METABOLISMO

Suma de todas las reacciones qumicas de un organismo

Principios -Todas las reacciones qumicas en la clula involucran enzimas -Las reacciones se agrupan en una serie ordenada de pasos o vas: - Tienen pasos en comn con otras vas - Algunas convergen (degradacin de grasas conduce a gluclisis) - Algunas son nicas de un sistema vivo (pared celular en cls vegetales, hemoglobina en GR) - Otras son virtualmente universales (gluclisis y respiracin)

Anabolismo: reacciones qumicas involucradas en la sntesis - formacin de molculas complejas - almacenamiento de energa en enlaces qumicos (reacciones endergnicas) Catabolismo: reacciones qumicas involucradas en la degradacin - liberacin de energa para otros trabajos de la clula - suministrar materia prima a los procesos anablicos

FLUJO DE ENERGIA
Energa: capacidad para para hacer un trabajo (fsicos) o causar un cambio (bioqumicos)
Los cambios en la energa estn relacionados con cambios en la materia Sistema biolgico: -energa de movimiento: energa cintica (puede hacer trabajo, ej. Calor, luz, mecnica, elctrica) -energa de estado o de posicin: energa potencial (almacenada en las uniones qumicas, gradiente de concentracin, potencial elctrico)

Transformaciones de la energa: Leyes de la termodinmica

Pueden aplicarse a los organismos vivos - 1ra ley: la energa no se crea ni se destruye, se transforma - 2da ley: las transformaciones de la energa disminuyen la cantidad de energa disponible para hacer trabajo (G) y aumentan el desorden (entropa, S) (energa no utilizable)

Primera ley

Segunda ley

Si bien la segunda ley se aplica para todas las transformaciones energticas, nos vamos a centrar en las reacciones qumicas de los seres vivos

En los sistemas biolgicos, la energa total la denominamos entalpa (H)

Energa total = energa utilizable + energa no utilizable H = G + TS (temperatura * entropa)

G en una reaccin qumica: Gp Gr = H- TS

-Reacciones espontneas - G < 0

-Reacciones NO espontneas - G > 0

El cambio de energa libre de una reaccin qumica determina su punto de equilibrio al cual las reacciones en ambos sentidos ocurren a una misma velocidad
A+B C

Reacciones qumicas: transformaciones de energa (E en enlaces qumicos se transfiere a otros enlaces qumicos) -Los electrones pasan de un tomo o molcula a otro: -OXIDACION: prdida de un electrn -REDUCCION: ganancia de un electrn -Reacciones simultneas -El e- puede viajar con un H+ (transferencia de tomos de H): -Oxidacin de glucosa: C6H12O6 + 6O2 -Fotosntesis: 6CO2 + 6H2O + energa C6H12O6 + 6O2

6CO2 + 6H2O + energa

Cmo manejan la energa las clulas?

ATP (Adenosn trifosfato)

acopla reacciones exergnicas y endergnicas

ATP + H2O === ADP + Pi (HPO4-2) + energa libre G 12kcal/mol Esta reaccin es altamente exergnica (G = -12 kcal/mol) El equilibrio est muy desplazado hacia la derecha (en una clula hay 10 millones de veces ms de ADP que ATP)

ADP + H2O === AMP + Pi (HPO4-2) + energa libre

-Hay protenas especficas que catalizan la hidrlisis de ATP: ATPasas Ej? - El Pi puede eliminarse o transferirse a otras molculas: fosforilacin

-NAD y FAD: actan transfiriendo tomos (H+ y e-). Forman pares conjugados redox

Seres vivos
- miles de actividades qumicas dentro de clulas - las molculas deben chocar para reaccionar

-Reacciones qumicas requieren energa para comenzar

Energa de activacin: energa para llevar los reactivos a una forma molecular inestable (en estado de transicin) que posee mayor energa libre que reactivos o productos De dnde proviene la energa de activacin? De la propia energa cintica? Algunas pueden tener suficiente energa cintica para superar la barrera de activacin

