables du Nord. Par exemple, les collectivits inuites ont de tout temps utilis une plante mdicinale traditionnelle, Rhodiola rosea L., pour traiter la fatigue, la dpression et les infections, pour renforcer le systme immunitaire et pour protger le cur (Sauv, 2006). Pourtant, les populations sauvages canadiennes de la R. rosea pourraient tre fort touches par le changement climatique, qui aura aussi pour consquence llvation du niveau de la mer et une concurrence accrue chez les espces envahissantes (Cavaliere, 2009). Plusieurs des problmes associs la perte de la diversit biologique et lappauvrissement de la diversit culturelle ont t traits sparment par le pass. Le fait de reconnatre leurs interrelations et leur lien avec le dveloppement durable mnera une approche plus holistique et complte lendroit des mesures quil faut mettre en place, et ce, tous les niveaux.
2.2 L R oS i o n g n R aL i S E d E La biodiv ERS i T

La communaut scientifique sentend dsormais pour dire que la diversit biologique subit une rosion gnralise un rythme ingal dans lhistoire de lhumanit. On prvoit que ce taux atteindra son point culminant au cours des 50 prochaines annes et qu ce moment, il sera comparable aux grands vnements passs dextinction de la vie sur Terre, dont tmoignent les fossiles. Le rcente publication de Perspectives mondiales de la diversit biologique 3 (CDB, 2010) rapporte, en loccurrence, que les cosystmes travers le monde ont subi une perte de biodiversit et que labondance moyenne parmi les espces rares est en dclin dpassant le seuil du 30 % entre 1963 et 2006. Le rapport identifie par ailleurs cinq lments cls du changement environnemental qui mettent risque la biodiversit : perte dhabitat, exploitation, pollution, espces envahissantes et changement climatique. Les synergies entre ces lments, que lon prvoit fortes, provoqueront sans doute une augmentation du taux de perte de biodiversit qui pourrait ne pas atteindre son point culminant avant le milieu du sicle (Pimm et Raven, 2000). On estime que les taux de

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disparition despces se situeront entre 100 et 1000 fois le taux de rfrence (Lawton et May, 1995). On sattend ce que le taux de disparition de populations locales (p. ex., lalasmidonte naine ne se retrouve pas au Nouveau-Brunswick depuis 1968, le crapaud de Fowler est disparu de lle Pele dans les annes 1970, et la dernire observation de la mlisse bleue en Ontario remonte 1991) soit 100 fois plus lev (Hughes et al., 1997). Dimportantes pertes de diversit microbienne, bien quexigeant des dfinitions et des mthodes dvaluation diffrentes (voir lencadr 3.1), seraient galement prvoir. Cette perte de la diversit biologique dcoule de lactivit humaine, quil sagisse durbanisation, dagriculture (p. ex., la conversion de prairies en terres cultives ou en pturages), de pche ou dactivits industrielles (p. ex., le dveloppement des secteurs ptrolier et gazier, lexploration et le dveloppement miniers, et lindustrie forestire) qui ont transform et fragment les environnements terrestres et aquatiques (voir la figure 2.1). Lvaluation des cosystmes pour le millnaire, parue en 2005, estimait quenviron 60 % des services cosystmiques qui soutiennent la vie sur Terre sont dgrads ou exploits de faon non durable (valuation des cosystmes pour le millnaire, 2005). De plus, en 2008, la Liste rouge de lUnion internationale pour la conservation de la nature rvlait que 36 % des plus de 47 000 espces values taient menaces de disparition une augmentation par rapport au 22 % cit en 1998 (UICN, 2008). (La situation dune espce quant sa conservation est un indicateur important en matire de tendances de biodiversit.) Conformment aux tudes internationales, la biodiversit est galement risque au Canada. La figure 2.2 montre que le nombre despces identifies par le Comit sur la situation des espces en pril au Canada (COSEPAC) comme tant disparues ou risque, au Canada, est la hausse pour tous les animaux et toutes les plantes ltude. De plus, le statut de plusieurs de ces espces est en dclin. Chaque espce risque est rvalue au moins tous les dix ans; des 269 nouvelles valuations de la dsignation de statut, 46 espces qui avaient au pralable t considres comme tant risque ont t reclasses dans une catgorie de risque plus leve, alors que seules 27 espces avaient connu une amlioration de leur statut (Mooers et al., sous presse). La liste est loin dtre exhaustive, car plusieurs espces doivent encore tre values, notamment parmi les poissons, les invertbrs et les plantes. Bien que les tendances qui mergent dans la figure 2.2 soient grandement influences par la frquence des valuations des espces queffectue le COSEPAC, de mme que par le taux et les rsultats des nouvelles valuations, les donnes pour les groupes bien connus sont probantes. Par exemple, en 2009, 18 des 44 espces damphibiens (41 %), et 31 des 44 espces de reptiles (70 %) avaient reu la dsignation en pril dans une portion significative de leur tendue canadienne (COSEPAC, 2009).

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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Perte dhabitat

Exploitation

Pollution

Espces envahissantes

Changement climatique

Imprvisibilit environnementale

Changement de la biodiversit

Changement de la population

Changement cosystmique

Catastrophes

Changement conomique

Marchs

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 2.1 Linteraction entre les principaux lments participant aux changements de la biodiversit
Cette figure montre que tout changement de la biodiversit est li aux changements cosystmique, conomique et de la population, et est influenc par une gamme de facteurs, dont la perte dhabitat et les espces envahissantes. Les effets peuvent alimenter ce cycle, ce qui acclre et exacerbe encore ce changement.

Un certain nombre dinitiatives rcentes ont contribu identifier et examiner les menaces lendroit des lments cls de la biodiversit, travers les paysages canadiens. Par exemple, Venter et al. (2006) ont systmatiquement identifi les menaces qui psent sur les espces en voie de disparition au Canada, partir de rapports et dinformations que rendent disponibles le COSEPAC et le Service canadien de la faune. Ils ont dmontr que les menaces qui psent sur les espces au Canada correspondent gnralement aux problmatiques lies la biodiversit en gnral, y compris les menaces que reprsentent la perte croissante dhabitat, les espces envahissantes non indignes, lexploitation et la pollution. Les synergies entre ces menaces sont en soi une menace mergente, bien quencore peu comprises,

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

600 500

Nombre despces

400 300 200 100 0

1980

1985

1990

1995

2000

2005

Anne I I
Plantes Invertbrs

I I

Poissons Amphibiens et reptiles

I I

Oiseaux Mammifres

(Source des donnes : Rapports annuels du COSEPAC, 19772010, donnes compiles par David M. Green, 2010)

Figure 2.2 Nombre despces au Canada qui, selon le COSEPAC, seraient disparues ou en pril au Canada
Cette figure montre laugmentation du nombre despces, tous taxons confondus, qui ont t signales comme tant disparues ou en pril au Canada (disparues du pays, en voie de disparition, menaces ou proccupantes).

qui pse sur la biodiversit (Sala et al., 2000). Les pertes continues de biodiversit compromettront la capacit du Canada de ragir au changement climatique, et den attnuer les effets. lheure actuelle, il ny a pas de consensus concernant le rythme de perte de biodiversit que peuvent absorber la biosphre et la socit humaine, mais les donnes semblent indiquer que le seuil plantaire critique qui dfinit le taux scuritaire et tolrable de perte de biodiversit a peut-tre dj t franchi (Rockstrm et al., 2009). Des taux levs de diminution et de disparition de populations despces peuvent provoquer une rosion de la diversit gntique sous-jacente ncessaire pour sadapter au changement perptuel de lenvironnement et la destruction de lhabitat. La taille critique des populations a t identifie comme tant le seuil au-del duquel il devient trs difficile pour une population donne de se remettre de changements environnementaux (Bell et Gonzalez, 2009). Avec un nombre suffisamment grand dindividus, les populations peuvent souvent sadapter aux stress environnementaux. Dans le cas de bactries pathognes, la rsistance aux

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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antibiotiques est un bon exemple dadaptation microbienne, et les animaux comme les plantes peuvent sadapter rapidement aux stress anthropogniques, comme les pesticides ou la pollution aux mtaux lourds. Il nen demeure pas moins que les populations faillent souvent sadapter aux grands changements environnementaux, surtout lorsque ceux-ci surviennent simultanment. Les populations de poissons qui se trouvent dans les lacs ayant subi une acidification rapide en raison de la pollution de fonderies ont tendance disparatre de ces lacs, et mme les populations microbiennes peuvent en tre fort touches (Kwiatkowski et Roff, 1976). La tolrance plus grande des populations de plantes qui poussent sur les rsidus de mtaux lourds provenant de mines dsaffectes est un exemple classique de slection naturelle rapide. Toutefois, seule une minorit despces de la communaut dorigine dveloppe des niveaux de tolrance levs, une ralit qui mne la perte de la biodiversit (Bradshaw et McNeilly, 1991). La menace que reprsente le changement de biodiversit rpandu et rapide travers la plupart des rgions a suscit deux dcennies de recherche sur limpact de ce changement sur les fonctions et les services cosystmiques (Naeem et al., 2009). Des essais contrls et la thorie cologique ont permis dtablir que des niveaux rduits despces et de diversit gntique peuvent avoir une incidence sur les processus cosystmiques, dont la production de biomasse, lapport nutritionnel (Crutsinger et al., 2006; Cardinale et al., 2007), la dissmination des graines, la pollinisation des plantes et la rgulation du climat rgional. Diaz et al., (2006) ont rsum les principales constatations scientifiques de la recherche qui a permis dtablir un lien entre le changement de biodiversit et les processus et services cosystmiques. Ils identifient ainsi la production de biomasse, la fertilit des sols, la pollinisation, la rsistance aux organismes envahisseurs, le contrle des organismes nuisibles et des maladies, la rgulation du climat, la squestration du carbone et la protection contre des dangers naturels, comme les crues et les temptes.
2.3 LE R L E E S S E nT iE L dE L a Taxonomi E

Ce chapitre a dcrit en quoi la biodiversit est fondamentale au fonctionnement de la biosphre, la stabilit et la productivit de lconomie, la viabilit de plusieurs cultures et au bien-tre humain. Dceler la perte despces, voire lintroduction et le flux despces indignes et non indignes, est essentiel la gestion de ces systmes, dont dpendent les modes de subsistance de bon nombre de Canadiens. Ltude des nuages qui traversent le ciel nous permet de nous prmunir contre les intempries venir; il en va de mme pour la surveillance des composantes de la biodiversit : elle est indispensable notre comprhension de la nature, qui volue et sadapte sans cesse. Sans ce savoir, nous ne nous habilitons

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

pas nous adapter, grer limpact sur la biodiversit, ni nous parer contre les temptes qui peuvent poindre lhorizon. Comprendre ce changement et en explorer les consquences pose un dfi scientifique la fois clair et urgent. Les problmes environnementaux actuels ne sauraient tre rsolus au moyen dapproches disciplinaires traditionnelles en sciences de lenvironnement. Puisque le changement de biodiversit mane de linfluence grandissante des humains sur leur environnement, il faut la fois des recherches en sciences naturelles et en sciences sociales. Les sciences de la biodiversit ont donc merg comme un domaine transdisciplinaire qui a recours des outils et des thories issues de plusieurs disciplines, dont la biologie molculaire, la taxonomie, la systmatique, lcophysiologie, lvolution, lcologie, lconomie, les sciences politiques et les arts. Les sciences de la biodiversit lient ces domaines varis en un seul cadre conceptuel cohrent, qui est adapt aux dfis mthodologiques, conceptuels et politiques propres au changement de la biodiversit au XXIe sicle. Or, la solidit des sciences de la biodiversit est tributaire de chacune des disciplines qui les composent. La taxonomie est fondamentale; les progrs des sciences de la biodiversit reposent sur la dcouverte et lidentification exacte des espces qui composent les cosystmes. La figure 2.3 illustre les liens entre la taxonomie et les autres disciplines : En ce qui a trait lcologie, la taxonomie dcouvre les composantes des espces que comprennent les cosystmes et aide les cologistes dans leurs travaux didentification de ces espces, exercice vital la surveillance du changement dun environnement. Parmi les rles conomiques de la taxonomie, rappelons que cette discipline aide suivre des espces nuisibles en fournissant les moyens didentifier celles-ci et de dcouvrir les espces ayant une utilit quelconque. La taxonomie rpertorie et dcrit les espces, qui sont autant de produits de lvolution et qui sont source des donnes de base de la biologie de lvolution. En recensant les espces dans diffrentes aires gographiques, la taxonomie appuie la biologie de la conservation dans son travail de slection et dvaluation des rserves fauniques. Lvaluation des stratgies de gestion qui font appel la surveillance despces cibles exige une identification taxonomique exacte. La taxonomie donne lieu des dcisions plus claires en conomie, en gestion et en conservation et, de ce fait, une gouvernance plus claire de nos ressources en biodiversit, tant lchelle locale qu lchelle mondiale.

Chapitre 2 La biodiversit, son importance et le rle de la taxonomie

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cologie
Changements de la biodiversit Identification et suivis de changements
ion cat des ri ibil its

conomie
Services et valuations

es squ

et d

es

s pos

Ide

ntif

Taxonomie
Dcouvrir la biodiversit Identification des cibles et valuation des rsultats
Inv et d enta v ire p alu erm er l et es tan rs t d erv e s es le c

Gestion
Ressources, biocontrles

Gouvernance de la biodiversit
chelles locale, nationale, mondiale

Observation des rsultats de lvolution

tion

ner

Biologie de lvolution
Origines de la biodiversit

Biologie de la conservation
Rserves, restauration

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 2.3 Les composantes des sciences de la biodiversit et leurs interrelations

Points saillants du chapitre


La diversit de la vie sur Terre est un patrimoine naturel irremplaable qui joue un rle vital dans le fonctionnement de la biosphre et le bien-tre, la culture, lconomie et le potentiel dinnovation de lhumanit. Au Canada, comme partout au monde, la biodiversit subit une rosion plus soutenue qu tout autre moment de lhistoire de lhumanit. Les cinq principales causes de ce recul de la biodiversit, au Canada et dans le reste du monde, sont la perte dhabitats, lexploitation, la pollution, le changement climatique et les espces envahissantes. Afin de rpondre au besoin urgent de comprendre le changement de la biodiversit et les consquences de ce changement, les sciences intgres de la biodiversit se sont imposes et, pour ce faire, elles ont recours aux outils et thories de diffrents domaines dtude.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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Chapitre 3

La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

La taxonomie la science qui dcouvre, diffrencie, classifie et documente les organismes est le fondement mme des sciences de la biodiversit. Les approches conventionnelles la dcouverte, la caractrisation et larchivage des espces sont de plus en plus soutenues par des avances technologiques rcentes, ce qui acclre lexploration de la vie sur Terre.

Un des projets scientifiques les plus ambitieux et les plus importants qui soient nest pas n lre de lexploration de lespace, de lavnement de linformatique ou de la gnomique. Au contraire, il a dbut il y a des millnaires, lorsque les cultures indignes du monde entier se sont mises observer et caractriser lincroyable diversit de la vie sur Terre. Depuis le milieu du XVIIIe sicle, un rseau compos de milliers de biologistes a contribu au savoir partag dans ce domaine, connu comme le systme linnen de classification, en levant le voile sur des espces qui ont non seulement t tudies titre dorganismes modles dont on reconnat le rle cologique cl, mais aussi qui nous ont donn des mdicaments et des matriaux biomimtiques fort utiles. Ce projet nest pas complt. Daprs les estimations actuelles, la majorit des espces sur Terre restent encore dcouvrir et la moiti de celles qui sont dj connues sont tellement peu caractrises que peu de biologistes sont en mesure de les identifier. Environ 1,6 million despces sont prsentement connues du milieu scientifique (May, 2010) et les travaux sur le terrain permettent de continuer de dcouvrir de nouvelles espces. Les estimations prudentes semblent indiquer quentre 5 et 10 millions despces existeraient dans la nature (May, 2010), bien que de nouveaux chantillonnages des plus petits organismes, comme les invertbrs, les myctes et les microbes qui sont la base de plusieurs des processus cosystmiques fondamentaux pourraient faire en sorte que ces estims soient revus la hausse (voir lencadr 3.1 sur la diversit des microbes). Intensifier les travaux tels quils ont t mens ce jour ne permettra pas de sacquitter efficacement de la tche : il y a simplement trop faire. mesure que le XXIe sicle avance, les mthodes conventionnelles et les nouvelles technologies soutenues par de vastes collaborations internationales crent de nouvelles occasions de progrs rapides en taxonomie. Il sagit de la premire gnration disposant de

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

la technologie ncessaire pour reprer et documenter toutes les espces sur Terre, mais peut-tre aussi la dernire qui aura loccasion de le faire (voir Wheeler, 2003). Tel que prcis au chapitre 2 (section 2.3), les rsultats de la recherche taxonomique la science de la dcouverte, de la description et de la diffrenciation des espces sont les fondements dautres disciplines qui dpendent sur de portraits exacts des espces sur Terre. La dcouverte de chaque nouvelle espce permet de brosser un portrait de plus en plus complet des espces qui participent nos cosystmes, et sont autant de nouvelles occasions dexplorer et dexploiter les innovations volutionnaires. Les espces sont des communauts de mme ascendance gntique; aussi, le fait de distinguer les espces les unes des autres est-il simplement une composante de lactivit plus vaste denqute des connexions historico-gntiques de tous les tres vivants qui se trouvent sur larbre phylogntique de la vie. Il existe des liens troits entre la discipline qui se proccupe du portrait global du grand arbre de la vie (la biologie phylogntique ou la systmatique), et celle qui examine de plus prs les lignes pour en diffrencier les espces. Il y a des biologistes qui ne font pas la distinction entre les efforts visant rsoudre les liens gntiques plus grande ou plus petite chelle. Il nempche que certains biologistes se consacrent exclusivement une seule de ces disciplines, et quil y aurait diffrents types dutilisateurs de leurs rsultats les cologistes, dune part, qui peroivent les espces comme tant des units cologiques, et les biologistes de lvolution, dautre part, qui sintressent autant la phylognie quaux espces. Les objectifs de la taxonomie consistent dcouvrir des espces, en dcrire les caractristiques qui les distinguent de sorte quon puisse les identifier, et fournir des donnes de rfrence sur les espces, que ce soit sur les plans de la morphologie, de la distribution gographique ou de lhistoire naturelle. Ce chapitre dcrit ce quest la taxonomie, pourquoi il sagit dune discipline importante et comment la science la transforme.
3.1 L i mP oRTa n C E d E d C o u vRi R E T d E d i f f R En C iE R L E S E S P C E S

Dans quelle mesure la tche qui incombe la taxonomie, soit la dcouverte et la documentation des espces, est-elle importante? Toute science doit procder la diffrenciation des entits qui composent sa discipline : les scientifiques spcialiss en gnomique font la distinction entre les diffrents gnes, les astronomes, entre les catgories dtoiles et de galaxies, et les physiciens, entre les particules lmentaires. Des investissements considrables dans chacun de ces domaines sont consacrs cet exercice de cartographie des lments, et pour cause. Il nest pas possible de comprendre le fonctionnement des gnes polymrases si on ne

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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peut diffrencier un gne polymrase dun autre, et nous ne saurions comprendre le comportement des neutrinos si nous ntions pas en mesure de reconnatre un neutrino. Ces sciences ne peuvent pas tirer de lois gnrales si elles narrivent pas, de faon fiable et rpte, reconnatre et recueillir des donnes sur des entits particulires. En sciences de la biodiversit, nous comprenons les cosystmes en tudiant les rles despces participantes. Nous ne pouvons dterminer le rle dune espce moins de pouvoir la reconnatre et lui attribuer nos observations. Nous nous adonnons la prospection de biomatriaux et de produits chimiques en nous attardant aux espces les plus aptes tre la source dinnovations de lvolution. Si nous narrivons pas reconnatre les espces, nous pourrions tre dans limpossibilit de raliser ou de rpter des tudes prcises. Le principe gnral en est simple : lorsque les donnes sont recueillies dans une science quelconque, ces donnes portent sur des objets ou des entits des gnes, des toiles, des particules ou des espces pour lesquels nous souhaitons laborer des thories prdictives. Si les entits ne peuvent pas tre diffrencies entre elles, les donnes seront attribues incorrectement ou de manire ambigu. Il nous faut diffrencier les espces les unes des autres pour pouvoir enregistrer les donnes sur ces espces, mais dans quelle mesure? Avec quelle prcision? Un biologiste du dveloppement doit savoir si une tude exprimentale porte sur la mouche des fruits Drosophila melanogaster Meigan ou sur larabette des dames Arabidopsis thaliana (L.) Heynh, mais ces espces sont des organismes modles conservs en laboratoire. Un chercheur en biodiversit peut rencontrer des milliers despces. En effet, il y a plus de 1 450 espces sauvages de la Drosophila, y compris la D. melanogaster. Doivent-elles toutes tre reconnues et identifies? Est-ce suffisant dtablir des identifications de basse rsolution, en identifiant, par exemple, un spcimen comme tant simplement un papillon plutt que comme tant le Danaus plexippus L., papillon monarque ? Les identifications despces errones ou ambigus nuisent notre capacit de comprendre lcologie, mais il est difficile de prdire dans quelle mesure elle nous nuit, puisque les cosystmes font intervenir les processus les plus complexes qui soient connus de la science. Si les cosystmes taient entirement constitus de groupes facilement identifiables comme des vertbrs ou des plantes fleurs, le problme de lidentification de basse rsolution des arthropodes (insectes, mites, etc.), des myctes et des microbes se poserait peu. Or, on reconnat de plus en plus que ces groupes peu connus de petits organismes jouent un rle important dans nos cosystmes (Brussaard et al., 1997; Callaway et al., 2004; Wall et al., 2010). Diffrentes espces au sein dun genre ou dune famille diffrent frquemment sur

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

le plan des rles cologiques quils tiennent, et lidentification basse rsolution dchantillons a tendance regrouper les organismes de diffrentes cologies, ce qui donne lieu des rsultats cologiques basse rsolution et des prdictions cologiques fausses (p. ex., Knowlton et al., 1992; Bortolus, 2008). Ce problme a t tout particulirement observ dans le domaine de lcologie des rseaux trophiques, o lagrgation taxonomique a gomm la diversit et la complexit des interactions des cosystmes et a men une comprhension incomplte de la topologie et des dynamiques inhrentes aux rseaux trophiques (p. ex., Krause et al., 2003). Il sensuit donc que lidentification de plus haute rsolution mnera une comprhension cologique plus prcise des consquences du changement de la biodiversit. Lidentification exacte des espces est non seulement vitale pour la recherche en biodiversit, mais galement pour les solutions aux problmes appliqus. Les initiatives en biologie de la conservation, en agriculture, en mdecine et en bioprospection dpendent des identifications despces. Une sorte dherbe, Spartina, qui avait t intentionnellement transplante dans la rgion de San Francisco pour venir soutenir la population locale de lespce, qui priclitait dans la rgion, a par la suite fait lobjet dune observation plus pousse : on a dcouvert que la plante avait t mal identifie au dpart, et que, de ce fait, une espce envahissante avait vraisemblablement t introduite de faon involontaire par lhomme (Bortolus, 2008). Une cochenille qui sattaquait aux manguiers dAfrique de lOuest navait pas t identifie au dpart, mais un taxonomiste la reconnue comme provenant de lAsie du Sud, ce qui a contribu concentrer en Asie les recherches dagents de biocontrle, lesquels ont russi contrler le problme (Bokonon-Ganta et al., 2002). Au Vietnam, la taxonomie a rcemment permis de diffrencier deux espces de moustiques qui avaient jusque-l t confondues le premier tait porteur de la malaria, mais non le second , ce qui a permis daffiner la surveillance et le contrle de ces espces (Van Bortel et al., 2001). La connaissance de nos espces est galement essentielle la bioprospection, pour aiguillonner linnovation, comme nous le verrons au chapitre 7. La prochaine occasion ou crise pourrait survenir dans presque tous les groupes dorganismes. Ltat actuel de notre comprhension de plusieurs groupes despces est pourtant tel que nous ne sommes pas prts faire face ces dfis. Tout porte croire que moins de la moiti des espces canadiennes sont connues (voir le tableau 5.1). Si nous nidentifions pas nos espces, nous ne saurons pas, dans dix ans, si des espces inaperues sont en voie de disparition en raison des changements mondiaux, et nous pourrions ne pas savoir sil y a de nouveaux cas despces envahissantes. Nous naurons conscience que dune fraction des cibles disponibles de bioprospection. Les menaces seront mal identifies, et des occasions prometteuses, manques.

