PARTIE 1 : Des phnotypes diffrents niveaux dorganisation du vivant CHAPITRE 1 : Du gnotype au phnotype, relations avec lenvironnement

TP/TD 4 : Du gne la protine

Objectifs mthodologiques : tre capable dinterprter des expriences historiques. Objectifs de connaissance : connatre les relations entre gne et protine. RAPPEL : Le programme gntique contrle les activits fondamentales des cellules. Les principaux acteurs de la vie cellulaire sont des protines.

Problme : Quels liens existent entre gne et protine ?

I. Lien fonctionnel
Lhypothse dune relation entre gne et enzyme a t valide exprimentalement par les travaux de Beadle et Tatum, au dbut des annes 40. Leur matriel dtude est la moisissure orange du pain, Neurospora crassa. Ce champignon se cultive facilement en laboratoire : les spores poussent sur un milieu nutritif minimum (MM). Avec ce milieu, les cellules issues des spores ralisent les chanes de ractions pour produire toutes leurs molcules (acides amins, bases azotes, pigments, ). Loriginalit de la mthode de Beadle et Tatum rside dans lide de crer des mutations pour chercher ensuite leurs effets sur des ractions mtaboliques dj connues et impliquant des enzymes. Lirradiation de spores aux rayons X ou UV produit des mutations qui empchent le dveloppement des champignons sur milieu minimum seul ; celui-ci doit tre complt. Par exemple, certains mutants poussent sur milieu minimum la condition dy ajouter un acide amin, larginine : ce sont des mutants arg-. Les biochimistes de lpoque savent que la synthse darginine se fait en plusieurs tapes avec des molcules intermdiaires, la citrulline et lornithine. Cela incite Beadle et Tatum tester la croissance de leurs mutants arg - sur diffrents milieux . Ils trouvent alors trois types de mutants, tous incapables de faire de larginine MAIS pour des raisons diffrentes. Les rsultats sont consigns dans le tableau ci-dessous. Dautre part, les tudes gntiques de Beadle et Tatum prouvent que les mutations A, B, C sont localises sur trois gnes diffrents. Daprs Bordas collection Tavernier, TS spcialit SVT (2002) DOCS du NATHAN 1reS p.48-49 1) 2) Dterminer les niveaux de la voie de biosynthse o les mutants A, B, C sont affects ? Comment Beadle et Tatum ont-ils pu tablir le concept un gne un enzyme ?

II. Lien spatial

A. Colinarit entre gne et protine
Le concept un gne un enzyme formul par G. Beadle et E. Tatum ne prjugeait en rien de la faon dont on peut passer dune molcule lautre. La colinarit entre un gne et une protine fut dmontre au dbut des annes 60, par C. Yanovsky. Ce dernier isola, chez la bactrie Escherichia coli, un certain nombre de mutants pour la chane A de la tryptophane synthtase [enzyme impliqu dans la biosynthse du tryptophane -un acide amin- et cod par le gne TrpA]. Cest en analysant la correspondance entre lordre des mutations dans le gne et celui des changements apparus dans la chane polypeptidique quil dmontra cette colinarit. Daprs Nathan collection Prilleux, 1reS SVT (2001) DOC du NATHAN 1reS p.51 3) Expliquer en quoi lanalyse des positions relatives des mutations et des modifications de la chane polypeptidique permet dtablir une correspondance troite entre les deux types de molcules. Montrer que linformation contenue dans lADN est ncessaire pour diriger la synthse du polypeptidique correspondant.

4)

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B. Localisation cellulaire

5) Rappeler la localisation cellulaire de lADN.

- Cette localisation est permanente -

Exprience de pulse et chasse : On fournit une cellule tout ce dont elle a besoin, dont de la leucine (acide amin). MAIS pendant un cours instant (pulse), la leucine utilise est de la leucine tritie (contenant un atome radioactif) puis aprs rinage (chasse), de la leucine classique . Aprs 2-3 minutes, la radioactivit est dcele (par autoradiographie) dans le cytoplasme, au niveau de granules appels ribosomes . 6) 7) Expliquer ce quil se passe dans la cellule durant les 3 minutes de lexprience. En dduire le lieu de la synthse protique. Quel problme se pose ? Proposer une hypothse.

III. Lien molculaire

A. Proprits de lintermdiaire

8) Quelle proprit de lARN est rvle par le doc.3 p.42 ? (dcrire les rsultats avant de conclure)
9) Justifier le terme de messager donn aux ARN ici tudis.

B. Rle de lARNm
10) Quelles proprits de lARNm sont rvles par le doc.4 p.43 ? (dcrire les rsultats avant de conclure) 11) Quel est lintrt de cette exprience vis--vis du problme pos ?

C. Nature du codage de linformation

12) Comment est code linformation dans lADN ? Dans les protines ? 13) Aprs avoir rappeler la relation existante entre les deux brins de lADN, montrer que linformation contenue dans un
seul des deux brins de lADN est suffisante pour diriger la synthse du polypeptidique correspondant. 14) Reproduire et remplir le tableau comparatif ci-dessous : ADN Nombre de chane Schma dun monomre (= motif rpt) ARNm protine

Schma de la liaison entre deux monomres

Alphabet (nb et/ou nom des diffrents motifs)

Vous pouvez vous aider du doc.1 p.44 en ce qui concerne lARNm.

PARTIE 1 : Des phnotypes diffrents niveaux dorganisation du vivant CHAPITRE 1 : Du gnotype au phnotype, relations avec lenvironnement 15) En sappuyant sur le tableau ci-dessus, expliquer les noms de transcription et de traduction donns aux deux tapes de lexpression de linformation gntique.