FACULTAD DE CIENCIAS BIOLGICAS PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATLICA DE CHILE BOLSA DE TRABAJO Cursos Experimentales

Elaborado por: Direccin de Pregrado y Centro de Alumnos de Ciencias Biolgicas 2012.

DEPARTAMENTO DE BIOLOGA CELULAR Y MOLECULAR Acadmico: Mara Paz Marzolo, Laboratorio de Trfico Intracelular y Sealizacin, Depto. Biologa Celular y Molecular Oferta: BIO295, BIO296, BIO3319. Titulo descriptivo: 1. Trfico, sealizacin y funcin de ApoER2 en neuronas hipocampales y clulas epiteliales. 2. Papel de ApoER2 y Megalina en procesos de regeneracin del sistema nervioso perifrico Breve Descripcin: 1. El receptor 2 de ApoE (APOER2) cumple un papel fundamental en el desarrollo del sistema nervioso y tambin en plasticidad sinptica y sobrevida neuronal en condiciones de neurodegeneracin. Se expresa en varias variantes de splicing, cuya funcin y localizacin subcelular no estn del todo claras pero que debieran ser importantes en su funcin, como receptor de la molecula reelina. Al unir reelina el receptor no solo activa una compleja cascada de transduccin de seales, sino que adems modifica su propia expresin mediante la activacin de procesamiento proteoltico por alfa y gamma-secretasas, y por degradacin lisosomal. Estamos interesados en conocer a nivel molecular los determinantes de su distribucin polarizada en neuronas y en epitelios, asi como los determinantes celulares de su trafico biosinttico y endoctico, que llevan a la degradacin y,o al reciclaje del receptor. Hemos descrito que protenas adaptadoras como sorting nexin 17 y el complejo AP4 estn asociados al receptor y nos interesa entender su papel en el trafico y sealizacin del receptor. Todos estos aspectos sern adems evaluados en trminos de la funcin del receptor en neuronas. Recientemente adems hemos encontrado que el receptor se expresa en tejido renal abriendo una nueva ventana de estudio de su funcin y trafico en este rgano. 2. Se sabe que reelina es importante durante el desarrollo del sistema nervioso central y recientemente se ha encontrado tambin asociado a la expresin en sistema nervioso perifrico (SNP). Hemos encontrado que apoer2 se expresa en SNP tanto en clulas de schwann (SC) como en neuronas. La expresin del receptor el glia (SC) no ha sido descrita y este podra cumplir un papel importante en procesos de desdiferenciacin, diferenciacion y sobrevida, todos claves durante los eventos de dao y regeneracin nerviosa. A nivel neuronal, el receptor podra regular crecimiento axonal a travs de la modulacin de protenas del citoesqueleto de actina y tubulina, como se ha visto en sistema nervioso central. Contamos con ratones nulos para la expresin del receptor para estudiar tanto in vitro (clulas en cultivo primario derivadas de estos ratones) e in vivo, funcionalmente, el papel del receptor en este proceso. Megalina, como receptor de mltiples protenas de importancia fisiolgica en sobrevida, nutricin y regulacin de los procesos de diferenciacin, es un receptor que se expresa en forma importante en epitelios. Por aos hemos estudiado su trfico, funcin y regulacin de su expresin en epitelios, en condiciones normales y asociadas a patologas renal y de la vesicula biliar, aportando datos relevantes en el campo de estudio de este receptor. Recientemente hemos encontrado que neuronas del ganglio de la raz dorsal (DRG) expresan este receptor y estamos interesados en evaluar su funcin y regulacin durante los procesos de dao y
1

regeneracin en SNP. Contamos con los ratones modificados genticamente para evaluar tanto in vitro como in vivo el papel de este receptor en estos procesos. Financiamiento: 1. Fondecyt para BIO296 y tcnicas avanzadas (2) 2. Nucleo Milenio en Biologia Regenerativa (MINREB) para Tecnicas Avanzadas en Bioqumica (2) * Cuenta con fondos para pagar 4 tesis de pregrado (Tcnicas avanzadas) Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Jorge Larios, Licenciado en Bioquimica PUC, finalizando su memoria; Felipe Cabezas, Bioquimico PUC; Maria Luisa Benitez, Magister en Bioquimica, Lab. Manager; Catalina Grabowski, Estudiante de Doctorado, Mencin Biologa Celular y Molecular Contacto: mmarzolo@bio.puc.cl / Oficina: 3542112

Nombre del Profesor: Alejandra Alvarez Departamento y Laboratorio: Laboratorio de Sealizacin Celular, departamento de Biologa Celular y Molecular Qu tipo de curso se ofrece: BIO295 o BIO296, BIO3319 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Vas de sealizacin en enfermedades neurodegenerativas, estudios de muerte celular, alteracin de citoesqueleto y secrecin del pptido amiloide en la enfermedad de Alzheimer Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Lisbell Estada Contacto: aalvarez@bio.puc.cl

Acadmico: Doctor Juan Larran, DBCM y Laboratorio Biologa del Desarrollo y Regeneracin Oferta: BIO3319 Titulo descriptivo: Regeneracin espinal en anfibios Breve Descripcin: Anlisis del transcriptoma involucrado en la regeneracin de mdula espinal Financiamiento: si Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): directamente con el Doctor Larran Contacto: jlarrain@bio.puc.cl/ Oficina: 3542926

