Aspectos generales de la regulacin gnica

Gen Elementos reguladores Protenas de unin al ADN Niveles de regulacin gnica

Regulacin de la expresin en Procariotas

Transcripcin (etapas y aspectos generales) Opern: estructura y tipos Opern Lac y Trp

Conceptos
Gen: Secuencia completa de cidos nucleicos necesaria para la sntesis de un producto gnico (polipptido o ARN) . Unidad de trascripcin. Genoma: Informacin gentica total transportada por una clula u organismo.

Expresin gnica: Proceso de trascripcin gnica y traduccin.

Genes
Genes estructurales
Codifican potenas implicadas en procesos generales (metabolismo, catabolismo) o componentes estructurales de la clula

Genes reguladores
Codifican para ARN/protenas que afectan la transcripcin/traduccin de otras secuencias
Usualmente se unen al ADN

Elementos reguladores
Secuencias de ADN que no se transcriben Sitio de unin de protenas reguladoras

El dogma central del flujo de la informacin gentica

Estructura del gen y el mensajero procariota

RNA Polimerasa
Enzima responsable de la sntesis de RNA: RNA polimerasa DNA dependiente

La RNA polimerasa procariota es una protena con mltiples subunidades de ~480kD.

En los sistemas eucariotas existen tres tipos de RNA polimerasas, cada una de las cuales es una protena con mltiples unidades y responsable de la trascripcin de diferentes RNAs.

ARN polimerasa procariota

Ensamblaje de la enzima; reconoce el promotor; enlaza algunos activadores Formacin del enlace fosfodister; centro cataltico de la enzima

Unin al DNA molde; centro cataltico de la enzima. Confiere especificidad al sitio promotor

ARN polimerasa procariota

RNA polimerasa
Ciclo de la RNA pol bacteriana

El promotor bacteriano

Los promotores fuertes tienen adems elementos UP corriente arriba

La RNA polimerasa (holoenzima) se une a secuencias del promotor mediante la interaccin del factor sigma . El dominio CTD de la subunidad alfa se utiliza para incrementar la velocidad a la que se transcribe un gen mediante la interaccin de ste con un elemento UP.

Terminacin
Independiente del factor Rho

Terminacin
Dependiente de Rho

Estructura del opern procariota

En procariotas, genes con funciones similares se encuentran agrupados bajo el control del mismo promotor. Se transcriben en un solo mRNA El opern est conformado por el promotor, operador, y genes estructurales. Promotor sitio de unin de la ARN polimerasa Operador on/off switch; determina si la transcripcin ocurre o no. Regulador No es parte del opern Codifica para protena regulatorias que se unen al operador.

Control gnico
Clasificacin en base a la funcin de la protena reguladora. Control negativo Funcin del represor inhibe la transcripcin Control positivo Funcin del activador activa la trascripcin Clasificacin en base al estado del opern Inducible Transcripcin usualmente off; necesita ser activada. Reprimible Transcripcin usualmente on; necesita ser silenciada.

Opern Lac
Cuando la lactosa no est presente, hay muy bajo nivel de transcripcin de los genes. Cuando la lactosa est presente, la tasa de transcripcin incrementa 1,000x (en minutos) Opern inducible negativo Negativo el gen regulador inhibe la transcripcin. Inducible normalmente en la posicin off .

MUTACIONES DE LAC

Cis

Opern

Trans Independiente

Operador Lac
Superposicin del extremo 3 del promotor y el extremo 5 del primer gen estructural (lacZ)

IPTG

Regin controladora del opern lac

Si se muta esta regin, hay transcripcin basal del opern lac, pero no hay estimulacin de la transcripcin por la proteina activadora del catabolismo (CAP) con AMPc .

Regin controladora del opern lac

La unin del complejo CAP-AMPc al ADN produce una curvatura pronunciada en el ADN que activa la transcripcin

Experimento que demuestra que la unin de CAP produce una curvatura en el mismo. (Wu y Crothers 1984)

Opern Triptfano

Codifica a enzimas participantes en la sntesis de Trp Al igual que el opern lac es un opern inducible negativo El sitio operador est en el mismo promotor, no adyacente como en el opern lac

Control del opern Triptfano mediante atenuacin

Dos estructuras secuendarias distintas puede adoptar el ARN que se encuentra corriente arriba al gen trpE

Estructura ms estable con dos horquillas Nivel de Triptfano alto

Estructura menos estable con una horquilla (antiterminador) Nivel de Triptfano bajo

Dos estructuras secuendarias distintas puede adoptar el ARN que se encuentra corriente arriba al gen trpE

Interruptores ribosmicos
(riboswitches) Que actan como inhibidores de la traduccin

Interruptores ribosmicos
(riboswitches) Que actan como ribozimas