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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Travail sur le terrain

Collections

Spcimens

Observations

Donnes

Tissus

Laboratoires de recherche

Analyses morphologiques

Analyses comportementales

Analyses gographiques

Analyses gntiques

Dcouverte et identification despces

Systmatiques Classification

volution et gntique Biogographie Conservation Publications

Personnel hautement qualifi

(Images du diagramme gracieuset de Paul D.N. Hebert (tissus, analyses morphologiques et analyses gntiques), David M. Green (spcimens, analyses comportementales)

Figure 3.1 Droulement des activits dans le domaine de la taxonomie


Le processus taxonomique commence gnralement par un travail sur le terrain qui permet dobtenir des spcimens et des donnes sur leur contexte gographique et cologique. Les spcimens sont tudis la fois directement et la suite de leur prservation, pour en dcrire les caractristiques qui les distinguent (informations morphologiques) et pour en extraire des donnes gntiques. Ensemble, les donnes morphologiques, comportementales, gographiques et gntiques sont analyses en vue dobtenir une valuation de ce quest une espce donne, et comment lidentifier. Ces connaissances des espces et de ce qui les distingue les unes des autres ne sont que le premier des nombreux rsultats obtenus parmi les autres, nommons des spcimens entiers, des collections de tissus, des bases de donnes de spcimens, dimages, de gnes et de donnes gographiques, ainsi que des publications, dont des guides didentification. Les champs affilis qui bnficient directement du travail taxonomique se trouvent dans la partie infrieure de la figure.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

3.2

L a fa o n dE d C o u vR i R E T dE d i f f R En Ci E R L E S E S P C E S

La mission de la science, qui est de dcouvrir et de documenter les espces sur Terre (figure 3.1), a pour point de dpart la recherche sur le terrain : dans les ocans, les lacs, les rivires, les montagnes, les prairies, les forts, les dserts et la toundra. Les dplacements dsormais plus faciles facilitent le travail de cueillette dans les zones loignes, mais la collecte de la plupart des tres vivants na pas t pour autant fondamentalement simplifie par la technologie : il faut encore marcher, cueillir, creuser et plonger. Les spcimens qui sont ainsi recueillis sont, pour la plupart des groupes, archivs dans des muses en vue dune tude continue et plus pousse. Les taxonomistes tudient les spcimens, tant rcemment rassembls que depuis longtemps archivs, pour dterminer sils pourraient reprsenter des espces jusqualors inconnues de la science, ou encore pour dcouvrir de nouvelles preuves permettant de mieux diffrencier des espces dj connues. Traditionnellement, les preuves servant diffrencier les espces ont t dordre morphologique lexamen des diffrences de taille, de structure et de coloration. Les diffrences morphologiques peuvent rvler des diffrences gntiques et, par consquent, contribuer classer les spcimens dans certaines communauts gntiques distinctes (cest--dire diffrentes espces). Les preuves morphologiques sont indirectes; nanmoins, lutilisation de ces tudes au cours des 250 dernires annes a permis de tracer les grandes lignes de la dlimitation des espces, mme si elle na russi couvrir quune petite fraction de la biodiversit. La classification et la dlimitation des espces sont encore principalement fondes sur les rsultats taxonomiques tirs des donnes morphologiques. La technologie transforme la taxonomie par lentremise de nouvelles donnes et de mthodes plus rapides. Les donnes gntiques, dabord introduites dans les annes 1970 et de plus en plus faciles obtenir, offrent un portrait plus direct et de plus haute rsolution des frontires des espces, plus particulirement lchelle microbienne (voir lencadr 3.1). Les progrs en analyse des images, tant optique quinformatique, rendent possible la documentation rapide de la morphologie. La technologie de base de donnes permet la surveillance hautement efficace des spcimens et des espces, alors que de nouvelles mthodes emploient Internet pour assurer une diffusion plus rapide et plus grande des rsultats. Malgr ces progrs, la plupart des espces dcrites par la science ne sont pas facilement ou adquatement identifies dans les informations publies. La vieille documentation est disperse et fonde sur des donnes pauvrement dcrites ou difficiles daccs. Or, de rcents changements donnent espoir de surmonter cette difficult. Les technologies de linformation, dont Internet, sont rassembler les

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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Encadr 3 .1 La diversit lchelle microbienne


Les organismes que les biologistes appellent gnralement microbes font rfrence aux bactries, aux arches (semblables aux bactries sur plusieurs plans), aux algues, aux protozoaires (comme les amibes) et aux autres micromyctes plus petits (les levures, par exemple, mais non les macromyctes). Cest leur taille microscopique, le fait quil sagisse dorganismes unicellulaires (ou seulement damas ou de fils, en nombre limit), et le fait quils prsentent des similitudes cologiques du fait de leur petite taille, qui en font tous des microbes. Malgr ces similitudes, toutefois, ce groupe est en fait trs diversifi. En termes biochimiques, structuraux, gntiques et cologiques, les microbes prsentent plus de diffrences et de particularits que lensemble des plantes et des animaux. Les organismes microbiens emplissent toutes les niches o la vie est possible, que ce soit dans les crevasses des rochers des valles geles et assches de lAntarctique, dans les bouches hydrothermales en eaux profondes, o les tempratures atteignent les 120C, et jusque sur toutes les surfaces internes et externes de notre propre corps. Les activits microbiennes (et surtout bactriennes), comme la fixation de lazote, la photosynthse et la production de mthane, sont galement les pierres angulaires des cycles biogochimiques majeurs qui font de la Terre une plante habitable. Sans les animaux et les plantes, la Terre serait ennuyeuse; sans les microbes, elle serait morte. Les tudes sur la biodiversit microbienne se distinguent de plusieurs faons tant sur le plan de la mthodologie que sur celui des objectifs des tudes sur la biodiversit des animaux et des plantes. Les sciences de la diversit microbienne prservent rarement des spcimens morts dans des muses. Par ailleurs, le terme espce peut ne pas revtir la mme signification en raison des impressionnantes variations gntiques au sein dune mme espce et entre espces. De plus, les espces microbiennes sont gnralement perues comme tant cosmopolites, cest--dire quelles se retrouvent lchelle de la plante, l o les conditions ncessaires existent. Les perces en biologie molculaire et en gnomique signifient que la diversit microbienne peut dsormais tre directement value par le biais danalyses dADN dchantillons de sol ou deau, sans cultiver des organismes en laboratoire. Cet important domaine dtude sappelle la mtagnomique.

donnes comparatives et rvolutionner lidentification au moyen de bases de donnes, de guides didentification et de communauts en ligne. Les mthodes de comparaison des squences dADN (voir lencadr 3.2) promettent de faciliter considrablement lidentification. La technologie pourrait bientt faire en sorte

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

que lidentification gntique des espces puisse se faire rapidement et peu de frais. Cela dit, les donnes ncessaires pour identifier les espces les plus connues ne sont pas encore compiles. Llaboration de telles mthodes est un objectif cl de la taxonomie : lidentification rapide et prcise in situ faciliterait grandement la cueillette de donnes de base pour de nombreuses tudes cologiques.
Les mthodes taxonomiques nouvelles ou conventionnelles

Dans la mesure o la taxonomie fait face tant de nouvelles demandes qu de nouvelles occasions, il nest gure surprenant que les taxonomistes travaillent dterminer quelle est la meilleure faon davancer la mission quest la dcouverte de la biodiversit (p. ex., Godfray, 2002; EDIT, 2008). Les perces technologiques, la demande pour des valuations rapides et exactitude leve de nos cosystmes, et la tche herculenne quest la documentation dune si large part de la biodiversit comportent toutes leur propre lot de dfis. Il sagit dune proccupation qui est reflte dans une des sous-questions soumises au comit dexperts : Les techniques molculaires supplantent-elles rellement la taxonomie traditionnelle, ou crent-elles des occasions permettant den cibler les efforts? Avec 1,6 million despces connues (May, 2010) et des millions dautres qui restent dcouvrir et diffrencier, la construction dun systme didentification gntique exhaustif prendra des dcennies, et la taxonomie morphologique est appele y jouer un rle cl. Pour chafauder cette base de donnes de squences pour un nombre aussi lev despces, lchantillonnage doit tre cibl efficacement de faon maximiser le nombre despces rpertories. De plus, pour viter de gaspiller nos ressources en chantillonnant des tourneaux et des pissenlits, il faut laisser aux spcialistes le soin didentifier les spcimens quil faut examiner, dans la mesure o ce sont eux qui, dune part, connaissent le mieux les habitats les plus aptes y compter des espces non chantillonnes et qui, dautre part, peuvent rapidement valuer la morphologie pour retenir les spcimens qui reprsentent probablement des espces diffrentes. Les donnes gntiques pourraient ou non remplacer, dans une grande mesure, les donnes morphologiques dans lidentification despces, et ce, selon les organismes ltude. Par exemple, les myctes sont trs diversifis, mais prsentent peu de traits morphologiques permettant de les diffrencier, tandis que leur dtermination gntique est de la plus grande utilit aux spcialistes dans ce domaine. Les oiseaux, par contre, sont bien caractriss sur le plan morphologique et la plupart des chercheurs continueront sans doute didentifier les oiseaux, in situ, au moyen dindices visibles. Au final, la place quoccupera lidentification gntique dpendra peut-tre galement des perces dans des domaines concurrents, comme lanalyse dimages. Il nen demeure pas moins que

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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cette question concerne peu nos choix dans un avenir rapproch. Nous devons investir dans les bases de donnes gntiques pour lidentification, elles seront dune grande valeur. Cependant, mme si lobjectif ultime tait lidentification gntique, la taxonomie morphologique demeurerait ncessaire pour atteindre ce but. Les donnes morphologiques reprsentent aussi un important mcanisme de contrle de la qualit tout aussi efficace que lest lidentification gntique, qui est en voie dlaboration. Pour ce qui est de la diffrenciation despces, les meilleures donnes sont, en principe, celles qui sont tires de plusieurs gnes du gnome prlev de plusieurs spcimens et de plusieurs espces. Or, cette mthode est trop coteuse. Cest pourquoi les chercheurs ont recours des raccourcis, en se servant seulement de mthodes qui ncessitent quelques loci de gnes, comme le code-barres dADN. Dans le cas de ces mthodes gntiques approximatives, les informations morphologiques jouent un grand rle en permettant de dtecter les erreurs ou de corroborer que deux espces sont distinctes, car la morphologie reflte une plus grande portion du gnome (voir lencadr 3.2). Sans les donnes morphologiques et sans la participation des taxonomistes, un systme didentification gntique serait dconnect de la classification existante des organismes, qui est fonde sur la morphologie. Lintgration de lidentification gntique la classification existante est importante parce que presque tous les rsultats des derniers sicles en biologie sont attribus des espces identifies et classifies au moyen de la morphologie. Cest pourquoi, pour assurer un accs continu aux donnes patrimoniales, les normes de rfrence doivent relier les espces gntiquement caractrises aux donnes de classification conventionnelles, et ce, au moyen de lidentification morphologique, ce qui exige un effort considrable de la part de la taxonomie morphologique. La taxonomie morphologique et gntique sont, pour ainsi dire, des collaborateurs ncessaires. La taxonomie morphologique joue aussi un autre rle : elle fournit une caractrisation de rfrence des tres vivants. Pour la plupart des espces connues de la science, les seules donnes que nous ayons sont celles qui ont t fournies par les taxonomistes. Ces informations comprennent des donnes sur lhistoire naturelle, de mme que sur la morphologie. Mme ces seules donnes de rfrence de base les organismes sont-ils grands ou petits? poilus ou pineux? dents ou non? peuvent tre dterminants dans linterprtation cologique ou la bioprospection. La valeur de ces donnes morphologiques de base et dautres donnes non gntiques (phnotypiques) est reconnue par le Code-barres de la vie (Barcode of Life)1, qui encourage lenregistrement dimages numriques de spcimens mesure quelles ont t contrles.

http://www.boldsystems.org

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 3 .2 Lidentification molculaire des espces


Dans plusieurs cas, il est possible, voire ncessaire, didentifier lespce dun organisme mme sil est manquant. Par exemple, comment faire la diffrence entre les produits issus despces de poissons lgalement rcolts par opposition aux poissons illgalement rcolts? La rponse est dans leurs gnes, comme lont montr Bartlett et Davidson (1991), en identifiant des chantillons de chair de thon partir de squences dADN de gnes mitochondriaux. Il sagit l de lessence de la technique des codes-barres dADN, qui utilise la diversit de la squence des rgions gniques standardises pour crer un systme numrique de reconnaissance des espces (Hebert et al., 2003). La technique de codes-barres dADN fonctionne si bien, et pour tant despces, quil a permis la mise sur pied de systmes didentification aux nombreuses applications et donne espoir quun certain nombre de rgions gniques permettront lidentification de presque toutes les espces eucaryotes. La pratique du codes-barres dADN reconnat la ncessit denregistrer les dtails de la collecte, de lidentification et de lentreposage long terme de chaque spcimen, rattachant ainsi les informations sur le spcimen et la squence. La base de donnes du Code-barres de la vie (BOLD, pour Barcode of Life Data) compte prsent prs dun million dchantillons de codes-barres dADN provenant de plus de 100 000 espces. Les codes-barres dADN supposent que la plupart des espces prsente suffisamment de diffrences gntiques par rapport aux espces rapproches pour permettre leur diagnostic au moyen dinformations tires de squences trs limites. Nanmoins, lanalyse dempreintes gntiques despces doit tre exacte et suffisamment dfendable pour rsister un examen minutieux devant un tribunal. Lentomologie judiciaire a t une des premires preuves de la validit des squences molculaires, en tant que moyen didentifier des insectes dans un contexte judiciaire. La prsence de larves de mouches sur un cadavre est un indicateur fiable de ltat de dcomposition du corps, et donc de lheure du dcs; une telle preuve est tout fait accepte en cour. Cela dit, il peut savrer difficile didentifier lespce des larves moins que celles-ci ne soient cultives jusqu lge adulte, ce qui peut signifier quun laps de temps important peut scouler avant quon puisse se servir de ces donnes comme preuves. Le recours aux squences dADN pour identifier les larves peut grandement acclrer lidentification (Sperling et al., 1994). Cependant, lADN nest pas encore devenu la principale mthode admise pour lidentification dinsectes dans les affaires judiciaires. Tant quil y aura une incertitude quelconque relativement la conformit absolue entre les codes-barres dADN et les espces identifies par dautres moyens (Wells et al., 2007), les lments de corroboration provenant dautres mthodes didentification demeureront probablement essentiels, aux cts des caractristiques molculaires, dans lidentification despces importantes sur le plan judiciaire.

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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De fait, les proccupations initiales des taxonomistes, savoir que les donnes gntiques la mode pourraient mener la fin des fondements morphologiques de la taxonomie, se sont avres, jusqu maintenant, non fondes (Packer et al., 2009). Le code-barres dADN prend de lampleur (Hebert et al., 2003), tout comme, en parallle, les exigences du projet pour la collaboration de taxonomistes qui connaissent la morphologie et lhistoire naturelle de groupes spcifiques dorganismes, tant pour lintgration des rsultats dans la classification existante que pour lchantillonnage de spcimens. Les taxonomistes morphologiques sont ainsi devenus des partenaires priss dans cet effort visant crer une base de donnes gntique de rfrence pour lidentification despces, et ils sont donc, ce titre, de plus en plus demands.
3.3 L a R Ch i va g E d E S P C E S d anS LES CoLLECT ion S

Avec des millions despces travers le monde, la masse de renseignements qui est recueillie sur la biodiversit est norme. Cette information doit tre partage, non seulement avec les chercheurs actuels, mais galement avec les chercheurs de demain, par le biais darchives long terme. Les entrepts les plus importants dinformations sur les espces sont les spcimens biologiques qui ont t rassembls et entreposs par des individus et des institutions au fil des sicles. Certains spcimens contenus dans des collections, tel le Muse dhistoire naturelle de Londres2, datent des XVIe et XVIIe sicles et, encore aujourdhui, ils demeurent en trs bon tat. La Socit linnenne3, galement tablie Londres, a la charge dune bonne part de la collection datant du XVIIIe sicle quavait consulte Carl von Linn pour baser ses premires descriptions despces. En dautres termes, certaines personnes ont compris la valeur de ces fragiles spcimens et ont cr les conditions ncessaires leur maintenance pour les gnrations futures. Bien que les biologistes rattachs plusieurs disciplines contribuent des spcimens aux collections, les spcimens de la plupart des espces sont offerts par les taxonomistes, dans le cadre de leur qute visant comprendre la diversit des espces. Chaque spcimen apporte avec lui un lot dinformations dans lavenir. Les spcimens des collections sont souvent des sources irremplaables dADN et de donnes sur la morphologie, le lieu et lhistoire naturelle. Certains, comme les microbes et les semences, sont vivants, mais la plupart sont prservs. Les mthodes de prservation sont nombreuses, mais on peut dsormais compter sur des fluides et des conglateurs spciaux permettant les tudes gnomiques.

2 3

http://www.nhm.ac.uk/ http://www.linnean-online.org/

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 3 .3 Lever le voile sur la biodiversit cache


La dcouverte de nouvelles espces de plantes et danimaux canadiens est un processus continuel qui nest pas limit aux plus petites espces de notre faune. Les collections musales contiennent une mine de spcimens non traditionnels comme des tissus congels et des chantillons dADN qui peuvent lever (Gracieuset de David M. Green) le voile sur une biodiversit inattendue. Jusquau milieu des annes 1990, la grenouille macule a t considre comme une seule espce, que lon pouvait trouver un peu partout dans la grande rgion continentale de la Colombie-Britannique et du Nord-Ouest des tats-Unis. Cependant, les tudes gntiques ont montr que les populations de ces grenouilles qui vivaient sur la cte pacifique, depuis la valle de la rivire Fraser et au sud jusquen Californie, taient tel point diffrentes des autres quelles ne pouvaient plus, en toute connaissance de cause, tre considres comme appartenant cette espce, mais quil fallait plutt y voir une espce distincte (Green et al., 1997). Dsormais connue comme la grenouille macule de lOregon, elle a reu la dsignation despce en pril, et ce, pour lensemble de sa zone dhabitation. La grenouille macule de Columbia, beaucoup plus commune, nest pas en pril. Ce nest que lorsque linformation gntique a montr que ces espces taient distinctes que les scientifiques ont commenc relever les diffrences morphologiques entre elles (Matsuda et al., 2006). Les paulards qui vivent dans les eaux de locan Pacifique au large de la Colombie-Britannique sont depuis longtemps reconnus comme formant des populations distinctes, dites des cotypes, qui diffrent sur le plan de la morphologie, du comportement et du rgime alimentaire. Les paulards rsidants, que lon peut rgulirement observer depuis le dtroit de Georgie et dautres eaux ctires, se nourrissent de poissons, notamment de saumon. Par contre, les paulards migrateurs, qui demeurent en haute mer, se nourrissent de phoques et dautres mammifres marins. Les paulards rsidants et migrateurs ont chacun leur propre langage vocal, ninteragissent pas socialement et ne se croisent pas. Des analyses gntiques rcentes de leur ADN mitochondrial indiquent que ces cotypes ont diverg lun de lautre il y a de cela entre 150 000 et 700 000 annes, ce qui indique quil sagit bien despces distinctes et, ce jour, sans nom (Morin et al., 2010). Toutes les populations dpaulards des eaux canadiennes du Pacifique sont dsignes comme tant soit en voie de disparition, soit menaces.

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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Abstraction faite de la mthode de prservation, il nen demeure pas moins que la tche des collections demeure la maintenance despces pendant des sicles, si possible. Cela est particulirement important dans la mesure o certaines espces des collections actuelles sont soit disparues, soit en voie de disparition, et que les spcimens sont les seules traces que nous ayons de ces espces. La maintenance sur plusieurs sicles nest pas chose facile en raison des conomies fluctuantes et des priorits scientifiques changeantes. Afin de pouvoir communiquer au sujet des espces que nous dcouvrons, il nous faut des noms que nous pouvons attribuer aux espces et, par souci de stabilit, ces noms doivent tre ancrs dans des spcimens de rfrence. Aussi, pour chaque espce nomme, il existe un spcimen particulier, ou une srie de spcimens, connu comme le type ou la srie type, qui attribue un nom cette espce biologique. Ces spcimens types, de mme que les donnes sur le lieu et la date de collecte, sont de la plus grande importance pour notre systme global de connaissances biologiques. Ils doivent tre entreposs de faon scuritaire. Voil un des rles principaux des collections biologiques. Les collections biologiques sont largement utilises dans plusieurs disciplines. En tant que matriau de base des domaines de la taxonomie et de la systmatique, les collections et leurs donnes documentent les rsultats des recherches biologiques par le biais de spcimens de rfrence, qui peuvent tre nouveau analyss, peut-tre au moyen de nouvelles techniques dextraction et de squenage dADN, pour fournir des donnes sur les tendances historiques et de nouvelles connaissances (voir lencadr 3.3 pour des exemples de la valeur des collections musales). Les cologistes peuvent examiner le contenu des entrailles, tracer lincorporation des lments ou comparer les formes de croissance en vue de comprendre les contextes cologiques. Les guides dhistoire naturelle (voir lencadr 6.2) dpendent galement beaucoup des collections biologiques. De plus, en tant que traces partir desquelles les espces ont t repres, et quand elles lont t, les collections peuvent galement contribuer de nouvelles tudes dans dautres domaines scientifiques, comme le changement climatique et la sant humaine.
Le rle croissant des technologies de linformation

Lentreposage de donnes normalises, quil sagisse de bases de donnes lectroniques ou de monographies et de catalogues imprims, est au cur de la taxonomie depuis que Carl von Linn a tabli les normes de descriptions et de classification despces. Les donnes se rapportant aux spcimens (collecte de donnes, morphologie, squences dADN) et aux espces sont entreposes.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Aujourdhui, les bases de donnes ne sont pas que des technologies; il sagit de gages darchivage et de partage de donnes. Lentreposage long terme de donnes sur les spcimens et les espces doit tre assur. En outre, laccs aux donnes par divers intervenants, des biologistes au grand public, doit tre conu de faon rehausser la science tout autant que les connaissances du grand public. Des bases de donnes internationales standardises tant pour les spcimens que pour les espces sont en voie de conception par des rseaux et des groupes de travail internationaux, comme le Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB)4 et les Normes dinformation sur la biodiversit (TDWG, pour Taxonomic Database Working Group5 ). De pair avec les bases de donnes accessibles en ligne, les donnes normalises permettent dsormais une mise en commun et des changes dinformation sur les espces qui sont ingals, de mme que la collecte de spcimens qui reprsentent ces espces. La saisie des renseignements dans ces bases de donnes exige la numrisation tant de collections existantes que de nouvelles collections. Cela rendra possibles des tudes synthtiques exhaustives, permettant, par exemple, de demander si le rayon despces stend ou rtrcit. Les bases de donnes dimages, de mme que les cls taxonomiques en ligne, dissminent les moyens didentifier les espces aux biologistes et au public. Internet offre plus que jamais les moyens de coordonner la recherche et de diffuser les rsultats.
3.4 L a T En d a nC E L a Co L L a b oR aTi on

La mission quest la dcouverte de toutes les espces de vie sur Terre exigera bien plus que la seule technologie elle ncessitera dimportantes collaborations nationales et internationales.
Les collaborations entre universits, recherche gouvernementale et muses

Les muses qui se spcialisent en archivage ont une mission long terme; les universits, qui mettent laccent sur la formation, comme les agences gouvernementales qui sadonnent la recherche, ont davantage tendance se voir confier des mandats plus court terme. Si ces groupes sont isols lun de lautre, les tudiants pourraient ne jamais croiser la taxonomie et la recherche qui ont recours aux collections, ce qui signifie que la recherche taxonomique ne pourrait tre efficacement intgre dautres disciplines qui relvent de la biologie (cologie, physiologie, etc.). Lintgration de la recherche taxonomique dautres disciplines

4 5

http://www.gbif.org/ http://www.tdwg.org/

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

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est pourtant vitale pour veiller ce que les rsultats soient achemins efficacement par des individus, des bases de donnes et des dispositifs aux biologistes qui en dpendent. Accrotre les changes, virtuellement et autrement, donnera lieu dimportantes synergies.
Les collaborations multidisciplinaires

Dans la mesure o elle permet de dcouvrir les lments de la biodiversit, la taxonomie est le fondement de toutes les tudes de la biodiversit (voir le chapitre 2). Elle reprsente donc un collaborateur indispensable pour les tudes cologiques, qui tentent de comprendre comment les lments de la vie interagissent entre eux. Le champ de cette collaboration a t largi puisque les tudes en changement climatique requirent la surveillance des rayons gographiques et saisonniers des espces, dont les donnes patrimoniales tires dtudes taxonomiques et des collections fournissent dimportantes donnes de rfrence historiques. La biologie de la conservation est de plus en plus dpendante de la taxonomique parce que la reconnaissance des points chauds sur le plan de la biodiversit en vue de la mise sur pied de rserves exige la diffrenciation exacte des espces et la quantification de la diversit. mesure que la bioprospection augmente son champ de recherche despces prsentant des attributs dune utilit dans des domaines aussi varis que la pharmaceutique et la nanotechnologie, la carte de base de la biodiversit que propose la taxonomie est un guide ncessaire. Les contributions dautres disciplines la taxonomie ont normment augment au cours des dernires dcennies, notamment par le biais de linformatique (les bases de donnes) et la biologie molculaire (lanalyse gntique).
La science taxonomique et le savoir traditionnel

Le savoir traditionnel (voir lencadr 3.4) englobe le savoir, les innovations et les pratiques des communauts autochtones et locales dont les styles de vie traditionnels savrent tre importants la prservation et lutilisation durable de la diversit biologique. Plusieurs espces sont isoles, et ce, dans des endroits trs localiss, et les combinaisons despces dans les cosystmes sont souvent uniques. Par consquent, le savoir local qui sest accumul avec le temps et qui a t transmis dune gnration lautre souvent par lentremise de lgendes, de chansons, de valeurs culturelles et spirituelles, de lois traditionnelles, de la langue et des rituels est dune valeur particulirement importante dans la comprhension de la biodiversit (Brown et Brown, 2009). Il arrive souvent que le savoir traditionnel ne soit pas confin des frontires ethniques ou gographiques.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Plusieurs communauts autochtones et locales crent et grent la biodiversit par le biais de leurs actions et de leur organisation sociale. La recherche a commenc lucider ce rle et il est de plus en plus pris en compte par les parcs nationaux, qui signent des ententes de cogestion avec les communauts autochtones (Conseil canadien des parcs, 2010). La collaboration entre les biologistes et les dtenteurs du savoir traditionnel devraient intgrer ce savoir dans la documentation scientifique avant que ce savoir ne soit perdu.

Encadr 3 .4 Le savoir traditionnel


Le savoir traditionnel a dabord t officiellement reconnu la Confrence des Nations Unies sur lenvironnement et le dveloppement, qui sest tenue Rio de Janeiro en 1992. Larticle 8j de la Convention sur la diversit biologique demande aux tats signataires de respecter, prserver et maintenir le savoir traditionnel des communauts autochtones et des collectivits locales qui contribue la conservation et lutilisation durable de la biodiversit. Laccs au savoir traditionnel doit tre fond sur le consentement pralablement obtenu des dtenteurs du savoir et leur participation quitable au partage des retombes qui dcouleraient de lutilisation dudit savoir.

Les chercheurs en taxonomie et le grand public

Si les membres du public ne sont pas sensibiliss la biodiversit, ils ne sauront pas lapprcier pleinement ni comprendre en quoi leurs propres choix peuvent laffecter. Ceux qui font la surveillance de la biodiversit peuvent transmettre leur propre savoir ainsi que leur passion au grand public, et notamment aux enfants. Faire dcouvrir aux enfants les merveilles de la biodiversit qui existe lextrieur de leur monde urbain et les mettre en contact avec des scientifiques spcialiss en biodiversit titre de modles est un important investissement dans lavenir de la biodiversit. Pour leur part, les chercheurs en taxonomie peuvent grandement bnficier dun change de savoir avec le public, dont des ornithologues amateurs et des photographes de la faune. Ces citoyens qui sintressent manifestement la biodiversit sont de plus en plus nombreux avec la venue dappareils numriques qui captent des images de petits organismes, comme des insectes. Ces individus, quon appelle souvent des naturalistes, de mme que les chasseurs et les pcheurs,

Chapitre 3 La taxonomie : le fondement des sciences de la biodiversit

47

possdent une gamme de comptences ainsi quun savoir local et spcifique de la biodiversit, qui sont en lien avec leur passion dobserver, dapprendre et de comprendre lenvironnement naturel. Ces personnes sont souvent en mesure de reconnatre et de documenter les changements de la biodiversit. La collaboration entre les chercheurs en taxonomie et le grand public a cours depuis fort longtemps, tant dans les muses que dans les livres. Les muses se servent de leur expertise en recherche et de leurs collections pour amener la biodiversit au public, alors que les guides didentification (voir lencadr 6.2) facilitent la dcouverte de la biodiversit par le public, in situ. Une nouvelle avenue de collaboration est, bien sr, Internet. Non seulement les muses et les scientifiques spcialiss en biodiversit peuvent-ils communiquer en ligne avec le public, mais les naturalistes peuvent partager entre eux leurs photographies, leurs histoires et leur enthousiasme par le biais de blogues et autres formes de mdias sociaux. Par exemple, plusieurs sites Web, du plus gnral (flickr.com) au plus spcialis (bugguide.net), encouragent les membres du public afficher leurs photographies dorganismes et solliciter des identifications de la part dexperts professionnels et amateurs. Cette forme dapprovisionnement par la foule, qui fait appel ce que Janzen (1993) avait nomm la taxosphre la grande communaut de taxonomistes offre une rtroaction suffisamment rapide pour quelle devienne une importante ressource ducative sur laquelle dvelopper une littratie de la biodiversit chez des personnes aux intrts et aux habilets varis.

Points saillants du chapitre


La taxonomie est le fondement des sciences de la biodiversit, dans la mesure o elle dcouvre et identifie les lments fondamentaux de la biodiversit. Il y a un immense besoin de recherche taxonomique. La taxonomie doit intgrer les approches morphologiques classiques aux nouvelles techniques gntiques et informatiques. Cela reprsente une synergie des approches, et non une transition d ancien nouveau . Il existe de nouvelles et importantes approches et occasions de collaboration fort intressantes entre les scientifiques, les dtenteurs du savoir traditionnel, les naturalistes et le grand public.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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Chapitre 4

Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

Le Canada se distingue depuis longtemps en sciences de la biodiversit et en recherche taxonomique. Il existe toujours des personnes qui sintressent la taxonomie et qui possdent une expertise dans ce domaine au Canada, mais le manque de soutien et de possibilits demploi empche le Canada de raliser pleinement sa capacit de contribuer aux sciences de la biodiversit.