Acadmico: Enrique Brandan Oferta: BIO3319 / BIO296 Breve Descripcin: El inters de nuestro laboratorios, son los procesos celulares y moleculares involucrados en la formacin del musculo esqueltico y en las distrofias musculares. En particular, estamos estudiando los
2

mecanismos involucrados en las distrofias musculares y un proceso denominado fibrosis, el cual corresponde a un reemplazo del tejido muscular funcional por un tejido conectivo no funcional. La consecuencia de esta fibrosis es la disminucin de la capacidad de generar fuerza del msculo y una cada en la eficiencia de la terapia celular (mecanismo de re-expresin de protenas genticamente afectadas por las distrofias a travs de la inyeccin de clulas progenitoras en el musculo esqueltico). A travs de aproximaciones genticas, celulares y moleculares estamos inhibiendo la fibrosis y mejorando tanto la fuerza muscular como la terapia celular. Financiamiento: Varios Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con el Dr. Brandan Contacto: ebrandan@bio.puc.cl / Oficina: 6862725

Acadmico: Dr. Hugo Olgun Oferta: BIO295, BIO296 Titulo descriptivo: Regeneracin tisular y la biologa de clulas troncales adultas: usando el msculo esqueltico como mesn de trabajo Breve Descripcin: El msculo esqueltico en vertebrados adultos representa un ejemplo notable de regeneracin tisular as como de la funcin de clulas troncales adultas. Dado que los ncleos que conforman la fibra muscular o miofibra estn en un estado de diferenciacin terminal y son incapaces de participar en la reparacin del msculo, su mantencin y regeneracin se atribuyen a una poblacin minoritaria de precursores miognicos, denominada clulas satlites. Dichos precursores residen entre la membrana plasmtica de la miofibra y la lmina basal que la recubre, en un estado quiescente. Frente a estmulos como el dao muscular las clulas satlites se activan y proliferan extensivamente. Seales intrnsecas y extrnsecas inducen el programa de diferenciacin muscular en los mioblastos adultos (o clulas satlites activadas), los que finalmente se fusionan con fibras pre-existentes o entre s para formar nuevas miofibras. Durante el proceso de regeneracin, tambin se renueva la poblacin quiescente de clulas satlites, posibilitando la mantencin y regeneracin del msculo a travs de la vida adulta. As, una regeneracin muscular efectiva implica un delicado balance entre la diferenciacin de mioblastos adultos y la renovacin de las clulas satlites. En nuestro laboratorio nos interesamos en entender la regulacin molecular del destino celular de progenitores tisulares adultos, utilizando el modelo de clulas satlites. Este es un fenmeno clave para determinar los mecanismos que controlan la funcin y renovacin de las clulas satlites (como tambin de otras clulas troncales adultas), as como para aportar al desarrollo de terapias celulares ms efectivas en el tratamiento de enfermedades musculares degenerativas y la reparacin de tejido muscular luego de dao extenso. Especficamente, hemos enfocado nuestra atencin en la funcin y regulacin del factor de transcripcin Pax7, que aparece como un componente clave en la biognesis y mantencin de las clulas satlites. Adicionalmente, mediante una colaboracin reciente con la Facultad de Ingeniera UC buscamos aplicar parte de estas investigaciones en la generacin de biomateriales para la creacin de tejido muscular en el laboratorio. Financiamiento: VRI; postulacin a FONDECYT 2012 en revisin Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con el Doctor Olgun Contacto: holguin@bio.puc.cl / 3541860

Doctor Jorge Campusano, no cuenta con disponibilidad para primer semestre de 2012.
3

DEPARTAMENTO FISIOLGIA

Acadmico: Manuel Villaln, Unidad de Endocrinologa y Reproduccin Oferta: BIO295, BIO296 y BIO3319 Titulo descriptivo: Obesidad y su efecto sobre la fisiologa del tracto reproductivo Efectos de Contaminantes ambientales y microorganismos sobre el epitelio respiratorio Humano/ratn

Breve Descripcin: Unidad de Endocrinologa y Reproduccin. Financiamiento: FONDECYT y Anillo (Ingeniera y Medicina) Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Carolina Oses (alumna de doctorado), Daniela Carreo (alumna de doctorado), Mariana Ros (bioqumica), Karla Droguett (alumna de doctorado). Contacto: mvillalon@bio.puc.cl / Oficina: 3542873

Acadmico: Victoria Velarde Oferta: BIO295 Titulo descriptivo: Funcin renal y cardiovascular en diabetes Breve Descripcin: utilizan modelos animales y de clulas en cultivo para estudiar las respuestas y vas de sealizacin activadas en diabetes y sus modificaciones frente a nuevos tratamientos farmacuticos. Financiamiento: FONDEF, ANILLO Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Valerie Decap Contacto: vvelarde@bio.puc.cl / Oficina: 3542864

Acadmico: Rodrigo Iturriaga, Laboratorio de Neurobiologa Oferta: BIO295, BIO296 y BIO3319 Titulo descriptivo: Contribucin del estrs oxidativo sobre los cambios patolgicos producidos por la hipoxia intermitente crnica en modelos de apnea del sueo

Breve Descripcin: Se usa un modelo de roedores expuestos a hipoxia intermitente crnica (HIC), a fin de generar un cuadro hipertensivo de manera fisiolgica simulando los episodios de hipoxia-re oxigenacin observados en los pacientes con apnea obstructiva (AOS).

