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Compression irrversible par ondelettes en radiologie thoracique numrique :

Evaluation qualitative sur des structures anatomiques et pathologiques


Christine CAVARO-MENARD1, Franois GOUPIL2, Benot DENIZOT2, Jean-Yves TANGUY3, Jean-Jacques LE JEUNE2, Christine CARON-POITREAU3
1

LISA - Equipe Signal Image - Universit d'Angers - 62 av. Notre Dame du Lac - 49000 ANGERS

INSERM, ERIT-M 0104 - Facult de Mdecine d'Angers - 1 rue Haute de Recule - 49033 ANGERS
3

Service de Radiologie - CHU Angers - 4 rue Larrey - 49033 ANGERS Cedex 01


christine.menard@univ-angers.fr

Rsum - La compression dimages reprsente une alternative de faible cot laugmentation systmatique de la capacit de stockage des
systmes darchivage et des lignes de transmission (PACS). Afin dtudier les effets de la compression irrversible par ondelettes (base de la norme JPEG2000) sur des radiographies thoraciques demble numriques (Thoravision), nous avons dfini un protocole complet dvaluation. Les taux de compression de 20:1, 40:1, 60:1 ont t valus en double aveugle par 3 radiologues dans des conditions standardises sur des structures anatomiques (suivant 11 critres portant sur les dtails, les contours et les artfacts sur une population de 30 sujets sains) et pathologiques (pneumothorax et syndromes interstitiels). Des courbes ROC ont t ralises partir de deux populations de 20 patients. Notre tude dtermine un taux de compression acceptable 20:1 pour les radiographies normales et 60:1 pour les images pathologiques. Linterprtation rigoureuse dune radiographie thoracique ncessitant la conservation des structures anatomiques, le taux de 20:1 apparat tre la limite acceptable en pratique clinique. Notre protocole dvaluation suggre par ailleurs quune valuation qualitative dune compression par ondelettes de radiographie thoracique peut tre ralise uniquement sur des critres anatomiques portant sur la vascularisation fine du poumon o la dgradation est prdominante.

Abstract Image compression is an inexpensively alternative to systematic increase of capacity of pictures archiving systems and lines
transmission (PACS). To evaluate the effect of wavelet-based lossy compression (base of the norm JPEG 2000) on digital chest radiographs (Thoravision), we define a complete qualitative study. The compression ratio 20:1, 40:1 and 60:1 were evaluated with a double blind protocol by 3 senior chest radiographs in standardised conditions on anatomic structures (11 features were studied which analyse details, contours and artefacts of 30 normal radiographs) and pathologic radiographs (pneumothorax and interstitial lung abnormalities). ROC studies were analysed with two populations of 20 patients. Our study allows to accept compression ratio of 20:1 for normal radiographs and 60:1 for pathologic images. A strict interpretation of chest radiographs, requiring anatomic structures conservation, the 20:1 compression ratio is the acceptable limit for a clinical use. Early vulnerability of details suggest that a complete evaluation of wavelet compression on chest radiographs may be realised with only pulmonary vasculature structures where the degradation predominates.

1. INTRODUCTION
La radiographie thoracique, en reprsentant prs de la moiti des actes pratiqus en milieu hospitalier, peut tre considre comme un modle de la mutation de la radiographie conventionnelle vers l'imagerie numrique. Elle exige des caractristiques physiques particulires lies la complexit de l'environnement anatomique du thorax, intgrant une rsolution spatiale et un contraste suffisant pour une bonne visualisation des dtails [1]. Ces caractristiques ont pour consquence un fichier numrique volumineux (l'activit moyenne journalire du CHU d'Angers ncessite une capacit de stockage de plus de 600 Mo). Ce volume important de donnes numriques stocker, transmettre et grer est actuellement une limite lintgration des radiographies thoraciques dans les systmes de rseaux dimages numriques et au dveloppement de la tlmdecine [2]. La compression dimage, en rduisant le volume des donnes ncessaire la reprsentation de l'image est ne de cette difficult de stockage des donnes volumineuses et de leur transmission distance. Les techniques de compression exacte, en liminant les redondances spatiales de limage ont une efficacit limite. Le taux de compression maximal reste infrieur 3:1 quelle que soit la technique [3]. Seules des techniques de compression avec pertes d'information irrversibles permettent des taux de compression beaucoup plus levs. Cependant, pour tre thiquement acceptables, ces dernires mthodes doivent tre rigoureusement values afin de dfinir le taux de compression maximal qui nengendre aucune dgradation des paramtres anatomiques et diagnostiques de l'image [4].