La rputation du Canada, bien connu pour son expertise dans les domaines lis la biodiversit, dont lcologie, lvolution, la taxonomie et la systmatique, nest plus faire. Un rapport publi en 2006 par le Conseil des acadmies canadiennes a conclu que les sciences de la biodiversit ( cologie et volution ) reprsentaient un des quatre sous-champs en sciences et technologies sur 125 o le Canada se classait parmi les 30 premiers pays au monde en ce qui a trait la qualit et lintensit de ses publications (Conseil des acadmies canadiennes, 2006). Le Conseil des acadmies canadiennes a galement rapport quil y avait eu une remarquable augmentation de 25 %, au Canada, du nombre de publications en cologie et en volution, pour les priodes allant de 1997 2000 et de 2001 2004; ailleurs au monde, cette augmentation tait de 16 %. La productivit en recherche au Canada pour chaque dollar de subvention en sciences de la biodiversit compte parmi les plus leves au monde (Peters et al., 1996). Cette excellence se reflte dans le Programme des chaires de recherche du Canada : 75 des 1 760 chaires de recherche ont t cres dans le domaine de lcologie et de lvolution (28 chaires de niveau 1, 47 chaires de niveau 2). Le succs des sciences de la biodiversit au Canada repose sur plusieurs facteurs. Le succs engendre le succs. Le fait dtre entour de collgues hors pair amliore la capacit de recruter des chercheurs suprieurs de partout au monde. De plus, la gamme dcosystmes au Canada offre une ressource naturelle qui non seulement attire les scientifiques spcialiss en biodiversit, mais qui impose galement la ncessit quune gamme dexperts comprenne, interprte et gre ces diffrentes ressources. titre dexemple, les stations de recherche offrent un accs et des capacits de recherche amliors dans divers environnements, depuis les stations marines jusqu la glace polaire (voir lappendice 3). Un autre facteur pouvant contribuer au succs disproportionn de lcologie et de lvolution au Canada est une diffrence dans les politiques de financement, en regard de celles des autres nations. Tel que not dans le Rapport du comit dexamen international du Programme de subventions la dcouverte (CRSNG, 2009), les subventions de recherche scientifique du Conseil de recherches en sciences naturelles et en gnie

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

(CRSNG), qui se distinguent en raison du soutien quelles apportent des programmes de recherche scientifique qui connaissent un certain succs par opposition des projets spcifiques, offrent une base de financement long terme plus stable que dans plusieurs autres pays. La constance du financement est particulirement importante dans les sciences de la biodiversit en raison de la ncessit dobserver les tendances longue chance, dtablir des stations de recherche, deffectuer la production de rvisions et de monographies taxonomiques approfondies, et de raliser des dcouvertes scientifiques de bases dorganismes non modles. Pourtant, ce chapitre permettra de constater que la valeur des dollars de recherche par subvention est stagnante, au Canada. Cet tat de fait limite les chercheurs canadiens, dtournant leurs activits de recherche dentreprises coteuses, comme lanalyse molculaire, les travaux sur le terrain en rgion loigne ou la radiotlmtrie. Sur le plan de la productivit par dollar de subvention, du dossier de publication et de la rputation internationale, la recherche canadienne en sciences de la biodiversit est, dans son ensemble, dynamique et a un ascendant certain. La question cl qui se pose dans le cadre de cette valuation, toutefois, est si on peut galement dire que le domaine de la recherche taxonomique au Canada est en sant et spanouit.
4.1 LE S C o n T Ri b u T i o nS d u C a n a d a La R E C hE R C h E Ta x o n o m i q uE

Le Canada fait depuis longtemps des contributions de calibre mondial cette mission quest la dcouverte despces sur Terre. Pendant une bonne partie de la deuxime moiti du XXe sicle, le Canada sest maintenu en tte de la recherche dans le domaine de la taxonomie morphologique, plusieurs des systmaticiens entomologistes nord-amricains les plus en vue ayant t forms ou ayant travaill au Canada. Louvrage en trois tomes fort apprci, Manual of Nearctic Diptera6 (McAlpine et al., 198189), qui est toujours la rfrence en matire didentification et de caractrisation de ce groupe dinsectes qui revt une importance conomique, a t ralis en bonne partie par les chercheurs et les illustrateurs de la Collection nationale canadienne, Ottawa. Depuis sa publication, le groupe dexperts qui y avait travaill et qui avait galement contribu dautres ouvrages marquants (p. ex., Hymenoptera of the World, Goulet et Huber, 1993) a t rduit par attrition, alors que ces projets de publications, soutenus par le Conseil national de recherche, ont t interrompus. Les programmes objectifs prcis sont par contre venus soutenir un important renouvellement dans certains domaines; le Programme de biodiversit microbienne (encadr 4.1), par exemple, est reconnu internationalement pour son rle de formation, de dcouverte despces et de rvision taxonomique.

Le terme narctique fait rfrence la zone cologique qui couvre lAmrique du Nord, le Groenland et une partie du Mexique. Les diptres sont communment appels des mouches.

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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Malgr ce contexte de recherche bien ancr, le comit dexperts est conscient des proccupations communes et croissantes au sujet de la perte, au Canada, dexpertise en biodiversit dans des domaines spcifiques, notamment en taxonomie. Cela est conforme une apprhension de plus en plus grande au sujet du dclin du nombre et du niveau de formation de taxonomistes, qui trouve cho travers le monde. Un rapport britannique de 2008 faisait la lumire sur le fait que lexpertise taxonomique est sur le point de disparatre dans certains domaines (Chambre des lords, 2008). De plus, selon un rapport britanno-colombien paru rcemment, la perte dune expertise taxonomique dj limite a eu des rpercussions sur la capacit daborder certaines lacunes sur le plan des connaissances en biodiversit, dans cette province :

[Traduction] Des milliers, sinon des dizaines de milliers despces en Colombie-Britannique nont pas fait lobjet de descriptions scientifiques, et leur prsence sur le territoire de la province na pas t documente. Parmi les groupes despces pour lesquels une telle information est particulirement pauvre, nommons la plupart des invertbrs et les plantes non vasculaires. Cette lacune dans le savoir taxonomique est prsentement aggrave par lextinction de lexprience : les scientifiques possdant les connaissances, les comptences et la volont de sacquitter du travail ncessaire pour combler ces lacunes partent la retraite sans tre remplacs . (Austin et al., 2008).

Encadr 4 .1 La biodiversit microbienne : une histoire succs en matire de dveloppement et de soutien de lexpertise
Le travail de lInstitut canadien de recherches avances (ICRA) montre en quoi le rseautage peut transformer des domaines et des pratiques scientifiques. Le programme qui lavait prcd, soit le Programme de biologie de lvolution (19862007), de mme que le nouveau Programme de biodiversit microbienne intgr (depuis 2008), ont permis aux chercheurs canadiens de tisser des liens avec leurs collgues trangers et de discuter de la dcouverte de microbes qui se trouvent dans un environnement donn. Des groupes majeurs, jusqualors inconnus de virus, de bactries, dalgues et de protozoaires, ont t dcrits et caractriss, souvent jusqu lobtention dun squenage complet de gnomes. Grce en partie aux cibles dinvestissement de lICRA et au soutien de sa facult, de ses boursiers postdoctoraux et de ses tudiants aux tudes suprieures, le Canada est gnralement reconnu comme tant un chef de file mondial en matire de diversit des protistes : nous avons cr un cadre dexperts remarquablement cohsif, l o auparavant, on ne retrouvait que quelques chercheurs individuels qui, bien quexcellents, uvraient de faon isole.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

valuer le statut de lexpertise taxonomique au Canada est particulirement important parce que les taxonomistes sont souvent les seules personnes qui dtiennent une connaissance directe de plusieurs espces telles quon les trouve dans leur environnement naturel; ils savent o trouver une espce donne, la communaut dans laquelle vit cette espce, et les effets quelle peut avoir sur les services cosystmiques. Les taxonomistes morphologiques et dautres chercheurs possdant une expertise taxonomique spcifique dveloppent typiquement des connaissances trs pousses de lhistoire naturelle des organismes quils tudient; ils fournissent ainsi des informations cologiques et comportementales qui peuvent la fois permettre de vrifier les distinctions entre espces et servir de point de dpart de nouvelles recherches. La perte dexpertise taxonomique influe sur notre capacit non seulement catgoriser les espces, mais aussi interrelier des donnes propres une espce donne et dautres se rapportant lensemble dune communaut ou dun cosystme, puis documenter ces tendances au fil du temps. Pour valuer ltat actuel de la taxonomie au Canada et pour aider suivre ses grandes tendances, le comit dexperts a conu une enqute en ligne (voir lappendice1) qui sollicitait les rponses dindividus possdant une expertise dans le domaine de

2 1 0

62 67 21 17 126 70 3 16 18 11

Nombre dexperts 0 126

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 4.1 Emplacement des rpondants lenqute


Le plus grand nombre de rpondants lenqute sur lexpertise taxonomique provenaient de lOntario, du Qubec et de lAlberta. Peu dentre eux provenaient des Territoires du Nord-Ouest.

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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la taxonomie, quel que soit le secteur dans lequel travaillent ces individus. Tous les territoires et provinces ont t reprsents dans les 432 rponses reues, lexception du Nunavut (voir la figure 4.1). La majorit des rpondants taient titulaires dun doctorat qui tait principalement ax sur la taxonomie (142), ou qui portait sur certains lments de taxonomie (127). Les autres taient titulaires de doctorats sans composante taxonomique (31), nont pas prcis leur domaine dtudes doctorales (11) ou ntaient pas titulaires de doctorat (121).
4.2 LE S E x P E RT S C a n a d iEn S, PaR g Rou PE dgE

En raison des proccupations accrues et gnralises, travers le monde, au sujet de la perte du savoir taxonomique, le comit dexperts a examin la distribution des rpondants selon le groupe dge, pour tenter dy relever des preuves lappui de lhypothse voulant que lexpertise taxonomique risquait dtre perdue avec le dpart la retraite de ses experts. Les individus stant identifis comme tant un expert reconnu lchelle internationale pour un groupe de taxons donn taient, en moyenne, plus gs de 7,3 ans que les autres rpondants (voir la figure 4.2), une diffrence qui est trs significative (p < 0.0001, base sur 10 000 permutations alatoires, ci-aprs appel test de permutation). De la mme faon, les rpondants qui avaient publi au moins un ouvrage sur la taxonomie taient beaucoup plus gs que ceux qui navaient pas publi, mme lorsque les analyses taient circonscrites aux rpondants titulaires dun doctorat (figure 4.3; diffrence
70 60 59 47 40 40 30 20 20 11 10 0 4 2030 3140 4150 5160 6170 Plus de 70 20 36 63

I
46 49

Nombre de rponses

I
37

Expert reconnu dans un groupe taxonomique Expert non reconnu

50

Groupe dge (annes) (Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 4.2 Expertise reconnue en taxonomie, par groupe dge


Cette figure montre les rpondants qui se sont auto-identifis, dans lenqute sur lexpertise taxonomique, comme des experts de rputation internationale . La moiti des rpondants se sont auto-identifis comme tant un expert de calibre international.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

moyenne de catgorie dge = 7,9 annes, p = 0.0006, test de permutation). Cette concentration dexpertise taxonomique dans la cohorte la plus ge est encore plus flagrante lorsquon examine le nombre de rpondants ayant publi un grand nombre darticles ou des ouvrages plus importants, comme des monographies et des rvisions taxonomiques (voir lappendice 1). Les rsultats de lenqute, comme lillustrent les figures 4.2 et 4.3, montrent que les experts en taxonomie, dont plusieurs sapprtent prendre leur retraite, sont beaucoup plus gs que les autres rpondants. Il faut cependant des annes pour btir un dossier de publications et pour acqurir la reconnaissance de son expertise taxonomique; aussi faut-il se demander si, au fil du temps, les jeunes rpondants dvelopperont une expertise du mme calibre que celui du groupe qui partira bientt la retraite.
70 60 67 61 67

I I

Nombre de rponses

A publi dans le domaine de la taxonomie Na pas publi dans le domaine de la taxonomie 39

50 40 30 20 10 0 13 6 16 7 10 2 3140 4150 5160 6170 0 Plus de 70

23

2030

Groupe dge (annes) (Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 4.3 Rpondants ayant publi dans le domaine de la taxonomie, par groupe dge
La majorit des rpondants ont signal quils ont publi des articles valus par leurs pairs dans le domaine de la taxonomie. Seuls les rpondants titulaires de doctorats ont t comptabiliss.

4.3

L a P Po RT d E P h q LE x P E RT i S E Taxonomiqu E

Pour dterminer si lexpertise taxonomique commenait disparatre, le comit dexperts a fait lanalyse du rseau dalimentation de personnel hautement qualifi (PHQ) qui fait le pont, dans le milieu de la taxonomie au Canada, entre les jeunes tudiants et les experts qui partent la retraite. Tout en reconnaissant que des individus aux formations varies font dimportantes contributions la taxonomie, il nen reste pas moins que pour les besoins de ce rapport, le PHQ fait rfrence ceux qui sont titulaires dun doctorat en lien avec la taxonomie. En particulier, le

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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comit dexperts a tent de dterminer le niveau dintrt que pouvaient avoir les tudiants lendroit de la formation en taxonomie, de mme que la capacit de formation actuelle, et si les tudiants pouvaient, la suite de leur formation, obtenir du financement de recherche, dcrocher un emploi et faire carrire en taxonomie.
La formation

Dans un premier temps, le comit dexperts a examin la distribution par groupe dge des individus titulaires dun doctorat en taxonomie pour dterminer si les jeunes poursuivaient et recevaient une formation taxonomique pousse de cycle suprieur. Alors que lge moyen de la catgorie de rpondants titulaires dun doctorat principalement en taxonomie/systmatique tait de 3 ans plus lev que lge moyen des rpondants ayant reu peu ou aucune formation en taxonomie/ systmatique dans le cadre de leurs tudes doctorales (figure 4.4), ce rsultat nest pas significatif (test bilatral p = 0,07, test de permutation). En effet, prs de la moiti des rpondants de moins de 40 ans (42 %) taient titulaires de doctorats en taxonomie/systmatique.

40 35

35 36 31 28

37

Nombre de rponses

30 25 20 15 10 5 0 0 2030 3140 8 11 11

28

20 14 7 7 4 14 7 2 Plus de 70

4150

5160

6170

Groupe dge (annes) I I


Doctorat en taxonomie/systmatique Doctorat avec une formation partielle en taxonomie/systmatique

Doctorat sans aucune formation en taxonomie/systmatique

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 4.4 Formation doctorale en taxonomie, par groupe dge


La majorit des rpondants sont titulaires dun doctorat en taxonomie/systmatique, ou encore dun doctorat avec formation partielle dans ces domaines. La figure montre que le Canada a continu former des taxonomistes. Onze rpondants nont pas prcis dans quel domaine ils avaient complt leurs tudes doctorales.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Afin de dterminer si, au fil du temps, la taxonomie a t dlaisse au profit de la systmatique, les rsultats ont t filtrs selon le critre de la formation en taxonomie quavaient reue les individus. Les rsultats taient malgr tout similaires; lge moyen des individus titulaires de doctorats principalement axs sur la taxonomie/systmatique et qui avaient galement reu une formation en taxonomie, tait de 1,1 an de plus que celui des autres rpondants, ce qui est une diffrence noter, mme si elle est non significative (p = 0,51, test de permutation). Le fait que les rpondants forms en taxonomie et titulaires de doctorats en taxonomie/systmatique ne soient pas beaucoup plus gs que les autres rpondants indique que les plus jeunes cohortes sintressent toujours la taxonomie. Cela indique que le point dentre du rseau menant lexpertise taxonomique ne sest pas considrablement rtrci. Packer et al. (2009) ont galement not, par le biais de leurs observations personnelles, que le nombre dtudiants manifestant un intrt quelconque pour la recherche en taxonomie na pas diminu.
La capacit de formation en taxonomie

Lintrt soutenu des tudiants canadiens de cycle suprieur pour les mthodes taxonomiques correspond au dsir des taxonomistes canadiens de transmettre leurs comptences et leur savoir taxonomiques aux tudiants; les taxonomistes ont form des milliers dtudiants, et ce, tous les niveaux (voir lappendice 1). Un rpondant a identifi le besoin urgent qui se fait ressentir sur le plan de la formation : Je me prpare vouer le reste de ma vie la formation des jeunes naturalistes et taxonomistes. Jestime quen tant que socit, nous sommes ce point loigns dune vritable comprhension ou connexion aux espaces sauvages que cette situation requiert des mesures correctives urgentes. Cent vingt-quatre rpondants (des 350 rponses) ont rapport quils donnaient des cours de premier cycle prsentant les principes de la taxonomie et de la systmatique, alors que 40 rpondants (des 295 rponses) ont rapport le faire aux cycles suprieurs. Plusieurs de leurs tudiants avaient par la suite poursuivi une carrire en taxonomie. Le problme, toutefois, se situe sur le plan de la diversit de cette formation, parce que la plupart des tudiants provenaient seulement dune poigne de laboratoires. Seuls 11 rpondants, qui approchent tous de la retraite, ont rapport que sur lensemble de leur carrire, plus de cinq tudiants la matrise ou plus de cinq tudiants au doctorat avaient poursuivi une carrire en taxonomie. Puisque plusieurs tudiants sont forms dans quelques laboratoires prcis, il est probable que lexpertise taxonomique devienne de plus en plus concentre au profit des groupes taxonomiques o la formation demeure possible. Lorsquon examine

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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lexpertise taxonomique des diffrents taxons en regard de lge des rpondants (figure 4.5), les jeunes chercheurs, comparativement aux chercheurs plus gs, se concentrent de faon disproportionne sur les insectes et les angiospermes, ce qui suggre une croissance dans ces domaines. loppos, lexpertise rduite parmi les cohortes les plus jeunes se rpartit entre plusieurs groupes taxonomiques. Si cette tendance se maintient, la capacit canadienne de diffrencier des espces indites ou difficiles du point de vue taxonomique se limitera de plus en plus certains groupes despces. Lexpertise taxonomique est dj disproportionnellement basse pour tous les groupes autres que les plantes et les vertbrs, relativement au nombre despces canadiennes dans chaque groupe (voir lappendice 1, figure A1.5); par ailleurs, plusieurs rpondants lenqute ont attir lattention sur des pertes dexpertise taxonomique concernant les algues, les bryophytes, les myctes, certains groupes dinsectes, les isopodes et les amphipodes. Afin dassurer que les experts canadiens continuent de pouvoir reconnatre les espces indignes et autochtones sur lensemble de larbre de la vie, la formation doit tre soutenue pour maintenir une base dexpertise taxonomique globale. Pour quelle soit le plus efficace possible, cette formation doit se faire sous la gouverne de scientifiques spcialiss dans un groupe particulier dorganismes. Un tudiant qui se penche sur la taxonomie des myctes est le mieux servi dans un laboratoire spcialis dans ltude de myctes, et non de conifres ou daraignes. Un arachnologue ne peut adquatement former un tudiant quant aux caractristiques propres aux myctes et leur diversit, ni aux mthodes de collecte et dobservation. Alors que les tudiants peuvent tre forms au sein de leurs institutions dappartenance en techniques molculaires et en taxonomie en gnral, une formation complte exige dtudier un taxon donn. Lorsque cette expertise nexiste pas dans une universit donne ni mme au Canada, le comit dexperts est davis quun soutien logistique et financier de formation dans dautres tablissements et pays est requis pour se prmunir contre un ventuel appauvrissement de lexpertise taxonomique. Bien que le Canada maintienne prsentement une importante capacit de formation en taxonomie, plusieurs membres de la gnration actuelle de taxonomistes partiront bientt la retraite. Afin de renouveler cette capacit de formation, la prochaine gnration dexperts doit avoir accs suffisamment de possibilits demploi et de financement de recherche cibl pour pouvoir poursuivre une carrire en taxonomie. ce propos, un rpondant lenqute soulignait le fait que nous ne devons pas sous-estimer limportance de la recherche taxonomique au Canada, que ce soit dans le domaine de la foresterie, de laquaculture ou de la protection de la biodiversit canadienne. Nous devons trouver de nouvelles sources de financement et de soutien de cette recherche si nous voulons protger et exploiter notre biodiversit de faon durable.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Taxons
Algues Amphibiens et reptiles Angiospermes : dicotyldones Angiospermes : monocotyldones Annlides Bactries Oiseaux Bryophytes Cnidaires et ctnophores Crustacs chinodermes Poissons Fossiles Champignons Gymnospermes Insectes Lichens Mammifres Phylums de petits invertbrs autres Mollusques Nmatodes Autres arthropodes Plathelminthes Spongiaires Protistes Ptridophytes Virus 0 5 10 15 20 25 30 35

Groupe dge (annes) I I I


2040 4160 Plus de 60

Pourcentage (Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 4.5 Taxon tudi, par groupe dge


Cette figure montre le pourcentage de rpondants dun groupe dge donn ayant identifi un taxon spcifique comme tant leur domaine dexpertise taxonomique (par ex., 25 % des rpondants gs dentre 41 et 60 ans ont prcis quils tudiaient les insectes).

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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La disponibilit des emplois

Pour examiner si la disponibilit rduite demplois au Canada dans ce domaine freine la capacit de recherche en taxonomie, le comit dexperts a examin les offres demploi publies dans la revue Science de 1965 2004, par tranches de cinq ans (voir lappendice 4, figure A4.1). Cet exercice a permis de constater que malgr une tendance la hausse du nombre total demplois disponibles dans les sciences de la biodiversit, il ny aurait pratiquement plus douverture de postes en taxonomie. Un seul emploi avait t annonc au Canada en taxonomie au cours des dernires annes examines (1989, 1994, 1999, 2004), comparativement sept au cours des annes prcdentes (1969, 1974, 1979, 1984). Ce dclin dans le nombre de postes annoncs en taxonomie est trs significatif, surtout lorsquon le compare la tendance la hausse dans les autres domaines des sciences de la biodiversit. La perte demplois en taxonomie reflte une volution de la culture universitaire, de mme que des domaines de recherche jugs dsirables par les tudiants. Elle reflte galement des rductions deffectifs associes aux collections, qui sont marques par des retranchements au sein de plusieurs institutions. Pour documenter ltendue de ce retranchement, le comit dexperts a demand 63 collections canadiennes, soit les employeurs traditionnels des taxonomistes, de lui fournir des donnes longitudinales sur les tendances en matire de dotation. Des 46 rponses obtenues, 22 rapportaient une diminution des effectifs taxonomiques, alors que 12 indiquaient plutt une augmentation (les autres 12 collections faisaient tat de stabilit relative en matire deffectifs). La diminution du nombre de postes professionnels de deux collections qui, historiquement, avaient t dimportants employeurs au Canada, tait particulirement frappante (voir le tableau 4.1).
Tableau 4.1 Nombre de professionnels employs par deux des principaux employeurs de taxonomistes
tablissement Collection nationale de plantes vasculaires dAAC (professionnels) Muse canadien de la nature (employs scientifiques titulaires dun doctorat) Annes Annes Annes Annes Annes Annes 2010 1950 1960 1970 1980 1990 2000 1015 n/a 14 n/a 12 n/a 1214 27 68 20 6 18 6 16

(Conseil des acadmies canadiennes)

Ces statistiques ont t obtenues grce aux questions de suivi qui ont t envoyes aux rpondants lenqute.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Le constat de ce dclin trouve cho dans les commentaires de plusieurs autres rpondants : Plusieurs ministres ont connu un constant recul en ce qui a trait au remplacement de postes, y compris des postes individuels reprsentant des ordres entiers (p. ex., araignes, trichoptres). Un autre rpondant a not ce qui suit : Au cours des 30 dernires annes, nous avons perdu deux entomologistes temps plein ainsi quun mycologue temps plein. [] Plusieurs personnes dtenant une expertise taxonomique sont toujours ici, mais nous faisons de moins en moins de taxonomie. Packer et al., (2009) abondent dans le mme sens, rapportant un recul de 13 % (une baisse de 79 69) du nombre de taxonomistes professionnels (professeurs et taxonomistes travaillant au gouvernement) qui sintressent aux insectes et taxons connexes entre 1989 et 1997, soit une priode de huit ans. Plusieurs des rpondants ont indiqu que la pnurie demplois en taxonomie tait un facteur de taille pouvant en dcourager plusieurs poursuivre leurs recherches taxonomiques. Comme lexpliquait un des rpondants : Je me suis toujours beaucoup intress la taxonomie, mais je nai pas poursuivi de carrire dans le domaine parce que tellement peu de possibilits soffraient moi. Une autre personne sest plainte en ces termes : La taxonomie est un domaine qui attire beaucoup de jeunes chercheurs et tudiants canadiens malheureusement, il ny a pas de postes permanents dignes de ce nom dans notre propre pays et nous sommes obligs de nous expatrier ou de changer de profession. Le rseau dapprovisionnement de lexpertise taxonomique se resserre beaucoup lorsque les scientifiques titulaires de doctorats se cherchent un poste en taxonomie. La pnurie demplois en taxonomie constitue pourtant un contraste flagrant avec les besoins dans le domaine, qui se font de plus en plus grands : pour identifier les espces en pril (notamment la suite de la promulgation, en 2002, de la Loi sur les espces en pril), pour faire lvaluation despces introduites et potentiellement envahissantes, et pour dcouvrir et documenter la biodiversit au Canada.
Le financement de la recherche

Mme parmi les taxonomistes qui russissent obtenir un emploi, laccs limit aux fonds de recherche reprsente un autre obstacle de taille pouvant empcher les chercheurs de poursuivre leur travail de recherche taxonomique. Le comit dexperts a valu lvolution des tendances en matire de financement de recherche en faisant lanalyse de donnes tires du Programme de subventions la dcouverte du CRSNG, et en sattardant aux subventions qui se trouvent sous la rubrique Taxonomie, systmatique et phylogntique (code-matire 4709), quil sagisse du code-matire principal ou secondaire. Les analyses ont t limites au Comit de slection des subventions, volution et cologie (CSS 18), o tait regroupe la majeure partie des subventions.

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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La figure 4.6 montre que le nombre de subventions attribues aux chercheurs uvrant en Taxonomie, systmatique et phylogntique a augment au cours des 30 dernires annes, par rapport dautres domaines de lcologie et lvolution. Cette croissance, qui a surtout eu lieu pendant les annes 1990, reflte en partie lajout, en 1990, de la phylogntique au code-matire (le 4709 sappelait auparavant Taxonomie et systmatique ). En effet, il semble que ce changement ne reflte pas en soi une augmentation du soutien de la taxonomie : une analyse axe sur les taxonomistes actifs (identifis par rputation ou par dossier de publications de recherche) a relev un recul de 23 % du nombre de subventions reues dans le cadre du CSS 18 du CRNSG, entre 1991 et 2007 (Packer et al., 2009). Les niveaux de financement ont aussi augment quelque peu pendant cette mme priode, en ce qui a trait aux subventions en Taxonomie, systmatique et phylogntique , par rapport aux autres subventions du CSS 18 (figure 4.7). La croissance de ces subventions qui est observe aprs 1998 (appendice 4, figure A4.2C) et la valeur moyenne des subventions (figure 4.7) dans ce domaine refltent sans doute lallocation supplmentaire, en 1998, de 320 000 dollars verse par le CRSNG en vue daugmenter la capacit taxonomique (Groupe fdral de biosystmatique, 1995; Packer et al., 2009). Laugmentation de la valeur des subventions semble avoir t passagre, toutefois, et le niveau moyen actuel de financement a rejoint celui davant 1998 (figure 4.8).
14 % 14,3 13,3 14,5 13,3 12,4 12,4 11,8 2000 2005 10,0 10,2

Pourcentage de subventions

12 % 10 % 8% 4,8 3,5 3,1 3,7 3,3 3,0 2,2 2,4 1,9 2,6 1985 1990 6% 4% 2% 0% 1980 5,6 9,9 3,6 3,9

Anne (Source des donnes : CRSNG)

Figure 4.6 Pourcentage de subventions du CSS 18 ayant t remises en taxonomie, en systmatique et en phylogntique
Cette figure montre le pourcentage de subventions accordes par le sous-comit de lcologie et de lvolution (CSS 18) du CRSNG des demandes sinscrivant dans la catgorie Taxonomie, systmatique et phylogntique (code 4709, CRSNG, communication personnelle). Voir lappendice 4 pour de plus amples dtails.

12,3 11,7 12,1 11,3 11,9 10,1 11,6 1995

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Valeur de la subvention (dollars canadiens)

35 000 30 000 25,000 20 000 15 000 10 000 5 000 0 1980 1985 1990 1995 2000 2005

I I I

4709 du CSS 18 CSS 18 Ensemble du CRSNG

Anne (Source des donnes : CRSNG)

Figure 4.7 Valeur moyenne des subventions du CRSNG Tendances, de 19781979 20082009
Cette figure montre la valeur moyenne des subventions accordes dans le cadre de lensemble du Programme de subventions la dcouverte du CRSNG (bleu CRSNG, 2007), du sous-comit de lcologie et de lvolution (CSS 18, jaune CRSNG, communication personnelle), et de la sous-section du CSS 18, catgorie Taxonomie, systmatique et phylogntique (vert CRSNG, communication personnelle) (voir lappendice 4 pour de plus amples dtails).

Valeur de la subvention (dollars canadiens)

50 000 45 000 40 000 35 000 30 000 25 000 20 000 15 000 10 000 5 000 0 1980 1985 1990 1995 2000 2005

I I I

4709 du CSS 18 CSS 18 Ensemble du CRSNG

Anne
(Source des donnes : CRSNG)

Figure 4.8 Valeur moyenne des subventions Tendances, exprimes en dollars constants de 2010
Les dtails sont les mmes que pour la figure 4.7, ceci prs que les montants sont exprims en dollars constants de 2010 (voir lappendice 4 pour de plus amples dtails).