En este modelo ha sido posible reproducir las alteraciones cardiovasculares caractersticas de la AOS. Hemos demostrado que animales expuestos a HIC desarrollan potenciacin de las respuestas quimiosensoriales de los rganos quimiorreceptores del oxgeno, contribuyendo al desarrollo de alteraciones cardiorrespiratorias y autonmicas, e hipertensin. Estos estudios han llevado a postular que en la AOS se produce hipertensin a travs de la hipoxia-y el estrs oxidativo, generando un aumento en la sntesis de molculas pro-inflamatorias, conduciendo a la potenciacin quimiosensorial de las respuestas al oxgeno y disfuncin endotelial. Publicaciones: Los alumnos que han participado en los ltimos aos en estas actividades han sido coautores de trabajos publicados en revistas como Am Journal Physiol y Eur Respir J, y captulos de series peridicas como Adv Exp Biol Med.. Financiamiento: FONDECYT y Anillo Tutor: Dr. Rodrigo Iturriaga. Contacto: riturriaga@bio.puc.cl oficina: 6862852

Acadmico: Fernando Torrealba Oferta: 2 cupos BIO295 / 3 cupos BIO296 Lnea de investigacin: http://www.bio.puc.cl/labs/neda/Pagina.htm Contacto: ftorrealba@bio.puc.cl / Oficina: 6862853

El Doctor Juan Carlos Sez, no cuenta con vacantes disponibles para el primer semestre de 2012.

DEPARTAMENTO DE ECOLOGA

Acadmico: Doctor Luis Ebensperger Oferta: Bio-295 Titulo descriptivo: Variacin interanual de la actividad reproductiva en el roedor Octodon degus Breve Descripcin: Trabajo de terreno diario a partir de diciembre y hasta mediados o fines de enero, en Rinconada de Maip (RM). Esto involucra la captura, marcaje y posterior recaptura de animales Financiamiento: Gastos de transporte y alimentacin cubiertos Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con el Doctor Luis Ebensperger Contacto: lebensperger@bio.puc.cl / Oficina: 3542733

Acadmico: Doctor Bernab Santelices Oferta: BIO295-BIO296, hay slo 2 vacantes. Titulo descriptivo: Desarrollo de algas; coalescencia; ecologa DE MACROALGAS Financiamiento: si Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con el Doctor Bernab Santelices Contacto: bsantelices@bio.puc.cl / Oficina: 3542648

Acadmico: Miriam Fernandez y Mauricio Lima Oferta: BIO296 Titulo descriptivo: tres proyectos. 1. Modelo de dinmica poblacional para control canino 2. Impacto humano sobre interacciones trficas en ecosistemas costeros 3. Efectos ambientales sobre produccin pesquera de organismos bentonicos (especie a definir entre lapas, erizos y locos) Breve Descripcin: 1. El proyecto involucra desarrollar un modelo de crecimiento poblacional para poblaciones de mascotas (canes) y en base a los resultados de crecimiento poblacional generar propuestas para el control de la natalidad. 2. El proyecto se inserta en un proyecto de mayor envergadura que propone entender los factores que afectan la dinmica de los ecosistemas costeros sujetos a impacto humano en Chile central, desde variables ambientales hasta humanas, y proponer planes de conservacin y manejo sustentable. En
6

este contexto se estructuran varios mini proyectos, y este en particular propone evaluar el efecto indirecto de impacto humano sobre el reclutamiento de especies de interes comercial como la lapa. 3. El proyecto se inserta en un proyecto de mayor envergadura que propone entender los factores que afectan la dinmica de los ecosistemas costeros sujetos a impacto humano en Chile central, desde variables ambientales hasta humanas, y proponer planes de conservacin y manejo sustentable. En este contexto se estructuran varios mini proyectos, y este en particular propone evaluar el efecto de la heterogeneidad de la costa sobre la produccin pesquera Financiamiento: si Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con los Doctores ya sealados. Contacto: mfernandez@bio.puc.cl

Acadmico: Drs. Juan Luis Celis, Silvina Ippi y Juan Armesto Oferta: BIO295 / BIO296, Laboratorio de Ecosistemas Terrestres Titulo descriptivo: Descripcin de la dieta del ensable de aves del paisaje rural del norte de la Isla de Chilo. Objetivos: Cuantificar la proporcin de semillas e insectos en la dieta de las distintas especies de aves de Chilo Identificar los frutos consumidos por las distintas especies de aves de Chilo Identificar los insectos consumidos a nivel de orden y/o familia, por las distintas especies de aves de Chilo

El trabajo consiste en analizar en laboratorio bajo lupa, fecas de aves colectadas en muestreos con redes de niebla en la Estacin Biologica Senda Darwin, Chilo e identificar el contenido fecal. Ademas se ofrece asistir a terreno a participar en las capturas de aves. Recomendado de acuerdo al inters y disponibilidad de los estudiantes: Tener disponibilidad de 10 das para asistir a terreno a la Estacin Biologica Senda Darwin entre los meses de diciembre a Abril a hacer captura de aves con redes de niebla Breve Descripcin: * Pueden ser 2 unidades de investigacin por separado, una persona que se dedique a los insectos y otra a la identificacin de semillas colectadas en las fecas de aves. Contacto: jlcelis@gmail.com / jarmesto@bio.puc.cl / silvippi@yahoo.com

