CAPITULO 2

BIOENERGTICA

Ema Gonzlez Manuel Pinto - 2004

BIOENERGTICA

Las leyes de la Fsica y la Qumica incluyen los principios de la termodinmica que tambin se cumplen en el mundo biolgico.

Qu es Energa?: La definicin clsica seala que es la capacidad para realizar trabajo. En biologa, por lo tanto, esta se aplica a la capacidad de realizar trabajo biolgico.

Qu tipos de trabajo biolgico existen? Los principales tipos son: Trabajo qumico (sntesis de biomolculas)

Trabajo de concentracin y transporte de minerales y biomolculas en las clulas Trabajo mecnico (contraccin filamentos contrctiles) de msculos y

Trabajo elctrico (conduccin nerviosa)

FLUJO DE LA ENERGA BIOLGICA

Radiacin Solar: Flujo de energa desde el sol a los pigmentos fotosintticos

Fotosntesis : Flujo de energa desde la radiacin solar a los enlaces qumicos

Respiracin: Flujo desde las estructuras qumicas orgnicas a formas de energa utilizables en trabajo biolgico

Trabajo Biolgico: Uso y disipacin de la energa en los diferentes tipos de trabajo

Radiacin Solar: 4H 4He + 2e- + h h = 2,5 jouls/mol He Fotosntesis: 6CO2 + 6H2O + h Respiracin: C6H12O6 + 6O2 C6H12O6 + 6O2 G= + 686Kcal/mol 6CO2 + 6H2O + Energa (ATP) G= - 686Kcal/mol Trabajo Biolgico:

ATP

Oxidacin de la Glucosa

T. Qumico (Biosntesis)

T.de Concentracin y Transporte

T.Mecnico y otros

ADP+Pi

LA TERMODINMICA EN BIOLOGA
El anlisis de los distintos cambios de energa asociados a una reaccin qumica permite definir cuando una reaccin ocurrir en forma espontnea; pero no informa acerca de la velocidad con que ocurre esa reaccin, ni si ser completa o si alcanzar el equilibrio.

"Un proceso es espontneo cuando se produce sin intervencin externa".

En un proceso a presin constante, la mayor parte de la energa que el sistema gana o pierde adopta la forma de Calor. En las reacciones qumicas este calor corresponde a la Entalpa y puede ser absorbido o liberado hacia el entorno. El cambio de Entalpa (H) que acompaa a una reaccin depende slo de las variable en el estado inicial y final, sin considerar el camino recorrido. Esto se cumple en todas las funciones de estado: energa interna, entalpa, entropa, energa libre, etc. H = Hfinal - Hinicial

H (+) indica que el sistema gan calor de su entorno : Proceso Endotrmico H (-) indica que el sistema Exotrmico liber calor al entorno: Proceso

Entorno
Sistema

Calor

Sistema H ( + )

H ( - )

Exotrmico

Endotrmico

El signo del H no basta para indicar si una reaccin se llevar a cabo. La espontaneidad de los procesos se asocia con un aumento en el desorden del sistema que se expresa como un aumento de Entropa (S). Al igual que la entalpa, la entropa es una funcin de estado y se puede establecer el cambio de ella entre los estados inicial y final (S). S (+) indica un aumento del desorden del sistema (ej. un aumento en el movimiento de las partculas o bin un aumento en el nmero de partculas) C6H12O6 (s) 6 CO2 (g) + 6 H2O (g) Sf > Si S ( + ) S (-) indica una disminucin del desorden del sistema. El sistema aparece ms ordenado a costa del trabajo efectuado

inicial

Si > Sf S ( - )

final

La funcin de estado propuesta por Gibbs conocida como Energa Libre (G) considera las funciones entalpa y entropa de una reaccin qumica que ocurre a presin y temperatura constantes. Se expresa como : G = H - T S

G es una medida del trabajo til que puede realizar un sistema en un proceso espontneo.

