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Soutenance de stage
Le 29 août 2008
SANVITTAYAGUL Prongsagorn
• Présentation du travail
A. Hypothèse et stratégie
B. Manipulations et Résultats
• Présentation du travail
A. Hypothèse et stratégie
B. Manipulations et Résultats
Voie de recyclage
Voie de novo
Travail pendant le stage
C. Objectifs du stage
ARN polymérase
Bas2p
AICAR Bas1p
Opérateur ADE17
C. Objectifs du stage
ARN polymérase
Bas2p
Bas1p
Opérateur ADE17
C. Objectifs du stage
ARN polymérase
Bas2p
Bas1p
Opérateur ADE17
C. Objectifs du stage
ARN polymérase
5’
Bas2p Transcription
Bas1p ARN
Opérateur ADE17
3’
Bas2p
?
C. Objectifs du stage
?
?
Bas2p
? ?
?
?
PLAN
I. Le contexte et objectifs du stage
A. Équipe Génétique des Réseaux Métaboliques (GRM)
B. Biosynthèse des nucléotides puriques
C. Objectifs du stage
• Présentation du travail
A. Hypothèse et stratégie
B. Manipulations et Résultats
- Si Bas2p se fixe sur l’AICAR donc un mutant Bas2p qui fixe CAIR à la place d’AICAR
va être capable aussi d’activer la transcription du gène ADE 17 chez le mutant ade1
qui ne produit pas d’AICAR mais qui accumule le CAIR
Accumulation de CAIR
A. Hypothèse et stratégie
- Si Bas2p se fixe sur l’AICAR donc un mutant Bas2p qui fixe CAIR à la place d’AICAR
va être capable aussi d’activer la transcription du gène ADE 17 chez le mutant ade1
qui ne produit pas d’AICAR mais qui accumule le CAIR
Noyau
A. Hypothèse et stratégie
- Si Bas2p se fixe sur l’AICAR donc un mutant Bas2p qui fixe CAIR à la place d’AICAR
va être capable aussi d’activer la transcription du gène ADE 17 chez le mutant ade1
qui ne produit pas d’AICAR mais qui accumule le CAIR
Bas2p sauvage
CAIR
Bas1p sauvage
A. Hypothèse et stratégie
- Si Bas2p se fixe sur l’AICAR donc un mutant Bas2p qui fixe CAIR à la place d’AICAR
va être capable aussi d’activer la transcription du gène ADE 17 chez le mutant ade1
qui ne produit pas d’AICAR mais qui accumule le CAIR
CAIR ?
A. Hypothèse et stratégie
- Si Bas2p se fixe sur l’AICAR donc un mutant Bas2p qui fixe CAIR à la place d’AICAR
va être capable aussi d’activer la transcription du gène ADE 17 chez le mutant ade1
qui ne produit pas d’AICAR mais qui accumule le CAIR
5’ Traduction
ARN
?
?
3’
Transcription
Protéine ADE17-LACZ
+
Test X-Gal
Colonie BLEU
B. Manipulations et Résultats
PCR mutagenèse
- Taq polymérase
- 4 dNTP
mais concentration réduit
en G ou C et
en A ou T
- Amorce soit 1880-1881 ou
soit 1882-1883
- Plasmide P3455
- MgCl
- H2O
BAS2
1880-1881
B. Manipulations et Résultats
PCR mutagenèse
BAS2
1880-1881
B. Manipulations et Résultats
PCR mutagenèse
BAS2
1882-1883
B. Manipulations et Résultats
PCR mutagenèse
≈ 1600 pb
≈ 750 pb
B. Manipulations et Résultats
Digestion
- Plasmide P3455
- Enzyme de restriction
soit Pfl232 + Pst1 ou
soit BamH1+ Pst1
- Tampon spécifique de l’enzyme
(1X)
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Digestion
≈ 1600 pb
≈ 750 pb
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
+ contrôle
- Sans ADN
- Plasmide sauvage(P3455)
- Fragments PCR seul
- Plasmides coupés seul
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
EX. P3455 coupée/BamH1+ PST1 et fragment PCR 1882+1883
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
EX. P3455 coupée/BamH1+ PST1 et fragment PCR 1882+1883
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
EX. P3455 coupée/BamH1+ PST1 et fragment PCR 1882+1883
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Transformation et « GAP repair»
EX. P3455 coupée/BamH1+ PST1 et fragment PCR 1882+1883
BAS2
B. Manipulations et Résultats
Test X-Gal
Extraire le plasmide ?
Et séquençage ?
B. Manipulations et Résultats
Vérification
Cultivé chaque clone de bactéries dans un milieu liquide
Extraire le plasmide
Test X-Gal
- Faux positif
Hypothèse possible : Le plasmide P753 de souche de départ a subit une mutation
au niveau de l’opérateur du gène ADE17 pendant la
transformation
Expression constitutif
Colonie Bleu
Conclusion
• Nucleic Acids Research, Vol. 20. No. 14, K. Robzyk, Y. Kassir. 1992.
A simple and highly efficient procedure for rescuing autonomous plasmids
from yeast.