Acadmico: Peter von Dassow Qu tipo de curso se ofrece: BIO295, BIO296 Proyecto 1 Titulo descriptivo de la investigacin en curso:Genome evolution in the most abundant cosmopolitan coccolithophore Emiliania huxleyi, a keystone species providing a model for understanding the capacity of phytoplankton to adapt in a rapidly changing ocean. Breve descripcin de la misma:En general, ste proyecto busca investigar adaptaciones genmicas frente a
7

naturalmente alta concentraciones de CO2 disuelto (acidificacin) en aguas de surgencia en el Sistema de Corrientes de Humboldt (SCH). El aumento de CO2 dado a actividades humanos est bajando el pH del ocano. Varios estudios en el laboratorio han mostrado que sa acidificacin puede disminuir la capacidad de varios organismos de construir exo-esqueletos de calcio. Pero, los cocolitoforidos que se encuentran en el SCH son altamente calcificados, a pesar de que estn expuestos a condiciones de acidificacin natural. Queremos entender cuales son las adaptaciones distintas que tiene esas poblaciones y si esas poblaciones pueden intercambiar adaptaciones con poblaciones del misma morfo-especie que se encuentran en otros lugares. La primera etapa es de aislar y caracterizar un gran numero de nuevas cepas de cocolitoforidos de la especia E. huxleyi y hacer una caracterizacin inicial gentica de esas cepas. Alumnos en BIO295 y BIO296 en este proyecto, en el ao 2012, participarn en esta caracterizacin inicial de nuevas cepas con microscopa, extraccin de ADN, PCR, y secuenciacin. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Apoyado por FONDECYT 1110575 Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Dra. Daniella Mella Flores (postdoctorante) y Dr. Peter von Dassow (patrocinante) Contacto: pvondassow@bio.puc.cl / Oficina: 3542640 Proyecto 2 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Marcadores qumicos y biolgicos para entender el crecimiento acelerado de Ulva sp. En la costa de algarrobo, CHILE Breve descripcin de la misma:Algarrobo es una comunidad costera de la Quinta Regin de Chile que en los ltimos 10 aos se ha visto afectada por la proliferacin de la macroalga Ulvs sp. En este tiempo diversas hiptesis sobre este crecimiento descontrolado han surgido entre los pobladores que se ven afectados. Para buscar una solucin se recurri a la Estacin Costera de Investigaciones Marinas de la Pontificia Universidad Catlica de Chile en Las Cruces, la cual por medio de los trabajos de campo de dos cursos de la Facultad de Ciencias Biolgicas que funcionan con el Programa Aprendizaje Servicio (Microbiologa Marina y Oceanografa Fsica-Biolgica) han llevado a cabo algunos estudios preliminares. Sin embargo, debido a que una de las hiptesis contempla la interaccin de una descarga de aguas residuales que se localiza al norte de la baha de Algarrobo, se ha buscado una asociacin entre la Facultad de Qumica y la Facultad de Ciencias Biolgicas para determinar marcadores biolgicos y marcadores qumicos que estn asociados a actividades humanas. En este caso se determinarn cmo parmetros los niveles presentes de amonia, nitrato, cafena, estradiol, coliformes fecales y la razn C:N y d15N, mediante los cuales se busca determinar si correlacionar entre s, de modo de determinar si pueden ser atribuibles a la causa de la proliferacin de la macroalga. Alumnos en BIO295 o BIO296 participarn en analizar parmetros de microbiologa y nutrientes en la baha de Algarrobo y en un sitio de control frente la costa de El Quisco. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Apoyado por financiamiento VRI interdisciplinaria Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Dr. Peter von Dassow (coordinadora), Dra. Ady Giordano, y Dr. Rodrigo De la Iglesia. Contacto: pvondassow@bio.puc.cl / Oficina: 3542640

Nombre del Profesor: Juan Armesto, Laboratorio de Sistemas Terrestres Qu tipo de curso se ofrece: Bio 295 y 296 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: 1) Muestro y anlisiis de parecelas permanentes en bosques templados
8

2) Relacin entre fenologa y mutualismos planta-animal 3) Dieta del ensamble de aves del bosque Chilo Breve descripcin de la misma: Unidades bibliogrficas y posible trabajo de campo y laboratorio para avanzar en el conocimiento de los ecosistemas de bosques de Chilo y Fray Jorge. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: si, para actividades de campo y bibliografa. Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): Juan Luis Celis, Silvina Ippi, Mariela Nuez, Juan Armesto Contacto: jlcelis@gmail.com; mnunezavila@gmail.com

Dr. Jos Miguel Faria no cuenta con vacantes disponibles para el primer semestre de 2012.

DEPARTAMENTO DE GENTICA MOLECULAR Y MICROBIOLOGA

Acadmico: Loreto Holuigue Oferta: BIO295-BIO296 o BIO3319 Titulo descriptivo: Estudios de la respuesta antioxidante que se gatilla por estrs de tipo bitico y abitico en plantas de Arabidopsis thaliana. Breve Descripcin: Utilizando herramientas de genmica funcional analizamos el requerimiento de determinados genes que codifican para enzimas antioxidantes, en la respuesta de defensa que las plantas desarrollan al estar expuestas a diferentes condiciones de estrs. Financiamiento: si Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): la relacin es directa con la Doctora Holuigui. Contacto: lholuigue@bio.puc.cl / Telfono: 3542894

Acadmico: Doctora Paulina Bull Oferta: BIO295 / BIO3319 Titulo descriptivo: El factor de transcripcin PcACE1, sus motivos de Cys y su regulacin por cobre Breve Descripcin: Mi inters es avanzar en la investigacin de la importancia que tienen los motivos de Cys presentes en este factor de transcripcin, usando tcnicas de Biologa Molecular y expresin en S. cerevisiae Financiamiento: si Requisitos: 1) Concertar cita con Paulina Bull, 2) Haber aprobado Gentica Molecular BIO288, 3) Haber aprobado Laboratorio BIOQUIMICA II Gentica Molecular BIO266E Contacto: pbull@bio.puc.cl / Oficina: 3542663

