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Gentica

Expresin y alteraciones de la informacin gentica. Cdigo gentico: transcripcin. ARNm: traduccin. ARNt: sntesis de protenas. Introduccin

Pentosa + base nitrogenada = nuclesido. Nuclesido + P = nucletido. La pentosa puede ser, ribosa o desoxirribosa. Bases nitrogenadas:

Pricas: Adenina (A) Guanina (G) Pirimidnicas: Citosina (C) Timina (T) Uracilo (U)

El ADN o cido desoxirribonucleico. Tiene forma helicoidal. Su pentosa es la desoxirribosa y sus bases nitrogenadas son: A = T y G " C, las lneas horizontales, indican el nmero de puentes de hidrgeno que las enlaza. El ADN se encuentra en el ncleo de la clula o en el interior de los orgnulos energticos El ARN o cido ribonucleico. Tiene como pentosa a la ribosa y como bases nitrogenadas tiene: A = U y G " C. Se encuentra en el ncleo y en el citoplasma. Recibe la informacin del ADN y la transmite, hay tres tipos de ARN:

ARNm: tiene forma lineal. Va a transmitir la secuencia de nucletidos para que se ejecute en el citoplasma.

ARNt: va a colocar los aa en el orden que indique el ARNm, para as formar las protenas. ARNr: forma los ribosomas. Es donde se sintetizan las protenas, es el que est en mayor abundancia, aproximadamente es el 75% de los ARN.

Segn el dogma central de la biologa molecular, el ADN forma una copia de parte de su mensaje, sintetizando ARNm (transcripcin) la cual constituye la informacin utilizada por los ribosomas para la sntesis de protenas (traduccin) Transcripcin Traduccin ADN ARN protenas El cuerpo va a utilizar estas protenas la fisiologa y anatoma celular. El ADN est en el ncleo y debido a su gran tamao, no puede salir. Su informacin tiene que llegar al citoplasma que es donde se fabrican las protenas, para que ocurra esto, lo que va a hacer es sintetizar ARNm, esto es lo que se llama transcripcin. El ARNm es quien se va a encargar de llevar la informacin gentica al citoplasma. La transcripcin es un proceso que slo se da en el ncleo, al igual que la replicacin, mientras que la traduccin se da en el citoplasma. Una vez que el ARNm llega al citoplasma, se encuentra con los otros ARN. El paso de la secuencia de nucletidos hasta aa, es lo que se conoce como cdigo gentico, el cual es universal. Todos los seres vivos lo poseen, excepto los orgnulos energticos. En toda la naturaleza, los nicos seres vivos que no poseen ADN, son los retrovirus, que slo tienen ARN. La asociacin de los tres ARN, es lo que va a leer la secuencia de nucletidos, y lo hace de tres en tres nucletidos, son lo que se conocen como tripletes o codones. Cada triplete codifica para un aa. Si variamos una secuencia, variarn los aa, por tanto dar otras protenas. Nucleasas Son enzimas que catalizan la hidrlisis de los enlaces fosfodister de los cidos nucleicos. Estn presentes en todas las clulas. En las clulas eucariotas, las nucleasas se encuentran en los lisosomas. El pncreas es una glndula que sintetiza nucleasas y las vierte al duodeno, para que catalicen los cidos nucleicos que ingerimos.

Las nucleasas las podemos clasificar por el tipo de cido nucleico sobre el que acte y por el lugar especfico en el que acte del cido nucleico. Segn el tipo de cido nucleico sobre el que acte:

DNAasas, ADNasas o desoxirribonucleasas. RNAasas, ARNasas o ribonucleasas.

Dependiendo del lugar del cido nucleico sobre el que acten:


Exonucleasas: rompen los enlaces fosfodister de los extremos. Endonucleasas: rompen los enlaces fosfodister intermedios. Replicacin

Es la capacidad del ADN de producir copias de s mismo. El ADN es una doble hlice, la cual es especfica para el apareamiento de las bases nitrogenadas A = T y G " C. Conociendo una de las dos cadenas conocemos la otra, y a partir de la doble hlice, obtenemos dos idnticas. Es decir, una cadena acta de molde de la otra. Teoras sobre la replicacin

Conservativa: de las dos cadenas hijas, una proviene de la madre y la otra aparece nueva. Esta teora fue rechazada, porque no tena explicacin. Difusa: de las dos cadenas hijas, algunos fragmentos provienen de la cadena madre y otros son de nueva sntesis. Tambin se rechaz. Semiconservativa: a partir de una cadena madre, aparecen dos cadenas hijas, las cuales poseen una cadena de nueva sntesis y otra parental. Esta es la teora aceptada, y fue expuesta por Watson y Crick. La cadena inicial, sirve de molde para una cadena complementaria. Fueron Mendelson y Stalh quienes demostraron este modelo utilizando Escherichia coli (Ecoli)

La replicacin es muy precisa, y esto implica un mecanismo muy complejo para asegurar la obtencin de copias idnticas. Esto se produce en la fase S (ncleo en interfase) Normas de la replicacin

Es semiconservativa. Es bidireccional: a partir de un punto del cromosoma, va en las dos direcciones.

