ACIDOS NUCLEICOS REPLICACION DEL ADN

KELLY CASTRO CISNEROS

Los genes son secuencias de pares base en una molcula de ADN, con cada gen codificado para una protena.

CONCEPTOS GENERALES
Los cidos nucleicos : macromolculas que producen las clulas vivas y los virus.

Compuestas por C, H, O, N, P.

Cumplen con dos funciones: Transmitir las caractersticas hereditarias de una generacin a la siguiente Dirigir la sntesis de protenas especficas

Los cidos nucleicos son grandes molculas orgnicas formadas por la repeticin de monmeros (nucletido)

Nucletido es una molcula compuesta por tres unidades: Una pentosa : ribosa o desoxirribosa cido fosfrico. Una base nitrogenada, que puede ser una de estas cinco: adenina guanina - citosina - timina -Uracilo

COMPOSICIN QUMICA DE LOS CIDOS NUCLEICOS

Los cidos nucleicos son macromolculas polimricas formadas por subunidades nucletidos.

ESTAN CONSTITUIDOS POR:

Una azcar que es una pentosa, la cual puede ser:

ribosa

ARN ADN

desoxirribosa

Otro componente de su estructura son las:

CITOSINA (C) --ADN Y ARN

PIRIMIDNICA S

TIMINA (T) --ADN

URACILO (U) --ARN BASES NITROGENADAS

ADENINA (A) --ADN Y ARN

PRICAS
GUANINA (G) --ADN Y ARN

PENTOSA

BASE NITROGENADA

NUCLESIDO

NUCLESIDO

El enlace se forma entre el carbono anomrico del azcar y uno de los nitrgenos de la base nitrogenada. En la unin se forma una molcula de agua. Este enlace recibe el nombre de enlace N-glucosdico. Si la pentosa es una ribosa, tenemos un ribonuclesido. (adenina, guanina, citosina y uracilo) Si la pentosa es un desoxirribosa, tenemos un desoxirribonuclesido. (adenina, citosina, guanina y timina) Se nombra aadiendo la terminacin -osina, si derivan de una base prica, o -idina, se sta es pirimidnica, al nombre de la base que lo forma: adenosina, guanosina, citidina, timidina, etc. Si la pentosa es la desoxirribosa se antepone el prefijo desoxi-; por ejemplo, desoxiguanosina, desoxicitidina, etc.

ESTRUCTURA DE UN NUCLESIDO

Nuclesido

cido fosfrico
Es una unin fosfoster entre un OH del cido fosfrico y el OH situado en el carbono 5 del azcar.

NUCLETIDO

Al grupo fosfato de los nucletidos monofosfato puede unirse un segundo fosfato, y a ste un tercero, para formar los nucletidos mono-, di- y trifosfatos (AMP, ADP y ATP).

NUCLETIDO

Segn el azcar sea la ribosa o la desoxirribosa, tendremos ribonucletidos o desoxirribonucle tidos.

Se nombran aadiendo la terminacin monofosfato, por ejemplo, adenosin monofosfato (AMP).

Llevan el prefijo desoxi-, en el caso de estar formadas por la pentosa desoxirribosa. (dAMP).

ESTRUCTURA DE UN NUCLETIDO

PIRIMIDINAS

estructura quimica de la citosina

estructura quimica del uracilo

estructura quimica de la timina

PURINAS

estructura quimica de la adenina

estructura quimica de la guanina

estructura quimica de la ribosa

estructura quimica del Ac fosfrico

NUCLETIDOS LIBRES DE IMPORTANCIA BIOQUMICA

Adems de ser los constituyentes de los cidos nucleicos, los nucletidos y sus derivados participan en otros importantes sucesos bioqumicos celulares. El ATP, la moneda bioenergtica celular, suministra energa libre para la catlisis de mltiples reacciones biosintticas. De hecho, las proporciones intracelulares de ATP, ADP, AMP sirven para medir el nivel energtico celular y con ello regular coordinadamente varias vas metablicas. En eucariotas. El AMP cclico (AMPc) funciona como segundo mensajero de hormonas, activando las cinasas de protenas dependientes de AMPc. En clulas procariotas, el AMPc coordina una respuesta de estrs catablico activando la transcripcin de ciertos genes.