La Energa libre se relaciona con la espontaneidad de una reaccin: Si G es (-) la reaccin es espontnea en el sentido directo y se denomina Reaccin exergnica. Si G es (+) la reaccin no es espontnea en sentido directo, es una reaccin endergnica. Se debe aportar energa desde el entorno para que ocurra. La reaccin inversa ser espontnea. Si G = 0 la reaccin est en estado de equilibrio. posibilidad de realizar trabajo. No hay

Las reacciones con G (+) pueden ser impulsadas por reacciones espontneas que se acoplan a ellas. G y Equilibrio Qumico: En reacciones en donde existe transformacin de un sustrato en producto el G tambin depende de la relacin de las concentraciones de los reactantes y productos. Q = B/A A B G = G + RTlnQ
G = G condiciones estandar (25C; 1M) R = 1,987 cal/molxgrado (constante de los gases) Q = cuociente de reaccin

En equilibrio

G = 0

y Q = Keq

G = G + RTlnKeq = 0

Si :

G = - RTlnKeq = - 2,303 RT logKeq lnKeq (+)

G (-) ;

Keq > 1

Si se conoce la Constante de Equilibrio de una reaccin se podr estimar si ella es espontnea o termodinmicamente posible, sin considerar la velocidad a que se realiza.

Relacin entre Keq y G

Keq 0,001 0,010 0,100 1 10 100 1000 G cal/mol 4,089 2,726 1,363 0 - 1,363 - 2,726 - 4,089

a 25C

Tipo de reaccin Reacciones Endergnicas

Equilibrio Reacciones Exergnicas

Si en el equilibrio:
R P

[P] > 1 [R]

G ( - )

[P] < 1 [R]

G ( + )

Ejemplo.Glucosa1P T = 25C

( Fosfoglucomutasa ) Glucosa 6P

pH = 7,0

Concentracin inicial G-1- P = 0,020 M Concentracin final G-1- P = 0,001 M Concentracin G-6- P = 0,019 M Keq = 0,019/0,001 = 19

G = - 1,987 x (273 + 25) x 2,303 log 19 G = - 1745 cal/mol (reaccin exergnica)

G y reacciones de xido-reduccin :
En reacciones en donde se transfieren electrones desde un compuesto reductor hacia un compuesto oxidante el G se relaciona con la diferencia de potencial de reduccin (E) que se genera entre ambos. (e-)

Anodo (-) (oxidacin)

Ctodo (+) (reduccin)

H2

HCl Pt

AgCl Ag

G = - nF E n = N de electrones transferidos F = Cte de Faraday (23062 cal 96500 Coulomb) E0 = V entre oxidante (aceptor) y reductor (dador de e- )

La obtencin de energa til en los organismos vivos est relacionada con procesos de oxido-reduccin asociados a la transformacin de energas de diferente tipo. Por ejemplo la transformacin de la energa luminosa en energa de enlaces qumicos. Estas reacciones se encuentran asociadas a la fotosntesis en los cloroplastos y a la respiracin en las mitocondrias de los organismos vivos. As, tanto en el transporte de electrones en los cloroplastos como en el transporte en la cadena respiratoria en las mitocondrias, existen molculas con distintos potenciales de reduccin capaces de generar flujos de electrones en funcin de los gradientes de potencial que se generen.

Potenciales Normales de Reduccin

Componente
Acetato + 2H + 2 e-/Acetaldehido 2H + 2e / H2 NAD + 2H + 2e /NADH.H FAD + 2H+ + 2e- /FADH2 Acetaldehdo + 2H + 2e- / Etanol Oxaloacetato + 2H + 2e- / Malato Coenzima Qox + 2H+ + 2e-/ Co-Qred Citocromo box + 2H+ + 2e-/ Cit bred Ubiquinona + 2H + 2e- / Ubiquinol 2Citocromo cox + 2e- / 2Cit cred Citocromo aox + 2H+ + 2e-/ Cit ared O2 + 2H+ + 2e- / H2O
+ + + + -

E0 (V)
- 0,58 - 0,42 - 0,32 - 0,324 - 0,12 - 0,197 - 0,166 - 0,05 + 0,03 + 0,1 + 0,23 + 0,29 + 0,82

NADP+ + 2H+ + 2e- /NADPH.H+

El potencial de reduccin indica la capacidad del componente para ceder o captar electrones. A potencial ms negativo mayor capacidad reductora del componente.

Cunta energa se asocia al movimiento de 2 e- desde el NADH.H+ hasta el O2 ? G0 = - 2 x 23062 (0,82 - (- 0,32) ) = - 52.700 cal Parte de esta energa liberada queda ATP.

atrapada

en

forma

de

Qu tipo de reaccin es esta ? - Identifique el origen de los electrones que llegan a la cadena respiratoria. - Trate de cuantificar la cantidad de ATP mxima que se podra lograr con esta energa.