Cet article dcrit un protocole complet dvaluation de la compression irrversible par ondelettes (base de la norme JPEG2000) sur des radiographies thoraciques demble numriques (Thoravision). En effet, la littrature ne prsente aucune tude complte et prcise dvaluation des effets dune compression sur un systme de radiologie thoracique demble numrique, les tudes [5][6] ayant t ralises sur des radiographies conventionnelles numrises par scanner haute rsolution, introduisant une source de bruit supplmentaire.

2.3 Population
Radiographies normales - Pour l' tude de leffet de la compression sur les structures anatomiques du thorax, 30 clichs normaux issus du dpistage systmatique du personnel de l' hpital, dans le cadre de la mdecine prventive, ont t slectionns. Radiographies pathologiques - Les pathologies choisies pour cette tude sont : des pneumothorax reprsentant des anomalies dont la texture dans le plan frquentiel peut tre caractrise par des frquences moyennes (ligne pleurale de faible gradient), et des syndromes interstitiels dont la texture dans le plan frquentiel peut tre caractrise par des frquences leves. Pour ces deux pathologies, 20 patients ont t slectionns par 2 lecteurs ne participant pas l' valuation ultrieure. Un effort a t fait pour slectionner des anomalies de degr de difficult de lecture variable comprenant des anomalies la limite de la visibilit pour certains clichs. Pour les syndromes interstitiels la pathologie a t confirme par une tomodensitomtrie (TDM) thoracique avec coupes millimtriques. Pour chaque population (pneumothorax et syndromes interstitiels), 20 radiographies normales ont t associes aux 20 radiographies pathologiques afin de raliser une tude qualitative par courbe ROC.

2. MATERIEL
2.1 L'acquisition des images
Le systme dacquisition utilis est bas sur un dtecteur de rayons X au selenium (Thoravision Philips) [7]. Les clichs sont raliss debout en inspiration profonde selon une incidence postro-antrieure, avec une distance source-image de 2 mtres. La rsolution des images numriques est de 0.2 mm (2.5pl/mm). Les clichs du thorax sont imprims au format original du patient sur un film 36x43 cm par un reprographe LR 33 LASER AGFA.

2.2 Le codage par transformation en ondelettes


La dcomposition en ondelette est une analyse multirsolution base sur un filtrage passe-bande rcursif avec des filtres hautes frquences (dans les 3 directions horizontale, verticale, et "diagonale") et un filtre basses frquences [8]. La composante basse frquence est nouveau spare en 4 composantes selon le mme principe. Ce traitement est ralis n fois formant n niveaux de dcomposition. Il est admis que plus de 5 6 niveaux de dcomposition n' amliorent pas de manire sensible le taux de compression [9]. La distribution des valeurs des pixels des sous-images dtails est proche de la loi normale, avec par consquent de nombreux coefficients de faible valeur. L' intrt de la compression par ondelettes est de concentrer la distribution des pixels de l' image en une bande fine et pointue, en se dbarrassant des coefficients de faibles valeurs durant une tape de quantification rendant la compression irrversible et fixant la qualit de limage reconstruite. La lecture des coefficients peut se faire des coefficients parents vers la descendance pour constituer des squences comportant des plages de zro de longueurs importantes [10]. Afin de profiter au maximum de la corrlation spatiale des images, les coefficients verticaux, horizontaux et diagonaux sont scruts selon la mme orientation. Un codage par plage ou RLE "Run Lenght Encoding" permet alors d' exploiter la prsence de rptitions frquentes de zro. Le taux de compression peut alors tre optimis par un codage statistique de type Huffman. Le logiciel utilis Viewmed (Pegasus Imaging Corporation), cr pour la compression des images biomdicales, a reu l' agrment pour la compression des images mdicales de la Food and Drug Administration en 1998. Ce logiciel utilise une ondelette-mre biorthogonale 9.7 et une dcomposition en ondelettes sur 6 niveaux.