cuando hay un solo grupo fosfato,

nucletido-monofosfato (como el AMP)

cuando hay dos grupos fosfato,

nucletido-difosfato (como el ADP)

Cuando hay tres grupos fosfato

nucletido-trifosfato (como el ATP) si lleva tres.

NIVELES DE ESTRUCTURA = PROTENAS

Estructura primaria o secuencia de nucletidos (o bases) que forman la molcula del cido nucleico. Por convenio, se comienza por el carbono 5' libre de la cadena hasta alcanzar el extremo 3' libre. Estructura secundaria o disposicin espacial de los nucletidos consecutivos. Estructura terciaria o conformacin global de la molcula

TIPOS Y FUNCIONES GENERALES DE LOS CIDOS NUCLEICOS

Existen dos tipos de cidos nucleicos:

ADN
Pentonsa Desoxirribosa Bases nitrogenadas Timina En las eucariotas Es de doble cadena

ARN
Pentonsa Ribosa Bases nitrogenadas Uracilo

La masa molecular es mayor

En la eucariotas Es monocatenaria: puede presentase en forma de ARNm ARNt ARNr

la masa molecular es menor

Es bicatenario, constituido : dos cadenas polinucleotdicas unidas entre si.

La unin de las bases se realiza mediante puentes de hidrgeno

Esta doble cadena puede disponerse: En forma lineal O en forma circular

La molcula de ADN porta informacin para el desarrollo de las caractersticas biolgicas de un individuo

El ADN de algunos virus que es monocatenario

Las cuatro bases nitrogenadas del ADN estn a lo largo de la "columna vertebral" que conforman los azcares con el cido fosfrico en un orden particular.

La adenina con la timina La citosina (C) lo hace con la guanina.

La estructura primaria del ADN determinada por esta secuencia de bases ordenadas sobre la "columna" formada por los nucletidos:

Este orden es en realidad lo que se transmite de generacin en generacin

Estructura secundaria: es el modelo de la doble hlice,

Las dos hebras de ADN se mantienen unidas por los puentes hidrgenos entre las bases.

Los pares de bases estn formados por una purina y una pirimidina, de forma que ambas cadenas estn siempre equidistantes de la otra.

La Adenina se empareja siempre con la Timina mediante dos puentes de hidrgeno,

Los pares de bases adoptan una disposicin helicoidal en el ncleo central de la molcula, de forma que hay 10 pares de bases por cada vuelta de la hlice.

mientras que la Citosina se empareja siempre con la Guanina por medio de 3 puentes de hidrgeno

las dos hebras son antiparalelas La cadena de uniones azcar-fosfato est construda en manera tal que posee una polaridad

Constituido por una sola larga cadena de nucletidos. El azcar presente en el ARN es la ribosa.

ARN es qumicamente inestable

En el ARN la base que se aparea con la A es U

ARN

Segn su funcin se distinguen tres tipos de ARN:

ARNt:

disperso en el citoplasma FUNCION transportar aminocidos especficos en los ribosomas.

ARNm:

Se sintetiza y se destruye en minutos. Se halla asociado a Histonas para evitar el ataque de las Nucleasas. FUNCION: en la Sntesis Proteica, transportar la informacin copiada del ADN para la elaboracin de una protena.

ARNr:

Se encuentra en los ribosomas FUNCION: ordena los aminocidos que formarn parte de una protena.