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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La tendance globale laugmentation de la valeur des subventions, qui sobserve la figure 4.7, peut porter confusion, toutefois, parce quil faut prendre en compte la dvaluation du dollar canadien par linflation. La valeur des subventions en dollars constants de 2010 a diminu pour toutes les catgories du CSS 18, surtout au cours de la dernire dcennie (figure 4.8). Dans la mesure o le code-matire 4709 est reprsentatif, ces donnes indiquent que les analyses taxonomiques, systmatiques et phylogntiques ont vu leur financement total augmenter par rapport dautres domaines en cologie et en volution. En termes absolus, cependant, tous ces domaines ont souffert, entre 1991 et 2007, des niveaux stagnants du financement total par chercheur index linflation (figure 4.8). De plus, une analyse plus spcifique portant sur les taxonomistes praticiens a permis de constater une baisse de 45 %, entre 1991 et 2007, du financement total index linflation (Packer et al., 2009), ce qui indique que les taxonomistes ont souffert de manire disproportionne de financement faible en provenance du CRSNG, comparativement aux non-taxonomistes financs en vertu du code-matire 4709. Bien quil soit difficile de documenter les tendances en matire de cots de recherche, deux aspects de la recherche en taxonomie et en systmatique semblent toutefois indiquer que les cots augmentent plus rapidement que le taux dinflation. Tout dabord, les dplacements sont partie intgrante de la recherche en taxonomie et en systmatique, tant pour la collecte sur le terrain de spcimens que pour la recherche dans les muses et autres collections de spcimens pertinents. Selon lindice des prix la consommation de 2010, les cots de transport et dnergie ont augment de 55 % et de 67,8 % pour la priode entre 1991 et 2009, respectivement, dpassant laugmentation du cot de la vie au Canada, qui tait de lordre de 38,5 % (Statistique Canada, 2010). Par ailleurs, les tudes taxonomiques viennent de plus en plus complter les donnes morphologiques traditionnelles par des analyses gntiques molculaires, ce qui augmente le cot li aux descriptions despces. En effet, au cours de la dernire dcennie, plus de 35 % des publications dcrivant de nouvelles espces font mention de donnes danalyses molculaires, que ce soit dans le titre, le rsum ou les mots cls, une augmentation de moins de 5 % dans les annes 1980 et de moins de 25 % dans les annes 19907. Ces donnes dmontrent quune analyse exhaustive des cots lis la recherche pourrait bien laisser transparatre une importante rosion du pouvoir dachat des subventions de recherche en taxonomie et en systmatique. Le commentaire rvlateur dun rpondant lenqute rsume les sentiments exprims par nombre dautres rpondants : Le peu de financement qui existe suffit souvent peine soutenir un tudiant de troisime cycle, et il reste souvent peu de fonds pour lachat de fournitures, pour le travail sur le terrain ou pour les analyses dADN.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

4.4

L a T En d a nC E E n m aT i R E dE Pu bLi CaTion

Avec peu de possibilits demploi et de financement, plusieurs stagiaires en recherche taxonomique cherchent rorienter leur carrire. Par consquent, le comit dexperts a mis de lavant lhypothse que les contributions canadiennes la recherche taxonomique, jadis importantes, pourraient, avec le temps, accuser un recul. Afin de vrifier cette hypothse, le comit dexperts a eu recours au Web of Knowledge8 (Rseau du savoir) pour suivre, de 1973 aujourdhui, la proportion darticles en taxonomie crits par des auteurs qui donnent le Canada comme pays de rsidence (Thomson Reuters, 2010). Spcifiquement, une recherche de sujet a t effectue au moyen des cls de recherche n.sp. or sp.nov. (n.sp = sp.nov; nouvelle espce), lesquelles sont rgulirement utilises dans les articles taxonomiques qui dcrivent de nouvelles espces. Bien que le Web of Knowledge ne soit pas une base de donnes exhaustive, dans la mesure o elle ne contient pas toutes les sources taxonomiques, elle demeure quand mme importante, les articles sur les nouvelles espces tant tirs de 3 411 diffrentes sources (les quatre sources les plus frquentes tant les suivantes : International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology, Zootaxa, Journal of Parasitology, et International Journal of Systematic Bacteriology). Le message est clair : le Canada est en perte de vitesse en tant que chef de file mondial en taxonomie. Parmi les nations du G20 et les pays membres de lUnion europenne numrs dans le tableau 4.2, le Canada est pass de la 6e place quil occupait dans les annes 1980, la 14e place dans les annes 2000. Seule lInde (qui est passe de la 5e la 15e place) a accus un recul plus important. Quant au nombre total de publications, la contribution du Canada a connu une baisse de 30 % au cours des trois dernires dcennies, passant de 4,5 % du total mondial, dans les annes 1980, 3,1 % dans les annes 2000. Le dclin de la production du savoir taxonomique ne trouve pas cho dans les autres domaines des sciences de la biodiversit. Les recherches faites dans le Web of Knowledge en cologie de lvolution, en systmatique et en phylogntique ont permis de dceler une croissance, de lgre apprciable, relativement au nombre total darticles publis travers le monde sur ces sujets (appendice 4). Il est raisonnable de conclure que la rduction du nombre demplois en taxonomie a dj eu un impact ngatif sur la capacit canadienne dans ce domaine. Pour reprendre les propos dun rpondant lenqute : Il est triste de constater

Recherche dans la base de donnes Web of Science (25 juillet 2010), au moyen des cls suivantes : Compare les sujets=((n.sp or nov.sp) et (molecular or DNA or sequence)) sujet=(n.sp or nov.sp). http://wokinfo.com/

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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que le Canada, le chef de file mondial incontest en matire de formation et de dveloppement de taxonomistes et de systmaticiens pendant les annes 1960 et jusquaux annes 1980, voire jusquaux annes 1990, ne joue plus, dans les faits, ce rle de chef de file. De pair avec les taux de publication la baisse, on a assist, au Canada, une rduction de la capacit de publier des traits en taxonomie (monographies et rvisions). En mars 2010, les Presses scientifiques du CNRS ont mis fin leur travail de publication et ont transfr leurs publications savantes un organisme sans but lucratif. Malheureusement, leur srie de monographies trs respecte na pas t transfre. Ces publications ont traditionnellement servi dimportants vhicules aux dcouvertes taxonomiques; notons en particulier une srie intitule Les insectes et arachnides du Canada et de lAlaska, ainsi que dimportants ouvrages sur la biodiversit canadienne, dont Flora of the Yukon Territory (Flore du territoire du Yukon) et Climate Change & Northern Fish Populations (Changement climatique et populations ichtyologiques du Nord). La baisse du nombre de contributions techniques des taxonomistes canadiens aux efforts mondiaux visant dcouvrir et classifier de nouvelles espces reflte et met laccent sur la ralit de la rduction de la capacit taxonomique et de la formation de PHQ au Canada. Les propos suivants, tenus par un rpondant, traduisent le sentiment daccablement dans cette discipline : En tant que chercheur postdoctoral, il me faut des publications et des subventions ayant un impact important qui me permettront de me dmarquer lorsque je postule un emploi. Une seule description despce exige plus de travail que de mener une exprience, mais ne contribue en rien ma carrire. Je me demande parfois si mes descriptions despces ne seraient pas plutt des taches dans mon CV.
Les risques associs la pnurie de connaissances spcialises

Tel que prcis dans les sections prcdentes, le Canada est aux prises avec une pnurie de plus en plus importante en taxonomie, en raison du dpart la retraite de nombre dexperts, de possibilits demploi limites qui contribueraient pourtant renouveler cette expertise, et du dclin de la contribution canadienne aux dcouvertes taxonomiques et aux publications dans ce domaine. Cette pnurie continuera de compromettre la capacit du Canada de grer la durabilit de sa biodiversit et mnera des occasions manques sur le plan de la dcouverte despces. Les espces disparaissent un rythme plus rapide que la capacit des taxonomistes de les dcrire (Hambler et Speight, 1996), une situation qui ne fera que saccentuer si la perte dexpertise taxonomique se poursuit. En effet, lrosion

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Tableau 4.2 Classement des contributions, par pays, aux descriptions de nouvelles espces
Pays tats-Unis Chine Allemagne Japon France Royaume-Uni Australie Brsil Espagne Core du Sud Russie Italie Belgique Canada Inde Argentine Pays-Bas Mexique Sude Afrique du Sud Autriche Suisse Turquie Norvge Indonsie Arabie saoudite Nombre, travers le monde 19801989 1 (2916) 10 (189) 21 (81) 8 (431) 3 (685) 2 (731) 7 (530) 17 (110) 12 (163) 25 (8) 4 (669) 9 (200) 13 (149) 6 (621) 5 (666) 19 (100) 11 (169) 18 (103) 15 (119) 14 (142) 20 (94) 16 (114) 24 (10) 22 (78) 26 (5) 23 (20) 13 694 19901999 1 (3171) 10 (582) 3 (1405) 4 (1178) 2 (1469) 5 (1151) 6 (1016) 13 (394) 9 (597) 22 (125) 11 (508) 7 (648) 12 (445) 8 (632) 14 (374) 16 (292) 15 (342) 21 (175) 18 (267) 17 (275) 20 (207) 19 (252) 24 (38) 23 (124) 26 (9) 25 (14) 15 766 20002009 1 (5413) 2 (3627) 3 (2968) 4 (2541) 5 (2153) 6 (1893) 7 (1650) 8 (1566) 9 (1344) 10 (1274) 11 (1145) 12 (1022) 13 (980) 14 (926) 15 (791) 16 (685) 17 (652) 18 (581) 19 (465) 20 (444) 21 (428) 22 (366) 23 (235) 24 (210) 25 (90) 26 (46) 29 151

(Source des donnes : Thomson Reuters, 2010)

Le nombre de publications rpertori par Web of Knowledge et contenant les rubriques n.sp. ou sp.nov , par ordre de pays o lauteur est domicili. Le nombre entre parenthses montre le nombre total darticles pour cette priode. Le nombre de publications mondiales est galement prsent. Veuillez noter que les articles figurant parmi les publications mondiales peuvent figurer plus dune reprise dans le tableau sils sont signs par plusieurs auteurs domicilis dans des pays diffrents (dtails lappendice 4).

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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de lexpertise canadienne touchant plusieurs groupes taxonomiques, y compris les mollusques terrestres et deau douce, les lichens et les mousses, rend la tche difficile au COSEPAC, qui tente de pourvoir des postes dans plusieurs de ses sous-comits. Cette situation a pouss le COSEPAC se tourner vers des spcialistes trangers, lesquels peuvent tre moins familiers avec les problmatiques cologiques et juridiques propres aux espces en pril au Canada. Les risques associs des lacunes sur le plan de lexpertise taxonomique sont multiples. Le Canada sexpose des erreurs didentification despces introduites et des donnes inexactes quant leur talement et leur nuisibilit (p. ex., Choudhury et al., 2006). Sans lexpertise ncessaire pour identifier les espces, il est possible que lon attribue erronment la prestation de services cosystmiques la mauvaise espce, ou que lon faille distinguer les diffrences propres une espce en ce qui a trait la transmission de maladies, au potentiel de biorestauration ou au niveau denvahissement (Bortolus, 2008). Le Canada pourrait ainsi devenir incapable dvaluer le recul despces de taxons indignes (Haas, 1998) et dimportants fournisseurs de services cosystmiques. En guise dexemple, les pollinisateurs fournissent un service cosystmique vital (par le biais de la fertilisation) lagriculture, mais il nen demeure pas moins quil y a une lacune de plus en plus grande en expertise taxonomique permettant lidentification des pollinisateurs. Un rapport publi en 2008 par la Fdration canadienne de la faune dcrivait ainsi le dfi qui se pose : Un nombre de recommandations conues pour ralentir le dclin des pollinisateurs exige des connaissances des espces qui se trouvent dans un environnement donn. [] Toutefois, en ce qui a trait lapprofondissement des connaissances relatives aux espces, il est souvent difficile de trouver un expert pouvant faire lidentification ou la validation de spcimens. La baisse du nombre de spcialistes en taxonomie spcialiss en insectes pollinisateurs est aussi proccupante que lest le dclin de ces insectes (Chagnon, 2008). La taxonomie est galement la cl qui permet de comprendre et de prdire les changements dans lArctique, comme discut dans lencadr 4.2. Pour renverser la vapeur de cette lacune grandissante en expertise taxonomique au Canada, les preuves prsentes dans ce chapitre indiquent que le rseau de PHQ doit tre largi lendroit mme, dans le processus, o les tudiants commencent chercher de lemploi; il faut encore quil y ait un soutien et une reconnaissance plus grands des activits auxquelles sadonnent les taxonomistes. Sans un tel soutien, la capacit dinventorier la biodiversit du Canada et de documenter les changements dabondance des espces et de composition des cosystmes sera grandement mise en pril.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 4 .2 La taxonomie dans lArctique


Les effets du changement climatique sont dj manifestes dans lArctique (GIEC, 2007). Le rapport intitul Perspectives mondiales sur la diversit biologique 3 (CDB, 2010) dcrit en quoi la diminution de la glace de mer arctique menace tout un biome, mettant en pril nombre dalgues, dinvertbrs, de poissons et de mammifres adapts la vie sur ou sous la glace. Dautres habitats sont galement menacs, et des tudes palolimnologiques ont montr que certains tangs, qui existent depuis des millnaires et qui fondent pendant de brves priodes chaque t, sasschent dsormais (Smol et Douglas, 2007). En outre, le changement climatique expose lArctique une activit conomique accrue (p. ex., lindustrie minire, le forage ptrolier et gazier, et le tourisme). Ce changement rapide rend encore plus urgente la ncessit de dcouvrir et de comprendre la biodiversit de lArctique. Le Canada a une responsabilit vis--vis du monde, soit de dcouvrir, dapprendre des informations quamassent ses chercheurs sur la biodiversit dans lArctique, des microbes au buf musqu, et de partager ces informations avant quelles ne soient perdues jamais. Il faut des donnes pour mesurer le changement environnemental au fil du temps. Plusieurs importantes initiatives tentent dy parvenir, dont les programmes lis lAnne polaire internationale (API)9, qui avaient attir lattention du milieu scientifique sur lArctique, entre 2007 et 2009, le Recensement de la vie marine arctique10 et le Programme de surveillance de la biodiversit circumpolaire du Conseil de lArctique11, Whitehorse, au Yukon. Ces efforts et dautres, similaires, exigent toutefois un soutien et doivent prendre de lampleur, puisquune identification de lensemble des espces est requise pour raliser des valuations environnementales pousses en vue de projets de dveloppement, et pour suivre limpact environnemental que peuvent avoir ces projets.

4.5

LE S a uT R E S d T En T E u R S d u Sav oi R Ta x o n o m i q uE a u C a n a d a

La premire partie de ce chapitre sest penche sur la situation des taxonomistes hautement qualifis, titulaires dun doctorat ou lquivalent. Le reste du chapitre explore le rle essentiel du savoir taxonomique, ainsi que les collaborations entre les diffrents dtenteurs de savoirs, essentiels pour pleinement comprendre la biodiversit canadienne.
9 10 11

http://www.ipy.org/ http://www.coml.org/projects/arctic-ocean-diversity-arcod http://cbmp.arcticportal.org/

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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La taxonomie et le savoir traditionnel

Le lien mergent et volutif entre le savoir traditionnel et la science est dune grande pertinence pour la taxonomie au Canada, o des communauts autochtones tablies depuis longtemps sont en mesure de contribuer la comprhension globale despces et dcosystmes. Dans les preuves quil a soumises au comit dexperts, Henry Lickers (citoyen haudenosaunee membre de la nation snca et directeur du service de lenvironnement du Conseil des Mohawks dAkwesasne), expliquait ce qui suit : En raison de leurs utilisations mdicinales et nutritives, les espces et leurs cosystmes uniques sont connus des peuples autochtones. Comme se plaisait dire mon grand-pre : Toutes les espces taient connues et notre peuple en chantait les louanges. Plusieurs communauts autochtones sont aujourdhui fort proccupes de la disparition soutenue de leur savoir spcialis sur la biodiversit (voir aussi la section 2.3). Par exemple, les changements de lenvironnement social et naturel de lArctique canadien ont min le savoir cologique des Inuits : les enfants ne connaissent plus le nom des plantes et des animaux, ne savent plus pcher ni chasser le caribou, et ne sont plus en contact avec leur environnement (UNESCO, 2009). Le bulbe du quamassie, qui est dcrit dans lencadr 4.3, est un autre exemple de cette dgradation du savoir. Les raisons de cette rosion du savoir cologique autochtone sont complexes et plurielles, et impliquent une combinaison de facteurs sociaux, culturels et environnementaux.

Encadr 4 .3 Le dclin du savoir cologique : le bulbe du quamassie


Lhistoire du bulbe comestible du quamassie, une sorte de lys (Camassia spp. Lindl), nest quun des exemples qui illustrent le dclin du savoir cologique traditionnel (Turner et Turner, 2007, 2008). Le quamassie fut jadis une des plus importantes sources de nourriture des peuples autochtones de la cte Salish (Colombie-Britannique). Le bulbe, auquel on attribuait des valeurs spirituelles et culturelles et qui tait au cur de crmonies, de danses et dhistoires, se mangeait au repas familial comme aux festins et aux potlatchs. La rcolte du quamassie, sa prparation et sa consommation taient auparavant vitales la transmission intergnrationnelle des connaissances et de la culture, la gestion de lcosystme du quamassie tant un processus sophistiqu et complexe. Avec le temps, toutefois, le savoir associ au quamassie, de mme que son utilisation, ont priclit au point de tomber presque entirement dans loubli.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Avec le dclin du savoir traditionnel dans nombre de communauts, il est impratif que ce savoir soit li plus efficacement aux sciences de la biodiversit, et ce, par le biais de lducation interculturelle, notamment. Il est possible daugmenter la formation des tudiants issus des traditions autochtones et occidentales; ceux-ci peuvent alors travailler dans ces deux contextes culturels. Certaines universits ont tabli des programmes autochtones (p. ex., lUniversit Trent, lUniversit de lAlberta), alors que certains centres de recherche se penchent sur les proccupations autochtones concernant lintgrit de leur culture et de leur environnement (p. ex., le Centre de nutrition et denvironnement des peuples autochtones (ou CINE, pour Centre for Indigenous Peoples Nutrition and Environment), sous les auspices de lUniversit McGill). Des disciplines telles lethnobiologie, lethnobotanie, lethnocologie et lethnozoologie prennent par ailleurs de plus en plus dimportance. Les collaborations entre scientifiques et experts autochtones sadonnant la taxonomie pourraient mener des mthodes de collecte de donnes et de conservation, de mme qu des bases de donnes et de transmission des donnes qui soient de calibre plus lev. Les partenariats composs dobservateurs autochtones, de biologistes, de taxonomistes et dcologistes pourraient galement donner lieu de nouveaux cadres de comprhension de lhistoire de la biodiversit au Canada, des changements environnementaux venir et de stratgies de gestion de la biodiversit. Parmi les partenariats considrs comme des russites, nous retrouvons : ArcticNet, membre des Rseaux de centres dexcellence du Canada, rassemble des scientifiques et des gestionnaires en sciences naturelles, de la sant et sociales, dune part, et leurs partenaires issus des organisations inuites, les communauts du Nord, les agences fdrales et provinciales et le secteur priv, dautre part, pour tudier limpact du changement climatique sur les milieux ctiers de lArctique canadien; Le Programme sur la biodiversit nordique (Universit McGill), qui se sert dinsectes et daraignes pour surveiller les changements environnementaux dans les rgions coclimatiques borale, subarctique et nord-borale; et LUnit de recherche de la pche autochtone (Aboriginal Fisheries Research Unit) de lUniversit de la Colombie-Britannique, qui intgre le savoir traditionnel, lcologie aquatique, la lichtyobiologie et la taxonomie pour soutenir la gestion des ressources des peuples autochtones. Outre ces exemples universitaires, il existe plusieurs heureux partenariats communautaires qui facilitent le partage du savoir rgional de la biodiversit, dont la Cooprative du savoir cologique des terres frontalires de lArctique (Arctic Borderlands Ecological Knowledge Co-op), le Programme de surveillance gnrale du Nunavut, et le Programme des Territoires du Nord-Ouest de surveillance de

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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limpact cumulatif (NWT CIMP, pour Northwest Territories Cumulative Impact Monitoring Program). Le fait que chercheurs et experts autochtones travaillent ensemble sur un mme pied dgalit par le biais dchanges, dans les centres de recherche, ou sur le terrain, ce qui leur permet dexplorer les interrelations entre leurs faons de penser respectives peut mener de nouvelles approches et dcouvertes en sciences de la biodiversit. Les dirigeants autochtones invits fournir des preuves au comit dexperts ont soulign limportance dassurer ce dynamique change du savoir dans un cadre juste et quitable.
Le rle des naturalistes communautaires

Les naturalistes, dont les ornithologues, les observateurs dinsectes, les jardiniers et amateurs de plantes, de mme que les cueilleurs de champignons, ont des contributions essentielles faire lexpertise canadienne en matire de biodiversit. Ces personnes connaissent trs bien les espces qui vivent dans leur rgion et jouent bnvolement un grand rle dans la documentation et la reconnaissance des changements touchant la biodiversit. Certains naturalistes sorganisent en socits dhistoire naturelle ou en groupes similaires, mais les membres de ces organisations vieillissent et le recrutement de nouveaux membres semble tre problmatique. Par exemple, la Socit de lpidoptristes (Lepidopterists Society), un regroupement nord-amricain de naturalistes amateurs et professionnels, connat un dclin de 5 % 10 % par dcennie depuis 1985, et, fait plus alarmant encore, lge moyen de ses membres augmente de six mois chaque anne (F. Sperling, communication personnelle). Lurbanisation croissante des collectivits canadiennes a par ailleurs rduit de faon dramatique le lien entre les jeunes et la nature; depuis un sicle, le nombre de Canadiens qui vivent en milieu urbain plutt que rural a doubl, dpassant maintenant le seuil des 80 % (Statistique Canada, 2006b). Ce phnomne, que lon observe partout au monde, est bien dcrit dans louvrage de Richard Louv, intitul Last Child in the Woods: Saving our Children from Nature Deficit Disorder (Le dernier enfant dans les bois : Sauver nos jeunes du trouble du dficit de la nature) (Louv, 2008). Ce livre nous montre les bienfaits de la nature sur la sant et le bien-tre des enfants. La nature, pour les enfants qui lexplorent et sen inspirent, contribue leur dveloppement motionnel et intellectuel, tout en soutenant le dsir de protger et de restaurer leur environnement (Miller, 2005). Reconnaissant le besoin dtre un tmoin de la nature, le rseau Faites connaissance (Get to Know Society, 2010) a conclu des partenariats avec plus de 100 institutions en vue de promouvoir, au Canada, lapprciation de la nature et la littratie ce sujet. Bien quil ny ait jamais eu si peu de Canadiens vivant en contact direct avec la nature, le public valorise de plus en plus la biodiversit et accorde la priorit la prservation de la nature. Lorsquon demande aux Canadiens de dterminer

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

quoi devraient servir leurs impts, ceux-ci placent La protection de notre environnement, de nos cosystmes et de notre biodiversit et La rduction de la pauvret et des ingalits de la richesse au Canada en tte de liste des 20 investissements faire en vue damliorer leur qualit de vie (Rudd, 2010). Les Canadiens accordent par ailleurs une grande valeur pcuniaire la prservation des espces en pril, se disant prts dbourser des dizaines de millions de dollars pour prserver des espces comme le requin-taupe commun, et jusqu des centaines de millions pour le saumon de lAtlantique (Rudd, 2009). Le dsir de renouer avec la nature et de la prserver se manifeste dans le grand nombre de contributions aux bases de donnes comme lEncyclopdie de la vie (Encyclopedia of Life)12 et le nombre croissant de collaborations amateurs-experts par lentremise de BioBlitz et du Recensement des oiseaux de Nol (Christmas Bird Counts)13 (voir le chapitre 6). En effet, il y a un rseau de plus en plus grandissant de programmes de science citoyenne, comme ceux qui sont soutenus financirement par Environnement Canada, dont Attention grenouilles14, Veille aux vers15, et Oprations floraison16, qui servent recueillir des informations nationales sur la sant des cosystmes. Pour que le Canada documente adquatement les tendances dans le domaine de la biodiversit canadienne au cours des prochaines dcennies, il faut tablir un cadre de travail qui incorpore les contributions communautaires afin de documenter et de surveiller les espces conjointement avec les efforts du secteur industriel, dorganisations non gouvernementales (ONG), de gouvernements et duniversits. La science citoyenne est une composante importante qui facilite lchantillonnage dun plus grand nombre demplacements, et ce, plus frquemment. Or, pour tre efficace, la science citoyenne doit tre combine lexpertise scientifique (voir lencadr 4.4), surtout lexpertise taxonomique, pour rduire les risques didentifications errones et de collections de donnes insuffisantes. Elle doit galement recevoir, un financement suffisant pour utiliser ces contributions de faon optimale. titre dexemple dun tel partenariat, mentionnons que les images affiches lEncyclopdie de la vie doivent tre attestes par un expert avant quon ne leur enlve la vignette Na pas encore fait lobjet dune vrification .

12 13 14 15 16

http://www.eol.org/ http://www.bsc-eoc.org/national.html http://www.naturewatch.ca/francais/frogwatch/pq/ http://www.naturewatch.ca/francais/wormwatch/ http://www.naturewatch.ca/francais/plantwatch/

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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Les programmes de naturalistes communautaires, lorsquils sont adquatement financs et bien grs, sont la source dinformations valables sur la biodiversit, peuvent aider les Canadiens dvelopper une expertise en biodiversit et favorisent un intrt pour lenvironnement naturel et le respect de celui-ci. Ils peuvent permettre au Canada dutiliser lexpertise taxonomique existante comme levier pour valuer un plus grand chantillon despces canadiennes et pour tendre la porte gographique de ses donnes. De tels efforts btissent aussi des communauts relles et virtuelles bien verses en biodiversit, qui peuvent interpeller et inspirer de nouvelles gnrations de naturalistes et de taxonomistes.

Encadr 4 .4 La valeur dune population alerte


Limportance du rle des naturalistes communautaires se voit avec lexemple du longicorne asiatique (de la famille des crambycids), qui sattaque impitoyablement plusieurs sortes darbres, et surtout aux rables. La prsence de ce coloptre en Amrique du Nord fut dabord remarque par des rsidants de New York, qui ont alert les autorits la suite de dommages inhabituels subis par les arbres de leur quartier (Milius, 1999). Cest alors quun taxonomiste spcialiste de ce coloptre crambycid a pu en identifier lespce et sa provenance, ce qui a permis de mettre en place une campagne dradication efficace. titre de comparaison, Halifax, labsence dexpertise taxonomique locale a retard dune bonne dcennie la sensibilisation une invasion semblable dune autre espce, soit du longicorne brun de lpinette; mme si des spcimens de rfrence obtenus dans le cadre dune enqute gnrale avaient dj t dposs dans une collection rgionale (Smith et Hurley, 2000).

En investissant dans les rseaux de biodiversit qui viennent catalyser les changes dinformation entre citoyens de la science et taxonomistes, de mme quavec les parties intresses de lindustrie et du gouvernement, le Canada a le potentiel de dvelopper un systme labor de surveillance de la propagation despces envahissantes et du dclin despces indignes.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

La formation de taxonomistes en premire ligne

Bien que ce rapport ait mis laccent sur le statut des taxonomistes qui exercent leur profession ceux qui dcrivent les nouvelles espces, qui revoient notre comprhension des liens qui unissent les espces, et qui nous enseignent comment faire la distinction entre espces les individus forms pour se servir du savoir taxonomique et pour le mettre en application jouent aujourdhui un rle critique au Canada. Souvent forms au baccalaurat et la matrise, les praticiens qui ont appris reprer et identifier une espce dans la cl de classification sont sur les premires lignes de la description et de la surveillance de la biodiversit au Canada. De telles personnes travaillent au gouvernement, au sein dONG, et dans les universits, ou encore, sont des bnvoles qui effectuent une gamme de tches essentielles notre capacit dvaluer la sant de la biodiversit canadienne, dont les suivantes : valuations environnementales et noncs dincidences Rapports sur les espces en pril Enqute sur la biodiversit Analyses agricoles des plantes nuisibles et envahissantes Contrle frontalier despces en voie de disparition ou non indignes Guides naturalistes Les Canadiens forms en taxonomie jouent galement un rle cl dans la dcouverte despces, dans la mesure o ils sont le lien entre la communaut des naturalistes et les experts en taxonomie qui peuvent dcrire les espces en question. mesure que la science citoyenne en vient jouer un rle cl dans les enqutes sur la biodiversit, ce cadre dexperts fera le pont en validant les identifications et autres donnes. Pour jouer ce rle critique de pont, toutefois, ces experts doivent tre forms. Eu gard au nombre de taxonomistes qui va diminuant dans les milieux universitaires, le Canada pourrait tre en voie de perdre sa capacit de dispenser des cours axs sur diffrents groupes despces. Les cours parrains et les ateliers ouverts aux tudiants de toutes les parties du pays seraient une excellente faon pour le Canada de maximiser la capacit taxonomique que nous parvenons retenir. Le financement de ces cours pourrait cibler les groupes pour lesquels le Canada affiche un manque dexpertise (figure 4.5 et appendice 1, figure A1.5) et les groupes ayant une importance conomique quelconque. Idalement, ces cours seraient offerts aux tudiants de premier cycle comme aux membres du public et du secteur priv dont le travail bnficierait dune telle formation.