3. METHODE DEVALUATION
3.1 Etude Prliminaire
Dans le but de dfinir 3 taux de compressions discriminants tudier lors du protocole d' valuation qualitative, une tude prliminaire t ralise des taux de compression croissant par pas de 10, de 10 :1 120:1, sur 4 radiographies thoraciques (1 normale ; 1 avec nodules multiples de taille variable ; 1 avec un syndrome interstitiel ; 1 avec un pneumothorax). Les clichs dcomprims ont t compars sur ngatoscope par rapport au clich original par 3 lecteurs ne participant pas l' tude ultrieure. Il apparaissait ainsi aux lecteurs que les taux de compression discriminant slectionner pour le protocole dvaluation qualitative taient : 20:1 comme taux minimal tant donn lapparition dartefacts minimes - 60:1 comme taux maximal, o les artfacts pouvaient gner la lecture 40:1 comme taux intermdiaire o la vascularisation parenchymateuse anatomique semblait tre dgrade. Les structures pathologiques semblaient tre modifies uniquement pour des taux suprieurs 80 :1.

3.2 Sances de lecture


Trois radiologues seniors spcialiss dans la pathologie thoracique et ayant dj particip des protocoles d' valuation ont particip l' tude. Les sances d' valuation ont t effectues sur film en double aveugle. La lecture des clichs a t effectue selon des conditions standardises (sances de lectures d' une heure dans une seule pice sombre, sur le mme ngatoscope sans autre source lumineuse ; lecteur assis un bureau face au ngatoscope ; temps de lecture laiss libre au lecteur).

3.3 Critres dvaluation


Pour les images non pathologiques, onze critres anatomiques dvaluation ont t retenus. Lvaluation des dtails de l' image a porte sur la finesse de la vascularisation de 4 rgions du parenchyme pulmonaire. Celle des contours a port sur la nettet de 2 lignes mdiastinales et sur les bords de 4 structures anatomiques mdiastinales. Les artefacts de l' image ont galement t cots selon leurs consquences sur la lecture des images. Pour chaque clich, il a ainsi t tabli la grille de lecture rapporte figure 1.
5 Qualit visuelle 4 3 2 1

Vascularisation Rtrocardiaque
5
Qualit visuelle

Vascularisation Suprieure
4 3 2 1 Original 20:1 40:1 60:1

Original

20:1 40:1 Taux de compression

60:1

Taux de compression

L e c te u r1

L e c te u r2

L e c te u r3

M oyenne

Figure 2 : Finesse de la vascularisation parenchymateuse.


Carne et Bronches principales
5 Qualit visuelle 4 3 2 1 Original 20:1 40:1 Taux de compression 60:1

Ligne Para-Azygo-Oesophagienne
5 Qualit visuelle 4 3 2 1 Original 20:1 40:1 Taux de compression 60:1

Ligne Aortique Descendante


5

Disques intervertbraux
5 Qualit visuelle 4 3 2 1

Qualit visuelle

4 3 2 1 Original 20:1 40:1 Taux de compression 60:1

Original

20:1 40:1 Taux de compression

60:1

L ec teu r1

L ec teu r2

L ec teu r3

M o ye n n e

Figure 1 : Grille d' valuation des clichs normaux. Pour les images pathologiques, les 3 lecteurs ont valu la probabilit de prsence ou dabsence d' un pneumothorax puis d' un syndrome interstitiel, par une chelle psychovisuelle sur 5 points (5 : pathologie certaine ; 4 : pathologie probable ; 3 : impossibilit de se prononcer ; 2 : radiographie probablement normale ; 1 : radiographie certainement normale). L' tude des performances diagnostiques a t value par courbes ROC (logiciel Rockit 0.9B). Le test statistique z-score univari Az "Area test" a t utilis pour le calcul de la signification statistique des diffrences entre les aires sous les courbes ROC.