C H2 O H

O + 6 O2

6 CO2

H 2O

G = - 686 000 cal /mol

- Si el sustrato inicial o combustible fuera la Glucosa trate de estimar el rendimiento energtico de esta molcula al degradarse totalmente a nivel celular (revise el captulo Metabolismo de Hidratos de Carbono). - Calcule la energa que se necesita para traspasar 2 electrones desde el H20 al NADP+ en los cloroplastos.

Ley de Hess.- En una serie de reacciones concatenadas por un intermediario comn, el cambio de energa libre total ser igual a la sumatoria de los cambios de energa libre parciales Reacciones metablicas con G (+) : A + B D + C G1 = (+) 5 Kcal

Se acopla a una reaccin favorecida termodinmicamente

D A + B

2 E C

G2 = (-) 9 Kcal + 2E

GTotal = G1 + G2 = (-) 4 Kcal El mecanismo de acoplar reacciones es relativamente frecuente en vas metablicas para impulsar reacciones no espontneas o para favorecer un sentido de reaccin en algunas que son fcilmente reversibles.

G de hidrlisis de compuestos fosforilados:

El ATP es un compuesto clave en la energtica celular ya que es capaz de transferir energa entre procesos exergnicos y endergnicos. Pertenece a la familia de compuestos denominados nucletidos y a pH 7 se encuentra altamente ionizado. Su hidrlisis : ATP + H2O ADP + Pi

produce un G = - 7,3 Kcal/mol, cantidad apreciable de energa debido a que la Keq de su hidrlisis es muy elevada.

NH2 N O O O N N CH N

Adenina

- O P O P O P O H2 C OOOHO

O
D-Ribosa
OH

Forma ionizada del ATP a pH 7. Estructura de alto Adenosina contenido energtico debido a electrosttica y Adenosina Monofosfato (AMP) repulsin estabilizacin por resonancia. Adenosina Difosfato (ADP) Adenosina Trifosfato (ATP) PM=472

La gran tendencia a la hidrlisis de este compuesto se debe en parte a la acumulacin de cargas negativas en la porcin de los anhdridos fosfricos que se repelen entre s; esta repulsin es mayor ATP que en ADP. Adems los productos de la hidrlisis (ADP-3 y HPO4-2) son aniones con menor carga negativa que el ATP y se estabilizan como hbridos de resonancia. El ATP fosforila a otras biomolculas y a su vez se recupera por fosforilacin del ADP, si las condiciones energticas lo permiten. El G de hidrlisis de los compuestos fosforilados tambin se expresa como Potencial de transferencia de fosfato.

G de hidrlisis y Potencial de transferencia de fosfato

Compuesto fosforilado
Fosfoenol piruvato 1-3 bisfosfoglicerato Fosfocreatina ATP Glucosa 1 fosfato Fructosa 6 fosfato Glucosa 6 fosfato Glicerol 1 fosfato

G de hidrlisis kcal/mol
- 14,8 - 11,8 - 10,3 - 7,3 - 5,0 - 3,8 - 3,3 - 2,2

Potencial de transferencia
14,8 11,8 10,3 7,3 5,0 3,8 3,3 2,2

Los compuestos con mayor potencial de transferencia de fosfato pueden fosforilar a otros que tienen potencial menor.

Transferencia de fosfato (energa) entre ATP y ADP

Fosfoenol piruvato 1,3 difosfoglicerato Fosfocreatina P

ADP

ATP Flujo de Energa

Glu-1-fosfato Fru-6-fosfato Glu-6-fosfato

La clula como un sistema termodinmico abierto

Sustratos (Materia y Energa)
Membrana Celular

ADP

S1 S2 S3
Intermediarios

ATP

1)
Cofactores Reducidos

P eO2 2)

3)
Cofactores

ATP
ATP
Cofactores. Oxidados..

ADP
Componentes Celulares propios CO2 + H2O

Calor

Productos finales de desecho : Materia y Energa - Por qu se dice que este es un sistema termodinmico abierto? - Identifique los procesos bioqumicos representados en los sectores 1), 2) y 3) - Qu papel desempea el ATP?

ENTROPA CELULAR:

Macromolculas

Sistema ordenado

CALOR
Unidades Estructurales

ATP
Productos de Degradacin E cintica y desorden Membrana Celular

Macromolculas Propias

E cintica Orden CALOR hacia el entorno

E. entorno

Cintica

del

Entropa del entorno

En el conjunto clula y su entorno se cumple Segundo principio de la Termodinmica. - Identifique el trabajo qumico desarrollado - Identifique y compare las macromolculas iniciales o de entrada al organismo vivo con las macromolculas sintetizadas. - Cmo relaciona esta produccin de calor celular con los procesos de eliminacin de calor desde el organismo.