Chapitre 4 Lexpertise canadienne en recherche taxonomique

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La collaboration des diffrents dtenteurs du savoir taxonomique

En investissant dans la formation et les rseaux de biodiversit qui viennent catalyser lchange dinformations parmi les dtenteurs du savoir traditionnel, des citoyens de la science et des taxonomistes, le Canada serait en mesure de dvelopper un systme de surveillance labor partir de la propagation des espces envahissantes, comme le longicorne asiatique, ou encore du dclin despces indignes. Le pays serait mieux positionn pour comprendre, surveiller et amliorer les changements des cosystmes provoqus par lactivit humaine, tant lchelle locale que globale. Il monterait un inventaire plus complet de nos ressources naturelles. Celles-ci soutiennent et inspirent notre socit et sont source de produits pharmaceutiques, dantibiotiques et denzymes qui sont vitaux lindustrie. Ensemble, les Canadiens peuvent raliser un des plus importants et ambitieux projets scientifiques qui soit : dcouvrir et documenter lensemble de la biodiversit qui se trouve sur leur territoire.

Points saillants du chapitre


Il fut un temps o le Canada tait un chef de file en taxonomie, mais depuis 30 ans, sa situation accuse un recul important. Lintrt de la part des tudiants est toujours manifeste et on continue de former des taxonomistes, mais on sinquite de labsence de renouvellement de lexpertise existante. Les possibilits demploi sont trs faibles; les tudiants dans ce domaine ont tendance dlaisser la taxonomie pour tre embauchs dans dautres domaines et publier dans des revues savantes qui auront un impact important. Les niveaux de financement de recherche stagnent. La pnurie demplois et de financement en taxonomie a men une rduction dramatique de la contribution canadienne aux efforts mondiaux visant dcouvrir et dcrire la biodiversit de la Terre. Les collaborations entre les dtenteurs traditionnels du savoir, les citoyens de la science, lindustrie, les gouvernements et les universits sont la cl de la surveillance et de la documentation des changements de la biodiversit, et passent entre autres par des programmes de surveillance long terme.

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Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Chapitre 5

Les collections taxonomiques du Canada

Les collections biologiques sont le fondement de la recherche taxonomique, la somme danciennes recherches et le fondement de recherches futures. Les collections canadiennes, un trsor national qui compte plus de 50 millions de spcimens et qui augmente sans cesse, requirent une stratgie nationale et des investissements fdraux pour les prserver et les dvelopper pour les gnrations futures.

Une collection biologique est une banque de connaissances; chaque spcimen y reprsente une vaste somme dinformation qui est encode dans ses gnes et qui sexprime dans sa morphologie. Il sagit galement dune banque dinnovations dans la mesure o les espces, nombreuses et diverses, qui y sont reprsentes sont des volutions innovatrices que lhumanit peut exploiter titre daliments, de produits pharmaceutiques et dautres biens et services. Les expositions musales et les outils denseignement lis aux collections biologiques inspirent le public, et sont particulirement populaires auprs des enfants. Le personnel des collections musales visite rgulirement les coles et les organisations de naturalistes pour que le public sintresse la nature et lapprcie. Le taux de frquentation des muses est trs lev : par exemple, environ 300 000 visiteurs se rendent au Muse du Manitoba chaque anne; le Muse canadien de la nature attire 250 000 visiteurs par anne, mme pendant ses rnovations, et le Muse royal de lOntario a reu prs dun million de visiteurs lanne qui a suivi ses rnovations fort importantes. Les quelque 50 millions de spcimens qui se trouvent dans les collections biologiques canadiennes dont les plus vieilles remontent au dbut du XIXe sicle, revtent la plus grande importance pour les tudes sur la biodiversit. Les collections canadiennes comptent plus de 80 000 spcimens types partir desquels les espces et sous-espces ont t dcrites. Une bonne partie de ceux-ci se trouvent au Canada, mais nos collections contiennent plusieurs spcimens, y compris un certain nombre de spcimens types, despces que lon trouve dans dautres parties du monde. Ce chapitre examine ltat actuel des collections canadiennes de spcimens biologiques (section 5.1), leurs installations de maintenance et de conservation (section 5.2), et les institutions qui logent et tudient les spcimens, dont leur mode dorganisation et de gouvernance et leurs politiques (section 5.3). La composante finale des collections biologiques les donnes est traite au chapitre 6.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 5 .1 Le Colias johanseni : un papillon de lre glaciaire arctique est-il menac par le changement climatique?
Lorsque la dernire re glaciaire, avec ses nappes glaciaires hautes dun mille, sest abattue sur le Canada il y a 100 000 ans avant de se retirer il y a 20 000 ans, elle a failli liminer presque toutes les populations de papillons. Quelques espces reliques ont toutefois russi se rfugier labri de la glace, dans les hautes montagnes ou encore les rgions ctires. Il sagit des plus vieilles populations de papillons toujours (Gracieuset dAgriculture et Agroalivivantes au Canada, et elles sont donc, mentaire Canada, Collection nationale ce titre, dun norme intrt tant sur le plan canadienne dinsectes et darthropodes) scientifique que sur celui de la conservation. Un des papillons les plus intressants de cette poque est le Colias johanseni (Troubridge et Philip). Un seul spcimen de ce papillon a t dcouvert; ctait en 1916, par Fritz Johansen, membre dune expdition infortune en Arctique. Le spcimen (voir la photo) a t prlev au port Bernard, sur la cte arctique canadienne, et sest retrouv ensuite dans la Collection nationale canadienne (CNC) Ottawa, reposant dans un tiroir, aux cts despces qui lui ressemblaient et qui provenaient des montagnes Rocheuses. Pendant les annes 1990, aprs avoir not, sur la vignette, la rfrence inhabituelle concernant la provenance du papillon, puis la suite dune contre-vrification du journal de Johansen, deux taxonomistes, Jim Troubridge et Kenelm Philip, se sont rendus leur tour au port Bernard et ont trouv dautres individus de cette espce sur une colline qui avait t identifie par Johansen. la suite dune vrification dtaille de la documentation et des spcimens despces similaires, les chercheurs ont dtermin que ce papillon tait une nouvelle espce : une espce endmique au Canada qui semble avoir survcu lre glaciaire de locan Arctique dans un refuge ctier. Aprs avoir survcu lre glaciaire, puis un dlai de 80 ans avant quil ne soit redcouvert (possible grce lunique spcimen que dtenait le CNC), le Colias johanseni pourrait bientt devoir composer avec une autre menace. En effet, la calotte glaciaire arctique, prdit-on, continuera de fondre un rythme acclr en raison du changement climatique. Avec des tempratures de plus en plus leves, le niveau de la mer plus haut, et dautres effets qui sont toujours dterminer, quadviendra-t-il du Colias johanseni et dautres organismes reliques, confronts quils sont dnormes changements leur cosystme17? (Hall, 2009)
17

Adaptation dun article de Don Lafontaine, Collection nationale canadienne dinsectes, Agriculture et Agroalimentaire Canada, Ottawa.

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Dans ce chapitre, une bonne part de lanalyse du comit dexperts est fonde sur les rponses fournies dans le cadre de lenqute sur les collections qui a t distribue aux dtenteurs de collections biologiques travers le Canada. Cent vingt institutions et collections qui possdent la majeure partie des spcimens au Canada ont rpondu lenqute (voir lappendice 2). Le nombre rel de collections et de spcimens se trouvant au Canada serait quelque peu plus grand que ce quen a rapport lenqute puisque certaines collections orphelines , cest--dire sans propritaire ni conservateur, ny ont pas t rapportes. Les principales raisons en faveur du maintien des collections biologiques du Canada sont aussi varies que le sont les institutions qui les accueillent. Les raisons identifies par les rpondants sont les suivantes : identification des espces, recherche taxonomique, recherche conomique, recherche mdicale, prservation du patrimoine naturel, documentation de la biodiversit, analyse des ressources gntiques, et ducation. (Lencadr 5.1 propose un exemple de la valeur historique des collections.) Un rpondant faisait cette mise en garde : Les collections dhistoire naturelle sont les archives de la Terre le Canada doit reconnatre que la valeur de ces archives augmente mesure que nos espaces sauvages diminuent et que le climat change. Il nest pas possible de documenter le changement sans connatre le pass. Les donnes de collections et dautres donnes comme les donnes de terrain sur la taille et le statut des populations, peuvent grandement contribuer documenter le changement climatique.
5.1 LE S S P C i m E nS

Les collections biologiques se trouvent dans toutes les provinces, mais seul un territoire, les Territoires du Nord-Ouest, a indiqu possder une collection (voir la figure 5.1 pour les avoirs de spcimens, par province et territoire). Tel que rapport par les rpondants, 62 % des collections canadiennes sont denvergure principalement locale ou rgionale, 18 % sont principalement nationales et 33 % sont internationales18. Les spcimens des collections canadiennes proviennent de plusieurs sources. Les institutions elles-mmes embauchent souvent des scientifiques et des techniciens, qui sadonnent la collecte au nom de lorganisation, en fonction dobjectifs spcifiques tablis par celle-ci. Ces institutions participent souvent des changes de matriel pour combler des lacunes, ou des prts de matriel qui est temporairement log dans la collection. De plus, nombre de collections

18

Ces pourcentages ne donnent pas un total de 100, parce que certaines collections ont rapport quelles taient denvergure internationale, ainsi que surtout denvergure locale ou surtout denvergure nationale.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

0 1 102 0

3 005 048 5 139 216 378 930 2 265 022 33 074 317 7 365 049 50 542 28 740 553 430 212 945

Nombre de spcimens 0 33 074 317

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 5.1 Inventaire de spcimens, par province et territoire

acceptent des dons de particuliers ayant amass leur propre collection. De tels dons, qui peuvent compter des dizaines de milliers de spcimens, peuvent tre trs importants du point de vue historique. Finalement, des spcimens individuels, et loccasion des collections entires, sont acquis par les institutions.
Nombre de spcimens par espce

Selon une estimation mene en 1995 par le Muse canadien de la nature, il y aurait 106 000 espces au Canada (Mosquin et al., 1995; voir le tableau 5.1). Bien que ce nombre (qui ninclut pas les espces microbiennes) soit peu lev comparativement aux 5 10 millions despces estimes lchelle mondiale (May, 2010), ces espces sont vitales la sant et aux services de nos cosystmes. Pourtant, tel quillustr dans le tableau 5.1, environ 65 % seulement de nos espces plus grandes ont t nommes et dcrites, ce jour. Et si on comptait dans ce calcul de plus petits organismes, comme les microbes (voir lencadr 3.1 sur la diversit des microbes), le pourcentage rel despces connues serait trs petit. Selon lenqute, la plupart

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Tableau 5.1 Nombre estim despces et de spcimens au Canada, et nombre despces rapportes dans lenqute du comit dexperts
Groupe Nombre rapport despces Nombre total Pourcentage Nombre de spcimens despces despces rapports dans dcrites lenqute sur les collecions canadiennes (millions) 662 4 256 7 280 16 455 1 521 28 327 54 653 n/a n/a 106 602 100 97 72 69 67 61 55 n/a n/a 65 1,1 7,0 0,2 0,8 3,7 6,6 29,9 0,02 2,7 52,1

Vertbrs ( lexception des poissons) Plantes Algues Champignons et lichens Poissons Invertbrs ( lexception des insectes) Insectes Microbes Fossiles Total

662 4 120 5 300 11 130 1 021 17 362 29 985 n/a n/a 69 580

(Sources des donnes : Gagnon et Fitzgerald, 2004; Mosquin et al., 1995, et Conseil des acadmies canadiennes)
Les quatre premires colonnes ont t tires et adaptes de Gagnon et Fitzgerald (2004) (y compris les groupements taxonomiques). La dernire colonne est le nombre total des spcimens rapports, par taxon, dans lenqute sur les collections canadiennes.

des espces canadiennes qui sont dcrites sont reprsentes dans les collections canadiennes (voir lappendice 2, tableau A2.6). Le nombre estim de spcimens par groupe, selon lenqute sur les collections mene dans le cadre de ce rapport, a t ajout la dernire colonne du tableau 5.1 (les donnes sont prsentes en ordre dcroissant de pourcentage despces dcrites). Le nombre de spcimens dune espce donne que contiennent les collections dpend de la personne qui les a collects et pour quelles raisons elle les a rassembls, de mme que de la raret des espces collectes. Certaines espces trs rares sont reprsentes dans une seule collection, par un seul spcimen, et parfois par quelques-uns seulement. Dans dautres recherches, toutefois, une quantit importante dchantillons de certaines espces a t collecte, et ce, pour une foule de raisons, dont des rvisions taxonomiques (dADN et morphologiques), des donnes de distribution au fil du temps, des donnes cologiques qui peuvent tre variables, et lobtention de rfrences pour les tudes qui portent sur nombre

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

de spcimens. (Voir lencadr 5.2 pour un exemple de spcimens multiples se trouvant dans une collection, qui ont t utiles des tudes ultrieures.) Certaines collections contiennent galement des spcimens despces qui sont maintenant disparues et qui existent dsormais uniquement dans des collections; nommons, par exemple, les spcimens empaills du pigeon voyageur du Muse Beaty de la biodiversit, Vancouver.

Encadr 5 .2 Lpinoche du lac Enos : une collection permet dobserver les ravages volutionnaires occasionns par des espces envahissantes
Dans les placards du nouveau Muse Beaty de la biodiversit, situ lUniversit de la Colombie-Britannique, se trouvent des spcimens dune espce disparue, lpinoche du lac Enos (Gasterosteus sp.), originaire du lac (Gracieuset de Janette Boughman et Tiffany Malek) Enos, sur lle de Vancouver. Deux types distincts dpinoche se partageaient le lac Enos : la premire (benthique), vivait prs de la cte, alors que la seconde (limntique), vivait en eau libre (McPhail, 1984). Pendant des dcennies, ces deux espces troitement lies vivaient cte cte, conservant pourtant une morphologie, des attributs gntiques, des habitats et des sites de nidification distincts. Puis, au dbut des annes 1990, une espce dcrevisse (Pacifastacus leniusculus Dana) a t introduite sur lle de Vancouver la suite dune intervention humaine. Cette crevisse a fait des ravages environnementaux, se nourrissant de petits poissons et mettant littralement cet habitat sens dessus dessous. Aujourdhui, sil reste des pinoches dans le lac Enos, elles forment un seul banc de poissons, mi-chemin entre la forme benthique et limntique (Kraak et al., 2001). Les deux units dsignables de lespce sont disparues. La paire despces dpinoche a t remarque et comprise la suite de recherches sur le terrain et de collecte dhistoire naturelle. Parce que les spcimens et les informations associes ont t prservs pour la postrit, leur signification peut encore tre tudie et apprcie. En comparant ces poissons avant et aprs larrive de lcrevisse, et en faisant lanalyse des archives dADN ou darchives gntiques des spcimens fossiles, les scientifiques ont pu documenter les consquences gnomiques de laffaissement de ces espces (Taylor et al., 2006). Lhistoire des pinoches du lac Enos montre quel point les collections sont dirremplaables mines dinformation, dune grande importance pour les gnrations futures.

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Le nombre de spcimens par collection

La taille des 120 collections dont les reprsentants ont rpondu lenqute varie beaucoup, passant de 16,7 millions de spcimens dans les collections nationales dAgriculture et Agroalimentaire Canada quelques centaines de spcimens dans le cas de petites collections spcialises (voir le tableau 5.2 pour les plus grandes collections, cest--dire celles qui possdent le plus grand nombre de spcimens). Quatre-vingt-un pour cent des collections ont considrablement augment leur avoir biologique au cours des dix dernires annes, alors quenviron trois pour cent des collections ont vu leur taille diminuer. Les contraintes financires et budgtaires ont t identifies comme tant le facteur le plus important ayant men la diminution de la taille des collections (32 %). Tant et aussi longtemps que notre connaissance des espces canadiennes et leur distribution territoriale demeurera incomplte, dautres spcimens devront tre collects et prservs.

Tableau 5.2 Plus importantes collections canadiennes, en fonction du nombre estim de spcimens, selon les donnes fournies par les rpondants
tablissement de collection Collection nationale canadienne dinsectes, darachnides et de nmatodes Muse canadien de la nature Universit de lAlberta Universit McGill Muse royal de lOntario Universit de Guelph Universit de Montral Universit du Manitoba Universit de la Colombie-Britannique Type de collection Gouvernement fdral Endroit Ottawa, ON Nombre de spcimens (millions) 16,7

Gouvernement fdral Universit Universit Gouvernement provincial Universit Universit Universit Universit

Ottawa, ON Edmonton, AB Montral, QC Toronto, ON Guelph, ON Montral, QC Winnipeg, MB Vancouver, CB

7,4 3,5 3,4 3,2 2,5 2,5 2,1 2,1

(Conseil des acadmies canadiennes)

Ces chiffres sont autorapports et pourraient ne pas tre exhaustifs. Seuls les spcimens biologiques sont inclus. Sont exclus les spcimens gologiques et en culture.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Bien quil y ait des avantages lis la concentration des spcimens dans de grandes institutions les conomies dchelle, par exemple, ou la volont dviter le ddoublement des efforts , il y a galement de tout aussi bonnes raisons lappui du maintien de plusieurs diffrentes collections travers le pays. Une telle organisation facilite la recherche et lenseignement au sein de plusieurs diffrentes institutions, expose les jeunes la recherche ayant recours aux collections, et protge les collections des dsastres. Les collections rgionales sont importantes pour les socits dexperts-conseils en environnement, qui doivent accder des collections de rfrence afin de pouvoir identifier les espces. En labsence de collections rgionales, de telles socits auraient monter leurs propres collections, devraient voyager sur de grandes distances, ou simplement sabstenir de valider leur matriel. Les collections rgionales ont galement tendance mieux reprsenter la flore ou la faune locale que ne le font les grandes collections, dont la porte est plus globale. De plus, lexpertise taxonomique pourrait tre circonscrite si les scientifiques spcialiss en taxonomie se retrouvaient dans un nombre restreint de grandes institutions. La mme logique vient par ailleurs soutenir largument en faveur du maintien de collections au Canada, mme si dimportantes institutions trangres comptent un grand nombre de spcimens canadiens.
Lestimation de la valeur et du cot des spcimens

De manire gnrale, les institutions et les gestionnaires nont pas tent dattribuer une valeur pcuniaire leur collection. Lenqute du comit dexperts a donn lieu fort peu de rponses la question de la valeur des collections. La plupart des spcimens, notamment les spcimens historiques aux donnes compltes, sont considrs comme tant irremplaables ou inapprciables, bien quil soit reconnu que les collections biologiques doivent accorder une valeur pcuniaire leurs spcimens, ne serait-ce quaux fins dassurance. La Collection nationale canadienne dinsectes applique une valeur moyenne de 5 dollars par spcimen qui lui est donne, aux fins des reus officiels, condition que le spcimen soit en bon tat, ait t identifi et soit accompagn de donnes de base. Cette valeur augmente, toutefois, pour les spcimens de rfrence et les spcimens despces particulirement grandes ou rares. Certains spcimens fossiles de grande taille peuvent tre valus des milliers de dollars chacun. Cela dit, si on appliquait la valeur moyenne de 5 dollars par spcimen tablie par la Collection nationale canadienne tous les spcimens des collections canadiennes, la valeur totale des spcimens des collections du pays dpasserait les 250 millions de dollars. Le cot vritable de remplacement de tout ce matriel serait toutefois beaucoup plus lev, notamment pour les spcimens plus rares et ceux rcolts en zones loignes. En ce qui a trait aux taxons dont il nest plus possible dobtenir dchantillons, il ny a pas de remplacement possible.

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Les cots associs aux collections sont souvent pris en compte par les gestionnaires, puisquils doivent tre inclus dans les budgets annuels de la plupart des institutions propritaires de collections. Or, les cots dacquisition de spcimens, selon les rpondants lenqute, peuvent varier dun dollar des milliers de dollars par spcimen, la plupart se situant plutt au bas de cette chelle. Les cots dacquisition dpendent en partie de la taille ou de limportance dune collection (le plus la collection est importante, le plus le cot par spcimen a tendance tre faible). Les frais dentretien annuels des spcimens varient encore davantage que les cots dacquisition, allant de 0,001 dollar 500 dollars par spcimen, selon le type, la taille et la condition du spcimen, et les cots rels qui ont t inclus dans le calcul. En ralit, plusieurs facteurs influencent la valeur relle dune collection. Les cots dacquisition de spcimens englobent les salaires, les frais de dplacement et dexpdition et, loccasion, dacquisition. Par contre, ce sont les frais dentretien long terme qui comprennent la construction ddifices, le chauffage et la climatisation, llectricit, les mthodes de prservation, les fournitures et bien sr, lenveloppe salariale, qui sont les plus onreux.
5.2 LE S i nS Ta L L aT i o nS dE S C oLLECT ion S

Cette section examine ltat des installations qui accueillent les collections canadiennes, y compris les entrepts et les btiments, leur accessibilit aux fins de recherche, le niveau des travaux de conservation qui sy fait, lutilisation des outils et des technologies, les normes de pratiques exemplaires et les projections.
Les conditions dentreposage et de conservation

Les conditions dentreposage des spcimens des collections canadiennes diffrent considrablement, selon les ressources disponibles aux individus et aux institutions. La taille des spcimens et les mthodes dentreposage sont galement trs varies, dans la mesure o une grenouille, un papillon, des semences et le squelette dun dinosaure exigent chacun diffrentes expertises et installations pour en assurer la prservation et la prsentation, puisque les facteurs de dtrioration diffrent pour chacun. La condition des spcimens en tant que tels varie normment et dpend de plusieurs facteurs : la date et la mthode de collecte, ltat au moment de la collecte, la mthode de conservation, les conditions dentreposage, le contrle antiparasitaire et les conditions environnementales (clairage, temprature et humidit). Le terme le plus souvent employ pour dsigner ces facteurs est conservation, qui se dfinit ainsi : Le recours aux pratiques exemplaires pour prvenir ou interrompre la dtrioration physique long terme des spcimens naturels et des artfacts et

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

documents associs, dans le but den prserver la valeur scientifique et culturelle (Carter et Walker, 1999). Les dix agents de dtrioration pouvant endommager ou dtruire les spcimens de collections sont les forces physiques, les incendies, les inondations, les matires polluantes, les parasites, la lumire et les ultraviolets, une temprature et un taux dhumidit relative non conformes, la ngligence et les actes criminels (Muse canadien de la nature, 2010). Dans lenqute du comit dexperts, 48 rpondants (40 %) taient davis que ltat de leur collection stait amlior depuis 10 ans, 20 (17 %) estimaient quelle avait subi une dtrioration, et 44 (37 %) affirmaient que ltat de leur collection navait pas beaucoup chang. (Huit collections nont pas rpondu.) La majorit rapportait que plus de 75 % de leur collection tait entrepose dans des conditions adquates (appendice 2, figure A2.6). Cela signifie que prs de 78 % des spcimens sont entreposs dans des conditions adquates voil un immense atout pour le Canada.
Ltat des btiments

Lge des btiments o sont loges les collections est vari; certaines installations musales no-gothiques, vieilles de 150 ans, faisant le contrepoint dinstituts modernes btis depuis peine une dizaine dannes. Ltat de ces btiments varie galement selon limportance et les cots de rnovations relativement urgentes et les ressources disponibles. Alors que certaines collections trangres, comme lInstitut Smithsonian qui est situ dans les environs de Washington D.C., ou le Muse dhistoire naturelle de Londres, au Royaume-Uni, btissent de nouvelles installations dentreposage dotes de systmes de rgulation de la climatisation et de contrle des parasites qui sont la fine pointe de la technologie, les collections biologiques nationales du Canada sont entreposes dans des installations vieillissantes, pour la plupart. De plus, seules les collections de spcimens de plus grande taille (les mammifres, les oiseaux, etc.) du Muse canadien de la nature sont loges dans des installations rcentes et adquates. La Collection nationale canadienne dinsectes et de plantes, par exemple, est loge dans deux difices patrimoniaux situs la Ferme exprimentale centrale dOttawa. Ces difices nont pas t conus pour contenir de grandes collections biologiques; lnorme collection dinsectes nest pas dote des dispositifs de rgulation de la climatisation ncessaires sa conservation long terme (lentreposage dans des conditions contrles est galement indiqu pour le matriel de recherche en taxonomie molculaire). Les difices sont bonds et ces conditions limiteront sa croissance. On y installe prsentement des rayonnages compacts pour remdier temporairement cette situation (voir lencadr 5.5).

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Laccessibilit de la recherche

Une autre problmatique importante, en ce qui concerne les installations accueillant les collections, est laccessibilit des spcimens aux fins de la recherche. Mme lorsque les spcimens sont bien conservs, ils se retrouvent parfois dans des installations hors site ou conservs et catalogus de faon non conforme, ce qui les rend difficile localiser. Il arrive que des dons importants soient reus, sans quon se soit souci de leur ordre taxonomique; il arrive encore que ces contenants soient entreposs tels quels, sans fiches didentification claires ni accessibles des spcimens quils contiennent. Seuls 73 rpondants lenqute (61 %) ont indiqu que tous leurs spcimens taient accessibles aux fins de recherche ou dautres fins. En ce qui concerne les collections dont une partie est inaccessible ou entrepose dans des conditions inadquates (voir lappendice 2, figure A2.7), on a rapport quafin de pouvoir remdier cette situation, les besoins prioritaires taient les suivants : augmentation du personnel de conservation ou technique (34 rponses), augmentation de la capacit dentreposage sur les lieux mmes de la collection (18 rponses), et installation de nouveaux quipements dentreposage amliors, comme des tagres, des placards et des rayons (13 rponses).
La conservation

Toutes les collections exigent une capacit de conservation pour assurer leur maintenance long terme, et le personnel de conservation est appel jouer des rles diffrents, selon le type dinstitution. Les organisations plus grandes ont souvent leur emploi un personnel affect exclusivement la prservation de leur collection. Dans certaines institutions, ce rle incombe aux scientifiques ou aux techniciens. Certaines collections biologiques ou certaines parties de collections plus grandes ne bnficient pas des services de conservation, et ce, depuis plusieurs annes. On parle alors de collections orphelines. Plus de 30 rpondants ont comment que lensemble de leur collection, ou certaines parties de leur collection, ne font pas lobjet, ou encore trs peu, de soins de conservation. Dans certaines institutions, la conservation est assure par des bnvoles, souvent des scientifiques ou des techniciens la retraite, qui continuent de sadonner des activits de conservation. Bien que dune trs grande utilit, de tels individus ne devraient pas venir remplacer la capacit de conservation permanente.
Les normes de pratiques exemplaires

Lexpression pratiques exemplaires nest pas simple. Elle sous-tend que les collections biologiques du Canada sont rgies en vertu de normes acceptables de pratiques exemplaires, que ces normes sont facilement accessibles et quelles ont t avalises, et que les ressources permettant de les faire respecter soient mises en place. Plusieurs

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des plus grands muses dhistoire naturelle du monde, comme le Muse canadien de la nature19, le Muse dhistoire naturelle de Londres, au Royaume-Uni20 et le Muse amricain dhistoire naturelle21 de New York, aux tats-Unis, ont tabli leurs propres normes publiques, auxquelles ils tentent dadhrer. Ces normes dentretien des collections touchent la conservation, la gestion du risque, les services lis aux collections, la gestion des donnes, lthique, la gouvernance, les acquisitions et les retraits dinventaire. Les collections biologiques individuelles du Canada sont, pour la plupart, exploites en vertu de nombreuses normes. Les normes sont habituellement enchsses dans les noncs de politique, mais seuls 49 rpondants lenqute (41 %) ont rapport avoir des noncs de politique publics. Voyez lencadr 5.3 pour en savoir plus long sur les lignes directrices du Conseil de recherches en sciences naturelles et en gnie (CRSNG) rgissant les collections de recherche universitaire. Chaque politique sur les collections devrait contenir un plan dvaluation des imprvus, dont le risque dincendie et de dommages causs par leau. Les collections devraient toujours disposer de donnes exactes sur les activits de conservation, y compris comment les spcimens sont collects, quelles sont les procdures dacquisition, quelles sont les mthodes de prservation, et quelle utilisation on en fait (prts, chercheurs invits, etc.). Avec le roulement de personnel typique de toute institution, de telles donnes sont dune trs grande valeur dans la transmission de lhistoire des collections et des pratiques exemplaires qui y sont lies.