Acadmico: Luz Mnica Vsquez Oferta: BIO296 / BIO3319 Titulo descriptivo: Anlisis genmico en dinoflagelados y cianobacterias productoras de toxinas Breve Descripcin: www.ecomicrolab.cl Financiamiento: si Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor, especialmente para los BIO295): relacin directa con la Dra. Vsquez Contacto: mvasquez@bio.puc.cl / Oficina: 3542847

10

Acadmico: Alexis Kalergis Oferta: BIO296 y BIO3319 Titulo descriptivo: Inmunologa Celular y Molecular, aplicada a enfermedades infecciosas e inflamatorias Financiamiento: FONDECYT, Instituto Milenio Contacto: akalergis@bio.puc.cl / Oficina: 3542842

11

CENTRO DE INVESTIGACINES MDICAS (CIM)

Nombre del Profesor: Dr. Diego Mezzano Departamento y laboratorio: Laboratorio de Trombosis y Hemostasia, Escuela de Medicina Qu tipo de curso se ofrece: Tesis de pregrado, BIO295 y/o BIO296 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Platelet-Based Model of Hemostasis Breve descripcin de la misma: La hemostasia puede ser definida como un conjunto de procesos interrelacionados cuya finalidad es detener una hemorragia manteniendo la sangre en su estado lquido y facilitando la reparacin posterior del tejido. Actores de este proceso son la pared del vaso sanguneo, las plaquetas circulantes, el sistema de la coagulacin y el sistema de la fibrinolisis, que disuelve el cogulo para facilitar la reparacin del dao. Planteamos un modelo basado en plaquetas dado que son las primeras en intervenir en el proceso hemosttico y proveen una infinidad de componentes, tanto secretados como expresados en su membrana, capaces de nuclear a su alrededor la coagulacin de la sangre y modular la disolucin del cogulo. Las plaquetas sintetizan protenas a partir de su mRNA y, entre ellas, el Factor Tisular, que gatilla el inicio de la coagulacin. Este novedoso modelo sera autovalente, pues prescinde de elementos extravasculares para su desarrollo. La potencialidad de estudiar la funcin de cada una de las protenas plaquetarias, su integracin y "timing" en el proceso constituye una rica fuente de temas de Tesis de Pre y posgrado, as como de prcticas en tcnicas avanzadas, BIO295 y 296. Requisitos: Los exigidos por la Facultad para estos cursos o Tesis. Idealmente, dedicacin exclusiva o inmensamente mayoritaria al proyecto Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Proyecto FONDECYT Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Dr. Diego Mezzano Contacto: dmezzano@med.puc.cl Fono: 354 3774 o 3776 Cel: 95339636

Nombre del Profesor: Dr. Alejandro Corvalan DepartamentoHematologia y Oncologia, Laboratorio Patologia Molecular Qu tipo de curso se ofrece: BIO295 Seminario de Investigacin Departamental, BIO296 Seminario de Investigacin Biolgica, BIO3319 Tcnicas Avanzadas de Investigacin en Bioqumica Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Bases Moleculares del Cancer Breve descripcin de la misma: El cncer ser la primera causa de muerte en Chile en los prximos aos. En particular, el cncer gstrico y el cncer de mama son dos de los principales tumores en nuestro pas. Nuestro laboratorio, a travs de proyectos Fondecyts (#1030130 y #1080563) ha identificado un potencial biomarcador para la deteccin temprana del cncer gstrico a travs de una aproximacin "epigenetica" y "DNA libre en sangre". Nuestro biomarcador, Reprimo, (gen supresor de tumores dependiente de p53), se encuentra en fase de alidacin a nivel poblacional (FondefD09I1137) y a travs de un nuevo proyecto
12

Fondecyt (#1111014) estamos caracterizando su rol en la patognesis del cncer gstrico. Para ello realizamos anlisis in-vitro e in-vivo, utilizando una variedad de metodologas que incluyen bioinformtica, cultivos celulares, ensayos funcionales y tcnicas de biologa celular y molecular (western blot, clonamiento, secuenciacin, RealTime PCR, Methylight, MSP, etc..) y otras metodologias (tissue microarrays, etc...) Requisitos: entrevista personal Financiamiento: Fondecyt 1111014, FondefD09I1137 Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Dr. Alejandro Corvalan Contacto: corvalan@med.puc.cl

Nombre del Profesor: Dr. Hernn Gonzlez Departamento y laboratorio: Departamento Ciruga Oncolgica Qu tipo de curso se ofrece: Los tres tipos de curso Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Cancer de tiroides, estudio de marcadores moleculares para diagnstico y pronstico. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Consorcio biotecnolgico de biomedicina. Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Dr. Hernn Gonzlez Contacto: hegonzal@gmail.com

Nombre del Profesor: Dr. Jorge Carvajal Departamento y laboratorio: Laboratorio de Obstetricia y Ginecologa, Departamento de Obstetricia y Ginecologa. Facultad de Medicina Qu tipo de curso se ofrece: Tesis para optar a grado de pregrado, tambin es posible como BIO 295 y BIO 296 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Rol Paracrino del Pptido natriurtico Cerebral (BNP) en la Mantencin de la Quiescencia Miometrial del Embarazo. Estudio de sus vas de sealizacin celular en el miometrio humano