FLUJO DE MATERIA Y ENERGA EN LA NATURALEZA

Sol

Productos Orgnicos

O2
Organismos Fotosintticos Auttrofos Organismos Hetertrofos

CO2
H2O NH3 y otros

FLUJO Y TRANSFORMACIONES ENERGTICAS

CO2 ; H2O ; NH3 y otros

ORGANISMOS AUTTROFOS ENERGA SOLAR Procesos de Reduccin MOLCULAS ORGNICAS ENERGA QUMICA

ORGANISMOS HETERTROFOS

PROCESOS DEGRADATIVOS OXIDATIVOS (Prdida de H+ + e- ) ENERGA (*) ENERGA (*) PRODUCTOS FINALES : CO2 + H2O + NH3 + otros

(*) ENERGIA Celular

CALOR (prdida)

ATP (ganancia)

Analice la transferencia de energa en la naturaleza Identifique las molculas orgnicas energticas Seale otros nombres para los procesos bioqumicos aqu sealados.

USO DE SUSTRATOS ENERGTICOS EN ORGANISMOS VEGETALES

Sol Obtencin de Energa : Citosol - Mitoc. ATP Fotosntesis G-6-P

Almacenamiento de Energa y Cadenas Carbonadas

CO2; NO3

Cloroplastos y Citosol: Almidn AAc. Acumulacin de hexosas en frutos

Sntesis Componentes Estructurales Celulares:

Celulosa, Lignina, etc Acil CoA

Obtencin de Energa : Mitoc. ATP Almacenamiento de Energa especialmente en semillas : Triglicridos Ciclo del Glioxilato; Gluconeognesis Sntesis de Componentes Estructurales Celulares : Membranas celulares, ceras cuticulares

AAc.
Sntesis de Componentes Estructurales y Funcionales Retculo Endoplsmico; Protenas Sntesis Compuestos Nitrogenados Especializados : Bases nitrogenadas, DNA, porfirinas, pigmentos, hormonas vegetales etc. Obtencin de Energa : Intermediarios del Ciclo de Krebs Gluconeognesis

ATP Glucosa

Identifique los usos ms relevantes de cada tipo de sustrato. Al avanzar en su conocimiento bioqumico se recomienda que elabore sus propios esquemas que le permitirn comprender los procesos metablicos celulares y sus interrelaciones. Para cada componente aportado por la fotosntesis, identifique estructuras qumicas generales, vas catablicas que permiten generar ATP y mecanismos generales de fosforilacin. Compare el uso de sustratos en organismos vegetales y animales. Establezca las similitudes y diferencias.

USO DE SUSTRATOS ENERGTICOS EN ORGANISMOS ANIMALES

Membrana Sangre Glu Ac. Gr. AAc .

Almacenamiento de Energa Citosol : Glicgeno Sntesis Componentes Estructurales Celulares Obtencin de Energa : Citosol - Mitoc. ATP

G-6-P

Acil CoA

Obtencin de Energa : Mitoc. ATP Almacenamiento de Energa : Citosol : Triglicridos

AAc.

Sntesis Cptes. Estructurales Celulares Biosntesis Cptes. Estructurales y Funcionales Retculo Endopl. : Protenas Biosntesis Cptos. Nitrogenados Especializados : Bases Nitrogenadas, hormonas, porfirinas, etc.

Obtencin de Energa :

- Intermed. Ciclo de Krebs

- Gluconeognesis

ATP
Glucosa

o Identifique los usos ms relevantes de cada tipo de sustrato. o Al avanzar en su conocimiento bioqumico se recomienda que elabore sus propios esquemas que le permitirn comprender los procesos metablicos celulares y sus interrelaciones. o Para cada componente aportado por la sangre, identifique estructuras qumicas generales, vas catablicas que permiten generar ATP y mecanismos generales de fosforilacin

BIOMOLCULAS : PRIORIDADES DE SU USO ENERGTICO

LAS PRIMERAS BIOMOLCULAS QUE SE UTILIZAN PARA ESTE FIN SON : CARBOHIDRATOS (incluye Reservas)

ACETIL CoA

SEGN CONDICIONES SE UTILIZARN LOS LPIDOS : ACIDOS GRASOS (incluye Reservas)