Encadr 5 .3 Les lignes directrices du CRSNG lintention des muses


En 1999, le CRSNG a mis des lignes directrices lintention des chercheurs qui ont recours aux collections universitaires dans le cadre de leurs travaux et qui sont soutenus par des organismes subventionnaires fdraux (CRSNG, 1999). Ces lignes directrices, qui portent sur la proprit et le transfert de spcimens, la conservation, la documentation (ltiquetage et lentre des informations dans les bases de donnes), et laccessibilit des donnes et des spcimens, mettent laccent sur la ncessit de dfinir quelles sont les responsabilits qui incombent aux chercheurs et leur institution en matire dentretien convenable dune collection. Elles soulignent galement limportance doffrir aux institutions canadiennes le droit de premier refus lorsquil sagit de trouver un dpt long terme pour les spcimens. Il faudra mettre jour ces lignes directrices en fonction des nouvelles ralits que reprsentent les collections croissantes de matriel gntique associ aux spcimens, et des nouvelles occasions de numrisation des donnes de spcimens.

19 20 21

http://www.nature.ca http://www.nhm.ac.uk http://www.amnh.org

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Les projections

Cent quatre gestionnaires de collections ont rpondu la question de lenqute qui demandait une brve description de leurs projections quinquennales relativement lespace, aux finances et la capacit de recherche de leur collection : 57 % dentre eux ont lintention de maintenir le statu quo, condition que le financement ne soit pas rduit, 21 % ont dfinitivement lintention de mettre en uvre un projet dagrandissement, 10 % ont lintention de le faire sils obtiennent un financement pour soutenir ce projet, 7 % prvoient rduire leurs installations, et 5 % ont lintention de dmanteler leurs collections et de fermer les installations qui les accueillent. Limpression gnrale qui se dgage est que sans un financement accru, ou dans certains cas, lapport important de contributions nouvelles, plusieurs installations manqueront despace de faon dfinitive au cours des cinq prochaines annes, freinant ainsi la croissance future des collections. Un des rpondants rsumait en ces termes la situation : Nombre de collections nont pas suffisamment despace pour assurer leur croissance et leur dveloppement, et toutes les collections devraient tre dotes dun plan de 20 ans. Au cours des dernires annes, le gouvernement fdral a discut de moyens de mieux coordonner les activits des collections, mais aucune stratgie de financement na encore t approuve.
Les nouvelles approches et les nouvelles technologies

Plusieurs nouvelles approches ont permis, ces dernires annes, damliorer la faon dont les collections biologiques sont gres, y compris la mise en place de nouvelles installations dentreposage (p. ex., le rayonnage mobile, la rgulation de la climatisation), la collecte dchantillons dADN, la mthodologie de gestion des bases de donnes en vue de la prparation de linformation devant figurer sur les tiquettes de spcimens, la technologie dimagerie des spcimens (notamment les spcimens types), les outils dentretien des collections de cultures microbiennes et de myctes, et la mise en commun de donnes et dinformations grce linformatique. Lorsque ces ressources ont mis la disposition des gestionnaires de collections canadiennes ces nouvelles approches et ces nouvelles technologies, laccs aux collections et linformation sen est vu grandement amlior. Parmi les amliorations, on compte davantage despace pour assurer la croissance, la prservation des spcimens amliore, laccs en ligne des images et des donnes, lutilisation accrue de matire vivante, et lacclration des descriptions despces. Laccs aux donnes sur la biodiversit et la gestion de ces donnes sont abords au chapitre 6.

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5.3

LE S i nS TiTu T i o nS Ta x o n o m i q uE S

Une gamme dinstitutions accueille les collections dhistoire naturelle au Canada (voir le tableau 5.3). Selon lenqute du comit dexperts, les collections des universits et collges reprsentent 43 % de lensemble des collections, les collections fdrales et provinciales, 39 %, et les collections des institutions prives, de particuliers et personnelles, 18 %. La plupart de ces collections se trouvent dans des muses, et les plus grandes de ces institutions sont soit exploites par des gouvernements, soit par des corporations autonomes. Des stations de recherche sont un autre type dinstallation taxonomique; il sy effectue beaucoup de collecte de spcimens et un peu de prservation de spcimens. De plus, il se peut que certains laboratoires dagences gouvernementales et socits dexperts-conseils dtiennent des spcimens prservs, bien quil soit possible que ces socits se dlestent un jour de leurs collections la suite de lanalyse des donnes, ou par manque dintrt ou de capacit de conservation.
Tableau 5.3 Rpartition des rpondants et des spcimens, par type dinstitution
Rpondants Type dinstitution Gouvernement fdral Universit Gouvernement autre Collection autre Total Nombre 26 52 20 22 120 % du total 22 43 17 18 100 % 26,5 18,5 4,6 2,5 52,1 Spcimens Nombre (millions) % du total 51 36 9 4 100 %

(Conseil des acadmies canadiennes)

Cette figure montre le nombre de collections dont on fait tat dans lenqute, en fonction du type dinstitution et du nombre total de spcimens reprsents dans cette catgorie. La plupart des spcimens se trouvent dans les collections du gouvernement fdral (voir lappendice 2 pour de plus amples dtails.)

Rgle gnrale, les muses sont constitus de deux composantes qui sont interrelies, sans ncessairement tre compatibles : dune part, un volet public dexpositions, de prsentations et dactivits ducatives, et dautre part, un volet interne qui est ax sur les collections et la recherche. Les muses peuvent se consacrer exclusivement un ou lautre de ces volets; certains muses proposent uniquement des expositions pour le public, alors que dautres nen prsentent jamais.

Chapitre 5 Les collections taxonomiques du Canada

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Les muses canadiens varient beaucoup en ce qui a trait leur taille, leur personnel et leur raison dtre. Presque tous les muses dignes dintrt sont associs, un niveau ou un autre, soit une universit, soit un gouvernement. Les muses et leurs collections sont gouverns et grs en vertu de plusieurs modles organisationnels qui nont aucune cohrence entre eux. Bien que la plupart des grandes institutions soient labri des alas organisationnels, les plus petites collections ne bnficient pas de cette scurit long terme. Il sagit dun problme de taille qui menace de fragiliser lentretien dune part importante des collections de biodiversit canadiennes, et leur accs.
Les muses universitaires

Certains muses universitaires proposent des collections modestes qui servent uniquement aux fins de recherche et denseignement. Il arrive quelles tiennent dans un seul ou dans quelques placards, ou dans une seule pice, ou encore quil sagisse presque entirement dexpositions de spcimens monts datant parfois du XIXe sicle. Quelques-unes de ces institutions sont de grands tablissements denseignement qui sont dotes de collections de recherche et denseignement labores, qui prsentent des expositions publiques et qui offrent des programmes de rayonnement labors. Bien quil existe de grands muses universitaires, dont le Muse Beaty de la biodiversit et le Muse Redpath, il nen demeure pas moins que 20 des 28 muses universitaires (71 %) ayant rpondu au questionnaire de suivi lenqute ont rapport que moins de deux personnes soccupent de la collection. La plupart des muses universitaires sont des collections spcialises voues la recherche et lenseignement dtres vivants spcifiques. Par exemple, le professeur J.P. Bogart a mont une collection herptologique lUniversit de Guelph, le professeur Y. Alarie a amass une collection dinsectes aquatiques lUniversit Laurentienne, le professeur W. Schofield a assembl une collection de bryophytes lUniversit de la Colombie-Britannique et le professeur P. Brunel a cumul, lUniversit de Montral, une collection dinvertbrs marins. Ce genre de petites collections denseignement deviennent souvent orphelines lorsquun dpartement dfinit de nouvelles priorits ou quun chercheur part la retraite. Ces collections patrimoniales demeurent nanmoins dune grande valeur pdagogique, mais sont souvent sans soutien sur le plan financier ni sur celui de la conservation. Les muses universitaires formellement constitus au sein dun dpartement tirent leurs origines de collections individuelles, comme les collections susmentionnes, ou encore de dons extrieurs de spcimens. titre dexemple, lHerbier de lUniversit de la Colombie-Britannique a acquis les bryophytes de Schofield de mme que les algues recueillies par le professeur R. F. Scagel. LHerbier Fowler du Dpartement de biologie de lUniversit Queens, lHerbier Claude E. Garton

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Encadr 5 .4 Le Muse Redpath de lUniversit McGill


Le destin du Muse Redpath sur plus dun sicle tmoigne de limportance actuelle des muses dots de collections de biodiversit au Canada. Ce muse, financ par Peter Redpath et conu spcifiquement pour Sir William Dawson en 1882, fut le premier muse bti sur mesure au Canada. Pourtant, en 1910, ses mcnes originaux ntant plus de ce monde, la valeur perue du muse et sa (Gracieuset de David M. Green) pertinence aux yeux de luniversit taient devenues de peu de consquence; le muse toujours fonctionnel a t, en quelque sorte, relgu aux oubliettes pendant les 40 annes qui ont suivi. Le muse sest ainsi tourn vers les expositions publiques pendant les annes 1950, mais en 1970, luniversit a conclu quelle ne pouvait plus soutenir un muse public dhistoire naturelle sur son campus et en a ferm les portes. Pendant tout ce temps, cependant, les chercheurs et les conservateurs poursuivaient toujours leur travail. Lre moderne du Muse Redpath a dbut en 1986, lorsquil a de nouveau obtenu la permission de mettre sur pied un modeste programme dducation publique, de concert avec ses contributions acadmiques luniversit. Le muse est pass la Facult de sciences en 1995 et ldifice a t restaur de faon ce quil retrouve sa splendeur originale. Aujourdhui, le Muse Redpath est beaucoup plus productif et compte un personnel beaucoup plus toff qu aucun autre moment de son histoire. Ses collections contiennent maintenant plus de 400 000 spcimens palontologiques et zoologiques. Dawson serait impressionn de voir quel point son muse du XIXe sicle est devenu, au XXIe sicle, un dynamique centre de recherche et denseignement de la biodiversit . (Muse Redpath, 2007)

du Dpartement de biologie de lUniversit Lakehead, et lHerbier George F. Ledingham du Dpartement de biologie de lUniversit de Regina comptent parmi les herbiers universitaires issus de collections individuelles. lUniversit McGill, les avoirs du Muse Redpath proviennent originalement des collections palontologiques, zoologiques et gologiques de Sir William Dawson (voir lencadr 5.4). Toujours lUniversit McGill, le Muse dentomologie Henry H. Lyman, sous lgide du Dpartement des sciences des ressources naturelles, tait lorigine la collection dinsectes lgue luniversit par Lyman, en 1914.

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La plupart des muses universitaires sont de comptence dpartementale, bien quil y ait dimportantes exceptions. Le cas du Muse Thomas McCulloch de lUniversit Dalhousie est typique dans la mesure o on y trouve un conservateur qui rend des comptes au directeur du Dpartement de biologie. Il nen demeure pas moins que certains professeurs duniversit soccupent de leurs propres collections et indiquent quils le font de leur propre chef. Dans certains cas, les universits ont fait des efforts pour rassembler, sur le plan administratif ou physique, des collections dpartementales disparates. Si, lUniversit de lAlberta, les divers muses et galeries dart, dont les collections dhistoire naturelle, sont toujours des entits physiquement spares et situes dans divers dpartements, une entit administrative, le Dpartement des services des muses et des collections les encadre dsormais, lappui des politiques, des bases de donnes et des programmes de rayonnement de ces muses. Le Muse Beaty de la biodiversit de lUniversit de la Colombie-Britannique pousse plus loin cette amalgamation en rassemblant sous une mme bannire la recherche et lenseignement dpartementaux disparates en une seule structure administrative unique et dans un nouvel difice. Bien que le muse soit administr par un directeur qui rend des comptes au doyen des sciences de luniversit, lintgration nest pas encore acheve. Chaque collection est toujours chapeaute par un directeur et la gestion de chaque collection est lgrement diffrente. LUniversit McGill a un long historique de gestion, sous diffrentes formes, de ses diffrents muses. Tous les muses de McGill ont, un moment donn, t administrs par un comit des muses puis par le Secrtariat de lUniversit, mais ce modle, adopt avec succs par lUniversit de lAlberta, ne sest jamais vritablement install. La plupart des muses de McGill, dont le Muse Lyman et lHerbier de lUniversit McGill, sont dsormais de comptence dpartementale. Lexception en est le Muse Redpath (voir lencadr 5.4), qui fonctionne comme un dpartement acadmique de plein droit, dot dun personnel en voie de permanence, un petit nombre bien qu la hausse de cours de premier cycle et de cycle suprieur, et dun directeur qui rend des comptes au doyen des sciences.
Les collections gouvernementales

Bien que les muses et les collections du gouvernement (fdral, provinciaux et territoriaux) soient moins nombreux que les muses et les collections universitaires, on y compte nanmoins quelques-unes des collections les plus importantes au pays. La plus grande collection du pays est la Collection nationale canadienne dinsectes, darachnides et de nmatodes (voir lencadr 5.5), avec 16,7 millions de spcimens. Parmi les autres collections gouvernementales de grande envergure, nommons le Muse canadien de la nature (fdral) et le Muse royal de lOntario (provincial). Plusieurs collections de moindre envergure relvent galement du secteur public, dont la collection de pucerons Marjory Helen MacGillivray, lHerbier national de mycologie, et le Centre patrimonial du Nord du Prince de

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Galles (Prince of Wales Northern Heritage Centre), qui ne profitent pas de plus de deux employs. Ces collections plus petites reprsentent 16 des 25 (64 %) muses fdraux, provinciaux ou territoriaux qui ont rpondu au questionnaire qui a fait suite lenqute. Les plus grands des muses gouvernementaux sont gnralement structurs selon un modle corporatif. Par exemple, le Muse canadien de la nature est une socit dtat fdrale dirige par un conseil dadministration qui rend des comptes au Parlement canadien par le biais du ministre du Patrimoine canadien. Le conseil excutif, auquel sigent un prsident, un vice-prsident et lquipe de gestion, est

Encadr 5 .5 Les collections nationales dinsectes et de plantes, Ottawa


Agriculture et Agroalimentaire Canada (AAC) est dtenteur de la collection la plus importante de spcimens biologiques au Canada : la Collection nationale canadienne dinsectes, darachnides et de nmatodes. La collection, qui compte environ 16,7 millions spcimens et que viennent augmenter le million de (Gracieuset de Peter Hall) spcimens des herbiers nationaux de Encombrement, avec entreposage dans les corridors. plantes vasculaires et mycologiques, de mme que la collection de myctes et de bactries vivants galement stocks lAAC regroupe environ le tiers de tous les spcimens biologiques du Canada. Sa collection dinsectes est la troisime ou la quatrime plus grande au monde. La recherche agricole est le principal objectif des collections dAAC; celle-ci est axe sur les insectes en tant quespces nuisibles aux rcoltes et au btail, mais, au fil des ans, plusieurs autres secteurs, dont lindustrie forestire, la conservation et les parcs, ont contribu aux collections et aux initiatives de recherche, et en ont bnfici en retour. Des douzaines de chercheurs invits et des milliers de requtes de donnes et dinformation, provenant de tous les coins du monde, sont reues chaque anne. Le principal travail des scientifiques de cette collection est lidentification, la description et la classification dtres vivants il sagit de la pierre angulaire de la science de la biosystmatique. En tout, 77 employs en recherche et en technique taxonomique travaillent la Collection nationale de lAAC, Ottawa. Plusieurs de ces employs approchent lge de la retraite : 38 employs (50 %) ont cumul au moins 20 ans de service et la moiti de ces employs (19, soit 25 % du nombre total) ont au moins 30 ans de service leur actif (AAC, communication personnelle).

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responsable du rendement du muse. Le Muse royal de la Colombie-Britannique est une socit dtat dirige par une prsidente-directrice gnrale et un comit excutif, qui rend des comptes son conseil dadministration. Pour sa part, le Muse du Manitoba a un prsident-directeur gnral sa proue, qui rend lui aussi des comptes un conseil dadministration. Dautres muses fdraux et provinciaux sont plus troitement lis leurs gouvernements respectifs. Le Muse du Nouveau-Brunswick est une institution provinciale finance par la province du Nouveau-Brunswick et dirige par un prsident et un conseil dadministration. Le Muse royal de lOntario est une agence du gouvernement de lOntario; son conseil des gouverneurs, nomm par le lieutenant-gouverneur en conseil, en est lautorit dirigeante, alors que ses cadres suprieurs ont leur tte une prsidente-directrice gnrale. Le Muse royal de la Saskatchewan relve du ministre provincial du Tourisme, des Parcs, de la Culture et du Sport. Les muses et collections gouvernementaux de moindre envergure se situent souvent la queue dune trs longue hirarchie administrative; la plupart doivent, au final, rendre des comptes un ministre. Comme lexpliquait un rpondant : Je relve dun chercheur scientifique, qui relve de ladministration locale. Je nai pas dorganigramme avec moi, mais je dirais quil y a environ 17 niveaux qui me sparent du ministre des Ressources naturelles, dont je relve, finalement.
Les autres collections et muses

Vingt-deux autres collections ou bases de donnes, dont des muses privs et sans but lucratif et un hpital, ont t signales dans le cadre de lenqute. La plupart sont de petites organisations qui reoivent peu de soutien de lextrieur. (Voir lencadr 5.6 portant sur les collections microbiennes au Canada.)
Les stations de recherche

Les collections sont mises jour, en partie, par lajout de nouveaux spcimens, lorsque de nouveaux spcimens viennent tre identifis, lorsque des spcimens existants sont endommags, ou lorsque des spcimens additionnels sont ncessaires pour soutenir la recherche taxonomique plus pointue. Les universits canadiennes disposent dau moins 20 stations de recherche (voir lappendice 3), qui fournissent les infrastructures de base (hbergement et installations de laboratoire) ncessaires pour que les biologistes et les taxonomistes puissent raliser leurs recherches sur le terrain et pour contribuer former les nouveaux taxonomistes et biologistes. Ces stations de recherche qui seraient en pril en raison de compressions budgtaires du CRNSG, comme daucuns lont signal au comit dexperts ont le potentiel daugmenter les collections en agissant comme foyer de recherches taxonomiques connexes et en fournissant des donnes et des spcimens supplmentaires permettant dalimenter les sciences de la biodiversit. Il existe par ailleurs des stations de recherche gouvernementales qui servent depuis longtemps de stations

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Encadr 5 .6 Les collections microbiennes au Canada


Il est extrmement difficile de dresser linventaire des collections microbiennes du Canada, puisque la plupart des collections de cultures de microbes issues de lenvironnement se trouvent dans les laboratoires de chercheurs individuels et sont maintenues grce aux projets de recherche de ces chercheurs plutt qu des fonds publics. Les microbes qui causent des maladies chez les humains, ainsi que les plantes et animaux quils exploitent, se trouvent plus communment dans les collections publiques. Les plus grandes collections qui soient (sur le plan du nombre disolats) se trouvent sans doute dans les laboratoires cliniques de centres hospitaliers et comprennent des agents infectieux (virus, bactries, micromyctes et protozoaires) provenant de patients humains. Une tude ralise par lInitiative de recherche et de technologie CBRN et par la socit Sporometrics (IRTC, 2007) a not un recul des Centres nationaux de ressources biologiques protges du Canada, qui sont passs de 140 en 1986, 86 en 1994 et 40, au plus, en 2006. Fait notable, aucun centre canadien navait un effectif de plus de trois employs plein temps, une situation qui est diamtralement oppose celle de la Collection amricaine des cultures types (American Type Culture Collection) qui, avec ses 450 employs, savre tre une source traditionnelle des cultures dont se servent les microbiologistes canadiens. De plus, plusieurs des petits centres canadiens risquent de devoir fermer boutique, mesure que les universitaires qui sen occupaient pour rendre service la communaut microbienne largie partent la retraite, ou que les institutions auxquelles ils sont affilis composent avec des compressions budgtaires et de nouvelles exigences de rcupration des cots ou des rsultats rapides.

de recherche et de stations de surveillance. Se servir des infrastructures et des investissements existants physiques ou logistiques en zone loigne comme dun levier est une faon de faire qui a dj fonctionn et qui peut encore jouer un rle important dans llaboration dune approche durable la collecte de donnes sur la diversit biologique au Canada.
Le financement des institutions

Le financement institutionnel comprend essentiellement les salaires et les fonds dexploitation (fournitures, etc.). Les frais de maintenance et dexploitation des btiments (le cot dentretien des salles o sont places les collections) sont habituellement exclus. En gnral, la majeure partie du financement est assure par linstitution laquelle appartient la collection (p. ex., une universit, un

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gouvernement), et peu dargent provient dautres bailleurs de fonds. Par exemple, seules 11 des 120 collections ont rapport avoir reu des fonds de fondations, cette source reprsentant moins de 25 % du financement total. Des 13 collections qui ont fait tat de dons du public, ces dons reprsentaient moins de 10 % du financement total de 10 de ces 13 collections. Un rpondant affirmait ce qui suit : Notre muse est un joyau cach, dans notre dpartement. Luniversit a tent de sen dpartir plusieurs reprises et ne le soutient pas financirement, sauf quand on ly oblige. Un autre rpondant a expliqu : Il ny a pas de soutien de base pour la [collection]. Elle ne figure dans aucun poste budgtaire dans aucun budget. Le financement est fonction de notre capacit dobtenir des fonds extrieurs, bien que les chefs de dpartement aient fourni, au fil des ans, de petites sommes qui nous permettent de payer les fournitures essentielles. Seules les plus grandes collections sont soutenues par un personnel dvou dont les salaires sont verss par les institutions. Bien quil semble que la conservation des collections incombe souvent des membres du personnel dont la principale tche nest pas lentretien de la collection, lenqute ne nous permet pas de poursuivre plus loin cette analyse. Les rponses la question portant sur le financement annuel approximatif varient normment daucuns comptabilisant les salaires, dautres ne le faisant pas. Certaines des plus grandes institutions ont dimportants budgets de fonctionnement (jusqu 25 millions de dollars, ce qui comprend la masse salariale), mais la plupart des budgets de fonctionnement des collections sont beaucoup plus petits, variant entre 0 et 5 000 dollars (la plupart des budgets plus levs semblent inclure des salaires, mais cela ntait pas toujours prcis par les rpondants). Les lignes directrices du CRSNG (voir lencadr 5.3) mettent peut-tre laccent sur le dpt de spcimens dans des collections canadiennes tablies, quil sagisse duniversits ou non, mais il nexiste pas de programme de subventions permettant de soutenir les collections appeles devenir le dpt de ces spcimens. Le fardeau financier associ cette politique repose donc entirement sur les institutions propritaires de ces collections. Aux tats-Unis, le Programme damliorations aux collections de recherches biologiques (BRC, pour Improvements to Biological Research Collections Program) de la Fondation nationale des sciences [Traduction] finance les amliorations visant mettre en rseau, scuriser et organiser les collections dhistoire naturelle tablies en vue dune accessibilit durable, exacte et efficace desdites collections de la part de la communaut de recherche en biologie (NSF, 2010a). Le comit dexperts estime que labsence de financement en appui de la politique du CRSNG constitue une lacune dans le dossier du financement des collections de biodiversit au Canada.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Le financement qua rcemment fourni la Fondation canadienne pour linnovation (FCI) pour soutenir les infrastructures en lien avec la biodiversit a permis de beaucoup amliorer les systmes de soutien de collections tels le Muse Beaty de la biodiversit, lUniversit de la Colombie-Britannique, lInstitut de biodiversit de lOntario, lUniversit Guelph, et le Centre sur la biodiversit, lUniversit de Montral (encadr 6.4). Cette subvention qua accorde la FCI au Centre sur la biodiversit a jou un rle cl dans la mise en route de Canadensys, le rseau universitaire de la biodiversit. Or, les subventions de la FCI ne peuvent tre affectes lexploitation dune collection ou aux salaires, bien que de plus petites subventions accordes des chercheurs individuels aient permis de financer lachat dquipements, comme des rayonnages mobiles et des outils de recherche. Les collections de biodiversit canadienne qui sont des muses reconnus lchelle nationale (exception faite des institutions gouvernementales fdrales) peuvent demander une aide financire au ministre du Patrimoine canadien, par le biais de son Programme daide aux muses (PAM) qui vient appuyer des projets prcis court terme. Deux volets du PAM, soit Accs au patrimoine et Dveloppement organisationnel, appuient financirement des projets qui viennent renforcer la gestion globale des fonctions musologiques cls. Notons que pour lexercice 20082009, aucune collection de biodiversit navait obtenu de financement du PAM (Patrimoine canadien, 2010).

Points saillants du chapitre


Il existe plus de 50 millions de spcimens biologiques au Canada. Ceux-ci se trouvent dans plusieurs diffrentes collections publiques et prives. Ces collections de biodiversit doivent tre loges et conserves au profit des gnrations futures. Les nouvelles approches et technologies des dernires annes permettent damliorer la gestion de nos collections biologiques; pourtant, plusieurs collections de biodiversit sont loges dans des installations vieillissantes, qui offrent peu despace supplmentaire permettant daccommoder la croissance de ces collections. Les collections sont diriges selon diffrents modles organisationnels et il nexiste aucune stratgie, norme ou source de financement denvergure nationale les ciblant. Nombre de collections souffrent dun manque de financement stable long terme et sont aux prises avec une capacit de conservation limite et souvent inadquate. Lorsque les employs partent la retraite, il arrive souvent quils ne soient pas remplacs, ce qui donne lieu des collections orphelines. Les stations de recherche constituent des infrastructures dune grande valeur aux yeux des biologistes et des taxonomistes, et contribuent former les nouveaux taxonomistes et biologistes.

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

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Chapitre 6

Laccs accru aux informations sur la biodiversit

Le Canada accuse un certain retard en ce qui a trait la numrisation de ses collections et des donnes de terrain. De plus, le Canada ne possde quun nombre limit de donnes sur la plupart des groupes taxonomiques et affiche dimportantes lacunes gographiques sur le plan de linformation dont elle dispose sur ses zones loignes et sur le Nord canadien. Cette information est pourtant essentielle pour comprendre les ressources en biodiversit du Canada et pour relever les dfis propres ces ressources.