Es similar a la del ADN pero con diferencias en su composicin. Lleva una sola cadena de polinucleotido. En varios tipos de ARN se encuentra una estructura secundaria que se parece a una cadena de ADN y es que la cadena lineal del ARN toma forma de horquilla unindose a las bases mediante puentes de hidrgeno. El ARN se encuentra en la pared de los ribosomas. Hay varios tipos y cada uno de ellos va a desempear una funcin diferente en la sntesis de protenas y tambin en la transferencia de informacin del ADN. El ARN se sintetiza en el ncleo, como un filamento complementario a una de las cadenas del ADN. En el momento que se sintetiza el ARN existe dentro del ncleo un hbrido ADN-ARN de vida corta.

ADN REPLICACIN

REPLICACIN DEL DNA

Es el mecanismo que permite al DNA duplicarse (es decir, sintetizar una copia idntica). De esta manera de una molcula de DNA nica, se obtienen dos ms "clones" de la primera. Gracias a la complementariedad entre las bases que forman la secuencia de cada una de las cadenas, el DNA tiene la importante propiedad de reproducirse idnticamente, lo que permite que la informacin gentica se transmita de una clula madre a las clulas hijas y es la base de la herencia del material gentico.

Replicacin de DNA. La doble hlice es desenrollada y cada hebra hace de plantilla para la sntesis de la nueva cadena. La DNA polimerasa aade los nucletidos complementarios a los de la cadena original.

MODELOS DE REPLICACIN
En cada una de las molculas hijas se conserva una de las cadenas originales, y por eso se dice que la replicacin del DNA es semi-conservadora.

a) Conservadora. Se sintetiza una molcula totalmente nueva, copia de la original. b) Dispersora, o dispersante. Las cadenas hijas constan de fragmentos de la cadena antigua y fragmentos de la nueva. c) Semiconservadora (modelo correcto). En cada una de las molculas hijas se conserva una de las cadenas originales.
Tres posibles modelos de replicacin. a) Conservadora, b) Dispersora, c) Semiconservadora (mecanismo real)

SECUENCIALIDAD
LA REPLICACIN AVANZA EN FORMA DE HORQUILLA Debido a que en la clula ambas cadenas de la doble hlice de DNA se duplican al mismo tiempo, stas deben separarse para que cada una de ellas sirva de molde para la sntesis de una nueva cadena. Por eso, la replicacin avanza con una estructura en forma de horquilla .

Tres posibles modelos de replicacin. a) Conservadora, b) Dispersora, Semiconservadora (mecanismo real)

c)

BIDIRECCIONALIDAD
El movimiento de la horquilla es bidireccional en la mayora de los casos, es decir, a partir de un punto se sintetizan las dos cadenas en ambos sentidos, que avanza en direccin a la regin de DNA no duplicado dejando atrs los dos moldes de DNA de cadena simple donde se est produciendo la replicacin.

En la mayora de los casos la replicacin es bidireccional. No obstante, la replicacin se puede considerar, de forma general, bidireccional.

SEMIDESCONTINUIDAD
La replicacin siempre se produce en sentido 5' 3', siendo el extremo 3'-OH libre el punto a partir del cual se produce la elongacin del DNA. Esto plantea un problema, y es que las cadenas tienen que crecer simultneamente a pesar de que son antiparalelas, es decir, que cada cadena tiene el extremo 5' enfrentado con el extremo 3' de la otra cadena. Por ello, una de las cadenas debera ser sintetizada en direccin 3' 5'. Este problema lo resolvieron los cientficos japoneses Reiji Okazaki y Tsuneko Okazaki en la dcada de 1960, al descubrir que una de las nuevas cadenas de ADN se sintetiza en forma de trozos cortos que, en su honor, se denominan fragmentos de Okazaki.

Su longitud suele variar entre 1000 y 2000 nucletidos en las bacterias y entre 100 y 400 nucletidos en eucariontes.

DNA POLIMERASAS
La DNA polimerasa es la enzima que cataliza la sntesis de la nueva cadena de DNA a partir de desoxirribonucletidos y de la molcula de DNA plantilla o molde que es la que ser replicada. La enzima copia la cadena de nucletidos de forma complementaria (A por T, C por G) para dar a cada clula hija una copia del DNA durante la replicacin.