En virus y bacterias hay un nico punto de origen, mientras que en eucariotas hay varios. Es semidiscontinua: en la hebra conductora se van a sintetizar fragmentos grandes de forma continua, mientras que en la hebra retardada, la sntesis es discontinua (se incorporan nucletidos que forman pequeos fragmentos que se disponen de forma separada, son los fragmentos de Okazaki) La replicacin avanza por adiccin de nucletidos en direccin 3' ---- 5', la que valla en sentido contrario es la hebra retardada. El inicio de la sntesis de cada fragmento requiere un extremo hidroxilo libre, que es proporcionado por un ARN cebador. Enzimas de la replicacin

ADN polimerasas: con dos funciones: Actividad polimerasa: catalizan la unin de nucletidos en la cadena de ADN. Actividad exonucleasa: catalizan la rotura de los enlaces de los nucletidos cuando las molculas tienen un extremo libre. ARN polimerasas: catalizan la formacin de cadenas de ARN. Topoisomerasas y girasas: adaptan la estructura espacial de la doble hlice a las necesidades del proceso de sntesis. Ligasas: sellan las uniones entre los fragmentos de las cadenas. Helicasas: van a separar las dos cadenas de ADN. Protenas SSB: mantienen separadas las dos cadenas monocatenarias y actan conjuntamente con las helicasas. Primera etapa de la replicacin - Etapa de desenrollamiento

Comienza el desenrollamiento de la cadena en un punto de la misma. En ese punto hay una secuencia determinada de nucletidos. Por tanto las primeras enzimas que intervienen son las helicasas, que rompen los puentes de hidrgeno entre las bases nitrogenadas y abren la doble cadena. Al separar estas dos cadenas, se generan una tensiones que van a ser eliminadas por las topoisomeras o por las girasas. Las cadenas se mantienen separadas gracias a la accin de las SSB. Segunda etapa

Cuando hemos separado las hebras, va a comenzar la sntesis de cadenas complementarias, a partir de los moldes. Este proceso lo cataliza la ADN polimerasa III, la cual va a necesitar:

Una hebra de ADN que va a recorrer en sentido 5' ---- 3', sobre la cual sintetiza la hebra complementaria. Nucletidos en sentido 5' ---- 3' porque la nueva hebra crece en este sentido, pero adems esos nucletidos tienen que ser los complementarios de los de la hebra parental. ATP para proporcionar energa en la unin de los nucletidos. Una cadena de ARN, que sea corta (unos 40 50 nucletidos), es el ARN cebador o primer, el cual es sintetizado por la ARN polimerasa, tambin llamada primasa.

La doble hlice se separa como una cremallera, se forma la horquilla de replicacin, la cual es una zona de interseccin entre las zonas recin sintetizadas y las no replicadas. La ADN polimerasa III recorre el ADN molde en direccin 3' a 5', con lo que va a haber una sntesis continua en una hebra, que es la que llamamos hebra conductora. En la otra hebra (hebra retardada) la direccin de nucletidos es contraria (5' a 3') con lo que la ADN polimerasa III no va a poder recorrerla, esto provoca una sntesis discontinua. Para la hebra retardada, hay que colocar unos fragmentos de ADN, que son los fragmentos de Okazaki (1000 2000 nucletidos) cada uno de ellos requiere de un ARN cebador (formados por la ARN polimerasa) para iniciar la secuencia de nucletidos. Posteriormente se van a eliminar los fragmentos cebadores por la accin de la ADN polimerasa I, y en su lugar coloca los nucletidos correspondientes. Gracias a las ligasas se van a unir los fragmentos de Okazaki y los nucletidos colocados por la ADN polimerasa I, formando as una hebra continua. Cada hebra parental forma una doble hlice con su correspondiente hebra de nueva ->sntesis[Author:JML]. A pesar de estas etapas, la replicacin es un proceso muy rpido. En la Ecoli se unen unos 45.000 nucletidos/minuto. Aunque este mecanismo sea muy preciso, va a cometer errores, pero el ADN es la nica molcula capaz de efectuar correcciones en s misma. La replicacin no concluye hasta que se comprueba que la respuesta sintetizada es correcta. Si hay un nucletido mal colocado, se va a eliminar por la accin de las endo o exonucleasas y las ADN polimerasas rellenan los huecos con los nucletidos correspondientes, despus las ligasas unen los fragmentos. Con todo esto se va a producir 1 error por cada 1010 nucletidos. La fidelidad en la copia

es grandsima, pero siempre hay un pequeo margen para las mutaciones, que contribuyen a los cambios evolutivos. En la cadena nueva, las adeninas no estn metiladas. Posibles lesiones del ADN

Rayos ultravioleta: producen dmeros de timina que impiden la replicacin. Desaminacin hidroltica. Radiaciones ionizantes y reacciones oxidantes. Diferencias entre procariotas y eucariotas

En sntesis el proceso es similar, la diferencia se debe a dos factores principales:


El ADN en eucariotas es de mayor tamao. El ADN en eucariotas est empaquetado.

