Horloge molculaire

PDF Partager Des recherches ont permis de constater que le taux d'accumulation des mutations dans le gnome d'organismes diffrents est du mme ordre de grandeur dans des rgions homologues (rgions soumises la mme pression de slection). L'accumulation sera maximale pour des rgions qui ne sont pas soumises la pression de slection naturelle (ne codant pas pour des gnes) et minimale dans les parties du gnome soumises une forte pression (c'est dire les rgions codant pour des fonctions essentielles la survie de l'organisme). Chaque squence accumule les mutations un rythme qui lui est propre et qui est dict par l'intensit de la pression de slection laquelle elle est soumise. Pour reconstituer des phylognies (dater la divergence entre deux espces), on peut utiliser diffrentes molcules comme on utilise les aiguilles d'une montre pour calibrer l'horloge : - la trotteuse des secondes (taux de mutation important, par exemple un pseudogne) pour des vnements rcents (tudes des sous populations au sein d'une espce) ; - l'aiguille des minutes (taux de mutation moyen, par exemple le cytochrome C) pour l'analyse d'un pass proche ; - l'aiguille des heures (taux de mutations faible : les histones) pour l'tude d'un pass lointain. La vitesse d'volution de la squence est du mme ordre de grandeur au sein d'une mme classe fonctionnelle de protines et elle est diffrente pour des protines qui ont des fonctions diffrentes : la vitesse d'volution de la srum albumine est toujours plus importante que celle du cytochrome C. Ces diffrences de vitesse dpendent la fois de la probabilit qu'une substitution apparaisse et de sa compatibilit avec la survie de l'organisme. Si l'on admet cette thorie, et que l'on connat le taux d'accumulation des mutations, il est possible d'estimer le temps de divergences d'espces en comparant leur diversit molculaire. Arguments contre l'horloge molculaire La thorie de l'horloge molculaire est remise en cause et plusieurs arguments ont t dvelopps : - L'horloge molculaire ne serait pas constante (Goodman): les mutations avantageuses se fixeraient plus rapidement lors de la formation de nouvelles espces ; - L'horloge molculaire serait pisodique (Gillepsie) et les mutations ne se produiraient pas de faon indpendante au cours de l'volution: il y aurait des pisodes d'accumulation suivis d'arrts volutifs. Conclusion

Bien que le dbat persiste, il semble que l'horloge molculaire fonctionne assez bien sur de longues priodes volutives, pour des gnes ayant un taux de mutation relativement faible o mme si l'horloge ne bat pas trs rgulirement, les ralentissements et les acclrations se compensent. Il faut galement se mfier des estimations de temps de divergence bases sur un petit nombre de gnes. Source : infobiogen.fr