Breve descripcin de la misma: La mantencin del embarazo requiere una completa relajacin uterina durante la mayor parte de la gestacin, perodo conocido como Quiescencia Miometrial. Los mediadores encargados de la generacin y mantencin de la quiescencia miometrial son pobremente conocidos. Demostramos, en humano, que las membranas fetales (corion y amnios) producen factores que inhiben la contractilidad miometrial, y pueden ser mediadores paracrinos de la quiescencia miometrial del embarazo. Posteriormente observamos que las membranas fetales producen una protena denominada pptido natriurtico cerebral (BNP); y reportamos que la produccin de BNP por las membranas fetales es mayor durante el perodo de quiescencia miometrial. El BNP inhibe la contractilidad del miometrio humano prematuro in Vitro; sin embargo, reportamos que la accin inhibitoria del BNP no es mediada por el receptor
13

tradicional del BNP (receptor tipo guanilato ciclasa) ni por la va del GMPc (va habitual de accin celular de este pptido). Nosotros demostramos que la inhibicin de la contraccin miometrial producida por BNP est mediada por la activacin del receptor clearence(NPR-C), un receptor no acoplado a guanilato ciclasa. Sin embargo, la cascada intracelular desencadenada despus de la activacin NPR-C por BNP no se conoce. El trabajo en curso estudia precisamente el mecanismo intracelular de la ruta BNP/receptor clearance. Requisitos: Ser estudiante de bioqumica o biologa, con ganas de trabajar, responsable y disponibilidad de horario. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Fondecyt 1090616. Existe financiamiento especfico para el alumno. Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Ana Mara Delpiano (Bioqumico) y Jorge Carvajal C (MD, PhD) Contacto:Dr. Jorge Carvajal: jcarva@med.puc.cl / Ana Mara Delpiano: delpiano@med.puc.cl

Nombre del Profesor: Jose Suazo y Alicia Colombo Departamento y laboratorio: Depto Nutricion, Lab Nutricion y Genetica Qu tipo de curso se ofrece: Tesis de pregrado Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Rol de la prenilacion (via derivada de la sintesis de colesterol) en el desarrollo maxilofacial en pez cebra Breve descripcin de la misma: Uso de inhibidores de la prenilacion (modificacion postraduccional que depende de intermediarios derivados de la sintesis de colesterol) para evaluar su efecto en el desarrollo maxilofacial del pez cebra, mediante el uso de tinciones de embriones para ver desarrollo de estructuras y el uso de genes marcadores de migracion y diferenciaciacion. Requisitos: experiancia en laboratorio de investigacion Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Fondecyt de iniciacion (sin remuneracion para tesista) Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Jose Suazo y Alicia Colombo Contacto: Jose Suazo jsuazo@med.puc.cl Tesis 2 Nombre del Profesor: Jos Suazo Departamento y laboratorio: Depto Nutricion, Lab Nutricion y Genetica Qu tipo de curso se ofrece: Tesis pregrado Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Estudio de asociacion entre polimorfismos del gen MTHFR y la espina bifida en Chile Breve descripcin de la misma: determinar el genotipo de dos polimorfismos (SNPs) del gen MTHFR (via del metabolismo del folato) en una muestra de nios con espina bifida (defecto del cierre del tubo neural) y en sus padres para relacionarlos con la expresin de esta mal formacion congenita. Requisitos: experiencia en laboratorio de investigacin
14

Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Proyecto Hospital JJ Aguirre (sin remuneracion para tesista) Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Jos Suazo Contacto jsuazo@med.puc.cl

Nombre del Profesor: Silvana Zanlungo Departamento y laboratorio: Departamento de Gastroenterologa Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296) BIO295, BIO296 y BIO3319 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Mecanismos involucrados en el dao celular en las enfermedades de depsito lisosomal de Niemann Pick. Breve descripcin de la misma: Nuestra investigacin se ha centrado en el estudio de los mecanismos moleculares y celulares implicados en el transporte intracelular de colesterol. Estamos especialmente interesados en estudiar el papel de las protenas Niemann Pick C (NPC), NPC1 y NPC2, en las neuronas, las clulas hepticas y los cardiomiocitos. Su grupo est especialmente interesado en estudiar el transporte de colesterol en el hgado y la importancia de las protenas NPC en el estrs oxidativo y el metabolismo del cobre, dao al hgado, fibrosis y apoptosis. En el SNC, se est estudiando la conexin entre los defectos de transporte de colesterol, la respuesta al estrs y la apoptosis de las neuronas del cerebelo. En la enfermedad de Niemann Pick B estamos estudiando la mutacin chilena A357D en el gen de la esfingomielinasa cida. Requisitos: los que se necesitan para tomar los cursos. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Tenemos financiamiento del Centro FONDAP de Regulacin del Genoma y de mi proyecto FONDECYT Regular. Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Contacto: silvana@med.puc.cl; silvana.zanlungo@gmail.com

Nombre del Profesor: Paola Casanello Departamento y laboratorio: Divisin de Obstetricia y Ginecologa de la Facultad de Medicina/ Laboratorio de Investigacin en Perinatologa Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296) Tesis de pregrado, BIO295 y BIO 296 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: "Cambios epigenticos dependientes de estrs oxidativo e hipoxia en el promotor de eNOS y arginasa" "Expresin diferencial de protenas en clulas endoteliales de la vena umbilical humana en RCF e hipoxia" "Papel del estrs nitrosativo en la regulacin de la expresin y actividad de arginasa en HUVEC de RCF" Breve descripcin de la misma: Estudiamos las alteraciones en la funcin vascular de la placenta humana en la restriccin del crecimiento fetal (RCF) as como en clulas provenientes de placentas normales expuestas a hipoxia experimental. Nuestra aproximacin experimental incluye ensayos ex vivo: miografa de vasos umbilicales y corinico de la placenta e in vitro: en cultivos primarios de clulas endoteliales de arterias
15