Con estos factores obtenemos otras diferencias:


El tamao de los fragmentos de Okazaki son ms pequeos En procariotas, existen tres ADN polimerasas, en eucariotas cinco. La replicacin en procariotas, tiene un nico origen, en eucariotas, hay muchas orquillas de replicacin. Transcripcin

Es la sntesis de ARN por un molde de ADN. Las bases del ARN son A,U,G,C y la del ADN se diferencia en que en lugar de U tiene T. La informacin va al citoplasma para la sntesis de protenas. La sntesis de ARN se va a producir por la accin de la ARN polimerasa, a partir del ADN. Para que acte la ARN polimerasa vamos a necesitar un molde de ADN bicatenario, que une los nucletidos en sentido 5' --- 3'. Tambin necesitamos ATP. La ARN polimerasa, va a comenzar su sntesis en genes o regiones promotoras.

Gen: secuencia de ADN que puede originar ms de una protena con funciones diferentes. -->Transcripcin [Author:JML]en procariotas Hay dos hebras:

Codificadora: tiene la misma secuencia que el ADN. Molde o antisentido: sentido contrario.

Hay una ARN polimerasa con dos subunidades:


Subunidad . Subunidad .

Adems vamos a necesitar un factor en la ARN polimerasa para que sta reconozca la regin promotora de ADN (zona rica en A y T) La ARN polimerasa provoca un desenrollamiento y empieza a fabricar el ARN en el sentido 5' --- 3'. La cadena de ARN va a finalizar cuando la polimerasa llega a una zona del ADN hay una secuencia de terminacin (zona rica en C y G) aqu va actuar el factor . Hay tres tipos de ARN:

ARNm: su cadena se utiliza directamente para la sntesis de protenas. ARNt y ARNr: ambos necesitan un proceso de maduracin, que son recortes y uniones de diferentes fragmentos.

Los errores que se producen durante la transcripcin son mucho ms frecuentes que los que se producen durante la replicacin (1 error por cada 104 nucletidos), pero estos errores no se pasan a la descendencia. Transcripcin en eucariotas Intervienen diversos factores proteicos, adems de las 3 ARN polimerasas:

ARN polimerasa I: tiene informacin correspondiente a los ARNr. ARN polimerasa II: transcribe los genes de origen del ARNm. ARN polimerasa III: produce los ARNt y las histonas.

En todos estos casos, vamos a necesitar un proceso de maduracin, antes del cual tiene que haber un desenrollamiento de la espiral, y as el ARNm comienza la transcripcin en la regin promotora, donde se encuentra situada la ARN polimerasa II (esta zona promotora, es rica en A y T) En las clulas eucariotas, no hay factor sigma, pero en cambio, existen factores basales y varios activadores. Una vez que comienza la transcripcin, 5', se une una caperuza (7 metil guanosina trifosfato) que sirve para identificar el fragmento en la transcripcin y para proporcionar estabilidad. La transcripcin va a acabar cuando llegue a una zona rica en C y G. Al llegar al extremo 3' del ARN recin sintetizado, se une la cola poliA (aade unas 200 adeninas), la enzima que la va a unir es la poliA polimerasa. En un gen hay diferentes zonas:

Intrones: no codifican para ninguna protena. Exones: son los que s codifican.

En el proceso de maduracin, se van a eliminar los intrones, para unir despus los exones, de esto se encargan las ribonucleoprotenas pequeas nucleares o RNPpn o espliciosomas que provocan cortes. El ARN definitivo, est formado por una secuencia continua de exones que se van a unir por las ligasas. Los ARNt estn sintetizados por la ARN polimerasa III, en l va a haber metilaciones y se le va a unir en el extremo 3', un codon que es el CCA, el cual est fosforizado y se le une el aa. Los ARNr se forman por la accin de la ARN polimerasa I, excepto los de 5 Svedbergs. -->Traduccin[Author:JML] Una vez obtenida la copia del mensaje gentico en forma de ARNm, este ARNm va a dirigir la sntesis de protenas en los ribosomas. Los ribosomas van a interpretar la secuencia completa de nucletidos del ARNm como la informacin necesaria para la unin de aa especficos mediante enlaces peptdicos. La correspondencia entre los nucletidos del ARNm y los aa que forman una protena es lo que se denomina cdigo gentico.