Figure 3 : Nettet des lignes. Les dtails de limage, sont analyss par la vascularisation fine du poumon au niveau de 4 rgions anatomiques. La qualit visuelle de la vascularisation apparat proche de 4 ("fine") un taux de 20:1, pour chaque lecteur. A un taux de 40:1, elle est plus htrogne, variable selon le lecteur et la rgion anatomique tudie, value entre 3 ("mal vue") et 4. A un taux de 60:1, la qualit visuelle devient franchement mauvaise, avec une courbe descendant jusqu 2 ("grossire ou floue") en rgion rtrocardiaque et rtrodiaphragmatique. Les contours de limage sont analyss par la nettet des lignes mdiastinales et des bords de structures anatomiques. Les courbes des rponses ont pour les 6 critres tudis un aspect bien parallle, montrant des rponses globalement plus homognes que les critres portant sur les dtails de limage. Hormis la ligne aortique descendante, la qualit visuelle de ces critres nest pas juge parfaite sur les clichs originaux, le plus souvent cot 3 "trac manuel incomplet", ou 4 "trac manuel complet possible". Des artfacts minimes apparaissent un taux de 20:1. A partir de 40:1 les artfacts sont bien visibles, cots entre 2 "gnent la lecture dun ou plusieurs critres anatomiques" et 3 "ne gnent pas la lecture des critres anatomiques".

4. RESULTATS
4.1 Sujets normaux
La moyenne des rponses de lensemble des lecteurs en fonction du taux de compression est reprsentes, pour les dtails de limage figure 2, pour les contours de limage figure 3 (les 4 zones les plus significatives sont prsentes).
Vascularisation Rtrodiaphragmatique
5 Qualit visuellle Qualit visuelle 4 3 2 1 Original 20:1 40:1 Taux de compression 60:1 5 4 3 2 1 Original 20:1 40:1 Taux de compression 60:1

Vascularisation Infrieure

4.2 Sujets pathologiques


Lvaluation par courbes ROC ne montre pas de diffrences significatives au niveau des aires sous la courbe entre les images originales et les images comprimes jusqu 60 :1 pour les pneumothorax et les syndromes interstitiels (figures 4-a et 4-b).