y venas umbilicales y corinicas estudiamos actividades enzimticas de NOS y arginasas, expresin de protenas (western blot, inmunocitoqumica e IFI) y genes (PCR cuantitativo), geles 2D (DIGE), modificaciones epigenticas en el promotor de genes (metilacin del DNA y modificaciones de histonas), actividad y expresin de transportadores de membrana, silenciamiento de genes (RNA interferentes), etc. Requisitos: Los necesarios para inscribir los cursos Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Para tesistas de pre y postgrado tenemos opciones de financiamiento dentro de los rangos permitidos por los proyectos Fondecyt/Anillos Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): El tutor principar ser el profesor y se le asignar un tutor prctico que puede ser un asistente tcnico o un estudiante de postgrado. Contacto: pcasane@med.puc.cl o anexo 8119 (of), 8116 (lab)

Nombre del Profesor: Dr Juan Fco. Miquel Departamento y laboratorio: Gastroenterologa Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296); BIO3319 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Evaluacin funcional in vivo de variantes genticas del transportador de esteroles ABCG5/G8 y su participacin en litiasis vesicular. Breve descripcin de la misma: ABCG5/G8 son genes heterodmeros obligados que transportan esteroles neutros (colesterol, fitoesteroles) y que se expresan en intestino e hgado. En el hgado actan como transportadores de esteroles facilitando su secrecin hacia la bilis. Una ganacia de funcin de estos genes incrementa el contenido de colesterol en la bilis. Variantes genticas en ABCG5/G8 se correlacionan con incremento de riesgo de litiasis en la va biliar en nuestra poblacin. Sin embargo, la funcin de estas variantes no ha sido estudiada. El proyecto contempla evaluar si estas variantes modifican la capacidad funcional de estos transportadores al ser expresados mediante vectores adenovirales en hgados de ratones. Requisitos: Tener demostrada capacidad de manejo de ciertas tcnicas de laboratorio bsicas. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: se contempla un financiamiento mnimo. Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Dr. Juan Fco. Miquel Contacto: jfmiquel@med.puc.cl

Nombre del Profesor : Olga Panes. Lugar: Laboratorio de Hemostasia y Trombosis, Facultad de Medicina PUC. Proyecto Fondecyt 1110404 Nueva Funcin de las Plaquetas: Integracin de los procesos de iniciacin de la coagulacin, lisis del cogulo y reparacin de heridas Novel Platelet Function: An Integrating Role in Clotting Initiation, Clot Lysis and Wound Healing Processes. Tutores : Olga Panes Becerra o Diego Mezzano A. o Valeria Matus R

16

Poseemos varios tpicos incluidos en este proyecto, desde el anlisis de datos clnicos y medicin de parmetros bioqumicos determinantes de la funcin plaquetaria, como investigacin bsica en: factores de crecimiento y fisiologa plaquetaria o Gentica molecular e investigacin en complejos y procesos de sntesis en plaquetas humanas, desde el mRNA, procesos de proteccin a sntesis de Protena final. Por favor contactarse con Olga Panes B opanes@med.puc.cl o en el Laboratorio de Hemostasia y Trombosis, Marcoleta 328, torre 2 local 2

Nombre del Profesor: Dr. Attilio Rigotti Departamento y laboratorio: Laboratorio de Gastroenterologa, Departamento de Gastroenterologa, Escuela de Medicina, PUC Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296): Se ofrece tanto BIO295, BIO296 y Tesis de Pregrado Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Metabolismo y Funcionalidad de las Lipoprotenas de Alta Densidad (HDL) Breve descripcin de la misma: Las partculas de lipoprotenas de alta densidad (HDL) tienen un importante efecto protector cardiovascular contra el desarrollo de ateroesclerosis. Nuestra lnea de trabajo se enfoca hacia el estudio del metabolismo de las partculas de HDL dependiente del receptor celular SR-BI y de su funcionalidad en el transporte reverso del colesterol, defensa frente al stress oxidativo y el metabolismo de la glucosa, tanto en clulas en cultivo, modelos animales y pacientes con trastornos metablicos y cardiopata coronaria Requisitos: Aprobacin previa de cursos de Metabolismo y/o Bioqumica Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Financiamiento de FONDECYT Contacto: arigotti@med.puc.cl

Nombre del Profesor: Dolores Busso Departamento y laboratorio: Lab. Dr. Arrilio Rigotti, departamento gastroenterologa, escuela Medicina. Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296): BIO295-BIO296 Titulo descriptivo de la investigacin en curso: "Relevancia del metobolismo de colesterol en la biologa de la reproduccin y el desarrollo embrionario." Breve descripcin de la misma: ver en el link http://escuela.med.puc.cl/deptos/gastro/Rigotti/lab/equipobusso.htm Requisitos: a conversar Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: financiamiento FONDECYT Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): co-tutora con el Dr. Attilio Rigotti Contacto: dbusso@med.puc.cl