Comprendre pleinement la biodiversit canadienne dpendra de la quantit et de la qualit de linformation qui se trouve dans les collections de la biodiversit du Canada et qui est gnre par les taxonomistes et autres dtenteurs du savoir traditionnel au Canada. Il est donc vital que les donnes sur les lments de la biodiversit y compris les espces, les gnes et les cosystmes soient cres et organises de faon ce quelles soient facilement accessibles au public, aux dcideurs et aux scientifiques. Ces donnes requirent une intendance long terme et sont essentielles, entre autres choses, la comprhension de limpact des espces envahissantes et lidentification et la conservation des espces en pril. Comme mentionn au chapitre 3, les progrs en matire de technologie, dentreposage lectronique, de bases de donnes, dInternet et doutils qui facilitent la numrisation des donnes ont rvolutionn la faon dont les donnes de biodiversit peuvent tre cres, maintenues, distribues et utilises. titre dexemple, la technologie actuelle peut documenter avec exactitude linformation de position de toute observation ou tout spcimen, de faon ce quelle puisse tre suivie sur un plan de coordonnes et compare dautres informations gographiques, dont la topographie, les routes, les voies navigables et la prsence despces concomitantes. Cette golocalisation, que vient complter linformation cologique, permet aux chercheurs dvaluer limpact despces envahissantes trangres, de conserver les espces en pril et dvaluer le degr de vulnrabilit dune espce ltalement urbain, aux pesticides ou au changement climatique (voir lencadr 6.1). Laccessibilit de linformation de nature taxonomique est galement ncessaire pour protger le Canada des espces envahissantes trangres. Comment saurions-nous quune invasion sest produite sans ces informations? Savons-nous quel est limpact dune espce envahissante sur les espces endmiques du Canada, sur notre conomie, sur notre bien-tre ou sur notre culture? Dans quelle mesure se propage linvasion? Quelles sont les options de contrle? Les rponses ces questions de base exigent des donnes taxonomiques.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Encadr 6 .1 Documenter le changement cologique au moyen de donnes tires de spcimens des collections de biodiversit
Les donnes tires des collections biologiques peuvent servir reconstruire de rcents changements de la distribution et de la phnologie despces. Par exemple, le phytocologiste Claude Lavoie et al. (2007) ont retrac la propagation de lherbe poux (Ambrosia artemisiifolia L.) travers le sud du Qubec depuis deux sicles (18222005) au moyen de donnes tires de spcimens provenant de sept herbiers. Ils ont pu montrer que cette espce, que lon trouvait lorigine uniquement dans la rgion de Montral, stait propage, la fin des annes 1950, travers le sud du Qubec, profitant notamment, pour ce faire, du dveloppement du systme routier qui se faisait pendant cette priode. Claude Lavoie et Daniel Lachance (2006) se sont galement servis des dates deffloraison obtenues par lentremise des spcimens dherbiers et de stations mtorologiques adjacentes pour montrer que leffloraison du tussilage pas-dge (Tussilago farfara L.) en milieu urbain, comme Montral ou Qubec, avait lieu beaucoup plus tt la fin du XXe sicle quau tournant de ce mme sicle. Or, un tel signalement ne pouvait tre fait pour dautres rgions du sud du Qubec, ce qui suggre un changement de la priode deffloraison propre aux environnements urbains (voir les diagrammes ci-aprs). Lherbe poux est un important allergne; comprendre sa propagation et son comportement en milieu urbain peut contribuer aux efforts visant amliorer la sant et le bien-tre des victimes dallergies.
Montral et Qubec
200

Autres endroits

Date de collection (date julienne)

180 160 140 120 100 80 60 1920 1940 1960 1980 2000 1920 1940 1960 1980 2000

Anne (Reproduction avec la permission du American Journal of Botany) (Lavoie et Lachance, 2006)

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

101

Ce chapitre value le dveloppement et la gestion des donnes taxonomiques, dont les suivantes : la numrisation des espces, les donnes de terrain, les contributions de la science citoyenne, la publication des donnes et les questions lies la capacit du Canada de grer, de partager les donnes et dy accder, en regard du rle que doivent jouer les normes de donnes.
6.1 a u g mEn T E R L E S i n f oR m aT ion S S uR La b i o d i vE R S i T

Les progrs technologiques ont augment les attentes relativement la capacit du Canada interroger efficacement les donnes et les informations sur la biodiversit. Cependant, le Canada dispose prsentement de ressources limites et mal soutenues de numrisation des informations des collections canadiennes. Par exemple, le Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB)22, un projet denvergure internationale visant assurer un accs gratuit et libre aux donnes sur la biodiversit canadienne, ne dispose que de 1,69 million de fiches numrises provenant des institutions canadiennes23, soit 3 % seulement du nombre despces rapportes dans le cadre de lenqute du comit dexperts (tableau 5.1). Par consquent, laccs en temps opportun et aux donnes de biodiversit compltes est trs limit au Canada, ce qui reprsente une lacune sur le plan des connaissances, qui compromet notre capacit de relever les dfis, importants, en matire de biodiversit.
Numriser les collections biologiques

Comme discut au chapitre 5, les collections biologiques du Canada contiennent au-del de 50 millions de spcimens. Des informations sont associes chacun de ces spcimens, mais celles-ci ne sont pas, pour la plupart, accessibles lectroniquement et donc ne peuvent aisment contribuer clairer les dcisions qui se prennent au Canada. Dans lenqute du comit dexperts portant sur les collections canadiennes, la majorit des rpondants ont rapport que soit quaucune partie, soit moins de 10 % des donnes de leur collection tait accessible en ligne; cette proportion variait galement selon le taxon. Par exemple, en ce qui a trait aux insectes, 28 des 44 collections, dont la Collection nationale canadienne qui compte 16,7 millions dinsectes, darachnides et de nmatodes, ont rapport que laccessibilit en ligne de leurs donnes de spcimens tait de 10 % ou moins. Ce niveau passait 11 des 21 collections pour ce qui est des mollusques, alors que pour les poissons, 9 des 20 collections avaient rapport un accs en ligne de 10 % ou moins. Voir lappendice 2, tableau A2.9 pour de plus amples dtails.

22 23

http://www.gbif.org/ Les donnes taient exactes en date du 25 mai 2010.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Le manque relatif de donnes de collection informatises peut tre attribu un manque dinvestissement constant dans ce domaine. Les muses canadiens comptent peu demploys affects la numrisation de leurs collections. Dans lenqute sur les collections canadiennes, seules 13 collections ont rapport avoir leur emploi des bioinformaticiens temps plein, et une seule collection en avait plus dun. Lidentification exacte des spcimens de collection est essentielle la cration de donnes de qualit. Or, le manque de taxonomistes qualifis impose des limites de base la numrisation. Le financement qui rend possible lacquisition doutils et de technologies de numrisation nest souvent pas complt de fonds permettant lentre des donnes. Dans plusieurs cas, ce sont des bnvoles et des tudiants qui, avec les chercheurs et les conservateurs, effectuent cette numrisation, selon le temps disponible (voir lappendice 2). Frquemment, mme lorsque les donnes ont t numrises, celles-ci ne sont pas plus accessibles pour autant, puisque les outils technologiques ne sinscrivent pas dans un rseau largi de partage de donnes. Souvent, la seule faon pour un utilisateur potentiel daccder des donnes importantes sur des spcimens est de se rendre physiquement lendroit o se trouve le spcimen, ou de communiquer avec le gestionnaire ou le taxonomiste de cette collection, sil existe effectivement une telle personne pour ce groupe taxonomique. Dans certains cas, les personnes qui sintressent ces donnes soccupent elles-mmes de numriser les informations dans le cadre de projets de recherche spcifiques. Or, celles-ci pourraient fort bien ne pas tre mises en rseau ou partages dans le cadre dinitiatives de numrisation plus vastes. Cette situation peut donner lieu une duplication des efforts et montre que le processus de numrisation doit tre davantage gr.
Les donnes associes aux observations sur le terrain

Aussi importantes que les collections sont les donnes associes aux levs et inventaires sur le terrain. Lobservation in situ demande la participation de taxonomistes ou de parataxonomistes comptents (p. ex., tudiants de deuxime et troisime cycle, tudiants de premier cycle forms dans ce domaine, et autres naturalistes comptents) qui se rendent dans diffrentes rgions du Canada pour y raliser des levs ou des inventaires dune espce ou de plusieurs espces. Ils amassent des donnes sur des organismes individuels et sur leur emplacement, souvent sans en rcolter un spcimen. Selon le niveau dexpertise de ces observateurs, les donnes recueillies sur le terrain donnent lieu dimportantes sommes de donnes trs utiles, qui savrent distinctes des spcimens des collections, mais galement complmentaires. Le SMIB rapporte que plus de 60 % des donnes totales sont associes des observations sur le terrain, ce qui dpasse la quantit de donnes provenant des fiches de spcimens. Les observations sur le terrain peuvent servir de plusieurs diffrentes faons : diriger des recherches supplmentaires,

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

103

crer des modles dtendue et de distribution despces, identifier les besoins spcifiques en matire dhabitat, tudier limpact du changement climatique et guider les actions de conservation de la biodiversit. Il existe un jeu rciproque entre les spcimens des collections et les observations sur le terrain, notamment en ce qui a trait lidentification exacte despces. Les spcimens des collections sont autant de rfrences de base revtant la plus grande importance en ce qui a trait lidentification des espces.
Les lacunes du Canada en matire de donnes dobservation

Dans ses observations sur le terrain, le Canada est opportuniste plutt que systmatique dans sa collecte de donnes sur la biodiversit. Mis part le cas des vertbrs, il existe dimportantes lacunes sur le plan des observations sur le terrain pour la plupart des groupes taxonomiques au Canada. Le rseau NatureServe Canada, qui dispose de donnes taxonomiques sur plus de 48 500 espces au Canada, tente activement de suivre ou de collecter des donnes dobservation de manire rgulire sur plus de 10 500 espces cibles en fonction de leur statut de conservation. Toutefois, la couverture gographique des donnes de NatureServe Canada nest ni complte, ni aussi exhaustive que les donnes quivalentes des tats-Unis. NatureServe Canada ne dispose pas de donnes spatiales, par exemple, pour le Nunavut et les Territoires du Nord-Ouest, et peu pour le Yukon, le nord de la plupart des provinces et dimportantes aires de lest du Canada. Les donnes sur les papillons, un des ensembles de donnes les plus complets du Systme canadien dinformation sur la biodiversit (SCIB, une initiative du gouvernement fdral mandate de coordonner les donnes de biodiversit24), servent dexemple qui permet dillustrer lapproche opportuniste du Canada en matire de cueillette dobservations (voir la figure 6.1). En tant que groupe taxonomique relativement charismatique et fort observ, la plupart des donnes sur les papillons sont recueillies dans les parties les plus populeuses du Canada. Pour ce qui est des rgions plus loignes, les fiches de spcimens concident souvent avec le rseau routier et les voies navigables. De grandes rgions loignes de ces voies plus praticables nont pas fait lobjet de levs de papillons ni dautres espces. La porte limite, tant spatiale que gographique, des donnes dobservation du Canada souligne la ncessit de procder dautres inventaires despces au Canada. Lorsque les donnes existent, celles-ci savrent tre dune grande utilit dautres branches scientifiques; par exemple, les donnes sur les papillons du tableau 6.1 ont t utilises pour tudier le changement climatique (p. ex.,

24

http://www.cbif.gc.ca/home_f.php

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

(Adapt et reproduit avec la permission de Larry Speers)

Figure 6.1 Donnes sur les papillons rpertories dans le Systme canadien dinformation sur la biodiversit (SCIB)
Chaque point sur la carte reprsente le dossier dun spcimen. Donnes exactes en date de mars 2010.

Kharouba et al., 2009). ce jour, le Canada na pas mis en place de programme dinventaire concert et efficace pour combler les pnuries dinformations cls sur sa biodiversit, mme en ce qui a trait des espces prioritaires dsignes en vertu de la Loi sur les espces en pril. En 2001, le Bureau du vrificateur gnral du Canada avait recommand quEnvironnement Canada, Pches et Ocans Canada et Parcs Canada dressent un inventaire complet des espces en pril qui relveraient de leur comptence respective. Le Bureau du vrificateur gnral a par la suite fait tat de progrs insatisfaisants relativement cette recommandation dans le cadre dun rapport publi en mars 2008 (Vrificateur gnral du Canada, 2008).
La science citoyenne : le rle du public dans la production de donnes de biodiversit

Le lancement rcent de lEncyclopdie de la vie, un ambitieux projet dont lobjectif est de produire une page Web pour chaque espce sur Terre, a permis de constater

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

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clairement lampleur de lengouement du grand public pour linformation sur la biodiversit accessible en ligne : 11,5 millions de personnes ont visit le site, la premire journe, provoquant une panne des serveurs (SEED, 2010). Le grand public contribue galement beaucoup aux donnes de biodiversit il sagit dun effort complmentaire celui des chercheurs professionnels spcialiss en biodiversit du Canada. titre dexemple, le SMIB rapportait que 56 % de toutes les fiches canadiennes sont des observations despces doiseaux (labondance de ces donnes sous-tend une sous-reprsentation de plusieurs autres groupes taxonomiques) et que plusieurs de ces contributions avaient t faites par des naturalistes amateurs. La principale source de ces donnes est le Rseau de connaissances aviaires (AKN, pour Avian Knowledge Network), une initiative couvrant lhmisphre ouest et qui traite les donnes depuis ses bureaux aux tats-Unis. LAKN recueille des donnes au Canada par lentremise de son projet eBird, dvelopp par tudes doiseaux Canada (EOC), le Laboratoire dornithologie de Cornell et la Socit nationale dAudubon (National Audubon Society). Le projet documente la prsence ou labsence despces, de mme que labondance doiseaux, depuis une liste de contrle des donnes. Une interface simple et intuitive en ligne permet des dizaines de milliers de participants, dont plusieurs sont au Canada, de soumettre leurs observations ou de consulter la base de donnes eBird par le biais doutils de recherches interactifs. eBird encourage les visiteurs y participer en leur fournissant des outils en ligne qui leur permettent de conserver leurs fiches doiseaux personnelles et de visualiser les donnes au moyen de cartes, de graphiques et de diagrammes barres interactifs. Ces donnes peuvent tre utilises pour modliser les distributions doiseaux et pour explorer les facteurs qui influent sur leur conservation. Au Canada, on a tent de profiter de la science citoyenne pour observer dautres groupes taxonomiques. Ensemble, Environnement Canada, Nature Canada et lUniversit de Guelph ont mis sur pied le programme NatureWatch Canada, qui a pour mandat de recueillir des donnes sur les grenouilles, les plantes et les vers du Canada, par le biais de citoyens de la science. Le programme vient augmenter les donnes du SMIB, bien que celui-ci soit loin davoir connu autant de succs que le programme eBird. Lvolution perptuelle de la technologie et la sophistication croissante dInternet signifient quil est de plus en plus facile daugmenter les programmes de science citoyenne. mesure que les technologies de positionnement global (GPS) et les ordinateurs de poche deviennent accessibles au grand public, la science citoyenne peut aider amliorer grandement lexactitude spatiale des observations et permettre une identification plus prcise des espces. Dans plusieurs cas, on monte des programmes visant former les observateurs, afin quils ralisent des observations et quils puissent mme sadonner la collecte de spcimens (voir aussi lencadr 6.2 pour le rle des guides didentification).

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Par exemple, le Centre de donnes sur la conservation du Canada Atlantique a dvelopp un atlas de cinq ans des papillons des Maritimes pour faciliter lobservation de papillons. En exploitant les efforts combins des scientifiques de la conservation et ceux des naturalistes, le programme tente damliorer la qualit de linformation sur le nombre, la distribution et le statut des papillons des Maritimes, ce qui sera tout particulirement utile dans lvaluation du statut de conservation de diffrentes espces (CDCCA, 2010).

Encadr 6 .2 Les guides didentification : un outil indispensable pour faire le lien entre les citoyens de la science et les taxonomistes
Le public canadien est maintenant en mesure de faire une grande contribution aux sciences de la taxonomie grce la prolifration de guides dhistoire naturelle crits par des spcialistes au moyen dune varit de donnes, dont des donnes taxonomiques. Les citoyens se servent de ces guides doiseaux, de plantes, dinsectes et dautres organismes pour identifier les espces mme leur milieu naturel, puis pour tablir des rapports dobservation sur le comportement des spcimens observs et consigner ceux-ci. Ces donnes dobservation sur le terrain aident leur tour les taxonomistes dvelopper des portraits de distribution despces plus exacts qui permettront de mieux dfinir les espces.

(Gracieuset du Muse royal de lOntario ROM)

(Gracieuset du Royal BC Museum)

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

107

6.2

L a C C S a u x i n f oR m aT i o n S SuR La biodiv ERS iT

Une fois les donnes cres, il faut les publier et les partager. Ce nest qualors que les chercheurs, dcideurs et citoyens retirent la pleine valeur de linformation sur la biodiversit.
La publication des donnes

Llaboration dapproches cohrentes favoriserait llaboration de donnes au Canada. Cependant, il existe des lacunes sur le plan des donnes dobservation et de spcimens qui peuvent tre en partie attribues un historique, dans la communaut des sciences de la biodiversit, de cloisonnement des donnes au profit de projets de recherche individuels. Bien quil existe des initiatives visant, dune part, travailler de faon plus collaborative et stratgique, et dautre part, assurer la mise en commun de donnes de biodiversit qui reposent sur des balises communes, les chercheurs individuels sont peu enclins faire leffort supplmentaire en ce sens, ni assumer les dpenses supplmentaires requises pour rendre publiques leurs bases de donnes (Costello, 2009). Les donnes de biodiversit peuvent ainsi tre disperses dans plusieurs bases de donnes ou encore ne subsister que sur des supports papier, sur des tiquettes de spcimens de collection, ou sur dautres supports qui ne sont pas propices la recherche ou aux dcouvertes interactives. Sans un dpt clairement identifi et reposant sur des normes communes, les donnes numrises risquent dtre perdues. Faire avancer le travail ncessaire la dcouverte despces pourrait ncessiter une transformation de la faon dont les carrires des biologistes sont values. Dans la plupart des disciplines scientifiques, cest le dossier de publication qui est la jauge de crdibilit : plus on publie, plus on est rcompens. Les carrires des scientifiques sont habituellement mieux servies par la publication de plusieurs articles plus courts que par un nombre moindre douvrages de plus longue haleine. En taxonomie, cependant, la publication la plus efficace est la somme de plusieurs dcouvertes individuelles les rsultats de douzaines de nouvelles espces diffrencies en une importante monographie comparative. Par ailleurs, il demeure que les contributions de base des taxonomistes sont les spcimens quils collectent et les donnes quils entrent dans les bases de donnes, et non seulement leur dossier de publication proprement parler. Ces contributions, qui ne sont pas prises en compte dans le dossier de publication, sont pourtant appeles devenir une partie de plus en plus importante du travail des taxonomistes, mesure que la discipline adopte des moyens plus efficaces de publier et de diffuser les donnes. Afin de mieux reconnatre les contributions des taxonomistes, des efforts sont dploys dans dautres communauts de recherche (p. ex., Howe et al., 2008) pour concevoir un systme uniformis de microattributions qui comptent les contributions sur une chelle plus affine qui va au-del du seul dossier de

108

La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

publication, en mesurant les spcimens dposs, les espces dcrites, les squences dADN obtenues, et les entres dans les bases de donnes. Bien sr, pour russir mieux reconnatre les contributions des taxonomistes, ces nouveaux paramtres devront tre reconnus par leurs collgues et les administrateurs des institutions. Les politiques institutionnelles mergentes et des mesures incitatives (p. ex., qui seraient lies lavancement professionnel) seront ncessaires pour reconnatre davantage limportance de ces contributions.
Le partage des donnes

Il ne suffit pas de numriser les informations, elles doivent aussi tre accessibles. Laccs exige que les donnes soient captes et partages en vertu de normes communes de prsentation des donnes. Les Normes dinformation sur la biodiversit (pour Biodiversity Information Standards (TDWG), anciennement connu sous Taxonomic Database Working Group25), une association internationale scientifique et ducative sans but lucratif affilie lUnion internationale des sciences biologiques (qui ne compte aucune institution canadienne parmi ses membres) a adopt la norme Darwin Core une plateforme dchanges de donnes simple et extensible. Cette norme est devenue le fondement du partage de donnes, mais dautres dfis demeurent. Lexactitude des informations taxonomiques est fondamentale aux donnes partages, pour veiller ce que linformation sur une espce ne soit pas confondue avec des donnes dautres espces. Lencadr 6.3 propose un aperu

Encadr 6 .3 Limportance de la gestion des donnes taxonomiques


Le Systme dinformation taxonomique intgr (SITI) est une initiative de gestion de linformation taxonomique des espces nord-amricaines. Le Canada a adopt les numros de srie taxonomiques (TSN) et en a fait un lment obligatoire des donnes sur les espces sauvages, en vertu de la Convention sur le commerce international des espces en pril (CITES). De plus, le SITI a conclu un partenariat avec lorganisme Species 2000, en vue de produire le Catalogue de la vie. Publi chaque anne, ce catalogue, qui contient plus de 1,26 million despces uniques, fait maintenant autorit sur le plan des donnes taxonomiques, donnes dont se servent de grands projets internationaux, comme le SMIB et lEncyclopdie de la vie (EOL). Sil est dot de ressources suffisantes, le SITI a le potentiel et lextensibilit ncessaires pour simposer comme la norme taxonomique de rfrence au Canada, et servirait une gamme de chercheurs et dautres communauts consommatrices de telles informations.

25

http://www.tdwg.org/

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

109

de lutilisation croissante, au Canada, du Systme dinformation taxonomique intgr (SITI). Dans dautres cas, les donnes peuvent tre sensibles : par exemple, le fait dexposer des donnes sur une espce cultive dsigne comme tant en pril, comme le ginseng cinq folioles, peut aggraver davantage la situation de cette espce. Il arrive encore que les donnes soient considres comme tant de diffusion restreinte plutt que sensibles, notamment pour permettre un chercheur de prparer une publication ou de respecter les droits de proprit intellectuelle. La ncessit de respecter de telles proccupations et de tels droits est critique au partage et au libre accs de telles donnes.
Les rseaux nationaux

Une bonne part des donnes disponibles sur la biodiversit sont captes et partages par une poigne de rseaux au Canada. Deux dentre eux travaillent actuellement la capture systmatique de donnes de tous les groupes taxonomiques pour tout le Canada : le Systme canadien dinformation sur la biodiversit (SCIB) sert de point de rassemblement du partage de donnes, au Canada comme ltranger, alors que NatureServe Canada, un rseau de centres de conservation de donnes provinciaux et territoriaux, met en commun les donnes taxonomiques et dobservation sur les espces.

Encadr 6 .4 Le Centre sur la biodiversit, Universit de Montral


Centre dexcellence de conservation et de numrisation des collections dhistoire naturelle et de recherche et formation en biodiversit, le Centre sur la biodiversit, situ au Jardin botanique de Montral, ouvrira ses portes la fin 2010. Le Centre accueillera les collections dhistoire naturelle de lUniversit de Montral, de lHerbier Marie-Victorin, de la Collection entomologique Ouellet-Robert, de lInsectarium de Montral, et du Fungarium, un herbier de myctes appartenant au Cercle des mycologues de Montral, une organisation amateur bien connue. Cette nouvelle installation coordonnera le rseautage et laccs international aux bases de donnes des principales collections biologiques de plantes, dinsectes et de myctes de Canadensys le consortium des universits canadiennes sur la biodiversit. Le Centre disposera de la technologie dimagerie qui lui permettra de photographier des spcimens dherbiers et dinsectes, de mme que de microscopes lectroniques balayage et de logiciels permettant la numrisation de spcimens. Les informations et images figurant dans des bases de donnes seront accessibles par le biais de Canadensys et du SMIB, et ce partage des donnes reprsentera une importante contribution la disponibilit des donnes de biodiversit canadiennes.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Parmi dautres rseaux cls de donnes de biodiversit canadiennes, nommons les suivants : Canadensys, une affiliation duniversits voue rendre plus accessibles les informations sur les spcimens des collections biologiques universitaires et faciliter leur mise en commun (voir lencadr 6.4); Base de donnes du Code-barres de la vie (BOLD, pour Barcode of Life Data) (voir lencadr 3.2); Fishnet, un rseau qui partage des donnes sur des espces de poissons qui se trouvent dans les muses dhistoire naturelle et dautres institutions; et eBird Canada, une importante base de donnes dobservation, dont une bonne partie des donnes est disponible par lentremise du Rseau de connaissances aviaires (AKN) et tudes doiseaux Canada (EOC). Nombre de rseaux moins connus captent et partagent des donnes de biodiversit de base au Canada (p. ex., ORNIS, MaNIS et HerpNet), et comptent des donnes de spcimens de groupes taxonomiques spcifiques, dont des donnes axes sur le Canada. Dans plusieurs cas, ces autres sources de donnes de spcimens canadiens sont situes lextrieur du Canada et les donnes publies par le SMIB sont par consquent reconnues comme provenant de lextrieur du Canada.
Le partage de donnes lchelle internationale

Les efforts de partage de donnes du Canada font pitre figure sur la scne internationale. La participation au SMIB, un point de partage international de donnes, demeure un choix qui revient aux organisations et rseaux individuels. Le manque dinvestissements lappui de la numrisation de collections et de donnes dobservation, ainsi que labsence dune politique muscle exigeant la numrisation, rduisent beaucoup les contributions canadiennes aux bases de donnes mondiales, comme le montre la figure 6.2. Cet tat de fait limite galement la capacit du Canada de tirer des informations utiles de ces bases de donnes. Le portail du SMIB donne des statistiques de base sur les sources de ses donnes. Celui-ci contient, en fait dinformations taxonomiques gnrales, un total de 51 209 espces rpertories au Canada, bien que certaines dentre elles soient des fossiles et que dautres puissent encore tre des doublons (p. ex., il existe plusieurs entres pour le Poa pratensis L., plus communment connu comme le pturin des prs ou le pturin commun : en anglais, on le dsigne tour tour comme Smooth Meadow-grass , Common Meadow Grass et Kentucky Bluegrass ). Cela reprsenterait environ la moiti des espces connues du Canada et un tiers des espces estimes. Le SMIB possde des donnes sur 9 427 espces dinsectes canadiens, ce qui quivaut environ un tiers des 30 000 espces dinsectes connues

Chapitre 6 Laccs accru aux informations sur la biodiversit

111

80

Fiches de spcimens (millions)

70 60 50 40 17,01 30 20 10 24,02

75,81

10,93

7,27

5,69

5,35

4,88

4,04

3,67

2,84

2,82

2,62

1,86

1,77

1,78

1,72

1,69

1,51

Figure 6.2 Les 20 pays collaborateurs les plus importants au Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB)
Les bases de donnes de spcimens du SMIB ont t interroges le 25 mai 2010 pour tablir le nombre total de fiches de spcimens contribues, par pays. La figure montre seulement les 20 premiers pays.

du Canada, et environ 17 % des prs de 55 000 espces dinsectes estimes au Canada (voir le tableau 5.1). Ces donnes peuvent tre utilises par les chercheurs pour modliser ltendue et limpact du changement climatique ou encore pour examiner les interactions entre espces. Le SMIB rpertorie un total de 6,35 millions de spcimens dont les informations sur la latitude et la longitude indiquent quils se trouvent au Canada. Pourtant, le SMIB indique que seul 1,33 million de ces spcimens est log et administr par des institutions canadiennes, et que la majorit (3,80 millions) est plutt dtenue aux tats-Unis. Cela signifie quenviron 80 % de linformation numrise daccs libre portant sur le Canada est tenue et fournie par des institutions situes lextrieur du Canada, et il soit important de se rappeler que la majorit des informations du Canada (que ce soit dans les collections ou dans les notes dobservation sur le terrain) nont toujours pas t numrises.

d Ro e yau me -U ni Fra nce All em ag ne Pa ysBa Da s ne ma rk Esp ag ne Au str al No ie rv ge Co sta Ric a Au tr Afr iqu iche ed uS u Me d xiq ue Fin lan de Jap on Po log ne No uv Cana ell da Co e-Z re la ,R nd p e ub liq ue de

s-U

ta t

Su

nis

(Source des donnes : GBIF, 2010)

1,17

112

La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Selon le comit dexperts, le Canada nest pas pleinement engag dans les efforts mondiaux de dveloppement et dchange de donnes de biodiversit. Cela est d au fait quil manque de financement, de direction gouvernementale dcisive et dune culture de recherche taxonomique dans ce domaine. Il sera essentiel dadopter les changements, plutt que dy rsister, pour assurer le succs de la communaut taxonomique au Canada. Une telle volution de la culture, soutenue par des investissements dans les collections et les inventaires de base au Canada, complterait lamlioration des bases de donnes. Cela augmenterait notre accs aux connaissances sur les espces indignes de mme que sur les espces envahissantes et mnerait, au Canada, un soutien plus efficace des politiques et des activits de gestion de la biodiversit.

Points saillants du chapitre


Numriser les collections de biodiversit et investir dans les enqutes de base et les inventaires est essentiel la comprhension du changement environnemental, lidentification et au contrle des espces non indignes et lidentification et la conservation des espces en pril. Le Canada affiche dimportantes lacunes gographiques et taxonomiques en matire de couverture des donnes. On sollicite souvent lavis des experts canadiens relativement la gestion de la biodiversit, mme si ceux-ci se basent sur une quantit limite de donnes. Dans le domaine des sciences de la biodiversit, il nexiste pas dincitatifs financiers ou politiques apprciables lappui de la numrisation et de la diffusion des donnes. Il existe des normes internationales de numrisation et de partage des donnes. Or, sur la scne internationale, le Canada fait pitre figure sur le plan de la numrisation, des inventaires et des contributions aux projets de partage des donnes, tel le Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB). La majeure partie des informations du Canada nest toujours pas numrise, et 80 % des informations en ligne portant sur la biodiversit canadienne sont dtenues et affiches par des institutions situes lextrieur du Canada.

Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits

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Chapitre 7

La taxonomie au Canada : crer des possibilits

Le Canada a des forces dans plusieurs domaines de la taxonomie, mais affiche galement dimportantes lacunes. De plus, il lui manque un plan stratgique qui lui permettrait de profiter des occasions lies ses ressources en biodiversit. Le Canada ne fait pas bande part, cet gard, mais la situation volue et plusieurs nations consacrent des budgets importants la dcouverte et la documentation de la biodiversit. Le Canada est bien positionn pour stablir comme un chef de file mondial en taxonomie, un statut qui est associ dintressantes retombes, tant environnementales quconomiques.

