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Chapitre I introduction la microbiologie I. apparition de la vie sur Terre .............................................................................................. 2 1. 2. 3. chronologie (voir polycopi) ..........................................................................................

. 2 les traces des premires bactries................................................................................... 2 la dcouverte des archobactries .................................................................................. 2

II. la classification des bactries.............................................................................................. 3 1. 2. 3. 4. la notion de microbiologie.............................................................................................. 3 le systme de classification des organismes................................................................... 3 la classification phntique des bactries....................................................................... 3 la classification phyltique des bactries ....................................................................... 4

Chapitre I : introduction la microbiologie Introduction: On tudie les archives gologiques pour avoir plusieurs types de renseignements. Quelles ont t les premires formes de vie ? A quel moment sont-elles apparues ? Comment se sontelles modifies ? Comment et quand sest dvelopp une atmosphre oxygne ? I. apparition de la vie sur Terre

1. chronologie (voir polycopi) 2. les traces des premires bactries

On a dcouvert des fossiles de bactries de 3.5 milliards dannes. Les stromatolithes 2 types : Stromatolithes rcents ou en court de formation Stromatolithes anciens fossils

Structure Structure organique en forme de dme form dune succession de couches. A la surface du dme on a une couche glatineuse compos dun mlange de cyanobactries et de sdiments. Rle Les cyanobactries font faire de la photosynthse et produire de loxygne utilis par dautres bactries qui sont localises dans les couches plus profondes du stromatolithe. Celuici va piger des particules sdimentaires. Consommation de CO2 donc baisse de la pression en CO2 ce qui forme des carbonates de calcium. La structure des stromatolithes anciens est la mme que les stromatolithes rcents. Par microscopie lectronique, on a montr la prsence de fossiles de cyanobactries. Les empreintes fossiles On a trouv des fossiles de bactries dans les roches. 3. la dcouverte des archobactries Bactries vivantes que lon retrouve dans des environnements hostiles (chaleur, acidit, pression). Elles ont conserv des bactries trs anciennes (paroi diffrentes que celle des

bactries). Les 1res bactries apparues sur Terre ont du se dvelopper dans les fonds marins pour se protger des UV. Les bactries sont hyperthermophiles et basophiles. II. la classification des bactries

1. la notion de microbiologie Etude des organismes qui sont trop petit pour tre visible lil nu. Spcialisation : Bactriologie Virologie Mycologie Algologie Ltude des microorganismes ncessite certaines techniques particulires : emploi de culture strile strilisation du matriel croissance dun microorganisme pur 2. le systme de classification des organismes Systme bas sur 2 rgnes : animaux vgtaux

Aprs la dcouverte des microorganismes, il a fallu rinventer des bactries. 2 systmes de classification : classification phntique classification phyltique 3. la classification phntique des bactries Principe Cette classification repose sur des caractres phnotypiques (bible de Bergey). Bas sur le principe de la taxonomie (science du classement). Formation de groupes dindividus qui se ressemble (taxon). Des espces qui ont diverg ont des caractres trs proches. Des espces qui ont diverg il y a trs longtemps nont pas les mmes caractres. Les rangs taxonomiques Rgne, embranchements, classe, ordre, famille, genre, espce Les grands groupes bactriens

Bas sur les types de paroi

firmicutes

gracilicutes

Les embranchements chez les bactries

tnricutes

mendosicutes

Les problmes lis cette classification Critre choisi la paroi. Choix fait arbitrairement. Ce critre na aucun lien de parent. 4. la classification phyltique des bactries Principe Etude de la squence de lARN 16s (ARN ribosomique). 2 bactries ayant 1 squence proche, ont diverg il y a peu de temps. 1 seule classification possible bas sur lvolution du matriel gntique. Les domaines 4

3 domaines : bactries archobactries eucaryotes Dans le domaine des bactries, il y a 11 groupes. Lorsque lon compare ces 2 types de classifications diffrentes

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