MODO DE OPERACIN: En cada horquilla de replicacin, la DNA polimerasa y otras enzimas sintetizan dos nuevas cadenas de DNA que son complementarias respecto a las 2 cadenas originales.

Su longitud suele variar entre 1000 y 2000 nucletidos en las bacterias y entre 100 y 400 nucletidos en eucariontes.

ADN POLIMERASA

FUNCIN CORRECTORA
Adems de participar en la elongacin, desempean una funcin correctora y reparadora gracias a su actividad exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de degradar el DNA partiendo de un extremo de ste. Es importante que existan estos mecanismos de correccin ya que de lo contrario los errores producidos durante la copia del DNA daran lugar a mutaciones. Las fosfodiesterasas o nucleasa s son enzimas hidrolasas que ca talizan la ruptura de los enlaces fosfodister, como por ejemplo los que se establecen en los cidos nucleicos entre la pentosa de un nucletido y el grupo fosfato de otro.

Funcin correctora exonucleasa 3' 5' de las DNA polimerasas.

PROCESO GENERAL
La helicasa rompe los puentes de hidrgeno de la doble hlice permitiendo el avance de la horquilla de replicacin. La topoisomerasa impide que el DNA se enrede debido al super-enrollamiento producido por la separacin de la doble hlice. Las protenas SSB se unen la hebra discontinua de DNA, impidiendo que sta se una consigo misma. La DNA polimerasa sintetiza la cadena complementaria de forma continua en la hebra adelantada y de forma discontinua en la hebra rezagada. La RNA primasa sintetiza el cebador de RNA necesario para la sntesis de la cadena complementaria a la cadena rezagada. La DNA ligasa une los fragmentos de Okazaki.

INICIACIN
Para que pueda formarse la horquilla de replicacin es necesario que las dos cadenas se separen para sintetizar el cebador y el DNA de la cadena de nueva sntesis. Para ello el DNA debe desenrollarse y el punto de partida viene determinado por una secuencia especfica de nucletidos conocida como origen de replicacin. (Adenina y Timina)

Protena iniciadora: desnaturalizacin del DNA y reclutamiento de protenas. El origen de replicacin aparece en naranja.

ELONGACIN
En el siguiente paso, la holoenzima DNA Pol III cataliza la sntesis de las nuevas cadenas aadiendo nucletidos sobre el molde. Esta sntesis se da bidireccionalmente desde cada origen, con dos horquillas de replicacin que avanzan en sentido opuesto. Cuando el avance de dos horquillas adyacentes las lleva a encontrarse, es decir, cuando dos burbujas se tocan, se fusionan, y cuando todas se han fusionado todo el cromosoma ha quedado replicado.

Enzimas que participan en la replicacin: helicasa, protenas SSB, topoisomerasa, RNA primasa, Holoenzima DNA Pol III

ELONGACIN
Puesto que la holoenzima ADN Pol III necesita de un extremo 3'-OH libre, es necesario que una RNA primasa catalice la formacin de un fragmento corto especfico de RNA llamado cebador, que determinar el punto por donde la DNA polimerasa comienza a aadir nucletidos. Pero debido a la unidireccionalidad de la actividad polimerasa de la DNA Pol III, que slo es capaz de sintetizar en sentido 5 3', la replicacin slo puede ser continua en la hebra adelantada; en la hebra rezagada es discontinua, dando lugar a los fragmentos de Okazaki.

Hebra rezagada: sntesis de cebadores, unin de fragmentos de Okazaki y eliminacin de los cebadores

TERMINACIN
Terminacin de los genomas lineales

El final de la replicacin se produce cuando la DNA polimerasa III se encuentra con una secuencia de terminacin (secuencia ter). Se produce entonces el desacople de todo el replisoma y la finalizacin de la replicacin.

REPLICACION DE ADN