Les chapitres prcdents de ce rapport taient consacrs lvaluation de la capacit du Canada en taxonomie la science qui dcouvre, diffrencie, classifie et documente les tres vivants. Ce dernier chapitre procde une analyse des lacunes, laquelle est suivie dune section qui passe en revue les faons dont les nations du monde sont btir leur capacit en taxonomie. La troisime section est consacre aux derniers dveloppements qui ont renforc ltat de prparation de notre pays concevoir une initiative majeure dans ce domaine de la science. La dernire section met de lavant une approche permettant de stimuler la taxonomie au Canada, et se penche sur les avantages lis une telle approche.
7.1 LE S aC T i f S E T L E S L aC u nE S dE La Ta x o n o m iE Ca n a d iEn n E

Le comit dexperts a relev dimportants actifs stratgiques en taxonomie canadienne. Le Canada est dtenteur dimportantes collections dhistoire naturelle qui sont values, de faon conservatrice, un quart de milliard de dollars. Il dispose aussi de chercheurs et de programmes de recherche de calibre mondial. Le savoir des populations autochtones et du secteur non gouvernemental du Canada reprsente par ailleurs un ajout considrable la capacit de la biodiversit aux secteurs gouvernemental et universitaire. Les jeunes Canadiens sont trs attachs la taxonomie et souhaiteraient y faire carrire, ce qui est le reflet du fait quils vivent dans une nation connue pour ses terres magnifiques, dont une part apprciable est toujours ltat naturel. La nation devrait profiter de cet intrt. Le Canada possde galement une capacit danalyse de calibre mondial dans trois domaines linformatique, la gnomique et la tldtection , qui soutient une nouvelle approche la dcouverte, la documentation et lvaluation de la biodiversit.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Lacunes actuelles
Au Canada, il existe des lacunes sur les plans de la description despces et de la distribution gographique. Le Canada est galement la trane par rapport dautres pays en ce qui concerne la numrisation, les inventaires systmatiques, de mme que le soutien en matire de contributions nationales aux initiatives internationales de partage de donnes sur la biodiversit. On constate labsence dune stratgie et de normes nationales en matire de collections. Plusieurs collections sont entreposes dans des installations dsutes et inadquates, dont la capacit de croissance est limite. Le personnel hautement qualifi se perd en raison de possibilits demploi peu prometteuses et de niveaux de financement de recherche stagnants. Les taxonomistes et les naturalistes sont vieillissants et ne sont pas remplacs au moment de leur dpart. Les connaissances traditionnelles et communautaires sont risque.

Consquences
Une capacit insuffisante grer, conserver et se servir adquatement de la biodiversit canadienne. Une capacit limite valuer la rponse de la biodiversit canadienne aux changements mondiaux, et son importance dans la capacit dattnuation et dadaptation. Une capacit limite ragir la menace des espces envahissantes et la prolifration dorganismes nuisibles. Une capacit limite de la taxonomie fournir un soutien de base dautres volets des sciences de la biodiversit. Une capacit limite identifier les composantes de la biodiversit dans un contexte canadien. Une baisse dintrt, notamment de la part de jeunes Canadiens, lendroit de la biodiversit et des cosystmes.

Rsultats
Une capacit rduite comprendre la biodiversit, sa perte et lrosion de services cologiques connexes. Cette biodiversit est source de bienfaits pour lconomie, la sant et la culture des Canadiens. La biotechnologie et les industries primaires comme lindustrie forestire, lagriculture et la pche sont particulirement vulnrables.

(Conseil des acadmies canadiennes)

Figure 7.1 Lacunes sur le plan de la taxonomie canadienne, consquences de ces lacunes et rsultats potentiels long terme

Bien que le Canada dispose davoirs cls, lanalyse du comit dexperts a rvl que certaines de ses forces sont menaces et quon ne tire pas pleinement profit des bienfaits potentiels de la biodiversit (figure 7.1). Ainsi, pour rpondre directement

Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits

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la question que lui a soumise le ministre, le comit dexperts estime que le Canada nest pas encore outill pour pleinement comprendre les dfis que prsentent ses ressources en diversit. Nombre despces, voire la plupart des espces des cosystmes canadiens, ne sont pas encore connues et nous navons pas encore labor de mthode didentification rapide pour la plupart des espces connues. Le Canada est le foyer de nombre de collections impressionnantes de spcimens, mais la plupart des renseignements sur ces spcimens sont enferms dans des placards plutt que dtre librement et gratuitement accessibles en ligne. Cette situation doit tre corrige, pour le bien non seulement de la taxonomie, mais aussi pour celui des autres disciplines en biologie qui dpendent des informations taxonomiques. On a relev dimportantes lacunes gographiques sur le plan de laccs linformation sur la biodiversit au Canada qui exigent, pour y remdier, le captage de donnes de terrain existantes, dimportantes recherches sur le terrain et la surveillance long terme. Il faut absolument augmenter le recrutement de jeunes taxonomistes parce que nombre des chefs de file actuels du Canada dans ce domaine approchent lge de la retraite et notre contribution internationale la recherche diminue. Il nexiste pas de stratgie ou de programmes nationaux permettant de crer une cohsion et une interactivit entre les intervenants gouvernementaux, universitaires et du secteur priv qui uvrent dans le milieu des sciences de la biodiversit.
7.2 L a Ta x o n o m iE : u n E S C i EnCE En TRan SiTion

Les sciences de la taxonomie se transforment les progrs rcents, notamment dans les domaines de la gnomique et des sciences informatiques, rvolutionnent autant laccs linformation sur la biodiversit que la cadence de la documentation. De plus en plus de nations y font des investissements majeurs, en esprant profiter des possibilits lies ce domaine. Aux tats-Unis, la Fondation nationale des sciences (NSF) dploie plusieurs programmes axs sur la taxonomie. Le programme Partenariats visant rehausser lexpertise en taxonomie (PEET, pour Partnerships for Enhancing Expertise in Taxonomy) a dj dbours 30 millions de dollars amricains pour soutenir la formation de la prochaine gnration de taxonomistes (NSF, 2010b). Un autre programme, Assembler larbre de la vie (AToL, pour Assembling the Tree of Life), a distribu plus de 115 millions de dollars amricains pour des collaborations de recherche denvergure dont le but est de tirer au clair les relations phylogntiques entre les principaux groupes dtres vivants (p. ex., tous les poissons, tous les vers). Une troisime initiative, lInventaire plantaire de la biodiversit (PBI, pour Planetary Biodiversity Inventory), a distribu, ce jour, 15 millions de dollars amricains lappui de projets denqutes exhaustives de la biodiversit qui ciblent plus prcisment certaines lignes de vie (p. ex., tous les poissons-chats). Enfin, nommons le Rseau dobservatoires cologiques nationaux (NEON, pour National Ecological

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Observatory Network), o intervient la NSF mais aussi dautres dpartements et agences. NEON est une initiative dote de 300 millions de dollars amricains voue la surveillance de la biodiversit dans 20 sites rpartis aux tats-Unis, et ce, sur une priode de 30 ans; elle jumelle des programmes de collecte et des programmes didentification gntique et de tldtection (NEON, 2010). Dautres pays misent aussi beaucoup sur la taxonomie. LInitiative sudoise de taxonomie (Swedish Taxonomy Initiative), un programme de 20 ans dot dun budget de plus de 200 millions de dollars amricains, est assembler un recueil accessible au public des espces multicellulaires qui se trouvent sur le territoire sudois (ArtDatabanken, 2010). LAtlas de lAustralie vivante (Atlas of Living Australia), une initiative lance en 2008 et dote dun budget de 30 millions de dollars australiens, a pour sa part une orientation diffrente : ce partenariat gouvernemental-musal btit le systme informatique et de gestion des donnes ncessaire pour fournir tous les Australiens un accs en ligne aux informations sur leur biodiversit (CSIRO, 2010). Ajoutons galement le rseau EDIT (pour European Distributed Institute of Taxonomy), un projet de 12 millions deuros vou la mise sur pied dun rseau dexcellence compos de 28 grands instituts de biodiversit situs partout en Europe (EDIT, 2008). Les organismes de financement canadiens ne sont pas en reste pour autant. Ils ont investi plus de 50 millions de dollars dans lavancement des tudes phylogntiques et dans llaboration dun systme didentification gntique despces. Or, ce sont les occasions de financement des initiatives, des collections et des projets de bases de donnes canadiennes qui font dfaut. Ces diverses initiatives de recherche, qui reposent toutes sur des balises bien solides en taxonomie classique, bnficient des technologies du numrique, de lanalyse molculaire et de la tldtection. Du point de vue des grands projets scientifiques, ces investissements, qui varient de 15 300 millions de dollars, sont nanmoins modestes et signifient quaucune nation na encore tabli de programme qui saisisse pleinement au vol ces nouvelles occasions. Il est clair, toutefois, que ces activits de recherche ont beaucoup aid dvelopper les collaborations entre chercheurs dans les domaines de la taxonomie et de lanalyse de la biodiversit. De telles collaborations sont galement essentielles la revitalisation du travail de base, en taxonomie, dont les identifications et les descriptions, qui demeurent un point dancrage incontournable des sciences de la biodiversit.
7.3 LE S S C iE n C E S d E L a b i o d i vE R S i T au Canada : u n E La n C E q u i S i nT E nS i f i E

Comme not plus tt, lcologie, lvolution et la taxonomie des disciplines qui sont au cur des sciences de la biodiversit sont autant de forces que dveloppe depuis longtemps le Canada. Pourtant, jusqu tout rcemment, la capacit du Canada dans ces domaines reposait en bonne partie sur les capacits individuelles

Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits

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de chercheurs ou de petites quipes. Cette dernire dcennie a t marque par dimportants changements cet gard : les chercheurs ont uni leurs forces pour btir des alliances qui exploitent les nouvelles technologies dcrites dans ce rapport. LInstitut de la biodiversit de lOntario, le Centre de recherche sur la biodiversit de lUniversit de la Colombie-Britannique, et le Centre sur la biodiversit, au Qubec, sont autant de regroupements de recherche qui reoivent un important soutien financier depuis 2005. Les interactions lchelle de la communaut universitaire des scientifiques qui se consacrent la biodiversit ont t aiguillonnes par le lancement, en 2007, de Canadensys, un rseau de bases de donnes taxonomiques universitaires. Les agences et ministres fdraux ayant un intrt quelconque tirer de lavancement des sciences de la biodiversit ont galement atteint un niveau ingal de coordination la suite de la mise sur pied, en 2003, du Partenariat fdral en matire dinformation sur la biodiversit. On constate aussi un dialogue de plus en plus dynamique avec les organisations non gouvernementales (ONG) actives au Canada comme lUnion internationale pour la conservation de la nature (UICN), qui publie une Liste rouge des espces menaces, le Systme mondial dinformation sur la biodiversit (SMIB), qui vise mobiliser les donnes de biodiversit, et NatureServe, qui se sert des donnes de biodiversit pour rehausser les actions de conservation. Cette cohsion accrue des ressources humaines est accompagne dinvestissements majeurs dans les installations de recherche. Depuis dix ans, la Fondation canadienne pour linnovation (FCI) a vers aux universits de la Colombie-Britannique, de Guelph et de Montral et dautres agences un montant total qui dpasse les 80 millions de dollars, afin de btir de nouvelles installations de sciences de la biodiversit. Des investissements de plusieurs millions de dollars ont t verss au Muse canadien de la nature, la Collection nationale canadienne et au Muse royal de lOntario. Outre ces nouvelles infrastructures en milieu urbain, la capacit du Canada de soutenir des programmes de surveillance long terme en rgion loigne a t renforce de lordre de 85 millions de dollars. Cet investissement est destin la remise en tat des stations de lArctique, et on annoncera sous peu un investissement de 250 millions de dollars pour soutenir une station du HautArctique. Des investissements supplmentaires dans les stations de recherche btiraient non seulement une capacit de formation, mais fourniraient galement une occasion de mettre sur pied des programmes de recherche novateurs et de surveillance long terme des changements des cosystmes. La communaut des sciences de la biodiversit a aussi reu un soutien important de la part du Programme de rseaux stratgiques de recherche du CRSNG, qui verse 15 millions de dollars depuis 2005 lappui de rseaux de soutien dans les domaines du code-barres dADN, de la biologie de pollinisation et des espces envahissantes. Chacun de ces rseaux est une ralisation majeure sur le plan de la recherche, mais le niveau de financement (un million de dollars par anne),

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

sa dure de vie limite (cinq ans), et la ncessit dtablir un axe thmatique signifie que lintgration accrue des sciences de la biodiversit naura pas t atteinte. Sur une note positive, ces rseaux et ces centres de biodiversit y sont pour beaucoup dans ltablissement de liens scientifiques et la capacit administrative accrue, deux lments qui ont contribu mieux prparer la communaut des sciences de la biodiversit du Canada grer des investissements importants dans des projets de grande envergure.
7.4 LE R L E f u T u R d E L a Ta x o n o m iE dan S u n C a n a d a a x S u R L E Sav o i R

Le comit dexperts estime que le Canada est bien positionn pour jouer un rle de chef de file sur la scne mondiale, en taxonomie et dans les sciences de la biodiversit. Cette conclusion repose en partie sur les ralisations de la dernire dcennie, lesquelles sont prsentes dans la section prcdente. Elle reflte galement le fait quaucune autre nation na dvelopp de programme qui intgre pleinement les technologies mergentes et un savoir taxonomique bien camp. Le Canada pourrait tre le premier y parvenir, condition quune vision audacieuse soit mise de lavant et soutenue par sa communaut scientifique, ses dcideurs, ses dtenteurs du savoir traditionnel, ses organisations non gouvernementales (ONG) et son secteur industriel. Proposer des mcanismes dtaills et des modles de financement lappui de cet effort outrepasse le mandat du comit dexperts. Prcisons nanmoins que le programme des Rseaux de centres dexcellence du Canada (RCE) et les outils financiers issus du Programme de chaires de recherche du Canada ont permis au Canada de se hisser jusqu devenir un des chefs de file lchelle mondiale dans dautres domaines dintrt national, comme il la fait dans le domaine des sciences de lArctique26. Une stratgie de financement similaire pourrait transformer la taxonomie et les sciences de la biodiversit, et les retombes pour la nation seraient nombreuses. La capacit scientifique est rarement le facteur dterminant dans lobtention dinvestissements majeurs dans un domaine scientifique particulier; lanalyse de rentabilit prend souvent le dessus sur les proccupations scientifiques. Il y aura certainement des cots rattachs prparer le Canada pour quil puisse pleinement comprendre et grer ses ressources en biodiversit, mais les retombes seront nombreuses. La dernire section de ce chapitre passe en revue trois des moyens qui feraient en sorte que la capacit accrue en taxonomie puisse contribuer

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http://www.arcticnet.ulaval.ca/

Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits

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au bien-tre conomique du Canada, son statut titre de citoyen du monde responsable, et la protection de ses ressources naturelles.
Linnovation : des solutions biologiques des problmes complexes

Linnovation exige lexploration et la mise lpreuve dides novatrices. Alors que les tres humains sadonnent cet exercice depuis des millnaires, la nature sy adonne depuis des milliards dannes : chaque espce a explor des solutions novatrices lui permettant dassurer sa survie, puis a mis ces ides lpreuve par le biais de la slection naturelle. Ce processus par ttonnements sest produit chez des millions despces pendant des millions dannes, donnant lieu diverses solutions divers problmes. Les oiseaux ont dvelopp le vol, et les humains sen sont inspirs. Le perce-tige de la bardane a dvelopp le velcro, et les humains lont imit. Les myctes ont labor des substances chimiques pour contrler les bactries, et les humains les exploitent dsormais titre dantibiotiques. Les plantes ont dvelopp des mcanismes de dfense chimiques pour repousser les herbivores, et les humains y puisent et sen servent de plusieurs faons, que ce soit titre de mdicaments ou pour protger leurs rcoltes. Chaque espce reprsente laboutissement dune chane ininterrompue de survivants sur des milliards dannes il sagit donc dune encyclopdie dinnovations prouves qui ont assur la survie de cette espce. Diffrentes espces ont privilgi diffrentes innovations, provoquant ainsi le besoin de procder lidentification des espces si on souhaite bien explorer ces innovations biologiques. Les caractristiques quont dveloppes les espces et qui sont encodes mme leurs gnes sont en quelque sorte la proprit intellectuelle ou les innovations non brevetes de ces espces; celles-ci sont prtes tre dcouvertes et exploites. Les humains sadonnent la bioprospection depuis des millnaires plusieurs des analgsiques et des stimulants provenant des plantes ont dabord t identifis grce au savoir traditionnel. Or, la cadence de la dcouverte de ces solutions toutes faites sacclre mesure que nous matrisons la biologie cellulaire et les techniques de reproduction des solutions biologiques par lentremise de perces en chimie, en gnie chimique et en nanotechnologie. Dautres nations ont commenc laborer des plans stratgiques qui font de la biodcouverte le nud de leur stratgie sur la biodiversit. Par exemple, la Norvge a tabli un programme qui isole les composs bioactifs des espces arctiques, ce qui mnera nombre de brevets. Des activits pousses de recherche taxonomique permettraient au Canada de se concentrer sur la dcouverte de composs et de voies biochimiques utiles dans de multiples domaines : de la gnration de biocarburants la protection de la sant humaine et au dveloppement de nouveaux procds manufacturiers.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Respecter nos engagements nationaux en matire de conservation de la biodiversit

Nous habitons une plante dont la biodiversit est de plus en plus menace. Ce fait a t dmontr de faon dramatique : les Nations Unies ont rcemment dcid dtablir une Plateforme de politique scientifique intergouvernementale sur les services de biodiversit et dcosystmes (Intergouvernemental Science Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services). Le Canada sest dot de plusieurs politiques qui tmoignent de notre engagement national vis--vis de la protection de la biodiversit, dont, entre autres, la Loi sur les espces sauvages au Canada, la Loi sur les parcs nationaux du Canada, la Loi sur les pches et la Loi canadienne sur lvaluation environnementale. Le Canada est galement signataire daccords internationaux, dont la Convention sur le commerce international des espces en pril (CITES), la Convention sur les zones humides dimportance internationale, ou Convention de Ramsar, la Convention des Nations Unies sur le droit de la mer, et de faon plus globale, la Convention sur la diversit biologique (CDB). La ralisation des objectifs de ces accords repose sur les sciences de la biodiversit, qui sappuient sur les informations taxonomiques de base. Il faut y voir une dure ralit. La capacit limite du Canada faire lanalyse des informations de la biodiversit restreint sa capacit atteindre les objectifs tablis dans ces instruments de politique. Cela na rien de nouveau la Stratgie canadienne de la biodiversit (1995) a t la premire reconnatre la ncessit dtablir notre propre catalogue qui inventorie la vie que lon trouve en sol canadien. Llaboration dun programme national de taxonomie qui tire pleinement avantage des nouvelles technologies est ncessaire pour combler cette lacune, et mettre capacit et engagement sur un mme pied dgalit.
Protger les ressources naturelles du Canada

Parmi les nations du monde, le Canada est un des premiers exportateurs de produits agricoles et forestiers. Or, cette position ne pourra tre maintenue que si le Canada dveloppe une capacit scientifique suffisante en taxonomie et dans les autres sciences de la biodiversit pour lui permettre de faciliter le dveloppement de nouveaux cultivars et pour faire en sorte que les pratiques dutilisation des sols soient durables. Des programmes de biosurveillance sont par ailleurs ncessaires pour assurer que les rcoltes et les forts soient mises labri, tant des espces nuisibles rsidantes que des nouveaux envahisseurs. Les avantages conomiques lis linterception dune seule espce envahissante peuvent tre normes. La moule zbre a fait son entre dans les eaux canadiennes en 1987. Depuis ce temps, sa prsence a cot trs cher aux Canadiens. En effet, plus de 5 milliards de dollars ont t dpenss par les tats-Unis et par le Canada, ciblant le seul bassin des Grands Lacs (Pimental et al., 2000). Par ailleurs, une des essences de feuillus les plus importantes au Canada risque dtre dcime par une autre espce envahissante, largile du frne. Cela voque une situation semblable,

Chapitre 7 La taxonomie au Canada : crer des possibilits

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o dautres espces envahissantes avaient dcim les ormes et les chtaigniers, lesquels comptaient nagure parmi les fleurons de la fort caducifolie du Canada. Une solide capacit en taxonomie, y compris en recherche sur le terrain et en inventaires, promet dintercepter ou dradiquer rapidement les espces envahissantes avant que celles-ci ntablissent une population ce point dense que leur contrle devient impossible. Une taxonomie dynamique et solide est la pierre angulaire qui permet de tenir la promesse qui est inhrente la biodiversit.

Points saillants du chapitre


Le Canada est bien positionn pour devenir un chef de file international en taxonomie, une discipline qui est en voie de transformation travers le monde, en raison de collaborations sur une chelle beaucoup plus grande quauparavant, de mme quen raison de ladoption de nouvelles technologies. Le Canada peut se trouver la tte de ce mouvement en investissant dans ses forces et en btissant des liens plus solides entre les diffrentes organisations qui sintressent, pour diverses raisons, aux sciences de la biodiversit, dont les universits, les gouvernements, le secteur industriel, les dtenteurs du savoir traditionnel et les ONG. Il est par ailleurs impratif de lancer une enqute audacieuse sur les nouvelles technologies, qui promettent de transformer notre habilet de documenter et de surveiller la biodiversit. Si le Canada omet dagir, des dcisions stratgiques mal claires risquent dtre prises sur des questions urgentes, comme le changement climatique, la conservation et la gestion de ses ressources naturelles. linverse, laction ouvrira grande la porte aux possibilits de dveloppement conomique dans le secteur traditionnel des ressources renouvelables et dans le domaine mergeant des bioproduits et des bioprocds.

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Glossaire

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glossaire
Biodiversit

La varit qui marque les tres vivants de toutes les provenances, y compris, entre autres, les cosystmes terrestres, marins et aquatiques, ainsi que les milieux cologiques auxquels ils prennent part. Cette varit comprend la diversit au sein dune espce et entre espces, de mme que la diversit des cosystmes[1].
Conservation

La gestion des interactions humaines avec les gnes, les espces et les cosystmes, de faon en tirer le plus de bienfaits possible pour la gnration actuelle tout en veillant au maintien de son potentiel rpondre aux besoins et aux aspirations des gnrations futures; englobe les notions de sauvegarde, dtude et dexploitation de la biodiversit[2].
COSEPAC

Le Comit sur la situation des espces en pril au Canada (COSEPAC) est un comit compos de spcialistes, qui value et dsigne les espces sauvages qui risquent de disparatre du Canada[3].
Diversit culturelle

La varit ou pluralit des structures sociales humaines, des systmes de croyances et des stratgies dadaptation des situations donnes, dans diffrentes parties du monde[2].
Numrisation

Le procd denregistrement des informations sous forme numrique[4].


cologie

Une branche de la science qui sintresse aux interrelations qui lient les organismes et leur environnement[2].
cosystme

Un complexe dynamique de communauts de plantes, danimaux, de champignons et de microorganismes, et leur environnement non vivant, interagissant de manire former une seule unit cologique[2].
En voie de disparition

Dsignation des espces sauvages exposes une disparition du pays ou une disparition imminente[3].

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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

Disparue

Dsignation des espces qui nexistent plus[3].


Disparue du pays

Dsignation des espces qui nexistent plus dans une rgion particulire[3].
Partenariat fdral en matire dinformation sur la biodiversit (PFIB)

Un groupe informel constitu de reprsentants dAgriculture et dAgroalimentaire Canada, du Muse canadien de la nature, de Pches et Ocans Canada, dEnvironnement Canada, de Sant Canada, de lAgence canadienne dinspection des aliments, de Parcs Canada et de Ressources naturelles Canada, dont le mandat est de veiller la reconnaissance, la mise de lavant et au soutien de la biosystmatique, et son utilisation efficace au Canada[3].
Diversit gntique

La varit de gnes au sein dune espce, dune varit ou dune race[2].


Espce envahissante

Une espce envahissante est une espce qui a colonis de nouveaux territoires. La propagation des populations despces envahissantes peut engendrer des problmes conomiques et environnementaux[4].
Inventaire

La collecte de donnes de terrain lies aux ressources naturelles et leurs proprits[2].


Microorganismes

On les appelle galement des microbes. Dans son sens le plus large, microorganisme fait rfrence aux organismes qui sont trop petits pour quon puisse les observer lil nu. Certains animaux et plantes sont microbiens, mais en gnral, ce terme dsigne plutt des bactries, des arches, des protozoaires, certains myctes (y compris les levures), plusieurs algues et les virus[4].
Morphologie

La forme et la structure des tres vivants, ou la branche de la biologie qui tudie la forme et la structure des tres vivants[4].
Phylogntique

Ltude de lhistoire de lvolution des tres vivants, qui sintresse tout particulirement aux agencements dembranchements anctres-descendants[4].
Espce

La classification dune plante, dun animal ou dun microorganisme dans un groupe qui prsente des caractristiques et des processus de reproduction distinct[5]. Fait

Glossaire

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souvent rfrence des groupes qui peuvent se reproduire librement entre eux, mais non avec des membres dautres espces[2].
Diversit des espces

Le nombre et la varit des espces qui se trouvent dans une rgion donne[2].
Systmatique

Ltude scientifique des tres vivants et de leur diversit, de mme que des liens qui se tissent entre eux[2]. (Dans ce rapport, le terme systmatique respecte lusage habituel et concerne principalement les liens phylogntiques et la classification, et ce, linverse de la taxonomie, qui met laccent sur la dcouverte et la diffrenciation des espces.)
Taxonomie

La science de la dcouverte, de la diffrenciation, de la classification et de la documentation des tres vivants[4].


Monographie taxonomique

Le traitement systmatique le plus dtaill possible dun groupe donn, qui comprend habituellement, outre des descriptions compltes, tout ce qui est connu de la biologie, de lcologie et de la distribution de ce groupe[6].
Rvision taxonomique

Nouvelle tude dun groupe visant en corriger ou en amliorer le diagnostic, la description ou la phylognie[6].
LE S d f i n iT i o nS S o nT T i R E S o u ada PTES d E S S o uR C E S S u i va nT E S :

[1] Convention sur la diversit biologique. Article 2, Use of terms (en anglais seulement). Adresse URL : http://www.cbd.int/convention/articles. shtml?a=cbd-02 (dernire consultation : juillet 2010). [2] Programme des Nations Unies pour lenvironnement. Centre mondial de surveillance de la conservation. Adresse URL : http://sea.unep-wcmc.org/ reception/glossaryS-Z.htm (dernire consultation : juillet 2010). [3] COSEPAC. Manuel des oprations et des procdures. Appendice C. [4] Dfinition arrte par le comit dexperts. [5] Espces envahissantes, gouvernement du Canada. Adresse URL : http:// www.invasivespecies.gc.ca/francais/View.asp?x=501 (dernire consultation : septembre 2010). [6] Winston, J. E. (1999). Describing Species. Practical Taxonomic Procedure for Biologists. New York, Columbia University Press.

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Rfrences

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Rfrences
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La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits

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Le comit dexperts sur les sciences de la biodiversit

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valuations du Conseil des acadmies canadiennes


Les rapports dvaluation ci-dessous peuvent tre tlchargs depuis le site Web du CCA (www.sciencepourlepublic.ca) : La taxonomie canadienne : explorer la biodiversit, crer des possibilits (2010) Honntet, responsabilit et confiance : Promouvoir lintgrit en recherche au Canada (2010) Meilleure recherche = Meilleur management (2009) La gestion durable des eaux souterraines au Canada (2009) Innovation et stratgies dentreprise : pourquoi le Canada nest pas la hauteur (2009) Vision pour lInitiative canadienne de recherche dans lArctique valuation des possibilits (2008) La production dnergie partir des hydrates de gaz potentiel et dfis pour le Canada (2008) Petit et diffrent : perspective scientifique sur les dfis rglementaires du monde nanomtrique (2008) La transmission du virus de la grippe et la contribution de lquipement de protection respiratoire individuelle valuation des donnes disponibles (2007) Ltat de la science et de la technologie au Canada (2006) Les valuations suivantes fait prsentement lobjet de dlibrations du comit dexperts : Approches dvaluation du risque de la sant des animaux Tests intgrs pour les pesticides Rendement scientifique et financement de la recherche Les chercheures universitaires

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Le comit dexperts sur les sciences de la biodiversit

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