6. CONCLUSION

Nous pouvons donc conclure par notre tude quun taux de compression maximal 20:1 est acceptable sur des images de Thoravision avec le logiciel de compression par 0,8 0,8 Courbe ROC - Syndromes Interstitiels Courbe ROC - Pneumothorax ondelettes Viewmed. A ce taux les structures anatomiques Originales Az=0,9712 Originales Az=0,9956 sont correctement conserves et nous sommes nettement en Compression 20:1 Az=0,9971 Compression 20:1 Az=0,9746 Compression 40:1 Az=0,9896 Compression 40:1 Az=0,9985 dessous du seuil limite acceptable de 60:1 pour les images Compression 60:1 Az=0,9895 Compression 60:1 Az=0,9959 pathologiques. Une application immdiate et pratique de ce 0,6 0,6 0 0,2 0,4 0 0,2 0,4 logiciel est de conserver les donnes sur le disque dur de la Thoravision du service de radiologie pendant plus de 2 mois Figure 4 : Courbes ROC (les aires sous les courbes tant proches de 1, lchelle a t rduite pour mieux distinguer chaque courbe.) alors quelles ne sont accessibles actuellement que 3 jours. De telles valuations qualitatives sont difficiles mettre 5. DISCUSSION en uvre (dfinition prcise de chaque structure valuer, L' valuation d' une radiographie pulmonaire normale lecture en aveugle dun nombre important dimages par plusieurs lecteurs expriments). Cependant, seule ce type ncessite de dfinir des structures anatomiques subtiles dvaluation doit tre envisage pour chaque type dimage tudier. Nos critres sont proches de ceux slectionns par biomdicale, avant de considrer une compression avec perte Erickson [5] dans son tude sur la compression de dinformation comme thiquement acceptable. Notre radiographies non pathologiques. Ils ont t slectionns en protocole dvaluation laisse mme suggrer que seuls les accord avec les lecteurs, partir dtudes antrieures critres de la vascularisation fine du poumon pourraient tre d' valuation de laThoravision par rapport au systme de valus pour une compression par ondelettes, tant donn radiologie conventionnelle. Afin de mieux analyser leffet leur dgradation plus prcoce que les contours de limage. des ondelettes, nos critres ont t regroups sous trois items : les dtails de limages tudis par la vascularisation fine du poumon ; les contours de limage reprsents par des lignes Rfrences et des structures anatomiques mdiastinales, et la qualit [1] Frija J, De Kerviler E, Zagdanski AM, Feger C, Attal P, gnrale de limage reprsente par les artfacts induit par Laval-Jeantet M. Radiologie numrique du thorax. J les ondelettes. Au lieu dune seule chelle imprcise Radiol 1997; 78: 193-207. dvaluation pour tous les critres allant classiquement de [2] Siegel EL. Economic and clinical impast of filmless "trs bien vu" "non vu" [6], nous avons dfini une chelle operation in a multifacility environment. J Digit psychovisuelle dtaille et adapte ces trois items, dans le Imaging 1998; 11: 42-47. but de favoriser au niveau de chaque critre des rponses [3] Mendoca, Campilho. Reversible methods for medical homognes et comparables entre les lecteurs. image compression. ITBM, 1992 ; 23 : 49-57. Lanalyse des courbes des rponses montre une [4] Cavaro-Menard C, Le Duff A, Balzer P, Denizot B, dgradation prdominant sur les dtails de limage :la courbe Jallet P, Le Jeune JJ. Quality assessment of compressed dcrot rapidement pour les critres de la vascularisation fine cardiac MRI. Effect of lossy compression on du poumon, alors quelle reste quasi horizontale pour les computerized physiological parameters. ICIAP99 critres tudiant les contours de limage. Au vu de ces (IEEE Computer Society Press), Venise Italie, 1999. rsultats les critres anatomiques de la vascularisation [5] Erickson BJ, Manduca A, Persons KR, Earnest IV F, apparaissent les plus pertinents pour valuer le seuil Hartman TE, Harms GF, Brown LR. Evaluation of anatomique limite acceptable dune compression par les irreversible compression of digitized posterior-anterior ondelettes pour limagerie numrique du thorax. chest radiographs. J Digit Imaging 1997; 10: 97-102. Les deux pathologies tudies ont t slectionnes pour [6] Savcenko V, Erickson BJ, Palisson PM, Persons KR, les caractristiques de leurs anomalies sur la radiographie Manduca A, Harms GF, Brown LR. Detection of subtle pulmonaire (dgradation sous leffet dune transformation en abnormalities on chest radiographs after irreversible ondelette). De plus ces pathologies peuvent engendrer des compression. Radiology 1998; 206: 609-616. difficults diagnostiques pour le radiologue, car leurs [7] Neitzel U. Selenium: a new image detector for digital caractristiques smiologiques sont parfois subtiles. En chest radiography. Medica Mundi 1993; 38: 89-93. pratique, linterprtation de structures pathologiques ne peut [8] Erickson B, Manduca A, Palisson P,Persons K,Earnest tre rigoureusement value sans conservation correcte des F,Savcenko V,Hangiandreou N. Wavelet compression of repres anatomiques de limage. Mme si les caractristiques medical image. Radiology 1998; 206: 599-607. dune structure pathologique persistent, le radiologue [9] Persons, Palisson, Manduca, Erickson, Savcenko. An nacceptera pas de poser un diagnostic si les structures analytical look at the effects of compression on medical anatomiques sont trop dgrades. images. J Digit Imaging 1997; 10: 60-66. Des mesures quantitatives de quelques images ont montr [10]Said A, Pearlman W. A new fast and efficient image un PSNR lev, suprieur 50 dB au taux de compression de codec based on set partitioning in hierarchical trees. 120:1, et une diminution rgulire du PSNR infrieure 4 IEEE Trans Circuits Syst. Video Techn. 1996;243-250. dB entre 20:1 et 120:1. Ces mesures globales ne permettent donc pas destimer la dgradation des paramtres anatomiques et diagnostiques dune image de Thoravision.