CATALIZADORES
- sustancia que acelera una reaccin qumica - no se consume - disminuye la energa de activacin

El G no cambia, ni tampoco el equilibrio qumico

Enzimas
- protenas globulares (la mayora) especializadas en actuar como catalizadores biolgicos - forma una asociacin pasajera con las molculas que reaccionan -son muy efectivas en cantidades muy pequeas

S + E

ES

P + E

Estructura -1 o varias cadenas polipeptdicas -Sitio activo: - surco en donde encaja el sustrato y ocurren las reacciones; -pocos aa involucrados; -determinado por estructura terciaria -Configuracin 3D y distribucin de cargas complementarias al sustrato -Reconoce, une al sustrato y lo orienta -Altamente especficas

Unin del sustrato al sitio activo

Modelo llave-cerradura - Sitio activo poco flexible Hiptesis del ajuste inducido -Es sitio activo es flexible y se ajusta al sustrato. -Se produce una tensin que facilita la conversin del sustrato en un estado de transicin debilitando uniones crticas -El estado de transicin se estabiliza por su unin a la enzima con lo cual baja la energa de activacin requerida

Mecanismo cataltico de la quimotripsina (serin proteasa)

Se producen interacciones (uniones dbiles) entre sustrato y enzima

Substrate binding by serine proteases

Cmo baja la energa de activacin?

La tensin producida por la distorsin del sustrato facilita el pasaje a estado de transicin debilitando sus enlaces. El estado de transicin se estabiliza por su unin a la enzima Orienta a los sustratos Agregan carga a los sustratos

Cmo graficaran la velocidad de una reaccin qumica en funcin de la concentracin de sustrato?

Adems de unir sustratos, los sitios activos de muchas enzimas unen otras molculas no proteicas que participan en la catlisis: Cofactores: iones inorgnicos que se unen temporalmente -Mg2+ involucrado en reacciones de transferencia de fosfatos -Otros: K+ y Ca2+

Coenzimas -Se alteran pero no de forma irreversible. Se reciclan en otras reacciones

-Algunas funcionan como aceptoras de e- en reacciones redox

Por ej. NAD: nicotinamida adenina dinucletido FAD otras a partir de vitaminas

Papel de las enzimas en la organizacin y regulacin metablica

El metabolismo est organizado en vas A
B C

Ventajas para la clulas? -Enzimas de una va agrupadas espacialmente (ej., en membrana plasmtica) -Escasa acumulacin de productos intermedios -No se alcanza el equilibrio porque porque las reacciones secuenciales eliminan los productos del sistema

Regulacin de la actividad enzimtica

- Concentracin de enzima y sustrato y disponibilidad de cofactores determinan las velocidades de las reacciones Sntesis de novo: produccin de enzimas slo cuando las clulas las requieran Sntesis de formas inactivas de enzimas: quimotripsingeno inactivo se sintetiza en pncreas, quimotripsina en intestino delgado Dependencia de la temperatura (hasta 40 grados) y del pH (pepsina)

Interacciones alostricas -Enzimas con sitio activo y sitio alostrico (unin de efector alostrico): cambia la conformacin de la enzima

Inhibicin por retroalimentacin: el producto final acta inhibiendo a la primer enzima de la va (en gral es alostrica) o favoreciendo una rama de una va metablica ramificada

Inhibicin competitiva
-Compuestos que inhiben la actividad enzimtica porque ocupan el sitio activo -Reversible -Depende de la concentracin de las molculas -Ej. Drogas para tratar infecciones bacterianas en animales (droga con estructura similar a un intermediario de la sntesis de cido flico)

Inhibicin no competitiva
-El compuesto qumico inhibitorio no se parece al sustrato y se une a un sitio distinto del sitio activo -A menudo puede ser reversible -Inhibicin no se revierte por un incremento en concentracin de sustrato -

Inhibicin irreversible
-Los compuestos se unen permanentemente a grupos funcionales claves del sitio activo -Desnaturalizan la protena -Penicilina

Regulacin por Fosforilaciones

- Quinasas y fosfatasas