ACETIL CoA

SI LOS PROCESOS ANTERIORES NO SON SUFICIENTES SE RECURRE A LOS AMINOCIDOS : AMINOCIDOS Componentes del Ciclo

de Krebs

ACETIL CoA Y DERIVADOS DE AMINOCIDOS SE INCORPORAN AL CICLO DE KREBS ASOCIADO A LA CADENA RESPIRATORIA :

CICLO DE KREBS PRECURSORES PARA BIOSNTESIS

ATP
ENERGA CELULAR

Para cada tipo de sustrato, identifique los procesos catablicos que ocurren antes de incorporarse al Ciclo de Krebs. Es el ciclo de Krebs generador de ATP directamente? Cmo se asocia el Ciclo de Krebs con la cadena respiratoria? Determine cmo cambia esta situacin bajo condiciones de ayuno o de trabajo intenso como ejercicio, crecimiento, etc.

UTILIZACIN DE ENERGA EN TRABAJO BIOLGICO

Desde los procesos exergnicos se genera :

ATP y OTROS COMPUESTOS CON ALTO POTENCIAL DE TRANSFERENCIA DE FOSFATO

Estos compuestos se utilizan en diversos procesos : (*)

CONDUCCIN NERVIOSA

BIOSNTESIS DE BIOMOLCULAS

TRANPORTE DE SUSTRATOS

TRABAJO MECNICO: CONTRACCIN MUSCULAR

(*)

Los procesos de utilizacin son de tipo endergnico.

Qu entiende por Potencial de transferencia de fosfato? Refirase al G de hidrlisis de los compuestos fosforilados. Asocie lo anterior con procesos de produccin o de gasto de ATP.

Las molculas energticas ATP / ADP / AMP tambin son efectores o reguladores alostricos en vas relacionadas con la produccin de ATP, por ejemplo desde la Glucosa. La Glucosa que se cataboliza, en los vegetales puede provenir directamente de la Fotosntesis o de la degradacin de hidratos de carbono de reserva (Almidn). En los animales puede provenir de la Glucosa sangunea o de la degradacin del Glicgeno (Glicognolisis). Las vas catablicas de la Glucosa son la Glicolisis y el Ciclo de Krebs MOLCULAS ENERGTICAS (ATP, REGULADORES ALOSTRICOS EN RELACIONADAS CON LA GLUCOSA. ADP, VAS AMP) COMO METABOLICAS

Si:

ADP AMP

; ATP
Glicgenolisis

Si:

ATP

ADP AMP
Glicgenolisis Gliclisis

Fosforilasa (+) ; F6P-Quinasa (+) ;

Fosforilasa (-) ; Gliclisis F6P-Quinasa (-) ; F1-6bisP-fosfatasa(-) ; neognesis DH-Pirvica (+) ; Gluco-

P-enol-Pir-Quinasa (-) ;

Gliclisis

Acetil Co A DH-Pirvica (-) ; Acetil Co A

Se activa C. de K. Se frena C. de K.

Signos (+) o (-) indican si el efecto del regulador es de activacin o de inhibicin de la accin de la enzima mencionada.

ANTE UNA DISMINUCUN DE ATP INTRACELULAR SE ACTIVAN LOS PROCESOS DE DEGRADACIN o CATABLICOS. POR EL CONTRARIO EN UNA SITUACIN DE AUMENTO DE ATP DISMINUYEN LOS PROCESOS DE DEGRADACIN o PRODUCTORES DE ENERGA CELULAR.

AVERIGUE EN QUE SITUACIONES FISIOLGICAS SE MANIFIESTA UNA U OTRA DE ESTAS POSIBILIDADES.

Bibliografa o Brown,T.L. ; LeMay, H.E. ; Bursten, B.E. 1998. Qumica: La Ciencia Central, 7ed., Prentice Hall Hispanoamericana, Mxico DF, Mxico 991p o Levine, I.N. 1991, Espaa, 1077p Fisicoqumica, McGraw-Hill/Interamericana,

o Lehninger, A. 1975 . Bioenergtica, Fondo Educ. Interam. S.A. 225p. o Nelson,D.L. ; Cox M.M. 2000. Lehninger: Principles of Biochemistry, 3 ed, Worth Publishers, New York, USA, 1152p o Sybesma Ch 1989.- Biophysics, Kluwer Acad. Pub. London 311p. o Stryer, L. 1995, Bioqumica, 4 ed. Espaa, 1010p Revert, S. A., Barcelona,