17

Nombre del Profesor: Vctor Corts Departamento y laboratorio: Departamento de Nutricin, Diabetes y Metabolismo, Facultad de Medicina Qu tipo de curso se ofrece: (Si es tesis de pregrado o si sirven como BIO295 y/o BIO296) Ambos Titulo descriptivo de la investigacin en curso: Caracterizacin transcripcional de la adipognesis defectuosa en ratones deficientes de AGPAT2 Breve descripcin de la misma: Mutaciones en el gen AGPAT2 producen ausencia total de tejido adiposo en humanos. Esta enfermedad se conoce como lipodistrofia congnita generalizada y sus mecanismos moleculares son desconocidos. En mi proyecto Fondecyt estamos investigando, entre otros aspectos de esta patologa, las diferencias que ocurren en la adipognesis lipodistrfica y normal a nivel transcripcional y traduccional, usando el ratn Agpat2-/-, recientemente generado y caracterizado por mi en The University of Texas Southwestern Medical Center. Para realizar estos objetivos, diferenciamos fibroblastos embrionarios derivados de estos animales in vitro, y medimos los niveles de transcritos de inters por PCR cuantitativo en tiempo real, a distintos tiempos de diferenciacin y bajo distintos estmulos Requisitos: Familiaridad terica con los conceptos de: regulacin transcripcional, cultivo celular y diferenciacin in vitro. Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Fondecyt, Conicyt de insercin en la acadmia Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Vctor Corts Contacto: vcortes@med.puc.cl; vcortesm@gmail.com

Profesora: Alicia Colombo T.M. PhD 1.-Anlisis de la expresin de protinas que modulan citoesqueleto en el tracto Hab-NIP en pez cebra (PCR, tcnicas de biologa molecular bsicas, hibridacin in situ, inmunofluorescencia, confocal) 2.-Efecto de la inhibicin de la sintsis de colesterol en el desarrollo de mandbula y paladar en pez cebra (Tincin de cartilago, hueso e hibridacin in situ, utilizacin de peces trangnicos y confocal) La idea es que con esto avancen experimentalmente para continuar con la tesis (proyeccion de un ao), con remuneracin.

Nombre del Profesor: Alfonso Gonzlez Departamento y laboratorio: Laboratorio Citologa Biomdica. Depto Biologa Celular y Molecular, Fc. Ciencias. Depto. Inmunologa Clnica y Reumatologa, Fac. Medicina Qu tipo de curso se ofrece: BIO295, BIO296 y Tesis Titulo descriptivo de la investigacin en curso: 1) Trfico de protenas, mecanismos, funciones y aplicacin en nuevas terapias anti-cncer

18

2) Dao psiquitrico y cognitivo por autoanticuerpos en lupus Breve descripcin de la misma: 1) I. Trfico vesicular de protenas hacia y desde la superficie celular: mecanismos y aplicaciones biomdicas. Esta lnea de investigacin aborda uno de los aspectos ms importantes de la biologa celular, ya que se ocupa de entender cmo se genera y se mantiene la superficie celular y cmo sus alteraciones pueden llevar a enfermedad. La superficie celular es el lugar donde ocurren la mayor parte de las interacciones de la clula con su medio y sus funciones se reflejan en procesos fisiolgicos y en alteraciones patognicas. Adems, los tratamientos de diversas enfermedades intentan restituir o inhibir procesos que ocurren en la superficie celular. Aqu estudiamos el trfico de las protenas desde sus sitios de sntesis hacia los sitios donde cumplen su funcin en la superficie celular (ruta exoctica). Tambin estudiamos el trfico de protenas desde la superficie celular hacia compartimentos intracelulares (ruta endoctica), desde donde las protenas pueden reciclar o entrar en una ruta degradativa. Sobre este trfico de protenas altamente controlado interesa conocer sus mecanismos y funcin en la generacin de ciertos tipos de clulas en las cuales las funciones de la superficie celular se separan en distintas zonas. epiteliales y las neuronas, y en el reciclaje de la superficie celular de las clulas en general. Un aspecto de particular importancia en enfermedades es entender cmo el trfico de receptores que se encuentran en la superficie celular se relaciona con el control de la proliferacin celular y con sus alteraciones conducentes a cncer. En esta parte nuestros hallazgos han derivado hacia potenciales aplicaciones innovadoras en el tratamiento del cncer. Hemos encontrado que el trfico de uno de estos receptores, que frecuentemente se encuentra alterado en diversos tipos de cnceres, aumentando su malignidad, puede utilizarse como blanco para disear una nueva familia de frmacos que contraresten el crecimiento tumoral. Estos nuevos frmacos podran utilizarse para aumentar la eficacia de los tratamientos existentes o constituir la nica alternativa para los casos donde ya haya aparecido resistencia a la quimioterapia. II. Dao siquitrico y cognitivo por autoanticuerpos en lupus Los pacientes con lupus eritematoso diseminado frecuentemente presentan manifestaciones neuropsiquitricas, incluyendo psicosis y depresin, o dao cognitivo. Estas manifestaciones aumentan la gravedad de la enfermedad y empeoran la calidad de vida de los pacientes. Una hiptesis que se ha estado estudiando desde hace ms de dos decadas propone que atribuye un papel patognico a ciertos autoanticuerpos que estos pacientes producen. Entre stos, los autoanticuerpos contra protenas ribosomales P (anti-P) han sido los ms estudiados. Sin embargo hasta hace poco no se entenda cmo estos anticuerpos dirigidos contra ribosomas, que se encuentran en todo tipo clulas, podran causar dao neuronal. Nuestro laboratorio ha descubierto un nuevo blanco de estos autoanticuerpos anti-P que se encuentra en la superficie de ciertas neuronas en regiones especficas del cerebro, incluyendo regiones involucradas en memoria, cognicin y emocin. Requisitos: Entrevista y Notas Sealar si existen fuentes de financiamiento o no: Posible tutor y nombre (slo si tendra algn tutor): Alfonso Gonzlez Contacto: agonzara56@gmail.com / Telfono: 6862710

19