Se denomina fase de traduccin porque cambiamos de lenguaje, pasamos de nucletidos a aa especficos. Cada triplete da un aa. La traduccin se lleva a cabo en los ribosomas que estn formados por distintos tipos de ARNr y protenas. El ribosoma durante la sntesis de protenas se encarga de:

Permitir la aproximacin del ARNm y el transferente. Permitir la orientacin adecuada para la formacin del enlace peptdico. Participa en la alineacin del ARNm. Selecciona el codon de inicio, quedando determinada la pauta de lectura del molde. Controla la fidelidad de la traduccin. Interviene en la etapa de terminacin y liberacin de la cadena peptdica.

La traduccin es un proceso que se da de forma muy parecida en procariotas y en eucariotas. Lo primero es activar los aa, que es unirlos a un ARNt especfico, este se da en el citoplasma y lo cataliza la enzima aminoacil ARNt sintetasa, tambin se necesita ATP. El ARNt adems de llevar unido el aa va a reconocer el codon del ARNm, as una vez activado los aa, va a tener lugar la sntesis de protenas (que incluso comienza antes de que se halla sintetizado todo el ARNm) La traduccin tiene tres etapas:

Iniciacin. Elongacin o alargamiento. Terminacin. Iniciacin

El ARNm se une a los ribosomas citoplasmticos, cuyas dos subunidades estn separadas y deben acoplarse. El ARNm se une por su extremo 5' a la subunidad menor del ribosoma, gracias al factor de iniciacin IF3.

Luego se produce la fijacin del primer aminoacil ARNt y lo fija por la formacin de puentes de hidrgeno entre las bases del anticodon del ARNt y el codon del ARNm. El primer codon o codon de iniciacin, es siempre 5'AUG3' con lo que su anticodon es el UAG. El aa que corresponde es la meteonina en el caso de las clulas eucariotas y la formilmeteonina en procariotas. Este primer aa, luego puede desaparecer, pero siempre es el inicio. En este proceso interviene el factor de iniciacin IF2. Por ltimo se produce el acoplamiento de la subunidad mayor del ribosoma gracias al factor IF1, quedndose formado el complejo de iniciacin. Para este proceso necesitamos la presencia de GTP, para obtener energa, con lo que se va a pasar a ADP y un cido fosfrico. Este complejo va a cubrir dos tripletes del ARNm, por tanto solo tendremos dos posiciones. El primero es el sitio P y el segundo es el sitio -->A[Author:JML]. Elongacin o alargamiento Los aa se van situando a lo largo de la cadena peptdica. Vamos a distinguir tres subetapas:

Unin de un aminoacil ARNt al sitio A: se necesita un factor de elongacin que es el EF. Formacin del enlace peptdico: se unen los aa del sitio P con los del A, para ello se necesita una enzima que es la peptidil transferasa. Traslocacin del dipptido al sitio P: con esto el sitio A queda libre para ser ocupado por otro ARNt con aa. Terminacin

Hay tres codones de terminacin, UAA, UAG, UGA. Cuando el ribosoma llega a alguno de estos codones, se acaba la traduccin. Para estos codones, no hay ARNt especfico, porque no codifican para ningn aa. En esta etapa, interviene un factor de liberacin, el RF. Como consecuencia de la traduccin, se liberan:

Cadena proteica. Dos subunidades ribosmicas que se separan. ARNm, el cual puede ser reutilizado o destruido, que es lo ms frecuente.

Se sintetizan unos 1400 aa por minuto. Para hacer esto ms rpido se pueden utilizar los polisomas o polirribosomas (asociacin de varios ribosomas) Diferencias entre procariotas y eucariotas en la fase de traduccin

El primer ARNt en eucariotas, es solo meteonina, en lugar de la formilmeteonina. Los factores de elongacin, liberacin y iniciacin, son distintos. Al existir una membrana nuclear, se diferencia la traduccin de la transcripcin. Cdigo gentico

Es la secuencia de nucletidos del ARNm y de aa que constituyen una protena. Hay 4 BN y 20 aa distintos. Las 4 BN se pueden combinar en tripletes, con lo que van a haber 64 tripletes, 3 tripletes son de terminacin y 1 de iniciacin. Caractersticas del cdigo gentico

Es universal, excepto en orgnulos energticos y algunos protozoos ciliados. Est formado por una secuencia lineal de BN (codones) que codifican un aa. No es ambiguo, cada codon codifica un nico aa. Entre los codones, no existe separacin. Hay siempre la misma separacin entre las BN. Es degenerado, un mismo aa puede codificar para distintos codones, son los codones sinnimos. Balanceo de tercera base: esta base, puede cambiarse por otra base, con lo que se coloca otro aa.

Dibujo de esto procesos Poner el dibujo de lo que se cuenta a continuacin Te falta algo por arriba Dibujo

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