Qumica Orgnica 4a Edio

Paula Yurkanis Bruice

Captulo 27
Nucleosdeos, nucleotdeos e cidos nuclicos

Irene Lee Case Western Reserve University Cleveland, OH 2004, Prentice Hall

cidos nuclicos

Nos cidos nuclicos, o grupo fosfato um fosfodister.

As bases nos cidos nuclicos

Adenina, guanina, citosina e timina so encontradas no DNA. Adenina, guanina, citosina e uracila so encontradas no RNA.

Nucleosdeo = base + acar

Nucleotdeo = base + acar + fosfato

Diferentes formas de nucleotdeos

ATP como fonte de energia qumica

A energia liberada da hidrlise do ATP usada para conduzir a fosforilao da D-glicose (reaes acopladas).

A quebra da ligao de fosfoanidrido no ATP

 Sem ATP, o grupo OH no pode ser deslocado.

Essa reao no pode ocorrer devido ao pobre grupo de sada.

Reao de transferncia de fosforila Mecanismo I

Reao de transferncia de fosforila Mecanismo II

Transferncia de fosforila Mecanismo III

O pirofosfato pode ser posteriormente hidrolisado em fosfato.

O P

O + H2O

O 2 -O P OH O-

O P O-O OO-

Por que a hidrlise de uma ligao de fosfoanidrido to exergnica?

1. Melhor repulso eletrosttica no ATP.

2. Maior solvatao nos produtos.

3. Maior estabilizao por ressonncia nos produtos.

O P

O P -O OO-

O P -O O-

+ -O

O P OOH

As interaes entre o ATP, Mg2+, e resduos de arginina e lisina no stio ativo de uma enzima.

Como todas as cargas negativas no ATP so neutralizadas, o ATP prontamente aproximado pelos nuclefilos.

Outros nucleotdeos importantes

O AMPc serve como uma ponte entre vrios hormnios e certas enzimas que regulam as funes celulares.

Os cidos nuclicos

Emparelhamento de bases complementares no DNA

O acar-fosfato est na parte externa e as bases esto na parte interna.

A dupla hlice do DNA

Hidrlise do RNA

As trs formas helicoidais do DNA

Ligaes hidrognio e interaes stacking das bases unem as hlices do DNA.

Replicao do DNA

Transcrio do DNA

O comprimento de bases representando uma poro de um gene chamado de xon. O comprimento de bases que no contm informao gentica chamado de ntron. O mRNA cortado antes de deixar o ncleo.

O RNA transportador

O mecanismo proposto para a aminoacil-tRNA sintetase

Stio de ligao para o tRNAHis

Uma protena sintetizada a partir de sua terminao N em direo a sua terminao C. Cada aminocido especificado por uma seqncia de trs bases conhecida como o cdigo gentico.

Traduo

Por que o DNA contm timina e no uracila?

A sntese da timina energeticamente cara.

Por que a citosina pode ser convertida em uracila

Tendo T no lugar de U no DNA, permite que as U sejam reconhecidas como erros.

Seqncia de bases do DNA

Sntese laboratorial de DNA

Sntese de oligonucleotdeos com fosforamiditos

Os grupos amino das bases devem ser protegidos.

Remoo do grupo protetor pela amnia

Utilizao de monmeros de H-fosfonato para sintetizar cadeias de DNA.

Emparelhamento de bases de Hoogsteen